Plants Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of plants only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 A. eriantha gooseberry (White 2019)
GCA_004150315.1
n/a 21,507
(2.72 %)
60,050
(11.57 %)
n/a 35.92
(99.97 %)
2,344
(0.03 %)
1,735
(100.00 %)
430,950
(2.82 %)
273,041
(3.10 %)
4,895,011
(32.98 %)
29,695
(1.88 %)
2 A.eriantha eudicots (MHT-2021 2021)
GCF_019202715.1
71,489
(11.95 %)
23,883
(3.45 %)
59,407
(13.07 %)
n/a 35.65
(99.64 %)
710
(0.36 %)
88
(100.00 %)
430,287
(3.04 %)
350,721
(4.29 %)
3,875,064
(36.80 %)
27,794
(1.97 %)
3 adzuki bean (Jingnong 6 2015)
GCF_001190045.1
40,474
(10.62 %)
16,697
(3.71 %)
47,542
(15.07 %)
n/a 34.07
(96.37 %)
21,264
(3.63 %)
58,639
(96.37 %)
257,290
(4.08 %)
239,596
(6.43 %)
2,925,469
(36.04 %)
24,461
(2.99 %)
4 adzuki bean (LongXiaoDou No.4 2021)
GCF_016808095.1
50,989
(11.87 %)
16,661
(3.75 %)
45,945
(15.40 %)
n/a 33.63
(100.00 %)
32
(0.00 %)
36
(100.00 %)
263,673
(3.52 %)
264,113
(5.18 %)
2,808,981
(37.65 %)
20,402
(2.60 %)
5 African boxthorn (CSIRO_LF1 2023)
GCF_029784015.1
54,359
(4.64 %)
16,693
(1.34 %)
75,114
(9.09 %)
n/a 37.42
(99.88 %)
15,111
(0.12 %)
14,905
(100.00 %)
668,488
(2.42 %)
511,720
(3.29 %)
8,110,750
(42.79 %)
50,821
(2.66 %)
6 African oil palm
GCF_000442705.1
51,575
(5.06 %)
16,948
(1.48 %)
76,464
(9.29 %)
n/a 37.21
(68.90 %)
166,490
(31.14 %)
202,468
(68.86 %)
580,361
(3.63 %)
445,124
(2.25 %)
5,831,606
(30.77 %)
75,576
(3.67 %)
7 African oil palm (ETL-2024a 2024)
GCF_000442705.2
61,514
(3.59 %)
17,694
(0.94 %)
82,131
(6.45 %)
n/a 38.54
(93.07 %)
37,524
(6.94 %)
30
(100.00 %)
930,885
(3.15 %)
928,025
(5.06 %)
6,719,901
(56.47 %)
104,550
(9.50 %)
8 African rice (2021)
GCF_000147395.1
43,826
(15.96 %)
16,224
(4.82 %)
51,031
(25.64 %)
n/a 42.87
(100.00 %)
21
(0.00 %)
73
(100.00 %)
178,763
(2.60 %)
125,689
(4.18 %)
1,761,585
(30.96 %)
60,891
(21.37 %)
9 algarrobo blanco (v1 B1F8T4 2019)
GCF_004799145.1
62,791
(10.08 %)
25,423
(3.34 %)
69,507
(14.55 %)
n/a 34.31
(100.00 %)
n/a 6,087
(100.00 %)
367,402
(2.31 %)
175,862
(2.27 %)
4,241,058
(38.29 %)
18,927
(1.15 %)
10 algarrobo blanco (v2 B1F8T4 2019)
GCF_004799145.2
62,791
(10.08 %)
25,443
(3.35 %)
69,492
(14.56 %)
n/a 34.31
(100.00 %)
n/a 6,085
(100.00 %)
366,178
(2.25 %)
175,852
(2.27 %)
4,240,382
(38.29 %)
18,927
(1.15 %)
11 almond
GCF_902201215.1
37,363
(19.64 %)
14,509
(6.35 %)
33,193
(24.70 %)
n/a 37.65
(98.29 %)
6,531
(1.72 %)
1,700
(99.96 %)
137,974
(2.59 %)
100,386
(3.92 %)
1,251,126
(26.07 %)
10,893
(2.94 %)
12 annual mercury (v1 primary hap 2022)
GCF_937616625.1
47,801
(11.07 %)
13,620
(2.91 %)
37,334
(14.26 %)
n/a 33.91
(100.00 %)
15
(0.00 %)
63
(100.00 %)
201,121
(2.22 %)
661,096
(20.12 %)
2,185,025
(50.59 %)
9,024
(2.18 %)
13 annual mercury (v2 primary hap 2022)
GCF_937616625.2
44,356
(10.99 %)
13,620
(2.91 %)
37,334
(14.26 %)
n/a 33.91
(100.00 %)
15
(0.00 %)
63
(100.00 %)
201,121
(2.22 %)
661,096
(20.12 %)
2,185,025
(50.59 %)
9,024
(2.18 %)
14 annual ryegrass (FL_2022 2022)
GCF_022539505.1
73,172
(3.41 %)
26,626
(1.10 %)
228,260
(15.00 %)
n/a 44.76
(99.87 %)
31,919
(0.13 %)
1,764
(100.00 %)
639,429
(1.31 %)
739,566
(3.57 %)
6,976,583
(59.37 %)
560,429
(28.70 %)
15 ant C.braunii (S276 2018)
GCA_003427395.1
n/a 3,649
(0.20 %)
126,898
(19.85 %)
n/a 48.33
(81.70 %)
641,791
(18.38 %)
653,445
(81.62 %)
1,577,107
(5.98 %)
1,434,259
(6.24 %)
8,533,748
(36.35 %)
278,266
(17.95 %)
16 ant C.sp. (NIES-68 2022)
GCA_027943385.1
n/a 3,655
(0.79 %)
32,911
(30.45 %)
n/a 55.81
(100.00 %)
n/a 2,529
(100.00 %)
255,839
(6.03 %)
392,694
(15.77 %)
1,480,495
(52.16 %)
23,662
(78.57 %)
17 ant L.chinense (Lushan-1 2018)
GCA_003013855.2
n/a 15,545
(0.82 %)
85,577
(6.98 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
473
(0.00 %)
4,183
(100.00 %)
860,506
(2.32 %)
825,722
(4.56 %)
8,205,488
(53.73 %)
153,728
(4.12 %)
18 ant M.endlicherianum (SAG 12.97 2019)
GCA_009602735.1
n/a 2,806
(1.27 %)
21,989
(34.80 %)
n/a 51.93
(90.29 %)
24,291
(9.73 %)
38,152
(90.27 %)
147,548
(5.58 %)
92,866
(3.14 %)
715,552
(34.44 %)
34,833
(26.81 %)
19 apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 refseq)
GCF_002114115.1
64,916
(11.38 %)
22,530
(3.52 %)
67,146
(16.22 %)
n/a 38.04
(88.96 %)
7,264
(11.05 %)
807
(100.00 %)
692,611
(50.77 %)
322,556
(4.41 %)
3,055,836
(35.69 %)
25,923
(1.76 %)
20 Asian cultivated rice (Carolina Gold Select 2019)
GCA_004007595.1
n/a 16,583
(4.58 %)
55,248
(25.46 %)
n/a 43.36
(99.98 %)
696
(0.02 %)
615
(100.00 %)
495,126
(50.28 %)
124,567
(3.20 %)
1,922,072
(32.59 %)
65,220
(23.87 %)
21 Australian wild rice (MA-2024b 2025)
GCA_047496205.1
n/a 16,434
(4.16 %)
55,282
(23.68 %)
n/a 43.56
(100.00 %)
4
(0.00 %)
16
(100.00 %)
602,996
(48.61 %)
170,830
(6.54 %)
1,845,923
(37.36 %)
69,474
(22.48 %)
22 avocado (Hass MH2022 2023)
GCA_029852735.1
n/a 15,968
(1.61 %)
64,612
(11.72 %)
n/a 39.99
(100.00 %)
36
(0.00 %)
482
(100.00 %)
1,348,599
(20.35 %)
427,369
(10.49 %)
4,298,119
(41.03 %)
54,543
(5.58 %)
23 Bahia grass (Cayasta R1 2024)
GCA_036689595.1
n/a 17,830
(3.66 %)
74,926
(26.22 %)
n/a 45.79
(99.95 %)
2,801
(0.05 %)
2,811
(99.95 %)
643,354
(26.01 %)
146,179
(4.41 %)
2,284,294
(38.05 %)
110,855
(27.67 %)
24 Balbis banana (DH-PKW 2019)
GCA_004837865.1
n/a 18,974
(3.45 %)
47,957
(15.55 %)
n/a 38.02
(99.72 %)
1,197
(0.27 %)
2,590
(100.00 %)
208,141
(3.88 %)
197,690
(7.95 %)
2,068,575
(42.39 %)
52,850
(9.12 %)
25 Barbados nut
GCF_014843425.1
33,622
(13.80 %)
12,687
(4.63 %)
26,511
(14.56 %)
n/a 33.40
(99.60 %)
2,151
(0.40 %)
1,232
(100.00 %)
281,490
(24.82 %)
186,260
(5.65 %)
2,028,357
(33.33 %)
8,868
(1.38 %)
26 barrel medic (2018)
GCF_003473485.1
50,906
(14.28 %)
16,712
(3.68 %)
41,041
(14.51 %)
n/a 33.43
(99.87 %)
22
(0.13 %)
42
(100.00 %)
393,909
(27.89 %)
175,427
(3.92 %)
2,532,494
(37.64 %)
3,384
(0.27 %)
27 barrel medic (A17 2014)
GCF_000219495.3
48,865
(15.69 %)
16,549
(3.99 %)
40,316
(15.41 %)
n/a 33.14
(94.48 %)
8,785
(5.53 %)
8,027
(94.47 %)
366,709
(22.34 %)
146,748
(2.80 %)
2,549,499
(32.46 %)
3,695
(0.65 %)
28 barrel medic (HM340 2017)
GCA_002024945.1
n/a 16,672
(3.96 %)
40,032
(15.19 %)
n/a 33.05
(99.32 %)
107
(0.68 %)
909
(100.00 %)
381,065
(23.82 %)
162,402
(3.97 %)
2,490,028
(35.39 %)
3,335
(0.34 %)
29 bay (USA: Berkeley CA var. californica CCGP_DODD_UMBCAL_S1 alternate hap 2023)
GCA_028538565.1
n/a 15,063
(1.43 %)
65,125
(11.47 %)
n/a 40.34
(100.00 %)
39
(0.00 %)
197
(100.00 %)
735,552
(11.30 %)
567,295
(6.87 %)
4,176,675
(45.56 %)
66,834
(4.90 %)
30 bay (USA: Berkeley CA var. californica CCGP_DODD_UMBCAL_S1 primary hap 2023)
GCA_028534965.1
n/a 15,223
(1.43 %)
65,769
(11.33 %)
n/a 40.37
(100.00 %)
36
(0.00 %)
303
(100.00 %)
744,623
(11.37 %)
571,691
(7.15 %)
4,217,655
(45.87 %)
68,566
(4.96 %)
31 beefsteak plant (Hoko-3 primary hap 2022)
GCA_026008535.1
n/a 28,039
(2.07 %)
120,338
(15.60 %)
n/a 35.28
(100.00 %)
23
(0.00 %)
71
(100.00 %)
2,012,805
(68.74 %)
678,680
(5.87 %)
8,191,868
(44.06 %)
65,395
(2.45 %)
32 beet (v1 EL10 2021 USDA)
GCF_002917755.1
47,727
(9.45 %)
11,911
(2.04 %)
50,202
(16.78 %)
n/a 35.86
(99.99 %)
323
(0.01 %)
42
(100.00 %)
294,768
(3.41 %)
341,699
(6.22 %)
2,932,896
(35.20 %)
25,364
(1.79 %)
33 beet (v2 EL10 2022 USDA)
GCF_026745355.1
45,490
(9.22 %)
11,850
(2.05 %)
49,071
(15.89 %)
n/a 35.85
(94.03 %)
3,200
(5.97 %)
20
(100.00 %)
290,870
(3.40 %)
336,343
(5.76 %)
2,901,079
(33.21 %)
25,108
(1.67 %)
34 bell pepper eudicots (UCD-10X-F1 2018)
GCF_002878395.1
70,848
(2.17 %)
15,922
(0.50 %)
69,601
(2.75 %)
n/a 34.91
(97.27 %)
52,577
(2.73 %)
81,202
(100.00 %)
1,192,132
(1.94 %)
1,097,384
(4.12 %)
23,393,622
(47.64 %)
19,517
(0.21 %)
35 bigberry manzanita (GLNDR_RDG_Rd-6 alternate hap 2021)
GCA_019985075.1
n/a 13,887
(2.34 %)
44,507
(14.12 %)
n/a 37.97
(100.00 %)
120
(0.00 %)
2,350
(100.00 %)
250,361
(2.10 %)
231,118
(13.56 %)
2,049,366
(44.58 %)
22,527
(6.34 %)
36 bigberry manzanita (GLNDR_RDG_Rd-6 primary hap 2022)
GCA_019985065.2
n/a 15,102
(2.62 %)
47,553
(15.64 %)
n/a 38.11
(100.00 %)
82
(0.00 %)
272
(100.00 %)
257,066
(2.22 %)
226,514
(14.63 %)
2,470,334
(38.37 %)
21,415
(5.59 %)
37 birdsfoot trefoil (B-129 2022)
GCF_012489685.1
57,539
(11.82 %)
16,919
(2.98 %)
64,687
(19.59 %)
n/a 38.05
(99.97 %)
1,625
(0.04 %)
65
(100.00 %)
236,645
(2.13 %)
205,150
(5.19 %)
2,202,942
(41.60 %)
32,283
(3.44 %)
38 bitter melon
GCF_001995035.1
31,725
(13.80 %)
12,858
(4.62 %)
30,539
(16.85 %)
n/a 34.58
(92.32 %)
109,310
(7.74 %)
1,052
(100.00 %)
162,837
(2.82 %)
89,571
(2.03 %)
1,951,167
(30.96 %)
14,100
(2.00 %)
39 black cottonwood (Ptri.A.LA.226.w1 alternate hap 2023)
GCA_028534865.1
n/a 20,077
(4.66 %)
43,061
(17.16 %)
n/a 34.80
(100.00 %)
33
(0.00 %)
338
(100.00 %)
267,110
(2.88 %)
173,502
(6.32 %)
2,366,759
(39.61 %)
5,093
(4.11 %)
40 black cottonwood (Ptri.A.LA.226.w1 primary hap 2023)
GCA_028534895.1
n/a 19,804
(4.58 %)
42,642
(17.03 %)
n/a 34.85
(100.00 %)
26
(0.00 %)
132
(100.00 %)
265,925
(2.85 %)
174,688
(6.70 %)
2,359,101
(40.07 %)
4,963
(4.10 %)
41 black cottonwood (v4.1 Nisqually-1 2022)
GCF_000002775.5
59,638
(15.94 %)
19,969
(4.99 %)
41,581
(16.22 %)
n/a 33.75
(99.85 %)
59
(0.15 %)
106
(99.85 %)
257,833
(2.91 %)
156,371
(4.50 %)
2,423,627
(36.28 %)
3,761
(0.66 %)
42 black gram (Urdbean 2024)
GCA_036885675.1
n/a 16,158
(3.35 %)
47,346
(15.05 %)
n/a 33.60
(99.97 %)
282
(0.03 %)
13
(100.00 %)
832,234
(57.53 %)
240,933
(5.84 %)
2,976,104
(38.95 %)
16,895
(2.01 %)
43 black tea
GCF_004153795.1
101,253
(3.17 %)
20,982
(0.66 %)
156,999
(7.69 %)
n/a 37.85
(92.12 %)
79,329
(7.89 %)
14,028
(100.00 %)
1,926,995
(3.23 %)
2,024,420
(8.06 %)
17,959,098
(50.75 %)
181,027
(2.79 %)
44 blue lilly pilly tree (NSW1041296 2022)
GCF_021117445.2
46,173
(12.87 %)
15,187
(3.49 %)
50,585
(20.61 %)
n/a 40.95
(100.00 %)
13
(0.00 %)
72
(100.00 %)
494,434
(48.54 %)
220,571
(4.98 %)
1,866,530
(29.09 %)
59,325
(10.76 %)
45 bread wheat (Chinese Spring 2020)
GCA_002220415.3
n/a 46,431
(0.31 %)
805,204
(7.93 %)
n/a 46.09
(99.87 %)
211,982
(0.14 %)
70,316
(100.00 %)
9,191,325
(44.14 %)
5,086,953
(4.53 %)
282,298
(99.86 %)
3,241,124
(28.06 %)
46 bread wheat (Chinese Spring 2021, UC Davis)
GCF_018294505.1
221,450
(1.62 %)
n/a 763,380
(8.08 %)
n/a 46.14
(98.27 %)
214,799
(1.73 %)
91,589
(100.00 %)
8,660,189
(44.94 %)
4,402,049
(3.94 %)
306,386
(98.27 %)
3,040,030
(27.48 %)
47 bread wheat (Chinese Spring IWGSC RefSeq v1.0 2018)
GCA_900519105.1
n/a n/a 751,576
(8.03 %)
n/a 46.05
(98.12 %)
693,028
(1.90 %)
693,050
(98.10 %)
8,420,935
(44.23 %)
4,115,828
(3.69 %)
693,050
(98.10 %)
3,076,631
(26.41 %)
48 bread wheat (Fielder 2021)
GCA_907166925.1
n/a n/a 773,766
(8.20 %)
n/a 46.05
(100.00 %)
1,407
(0.00 %)
3,795
(100.00 %)
8,703,192
(44.57 %)
4,569,103
(5.20 %)
5,202
(100.00 %)
3,001,896
(28.00 %)
49 bread wheat (Kariega 2021)
GCA_910594105.1
n/a 47,400
(0.34 %)
778,134
(8.33 %)
n/a 46.11
(99.87 %)
7,376
(0.13 %)
7,398
(99.87 %)
14,835,099
(85.31 %)
4,570,540
(5.40 %)
7,395
(99.87 %)
2,994,427
(28.25 %)
50 brown mustard (Varuna 2020)
GCA_015484525.1
n/a 50,825
(7.02 %)
128,133
(24.54 %)
n/a 37.47
(96.71 %)
3,070
(3.29 %)
720
(100.00 %)
905,496
(54.34 %)
440,139
(7.46 %)
4,073,637
(39.30 %)
54,083
(6.71 %)
51 button wrinklewort R.leptorrhynchoides (AG116_Rl617_1_P2 2025)
GCF_046630445.1
79,194
(1.39 %)
19,567
(0.31 %)
119,910
(3.26 %)
n/a 33.70
(100.00 %)
1
(0.00 %)
549
(100.00 %)
3,727,770
(5.18 %)
3,762,751
(4.98 %)
10,213,591
(82.37 %)
54,254
(0.38 %)
52 cacao
GCF_000208745.1
34,727
(13.67 %)
14,294
(4.65 %)
29,216
(14.38 %)
n/a 34.09
(94.31 %)
11,787
(5.70 %)
431
(100.00 %)
206,049
(15.64 %)
99,229
(2.66 %)
1,933,579
(33.24 %)
2,964
(0.34 %)
53 California black walnut (Jcal.S.LA.6 alternate hap 2022)
GCA_023349545.1
n/a 18,729
(3.22 %)
57,374
(16.70 %)
n/a 36.81
(100.00 %)
78
(0.00 %)
915
(100.00 %)
421,731
(3.42 %)
300,957
(5.54 %)
2,794,242
(34.11 %)
25,348
(3.39 %)
54 California black walnut (Jcal.S.LA.6 primary hap 2022)
