Plants Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of plants only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 A. eriantha gooseberry (White 2019)
GCA_004150315.1
n/a 21,507
(2.72 %)
60,050
(11.57 %)
n/a 35.92
(99.97 %)
2,344
(0.03 %)
1,735
(100.00 %)
430,950
(2.82 %)
273,041
(3.10 %)
4,895,011
(32.98 %)
29,695
(1.88 %)
2 A.eriantha eudicots (MHT-2021 2021)
GCF_019202715.1
71,489
(11.95 %)
23,883
(3.45 %)
59,407
(13.07 %)
n/a 35.65
(99.64 %)
710
(0.36 %)
88
(100.00 %)
430,287
(3.04 %)
350,721
(4.29 %)
3,875,064
(36.80 %)
27,794
(1.97 %)
3 adzuki bean (Jingnong 6 2015)
GCF_001190045.1
40,474
(10.62 %)
16,697
(3.71 %)
47,542
(15.07 %)
n/a 34.07
(96.37 %)
21,264
(3.63 %)
58,639
(96.37 %)
257,290
(4.08 %)
239,596
(6.43 %)
2,925,469
(36.04 %)
24,461
(2.99 %)
4 adzuki bean (LongXiaoDou No.4 2021)
GCF_016808095.1
50,989
(11.87 %)
16,661
(3.75 %)
45,945
(15.40 %)
n/a 33.63
(100.00 %)
32
(0.00 %)
36
(100.00 %)
263,673
(3.52 %)
264,113
(5.18 %)
2,808,981
(37.65 %)
20,402
(2.60 %)
5 African boxthorn (CSIRO_LF1 2023)
GCF_029784015.1
54,359
(4.64 %)
16,693
(1.34 %)
75,114
(9.09 %)
n/a 37.42
(99.88 %)
15,111
(0.12 %)
14,905
(100.00 %)
668,488
(2.42 %)
511,720
(3.29 %)
8,110,750
(42.79 %)
50,821
(2.66 %)
6 African oil palm
GCF_000442705.1
51,575
(5.06 %)
16,948
(1.48 %)
76,464
(9.29 %)
n/a 37.21
(68.90 %)
166,490
(31.14 %)
202,468
(68.86 %)
580,361
(3.63 %)
445,124
(2.25 %)
5,831,606
(30.77 %)
75,576
(3.67 %)
7 African oil palm (ETL-2024a 2024)
GCF_000442705.2
61,514
(3.59 %)
17,694
(0.94 %)
82,131
(6.45 %)
n/a 38.54
(93.07 %)
37,524
(6.94 %)
30
(100.00 %)
930,885
(3.15 %)
928,025
(5.06 %)
6,719,901
(56.47 %)
104,550
(9.50 %)
8 African rice (2021)
GCF_000147395.1
43,826
(15.96 %)
16,224
(4.82 %)
51,031
(25.64 %)
n/a 42.87
(100.00 %)
21
(0.00 %)
73
(100.00 %)
178,763
(2.60 %)
125,689
(4.18 %)
1,761,585
(30.96 %)
60,891
(21.37 %)
9 algarrobo blanco (v1 B1F8T4 2019)
GCF_004799145.1
62,791
(10.08 %)
25,423
(3.34 %)
69,507
(14.55 %)
n/a 34.31
(100.00 %)
n/a 6,087
(100.00 %)
367,402
(2.31 %)
175,862
(2.27 %)
4,241,058
(38.29 %)
18,927
(1.15 %)
10 algarrobo blanco (v2 B1F8T4 2019)
GCF_004799145.2
62,791
(10.08 %)
25,443
(3.35 %)
69,492
(14.56 %)
n/a 34.31
(100.00 %)
n/a 6,085
(100.00 %)
366,178
(2.25 %)
175,852
(2.27 %)
4,240,382
(38.29 %)
18,927
(1.15 %)
11 almond
GCF_902201215.1
37,363
(19.64 %)
14,509
(6.35 %)
33,193
(24.70 %)
n/a 37.65
(98.29 %)
6,531
(1.72 %)
1,700
(99.96 %)
137,974
(2.59 %)
100,386
(3.92 %)
1,251,126
(26.07 %)
10,893
(2.94 %)
12 annual mercury (v1 primary hap 2022)
GCF_937616625.1
47,801
(11.07 %)
13,620
(2.91 %)
37,334
(14.26 %)
n/a 33.91
(100.00 %)
15
(0.00 %)
63
(100.00 %)
201,121
(2.22 %)
661,096
(20.12 %)
2,185,025
(50.59 %)
9,024
(2.18 %)
13 annual mercury (v2 primary hap 2022)
GCF_937616625.2
44,356
(10.99 %)
13,620
(2.91 %)
37,334
(14.26 %)
n/a 33.91
(100.00 %)
15
(0.00 %)
63
(100.00 %)
201,121
(2.22 %)
661,096
(20.12 %)
2,185,025
(50.59 %)
9,024
(2.18 %)
14 annual ryegrass (FL_2022 2022)
GCF_022539505.1
73,172
(3.41 %)
26,626
(1.10 %)
228,260
(15.00 %)
n/a 44.76
(99.87 %)
31,919
(0.13 %)
1,764
(100.00 %)
639,429
(1.31 %)
739,566
(3.57 %)
6,976,583
(59.37 %)
560,429
(28.70 %)
15 ant C.braunii (S276 2018)
GCA_003427395.1
n/a 3,649
(0.20 %)
126,898
(19.85 %)
n/a 48.33
(81.70 %)
641,791
(18.38 %)
653,445
(81.62 %)
1,577,107
(5.98 %)
1,434,259
(6.24 %)
8,533,748
(36.35 %)
278,266
(17.95 %)
16 ant C.sp. (NIES-68 2022)
GCA_027943385.1
n/a 3,655
(0.79 %)
32,911
(30.45 %)
n/a 55.81
(100.00 %)
n/a 2,529
(100.00 %)
255,839
(6.03 %)
392,694
(15.77 %)
1,480,495
(52.16 %)
23,662
(78.57 %)
17 ant L.chinense (Lushan-1 2018)
GCA_003013855.2
n/a 15,545
(0.82 %)
85,577
(6.98 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
473
(0.00 %)
4,183
(100.00 %)
860,506
(2.32 %)
825,722
(4.56 %)
8,205,488
(53.73 %)
153,728
(4.12 %)
18 ant M.endlicherianum (SAG 12.97 2019)
GCA_009602735.1
n/a 2,806
(1.27 %)
21,989
(34.80 %)
n/a 51.93
(90.29 %)
24,291
(9.73 %)
38,152
(90.27 %)
147,548
(5.58 %)
92,866
(3.14 %)
715,552
(34.44 %)
34,833
(26.81 %)
19 apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 refseq)
GCF_002114115.1
64,916
(11.38 %)
22,530
(3.52 %)
67,146
(16.22 %)
n/a 38.04
(88.96 %)
7,264
(11.05 %)
807
(100.00 %)
692,611
(50.77 %)
322,556
(4.41 %)
3,055,836
(35.69 %)
25,923
(1.76 %)
20 apple (hap1 2024)
GCF_042453785.1
78,522
(12.41 %)
22,548
(3.38 %)
68,116
(16.07 %)
n/a 38.09
(100.00 %)
89
(0.00 %)
19
(100.00 %)
315,260
(2.21 %)
337,450
(5.03 %)
3,018,840
(41.78 %)
26,464
(1.96 %)
21 Asian cultivated rice (Carolina Gold Select 2019)
GCA_004007595.1
n/a 16,583
(4.58 %)
55,248
(25.46 %)
n/a 43.36
(99.98 %)
696
(0.02 %)
615
(100.00 %)
495,126
(50.28 %)
124,567
(3.20 %)
1,922,072
(32.59 %)
65,220
(23.87 %)
22 Australian watermeal (WA8730 2020)
GCA_013350365.1
n/a 8,508
(2.10 %)
37,551
(17.70 %)
n/a 40.80
(95.30 %)
1,778
(4.70 %)
7,026
(95.30 %)
167,876
(5.21 %)
220,174
(6.35 %)
2,006,559
(31.53 %)
43,277
(15.01 %)
23 Australian wild rice (MA-2024b 2025)
GCA_047496205.1
n/a 16,434
(4.16 %)
55,282
(23.68 %)
n/a 43.56
(100.00 %)
4
(0.00 %)
16
(100.00 %)
602,996
(48.61 %)
170,830
(6.54 %)
1,845,923
(37.36 %)
69,474
(22.48 %)
24 avocado (Hass MH2022 2023)
GCA_029852735.1
n/a 15,968
(1.61 %)
64,612
(11.72 %)
n/a 39.99
(100.00 %)
36
(0.00 %)
482
(100.00 %)
1,348,599
(20.35 %)
427,369
(10.49 %)
4,298,119
(41.03 %)
54,543
(5.58 %)
25 Bahia grass (Cayasta R1 2024)
GCA_036689595.1
n/a 17,830
(3.66 %)
74,926
(26.22 %)
n/a 45.79
(99.95 %)
2,801
(0.05 %)
2,811
(99.95 %)
643,354
(26.01 %)
146,179
(4.41 %)
2,284,294
(38.05 %)
110,855
(27.67 %)
26 Balbis banana (DH-PKW 2019)
GCA_004837865.1
n/a 18,974
(3.45 %)
47,957
(15.55 %)
n/a 38.02
(99.72 %)
1,197
(0.27 %)
2,590
(100.00 %)
208,141
(3.88 %)
197,690
(7.95 %)
2,068,575
(42.39 %)
52,850
(9.12 %)
27 Barbados nut
GCF_014843425.1
33,622
(13.80 %)
12,687
(4.63 %)
26,511
(14.56 %)
n/a 33.40
(99.60 %)
2,151
(0.40 %)
1,232
(100.00 %)
281,490
(24.82 %)
186,260
(5.65 %)
2,028,357
(33.33 %)
8,868
(1.38 %)
28 barrel medic (2018)
GCF_003473485.1
50,906
(14.28 %)
16,712
(3.68 %)
41,041
(14.51 %)
n/a 33.43
(99.87 %)
22
(0.13 %)
42
(100.00 %)
393,909
(27.89 %)
175,427
(3.92 %)
2,532,494
(37.64 %)
3,384
(0.27 %)
29 barrel medic (A17 2014)
GCF_000219495.3
48,865
(15.69 %)
16,549
(3.99 %)
40,316
(15.41 %)
n/a 33.14
(94.48 %)
8,785
(5.53 %)
8,027
(94.47 %)
366,709
(22.34 %)
146,748
(2.80 %)
2,549,499
(32.46 %)
3,695
(0.65 %)
30 barrel medic (HM340 2017)
GCA_002024945.1
n/a 16,672
(3.96 %)
40,032
(15.19 %)
n/a 33.05
(99.32 %)
107
(0.68 %)
909
(100.00 %)
381,065
(23.82 %)
162,402
(3.97 %)
2,490,028
(35.39 %)
3,335
(0.34 %)
31 bay (USA: Berkeley CA var. californica CCGP_DODD_UMBCAL_S1 alternate hap 2023)
GCA_028538565.1
n/a 15,063
(1.43 %)
65,125
(11.47 %)
n/a 40.34
(100.00 %)
39
(0.00 %)
197
(100.00 %)
735,552
(11.30 %)
567,295
(6.87 %)
4,176,675
(45.56 %)
66,834
(4.90 %)
32 bay (USA: Berkeley CA var. californica CCGP_DODD_UMBCAL_S1 primary hap 2023)
GCA_028534965.1
n/a 15,223
(1.43 %)
65,769
(11.33 %)
n/a 40.37
(100.00 %)
36
(0.00 %)
303
(100.00 %)
744,623
(11.37 %)
571,691
(7.15 %)
4,217,655
(45.87 %)
68,566
(4.96 %)
33 beefsteak plant (Hoko-3 primary hap 2022)
GCA_026008535.1
n/a 28,039
(2.07 %)
120,338
(15.60 %)
n/a 35.28
(100.00 %)
23
(0.00 %)
71
(100.00 %)
2,012,805
(68.74 %)
678,680
(5.87 %)
8,191,868
(44.06 %)
65,395
(2.45 %)
34 beet (v1 EL10 2021 USDA)
GCF_002917755.1
47,727
(9.45 %)
11,911
(2.04 %)
50,202
(16.78 %)
n/a 35.86
(99.99 %)
323
(0.01 %)
42
(100.00 %)
294,768
(3.41 %)
341,699
(6.22 %)
2,932,896
(35.20 %)
25,364
(1.79 %)
35 beet (v2 EL10 2022 USDA)
GCF_026745355.1
45,490
(9.22 %)
11,850
(2.05 %)
49,071
(15.89 %)
n/a 35.85
(94.03 %)
3,200
(5.97 %)
20
(100.00 %)
290,870
(3.40 %)
336,343
(5.76 %)
2,901,079
(33.21 %)
25,108
(1.67 %)
36 bell pepper eudicots (UCD-10X-F1 2018)
GCF_002878395.1
70,848
(2.17 %)
15,922
(0.50 %)
69,601
(2.75 %)
n/a 34.91
(97.27 %)
52,577
(2.73 %)
81,202
(100.00 %)
1,192,132
(1.94 %)
1,097,384
(4.12 %)
23,393,622
(47.64 %)
19,517
(0.21 %)
37 bigberry manzanita (GLNDR_RDG_Rd-6 alternate hap 2021)
GCA_019985075.1
n/a 13,887
(2.34 %)
44,507
(14.12 %)
n/a 37.97
(100.00 %)
120
(0.00 %)
2,350
(100.00 %)
250,361
(2.10 %)
231,118
(13.56 %)
2,049,366
(44.58 %)
22,527
(6.34 %)
38 bigberry manzanita (GLNDR_RDG_Rd-6 primary hap 2022)
GCA_019985065.2
n/a 15,102
(2.62 %)
47,553
(15.64 %)
n/a 38.11
(100.00 %)
82
(0.00 %)
272
(100.00 %)
257,066
(2.22 %)
226,514
(14.63 %)
2,470,334
(38.37 %)
21,415
(5.59 %)
39 birdsfoot trefoil (B-129 2022)
GCF_012489685.1
57,539
(11.82 %)
16,919
(2.98 %)
64,687
(19.59 %)
n/a 38.05
(99.97 %)
1,625
(0.04 %)
65
(100.00 %)
236,645
(2.13 %)
205,150
(5.19 %)
2,202,942
(41.60 %)
32,283
(3.44 %)
40 bitter melon
GCF_001995035.1
31,725
(13.80 %)
12,858
(4.62 %)
30,539
(16.85 %)
n/a 34.58
(92.32 %)
109,310
(7.74 %)
1,052
(100.00 %)
162,837
(2.82 %)
89,571
(2.03 %)
1,951,167
(30.96 %)
14,100
(2.00 %)
41 black cottonwood (Ptri.A.LA.226.w1 alternate hap 2023)
GCA_028534865.1
n/a 20,077
(4.66 %)
43,061
(17.16 %)
n/a 34.80
(100.00 %)
33
(0.00 %)
338
(100.00 %)
267,110
(2.88 %)
173,502
(6.32 %)
2,366,759
(39.61 %)
5,093
(4.11 %)
42 black cottonwood (Ptri.A.LA.226.w1 primary hap 2023)
GCA_028534895.1
n/a 19,804
(4.58 %)
42,642
(17.03 %)
n/a 34.85
(100.00 %)
26
(0.00 %)
132
(100.00 %)
265,925
(2.85 %)
174,688
(6.70 %)
2,359,101
(40.07 %)
4,963
(4.10 %)
43 black cottonwood (v4.1 Nisqually-1 2022)
GCF_000002775.5
59,638
(15.94 %)
19,969
(4.99 %)
41,581
(16.22 %)
n/a 33.75
(99.85 %)
59
(0.15 %)
106
(99.85 %)
257,833
(2.91 %)
156,371
(4.50 %)
2,423,627
(36.28 %)
3,761
(0.66 %)
44 black gram (Urdbean 2024)
GCA_036885675.1
n/a 16,158
(3.35 %)
47,346
(15.05 %)
n/a 33.60
(99.97 %)
282
(0.03 %)
13
(100.00 %)
832,234
(57.53 %)
240,933
(5.84 %)
2,976,104
(38.95 %)
16,895
(2.01 %)
45 black tea
GCF_004153795.1
101,253
(3.17 %)
20,982
(0.66 %)
156,999
(7.69 %)
n/a 37.85
(92.12 %)
79,329
(7.89 %)
14,028
(100.00 %)
1,926,995
(3.23 %)
2,024,420
(8.06 %)
17,959,098
(50.75 %)
181,027
(2.79 %)
46 blue lilly pilly tree (NSW1041296 2022)
GCF_021117445.2
46,173
(12.87 %)
15,187
(3.49 %)
50,585
(20.61 %)
n/a 40.95
(100.00 %)
13
(0.00 %)
72
(100.00 %)
494,434
(48.54 %)
220,571
(4.98 %)
1,866,530
(29.09 %)
59,325
(10.76 %)
47 bread wheat (Chinese Spring 2020)
GCA_002220415.3
n/a 46,431
(0.31 %)
805,204
(7.93 %)
n/a 46.09
(99.87 %)
211,982
(0.14 %)
70,316
(100.00 %)
9,191,325
(44.14 %)
5,086,953
(4.53 %)
282,298
(99.86 %)
3,241,124
(28.06 %)
48 bread wheat (Chinese Spring 2021, UC Davis)
GCF_018294505.1
221,450
(1.62 %)
n/a 763,380
(8.08 %)
n/a 46.14
(98.27 %)
214,799
(1.73 %)
91,589
(100.00 %)
8,660,189
(44.94 %)
4,402,049
(3.94 %)
306,386
(98.27 %)
3,040,030
(27.48 %)
49 bread wheat (Chinese Spring IWGSC RefSeq v1.0 2018)
GCA_900519105.1
n/a n/a 751,576
(8.03 %)
n/a 46.05
(98.12 %)
693,028
(1.90 %)
693,050
(98.10 %)
8,420,935
(44.23 %)
4,115,828
(3.69 %)
693,050
(98.10 %)
3,076,631
(26.41 %)
50 bread wheat (Fielder 2021)
GCA_907166925.1
n/a n/a 773,766
(8.20 %)
n/a 46.05
(100.00 %)
1,407
(0.00 %)
3,795
(100.00 %)
8,703,192
(44.57 %)
4,569,103
(5.20 %)
5,202
(100.00 %)
3,001,896
(28.00 %)
51 bread wheat (Kariega 2021)
GCA_910594105.1
n/a 47,400
(0.34 %)
778,134
(8.33 %)
n/a 46.11
(99.87 %)
7,376
(0.13 %)
7,398
(99.87 %)
14,835,099
(85.31 %)
4,570,540
(5.40 %)
7,395
(99.87 %)
2,994,427
(28.25 %)
52 brown mustard (Varuna 2020)
GCA_015484525.1
n/a 50,825
(7.02 %)
128,133
(24.54 %)
n/a 37.47
(96.71 %)
3,070
(3.29 %)
720
(100.00 %)
905,496
(54.34 %)
440,139
(7.46 %)
4,073,637
(39.30 %)
54,083
(6.71 %)
53 button wrinklewort R.leptorrhynchoides (AG116_Rl617_1_P2 2025)
GCF_046630445.1
79,194
(1.39 %)
19,567
(0.31 %)
119,910
(3.26 %)
n/a 33.70
(100.00 %)
1
(0.00 %)
549
(100.00 %)
3,727,770
(5.18 %)
3,762,751
(4.98 %)
10,213,591
(82.37 %)
54,254
(0.38 %)
54 cacao
GCF_000208745.1
34,727
(13.67 %)
14,294
(4.65 %)
29,216
(14.38 %)
n/a 34.09
(94.31 %)
11,787
(5.70 %)
431
(100.00 %)
206,049
(15.64 %)
99,229
(2.66 %)
1,933,579
(33.24 %)
2,964
(0.34 %)
55 California black walnut (Jcal.S.LA.6 alternate hap 2022)
