Birds Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of birds only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 Abyssinian ground-hornbill (alternate hap 2019)
GCA_009769595.1
n/a 11,948
(1.86 %)
22,509
(2.24 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
n/a 3,527
(100.00 %)
361,147
(5.36 %)
125,372
(0.75 %)
5,917,083
(18.51 %)
38,787
(3.82 %)
2 Abyssinian ground-hornbill (primary hap 2019)
GCA_009769605.1
n/a 12,926
(1.90 %)
23,453
(2.26 %)
n/a 43.30
(99.29 %)
204
(0.71 %)
112
(100.00 %)
401,839
(5.61 %)
145,540
(0.78 %)
6,556,090
(19.22 %)
40,986
(3.65 %)
3 acorn woodpecker (bairdi alternate hap 2022)
GCA_026170555.1
n/a 12,415
(1.42 %)
23,266
(1.78 %)
n/a 46.76
(99.99 %)
1,555
(0.01 %)
2,294
(100.00 %)
1,077,039
(17.72 %)
548,450
(13.79 %)
4,965,697
(43.00 %)
29,460
(3.04 %)
4 acorn woodpecker (bairdi primary hap 2022)
GCA_026170545.1
n/a 11,832
(1.45 %)
22,508
(1.87 %)
n/a 46.81
(99.99 %)
1,317
(0.01 %)
4,491
(99.99 %)
980,493
(17.23 %)
496,946
(14.39 %)
5,155,337
(42.38 %)
28,236
(3.22 %)
5 acorn woodpecker (bairdi primary hap 2022)
GCF_026170545.1
41,049
(4.47 %)
11,830
(1.45 %)
22,522
(1.87 %)
n/a 46.81
(99.99 %)
1,317
(0.01 %)
4,489
(99.99 %)
980,471
(17.23 %)
496,933
(14.40 %)
5,155,020
(42.38 %)
28,236
(3.22 %)
6 Adelie penguin
GCF_000699105.1
17,638
(3.05 %)
11,763
(1.71 %)
10,671
(1.99 %)
n/a 41.51
(95.58 %)
95,110
(4.45 %)
114,374
(95.55 %)
360,323
(4.64 %)
126,490
(0.70 %)
6,900,013
(18.31 %)
27,176
(0.96 %)
7 African ostrich
GCF_000698965.1
29,026
(4.42 %)
12,011
(1.64 %)
17,852
(1.82 %)
34,707
(3.37 %)
41.05
(96.74 %)
72,649
(3.29 %)
79,564
(96.71 %)
321,765
(3.17 %)
152,444
(0.82 %)
7,196,207
(17.79 %)
33,542
(1.33 %)
8 African ostrich (bStrCam1hap1 2024)
GCF_040807025.1
70,988
(5.69 %)
14,024
(1.60 %)
24,944
(1.95 %)
n/a 44.34
(100.00 %)
116
(0.00 %)
262
(100.00 %)
710,321
(8.33 %)
473,161
(7.22 %)
5,692,215
(24.23 %)
46,493
(8.90 %)
9 African ostrich (bStrCam1hap2 2024)
GCA_040807015.1
n/a 13,036
(1.56 %)
32,740
(2.89 %)
n/a 45.71
(100.00 %)
82
(0.00 %)
250
(100.00 %)
651,979
(9.34 %)
459,653
(10.08 %)
4,547,348
(28.27 %)
49,261
(10.50 %)
10 American crow
GCF_000691975.1
36,379
(6.32 %)
12,151
(1.86 %)
11,346
(2.24 %)
n/a 41.85
(96.40 %)
79,099
(3.62 %)
89,646
(96.38 %)
416,990
(6.08 %)
224,964
(1.60 %)
6,343,680
(18.42 %)
20,148
(0.77 %)
11 American flamingo (alternate hap 2019)
GCA_009819805.1
n/a 12,384
(1.73 %)
23,611
(2.05 %)
n/a 43.35
(100.00 %)
n/a 3,529
(100.00 %)
496,877
(7.22 %)
162,522
(0.74 %)
6,684,675
(20.14 %)
51,895
(5.89 %)
12 American flamingo (primary hap 2019)
GCA_009819775.1
n/a 13,100
(1.79 %)
23,372
(2.04 %)
n/a 43.27
(99.31 %)
280
(0.69 %)
90
(100.00 %)
538,004
(7.73 %)
183,346
(0.79 %)
7,056,270
(20.92 %)
52,012
(5.96 %)
13 Anna's hummingbird (alternate hap BGI_N300 2018)
GCA_003957575.1
n/a 11,084
(1.90 %)
19,321
(2.14 %)
n/a 41.32
(100.00 %)
6
(0.00 %)
3,803
(100.00 %)
475,493
(7.41 %)
223,791
(1.37 %)
5,585,250
(20.30 %)
14,903
(1.46 %)
14 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 refseq)
GCF_003957555.1
31,091
(4.24 %)
12,257
(1.95 %)
14,633
(2.35 %)
n/a 41.49
(98.48 %)
429
(1.52 %)
159
(100.00 %)
535,315
(7.95 %)
262,055
(1.51 %)
6,092,276
(20.84 %)
17,130
(1.48 %)
15 bald eagle
GCF_000737465.1
26,869
(3.49 %)
13,007
(1.88 %)
15,874
(2.35 %)
n/a 41.68
(98.38 %)
30,862
(1.63 %)
31,786
(98.37 %)
355,319
(3.99 %)
119,526
(0.44 %)
6,923,742
(18.48 %)
33,353
(1.97 %)
16 band-tailed pigeon (hap2 2024 genbank)
GCA_036971685.1
n/a 13,319
(1.60 %)
25,993
(2.05 %)
n/a 43.83
(99.41 %)
219
(0.59 %)
453
(100.00 %)
700,173
(13.18 %)
457,546
(13.85 %)
4,523,003
(31.73 %)
42,686
(7.00 %)
17 band-tailed pigeon (hap2 2024 refseq)
GCF_036971685.1
36,326
(4.04 %)
13,317
(1.60 %)
25,993
(2.05 %)
n/a 43.83
(99.41 %)
219
(0.59 %)
452
(100.00 %)
700,166
(13.18 %)
457,543
(13.85 %)
4,522,973
(31.73 %)
42,686
(7.00 %)
18 bar-tailed trogon
GCF_000703405.1
15,393
(2.18 %)
11,432
(1.52 %)
23,733
(1.98 %)
n/a 41.38
(99.58 %)
50,921
(0.42 %)
105,649
(99.58 %)
386,871
(6.20 %)
142,825
(0.82 %)
6,474,942
(19.87 %)
18,662
(0.63 %)
19 barn owl (U. Lausanne 2021)
GCF_018691265.1
46,583
(5.22 %)
13,036
(1.82 %)
22,849
(2.14 %)
n/a 41.65
(95.89 %)
259
(4.11 %)
70
(100.00 %)
610,994
(5.59 %)
254,870
(1.12 %)
7,109,716
(19.00 %)
38,384
(2.94 %)
20 Barn swallow (bHirRus1 v3 alternate hap 2021)
GCA_015227815.3
n/a 11,132
(1.94 %)
20,993
(2.40 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
6
(0.00 %)
2,476
(100.00 %)
550,072
(10.78 %)
282,378
(2.00 %)
5,634,117
(20.43 %)
30,305
(2.79 %)
21 barn swallow (v3 primary hap 2021 refseq)
GCF_015227805.2
41,925
(5.13 %)
12,395
(1.89 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
664,757
(13.92 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
36,548
(2.85 %)
22 Bengalese finch
GCF_005870125.1
32,857
(5.06 %)
12,604
(1.98 %)
23,707
(2.41 %)
n/a 41.59
(97.06 %)
37,862
(2.95 %)
2,015
(100.00 %)
507,898
(7.97 %)
424,913
(2.80 %)
6,456,852
(20.03 %)
29,692
(2.46 %)
23 bird A.albertisi (hap1 2024)
GCA_039906565.1
n/a 13,007
(1.87 %)
23,375
(2.27 %)
n/a 42.52
(99.99 %)
439
(0.01 %)
592
(100.00 %)
467,217
(6.83 %)
273,604
(2.43 %)
6,154,114
(21.83 %)
23,203
(2.12 %)
24 bird A.albertisi (hap2 2024)
GCA_039906465.1
n/a 12,101
(1.93 %)
21,258
(2.30 %)
n/a 42.52
(99.99 %)
344
(0.01 %)
525
(100.00 %)
412,944
(6.30 %)
232,333
(2.21 %)
5,715,517
(21.35 %)
20,873
(2.13 %)
25 bird A.imberbis (Cuckoo-Finch-1a 21T00152 2023)
GCF_031753505.1
53,868
(5.67 %)
12,992
(1.79 %)
25,575
(2.33 %)
n/a 43.43
(99.99 %)
431
(0.01 %)
1,370
(100.00 %)
437,810
(3.71 %)
484,607
(8.45 %)
5,614,533
(25.04 %)
45,374
(4.99 %)
26 bird E.chinensis (hap1 2024)
GCA_039878515.1
n/a 12,607
(2.39 %)
22,429
(2.59 %)
n/a 41.57
(99.99 %)
331
(0.01 %)
425
(100.00 %)
521,486
(5.26 %)
266,418
(2.40 %)
5,305,054
(20.63 %)
19,590
(2.16 %)
27 bird E.chinensis (hap2 2024)
GCA_039878825.1
n/a 12,731
(2.42 %)
22,580
(2.63 %)
n/a 41.64
(99.99 %)
330
(0.01 %)
191
(100.00 %)
520,888
(5.33 %)
274,030
(2.07 %)
5,360,112
(20.48 %)
19,673
(2.18 %)
28 bird P.flaviventris (CSIRO_AGI_PZ_B2104156 2023)
GCF_033815535.1
46,130
(4.40 %)
13,292
(1.73 %)
24,384
(2.16 %)
n/a 43.01
(100.00 %)
n/a 993
(100.00 %)
514,287
(6.54 %)
355,123
(8.64 %)
5,531,059
(27.22 %)
28,362
(1.86 %)
29 bird Z.leucophrys gambelii (GWCS_2022_RI 2023)
GCF_028769735.1
42,284
(5.19 %)
12,694
(1.84 %)
25,490
(2.39 %)
n/a 42.81
(100.00 %)
339
(0.00 %)
3,792
(100.00 %)
398,368
(3.10 %)
569,232
(5.31 %)
6,675,899
(23.29 %)
31,995
(2.37 %)
30 black swan (v2 Queensland, Australia AKBS03 2022)
GCF_013377495.2
41,421
(4.72 %)
13,027
(1.98 %)
22,616
(2.25 %)
n/a 41.96
(99.99 %)
130
(0.01 %)
568
(100.00 %)
636,501
(5.67 %)
297,964
(1.45 %)
6,820,083
(21.47 %)
31,725
(3.49 %)
31 black-capped chickadee (hap1 2023)
GCF_030490865.1
44,388
(4.96 %)
13,738
(1.81 %)
26,691
(2.34 %)
n/a 42.41
(99.92 %)
404
(0.08 %)
307
(100.00 %)
730,165
(12.91 %)
566,529
(6.51 %)
6,499,984
(24.36 %)
42,650
(2.59 %)
32 black-capped chickadee (hap2 2023)
GCA_030490855.1
n/a 11,495
(1.90 %)
22,202
(2.49 %)
n/a 42.77
(99.94 %)
240
(0.06 %)
157
(100.00 %)
560,436
(11.20 %)
441,102
(7.11 %)
5,126,888
(23.42 %)
35,457
(2.90 %)
33 black-headed gull (Kunming 2023)
GCA_030820635.1
n/a 12,902
(1.75 %)
23,180
(2.09 %)
n/a 43.21
(100.00 %)
149
(0.00 %)
297
(100.00 %)
498,044
(5.37 %)
199,557
(4.44 %)
6,843,616
(23.12 %)
42,444
(3.62 %)
34 black-headed gull (primary hap 2024 genbank)
GCA_963924245.1
n/a 13,244
(1.58 %)
25,111
(1.96 %)
n/a 44.66
(99.99 %)
462
(0.01 %)
729
(100.00 %)
516,350
(4.84 %)
268,175
(14.83 %)
5,880,256
(31.31 %)
45,313
(4.92 %)
35 black-headed gull (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924245.1
46,133
(4.67 %)
13,243
(1.58 %)
24,048
(1.89 %)
n/a 44.66
(99.99 %)
462
(0.01 %)
728
