Viral Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of viral only.

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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)

count	common name link to genome browser	ncbiGene	gc5 base	gaps	assembly sequences	Repeat Masker	TRF simpleRepeat	window Masker	cpg islands
1	Adeno-associated virus - 1 (2000) GCF_000863065.1	2 (86.54 %)	56.52 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (2.86 %)	n/a	0 (0.00 %)	1 (71.49 %)
2	Adeno-associated virus - 3 (3H 2000) GCF_000841585.1	2 (86.46 %)	53.88 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.70 %)	n/a	0 (0.00 %)	1 (53.20 %)
3	Adeno-associated virus - 4 (ATCC VR-646 2000) GCF_000836885.1	2 (85.53 %)	57.46 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	2 (74.41 %)
4	Adeno-associated virus - 7 (2004) GCF_000845645.1	2 (86.55 %)	57.33 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	1 (70.20 %)
5	Adeno-associated virus - 8 (2004) GCF_000846525.1	2 (93.22 %)	57.06 (99.93 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.84 %)	n/a	2 (0.32 %)	1 (63.24 %)
6	adeno-associated virus 2 (1993) GCF_000838645.1	14 (89.01 %)	53.80 (99.91 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (3.18 %)	n/a	0 (0.00 %)	1 (54.43 %)
7	adeno-associated virus 5 (2004) GCF_000846385.1	2 (86.34 %)	55.15 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (2.65 %)	n/a	4 (0.60 %)	2 (79.06 %)
8	Adult diarrheal rotavirus strain J19 (J19 2005) GCF_000864245.1	11 (95.04 %)	33.42 (99.83 %)	n/a	11 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.20 %)	37 (2.83 %)	0 (0.00 %)
9	African swine fever virus (26544/OG10 2019) GCF_003032925.1	164 (88.73 %)	38.56 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	25 (0.58 %)	59 (1.70 %)	1,341 (13.78 %)	17 (3.41 %)
10	African swine fever virus (47/Ss/2008 2019) GCF_003033005.1	235 (88.78 %)	38.48 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	27 (0.61 %)	59 (2.29 %)	1,387 (14.30 %)	17 (3.38 %)
11	African swine fever virus (ASFV Georgia 2007/1 2020) GCF_003047755.2	195 (89.23 %)	38.39 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	19 (0.33 %)	54 (1.73 %)	1,342 (13.47 %)	16 (3.41 %)
12	African swine fever virus (BA71 2019) GCF_003032875.1	161 (89.06 %)	38.81 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	25 (0.57 %)	61 (2.86 %)	1,343 (14.57 %)	17 (3.46 %)
13	African swine fever virus (BA71V 2014) GCF_000858485.1	152 (88.20 %)	38.95 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	25 (0.57 %)	55 (3.36 %)	1,176 (14.34 %)	17 (3.67 %)
14	African swine fever virus (Benin 97/1 2019) GCF_003047675.1	156 (88.61 %)	38.59 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	25 (0.59 %)	59 (1.90 %)	1,380 (14.38 %)	17 (3.44 %)
15	African swine fever virus (E75 2019) GCF_003047715.1	171 (86.69 %)	38.66 (100.00 %)	1 (0.00 %)	2 (100.00 %)	25 (0.59 %)	56 (1.72 %)	1,332 (13.80 %)	17 (3.44 %)
16	African swine fever virus (Ken05/Tk1 2019) GCF_003032905.1	168 (88.02 %)	38.25 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	17 (0.33 %)	73 (2.13 %)	1,263 (12.68 %)	12 (2.54 %)
17	African swine fever virus (Ken06.Bus 2019) GCF_003032915.1	161 (87.27 %)	38.53 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	20 (0.43 %)	82 (2.27 %)	1,244 (12.87 %)	11 (3.08 %)
18	African swine fever virus (L60 2019) GCF_003032865.1	163 (89.33 %)	38.61 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	25 (0.58 %)	57 (1.89 %)	1,368 (14.10 %)	17 (3.42 %)
19	African swine fever virus (NHV 2019) GCF_003032885.1	158 (89.62 %)	38.87 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	24 (0.59 %)	53 (2.09 %)	1,299 (14.32 %)	18 (3.77 %)
20	African swine fever virus (OURT 88/3 2019) GCF_003047695.1	157 (89.68 %)	38.86 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	24 (0.59 %)	49 (1.75 %)	1,293 (14.30 %)	18 (3.78 %)
21	Aichi virus 1 (A846/88 1998) GCF_000861885.1	1 (88.50 %)	58.90 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.09 %)	n/a	8 (2.47 %)	1 (81.27 %)
22	Aigai virus (AP92 2023) GCF_018594555.1	3 (95.48 %)	44.05 (99.97 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	20 (1.33 %)	0 (0.00 %)
23	Akhmeta virus (Akhmeta_2013-88 2021) GCF_006452035.1	220 (91.30 %)	33.52 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	46 (0.98 %)	34 (1.69 %)	1,169 (9.68 %)	0 (0.00 %)
24	Alenquer virus (2021) GCF_013086385.1	4 (95.09 %)	39.86 (99.96 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.29 %)	13 (1.66 %)	0 (0.00 %)
25	Alkhumra hemorrhagic fever virus (Zaki #2 2012) GCA_031116565.1	1 (95.14 %)	54.00 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.40 %)	n/a	2 (0.13 %)	0 (0.00 %)
26	Alphapapillomavirus 12 (2000) GCF_000836865.1	8 (86.97 %)	48.06 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.36 %)	1 (0.51 %)	13 (3.72 %)	1 (4.50 %)
27	Alphapapillomavirus 3 (2000) GCF_000862805.1	7 (82.89 %)	46.32 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.79 %)	1 (0.95 %)	16 (5.23 %)	0 (0.00 %)
28	Alphapapillomavirus 4 (1991) GCF_000864945.1	7 (86.62 %)	48.40 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.34 %)	1 (0.50 %)	7 (2.05 %)	0 (0.00 %)
29	Anatid alphaherpesvirus 1 (2085 2023) GCA_008791745.1	78 (79.40 %)	44.93 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	11 (0.18 %)	13 (1.23 %)	226 (2.34 %)	5 (4.61 %)
30	Anelloviridae sp. (ctbb016 2023) GCF_004286455.1	2 (74.06 %)	37.47 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.56 %)	11 (7.40 %)	0 (0.00 %)
31	Anelloviridae sp. (ctbc019 2023) GCF_004285675.1	2 (81.37 %)	36.92 (99.89 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (6.97 %)	0 (0.00 %)
32	Anelloviridae sp. (ctbd020 2023) GCF_004286695.1	2 (84.88 %)	37.93 (99.87 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.35 %)	7 (5.11 %)	0 (0.00 %)
33	Anelloviridae sp. (ctbf014 2023) GCF_004286755.1	3 (79.12 %)	35.76 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (8.44 %)	0 (0.00 %)
34	Anelloviridae sp. (ctbf050 2023) GCF_004285795.1	3 (82.06 %)	37.83 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	16 (12.62 %)	0 (0.00 %)
35	Anelloviridae sp. (ctbg056 2023) GCF_004285195.1	4 (89.12 %)	35.92 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.64 %)	1 (1.13 %)	19 (15.20 %)	0 (0.00 %)
36	Anelloviridae sp. (ctbi042 2023) GCF_004286375.1	1 (85.84 %)	32.36 (99.77 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (9.17 %)	0 (0.00 %)
37	Anelloviridae sp. (ctcd026 2023) GCF_004287315.1	2 (80.01 %)	37.81 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (4.86 %)	0 (0.00 %)
38	Anelloviridae sp. (ctcf040 2023) GCF_004287355.1	2 (84.67 %)	35.84 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.18 %)	n/a	9 (5.57 %)	0 (0.00 %)
39	Anelloviridae sp. (ctea38 2023) GCF_004287275.1	3 (79.81 %)	36.34 (99.85 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (6.46 %)	0 (0.00 %)
40	Anelloviridae sp. (ctei055 2023) GCF_004286855.1	2 (66.81 %)	34.97 (99.92 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (2.20 %)	n/a	9 (13.25 %)	0 (0.00 %)
41	Anelloviridae sp. (ctga035 2023) GCF_004286675.1	2 (74.70 %)	37.19 (99.86 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.54 %)	1 (2.52 %)	3 (4.91 %)	0 (0.00 %)
42	Anelloviridae sp. (vzttmv5 2023) GCF_006370125.1	2 (74.68 %)	39.93 (99.86 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.75 %)	1 (3.25 %)	9 (7.81 %)	0 (0.00 %)
43	Anjozorobe virus (Anjozorobe/Em/MDG/2009/ATD49 2017) GCF_002145785.1	3 (93.60 %)	37.87 (99.96 %)	n/a	3 (100.00 %)	6 (0.78 %)	1 (0.36 %)	16 (2.19 %)	0 (0.00 %)
44	Argentinian mammarenavirus (XJ13 2003) GCF_000856545.1	4 (95.69 %)	41.57 (99.95 %)	n/a	2 (100.00 %)	4 (0.24 %)	1 (0.48 %)	2 (0.58 %)	0 (0.00 %)
45	Arthrobacter phage Corgi (2023) GCF_003692095.1	26 (95.88 %)	67.58 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	9 (2.24 %)	n/a	99 (8.18 %)	1 (99.92 %)
46	Astrovirus (MLB1 2008) GCF_000880715.1	3 (98.83 %)	40.86 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.70 %)	n/a	4 (1.15 %)	0 (0.00 %)
47	Astrovirus (VA1 2009) GCF_000885815.1	4 (97.94 %)	41.93 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.67 %)	n/a	7 (0.87 %)	0 (0.00 %)
48	Astrovirus MLB2 (MLB2/human/Stl/WD0559/2008 2012) GCF_000895575.1	3 (99.13 %)	40.52 (99.93 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (2.01 %)	0 (0.00 %)
49	Astrovirus MLB3 (MLB3/human/Vellore/26564/2004 2012) GCF_000899535.1	3 (99.15 %)	40.00 (99.93 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (2.19 %)	0 (0.00 %)
50	Astrovirus VA3 (VA3/human/Vellore/28054/2005 2012) GCF_000901475.1	3 (98.01 %)	41.78 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.29 %)	0 (0.00 %)
51	Astrovirus VA4 (VA4/human/Nepal/S5363/2008 2012) GCF_000897955.1	3 (97.62 %)	42.99 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.11 %)	0 (0.00 %)
52	Atlantic salmon calicivirus (Nordland/2011 2014) GCF_000919195.1	2 (97.89 %)	53.49 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	3 (56.39 %)
53	Australian bat lyssavirus (insectivorous isolate 1999) GCF_000850325.1	5 (91.79 %)	44.15 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (0.61 %)	0 (0.00 %)
54	Bacillus phage PfNC7401 (2016) GCA_002611025.1	79 (85.50 %)	36.55 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.12 %)	4 (0.31 %)	121 (3.62 %)	0 (0.00 %)
55	Banna virus strain JKT-6423 (JKT-6423 JKT-6423 2000) GCF_000858185.1	12 (86.10 %)	39.33 (99.89 %)	n/a	12 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (0.64 %)	0 (0.00 %)
56	Barmah Forest virus (BH2193 1997) GCF_000847585.1	5 (95.39 %)	48.55 (99.97 %)	2 (0.02 %)	3 (99.98 %)	4 (0.59 %)	n/a	7 (2.47 %)	5 (15.26 %)
57	Bastrovirus 7 (2017) GCF_002285025.1	3 (97.74 %)	58.36 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.27 %)	4 (52.22 %)
58	Bat sapovirus (Bat-SaV/Limbe65/CAM/2014 2017) GCF_002005625.1	2 (97.81 %)	46.98 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.24 %)	n/a	5 (0.75 %)	1 (5.51 %)
59	Bat sapovirus (TLC58/HK 2012) GCF_000894635.1	2 (96.96 %)	60.16 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.49 %)	n/a	6 (0.66 %)	1 (94.41 %)
60	Beiji nairovirus (H160 2023) GCF_029888155.1	2 (86.68 %)	43.91 (99.97 %)	2 (0.01 %)	4 (99.99 %)	5 (0.59 %)	n/a	17 (2.03 %)	0 (0.00 %)
61	Betacoronavirus (England 1 H123990006 2018) GCF_002816195.1	12 (97.48 %)	41.18 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.12 %)	n/a	2 (0.06 %)	0 (0.00 %)
62	Betapolyomavirus macacae (2000) GCF_000837645.1	18 (99.29 %)	40.76 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	3 (4.54 %)	15 (4.33 %)	0 (0.00 %)
63	Bhanja virus (ibAr2709 2015) GCF_001019855.1	4 (96.85 %)	45.34 (99.95 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.56 %)	0 (0.00 %)
64	Bocaparvovirus primate1 (Salvador1 2023) GCF_003033285.1	9 (85.80 %)	42.31 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.52 %)	n/a	6 (1.64 %)	0 (0.00 %)
65	Borna disease virus 2 (No/98 2016) GCF_000847565.3	6 (97.61 %)	50.10 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.43 %)	n/a	3 (0.24 %)	3 (11.20 %)
66	Bourbon virus (MO-2013-2499 2023) GCF_023156645.1	6 (95.52 %)	45.81 (99.91 %)	1 (0.01 %)	7 (99.99 %)	3 (0.00 %)	1 (0.36 %)	5 (0.62 %)	0 (0.00 %)
67	Bovine adeno-associated virus (2004) GCF_000846165.1	2 (86.17 %)	53.77 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (1.43 %)	2 (50.44 %)
68	Bovine calicivirus strain (Kirklareli 2016) GCF_001714355.1	2 (98.04 %)	58.37 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.09 %)	1 (96.34 %)
69	Bovine herpesvirus type 1.1 (NVSL challenge 97-11 2022) GCF_008777455.1	75 (84.84 %)	72.42 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	n/a	116 (4.31 %)	1,304 (33.41 %)	1 (99.99 %)
70	Bowe virus (VN1512 2017) GCF_002118085.1	3 (94.38 %)	36.23 (99.97 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (1.00 %)	1 (0.29 %)	12 (2.09 %)	0 (0.00 %)
71	Bruges virus (BE/Vieux-Genappe/TE/2013/1 2017) GCF_002117675.1	3 (93.06 %)	38.99 (99.93 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.47 %)	n/a	8 (1.00 %)	0 (0.00 %)
72	Bufavirus-3 (BTN-63 2014) GCF_000924255.1	5 (95.27 %)	39.77 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.31 %)	1 (0.78 %)	18 (5.18 %)	0 (0.00 %)
73	Bunyamwera virus (1991) GCF_000849925.1	4 (95.34 %)	35.16 (99.97 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	30 (3.12 %)	0 (0.00 %)
74	Caaingua virus (MS681 2021) GCF_018585185.1	2 (96.38 %)	51.29 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (0.81 %)	n/a	5 (0.75 %)	4 (85.60 %)
75	Cache Valley virus (6V633 2019) GCF_004789995.1	4 (95.45 %)	35.43 (99.98 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (0.75 %)	0 (0.00 %)
76	Calicivirus chicken/V0021/Bayern/2004 (Bavaria04V0021 2023) GCF_004786895.1	2 (98.62 %)	54.02 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.64 %)	1 (4.06 %)
77	Calicivirus isolate (TCG 14 2005) GCF_000859525.1	2 (98.09 %)	56.20 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.19 %)	n/a	2 (1.07 %)	2 (69.58 %)
78	Calicivirus pig/AB90/CAN (AB90 2009) GCF_000883855.1	2 (99.21 %)	54.31 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.39 %)	1 (0.39 %)	10 (1.83 %)	0 (0.00 %)
79	California encephalitis virus (BFS 283 2021) GCF_003972565.1	4 (94.87 %)	36.45 (99.95 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (0.66 %)	0 (0.00 %)
80	Camel Crimean-Congo hemorrhagic fever orthonairovirus (camel/Abu Dhabi/B84 2020) GCA_032106395.1	3 (96.30 %)	43.00 (99.98 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.56 %)	n/a	16 (0.70 %)	0 (0.00 %)
81	Canine vesivirus (2003) GCF_000851085.1	3 (97.08 %)	45.89 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.63 %)	0 (0.00 %)
82	Capira virus (VP-366G 2015) GCA_031322265.1	4 (95.28 %)	38.38 (99.97 %)	2 (0.03 %)	5 (99.97 %)	4 (1.01 %)	6 (0.94 %)	4 (1.22 %)	0 (0.00 %)
83	Carnivore chapparvovirus 1 (VRI 849 2020) GCA_031190585.1	2 (83.55 %)	37.38 (99.90 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.90 %)	n/a	3 (1.98 %)	0 (0.00 %)
84	Catu virus (BeH 151 2018) GCF_002831305.1	3 (98.05 %)	37.20 (99.97 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (0.91 %)	0 (0.00 %)
85	Central cimpanzee simian foamy virus (Pan troglodytes troglodytes BAD327 2018) GCF_003032755.1	6 (75.24 %)	38.61 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (0.88 %)	0 (0.00 %)
86	Cercopithecine alphaherpesvirus 2 (B264 2004) GCF_000846965.1	80 (78.07 %)	75.97 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	169 (6.25 %)	180 (5.92 %)	1,059 (33.71 %)	1 (100.00 %)
87	Chandipura virus (CIN 0451 2013) GCF_000906815.1	5 (96.34 %)	42.53 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.29 %)	n/a	19 (1.75 %)	0 (0.00 %)