GCA_023349395.1
n/a 18,579
(3.26 %)
56,295
(16.71 %)
n/a 36.92
(100.00 %)
11
(0.00 %)
138
(100.00 %)
414,129
(3.48 %)
293,951
(5.95 %)
3,055,420
(34.96 %)
24,749
(4.05 %)
55 California pipevine (CCGP_79_NKW_82.1479hap1 2023)
GCF_029961685.1
43,175
(7.78 %)
16,377
(2.29 %)
43,559
(11.38 %)
n/a 36.31
(100.00 %)
175
(0.00 %)
706
(100.00 %)
341,665
(12.46 %)
223,217
(36.36 %)
2,388,236
(58.00 %)
26,535
(3.98 %)
56 California scrub oak (Qber.S.LA.60 alternate hap 2023)
GCA_028535905.1
n/a 16,153
(1.86 %)
68,653
(14.03 %)
n/a 35.79
(100.00 %)
43
(0.00 %)
807
(100.00 %)
783,798
(4.17 %)
456,025
(10.87 %)
4,951,918
(40.76 %)
21,783
(2.16 %)
57 California scrub oak (Qber.S.LA.60 primary hap 2023)
GCA_028535815.1
n/a 15,836
(1.90 %)
66,803
(13.99 %)
n/a 35.77
(100.00 %)
32
(0.00 %)
283
(100.00 %)
762,029
(4.24 %)
448,099
(10.97 %)
4,784,968
(41.07 %)
20,384
(2.28 %)
58 Cannabis sativa ( 2020)
GCA_016165845.1
n/a 18,838
(1.94 %)
71,211
(13.84 %)
n/a 33.78
(99.91 %)
8,772
(0.10 %)
147
(100.00 %)
643,488
(3.49 %)
361,843
(3.63 %)
4,074,440
(56.52 %)
27,745
(1.31 %)
59 Cannabis sativa (Cannatonic 2016)
GCA_001865755.1
n/a 10,725
(1.71 %)
41,537
(11.41 %)
n/a 33.68
(100.00 %)
n/a 11,110
(100.00 %)
396,112
(4.11 %)
221,932
(3.23 %)
2,389,229
(59.21 %)
17,045
(1.23 %)
60 Cannabis sativa (Harvard OEB 2019)
GCF_900626175.2
39,696
(6.07 %)
13,883
(1.80 %)
50,556
(11.19 %)
n/a 33.51
(84.07 %)
843
(15.93 %)
1,052
(84.07 %)
496,648
(3.63 %)
258,281
(2.28 %)
3,594,433
(47.71 %)
22,750
(1.69 %)
61 Cannabis sativa (Jamaican Lion DASH 2019)
GCA_003660325.2
n/a 24,975
(1.79 %)
113,252
(15.69 %)
n/a 34.00
(100.00 %)
n/a 3,372
(100.00 %)
936,351
(4.13 %)
520,230
(3.65 %)
5,183,602
(58.66 %)
47,327
(1.58 %)
62 Cannabis sativa (Jamaican Lion Mother 2020)
GCA_012923435.1
n/a 15,253
(1.67 %)
62,228
(12.57 %)
n/a 34.08
(100.00 %)
n/a 1,599
(100.00 %)
595,917
(3.95 %)
335,791
(3.38 %)
3,478,519
(61.18 %)
31,738
(1.57 %)
63 Cannabis sativa (JL 2020)
GCA_013030365.1
n/a 15,334
(1.80 %)
60,140
(12.83 %)
n/a 33.79
(99.92 %)
2,496
(0.09 %)
483
(100.00 %)
567,458
(3.73 %)
320,455
(3.12 %)
3,403,771
(58.38 %)
27,791
(1.48 %)
64 capsicum (Zunla-1 2015 refseq)
GCF_000710875.1
57,769
(2.07 %)
16,114
(0.55 %)
62,579
(2.93 %)
n/a 34.94
(96.78 %)
107,172
(3.23 %)
108,799
(96.77 %)
968,939
(3.15 %)
948,741
(4.39 %)
21,535,213
(46.15 %)
16,685
(0.21 %)
65 carrot
GCF_001625215.1
51,773
(15.95 %)
16,649
(3.96 %)
50,187
(20.50 %)
n/a 34.79
(91.77 %)
26,112
(8.24 %)
4,826
(100.00 %)
179,630
(2.41 %)
166,060
(4.97 %)
1,981,148
(31.51 %)
8,564
(0.85 %)
66 carrot (DH1 2023)
GCF_001625215.2
60,116
(15.29 %)
16,679
(3.49 %)
51,607
(18.82 %)
n/a 34.97
(99.99 %)
554
(0.01 %)
11
(100.00 %)
195,035
(2.33 %)
186,941
(8.11 %)
2,018,050
(39.61 %)
10,319
(1.14 %)
67 cassava (60444 2018)
GCA_003957885.1
n/a 27,737
(2.70 %)
78,774
(11.79 %)
n/a 37.13
(76.51 %)
36,478
(23.50 %)
4,440
(100.00 %)
584,617
(3.41 %)
554,162
(3.52 %)
4,126,060
(43.14 %)
77,570
(1.78 %)
68 cassava (v8 AM560-2 2021 DOE)
GCF_001659605.2
56,386
(9.38 %)
18,790
(2.86 %)
49,944
(11.73 %)
n/a 37.52
(99.61 %)
672
(0.39 %)
758
(99.61 %)
377,964
(3.52 %)
356,023
(4.79 %)
2,560,255
(56.85 %)
52,506
(2.50 %)
69 castor bean (Hale 2011 JCVI)
GCF_000151685.1
33,377
(11.52 %)
13,874
(4.00 %)
33,656
(13.67 %)
n/a 33.84
(96.11 %)
23,313
(3.90 %)
49,406
(96.10 %)
207,850
(3.52 %)
166,467
(10.85 %)
1,676,921
(43.19 %)
12,838
(2.54 %)
70 castor bean (wild-type WT05 2021)
GCA_019578655.1
n/a 13,864
(4.31 %)
29,909
(14.27 %)
n/a 33.05
(99.95 %)
331
(0.05 %)
146
(100.00 %)
328,084
(38.04 %)
128,377
(6.36 %)
1,992,583
(39.20 %)
7,290
(1.00 %)
71 castor bean (wild-type WT05 2021)
GCF_019578655.1
39,358
(13.36 %)
13,841
(4.31 %)
29,805
(14.24 %)
n/a 33.03
(99.95 %)
331
(0.05 %)
140
(100.00 %)
205,974
(3.02 %)
128,354
(6.37 %)
1,998,066
(39.24 %)
7,216
(0.99 %)
72 celery A.graveolens (Ventura 2021)
GCF_009905375.1
89,565
(2.38 %)
17,560
(0.48 %)
115,390
(5.30 %)
n/a 35.68
(99.73 %)
4,633
(0.27 %)
4,854
(100.00 %)
1,247,170
(1.97 %)
1,423,285
(4.75 %)
11,041,078
(71.09 %)
31,562
(0.31 %)
73 Ceratopteris richardii C-fern (Hn-n 2020)
GCA_011386875.1
n/a 3
(0.11 %)
117
(7.42 %)
n/a 39.35
(99.99 %)
4
(0.01 %)
35
(100.00 %)
1,139
(3.04 %)
1,677
(4.92 %)
11,074
(10.60 %)
76
(1.07 %)
74 Ceratopteris richardii C-fern (Hn-n Whitten #5841 2020)
GCA_009866685.1
n/a 6,487
(0.16 %)
114,999
(4.12 %)
n/a 37.82
(62.87 %)
490,371
(37.15 %)
1,116,784
(62.85 %)
692,892
(1.67 %)
790,165
(1.22 %)
18,073,193
(31.20 %)
24,414
(0.46 %)
75 chia eudicots (TCC Black 2014 2022)
GCF_023119035.1
53,262
(17.46 %)
17,642
(4.97 %)
49,474
(23.85 %)
n/a 36.14
(99.81 %)
3,756
(0.19 %)
1,556
(100.00 %)
156,083
(2.30 %)
128,904
(3.10 %)
2,112,137
(31.93 %)
31,157
(5.92 %)
76 chickpea
GCF_000331145.1
42,036
(9.83 %)
15,685
(3.16 %)
30,411
(8.82 %)
n/a 31.04
(90.95 %)
31,897
(9.07 %)
39,024
(90.93 %)
339,564
(10.51 %)
318,439
(11.48 %)
2,929,750
(43.82 %)
3,488
(0.28 %)
77 chickpea (CDC Frontier Library 1 2024)
GCF_000331145.2
42,320
(9.82 %)
15,593
(3.16 %)
30,475
(8.82 %)
n/a 31.03
(91.05 %)
33,507
(8.98 %)
6,446
(100.00 %)
308,190
(3.39 %)
318,609
(11.50 %)
2,922,065
(43.86 %)
3,472
(0.28 %)
78 chicory (Punajuju 2022)
GCA_023525715.1
n/a 16,855
(1.17 %)
92,310
(11.34 %)
n/a 35.50
(99.99 %)
510
(0.01 %)
208
(100.00 %)
1,976,706
(34.89 %)
781,413
(8.81 %)
6,080,413
(49.06 %)
51,571
(2.99 %)
79 China rose (Old Blush v2 2019)
GCF_002994745.2
66,337
(12.31 %)
15,432
(2.83 %)
67,569
(21.71 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
33
(0.00 %)
53
(100.00 %)
275,878
(2.26 %)
229,333
(3.98 %)
2,244,200
(35.17 %)
37,317
(4.17 %)
80 Chinese keys (BR_CEBAR01 2022)
GCA_024364735.1
n/a 23,898
(0.89 %)
138,156
(8.52 %)
n/a 40.10
(96.58 %)
25,154
(3.42 %)
35,781
(96.58 %)
829,613
(1.78 %)
1,793,985
(6.94 %)
8,707,237
(62.53 %)
317,707
(8.50 %)
81 Chinese licorice (Kyoto 2023)
GCA_030159175.1
n/a 16,920
(3.67 %)
44,776
(19.51 %)
n/a 37.70
(100.00 %)
20
(0.00 %)
89
(100.00 %)
593,642
(17.68 %)
219,391
(21.45 %)
2,088,553
(50.28 %)
15,616
(4.58 %)
82 Chinese licorice (manju 2023)
GCA_027886165.1
n/a 16,877
(4.02 %)
43,800
(15.68 %)
n/a 35.67
(99.96 %)
1,409
(0.03 %)
6,467
(100.00 %)
582,162
(19.03 %)
193,998
(5.82 %)
2,492,820
(41.31 %)
18,054
(4.04 %)
83 Chinese medicinal orchid (niu2020 2021)
GCA_019514585.1
n/a 13,666
(0.97 %)
71,763
(9.04 %)
n/a 35.33
(99.97 %)
1,170
(0.03 %)
1,621
(100.00 %)
635,445
(2.92 %)
599,600
(4.44 %)
8,101,700
(44.90 %)
75,475
(3.56 %)
84 Chinese white pear (Dangshansuli 2012)
GCF_000315295.1
54,029
(12.78 %)
22,400
(4.38 %)
57,140
(17.42 %)
n/a 37.29
(97.86 %)
24,384
(2.15 %)
26,566
(97.85 %)
368,808
(18.26 %)
218,013
(4.36 %)
2,456,496
(34.15 %)
18,367
(1.88 %)
85 Chinese white pear (Hongxiangsu 2021)
GCF_019419815.1
62,514
(13.83 %)
22,289
(4.29 %)
57,502
(17.16 %)
n/a 37.35
(100.00 %)
n/a 452
(100.00 %)
290,077
(2.40 %)
209,363
(3.56 %)
2,519,627
(35.77 %)
19,299
(1.84 %)
86 clementine
GCF_000493195.1
36,454
(14.29 %)
14,126
(4.66 %)
32,820
(18.34 %)
n/a 34.96
(97.94 %)
7,564
(2.07 %)
8,962
(97.93 %)
178,443
(2.76 %)
104,853
(5.57 %)
1,933,079
(33.91 %)
7,930
(3.80 %)
87 climbing nightshade (primary hap 2022)
GCF_947179165.1
44,646
(5.40 %)
15,784
(1.70 %)
48,875
(7.66 %)
n/a 35.83
(100.00 %)
38
(0.00 %)
105
(100.00 %)
347,467
(1.98 %)
290,488
(4.50 %)
6,293,084
(43.53 %)
8,929
(0.83 %)
88 club-mosses (2010)
GCF_000143415.4
49,382
(28.03 %)
11,312
(4.28 %)
36,277
(36.82 %)
n/a 45.22
(98.15 %)
4,395
(1.86 %)
5,152
(98.14 %)
138,958
(36.90 %)
77,054
(2.71 %)
802,227
(32.19 %)
34,479
(27.80 %)
89 club-mosses (Aurea 2015)
GCA_001021135.1
n/a 6,316
(4.02 %)
55,013
(41.57 %)
n/a 44.70
(99.81 %)
351
(0.00 %)
106,265
(100.00 %)
29,218
(1.24 %)
29,377
(1.67 %)
480,195
(13.66 %)
19,392
(13.60 %)
90 coffee (Caturra red CCC135-36 2018)
GCA_003713225.1
n/a 23,597
(2.02 %)
86,132
(13.38 %)
n/a 36.94
(99.79 %)
690
(0.21 %)
2,832
(100.00 %)
502,137
(2.12 %)
386,196
(3.95 %)
5,651,566
(41.67 %)
36,395
(1.62 %)
91 coffee (Red Bourbon ID1545 2023)
GCA_030873655.1
n/a 25,435
(1.84 %)
94,196
(12.02 %)
n/a 37.21
(99.99 %)
197
(0.01 %)
1,794
(100.00 %)
1,591,482
(68.40 %)
423,470
(5.23 %)
6,621,994
(45.23 %)
49,710
(2.01 %)
92 coffee C.arabica (CCC135-36 2018)
GCF_003713225.1
80,737
(8.03 %)
23,574
(2.02 %)
85,662
(13.32 %)
n/a 36.94
(99.79 %)
691
(0.21 %)
2,833
(100.00 %)
501,414
(2.11 %)
386,209
(3.95 %)
5,652,743
(41.66 %)
36,398
(1.62 %)
93 coffee C.arabica (ET-39 2024)
GCF_036785885.1
119,626
(9.97 %)
25,877
(2.06 %)
97,184
(14.13 %)
n/a 37.50
(100.00 %)
107
(0.00 %)
134
(100.00 %)
542,076
(2.06 %)
445,020
(5.76 %)
5,654,970
(44.41 %)
38,607
(3.43 %)
94 coffee C.eugenioides (CCC68of 2018)
GCF_003713205.1
43,829
(7.69 %)
14,911
(2.02 %)
57,408
(14.42 %)
n/a 36.89
(97.92 %)
3,482
(2.08 %)
3,530
(100.00 %)
312,360
(2.09 %)
234,658
(3.24 %)
3,464,594
(38.91 %)
21,553
(1.54 %)
95 Commerson's wild potato (CGN18024_1 2023)
GCA_029007595.1
n/a 16,068
(2.21 %)
50,780
(10.49 %)
n/a 34.48
(99.99 %)
1
(0.01 %)
639
(100.00 %)
1,250,333
(70.08 %)
249,197
(3.97 %)
5,014,592
(38.92 %)
6,970
(0.46 %)
96 common bean
GCF_000499845.1
32,720
(9.56 %)
16,474
(3.53 %)
45,055
(14.46 %)
n/a 34.96
(90.70 %)
40,860
(9.33 %)
41,568
(90.67 %)
233,709
(2.97 %)
208,045
(3.61 %)
2,886,693
(37.28 %)
38,054
(5.05 %)
97 common cattail (L0001 2021)
GCF_019914945.1
37,046
(18.67 %)
14,152
(6.13 %)
28,640
(19.48 %)
n/a 37.74
(99.99 %)
66
(0.01 %)
76
(100.00 %)
129,836
(2.97 %)
80,188
(2.65 %)
1,248,248
(29.88 %)
22,935
(5.83 %)
98 common fig (Dottato GU2019 2019)
GCA_009761775.1
n/a 14,992
(4.28 %)
36,350
(16.84 %)
n/a 34.41
(99.99 %)
394
(0.01 %)
905
(99.99 %)
475,247
(5.76 %)
230,646
(4.36 %)
2,425,030
(37.74 %)
18,611
(3.41 %)
99 common jujube (AT0 2021)
GCF_020796205.1
49,622
(12.72 %)
14,929
(3.58 %)
32,981
(12.20 %)
n/a 33.07
(99.99 %)
381
(0.01 %)
538
(100.00 %)
525,520
(5.43 %)
225,151
(3.91 %)
2,463,587
(42.86 %)
13,018
(1.79 %)
100 common jujube (Dongzao 2015)
GCF_000826755.1
49,976
(13.24 %)
16,949
(3.79 %)
38,488
(13.47 %)
n/a 33.40
(95.35 %)
24,158
(4.67 %)
28,947
(95.33 %)
525,525
(5.37 %)
246,475
(5.25 %)
2,603,240
(38.46 %)
13,597
(2.11 %)
101 common jujube (Dongzao 2023)
GCF_031755915.1
51,464
(13.54 %)
14,443
(3.56 %)
31,633
(12.06 %)
n/a 33.20
(100.00 %)
n/a 14
(100.00 %)
516,010
(5.54 %)
234,395
(5.05 %)
2,319,259
(43.64 %)
12,926
(2.66 %)
102 common jujube (Junzao 2020)
GCA_001835785.2
n/a 14,443
(3.88 %)
30,773
(12.63 %)
n/a 32.95
(99.91 %)
222
(0.09 %)
155
(100.00 %)
478,087
(5.53 %)
206,042
(4.15 %)
2,222,289
(41.43 %)
11,860
(1.82 %)
103 common reed (primary hap 2023)
GCF_958298935.1
65,051
(8.85 %)
26,142
(3.49 %)
114,639
(23.87 %)
n/a 44.17
(100.00 %)
59
(0.00 %)
37
(100.00 %)
243,799
(1.41 %)
237,530
(2.79 %)
4,477,357
(31.45 %)
154,087
(19.32 %)
104 common sunflower
GCF_002127325.2
133,319
(3.74 %)
19,514
(0.59 %)
166,187
(9.16 %)
n/a 38.59
(97.94 %)
2,384
(2.06 %)
334
(100.00 %)
1,263,836
(2.20 %)
1,549,598
(4.15 %)
12,728,097
(58.39 %)
170,287
(2.39 %)
105 common tobacco (Basma Xanthi 2014)
GCA_000715095.1
n/a 29,103
(0.75 %)
200,375
(6.85 %)
n/a 38.98
(95.11 %)
468,375
(4.88 %)
1,111,920
(95.12 %)
1,199,550
(3.27 %)
1,359,905
(4.81 %)
24,590,709
(50.95 %)
205,873
(1.79 %)
106 common tobacco (K326 2023)
GCA_000715075.2
n/a 31,039
(0.78 %)
176,804
(6.40 %)
n/a 39.12
(100.00 %)
710
(0.00 %)
699
(100.00 %)
4,626,207
(84.12 %)
1,502,920
(6.71 %)
24,314,611
(56.69 %)
225,794
(1.93 %)
107 common tobacco (K326 2023)
GCF_000715075.1
116,106
(3.08 %)
31,018
(0.77 %)
176,913
(6.40 %)
n/a 39.12
(100.00 %)
712
(0.00 %)
701
(100.00 %)
1,205,229
(1.45 %)
1,502,955
(6.71 %)
24,316,152
(56.68 %)
225,863
(1.93 %)
108 common tobacco (TN90 2014)
GCF_000715135.1
100,875
(3.08 %)
29,968
(0.80 %)
184,998
(7.05 %)
n/a 38.95
(97.11 %)
292,325
(2.90 %)
292,601
(97.11 %)
1,134,202
(3.09 %)
1,268,208
(4.45 %)
24,013,710
(52.08 %)
204,914