(100.00 %)
516,346
(4.84 %)
268,169
(14.83 %)
5,880,218
(31.31 %)
45,313
(4.92 %)
36 black-legged kittiwake (bRisTri1 2023 refseq)
GCF_028500815.1
51,115
(5.11 %)
13,211
(1.67 %)
24,108
(1.99 %)
n/a 44.40
(99.94 %)
283
(0.06 %)
716
(100.00 %)
521,275
(5.36 %)
236,727
(8.62 %)
5,684,588
(26.70 %)
45,318
(4.71 %)
37 black-legged kittiwake (bRisTri1.mat 2023)
GCA_028501385.1
n/a 12,650
(1.68 %)
22,959
(2.02 %)
n/a 44.62
(99.95 %)
223
(0.05 %)
733
(100.00 %)
483,413
(5.25 %)
221,284
(9.35 %)
6,264,499
(27.26 %)
42,776
(4.88 %)
38 black-throated flowerpiercer
GCA_019023105.1
n/a 12,249
(1.86 %)
23,692
(2.34 %)
n/a 42.36
(99.99 %)
970
(0.01 %)
600
(100.00 %)
491,914
(6.04 %)
365,884
(2.89 %)
6,453,998
(20.73 %)
30,076
(2.44 %)
39 blackcap (alternate hap 2019)
GCA_009819715.1
n/a 11,586
(1.87 %)
22,618
(2.41 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
2
(0.00 %)
3,566
(100.00 %)
473,456
(5.97 %)
308,518
(2.29 %)
5,987,640
(19.64 %)
25,451
(2.38 %)
40 blackcap (primary hap 2019 refseq)
GCF_009819655.1
31,610
(4.74 %)
12,379
(1.92 %)
22,970
(2.37 %)
n/a 42.00
(98.88 %)
413
(1.12 %)
190
(100.00 %)
582,016
(10.36 %)
330,354
(2.12 %)
6,410,626
(19.76 %)
26,838
(2.34 %)
41 blue tit
GCF_002901205.1
42,986
(5.81 %)
12,162
(1.76 %)
16,442
(2.29 %)
n/a 41.18
(92.58 %)
24,797
(7.42 %)
29,297
(100.00 %)
486,455
(6.02 %)
423,142
(2.68 %)
6,777,615
(18.84 %)
26,565
(0.98 %)
42 blue-and-yellow macaw (hap1 2023)
GCA_028858755.1
n/a 12,919
(1.77 %)
22,770
(2.15 %)
n/a 42.69
(99.92 %)
107
(0.08 %)
246
(100.00 %)
711,670
(17.55 %)
242,430
(5.04 %)
5,545,074
(24.84 %)
25,153
(2.06 %)
43 blue-and-yellow macaw (hap2 2023)
GCA_028858555.1
n/a 13,216
(1.69 %)
23,855
(2.07 %)
n/a 43.30
(99.92 %)
130
(0.08 %)
274
(100.00 %)
746,174
(21.96 %)
291,116
(9.91 %)
5,424,976
(28.69 %)
26,750
(2.02 %)
44 blue-crowned manakin
GCF_001604755.1
42,586
(5.25 %)
12,442
(1.93 %)
16,972
(2.49 %)
n/a 41.74
(97.93 %)
22,456
(2.07 %)
23,501
(97.93 %)
470,567
(6.92 %)
226,975
(1.27 %)
6,395,476
(19.17 %)
24,084
(1.85 %)
45 blue-fronted amazon (AMXYW 2021)
GCA_017639355.1
n/a 12,250
(1.92 %)
19,607
(2.10 %)
n/a 41.72
(93.42 %)
3,560,856
(6.92 %)
1,498
(100.00 %)
559,187
(10.05 %)
144,509
(0.66 %)
5,883,053
(17.90 %)
18,581
(1.17 %)
46 blue-fronted amazon (FVVF132 2015)
GCA_001420675.1
n/a 12,339
(1.91 %)
20,350
(2.13 %)
n/a 41.72
(93.49 %)
3,559,082
(6.85 %)
3,232
(100.00 %)
501,831
(8.21 %)
144,313
(0.66 %)
5,882,906
(17.92 %)
18,584
(1.17 %)
47 Bourke's parrot (Australia Nb327-2 2023)
GCF_033783945.1
43,924
(4.72 %)
13,092
(1.91 %)
23,195
(2.31 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
37
(0.00 %)
1,864
(100.00 %)
469,079
(6.31 %)
205,954
(1.49 %)
5,911,944
(20.89 %)
22,555
(1.70 %)
48 Brazilian merganser (hap1 2024)
GCA_036873955.1
n/a 13,202
(1.80 %)
24,416
(2.14 %)
n/a 42.42
(100.00 %)
327
(0.00 %)
569
(100.00 %)
832,469
(7.06 %)
531,644
(7.37 %)
6,294,434
(28.49 %)
34,786
(3.61 %)
49 Brazilian merganser (hap2 2024)
GCA_036850655.1
n/a 12,578
(1.76 %)
23,066
(2.06 %)
n/a 42.87
(100.00 %)
244
(0.00 %)
720
(100.00 %)
773,452
(7.75 %)
522,491
(10.88 %)
5,592,104
(31.80 %)
33,981
(4.60 %)
50 bronzed cowbird (106 2024)
GCF_037042795.1
30,276
(4.54 %)
12,775
(1.77 %)
24,737
(2.30 %)
n/a 42.93
(100.00 %)
67
(0.00 %)
528
(100.00 %)
410,661
(3.03 %)
498,610
(9.50 %)
6,332,690
(26.06 %)
33,278
(2.51 %)
51 brown eared-pheasant
GCA_019593555.1
n/a 13,027
(2.37 %)
22,748
(2.48 %)
n/a 41.03
(98.67 %)
114,232
(1.35 %)
2,408
(100.00 %)
523,649
(0.00 %)
228,783
(1.17 %)
6,134,418
(20.24 %)
19,702
(2.00 %)
52 brown headed cowbird (v1.1 BHLD 08-10-18 2022)
GCF_012460135.2
31,871
(5.31 %)
12,561
(1.89 %)
24,218
(2.41 %)
n/a 42.40
(99.99 %)
318
(0.01 %)
692
(99.99 %)
598,355
(12.36 %)
420,712
(3.73 %)
6,496,704
(21.26 %)
28,568
(2.41 %)
53 brown kiwi
GCF_001039765.1
26,121
(3.23 %)
12,909
(1.54 %)
23,267
(1.91 %)
n/a 41.28
(86.08 %)
368,297
(13.97 %)
24,718
(100.00 %)
367,446
(2.94 %)
316,602
(7.36 %)
7,164,456
(14.67 %)
59,756
(2.40 %)
54 brown roatelo
GCF_000695765.1
16,756
(2.26 %)
12,208
(1.55 %)
27,079
(2.12 %)
n/a 41.32
(99.66 %)
51,602
(0.35 %)
119,122
(99.65 %)
345,102
(5.17 %)
194,444
(1.21 %)
6,441,258
(19.39 %)
19,018
(0.67 %)
55 budgerigar (maternal 2020)
GCA_012275265.1
n/a 12,659
(1.89 %)
22,063
(2.28 %)
n/a 41.89
(94.20 %)
388
(5.80 %)
930
(100.00 %)
504,677
(9.95 %)
268,616
(3.12 %)
5,481,198
(20.78 %)
20,278
(1.55 %)
56 budgerigar (maternal Z 2020 refseq)
GCF_012275295.1
32,026
(4.32 %)
13,239
(1.87 %)
23,063
(2.25 %)
26,324
(3.11 %)
41.80
(99.72 %)
284
(0.28 %)
864
(100.00 %)
538,374
(10.19 %)
279,504
(3.12 %)
5,874,531
(22.08 %)
21,155
(1.61 %)
57 budgerigar (paternal hap 2020)
GCA_012275275.1
n/a 13,127
(1.94 %)
22,492
(2.30 %)
n/a 41.84
(98.98 %)
737
(1.02 %)
330
(100.00 %)
505,478
(9.66 %)
231,633
(2.15 %)
5,778,405
(20.30 %)
20,205
(1.61 %)
58 budgerigar (v6.3 2021 WashU)
GCF_000238935.1
25,525
(4.05 %)
12,188
(1.82 %)
15,819
(2.26 %)
n/a 41.25
(97.26 %)
51,022
(2.75 %)
70,863
(97.25 %)
465,974
(9.37 %)
127,353
(0.54 %)
5,864,264
(19.05 %)
15,886
(0.88 %)
59 burrowing owl
GCF_003259725.1
30,559
(4.30 %)
11,741
(1.72 %)
10,976
(2.04 %)
n/a 40.92
(98.92 %)
33,737
(1.09 %)
445
(100.00 %)
492,320
(6.21 %)
182,281
(0.73 %)
6,811,984
(19.35 %)
22,840
(1.08 %)
60 California black rail (168171201 alternate hap 2022)
GCA_022605925.1
n/a 11,551
(1.57 %)
22,390
(2.09 %)
n/a 44.21
(99.99 %)
1,672
(0.01 %)
3,563
(100.00 %)
465,417
(6.39 %)
218,050
(11.40 %)
4,588,632
(30.42 %)
22,622
(2.16 %)
61 California black rail (168171201 primary hap 2022)
GCA_022605575.1
n/a 12,725
(1.54 %)
24,572
(2.13 %)
n/a 43.81
(100.00 %)
319
(0.00 %)
964
(100.00 %)
522,782
(6.36 %)
226,563
(14.09 %)
5,497,483
(32.27 %)
24,529
(1.77 %)
62 California condor (v2 813 2022 refseq)
GCF_018139145.2
27,527
(3.38 %)
12,653
(1.75 %)
21,924
(1.97 %)
n/a 42.16
(99.97 %)
632
(0.03 %)
542
(100.00 %)
434,141
(3.82 %)
177,389
(0.88 %)
7,171,770
(20.32 %)
34,918
(3.00 %)
63 California quail (MVZ:Bird:193975 alternate hap 2022)
GCA_023055725.1
n/a 12,948
(1.71 %)
24,838
(2.01 %)
n/a 43.36
(100.00 %)
248
(0.00 %)
1,601
(100.00 %)
1,359,516
(35.69 %)
599,039
(11.78 %)
3,454,101
(36.94 %)
36,496
(2.55 %)
64 California quail (MVZ:Bird:193975 primary hap 2022)
GCA_023055505.1
n/a 12,718
(2.12 %)
23,363
(2.40 %)
n/a 42.23
(100.00 %)
287
(0.00 %)
608
(100.00 %)
881,563
(19.85 %)
308,707
(5.50 %)
5,409,060
(25.34 %)
25,268
(2.42 %)
65 California towhee (CALT 2023)
GCF_028551555.1
28,823
(3.21 %)
12,791
(1.50 %)
26,511
(2.06 %)
n/a 44.24
(100.00 %)
n/a 627
(100.00 %)
473,712
(3.18 %)
586,987
(10.80 %)
4,965,312
(32.86 %)
48,369
(2.73 %)
66 Canada goose (SJ_97 2019)
GCA_006130075.1
n/a 13,061
(1.95 %)
24,149
(2.23 %)
n/a 42.13
(98.37 %)
15,389
(1.64 %)
28,876
(98.36 %)
715,113
(7.61 %)
319,386
(1.67 %)
6,810,836
(21.27 %)
40,389
(4.15 %)
67 carmine bee-eater (alternate hap 2019)
GCA_009819585.1
n/a 12,381
(1.76 %)
28,865
(2.78 %)
n/a 43.05
(100.00 %)
n/a 3,296
(100.00 %)
542,765
(7.77 %)
204,389
(1.06 %)
6,415,832
(21.53 %)
31,638
(2.54 %)
68 carmine bee-eater (primary hap 2019)
GCA_009819595.1
n/a 12,740
(1.82 %)
28,031
(2.77 %)
n/a 42.88
(99.47 %)
269
(0.53 %)
109
(100.00 %)
556,926
(7.87 %)
213,180
(1.09 %)
6,641,077
(21.58 %)
30,881
(2.41 %)
69 chaffinch (primary hap 2023)
GCA_963513975.1
n/a 12,708
(1.72 %)
24,978
(2.26 %)
n/a 44.06
(99.99 %)
573
(0.01 %)
467
(100.00 %)
495,590
(3.15 %)
493,628
(13.34 %)
6,163,336
(28.37 %)
39,042
(6.25 %)
70 chestnut-breasted malkoha (KB17595 2023)
GCF_032191515.1
36,882
(4.04 %)
13,316
(1.67 %)
25,480
(2.15 %)
n/a 43.00
(100.00 %)
181
(0.00 %)
587
(100.00 %)
486,715
(8.57 %)
476,696
(11.88 %)
6,153,538
(29.89 %)
33,146
(2.23 %)
71 chicken (Cobb bGalGal5 alternate hap 2022)
GCA_027408205.1
n/a 11,740
(2.36 %)
21,473