88	Chandiru virus (2011) GCF_000891915.1	4 (94.55 %)	39.54 (99.96 %)	6 (0.06 %)	9 (99.94 %)	4 (0.24 %)	1 (0.42 %)	21 (2.82 %)	0 (0.00 %)
89	Changuinola virus (CGLV/BE AN 28873 2013) GCF_000911195.1	10 (96.06 %)	42.18 (99.89 %)	n/a	10 (100.00 %)	6 (0.61 %)	n/a	7 (0.79 %)	2 (3.32 %)
90	Chicken calicivirus (RS/BR/2015 2017) GCF_001963095.1	2 (95.46 %)	54.17 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.38 %)	1 (2.63 %)
91	Chikungunya virus (S27-African prototype 2002) GCF_000854045.1	2 (94.47 %)	50.04 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.87 %)	n/a	3 (1.76 %)	7 (34.06 %)
92	Chimpanzee adenovirus Y25 (2012) GCF_000897015.1	37 (82.60 %)	58.78 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	13 (1.03 %)	3 (0.46 %)	100 (4.44 %)	5 (75.08 %)
93	Circo-like virus-Brazil (hs1 2014) GCF_000919735.1	4 (87.77 %)	34.73 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (3.05 %)	1 (2.26 %)	8 (7.21 %)	0 (0.00 %)
94	Circular ssDNA virus sp. (2023) GCF_023122845.1	2 (76.33 %)	57.82 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.59 %)	3 (1.77 %)	3 (2.41 %)	1 (83.33 %)
95	Circular ssDNA virus sp. (HV-CV1 2016) GCF_001678815.1	3 (73.09 %)	52.61 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (1.25 %)	1 (78.14 %)
96	Cocal virus (Indiana 2 2015) GCF_001440915.1	7 (99.82 %)	43.98 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.34 %)	n/a	7 (0.53 %)	0 (0.00 %)
97	Cocle virus (GML244915 2023) GCF_013086615.1	4 (91.78 %)	40.00 (99.95 %)	n/a	3 (100.00 %)	6 (2.05 %)	9 (1.44 %)	13 (3.57 %)	0 (0.00 %)
98	Colobus guereza papillomavirus 2 (CgPV2 2011) GCF_000892175.1	6 (92.13 %)	47.13 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (1.54 %)	2 (1.95 %)	5 (2.71 %)	3 (15.12 %)
99	Colorado tick fever virus (Florio; N-7180 2002) GCF_000853265.1	13 (95.61 %)	46.56 (99.92 %)	n/a	12 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	32 (1.25 %)	7 (8.12 %)
100	Corriparta virus (AUS1960/01 2018) GCF_002829365.1	12 (95.17 %)	44.27 (99.91 %)	n/a	10 (100.00 %)	4 (0.41 %)	n/a	2 (0.32 %)	3 (6.68 %)
101	Cosavirus A (HCoSV-A1 0553 2009) GCF_000885595.1	1 (83.53 %)	43.75 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.63 %)	n/a	5 (1.90 %)	0 (0.00 %)
102	Cosavirus D (HCoSV-D1 5004 2009) GCF_000886475.1	1 (88.44 %)	42.47 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (1.18 %)	0 (0.00 %)
103	Cosavirus E (HCoSV-E1 2009) GCF_000886455.1	1 (96.38 %)	41.93 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.27 %)	n/a	5 (0.79 %)	0 (0.00 %)
104	Cosavirus F (PK5006 2017) GCF_002117635.1	1 (95.96 %)	44.40 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.93 %)	0 (0.00 %)
105	Cosavirus JMY-2014 (Cosa-CHN 2014) GCF_000930055.1	1 (88.17 %)	42.21 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.25 %)	0 (0.00 %)
106	Cowpox virus (Brighton Red 2002) GCF_000839185.1	233 (91.92 %)	33.40 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	41 (0.80 %)	64 (2.52 %)	1,041 (9.40 %)	0 (0.00 %)
107	Coxsackievirus A2 (Fleetwood CA2 2018) GCF_002816655.1	1 (88.90 %)	48.26 (99.96 %)	4 (0.05 %)	5 (99.95 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.64 %)	1 (4.18 %)
108	Coxsackievirus B3 (2018) GCF_002816685.1	1 (88.63 %)	47.67 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (1.11 %)	0 (0.00 %)
109	Crimean-Congo hemorrhagic fever orthonairovirus (IbAr10200 2003) GCF_000854165.1	3 (95.80 %)	42.23 (99.97 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.22 %)	26 (1.53 %)	0 (0.00 %)
110	Crosse virus (La Crosse/original 1994) GCA_002831285.1	6 (94.68 %)	36.60 (99.96 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.32 %)	n/a	17 (1.43 %)	0 (0.00 %)
111	Cuevavirus lloviuense (Lloviu virus/M.schreibersii-wt/ESP/2003/Asturias-Bat86 2011) GCF_000896415.1	9 (80.46 %)	45.99 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.18 %)	n/a	13 (0.66 %)	0 (0.00 %)
112	Cutavirus (BR-337 2018) GCF_003033315.1	6 (99.33 %)	38.92 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (3.34 %)	n/a	15 (7.76 %)	0 (0.00 %)
113	Cyclovirus (NG12 2018) GCF_002820165.1	2 (83.78 %)	47.65 (99.78 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
114	Cyclovirus (NG14 2018) GCF_002820185.1	2 (86.35 %)	46.41 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.56 %)	1 (40.17 %)
115	Cyclovirus (PK5006 2018) GCF_002820085.1	2 (86.65 %)	43.66 (99.83 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (1.80 %)	1 (17.18 %)
116	Cyclovirus (PK5034 2018) GCF_002820145.1	2 (83.54 %)	48.09 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
117	Cyclovirus (PK5222 2018) GCF_002820105.1	2 (85.80 %)	43.62 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (3.33 %)	n/a	4 (5.29 %)	1 (23.56 %)
118	Cyclovirus (PK5510 2018) GCF_002820065.1	2 (84.59 %)	44.67 (99.77 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.91 %)	0 (0.00 %)
119	Cyclovirus (SL-108277 2018) GCF_002820225.1	2 (87.89 %)	41.99 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.99 %)	n/a	2 (1.52 %)	1 (15.67 %)
120	Cyclovirus (TN25 2018) GCF_002820125.1	3 (81.95 %)	45.20 (99.89 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (1.50 %)	1 (12.37 %)
121	Cyclovirus VN (hcf2 2018) GCF_002820205.1	3 (81.79 %)	46.20 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (1.62 %)	0 (0.00 %)
122	Dandenong virus (0710-2678 2007) GCA_031580275.1	4 (95.83 %)	43.24 (99.99 %)	n/a	2 (100.00 %)	4 (0.73 %)	1 (0.31 %)	5 (1.88 %)	0 (0.00 %)
123	Dar es Salaam virus (TZ-189 2023) GCF_018595055.1	3 (92.94 %)	40.08 (99.92 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.67 %)	n/a	14 (2.66 %)	0 (0.00 %)
124	Deer tick virus (ctb30 CT95 2001) GCA_004786555.1	1 (94.89 %)	52.70 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (0.86 %)	1 (2.25 %)
125	Dengue virus 1 (clone 45AZ5 Nauru Island 1997) GCF_000862125.1	1 (94.82 %)	46.67 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.68 %)	0 (0.00 %)
126	Dengue virus 2 (16681/84 Thailand 1993) GCF_000871845.1	5 (98.86 %)	45.82 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.27 %)	n/a	2 (0.16 %)	0 (0.00 %)
127	Dengue virus 3 (D3/H/IMTSSA-SRI/2000/1266 Sri Lanka 2007) GCF_000866625.1	5 (98.92 %)	46.71 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.60 %)	0 (0.00 %)
128	Dengue virus 4 (clone rDEN4 2001) GCF_000865065.1	4 (98.81 %)	47.13 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.27 %)	0 (0.00 %)
129	Dengue virus type 3 (H87 2023) GCA_004788295.1	1 (95.11 %)	46.65 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.19 %)	0 (0.00 %)
130	Dengue virus type 4 (814669 2023) GCA_004786575.1	1 (95.45 %)	47.05 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.27 %)	0 (0.00 %)
131	Dhori thogotovirus (Dhori/1313/61 2017) GCF_002116195.1	6 (95.15 %)	45.84 (99.90 %)	n/a	6 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (1.33 %)	0 (0.00 %)
132	Dianlovirus menglaense (Rousettus-wt/CHN/2015/Sharen-Bat9447-1 2021) GCF_013088285.1	7 (98.97 %)	36.55 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.22 %)	n/a	10 (0.75 %)	0 (0.00 %)
133	Dugbe orthonairovirus (ArD44313 1995) GCF_000850985.1	3 (96.61 %)	40.19 (99.98 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.27 %)	n/a	41 (3.15 %)	0 (0.00 %)
134	Duvenhage lyssavirus (86132SA 2013) GCF_000905375.1	5 (90.59 %)	44.22 (99.99 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.72 %)	0 (0.00 %)
135	Eastern chimpanzee simian foamy virus (2018) GCF_003032765.1	5 (93.39 %)	37.99 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.77 %)	n/a	8 (0.77 %)	0 (0.00 %)
136	Eastern equine encephalitis virus (ssp. North American variant 1991) GCF_000862705.1	5 (96.00 %)	48.71 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (0.91 %)	n/a	3 (0.64 %)	5 (23.55 %)
137	ebolavirus (Bundibugyo virus/H.sapiens-tc/UGA/2007/Butalya-811250 2010) GCF_000889155.1	11 (96.40 %)	42.01 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.45 %)	n/a	17 (0.92 %)	0 (0.00 %)
138	ebolavirus (Reston virus/M.fascicularis-tc/USA/1989/Philippines89-Pennsylvania 2002) GCF_000854085.1	11 (98.80 %)	40.62 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (0.55 %)	n/a	6 (0.28 %)	0 (0.00 %)
139	ebolavirus (Sudan virus/H.sapiens-tc/UGA/2000/Gulu-808892 2004) GCF_000855585.1	11 (96.95 %)	41.34 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.38 %)	n/a	10 (0.49 %)	0 (0.00 %)
140	ebolavirus (Tai Forest virus/H.sapiens-tc/CIV/1994/Pauleoula-CI 2010) GCF_000888475.1	11 (96.41 %)	42.26 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.50 %)	n/a	24 (1.26 %)	0 (0.00 %)
141	Echarate virus (2021) GCF_013086425.1	4 (94.01 %)	39.66 (99.95 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.97 %)	2 (0.45 %)	20 (2.92 %)	0 (0.00 %)
142	Ectromelia virus (Moscow 2002) GCF_000841905.1	173 (80.43 %)	33.18 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	45 (0.96 %)	22 (1.55 %)	1,122 (9.40 %)	0 (0.00 %)
143	Ekpoma virus 1 (EKV-1 2018) GCF_002815855.1	8 (98.40 %)	40.35 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (0.96 %)	0 (0.00 %)
144	Ekpoma virus 2 (EKV-2 2018) GCF_002815875.1	8 (96.76 %)	39.26 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.54 %)	1 (3.07 %)	16 (1.81 %)	0 (0.00 %)
145	Encephalomyocarditis virus (Ruckert 1993) GCF_000862985.1	3 (87.80 %)	49.47 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.68 %)	1 (1.68 %)	2 (1.83 %)	0 (0.00 %)
146	Enterovirus 5666/sin/002209 (2001) GCA_031116435.1	1 (88.81 %)	48.02 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (1.00 %)	1 (3.40 %)
147	Enterovirus 5865/sin/000009 (2001) GCA_031116425.1	1 (88.81 %)	48.03 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (1.15 %)	1 (3.40 %)
148	Enterovirus A (1994) GCF_000861905.1	1 (88.79 %)	47.94 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.09 %)	1 (3.32 %)
149	enterovirus A114 (V13-0285 2016) GCF_001684625.1	1 (89.76 %)	47.55 (99.97 %)	4 (0.05 %)	5 (99.95 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	1 (5.74 %)
150	Enterovirus A71 (BrCr 1996) GCA_008766895.1	1 (88.85 %)	47.66 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.63 %)	1 (5.09 %)
151	Enterovirus A71 (pinf7-54A 2005) GCA_031109255.1	1 (88.18 %)	47.90 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.72 %)	1 (0.72 %)	1 (0.74 %)	0 (0.00 %)
152	Enterovirus C (human poliovirus 1 Mahoney 1982) GCF_000861165.1	5 (98.35 %)	46.34 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.40 %)	1 (6.95 %)
153	Enterovirus D (Enterovirus 70 1993) GCF_000861205.1	1 (89.14 %)	42.80 (100.00 %)	3 (0.04 %)	4 (99.96 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
154	enterovirus D68 (Fermon 2018) GCF_002816725.1	1 (89.14 %)	41.07 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.27 %)	0 (0.00 %)
155	Eothenomys miletus hantavirus (LX309 2018) GCF_002827125.1	3 (91.02 %)	37.39 (99.94 %)	1 (0.01 %)	4 (99.99 %)	5 (0.87 %)	n/a	18 (2.75 %)	0 (0.00 %)
156	Epstein-Barr virus (Raji 2005) GCF_002402265.1	98 (77.44 %)	59.50 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	30 (0.66 %)	34 (5.62 %)	577 (10.56 %)	27 (45.97 %)
157	Epstein-Barr virus type 2 (AG876 2007) GCF_000872045.1	114 (68.90 %)	59.54 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	34 (0.79 %)	29 (5.78 %)	498 (10.10 %)	24 (45.98 %)
158	Equine herpesvirus 1 (Ab4 1993) GCA_000844025.1	81 (83.51 %)	56.66 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	23 (0.73 %)	28 (3.15 %)	306 (5.68 %)	2 (99.10 %)
159	Erve virus (2012) GCA_001629985.1	3 (97.03 %)	38.56 (99.96 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (0.67 %)	0 (0.00 %)
160	Escherichia phage Lambda (2000) GCF_000840245.1	92 (95.32 %)	49.86 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.20 %)	n/a	36 (0.81 %)	4 (51.36 %)
161	European bat 1 lyssavirus (RV9; 9395GER 2007) GCF_000870765.1	5 (90.43 %)	44.65 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (1.08 %)	0 (0.00 %)
162	European bat 2 lyssavirus (RV1333 2015) GCF_000871625.2	5 (90.69 %)	44.80 (100.00 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (0.50 %)	0 (0.00 %)
163	European brown hare syndrome virus (EBHSV-GD 2000) GCF_000857785.1	2 (98.66 %)	49.34 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.79 %)	1 (3.24 %)
164	Fathead minnow calicivirus (FHMCV/USA/MN/2012 2017) GCF_002285005.1	2 (98.66 %)	50.67 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (1.25 %)	3 (65.78 %)
165	Feline calicivirus (2023) GCF_008767155.1	2 (95.03 %)	46.14 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (1.22 %)	0 (0.00 %)
166	Feline calicivirus (Urbana 2003) GCF_000853345.1	3 (100.00 %)	45.17 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.39 %)	0 (0.00 %)
167	Fiwi virus (FIWIV CH17 2023) GCF_023131885.1	7 (94.31 %)	53.32 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.81 %)	4 (7.96 %)
168	Foot-and-mouth disease virus O (O6 o6pirbright iso58 2018) GCF_002816555.1	1 (85.34 %)	53.82 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.30 %)	2 (0.34 %)	2 (90.85 %)
169	Fort Sherman virus (86MSP18 2019) GCF_004789975.1	4 (95.36 %)	34.88 (99.93 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.80 %)	n/a	19 (1.87 %)	0 (0.00 %)
170	Fugong virus (FG10 2017) GCF_002118945.1	3 (93.43 %)	36.93 (99.97 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.38 %)	n/a	15 (1.61 %)	0 (0.00 %)
171	Gallid alphaherpesvirus 1 (SA-2 1999) GCA_000847005.2	90 (80.77 %)	47.74 (99.98 %)	n/a	14 (100.00 %)	11 (0.22 %)	9 (0.61 %)	221 (1.97 %)	23 (30.48 %)
172	Gallid alphaherpesvirus 3 (HPRS24 2000) GCF_000838845.1	78 (74.47 %)	53.61 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	47 (1.57 %)	60 (2.83 %)	387 (6.28 %)	1 (99.49 %)
173	Gammapapillomavirus sp. (GammaDyskD_w07c34d 2019) GCF_004131625.1	6 (92.05 %)	35.95 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.82 %)	1 (0.86 %)	23 (5.21 %)	0 (0.00 %)
174	Gammapapillomavirus sp. (Gammai915_ga2c70 2019) GCF_004131645.1	7 (92.78 %)	37.08 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.56 %)	8 (1.03 %)	0 (0.00 %)
175	Gammapapillomavirus sp. (GammaiCH2_EV03c434 2019) GCF_004131665.1	7 (92.78 %)	35.74 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	18 (2.66 %)	1 (3.79 %)
176	Gammapapillomavirus sp. (Gamma_LCOSOc196 2019) GCF_004131525.1	7 (92.90 %)	37.15 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	21 (3.44 %)	1 (3.35 %)
177	Gammapapillomavirus sp. (Gamma_w11C51 2019) GCF_004131545.1	7 (93.37 %)	36.15 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.31 %)	n/a	9 (1.36 %)	0 (0.00 %)