(1.84 %)
109 common vetch (South Australia 2022)
GCA_021764765.1
n/a 17,420
(0.99 %)
77,140
(6.43 %)
n/a 35.62
(99.97 %)
5,823
(0.04 %)
18
(100.00 %)
708,538
(2.24 %)
719,430
(5.37 %)
8,370,861
(57.87 %)
32,513
(0.96 %)
110 cork oak (v2 HL8 2018)
GCF_002906115.2
53,587
(7.04 %)
17,804
(1.85 %)
77,741
(13.65 %)
n/a 35.35
(97.95 %)
25,649
(2.05 %)
22,642
(100.00 %)
860,049
(3.78 %)
485,854
(6.14 %)
5,989,180
(36.35 %)
20,674
(1.12 %)
111 cork oak (v3 HL8 2024)
GCF_002906115.3
56,406
(8.63 %)
16,303
(2.05 %)
63,990
(13.73 %)
n/a 34.91
(95.70 %)
26,066
(4.30 %)
28,407
(95.70 %)
743,470
(3.99 %)
393,077
(5.53 %)
4,897,193
(34.87 %)
16,140
(0.90 %)
112 cotton G.hirsutum (BGI 2015)
GCF_000987745.1
112,410
(5.51 %)
35,047
(1.61 %)
101,814
(6.75 %)
n/a 34.45
(97.16 %)
48,742
(2.84 %)
57,884
(97.16 %)
829,774
(2.69 %)
808,839
(3.64 %)
12,556,104
(52.01 %)
31,946
(0.61 %)
113 cotton G.hirsutum (HudsonAlpha 2021)
GCF_007990345.1
154,134
(6.02 %)
37,839
(1.61 %)
107,764
(6.56 %)
n/a 34.36
(99.87 %)
5,708
(0.13 %)
6,735
(99.87 %)
996,701
(2.36 %)
903,817
(3.56 %)
13,123,355
(54.75 %)
35,220
(0.59 %)
114 cotton G.raimondii
GCF_000327365.1
72,590
(8.99 %)
20,368
(2.64 %)
86,941
(18.36 %)
n/a 33.22
(98.25 %)
19,717
(1.76 %)
20,751
(98.24 %)
367,610
(3.53 %)
300,200
(3.32 %)
5,199,574
(40.83 %)
10,926
(0.55 %)
115 cowpea (IT97K-499-35 v2 2019)
GCF_004118075.2
48,588
(10.55 %)
16,925
(3.30 %)
44,689
(13.01 %)
n/a 32.95
(99.48 %)
68
(0.52 %)
676
(100.00 %)
344,688
(3.92 %)
283,941
(8.14 %)
3,091,888
(41.66 %)
24,507
(2.34 %)
116 crookneck pumpkin
GCF_002738365.1
49,636
(19.79 %)
18,863
(6.83 %)
34,588
(19.24 %)
n/a 36.43
(97.43 %)
13,813
(2.58 %)
3,500
(100.00 %)
181,838
(3.12 %)
140,936
(7.42 %)
1,550,544
(33.30 %)
13,714
(2.69 %)
117 cucumber
GCF_000004075.3
37,079
(18.45 %)
13,349
(5.61 %)
23,889
(15.73 %)
n/a 32.84
(99.98 %)
89
(0.02 %)
88
(100.00 %)
158,454
(3.72 %)
77,247
(3.20 %)
1,739,467
(33.72 %)
5,730
(1.35 %)
118 cultivated vanilla (Daphna alternate hap 2020)
GCA_016413885.1
n/a 14,128
(1.63 %)
42,460
(7.33 %)
n/a 30.78
(99.98 %)
2,018
(0.02 %)
668
(100.00 %)
377,357
(3.69 %)
183,159
(2.82 %)
5,560,199
(36.58 %)
30,878
(2.75 %)
119 cultivated vanilla (Daphna primary hap 2020)
GCA_016413895.1
n/a 13,933
(1.63 %)
40,035
(6.93 %)
n/a 30.80
(99.98 %)
1,977
(0.02 %)
667
(100.00 %)
373,612
(3.67 %)
181,531
(2.84 %)
5,483,268
(36.45 %)
30,829
(2.75 %)
120 currant tomato (LA2093 2020)
GCA_014964335.1
n/a 15,541
(2.01 %)
39,725
(7.40 %)
n/a 34.48
(99.94 %)
373
(0.06 %)
127
(100.00 %)
369,651
(3.79 %)
256,146
(4.80 %)
5,523,685
(41.09 %)
32,203
(2.29 %)
121 damask rose (2016)
GCA_001662545.1
n/a 16,060
(1.87 %)
117,610
(18.87 %)
n/a 38.73
(97.06 %)
101,982
(2.91 %)
409,854
(97.09 %)
329,911
(1.95 %)
258,478
(2.82 %)
3,747,902
(31.42 %)
48,987
(3.05 %)
122 date palm (Barhee BC4 2019)
GCF_009389715.1
61,678
(8.40 %)
18,582
(2.20 %)
70,121
(14.29 %)
n/a 40.29
(100.00 %)
317
(0.00 %)
2,391
(100.00 %)
431,923
(8.92 %)
371,389
(4.19 %)
2,721,501
(44.16 %)
89,481
(12.47 %)
123 date palm (Khalas 2013)
GCF_000413155.1
48,949
(10.55 %)
16,697
(2.99 %)
64,523
(16.24 %)
n/a 39.33
(91.22 %)
64,723
(8.79 %)
143,382
(91.21 %)
284,003
(7.58 %)
185,641
(2.23 %)
2,574,645
(27.52 %)
62,332
(7.21 %)
124 date-plum (Yz01 2020)
GCF_014633365.1
48,290
(8.05 %)
15,110
(2.28 %)
57,536
(14.48 %)
n/a 36.57
(99.99 %)
606
(0.01 %)
43
(100.00 %)
445,970
(3.39 %)
319,468
(5.39 %)
3,687,072
(36.31 %)
41,402
(3.02 %)
125 dessert banana (baxijiao 2024)
GCF_036884655.1
193,799
(12.81 %)
52,060
(3.07 %)
144,859
(15.37 %)
n/a 39.78
(99.99 %)
219
(0.01 %)
1,085
(100.00 %)
713,274
(2.40 %)
840,280
(6.39 %)
4,419,734
(51.60 %)
203,906
(13.78 %)
126 domesticated barley (Golden Promise 2019)
GCA_902500625.1
n/a 17,386
(0.43 %)
252,520
(9.04 %)
n/a 44.38
(97.83 %)
621,008
(2.23 %)
8
(100.00 %)
3,098,901
(53.34 %)
2,055,561
(5.88 %)
14,404,046
(70.52 %)
706,795
(16.04 %)
127 domesticated barley (H.vulgare 2021 refseq)
GCF_904849725.1
63,364
(1.67 %)
17,849
(0.43 %)
260,921
(9.04 %)
n/a 44.46
(99.97 %)
162
(0.03 %)
291
(100.00 %)
2,720,197
(55.13 %)
1,726,335
(5.40 %)
14,010,390
(72.58 %)
732,834
(17.24 %)
128 durian
GCF_002303985.1
68,467
(10.35 %)
24,627
(3.34 %)
48,130
(9.41 %)
n/a 32.64
(99.58 %)
3,044
(0.43 %)
677
(100.00 %)
490,482
(3.80 %)
509,842
(12.92 %)
4,397,155
(48.22 %)
56,957
(6.23 %)
129 durum wheat (2019)
GCA_900231445.1
n/a 32,523
(0.34 %)
530,488
(8.17 %)
n/a 46.01
(98.73 %)
330,230
(1.28 %)
330,244
(98.72 %)
2,723,974
(3.46 %)
2,746,444
(3.02 %)
330,244
(98.72 %)
2,108,395
(25.96 %)
130 eggplant (2014)
GCA_000787875.1
n/a 15,481
(1.92 %)
48,974
(7.98 %)
n/a 35.72
(95.30 %)
118,249
(4.75 %)
143,048
(95.25 %)
317,711
(2.21 %)
307,772
(4.55 %)
6,006,653
(38.61 %)
7,570
(0.50 %)
131 elephant grass (2022)
GCA_022644695.1
n/a 34,754
(1.95 %)
231,748
(22.13 %)
n/a 46.97
(99.99 %)
1,574
(0.01 %)
1,588
(99.99 %)
587,262
(1.41 %)
551,392
(2.62 %)
9,678,348
(46.32 %)
398,884
(36.81 %)
132 emerald green okra A.esculentus (Green Star 2024)
GCA_035048815.1
n/a 57,092
(4.66 %)
139,785
(17.31 %)
n/a 33.78
(99.95 %)
104
(0.05 %)
182
(99.95 %)
665,897
(3.33 %)
561,368
(7.98 %)
6,809,885
(45.67 %)
31,360
(1.27 %)
133 English oak (primary hap 2022)
GCF_932294415.1
69,211
(8.60 %)
15,792
(1.92 %)
66,872
(14.31 %)
n/a 35.68
(100.00 %)
119
(0.00 %)
96
(100.00 %)
773,652
(4.18 %)
429,695
(8.87 %)
4,823,216
(39.65 %)
21,654
(2.15 %)
134 English walnut
GCF_001411555.2
52,962
(10.18 %)
18,927
(3.19 %)
60,210
(17.37 %)
n/a 36.21
(99.89 %)
1,051
(0.11 %)
24,757
(100.00 %)
434,989
(3.86 %)
303,673
(3.70 %)
3,318,114
(33.94 %)
24,028
(1.83 %)
135 eudicot A.cruentus (Arusha 2021)
GCA_019425755.1
n/a 12,903
(3.20 %)
33,445
(14.99 %)
n/a 33.08
(99.96 %)
983
(0.04 %)
625
(100.00 %)
891,822
(54.95 %)
181,416
(3.89 %)
2,376,097
(36.79 %)
4,821
(0.53 %)
136 eudicot A.glutinosa (primary hap 2023)
GCF_958979055.1
42,218
(10.92 %)
14,784
(3.18 %)
46,293
(16.46 %)
n/a 36.73
(100.00 %)
96
(0.00 %)
15
(100.00 %)
433,802
(3.92 %)
270,411
(4.15 %)
2,634,547
(36.26 %)
29,535
(3.72 %)
137 eudicot A.graveolens (Ventura 2020)
GCA_009905375.1
n/a 17,520
(0.48 %)
115,295
(5.30 %)
n/a 35.68
(99.73 %)
4,633
(0.27 %)
4,852
(100.00 %)
1,247,334
(1.96 %)
1,423,238
(4.75 %)
11,040,179
(71.10 %)
31,499
(0.31 %)
138 eudicot C.lanceoleosa (SQ_2022a 2022)
GCA_025200525.1
n/a 21,858
(0.67 %)
153,069
(7.18 %)
n/a 37.63
(99.99 %)
2,949
(0.01 %)
790
(100.00 %)
4,031,259
(23.47 %)
2,174,993
(6.70 %)
18,920,250
(54.60 %)
200,005
(3.83 %)
139 eudicot C.lavandulifolium (G1 2022)
GCA_022545495.1
n/a 18,954
(0.61 %)
117,628
(6.04 %)
n/a 36.02
(99.96 %)
10,291
(0.04 %)
178
(100.00 %)
2,596,263
(19.70 %)
1,222,904
(3.44 %)
12,327,164
(55.80 %)
67,370
(0.88 %)
140 eudicot C.sativa (Pink pepper KNU-18-1 2023)
GCF_029168945.1
47,822
(7.37 %)
14,132
(1.76 %)
52,606
(11.89 %)
n/a 34.09
(100.00 %)
53
(0.00 %)
18
(100.00 %)
490,095
(3.26 %)
291,432
(3.68 %)
3,197,241
(60.23 %)
29,385
(2.13 %)
141 eudicot C.seticuspe (Gojo-0 2021)
GCA_019973895.1
n/a 17,958
(0.52 %)
141,880
(7.25 %)
n/a 36.23
(98.03 %)
37,176
(1.97 %)
45,671
(98.03 %)
3,118,877
(21.04 %)
1,512,311
(3.93 %)
10,481,296
(59.70 %)
63,123
(0.67 %)
142 eudicot D.spatulata (IRGN DVMQU6P362 2024)
GCA_035668315.1
n/a 16,707
(3.49 %)
62,287
(20.90 %)
n/a 37.76
(99.96 %)
1,083
(0.03 %)
24,058
(99.97 %)
274,473
(12.37 %)
110,623
(2.62 %)
2,103,310
(28.32 %)
22,076
(2.40 %)
143 eudicot E.lathyris (primary hap 2023)
GCF_963576675.1
54,052
(4.78 %)
14,372
(1.33 %)
80,776
(14.35 %)
n/a 36.88
(100.00 %)
24
(0.00 %)
57
(100.00 %)
496,928
(2.45 %)
491,703
(4.75 %)
4,850,176
(50.53 %)
57,897
(3.26 %)
144 eudicot E.russellianum (2023)
GCA_036186865.1
n/a 18,823
(1.28 %)
96,845
(13.58 %)
n/a 37.91
(99.98 %)
26,521
(0.02 %)
100
(100.00 %)
1,526,493
(77.75 %)
539,134
(3.70 %)
6,307,362
(47.97 %)
31,022
(0.81 %)
145 eudicot G.bilobum (WA Gb01-03AN 2023)
GCF_033153095.1
45,049
(8.43 %)
18,010
(3.03 %)
54,840
(15.32 %)
n/a 35.23
(100.00 %)
4
(0.00 %)
5,089
(100.00 %)
397,210
(3.11 %)
254,173
(4.10 %)
3,228,435
(42.44 %)
15,343
(0.97 %)
146 eudicot H.pumila (YLH828 2023)
GCF_033568475.1
51,602
(5.64 %)
14,506
(1.52 %)
55,054
(9.40 %)
n/a 37.18
(100.00 %)
411
(0.00 %)
133
(100.00 %)
397,610
(2.13 %)
326,774
(3.20 %)
4,120,854
(57.35 %)
63,233
(2.52 %)
147 eudicot M.micrantha (NLD-2019 2019)
GCA_009363875.1
n/a 19,940
(1.00 %)
96,066
(8.14 %)
n/a 36.20
(99.99 %)
1,599
(0.01 %)
2,815
(100.00 %)
908,702
(2.54 %)
980,385
(4.65 %)
9,286,677
(54.99 %)
89,410
(1.77 %)
148 eudicot N.benthamiana (KLAB 2023)
GCA_034376525.1
n/a 27,772
(0.99 %)
128,971
(6.28 %)
n/a 37.84
(100.00 %)
4
(0.00 %)
667
(100.00 %)
4,744,181
(80.09 %)
1,261,453
(5.53 %)
18,063,531
(49.81 %)
86,419
(1.62 %)
149 eudicot N.caerulescens (Cira 2024)
GCA_046127275.1
n/a 20,205
(8.11 %)
49,304
(30.44 %)
n/a 39.42
(99.99 %)
41
(0.01 %)
1,181
(100.00 %)
413,962
(43.41 %)
125,005
(11.92 %)
1,047,909
(36.93 %)
24,840
(5.52 %)
150 eudicot P.eburnea (SZY01 2022)
GCF_022965805.1
61,645
(7.70 %)
19,490
(2.24 %)
62,769
(12.34 %)
n/a 37.11
(99.83 %)
1,024
(0.17 %)
1,225
(100.00 %)
314,817
(1.84 %)
291,276
(6.35 %)
3,964,714
(53.25 %)
61,424
(2.69 %)
151 eudicot P.frutescens var. frutescens (PF040 2021)
GCA_019511825.2
n/a 28,418
(2.15 %)
120,101
(15.79 %)
n/a 35.13
(99.99 %)
763
(0.01 %)
1,465
(100.00 %)
1,497,762
(21.02 %)
662,726
(4.46 %)
8,218,287
(43.32 %)
65,299
(2.16 %)
152 eudicot P.huaijiensis (GDHJ02 2020)
GCF_012295235.1
55,830
(12.29 %)
19,054
(3.86 %)
48,657
(15.27 %)
n/a 35.65
(97.46 %)
31,613
(2.54 %)
21,121
(100.00 %)
195,798
(1.99 %)
128,140
(2.47 %)
2,568,483
(41.18 %)
16,399
(1.28 %)
153 eudicot P.nigra (primary hap 2023)
GCF_951802175.1
55,369
(16.07 %)
19,591
(4.65 %)
41,748
(16.14 %)
n/a 34.95
(99.99 %)
277
(0.01 %)
21
(100.00 %)
256,070
(2.83 %)
178,940
(8.44 %)
2,317,187
(40.87 %)
3,317
(6.62 %)
154 eudicot P.vulgaris (G19833 2024)
GCF_000499845.2
48,620
(10.29 %)
16,779
(3.20 %)
47,438
(13.87 %)
n/a 35.62
(98.95 %)
566
(1.05 %)
1,034
(98.95 %)
245,672
(2.41 %)
239,601
(4.78 %)
2,887,505
(44.41 %)
44,689
(7.20 %)
155 eudicot R.rugosa (primary hap 2023)
GCF_958449725.1
62,563
(15.19 %)
15,236
(3.45 %)
60,387
(23.53 %)
n/a 39.30
(99.95 %)
1,014
(0.05 %)
77
(100.00 %)
226,730
(2.23 %)
196,099
(4.12 %)
1,632,269
(33.79 %)
38,448
(5.69 %)
156 eudicot S.americanum (SP2273 SP2273 2023)
GCA_030463325.1
n/a 15,767
(1.56 %)
57,615
(9.26 %)
n/a 36.15
(100.00 %)
214
(0.00 %)
90
(100.00 %)
2,179,570
(59.21 %)
301,263
(3.51 %)
5,651,338
(51.90 %)
28,868
(1.00 %)
157 eudicot S.americanum (SP2275 SP2275 2023)
GCA_030463385.1
n/a 15,677
(1.56 %)
57,771
(9.32 %)
n/a 36.18
(100.00 %)
n/a 540
(100.00 %)
2,161,174
(59.26 %)
298,020
(3.34 %)
5,624,901
(52.02 %)
29,520
(1.04 %)
158 eudicot S.miltiorrhiza (Shanhuang shh 2023)
GCA_028751815.1
n/a 15,144
(2.60 %)
67,052
(21.48 %)
n/a 37.46
(99.58 %)
695
(0.42 %)
171
(100.00 %)
614,263
(17.32 %)
364,006
(5.05 %)
2,679,398
(42.13 %)
64,170
(6.16 %)
159 eudicot T.arvense (2022)
GCA_911865555.2
n/a 23,487
(5.55 %)
54,244
(16.93 %)
n/a 38.39
(100.00 %)
24
(0.00 %)
964
(100.00 %)
204,363
(1.86 %)
150,149
(5.58 %)
2,245,900
(50.03 %)
35,971
(3.77 %)
160 eudicot V.riparia x Vitis rupestris (2022)
GCA_946000675.1
n/a 29,137
(2.81 %)
89,605
(14.72 %)
n/a 35.15
(99.99 %)
102
(0.01 %)
596
(99.99 %)
664,293
(2.97 %)
503,960
(9.26 %)
5,715,446
(39.21 %)
22,264
(1.77 %)
161 eudicot V.rotundifolia (Noble 2022)
GCA_022557335.1
n/a 13,992
(3.39 %)
38,479
(14.93 %)
n/a 33.54
(99.82 %)
17,084
(0.19 %)
17,104
(99.81 %)
696,697
(51.55 %)
178,090
(4.22 %)
2,480,890
(32.65 %)
6,497
(0.70 %)
162 Euphrates poplar (v2 2014)
GCF_000495115.2
56,366
(12.92 %)
20,853
(4.29 %)
41,483
(12.40 %)
n/a 32.05
(95.31 %)
22,764
(4.70 %)
32,266
(95.30 %)
357,310
(3.64 %)
246,638
(4.06 %)
2,660,781
(43.22 %)
2,691
(0.38 %)
163 European chestnut (Marrone di Chiusa Pesio 2024)
GCF_040712315.1