(2.56 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
4
(0.00 %)
2,263
(100.00 %)
551,116
(10.78 %)
241,638
(4.43 %)
4,973,260
(21.77 %)
21,151
(2.71 %)
72 chicken (Cobb bGalGal5 primary hap 2022)
GCA_027408225.1
n/a 13,037
(2.20 %)
23,550
(2.37 %)
n/a 42.31
(99.81 %)
460
(0.19 %)
252
(100.00 %)
681,166
(12.04 %)
381,093
(7.09 %)
5,610,806
(24.65 %)
25,664
(2.75 %)
73 chicken (GRCg6a 2018)
GCF_000002315.6
62,183
(8.40 %)
13,099
(2.32 %)
18,797
(2.76 %)
73,407
(9.29 %)
42.23
(99.08 %)
952
(0.92 %)
2,380
(99.08 %)
684,052
(12.74 %)
307,144
(2.92 %)
5,863,131
(21.16 %)
24,405
(2.72 %)
74 chicken (Huxu 2023)
GCA_024206055.2
n/a 13,405
(2.26 %)
24,435
(2.45 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
14
(0.00 %)
41
(100.00 %)
704,190
(12.54 %)
502,701
(5.74 %)
5,731,097
(23.50 %)
27,781
(2.90 %)
75 chicken (Ross bGalGal4 alternate hap 2022)
GCA_027408255.1
n/a 11,339
(2.33 %)
20,588
(2.51 %)
n/a 42.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,684
(100.00 %)
537,847
(10.84 %)
217,964
(3.81 %)
4,879,985
(21.43 %)
19,653
(2.66 %)
76 chicken (Ross bGalGal4 primary hap 2023)
GCA_027557775.1
n/a 12,855
(2.22 %)
23,147
(2.37 %)
n/a 42.15
(99.74 %)
566
(0.26 %)
246
(100.00 %)
672,973
(12.00 %)
342,156
(6.53 %)
5,690,712
(23.98 %)
24,413
(2.63 %)
77 chicken white leghorn layer X broiler (v2 broiler haplotype 2021 2021)
GCF_016699485.2
74,716
(9.14 %)
13,128
(2.33 %)
23,484
(2.48 %)
72,013
(9.34 %)
42.20
(99.68 %)
463
(0.32 %)
677
(99.68 %)
697,827
(12.53 %)
290,892
(2.63 %)
5,887,021
(21.30 %)
24,469
(2.59 %)
78 Chilean tinamou
GCF_003342845.1
24,894
(4.16 %)
12,545
(2.09 %)
18,167
(2.87 %)
n/a 42.04
(98.74 %)
1,226,739
(1.39 %)
2,217
(100.00 %)
496,518
(5.43 %)
290,573
(1.50 %)
5,870,743
(19.53 %)
44,640
(5.21 %)
79 chimney swift (M959 v1.1 2014)
GCF_000747805.2
15,969
(2.53 %)
12,045
(1.82 %)
18,580
(2.07 %)
n/a 41.40
(96.00 %)
65,471
(4.02 %)
84,174
(95.98 %)
469,979
(5.99 %)
194,781
(2.21 %)
6,361,618
(19.70 %)
12,438
(0.41 %)
80 chuck-will's-widow (BGI_N321 v2 2014)
GCF_000700745.2
17,193
(2.21 %)
12,092
(1.49 %)
28,685
(1.89 %)
n/a 40.76
(99.62 %)
56,333
(0.39 %)
125,214
(99.61 %)
516,189
(5.36 %)
202,882
(1.12 %)
6,588,198
(20.47 %)
8,029
(0.24 %)
81 collared flycatcher
GCF_000247815.1
28,360
(4.07 %)
12,200
(1.78 %)
14,028
(2.24 %)
33,113
(3.87 %)
44.22
(98.57 %)
11,403
(1.43 %)
30,843
(98.57 %)
559,053
(7.88 %)
597,207
(11.39 %)
6,656,400
(23.61 %)
29,879
(1.50 %)
82 common buzzard (bButBut1.hap1.1 2024)
GCA_964188355.1
n/a 13,512
(1.75 %)
24,417
(2.13 %)
n/a 43.17
(99.99 %)
471
(0.01 %)
546
(100.00 %)
439,018
(4.62 %)
244,865
(6.73 %)
6,778,625
(23.94 %)
43,400
(4.80 %)
83 common buzzard (bButBut1.hap2.1 2024)
GCA_964188375.1
n/a 13,593
(1.72 %)
24,541
(2.09 %)
n/a 43.49
(99.99 %)
471
(0.01 %)
929
(99.99 %)
439,011
(4.19 %)
247,629
(8.40 %)
6,711,875
(25.06 %)
49,141
(4.61 %)
84 common canary (domestic yellow sc_yellow_7_cibi 2019)
GCF_007115625.1
32,985
(4.99 %)
12,248
(1.89 %)
15,910
(2.38 %)
n/a 42.17
(98.21 %)
47,138
(1.81 %)
3,536
(100.00 %)
477,249
(6.30 %)
313,951
(2.10 %)
6,525,604
(19.58 %)
25,722
(1.90 %)
85 common canary (serCan28SL12 2022)
GCF_022539315.1
41,390
(5.57 %)
12,314
(1.93 %)
23,133
(2.37 %)
n/a 42.36
(99.95 %)
1,055
(0.05 %)
685
(100.00 %)
553,077
(10.89 %)
322,311
(2.75 %)
6,543,183
(20.47 %)
26,268
(2.31 %)
86 common cuckoo (bCucCan1 alternate hap 2021)
GCA_017976305.1
n/a 12,464
(1.91 %)
24,623
(2.50 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
8
(0.00 %)
1,004
(100.00 %)
505,582
(10.93 %)
292,484
(2.48 %)
6,061,828
(21.38 %)
24,010
(1.80 %)
87 common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 refseq)
GCF_017976375.1
50,206
(6.30 %)
13,190
(1.85 %)
24,284
(2.29 %)
n/a 42.18
(99.58 %)
296
(0.42 %)
150
(100.00 %)
566,161
(11.56 %)
310,430
(2.36 %)
6,712,791
(21.76 %)
25,268
(1.73 %)
88 common goldeneye (primary hap 2024)
GCA_964059595.1
n/a 13,374
(1.90 %)
24,308
(2.28 %)
n/a 42.07
(99.99 %)
454
(0.01 %)
544
(100.00 %)
751,865
(6.78 %)
400,294
(3.80 %)
6,184,781
(24.97 %)
35,712
(2.66 %)
89 common mallard (Pekin duck 2017)
GCA_002743455.1
n/a 12,871
(1.94 %)
25,038
(2.26 %)
n/a 41.42
(95.05 %)
25,623
(4.96 %)
21,442
(100.00 %)
760,634
(7.52 %)
360,866
(1.37 %)
6,710,465
(20.25 %)
32,823
(2.15 %)
90 common moorhen (bGalChl1.hap1.1 2024)
GCA_964237585.1
n/a 12,976
(1.68 %)
23,758
(2.12 %)
n/a 44.70
(99.99 %)
603
(0.01 %)
845
(100.00 %)
499,923
(5.57 %)
250,214
(7.38 %)
6,350,978
(25.68 %)
27,790
(2.32 %)
91 common moorhen (bGalChl1.hap2.1 2024)
GCA_964237395.1
n/a 12,745
(1.75 %)
23,052
(2.18 %)
n/a 43.90
(99.99 %)
536
(0.01 %)
931
(99.99 %)
483,812
(5.59 %)
210,131
(3.30 %)
6,332,994
(22.33 %)
26,285
(2.20 %)
92 common myna (bArcTri1 alternate hap 2023)
GCA_027559525.1
n/a 10,692
(1.77 %)
20,925
(2.29 %)
n/a 42.15
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,221
(100.00 %)
328,602
(4.16 %)
604,057
(8.02 %)
5,233,128
(25.06 %)
25,210
(3.70 %)
93 common myna (bArcTri1 primary hap 2023)
GCA_027559615.1
n/a 12,560
(1.73 %)
23,740
(2.16 %)
n/a 42.32
(99.80 %)
435
(0.20 %)
455
(100.00 %)
395,254
(5.40 %)
937,774
(11.00 %)
6,145,808
(28.07 %)
32,293
(3.87 %)
94 common pochard (bAytFer1.hap1.1 2024)
GCA_964211825.1
n/a 13,505
(1.83 %)
24,961
(2.21 %)
n/a 42.19
(99.99 %)
474
(0.01 %)
870
(100.00 %)
833,892
(8.17 %)
576,230
(8.04 %)
6,149,355
(27.84 %)
34,089
(2.69 %)
95 common pochard (bAytFer1.hap2.1 2024)
GCA_964211795.1
n/a 12,828
(1.96 %)
23,534
(2.35 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
405
(0.01 %)
767
(99.99 %)
725,169
(7.34 %)
472,156
(5.81 %)
5,786,296
(25.35 %)
30,917
(2.80 %)
96 common starling
GCF_001447265.1
28,711
(4.57 %)
12,585
(2.01 %)
17,785
(2.59 %)
n/a 41.49
(97.70 %)
23,392
(2.31 %)
22,666
(97.69 %)
427,543
(5.30 %)
310,445
(1.74 %)
6,482,337
(19.49 %)
23,883
(1.99 %)
97 common swift (bApuApu2 alternate hap 2021)
GCA_020740585.1
n/a 11,653
(1.89 %)
19,731
(2.20 %)
n/a 42.01
(100.00 %)
5
(0.00 %)
1,697
(100.00 %)
443,384
(6.09 %)
185,968
(1.18 %)
5,916,553
(20.88 %)
18,864
(1.75 %)
98 common swift (primary hap 2021 refseq)
GCF_020740795.1
39,986
(4.95 %)
12,292
(1.88 %)
20,379
(2.16 %)
n/a 41.95
(99.84 %)
256
(0.16 %)
110
(100.00 %)
499,695
(6.70 %)
199,749
(1.12 %)
6,354,003
(21.19 %)
20,393
(1.74 %)
99 common tern (alternate hap 2019)
GCA_009819645.1
n/a 12,773
(1.79 %)
24,751
(2.23 %)
n/a 43.24
(100.00 %)
n/a 2,235
(100.00 %)
549,460
(7.58 %)
204,051
(1.02 %)
6,880,566
(20.70 %)
47,352
(3.95 %)
100 common tern (primary hap 2019)
GCA_009819605.1
n/a 13,103
(1.81 %)
24,044
(2.16 %)
n/a 43.03
(99.16 %)
205
(0.84 %)
123
(100.00 %)
570,312
(7.91 %)
216,895
(1.04 %)
7,043,151
(20.98 %)
45,694
(3.73 %)
101 common yellowthroat (alternate hap 2019)
GCA_009764545.1
n/a 10,611
(1.77 %)
21,125
(2.21 %)
n/a 41.77
(100.00 %)
1
(0.00 %)
4,976
(100.00 %)
422,889
(5.99 %)
294,928
(2.71 %)
5,928,421
(19.76 %)
21,397
(1.91 %)
102 common yellowthroat (primary hap 2019)
GCA_009764595.1
n/a 11,741
(1.82 %)
22,382
(2.29 %)
n/a 42.01
(98.73 %)
1,479
(1.27 %)
278
(100.00 %)
476,049
(6.38 %)
367,108
(3.16 %)
6,576,957
(20.43 %)
25,004
(2.02 %)
103 Cory's shearwater (bCalBor7.hap1.1 2024)
GCA_964195595.1
n/a 13,703
(1.71 %)
26,310
(2.10 %)
n/a 43.29
(99.99 %)
525
(0.01 %)
414
(100.00 %)
479,045
(5.03 %)
336,466
(4.95 %)
5,910,298
(24.89 %)
48,046
(4.19 %)
104 Cory's shearwater (bCalBor7.hap2.1 2024)
GCA_964196065.1
n/a 12,750
(1.85 %)
23,191
(2.16 %)
n/a 43.03
(99.99 %)
477
(0.01 %)
726
(99.99 %)
403,846
(4.59 %)
252,125
(3.30 %)
6,206,493
(22.07 %)
41,821
(4.50 %)
105 crested ibis (BGI_Y956 2014)
GCF_000708225.1
17,134
(2.52 %)
12,801
(1.77 %)
14,062
(2.19 %)
n/a 41.83
(97.20 %)
70,475
(2.81 %)
130,030
(97.19 %)
395,055
(4.53 %)
182,744
(0.97 %)
7,244,849
(18.69 %)
39,156
(2.06 %)