178	Gammapapillomavirus sp. (Gamma_w23c08c 2019) GCF_004131565.1	7 (92.58 %)	37.70 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.48 %)	n/a	12 (1.77 %)	0 (0.00 %)
179	Gammapapillomavirus sp. (Gamma_w27c03a 2019) GCF_004131685.1	7 (93.31 %)	38.27 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.19 %)	1 (3.22 %)
180	Gammapapillomavirus sp. (Gamma_w27c157c 2019) GCF_004131585.1	6 (92.56 %)	35.63 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.28 %)	n/a	14 (1.98 %)	0 (0.00 %)
181	Gammapapillomavirus sp. (Gamma_w34c04a 2019) GCF_004131605.1	6 (92.68 %)	35.88 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	21 (3.39 %)	0 (0.00 %)
182	GB virus C (1996) GCF_000862005.1	1 (91.81 %)	59.09 (99.98 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	15 (1.67 %)	2 (82.30 %)
183	Gemycircularvirus (HV-GcV1 2016) GCF_001679855.1	4 (85.16 %)	52.74 (99.82 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.31 %)	2 (84.05 %)
184	Gemycircularvirus (HV-GcV2 2016) GCF_001679875.1	3 (86.34 %)	53.63 (99.91 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.40 %)	1 (88.59 %)
185	Gemycircularvirus (SL1 2015) GCF_000973195.1	3 (87.86 %)	50.89 (99.82 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.46 %)	1 (1.46 %)	1 (1.46 %)	1 (90.45 %)
186	Gemycircularvirus C1c (GemyC1c 2018) GCF_002826005.1	1 (45.38 %)	50.12 (99.81 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (2.42 %)	1 (2.42 %)	3 (4.36 %)	2 (56.47 %)
187	Gemycircularvirus sp. (Vietnam 2023) GCF_018591295.1	3 (87.17 %)	47.97 (99.82 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.32 %)	1 (44.43 %)
188	GIII (Norovirus Bo/GIII.2/Adam/2006/No 2016) GCF_001595675.1	3 (99.14 %)	57.11 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (1.01 %)	6 (36.84 %)
189	Goatpox virus (Pellor 2002) GCF_000840165.1	150 (93.15 %)	25.31 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	51 (1.59 %)	8 (0.24 %)	1,548 (24.38 %)	0 (0.00 %)
190	Goose calicivirus (N 2014) GCF_000920715.1	2 (97.15 %)	54.67 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.25 %)	1 (41.13 %)
191	Great Island virus (CanAr 42 2010) GCF_000887635.1	11 (95.17 %)	57.79 (99.90 %)	n/a	10 (100.00 %)	4 (0.19 %)	n/a	17 (1.06 %)	10 (95.67 %)
192	Grotenhout virus (Gierle-1 2023) GCF_018594915.1	2 (86.62 %)	44.02 (99.96 %)	n/a	2 (100.00 %)	5 (0.45 %)	n/a	18 (1.68 %)	0 (0.00 %)
193	Guaroa virus (BeH22063 2017) GCF_002118805.1	5 (95.03 %)	34.13 (99.96 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.46 %)	n/a	10 (1.74 %)	0 (0.00 %)
194	Guenon simian foamy virus (Cercopithecus nictitans AG16 2019) GCF_003032775.1	6 (76.21 %)	38.62 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (1.09 %)	n/a	5 (0.38 %)	0 (0.00 %)
195	Gyrovirus (Tu243 2013) GCF_000913875.1	3 (75.54 %)	48.51 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (5.69 %)	1 (17.67 %)
196	Gyrovirus (Tu789 2013) GCF_000912415.1	3 (80.81 %)	52.68 (99.91 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (3.94 %)	12 (10.96 %)	1 (43.30 %)
197	Gyrovirus 4 (D137 2012) GCF_000899075.1	2 (74.58 %)	49.46 (99.80 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (3.88 %)	1 (43.41 %)
198	Gyrovirus GyV3 (FecGy 2012) GCF_000896975.1	3 (81.48 %)	52.70 (99.83 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.97 %)	n/a	6 (4.83 %)	1 (43.37 %)
199	Hantaan orthohantavirus (76-118 2003) GCF_000856085.1	3 (94.17 %)	38.56 (99.96 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (0.78 %)	0 (0.00 %)
200	Hantavirus (Z10 2004) GCF_000855785.1	3 (94.13 %)	39.29 (99.96 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.38 %)	1 (0.30 %)	14 (1.40 %)	0 (0.00 %)
201	Heartland virus (Patient1 2014) GCF_000922255.1	4 (96.17 %)	46.33 (99.94 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.27 %)	0 (0.00 %)
202	Heartland virus (TN 2023) GCF_013086545.1	4 (96.63 %)	46.52 (99.94 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.18 %)	0 (0.00 %)
203	Hendra henipavirus (1998) GCF_000852685.1	9 (82.12 %)	39.43 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.38 %)	n/a	13 (0.75 %)	0 (0.00 %)
204	Hepacivirus platyrrhini (2018) GCF_002820785.1	1 (94.01 %)	50.47 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.30 %)	1 (0.30 %)	4 (0.52 %)	2 (5.22 %)
205	Hepatitis B virus (2015) GCF_000861825.2	4 (55.31 %)	48.46 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	1 (12.45 %)
206	Hepatitis C virus genotype 1 (H77 1997) GCF_000861845.1	3 (93.68 %)	58.24 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.33 %)	6 (1.40 %)	13 (2.88 %)	1 (90.43 %)
207	Hepatitis C virus genotype 3 (NZL1 2007) GCF_000874285.1	3 (95.88 %)	55.65 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.33 %)	n/a	8 (0.95 %)	6 (52.40 %)
208	Hepatitis C virus genotype 4 (ED43 2007) GCF_000874265.1	3 (96.50 %)	56.18 (100.00 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	5 (0.66 %)	n/a	5 (0.51 %)	4 (70.23 %)
209	Hepatitis C virus genotype 5 (EUH1480 2007) GCF_000873605.1	3 (96.81 %)	57.09 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	14 (1.62 %)	3 (70.82 %)
210	Hepatitis C virus genotype 7 (QC69 2016) GCF_001712785.1	3 (95.88 %)	56.81 (99.97 %)	12 (0.13 %)	13 (99.87 %)	4 (0.27 %)	1 (0.26 %)	8 (0.84 %)	10 (48.13 %)
211	hepatitis D virus 1 (TW2667 2023) GCF_018547865.1	2 (38.48 %)	58.93 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (3.46 %)	1 (1.97 %)	3 (4.47 %)	1 (80.79 %)
212	hepatitis D virus 2 (TW2476 2023) GCF_018547875.1	2 (38.30 %)	59.58 (99.76 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (2.02 %)	1 (72.92 %)
213	hepatitis D virus 4 (TW-2b Taiwan isolate 2023) GCF_003033645.1	1 (34.90 %)	60.66 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.42 %)	1 (99.52 %)
214	Hepatitis delta virus (1993) GCF_000856565.1	2 (38.35 %)	58.81 (99.88 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.68 %)	1 (3.63 %)	1 (71.11 %)
215	Hepatitis delta virus (dFr2005 2023) GCF_018547925.1	1 (38.42 %)	60.24 (99.88 %)	8 (0.47 %)	9 (99.53 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (4.51 %)	1 (80.44 %)
216	Hepatitis delta virus (dFr2072 2023) GCF_018547915.1	1 (35.06 %)	60.78 (99.94 %)	3 (0.24 %)	4 (99.76 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (4.94 %)	1 (76.26 %)
217	Hepatitis delta virus (dFr2158 2023) GCF_018547935.1	1 (38.90 %)	60.42 (99.76 %)	15 (0.96 %)	16 (99.04 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (3.70 %)	1 (96.83 %)
218	Hepatitis delta virus (VnzD8349 2023) GCF_018547805.1	1 (35.22 %)	60.46 (99.82 %)	10 (0.72 %)	11 (99.28 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.54 %)	2 (87.09 %)
219	Hepatovirus A (1993) GCF_000860505.1	3 (100.00 %)	37.87 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.45 %)	1 (0.47 %)	1 (0.53 %)	0 (0.00 %)
220	Hepatovirus A (2ID 2023) GCA_008776015.1	1 (89.26 %)	33.72 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.57 %)	n/a	12 (3.99 %)	0 (0.00 %)
221	Herpes simplex virus type 1 (17 1990) GCF_000859985.2	81 (86.40 %)	68.30 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	81 (2.72 %)	51 (2.90 %)	932 (18.12 %)	1 (100.00 %)
222	Herpes simplex virus type 1 (HSV-H15119 2019) GCA_027936425.1	80 (76.71 %)	68.05 (100.00 %)	1 (0.00 %)	2 (100.00 %)	92 (2.63 %)	60 (4.91 %)	1,082 (18.73 %)	1 (100.00 %)
223	HMO Astrovirus A (NI-295 2009) GCF_000884395.1	4 (97.57 %)	43.54 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.11 %)	0 (0.00 %)
224	Hudisavirus sp. (P22 2017) GCF_002375055.1	2 (81.59 %)	51.99 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.86 %)	1 (1.08 %)	3 (1.39 %)	2 (18.65 %)
225	human adenovirus 1 (2004) GCF_000858645.1	44 (91.94 %)	55.26 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	12 (0.98 %)	2 (0.11 %)	103 (4.79 %)	6 (70.17 %)
226	human adenovirus 2 (2004) GCF_000859465.1	42 (90.84 %)	55.20 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	13 (0.89 %)	1 (0.12 %)	105 (4.66 %)	5 (70.08 %)
227	human adenovirus 35 (2004) GCF_000857885.1	44 (93.67 %)	48.88 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (0.68 %)	3 (0.30 %)	80 (3.56 %)	6 (39.41 %)
228	human adenovirus 5 (2004) GCF_000857865.1	42 (90.68 %)	55.20 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	12 (0.95 %)	n/a	99 (4.47 %)	5 (69.88 %)
229	human adenovirus 54 (Kobe-H 2009) GCF_000885675.1	40 (91.15 %)	54.91 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	9 (0.74 %)	n/a	65 (2.61 %)	3 (66.98 %)
230	human adenovirus 7 (2004) GCF_000859485.1	45 (92.24 %)	51.27 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	9 (0.56 %)	1 (1.54 %)	61 (2.28 %)	7 (43.72 %)
231	human alphaherpesvirus 2 (HG52 2013) GCF_000858385.2	86 (83.37 %)	70.38 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	124 (3.80 %)	64 (3.26 %)	1,158 (23.65 %)	1 (99.99 %)
232	human associated cyclovirus 10 (7078A 2014) GCF_000918035.2	2 (86.20 %)	43.41 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
233	human associated gemyvongvirus 1 (DB1 2015) GCF_001448435.1	4 (89.04 %)	51.81 (99.91 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.89 %)	1 (1.89 %)	1 (2.24 %)	1 (97.10 %)
234	human associated huchismacovirus 1 (Oregon/6/2011/GottageGrove/5A1 2018) GCF_003033475.1	2 (69.15 %)	42.76 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
235	human associated huchismacovirus 2 (France/8/2008/2444 2018) GCF_003033485.1	2 (69.81 %)	43.97 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.38 %)	2 (0.57 %)	0 (0.00 %)
236	human associated huchismacovirus 3 (France/1/2009/3664 2018) GCF_003033495.1	2 (70.27 %)	42.28 (99.84 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (1.79 %)	0 (0.00 %)
237	Human associated porprismacovirus (16845x3_952 2023) GCF_018583805.1	2 (70.54 %)	47.72 (99.92 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.58 %)	0 (0.00 %)
238	human associated porprismacovirus 2 (SF2 2015) GCF_000931315.1	2 (74.85 %)	48.83 (99.84 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.55 %)	1 (41.76 %)
239	Human associated porprismacovirus 3 (16806x66_213 2023) GCF_018583635.1	2 (72.49 %)	48.72 (99.87 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (1.72 %)	1 (9.00 %)
240	human astrovirus (1993) GCF_000861865.1	3 (97.58 %)	44.83 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.88 %)	1 (1.34 %)	9 (2.08 %)	0 (0.00 %)
241	human astrovirus BF34 (BF34 2014) GCF_000923215.1	4 (97.29 %)	43.77 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.47 %)	0 (0.00 %)
242	human betaherpesvirus 5 (Merlin 2004) GCF_000845245.1	194 (84.91 %)	57.48 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	74 (1.33 %)	28 (0.67 %)	1,047 (7.96 %)	1 (99.99 %)
243	human betaherpesvirus 6A (U1102 1995 refseq) GCF_000845685.2	115 (79.56 %)	42.44 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	33 (1.67 %)	36 (4.27 %)	603 (9.83 %)	3 (13.72 %)
244	human betaherpesvirus 6B (Z29 1999) GCF_000846365.1	128 (82.45 %)	42.77 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	27 (1.57 %)	20 (3.84 %)	652 (8.84 %)	6 (15.35 %)
245	human betaherpesvirus 7 (RK 1995) GCF_000848125.1	111 (79.51 %)	36.22 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	16 (1.65 %)	34 (8.04 %)	791 (15.85 %)	3 (5.14 %)
246	human bocavirus 2c PK (PK-5510 2009) GCF_000882675.1	4 (87.74 %)	41.59 (99.98 %)	1 (0.02 %)	2 (99.98 %)	5 (1.23 %)	n/a	5 (0.98 %)	0 (0.00 %)
247	human bocavirus 3 (W471 2009) GCF_000882855.1	4 (88.44 %)	42.16 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (1.95 %)	1 (4.96 %)
248	human bocavirus 4 NI (HBoV4-NI-385 2009) GCF_000886375.1	6 (92.83 %)	40.41 (99.92 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (1.06 %)	0 (0.00 %)
249	human circovirus VS6600022 (VS6600022 2014) GCF_000924015.1	4 (85.08 %)	47.13 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.85 %)	n/a	1 (0.25 %)	2 (49.61 %)
250	human coronavirus 229E (2001) GCF_000853505.1	9 (97.14 %)	38.26 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.31 %)	2 (0.29 %)	57 (2.91 %)	0 (0.00 %)
251	human coronavirus HKU1 (HKU1 2004) GCF_000858765.1	10 (98.07 %)	32.06 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (0.72 %)	1 (1.60 %)	89 (5.62 %)	0 (0.00 %)
252	human coronavirus NL63 (Amsterdam I 2004) GCF_000853865.1	8 (97.86 %)	34.46 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	9 (1.09 %)	n/a	84 (5.24 %)	0 (0.00 %)
253	human coronavirus OC43 (ATCC VR-759 2019) GCF_003972325.1	11 (97.82 %)	36.79 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (0.43 %)	1 (0.09 %)	90 (3.88 %)	0 (0.00 %)
254	human cosavirus (Cosavirus_Amsterdam_1994 2014) GCF_000920655.1	1 (81.59 %)	43.53 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (1.59 %)	0 (0.00 %)
255	human cosavirus B (HCoSV-B1 2263 2009) GCF_000884955.1	1 (88.49 %)	43.79 (100.00 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	4 (0.47 %)	n/a	6 (1.35 %)	0 (0.00 %)
256	Human CSF-associated densovirus (21 2023) GCF_029883595.1	5 (90.42 %)	40.04 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.66 %)	n/a	2 (0.38 %)	0 (0.00 %)
257	human cyclovirus VS5700009 (VS5700009 2013) GCF_000908835.1	3 (84.17 %)	46.45 (99.89 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.38 %)	1 (13.92 %)
258	human DNA virus (IND-KIs-REVA-1990 2019) GCF_003727435.1	1 (6.26 %)	53.36 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (1.89 %)	n/a	3 (0.59 %)	1 (93.16 %)
259	human endogenous retrovirus K113 (2013) GCF_000913595.1	1 (22.17 %)	41.86 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (1.60 %)	n/a	14 (2.49 %)	0 (0.00 %)
260	human enterovirus 71 HZ08/Hangzhou/2008 (HZ08 2011) GCA_031128755.1	1 (88.89 %)	47.98 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.14 %)	1 (4.77 %)
261	human erythrovirus V9 (V9 2001) GCF_000841965.1	6 (90.67 %)	42.09 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (1.75 %)	0 (0.00 %)
262	human fecal virus Jorvi2 (Jorvi2 2017) GCF_002219885.1	5 (72.08 %)	31.11 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (5.43 %)	n/a	20 (11.11 %)	0 (0.00 %)
263	human fecal virus Jorvi3 (Jorvi3 2017) GCF_002219525.1	2 (84.04 %)	32.53 (99.90 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (1.60 %)	0 (0.00 %)
264	human fecal virus Jorvi4 (Jorvi4 2017) GCF_002219705.1	2 (81.18 %)	45.77 (99.87 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.34 %)	0 (0.00 %)
265	human feces pecovirus (PeCV-NI 2019) GCF_003726995.1	2 (72.77 %)	50.00 (99.90 %)	1 (0.03 %)	2 (99.97 %)	5 (2.46 %)	n/a	0 (0.00 %)	1 (55.12 %)
266	human feces smacovirus 2 (SmaCV2 2018) GCF_003033575.1	2 (74.86 %)	46.00 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.54 %)	1 (19.22 %)