GCA_023349545.1
n/a 18,729
(3.22 %)
57,374
(16.70 %)
n/a 36.81
(100.00 %)
78
(0.00 %)
915
(100.00 %)
421,731
(3.42 %)
300,957
(5.54 %)
2,794,242
(34.11 %)
25,348
(3.39 %)
56 California black walnut (Jcal.S.LA.6 primary hap 2022)
GCA_023349395.1
n/a 18,579
(3.26 %)
56,295
(16.71 %)
n/a 36.92
(100.00 %)
11
(0.00 %)
138
(100.00 %)
414,129
(3.48 %)
293,951
(5.95 %)
3,055,420
(34.96 %)
24,749
(4.05 %)
57 California pipevine (CCGP_79_NKW_82.1479hap1 2023)
GCF_029961685.1
43,175
(7.78 %)
16,377
(2.29 %)
43,559
(11.38 %)
n/a 36.31
(100.00 %)
175
(0.00 %)
706
(100.00 %)
341,665
(12.46 %)
223,217
(36.36 %)
2,388,236
(58.00 %)
26,535
(3.98 %)
58 California scrub oak (Qber.S.LA.60 alternate hap 2023)
GCA_028535905.1
n/a 16,153
(1.86 %)
68,653
(14.03 %)
n/a 35.79
(100.00 %)
43
(0.00 %)
807
(100.00 %)
783,798
(4.17 %)
456,025
(10.87 %)
4,951,918
(40.76 %)
21,783
(2.16 %)
59 California scrub oak (Qber.S.LA.60 primary hap 2023)
GCA_028535815.1
n/a 15,836
(1.90 %)
66,803
(13.99 %)
n/a 35.77
(100.00 %)
32
(0.00 %)
283
(100.00 %)
762,029
(4.24 %)
448,099
(10.97 %)
4,784,968
(41.07 %)
20,384
(2.28 %)
60 Cannabis sativa ( 2020)
GCA_016165845.1
n/a 18,838
(1.94 %)
71,211
(13.84 %)
n/a 33.78
(99.91 %)
8,772
(0.10 %)
147
(100.00 %)
643,488
(3.49 %)
361,843
(3.63 %)
4,074,440
(56.52 %)
27,745
(1.31 %)
61 Cannabis sativa (Cannatonic 2016)
GCA_001865755.1
n/a 10,725
(1.71 %)
41,537
(11.41 %)
n/a 33.68
(100.00 %)
n/a 11,110
(100.00 %)
396,112
(4.11 %)
221,932
(3.23 %)
2,389,229
(59.21 %)
17,045
(1.23 %)
62 Cannabis sativa (Harvard OEB 2019)
GCF_900626175.2
39,696
(6.07 %)
13,883
(1.80 %)
50,556
(11.19 %)
n/a 33.51
(84.07 %)
843
(15.93 %)
1,052
(84.07 %)
496,648
(3.63 %)
258,281
(2.28 %)
3,594,433
(47.71 %)
22,750
(1.69 %)
63 Cannabis sativa (Jamaican Lion DASH 2019)
GCA_003660325.2
n/a 24,975
(1.79 %)
113,252
(15.69 %)
n/a 34.00
(100.00 %)
n/a 3,372
(100.00 %)
936,351
(4.13 %)
520,230
(3.65 %)
5,183,602
(58.66 %)
47,327
(1.58 %)
64 Cannabis sativa (Jamaican Lion Mother 2020)
GCA_012923435.1
n/a 15,253
(1.67 %)
62,228
(12.57 %)
n/a 34.08
(100.00 %)
n/a 1,599
(100.00 %)
595,917
(3.95 %)
335,791
(3.38 %)
3,478,519
(61.18 %)
31,738
(1.57 %)
65 Cannabis sativa (JL 2020)
GCA_013030365.1
n/a 15,334
(1.80 %)
60,140
(12.83 %)
n/a 33.79
(99.92 %)
2,496
(0.09 %)
483
(100.00 %)
567,458
(3.73 %)
320,455
(3.12 %)
3,403,771
(58.38 %)
27,791
(1.48 %)
66 carrot
GCF_001625215.1
51,773
(15.95 %)
16,649
(3.96 %)
50,187
(20.50 %)
n/a 34.79
(91.77 %)
26,112
(8.24 %)
4,826
(100.00 %)
179,630
(2.41 %)
166,060
(4.97 %)
1,981,148
(31.51 %)
8,564
(0.85 %)
67 carrot (DH1 2023)
GCF_001625215.2
60,116
(15.29 %)
16,679
(3.49 %)
51,607
(18.82 %)
n/a 34.97
(99.99 %)
554
(0.01 %)
11
(100.00 %)
195,035
(2.33 %)
186,941
(8.11 %)
2,018,050
(39.61 %)
10,319
(1.14 %)
68 cassava (60444 2018)
GCA_003957885.1
n/a 27,737
(2.70 %)
78,774
(11.79 %)
n/a 37.13
(76.51 %)
36,478
(23.50 %)
4,440
(100.00 %)
584,617
(3.41 %)
554,162
(3.52 %)
4,126,060
(43.14 %)
77,570
(1.78 %)
69 cassava (v8 AM560-2 2021 DOE)
GCF_001659605.2
56,386
(9.38 %)
18,790
(2.86 %)
49,944
(11.73 %)
n/a 37.52
(99.61 %)
672
(0.39 %)
758
(99.61 %)
377,964
(3.52 %)
356,023
(4.79 %)
2,560,255
(56.85 %)
52,506
(2.50 %)
70 castor bean (Hale 2011 JCVI)
GCF_000151685.1
33,377
(11.52 %)
13,874
(4.00 %)
33,656
(13.67 %)
n/a 33.84
(96.11 %)
23,313
(3.90 %)
49,406
(96.10 %)
207,850
(3.52 %)
166,467
(10.85 %)
1,676,921
(43.19 %)
12,838
(2.54 %)
71 castor bean (wild-type WT05 2021)
GCA_019578655.1
n/a 13,864
(4.31 %)
29,909
(14.27 %)
n/a 33.05
(99.95 %)
331
(0.05 %)
146
(100.00 %)
328,084
(38.04 %)
128,377
(6.36 %)
1,992,583
(39.20 %)
7,290
(1.00 %)
72 castor bean (wild-type WT05 2021)
GCF_019578655.1
39,358
(13.36 %)
13,841
(4.31 %)
29,805
(14.24 %)
n/a 33.03
(99.95 %)
331
(0.05 %)
140
(100.00 %)
205,974
(3.02 %)
128,354
(6.37 %)
1,998,066
(39.24 %)
7,216
(0.99 %)
73 celery A.graveolens (Ventura 2021)
GCF_009905375.1
89,565
(2.38 %)
17,560
(0.48 %)
115,390
(5.30 %)
n/a 35.68
(99.73 %)
4,633
(0.27 %)
4,854
(100.00 %)
1,247,170
(1.97 %)
1,423,285
(4.75 %)
11,041,078
(71.09 %)
31,562
(0.31 %)
74 Ceratopteris richardii C-fern (Hn-n 2020)
GCA_011386875.1
n/a 3
(0.11 %)
117
(7.42 %)
n/a 39.35
(99.99 %)
4
(0.01 %)
35
(100.00 %)
1,139
(3.04 %)
1,677
(4.92 %)
11,074
(10.60 %)
76
(1.07 %)
75 Ceratopteris richardii C-fern (Hn-n Whitten #5841 2020)
GCA_009866685.1
n/a 6,487
(0.16 %)
114,999
(4.12 %)
n/a 37.82
(62.87 %)
490,371
(37.15 %)
1,116,784
(62.85 %)
692,892
(1.67 %)
790,165
(1.22 %)
18,073,193
(31.20 %)
24,414
(0.46 %)
76 chia eudicots (TCC Black 2014 2022)
GCF_023119035.1
53,262
(17.46 %)
17,642
(4.97 %)
49,474
(23.85 %)
n/a 36.14
(99.81 %)
3,756
(0.19 %)
1,556
(100.00 %)
156,083
(2.30 %)
128,904
(3.10 %)
2,112,137
(31.93 %)
31,157
(5.92 %)
77 chickpea
GCF_000331145.1
42,036
(9.83 %)
15,685
(3.16 %)
30,411
(8.82 %)
n/a 31.04
(90.95 %)
31,897
(9.07 %)
39,024
(90.93 %)
339,564
(10.51 %)
318,439
(11.48 %)
2,929,750
(43.82 %)
3,488
(0.28 %)
78 chickpea (CDC Frontier Library 1 2024)
GCF_000331145.2
42,320
(9.82 %)
15,593
(3.16 %)
30,475
(8.82 %)
n/a 31.03
(91.05 %)
33,507
(8.98 %)
6,446
(100.00 %)
308,190
(3.39 %)
318,609
(11.50 %)
2,922,065
(43.86 %)
3,472
(0.28 %)
79 chicory (Punajuju 2022)
GCA_023525715.1
n/a 16,855
(1.17 %)
92,310
(11.34 %)
n/a 35.50
(99.99 %)
510
(0.01 %)
208
(100.00 %)
1,976,706
(34.89 %)
781,413
(8.81 %)
6,080,413
(49.06 %)
51,571
(2.99 %)
80 China rose (Old Blush v2 2019)
GCF_002994745.2
66,337
(12.31 %)
15,432
(2.83 %)
67,569
(21.71 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
33
(0.00 %)
53
(100.00 %)
275,878
(2.26 %)
229,333
(3.98 %)
2,244,200
(35.17 %)
37,317
(4.17 %)
81 Chinese keys (BR_CEBAR01 2022)
GCA_024364735.1
n/a 23,898
(0.89 %)
138,156
(8.52 %)
n/a 40.10
(96.58 %)
25,154
(3.42 %)
35,781
(96.58 %)
829,613
(1.78 %)
1,793,985
(6.94 %)
8,707,237
(62.53 %)
317,707
(8.50 %)
82 Chinese licorice (Kyoto 2023)
GCA_030159175.1
n/a 16,920
(3.67 %)
44,776
(19.51 %)
n/a 37.70
(100.00 %)
20
(0.00 %)
89
(100.00 %)
593,642
(17.68 %)
219,391
(21.45 %)
2,088,553
(50.28 %)
15,616
(4.58 %)
83 Chinese licorice (manju 2023)
GCA_027886165.1
n/a 16,877
(4.02 %)
43,800
(15.68 %)
n/a 35.67
(99.96 %)
1,409
(0.03 %)
6,467
(100.00 %)
582,162
(19.03 %)
193,998
(5.82 %)
2,492,820
(41.31 %)
18,054
(4.04 %)
84 Chinese medicinal orchid (niu2020 2021)
GCA_019514585.1
n/a 13,666
(0.97 %)
71,763
(9.04 %)
n/a 35.33
(99.97 %)
1,170
(0.03 %)
1,621
(100.00 %)
635,445
(2.92 %)
599,600
(4.44 %)
8,101,700
(44.90 %)
75,475
(3.56 %)
85 Chinese white pear (Dangshansuli 2012)
GCF_000315295.1
54,029
(12.78 %)
22,400
(4.38 %)
57,140
(17.42 %)
n/a 37.29
(97.86 %)
24,384
(2.15 %)
26,566
(97.85 %)
368,808
(18.26 %)
218,013
(4.36 %)
2,456,496
(34.15 %)
18,367
(1.88 %)
86 Chinese white pear (Hongxiangsu 2021)
GCF_019419815.1
62,514
(13.83 %)
22,289
(4.29 %)
57,502
(17.16 %)
n/a 37.35
(100.00 %)
n/a 452
(100.00 %)
290,077
(2.40 %)
209,363
(3.56 %)
2,519,627
(35.77 %)
19,299
(1.84 %)
87 Christmas fern (IRGN 58ZZQ2NR20 2022)
GCA_025802375.1
n/a 2,216
(0.22 %)
115,851
(13.84 %)
n/a 40.55
(99.77 %)
6,993
(0.02 %)
496,888
(99.98 %)
1,157,849
(61.20 %)
244,472
(3.76 %)
2,756,209
(21.19 %)
9,107
(0.82 %)
88 clementine
GCF_000493195.1
36,454
(14.29 %)
14,126
(4.66 %)
32,820
(18.34 %)
n/a 34.96
(97.94 %)
7,564
(2.07 %)
8,962
(97.93 %)
178,443
(2.76 %)
104,853
(5.57 %)
1,933,079
(33.91 %)
7,930
(3.80 %)
89 climbing nightshade (primary hap 2022)
GCF_947179165.1
44,646
(5.40 %)
15,784
(1.70 %)
48,875
(7.66 %)
n/a 35.83
(100.00 %)
38
(0.00 %)
105
(100.00 %)
347,467
(1.98 %)
290,488
(4.50 %)
6,293,084
(43.53 %)
8,929
(0.83 %)
90 club-mosses (2010)
GCF_000143415.4
49,382
(28.03 %)
11,312
(4.28 %)
36,277
(36.82 %)
n/a 45.22
(98.15 %)
4,395
(1.86 %)
5,152
(98.14 %)
138,958
(36.90 %)
77,054
(2.71 %)
802,227
(32.19 %)
34,479
(27.80 %)
91 club-mosses (Aurea 2015)
GCA_001021135.1
n/a 6,316
(4.02 %)
55,013
(41.57 %)
n/a 44.70
(99.81 %)
351
(0.00 %)
106,265
(100.00 %)
29,218
(1.24 %)
29,377
(1.67 %)
480,195
(13.66 %)
19,392
(13.60 %)
92 coffee (Caturra red CCC135-36 2018)
GCA_003713225.1
n/a 23,597
(2.02 %)
86,132
(13.38 %)
n/a 36.94
(99.79 %)
690
(0.21 %)
2,832
(100.00 %)
502,137
(2.12 %)
386,196
(3.95 %)
5,651,566
(41.67 %)
36,395
(1.62 %)
93 coffee (Red Bourbon ID1545 2023)
GCA_030873655.1
n/a 25,435
(1.84 %)
94,196
(12.02 %)
n/a 37.21
(99.99 %)
197
(0.01 %)
1,794
(100.00 %)
1,591,482
(68.40 %)
423,470
(5.23 %)
6,621,994
(45.23 %)
49,710
(2.01 %)
94 coffee C.arabica (CCC135-36 2018)
GCF_003713225.1
80,737
(8.03 %)
23,574
(2.02 %)
85,662
(13.32 %)
n/a 36.94
(99.79 %)
691
(0.21 %)
2,833
(100.00 %)
501,414
(2.11 %)
386,209
(3.95 %)
5,652,743
(41.66 %)
36,398
(1.62 %)
95 coffee C.arabica (ET-39 2024)
GCF_036785885.1
119,626
(9.97 %)
25,877
(2.06 %)
97,184
(14.13 %)
n/a 37.50
(100.00 %)
107
(0.00 %)
134
(100.00 %)
542,076
(2.06 %)
445,020
(5.76 %)
5,654,970
(44.41 %)
38,607
(3.43 %)
96 coffee C.eugenioides (CCC68of 2018)
GCF_003713205.1
43,829
(7.69 %)
14,911
(2.02 %)
57,408
(14.42 %)
n/a 36.89
(97.92 %)
3,482
(2.08 %)
3,530
(100.00 %)
312,360
(2.09 %)
234,658
(3.24 %)
3,464,594
(38.91 %)
21,553
(1.54 %)
97 Commerson's wild potato (CGN18024_1 2023)
GCA_029007595.1
n/a 16,068
(2.21 %)
50,780
(10.49 %)
n/a 34.48
(99.99 %)
1
(0.01 %)
639
(100.00 %)
1,250,333
(70.08 %)
249,197
(3.97 %)
5,014,592
(38.92 %)
6,970
(0.46 %)
98 common bean
GCF_000499845.1
32,720
(9.56 %)
16,474
(3.53 %)
45,055
(14.46 %)
n/a 34.96
(90.70 %)
40,860
(9.33 %)
41,568
(90.67 %)
233,709
(2.97 %)
208,045
(3.61 %)
2,886,693
(37.28 %)
38,054
(5.05 %)
99 common cattail (L0001 2021)
GCF_019914945.1
37,046
(18.67 %)
14,152
(6.13 %)
28,640
(19.48 %)
n/a 37.74
(99.99 %)
66
(0.01 %)
76
(100.00 %)
129,836
(2.97 %)
80,188
(2.65 %)
1,248,248
(29.88 %)
22,935
(5.83 %)
100 common fig (Dottato GU2019 2019)
GCA_009761775.1
n/a 14,992
(4.28 %)
36,350
(16.84 %)
n/a 34.41
(99.99 %)
394
(0.01 %)
905
(99.99 %)
475,247
(5.76 %)
230,646
(4.36 %)
2,425,030
(37.74 %)
18,611
(3.41 %)
101 common jujube (AT0 2021)
GCF_020796205.1
49,622
(12.72 %)
14,929
(3.58 %)
32,981
(12.20 %)
n/a 33.07
(99.99 %)
381
(0.01 %)
538
(100.00 %)
525,520
(5.43 %)
225,151
(3.91 %)
2,463,587
(42.86 %)
13,018
(1.79 %)
102 common jujube (Dongzao 2015)
GCF_000826755.1
49,976
(13.24 %)
16,949
(3.79 %)
38,488
(13.47 %)
n/a 33.40
(95.35 %)
24,158
(4.67 %)
28,947
(95.33 %)
525,525
(5.37 %)
246,475
(5.25 %)
2,603,240
(38.46 %)
13,597
(2.11 %)
103 common jujube (Dongzao 2023)
GCF_031755915.1
51,464
(13.54 %)
14,443
(3.56 %)
31,633
(12.06 %)
n/a 33.20
(100.00 %)
n/a 14
(100.00 %)
516,010
(5.54 %)
234,395
(5.05 %)
2,319,259
(43.64 %)
12,926
(2.66 %)
104 common jujube (Junzao 2020)
GCA_001835785.2
n/a 14,443
(3.88 %)
30,773
(12.63 %)
n/a 32.95
(99.91 %)
222
(0.09 %)
155
(100.00 %)
478,087
(5.53 %)
206,042
(4.15 %)
2,222,289
(41.43 %)
11,860
(1.82 %)
105 common reed (primary hap 2023)
GCF_958298935.1
65,051
(8.85 %)
26,142
(3.49 %)
114,639
(23.87 %)
n/a 44.17
(100.00 %)
59
(0.00 %)
37
(100.00 %)
243,799
(1.41 %)
237,530
(2.79 %)
4,477,357
(31.45 %)
154,087
(19.32 %)
106 common sunflower
GCF_002127325.2
133,319
(3.74 %)
19,514
(0.59 %)
166,187
(9.16 %)
n/a 38.59
(97.94 %)
2,384
(2.06 %)
334
(100.00 %)
1,263,836
(2.20 %)
1,549,598
(4.15 %)
12,728,097
(58.39 %)
170,287
(2.39 %)
107 common tobacco (Basma Xanthi 2014)
GCA_000715095.1
n/a 29,103
(0.75 %)
200,375
(6.85 %)
n/a 38.98
(95.11 %)
468,375
(4.88 %)
1,111,920
(95.12 %)
1,199,550
(3.27 %)
1,359,905
(4.81 %)
24,590,709
(50.95 %)
205,873
(1.79 %)
108 common tobacco (K326 2023)
GCA_000715075.2
n/a 31,039
(0.78 %)
176,804
(6.40 %)
n/a 39.12
(100.00 %)
710
(0.00 %)
699
(100.00 %)
4,626,207
(84.12 %)
1,502,920
(6.71 %)
24,314,611
(56.69 %)
225,794
(1.93 %)
109 common tobacco (K326 2023)
GCF_000715075.1
116,106
(3.08 %)
31,018
(0.77 %)
176,913
(6.40 %)
n/a 39.12
(100.00 %)
712
(0.00 %)
701
(100.00 %)
1,205,229
(1.45 %)
1,502,955
(6.71 %)
24,316,152
(56.68 %)
225,863
(1.93 %)
110 common tobacco (TN90 2014)
GCF_000715135.1
100,875
(3.08 %)
29,968
(0.80 %)
184,998
(7.05 %)
n/a 38.95
(97.11 %)
292,325