106 cuckoo roller (BGI_N330 2014)
GCF_000691785.1
16,484
(2.21 %)
12,195
(1.53 %)
24,940
(1.96 %)
n/a 41.82
(99.74 %)
56,010
(0.27 %)
113,170
(99.73 %)
349,912
(4.65 %)
131,678
(0.66 %)
6,778,773
(18.46 %)
35,090
(1.44 %)
107 cuckoo roller (hap1 2023)
GCA_034619455.1
n/a 13,157
(1.67 %)
30,413
(2.59 %)
n/a 43.53
(100.00 %)
290
(0.00 %)
353
(100.00 %)
609,076
(8.83 %)
331,584
(6.01 %)
5,966,458
(23.99 %)
45,694
(7.05 %)
108 cuckoo roller (hap2 2023)
GCA_034619465.1
n/a 13,044
(1.66 %)
30,275
(2.65 %)
n/a 43.69
(100.00 %)
271
(0.00 %)
295
(100.00 %)
603,184
(8.76 %)
324,082
(7.37 %)
6,147,876
(25.10 %)
44,051
(8.95 %)
109 Dalmatian pelican (alternate hap 2023)
GCA_030449815.1
n/a 12,766
(1.68 %)
26,055
(2.18 %)
n/a 43.44
(100.00 %)
n/a 7,284
(100.00 %)
607,561
(13.23 %)
239,649
(4.41 %)
6,086,519
(23.21 %)
38,398
(5.49 %)
110 Dalmatian pelican (BGI_N334 2014)
GCF_000687375.1
16,438
(2.13 %)
11,927
(1.44 %)
25,409
(1.84 %)
n/a 41.39
(99.65 %)
57,580
(0.36 %)
121,562
(99.64 %)
394,453
(5.19 %)
159,315
(0.83 %)
6,832,864
(19.52 %)
25,648
(0.91 %)
111 Dalmatian pelican (primary hap 2023)
GCA_030463565.1
n/a 13,457
(1.72 %)
25,299
(2.10 %)
n/a 43.41
(99.99 %)
390
(0.01 %)
311
(100.00 %)
660,747
(14.47 %)
294,268
(5.22 %)
6,840,996
(24.63 %)
39,705
(5.14 %)
112 Domestic goose (bAnsAns1.hap1.1 2024)
GCA_964211835.1
n/a 13,401
(1.75 %)
24,999
(2.15 %)
n/a 43.53
(99.99 %)
930
(0.01 %)
819
(100.00 %)
685,992
(5.59 %)
452,303
(8.91 %)
5,976,185
(28.48 %)
43,672
(4.38 %)
113 Domestic goose (bAnsAns1.hap2.1 2024)
GCA_964211785.1
n/a 12,473
(1.84 %)
22,849
(2.21 %)
n/a 43.41
(99.99 %)
754
(0.01 %)
1,135
(99.99 %)
594,136
(5.06 %)
375,813
(7.54 %)
5,497,978
(26.76 %)
39,164
(4.55 %)
114 Downy woodpecker (alternate hap 2020)
GCA_014839825.1
n/a 11,732
(1.74 %)
22,080
(2.25 %)
n/a 45.44
(100.00 %)
4
(0.00 %)
1,342
(100.00 %)
921,959
(20.95 %)
334,804
(3.26 %)
5,352,773
(31.27 %)
24,105
(1.81 %)
115 downy woodpecker (primary hap 2020)
GCF_014839835.1
25,483
(3.24 %)
12,410
(1.70 %)
22,416
(2.11 %)
n/a 45.31
(99.66 %)
187
(0.34 %)
180
(100.00 %)
1,259,627
(26.52 %)
378,533
(3.38 %)
5,846,661
(32.04 %)
26,005
(1.75 %)
116 East African grey crowned-crane
GCF_000709895.1
16,274
(2.23 %)
12,032
(1.55 %)
26,131
(1.84 %)
n/a 41.21
(99.65 %)
58,359
(0.36 %)
111,850
(99.64 %)
374,845
(4.51 %)
130,655
(0.66 %)
6,753,184
(18.86 %)
26,202
(0.96 %)
117 East African grey crowned-crane (alternate hap 2020)
GCA_011004865.1
n/a 11,799
(1.88 %)
22,122
(2.30 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
4
(0.00 %)
971
(100.00 %)
457,930
(6.40 %)
150,544
(0.85 %)
6,074,490
(20.16 %)
33,323
(3.81 %)
118 East African grey crowned-crane (primary hap 2020)
GCA_011004875.1
n/a 13,276
(1.84 %)
25,393
(2.30 %)
n/a 42.38
(99.61 %)
144
(0.39 %)
105
(100.00 %)
548,862
(7.06 %)
187,966
(0.97 %)
7,004,597
(21.19 %)
36,626
(3.69 %)
119 Eastern black-eared wheatear (GR-GAL-2019-014 2023)
GCF_029582105.1
38,171
(5.79 %)
12,559
(1.96 %)
23,642
(2.48 %)
n/a 42.01
(99.99 %)
582
(0.01 %)
587
(100.00 %)
599,051
(9.46 %)
453,954
(3.77 %)
6,287,657
(20.75 %)
27,831
(2.52 %)
120 emperor penguin
GCF_000699145.1
20,055
(3.28 %)
12,513
(1.77 %)
11,986
(2.13 %)
n/a 41.62
(94.30 %)
72,501
(5.72 %)
83,173
(94.28 %)
478,239
(5.68 %)
200,181
(2.24 %)
7,154,684
(17.95 %)
31,615
(1.38 %)
121 emu (2018)
GCF_003342905.1
36,047
(5.11 %)
12,857
(1.77 %)
17,727
(2.32 %)
n/a 41.63
(99.02 %)
1,408,082
(1.11 %)
2,778
(100.00 %)
440,224
(4.29 %)
175,539
(0.70 %)
7,218,815
(17.59 %)
43,752
(4.64 %)
122 emu (hap1 2024)
GCF_036370855.1
54,479
(5.65 %)
13,972
(1.59 %)
25,695
(1.97 %)
n/a 43.79
(100.00 %)
129
(0.00 %)
271
(100.00 %)
713,839
(12.11 %)
418,774
(7.08 %)
5,668,105
(24.04 %)
51,137
(7.32 %)
123 emu (hap2 2024)
GCA_036417515.1
n/a 12,839
(1.57 %)
24,113
(1.98 %)
n/a 44.40
(100.00 %)
101
(0.00 %)
242
(100.00 %)
657,460
(14.23 %)
397,600
(8.84 %)
4,824,789
(26.94 %)
48,081
(7.49 %)
124 emu (v2 ZJU1.0 2023)
GCA_016128335.2
n/a 13,213
(1.74 %)
24,562
(2.10 %)
n/a 42.41
(99.99 %)
539
(0.01 %)
767
(100.00 %)
567,285
(7.79 %)
258,030
(2.59 %)
7,108,005
(19.16 %)
41,752
(6.24 %)
125 Eurasian collared-dove (bStrDea1.hap1.1 2024)
GCA_964273445.1
n/a 13,292
(1.69 %)
25,387
(2.13 %)
n/a 41.80
(99.99 %)
696
(0.01 %)
2,451
(100.00 %)
489,065
(4.78 %)
331,025
(13.58 %)
6,196,233
(29.98 %)
37,567
(3.51 %)
126 Eurasian collared-dove (bStrDea1.hap2.1 2024)
GCA_964273585.1
n/a 13,051
(1.80 %)
24,815
(2.25 %)
n/a 42.33
(99.99 %)
683
(0.01 %)
584
(100.00 %)
482,819
(5.02 %)
292,761
(7.61 %)
6,282,928
(25.46 %)
35,630
(3.58 %)
127 Eurasian crane (hap1 2024)
GCA_964106855.1
n/a 13,457
(1.70 %)
24,519
(2.05 %)
n/a 44.24
(99.99 %)
593
(0.01 %)
754
(100.00 %)
516,462
(4.57 %)
262,941
(8.12 %)
5,356,948
(26.79 %)
48,488
(7.36 %)
128 Eurasian curlew (hap1 2024)
GCA_964106895.1
n/a 13,239
(1.66 %)
24,512
(2.02 %)
n/a 43.98
(99.99 %)
785
(0.01 %)
1,834
(100.00 %)
600,399
(6.45 %)
616,756
(7.75 %)
5,607,190
(28.35 %)
39,863
(3.53 %)
129 Eurasian curlew (hap2 2024)
GCA_964059295.1
n/a 12,728
(1.78 %)
23,645
(2.18 %)
n/a 43.53
(99.99 %)
693
(0.01 %)
1,504
(99.99 %)
544,959
(6.24 %)
393,773
(4.49 %)
5,839,698
(24.52 %)
35,759
(3.26 %)
130 Eurasian nightjar (alternate hap 2021)
GCA_907165095.1
n/a 12,266
(1.90 %)
22,091
(2.30 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
25
(0.00 %)
2,502
(100.00 %)
458,278
(5.64 %)
212,205
(1.54 %)
6,032,224
(21.16 %)
21,942
(1.89 %)
131 Eurasian nightjar (primary hap 2021)
GCA_907165065.1
n/a 13,040
(1.86 %)
22,823
(2.21 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
153
(0.00 %)
121
(100.00 %)
595,803
(8.38 %)
248,128
(1.78 %)
6,744,611
(22.18 %)
24,805
(1.90 %)
132 Eurasian tree sparrow
GCF_014805655.1
43,477
(5.70 %)
12,550
(1.95 %)
24,541
(2.43 %)
n/a 42.02
(99.82 %)
4,765
(0.18 %)
18,975
(100.00 %)
464,973
(6.08 %)
492,684
(3.98 %)
6,663,773
(20.49 %)
28,741
(2.30 %)
133 European golden plover (primary hap 2021)
GCA_017639485.1
n/a 12,984
(1.78 %)
22,854
(2.04 %)
n/a 42.70
(99.01 %)
268
(0.99 %)
107
(100.00 %)
558,587
(8.35 %)
180,400
(0.83 %)
7,132,381
(21.18 %)
40,661
(3.41 %)
134 European robin (alternate hap 2021)
GCA_903797565.2
n/a 11,359
(1.98 %)
21,437
(2.45 %)
n/a 41.70
(100.00 %)
18
(0.00 %)
3,668
(100.00 %)
346,477
(2.88 %)
283,542
(2.49 %)
5,597,130
(19.71 %)
22,977
(2.32 %)
135 European robin (primary hap 2021)
GCA_903797595.2
n/a 12,344
(1.85 %)
23,934
(2.37 %)
n/a 42.10
(99.97 %)
990
(0.03 %)
1,119
(100.00 %)
532,973
(5.96 %)
401,820
(3.43 %)
6,320,210
(21.42 %)
30,391
(2.60 %)
136 European shag (alternate hap 2023)
GCA_949628205.1
n/a 11,681
(1.64 %)
22,195
(2.04 %)
n/a 43.00
(100.00 %)
1
(0.00 %)
9,752
(100.00 %)
363,092
(4.61 %)
347,630
(2.63 %)
5,664,392
(21.56 %)
32,162
(3.60 %)
137 European shag (primary hap 2023)
GCA_949628215.1
n/a 13,203
(1.74 %)
22,959
(2.04 %)
n/a 43.10
(100.00 %)
222
(0.00 %)
356
(100.00 %)
436,838
(4.84 %)
471,070
(3.20 %)
6,601,537
(22.79 %)
37,247
(3.95 %)
138 European turtle dove (v1.2 2021)
GCA_901699155.2
n/a 12,391
(1.76 %)
23,333
(2.17 %)
n/a 41.84
(99.67 %)
940
(0.33 %)
311
(100.00 %)
550,895
(7.50 %)
227,532
(1.16 %)
6,767,530
(21.05 %)
34,682
(2.57 %)
139 European turtle dove (v1.2 alternate hap 2021)
GCA_901699165.2
n/a 11,276
(1.79 %)
21,210
(2.15 %)
n/a 41.73
(100.00 %)
n/a 3,334
(100.00 %)
426,785
(4.89 %)
182,446
(0.97 %)
6,038,491
(20.24 %)
29,692
(2.35 %)
140 Eurpoean golden plover (bPluApr1 alternate hap 2021)
GCA_017639475.1
n/a 11,836
(1.83 %)
21,119
(2.12 %)
n/a 42.78
(100.00 %)
5
(0.00 %)
1,147
(100.00 %)
443,887
(6.00 %)
149,233
(0.76 %)
6,328,128
(20.72 %)
37,413
(3.59 %)
141 garden warbler (bSylBor1 alternate hap 2020)
GCA_014839765.1
n/a 12,359
(1.95 %)
23,228
(2.46 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
n/a 775
(100.00 %)
485,213
(6.08 %)