49,645
(7.87 %)
15,653
(2.10 %)
61,041
(13.43 %)
n/a 35.42
(100.00 %)
65
(0.00 %)
13
(100.00 %)
595,120
(3.41 %)
355,816
(4.98 %)
4,680,964
(38.07 %)
20,075
(1.41 %)
164 European crab apple (2022)
GCF_916048215.2
77,800
(12.38 %)
22,539
(3.42 %)
67,761
(16.26 %)
n/a 38.07
(99.99 %)
101
(0.01 %)
34
(100.00 %)
309,302
(2.18 %)
331,724
(5.06 %)
2,996,468
(41.19 %)
25,597
(2.08 %)
165 European hazelnut (Tombul 2020)
GCF_901000735.1
39,203
(13.04 %)
15,600
(4.11 %)
42,096
(18.23 %)
n/a 35.90
(99.54 %)
14,532
(0.48 %)
12
(100.00 %)
358,479
(3.69 %)
179,807
(3.40 %)
2,234,313
(32.05 %)
12,963
(1.47 %)
166 European hop (primary hap 2023)
GCF_963169125.1
72,613
(2.92 %)
14,868
(0.56 %)
135,918
(7.87 %)
n/a 39.00
(100.00 %)
129
(0.00 %)
319
(100.00 %)
1,077,704
(2.26 %)
853,368
(5.27 %)
13,477,464
(61.64 %)
152,063
(4.18 %)
167 European hop (Shinshu Wase 2014)
GCA_000831365.1
n/a 17,158
(0.86 %)
191,202
(13.47 %)
n/a 38.57
(86.69 %)
530,762
(13.34 %)
292,698
(86.67 %)
770,031
(2.12 %)
637,135
(3.75 %)
13,484,203
(41.57 %)
81,500
(2.36 %)
168 European mistletoe (primary hap 2023)
GCA_963277665.1
n/a 12,110
(0.01 %)
960,545
(1.07 %)
n/a 31.25
(100.00 %)
6,368
(0.00 %)
5,951
(100.00 %)
61,111,090
(11.87 %)
29,667,857
(2.75 %)
11,464
(100.00 %)
1,680,995
(2.36 %)
169 false flax
GCF_000633955.1
123,030
(22.63 %)
61,894
(13.77 %)
113,219
(31.09 %)
n/a 36.55
(92.99 %)
74,428
(7.02 %)
37,780
(99.99 %)
346,267
(2.46 %)
233,837
(5.56 %)
3,452,066
(27.34 %)
32,235
(2.62 %)
170 fava bean (2023)
GCA_948472305.1
n/a 18,459
(0.14 %)
221,591
(2.78 %)
n/a 37.44
(100.00 %)
5,330
(0.00 %)
3,992
(100.00 %)
4,140,168
(2.97 %)
4,673,353
(13.95 %)
36,694,276
(79.21 %)
59,853
(0.73 %)
171 Fendler's bladderpod (2019)
GCA_900406525.1
n/a 29,791
(9.22 %)
82,813
(26.56 %)
n/a 34.83
(99.51 %)
109,570
(0.49 %)
209,502
(99.51 %)
193,365
(2.63 %)
165,270
(4.54 %)
2,180,278
(29.35 %)
8,339
(0.91 %)
172 Fendler's bladderpod (WCL-YS1 PI 610492 2024)
GCA_036630335.1
n/a 23,679
(9.84 %)
43,179
(26.89 %)
n/a 34.92
(96.38 %)
98,816
(3.75 %)
9,891
(100.00 %)
373,519
(23.21 %)
328,539
(16.37 %)
1,720,493
(26.70 %)
5,729
(0.77 %)
173 field dodder (2020)
GCA_900332095.2
n/a 20,063
(4.21 %)
57,416
(19.19 %)
n/a 35.99
(94.55 %)
29,211
(5.47 %)
36,112
(94.53 %)
448,370
(12.07 %)
208,393
(3.46 %)
2,648,975
(35.75 %)
35,117
(3.87 %)
174 field mustard (Chiifu-401-42 2020)
GCF_000309985.2
73,442
(34.55 %)
30,193
(10.12 %)
57,010
(25.57 %)
n/a 36.83
(99.39 %)
408
(0.61 %)
1,100
(100.00 %)
261,522
(15.13 %)
196,553
(8.43 %)
1,533,242
(38.01 %)
24,895
(5.44 %)
175 field pennycress (KM-2021 2021)
GCA_018983045.1
n/a 22,245
(5.38 %)
51,310
(16.10 %)
n/a 39.02
(99.92 %)
1,923
(0.08 %)
2,298
(100.00 %)
172,036
(1.52 %)
129,452
(6.55 %)
2,388,667
(53.91 %)
37,074
(4.98 %)
176 finger millet (KNE 796-S 2023)
GCA_032690845.1
n/a 31,097
(3.07 %)
140,467
(22.19 %)
n/a 43.87
(99.87 %)
142
(0.13 %)
674
(99.87 %)
1,168,206
(39.18 %)
229,202
(4.14 %)
4,910,934
(41.23 %)
205,561
(17.19 %)
177 finger millet (ML-365 2017)
GCA_002180455.1
n/a 30,000
(2.41 %)
346,692
(27.97 %)
n/a 45.34
(98.74 %)
507,646
(1.30 %)
1,033,269
(98.70 %)
323,234
(1.19 %)
394,943
(6.28 %)
6,129,348
(33.00 %)
325,103
(21.18 %)
178 flowering dogwood (Cherokee Brave 2023)
GCF_030987335.1
63,465
(6.03 %)
17,263
(1.31 %)
78,564
(9.37 %)
n/a 35.95
(100.00 %)
96
(0.00 %)
459
(100.00 %)
982,341
(3.33 %)
719,891
(7.87 %)
6,810,592
(50.46 %)
27,883
(2.10 %)
179 foxtail millet
GCF_000263155.2
40,951
(13.47 %)
17,758
(5.07 %)
60,598
(30.59 %)
n/a 46.14
(98.82 %)
6,442
(1.19 %)
6,779
(98.81 %)
115,365
(1.46 %)
116,980
(2.45 %)
1,691,260
(29.31 %)
78,297
(28.27 %)
180 fried-egg orchid (Lindl 2021)
GCA_019925795.1
n/a 13,889
(0.88 %)
71,188
(7.43 %)
n/a 35.53
(99.95 %)
1,481
(0.05 %)
822
(100.00 %)
671,921
(2.91 %)
624,024
(4.46 %)
7,792,634
(47.85 %)
76,668
(3.16 %)
181 garden asparagus (2017)
GCF_001876935.1
45,159
(4.02 %)
13,440
(1.02 %)
85,207
(11.07 %)
n/a 39.02
(97.02 %)
47,391
(2.99 %)
56,182
(97.01 %)
427,496
(2.02 %)
885,946
(8.32 %)
6,075,356
(46.49 %)
111,109
(6.80 %)
182 garden lettuce (Salinas v11 2022)
GCF_002870075.4
69,048
(2.69 %)
16,407
(0.56 %)
105,654
(5.75 %)
n/a 37.92
(99.95 %)
384
(0.05 %)
93
(100.00 %)
1,192,578
(2.37 %)
1,282,344
(4.72 %)
12,843,881
(61.50 %)
160,781
(2.86 %)
183 garden pea (Zhongwan6 2022)
GCF_024323335.1
74,264
(1.88 %)
17,744
(0.43 %)
129,692
(4.97 %)
n/a 37.94
(99.73 %)
826
(0.27 %)
1,566
(100.00 %)
1,517,586
(2.16 %)
1,541,702
(5.89 %)
13,206,825
(66.95 %)
105,766
(0.97 %)
184 garlic-fruit tree (guangnan 2023)
GCF_029873635.1
43,473
(2.84 %)
13,544
(0.88 %)
64,877
(5.24 %)
n/a 36.06
(100.00 %)
596
(0.00 %)
510
(100.00 %)
1,556,970
(22.50 %)
788,188
(5.25 %)
10,081,845
(53.72 %)
41,032
(1.09 %)
185 ghaf (Desert tree PC_DT_omini 2023)
GCF_029017545.1
59,652
(8.73 %)
18,917
(2.55 %)
47,052
(9.22 %)
n/a 32.09
(99.98 %)
1,693
(0.02 %)
2,266
(100.00 %)
452,206
(3.00 %)
195,931
(2.27 %)
4,921,469
(39.63 %)
9,731
(0.69 %)
186 ginger
GCF_018446385.1
127,579
(4.07 %)
33,995
(0.96 %)
186,756
(7.79 %)
n/a 39.16
(100.00 %)
901
(0.00 %)
211
(100.00 %)
1,187,168
(2.18 %)
2,088,683
(6.47 %)
12,917,773
(61.42 %)
398,512
(10.38 %)
187 globe artichoke (v1.1 2C 2018)
GCF_001531365.2
42,106
(6.72 %)
15,819
(2.23 %)
49,753
(11.10 %)
n/a 35.35
(90.31 %)
310,402
(9.76 %)
13,479
(99.93 %)
394,793
(2.75 %)
364,336
(3.37 %)
4,190,750
(39.49 %)
12,198
(0.64 %)
188 goatgrass A.strangulata
GCF_002575655.1
87,385
(2.18 %)
17,963
(0.44 %)
263,708
(10.29 %)
n/a 46.32
(97.73 %)
107,163
(2.27 %)
109,126
(100.00 %)
1,490,873
(15.60 %)
1,415,562
(5.65 %)
12,540,551
(71.59 %)
881,849
(29.81 %)
189 goatgrass A.tauschii
GCF_001957025.1
69,195
(1.77 %)
18,614
(0.43 %)
300,274
(11.28 %)
n/a 46.38
(100.00 %)
n/a 68,537
(100.00 %)
1,555,328
(15.65 %)
1,485,488
(4.71 %)
13,133,338
(73.17 %)
928,327
(30.84 %)
190 goatgrass A.tauschii.strangulata (AL8/78 2024)
GCF_002575655.3
93,689
(2.58 %)
18,524
(0.46 %)
261,939
(10.44 %)
n/a 46.35
(99.97 %)
347
(0.03 %)
1,115
(100.00 %)
1,094,634
(1.42 %)
1,403,604
(6.42 %)
12,367,986
(72.90 %)
849,453
(31.38 %)
191 goji berry (Lr01 2021)
GCF_019175385.1
69,808
(4.35 %)
17,353
(1.01 %)
81,347
(7.68 %)
n/a 38.10
(99.95 %)
1,565
(0.05 %)
166
(100.00 %)
816,909
(2.29 %)
708,412
(4.09 %)
8,106,901
(53.67 %)
66,433
(1.82 %)
192 golden kiwifruit (Hongyang 2019)
GCA_009663005.1
n/a 21,161
(2.89 %)
55,843
(11.78 %)
n/a 35.63
(99.99 %)
646
(0.01 %)
2,366
(99.99 %)
423,518
(2.92 %)
293,299
(3.76 %)
4,466,312
(33.71 %)
25,250
(1.74 %)
193 golden kiwifruit (Red5 2018)
GCA_003024255.1
n/a 22,332
(3.88 %)
51,709
(13.62 %)
n/a 35.31
(96.44 %)
25,521
(3.57 %)
1,234
(100.00 %)
347,035
(2.87 %)
241,862
(4.11 %)
3,578,217
(30.95 %)
19,259
(1.41 %)
194 grain amaranth (AhG2s 2020)
GCA_000753965.2
n/a 13,698
(3.27 %)
34,546
(14.58 %)
n/a 32.99
(90.06 %)
7,031
(9.94 %)
1,567
(100.00 %)
217,772
(3.32 %)
181,251
(3.71 %)
2,391,775
(32.66 %)
4,425
(0.40 %)
195 great duckweed (2018)
GCA_900492545.1
n/a 10,264
(6.56 %)
16,841
(26.52 %)
n/a 42.27
(99.98 %)
84
(0.02 %)
20
(100.00 %)
96,389
(3.49 %)
54,278
(2.54 %)
843,136
(22.61 %)
18,978
(24.35 %)
196 great duckweed (9509 2017)
GCA_001981405.1
n/a 10,023
(7.00 %)
16,353
(26.89 %)
n/a 42.30
(92.78 %)
89,257
(7.32 %)
89,277
(92.68 %)
80,787
(2.86 %)
45,432
(1.93 %)
786,155
(19.70 %)
19,057
(20.99 %)
197 green algae (1602 2018)
GCA_002245835.2
n/a 770
(0.70 %)
5,466
(68.75 %)
n/a 63.95
(100.00 %)
n/a 159
(100.00 %)
62,109
(5.65 %)
29,993
(4.25 %)
581,123
(37.15 %)
127
(97.30 %)
198 green algae (18125 2025)
GCA_048595725.1
n/a 865
(2.16 %)
3,109
(76.75 %)
n/a 67.78
(100.00 %)
n/a 55
(100.00 %)
35,578
(6.99 %)
19,197
(3.61 %)
216,318
(31.95 %)
54
(99.88 %)
199 green algae (211/11P 2022)
GCA_023343905.1
n/a 1,009
(1.60 %)
4,892
(65.40 %)
n/a 61.60
(98.43 %)
12
(1.57 %)
57
(98.43 %)
48,271
(5.94 %)
22,435
(3.81 %)
358,729
(31.71 %)
405
(96.46 %)
200 green algae (ATCC 16529 2021)
GCA_016906385.1
n/a 748
(2.62 %)
2,222
(71.29 %)
n/a 64.15
(97.91 %)
6,559
(2.25 %)
19
(100.00 %)
268
(0.10 %)
2,320
(1.18 %)
110,762
(22.64 %)
29
(99.25 %)
201 green algae (CCAP 19/42 2023)
GCA_031753455.1
n/a 1,362
(0.45 %)
15,767
(32.44 %)
n/a 49.19
(100.00 %)
n/a 300
(100.00 %)
442,436
(43.24 %)
171,808
(11.44 %)
978,912
(31.81 %)
10,820
(2.10 %)
202 green algae (CCMP1545 2009)
GCF_000151265.4
10,237
(66.85 %)
988
(3.27 %)
4,789
(69.24 %)
n/a 65.94
(98.86 %)
583
(1.14 %)
497
(98.86 %)
37,284
(8.77 %)
20,399
(4.09 %)
206,658
(48.59 %)
43
(99.34 %)
203 green algae (HMC1 2018)
GCA_003255715.1
n/a 1,000
(1.89 %)
7,921
(69.96 %)
n/a 62.97
(97.56 %)
2,472
(2.45 %)
3,774
(100.00 %)
10,519
(1.96 %)
4,558
(1.31 %)
172,635
(22.08 %)
3,978
(96.84 %)
204 green algae (JCM 15793 2018)
GCA_002897115.2
n/a 1,087
(3.87 %)
3,215
(73.44 %)
n/a 61.27
(98.39 %)
10,986
(1.68 %)
46
(100.00 %)
8,982
(1.85 %)
3,745
(0.85 %)
119,487
(14.35 %)
79
(99.57 %)
205 green algae (JCM 9641 2017)
GCA_002794665.1
n/a 928
(3.73 %)
2,196
(76.87 %)
n/a 73.37
(97.42 %)
12,055
(2.67 %)
27
(100.00 %)
15,929
(5.38 %)
7,990
(2.29 %)
164,687
(38.62 %)
30
(99.90 %)
206 green algae (KO-2023 2023)
GCA_030272585.1
n/a 1,751
(1.39 %)
15,265
(40.46 %)
n/a 46.07
(100.00 %)
n/a 29
(100.00 %)
60,131
(4.76 %)
34,318
(3.34 %)
393,810
(24.33 %)
19,071
(23.42 %)
207 green algae (LANL1001 2019)
GCA_006384855.1
n/a 2,016
(0.62 %)
31,585
(41.01 %)
n/a 57.91
(100.00 %)
1
(0.00 %)
3,614
(100.00 %)
183,076
(3.30 %)
101,860
(5.85 %)
972,524
(32.54 %)
4,760
(98.23 %)
208 green algae (RCC4221 2014)
GCA_000214015.2
n/a 1,108
(6.57 %)
3,692
(76.52 %)
n/a 59.39
(99.94 %)
477
(0.07 %)
20
(100.00 %)
8,604
(3.92 %)
4,944
(2.18 %)
102,578
(28.06 %)
20
(99.94 %)
209 green algae (SAG 2063 2018)
GCA_003613005.1
n/a 869
(2.13 %)
9,821
(78.63 %)
n/a 67.62
(98.00 %)
579
(1.95 %)
7,535
(98.05 %)
35,537
(6.91 %)
19,692
(3.56 %)
218,412
(30.60 %)
6,958
(98.59 %)
210 green algae (YS-2018 2019)
GCA_004138255.1
n/a 1,365
(1.08 %)
11,070
(58.24 %)
n/a 55.95
(98.44 %)
780
(1.56 %)
597
(100.00 %)
25,537
(1.66 %)
27,257
(3.92 %)
365,387
(19.48 %)
3,732
(86.39 %)
211 green algae A.protothecoides (0710 2014)
GCF_000733215.1
7,014
(37.71 %)
966
(2.72 %)
2,947
(70.38 %)
n/a 63.54
(95.35 %)
1,012
(4.66 %)
1,386
(95.34 %)
8,655
(1.88 %)
3,803
(1.89 %)
147,537
(20.31 %)
604
(53.91 %)
212 green algae B.prasinos (RCC1105 2012)
GCF_002220235.1
7,904
(82.34 %)
1,231
(6.04 %)
4,460
(76.24 %)
n/a 48.02
(99.76 %)
20
(0.24 %)
21
(100.00 %)
17,900
(4.88 %)
5,674
(1.75 %)
113,699
(21.91 %)
7
(0.01 %)
213 green algae C.reinhardtii (CC-5816 2022)
GCA_026108075.1
n/a 1,057
(0.55 %)
9,735
(58.02 %)
n/a 64.03
(100.00 %)
n/a 17
(100.00 %)
166,909
(9.00 %)
120,034
(10.13 %)
750,946
(37.60 %)
166
(99.31 %)
214 green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 refseq)
GCF_000002595.2
19,527
(53.99 %)
990
(0.56 %)
9,689
(59.71 %)
n/a 64.08
(96.36 %)
1,459
(3.65 %)
1,512
(96.35 %)
174,119
(17.13 %)
110,553
(6.12 %)
748,240
(34.06 %)
92
(46.06 %)
215 green algae C.subellipsoidea (C-169 2012)
GCF_000258705.1
9,839
(29.70 %)
1,307
(1.78 %)
8,108
(53.71 %)
n/a 52.94
(100.00 %)
n/a 29
(100.00 %)
8,446
(0.85 %)
5,471
(0.85 %)
265,761
(14.34 %)
11,329
(19.64 %)
216 green algae C.variabilis (NC64A 2010 refseq)
GCF_000147415.1
9,780
(32.79 %)
744
(1.00 %)
4,520
(67.55 %)
n/a 67.14
(91.48 %)
3,543
(8.55 %)
3,810
(91.45 %)
64,770
(8.22 %)
28,736
(2.86 %)
416,740
(37.15 %)
756
(45.48 %)
217 green algae K.nitens (NIES-2285 2014)
GCA_000708835.1
n/a 2,471
(1.78 %)
14,771
(54.27 %)
n/a 52.42
(98.98 %)
2,081
(1.02 %)
3,731
(98.98 %)
10,051
(0.46 %)
14,278
(1.14 %)
388,120
(8.55 %)
8,698
(83.31 %)
218 green algae M.commoda (RCC299 2009)
GCF_000090985.2
10,137
(72.46 %)
1,301
(4.51 %)
5,667
(86.20 %)
n/a 63.82
(100.00 %)
n/a 19
(100.00 %)
14,619
(3.58 %)
8,937
(2.75 %)
178,499
(27.69 %)
10
(25.23 %)
219 green algae M.neglectum (SAG 48.87 2015)
GCF_000611645.1