(2.90 %)
292,601
(97.11 %)
1,134,202
(3.09 %)
1,268,208
(4.45 %)
24,013,710
(52.08 %)
204,914
(1.84 %)
111 common vetch (South Australia 2022)
GCA_021764765.1
n/a 17,420
(0.99 %)
77,140
(6.43 %)
n/a 35.62
(99.97 %)
5,823
(0.04 %)
18
(100.00 %)
708,538
(2.24 %)
719,430
(5.37 %)
8,370,861
(57.87 %)
32,513
(0.96 %)
112 cork oak (v2 HL8 2018)
GCF_002906115.2
53,587
(7.04 %)
17,804
(1.85 %)
77,741
(13.65 %)
n/a 35.35
(97.95 %)
25,649
(2.05 %)
22,642
(100.00 %)
860,049
(3.78 %)
485,854
(6.14 %)
5,989,180
(36.35 %)
20,674
(1.12 %)
113 cork oak (v3 HL8 2024)
GCF_002906115.3
56,406
(8.63 %)
16,303
(2.05 %)
63,990
(13.73 %)
n/a 34.91
(95.70 %)
26,066
(4.30 %)
28,407
(95.70 %)
743,470
(3.99 %)
393,077
(5.53 %)
4,897,193
(34.87 %)
16,140
(0.90 %)
114 cotton G.hirsutum (BGI 2015)
GCF_000987745.1
112,410
(5.51 %)
35,047
(1.61 %)
101,814
(6.75 %)
n/a 34.45
(97.16 %)
48,742
(2.84 %)
57,884
(97.16 %)
829,774
(2.69 %)
808,839
(3.64 %)
12,556,104
(52.01 %)
31,946
(0.61 %)
115 cotton G.hirsutum (HudsonAlpha 2021)
GCF_007990345.1
154,134
(6.02 %)
37,839
(1.61 %)
107,764
(6.56 %)
n/a 34.36
(99.87 %)
5,708
(0.13 %)
6,735
(99.87 %)
996,701
(2.36 %)
903,817
(3.56 %)
13,123,355
(54.75 %)
35,220
(0.59 %)
116 cotton G.raimondii
GCF_000327365.1
72,590
(8.99 %)
20,368
(2.64 %)
86,941
(18.36 %)
n/a 33.22
(98.25 %)
19,717
(1.76 %)
20,751
(98.24 %)
367,610
(3.53 %)
300,200
(3.32 %)
5,199,574
(40.83 %)
10,926
(0.55 %)
117 cowpea (IT97K-499-35 v2 2019)
GCF_004118075.2
48,588
(10.55 %)
16,925
(3.30 %)
44,689
(13.01 %)
n/a 32.95
(99.48 %)
68
(0.52 %)
676
(100.00 %)
344,688
(3.92 %)
283,941
(8.14 %)
3,091,888
(41.66 %)
24,507
(2.34 %)
118 crookneck pumpkin
GCF_002738365.1
49,636
(19.79 %)
18,863
(6.83 %)
34,588
(19.24 %)
n/a 36.43
(97.43 %)
13,813
(2.58 %)
3,500
(100.00 %)
181,838
(3.12 %)
140,936
(7.42 %)
1,550,544
(33.30 %)
13,714
(2.69 %)
119 cucumber
GCF_000004075.3
37,079
(18.45 %)
13,349
(5.61 %)
23,889
(15.73 %)
n/a 32.84
(99.98 %)
89
(0.02 %)
88
(100.00 %)
158,454
(3.72 %)
77,247
(3.20 %)
1,739,467
(33.72 %)
5,730
(1.35 %)
120 cultivated vanilla (Daphna alternate hap 2020)
GCA_016413885.1
n/a 14,128
(1.63 %)
42,460
(7.33 %)
n/a 30.78
(99.98 %)
2,018
(0.02 %)
668
(100.00 %)
377,357
(3.69 %)
183,159
(2.82 %)
5,560,199
(36.58 %)
30,878
(2.75 %)
121 cultivated vanilla (Daphna primary hap 2020)
GCA_016413895.1
n/a 13,933
(1.63 %)
40,035
(6.93 %)
n/a 30.80
(99.98 %)
1,977
(0.02 %)
667
(100.00 %)
373,612
(3.67 %)
181,531
(2.84 %)
5,483,268
(36.45 %)
30,829
(2.75 %)
122 currant tomato (LA2093 2020)
GCA_014964335.1
n/a 15,541
(2.01 %)
39,725
(7.40 %)
n/a 34.48
(99.94 %)
373
(0.06 %)
127
(100.00 %)
369,651
(3.79 %)
256,146
(4.80 %)
5,523,685
(41.09 %)
32,203
(2.29 %)
123 damask rose (2016)
GCA_001662545.1
n/a 16,060
(1.87 %)
117,610
(18.87 %)
n/a 38.73
(97.06 %)
101,982
(2.91 %)
409,854
(97.09 %)
329,911
(1.95 %)
258,478
(2.82 %)
3,747,902
(31.42 %)
48,987
(3.05 %)
124 date palm (Barhee BC4 2019)
GCF_009389715.1
61,678
(8.40 %)
18,582
(2.20 %)
70,121
(14.29 %)
n/a 40.29
(100.00 %)
317
(0.00 %)
2,391
(100.00 %)
431,923
(8.92 %)
371,389
(4.19 %)
2,721,501
(44.16 %)
89,481
(12.47 %)
125 date palm (Khalas 2013)
GCF_000413155.1
48,949
(10.55 %)
16,697
(2.99 %)
64,523
(16.24 %)
n/a 39.33
(91.22 %)
64,723
(8.79 %)
143,382
(91.21 %)
284,003
(7.58 %)
185,641
(2.23 %)
2,574,645
(27.52 %)
62,332
(7.21 %)
126 date-plum (Yz01 2020)
GCF_014633365.1
48,290
(8.05 %)
15,110
(2.28 %)
57,536
(14.48 %)
n/a 36.57
(99.99 %)
606
(0.01 %)
43
(100.00 %)
445,970
(3.39 %)
319,468
(5.39 %)
3,687,072
(36.31 %)
41,402
(3.02 %)
127 desmid P.margaritaceum (SKD-8 2022)
GCA_023375785.1
n/a 6,643
(0.13 %)
342,902
(20.03 %)
n/a 51.10
(86.42 %)
704,233
(13.62 %)
1,037,019
(86.38 %)
4,516,716
(76.58 %)
2,687,996
(21.25 %)
15,150,374
(48.80 %)
680,776
(31.03 %)
128 dessert banana (baxijiao 2024)
GCF_036884655.1
193,799
(12.81 %)
52,060
(3.07 %)
144,859
(15.37 %)
n/a 39.78
(99.99 %)
219
(0.01 %)
1,085
(100.00 %)
713,274
(2.40 %)
840,280
(6.39 %)
4,419,734
(51.60 %)
203,906
(13.78 %)
129 domesticated barley (Golden Promise 2019)
GCA_902500625.1
n/a 17,386
(0.43 %)
252,520
(9.04 %)
n/a 44.38
(97.83 %)
621,008
(2.23 %)
8
(100.00 %)
3,098,901
(53.34 %)
2,055,561
(5.88 %)
14,404,046
(70.52 %)
706,795
(16.04 %)
130 domesticated barley (H.vulgare 2021 refseq)
GCF_904849725.1
63,364
(1.67 %)
17,849
(0.43 %)
260,921
(9.04 %)
n/a 44.46
(99.97 %)
162
(0.03 %)
291
(100.00 %)
2,720,197
(55.13 %)
1,726,335
(5.40 %)
14,010,390
(72.58 %)
732,834
(17.24 %)
131 durian
GCF_002303985.1
68,467
(10.35 %)
24,627
(3.34 %)
48,130
(9.41 %)
n/a 32.64
(99.58 %)
3,044
(0.43 %)
677
(100.00 %)
490,482
(3.80 %)
509,842
(12.92 %)
4,397,155
(48.22 %)
56,957
(6.23 %)
132 durum wheat (2019)
GCA_900231445.1
n/a 32,523
(0.34 %)
530,488
(8.17 %)
n/a 46.01
(98.73 %)
330,230
(1.28 %)
330,244
(98.72 %)
2,723,974
(3.46 %)
2,746,444
(3.02 %)
330,244
(98.72 %)
2,108,395
(25.96 %)
133 eggplant (2014)
GCA_000787875.1
n/a 15,481
(1.92 %)
48,974
(7.98 %)
n/a 35.72
(95.30 %)
118,249
(4.75 %)
143,048
(95.25 %)
317,711
(2.21 %)
307,772
(4.55 %)
6,006,653
(38.61 %)
7,570
(0.50 %)
134 elephant grass (2022)
GCA_022644695.1
n/a 34,754
(1.95 %)
231,748
(22.13 %)
n/a 46.97
(99.99 %)
1,574
(0.01 %)
1,588
(99.99 %)
587,262
(1.41 %)
551,392
(2.62 %)
9,678,348
(46.32 %)
398,884
(36.81 %)
135 emerald green okra A.esculentus (Green Star 2024)
GCA_035048815.1
n/a 57,092
(4.66 %)
139,785
(17.31 %)
n/a 33.78
(99.95 %)
104
(0.05 %)
182
(99.95 %)
665,897
(3.33 %)
561,368
(7.98 %)
6,809,885
(45.67 %)
31,360
(1.27 %)
136 English oak (primary hap 2022)
GCF_932294415.1
69,211
(8.60 %)
15,792
(1.92 %)
66,872
(14.31 %)
n/a 35.68
(100.00 %)
119
(0.00 %)
96
(100.00 %)
773,652
(4.18 %)
429,695
(8.87 %)
4,823,216
(39.65 %)
21,654
(2.15 %)
137 English walnut
GCF_001411555.2
52,962
(10.18 %)
18,927
(3.19 %)
60,210
(17.37 %)
n/a 36.21
(99.89 %)
1,051
(0.11 %)
24,757
(100.00 %)
434,989
(3.86 %)
303,673
(3.70 %)
3,318,114
(33.94 %)
24,028
(1.83 %)
138 eudicot A.cruentus (Arusha 2021)
GCA_019425755.1
n/a 12,903
(3.20 %)
33,445
(14.99 %)
n/a 33.08
(99.96 %)
983
(0.04 %)
625
(100.00 %)
891,822
(54.95 %)
181,416
(3.89 %)
2,376,097
(36.79 %)
4,821
(0.53 %)
139 eudicot A.glutinosa (primary hap 2023)
GCF_958979055.1
42,218
(10.92 %)
14,784
(3.18 %)
46,293
(16.46 %)
n/a 36.73
(100.00 %)
96
(0.00 %)
15
(100.00 %)
433,802
(3.92 %)
270,411
(4.15 %)
2,634,547
(36.26 %)
29,535
(3.72 %)
140 eudicot A.graveolens (Ventura 2020)
GCA_009905375.1
n/a 17,520
(0.48 %)
115,295
(5.30 %)
n/a 35.68
(99.73 %)
4,633
(0.27 %)
4,852
(100.00 %)
1,247,334
(1.96 %)
1,423,238
(4.75 %)
11,040,179
(71.10 %)
31,499
(0.31 %)
141 eudicot C.lanceoleosa (SQ_2022a 2022)
GCA_025200525.1
n/a 21,858
(0.67 %)
153,069
(7.18 %)
n/a 37.63
(99.99 %)
2,949
(0.01 %)
790
(100.00 %)
4,031,259
(23.47 %)
2,174,993
(6.70 %)
18,920,250
(54.60 %)
200,005
(3.83 %)
142 eudicot C.lavandulifolium (G1 2022)
GCA_022545495.1
n/a 18,954
(0.61 %)
117,628
(6.04 %)
n/a 36.02
(99.96 %)
10,291
(0.04 %)
178
(100.00 %)
2,596,263
(19.70 %)
1,222,904
(3.44 %)
12,327,164
(55.80 %)
67,370
(0.88 %)
143 eudicot C.sativa (Pink pepper KNU-18-1 2023)
GCF_029168945.1
47,822
(7.37 %)
14,132
(1.76 %)
52,606
(11.89 %)
n/a 34.09
(100.00 %)
53
(0.00 %)
18
(100.00 %)
490,095
(3.26 %)
291,432
(3.68 %)
3,197,241
(60.23 %)
29,385
(2.13 %)
144 eudicot C.seticuspe (Gojo-0 2021)
GCA_019973895.1
n/a 17,958
(0.52 %)
141,880
(7.25 %)
n/a 36.23
(98.03 %)
37,176
(1.97 %)
45,671
(98.03 %)
3,118,877
(21.04 %)
1,512,311
(3.93 %)
10,481,296
(59.70 %)
63,123
(0.67 %)
145 eudicot D.spatulata (IRGN DVMQU6P362 2024)
GCA_035668315.1
n/a 16,707
(3.49 %)
62,287
(20.90 %)
n/a 37.76
(99.96 %)
1,083
(0.03 %)
24,058
(99.97 %)
274,473
(12.37 %)
110,623
(2.62 %)
2,103,310
(28.32 %)
22,076
(2.40 %)
146 eudicot E.lathyris (primary hap 2023)
GCF_963576675.1
54,052
(4.78 %)
14,372
(1.33 %)
80,776
(14.35 %)
n/a 36.88
(100.00 %)
24
(0.00 %)
57
(100.00 %)
496,928
(2.45 %)
491,703
(4.75 %)
4,850,176
(50.53 %)
57,897
(3.26 %)
147 eudicot E.russellianum (2023)
GCA_036186865.1
n/a 18,823
(1.28 %)
96,845
(13.58 %)
n/a 37.91
(99.98 %)
26,521
(0.02 %)
100
(100.00 %)
1,526,493
(77.75 %)
539,134
(3.70 %)
6,307,362
(47.97 %)
31,022
(0.81 %)
148 eudicot G.bilobum (WA Gb01-03AN 2023)
GCF_033153095.1
45,049
(8.43 %)
18,010
(3.03 %)
54,840
(15.32 %)
n/a 35.23
(100.00 %)
4
(0.00 %)
5,089
(100.00 %)
397,210
(3.11 %)
254,173
(4.10 %)
3,228,435
(42.44 %)
15,343
(0.97 %)
149 eudicot H.pumila (YLH828 2023)
GCF_033568475.1
51,602
(5.64 %)
14,506
(1.52 %)
55,054
(9.40 %)
n/a 37.18
(100.00 %)
411
(0.00 %)
133
(100.00 %)
397,610
(2.13 %)
326,774
(3.20 %)
4,120,854
(57.35 %)
63,233
(2.52 %)
150 eudicot M.micrantha (NLD-2019 2019)
GCA_009363875.1
n/a 19,940
(1.00 %)
96,066
(8.14 %)
n/a 36.20
(99.99 %)
1,599
(0.01 %)
2,815
(100.00 %)
908,702
(2.54 %)
980,385
(4.65 %)
9,286,677
(54.99 %)
89,410
(1.77 %)
151 eudicot N.benthamiana (KLAB 2023)
GCA_034376525.1
n/a 27,772
(0.99 %)
128,971
(6.28 %)
n/a 37.84
(100.00 %)
4
(0.00 %)
667
(100.00 %)
4,744,181
(80.09 %)
1,261,453
(5.53 %)
18,063,531
(49.81 %)
86,419
(1.62 %)
152 eudicot N.caerulescens (Cira 2024)
GCA_046127275.1
n/a 20,205
(8.11 %)
49,304
(30.44 %)
n/a 39.42
(99.99 %)
41
(0.01 %)
1,181
(100.00 %)
413,962
(43.41 %)
125,005
(11.92 %)
1,047,909
(36.93 %)
24,840
(5.52 %)
153 eudicot P.eburnea (SZY01 2022)
GCF_022965805.1
61,645
(7.70 %)
19,490
(2.24 %)
62,769
(12.34 %)
n/a 37.11
(99.83 %)
1,024
(0.17 %)
1,225
(100.00 %)
314,817
(1.84 %)
291,276
(6.35 %)
3,964,714
(53.25 %)
61,424
(2.69 %)
154 eudicot P.frutescens var. frutescens (PF040 2021)
GCA_019511825.2
n/a 28,418
(2.15 %)
120,101
(15.79 %)
n/a 35.13
(99.99 %)
763
(0.01 %)
1,465
(100.00 %)
1,497,762
(21.02 %)
662,726
(4.46 %)
8,218,287
(43.32 %)
65,299
(2.16 %)
155 eudicot P.huaijiensis (GDHJ02 2020)
GCF_012295235.1
55,830
(12.29 %)
19,054
(3.86 %)
48,657
(15.27 %)
n/a 35.65
(97.46 %)
31,613
(2.54 %)
21,121
(100.00 %)
195,798
(1.99 %)
128,140
(2.47 %)
2,568,483
(41.18 %)
16,399
(1.28 %)
156 eudicot P.nigra (primary hap 2023)
GCF_951802175.1
55,369
(16.07 %)
19,591
(4.65 %)
41,748
(16.14 %)
n/a 34.95
(99.99 %)
277
(0.01 %)
21
(100.00 %)
256,070
(2.83 %)
178,940
(8.44 %)
2,317,187
(40.87 %)
3,317
(6.62 %)
157 eudicot P.vulgaris (G19833 2024)
GCF_000499845.2
48,620
(10.29 %)
16,779
(3.20 %)
47,438
(13.87 %)
n/a 35.62
(98.95 %)
566
(1.05 %)
1,034
(98.95 %)
245,672
(2.41 %)
239,601
(4.78 %)
2,887,505
(44.41 %)
44,689
(7.20 %)
158 eudicot R.rugosa (primary hap 2023)
GCF_958449725.1
62,563
(15.19 %)
15,236
(3.45 %)
60,387
(23.53 %)
n/a 39.30
(99.95 %)
1,014
(0.05 %)
77
(100.00 %)
226,730
(2.23 %)
196,099
(4.12 %)
1,632,269
(33.79 %)
38,448
(5.69 %)
159 eudicot S.americanum (SP2273 SP2273 2023)
GCA_030463325.1
n/a 15,767
(1.56 %)
57,615
(9.26 %)
n/a 36.15
(100.00 %)
214
(0.00 %)
90
(100.00 %)
2,179,570
(59.21 %)
301,263
(3.51 %)
5,651,338
(51.90 %)
28,868
(1.00 %)
160 eudicot S.americanum (SP2275 SP2275 2023)
GCA_030463385.1
n/a 15,677
(1.56 %)
57,771
(9.32 %)
n/a 36.18
(100.00 %)
n/a 540
(100.00 %)
2,161,174
(59.26 %)
298,020
(3.34 %)
5,624,901
(52.02 %)
29,520
(1.04 %)
161 eudicot S.miltiorrhiza (Shanhuang shh 2023)
GCA_028751815.1
n/a 15,144
(2.60 %)
67,052
(21.48 %)
n/a 37.46
(99.58 %)
695
(0.42 %)
171
(100.00 %)
614,263
(17.32 %)
364,006
(5.05 %)
2,679,398
(42.13 %)
64,170
(6.16 %)
162 eudicot T.arvense (2022)
GCA_911865555.2
n/a 23,487
(5.55 %)
54,244
(16.93 %)
n/a 38.39
(100.00 %)
24
(0.00 %)
964
(100.00 %)
204,363
(1.86 %)
150,149
(5.58 %)
2,245,900
(50.03 %)
35,971
(3.77 %)
163 eudicot V.riparia x Vitis rupestris (2022)
GCA_946000675.1
n/a 29,137
(2.81 %)
89,605
(14.72 %)
n/a 35.15
(99.99 %)
102
(0.01 %)
596
(99.99 %)
664,293
(2.97 %)
503,960
(9.26 %)
5,715,446
(39.21 %)
22,264
(1.77 %)
164 eudicot V.rotundifolia (Noble 2022)
GCA_022557335.1
n/a 13,992
(3.39 %)
38,479
(14.93 %)
n/a 33.54
(99.82 %)
17,084
(0.19 %)
17,104
(99.81 %)
696,697
(51.55 %)
178,090
(4.22 %)
2,480,890
(32.65 %)
6,497
(0.70 %)
165 Euphrates poplar (v2 2014)
GCF_000495115.2
56,366
(12.92 %)
20,853
(4.29 %)
41,483
(12.40 %)
n/a 32.05
(95.31 %)