333,505
(2.21 %)
6,358,327
(19.87 %)
26,594
(2.34 %)
142 garden warbler (primary hap 2020)
GCA_014839755.1
n/a 12,520
(1.95 %)
23,459
(2.46 %)
n/a 42.08
(99.82 %)
134
(0.18 %)
176
(100.00 %)
491,810
(6.09 %)
376,746
(2.55 %)
6,461,292
(20.23 %)
27,799
(2.40 %)
143 golden eagle (v1.4 2021)
GCF_900496995.4
60,920
(5.98 %)
13,334
(1.84 %)
23,261
(2.12 %)
n/a 42.16
(99.58 %)
228
(0.42 %)
144
(100.00 %)
544,341
(5.93 %)
186,461
(0.80 %)
7,090,610
(20.01 %)
38,495
(3.10 %)
144 golden eagle (v1.4 alternate hap 2021)
GCA_902153765.2
n/a 9,172
(1.85 %)
16,917
(2.12 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
2
(0.00 %)
3,855
(100.00 %)
377,153
(8.49 %)
117,959
(0.78 %)
4,418,970
(18.34 %)
27,767
(3.57 %)
145 golden pheasant
GCA_003413605.1
n/a 12,891
(2.28 %)
21,429
(2.37 %)
n/a 40.87
(97.55 %)
51,170
(2.47 %)
65,464
(97.53 %)
541,931
(8.01 %)
249,405
(2.01 %)
6,173,989
(19.98 %)
22,227
(1.31 %)
146 golden-collared manakin
GCF_001715985.3
27,575
(4.33 %)
11,806
(1.85 %)
13,267
(2.32 %)
n/a 41.42
(97.44 %)
20,874
(2.57 %)
3,619
(100.00 %)
447,084
(7.00 %)
197,843
(1.19 %)
6,198,932
(18.50 %)
18,804
(1.03 %)
147 great cormorant (BGI_N336 2014)
GCF_000708925.1
15,472
(2.07 %)
11,547
(1.44 %)
22,727
(1.73 %)
n/a 41.28
(99.25 %)
98,475
(0.77 %)
162,787
(99.23 %)
324,530
(4.59 %)
144,409
(1.43 %)
6,724,538
(18.06 %)
14,330
(0.42 %)
148 great cormorant (primary hap 2024 genbank)
GCA_963921805.1
n/a 13,434
(1.76 %)
30,619
(3.17 %)
n/a 43.47
(99.99 %)
493
(0.01 %)
351
(100.00 %)
556,740
(10.18 %)
303,279
(3.45 %)
6,599,611
(22.65 %)
38,341
(5.45 %)
149 great cormorant (primary hap 2024 refseq)
GCF_963921805.1
46,253
(5.46 %)
13,432
(1.76 %)
23,419
(2.08 %)
n/a 43.47
(99.99 %)
493
(0.01 %)
350
(100.00 %)
556,733
(10.18 %)
303,277
(3.45 %)
6,599,550
(22.65 %)
38,340
(5.45 %)
150 great potoo (bNycGra1 alternate hap 2020)
GCA_013368595.1
n/a 11,630
(1.85 %)
20,866
(2.20 %)
n/a 42.73
(100.00 %)
14
(0.00 %)
1,395
(100.00 %)
421,187
(9.08 %)
159,172
(0.96 %)
5,602,689
(22.75 %)
29,548
(2.77 %)
151 great potoo (primary hap 2020 genbank)
GCA_013368605.1
n/a 13,116
(1.77 %)
23,657
(2.10 %)
n/a 42.67
(99.51 %)
243
(0.49 %)
191
(100.00 %)
514,142
(9.71 %)
210,381
(1.13 %)
6,501,989
(23.95 %)
35,785
(2.69 %)
152 great potoo (primary hap 2020 refseq)
GCF_013368605.1
33,115
(3.89 %)
13,120
(1.77 %)
23,657
(2.10 %)
n/a 42.67
(99.51 %)
243
(0.49 %)
190
(100.00 %)
610,506
(15.46 %)
210,373
(1.13 %)
6,501,918
(23.95 %)
35,788
(2.78 %)
153 great tit
GCF_001522545.3
46,201
(6.78 %)
12,250
(2.00 %)
16,577
(2.52 %)
n/a 41.37
(98.24 %)
24,615
(1.76 %)
24,044
(98.24 %)
447,566
(5.89 %)
249,384
(1.36 %)
6,330,291
(19.11 %)
23,876
(1.88 %)
154 greater honeyguide (239-I01 2023)
GCF_027791375.1
20,607
(2.63 %)
12,184
(1.76 %)
21,560
(2.12 %)
n/a 43.63
(100.00 %)
556
(0.00 %)
1,452
(100.00 %)
804,583
(12.49 %)
291,451
(3.14 %)
5,887,349
(28.34 %)
19,623
(1.55 %)
155 greater prairie chicken
GCA_001870855.1
n/a 12,923
(2.36 %)
24,062
(2.50 %)
n/a 41.23
(99.63 %)
48,408
(0.39 %)
60,594
(99.61 %)
544,139
(7.50 %)
214,682
(0.99 %)
6,153,628
(19.86 %)
23,154
(2.26 %)
156 greater rhea
GCA_003343005.1
n/a 12,895
(1.81 %)
20,976
(2.06 %)
n/a 40.79
(98.79 %)
2,075,293
(1.40 %)
2,162
(100.00 %)
509,589
(0.00 %)
196,258
(0.73 %)
6,982,184
(18.70 %)
41,811
(3.95 %)
157 greater sage-grouse
GCF_019232065.1
36,656
(5.50 %)
12,419
(2.36 %)
21,319
(2.40 %)
n/a 41.16
(96.34 %)
9,894
(3.66 %)
1,502
(100.00 %)
574,006
(8.05 %)
196,630
(0.72 %)
5,996,002
(19.65 %)
18,807
(1.81 %)
158 green peafowl
GCA_016647715.1
n/a 12,897
(2.25 %)
23,427
(2.41 %)
n/a 41.73
(98.15 %)
32,668
(1.85 %)
2,446
(100.00 %)
481,865
(6.04 %)
188,685
(1.04 %)
6,268,032
(20.57 %)
22,330
(1.85 %)
159 grey parrot (MU2MI4XJKV 2020)
GCA_009867235.1
n/a 13,159
(1.57 %)
41,528
(2.68 %)
n/a 41.82
(99.96 %)
4,777
(0.03 %)
54,154
(99.97 %)
525,535
(7.07 %)
222,932
(1.16 %)
6,301,005
(19.38 %)
28,978
(2.14 %)
160 ground parrot (Strahan ANWC-B61680 2023)
GCF_028554395.1
41,746
(4.05 %)
13,173
(1.89 %)
24,269
(2.31 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
n/a 8,090
(100.00 %)
468,845
(6.23 %)
261,918
(2.42 %)
5,956,005
(21.98 %)
25,573
(1.77 %)
161 gyrfalcon (bFalRus1 alternate hap 2020)
GCA_015220155.1
n/a 6,534
(1.74 %)
12,152
(1.97 %)
n/a 42.70
(100.00 %)
n/a 8,370
(100.00 %)
179,674
(3.19 %)
76,165
(0.79 %)
2,908,228
(16.85 %)
11,838
(2.15 %)
162 gyrfalcon (primary hap 2020)
GCF_015220075.1
47,961
(5.90 %)
13,016
(1.82 %)
21,266
(2.02 %)
n/a 42.20
(99.55 %)
635
(0.45 %)
133
(100.00 %)
484,104
(5.60 %)
186,430
(0.85 %)
7,162,723
(18.83 %)
24,760
(2.03 %)
163 Harpy eagle (bHarHar1 alternate hap 2022)
GCA_026419925.1
n/a 11,838
(1.64 %)
24,014
(2.16 %)
n/a 43.80
(100.00 %)
1
(0.00 %)
5,969
(100.00 %)
405,109
(3.51 %)
220,222
(6.17 %)
4,708,177
(25.30 %)
58,446
(5.44 %)
164 Harpy eagle (primary hap 2022 refseq)
GCF_026419915.1
51,641
(5.08 %)
13,412
(1.70 %)
24,002
(2.05 %)
n/a 43.39
(99.80 %)
342
(0.20 %)
322
(100.00 %)
456,476
(3.62 %)
260,495
(7.70 %)
5,658,773
(24.81 %)
60,606
(5.66 %)
165 Hawaiian crow (bCorHaw1 alternate hap 2021)
GCA_020740675.1
n/a 7,477
(1.92 %)
14,094
(2.40 %)
n/a 43.16
(100.00 %)
n/a 2,762
(100.00 %)
296,732
(12.20 %)
135,408
(4.08 %)
3,123,655
(20.92 %)
23,288
(3.74 %)
166 Hawaiian crow (primary hap 2021 refseq)
GCF_020740725.1
51,593
(6.18 %)
12,739
(1.83 %)
23,664
(2.30 %)
n/a 43.30
(99.84 %)
294
(0.16 %)
188
(100.00 %)
409,129
(0.00 %)
304,680
(5.73 %)
5,953,375
(23.59 %)
46,118
(3.85 %)
167 helmeted guineafowl
GCF_002078875.1
55,435
(7.96 %)
12,866
(2.29 %)
18,391
(2.68 %)
n/a 41.73
(98.08 %)
15,598
(1.93 %)
2,739
(100.00 %)
486,655
(7.97 %)
173,056
(0.98 %)
6,144,176
(20.18 %)
26,577
(2.39 %)
168 hoatzin (BGI_N306 2014)
GCF_000692075.1
14,928
(2.31 %)
11,454
(1.65 %)
11,717
(2.07 %)
n/a 42.42
(94.92 %)
99,371
(5.11 %)
109,627
(94.89 %)
360,821
(6.34 %)
145,440
(1.01 %)
6,679,356
(18.72 %)
40,581
(1.42 %)
169 hoatzin (hap1 2023)
GCA_030867145.1
n/a 13,089
(1.50 %)
29,621
(2.22 %)
n/a 45.56
(100.00 %)
268
(0.00 %)
683
(100.00 %)
610,333
(22.07 %)
252,997
(12.56 %)
5,154,598
(31.67 %)
58,754
(5.54 %)
170 hoatzin (hap2 2023)
GCA_030867165.1
n/a 12,349
(1.54 %)
27,206
(2.21 %)
n/a 45.91
(100.00 %)
212
(0.00 %)
535
(100.00 %)
529,757
(21.69 %)
235,999
(14.32 %)
4,845,810
(31.86 %)
53,781
(5.77 %)
171 hooded crow (v6 S_Up_H32 2022)
GCF_000738735.6
42,787
(6.57 %)
11,856
(1.93 %)
20,738
(2.23 %)
n/a 42.10
(99.68 %)
425
(0.32 %)
47
(100.00 %)
458,399
(8.32 %)
164,830
(0.93 %)
6,148,741
(19.00 %)
25,266
(2.09 %)
172 house finch (bHaeMex1 alternate hap 2022)
GCA_027406555.1
n/a 12,027
(1.89 %)
23,973
(2.49 %)
n/a 43.03
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1,004
(100.00 %)
385,230
(3.05 %)
398,497
(5.70 %)
5,772,203
(22.69 %)
28,740
(2.98 %)
173 house finch (primary hap 2022 refseq)
GCF_027477595.1
43,228
(5.71 %)
12,702
(1.83 %)
24,568
(2.38 %)
n/a 42.91
(99.02 %)
296
(0.98 %)
184
(100.00 %)
440,384
(3.17 %)
463,164
(6.37 %)
6,300,138
(23.47 %)
30,897
(2.53 %)
174 house sparrow (hap1 2024 genbank)
GCA_036417665.1
n/a 12,831
(1.61 %)
26,124
(2.26 %)
n/a 43.99
(100.00 %)
202
(0.00 %)
334
(100.00 %)
647,396
(12.37 %)
646,615
(14.14 %)
5,906,524
(30.36 %)
36,193
(2.91 %)
175 house sparrow (hap1 2024 refseq)
GCF_036417665.1
75,216
(7.36 %)
12,832
(1.61 %)
26,124
(2.26 %)
n/a 43.99
(100.00 %)
204
(0.00 %)
335
(100.00 %)
647,402
(12.37 %)
646,615
(14.14 %)
5,906,561
(30.36 %)
36,193
(2.91 %)
176 house sparrow (hap2 2024)
GCA_036417895.1
n/a 12,201
(1.59 %)
24,721
(2.19 %)
n/a 44.46
(100.00 %)
182
(0.00 %)
482
(100.00 %)
629,688
(12.73 %)
644,409
(14.12 %)
5,103,050
(31.93 %)
33,424
(2.42 %)
177 Humboldt's penguin (bSphHub1 alternate hap 2022)
GCA_027474345.1
n/a 11,806
(1.66 %)
21,429
(1.97 %)
n/a 43.73
(100.00 %)
1
(0.00 %)