267	human feces smacovirus 3 (SmaCV3.21 P21 2017) GCF_002271185.1	2 (72.89 %)	46.99 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (2.66 %)	1 (1.56 %)	4 (1.25 %)	0 (0.00 %)
268	Human feces smacovirus 3 (SmaCV3_ETH_P15_2016 2023) GCF_003963575.1	2 (72.88 %)	47.89 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.91 %)	2 (0.56 %)	1 (24.13 %)
269	human gammaherpesvirus 8 (BCBL-1 2019) GCA_027939675.1	n/a	53.47 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (0.10 %)	29 (2.97 %)	135 (3.68 %)	8 (83.99 %)
270	human gammaherpesvirus 8 (GK18 2007) GCF_000838265.1	113 (85.53 %)	53.76 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	10 (0.18 %)	29 (2.88 %)	151 (3.93 %)	9 (84.42 %)
271	human gammaherpesvirus 8 (JSC-1 2009) GCA_027939395.1	102 (83.23 %)	53.77 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	11 (1.00 %)	29 (3.04 %)	198 (4.58 %)	9 (84.78 %)
272	human gammaherpesvirus 8 (JSC-1 2019) GCA_027939375.1	102 (83.23 %)	53.78 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	11 (1.00 %)	29 (3.04 %)	198 (4.58 %)	9 (84.78 %)
273	human gammaherpesvirus 8 (JSC-1 2021) GCA_027939385.1	102 (83.23 %)	53.77 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	11 (1.00 %)	29 (3.04 %)	198 (4.58 %)	9 (84.78 %)
274	human gammaherpesvirus 8 (UNC_BCBL-1 2022) GCA_027939455.1	114 (84.22 %)	53.75 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	10 (0.18 %)	29 (2.87 %)	145 (3.86 %)	9 (84.42 %)
275	human gemycircularvirus (GeTz1 2018) GCF_002826025.1	4 (77.38 %)	49.05 (99.91 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (1.23 %)	0 (0.00 %)
276	human genital-associated circular DNA virus-1 (349 2015) GCF_000973295.1	4 (80.18 %)	54.85 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (1.21 %)	1 (91.86 %)
277	human hepegivirus (AK-790 2018) GCF_002821385.1	1 (96.18 %)	53.60 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.51 %)	2 (88.97 %)
278	human immunodeficiency virus 1 (1998) GCF_000864765.1	14 (93.78 %)	42.11 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.57 %)	1 (0.34 %)	18 (3.29 %)	1 (2.29 %)
279	human immunodeficiency virus 2 (BEN 1993) GCF_000856385.1	12 (84.81 %)	45.66 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.98 %)	10 (1.44 %)	0 (0.00 %)
280	Human lung-associated brisavirus AA (2023) GCA_014883685.1	3 (85.41 %)	34.45 (99.87 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.12 %)	1 (1.25 %)	3 (6.59 %)	0 (0.00 %)
281	Human lung-associated brisavirus II (2023) GCA_014883695.1	3 (86.04 %)	33.48 (99.90 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.16 %)	1 (1.36 %)	2 (4.96 %)	0 (0.00 %)
282	Human lung-associated brisavirus MD (2023) GCA_014883705.1	3 (77.31 %)	33.41 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.15 %)	2 (2.62 %)	5 (6.75 %)	0 (0.00 %)
283	Human lung-associated brisavirus RC (2023) GCA_014883715.1	3 (88.73 %)	35.17 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (2.45 %)	1 (1.35 %)	3 (5.95 %)	0 (0.00 %)
284	human lung-associated vientovirus FB (2021) GCF_013088445.1	3 (86.49 %)	33.94 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.15 %)	1 (1.34 %)	3 (6.81 %)	0 (0.00 %)
285	human mastadenovirus A (2004) GCF_000884295.1	41 (94.00 %)	46.52 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (0.61 %)	n/a	73 (3.33 %)	6 (30.52 %)
286	human mastadenovirus A (Huie 1993) GCF_000846805.1	43 (94.41 %)	46.52 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (0.61 %)	n/a	73 (3.33 %)	6 (30.52 %)
287	human mastadenovirus B (GB 2008) GCF_000880515.1	48 (93.42 %)	51.05 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (0.47 %)	1 (0.18 %)	41 (1.61 %)	7 (43.26 %)
288	human mastadenovirus B (Slobitski 2008) GCF_000857085.1	46 (93.74 %)	48.88 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	10 (0.82 %)	3 (0.30 %)	50 (2.47 %)	6 (39.41 %)
289	human mastadenovirus C (1993) GCF_000845085.1	63 (97.51 %)	55.20 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	13 (0.89 %)	1 (0.12 %)	105 (4.66 %)	5 (70.08 %)
290	human mastadenovirus D (2004) GCF_000858625.1	21 (47.83 %)	56.58 (100.00 %)	4 (0.01 %)	5 (99.99 %)	12 (1.24 %)	n/a	61 (3.14 %)	3 (66.84 %)
291	human mastadenovirus D (Hicks; NIAID V-209-003-014 2008) GCF_000845985.1	47 (93.93 %)	57.10 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	10 (0.92 %)	1 (0.13 %)	59 (2.95 %)	3 (67.41 %)
292	human mastadenovirus E (vaccine (CL 68578) 2001) GCF_000859665.1	40 (96.48 %)	57.67 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	9 (0.65 %)	n/a	107 (4.08 %)	5 (73.25 %)
293	human mastadenovirus F (Dugan 1993) GCF_000846685.1	44 (94.91 %)	51.22 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (0.32 %)	n/a	63 (2.23 %)	1 (62.53 %)
294	human metapneumovirus (00-1 2018) GCF_002815375.1	9 (93.36 %)	36.29 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (1.38 %)	1 (0.34 %)	27 (3.46 %)	0 (0.00 %)
295	human orthopneumovirus (2018) GCF_002815475.1	12 (97.34 %)	33.24 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.64 %)	1 (0.24 %)	19 (3.32 %)	0 (0.00 %)
296	human orthopneumovirus (B1 1997) GCF_000855545.1	10 (97.35 %)	33.56 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	11 (1.61 %)	2 (0.52 %)	16 (3.21 %)	0 (0.00 %)
297	human orthorubulavirus 2 (1991) GCF_000863525.1	8 (98.61 %)	38.41 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.38 %)	n/a	6 (0.27 %)	0 (0.00 %)
298	human papillomavirus (SE379 2015) GCF_001274345.1	6 (93.54 %)	37.49 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.98 %)	1 (2.70 %)	21 (3.02 %)	0 (0.00 %)
299	human papillomavirus 103 (Qv33725 2006) GCF_000868225.1	6 (88.01 %)	41.58 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.45 %)	n/a	19 (3.06 %)	0 (0.00 %)
300	human papillomavirus 108 (2009) GCF_000883655.1	5 (88.56 %)	42.65 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (1.38 %)	0 (0.00 %)
301	human papillomavirus 109 (2009) GCF_000883695.1	7 (92.87 %)	38.28 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.94 %)	1 (0.48 %)	19 (3.13 %)	1 (3.23 %)
302	human papillomavirus 116 (HPV116 2009) GCF_000884175.1	7 (93.82 %)	38.50 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.40 %)	1 (4.73 %)
303	human papillomavirus 121 (NJ3301 2010) GCF_000889075.1	7 (92.45 %)	37.74 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.41 %)	n/a	9 (0.98 %)	0 (0.00 %)
304	human papillomavirus 126 (HPV126 2011) GCF_000896435.1	7 (91.96 %)	38.05 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	18 (2.68 %)	1 (2.92 %)
305	human papillomavirus 127 (R3a 2010) GCF_000890115.1	8 (93.50 %)	36.98 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	2 (0.79 %)	18 (2.79 %)	1 (3.20 %)
306	human papillomavirus 132 (27-50 2011) GCF_000888015.1	7 (93.36 %)	37.94 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (1.89 %)	0 (0.00 %)
307	human papillomavirus 134 (39-65 2011) GCF_000889695.1	7 (92.69 %)	38.14 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (1.48 %)	0 (0.00 %)
308	human papillomavirus 135 (NJ3500 2012) GCF_000898235.1	7 (92.24 %)	36.86 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.56 %)	1 (0.67 %)	14 (2.77 %)	0 (0.00 %)
309	human papillomavirus 136 (CL3865 2012) GCF_000899695.1	7 (91.83 %)	38.51 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.85 %)	n/a	19 (3.31 %)	0 (0.00 %)
310	human papillomavirus 140 (NJ2801C1 2012) GCF_000898855.1	7 (91.69 %)	39.71 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.79 %)	n/a	4 (1.28 %)	0 (0.00 %)
311	human papillomavirus 154 (PV77 2013) GCF_000908695.1	7 (92.75 %)	37.93 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (1.37 %)	0 (0.00 %)
312	human papillomavirus 161 (KC1 2018) GCF_002826985.1	6 (92.39 %)	37.73 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.36 %)	0 (0.00 %)
313	human papillomavirus 163 (KC3 2015) GCF_001430115.1	6 (93.54 %)	37.69 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (1.80 %)	0 (0.00 %)
314	human papillomavirus 166 (KC9 2012) GCF_000899515.1	6 (92.72 %)	38.29 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.79 %)	0 (0.00 %)
315	human papillomavirus 167 (KC10 2013) GCF_000913075.1	6 (92.78 %)	35.83 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	23 (5.24 %)	0 (0.00 %)
316	human papillomavirus 172 (2018) GCF_002827005.1	7 (95.04 %)	37.77 (99.96 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	5 (1.22 %)	n/a	4 (0.60 %)	0 (0.00 %)
317	human papillomavirus 175 (SE87 2018) GCF_002827025.1	7 (93.05 %)	38.87 (99.99 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	4 (0.29 %)	n/a	8 (1.00 %)	1 (3.46 %)
318	human papillomavirus 178 (2014) GCF_000918095.1	7 (92.49 %)	38.15 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.53 %)	2 (0.59 %)	8 (1.35 %)	0 (0.00 %)
319	human papillomavirus 179 (SIBX16 2013) GCF_000912535.1	6 (92.78 %)	36.76 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.87 %)	n/a	7 (1.67 %)	0 (0.00 %)
320	human papillomavirus 18 (2000) GCF_000865665.1	8 (87.96 %)	40.43 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.70 %)	n/a	12 (3.67 %)	0 (0.00 %)
321	human papillomavirus 184 (SIBX17 2018) GCF_002987365.1	6 (92.71 %)	36.89 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.98 %)	1 (0.53 %)	4 (0.40 %)	0 (0.00 %)
322	human papillomavirus 187 (ACS447 2018) GCF_003055605.1	6 (92.85 %)	38.90 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (1.36 %)	0 (0.00 %)
323	human papillomavirus 201 (HPV201 2015) GCF_001184845.1	7 (93.33 %)	37.71 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.48 %)	n/a	5 (0.95 %)	0 (0.00 %)
324	human papillomavirus 203 (SE369 2019) GCF_004133345.1	7 (92.96 %)	37.54 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.43 %)	n/a	10 (1.33 %)	0 (0.00 %)
325	human papillomavirus 204 (A342 2018) GCF_002827045.1	7 (92.47 %)	37.84 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.50 %)	n/a	6 (1.44 %)	1 (2.92 %)
326	human papillomavirus 30 (2018) GCF_002987345.1	6 (84.46 %)	40.39 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.31 %)	2 (1.03 %)	14 (4.22 %)	0 (0.00 %)
327	human papillomavirus 4 (1993) GCF_000864845.1	7 (92.18 %)	38.53 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.71 %)	1 (0.35 %)	23 (3.75 %)	0 (0.00 %)
328	human papillomavirus 5 (1993) GCF_000866505.1	8 (92.64 %)	42.39 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	9 (2.94 %)	1 (0.39 %)	13 (3.01 %)	1 (7.11 %)
329	human papillomavirus 71 (2018) GCF_002826825.1	1 (24.06 %)	44.38 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (2.47 %)	3 (1.63 %)	11 (3.93 %)	0 (0.00 %)
330	human papillomavirus 9 (1993) GCF_000863685.1	7 (94.00 %)	41.00 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.14 %)	2 (0.93 %)	13 (2.45 %)	1 (4.63 %)
331	human papillomavirus KC5 (KC5 2015) GCF_000989155.1	7 (92.99 %)	36.78 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.71 %)	0 (0.00 %)
332	human papillomavirus type 10 (1993) GCF_000864905.1	7 (84.68 %)	45.89 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.78 %)	n/a	16 (3.86 %)	0 (0.00 %)
333	human papillomavirus type 101 (Qv23954 2006) GCF_000869845.1	6 (89.06 %)	43.12 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.33 %)	n/a	5 (0.61 %)	0 (0.00 %)
334	human papillomavirus type 112 (2009) GCF_000882135.1	7 (93.62 %)	37.52 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.73 %)	1 (3.81 %)
335	human papillomavirus type 128 (2011) GCF_000889675.1	7 (92.33 %)	35.98 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	16 (3.18 %)	0 (0.00 %)
336	human papillomavirus type 129 (2011) GCF_000891495.1	7 (93.07 %)	37.31 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.82 %)	n/a	3 (0.35 %)	0 (0.00 %)
337	human papillomavirus type 131 (27-49 2011) GCF_000890535.1	7 (93.15 %)	37.03 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	17 (2.73 %)	0 (0.00 %)
338	human papillomavirus type 137 (NJ2801H 2012) GCF_000897255.1	7 (93.60 %)	37.57 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.32 %)	n/a	16 (2.39 %)	0 (0.00 %)
339	human papillomavirus type 144 (CL3740 2012) GCF_000898255.1	7 (92.09 %)	38.23 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (1.32 %)	0 (0.00 %)
340	human papillomavirus type 156 (GC01 2017) GCF_002006915.1	7 (92.47 %)	36.18 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (1.86 %)	0 (0.00 %)
341	human papillomavirus type 16 (1993) GCF_000863945.3	11 (87.67 %)	36.53 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (3.26 %)	1 (0.32 %)	12 (4.50 %)	0 (0.00 %)
342	human papillomavirus type 26 (1993) GCF_000866485.1	6 (84.85 %)	38.60 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (2.74 %)	2 (0.45 %)	14 (5.89 %)	0 (0.00 %)
343	human papillomavirus type 32 (1993) GCF_000864925.1	6 (84.42 %)	40.98 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.83 %)	n/a	9 (1.96 %)	0 (0.00 %)
344	human papillomavirus type 34 (1993) GCF_000863965.1	6 (85.10 %)	38.25 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (2.33 %)	3 (1.17 %)	8 (3.52 %)	0 (0.00 %)
345	human papillomavirus type 41 (1991) GCF_000863845.1	11 (90.82 %)	46.94 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.45 %)	n/a	3 (0.28 %)	1 (3.68 %)
346	human papillomavirus type 48 (1995) GCF_000839365.1	7 (93.41 %)	36.76 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.58 %)	18 (3.61 %)	1 (4.07 %)
347	human papillomavirus type 49 (1993) GCF_000862825.1	6 (93.19 %)	41.11 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.81 %)	n/a	11 (2.66 %)	0 (0.00 %)
348	human papillomavirus type 50 (1995) GCF_000841625.1	7 (92.78 %)	36.85 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.53 %)	14 (2.00 %)	0 (0.00 %)
349	human papillomavirus type 53 (1993) GCF_000865685.1	7 (66.96 %)	40.14 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (2.47 %)	n/a	24 (6.16 %)	0 (0.00 %)
350	human papillomavirus type 54 (1995) GCF_000864725.1	7 (84.57 %)	41.88 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.32 %)	n/a	9 (3.05 %)	0 (0.00 %)
351	human papillomavirus type 60 (1995) GCF_000838505.1	7 (92.85 %)	36.94 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.83 %)	n/a	12 (2.15 %)	1 (3.27 %)
352	human papillomavirus type 63 (1993) GCF_000865565.1	7 (91.55 %)	40.44 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.20 %)	1 (0.59 %)	5 (0.53 %)	0 (0.00 %)
353	human papillomavirus type 6b (type 6b (HPV6b) 1985) GCF_000861945.1	9 (89.64 %)	40.87 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.39 %)	1 (0.76 %)	15 (3.21 %)	0 (0.00 %)
354	human papillomavirus type 7 (1993) GCF_000861925.1	6 (82.97 %)	39.53 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (1.73 %)	1 (0.59 %)	13 (3.49 %)	0 (0.00 %)