22,764
(4.70 %)
32,266
(95.30 %)
357,310
(3.64 %)
246,638
(4.06 %)
2,660,781
(43.22 %)
2,691
(0.38 %)
166 European chestnut (Marrone di Chiusa Pesio 2024)
GCF_040712315.1
49,645
(7.87 %)
15,653
(2.10 %)
61,041
(13.43 %)
n/a 35.42
(100.00 %)
65
(0.00 %)
13
(100.00 %)
595,120
(3.41 %)
355,816
(4.98 %)
4,680,964
(38.07 %)
20,075
(1.41 %)
167 European crab apple (2022)
GCF_916048215.2
77,800
(12.38 %)
22,539
(3.42 %)
67,761
(16.26 %)
n/a 38.07
(99.99 %)
101
(0.01 %)
34
(100.00 %)
309,302
(2.18 %)
331,724
(5.06 %)
2,996,468
(41.19 %)
25,597
(2.08 %)
168 European hop (primary hap 2023)
GCF_963169125.1
72,613
(2.92 %)
14,868
(0.56 %)
135,918
(7.87 %)
n/a 39.00
(100.00 %)
129
(0.00 %)
319
(100.00 %)
1,077,704
(2.26 %)
853,368
(5.27 %)
13,477,464
(61.64 %)
152,063
(4.18 %)
169 European hop (Shinshu Wase 2014)
GCA_000831365.1
n/a 17,158
(0.86 %)
191,202
(13.47 %)
n/a 38.57
(86.69 %)
530,762
(13.34 %)
292,698
(86.67 %)
770,031
(2.12 %)
637,135
(3.75 %)
13,484,203
(41.57 %)
81,500
(2.36 %)
170 European mistletoe (primary hap 2023)
GCA_963277665.1
n/a 12,110
(0.01 %)
960,545
(1.07 %)
n/a 31.25
(100.00 %)
6,368
(0.00 %)
5,951
(100.00 %)
61,111,090
(11.87 %)
29,667,857
(2.75 %)
11,464
(100.00 %)
1,680,995
(2.36 %)
171 false flax
GCF_000633955.1
123,030
(22.63 %)
61,894
(13.77 %)
113,219
(31.09 %)
n/a 36.55
(92.99 %)
74,428
(7.02 %)
37,780
(99.99 %)
346,267
(2.46 %)
233,837
(5.56 %)
3,452,066
(27.34 %)
32,235
(2.62 %)
172 fava bean (2023)
GCA_948472305.1
n/a 18,459
(0.14 %)
221,591
(2.78 %)
n/a 37.44
(100.00 %)
5,330
(0.00 %)
3,992
(100.00 %)
4,140,168
(2.97 %)
4,673,353
(13.95 %)
36,694,276
(79.21 %)
59,853
(0.73 %)
173 Fendler's bladderpod (2019)
GCA_900406525.1
n/a 29,791
(9.22 %)
82,813
(26.56 %)
n/a 34.83
(99.51 %)
109,570
(0.49 %)
209,502
(99.51 %)
193,365
(2.63 %)
165,270
(4.54 %)
2,180,278
(29.35 %)
8,339
(0.91 %)
174 Fendler's bladderpod (WCL-YS1 PI 610492 2024)
GCA_036630335.1
n/a 23,679
(9.84 %)
43,179
(26.89 %)
n/a 34.92
(96.38 %)
98,816
(3.75 %)
9,891
(100.00 %)
373,519
(23.21 %)
328,539
(16.37 %)
1,720,493
(26.70 %)
5,729
(0.77 %)
175 ferns C-fern (Hn-n Whitten #5841 2021)
GCA_020310875.1
n/a 9,421
(0.09 %)
135,222
(2.48 %)
n/a 38.64
(99.38 %)
4,604
(0.62 %)
10,776
(99.38 %)
2,992,638
(8.23 %)
4,552,105
(9.86 %)
24,840,439
(73.42 %)
166,309
(1.00 %)
176 field dodder (2020)
GCA_900332095.2
n/a 20,063
(4.21 %)
57,416
(19.19 %)
n/a 35.99
(94.55 %)
29,211
(5.47 %)
36,112
(94.53 %)
448,370
(12.07 %)
208,393
(3.46 %)
2,648,975
(35.75 %)
35,117
(3.87 %)
177 field mustard (Chiifu-401-42 2020)
GCF_000309985.2
73,442
(34.55 %)
30,193
(10.12 %)
57,010
(25.57 %)
n/a 36.83
(99.39 %)
408
(0.61 %)
1,100
(100.00 %)
261,522
(15.13 %)
196,553
(8.43 %)
1,533,242
(38.01 %)
24,895
(5.44 %)
178 field pennycress (KM-2021 2021)
GCA_018983045.1
n/a 22,245
(5.38 %)
51,310
(16.10 %)
n/a 39.02
(99.92 %)
1,923
(0.08 %)
2,298
(100.00 %)
172,036
(1.52 %)
129,452
(6.55 %)
2,388,667
(53.91 %)
37,074
(4.98 %)
179 finger millet (KNE 796-S 2023)
GCA_032690845.1
n/a 31,097
(3.07 %)
140,467
(22.19 %)
n/a 43.87
(99.87 %)
142
(0.13 %)
674
(99.87 %)
1,168,206
(39.18 %)
229,202
(4.14 %)
4,910,934
(41.23 %)
205,561
(17.19 %)
180 finger millet (ML-365 2017)
GCA_002180455.1
n/a 30,000
(2.41 %)
346,692
(27.97 %)
n/a 45.34
(98.74 %)
507,646
(1.30 %)
1,033,269
(98.70 %)
323,234
(1.19 %)
394,943
(6.28 %)
6,129,348
(33.00 %)
325,103
(21.18 %)
181 flowering dogwood (Cherokee Brave 2023)
GCF_030987335.1
63,465
(6.03 %)
17,263
(1.31 %)
78,564
(9.37 %)
n/a 35.95
(100.00 %)
96
(0.00 %)
459
(100.00 %)
982,341
(3.33 %)
719,891
(7.87 %)
6,810,592
(50.46 %)
27,883
(2.10 %)
182 foxtail millet
GCF_000263155.2
40,951
(13.47 %)
17,758
(5.07 %)
60,598
(30.59 %)
n/a 46.14
(98.82 %)
6,442
(1.19 %)
6,779
(98.81 %)
115,365
(1.46 %)
116,980
(2.45 %)
1,691,260
(29.31 %)
78,297
(28.27 %)
183 fried-egg orchid (Lindl 2021)
GCA_019925795.1
n/a 13,889
(0.88 %)
71,188
(7.43 %)
n/a 35.53
(99.95 %)
1,481
(0.05 %)
822
(100.00 %)
671,921
(2.91 %)
624,024
(4.46 %)
7,792,634
(47.85 %)
76,668
(3.16 %)
184 garden asparagus (2017)
GCF_001876935.1
45,159
(4.02 %)
13,440
(1.02 %)
85,207
(11.07 %)
n/a 39.02
(97.02 %)
47,391
(2.99 %)
56,182
(97.01 %)
427,496
(2.02 %)
885,946
(8.32 %)
6,075,356
(46.49 %)
111,109
(6.80 %)
185 garden pea (Zhongwan6 2022)
GCF_024323335.1
74,264
(1.88 %)
17,744
(0.43 %)
129,692
(4.97 %)
n/a 37.94
(99.73 %)
826
(0.27 %)
1,566
(100.00 %)
1,517,586
(2.16 %)
1,541,702
(5.89 %)
13,206,825
(66.95 %)
105,766
(0.97 %)
186 garlic-fruit tree (guangnan 2023)
GCF_029873635.1
43,473
(2.84 %)
13,544
(0.88 %)
64,877
(5.24 %)
n/a 36.06
(100.00 %)
596
(0.00 %)
510
(100.00 %)
1,556,970
(22.50 %)
788,188
(5.25 %)
10,081,845
(53.72 %)
41,032
(1.09 %)
187 ghaf (Desert tree PC_DT_omini 2023)
GCF_029017545.1
59,652
(8.73 %)
18,917
(2.55 %)
47,052
(9.22 %)
n/a 32.09
(99.98 %)
1,693
(0.02 %)
2,266
(100.00 %)
452,206
(3.00 %)
195,931
(2.27 %)
4,921,469
(39.63 %)
9,731
(0.69 %)
188 ginger
GCF_018446385.1
127,579
(4.07 %)
33,995
(0.96 %)
186,756
(7.79 %)
n/a 39.16
(100.00 %)
901
(0.00 %)
211
(100.00 %)
1,187,168
(2.18 %)
2,088,683
(6.47 %)
12,917,773
(61.42 %)
398,512
(10.38 %)
189 globe artichoke (v1.1 2C 2018)
GCF_001531365.2
42,106
(6.72 %)
15,819
(2.23 %)
49,753
(11.10 %)
n/a 35.35
(90.31 %)
310,402
(9.76 %)
13,479
(99.93 %)
394,793
(2.75 %)
364,336
(3.37 %)
4,190,750
(39.49 %)
12,198
(0.64 %)
190 goatgrass A.strangulata
GCF_002575655.1
87,385
(2.18 %)
17,963
(0.44 %)
263,708
(10.29 %)
n/a 46.32
(97.73 %)
107,163
(2.27 %)
109,126
(100.00 %)
1,490,873
(15.60 %)
1,415,562
(5.65 %)
12,540,551
(71.59 %)
881,849
(29.81 %)
191 goatgrass A.tauschii
GCF_001957025.1
69,195
(1.77 %)
18,614
(0.43 %)
300,274
(11.28 %)
n/a 46.38
(100.00 %)
n/a 68,537
(100.00 %)
1,555,328
(15.65 %)
1,485,488
(4.71 %)
13,133,338
(73.17 %)
928,327
(30.84 %)
192 goatgrass A.tauschii.strangulata (AL8/78 2024)
GCF_002575655.3
93,689
(2.58 %)
18,524
(0.46 %)
261,939
(10.44 %)
n/a 46.35
(99.97 %)
347
(0.03 %)
1,115
(100.00 %)
1,094,634
(1.42 %)
1,403,604
(6.42 %)
12,367,986
(72.90 %)
849,453
(31.38 %)
193 goji berry (Lr01 2021)
GCF_019175385.1
69,808
(4.35 %)
17,353
(1.01 %)
81,347
(7.68 %)
n/a 38.10
(99.95 %)
1,565
(0.05 %)
166
(100.00 %)
816,909
(2.29 %)
708,412
(4.09 %)
8,106,901
(53.67 %)
66,433
(1.82 %)
194 golden kiwifruit (Hongyang 2019)
GCA_009663005.1
n/a 21,161
(2.89 %)
55,843
(11.78 %)
n/a 35.63
(99.99 %)
646
(0.01 %)
2,366
(99.99 %)
423,518
(2.92 %)
293,299
(3.76 %)
4,466,312
(33.71 %)
25,250
(1.74 %)
195 golden kiwifruit (Red5 2018)
GCA_003024255.1
n/a 22,332
(3.88 %)
51,709
(13.62 %)
n/a 35.31
(96.44 %)
25,521
(3.57 %)
1,234
(100.00 %)
347,035
(2.87 %)
241,862
(4.11 %)
3,578,217
(30.95 %)
19,259
(1.41 %)
196 grain amaranth (AhG2s 2020)
GCA_000753965.2
n/a 13,698
(3.27 %)
34,546
(14.58 %)
n/a 32.99
(90.06 %)
7,031
(9.94 %)
1,567
(100.00 %)
217,772
(3.32 %)
181,251
(3.71 %)
2,391,775
(32.66 %)
4,425
(0.40 %)
197 great duckweed (2018)
GCA_900492545.1
n/a 10,264
(6.56 %)
16,841
(26.52 %)
n/a 42.27
(99.98 %)
84
(0.02 %)
20
(100.00 %)
96,389
(3.49 %)
54,278
(2.54 %)
843,136
(22.61 %)
18,978
(24.35 %)
198 great duckweed (9509 2017)
GCA_001981405.1
n/a 10,023
(7.00 %)
16,353
(26.89 %)
n/a 42.30
(92.78 %)
89,257
(7.32 %)
89,277
(92.68 %)
80,787
(2.86 %)
45,432
(1.93 %)
786,155
(19.70 %)
19,057
(20.99 %)
199 green algae (1602 2018)
GCA_002245835.2
n/a 770
(0.70 %)
5,466
(68.75 %)
n/a 63.95
(100.00 %)
n/a 159
(100.00 %)
62,109
(5.65 %)
29,993
(4.25 %)
581,123
(37.15 %)
127
(97.30 %)
200 green algae (18125 2025)
GCA_048595725.1
n/a 865
(2.16 %)
3,109
(76.75 %)
n/a 67.78
(100.00 %)
n/a 55
(100.00 %)
35,578
(6.99 %)
19,197
(3.61 %)
216,318
(31.95 %)
54
(99.88 %)
201 green algae (211/11P 2022)
GCA_023343905.1
n/a 1,009
(1.60 %)
4,892
(65.40 %)
n/a 61.60
(98.43 %)
12
(1.57 %)
57
(98.43 %)
48,271
(5.94 %)
22,435
(3.81 %)
358,729
(31.71 %)
405
(96.46 %)
202 green algae (ATCC 16529 2021)
GCA_016906385.1
n/a 748
(2.62 %)
2,222
(71.29 %)
n/a 64.15
(97.91 %)
6,559
(2.25 %)
19
(100.00 %)
268
(0.10 %)
2,320
(1.18 %)
110,762
(22.64 %)
29
(99.25 %)
203 green algae (CCAP 19/42 2023)
GCA_031753455.1
n/a 1,362
(0.45 %)
15,767
(32.44 %)
n/a 49.19
(100.00 %)
n/a 300
(100.00 %)
442,436
(43.24 %)
171,808
(11.44 %)
978,912
(31.81 %)
10,820
(2.10 %)
204 green algae (CCMP1545 2009)
GCF_000151265.4
10,237
(66.85 %)
988
(3.27 %)
4,789
(69.24 %)
n/a 65.94
(98.86 %)
583
(1.14 %)
497
(98.86 %)
37,284
(8.77 %)
20,399
(4.09 %)
206,658
(48.59 %)
43
(99.34 %)
205 green algae (HMC1 2018)
GCA_003255715.1
n/a 1,000
(1.89 %)
7,921
(69.96 %)
n/a 62.97
(97.56 %)
2,472
(2.45 %)
3,774
(100.00 %)
10,519
(1.96 %)
4,558
(1.31 %)
172,635
(22.08 %)
3,978
(96.84 %)
206 green algae (JCM 15793 2018)
GCA_002897115.2
n/a 1,087
(3.87 %)
3,215
(73.44 %)
n/a 61.27
(98.39 %)
10,986
(1.68 %)
46
(100.00 %)
8,982
(1.85 %)
3,745
(0.85 %)
119,487
(14.35 %)
79
(99.57 %)
207 green algae (JCM 9641 2017)
GCA_002794665.1
n/a 928
(3.73 %)
2,196
(76.87 %)
n/a 73.37
(97.42 %)
12,055
(2.67 %)
27
(100.00 %)
15,929
(5.38 %)
7,990
(2.29 %)
164,687
(38.62 %)
30
(99.90 %)
208 green algae (KO-2023 2023)
GCA_030272585.1
n/a 1,751
(1.39 %)
15,265
(40.46 %)
n/a 46.07
(100.00 %)
n/a 29
(100.00 %)
60,131
(4.76 %)
34,318
(3.34 %)
393,810
(24.33 %)
19,071
(23.42 %)
209 green algae (LANL1001 2019)
GCA_006384855.1
n/a 2,016
(0.62 %)
31,585
(41.01 %)
n/a 57.91
(100.00 %)
1
(0.00 %)
3,614
(100.00 %)
183,076
(3.30 %)
101,860
(5.85 %)
972,524
(32.54 %)
4,760
(98.23 %)
210 green algae (RCC4221 2014)
GCA_000214015.2
n/a 1,108
(6.57 %)
3,692
(76.52 %)
n/a 59.39
(99.94 %)
477
(0.07 %)
20
(100.00 %)
8,604
(3.92 %)
4,944
(2.18 %)
102,578
(28.06 %)
20
(99.94 %)
211 green algae (SAG 2063 2018)
GCA_003613005.1
n/a 869
(2.13 %)
9,821
(78.63 %)
n/a 67.62
(98.00 %)
579
(1.95 %)
7,535
(98.05 %)
35,537
(6.91 %)
19,692
(3.56 %)
218,412
(30.60 %)
6,958
(98.59 %)
212 green algae (YS-2018 2019)
GCA_004138255.1
n/a 1,365
(1.08 %)
11,070
(58.24 %)
n/a 55.95
(98.44 %)
780
(1.56 %)
597
(100.00 %)
25,537
(1.66 %)
27,257
(3.92 %)
365,387
(19.48 %)
3,732
(86.39 %)
213 green algae A.protothecoides (0710 2014)
GCF_000733215.1
7,014
(37.71 %)
966
(2.72 %)
2,947
(70.38 %)
n/a 63.54
(95.35 %)
1,012
(4.66 %)
1,386
(95.34 %)
8,655
(1.88 %)
3,803
(1.89 %)
147,537
(20.31 %)
604
(53.91 %)
214 green algae B.prasinos (RCC1105 2012)
GCF_002220235.1
7,904
(82.34 %)
1,231
(6.04 %)
4,460
(76.24 %)
n/a 48.02
(99.76 %)
20
(0.24 %)
21
(100.00 %)
17,900
(4.88 %)
5,674
(1.75 %)
113,699
(21.91 %)
7
(0.01 %)
215 green algae C.reinhardtii (CC-5816 2022)
GCA_026108075.1
n/a 1,057
(0.55 %)
9,735
(58.02 %)
n/a 64.03
(100.00 %)
n/a 17
(100.00 %)
166,909
(9.00 %)
120,034
(10.13 %)
750,946
(37.60 %)
166
(99.31 %)
216 green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 refseq)
GCF_000002595.2
19,527
(53.99 %)
990
(0.56 %)
9,689
(59.71 %)
n/a 64.08
(96.36 %)
1,459
(3.65 %)
1,512
(96.35 %)
174,119
(17.13 %)
110,553
(6.12 %)
748,240
(34.06 %)
92
(46.06 %)
217 green algae C.subellipsoidea (C-169 2012)
GCF_000258705.1
9,839
(29.70 %)
1,307
(1.78 %)
8,108
(53.71 %)
n/a 52.94
(100.00 %)
n/a 29
(100.00 %)
8,446
(0.85 %)
5,471
(0.85 %)
265,761
(14.34 %)
11,329
(19.64 %)
218 green algae C.variabilis (NC64A 2010 refseq)
GCF_000147415.1
9,780
(32.79 %)
744
(1.00 %)
4,520
(67.55 %)
n/a 67.14
(91.48 %)
3,543
(8.55 %)
3,810
(91.45 %)
64,770
(8.22 %)
28,736
(2.86 %)
416,740
(37.15 %)
756
(45.48 %)
219 green algae K.nitens (NIES-2285 2014)
GCA_000708835.1
n/a 2,471
(1.78 %)
14,771
(54.27 %)
n/a 52.42
(98.98 %)
2,081
(1.02 %)
3,731
(98.98 %)
10,051
(0.46 %)
14,278
(1.14 %)
388,120
(8.55 %)
8,698
(83.31 %)
220 green algae M.commoda (RCC299 2009)
GCF_000090985.2
10,137
(72.46 %)
1,301
(4.51 %)
5,667
(86.20 %)
n/a 63.82
(100.00 %)
n/a 19
(100.00 %)
14,619
(3.58 %)
8,937
(2.75 %)
178,499
(27.69 %)
10
(25.23 %)
221 green algae M.neglectum (SAG 48.87 2015)
GCF_000611645.1
16,734
(25.96 %)
666
(0.47 %)
12,122
(60.02 %)
n/a 64.75
(96.59 %)
5,358
(3.43 %)
12,077
(96.57 %)
73,343
(6.73 %)
43,518
(3.04 %)
568,630
(31.80 %)
7,776
(96.69 %)
222 green algae M.pusilla (CCMP1545 2009)