16,734
(25.96 %)
666
(0.47 %)
12,122
(60.02 %)
n/a 64.75
(96.59 %)
5,358
(3.43 %)
12,077
(96.57 %)
73,343
(6.73 %)
43,518
(3.04 %)
568,630
(31.80 %)
7,776
(96.69 %)
220 green algae M.pusilla (CCMP1545 2009)
GCF_000151265.2
10,242
(66.86 %)
990
(3.27 %)
4,789
(69.24 %)
n/a 65.94
(98.86 %)
583
(1.14 %)
497
(98.86 %)
36,818
(8.73 %)
20,399
(4.09 %)
206,658
(48.59 %)
32
(47.70 %)
221 green algae O.lucimarinus (CCE9901 2007)
GCF_000092065.1
7,603
(72.01 %)
1,064
(6.25 %)
3,493
(72.08 %)
n/a 60.44
(100.00 %)
n/a 21
(100.00 %)
11,026
(5.45 %)
11,732
(3.90 %)
107,661
(34.88 %)
12
(61.27 %)
222 green algae O.tauri (RCC4221 2014)
GCF_000214015.3
7,766
(82.33 %)
1,131
(6.60 %)
3,714
(76.22 %)
n/a 59.21
(99.94 %)
477
(0.07 %)
22
(100.00 %)
8,503
(3.84 %)
4,946
(2.16 %)
102,428
(27.87 %)
16
(57.14 %)
223 green algae V.carteri (Eve 2010)
GCF_000143455.1
14,333
(21.46 %)
1,411
(0.77 %)
13,095
(47.93 %)
n/a 55.97
(91.15 %)
12,014
(8.87 %)
11,352
(91.13 %)
175,729
(14.69 %)
105,113
(5.10 %)
667,226
(23.91 %)
4,325
(42.65 %)
224 green chiretta (2019)
GCF_009805555.1
46,094
(16.56 %)
14,632
(4.66 %)
34,242
(19.36 %)
n/a 33.53
(100.00 %)
n/a 271
(100.00 %)
293,800
(4.64 %)
151,157
(7.38 %)
1,732,880
(41.88 %)
21,835
(6.05 %)
225 green foxtail
GCF_005286985.1
47,022
(14.66 %)
17,750
(5.12 %)
60,106
(30.88 %)
n/a 46.17
(99.85 %)
61
(0.15 %)
76
(99.85 %)
116,493
(1.51 %)
120,039
(2.72 %)
1,676,017
(29.11 %)
75,497
(29.44 %)
226 green foxtail (2024)
GCF_005286985.2
43,377
(14.56 %)
17,909
(5.15 %)
60,312
(30.80 %)
n/a 46.17
(99.96 %)
14
(0.04 %)
40
(99.96 %)
117,054
(1.49 %)
121,212
(2.84 %)
1,685,787
(29.32 %)
75,777
(29.49 %)
227 green foxtail (ME034v 2020)
GCA_012934335.1
n/a 18,040
(5.19 %)
61,671
(31.38 %)
n/a 45.99
(100.00 %)
54
(0.00 %)
63
(100.00 %)
105,738
(1.38 %)
87,424
(2.22 %)
1,777,815
(26.85 %)
74,932
(30.30 %)
228 guar (PI 68867901 SD 2022)
GCA_026586085.1
n/a 16,149
(3.62 %)
40,368
(13.76 %)
n/a 32.74
(100.00 %)
n/a 627
(100.00 %)
724,179
(25.31 %)
196,353
(10.67 %)
2,757,251
(41.21 %)
9,690
(0.94 %)
229 guar (short-day 2024)
GCA_037177725.1
n/a 16,198
(3.33 %)
43,918
(13.95 %)
n/a 33.41
(100.00 %)
24
(0.00 %)
237
(100.00 %)
813,394
(29.89 %)
243,439
(13.12 %)
2,549,208
(42.63 %)
10,217
(1.78 %)
230 Guinea yam (TDr96_F1 2017)
GCA_002240015.2
n/a 11,944
(2.63 %)
37,372
(13.64 %)
n/a 35.58
(88.95 %)
1,032,823
(11.31 %)
21
(100.00 %)
293,868
(3.21 %)
174,614
(3.18 %)
2,690,184
(32.53 %)
15,323
(1.42 %)
231 habanero-type pepper (PI159236 2017)
GCA_002271895.2
n/a 16,562
(0.53 %)
72,911
(2.91 %)
n/a 34.88
(98.35 %)
196,261
(1.66 %)
87,978
(100.00 %)
1,136,015
(1.95 %)
1,019,921
(4.33 %)
22,445,162
(47.06 %)
20,737
(0.24 %)
232 hairy vetch (HV-30 2023)
GCF_029867415.1
88,183
(5.03 %)
22,129
(1.02 %)
118,243
(9.15 %)
n/a 35.63
(99.98 %)
3,486
(0.02 %)
1,888
(100.00 %)
1,001,308
(2.63 %)
1,132,664
(5.72 %)
8,340,755
(56.16 %)
43,665
(1.21 %)
233 Hall's panicgrass
GCF_002211085.1
43,787
(9.63 %)
17,635
(3.85 %)
66,270
(23.98 %)
n/a 46.87
(98.63 %)
736
(1.37 %)
1,027
(98.63 %)
157,811
(1.55 %)
119,571
(2.57 %)
2,107,254
(45.30 %)
102,278
(32.16 %)
234 Hawaiian beggarticks (Kalapana, Puna primary hap 2024)
GCF_021521415.1
100,198
(3.70 %)
41,058
(1.06 %)
207,532
(8.30 %)
n/a 37.08
(100.00 %)
n/a 15,833
(100.00 %)
2,024,684
(2.90 %)
1,837,742
(5.29 %)
17,556,257
(56.19 %)
201,310
(3.34 %)
235 Himalayan balsam (dImpGla2.1 2021)
GCF_907164915.1
40,392
(7.39 %)
16,711
(2.29 %)
50,292
(11.24 %)
n/a 32.12
(99.95 %)
858
(0.05 %)
1,115
(100.00 %)
439,789
(3.56 %)
574,639
(8.97 %)
4,147,814
(47.01 %)
16,291
(1.13 %)
236 Himalayan yew (Yunnan 2021)
GCA_018340775.1
n/a 11,782
(0.08 %)
129,658
(1.42 %)
n/a 36.91
(99.99 %)
11,130
(0.01 %)
150
(100.00 %)
2,861,102
(1.57 %)
2,476,232
(2.57 %)
65,436,741
(53.97 %)
157,149
(0.72 %)
237 horseweed
GCF_010389155.1
39,622
(11.54 %)
14,718
(3.15 %)
42,194
(16.23 %)
n/a 34.08
(99.99 %)
502
(0.01 %)
357
(100.00 %)
267,124
(2.84 %)
155,729
(2.71 %)
2,475,353
(36.48 %)
5,205
(0.40 %)
238 Indian licorice
GCF_003935025.1
44,610
(13.60 %)
17,108
(4.95 %)
34,097
(14.33 %)
n/a 31.84
(100.00 %)
184
(0.00 %)
160
(100.00 %)
217,674
(3.40 %)
106,243
(4.04 %)
2,232,509
(38.91 %)
5,438
(1.06 %)
239 interior live oak (QUWIS_CCGP_1 alternate hap 2022)
GCA_023055485.1
n/a 16,184
(2.02 %)
66,215
(14.16 %)
n/a 35.37
(100.00 %)
82
(0.00 %)
689
(100.00 %)
739,891
(4.58 %)
435,389
(7.62 %)
4,843,419
(38.03 %)
13,298
(2.56 %)
240 interior live oak (QUWIS_CCGP_1 primary hap 2022)
GCA_023055345.1
n/a 15,832
(2.09 %)
63,488
(14.36 %)
n/a 35.19
(100.00 %)
81
(0.00 %)
358
(100.00 %)
703,028
(4.29 %)
399,798
(6.48 %)
4,662,881
(36.96 %)
12,534
(1.92 %)
241 island oak (RSA801373 alternate hap 2023)
GCA_028535165.1
n/a 15,893
(1.97 %)
68,998
(15.27 %)
n/a 35.87
(100.00 %)
53
(0.00 %)
156
(100.00 %)
746,424
(4.43 %)
451,117
(7.39 %)
4,820,434
(38.55 %)
20,367
(2.62 %)
242 island oak (RSA801373 primary hap 2023)
GCA_028535515.1
n/a 15,880
(1.95 %)
69,093
(15.25 %)
n/a 35.97
(100.00 %)
53
(0.00 %)
274
(100.00 %)
751,691
(4.60 %)
457,914
(7.61 %)
4,850,082
(38.95 %)
20,561
(3.01 %)
243 J.microcarpa x regia eudicots (UCDavis 2019)
GCF_004785595.1
50,504
(10.14 %)
18,451
(3.41 %)
55,094
(16.89 %)
n/a 36.30
(99.18 %)
54
(0.82 %)
154
(100.00 %)
411,290
(3.65 %)
260,413
(3.49 %)
3,023,907
(31.93 %)
23,270
(1.88 %)
244 Japanese apricot
GCF_000346735.1
32,312
(19.60 %)
14,463
(6.46 %)
33,049
(23.94 %)
n/a 37.45
(92.82 %)
15,597
(7.20 %)
23,761
(92.80 %)
118,757
(2.25 %)
84,983
(4.53 %)
1,374,244
(23.24 %)
7,808
(1.87 %)
245 Japanese cedar (2023)
GCF_030272615.1
80,727
(1.01 %)
14,175
(0.13 %)
225,166
(3.69 %)
n/a 36.42
(99.98 %)
3,031
(0.02 %)
2,699
(100.00 %)
2,873,672
(2.01 %)
4,198,037
(4.24 %)
5,730
(99.98 %)
71,102
(1.16 %)
246 Japanese morning glory
GCF_001879475.1
58,979
(8.37 %)
16,977
(2.14 %)
77,626
(18.21 %)
n/a 37.61
(99.97 %)
449
(0.03 %)
3,418
(100.00 %)
641,896
(6.26 %)
639,051
(8.97 %)
3,622,236
(46.63 %)
77,860
(10.47 %)
247 Japanese rice (2023)
GCF_034140825.1
55,725
(16.73 %)
16,338
(4.37 %)
54,077
(25.00 %)
n/a 43.72
(100.00 %)
4
(0.00 %)
15
(100.00 %)
196,712
(2.76 %)
141,936
(4.82 %)
1,727,479
(35.05 %)
63,894
(25.90 %)
248 Japanese rice (Kitaake 2020)
GCA_009797565.1
n/a 16,562
(4.59 %)
53,878
(24.77 %)
n/a 43.61
(98.95 %)
474
(1.05 %)
476
(98.95 %)
494,831
(50.75 %)
141,079
(3.52 %)
1,728,936
(33.69 %)
64,216
(25.20 %)
249 Japanese rice (Nipponbare 2015)
GCF_001433935.1
53,454
(17.22 %)
16,804
(4.69 %)
53,712
(24.95 %)
n/a 43.57
(99.97 %)
925
(0.03 %)
58
(100.00 %)
402,182
(39.07 %)
138,035
(3.47 %)
1,719,939
(33.46 %)
63,485
(25.25 %)
250 Joseph's coat eudicots (Red AtriRed21 2022)
GCF_026212465.1
44,756
(10.39 %)
13,649
(2.41 %)
38,664
(12.08 %)
n/a 31.93
(99.74 %)
2,496
(0.26 %)
49
(100.00 %)
270,085
(9.40 %)
247,307
(22.95 %)
2,428,999
(49.81 %)
5,914
(1.27 %)
251 Korean lawngrass (Nagirizaki 2016)
GCA_001602275.1
n/a 21,051
(6.88 %)
57,023
(32.54 %)
n/a 44.09
(96.75 %)
14,848
(3.26 %)
26,634
(96.74 %)
101,349
(1.46 %)
71,657
(2.17 %)
1,693,252
(21.97 %)
60,198
(24.06 %)
252 lamb's quarters (primary hap 2023)
GCA_948465745.1
n/a 32,598
(1.94 %)
125,993
(12.58 %)
n/a 36.17
(100.00 %)
67
(0.00 %)
158
(100.00 %)
2,407,940
(63.57 %)
996,815
(6.91 %)
7,383,118
(51.29 %)
84,154
(2.40 %)
253 large cranberry (Ben Lear CNJ99-125-1 inbred clone 2014)
GCA_000775335.2
n/a 14,225
(2.70 %)
66,262
(14.87 %)
n/a 37.74
(99.90 %)
1,390
(0.01 %)
201,496
(99.99 %)
201,938
(1.93 %)
136,145
(2.39 %)
2,755,676
(26.83 %)
12,815
(1.29 %)
254 lemon (UCLL1 2023)
GCA_034663555.1
n/a 27,668
(4.03 %)
72,915
(18.34 %)
n/a 36.06
(99.99 %)
136
(0.01 %)
624
(99.99 %)
382,061
(2.62 %)
254,813
(8.31 %)
3,593,274
(41.24 %)
14,758
(7.59 %)
255 lettuce eudicots (Salinas 2011)
GCA_000227445.1
n/a 15,031
(1.06 %)
140,751
(10.18 %)
n/a 36.82
(99.85 %)
n/a 876,110
(100.00 %)
505,796
(3.85 %)
318,171
(2.09 %)
9,808,138
(33.85 %)
30,057
(0.85 %)
256 liverwort (2024)
GCA_039105155.1
n/a 5,119
(1.70 %)
26,429
(24.22 %)
n/a 43.50
(100.00 %)
1
(0.00 %)
12
(100.00 %)
178,255
(36.35 %)
53,790
(2.08 %)
834,624
(30.68 %)
25,774
(29.87 %)
257 long-grained rice (Zhenshan 97 2020)
GCA_001623345.3
n/a 16,254
(4.30 %)
54,135
(24.00 %)
n/a 43.62
(100.00 %)
n/a 13
(100.00 %)
204,282
(2.82 %)
143,681
(3.92 %)
1,729,033
(36.62 %)
65,538
(25.47 %)
258 lyrate rockcress
GCF_000004255.2
44,526
(28.52 %)
25,416
(19.36 %)
34,938
(31.66 %)
n/a 36.08
(88.90 %)
2,950
(11.10 %)
3,646
(88.90 %)
141,441
(20.58 %)
72,583
(3.25 %)
1,012,438
(24.68 %)
8,053
(2.48 %)
259 macadamia nut
GCF_013358625.1
58,226
(8.43 %)
16,723
(2.11 %)
62,465
(13.23 %)
n/a 39.13
(98.51 %)
22,059
(1.50 %)
2,644
(100.00 %)
463,575
(3.09 %)
304,057
(3.39 %)
4,183,445
(34.36 %)
18,956
(1.40 %)
260 Madagascar periwinkle (Sunstorm Apricot 2015)
GCA_000949345.1
n/a 13,013
(2.26 %)
38,671
(8.42 %)
n/a 33.59
(99.19 %)
123,798
(0.85 %)
203,100
(99.15 %)
329,865
(3.57 %)
244,018
(4.63 %)
3,737,818
(40.09 %)
4,827
(0.29 %)
261 Madagascar periwinkle (Sunstorm Apricot FGT_2020_1 2023)
GCA_028651295.1
n/a 12,929
(2.13 %)
34,499
(7.89 %)
n/a 33.83
(100.00 %)
1
(0.00 %)
174
(100.00 %)
560,407
(20.53 %)
306,275
(8.15 %)
3,716,838
(44.45 %)
6,827
(0.40 %)
262 Magnolia sinica (HGM2019 2023)
GCF_029962835.1
69,307
(3.21 %)
14,466
(0.72 %)
84,219
(6.52 %)
n/a 40.18
(100.00 %)
73
(0.00 %)
127
(100.00 %)
1,415,484
(14.07 %)
1,154,832
(6.29 %)
10,231,412
(50.86 %)
107,342
(2.63 %)
263 maize
GCF_902167145.1
76,701
(3.66 %)
23,553
(1.55 %)
154,773
(10.70 %)
n/a 46.77
(99.83 %)
708
(0.17 %)
697
(100.00 %)
1,340,549
(78.65 %)
843,168
(5.20 %)
5,886,498
(69.23 %)
372,641
(31.10 %)
264 maize (2020)
GCA_905067065.1
n/a 23,433
(1.61 %)
150,853
(10.66 %)
n/a 46.83
(98.14 %)
56,163
(1.87 %)
56,173
(98.13 %)
581,502
(1.40 %)
753,129
(3.49 %)
5,867,216
(67.88 %)
377,414
(31.33 %)
265 maize (B104 2021)
GCA_910593975.1
n/a 23,680
(1.58 %)
153,453
(10.69 %)
n/a 46.83
(99.71 %)
1,223
(0.29 %)
697
(100.00 %)
593,292
(1.41 %)
805,647
(4.47 %)
5,887,178
(69.17 %)
370,755
(32.34 %)
266 maize (B73 2017)
GCA_000005005.6
n/a 23,511
(1.62 %)
151,975
(10.84 %)
n/a 46.87
(98.56 %)
2,523
(1.44 %)
3,128
(98.56 %)
1,308,956
(78.59 %)
771,560
(3.39 %)
5,850,966
(67.94 %)
367,973
(32.21 %)
267 maize (OH43 2020)
GCA_902167015.1
n/a 23,864
(1.57 %)
154,358
(10.67 %)
n/a 46.77
(99.88 %)
551
(0.12 %)
777
(100.00 %)
1,341,834
(78.70 %)
834,042
(5.01 %)
5,916,520
(69.26 %)
372,114
(32.08 %)
268 malo sina (v2 2021)
GCF_000231095.2
34,262
(16.98 %)
15,545
(6.13 %)
36,746
(24.10 %)
n/a 41.55
(100.00 %)
14
(0.00 %)
74
(100.00 %)
140,519
(2.59 %)
67,337
(3.89 %)
1,493,779
(29.32 %)
41,044
(18.43 %)
269 mango
GCF_011075055.1
60,349
(16.06 %)
20,653
(5.13 %)
40,887
(15.20 %)
n/a 32.71
(99.98 %)
169
(0.02 %)
250
(100.00 %)
213,445
(3.09 %)
125,929
(3.29 %)
2,447,401
(32.63 %)
7,059
(0.98 %)
270 monocots
GCF_002575655.2
84,334
(2.18 %)
17,888
(0.44 %)
263,541
(10.26 %)
n/a 46.33
(97.97 %)
69,858
(2.04 %)
109,197
(100.00 %)
1,492,485
(15.65 %)
1,422,870
(5.39 %)
12,521,384
(71.80 %)
881,939
(30.07 %)
271 monocots (2017)
GCA_900070015.1
n/a 13,790
(0.81 %)
584,401
(17.92 %)
n/a 44.69
(99.26 %)
714,678
(0.49 %)
3,598,227
(99.51 %)
405,591
(2.31 %)
383,580
(1.94 %)
9,713,864
(28.00 %)
392,202
(11.97 %)
272 monocots (2023)
GCA_947561735.1
n/a 17,702
(1.12 %)
131,056
(12.62 %)
n/a 49.54
(99.71 %)
154
(0.29 %)
161
(99.71 %)
2,363,767
(55.11 %)
562,150
(3.01 %)
6,046,063
(67.25 %)
78,069
(17.77 %)
273 monocots (lm5633 2022)
GCA_024174645.1
n/a 10,209
(2.40 %)
33,920
(14.90 %)
n/a 39.23
(99.63 %)
2,722
(0.38 %)
2,381
(100.00 %)
339,295
(20.82 %)
149,186
(3.14 %)
1,958,662
(44.97 %)
37,690
(12.52 %)
274 monocots (Oco-Bangladesh 2023)
GCA_030770085.1
n/a 22,601
(4.02 %)
78,799
(21.93 %)
n/a 42.06
(100.00 %)
13
(0.00 %)
450
(100.00 %)
708,554
(36.63 %)
97,691
(2.08 %)
2,711,269
(26.55 %)
87,312
(19.47 %)
275 mosses
GCF_000002425.4
55,044