4,343
(100.00 %)
508,803
(10.25 %)
162,918
(5.44 %)
6,029,969
(24.67 %)
27,953
(3.83 %)
178 Humboldt's penguin (bSphHub1 primary hap 2022)
GCA_027474245.1
n/a 13,233
(1.67 %)
23,010
(1.93 %)
n/a 43.91
(99.92 %)
253
(0.08 %)
136
(100.00 %)
610,144
(11.51 %)
214,393
(5.75 %)
6,069,916
(25.74 %)
33,172
(3.38 %)
179 hyacinth macaw (LEKZKR9XQ3 2022)
GCA_009936445.2
n/a 12,424
(1.21 %)
43,440
(2.06 %)
n/a 41.86
(99.95 %)
1,098
(0.00 %)
260,829
(100.00 %)
497,886
(5.29 %)
184,967
(0.96 %)
6,167,538
(20.22 %)
33,529
(1.55 %)
180 jackdaw
GCA_013407035.1
n/a 12,072
(1.93 %)
20,925
(2.08 %)
n/a 42.15
(99.72 %)
511
(0.28 %)
41
(100.00 %)
428,760
(6.13 %)
173,436
(1.02 %)
6,231,317
(19.25 %)
26,177
(2.17 %)
181 Japanese quail
GCF_001577835.2
49,210
(7.77 %)
12,864
(2.54 %)
22,540
(2.69 %)
37,604
(4.36 %)
41.28
(98.88 %)
11,601
(1.12 %)
9,642
(98.88 %)
559,601
(7.91 %)
321,128
(2.22 %)
5,497,911
(19.81 %)
17,977
(1.86 %)
182 kagu (bRhyJub1 alternate hap 2023)
GCA_027595965.1
n/a 8,732
(1.74 %)
16,473
(2.17 %)
n/a 45.10
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,819
(100.00 %)
314,902
(10.49 %)
133,061
(10.84 %)
3,656,435
(25.68 %)
32,592
(5.25 %)
183 kagu (bRhyJub1 primary hap 2023)
GCA_027574665.1
n/a 13,042
(1.63 %)
24,142
(2.01 %)
n/a 45.07
(99.96 %)
300
(0.04 %)
148
(100.00 %)
563,851
(12.90 %)
270,861
(12.36 %)
6,191,106
(28.24 %)
54,426
(4.92 %)
184 kakapo (Jane alternate hap 2019)
GCA_004011185.1
n/a 3,256
(1.65 %)
6,220
(1.98 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
11
(0.00 %)
3,728
(100.00 %)
127,817
(7.83 %)
53,447
(1.21 %)
1,502,789
(18.09 %)
5,487
(1.71 %)
185 kakapo (v2 Jane 2020 refseq)
GCF_004027225.2
49,757
(5.76 %)
13,110
(1.92 %)
22,782
(2.26 %)
n/a 41.97
(99.08 %)
373
(0.92 %)
89
(100.00 %)
507,148
(7.85 %)
208,178
(1.08 %)
6,258,087
(20.50 %)
22,278
(1.77 %)
186 kea
GCF_000696875.1
15,953
(2.35 %)
11,985
(1.66 %)
22,107
(2.01 %)
n/a 41.09
(99.60 %)
51,381
(0.42 %)
93,561
(99.58 %)
368,226
(5.60 %)
138,157
(0.75 %)
5,905,331
(18.06 %)
7,218
(0.22 %)
187 killdeer
GCF_000708025.1
16,480
(2.43 %)
12,356
(1.72 %)
12,853
(2.15 %)
n/a 41.88
(97.24 %)
63,995
(2.78 %)
79,162
(97.22 %)
424,095
(5.93 %)
167,406
(0.94 %)
7,070,701
(19.44 %)
37,082
(1.57 %)
188 king vulture (hap1 2024)
GCA_037962945.1
n/a 13,641
(1.52 %)
24,293
(1.78 %)
n/a 44.12
(100.00 %)
154
(0.00 %)
130
(100.00 %)
484,661
(3.34 %)
252,569
(16.01 %)
5,595,734
(32.51 %)
77,942
(3.59 %)
189 king vulture (hap2 2024)
GCA_037950955.1
n/a 12,764
(1.49 %)
23,033
(1.77 %)
n/a 44.67
(100.00 %)
128
(0.00 %)
140
(100.00 %)
432,536
(3.01 %)
230,315
(20.91 %)
4,960,923
(35.56 %)
86,907
(3.76 %)
190 lammergeier (bGypBar2 alternate hap 2023)
GCA_028017155.1
n/a 10,584
(1.75 %)
19,112
(2.09 %)
n/a 43.19
(100.00 %)
n/a 2,892
(100.00 %)
363,564
(3.53 %)
235,220
(7.22 %)
5,072,834
(23.83 %)
24,909
(2.64 %)
191 lammergeier (bGypBar2 primary hap 2023)
GCA_028022735.1
n/a 13,529
(1.69 %)
23,672
(1.98 %)
n/a 43.50
(99.85 %)
259
(0.15 %)
232
(100.00 %)
491,653
(3.53 %)
349,011
(9.83 %)
5,955,030
(26.51 %)
32,237
(2.61 %)
192 lance-tailed manakin (2020)
GCF_009829145.1
46,366
(5.56 %)
12,594
(1.91 %)
22,763
(2.31 %)
26,057
(3.91 %)
41.97
(99.70 %)
206
(0.30 %)
93
(100.00 %)
485,121
(7.13 %)
247,189
(1.64 %)
6,498,294
(20.04 %)
25,377
(1.97 %)
193 lance-tailed manakin (alternate hap 2020)
GCA_009829205.1
n/a 12,282
(1.85 %)
23,867
(2.36 %)
n/a 42.20
(100.00 %)
n/a 4,269
(100.00 %)
472,384
(7.01 %)
237,680
(1.65 %)
6,121,661
(19.48 %)
25,589
(2.05 %)
194 lanner falcon (bFalBia1 alternate hap 2022)
GCA_023634305.1
n/a 12,458
(1.70 %)
22,259
(2.05 %)
n/a 43.23
(100.00 %)
n/a 3,090
(100.00 %)
413,301
(3.46 %)
189,449
(5.28 %)
5,962,597
(22.07 %)
31,611
(2.72 %)
195 lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023638135.1
48,561
(5.70 %)
12,862
(1.69 %)
21,562
(1.92 %)
n/a 43.03
(99.83 %)
158
(0.17 %)
397
(100.00 %)
439,975
(3.77 %)
203,640
(6.96 %)
6,921,438
(23.57 %)
32,398
(2.65 %)
196 lesser black-backed gull (primary hap 2024)
GCA_963932225.1
n/a 13,333
(1.68 %)
24,731
(2.05 %)
n/a 44.40
(99.99 %)
537
(0.01 %)
1,382
(100.00 %)
509,160
(5.11 %)
266,609
(9.64 %)
6,827,304
(27.15 %)
44,108
(6.34 %)
197 lesser kestrel (alternate hap 2021)
GCA_017639645.1
n/a 12,578
(1.83 %)
22,257
(2.16 %)
n/a 42.51
(98.97 %)
258
(1.03 %)
551
(100.00 %)
431,717
(3.61 %)
201,876
(1.38 %)
6,620,060
(19.16 %)
27,552
(2.26 %)
198 lesser kestrel (v2 2021)
GCF_017639655.2
47,420
(5.64 %)
13,098
(1.80 %)
22,203
(2.07 %)
n/a 42.30
(99.66 %)
298
(0.34 %)
291
(100.00 %)
516,499
(5.58 %)
210,234
(1.26 %)
7,133,934
(19.19 %)
27,558
(2.21 %)
199 lesser prairie-chicken (F22 2022)
GCF_026119805.1
51,352
(6.92 %)
12,689
(2.35 %)
22,377
(2.51 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
58
(0.00 %)
206
(100.00 %)
498,179
(5.36 %)
218,390
(1.80 %)
6,038,211
(20.76 %)
20,648
(2.33 %)
200 lesser rhea (206185 2018)
GCA_003342835.1
n/a 13,105
(1.81 %)
25,654
(2.45 %)
n/a 40.86
(98.66 %)
1,039,616
(1.43 %)
3,019
(100.00 %)
522,333
(5.61 %)
208,867
(0.79 %)
7,080,214
(19.15 %)
42,016
(4.35 %)
201 lesser rhea (bPtePen1 alternate hap 2023)
GCA_028389885.1
n/a 10,465
(1.71 %)
19,083
(2.16 %)
n/a 42.10
(100.00 %)
n/a 910
(100.00 %)
520,125
(6.78 %)
251,547
(4.21 %)
5,321,207
(21.53 %)
34,698
(5.69 %)
202 lesser rhea (bPtePen1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028389875.1
39,024
(4.18 %)
13,360
(1.72 %)
23,870
(2.13 %)
n/a 42.45
(99.89 %)
128
(0.11 %)
180
(100.00 %)
674,149
(6.73 %)
329,124
(5.34 %)
6,820,245
(22.78 %)
45,073
(5.83 %)
203 little egret
GCF_000687185.1
25,843
(3.55 %)
12,162
(1.73 %)
10,954
(2.03 %)
n/a 42.25
(95.99 %)
88,871
(4.04 %)
100,662
(95.96 %)
490,997
(6.84 %)
165,380
(1.23 %)
6,955,585
(18.98 %)
31,136
(1.15 %)
204 long-tailed duck (primary hap 2024)
GCA_963989345.1
n/a 13,329
(1.88 %)
23,888
(2.25 %)
n/a 42.30
(99.99 %)
544
(0.01 %)
272
(100.00 %)
784,647
(6.78 %)
501,860
(7.36 %)
6,388,957
(26.13 %)
34,028
(3.04 %)
205 long-tailed hermit (PSU5 alternate hap 2022)
GCA_023637925.1
n/a 12,264
(2.01 %)
20,528
(2.37 %)
n/a 40.99
(100.00 %)
n/a 230
(100.00 %)
498,393
(5.07 %)
266,700
(1.49 %)
6,131,743
(20.45 %)
15,809
(1.43 %)
206 long-tailed hermit (PSU5 primary hap 2022)
GCA_023637945.1
n/a 12,328
(2.02 %)
20,312
(2.34 %)
n/a 41.00
(99.63 %)
141
(0.37 %)
211
(99.63 %)
497,506
(5.06 %)
265,815
(1.51 %)
6,045,702
(20.10 %)
15,922
(1.43 %)
207 Macqueen's bustard (BGI_N324 2014)
GCF_000695195.1
15,790
(2.21 %)
11,632
(1.52 %)
24,790
(1.96 %)
n/a 41.10
(99.68 %)
56,130
(0.33 %)
115,823
(99.67 %)
391,856
(4.80 %)
148,075
(0.90 %)
6,682,530
(20.03 %)
27,675
(1.15 %)
208 Macqueen's bustard (maternal hap 2024)
GCA_036417535.1
n/a 13,082
(1.73 %)
27,150
(2.44 %)
n/a 43.25
(100.00 %)
100
(0.00 %)
329
(100.00 %)
669,243
(14.71 %)
211,387
(6.69 %)
6,514,716
(27.07 %)
47,331
(8.09 %)
209 Macqueen's bustard (paternal 2024)
GCA_036418225.1
n/a 11,814
(1.80 %)
23,161
(2.38 %)
n/a 43.09
(100.00 %)
84
(0.00 %)
343
(100.00 %)
586,864
(13.28 %)
184,036
(5.91 %)
5,606,205
(25.25 %)
42,560
(7.71 %)
210 maguari stork (bCicMag1 alternate hap 2021)
GCA_017639665.1
n/a 10,658
(1.74 %)
18,941
(1.98 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
5
(0.00 %)
4,278
(100.00 %)
326,479
(4.02 %)
141,715
(0.74 %)
5,600,372
(19.59 %)
27,330
(3.35 %)
211 maguari stork (primary hap 2021)
GCA_017639555.1
n/a 12,905
(1.81 %)
22,204
(2.01 %)
n/a 42.12
(98.21 %)
232
(1.79 %)
153
(100.00 %)
485,318
(6.35 %)
184,992
(0.78 %)
7,064,965
(19.56 %)
31,653
(3.02 %)
212 mallard (CAU_Wild1.0 2019)
GCA_008746955.1
n/a 13,260
(1.85 %)
25,071
(2.17 %)
n/a 42.41
(99.90 %)
318
(0.10 %)
1,665
(100.00 %)
849,782
(8.18 %)
438,622
(5.10 %)
6,729,782
(25.03 %)
34,670
(3.03 %)
213 mallard (hap1 2024)
GCA_964188345.1
n/a 13,680
(1.77 %)
26,845
(2.33 %)