GCF_000151265.2
10,242
(66.86 %)
990
(3.27 %)
4,789
(69.24 %)
n/a 65.94
(98.86 %)
583
(1.14 %)
497
(98.86 %)
36,818
(8.73 %)
20,399
(4.09 %)
206,658
(48.59 %)
32
(47.70 %)
223 green algae O.lucimarinus (CCE9901 2007)
GCF_000092065.1
7,603
(72.01 %)
1,064
(6.25 %)
3,493
(72.08 %)
n/a 60.44
(100.00 %)
n/a 21
(100.00 %)
11,026
(5.45 %)
11,732
(3.90 %)
107,661
(34.88 %)
12
(61.27 %)
224 green algae O.tauri (RCC4221 2014)
GCF_000214015.3
7,766
(82.33 %)
1,131
(6.60 %)
3,714
(76.22 %)
n/a 59.21
(99.94 %)
477
(0.07 %)
22
(100.00 %)
8,503
(3.84 %)
4,946
(2.16 %)
102,428
(27.87 %)
16
(57.14 %)
225 green algae V.carteri (Eve 2010)
GCF_000143455.1
14,333
(21.46 %)
1,411
(0.77 %)
13,095
(47.93 %)
n/a 55.97
(91.15 %)
12,014
(8.87 %)
11,352
(91.13 %)
175,729
(14.69 %)
105,113
(5.10 %)
667,226
(23.91 %)
4,325
(42.65 %)
226 green chiretta (2019)
GCF_009805555.1
46,094
(16.56 %)
14,632
(4.66 %)
34,242
(19.36 %)
n/a 33.53
(100.00 %)
n/a 271
(100.00 %)
293,800
(4.64 %)
151,157
(7.38 %)
1,732,880
(41.88 %)
21,835
(6.05 %)
227 green foxtail
GCF_005286985.1
47,022
(14.66 %)
17,750
(5.12 %)
60,106
(30.88 %)
n/a 46.17
(99.85 %)
61
(0.15 %)
76
(99.85 %)
116,493
(1.51 %)
120,039
(2.72 %)
1,676,017
(29.11 %)
75,497
(29.44 %)
228 green foxtail (2024)
GCF_005286985.2
43,377
(14.56 %)
17,909
(5.15 %)
60,312
(30.80 %)
n/a 46.17
(99.96 %)
14
(0.04 %)
40
(99.96 %)
117,054
(1.49 %)
121,212
(2.84 %)
1,685,787
(29.32 %)
75,777
(29.49 %)
229 green foxtail (ME034v 2020)
GCA_012934335.1
n/a 18,040
(5.19 %)
61,671
(31.38 %)
n/a 45.99
(100.00 %)
54
(0.00 %)
63
(100.00 %)
105,738
(1.38 %)
87,424
(2.22 %)
1,777,815
(26.85 %)
74,932
(30.30 %)
230 guar (PI 68867901 SD 2022)
GCA_026586085.1
n/a 16,149
(3.62 %)
40,368
(13.76 %)
n/a 32.74
(100.00 %)
n/a 627
(100.00 %)
724,179
(25.31 %)
196,353
(10.67 %)
2,757,251
(41.21 %)
9,690
(0.94 %)
231 guar (short-day 2024)
GCA_037177725.1
n/a 16,198
(3.33 %)
43,918
(13.95 %)
n/a 33.41
(100.00 %)
24
(0.00 %)
237
(100.00 %)
813,394
(29.89 %)
243,439
(13.12 %)
2,549,208
(42.63 %)
10,217
(1.78 %)
232 Guinea yam (TDr96_F1 2017)
GCA_002240015.2
n/a 11,944
(2.63 %)
37,372
(13.64 %)
n/a 35.58
(88.95 %)
1,032,823
(11.31 %)
21
(100.00 %)
293,868
(3.21 %)
174,614
(3.18 %)
2,690,184
(32.53 %)
15,323
(1.42 %)
233 habanero-type pepper (PI159236 2017)
GCA_002271895.2
n/a 16,562
(0.53 %)
72,911
(2.91 %)
n/a 34.88
(98.35 %)
196,261
(1.66 %)
87,978
(100.00 %)
1,136,015
(1.95 %)
1,019,921
(4.33 %)
22,445,162
(47.06 %)
20,737
(0.24 %)
234 hairy vetch (HV-30 2023)
GCF_029867415.1
88,183
(5.03 %)
22,129
(1.02 %)
118,243
(9.15 %)
n/a 35.63
(99.98 %)
3,486
(0.02 %)
1,888
(100.00 %)
1,001,308
(2.63 %)
1,132,664
(5.72 %)
8,340,755
(56.16 %)
43,665
(1.21 %)
235 Hall's panicgrass
GCF_002211085.1
43,787
(9.63 %)
17,635
(3.85 %)
66,270
(23.98 %)
n/a 46.87
(98.63 %)
736
(1.37 %)
1,027
(98.63 %)
157,811
(1.55 %)
119,571
(2.57 %)
2,107,254
(45.30 %)
102,278
(32.16 %)
236 Hawaiian beggarticks (Kalapana, Puna primary hap 2024)
GCF_021521415.1
100,198
(3.70 %)
41,058
(1.06 %)
207,532
(8.30 %)
n/a 37.08
(100.00 %)
n/a 15,833
(100.00 %)
2,024,684
(2.90 %)
1,837,742
(5.29 %)
17,556,257
(56.19 %)
201,310
(3.34 %)
237 Himalayan balsam (dImpGla2.1 2021)
GCF_907164915.1
40,392
(7.39 %)
16,711
(2.29 %)
50,292
(11.24 %)
n/a 32.12
(99.95 %)
858
(0.05 %)
1,115
(100.00 %)
439,789
(3.56 %)
574,639
(8.97 %)
4,147,814
(47.01 %)
16,291
(1.13 %)
238 Himalayan yew (Yunnan 2021)
GCA_018340775.1
n/a 11,782
(0.08 %)
129,658
(1.42 %)
n/a 36.91
(99.99 %)
11,130
(0.01 %)
150
(100.00 %)
2,861,102
(1.57 %)
2,476,232
(2.57 %)
65,436,741
(53.97 %)
157,149
(0.72 %)
239 horseweed
GCF_010389155.1
39,622
(11.54 %)
14,718
(3.15 %)
42,194
(16.23 %)
n/a 34.08
(99.99 %)
502
(0.01 %)
357
(100.00 %)
267,124
(2.84 %)
155,729
(2.71 %)
2,475,353
(36.48 %)
5,205
(0.40 %)
240 Indian licorice
GCF_003935025.1
44,610
(13.60 %)
17,108
(4.95 %)
34,097
(14.33 %)
n/a 31.84
(100.00 %)
184
(0.00 %)
160
(100.00 %)
217,674
(3.40 %)
106,243
(4.04 %)
2,232,509
(38.91 %)
5,438
(1.06 %)
241 interior live oak (QUWIS_CCGP_1 alternate hap 2022)
GCA_023055485.1
n/a 16,184
(2.02 %)
66,215
(14.16 %)
n/a 35.37
(100.00 %)
82
(0.00 %)
689
(100.00 %)
739,891
(4.58 %)
435,389
(7.62 %)
4,843,419
(38.03 %)
13,298
(2.56 %)
242 interior live oak (QUWIS_CCGP_1 primary hap 2022)
GCA_023055345.1
n/a 15,832
(2.09 %)
63,488
(14.36 %)
n/a 35.19
(100.00 %)
81
(0.00 %)
358
(100.00 %)
703,028
(4.29 %)
399,798
(6.48 %)
4,662,881
(36.96 %)
12,534
(1.92 %)
243 island oak (RSA801373 alternate hap 2023)
GCA_028535165.1
n/a 15,893
(1.97 %)
68,998
(15.27 %)
n/a 35.87
(100.00 %)
53
(0.00 %)
156
(100.00 %)
746,424
(4.43 %)
451,117
(7.39 %)
4,820,434
(38.55 %)
20,367
(2.62 %)
244 island oak (RSA801373 primary hap 2023)
GCA_028535515.1
n/a 15,880
(1.95 %)
69,093
(15.25 %)
n/a 35.97
(100.00 %)
53
(0.00 %)
274
(100.00 %)
751,691
(4.60 %)
457,914
(7.61 %)
4,850,082
(38.95 %)
20,561
(3.01 %)
245 J.microcarpa x regia eudicots (UCDavis 2019)
GCF_004785595.1
50,504
(10.14 %)
18,451
(3.41 %)
55,094
(16.89 %)
n/a 36.30
(99.18 %)
54
(0.82 %)
154
(100.00 %)
411,290
(3.65 %)
260,413
(3.49 %)
3,023,907
(31.93 %)
23,270
(1.88 %)
246 Japanese apricot
GCF_000346735.1
32,312
(19.60 %)
14,463
(6.46 %)
33,049
(23.94 %)
n/a 37.45
(92.82 %)
15,597
(7.20 %)
23,761
(92.80 %)
118,757
(2.25 %)
84,983
(4.53 %)
1,374,244
(23.24 %)
7,808
(1.87 %)
247 Japanese cedar (2023)
GCF_030272615.1
80,727
(1.01 %)
14,175
(0.13 %)
225,166
(3.69 %)
n/a 36.42
(99.98 %)
3,031
(0.02 %)
2,699
(100.00 %)
2,873,672
(2.01 %)
4,198,037
(4.24 %)
5,730
(99.98 %)
71,102
(1.16 %)
248 Japanese morning glory
GCF_001879475.1
58,979
(8.37 %)
16,977
(2.14 %)
77,626
(18.21 %)
n/a 37.61
(99.97 %)
449
(0.03 %)
3,418
(100.00 %)
641,896
(6.26 %)
639,051
(8.97 %)
3,622,236
(46.63 %)
77,860
(10.47 %)
249 Japanese rice (2023)
GCF_034140825.1
55,725
(16.73 %)
16,338
(4.37 %)
54,077
(25.00 %)
n/a 43.72
(100.00 %)
4
(0.00 %)
15
(100.00 %)
196,712
(2.76 %)
141,936
(4.82 %)
1,727,479
(35.05 %)
63,894
(25.90 %)
250 Japanese rice (Kitaake 2020)
GCA_009797565.1
n/a 16,562
(4.59 %)
53,878
(24.77 %)
n/a 43.61
(98.95 %)
474
(1.05 %)
476
(98.95 %)
494,831
(50.75 %)
141,079
(3.52 %)
1,728,936
(33.69 %)
64,216
(25.20 %)
251 Japanese rice (Nipponbare 2015)
GCF_001433935.1
53,454
(17.22 %)
16,804
(4.69 %)
53,712
(24.95 %)
n/a 43.57
(99.97 %)
925
(0.03 %)
58
(100.00 %)
402,182
(39.07 %)
138,035
(3.47 %)
1,719,939
(33.46 %)
63,485
(25.25 %)
252 jewel orchid monocots (Aro_GA 2025)
GCA_051820535.1
n/a 41,719
(0.73 %)
293,147
(8.18 %)
n/a 39.10
(100.00 %)
283
(0.00 %)
3,452
(100.00 %)
3,539,676
(12.83 %)
1,885,641
(6.09 %)
19,476,248
(61.01 %)
583,795
(7.68 %)
253 Joseph's coat eudicots (Red AtriRed21 2022)
GCF_026212465.1
44,756
(10.39 %)
13,649
(2.41 %)
38,664
(12.08 %)
n/a 31.93
(99.74 %)
2,496
(0.26 %)
49
(100.00 %)
270,085
(9.40 %)
247,307
(22.95 %)
2,428,999
(49.81 %)
5,914
(1.27 %)
254 Korean lawngrass (Nagirizaki 2016)
GCA_001602275.1
n/a 21,051
(6.88 %)
57,023
(32.54 %)
n/a 44.09
(96.75 %)
14,848
(3.26 %)
26,634
(96.74 %)
101,349
(1.46 %)
71,657
(2.17 %)
1,693,252
(21.97 %)
60,198
(24.06 %)
255 lamb's quarters (primary hap 2023)
GCA_948465745.1
n/a 32,598
(1.94 %)
125,993
(12.58 %)
n/a 36.17
(100.00 %)
67
(0.00 %)
158
(100.00 %)
2,407,940
(63.57 %)
996,815
(6.91 %)
7,383,118
(51.29 %)
84,154
(2.40 %)
256 large cranberry (Ben Lear CNJ99-125-1 inbred clone 2014)
GCA_000775335.2
n/a 14,225
(2.70 %)
66,262
(14.87 %)
n/a 37.74
(99.90 %)
1,390
(0.01 %)
201,496
(99.99 %)
201,938
(1.93 %)
136,145
(2.39 %)
2,755,676
(26.83 %)
12,815
(1.29 %)
257 lemon (UCLL1 2023)
GCA_034663555.1
n/a 27,668
(4.03 %)
72,915
(18.34 %)
n/a 36.06
(99.99 %)
136
(0.01 %)
624
(99.99 %)
382,061
(2.62 %)
254,813
(8.31 %)
3,593,274
(41.24 %)
14,758
(7.59 %)
258 lettuce eudicots (Salinas 2011)
GCA_000227445.1
n/a 15,031
(1.06 %)
140,751
(10.18 %)
n/a 36.82
(99.85 %)
n/a 876,110
(100.00 %)
505,796
(3.85 %)
318,171
(2.09 %)
9,808,138
(33.85 %)
30,057
(0.85 %)
259 liverwort (2024)
GCA_039105155.1
n/a 5,119
(1.70 %)
26,429
(24.22 %)
n/a 43.50
(100.00 %)
1
(0.00 %)
12
(100.00 %)
178,255
(36.35 %)
53,790
(2.08 %)
834,624
(30.68 %)
25,774
(29.87 %)
260 long-grained rice (Zhenshan 97 2020)
GCA_001623345.3
n/a 16,254
(4.30 %)
54,135
(24.00 %)
n/a 43.62
(100.00 %)
n/a 13
(100.00 %)
204,282
(2.82 %)
143,681
(3.92 %)
1,729,033
(36.62 %)
65,538
(25.47 %)
261 lyrate rockcress
GCF_000004255.2
44,526
(28.52 %)
25,416
(19.36 %)
34,938
(31.66 %)
n/a 36.08
(88.90 %)
2,950
(11.10 %)
3,646
(88.90 %)
141,441
(20.58 %)
72,583
(3.25 %)
1,012,438
(24.68 %)
8,053
(2.48 %)
262 macadamia nut
GCF_013358625.1
58,226
(8.43 %)
16,723
(2.11 %)
62,465
(13.23 %)
n/a 39.13
(98.51 %)
22,059
(1.50 %)
2,644
(100.00 %)
463,575
(3.09 %)
304,057
(3.39 %)
4,183,445
(34.36 %)
18,956
(1.40 %)
263 Madagascar periwinkle (Sunstorm Apricot 2015)
GCA_000949345.1
n/a 13,013
(2.26 %)
38,671
(8.42 %)
n/a 33.59
(99.19 %)
123,798
(0.85 %)
203,100
(99.15 %)
329,865
(3.57 %)
244,018
(4.63 %)
3,737,818
(40.09 %)
4,827
(0.29 %)
264 Madagascar periwinkle (Sunstorm Apricot FGT_2020_1 2023)
GCA_028651295.1
n/a 12,929
(2.13 %)
34,499
(7.89 %)
n/a 33.83
(100.00 %)
1
(0.00 %)
174
(100.00 %)
560,407
(20.53 %)
306,275
(8.15 %)
3,716,838
(44.45 %)
6,827
(0.40 %)
265 Magnolia sinica (HGM2019 2023)
GCF_029962835.1
69,307
(3.21 %)
14,466
(0.72 %)
84,219
(6.52 %)
n/a 40.18
(100.00 %)
73
(0.00 %)
127
(100.00 %)
1,415,484
(14.07 %)
1,154,832
(6.29 %)
10,231,412
(50.86 %)
107,342
(2.63 %)
266 maize
GCF_902167145.1
76,701
(3.66 %)
23,553
(1.55 %)
154,773
(10.70 %)
n/a 46.77
(99.83 %)
708
(0.17 %)
697
(100.00 %)
1,340,549
(78.65 %)
843,168
(5.20 %)
5,886,498
(69.23 %)
372,641
(31.10 %)
267 maize (2020)
GCA_905067065.1
n/a 23,433
(1.61 %)
150,853
(10.66 %)
n/a 46.83
(98.14 %)
56,163
(1.87 %)
56,173
(98.13 %)
581,502
(1.40 %)
753,129
(3.49 %)
5,867,216
(67.88 %)
377,414
(31.33 %)
268 maize (B104 2021)
GCA_910593975.1
n/a 23,680
(1.58 %)
153,453
(10.69 %)
n/a 46.83
(99.71 %)
1,223
(0.29 %)
697
(100.00 %)
593,292
(1.41 %)
805,647
(4.47 %)
5,887,178
(69.17 %)
370,755
(32.34 %)
269 maize (B73 2017)
GCA_000005005.6
n/a 23,511
(1.62 %)
151,975
(10.84 %)
n/a 46.87
(98.56 %)
2,523
(1.44 %)
3,128
(98.56 %)
1,308,956
(78.59 %)
771,560
(3.39 %)
5,850,966
(67.94 %)
367,973
(32.21 %)
270 maize (OH43 2020)
GCA_902167015.1
n/a 23,864
(1.57 %)
154,358
(10.67 %)
n/a 46.77
(99.88 %)
551
(0.12 %)
777
(100.00 %)
1,341,834
(78.70 %)
834,042
(5.01 %)
5,916,520
(69.26 %)
372,114
(32.08 %)
271 malo sina (v2 2021)
GCF_000231095.2
34,262
(16.98 %)
15,545
(6.13 %)
36,746
(24.10 %)
n/a 41.55
(100.00 %)
14
(0.00 %)
74
(100.00 %)
140,519
(2.59 %)
67,337
(3.89 %)
1,493,779
(29.32 %)
41,044
(18.43 %)
272 Manchurian ash (Dongfeng_Y6 2025)
GCA_050941835.1
n/a 21,875
(2.60 %)
65,892
(12.45 %)
n/a 34.37
(100.00 %)
n/a 23
(100.00 %)
1,378,182
(52.01 %)
240,241
(3.28 %)
5,127,474
(35.91 %)
18,208
(1.03 %)
273 mango
GCF_011075055.1
60,349
(16.06 %)
20,653
(5.13 %)
40,887
(15.20 %)
n/a 32.71
(99.98 %)
169
(0.02 %)
250
(100.00 %)
213,445
(3.09 %)
125,929
(3.29 %)
2,447,401
(32.63 %)
7,059
(0.98 %)
274 Tausch's goatgrass monocots
GCF_002575655.2
84,334
(2.18 %)
17,888
(0.44 %)
263,541
(10.26 %)
n/a 46.33
(97.97 %)
69,858
(2.04 %)
109,197
(100.00 %)
1,492,485
(15.65 %)
1,422,870
(5.39 %)
12,521,384
(71.80 %)
881,939
(30.07 %)
275 bulbous barley monocots (2017)
GCA_900070015.1
n/a 13,790
(0.81 %)
584,401
(17.92 %)
n/a 44.69
(99.26 %)
714,678
(0.49 %)
3,598,227
(99.51 %)
405,591
(2.31 %)
383,580
(1.94 %)
9,713,864
(28.00 %)
392,202
(11.97 %)
276 pearl millet monocots (2023)
GCA_947561735.1
n/a 17,702
(1.12 %)
131,056
(12.62 %)
n/a 49.54
(99.71 %)
154
(0.29 %)
161
(99.71 %)
2,363,767
(55.11 %)
562,150
(3.01 %)
6,046,063
(67.25 %)
78,069
(17.77 %)
277 least duckweed monocots (lm5633 2022)
GCA_024174645.1
n/a 10,209
(2.40 %)
33,920
(14.90 %)
n/a 39.23
(99.63 %)
2,722
(0.38 %)
2,381
(100.00 %)
339,295
(20.82 %)
149,186
(3.14 %)
1,958,662
(44.97 %)
37,690
(12.52 %)
278 coastal wild rice monocots (Oco-Bangladesh 2023)
GCA_030770085.1
n/a 22,601
(4.02 %)
78,799
(21.93 %)
n/a 42.06