(11.86 %)
8,425
(1.46 %)
30,452
(12.55 %)
n/a 33.69
(98.74 %)
2,645
(1.27 %)
359
(100.00 %)
454,786
(48.35 %)
241,826
(2.56 %)
2,413,326
(52.52 %)
22,664
(3.06 %)
276 mosses (Gransden 2004 2024)
GCA_000002425.3
n/a 8,471
(1.47 %)
30,401
(12.59 %)
n/a 33.71
(99.04 %)
1,792
(0.96 %)
357
(100.00 %)
296,167
(2.79 %)
242,589
(2.68 %)
2,405,125
(52.64 %)
22,652
(3.11 %)
277 mosses (MN 2022)
GCA_021442195.1
n/a 8,227
(1.65 %)
29,076
(15.54 %)
n/a 36.47
(99.90 %)
38
(0.10 %)
74
(99.90 %)
202,616
(2.17 %)
147,367
(3.31 %)
2,577,180
(28.93 %)
12,940
(1.51 %)
278 mosses (SZ-1 2022)
GCA_026122775.1
n/a 8,528
(1.45 %)
30,650
(12.43 %)
n/a 33.77
(100.00 %)
29
(0.00 %)
26
(100.00 %)
300,802
(2.82 %)
246,537
(2.86 %)
2,464,328
(53.57 %)
23,310
(3.24 %)
279 mulberry M.notabilis
GCF_000414095.1
29,893
(12.15 %)
14,092
(4.40 %)
37,376
(17.73 %)
n/a 34.86
(94.92 %)
15,541
(5.08 %)
46,842
(94.92 %)
317,532
(5.00 %)
190,192
(6.25 %)
2,095,631
(34.49 %)
20,490
(3.43 %)
280 mung bean (VC1973A 2015 refseq)
GCF_000741045.1
47,653
(11.89 %)
16,644
(3.87 %)
43,967
(14.67 %)
n/a 33.18
(92.80 %)
96,870
(7.24 %)
2,465
(100.00 %)
264,597
(3.31 %)
198,963
(3.34 %)
2,842,720
(34.86 %)
13,975
(1.49 %)
281 muskmelon (AY 2022)
GCF_025177605.1
47,062
(10.58 %)
13,502
(2.95 %)
32,332
(13.20 %)
n/a 36.06
(99.99 %)
239
(0.01 %)
1,310
(100.00 %)
282,171
(3.23 %)
229,959
(11.70 %)
2,016,709
(43.94 %)
18,232
(10.96 %)
282 muskmelon (DHL92 2012)
GCF_000313045.1
35,384
(11.55 %)
13,191
(3.74 %)
28,295
(11.09 %)
n/a 33.23
(89.51 %)
29,172
(10.51 %)
60,751
(89.49 %)
239,295
(7.85 %)
172,598
(3.17 %)
2,304,858
(33.21 %)
12,855
(1.38 %)
283 Nalta jute (JRO-524 2017)
GCA_002141455.1
n/a 15,450
(3.86 %)
57,930
(23.73 %)
n/a 36.82
(99.97 %)
n/a 52,373
(100.00 %)
189,007
(2.22 %)
129,697
(4.38 %)
1,872,307
(38.03 %)
11,963
(5.74 %)
284 narrow-leaf cattail (Huaian 2025)
GCF_048772165.1
35,080
(19.76 %)
14,109
(6.33 %)
27,978
(20.09 %)
n/a 37.69
(100.00 %)
n/a 15
(100.00 %)
124,433
(3.10 %)
69,868
(2.56 %)
1,208,522
(27.94 %)
21,007
(5.28 %)
285 narrow-leaved blue lupine
GCF_001865875.1
57,263
(9.83 %)
22,097
(3.53 %)
51,774
(13.22 %)
n/a 33.46
(99.34 %)
44,657
(0.68 %)
55,107
(99.32 %)
280,867
(4.25 %)
210,750
(5.67 %)
3,920,315
(38.10 %)
6,462
(0.46 %)
286 New South Wales waratah (Mountain lineage 2021)
GCF_018873765.1
44,477
(5.41 %)
16,928
(1.94 %)
77,682
(16.06 %)
n/a 40.12
(100.00 %)
2,037
(0.00 %)
1,289
(100.00 %)
437,997
(2.33 %)
266,149
(5.08 %)
4,764,252
(34.25 %)
20,667
(1.81 %)
287 opium poppy
GCF_003573695.1
127,893
(4.57 %)
25,532
(0.85 %)
162,032
(9.31 %)
n/a 37.28
(99.80 %)
31,183
(0.20 %)
34,381
(100.00 %)
819,294
(1.49 %)
1,050,181
(6.80 %)
10,625,631
(55.85 %)
67,521
(1.21 %)
288 orchid D.catenatum
GCF_001605985.2
39,386
(3.85 %)
12,208
(0.99 %)
72,906
(8.22 %)
n/a 34.70
(96.03 %)
25,751
(3.92 %)
311,841
(96.08 %)
506,361
(2.45 %)
413,770
(3.23 %)
8,074,114
(39.07 %)
56,900
(2.34 %)
289 orchid P.equestris
GCF_001263595.1
32,146
(3.36 %)
11,541
(1.01 %)
54,049
(6.11 %)
n/a 34.46
(92.46 %)
98,814
(7.56 %)
188,398
(92.44 %)
487,071
(2.96 %)
511,903
(4.00 %)
7,060,408
(42.20 %)
31,179
(1.22 %)
290 Pacific Island silvergrass (M001 2021)
GCF_019320115.1
120,534
(4.81 %)
39,902
(1.95 %)
276,967
(16.36 %)
n/a 45.32
(99.56 %)
4,932
(0.44 %)
2,420
(100.00 %)
764,083
(1.38 %)
810,723
(3.95 %)
11,118,925
(53.40 %)
520,091
(23.03 %)
291 papaya
GCF_000150535.2
29,883
(11.99 %)
12,860
(4.47 %)
24,403
(11.58 %)
n/a 35.31
(73.55 %)
29,719
(26.47 %)
47,485
(73.53 %)
260,082
(34.69 %)
101,644
(3.59 %)
1,640,647
(28.88 %)
21,200
(2.95 %)
292 papaya (Sunset 2022)
GCA_022788785.1
n/a 13,725
(4.02 %)
25,348
(10.65 %)
n/a 36.01
(99.88 %)
337
(0.12 %)
67
(100.00 %)
385,123
(61.33 %)
131,783
(9.99 %)
2,029,883
(43.40 %)
25,597
(4.44 %)
293 patchouli (Gaoche1L2016 2018)
GCA_003675935.1
n/a 43,905
(2.21 %)
174,920
(14.40 %)
n/a 35.02
(93.97 %)
170,266
(6.06 %)
211,964
(93.94 %)
1,021,699
(2.86 %)
1,125,321
(8.02 %)
9,388,626
(47.60 %)
102,661
(4.26 %)
294 patchouli (shipai S1-5 2022)
GCA_023678885.1
n/a 47,432
(2.32 %)
168,583
(12.17 %)
n/a 34.43
(99.98 %)
764
(0.02 %)
966
(100.00 %)
2,043,616
(19.48 %)
1,147,892
(9.18 %)
9,501,180
(53.37 %)
110,140
(2.86 %)
295 peach
GCF_000346465.2
36,201
(20.87 %)
14,368
(6.26 %)
32,245
(24.09 %)
n/a 37.51
(98.79 %)
2,368
(1.22 %)
2,531
(98.78 %)
150,957
(10.06 %)
96,381
(5.52 %)
1,221,263
(28.72 %)
7,885
(2.07 %)
296 peanut
GCF_003086295.2
155,835
(5.15 %)
31,810
(1.19 %)
160,574
(8.81 %)
n/a 36.33
(99.85 %)
3,655
(0.15 %)
385
(100.00 %)
1,684,814
(3.52 %)
1,488,297
(4.81 %)
11,059,688
(62.32 %)
140,570
(2.45 %)
297 peanut (GDAAS-fuhuasheng2018 2019)
GCA_004170445.1
n/a 31,065
(1.17 %)
158,578
(8.79 %)
n/a 36.33
(98.97 %)
32,692
(1.04 %)
29
(100.00 %)
1,735,218
(3.66 %)
1,490,806
(4.26 %)
11,072,983
(61.75 %)
138,890
(2.46 %)
298 peanut (Tifrunner 2023)
GCF_003086295.3
173,169
(5.54 %)
31,897
(1.19 %)
160,532
(8.81 %)
n/a 36.33
(99.85 %)
3,697
(0.15 %)
443
(100.00 %)
1,676,149
(3.49 %)
1,489,126
(4.81 %)
11,105,477
(62.30 %)
140,609
(2.45 %)
299 pear (primary hap 2023)
GCF_963583255.1
48,939
(13.04 %)
22,082
(4.44 %)
56,235
(17.69 %)
n/a 37.45
(99.99 %)
145
(0.01 %)
176
(99.99 %)
289,539
(2.54 %)
223,443
(3.84 %)
2,308,351
(35.91 %)
19,559
(2.15 %)
300 pearl millet (Tift 23D2B1-P1-P5 2018)
GCA_002174835.2
n/a 17,949
(1.26 %)
134,829
(14.30 %)
n/a 47.95
(86.95 %)
156,852
(13.08 %)
52,033
(100.00 %)
380,858
(1.16 %)
466,997
(2.83 %)
5,117,134
(56.89 %)
380,989
(29.47 %)
301 pecan
GCF_018687715.1
71,340
(9.93 %)
18,671
(2.67 %)
60,632
(15.16 %)
n/a 36.30
(99.97 %)
22
(0.03 %)
39
(99.97 %)
473,853
(3.66 %)
367,846
(6.75 %)
3,301,121
(39.03 %)
27,274
(2.22 %)
302 pepperwort (EHA205 2019)
GCA_009757365.2
n/a 19,770
(7.79 %)
48,832
(21.86 %)
n/a 34.40
(96.79 %)
105,378
(3.36 %)
146,054
(96.64 %)
298,974
(31.14 %)
68,767
(2.63 %)
1,422,489
(26.49 %)
6,844
(1.17 %)
303 perennial ryegrass (Kyuss_39 2021)
GCF_019359855.1
89,789
(3.75 %)
17,693
(0.79 %)
174,787
(12.15 %)
n/a 44.32
(100.00 %)
238
(0.00 %)
1,677
(100.00 %)
605,852
(1.36 %)
760,915
(5.68 %)
5,216,229
(69.24 %)
542,998
(24.23 %)
304 perennial ryegrass (Kyuss_39 2024)
GCF_019359855.2
81,335
(3.75 %)
17,678
(0.79 %)
172,584
(12.06 %)
n/a 44.29
(100.00 %)
61
(0.00 %)
105
(100.00 %)
610,404
(1.37 %)
758,029
(5.51 %)
5,039,192
(69.30 %)
542,208
(23.92 %)
305 Peruvian cotton (G.raimondii 2012 DOE)
GCF_000327365.2
72,518
(8.99 %)
20,368
(2.64 %)
52,295
(10.15 %)
n/a 33.21
(98.25 %)
19,685
(1.76 %)
20,680
(98.24 %)
404,885
(2.81 %)
300,062
(3.31 %)
5,198,170
(40.84 %)
10,912
(0.59 %)
306 Peruvian cotton (GPD5lz 2022)
GCF_025698545.1
63,582
(8.69 %)
20,265
(2.62 %)
51,815
(10.02 %)
n/a 33.24
(100.00 %)
79
(0.00 %)
289
(100.00 %)
405,385
(2.83 %)
306,302
(3.81 %)
5,192,105
(41.79 %)
10,481
(0.65 %)
307 Phtheirospermum japonicum (okayama 2020)
GCA_014905375.1
n/a 15,868
(1.22 %)
104,104
(13.39 %)
n/a 36.03
(91.65 %)
318,321
(8.39 %)
328,880
(91.61 %)
810,727
(3.49 %)
710,744
(4.84 %)
7,339,863
(41.43 %)
104,967
(3.98 %)
308 pigeon pea (v2 2016 BGI)
GCF_000340665.2
46,412
(9.42 %)
17,396
(3.13 %)
49,710
(12.66 %)
n/a 32.76
(94.18 %)
36,323
(5.83 %)
67,834
(94.17 %)
395,663
(3.40 %)
306,602
(4.71 %)
3,749,364
(39.19 %)
26,504
(2.90 %)
309 pineapple
GCF_001540865.1
43,025
(11.65 %)
13,649
(3.36 %)
38,917
(14.95 %)
n/a 38.34
(98.23 %)
25,542
(1.78 %)
3,129
(100.00 %)
352,802
(7.31 %)
274,578
(4.75 %)
2,360,455
(38.94 %)
56,724
(11.73 %)
310 pink shepherd's-purse
GCF_000375325.1
37,318
(33.25 %)
22,836
(23.08 %)
26,822
(33.93 %)
n/a 35.63
(97.53 %)
6,294
(2.49 %)
7,067
(97.51 %)
74,470
(2.42 %)
42,509
(3.39 %)
814,442
(24.99 %)
5,817
(2.14 %)
311 pistachio
GCF_008641045.1
47,948
(7.92 %)
18,462
(2.58 %)
62,898
(14.05 %)
n/a 35.95
(99.84 %)
16,367
(0.16 %)
1,865
(100.00 %)
363,793
(2.43 %)
253,408
(4.08 %)
4,200,417
(36.34 %)
22,340
(1.78 %)
312 pocket water lily (Beijing-Zhang1983 2022)
GCF_008831285.2
41,223
(10.98 %)
11,576
(2.50 %)
38,220
(15.70 %)
n/a 38.61
(99.84 %)
626
(0.16 %)
1,409
(99.84 %)
236,190
(2.95 %)
153,746
(4.02 %)
2,151,579
(26.72 %)
24,561
(4.48 %)
313 pomegranate
GCF_007655135.1
43,277
(14.87 %)
14,635
(4.26 %)
39,381
(19.97 %)
n/a 40.38
(99.99 %)
188
(0.01 %)
474
(100.00 %)
173,182
(2.28 %)
174,872
(6.81 %)
1,640,973
(32.89 %)
26,506
(9.18 %)
314 potato S.stenotomum (F172 2021)
GCF_019186545.1
43,754
(6.67 %)
16,547
(2.25 %)
54,186
(11.30 %)
n/a 34.71
(88.41 %)
37,060
(11.60 %)
17,084
(100.00 %)
321,938
(2.14 %)
250,793
(4.04 %)
5,136,691
(33.92 %)
8,536
(0.30 %)
315 potato S.tuberosum (alt pseudohaplotype RH89-039-16 2020)
GCA_014189305.1
n/a 16,861
(1.98 %)
58,882
(12.19 %)
n/a 35.40
(99.95 %)
4,397
(0.05 %)
3,012
(100.00 %)
774,417
(46.83 %)
392,378
(8.45 %)
5,068,449
(42.72 %)
14,548
(1.32 %)
316 potato S.tuberosum (Dihaploid 'C-13' 2020)
GCA_010127505.1
n/a 17,614
(2.86 %)
45,684
(10.75 %)
n/a 34.49
(83.57 %)
10,041,161
(17.84 %)
12
(100.00 %)
606,573
(40.80 %)
168,871
(2.58 %)
5,508,800
(26.36 %)
5,550
(0.22 %)
317 potato S.tuberosum (DM 1-3 516 R44 2011)
GCF_000226075.1
43,158
(7.63 %)
16,423
(2.55 %)
50,333
(11.79 %)
n/a 34.83
(93.98 %)
45,215
(6.04 %)
60,069
(93.96 %)
662,626
(43.42 %)
212,315
(4.38 %)
4,691,843
(34.91 %)
9,851
(0.45 %)
318 potato S.tuberosum (hap 1 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169555.1
n/a 16,415
(2.15 %)
54,766
(12.48 %)
n/a 35.21
(99.98 %)
1,476
(0.02 %)
25
(100.00 %)
329,233
(2.28 %)
285,101
(5.66 %)
4,832,189
(40.28 %)
12,944
(0.99 %)
319 potato S.tuberosum (hap 2 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169535.1
n/a 16,694
(2.26 %)
53,990
(12.60 %)
n/a 35.20
(99.98 %)
1,499
(0.02 %)
28
(100.00 %)
323,447
(2.25 %)
283,098
(5.39 %)
4,727,964
(39.87 %)
12,316
(1.34 %)
320 potato S.tuberosum (hap 3 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169585.1
n/a 16,713
(2.23 %)
54,380
(12.60 %)
n/a 35.20
(99.98 %)
1,299
(0.02 %)
27
(100.00 %)
329,807
(2.31 %)
282,372
(6.11 %)
4,718,807
(40.25 %)
11,812
(1.00 %)
321 potato S.tuberosum (hap 4 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169575.1
n/a 16,640
(2.18 %)
54,937
(12.38 %)
n/a 35.18
(99.98 %)
1,383
(0.02 %)
26
(100.00 %)
329,665
(2.30 %)
285,993
(6.03 %)
4,858,802
(40.32 %)
12,792
(1.32 %)
322 potato S.tuberosum (RH89-039-16 2020)
GCA_014189475.1
n/a 16,312
(2.05 %)
54,438
(12.18 %)
n/a 35.23
(99.95 %)
4,448
(0.05 %)
12
(100.00 %)
730,464
(46.17 %)
338,389
(7.95 %)
4,903,557
(41.90 %)
12,226
(0.72 %)
323 potato S.verrucosum (2019)
GCF_900185275.1
35,846
(6.75 %)
16,408
(2.54 %)
48,924
(11.75 %)
n/a 34.59
(99.55 %)
1,612
(0.45 %)
1,332
(100.00 %)
297,683
(2.31 %)
234,616
(4.68 %)
4,308,149
(38.02 %)
8,192
(0.47 %)
324 Primulina tabacum (GXHZ01 2022)
GCF_025594145.1
69,821
(7.75 %)
19,604
(2.27 %)
61,800
(12.08 %)
n/a 36.89
(99.89 %)
1,710
(0.11 %)
541
(100.00 %)
310,321
(1.81 %)
229,404
(3.84 %)
4,409,199
(51.65 %)
40,094
(1.87 %)
325 proso millet (2018)
GCA_003046395.2
n/a 31,203
(4.33 %)
106,251
(25.92 %)
n/a 46.82
(98.02 %)
4,232
(1.98 %)
1,306
(100.00 %)
252,710
(1.48 %)
176,920
(3.16 %)
3,051,223
(41.53 %)
159,364
(32.38 %)
326 quinoa
GCF_001683475.1
74,918
(7.49 %)
22,914
(1.61 %)
105,619
(12.97 %)
n/a 36.87
(99.16 %)
725
(0.84 %)
3,487
(100.00 %)
810,277
(3.58 %)
762,903
(10.88 %)
6,551,884
(49.49 %)
93,630
(2.98 %)
327 radish (v2 WK10039 2023)
GCF_000801105.2
80,681
(20.53 %)
36,039
(9.58 %)
74,081
(26.98 %)
n/a 36.00
(99.94 %)
2,853
(0.06 %)
6,424
(100.00 %)
224,524
(2.48 %)
193,525
(5.49 %)
2,234,480
(35.04 %)
25,972
(4.13 %)
328 rape (Da-Ae 2021)
GCF_020379485.1
152,744
(19.27 %)
57,668
(6.87 %)
143,092
(23.51 %)
n/a 37.13
(99.99 %)
840
(0.01 %)
3,167
(100.00 %)
470,302
(2.29 %)
578,281
(9.24 %)
4,662,467
(42.41 %)
64,287
(5.62 %)
329 rape (ZS11 2017)
GCF_000686985.2
144,991
(17.51 %)
59,743
(7.71 %)
146,391
(26.97 %)
n/a 36.47
(92.96 %)
32,639
(7.05 %)
34,110
(92.95 %)
449,257
(2.67 %)