355	human papillomavirus type 85 (114B 2017) GCF_002153865.1	8 (90.54 %)	37.76 (98.31 %)	7 (1.95 %)	8 (98.05 %)	3 (0.00 %)	n/a	17 (4.34 %)	0 (0.00 %)
356	human papillomavirus type 88 (2008) GCF_000874925.1	7 (92.19 %)	40.11 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.35 %)	6 (0.71 %)	1 (4.00 %)
357	human papillomavirus type 90 (2002) GCF_000862685.1	7 (82.73 %)	46.65 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.95 %)	n/a	10 (3.96 %)	1 (2.53 %)
358	human papillomavirus type 92 (2003) GCF_000846285.1	7 (93.86 %)	39.96 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (2.48 %)	3 (1.50 %)	7 (2.92 %)	1 (4.21 %)
359	human papillomavirus type 96 (2003) GCF_000864825.1	7 (97.38 %)	40.31 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.81 %)	n/a	21 (3.83 %)	1 (4.33 %)
360	human parainfluenza virus 4a (M-25 2013) GCF_000910675.1	7 (83.27 %)	36.23 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.23 %)	1 (0.22 %)	13 (1.18 %)	0 (0.00 %)
361	human parechovirus 1 (2018) GCF_002817305.1	1 (89.15 %)	39.06 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (1.29 %)	0 (0.00 %)
362	human parvovirus 4 G1 (2005) GCF_000861005.1	2 (89.92 %)	44.94 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.87 %)	2 (1.52 %)	4 (0.70 %)	1 (3.85 %)
363	human parvovirus B19 (J35 1999) GCF_000839645.1	6 (81.47 %)	43.81 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	4 (2.93 %)	13 (4.72 %)	2 (12.12 %)
364	human pegivirus 2 (UC0125.US 2015) GCF_001310135.2	1 (92.98 %)	53.96 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.49 %)	2 (90.06 %)
365	human picobirnavirus (Hy005102 2005) GCF_000859285.1	3 (92.15 %)	46.02 (100.00 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
366	human poliovirus strain (Sabin 1 2023) GCA_008766755.1	1 (89.10 %)	46.26 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.23 %)	1 (7.15 %)
367	human polyomavirus 1 (1993) GCF_000837865.1	7 (89.15 %)	39.53 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	2 (2.45 %)	13 (4.13 %)	0 (0.00 %)
368	human polyomavirus 12 (hu1403 2013) GCF_000906235.1	6 (89.41 %)	39.60 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.64 %)	1 (0.91 %)	27 (6.74 %)	0 (0.00 %)
369	human polyomavirus 3 (Stockholm 60 2007) GCF_000873085.1	6 (88.17 %)	39.37 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.85 %)	26 (6.90 %)	0 (0.00 %)
370	human polyomavirus 6 (607a 2010) GCF_000888495.1	6 (89.67 %)	42.66 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.83 %)	0 (0.00 %)
371	human polyomavirus 7 (713a 2010) GCF_000889175.1	6 (89.14 %)	42.91 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (1.25 %)	0 (0.00 %)
372	human polyomavirus 9 (HPyV9 2011) GCF_000891615.1	6 (88.18 %)	39.16 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	20 (4.74 %)	0 (0.00 %)
373	Human PoSCV5-like circular virus (MRJ 2023) GCF_013087445.1	2 (86.31 %)	33.91 (99.90 %)	1 (0.03 %)	2 (99.97 %)	5 (2.29 %)	1 (1.36 %)	2 (5.00 %)	0 (0.00 %)
374	human respirovirus 1 (Washington 1964 2002) GCF_000848705.1	10 (99.19 %)	37.24 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (2.19 %)	1 (0.25 %)	4 (1.69 %)	0 (0.00 %)
375	human respirovirus 3 (1998) GCF_000850205.1	9 (93.58 %)	34.52 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (1.09 %)	n/a	11 (1.89 %)	0 (0.00 %)
376	Human respirovirus 3 (ZHYMgz01 Guangzhou 2023) GCF_006298365.1	6 (94.02 %)	35.29 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	11 (1.93 %)	n/a	13 (1.30 %)	0 (0.00 %)
377	human rhinovirus NAT001 (NAT001 2018) GCF_002816885.1	1 (92.58 %)	43.40 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
378	human rotavirus B (Bang373 2013) GCF_000907835.1	13 (95.17 %)	36.97 (99.88 %)	n/a	11 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	18 (1.22 %)	0 (0.00 %)
379	human RSV respiratory syncytial virus A (S2 ts1C 2000) GCF_000856445.1	13 (98.68 %)	33.21 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (0.89 %)	1 (0.26 %)	23 (3.73 %)	0 (0.00 %)
380	human smacovirus 1 (France/12/2008/3454 2015) GCF_000929235.1	2 (69.15 %)	43.94 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
381	human stool-associated circular virus NG13 (NG13 2018) GCF_002819605.1	2 (93.58 %)	43.54 (99.76 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (1.24 %)	0 (0.00 %)
382	human T-cell leukemia virus type I (1993) GCA_003102335.1	3 (59.99 %)	53.88 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	15 (2.55 %)	3 (15.21 %)
383	human T-cell leukemia virus type I (1998) GCF_000863585.1	11 (81.17 %)	53.47 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.33 %)	n/a	19 (2.50 %)	2 (12.06 %)
384	human T-lymphotropic virus 2 (1993) GCF_000847505.1	9 (94.24 %)	53.82 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.11 %)	n/a	16 (2.41 %)	2 (6.46 %)
385	human T-lymphotropic virus 4 (1863LE 2009) GCF_000882595.1	8 (77.85 %)	56.28 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.51 %)	n/a	30 (5.68 %)	3 (16.69 %)
386	human TMEV-like cardiovirus (2008) GCF_000875265.1	3 (86.45 %)	43.58 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.84 %)	0 (0.00 %)
387	Husavirus sp. (16370_59 2016) GCF_002374975.1	1 (98.06 %)	52.82 (99.99 %)	4 (0.05 %)	5 (99.95 %)	4 (0.37 %)	n/a	2 (0.25 %)	1 (99.41 %)
388	I virus (Cowden 2000) GCF_000849945.1	2 (99.13 %)	53.50 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.57 %)	1 (10.49 %)
389	IAS virus (2020) GCF_003443495.1	116 (90.03 %)	32.03 (99.98 %)	180 (0.31 %)	181 (99.69 %)	28 (1.11 %)	2 (0.08 %)	327 (5.48 %)	0 (0.00 %)
390	Igbo Ora virus (IBH10964 1998) GCA_002888815.1	2 (95.47 %)	48.08 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.42 %)	1 (1.24 %)	2 (0.48 %)	5 (13.59 %)
391	Ilesha virus (R5964 2019) GCF_004789595.1	4 (95.33 %)	32.35 (99.98 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.41 %)	n/a	21 (2.74 %)	0 (0.00 %)
392	Imjin virus (2017) GCF_002146225.1	3 (94.30 %)	36.50 (99.94 %)	n/a	3 (100.00 %)	6 (2.23 %)	6 (1.29 %)	9 (2.75 %)	0 (0.00 %)
393	Indian encephalitis associated cyclovirus (IECSF08 2017) GCF_001939215.2	3 (78.82 %)	43.78 (99.83 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.41 %)	0 (0.00 %)
394	Influenza A virus (A/California/07/2009 2015) GCF_001343785.1	14 (99.84 %)	43.70 (99.90 %)	4 (0.03 %)	12 (99.97 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (0.83 %)	0 (0.00 %)
395	Influenza A virus (A/Goose/Guangdong/1/96H5N1 2005) GCF_000864105.1	15 (96.68 %)	44.12 (99.93 %)	n/a	8 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.35 %)	0 (0.00 %)
396	Influenza A virus (A/Hong Kong/1073/99 2003) GCF_000851145.1	12 (97.14 %)	44.07 (99.90 %)	n/a	8 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (0.81 %)	0 (0.00 %)
397	Influenza A virus (A/Korea/426/1968 2005) GCF_000866645.1	15 (97.49 %)	43.41 (99.89 %)	1 (0.01 %)	9 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.28 %)	0 (0.00 %)
398	Influenza A virus (A/New York/392/2004 2005) GCF_000865085.1	15 (96.37 %)	42.94 (99.91 %)	n/a	8 (100.00 %)	4 (0.57 %)	n/a	6 (0.33 %)	0 (0.00 %)
399	Influenza A virus (A/Puerto Rico/8/1934 1982) GCF_000865725.1	15 (96.32 %)	43.40 (99.90 %)	n/a	8 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.68 %)	0 (0.00 %)
400	Influenza A virus (A/Shanghai/02/2013 2015) GCF_000928555.1	15 (99.34 %)	44.36 (99.92 %)	1 (0.01 %)	9 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.30 %)	0 (0.00 %)
401	Influenza B virus (B/Lee/1940 1993) GCF_000820495.2	11 (92.51 %)	40.19 (99.88 %)	n/a	8 (100.00 %)	5 (0.51 %)	n/a	23 (1.85 %)	0 (0.00 %)
402	Influenza C virus (C/Ann Arbor/1/50 2004) GCF_000856665.10	11 (95.87 %)	37.28 (99.91 %)	n/a	7 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	42 (4.23 %)	0 (0.00 %)
403	Influenza D virus (D/swine/Oklahoma/1334/2011 2018) GCF_002867775.1	9 (96.50 %)	41.45 (99.88 %)	n/a	7 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	23 (2.47 %)	0 (0.00 %)
404	Isfahan virus (2013) GCF_000906835.1	5 (96.29 %)	41.93 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	20 (1.82 %)	0 (0.00 %)
405	Issyk-Kul virus (LEIV-315K 2023) GCF_014883185.1	3 (95.40 %)	40.21 (99.95 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.22 %)	6 (0.25 %)	0 (0.00 %)
406	Japanese encephalitis virus (1993) GCF_000862145.1	3 (93.83 %)	51.43 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.15 %)	0 (0.00 %)
407	JC polyomavirus (Mad1 1993) GCF_000863805.1	9 (96.55 %)	40.45 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (3.82 %)	17 (5.52 %)	0 (0.00 %)
408	Jeju virus (10-11 2017) GCF_002117615.1	3 (93.96 %)	36.20 (99.94 %)	n/a	3 (100.00 %)	6 (1.02 %)	1 (0.28 %)	16 (2.20 %)	0 (0.00 %)
409	Jos virus (2023) GCF_023156725.1	6 (96.99 %)	46.01 (99.92 %)	1 (0.01 %)	7 (99.99 %)	4 (0.39 %)	n/a	15 (1.52 %)	0 (0.00 %)
410	Kander virus (CH17 2023) GCF_023155475.1	6 (94.29 %)	52.48 (99.99 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.32 %)	0 (0.00 %)
411	Kasokero virus (Z-52963 2018) GCF_002288735.2	3 (96.72 %)	42.73 (99.95 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.35 %)	n/a	29 (2.09 %)	0 (0.00 %)
412	Kenkeme virus (Fuyuan-Sr-326 2017) GCF_002146025.1	3 (95.18 %)	37.73 (99.95 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.26 %)	n/a	16 (1.40 %)	0 (0.00 %)
413	Kunjin virus (MRM61C 2023) GCA_004786635.1	1 (96.61 %)	50.58 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	1 (2.43 %)
414	Kyasanur Forest disease virus (2018) GCF_002820625.1	1 (98.80 %)	55.20 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.38 %)	n/a	1 (0.11 %)	3 (6.73 %)
415	La Crosse virus (human/78 2002) GCF_000850965.1	4 (94.68 %)	36.68 (99.95 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.32 %)	n/a	26 (2.75 %)	0 (0.00 %)
416	La Crosse virus (LACV/human/1960 2023) GCF_004789695.1	4 (94.68 %)	36.75 (99.96 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.32 %)	n/a	17 (1.56 %)	0 (0.00 %)
417	Lagos bat lyssavirus (0406SEN 2013) GCF_000905975.1	5 (90.15 %)	43.48 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.41 %)	0 (0.00 %)
418	Lake Victoria marburgvirus - (Leiden 2011) GCA_031129775.1	7 (76.60 %)	38.11 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.25 %)	0 (0.00 %)
419	Lake Victoria marburgvirus - Angola2005 (Ang1379c 2006) GCA_031121245.1	7 (98.72 %)	38.40 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (0.91 %)	0 (0.00 %)
420	Lake Victoria marburgvirus - Ci67 (2007) GCA_031121995.1	7 (98.72 %)	38.45 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.38 %)	0 (0.00 %)
421	Lake Victoria marburgvirus - DRC1999 (07DRC99 2006) GCA_031121255.1	7 (98.72 %)	38.19 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (1.27 %)	0 (0.00 %)
422	Langat virus (TP21 2000) GCF_000860805.1	1 (93.62 %)	54.31 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.56 %)	1 (2.18 %)
423	Langya virus (SDQD_H1801 2022) GCA_031319335.1	9 (81.86 %)	38.30 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.26 %)	n/a	18 (1.31 %)	0 (0.00 %)
424	Lassa mammarenavirus (Josiah 1998) GCF_000851705.1	4 (94.96 %)	42.06 (99.94 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.37 %)	9 (1.70 %)	0 (0.00 %)
425	Le Dantec virus (DakHD763 2017) GCF_002118505.1	6 (97.47 %)	37.82 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.38 %)	n/a	18 (1.72 %)	0 (0.00 %)
426	Lebombo virus (SAAR 3896 2018) GCF_002829425.1	11 (96.53 %)	47.16 (99.91 %)	n/a	10 (100.00 %)	5 (0.77 %)	n/a	6 (0.77 %)	5 (14.49 %)
427	LI polyomavirus (LIPyV 2017) GCF_002080215.1	6 (90.04 %)	39.85 (99.92 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	18 (3.95 %)	0 (0.00 %)
428	Louping ill virus (369/T2 1997) GCF_000863165.1	1 (94.24 %)	54.86 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.52 %)	3 (12.29 %)
429	Lumpy skin disease virus NI- (Neethling 2490 2001) GCF_000839805.1	156 (95.76 %)	25.91 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	55 (1.76 %)	20 (0.65 %)	1,542 (23.51 %)	0 (0.00 %)
430	Lymphocytic choriomeningitis mammarenavirus (Armstrong 53b 1993) GCF_000851025.1	4 (97.52 %)	42.29 (99.99 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.07 %)	0 (0.00 %)
431	Macaca fascicularis papillomavirus 2 (Mac191 2011) GCF_000892835.1	7 (91.76 %)	48.74 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.97 %)	2 (1.35 %)	3 (1.51 %)	2 (12.66 %)
432	Macaca mulatta papillomavirus 6 (PM084S3_c170482 2019) GCF_004134585.1	7 (83.26 %)	51.82 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	9 (2.70 %)	1 (0.34 %)	36 (7.23 %)	2 (16.69 %)
433	Machupo mammarenavirus (Carvallo 2003) GCF_000853725.1	4 (94.98 %)	41.77 (99.95 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.62 %)	0 (0.00 %)
434	Madariaga virus (MADV/Cebus apella/BRA/BEAN5122/1956 2014) GCF_000917835.1	2 (95.96 %)	49.14 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (0.74 %)	1 (1.31 %)	6 (0.83 %)	5 (18.11 %)
435	Madariaga virus (PE-3.0815 2023) GCF_002888955.1	2 (96.12 %)	49.30 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.55 %)	1 (1.31 %)	5 (0.65 %)	5 (17.39 %)
436	Madrid virus (BT4075 2017) GCF_002118405.1	4 (93.18 %)	34.25 (99.97 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	22 (2.75 %)	0 (0.00 %)
437	Maldonado virus (FMD 0077 2021) GCF_013086435.1	4 (97.39 %)	39.95 (99.95 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.84 %)	n/a	7 (1.82 %)	0 (0.00 %)
438	Mamastrovirus 1 (V1347 2016) GCF_001736695.1	2 (100.00 %)	44.60 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.68 %)	n/a	6 (1.65 %)	0 (0.00 %)
439	Mammalian orthoreovirus 3 (MPC/04 2009) GCF_000924315.1	11 (98.51 %)	47.01 (99.91 %)	n/a	10 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	15 (0.81 %)	3 (5.61 %)
440	Mammalian orthoreovirus 3 (T3D Dearing 2023) GCF_006298385.1	10 (96.87 %)	46.94 (99.94 %)	n/a	10 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	24 (1.20 %)	3 (4.20 %)
441	Mammarenavirus chapareense (810419 2008) GCF_000879235.1	4 (96.22 %)	40.03 (99.96 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.75 %)	0 (0.00 %)
442	Mammarenavirus choriomeningitidis (Armstrong 53b 2023) GCF_004789475.1	4 (95.06 %)	43.03 (99.96 %)	n/a	2 (100.00 %)	4 (1.05 %)	1 (0.43 %)	3 (1.37 %)	1 (2.40 %)
443	Mammarenavirus guanaritoense (INH-95551 2003) GCF_000853765.1	4 (96.01 %)	40.64 (99.96 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.75 %)	0 (0.00 %)
444	Mammarenavirus lassaense (Alzey 2016) GCA_900094045.1	4 (94.91 %)	42.17 (99.98 %)	n/a	2 (100.00 %)	4 (0.33 %)	2 (0.37 %)	7 (1.51 %)	0 (0.00 %)
445	Mammarenavirus lujoense (2009) GCF_000885555.1	4 (96.94 %)	42.40 (99.93 %)	n/a	2 (100.00 %)	4 (0.40 %)	n/a	7 (0.88 %)	0 (0.00 %)