(100.00 %)
13
(0.00 %)
450
(100.00 %)
708,554
(36.63 %)
97,691
(2.08 %)
2,711,269
(26.55 %)
87,312
(19.47 %)
279 mosses
GCF_000002425.4
55,044
(11.86 %)
8,425
(1.46 %)
30,452
(12.55 %)
n/a 33.69
(98.74 %)
2,645
(1.27 %)
359
(100.00 %)
454,786
(48.35 %)
241,826
(2.56 %)
2,413,326
(52.52 %)
22,664
(3.06 %)
280 mosses (Gransden 2004 2024)
GCA_000002425.3
n/a 8,471
(1.47 %)
30,401
(12.59 %)
n/a 33.71
(99.04 %)
1,792
(0.96 %)
357
(100.00 %)
296,167
(2.79 %)
242,589
(2.68 %)
2,405,125
(52.64 %)
22,652
(3.11 %)
281 mosses (MN 2022)
GCA_021442195.1
n/a 8,227
(1.65 %)
29,076
(15.54 %)
n/a 36.47
(99.90 %)
38
(0.10 %)
74
(99.90 %)
202,616
(2.17 %)
147,367
(3.31 %)
2,577,180
(28.93 %)
12,940
(1.51 %)
282 mosses (SZ-1 2022)
GCA_026122775.1
n/a 8,528
(1.45 %)
30,650
(12.43 %)
n/a 33.77
(100.00 %)
29
(0.00 %)
26
(100.00 %)
300,802
(2.82 %)
246,537
(2.86 %)
2,464,328
(53.57 %)
23,310
(3.24 %)
283 mulberry M.notabilis
GCF_000414095.1
29,893
(12.15 %)
14,092
(4.40 %)
37,376
(17.73 %)
n/a 34.86
(94.92 %)
15,541
(5.08 %)
46,842
(94.92 %)
317,532
(5.00 %)
190,192
(6.25 %)
2,095,631
(34.49 %)
20,490
(3.43 %)
284 mung bean (VC1973A 2015 refseq)
GCF_000741045.1
47,653
(11.89 %)
16,644
(3.87 %)
43,967
(14.67 %)
n/a 33.18
(92.80 %)
96,870
(7.24 %)
2,465
(100.00 %)
264,597
(3.31 %)
198,963
(3.34 %)
2,842,720
(34.86 %)
13,975
(1.49 %)
285 muskmelon (AY 2022)
GCF_025177605.1
47,062
(10.58 %)
13,502
(2.95 %)
32,332
(13.20 %)
n/a 36.06
(99.99 %)
239
(0.01 %)
1,310
(100.00 %)
282,171
(3.23 %)
229,959
(11.70 %)
2,016,709
(43.94 %)
18,232
(10.96 %)
286 muskmelon (DHL92 2012)
GCF_000313045.1
35,384
(11.55 %)
13,191
(3.74 %)
28,295
(11.09 %)
n/a 33.23
(89.51 %)
29,172
(10.51 %)
60,751
(89.49 %)
239,295
(7.85 %)
172,598
(3.17 %)
2,304,858
(33.21 %)
12,855
(1.38 %)
287 Nalta jute (JRO-524 2017)
GCA_002141455.1
n/a 15,450
(3.86 %)
57,930
(23.73 %)
n/a 36.82
(99.97 %)
n/a 52,373
(100.00 %)
189,007
(2.22 %)
129,697
(4.38 %)
1,872,307
(38.03 %)
11,963
(5.74 %)
288 narrow-leaf cattail (Huaian 2025)
GCF_048772165.1
35,080
(19.76 %)
14,109
(6.33 %)
27,978
(20.09 %)
n/a 37.69
(100.00 %)
n/a 15
(100.00 %)
124,433
(3.10 %)
69,868
(2.56 %)
1,208,522
(27.94 %)
21,007
(5.28 %)
289 narrow-leaved blue lupine
GCF_001865875.1
57,263
(9.83 %)
22,097
(3.53 %)
51,774
(13.22 %)
n/a 33.46
(99.34 %)
44,657
(0.68 %)
55,107
(99.32 %)
280,867
(4.25 %)
210,750
(5.67 %)
3,920,315
(38.10 %)
6,462
(0.46 %)
290 New South Wales waratah (Mountain lineage 2021)
GCF_018873765.1
44,477
(5.41 %)
16,928
(1.94 %)
77,682
(16.06 %)
n/a 40.12
(100.00 %)
2,037
(0.00 %)
1,289
(100.00 %)
437,997
(2.33 %)
266,149
(5.08 %)
4,764,252
(34.25 %)
20,667
(1.81 %)
291 opium poppy
GCF_003573695.1
127,893
(4.57 %)
25,532
(0.85 %)
162,032
(9.31 %)
n/a 37.28
(99.80 %)
31,183
(0.20 %)
34,381
(100.00 %)
819,294
(1.49 %)
1,050,181
(6.80 %)
10,625,631
(55.85 %)
67,521
(1.21 %)
292 orchid D.catenatum
GCF_001605985.2
39,386
(3.85 %)
12,208
(0.99 %)
72,906
(8.22 %)
n/a 34.70
(96.03 %)
25,751
(3.92 %)
311,841
(96.08 %)
506,361
(2.45 %)
413,770
(3.23 %)
8,074,114
(39.07 %)
56,900
(2.34 %)
293 orchid P.equestris
GCF_001263595.1
32,146
(3.36 %)
11,541
(1.01 %)
54,049
(6.11 %)
n/a 34.46
(92.46 %)
98,814
(7.56 %)
188,398
(92.44 %)
487,071
(2.96 %)
511,903
(4.00 %)
7,060,408
(42.20 %)
31,179
(1.22 %)
294 Pacific Island silvergrass (M001 2021)
GCF_019320115.1
120,534
(4.81 %)
39,902
(1.95 %)
276,967
(16.36 %)
n/a 45.32
(99.56 %)
4,932
(0.44 %)
2,420
(100.00 %)
764,083
(1.38 %)
810,723
(3.95 %)
11,118,925
(53.40 %)
520,091
(23.03 %)
295 papaya
GCF_000150535.2
29,883
(11.99 %)
12,860
(4.47 %)
24,403
(11.58 %)
n/a 35.31
(73.55 %)
29,719
(26.47 %)
47,485
(73.53 %)
260,082
(34.69 %)
101,644
(3.59 %)
1,640,647
(28.88 %)
21,200
(2.95 %)
296 papaya (Sunset 2022)
GCA_022788785.1
n/a 13,725
(4.02 %)
25,348
(10.65 %)
n/a 36.01
(99.88 %)
337
(0.12 %)
67
(100.00 %)
385,123
(61.33 %)
131,783
(9.99 %)
2,029,883
(43.40 %)
25,597
(4.44 %)
297 patchouli (Gaoche1L2016 2018)
GCA_003675935.1
n/a 43,905
(2.21 %)
174,920
(14.40 %)
n/a 35.02
(93.97 %)
170,266
(6.06 %)
211,964
(93.94 %)
1,021,699
(2.86 %)
1,125,321
(8.02 %)
9,388,626
(47.60 %)
102,661
(4.26 %)
298 patchouli (shipai S1-5 2022)
GCA_023678885.1
n/a 47,432
(2.32 %)
168,583
(12.17 %)
n/a 34.43
(99.98 %)
764
(0.02 %)
966
(100.00 %)
2,043,616
(19.48 %)
1,147,892
(9.18 %)
9,501,180
(53.37 %)
110,140
(2.86 %)
299 peach
GCF_000346465.2
36,201
(20.87 %)
14,368
(6.26 %)
32,245
(24.09 %)
n/a 37.51
(98.79 %)
2,368
(1.22 %)
2,531
(98.78 %)
150,957
(10.06 %)
96,381
(5.52 %)
1,221,263
(28.72 %)
7,885
(2.07 %)
300 peanut
GCF_003086295.2
155,835
(5.15 %)
31,810
(1.19 %)
160,574
(8.81 %)
n/a 36.33
(99.85 %)
3,655
(0.15 %)
385
(100.00 %)
1,684,814
(3.52 %)
1,488,297
(4.81 %)
11,059,688
(62.32 %)
140,570
(2.45 %)
301 peanut (GDAAS-fuhuasheng2018 2019)
GCA_004170445.1
n/a 31,065
(1.17 %)
158,578
(8.79 %)
n/a 36.33
(98.97 %)
32,692
(1.04 %)
29
(100.00 %)
1,735,218
(3.66 %)
1,490,806
(4.26 %)
11,072,983
(61.75 %)
138,890
(2.46 %)
302 peanut (Tifrunner 2023)
GCF_003086295.3
173,169
(5.54 %)
31,897
(1.19 %)
160,532
(8.81 %)
n/a 36.33
(99.85 %)
3,697
(0.15 %)
443
(100.00 %)
1,676,149
(3.49 %)
1,489,126
(4.81 %)
11,105,477
(62.30 %)
140,609
(2.45 %)
303 pear (primary hap 2023)
GCF_963583255.1
48,939
(13.04 %)
22,082
(4.44 %)
56,235
(17.69 %)
n/a 37.45
(99.99 %)
145
(0.01 %)
176
(99.99 %)
289,539
(2.54 %)
223,443
(3.84 %)
2,308,351
(35.91 %)
19,559
(2.15 %)
304 pearl millet (Tift 23D2B1-P1-P5 2018)
GCA_002174835.2
n/a 17,949
(1.26 %)
134,829
(14.30 %)
n/a 47.95
(86.95 %)
156,852
(13.08 %)
52,033
(100.00 %)
380,858
(1.16 %)
466,997
(2.83 %)
5,117,134
(56.89 %)
380,989
(29.47 %)
305 pecan
GCF_018687715.1
71,340
(9.93 %)
18,671
(2.67 %)
60,632
(15.16 %)
n/a 36.30
(99.97 %)
22
(0.03 %)
39
(99.97 %)
473,853
(3.66 %)
367,846
(6.75 %)
3,301,121
(39.03 %)
27,274
(2.22 %)
306 pepperwort (EHA205 2019)
GCA_009757365.2
n/a 19,770
(7.79 %)
48,832
(21.86 %)
n/a 34.40
(96.79 %)
105,378
(3.36 %)
146,054
(96.64 %)
298,974
(31.14 %)
68,767
(2.63 %)
1,422,489
(26.49 %)
6,844
(1.17 %)
307 perennial ryegrass (Kyuss_39 2021)
GCF_019359855.1
89,789
(3.75 %)
17,693
(0.79 %)
174,787
(12.15 %)
n/a 44.32
(100.00 %)
238
(0.00 %)
1,677
(100.00 %)
605,852
(1.36 %)
760,915
(5.68 %)
5,216,229
(69.24 %)
542,998
(24.23 %)
308 perennial ryegrass (Kyuss_39 2024)
GCF_019359855.2
81,335
(3.75 %)
17,678
(0.79 %)
172,584
(12.06 %)
n/a 44.29
(100.00 %)
61
(0.00 %)
105
(100.00 %)
610,404
(1.37 %)
758,029
(5.51 %)
5,039,192
(69.30 %)
542,208
(23.92 %)
309 Peruvian cotton (G.raimondii 2012 DOE)
GCF_000327365.2
72,518
(8.99 %)
20,368
(2.64 %)
52,295
(10.15 %)
n/a 33.21
(98.25 %)
19,685
(1.76 %)
20,680
(98.24 %)
404,885
(2.81 %)
300,062
(3.31 %)
5,198,170
(40.84 %)
10,912
(0.59 %)
310 Peruvian cotton (GPD5lz 2022)
GCF_025698545.1
63,582
(8.69 %)
20,265
(2.62 %)
51,815
(10.02 %)
n/a 33.24
(100.00 %)
79
(0.00 %)
289
(100.00 %)
405,385
(2.83 %)
306,302
(3.81 %)
5,192,105
(41.79 %)
10,481
(0.65 %)
311 Phtheirospermum japonicum (okayama 2020)
GCA_014905375.1
n/a 15,868
(1.22 %)
104,104
(13.39 %)
n/a 36.03
(91.65 %)
318,321
(8.39 %)
328,880
(91.61 %)
810,727
(3.49 %)
710,744
(4.84 %)
7,339,863
(41.43 %)
104,967
(3.98 %)
312 pigeon pea (v2 2016 BGI)
GCF_000340665.2
46,412
(9.42 %)
17,396
(3.13 %)
49,710
(12.66 %)
n/a 32.76
(94.18 %)
36,323
(5.83 %)
67,834
(94.17 %)
395,663
(3.40 %)
306,602
(4.71 %)
3,749,364
(39.19 %)
26,504
(2.90 %)
313 pineapple
GCF_001540865.1
43,025
(11.65 %)
13,649
(3.36 %)
38,917
(14.95 %)
n/a 38.34
(98.23 %)
25,542
(1.78 %)
3,129
(100.00 %)
352,802
(7.31 %)
274,578
(4.75 %)
2,360,455
(38.94 %)
56,724
(11.73 %)
314 pink shepherd's-purse
GCF_000375325.1
37,318
(33.25 %)
22,836
(23.08 %)
26,822
(33.93 %)
n/a 35.63
(97.53 %)
6,294
(2.49 %)
7,067
(97.51 %)
74,470
(2.42 %)
42,509
(3.39 %)
814,442
(24.99 %)
5,817
(2.14 %)
315 pistachio
GCF_008641045.1
47,948
(7.92 %)
18,462
(2.58 %)
62,898
(14.05 %)
n/a 35.95
(99.84 %)
16,367
(0.16 %)
1,865
(100.00 %)
363,793
(2.43 %)
253,408
(4.08 %)
4,200,417
(36.34 %)
22,340
(1.78 %)
316 pocket water lily (Beijing-Zhang1983 2022)
GCF_008831285.2
41,223
(10.98 %)
11,576
(2.50 %)
38,220
(15.70 %)
n/a 38.61
(99.84 %)
626
(0.16 %)
1,409
(99.84 %)
236,190
(2.95 %)
153,746
(4.02 %)
2,151,579
(26.72 %)
24,561
(4.48 %)
317 pomegranate
GCF_007655135.1
43,277
(14.87 %)
14,635
(4.26 %)
39,381
(19.97 %)
n/a 40.38
(99.99 %)
188
(0.01 %)
474
(100.00 %)
173,182
(2.28 %)
174,872
(6.81 %)
1,640,973
(32.89 %)
26,506
(9.18 %)
318 potato S.stenotomum (F172 2021)
GCF_019186545.1
43,754
(6.67 %)
16,547
(2.25 %)
54,186
(11.30 %)
n/a 34.71
(88.41 %)
37,060
(11.60 %)
17,084
(100.00 %)
321,938
(2.14 %)
250,793
(4.04 %)
5,136,691
(33.92 %)
8,536
(0.30 %)
319 potato S.tuberosum (alt pseudohaplotype RH89-039-16 2020)
GCA_014189305.1
n/a 16,861
(1.98 %)
58,882
(12.19 %)
n/a 35.40
(99.95 %)
4,397
(0.05 %)
3,012
(100.00 %)
774,417
(46.83 %)
392,378
(8.45 %)
5,068,449
(42.72 %)
14,548
(1.32 %)
320 potato S.tuberosum (Dihaploid 'C-13' 2020)
GCA_010127505.1
n/a 17,614
(2.86 %)
45,684
(10.75 %)
n/a 34.49
(83.57 %)
10,041,161
(17.84 %)
12
(100.00 %)
606,573
(40.80 %)
168,871
(2.58 %)
5,508,800
(26.36 %)
5,550
(0.22 %)
321 potato S.tuberosum (DM 1-3 516 R44 2011)
GCF_000226075.1
43,158
(7.63 %)
16,423
(2.55 %)
50,333
(11.79 %)
n/a 34.83
(93.98 %)
45,215
(6.04 %)
60,069
(93.96 %)
662,626
(43.42 %)
212,315
(4.38 %)
4,691,843
(34.91 %)
9,851
(0.45 %)
322 potato S.tuberosum (hap 1 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169555.1
n/a 16,415
(2.15 %)
54,766
(12.48 %)
n/a 35.21
(99.98 %)
1,476
(0.02 %)
25
(100.00 %)
329,233
(2.28 %)
285,101
(5.66 %)
4,832,189
(40.28 %)
12,944
(0.99 %)
323 potato S.tuberosum (hap 2 of 4 Otava Stieglitz 2021)
GCA_020169535.1
n/a 16,694
(2.26 %)
53,990
(12.60 %)
n/a 35.20
(99.98 %)
1,499
(0.02 %)
28
(100.00 %)
323,447
(2.25 %)
283,098
(5.39 %)
4,727,964
(39.87 %)
12,316
(1.34 %)
324 potato S.tuberosum (hap 3 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169585.1
n/a 16,713
(2.23 %)
54,380
(12.60 %)
n/a 35.20
(99.98 %)
1,299
(0.02 %)
27
(100.00 %)
329,807
(2.31 %)
282,372
(6.11 %)
4,718,807
(40.25 %)
11,812
(1.00 %)
325 potato S.tuberosum (hap 4 of 4 Otava Hera 2021)
GCA_020169575.1
n/a 16,640
(2.18 %)
54,937
(12.38 %)
n/a 35.18
(99.98 %)
1,383
(0.02 %)
26
(100.00 %)
329,665
(2.30 %)
285,993
(6.03 %)
4,858,802
(40.32 %)
12,792
(1.32 %)
326 potato S.tuberosum (RH89-039-16 2020)
GCA_014189475.1
n/a 16,312
(2.05 %)
54,438
(12.18 %)
n/a 35.23
(99.95 %)
4,448
(0.05 %)
12
(100.00 %)
730,464
(46.17 %)
338,389
(7.95 %)
4,903,557
(41.90 %)
12,226
(0.72 %)
327 potato S.verrucosum (2019)
GCF_900185275.1
35,846
(6.75 %)
16,408
(2.54 %)
48,924
(11.75 %)
n/a 34.59
(99.55 %)
1,612
(0.45 %)
1,332
(100.00 %)
297,683
(2.31 %)
234,616
(4.68 %)
4,308,149
(38.02 %)
8,192
(0.47 %)
328 Primulina tabacum (GXHZ01 2022)
GCF_025594145.1
69,821
(7.75 %)
19,604
(2.27 %)
61,800
(12.08 %)
n/a 36.89
(99.89 %)
1,710
(0.11 %)
541
(100.00 %)
310,321
(1.81 %)
229,404
(3.84 %)
4,409,199
(51.65 %)
40,094
(1.87 %)
329 proso millet (2018)
GCA_003046395.2
n/a 31,203
(4.33 %)
106,251
(25.92 %)
n/a 46.82
(98.02 %)
4,232
(1.98 %)
1,306
(100.00 %)
252,710
(1.48 %)
176,920
(3.16 %)
3,051,223
(41.53 %)
159,364
(32.38 %)
330 quinoa
GCF_001683475.1
74,918
(7.49 %)
22,914
(1.61 %)
105,619
(12.97 %)
n/a 36.87
(99.16 %)
725
(0.84 %)
3,487
(100.00 %)
810,277
(3.58 %)
762,903
(10.88 %)
6,551,884
(49.49 %)
93,630
(2.98 %)
331 radish (v2 WK10039 2023)
GCF_000801105.2
80,681
(20.53 %)
36,039
(9.58 %)
74,081
(26.98 %)
n/a 36.00
(99.94 %)
2,853
(0.06 %)
6,424
(100.00 %)
224,524
(2.48 %)
193,525
(5.49 %)
2,234,480
(35.04 %)
25,972
(4.13 %)
332 rape (Da-Ae 2021)
GCF_020379485.1
152,744
(19.27 %)
57,668
(6.87 %)
143,092
(23.51 %)
n/a 37.13
(99.99 %)
840
(0.01 %)
3,167
(100.00 %)
470,302
(2.29 %)
578,281
(9.24 %)
4,662,467
(42.41 %)
64,287
(5.62 %)
333 rape (ZS11 2017)
GCF_000686985.2
144,991
(17.51 %)
59,743
(7.71 %)
146,391
(26.97 %)
n/a 36.47
(92.96 %)
32,639
(7.05 %)
34,110
(92.95 %)
449,257
(2.67 %)
441,269
(5.84 %)
4,867,601
(32.91 %)
60,082
(3.53 %)