441,269
(5.84 %)
4,867,601
(32.91 %)
60,082
(3.53 %)
330 red clover eudicots (HEN17-A07 2021)
GCF_020283565.1
63,238
(17.01 %)
17,857
(4.13 %)
43,079
(17.27 %)
n/a 33.71
(99.97 %)
231
(0.03 %)
90
(100.00 %)
241,481
(2.65 %)
187,674
(4.85 %)
2,251,582
(37.03 %)
6,474
(1.93 %)
331 red sage (Shanhuang shh 2023)
GCF_028751815.1
62,715
(12.27 %)
15,176
(2.61 %)
67,175
(21.50 %)
n/a 37.47
(99.58 %)
695
(0.42 %)
173
(100.00 %)
377,231
(3.52 %)
364,027
(5.05 %)
2,679,528
(42.07 %)
64,243
(6.17 %)
332 red wild einkorn wheat (G1812 2018)
GCF_003073215.2
71,160
(1.59 %)
18,911
(0.39 %)
321,741
(10.16 %)
n/a 45.91
(99.38 %)
33,814
(0.62 %)
10,205
(100.00 %)
1,208,165
(1.25 %)
1,319,817
(2.96 %)
15,480,313
(71.93 %)
975,234
(26.52 %)
333 redroot sage (bh2-7 2020)
GCA_016432925.1
n/a 15,208
(2.55 %)
68,573
(21.07 %)
n/a 37.68
(99.37 %)
2,815
(0.63 %)
1,118
(100.00 %)
628,541
(17.44 %)
380,078
(5.18 %)
2,710,697
(43.28 %)
66,987
(6.29 %)
334 Rhododendron vialii eudicots (Sample 1 2023)
GCF_030253575.1
62,168
(11.90 %)
15,363
(2.73 %)
54,203
(18.86 %)
n/a 39.52
(100.00 %)
5
(0.00 %)
18
(100.00 %)
253,965
(2.10 %)
235,379
(9.36 %)
2,668,584
(34.08 %)
31,789
(3.72 %)
335 rice bean (VRB3 2023)
GCA_029865625.1
n/a 18,823
(3.07 %)
63,430
(18.52 %)
n/a 34.56
(96.54 %)
4,440
(3.46 %)
232
(100.00 %)
1,016,591
(59.80 %)
384,326
(8.33 %)
3,318,479
(40.76 %)
30,562
(3.41 %)
336 rice bean eudicots (VRB-3 Himshakti 2021)
GCF_018835915.1
38,736
(11.89 %)
16,669
(4.18 %)
43,369
(14.64 %)
n/a 32.90
(93.47 %)
20,717
(6.53 %)
15,445
(100.00 %)
233,635
(3.33 %)
204,141
(4.85 %)
2,682,022
(32.58 %)
16,828
(2.07 %)
337 riverbank grape
GCF_004353265.1
44,851
(10.22 %)
15,302
(3.01 %)
46,011
(14.96 %)
n/a 34.32
(98.79 %)
1,095
(1.21 %)
175
(100.00 %)
339,984
(3.03 %)
233,259
(4.71 %)
2,925,914
(35.27 %)
11,055
(0.93 %)
338 robusta coffee (DH200=94 2014)
GCA_900059795.1
n/a 13,770
(2.74 %)
46,992
(16.51 %)
n/a 36.65
(82.89 %)
12,714
(17.11 %)
25,216
(82.89 %)
219,723
(2.15 %)
140,449
(2.62 %)
2,590,105
(28.19 %)
12,700
(1.66 %)
339 rose gum (2021)
GCF_016545825.1
54,676
(10.44 %)
16,291
(2.42 %)
69,492
(17.92 %)
n/a 39.39
(99.97 %)
1,712
(0.03 %)
37
(100.00 %)
358,171
(2.83 %)
259,031
(3.65 %)
3,353,128
(29.52 %)
78,731
(7.66 %)
340 rose gum (BRASUZ1 2014)
GCF_000612305.1
65,107
(11.08 %)
16,389
(2.33 %)
74,557
(18.16 %)
n/a 39.28
(92.69 %)
27,773
(7.32 %)
32,724
(92.68 %)
357,835
(2.50 %)
266,806
(3.22 %)
3,496,176
(27.34 %)
79,393
(6.54 %)
341 rose of Sharon
GCF_006381635.1
91,942
(5.18 %)
44,363
(2.23 %)
136,768
(10.14 %)
n/a 34.23
(100.00 %)
2
(0.00 %)
1,789
(100.00 %)
889,945
(2.72 %)
968,890
(4.91 %)
9,836,479
(51.73 %)
42,560
(0.89 %)
342 rubber tree (MT/VB/25A 57/8 2023)
GCF_030052815.1
71,258
(4.21 %)
22,208
(1.24 %)
63,302
(5.13 %)
n/a 34.70
(91.68 %)
1,428
(8.32 %)
755
(100.00 %)
1,078,590
(2.96 %)
730,314
(3.70 %)
6,031,831
(65.59 %)
24,263
(0.70 %)
343 rubber tree (reyan7-33-97 2016)
GCF_001654055.1
66,124
(5.23 %)
22,033
(1.63 %)
59,727
(6.42 %)
n/a 34.84
(94.20 %)
40,863
(5.81 %)
7,453
(100.00 %)
827,088
(3.02 %)
565,394
(5.23 %)
5,065,470
(61.59 %)
13,573
(0.45 %)
344 S.splendens huo1 eudicots (BFU 2021)
GCF_004379255.1
94,414
(12.61 %)
31,218
(3.57 %)
108,219
(21.49 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
471
(0.00 %)
1,178
(100.00 %)
360,314
(2.17 %)
419,051
(4.85 %)
3,875,932
(41.07 %)
105,227
(10.14 %)
345 sacred lotus
GCF_000365185.1
43,140
(7.01 %)
15,920
(2.13 %)
61,231
(13.11 %)
n/a 38.30
(87.98 %)
175,846
(12.06 %)
58,428
(87.96 %)
408,351
(2.83 %)
275,384
(2.52 %)
4,643,876
(30.20 %)
40,599
(2.68 %)
346 saltwater cress
GCF_000478725.1
38,705
(18.07 %)
21,851
(11.68 %)
39,487
(28.65 %)
n/a 37.71
(98.09 %)
3,020
(1.92 %)
3,658
(98.08 %)
102,162
(1.93 %)
70,755
(3.25 %)
1,162,538
(32.09 %)
15,272
(3.87 %)
347 sandblossoms (Phelan CA IGA184 alternate hap 2022)
GCA_023055565.1
n/a 14,138
(0.74 %)
125,370
(12.27 %)
n/a 40.18
(100.00 %)
149
(0.00 %)
581
(100.00 %)
655,331
(1.73 %)
500,899
(4.88 %)
7,172,490
(54.24 %)
140,800
(5.87 %)
348 sandblossoms (Phelan CA IGA184 primary hap 2022)
GCA_023055425.1
n/a 15,588
(0.93 %)
117,831
(12.94 %)
n/a 40.08
(100.00 %)
85
(0.00 %)
123
(100.00 %)
597,532
(1.81 %)
430,194
(3.80 %)
6,075,115
(49.91 %)
129,512
(5.41 %)
349 scarlet sage (huo1 2021)
GCF_004379255.2
94,251
(12.60 %)
31,266
(3.58 %)
108,141
(21.47 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
471
(0.00 %)
1,162
(100.00 %)
357,482
(2.10 %)
419,009
(4.86 %)
3,874,047
(41.08 %)
105,216
(10.11 %)
350 scented satinash
GCF_900635055.1
42,531
(12.21 %)
15,353
(3.67 %)
53,811
(20.61 %)
n/a 40.64
(89.65 %)
11,862
(10.35 %)
19,039
(100.00 %)
179,421
(2.10 %)
174,902
(3.34 %)
1,785,894
(25.35 %)
55,685
(7.69 %)
351 sesame
GCF_000512975.1
38,693
(16.95 %)
15,555
(5.41 %)
35,316
(19.66 %)
n/a 35.00
(98.34 %)
9,940
(1.66 %)
26,176
(98.34 %)
161,123
(2.85 %)
79,750
(3.97 %)
1,807,029
(31.02 %)
9,873
(1.80 %)
352 shrubby jointvetch A. evenia (CIAT22838 2020)
GCA_013621005.1
n/a 16,242
(4.30 %)
39,583
(17.06 %)
n/a 35.22
(98.66 %)
2,946
(1.35 %)
1,451
(100.00 %)
253,228
(3.98 %)
186,657
(9.89 %)
1,792,662
(45.14 %)
19,928
(3.29 %)
353 silver malletwood (14919 2019)
GCF_900635035.1
46,475
(12.62 %)
17,469
(4.11 %)
51,531
(21.75 %)
n/a 40.30
(93.72 %)
7,529
(6.28 %)
15,781
(100.00 %)
194,855
(2.07 %)
116,828
(2.25 %)
1,801,472
(25.38 %)
44,191
(5.74 %)
354 silver malletwood (NSW1041297 2021)
GCF_020921035.1
43,419
(12.78 %)
14,758
(4.01 %)
41,180
(19.74 %)
n/a 40.38
(100.00 %)
36
(0.00 %)
75
(100.00 %)
160,749
(1.91 %)
114,741
(3.07 %)
1,619,569
(28.25 %)
43,290
(7.15 %)
355 silver poplar
GCF_005239225.1
53,066
(14.64 %)
20,299
(4.74 %)
44,556
(16.36 %)
n/a 33.75
(100.00 %)
n/a 1,287
(100.00 %)
309,097
(3.34 %)
175,288
(4.77 %)
2,457,634
(38.38 %)
4,613
(0.67 %)
356 silverweed cinquefoil (primary hap 2022)
GCF_933775445.1
28,734
(15.21 %)
13,143
(5.29 %)
32,007
(22.39 %)
n/a 37.81
(100.00 %)
8
(0.00 %)
147
(100.00 %)
89,958
(1.86 %)
351,649
(15.29 %)
884,646
(35.58 %)
14,711
(4.52 %)
357 sorghum (BTx623 2017)
GCF_000003195.3
48,290
(8.57 %)
17,901
(3.45 %)
73,969
(19.64 %)
n/a 43.88
(95.30 %)
3,906
(4.70 %)
4,775
(95.30 %)
556,607
(65.39 %)
177,271
(4.54 %)
2,371,199
(48.20 %)
110,115
(18.82 %)
358 sorghum (Tx430 2018)
GCA_003482435.1
n/a 18,138
(3.63 %)
75,180
(20.67 %)
n/a 43.67
(97.96 %)
2,108
(2.04 %)
308
(100.00 %)
559,950
(63.17 %)
156,952
(3.01 %)
2,481,716
(46.70 %)
109,923
(19.06 %)
359 soybean (EMBRAPA BRS 537 2021)
GCA_012273815.2
n/a 27,746
(3.01 %)
77,617
(11.66 %)
n/a 34.80
(97.95 %)
340
(2.05 %)
95
(100.00 %)
1,182,211
(56.35 %)
444,701
(6.81 %)
5,365,860
(45.98 %)
35,684
(1.48 %)
360 soybean (US DOE JGI-PGF v2 2021)
GCF_000004515.6
88,006
(9.87 %)
27,705
(3.08 %)
77,033
(11.88 %)
n/a 34.74
(97.36 %)
8,918
(2.65 %)
9,199
(97.35 %)
848,398
(38.02 %)
434,042
(5.29 %)
5,346,884
(45.07 %)
35,893
(1.55 %)
361 soybean (Williams 82 2023)
GCA_030864155.1
n/a 27,960
(2.93 %)
77,762
(11.36 %)
n/a 35.02
(100.00 %)
n/a 20
(100.00 %)
549,577
(2.73 %)
453,208
(9.60 %)
5,325,393
(48.31 %)
36,641
(1.53 %)
362 spider flower
GCF_000463585.1
45,524
(22.00 %)
21,103
(10.40 %)
38,184
(27.17 %)
n/a 39.40
(87.71 %)
24,824
(12.32 %)
37,073
(87.68 %)
144,827
(3.22 %)
103,970
(4.10 %)
1,118,840
(31.64 %)
29,313
(6.47 %)
363 spinach (Sp75 2017)
GCF_002007265.1
41,411
(5.75 %)
12,540
(1.38 %)
68,522
(12.26 %)
n/a 37.82
(95.53 %)
137,086
(4.48 %)
78,263
(100.00 %)
374,336
(2.48 %)
670,331
(6.78 %)
3,213,561
(52.82 %)
89,520
(4.54 %)
364 spinach (Varoflay 2021)
GCF_020520425.1
58,433
(7.11 %)
12,431
(1.27 %)
61,084
(11.35 %)
n/a 37.89
(100.00 %)
63
(0.00 %)
246
(100.00 %)
378,521
(2.27 %)
722,814
(6.29 %)
2,950,586
(58.17 %)
92,256
(5.21 %)
365 spotted monkey flower
GCF_000504015.1
34,441
(15.56 %)
14,508
(4.41 %)
34,904
(18.83 %)
n/a 35.50
(93.50 %)
15,528
(6.52 %)
17,740
(93.48 %)
227,143
(4.28 %)
204,234
(11.85 %)
1,776,879
(40.60 %)
21,718
(3.89 %)
366 spreading earthmoss (2024)
GCF_000002425.5
52,765
(10.63 %)
8,496
(1.48 %)
30,423
(12.59 %)
n/a 33.71
(99.04 %)
1,794
(0.96 %)
359
(100.00 %)
293,130
(2.79 %)
242,633
(2.68 %)
2,405,680
(52.61 %)
22,672
(3.11 %)
367 stiff brome
GCF_000005505.3
47,531
(20.35 %)
15,530
(6.01 %)
45,735
(34.29 %)
n/a 46.40
(99.84 %)
27
(0.16 %)
36
(99.84 %)
108,976
(17.41 %)
54,391
(1.94 %)
1,197,052
(21.34 %)
48,209
(34.43 %)
368 strawberry (Benihoppe 2023)
GCA_034370585.1
n/a 45,858
(5.68 %)
123,100
(24.81 %)
n/a 39.34
(100.00 %)
n/a 28
(100.00 %)
934,221
(35.80 %)
376,936
(6.46 %)
3,304,328
(31.01 %)
69,530
(5.73 %)
369 strawberry (Reikou 2013)
GCA_000511835.1
n/a 15,045
(1.35 %)
164,045
(15.16 %)
n/a 38.82
(94.24 %)
89,898
(5.63 %)
714,282
(94.37 %)
278,640
(1.91 %)
388,660
(6.94 %)
3,639,568
(28.92 %)
64,180
(3.80 %)
370 sugarcane (2018)
GCA_900465005.1
n/a 18,847
(4.51 %)
76,529
(27.07 %)
n/a 45.11
(99.96 %)
1,423
(0.03 %)
7,128
(99.97 %)
258,594
(29.31 %)
144,716
(2.51 %)
1,976,510
(35.41 %)
113,324
(26.96 %)
371 sugarcane (CC_01_1940 2021)
GCA_020102875.1
n/a 25,299
(3.45 %)
146,261
(29.51 %)
n/a 45.01
(99.92 %)
7,046
(0.08 %)
35,074
(100.00 %)
302,307
(1.66 %)
272,248
(3.71 %)
4,068,281
(29.60 %)
204,656
(25.44 %)
372 sugarcane (SP80-3280 WGSA1 2019)
GCA_008692665.1
n/a 78,903
(2.31 %)
756,432
(27.56 %)
n/a 43.71
(99.98 %)
36
(0.00 %)
398,389
(100.00 %)
1,981,854
(25.32 %)
926,250
(3.55 %)
15,903,748
(41.06 %)
829,054
(16.97 %)
373 sweet cherry
GCF_002207925.1
39,968
(19.06 %)
15,007
(5.83 %)
38,107
(23.61 %)
n/a 37.72
(90.64 %)
22,628
(9.39 %)
10,148
(100.00 %)
136,700
(2.47 %)
104,376
(7.20 %)
1,484,591
(25.20 %)
9,956
(2.27 %)
374 sweet cherry (Tieton 2020)
GCA_014155035.1
n/a 15,140
(4.31 %)
39,977
(20.09 %)
n/a 38.44
(99.98 %)
2,194
(0.02 %)
61
(100.00 %)
189,726
(2.51 %)
150,018
(21.96 %)
1,231,274
(44.86 %)
12,897
(3.14 %)
375 sweet orange
GCF_000317415.1
46,820
(15.94 %)
14,390
(4.63 %)
34,480
(18.04 %)
n/a 34.07
(91.90 %)
12,539
(8.11 %)
17,383
(91.89 %)
185,212
(2.95 %)
104,182
(4.92 %)
2,119,183
(29.53 %)
6,540
(0.93 %)
376 sweet potato (Taizhong6 2017)
GCA_002525835.2
n/a 23,319
(2.45 %)
98,107
(18.19 %)
n/a 35.14
(88.01 %)
171,925
(12.06 %)
28,461
(100.00 %)
579,745
(3.87 %)
473,175
(3.79 %)
4,850,126
(32.44 %)
52,715
(3.15 %)
377 sweet wormwood (Huhao1# 2018)
GCA_003112345.1
n/a 22,279
(1.15 %)
121,694
(10.54 %)
n/a 35.34
(91.81 %)
275,710
(8.22 %)
314,564
(91.78 %)
856,470
(2.64 %)
970,252
(5.69 %)
7,570,175
(42.39 %)
29,072
(0.54 %)
378 switchgrass
GCF_016808335.1
114,876
(10.54 %)
31,534
(3.21 %)
152,844
(27.54 %)
n/a 46.79
(99.59 %)
464
(0.41 %)
1,091
(99.59 %)
395,905
(1.77 %)
323,173
(5.10 %)
4,922,182
(39.47 %)
213,249
(32.45 %)
379 Tartarian buckwheat (Pinku1 2017)
GCA_002319775.1
n/a 15,605
(2.84 %)
50,437
(14.57 %)
n/a 38.53
(96.71 %)
2,456
(3.29 %)
7,020
(100.00 %)
257,784
(2.74 %)
211,756
(3.88 %)
2,209,417
(41.80 %)
54,125
(5.80 %)
380 Tasmanian pepperberry (RefF3 2024)
GCF_043159265.1
65,925
(7.32 %)
16,247
(1.53 %)
76,786
(13.23 %)
n/a 39.37
(100.00 %)
n/a 1,338
(100.00 %)
1,968,661
(26.22 %)
626,214
(13.70 %)
4,298,324
(45.52 %)
32,932
(4.92 %)
381 thale cress (Landsberg erecta 2016)
GCA_001651475.1
n/a 26,053
(33.97 %)
25,713
(36.19 %)
n/a 36.01
(98.51 %)
3,479
(1.50 %)
30
(100.00 %)
65,429
(14.19 %)
24,979
(1.85 %)
739,651
(21.49 %)
4,443
(1.81 %)
382 thale cress (tair10.1 Columbia 2018)
GCF_000001735.4
53,852
(40.10 %)
26,582
(34.47 %)
11,416
(18.70 %)
n/a 36.06
(99.85 %)
357
(0.16 %)
7
(100.00 %)
68,517
(16.50 %)
27,064
(2.77 %)
749,005
(22.64 %)
4,601
(1.63 %)
383 thunder duke vine
GCF_013401445.1
56,436
(17.59 %)
20,174
(5.61 %)
42,326
(19.85 %)
n/a 37.58
(99.96 %)
146
(0.04 %)
321
(100.00 %)
125,395
(2.23 %)
102,179
(22.89 %)
1,226,273
(38.50 %)
6,893
(1.71 %)
384 tobacco N.attenuata
GCF_001879085.1
50,668
(2.79 %)
17,479
(0.82 %)
117,543
(8.63 %)
n/a 40.23
(88.38 %)
119,817
(11.63 %)
37,194
(100.00 %)