446	Maporal virus (HV 97021050 2017) GCF_002145825.3	3 (92.24 %)	38.51 (99.91 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.25 %)	1 (0.22 %)	11 (1.32 %)	0 (0.00 %)
447	Marburg marburgvirus (Marburg virus/H.sapiens-tc/KEN/1980/Mt. Elgon-Musoke 1994) GCF_000857325.2	7 (98.72 %)	38.29 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	16 (1.05 %)	0 (0.00 %)
448	Marburg virus - Musoke, Kenya, 1980 (Musoke 2024) GCA_000857325.3	7 (98.72 %)	38.28 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	16 (1.05 %)	0 (0.00 %)
449	Marmot norovirus (HT16 2019) GCF_004130475.1	1 (92.61 %)	55.57 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.19 %)	0 (0.00 %)
450	Mayaro virus (2002) GCF_000863385.1	5 (96.78 %)	50.37 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.76 %)	n/a	4 (1.59 %)	5 (42.02 %)
451	Measles morbillivirus (Ichinose-B95a 1998) GCF_000854845.1	7 (94.55 %)	47.43 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (0.91 %)	1 (3.88 %)
452	Menangle virus (Australia/bat/2009/Cedar Grove 2018) GCF_002815295.1	7 (90.94 %)	42.02 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.41 %)	0 (0.00 %)
453	Merkel cell polyomavirus (R17b 2008) GCF_000874865.1	5 (88.06 %)	40.69 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (1.78 %)	0 (0.00 %)
454	Middle East respiratory syndrome-related coronavirus (HCoV-EMC HCoV-EMC/2012 2012) GCF_000901155.1	12 (97.48 %)	41.24 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.12 %)	n/a	4 (0.14 %)	0 (0.00 %)
455	Mink calicivirus (MCV-DL/2007/CN 2012) GCF_000901135.1	3 (95.62 %)	45.47 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.21 %)	n/a	1 (0.21 %)	0 (0.00 %)
456	Mokola lyssavirus (2004) GCF_000856485.1	5 (98.49 %)	44.42 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (0.73 %)	0 (0.00 %)
457	Molluscum contagiosum virus subtype 1 (1996) GCF_000843325.1	163 (85.07 %)	63.36 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	128 (3.25 %)	92 (4.74 %)	1,361 (17.29 %)	1 (99.95 %)
458	monkey B virus (8100812 2023) GCF_018580855.1	97 (76.06 %)	75.59 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	167 (5.56 %)	151 (4.68 %)	1,200 (33.97 %)	1 (99.99 %)
459	monkey B virus (E2490 2003) GCF_000844145.1	80 (76.11 %)	74.46 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	139 (4.30 %)	119 (5.55 %)	1,144 (32.51 %)	1 (99.99 %)
460	monkey B virus (KQ 2023) GCF_018580865.1	97 (76.48 %)	75.30 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	135 (4.65 %)	142 (6.00 %)	1,151 (34.13 %)	1 (100.00 %)
461	Monkeypox virus (MPXV-M5312_HM12_Rivers 2022) GCF_014621545.1	179 (83.90 %)	33.03 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	38 (0.78 %)	22 (0.54 %)	1,097 (9.44 %)	0 (0.00 %)
462	Monkeypox virus (Zaire-96-I-16 2021) GCF_000857045.1	180 (84.71 %)	33.09 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	37 (0.96 %)	24 (0.57 %)	1,102 (9.51 %)	0 (0.00 %)
463	Mopeia Lassa virus reassortant 29 (ML29 IGS-15 2004) GCF_000855745.1	4 (95.68 %)	43.06 (99.97 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (1.48 %)	0 (0.00 %)
464	Mumps orthorubulavirus (Miyahara 2000) GCF_000856685.1	8 (92.81 %)	42.49 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.24 %)	n/a	10 (0.59 %)	0 (0.00 %)
465	Mundri virus (A14 2023) GCF_029887105.1	8 (98.82 %)	40.65 (100.00 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	1 (0.34 %)	14 (1.28 %)	0 (0.00 %)
466	Mupapillomavirus 1 (1982) GCF_000866405.1	7 (86.17 %)	40.28 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.47 %)	1 (0.40 %)	7 (1.87 %)	1 (2.75 %)
467	Murine herpesvirus 68 (WUMS 2007) GCA_000845665.1	80 (90.74 %)	47.23 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (0.12 %)	31 (3.40 %)	69 (4.25 %)	4 (4.97 %)
468	Murray Valley encephalitis virus (1999) GCF_000863565.1	3 (93.56 %)	48.72 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.23 %)	1 (1.84 %)
469	MW polyomavirus (MA095 2012) GCF_000898335.1	6 (91.25 %)	36.91 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	14 (4.00 %)	0 (0.00 %)
470	Myxoma virus (Lausanne 2002) GCF_000843685.1	170 (95.89 %)	43.56 (100.00 %)	7 (0.00 %)	8 (100.00 %)	11 (0.16 %)	15 (0.33 %)	578 (5.25 %)	0 (0.00 %)
471	Nairobi sheep disease virus (Jilin 2017) GCF_002117695.1	3 (97.66 %)	44.18 (99.98 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	45 (2.54 %)	0 (0.00 %)
472	Nebraska virus (NB 2002) GCF_000851625.1	2 (98.09 %)	56.55 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.72 %)	n/a	1 (0.30 %)	2 (68.70 %)
473	New Jersey polyomavirus-2013 (NJ-PyV-2013 2014) GCF_000922675.1	9 (89.72 %)	39.28 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.06 %)	n/a	12 (3.58 %)	0 (0.00 %)
474	Newbury agent 1 (2006) GCF_000867125.1	2 (98.08 %)	56.20 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.19 %)	n/a	3 (1.18 %)	2 (62.74 %)
475	Nipah henipavirus (2000) GCF_000863625.1	11 (82.06 %)	38.17 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.17 %)	n/a	8 (0.37 %)	0 (0.00 %)
476	Nkolbisson virus (YM 31-65 2017) GCF_002145865.1	5 (97.26 %)	42.98 (99.97 %)	1 (0.02 %)	2 (99.98 %)	4 (0.67 %)	n/a	7 (0.52 %)	0 (0.00 %)
477	Norovirus (dog/GVI.1/HKU_Ca026F/2007/HKG 2019) GCF_007609015.1	3 (97.97 %)	56.44 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (1.17 %)	3 (66.91 %)
478	Norovirus GI (1993) GCF_000864005.1	3 (99.09 %)	48.03 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.52 %)	1 (0.35 %)	3 (0.31 %)	0 (0.00 %)
479	Norovirus GI (Hu/BD/2011/GI.7PNA2/Dhaka1882 2019) GCF_008704025.1	3 (99.22 %)	48.46 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.27 %)	0 (0.00 %)
480	Norovirus GI (Hu/JP/1998/GI.6PNA4/No20-Saitama-98-17 2019) GCF_008703965.1	3 (98.91 %)	49.94 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.56 %)	n/a	3 (0.36 %)	0 (0.00 %)
481	Norovirus GI (Hu/JP/2000/GI.6PNA1/WUG1 2019) GCF_008703985.1	3 (98.82 %)	49.62 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.43 %)	n/a	12 (1.55 %)	0 (0.00 %)
482	Norovirus GI/Hu/JP/2007/GI.P3_GI.3/Shimizu/KK2866 (Shimizu/KK2866 2018) GCF_003813225.1	3 (99.03 %)	48.57 (100.00 %)	2 (0.03 %)	3 (99.97 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.56 %)	1 (3.89 %)
483	Norovirus GII (Hu/GII.PNA4-GII.NA4/PNV06929/2008/PER 2019) GCF_008711635.1	3 (99.19 %)	47.69 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.29 %)	0 (0.00 %)
484	Norovirus GII (NORO_176-1_17_12_2015 2019) GCF_004193815.1	3 (99.64 %)	50.31 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.13 %)	0 (0.00 %)
485	Norovirus GII (NORO_226_06_01_2016 2018) GCF_003638685.1	3 (99.23 %)	48.61 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.86 %)	0 (0.00 %)
486	Norovirus GII.17 (Hu/GII.P17_GII.17/KR/2015/CAU-267 2018) GCF_003638645.1	3 (99.14 %)	48.14 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.71 %)	0 (0.00 %)
487	Norovirus GII.2 (BJSMQ 2018) GCF_003638665.1	3 (99.36 %)	48.71 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.19 %)	0 (0.00 %)
488	Norovirus GII/Hu/JP/2007/GII.P15_GII.15/Sapporo/HK299 (Sapporo/HK299 2019) GCF_007608995.1	3 (99.01 %)	49.25 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.29 %)	0 (0.00 %)
489	Norovirus GII/Hu/JP/2011/GII/Yuzawa/Gira2HS (Yuzawa/Gira2HS 2019) GCF_007609035.1	3 (98.91 %)	48.63 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.30 %)	0 (0.00 %)
490	Norovirus GIV (CU081210E/USA/2010 2020) GCF_010478905.1	3 (98.55 %)	58.56 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.28 %)	1 (98.56 %)
491	Norovirus GIV (Hu/GIV.1/LakeMacquarie/NSW268O/2010/AU 2016) GCF_001595715.1	3 (98.88 %)	50.71 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.37 %)	1 (3.69 %)
492	Norovirus GIV (Hu/US/2016/GIV.NA1PNA1/WI7002 2019) GCF_008704005.1	3 (99.96 %)	51.14 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.55 %)	1 (2.78 %)
493	Norovirus GV (Mu/NoV/GV/MNV1/2002/USA 2006) GCF_000868425.1	4 (98.92 %)	56.72 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.42 %)	n/a	5 (0.60 %)	4 (18.84 %)
494	Norwalk-like virus (Hu/Norovirus/hiroshima/1999/JP9912-02F 2016) GCF_001595695.1	3 (99.32 %)	50.06 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.23 %)	0 (0.00 %)
495	NY_014 poxvirus (2013 2017) GCF_002270605.1	197 (91.70 %)	29.52 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	42 (0.94 %)	15 (0.77 %)	1,374 (12.16 %)	0 (0.00 %)
496	Omsk hemorrhagic fever virus (Bogoluvovska 2003) GCF_000855505.1	1 (94.98 %)	53.64 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.20 %)	0 (0.00 %)
497	Onyong-nyong virus (1993) GCF_000863005.1	5 (100.00 %)	48.32 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	2 (1.28 %)	7 (1.39 %)	5 (15.80 %)
498	Onyong-nyong virus (SG650 2023) GCF_002888795.1	2 (95.47 %)	48.09 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.42 %)	1 (1.22 %)	4 (0.63 %)	4 (13.44 %)
499	Orf virus (OV-SA00 ORFD 2004) GCF_000844845.1	130 (89.67 %)	63.44 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	56 (2.03 %)	37 (1.70 %)	1,076 (16.55 %)	1 (100.00 %)
500	Oropouche virus (2004) GCF_000853785.1	4 (97.72 %)	35.40 (99.96 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	33 (3.75 %)	0 (0.00 %)
501	Orthobunyavirus bwambaense (M459 2017) GCF_002118905.1	4 (94.10 %)	31.34 (99.94 %)	n/a	3 (100.00 %)	8 (2.54 %)	5 (1.00 %)	23 (5.73 %)	0 (0.00 %)
502	Orthohantavirus asikkalaense (CZ/Beskydy/412/2010/Sm 2019) GCF_002815935.1	3 (93.28 %)	38.58 (99.89 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.33 %)	0 (0.00 %)
503	Orthohantavirus bayoui (HV F0260003 2018) GCF_002816435.1	3 (91.68 %)	39.50 (99.93 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.48 %)	n/a	11 (1.72 %)	0 (0.00 %)
504	Orthohantavirus caobangense (3 2017) GCF_002119025.1	3 (93.00 %)	36.66 (99.93 %)	n/a	3 (100.00 %)	7 (1.60 %)	2 (0.38 %)	10 (1.22 %)	0 (0.00 %)
505	Orthohantavirus delgaditoense (VHV-574 2017) GCF_002145545.1	3 (91.23 %)	37.63 (99.97 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.29 %)	3 (0.77 %)	6 (0.87 %)	0 (0.00 %)
506	Orthohantavirus dobravaense (DOBV/Ano-Poroia/Afl9/1999 2003) GCF_000863045.1	3 (94.21 %)	39.24 (99.96 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.68 %)	2 (0.46 %)	13 (1.44 %)	0 (0.00 %)
507	Orthohantavirus khabarovskense (Fuyuan-Mm-217 2017) GCF_002146125.1	3 (92.38 %)	38.20 (99.98 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.46 %)	n/a	17 (1.58 %)	0 (0.00 %)
508	Orthohantavirus montanoense (104/2006 2017) GCF_002117715.1	3 (91.77 %)	36.28 (99.95 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	5 (1.70 %)	15 (2.97 %)	0 (0.00 %)
509	Orthohantavirus prospectense (PH-1 2018) GCF_002994685.1	2 (82.88 %)	39.99 (99.95 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.28 %)	n/a	4 (0.55 %)	0 (0.00 %)
510	Orthohantavirus robinaense (P17-14855 2021) GCF_018594985.1	3 (100.04 %)	40.35 (99.96 %)	5 (0.04 %)	8 (99.96 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.54 %)	0 (0.00 %)
511	Orthohantavirus sangassouense (SA14 2017) GCF_002145925.1	3 (93.52 %)	38.80 (99.97 %)	1 (0.01 %)	4 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (1.29 %)	0 (0.00 %)
512	Orthohantavirus sinnombreense (NM H10 2003) GCF_000854765.1	4 (90.70 %)	38.42 (99.94 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.95 %)	5 (1.33 %)	11 (1.93 %)	0 (0.00 %)
513	Orthohantavirus sinnombreense (NM R11 2023) GCF_002830985.1	3 (90.70 %)	38.39 (99.98 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.95 %)	5 (1.33 %)	11 (1.91 %)	0 (0.00 %)
514	Orthohantavirus tatenalense (Upton_Heath 2021) GCF_018595015.1	3 (100.00 %)	38.26 (99.98 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	14 (1.55 %)	0 (0.00 %)
515	Orthohantavirus tulaense (Moravia/5302v/95 2003) GCF_000855225.1	4 (92.64 %)	38.04 (99.95 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.94 %)	n/a	9 (0.58 %)	0 (0.00 %)
516	Orthohepevirus A (Xinjiang 1993) GCF_000861105.1	3 (98.65 %)	57.95 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (1.80 %)	1 (89.53 %)
517	Orthomarburgvirus marburgense (Ravn virus/H.sapiens-tc/KEN/1987/Kitum Cave-810040 2014) GCF_000943645.1	7 (98.72 %)	37.76 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.17 %)	n/a	21 (1.20 %)	0 (0.00 %)
518	Orthonairovirus tomdiense (TT1 2023) GCF_018595155.1	3 (100.00 %)	45.30 (99.96 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.18 %)	n/a	9 (0.50 %)	0 (0.00 %)
519	Orthorubulavirus mapueraense (BeAnn 370284 2007) GCF_000873165.1	9 (96.64 %)	44.68 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (0.90 %)	0 (0.00 %)
520	Orungo virus (UGMP 359 2018) GCF_002829445.1	11 (96.63 %)	45.83 (99.93 %)	n/a	10 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.24 %)	2 (7.81 %)
521	Oz virus (EH8 2019) GCF_004117175.1	6 (94.83 %)	43.72 (99.95 %)	n/a	6 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (1.36 %)	0 (0.00 %)
522	Papio hamadryas papillomavirus 1 (Mac2085 2012) GCF_000896995.1	8 (85.63 %)	49.41 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.56 %)	1 (0.51 %)	9 (4.48 %)	1 (5.12 %)
523	Parainfluenza virus 5 (W3A 2004) GCF_000854805.1	9 (99.06 %)	42.27 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.24 %)	n/a	3 (0.30 %)	0 (0.00 %)
524	Paramecium bursaria Chlorella virus 1 (2011) GCF_000847045.1	814 (95.11 %)	39.97 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	75 (0.98 %)	146 (4.42 %)	1,227 (8.76 %)	23 (3.04 %)
525	Parechovirus A (Gregory 1998) GCF_000861505.1	1 (89.00 %)	39.48 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.30 %)	n/a	6 (0.98 %)	0 (0.00 %)
526	Parvovirus NIH-CQV (2013) GCF_000910875.1	3 (80.08 %)	45.77 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	2 (2.04 %)	0 (0.00 %)	2 (32.09 %)
527	Paslahepevirus balayani (2023) GCF_002826225.1	3 (98.54 %)	58.02 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (1.86 %)	1 (92.98 %)
528	Paslahepevirus balayani (AlgSwe2012 2023) GCF_023120075.1	3 (97.76 %)	58.57 (99.97 %)	6 (0.09 %)	7 (99.91 %)	6 (1.04 %)	1 (0.37 %)	22 (4.83 %)	1 (97.93 %)
529	Paslahepevirus balayani (little egret/kocsag02/2014/HUN 2023) GCF_023120345.1	3 (96.92 %)	51.40 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (2.22 %)	3 (11.05 %)
530	Pegivirus platyrrhini (2000) GCF_000847425.1	1 (93.48 %)	57.91 (100.00 %)	25 (0.26 %)	26 (99.74 %)	3 (0.00 %)	n/a	15 (1.65 %)	7 (35.01 %)
531	Pegivirus platyrrhini (2023) GCF_002821105.1	1 (92.91 %)	57.84 (99.97 %)	110 (1.15 %)	111 (98.85 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (1.15 %)	6 (66.95 %)
532	Pichinde virus (AN3739 2004) GCF_000856465.1	4 (96.57 %)	41.84 (99.94 %)	n/a	2 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.44 %)	0 (0.00 %)