334 red clover eudicots (HEN17-A07 2021)
GCF_020283565.1
63,238
(17.01 %)
17,857
(4.13 %)
43,079
(17.27 %)
n/a 33.71
(99.97 %)
231
(0.03 %)
90
(100.00 %)
241,481
(2.65 %)
187,674
(4.85 %)
2,251,582
(37.03 %)
6,474
(1.93 %)
335 red sage (Shanhuang shh 2023)
GCF_028751815.1
62,715
(12.27 %)
15,176
(2.61 %)
67,175
(21.50 %)
n/a 37.47
(99.58 %)
695
(0.42 %)
173
(100.00 %)
377,231
(3.52 %)
364,027
(5.05 %)
2,679,528
(42.07 %)
64,243
(6.17 %)
336 red wild einkorn wheat (G1812 2018)
GCF_003073215.2
71,160
(1.59 %)
18,911
(0.39 %)
321,741
(10.16 %)
n/a 45.91
(99.38 %)
33,814
(0.62 %)
10,205
(100.00 %)
1,208,165
(1.25 %)
1,319,817
(2.96 %)
15,480,313
(71.93 %)
975,234
(26.52 %)
337 redroot sage (bh2-7 2020)
GCA_016432925.1
n/a 15,208
(2.55 %)
68,573
(21.07 %)
n/a 37.68
(99.37 %)
2,815
(0.63 %)
1,118
(100.00 %)
628,541
(17.44 %)
380,078
(5.18 %)
2,710,697
(43.28 %)
66,987
(6.29 %)
338 Rhododendron vialii eudicots (Sample 1 2023)
GCF_030253575.1
62,168
(11.90 %)
15,363
(2.73 %)
54,203
(18.86 %)
n/a 39.52
(100.00 %)
5
(0.00 %)
18
(100.00 %)
253,965
(2.10 %)
235,379
(9.36 %)
2,668,584
(34.08 %)
31,789
(3.72 %)
339 rice bean (VRB3 2023)
GCA_029865625.1
n/a 18,823
(3.07 %)
63,430
(18.52 %)
n/a 34.56
(96.54 %)
4,440
(3.46 %)
232
(100.00 %)
1,016,591
(59.80 %)
384,326
(8.33 %)
3,318,479
(40.76 %)
30,562
(3.41 %)
340 rice bean eudicots (VRB-3 Himshakti 2021)
GCF_018835915.1
38,736
(11.89 %)
16,669
(4.18 %)
43,369
(14.64 %)
n/a 32.90
(93.47 %)
20,717
(6.53 %)
15,445
(100.00 %)
233,635
(3.33 %)
204,141
(4.85 %)
2,682,022
(32.58 %)
16,828
(2.07 %)
341 riverbank grape
GCF_004353265.1
44,851
(10.22 %)
15,302
(3.01 %)
46,011
(14.96 %)
n/a 34.32
(98.79 %)
1,095
(1.21 %)
175
(100.00 %)
339,984
(3.03 %)
233,259
(4.71 %)
2,925,914
(35.27 %)
11,055
(0.93 %)
342 robusta coffee (DH200=94 2014)
GCA_900059795.1
n/a 13,770
(2.74 %)
46,992
(16.51 %)
n/a 36.65
(82.89 %)
12,714
(17.11 %)
25,216
(82.89 %)
219,723
(2.15 %)
140,449
(2.62 %)
2,590,105
(28.19 %)
12,700
(1.66 %)
343 rose gum (2021)
GCF_016545825.1
54,676
(10.44 %)
16,291
(2.42 %)
69,492
(17.92 %)
n/a 39.39
(99.97 %)
1,712
(0.03 %)
37
(100.00 %)
358,171
(2.83 %)
259,031
(3.65 %)
3,353,128
(29.52 %)
78,731
(7.66 %)
344 rose gum (BRASUZ1 2014)
GCF_000612305.1
65,107
(11.08 %)
16,389
(2.33 %)
74,557
(18.16 %)
n/a 39.28
(92.69 %)
27,773
(7.32 %)
32,724
(92.68 %)
357,835
(2.50 %)
266,806
(3.22 %)
3,496,176
(27.34 %)
79,393
(6.54 %)
345 rose of Sharon
GCF_006381635.1
91,942
(5.18 %)
44,363
(2.23 %)
136,768
(10.14 %)
n/a 34.23
(100.00 %)
2
(0.00 %)
1,789
(100.00 %)
889,945
(2.72 %)
968,890
(4.91 %)
9,836,479
(51.73 %)
42,560
(0.89 %)
346 rubber tree (MT/VB/25A 57/8 2023)
GCF_030052815.1
71,258
(4.21 %)
22,208
(1.24 %)
63,302
(5.13 %)
n/a 34.70
(91.68 %)
1,428
(8.32 %)
755
(100.00 %)
1,078,590
(2.96 %)
730,314
(3.70 %)
6,031,831
(65.59 %)
24,263
(0.70 %)
347 rubber tree (reyan7-33-97 2016)
GCF_001654055.1
66,124
(5.23 %)
22,033
(1.63 %)
59,727
(6.42 %)
n/a 34.84
(94.20 %)
40,863
(5.81 %)
7,453
(100.00 %)
827,088
(3.02 %)
565,394
(5.23 %)
5,065,470
(61.59 %)
13,573
(0.45 %)
348 S.splendens huo1 eudicots (BFU 2021)
GCF_004379255.1
94,414
(12.61 %)
31,218
(3.57 %)
108,219
(21.49 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
471
(0.00 %)
1,178
(100.00 %)
360,314
(2.17 %)
419,051
(4.85 %)
3,875,932
(41.07 %)
105,227
(10.14 %)
349 sacred lotus
GCF_000365185.1
43,140
(7.01 %)
15,920
(2.13 %)
61,231
(13.11 %)
n/a 38.30
(87.98 %)
175,846
(12.06 %)
58,428
(87.96 %)
408,351
(2.83 %)
275,384
(2.52 %)
4,643,876
(30.20 %)
40,599
(2.68 %)
350 saltwater cress
GCF_000478725.1
38,705
(18.07 %)
21,851
(11.68 %)
39,487
(28.65 %)
n/a 37.71
(98.09 %)
3,020
(1.92 %)
3,658
(98.08 %)
102,162
(1.93 %)
70,755
(3.25 %)
1,162,538
(32.09 %)
15,272
(3.87 %)
351 sandblossoms (Phelan CA IGA184 alternate hap 2022)
GCA_023055565.1
n/a 14,138
(0.74 %)
125,370
(12.27 %)
n/a 40.18
(100.00 %)
149
(0.00 %)
581
(100.00 %)
655,331
(1.73 %)
500,899
(4.88 %)
7,172,490
(54.24 %)
140,800
(5.87 %)
352 sandblossoms (Phelan CA IGA184 primary hap 2022)
GCA_023055425.1
n/a 15,588
(0.93 %)
117,831
(12.94 %)
n/a 40.08
(100.00 %)
85
(0.00 %)
123
(100.00 %)
597,532
(1.81 %)
430,194
(3.80 %)
6,075,115
(49.91 %)
129,512
(5.41 %)
353 scarlet sage (huo1 2021)
GCF_004379255.2
94,251
(12.60 %)
31,266
(3.58 %)
108,141
(21.47 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
471
(0.00 %)
1,162
(100.00 %)
357,482
(2.10 %)
419,009
(4.86 %)
3,874,047
(41.08 %)
105,216
(10.11 %)
354 scented satinash
GCF_900635055.1
42,531
(12.21 %)
15,353
(3.67 %)
53,811
(20.61 %)
n/a 40.64
(89.65 %)
11,862
(10.35 %)
19,039
(100.00 %)
179,421
(2.10 %)
174,902
(3.34 %)
1,785,894
(25.35 %)
55,685
(7.69 %)
355 sesame
GCF_000512975.1
38,693
(16.95 %)
15,555
(5.41 %)
35,316
(19.66 %)
n/a 35.00
(98.34 %)
9,940
(1.66 %)
26,176
(98.34 %)
161,123
(2.85 %)
79,750
(3.97 %)
1,807,029
(31.02 %)
9,873
(1.80 %)
356 shrubby jointvetch A. evenia (CIAT22838 2020)
GCA_013621005.1
n/a 16,242
(4.30 %)
39,583
(17.06 %)
n/a 35.22
(98.66 %)
2,946
(1.35 %)
1,451
(100.00 %)
253,228
(3.98 %)
186,657
(9.89 %)
1,792,662
(45.14 %)
19,928
(3.29 %)
357 silver malletwood (14919 2019)
GCF_900635035.1
46,475
(12.62 %)
17,469
(4.11 %)
51,531
(21.75 %)
n/a 40.30
(93.72 %)
7,529
(6.28 %)
15,781
(100.00 %)
194,855
(2.07 %)
116,828
(2.25 %)
1,801,472
(25.38 %)
44,191
(5.74 %)
358 silver malletwood (NSW1041297 2021)
GCF_020921035.1
43,419
(12.78 %)
14,758
(4.01 %)
41,180
(19.74 %)
n/a 40.38
(100.00 %)
36
(0.00 %)
75
(100.00 %)
160,749
(1.91 %)
114,741
(3.07 %)
1,619,569
(28.25 %)
43,290
(7.15 %)
359 silver poplar
GCF_005239225.1
53,066
(14.64 %)
20,299
(4.74 %)
44,556
(16.36 %)
n/a 33.75
(100.00 %)
n/a 1,287
(100.00 %)
309,097
(3.34 %)
175,288
(4.77 %)
2,457,634
(38.38 %)
4,613
(0.67 %)
360 silverweed cinquefoil (primary hap 2022)
GCF_933775445.1
28,734
(15.21 %)
13,143
(5.29 %)
32,007
(22.39 %)
n/a 37.81
(100.00 %)
8
(0.00 %)
147
(100.00 %)
89,958
(1.86 %)
351,649
(15.29 %)
884,646
(35.58 %)
14,711
(4.52 %)
361 sorghum (BTx623 2017)
GCF_000003195.3
48,290
(8.57 %)
17,901
(3.45 %)
73,969
(19.64 %)
n/a 43.88
(95.30 %)
3,906
(4.70 %)
4,775
(95.30 %)
556,607
(65.39 %)
177,271
(4.54 %)
2,371,199
(48.20 %)
110,115
(18.82 %)
362 sorghum (Tx430 2018)
GCA_003482435.1
n/a 18,138
(3.63 %)
75,180
(20.67 %)
n/a 43.67
(97.96 %)
2,108
(2.04 %)
308
(100.00 %)
559,950
(63.17 %)
156,952
(3.01 %)
2,481,716
(46.70 %)
109,923
(19.06 %)
363 soybean (EMBRAPA BRS 537 2021)
GCA_012273815.2
n/a 27,746
(3.01 %)
77,617
(11.66 %)
n/a 34.80
(97.95 %)
340
(2.05 %)
95
(100.00 %)
1,182,211
(56.35 %)
444,701
(6.81 %)
5,365,860
(45.98 %)
35,684
(1.48 %)
364 soybean (US DOE JGI-PGF v2 2021)
GCF_000004515.6
88,006
(9.87 %)
27,705
(3.08 %)
77,033
(11.88 %)
n/a 34.74
(97.36 %)
8,918
(2.65 %)
9,199
(97.35 %)
848,398
(38.02 %)
434,042
(5.29 %)
5,346,884
(45.07 %)
35,893
(1.55 %)
365 soybean (Williams 82 2023)
GCA_030864155.1
n/a 27,960
(2.93 %)
77,762
(11.36 %)
n/a 35.02
(100.00 %)
n/a 20
(100.00 %)
549,577
(2.73 %)
453,208
(9.60 %)
5,325,393
(48.31 %)
36,641
(1.53 %)
366 spider flower
GCF_000463585.1
45,524
(22.00 %)
21,103
(10.40 %)
38,184
(27.17 %)
n/a 39.40
(87.71 %)
24,824
(12.32 %)
37,073
(87.68 %)
144,827
(3.22 %)
103,970
(4.10 %)
1,118,840
(31.64 %)
29,313
(6.47 %)
367 spinach (Sp75 2017)
GCF_002007265.1
41,411
(5.75 %)
12,540
(1.38 %)
68,522
(12.26 %)
n/a 37.82
(95.53 %)
137,086
(4.48 %)
78,263
(100.00 %)
374,336
(2.48 %)
670,331
(6.78 %)
3,213,561
(52.82 %)
89,520
(4.54 %)
368 spinach (Varoflay 2021)
GCF_020520425.1
58,433
(7.11 %)
12,431
(1.27 %)
61,084
(11.35 %)
n/a 37.89
(100.00 %)
63
(0.00 %)
246
(100.00 %)
378,521
(2.27 %)
722,814
(6.29 %)
2,950,586
(58.17 %)
92,256
(5.21 %)
369 spotted monkey flower
GCF_000504015.1
34,441
(15.56 %)
14,508
(4.41 %)
34,904
(18.83 %)
n/a 35.50
(93.50 %)
15,528
(6.52 %)
17,740
(93.48 %)
227,143
(4.28 %)
204,234
(11.85 %)
1,776,879
(40.60 %)
21,718
(3.89 %)
370 spreading earthmoss (2024)
GCF_000002425.5
52,765
(10.63 %)
8,496
(1.48 %)
30,423
(12.59 %)
n/a 33.71
(99.04 %)
1,794
(0.96 %)
359
(100.00 %)
293,130
(2.79 %)
242,633
(2.68 %)
2,405,680
(52.61 %)
22,672
(3.11 %)
371 stiff brome
GCF_000005505.3
47,531
(20.35 %)
15,530
(6.01 %)
45,735
(34.29 %)
n/a 46.40
(99.84 %)
27
(0.16 %)
36
(99.84 %)
108,976
(17.41 %)
54,391
(1.94 %)
1,197,052
(21.34 %)
48,209
(34.43 %)
372 strawberry (Benihoppe 2023)
GCA_034370585.1
n/a 45,858
(5.68 %)
123,100
(24.81 %)
n/a 39.34
(100.00 %)
n/a 28
(100.00 %)
934,221
(35.80 %)
376,936
(6.46 %)
3,304,328
(31.01 %)
69,530
(5.73 %)
373 strawberry (Reikou 2013)
GCA_000511835.1
n/a 15,045
(1.35 %)
164,045
(15.16 %)
n/a 38.82
(94.24 %)
89,898
(5.63 %)
714,282
(94.37 %)
278,640
(1.91 %)
388,660
(6.94 %)
3,639,568
(28.92 %)
64,180
(3.80 %)
374 sugarcane (2018)
GCA_900465005.1
n/a 18,847
(4.51 %)
76,529
(27.07 %)
n/a 45.11
(99.96 %)
1,423
(0.03 %)
7,128
(99.97 %)
258,594
(29.31 %)
144,716
(2.51 %)
1,976,510
(35.41 %)
113,324
(26.96 %)
375 sugarcane (CC_01_1940 2021)
GCA_020102875.1
n/a 25,299
(3.45 %)
146,261
(29.51 %)
n/a 45.01
(99.92 %)
7,046
(0.08 %)
35,074
(100.00 %)
302,307
(1.66 %)
272,248
(3.71 %)
4,068,281
(29.60 %)
204,656
(25.44 %)
376 sugarcane (SP80-3280 WGSA1 2019)
GCA_008692665.1
n/a 78,903
(2.31 %)
756,432
(27.56 %)
n/a 43.71
(99.98 %)
36
(0.00 %)
398,389
(100.00 %)
1,981,854
(25.32 %)
926,250
(3.55 %)
15,903,748
(41.06 %)
829,054
(16.97 %)
377 sweet cherry
GCF_002207925.1
39,968
(19.06 %)
15,007
(5.83 %)
38,107
(23.61 %)
n/a 37.72
(90.64 %)
22,628
(9.39 %)
10,148
(100.00 %)
136,700
(2.47 %)
104,376
(7.20 %)
1,484,591
(25.20 %)
9,956
(2.27 %)
378 sweet cherry (Tieton 2020)
GCA_014155035.1
n/a 15,140
(4.31 %)
39,977
(20.09 %)
n/a 38.44
(99.98 %)
2,194
(0.02 %)
61
(100.00 %)
189,726
(2.51 %)
150,018
(21.96 %)
1,231,274
(44.86 %)
12,897
(3.14 %)
379 sweet orange
GCF_000317415.1
46,820
(15.94 %)
14,390
(4.63 %)
34,480
(18.04 %)
n/a 34.07
(91.90 %)
12,539
(8.11 %)
17,383
(91.89 %)
185,212
(2.95 %)
104,182
(4.92 %)
2,119,183
(29.53 %)
6,540
(0.93 %)
380 sweet potato (Taizhong6 2017)
GCA_002525835.2
n/a 23,319
(2.45 %)
98,107
(18.19 %)
n/a 35.14
(88.01 %)
171,925
(12.06 %)
28,461
(100.00 %)
579,745
(3.87 %)
473,175
(3.79 %)
4,850,126
(32.44 %)
52,715
(3.15 %)
381 sweet wormwood (Huhao1# 2018)
GCA_003112345.1
n/a 22,279
(1.15 %)
121,694
(10.54 %)
n/a 35.34
(91.81 %)
275,710
(8.22 %)
314,564
(91.78 %)
856,470
(2.64 %)
970,252
(5.69 %)
7,570,175
(42.39 %)
29,072
(0.54 %)
382 switchgrass
GCF_016808335.1
114,876
(10.54 %)
31,534
(3.21 %)
152,844
(27.54 %)
n/a 46.79
(99.59 %)
464
(0.41 %)
1,091
(99.59 %)
395,905
(1.77 %)
323,173
(5.10 %)
4,922,182
(39.47 %)
213,249
(32.45 %)
383 Tartarian buckwheat (Pinku1 2017)
GCA_002319775.1
n/a 15,605
(2.84 %)
50,437
(14.57 %)
n/a 38.53
(96.71 %)
2,456
(3.29 %)
7,020
(100.00 %)
257,784
(2.74 %)
211,756
(3.88 %)
2,209,417
(41.80 %)
54,125
(5.80 %)
384 Tasmanian pepperberry (RefF3 2024)
GCF_043159265.1
65,925
(7.32 %)
16,247
(1.53 %)
76,786
(13.23 %)
n/a 39.37
(100.00 %)
n/a 1,338
(100.00 %)
1,968,661
(26.22 %)
626,214
(13.70 %)
4,298,324
(45.52 %)
32,932
(4.92 %)
385 thale cress (Landsberg erecta 2016)
GCA_001651475.1
n/a 26,053
(33.97 %)
25,713
(36.19 %)
n/a 36.01
(98.51 %)
3,479
(1.50 %)
30
(100.00 %)
65,429
(14.19 %)
24,979
(1.85 %)
739,651
(21.49 %)
4,443
(1.81 %)
386 thale cress (tair10.1 Columbia 2018)
GCF_000001735.4
53,852
(40.10 %)
26,582
(34.47 %)
11,416
(18.70 %)
n/a 36.06
(99.85 %)
357
(0.16 %)
7
(100.00 %)
68,517
(16.50 %)
27,064
(2.77 %)
749,005
(22.64 %)
4,601
(1.63 %)
387 thunder duke vine
GCF_013401445.1
56,436
(17.59 %)
20,174
(5.61 %)
42,326
(19.85 %)
n/a 37.58
(99.96 %)
146
(0.04 %)
321
(100.00 %)
125,395
(2.23 %)
102,179
(22.89 %)
1,226,273
(38.50 %)
6,893
(1.71 %)
388 tobacco N.attenuata
GCF_001879085.1
50,668
(2.79 %)
17,479
(0.82 %)
117,543
(8.63 %)
n/a 40.23
(88.38 %)
119,817
(11.63 %)
37,194
(100.00 %)
622,838
(1.51 %)
788,520
(3.46 %)
11,822,060
(48.66 %)
174,838
(3.17 %)
389 tobacco N.tomentosiformis
GCF_000390325.2
66,966
(3.67 %)
17,141
(1.02 %)
81,513
(6.82 %)
n/a 38.89
(97.29 %)
213,074
(2.72 %)
215,609
(97.29 %)