622,838
(1.51 %)
788,520
(3.46 %)
11,822,060
(48.66 %)
174,838
(3.17 %)
385 tobacco N.tomentosiformis
GCF_000390325.2
66,966
(3.67 %)
17,141
(1.02 %)
81,513
(6.82 %)
n/a 38.89
(97.29 %)
213,074
(2.72 %)
215,609
(97.29 %)
486,556
(1.53 %)
669,040
(5.52 %)
10,446,746
(53.83 %)
118,807
(2.33 %)
386 tomato (2024)
GCF_036512215.1
59,947
(8.20 %)
15,474
(1.94 %)
40,638
(7.50 %)
n/a 35.17
(99.99 %)
166
(0.01 %)
14
(100.00 %)
333,077
(2.31 %)
259,232
(7.09 %)
5,402,596
(43.04 %)
31,740
(4.85 %)
387 tomato (Micro-Tom 2020)
GCA_012431665.1
n/a 15,607
(2.04 %)
39,981
(7.57 %)
n/a 34.32
(97.69 %)
1,323
(2.31 %)
391
(100.00 %)
433,628
(20.28 %)
248,928
(3.94 %)
5,440,564
(39.72 %)
31,891
(1.72 %)
388 tomato (Micro-Tom S9 2023)
GCA_030162295.1
n/a 15,496
(2.07 %)
38,799
(7.36 %)
n/a 34.40
(98.25 %)
32,234
(1.76 %)
165
(100.00 %)
1,028,324
(71.24 %)
249,749
(4.56 %)
5,384,286
(39.87 %)
27,343
(1.53 %)
389 tomato (v3.1 Heinz 1706 2018)
GCF_000188115.5
45,958
(6.93 %)
15,425
(2.15 %)
38,319
(7.54 %)
n/a 34.12
(90.19 %)
19,539
(9.82 %)
3,066
(100.00 %)
311,852
(2.14 %)
229,773
(3.18 %)
5,390,626
(35.26 %)
25,196
(1.27 %)
390 toyon (HeAr 88 alternate hap 2022)
GCA_024363235.1
n/a 22,795
(3.47 %)
67,418
(16.40 %)
n/a 38.17
(100.00 %)
11
(0.00 %)
75
(100.00 %)
347,375
(3.07 %)
304,988
(3.96 %)
3,119,641
(40.22 %)
30,300
(3.29 %)
391 toyon (HeAr 88 primary hap 2022)
GCA_024362995.1
n/a 22,897
(3.50 %)
67,595
(16.43 %)
n/a 38.12
(100.00 %)
5
(0.00 %)
118
(100.00 %)
344,928
(2.90 %)
299,566
(3.87 %)
3,139,734
(39.86 %)
30,533
(2.95 %)
392 tree cotton (Shixiya-1 2022)
GCF_025698485.1
69,134
(4.11 %)
20,169
(1.21 %)
55,515
(4.75 %)
n/a 35.17
(100.00 %)
225
(0.00 %)
948
(100.00 %)
618,195
(1.97 %)
622,748
(3.28 %)
8,002,633
(61.80 %)
27,646
(0.67 %)
393 tree cotton (Shixiya1 2015 BGI)
GCF_000612285.1
53,446
(3.92 %)
20,707
(1.29 %)
56,318
(5.01 %)
n/a 35.03
(92.12 %)
45,768
(7.88 %)
121,185
(92.12 %)
618,119
(2.07 %)
589,954
(3.54 %)
8,098,351
(55.57 %)
28,949
(0.57 %)
394 trifoliate orange (ZK8 2021)
GCA_018350135.1
n/a 14,955
(4.81 %)
32,433
(16.97 %)
n/a 34.13
(99.99 %)
222
(0.01 %)
707
(99.99 %)
181,106
(2.67 %)
98,804
(3.46 %)
2,031,768
(34.51 %)
6,294
(1.72 %)
395 trilobed morning glory
GCF_003576645.1
49,472
(13.00 %)
16,803
(3.58 %)
50,448
(18.68 %)
n/a 35.68
(94.76 %)
31,256
(5.25 %)
17
(100.00 %)
333,211
(3.67 %)
335,317
(10.66 %)
2,341,085
(36.54 %)
27,290
(3.24 %)
396 turmeric (G26 2024)
GCF_044706935.1
40,834
(13.17 %)
18,067
(4.25 %)
53,196
(20.85 %)
n/a 37.76
(99.88 %)
4,668
(0.12 %)
7,139
(100.00 %)
169,406
(2.24 %)
191,181
(4.26 %)
2,052,731
(28.24 %)
50,044
(9.42 %)
397 Valencia sweet orange 2022
GCF_022201045.2
49,199
(16.33 %)
14,451
(4.70 %)
33,670
(18.59 %)
n/a 34.22
(100.00 %)
8
(0.00 %)
11
(100.00 %)
184,421
(2.80 %)
106,732
(3.28 %)
1,996,057
(33.86 %)
6,824
(1.28 %)
398 valley oak (v3.2 2019)
GCF_001633185.2
63,531
(8.16 %)
16,883
(1.90 %)
72,901
(14.48 %)
n/a 35.38
(99.77 %)
1,673
(0.23 %)
2,002
(100.00 %)
800,288
(3.71 %)
460,119
(7.41 %)
5,438,715
(37.84 %)
19,628
(1.10 %)
399 Van Houtte's columbine (alt pseudohaplotype PFEx6 2022)
GCA_023053535.1
n/a 13,357
(3.39 %)
37,446
(17.24 %)
n/a 37.56
(100.00 %)
63
(0.00 %)
249
(100.00 %)
244,573
(10.74 %)
180,141
(13.98 %)
1,184,686
(42.28 %)
6,470
(2.86 %)
400 Van Houtte's columbine (PFEx6 2022)
GCA_023053565.1
n/a 13,575
(3.44 %)
38,113
(17.59 %)
n/a 37.58
(100.00 %)
62
(0.00 %)
463
(100.00 %)
245,892
(11.25 %)
158,855
(13.35 %)
1,221,056
(41.58 %)
6,436
(2.63 %)
401 vegetable marrow (v2 mu-cu-16 2017)
GCF_002806865.2
48,839
(21.95 %)
19,452
(7.44 %)
35,987
(20.77 %)
n/a 36.49
(94.38 %)
49,199
(5.63 %)
24,194
(100.00 %)
181,473
(3.18 %)
143,114
(7.42 %)
1,614,901
(29.14 %)
13,094
(2.48 %)
402 water chestnut (Nanhuling F231 2024)
GCA_035582545.1
n/a 19,879
(3.81 %)
38,349
(12.06 %)
n/a 38.10
(100.00 %)
216
(0.00 %)
32
(100.00 %)
116,633
(1.34 %)
123,546
(2.75 %)
2,308,826
(51.78 %)
20,598
(2.37 %)
403 watermelon (97103 2019)
GCA_000238415.2
n/a 13,387
(3.57 %)
27,414
(10.73 %)
n/a 33.57
(98.45 %)
245
(1.55 %)
113
(100.00 %)
292,830
(3.56 %)
169,773
(2.91 %)
2,260,362
(43.24 %)
14,898
(1.47 %)
404 watermelon (Charleston Gray 2019)
GCA_004801215.2
n/a 13,662
(3.47 %)
28,811
(10.60 %)
n/a 33.52
(94.83 %)
19,579
(5.18 %)
6,794
(100.00 %)
314,974
(3.65 %)
193,157
(4.04 %)
2,390,687
(41.95 %)
15,527
(1.38 %)
405 watermelon (Kordofan 2021)
GCA_018142915.1
n/a 13,494
(3.54 %)
27,976
(10.71 %)
n/a 33.60
(100.00 %)
47
(0.00 %)
33
(100.00 %)
780,860
(60.44 %)
173,577
(3.01 %)
2,295,095
(44.07 %)
15,356
(1.51 %)
406 wax gourd
GCF_009727055.1
40,406
(4.66 %)
13,481
(1.43 %)
43,071
(6.68 %)
n/a 34.85
(98.39 %)
24,524
(1.62 %)
1,791
(100.00 %)
481,638
(2.55 %)
364,998
(3.11 %)
6,236,506
(49.68 %)
21,741
(0.93 %)
407 weeping love grass (Victoria 2019)
GCA_007726485.1
n/a 22,395
(3.96 %)
101,555
(33.88 %)
n/a 45.70
(99.78 %)
2,245
(0.22 %)
1,143
(100.00 %)
206,645
(1.57 %)
174,457
(2.79 %)
2,244,665
(26.11 %)
117,743
(29.88 %)
408 white cockle S.latifolia (original U9 population 2025)
GCF_048544455.1
89,156
(3.16 %)
15,292
(0.51 %)
135,024
(8.39 %)
n/a 38.77
(98.57 %)
827
(1.43 %)
720
(100.00 %)
1,158,845
(2.32 %)
1,353,517
(6.28 %)
10,836,475
(64.19 %)
161,610
(4.19 %)
409 white fonio (2020)
GCA_902806635.1
n/a 33,011
(5.39 %)
109,615
(30.77 %)
n/a 45.47
(97.23 %)
29,136
(2.79 %)
29,155
(97.21 %)
215,374
(1.42 %)
159,137
(1.91 %)
2,776,488
(28.15 %)
136,308
(27.74 %)
410 white lupine (Amiga GWH2020 2020)
GCA_010261695.1
n/a 21,959
(3.77 %)
51,652
(20.18 %)
n/a 36.92
(99.73 %)
1,764
(0.27 %)
3,171
(99.97 %)
215,169
(3.21 %)
247,660
(10.71 %)
2,556,478
(43.72 %)
14,520
(10.46 %)
411 white poplar (2024)
GCF_005239225.2
53,525
(15.07 %)
20,195
(4.72 %)
44,116
(16.35 %)
n/a 33.73
(99.86 %)
1,182
(0.14 %)
97
(100.00 %)
307,548
(3.27 %)
174,946
(4.79 %)
2,453,000
(38.39 %)
4,493
(0.61 %)
412 white poplar P.alba x Populus glandulosa (maternal hap 84K 2023)
GCA_033621325.1
n/a 19,540
(4.79 %)
41,183
(15.85 %)
n/a 34.67
(100.00 %)
2
(0.00 %)
21
(100.00 %)
265,758
(2.98 %)
150,154
(12.12 %)
2,138,699
(41.34 %)
3,578
(0.99 %)
413 white poplar P.alba x Populus glandulosa (paternal hap 84K 2023)
GCA_033617975.1
n/a 19,599
(4.60 %)
42,133
(16.21 %)
n/a 35.05
(100.00 %)
n/a 27
(100.00 %)
268,999
(2.93 %)
165,404
(12.23 %)
2,153,763
(42.62 %)
5,857
(2.24 %)
414 white yam
GCF_009730915.1
43,902
(7.41 %)
13,647
(2.09 %)
49,877
(12.79 %)
n/a 36.25
(99.19 %)
4,760
(0.81 %)
2,254
(100.00 %)
391,299
(3.19 %)
258,918
(3.96 %)
3,588,023
(40.59 %)
28,929
(2.37 %)
415 wild cabbage
GCF_000695525.1
66,716
(15.60 %)
31,142
(8.08 %)
103,348
(35.10 %)
n/a 36.11
(91.23 %)
52,140
(8.80 %)
33,760
(99.98 %)
197,515
(3.12 %)
214,463
(4.43 %)
2,535,207
(31.20 %)
29,995
(2.99 %)
416 wild cabbage (2018)
GCA_900416815.2
n/a 31,163
(6.66 %)
79,290
(25.04 %)
n/a 36.57
(98.21 %)
135
(1.79 %)
140
(100.00 %)
273,972
(2.76 %)
284,806
(6.41 %)
2,750,803
(38.77 %)
33,071
(3.37 %)
417 wild Colombian cocoa
GCF_002168275.1
29,804
(16.68 %)
13,252
(5.90 %)
22,247
(14.89 %)
n/a 32.94
(94.65 %)
119,056
(5.55 %)
6,074
(100.00 %)
107,979
(2.19 %)
67,029
(6.76 %)
1,525,353
(32.45 %)
2,481
(0.48 %)
418 wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.1 2019)
GCF_002162155.2
131,285
(1.34 %)
n/a 567,570
(8.14 %)
n/a 45.99
(96.70 %)
344,589
(3.31 %)
148,296
(100.00 %)
2,573,102
(1.23 %)
2,990,888
(3.37 %)
492,885
(96.69 %)
2,220,880
(25.34 %)
419 wild Malaysian banana
GCF_000313855.2
53,171
(14.87 %)
18,878
(4.31 %)
45,554
(18.36 %)
n/a 38.87
(82.70 %)
22,178
(17.31 %)
24,423
(82.71 %)
214,040
(7.81 %)
136,453
(2.42 %)
1,656,678
(31.15 %)
53,687
(8.28 %)
420 wild olive
GCF_002742605.1
67,081
(6.69 %)
19,793
(1.69 %)
68,749
(9.17 %)
n/a 35.40
(90.41 %)
47,638
(9.59 %)
41,226
(100.00 %)
425,922
(1.79 %)
378,656
(18.98 %)
5,982,070
(40.81 %)
12,534
(0.42 %)
421 wild peanut A.duranensis (v2 V14167 2020)
GCF_000817695.3
57,163
(6.21 %)
17,102
(1.68 %)
76,760
(11.48 %)
n/a 35.80
(88.03 %)
135,554
(12.02 %)
1,589
(100.00 %)
596,136
(3.37 %)
499,251
(3.39 %)
5,279,103
(45.94 %)
48,556
(1.91 %)
422 wild peanut A.ipaensis (K30076 2017)
GCF_000816755.2
78,441
(5.58 %)
16,952
(1.26 %)
89,380
(9.95 %)
n/a 36.84
(92.91 %)
122,617
(7.13 %)
997
(99.67 %)
777,978
(3.35 %)
619,944
(3.82 %)
5,823,472
(53.61 %)
79,537
(2.58 %)
423 wild peanut A.stenosperma (V10309 2020)
GCF_014773155.1
67,384
(5.06 %)
16,850
(1.28 %)
83,780
(9.77 %)
n/a 36.78
(93.48 %)
14,157
(6.52 %)
30
(100.00 %)
767,054
(3.15 %)
754,355
(3.89 %)
5,146,558
(56.74 %)
71,885
(2.45 %)
424 wild soybean
GCF_004193775.1
81,537
(9.20 %)
27,977
(2.99 %)
78,144
(11.64 %)
n/a 34.88
(97.58 %)
752
(2.42 %)
1,120
(100.00 %)
551,217
(2.79 %)
450,287
(6.65 %)
5,379,409
(46.22 %)
37,183
(1.52 %)
425 wild strawberry (2011 refseq)
GCF_000184155.1
25,210
(19.38 %)
13,996
(6.63 %)
46,505
(35.89 %)
n/a 38.40
(94.27 %)
16,253
(5.76 %)
16,460
(94.25 %)
71,057
(1.51 %)
74,581
(2.78 %)
1,034,180
(21.44 %)
14,806
(3.21 %)
426 wild sugarcane (AP85-441 2018)
GCA_003544955.1
n/a 67,698
(2.77 %)
385,590
(22.40 %)
n/a 44.92
(99.75 %)
76,230
(0.26 %)
15,303
(100.00 %)
1,015,234
(1.60 %)
910,932
(3.64 %)
10,425,387
(46.78 %)
637,314
(24.52 %)
427 wild tomato S.pennellii
GCF_001406875.1
46,114
(5.99 %)
15,458
(1.87 %)
42,907
(7.63 %)
n/a 34.50
(92.34 %)
41,684
(7.67 %)
41,696
(92.33 %)
363,460
(2.48 %)
271,129
(4.15 %)
6,330,153
(36.93 %)
19,639
(1.20 %)
428 wine grape (Chardonnay FPS 04 2020)
GCA_011037095.1
n/a 17,733
(2.85 %)
55,354
(14.76 %)
n/a 34.32
(99.33 %)
780
(0.67 %)
683
(100.00 %)
586,981
(35.31 %)
275,412
(4.57 %)
3,561,395
(35.28 %)
14,172
(0.96 %)
429 wine grape (Chkhaveri 2017)
GCA_002922885.1
n/a 14,109
(3.33 %)
40,033
(15.32 %)
n/a 34.56
(97.67 %)
9,429
(2.34 %)
21
(100.00 %)
410,680
(35.69 %)
189,467
(4.45 %)
2,405,053
(34.36 %)
10,620
(1.04 %)
430 wine grape (Pinot Noir 40024 2023)
GCF_030704535.1
46,430
(10.71 %)
14,823
(2.93 %)
44,674
(15.11 %)
n/a 35.08
(100.00 %)
n/a 21
(100.00 %)
310,377
(2.83 %)
242,451
(9.17 %)
2,706,407
(38.52 %)
11,751
(1.05 %)
431 wine grape (PN40024 2009)
GCF_000003745.3
46,797
(11.01 %)
14,907
(3.07 %)
44,949
(15.02 %)
n/a 34.56
(96.91 %)
13,440
(3.10 %)
14,644
(96.90 %)
462,807
(35.59 %)
222,647
(4.83 %)
2,745,513
(34.80 %)
11,591
(1.00 %)
432 winter cress (G-type 2016)
GCA_001920985.1
n/a 22,511
(18.61 %)
30,519
(28.94 %)
n/a 35.60
(90.69 %)
22,839
(9.35 %)
30,649
(90.65 %)
86,568
(2.39 %)
44,616
(2.78 %)
1,035,105
(23.86 %)
6,701
(1.74 %)
433 winter squash
GCF_002738345.1
49,714
(19.34 %)
18,860
(6.74 %)
33,884
(18.55 %)
n/a 36.33
(97.81 %)
17,224
(2.20 %)
8,299
(100.00 %)
169,605
(3.09 %)
134,380
(10.82 %)
1,493,623
(35.66 %)
12,619
(2.64 %)
434 wood tobacco
GCF_000393655.1
58,358
(2.93 %)
17,332
(0.82 %)
111,663
(7.17 %)
n/a 39.09
(92.17 %)
338,901
(7.84 %)
392,998
(92.16 %)
598,929
(1.44 %)
776,240
(4.57 %)
13,228,149
(49.11 %)
100,864
(1.49 %)
435 zha cai (T84-66 inbred line 2016)
GCA_001687265.1
n/a 56,069
(8.51 %)
138,660
(27.88 %)
n/a 36.22
(79.66 %)
22,714
(20.35 %)
9,746
(100.00 %)
367,321
(2.38 %)
303,381
(3.03 %)
4,551,648
(26.34 %)
50,430
(3.81 %)
TOTALS:total assembly count 435

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 602 assemblies assembly stats track stats
Mammals 699 assemblies assembly stats track stats
Birds 453 assemblies assembly stats track stats
Fishes 510 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 343 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1541 assemblies assembly stats track stats
Plants 435 assemblies assembly stats track stats
Fungi 3995 assemblies assembly stats track stats
Viruses 14996 assemblies assembly stats track stats
Archaea 2663 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 21837 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 687 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 5058 assemblies assembly stats track stats