n/a 42.87
(99.99 %)
571
(0.01 %)
936
(100.00 %)
941,876
(15.92 %)
570,703
(9.50 %)
6,169,980
(28.67 %)
41,791
(3.18 %)
214 mallard (hap2 2024)
GCA_964188335.1
n/a 12,715
(1.89 %)
24,338
(2.42 %)
n/a 42.70
(99.99 %)
485
(0.01 %)
972
(99.99 %)
795,168
(13.44 %)
445,147
(7.71 %)
5,728,430
(26.21 %)
35,679
(3.13 %)
215 mallard (Pekin duck Z2 2020 Zhejiang U)
GCF_015476345.1
59,854
(7.33 %)
12,988
(1.87 %)
23,709
(2.20 %)
86,787
(8.80 %)
42.27
(99.64 %)
905
(0.36 %)
756
(100.00 %)
803,558
(8.04 %)
417,575
(5.02 %)
6,627,843
(24.59 %)
35,030
(3.06 %)
216 mallard PBH1.5
GCF_003850225.1
54,114
(7.47 %)
12,199
(1.86 %)
15,363
(2.33 %)
n/a 41.63
(99.77 %)
71,703
(0.26 %)
2,150
(100.00 %)
770,322
(8.16 %)
357,617
(3.09 %)
6,587,406
(21.92 %)
29,913
(2.33 %)
217 Mariana crow
GCF_017639235.1
48,460
(7.00 %)
12,506
(1.97 %)
22,580
(2.35 %)
n/a 42.14
(98.94 %)
10,579
(1.06 %)
1,443
(100.00 %)
434,280
(5.91 %)
169,629
(0.82 %)
6,323,058
(18.94 %)
27,390
(2.04 %)
218 Mauritius kestrel (alternate hap 2023)
GCA_963210275.1
n/a 4,774
(1.89 %)
8,695
(2.32 %)
n/a 43.52
(100.00 %)
n/a 2,259
(100.00 %)
135,092
(3.67 %)
112,042
(8.63 %)
1,739,144
(22.50 %)
12,908
(3.26 %)
219 Mauritius kestrel (primary hap 2023)
GCA_963210335.1
n/a 13,064
(1.72 %)
22,269
(1.98 %)
n/a 42.67
(99.99 %)
407
(0.01 %)
316
(100.00 %)
459,578
(3.87 %)
315,686
(6.19 %)
6,650,507
(22.84 %)
36,076
(2.82 %)
220 Mauritius parakeet (alternate hap 2023)
GCA_963243765.1
n/a 8,873
(1.81 %)
16,175
(2.24 %)
n/a 42.92
(100.00 %)
n/a 2,130
(100.00 %)
331,293
(6.89 %)
161,393
(5.94 %)
3,516,196
(24.86 %)
16,659
(1.74 %)
221 Mauritius parakeet (primary hap 2023)
GCA_963264785.1
n/a 13,133
(1.81 %)
23,396
(2.19 %)
n/a 42.66
(99.99 %)
358
(0.01 %)
172
(100.00 %)
511,156
(7.05 %)
238,915
(5.05 %)
5,764,523
(25.19 %)
24,675
(1.70 %)
222 medium ground-finch
GCF_000277835.1
22,226
(4.24 %)
11,887
(1.83 %)
11,438
(2.19 %)
n/a 41.61
(97.77 %)
68,589
(2.25 %)
95,828
(97.75 %)
433,244
(5.91 %)
322,831
(2.24 %)
6,548,136
(19.49 %)
18,135
(0.69 %)
223 monk parakeet
GCA_017639245.1
n/a 13,067
(1.85 %)
n/a n/a 42.29
(99.99 %)
352
(0.01 %)
291
(100.00 %)
582,436
(9.49 %)
253,709
(2.79 %)
5,820,920
(22.52 %)
23,101
(1.75 %)
224 Montezuma quail (F1298 2024)
GCF_038088225.1
28,327
(3.95 %)
12,793
(2.29 %)
22,305
(2.47 %)
n/a 41.36
(100.00 %)
234
(0.00 %)
521
(100.00 %)
458,084
(6.03 %)
243,493
(3.14 %)
5,553,010
(22.13 %)
22,147
(2.41 %)
225 mute swan (bCygOlo1 v2 alternate hap 2021)
GCA_009769485.2
n/a 10,145
(1.98 %)
18,617
(2.30 %)
n/a 42.21
(100.00 %)
14
(0.00 %)
5,640
(100.00 %)
533,330
(9.11 %)
213,518
(1.29 %)
4,813,886
(20.16 %)
25,667
(3.86 %)
226 mute swan (v2 primary hap 2021)
GCF_009769625.2
59,524
(6.76 %)
12,983
(1.98 %)
22,400
(2.22 %)
33,839
(5.17 %)
41.92
(99.13 %)
451
(0.87 %)
171
(100.00 %)
700,051
(7.55 %)
301,579
(1.34 %)
6,791,838
(21.30 %)
31,278
(3.07 %)
227 Nelson's sparrow (bAmmNel1 alternate hap 2023)
GCA_027579665.1
n/a 11,687
(1.78 %)
24,169
(2.43 %)
n/a 43.32
(100.00 %)
n/a 2,834
(100.00 %)
414,780
(3.26 %)
491,012
(10.03 %)
5,570,475
(26.24 %)
29,485
(4.55 %)
228 Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027579445.1
31,033
(4.42 %)
12,385
(1.72 %)
24,339
(2.24 %)
n/a 43.01
(99.57 %)
215
(0.43 %)
77
(100.00 %)
479,994
(3.33 %)
443,098
(9.18 %)
6,350,593
(25.82 %)
31,693
(3.88 %)
229 New Caledonian crow (alternate hap 2019)
GCA_009651025.1
n/a 11,097
(1.99 %)
20,436
(2.45 %)
n/a 42.67
(100.00 %)
n/a 894
(100.00 %)
377,050
(6.03 %)
178,064
(1.53 %)
5,305,126
(19.49 %)
26,107
(2.52 %)
230 New Caledonian crow (primary hap 2019)
GCF_009650955.1
50,821
(6.95 %)
12,747
(1.94 %)
23,372
(2.37 %)
30,299
(3.60 %)
42.57
(97.41 %)
289
(2.59 %)
105
(100.00 %)
452,690
(6.21 %)
231,546
(1.70 %)
6,265,995
(19.54 %)
31,909
(2.48 %)
231 Nicobar pigeon (hap1 2024 genbank)
GCA_036013445.1
n/a 13,359
(1.72 %)
24,921
(2.13 %)
n/a 44.64
(100.00 %)
117
(0.00 %)
807
(100.00 %)
705,078
(18.28 %)
342,299
(9.55 %)
6,410,095
(28.06 %)
38,589
(9.40 %)
232 Nicobar pigeon (hap1 2024 refseq)
GCF_036013445.1
34,506
(4.09 %)
13,358
(1.72 %)
24,851
(2.13 %)
n/a 44.64
(100.00 %)
117
(0.00 %)
806
(100.00 %)
705,074
(18.28 %)
342,297
(9.55 %)
6,410,054
(28.06 %)
38,589
(9.40 %)
233 Nicobar pigeon (hap2 2024)
GCA_036010745.1
n/a 13,270
(1.84 %)
24,753
(2.28 %)
n/a 42.94
(100.00 %)
118
(0.00 %)
226
(100.00 %)
675,092
(12.72 %)
313,111
(3.64 %)
6,547,843
(23.22 %)
37,728
(3.88 %)
234 night parrot (Australia 2023)
GCF_034315485.1
48,921
(5.26 %)
12,986
(1.89 %)
22,892
(2.24 %)
n/a 42.22
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3,593
(100.00 %)
487,881
(6.13 %)
259,865
(3.37 %)
5,961,641
(22.88 %)
24,673
(1.77 %)
235 North Island brown kiwi (hap1 2024 genbank)
GCA_036417845.1
n/a 13,670
(1.52 %)
33,383
(2.64 %)
n/a 44.01
(100.00 %)
170
(0.00 %)
409
(100.00 %)
713,271
(8.42 %)
603,937
(6.25 %)
5,379,113
(27.65 %)
50,913
(9.74 %)
236 North Island brown kiwi (hap1 2024 refseq)
GCF_036417845.1
39,806
(3.75 %)
13,668
(1.52 %)
25,226
(1.90 %)
n/a 44.01
(100.00 %)
170
(0.00 %)
408
(100.00 %)
713,264
(8.42 %)
603,930
(6.25 %)
5,379,069
(27.65 %)
50,913
(9.74 %)
237 North Island brown kiwi (hap2 2024)
GCA_036417975.1
n/a 13,664
(1.44 %)
37,696
(2.80 %)
n/a 44.42
(100.00 %)
155
(0.00 %)
349
(100.00 %)
760,455
(8.84 %)
626,528
(6.85 %)
5,029,822
(30.45 %)
54,278
(9.43 %)
238 northern bobwhite
GCA_008692595.2
n/a 12,584
(2.37 %)
22,327
(2.53 %)
n/a 41.41
(99.04 %)
33,134
(0.97 %)
39,169
(99.03 %)
460,369
(4.63 %)
213,800
(1.34 %)
5,813,961
(19.54 %)
22,156
(2.37 %)
239 northern fulmar
GCF_000690835.1
16,383
(2.20 %)
11,965
(1.51 %)
24,294
(1.87 %)
n/a 41.17
(99.50 %)
54,825
(0.51 %)
112,214
(99.49 %)
330,541
(3.74 %)
146,735
(0.83 %)
6,838,937
(18.42 %)
24,859
(0.79 %)
240 northern gannet (hap1 2023)
GCA_031468805.1
n/a 13,367
(1.65 %)
24,403
(2.00 %)
n/a 42.94
(100.00 %)
263
(0.00 %)
829
(100.00 %)
498,574
(4.51 %)
273,984
(5.20 %)
5,544,122
(27.29 %)
34,879
(3.83 %)
241 northern gannet (hap2 2023)
GCA_031468815.1
n/a 13,477
(1.77 %)
23,613
(2.08 %)
n/a 42.44
(100.00 %)
248
(0.00 %)
427
(100.00 %)
474,930
(4.45 %)
237,604
(2.75 %)
5,847,260
(21.07 %)
30,873
(3.03 %)
242 northern goshawk (bAccGen1 primary hap v1 2022 refseq)
GCF_929443795.1
50,663
(4.74 %)
13,528
(1.65 %)
24,595
(1.99 %)
n/a 43.78
(100.00 %)
183
(0.00 %)
454
(100.00 %)
521,768
(3.86 %)
325,987
(9.82 %)
5,542,269
(27.30 %)
43,070
(4.44 %)
243 northern goshawk (bAccGen1 v1 alternate hap 2022)
GCA_929447715.1
n/a 12,115
(1.73 %)
22,764
(2.15 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
2
(0.00 %)
4,484
(100.00 %)
417,395
(3.68 %)
231,908
(7.24 %)
5,424,533
(24.05 %)
35,691
(4.26 %)
244 northern goshawk (v2 primary hap 2022 genbank)
GCA_929443795.2
n/a 13,527
(1.65 %)
24,595
(1.99 %)
n/a 43.78
(100.00 %)
183
(0.00 %)
455
(100.00 %)
511,000
(3.76 %)
325,992
(9.82 %)
5,542,342
(27.30 %)
43,070
(4.44 %)
245 northern pintail (primary hap 2024 genbank)
GCA_963932015.1
n/a 13,218
(1.88 %)
23,888
(2.27 %)
n/a 42.56
(99.99 %)
631
(0.01 %)
395
(100.00 %)
734,763
(5.74 %)
422,947
(7.08 %)
6,491,165
(25.88 %)
34,601
(2.98 %)
246 northern pintail (primary hap 2024 refseq)
GCF_963932015.1
61,479
(7.27 %)
13,217
(1.88 %)
23,886
(2.27 %)
n/a 42.56
(99.99 %)
631
(0.01 %)
394
(100.00 %)
734,760
(5.74 %)
422,946
(7.08 %)
6,491,116
(25.88 %)
34,601
(2.98 %)
247 Obi paradise-crow (lycPyr6 2020)
GCA_014706295.1
n/a 12,592
(1.89 %)
24,002
(2.35 %)
n/a 42.94
(99.48 %)
1,602
(0.52 %)
1,695
(100.00 %)
466,546
(6.40 %)
235,283
(1.98 %)
6,371,421
(20.17 %)
34,247
(3.02 %)
248 Okarito brown kiwi
GCF_003343035.1
43,838
(4.59 %)
13,232
(1.76 %)
18,641
(2.35 %)
n/a 41.52
(98.49 %)
696,987
(1.57 %)
4,120
(100.00 %)
482,272
(4.98 %)
178,540
(0.70 %)
7,407,982
(18.33 %)
43,081
(4.88 %)
249 Oriental scops-owl (oso-nibr-517 2020)