486,556
(1.53 %)
669,040
(5.52 %)
10,446,746
(53.83 %)
118,807
(2.33 %)
390 tomato (2024)
GCF_036512215.1
59,947
(8.20 %)
15,474
(1.94 %)
40,638
(7.50 %)
n/a 35.17
(99.99 %)
166
(0.01 %)
14
(100.00 %)
333,077
(2.31 %)
259,232
(7.09 %)
5,402,596
(43.04 %)
31,740
(4.85 %)
391 tomato (Micro-Tom 2020)
GCA_012431665.1
n/a 15,607
(2.04 %)
39,981
(7.57 %)
n/a 34.32
(97.69 %)
1,323
(2.31 %)
391
(100.00 %)
433,628
(20.28 %)
248,928
(3.94 %)
5,440,564
(39.72 %)
31,891
(1.72 %)
392 tomato (Micro-Tom S9 2023)
GCA_030162295.1
n/a 15,496
(2.07 %)
38,799
(7.36 %)
n/a 34.40
(98.25 %)
32,234
(1.76 %)
165
(100.00 %)
1,028,324
(71.24 %)
249,749
(4.56 %)
5,384,286
(39.87 %)
27,343
(1.53 %)
393 tomato (v3.1 Heinz 1706 2018)
GCF_000188115.5
45,958
(6.93 %)
15,425
(2.15 %)
38,319
(7.54 %)
n/a 34.12
(90.19 %)
19,539
(9.82 %)
3,066
(100.00 %)
311,852
(2.14 %)
229,773
(3.18 %)
5,390,626
(35.26 %)
25,196
(1.27 %)
394 toyon (HeAr 88 alternate hap 2022)
GCA_024363235.1
n/a 22,795
(3.47 %)
67,418
(16.40 %)
n/a 38.17
(100.00 %)
11
(0.00 %)
75
(100.00 %)
347,375
(3.07 %)
304,988
(3.96 %)
3,119,641
(40.22 %)
30,300
(3.29 %)
395 toyon (HeAr 88 primary hap 2022)
GCA_024362995.1
n/a 22,897
(3.50 %)
67,595
(16.43 %)
n/a 38.12
(100.00 %)
5
(0.00 %)
118
(100.00 %)
344,928
(2.90 %)
299,566
(3.87 %)
3,139,734
(39.86 %)
30,533
(2.95 %)
396 tree cotton (Shixiya-1 2022)
GCF_025698485.1
69,134
(4.11 %)
20,169
(1.21 %)
55,515
(4.75 %)
n/a 35.17
(100.00 %)
225
(0.00 %)
948
(100.00 %)
618,195
(1.97 %)
622,748
(3.28 %)
8,002,633
(61.80 %)
27,646
(0.67 %)
397 tree cotton (Shixiya1 2015 BGI)
GCF_000612285.1
53,446
(3.92 %)
20,707
(1.29 %)
56,318
(5.01 %)
n/a 35.03
(92.12 %)
45,768
(7.88 %)
121,185
(92.12 %)
618,119
(2.07 %)
589,954
(3.54 %)
8,098,351
(55.57 %)
28,949
(0.57 %)
398 trifoliate orange (ZK8 2021)
GCA_018350135.1
n/a 14,955
(4.81 %)
32,433
(16.97 %)
n/a 34.13
(99.99 %)
222
(0.01 %)
707
(99.99 %)
181,106
(2.67 %)
98,804
(3.46 %)
2,031,768
(34.51 %)
6,294
(1.72 %)
399 trilobed morning glory
GCF_003576645.1
49,472
(13.00 %)
16,803
(3.58 %)
50,448
(18.68 %)
n/a 35.68
(94.76 %)
31,256
(5.25 %)
17
(100.00 %)
333,211
(3.67 %)
335,317
(10.66 %)
2,341,085
(36.54 %)
27,290
(3.24 %)
400 turmeric (G26 2024)
GCF_044706935.1
40,834
(13.17 %)
18,067
(4.25 %)
53,196
(20.85 %)
n/a 37.76
(99.88 %)
4,668
(0.12 %)
7,139
(100.00 %)
169,406
(2.24 %)
191,181
(4.26 %)
2,052,731
(28.24 %)
50,044
(9.42 %)
401 Valencia sweet orange 2022
GCF_022201045.2
49,199
(16.33 %)
14,451
(4.70 %)
33,670
(18.59 %)
n/a 34.22
(100.00 %)
8
(0.00 %)
11
(100.00 %)
184,421
(2.80 %)
106,732
(3.28 %)
1,996,057
(33.86 %)
6,824
(1.28 %)
402 valley oak (v3.2 2019)
GCF_001633185.2
63,531
(8.16 %)
16,883
(1.90 %)
72,901
(14.48 %)
n/a 35.38
(99.77 %)
1,673
(0.23 %)
2,002
(100.00 %)
800,288
(3.71 %)
460,119
(7.41 %)
5,438,715
(37.84 %)
19,628
(1.10 %)
403 Van Houtte's columbine (alt pseudohaplotype PFEx6 2022)
GCA_023053535.1
n/a 13,357
(3.39 %)
37,446
(17.24 %)
n/a 37.56
(100.00 %)
63
(0.00 %)
249
(100.00 %)
244,573
(10.74 %)
180,141
(13.98 %)
1,184,686
(42.28 %)
6,470
(2.86 %)
404 Van Houtte's columbine (PFEx6 2022)
GCA_023053565.1
n/a 13,575
(3.44 %)
38,113
(17.59 %)
n/a 37.58
(100.00 %)
62
(0.00 %)
463
(100.00 %)
245,892
(11.25 %)
158,855
(13.35 %)
1,221,056
(41.58 %)
6,436
(2.63 %)
405 vegetable marrow (v2 mu-cu-16 2017)
GCF_002806865.2
48,839
(21.95 %)
19,452
(7.44 %)
35,987
(20.77 %)
n/a 36.49
(94.38 %)
49,199
(5.63 %)
24,194
(100.00 %)
181,473
(3.18 %)
143,114
(7.42 %)
1,614,901
(29.14 %)
13,094
(2.48 %)
406 water chestnut (Nanhuling F231 2024)
GCA_035582545.1
n/a 19,879
(3.81 %)
38,349
(12.06 %)
n/a 38.10
(100.00 %)
216
(0.00 %)
32
(100.00 %)
116,633
(1.34 %)
123,546
(2.75 %)
2,308,826
(51.78 %)
20,598
(2.37 %)
407 watermelon (97103 2019)
GCA_000238415.2
n/a 13,387
(3.57 %)
27,414
(10.73 %)
n/a 33.57
(98.45 %)
245
(1.55 %)
113
(100.00 %)
292,830
(3.56 %)
169,773
(2.91 %)
2,260,362
(43.24 %)
14,898
(1.47 %)
408 watermelon (Charleston Gray 2019)
GCA_004801215.2
n/a 13,662
(3.47 %)
28,811
(10.60 %)
n/a 33.52
(94.83 %)
19,579
(5.18 %)
6,794
(100.00 %)
314,974
(3.65 %)
193,157
(4.04 %)
2,390,687
(41.95 %)
15,527
(1.38 %)
409 watermelon (Kordofan 2021)
GCA_018142915.1
n/a 13,494
(3.54 %)
27,976
(10.71 %)
n/a 33.60
(100.00 %)
47
(0.00 %)
33
(100.00 %)
780,860
(60.44 %)
173,577
(3.01 %)
2,295,095
(44.07 %)
15,356
(1.51 %)
410 wax gourd
GCF_009727055.1
40,406
(4.66 %)
13,481
(1.43 %)
43,071
(6.68 %)
n/a 34.85
(98.39 %)
24,524
(1.62 %)
1,791
(100.00 %)
481,638
(2.55 %)
364,998
(3.11 %)
6,236,506
(49.68 %)
21,741
(0.93 %)
411 weeping love grass (Victoria 2019)
GCA_007726485.1
n/a 22,395
(3.96 %)
101,555
(33.88 %)
n/a 45.70
(99.78 %)
2,245
(0.22 %)
1,143
(100.00 %)
206,645
(1.57 %)
174,457
(2.79 %)
2,244,665
(26.11 %)
117,743
(29.88 %)
412 white cockle S.latifolia (original U9 population 2025)
GCF_048544455.1
89,156
(3.16 %)
15,292
(0.51 %)
135,024
(8.39 %)
n/a 38.77
(98.57 %)
827
(1.43 %)
720
(100.00 %)
1,158,845
(2.32 %)
1,353,517
(6.28 %)
10,836,475
(64.19 %)
161,610
(4.19 %)
413 white fonio (2020)
GCA_902806635.1
n/a 33,011
(5.39 %)
109,615
(30.77 %)
n/a 45.47
(97.23 %)
29,136
(2.79 %)
29,155
(97.21 %)
215,374
(1.42 %)
159,137
(1.91 %)
2,776,488
(28.15 %)
136,308
(27.74 %)
414 white lupine (Amiga GWH2020 2020)
GCA_010261695.1
n/a 21,959
(3.77 %)
51,652
(20.18 %)
n/a 36.92
(99.73 %)
1,764
(0.27 %)
3,171
(99.97 %)
215,169
(3.21 %)
247,660
(10.71 %)
2,556,478
(43.72 %)
14,520
(10.46 %)
415 white poplar (2024)
GCF_005239225.2
53,525
(15.07 %)
20,195
(4.72 %)
44,116
(16.35 %)
n/a 33.73
(99.86 %)
1,182
(0.14 %)
97
(100.00 %)
307,548
(3.27 %)
174,946
(4.79 %)
2,453,000
(38.39 %)
4,493
(0.61 %)
416 white poplar P.alba x Populus glandulosa (maternal hap 84K 2023)
GCA_033621325.1
n/a 19,540
(4.79 %)
41,183
(15.85 %)
n/a 34.67
(100.00 %)
2
(0.00 %)
21
(100.00 %)
265,758
(2.98 %)
150,154
(12.12 %)
2,138,699
(41.34 %)
3,578
(0.99 %)
417 white poplar P.alba x Populus glandulosa (paternal hap 84K 2023)
GCA_033617975.1
n/a 19,599
(4.60 %)
42,133
(16.21 %)
n/a 35.05
(100.00 %)
n/a 27
(100.00 %)
268,999
(2.93 %)
165,404
(12.23 %)
2,153,763
(42.62 %)
5,857
(2.24 %)
418 white yam
GCF_009730915.1
43,902
(7.41 %)
13,647
(2.09 %)
49,877
(12.79 %)
n/a 36.25
(99.19 %)
4,760
(0.81 %)
2,254
(100.00 %)
391,299
(3.19 %)
258,918
(3.96 %)
3,588,023
(40.59 %)
28,929
(2.37 %)
419 wild cabbage
GCF_000695525.1
66,716
(15.60 %)
31,142
(8.08 %)
103,348
(35.10 %)
n/a 36.11
(91.23 %)
52,140
(8.80 %)
33,760
(99.98 %)
197,515
(3.12 %)
214,463
(4.43 %)
2,535,207
(31.20 %)
29,995
(2.99 %)
420 wild cabbage (2018)
GCA_900416815.2
n/a 31,163
(6.66 %)
79,290
(25.04 %)
n/a 36.57
(98.21 %)
135
(1.79 %)
140
(100.00 %)
273,972
(2.76 %)
284,806
(6.41 %)
2,750,803
(38.77 %)
33,071
(3.37 %)
421 wild Colombian cocoa
GCF_002168275.1
29,804
(16.68 %)
13,252
(5.90 %)
22,247
(14.89 %)
n/a 32.94
(94.65 %)
119,056
(5.55 %)
6,074
(100.00 %)
107,979
(2.19 %)
67,029
(6.76 %)
1,525,353
(32.45 %)
2,481
(0.48 %)
422 wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.1 2019)
GCF_002162155.2
131,285
(1.34 %)
n/a 567,570
(8.14 %)
n/a 45.99
(96.70 %)
344,589
(3.31 %)
148,296
(100.00 %)
2,573,102
(1.23 %)
2,990,888
(3.37 %)
492,885
(96.69 %)
2,220,880
(25.34 %)
423 wild Malaysian banana
GCF_000313855.2
53,171
(14.87 %)
18,878
(4.31 %)
45,554
(18.36 %)
n/a 38.87
(82.70 %)
22,178
(17.31 %)
24,423
(82.71 %)
214,040
(7.81 %)
136,453
(2.42 %)
1,656,678
(31.15 %)
53,687
(8.28 %)
424 wild olive
GCF_002742605.1
67,081
(6.69 %)
19,793
(1.69 %)
68,749
(9.17 %)
n/a 35.40
(90.41 %)
47,638
(9.59 %)
41,226
(100.00 %)
425,922
(1.79 %)
378,656
(18.98 %)
5,982,070
(40.81 %)
12,534
(0.42 %)
425 wild peanut A.duranensis (v2 V14167 2020)
GCF_000817695.3
57,163
(6.21 %)
17,102
(1.68 %)
76,760
(11.48 %)
n/a 35.80
(88.03 %)
135,554
(12.02 %)
1,589
(100.00 %)
596,136
(3.37 %)
499,251
(3.39 %)
5,279,103
(45.94 %)
48,556
(1.91 %)
426 wild peanut A.ipaensis (K30076 2017)
GCF_000816755.2
78,441
(5.58 %)
16,952
(1.26 %)
89,380
(9.95 %)
n/a 36.84
(92.91 %)
122,617
(7.13 %)
997
(99.67 %)
777,978
(3.35 %)
619,944
(3.82 %)
5,823,472
(53.61 %)
79,537
(2.58 %)
427 wild peanut A.stenosperma (V10309 2020)
GCF_014773155.1
67,384
(5.06 %)
16,850
(1.28 %)
83,780
(9.77 %)
n/a 36.78
(93.48 %)
14,157
(6.52 %)
30
(100.00 %)
767,054
(3.15 %)
754,355
(3.89 %)
5,146,558
(56.74 %)
71,885
(2.45 %)
428 wild soybean
GCF_004193775.1
81,537
(9.20 %)
27,977
(2.99 %)
78,144
(11.64 %)
n/a 34.88
(97.58 %)
752
(2.42 %)
1,120
(100.00 %)
551,217
(2.79 %)
450,287
(6.65 %)
5,379,409
(46.22 %)
37,183
(1.52 %)
429 wild strawberry (2011 refseq)
GCF_000184155.1
25,210
(19.38 %)
13,996
(6.63 %)
46,505
(35.89 %)
n/a 38.40
(94.27 %)
16,253
(5.76 %)
16,460
(94.25 %)
71,057
(1.51 %)
74,581
(2.78 %)
1,034,180
(21.44 %)
14,806
(3.21 %)
430 wild sugarcane (AP85-441 2018)
GCA_003544955.1
n/a 67,698
(2.77 %)
385,590
(22.40 %)
n/a 44.92
(99.75 %)
76,230
(0.26 %)
15,303
(100.00 %)
1,015,234
(1.60 %)
910,932
(3.64 %)
10,425,387
(46.78 %)
637,314
(24.52 %)
431 wild tomato S.pennellii
GCF_001406875.1
46,114
(5.99 %)
15,458
(1.87 %)
42,907
(7.63 %)
n/a 34.50
(92.34 %)
41,684
(7.67 %)
41,696
(92.33 %)
363,460
(2.48 %)
271,129
(4.15 %)
6,330,153
(36.93 %)
19,639
(1.20 %)
432 wine grape (Chardonnay FPS 04 2020)
GCA_011037095.1
n/a 17,733
(2.85 %)
55,354
(14.76 %)
n/a 34.32
(99.33 %)
780
(0.67 %)
683
(100.00 %)
586,981
(35.31 %)
275,412
(4.57 %)
3,561,395
(35.28 %)
14,172
(0.96 %)
433 wine grape (Chkhaveri 2017)
GCA_002922885.1
n/a 14,109
(3.33 %)
40,033
(15.32 %)
n/a 34.56
(97.67 %)
9,429
(2.34 %)
21
(100.00 %)
410,680
(35.69 %)
189,467
(4.45 %)
2,405,053
(34.36 %)
10,620
(1.04 %)
434 wine grape (PN40024 2009)
GCF_000003745.3
46,797
(11.01 %)
14,907
(3.07 %)
44,949
(15.02 %)
n/a 34.56
(96.91 %)
13,440
(3.10 %)
14,644
(96.90 %)
462,807
(35.59 %)
222,647
(4.83 %)
2,745,513
(34.80 %)
11,591
(1.00 %)
435 winter cress (G-type 2016)
GCA_001920985.1
n/a 22,511
(18.61 %)
30,519
(28.94 %)
n/a 35.60
(90.69 %)
22,839
(9.35 %)
30,649
(90.65 %)
86,568
(2.39 %)
44,616
(2.78 %)
1,035,105
(23.86 %)
6,701
(1.74 %)
436 winter squash (2017)
GCF_002738345.1
49,714
(19.34 %)
18,860
(6.74 %)
33,884
(18.55 %)
n/a 36.33
(97.81 %)
17,224
(2.20 %)
8,299
(100.00 %)
169,605
(3.09 %)
134,380
(10.82 %)
1,493,623
(35.66 %)
12,619
(2.64 %)
437 wood tobacco (2013)
GCF_000393655.1
58,358
(2.93 %)
17,332
(0.82 %)
111,663
(7.17 %)
n/a 39.09
(92.17 %)
338,901
(7.84 %)
392,998
(92.16 %)
598,929
(1.44 %)
776,240
(4.57 %)
13,228,149
(49.11 %)
100,864
(1.49 %)
438 wood tobacco (2023)
GCF_000393655.2
69,980
(3.08 %)
17,329
(0.74 %)
106,002
(6.66 %)
n/a 39.22
(100.00 %)
351
(0.00 %)
153
(100.00 %)
757,555
(1.52 %)
896,381
(6.23 %)
12,682,761
(57.52 %)
112,643
(1.70 %)
439 wooly tobacco N.tomentosiformis (2023)
GCF_000390325.3
73,963
(4.14 %)
17,122
(0.98 %)
74,889
(6.28 %)
n/a 39.02
(99.99 %)
471
(0.01 %)
570
(100.00 %)
496,695
(1.39 %)
640,139
(8.47 %)
10,077,793
(57.60 %)
115,283
(2.23 %)
440 zha cai (T84-66 inbred line 2016)
GCA_001687265.1
n/a 56,069
(8.51 %)
138,660
(27.88 %)
n/a 36.22
(79.66 %)
22,714
(20.35 %)
9,746
(100.00 %)
367,321
(2.38 %)
303,381
(3.03 %)
4,551,648
(26.34 %)
50,430
(3.81 %)
TOTALS:total assembly count 444 (440 build completed, 99.10 % finished)

Additional hubs with collections of assemblies
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Primates 616 assemblies assembly stats track stats
Mammals 836 assemblies assembly stats track stats
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other vertebrates 406 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1941 assemblies assembly stats track stats
Plants 444 assemblies assembly stats track stats
Fungi 4128 assemblies assembly stats track stats
Viruses 15060 assemblies assembly stats track stats
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Bacteria 22332 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 689 assemblies assembly stats track stats
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VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 5519 assemblies assembly stats track stats