533	Piry virus (BeAn2423 2018) GCF_002816055.1	5 (96.19 %)	43.18 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (0.33 %)	12 (1.08 %)	0 (0.00 %)
534	Poliovirus 2 (Lansing 2023) GCA_003108605.1	1 (89.03 %)	46.71 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.13 %)	1 (4.73 %)
535	Poliovirus 3 (2023) GCA_008766715.1	1 (89.09 %)	46.90 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.11 %)	1 (5.49 %)
536	Potato leafroll virus (2000) GCF_000856725.1	9 (93.42 %)	49.46 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.30 %)	0 (0.00 %)	1 (9.72 %)
537	Potato leafroll virus (Canada 2023) GCF_021461725.1	n/a	49.44 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.33 %)	1 (0.17 %)	1 (9.89 %)
538	Powassan virus (LB 1993) GCF_000860485.1	1 (94.55 %)	53.32 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	14 (1.20 %)	1 (3.47 %)
539	Primate norovirus (SimianNoV-nj 2016) GCF_001755385.1	3 (97.68 %)	48.57 (99.96 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	6 (1.52 %)	1 (0.43 %)	7 (1.64 %)	0 (0.00 %)
540	Primate T-lymphotropic virus 1 (Tan90 2000) GCF_000861125.1	4 (68.45 %)	53.76 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	15 (2.27 %)	3 (15.46 %)
541	Primate T-lymphotropic virus 3 (CTO-604 2002) GCF_000847845.1	7 (60.22 %)	53.22 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (1.66 %)	3 (6.99 %)
542	Protoparvovirus primate1 (BF.86 2018) GCF_002827465.1	5 (93.20 %)	40.10 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.78 %)	1 (1.27 %)	20 (5.83 %)	0 (0.00 %)
543	Pseudomonas phage phi6 (S2 2006) GCA_002966185.1	12 (78.79 %)	55.86 (99.94 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.40 %)	3 (97.30 %)
544	Pulau reovirus (2018) GCF_002829605.1	12 (96.55 %)	48.18 (99.94 %)	n/a	10 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (0.40 %)	7 (10.97 %)
545	Punta Toro virus (Adames 2018) GCF_002815115.1	4 (92.61 %)	40.36 (99.94 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (1.74 %)	3 (0.77 %)	16 (3.35 %)	0 (0.00 %)
546	Punta Toro virus (PAN472868 2015) GCA_001021295.1	4 (92.38 %)	39.48 (99.92 %)	1 (0.01 %)	4 (99.99 %)	4 (0.98 %)	8 (1.26 %)	8 (2.86 %)	0 (0.00 %)
547	Punta Toro virus (PAN472868 2015) GCF_001021295.1	4 (92.38 %)	39.48 (99.92 %)	1 (0.01 %)	4 (99.99 %)	4 (0.98 %)	8 (1.26 %)	8 (2.86 %)	0 (0.00 %)
548	Puumala orthohantavirus (Sotkamo 2003) GCF_000854405.1	3 (39.37 %)	36.97 (99.98 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.66 %)	n/a	33 (3.47 %)	0 (0.00 %)
549	Rabbit calicivirus Australia 1 (MIC-07 2008) GCF_000882575.1	2 (99.12 %)	47.88 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	1 (3.68 %)
550	Rabbit hemorrhagic disease virus (FRG 2000) GCF_000861285.1	2 (99.09 %)	50.20 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.61 %)	1 (0.56 %)	8 (1.18 %)	0 (0.00 %)
551	Rabbit vesivirus (2006) GCF_000867805.1	3 (96.54 %)	47.74 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.01 %)	1 (1.01 %)	8 (1.87 %)	2 (7.00 %)
552	Rabies lyssavirus (1993) GCF_000859625.1	5 (95.29 %)	45.10 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (1.15 %)	0 (0.00 %)
553	Reticuloendotheliosis virus (HA9901 2005) GCF_000858025.1	3 (81.69 %)	52.71 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.86 %)	2 (1.01 %)	9 (1.35 %)	3 (8.85 %)
554	Rhinovirus A (1993) GCF_000862245.1	1 (90.81 %)	39.05 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.15 %)	0 (0.00 %)
555	rhinovirus A1 (ATCC VR-1559 2018) GCF_002816835.1	1 (90.75 %)	37.47 (99.97 %)	3 (0.04 %)	4 (99.96 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (2.02 %)	0 (0.00 %)
556	rhinovirus B14 (2000) GCF_000861265.1	1 (90.68 %)	40.58 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
557	rhinovirus B3 (2018) GCF_002816855.1	1 (90.69 %)	39.94 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.15 %)	0 (0.00 %)
558	Rhinovirus C (024 2007) GCF_000872325.1	1 (90.65 %)	42.80 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
559	Rift Valley fever virus (ZH-548 2010) GCF_000847345.1	4 (95.24 %)	45.11 (99.97 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.49 %)	n/a	8 (1.04 %)	0 (0.00 %)
560	Rockport virus (MSB57412 2018) GCF_002830685.1	3 (92.73 %)	35.05 (99.96 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.71 %)	n/a	22 (1.83 %)	0 (0.00 %)
561	Rosavirus A2 (GA7403 2014) GCF_000918175.1	1 (82.95 %)	51.41 (99.99 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (0.67 %)	1 (4.60 %)
562	Ross River virus (NB5092 1993) GCF_000862165.1	5 (96.96 %)	51.41 (99.90 %)	20 (0.47 %)	20 (99.53 %)	4 (0.90 %)	n/a	4 (1.54 %)	8 (48.39 %)
563	Ross River virus (QML 1 2023) GCF_002889255.1	2 (94.13 %)	51.05 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (1.26 %)	3 (2.11 %)	6 (2.51 %)	7 (49.69 %)
564	Rotavirus A (RVA/Simian-tc/ZAF/SA11-H96/1958/G3P5B[2] 2008) GCF_000880735.1	12 (94.00 %)	33.67 (99.88 %)	n/a	11 (100.00 %)	4 (0.19 %)	n/a	21 (1.24 %)	0 (0.00 %)
565	Rotavirus C (Bristol 2005) GCF_000864225.1	11 (95.04 %)	31.63 (99.89 %)	n/a	11 (100.00 %)	7 (1.19 %)	n/a	33 (2.72 %)	0 (0.00 %)
566	Rubella virus (F-Therien 1993) GCF_000863025.1	2 (99.15 %)	69.60 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.85 %)	n/a	54 (9.70 %)	1 (98.66 %)
567	Rubella virus (RVi/Bismarck.ND.USA/23.08/2B 2023) GCF_024749945.1	2 (97.77 %)	69.96 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (1.29 %)	3 (0.97 %)	54 (9.60 %)	1 (98.93 %)
568	Saint Louis encephalitis virus (Kern217 2005) GCF_000866785.1	1 (94.09 %)	49.75 (100.00 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (1.35 %)	1 (3.05 %)
569	Salivirus A (02394-01 2009) GCF_000885035.1	1 (89.05 %)	56.70 (99.95 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	4 (0.51 %)	n/a	14 (3.28 %)	3 (36.06 %)
570	Salivirus FHB (SaliV-FHB 2014) GCF_000926235.1	1 (88.75 %)	57.26 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (1.35 %)	1 (0.38 %)	13 (1.96 %)	2 (63.43 %)
571	Salivirus NG-J1 (NG-J1 2009) GCF_000886535.1	1 (89.26 %)	56.70 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	17 (2.15 %)	2 (48.16 %)
572	San Miguel sea lion virus 8 (2014) GCF_000925155.1	3 (98.48 %)	51.28 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.14 %)	3 (47.28 %)
573	Sandfly fever Naples virus (Toscana ISS.Phl.3 2004) GCF_000854285.1	4 (98.01 %)	44.60 (99.94 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.30 %)	n/a	13 (2.02 %)	0 (0.00 %)
574	sandfly fever Turkey virus (Izmir 19 2011) GCF_000891955.1	4 (93.98 %)	43.66 (99.94 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (2.77 %)	0 (0.00 %)
575	Sapovirus (Hu/Dresden/pJG-Sap01/DE 2004) GCF_000854265.1	3 (98.76 %)	50.63 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (1.06 %)	1 (3.94 %)
576	Sapovirus (Hu/GI/Sapporo/MT-2010/1982 2023) GCF_008792745.1	3 (98.75 %)	50.70 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (1.09 %)	1 (5.79 %)
577	Sapovirus (Mc10 2004) GCF_000853825.1	2 (98.38 %)	51.46 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.13 %)	0 (0.00 %)
578	Sapovirus C12 (C12 2004) GCF_000855765.1	2 (98.27 %)	51.73 (99.99 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.13 %)	2 (7.50 %)
579	Sapovirus Hu/Nagoya/NGY-1/2012/JPN (Hu/SaV/Nagoya/NGY-1/2012/JPN 2015) GCF_001008475.1	2 (98.47 %)	49.71 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.60 %)	n/a	0 (0.00 %)	0 (0.00 %)
580	SARS coronavirus Tor2 (Tor2 2003) GCF_000864885.1	16 (97.60 %)	40.76 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.08 %)	n/a	18 (0.74 %)	0 (0.00 %)
581	Semliki Forest virus (1987) GCF_000860285.1	4 (96.64 %)	53.22 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.66 %)	n/a	4 (1.46 %)	1 (92.56 %)
582	Seoul orthohantavirus (80-39 2003) GCF_000855645.1	3 (93.29 %)	39.00 (99.96 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.56 %)	n/a	14 (1.15 %)	0 (0.00 %)
583	Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus (HNXH 2019) GCF_003087855.1	4 (98.45 %)	48.84 (99.98 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.21 %)	n/a	5 (0.39 %)	0 (0.00 %)
584	Sewage-associated gemycircularvirus-10a (BS3980 2015) GCF_000930855.1	4 (82.35 %)	52.52 (99.82 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (1.02 %)	2 (76.08 %)
585	SFTS virus (HB29 2012) GCF_000897355.1	4 (96.58 %)	48.80 (99.91 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.21 %)	n/a	2 (0.12 %)	0 (0.00 %)
586	Sheeppox virus (TU-V02127 2002) GCF_000840205.1	148 (93.28 %)	25.01 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	46 (1.32 %)	13 (0.59 %)	1,524 (24.28 %)	0 (0.00 %)
587	simian adenovirus 1 (ATCC VR-195 2005) GCF_000847325.1	42 (94.47 %)	55.21 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	11 (0.98 %)	1 (0.08 %)	49 (2.50 %)	6 (69.90 %)
588	Simian foamy virus (1994) GCF_000848485.1	6 (78.31 %)	38.96 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.50 %)	n/a	7 (0.57 %)	0 (0.00 %)
589	Simian pegivirus (SPgVkrc SPgVkrc_RC08 2014) GCF_000921975.1	1 (91.31 %)	56.63 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	10 (1.02 %)	3 (66.17 %)
590	Simian T-cell lymphotropic virus 6 (Cmo8699AB 2008) GCF_000881775.1	8 (76.72 %)	51.89 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.79 %)	n/a	9 (1.53 %)	2 (8.06 %)
591	Simian T-lymphotropic virus 2 (PP1664 STLV-2PP1664 2000) GCF_000860005.1	13 (80.53 %)	54.76 (100.00 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	23 (3.20 %)	2 (8.40 %)
592	Sindbis virus (1993) GCF_000860545.1	5 (100.00 %)	50.91 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.34 %)	n/a	3 (0.28 %)	1 (93.38 %)
593	Singapore grouper iridovirus (2004) GCF_000846905.1	162 (89.23 %)	48.64 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	10 (0.23 %)	26 (2.80 %)	285 (4.52 %)	1 (0.16 %)
594	Sinu virus (CoB 38d 2023) GCF_023157055.1	6 (93.02 %)	32.86 (99.93 %)	n/a	6 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	42 (4.53 %)	0 (0.00 %)
595	Small anellovirus 1 (2005) GCF_000859305.1	3 (93.20 %)	38.22 (99.82 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.67 %)	10 (8.23 %)	0 (0.00 %)
596	Small anellovirus 2 (2005) GCF_000860145.1	5 (91.76 %)	39.54 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.76 %)	n/a	4 (5.35 %)	0 (0.00 %)
597	smallpox virus (India-1967, ssp. major Ind3 1993) GCF_000859885.1	197 (87.60 %)	32.73 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	31 (0.69 %)	7 (0.57 %)	1,031 (9.09 %)	0 (0.00 %)
598	Snowshoe hare virus (2021) GCF_004789895.1	4 (96.87 %)	37.25 (99.93 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.83 %)	n/a	15 (1.23 %)	0 (0.00 %)
599	Soldado virus (TRVL 52214 2023) GCF_014883305.1	3 (95.70 %)	37.14 (99.97 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.28 %)	1 (1.67 %)	45 (3.44 %)	0 (0.00 %)
600	Songling virus (HLJ1202 2023) GCF_029888075.1	3 (95.45 %)	48.99 (99.99 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.66 %)	5 (0.64 %)	15 (1.44 %)	0 (0.00 %)
601	Sosuga virus (2012 2014) GCF_000924495.1	7 (90.76 %)	42.38 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.47 %)	1 (0.26 %)	7 (0.73 %)	0 (0.00 %)
602	Staphylococcus phage 6ec (2014) GCF_000921075.1	144 (88.32 %)	29.29 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	34 (1.71 %)	10 (0.46 %)	603 (15.13 %)	0 (0.00 %)
603	Steller sea lion vesivirus (V1415 SSL2004-250F 2008) GCF_000879655.1	3 (97.56 %)	48.57 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.29 %)	10 (1.29 %)	3 (13.70 %)
604	STL polyomavirus (MA138 2013) GCF_000904055.1	8 (92.55 %)	36.63 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (2.91 %)	0 (0.00 %)
605	Suid alphaherpesvirus 1 (PRV-MdBio PRV-MdBio 2017) GCA_900230325.1	170 (86.10 %)	73.56 (100.00 %)	1 (0.00 %)	2 (100.00 %)	202 (7.85 %)	166 (7.32 %)	1,126 (32.56 %)	1 (99.40 %)
606	Tacheng Tick Virus 1 (TC253 2016) GCF_001755105.1	3 (90.86 %)	47.86 (99.97 %)	5 (0.03 %)	8 (99.97 %)	3 (0.00 %)	n/a	9 (0.81 %)	1 (2.17 %)
607	Tamdy virus (XJ01 2019) GCA_014883335.1	3 (93.06 %)	45.18 (100.00 %)	n/a	3 (100.00 %)	4 (0.16 %)	n/a	23 (1.59 %)	0 (0.00 %)
608	Thailand tick thogotovirus (THOV/Boophilus sp./Thailand 2023) GCF_023156685.1	7 (97.28 %)	45.06 (99.92 %)	n/a	6 (100.00 %)	4 (0.27 %)	n/a	24 (2.75 %)	0 (0.00 %)
609	Thogotovirus thogotoense (SiAr 126 2004) GCF_000854245.1	7 (96.85 %)	48.02 (99.89 %)	1 (0.01 %)	6 (99.99 %)	3 (0.00 %)	n/a	18 (1.95 %)	0 (0.00 %)
610	Thottapalayam virus (VRC 66412 2008) GCF_000879955.1	3 (94.84 %)	37.56 (99.98 %)	n/a	3 (100.00 %)	5 (0.96 %)	4 (0.55 %)	9 (1.26 %)	0 (0.00 %)
611	Tibrovirus congo (BASV-1 2019) GCF_002815815.1	8 (98.64 %)	38.79 (99.98 %)	1 (0.01 %)	2 (99.99 %)	4 (0.34 %)	n/a	10 (1.48 %)	0 (0.00 %)
612	Tick-borne encephalitis virus (2000) GCF_000863125.1	1 (91.96 %)	53.78 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.48 %)	1 (0.44 %)	7 (0.87 %)	2 (7.65 %)
613	Tick-borne encephalitis virus (Vasilchenko 2023) GCA_004788235.1	1 (93.76 %)	54.70 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.45 %)	4 (9.01 %)
614	Torque teno midi virus 1 (MD1-032 2007) GCF_000870545.1	6 (73.90 %)	42.59 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (4.41 %)	2 (2.62 %)	15 (12.39 %)	1 (7.12 %)
615	Torque teno midi virus 10 (MDJN14 2018) GCF_002818685.1	6 (73.73 %)	43.50 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (4.31 %)	2 (2.83 %)	7 (8.63 %)	1 (14.83 %)
616	Torque teno midi virus 11 (MDJN47 2018) GCF_002818705.1	6 (73.86 %)	43.29 (99.91 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (4.88 %)	1 (0.94 %)	12 (10.19 %)	1 (6.91 %)
617	Torque teno midi virus 12 (MDJN51 2018) GCF_002818725.1	6 (73.45 %)	41.70 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	10 (8.35 %)	1 (1.88 %)	9 (9.88 %)	0 (0.00 %)
618	Torque teno midi virus 13 (MDJN69 2018) GCF_002818745.1	6 (73.78 %)	43.72 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (4.92 %)	1 (1.86 %)	13 (9.57 %)	1 (6.84 %)
619	Torque teno midi virus 14 (MDJN97 2018) GCF_002818765.1	6 (73.84 %)	42.73 (99.91 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (6.42 %)	1 (1.86 %)	12 (9.12 %)	1 (6.86 %)
620	Torque teno midi virus 2 (MD2-013 2010) GCF_000887335.1	6 (73.90 %)	42.92 (99.91 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (3.20 %)	1 (1.84 %)	9 (7.78 %)	1 (6.79 %)
621	Torque teno midi virus 3 (2PoSMA 2018) GCF_002818545.1	2 (89.86 %)	38.65 (99.90 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (3.00 %)	n/a	4 (3.85 %)	0 (0.00 %)
622	Torque teno midi virus 4 (6PoSMA 2018) GCF_002818565.1	3 (89.24 %)	40.29 (99.84 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	11 (5.99 %)	0 (0.00 %)
623	Torque teno midi virus 5 (MDJHem2 2018) GCF_002818585.1	6 (73.91 %)	42.62 (99.91 %)	n/a	1 (100.00 %)	9 (6.45 %)	2 (2.87 %)	20 (11.94 %)	1 (6.89 %)
624	Torque teno midi virus 6 (MDJHem3-1 2018) GCF_002818605.1	6 (74.14 %)	43.04 (99.91 %)	n/a	1 (100.00 %)	7 (4.60 %)	1 (1.88 %)	11 (10.54 %)	1 (6.91 %)
625	Torque teno midi virus 7 (MDJHem3-2 2018) GCF_002818625.1	6 (73.98 %)	42.35 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.69 %)	2 (2.82 %)	15 (9.38 %)	1 (6.91 %)
626	Torque teno midi virus 8 (MDJN1 2018) GCF_002818645.1	6 (73.75 %)	42.95 (99.91 %)	n/a	1 (100.00 %)	8 (5.49 %)	1 (1.86 %)	9 (8.53 %)	1 (6.86 %)
627	Torque teno midi virus 9 (MDJN2 2018) GCF_002818665.1	6 (73.45 %)	42.48 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	6 (4.02 %)	2 (3.17 %)	11 (10.13 %)	0 (0.00 %)
628	Torque teno mini virus (SHA 2023) GCF_018580825.1	3 (75.69 %)	38.19 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (9.48 %)	0 (0.00 %)
629	Torque teno mini virus 1 (TLMV-CBD279 2010) GCF_000887355.1	3 (74.96 %)	38.14 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.84 %)	10 (6.55 %)	0 (0.00 %)
630	Torque teno mini virus 10 (BNI-700620-G1-CSF 2023) GCF_018583595.1	4 (82.54 %)	37.16 (99.93 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.87 %)	11 (9.75 %)	0 (0.00 %)
631	Torque teno mini virus 10 (BNI-700835-G3-CSF 2023) GCF_018583605.1	4 (81.01 %)	39.58 (99.86 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (2.75 %)	1 (2.78 %)	11 (7.15 %)	0 (0.00 %)
632	Torque teno mini virus 10 (LIL-y1 2018) GCF_002818445.1	4 (81.09 %)	38.93 (99.93 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.53 %)	1 (3.67 %)	4 (7.86 %)	0 (0.00 %)
633	Torque teno mini virus 11 (LIL-y2 2018) GCF_002818465.1	3 (82.86 %)	38.33 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.51 %)	11 (6.30 %)	0 (0.00 %)
634	Torque teno mini virus 12 (LIL-y3 2018) GCF_002818485.1	4 (81.35 %)	39.11 (99.93 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.96 %)	3 (2.27 %)	6 (11.23 %)	0 (0.00 %)
635	Torque teno mini virus 18 (222 2016) GCF_001661815.1	3 (74.46 %)	38.25 (99.89 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.82 %)	1 (2.89 %)	10 (8.67 %)	0 (0.00 %)
636	Torque teno mini virus 2 (TLMV-NLC023 2010) GCF_000888275.1	3 (73.96 %)	39.35 (100.00 %)	4 (0.14 %)	5 (99.86 %)	3 (0.00 %)	n/a	12 (5.39 %)	0 (0.00 %)
637	Torque teno mini virus 3 (TLMV-NLC026 2010) GCF_000887315.1	3 (75.17 %)	37.98 (99.93 %)	1 (0.03 %)	2 (99.97 %)	3 (0.00 %)	3 (3.83 %)	22 (14.67 %)	0 (0.00 %)
638	Torque teno mini virus 4 (Pt-TTV8-II 2010) GCF_000888295.1	2 (76.45 %)	39.93 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (2.15 %)	n/a	9 (8.29 %)	0 (0.00 %)
639	Torque teno mini virus 5 (TGP96 2010) GCF_000888975.1	3 (75.79 %)	37.04 (99.90 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (2.20 %)	1 (2.82 %)	6 (9.70 %)	0 (0.00 %)
640	Torque teno mini virus 6 (TLMV-CBD203 2010) GCF_000888315.1	3 (74.32 %)	37.34 (99.93 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.62 %)	2 (3.31 %)	0 (0.00 %)
641	Torque teno mini virus 7 (TLMV-CLC156 2010) GCF_000888255.1	2 (74.00 %)	36.14 (99.93 %)	2 (0.07 %)	3 (99.93 %)	3 (0.00 %)	3 (3.90 %)	8 (13.25 %)	0 (0.00 %)
642	Torque teno mini virus 8 (PB4TL 2010) GCF_000887215.1	2 (76.15 %)	37.80 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.27 %)	8 (7.29 %)	0 (0.00 %)
643	Torque teno mini virus 9 (TLMV-CLC062 2000) GCF_000837005.1	3 (77.41 %)	38.42 (100.00 %)	3 (0.21 %)	4 (99.79 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (4.01 %)	0 (0.00 %)
644	Torque teno mini virus ALA22 (TTMV-ALA22 2014) GCF_000930495.1	3 (75.94 %)	38.28 (99.86 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (3.05 %)	n/a	11 (7.69 %)	0 (0.00 %)
645	Torque teno mini virus ALH8 (TTMV-ALH8 2014) GCF_000929855.1	2 (74.78 %)	38.77 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.19 %)	1 (2.73 %)	8 (8.09 %)	0 (0.00 %)
646	Torque teno virus (Human/Japan/KS025/2016 2023) GCF_018580895.1	3 (82.70 %)	36.62 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.17 %)	n/a	11 (8.58 %)	0 (0.00 %)
647	Torque teno virus 1 (VT416 1998) GCF_000857545.1	5 (70.74 %)	49.06 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.80 %)	n/a	17 (6.93 %)	2 (35.41 %)
648	Torque teno virus 10 (JT34F 2010) GCF_000887255.1	6 (71.49 %)	51.22 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (3.00 %)	n/a	5 (4.22 %)	2 (38.57 %)
649	Torque teno virus 13 (TCHN-A 2018) GCF_002818305.1	2 (76.54 %)	52.27 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.24 %)	0 (0.00 %)	2 (49.70 %)
650	Torque teno virus 17 (2019) GCF_002986165.1	n/a	49.83 (99.88 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.51 %)	1 (1.26 %)	3 (2.37 %)	1 (20.50 %)
651	Torque teno virus 18 (2019) GCF_002986195.1	n/a	52.78 (99.91 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.44 %)	n/a	3 (0.81 %)	2 (29.67 %)
652	Torque teno virus 20 (2018) GCF_002818335.1	6 (83.33 %)	50.00 (99.88 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.79 %)	1 (1.27 %)	0 (0.00 %)	1 (20.90 %)
653	Torque teno virus 21 (TCHN-B 2018) GCF_002818355.1	2 (79.99 %)	45.33 (99.90 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.54 %)	n/a	10 (3.87 %)	1 (20.27 %)
654	Torque teno virus 29 (TTVyon-KC009 2018) GCF_002818425.1	3 (68.19 %)	52.69 (99.97 %)	7 (0.19 %)	8 (99.81 %)	4 (0.95 %)	n/a	11 (3.81 %)	2 (36.04 %)
655	Torque teno virus 3 (HEL32 2010) GCF_000888935.1	10 (70.14 %)	51.35 (99.92 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.72 %)	n/a	8 (4.06 %)	2 (36.13 %)
656	Torque teno virus 4 (Pt-TTV6 2010) GCF_000886355.1	2 (68.92 %)	53.55 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.92 %)	n/a	12 (7.51 %)	2 (37.05 %)
657	Torque teno virus 5 (TCHN-C1 2018) GCF_002818195.1	2 (67.73 %)	51.69 (99.88 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (1.27 %)	3 (0.74 %)	1 (20.04 %)
658	Torque teno virus 6 (KAV 2010) GCF_000888995.1	6 (70.15 %)	49.96 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.65 %)	n/a	4 (3.43 %)	2 (44.59 %)
659	Torque teno virus 7 (PMV 2010) GCF_000887275.1	3 (73.96 %)	48.41 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.14 %)	n/a	5 (1.61 %)	2 (24.36 %)
660	Torque teno virus 9 (BM1C 2018) GCF_002818245.1	1 (15.76 %)	46.54 (99.87 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (2.74 %)	n/a	1 (0.23 %)	1 (22.88 %)
661	Trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus (2010) GCF_000887495.1	6 (85.68 %)	40.08 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.92 %)	0 (0.00 %)
662	TTV-like mini virus (D11 2023) GCF_018580215.1	3 (75.99 %)	36.75 (99.89 %)	10 (0.42 %)	11 (99.58 %)	3 (0.00 %)	1 (1.89 %)	11 (8.38 %)	0 (0.00 %)
663	TTV-like mini virus (Emory1 2023) GCF_018580655.1	3 (76.93 %)	37.31 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	13 (5.05 %)	0 (0.00 %)
664	TTV-like mini virus (Emory2 2023) GCF_018580665.1	3 (82.23 %)	36.35 (99.90 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	5 (3.40 %)	0 (0.00 %)
665	TTV-like mini virus (TTMV_LY1 2013) GCF_000905335.1	3 (75.48 %)	38.63 (99.93 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.72 %)	2 (2.71 %)	7 (9.51 %)	0 (0.00 %)
666	TTV-like mini virus (TTMV_LY3 2023) GCF_018580125.1	3 (73.76 %)	39.86 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	2 (4.43 %)	6 (7.51 %)	0 (0.00 %)
667	TTV-like mini virus (vzttmv4 2023) GCF_018584815.1	3 (82.18 %)	38.42 (99.93 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.79 %)	4 (4.88 %)	0 (0.00 %)
668	TTV-like mini virus (zhenjiang 2023) GCF_018580875.1	3 (75.71 %)	37.86 (99.90 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1 (2.65 %)	7 (6.22 %)	0 (0.00 %)
669	Tulane virus (2019) GCF_004786795.1	3 (98.38 %)	46.66 (99.94 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.21 %)	0 (0.00 %)
670	Tupaia hepatovirus A (TN1 2016) GCF_001502175.1	1 (90.12 %)	39.41 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.63 %)	n/a	2 (0.97 %)	0 (0.00 %)
671	Turkey calicivirus (L11043 2019) GCF_004786995.1	2 (98.47 %)	50.01 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	0 (0.00 %)	2 (7.99 %)
672	Turkey herpesvirus (FC126 Burmester 2001) GCF_000839725.1	84 (78.98 %)	47.56 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	13 (0.36 %)	14 (1.60 %)	256 (2.38 %)	0 (0.00 %)
673	Upolu virus (2023) GCF_023156825.1	6 (94.48 %)	42.76 (99.92 %)	n/a	6 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	26 (2.56 %)	0 (0.00 %)
674	Uukuniemi virus (2003) GCF_000851865.1	4 (96.08 %)	47.69 (99.94 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	6 (0.86 %)	0 (0.00 %)
675	Vaccinia virus (WR (Western Reserve) 2005) GCF_000860085.1	223 (88.80 %)	33.34 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	26 (0.57 %)	10 (3.43 %)	744 (9.15 %)	0 (0.00 %)
676	Varicella-zoster virus (Dumas 1987) GCF_000858285.1	74 (89.36 %)	46.02 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	14 (0.32 %)	17 (0.92 %)	421 (5.39 %)	1 (0.20 %)
677	Variegated bornavirus 1 (squirrel brain 2016) GCF_001698295.1	6 (99.17 %)	42.84 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.16 %)	0 (0.00 %)
678	Venezuelan equine encephalitis virus (1993) GCF_000862105.1	6 (100.00 %)	50.12 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.27 %)	1 (0.30 %)	6 (1.47 %)	4 (15.75 %)
679	Venezuelan equine encephalitis virus (Trinidad donkey donkey/Trinidad/1943 2023) GCF_002889695.1	4 (100.00 %)	49.79 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	5 (0.51 %)	1 (0.30 %)	6 (1.28 %)	4 (12.87 %)
680	Vesicular exanthema of swine virus (2000) GCF_000847705.1	3 (97.55 %)	47.83 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	7 (0.86 %)	1 (3.04 %)
681	Vesicular stomatitis Alagoas virus (Indiana 3 2014) GCF_000924515.1	6 (99.38 %)	42.58 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.36 %)	n/a	12 (0.94 %)	0 (0.00 %)
682	Vesicular stomatitis Indiana virus (1993) GCF_000850045.1	4 (91.34 %)	41.74 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	8 (0.60 %)	0 (0.00 %)
683	Vesicular stomatitis Indiana virus (98COE 2018) GCF_002815995.1	6 (99.37 %)	41.75 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.28 %)	n/a	5 (0.31 %)	0 (0.00 %)
684	Vesicular stomatitis New Jersey virus (NJ1184HDB 2014) GCF_000923855.1	6 (95.91 %)	39.89 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	19 (1.57 %)	0 (0.00 %)
685	vesivirus (Hom-1 2017) GCF_002118765.1	3 (97.57 %)	48.33 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.10 %)	1 (3.05 %)
686	Vesivirus ferret badger/JX12/China/2012 (FBCV-JX12 2015) GCF_001019935.1	3 (98.23 %)	45.18 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.14 %)	0 (0.00 %)
687	virus (MSSI2.225 ms23.49 2014) GCF_000923355.1	3 (85.39 %)	51.80 (99.82 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.31 %)	1 (70.83 %)
688	Walrus calicivirus (2003) GCF_000852525.1	3 (97.71 %)	48.23 (99.95 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	4 (0.49 %)	3 (9.51 %)
689	Wenling frogfish filovirus (XYHYS28627 2021) GCF_004788975.1	10 (92.19 %)	49.85 (99.99 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.30 %)	n/a	3 (0.17 %)	1 (1.26 %)
690	Wenling thamnaconus septentrionalis filovirus (LQMMTII17328 2021) GCF_004788995.1	6 (91.55 %)	47.74 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.22 %)	n/a	6 (0.57 %)	0 (0.00 %)
691	Wesselsbron virus (SAH177 2009) GCF_000883915.1	1 (94.49 %)	47.65 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.37 %)	0 (0.00 %)
692	West Nile virus (956 1993) GCF_000861085.1	3 (93.90 %)	51.06 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.19 %)	3 (7.47 %)
693	West Nile virus (NY99 385-99 2007) GCF_000875385.1	5 (93.41 %)	51.17 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.07 %)	1 (2.23 %)
694	Western equine encephalitis virus (71V-1658 2000) GCF_000850885.1	4 (96.79 %)	49.21 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	1 (0.64 %)	3 (52.96 %)
695	Western equine encephalitis virus (AG80-646 2023) GCF_002889215.1	2 (96.04 %)	48.32 (99.98 %)	8 (0.07 %)	9 (99.93 %)	4 (0.29 %)	n/a	5 (1.46 %)	3 (7.08 %)
696	WU Polyomavirus (B0 2007) GCF_000870785.1	6 (85.79 %)	39.18 (99.92 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (1.03 %)	1 (0.71 %)	16 (3.46 %)	0 (0.00 %)
697	Yaba monkey tumor virus (2003) GCF_000845705.1	140 (94.29 %)	29.83 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	24 (0.67 %)	6 (0.47 %)	1,223 (18.16 %)	0 (0.00 %)
698	Yaba-like disease virus (2001) GCF_000847185.1	152 (95.76 %)	27.00 (100.00 %)	n/a	1 (100.00 %)	39 (1.06 %)	10 (0.44 %)	1,396 (21.09 %)	0 (0.00 %)
699	Yellow fever virus (17D vaccine strain 1986) GCF_000857725.1	1 (100.00 %)	49.72 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.27 %)	n/a	1 (0.28 %)	0 (0.00 %)
700	Yezo virus (HH003-2020 2023) GCF_029888495.1	3 (95.97 %)	45.30 (99.96 %)	n/a	3 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	21 (1.09 %)	0 (0.00 %)
701	Zaire ebolavirus (Ebola virus/H.sapiens-tc/COD/1976/Yambuku-Mayinga 1999) GCF_000848505.1	11 (95.31 %)	41.07 (99.98 %)	n/a	1 (100.00 %)	4 (0.18 %)	n/a	4 (0.15 %)	1 (1.12 %)
702	Zika virus (MR 766 2009) GCF_000882815.3	1 (95.05 %)	50.95 (99.96 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	3 (0.26 %)	0 (0.00 %)
703	Zika virus (Natal RGN 2017) GCF_002366285.1	1 (95.04 %)	51.26 (99.97 %)	n/a	1 (100.00 %)	3 (0.00 %)	n/a	2 (0.18 %)	0 (0.00 %)
TOTALS:	total assembly count 703

Additional hubs with collections of assemblies
Collection	Hub index pages:	Assembly statistics:	Track statistics:
Primates	261 assemblies	assembly stats	track stats
Mammals	680 assemblies	assembly stats	track stats
Birds	433 assemblies	assembly stats	track stats
Fishes	493 assemblies	assembly stats	track stats
other vertebrates	317 assemblies	assembly stats	track stats
Invertebrates	1177 assemblies	assembly stats	track stats
Plants	320 assemblies	assembly stats	track stats
Fungi	922 assemblies	assembly stats	track stats
Viruses	703 assemblies	assembly stats	track stats
Bacteria	317 assemblies	assembly stats	track stats
legacy/superseded	586 assemblies	assembly stats	track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project	1303 assemblies	assembly stats	track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project	126 assemblies	assembly stats	track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium	96 assemblies	assembly stats	track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center	1179 assemblies	assembly stats	track stats

Viral Genomes assembly hubs, track statistics

See also: hub access, assembly statistics

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