GCA_010365825.1
n/a 12,953
(1.76 %)
25,275
(2.07 %)
24,636
(2.89 %)
41.70
(98.42 %)
42,691
(1.58 %)
151,517
(98.42 %)
494,677
(6.28 %)
222,654
(1.07 %)
7,211,171
(19.25 %)
41,048
(2.24 %)
250 peregrine falcon (bFalPer1 alternate hap 2022)
GCA_023634185.1
n/a 12,529
(1.75 %)
24,654
(2.25 %)
n/a 42.72
(100.00 %)
n/a 2,745
(100.00 %)
517,204
(7.95 %)
218,606
(4.15 %)
6,216,533
(21.16 %)
26,313
(2.41 %)
251 peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023634155.1
49,100
(5.64 %)
13,021
(1.66 %)
21,794
(1.95 %)
n/a 42.65
(99.69 %)
241
(0.31 %)
125
(100.00 %)
586,320
(11.83 %)
335,218
(8.05 %)
7,038,851
(24.65 %)
26,085
(2.25 %)
252 peregrine falcon (BGI 2013)
GCF_000337955.1
37,506
(5.42 %)
12,670
(1.80 %)
11,311
(2.11 %)
n/a 41.77
(98.44 %)
76,069
(1.58 %)
83,081
(98.42 %)
437,234
(5.32 %)
170,160
(0.93 %)
7,157,857
(18.38 %)
22,325
(0.89 %)
253 pin-tailed whydah (BioBank_ID:100142 2022)
GCF_024509145.1
41,770
(4.95 %)
12,712
(1.86 %)
24,157
(2.37 %)
n/a 42.69
(100.00 %)
338
(0.00 %)
484
(100.00 %)
641,523
(14.11 %)
414,142
(6.03 %)
6,230,412
(23.70 %)
49,402
(3.94 %)
254 pink pigeon (alternate hap 2023)
GCA_963082445.1
n/a 10,425
(1.96 %)
20,219
(2.49 %)
n/a 42.52
(100.00 %)
n/a 1,277
(100.00 %)
344,711
(4.99 %)
225,902
(3.41 %)
4,563,425
(21.61 %)
28,391
(3.74 %)
255 pink pigeon (primary hap 2023)
GCA_963082525.1
n/a 13,140
(1.85 %)
25,111
(2.31 %)
n/a 42.27
(99.99 %)
509
(0.01 %)
143
(100.00 %)
488,313
(5.48 %)
331,962
(3.50 %)
6,243,204
(22.87 %)
36,343
(3.63 %)
256 pink-footed goose (primary hap 2024)
GCA_964034855.1
n/a 13,275
(1.76 %)
24,103
(2.11 %)
n/a 43.68
(99.98 %)
1,137
(0.02 %)
715
(100.00 %)
792,215
(9.76 %)
471,286
(10.34 %)
6,448,623
(29.48 %)
49,485
(4.41 %)
257 plumbeous ibis (bTheCae1 alternate hap 2021)
GCA_020745805.1
n/a 11,774
(1.90 %)
20,857
(2.20 %)
n/a 42.59
(100.00 %)
4
(0.00 %)
749
(100.00 %)
356,053
(4.37 %)
157,695
(0.93 %)
5,995,637
(19.60 %)
30,478
(4.03 %)
258 plumbeous ibis (primary hap 2021)
GCA_020745775.1
n/a 13,028
(1.84 %)
22,722
(2.10 %)
n/a 42.37
(99.81 %)
104
(0.19 %)
88
(100.00 %)
488,030
(6.66 %)
188,606
(1.01 %)
6,982,793
(20.08 %)
32,920
(3.37 %)
259 Puerto Rican parrot (LU 182127 2020)
GCA_000332375.2
n/a 12,000
(1.69 %)
22,393
(2.01 %)
n/a 41.66
(74.61 %)
137,572
(25.41 %)
200,284
(74.59 %)
536,198
(8.55 %)
200,698
(0.96 %)
5,147,882
(14.30 %)
14,572
(0.41 %)
260 razorbill (2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019)
GCA_008658365.1
n/a 12,787
(1.83 %)
22,839
(2.13 %)
n/a 42.67
(99.70 %)
227
(0.30 %)
95
(100.00 %)
543,517
(7.16 %)
212,546
(1.12 %)
6,930,708
(20.10 %)
38,960
(3.02 %)
261 razorbill (alternate hap 2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019)
GCA_008658355.1
n/a 12,937
(1.75 %)
24,253
(2.09 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
n/a 3,309
(100.00 %)
562,549
(7.14 %)
210,852
(1.04 %)
7,264,995
(20.26 %)
40,926
(2.91 %)
262 red-backed fairy wren (Western Australia 2023)
GCF_030028575.1
29,027
(5.08 %)
12,371
(2.00 %)
24,297
(2.42 %)
n/a 41.70
(96.94 %)
3,337,637
(3.40 %)
10,634
(100.00 %)
349,349
(2.76 %)
398,866
(2.71 %)
6,299,092
(18.40 %)
27,078
(2.11 %)
263 red-billed tropicbird (maternal hap 2024)
GCA_964289735.1
n/a 13,231
(1.68 %)
24,060
(2.00 %)
n/a 43.15
(99.98 %)
1,269
(0.02 %)
660
(100.00 %)
440,963
(5.78 %)
187,847
(3.22 %)
6,601,610
(24.99 %)
54,002
(5.24 %)
264 red-billed tropicbird (paternal hap 2024)
GCA_964289755.1
n/a 11,989
(1.71 %)
21,527
(2.03 %)
n/a 43.19
(99.98 %)
1,072
(0.02 %)
1,572
(99.98 %)
383,852
(5.39 %)
164,123
(3.45 %)
5,859,520
(24.45 %)
48,825
(5.37 %)
265 red-crested pochard (primary hap 2024)
GCA_964035555.1
n/a 13,234
(1.92 %)
23,753
(2.26 %)
n/a 42.08
(99.99 %)
714
(0.01 %)
141
(100.00 %)
772,537
(6.34 %)
437,831
(4.05 %)
6,488,340
(24.52 %)
31,577
(2.49 %)
266 red-crested turaco (alternate hap 2019)
GCA_009764505.1
n/a 11,247
(1.70 %)
23,705
(2.27 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
n/a 3,476
(100.00 %)
482,817
(8.51 %)
153,169
(0.81 %)
5,919,109
(21.87 %)
39,766
(3.41 %)
267 red-crested turaco (primary hap 2019)
GCA_009769465.1
n/a 12,744
(1.75 %)
25,706
(2.29 %)
n/a 42.60
(97.89 %)
344
(2.11 %)
140
(100.00 %)
551,885
(8.95 %)
176,530
(0.80 %)
6,805,042
(22.19 %)
43,051
(3.40 %)
268 red-fronted tinkerbird (bPogPus1 alternate hap 2020)
GCA_015220175.1
n/a 11,434
(1.65 %)
21,710
(2.11 %)
n/a 46.12
(100.00 %)
12
(0.00 %)
2,748
(100.00 %)
859,899
(15.52 %)
319,622
(3.85 %)
5,367,970
(34.63 %)
23,381
(1.81 %)
269 red-fronted tinkerbird (primary hap 2020 genbank)
GCA_015220805.1
n/a 12,345
(1.60 %)
23,206
(2.02 %)
n/a 45.96
(99.53 %)
307
(0.47 %)
253
(100.00 %)
1,082,064
(22.90 %)
378,866
(4.28 %)
6,003,548
(35.88 %)
26,519
(1.76 %)
270 red-fronted tinkerbird (primary hap 2020 refseq)
GCF_015220805.1
44,843
(4.51 %)
12,341
(1.60 %)
23,205
(2.02 %)
n/a 45.96
(99.53 %)
307
(0.47 %)
252
(100.00 %)
981,758
(15.82 %)
378,855
(4.28 %)
6,003,474
(35.88 %)
26,519
(1.76 %)
271 red-legged partridge
GCA_019345075.1
n/a 12,441
(2.23 %)
20,933
(2.29 %)
n/a 41.44
(96.96 %)
18,534
(3.05 %)
29,132
(96.95 %)
543,702
(6.02 %)
222,583
(0.97 %)
5,978,744
(20.17 %)
19,970
(0.97 %)
272 red-legged seriema (alternate hap 2019)
GCA_009819485.1
n/a 10,131
(1.78 %)
19,775
(2.21 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,840
(100.00 %)
366,591
(6.01 %)
117,928
(0.90 %)
5,340,048
(18.90 %)
26,293
(2.86 %)
273 red-legged seriema (primary hap 2019)
GCA_009819825.1
n/a 13,229
(1.84 %)
25,580
(2.35 %)
n/a 42.20
(99.59 %)
194
(0.41 %)
110
(100.00 %)
483,784
(6.50 %)
160,481
(0.73 %)
6,960,060
(19.71 %)
32,899
(2.77 %)
274 red-throated loon (BGI_N328 2014)
GCF_000690875.1
15,829
(2.14 %)
11,589
(1.46 %)
22,840
(1.76 %)
n/a 41.12
(99.40 %)
64,882
(0.61 %)
126,713
(99.39 %)
293,224
(3.50 %)
123,593
(0.80 %)
6,849,573
(18.22 %)
17,100
(0.51 %)
275 red-throated loon (hap1 2023)
GCA_030936125.1
n/a 13,357
(1.64 %)
29,603
(2.35 %)
n/a 43.54
(100.00 %)
260
(0.00 %)
3,225
(100.00 %)
549,694
(8.44 %)
246,171
(10.46 %)
5,258,356
(27.36 %)
39,810
(3.37 %)
276 red-throated loon (hap2 2023 refseq)
GCF_030936135.1
25,173
(3.02 %)
13,216
(1.71 %)
24,050
(2.10 %)
n/a 43.11
(100.00 %)
249
(0.00 %)
1,185
(100.00 %)
544,422
(8.81 %)
223,672
(5.77 %)
6,669,433
(23.63 %)
38,305
(3.37 %)
277 red-winged blackbird (BioBank_ID:100140 2023)
GCF_020745825.1
29,994
(3.93 %)
12,687
(1.75 %)
25,287
(2.30 %)
n/a 43.15
(100.00 %)
106
(0.00 %)
516
(100.00 %)
785,960
(17.62 %)
522,256
(9.27 %)
6,371,580
(25.40 %)
32,643
(2.66 %)
278 rhinoceros hornbill
GCF_000710305.1
15,595
(2.24 %)
11,495
(1.55 %)
25,766
(1.88 %)
n/a 42.65
(98.44 %)
118,543
(1.60 %)
180,800
(98.40 %)
271,331
(3.93 %)
134,645
(1.25 %)
6,383,631
(17.75 %)
24,531
(0.79 %)
279 rifleman (bAcaChl1 alternate hap 2021)
GCA_016880875.1
n/a 9,867
(1.89 %)
19,635
(2.52 %)
n/a 42.54
(100.00 %)
20
(0.00 %)
2,879
(100.00 %)
394,769
(10.00 %)
186,556
(1.91 %)
4,428,687
(19.09 %)
15,730
(1.88 %)
280 rifleman (primary hap 2021)
GCA_016904835.1
n/a 12,620
(1.92 %)
24,568
(2.61 %)
n/a 42.41
(99.61 %)
195
(0.39 %)
206
(100.00 %)
495,673
(9.14 %)
253,008
(2.04 %)
5,936,177
(19.93 %)
20,145
(1.83 %)
281 ring-necked pheasant
GCF_004143745.1
33,221
(6.38 %)
13,027
(2.35 %)
19,960
(2.74 %)
n/a 41.21
(99.22 %)
19,995
(0.78 %)
39,678
(100.00 %)
586,827
(8.20 %)
291,437
(1.68 %)
6,237,616
(20.77 %)
22,365
(2.11 %)
282 rock pigeon (Danish tumbler 2013 BGI)
GCF_000337935.1
52,369
(6.40 %)
12,577
(1.87 %)
14,272
(2.42 %)
n/a 41.48
(98.13 %)
85,176
(1.90 %)
100,099
(98.10 %)
480,221
(6.94 %)
268,561
(1.86 %)
6,408,260
(19.42 %)
29,801
(1.43 %)
283 rock pigeon (racing homer bColLiv1 2024)
GCA_036010775.2
n/a 12,450
(1.75 %)
23,660
(2.21 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
192
(0.00 %)
673
(100.00 %)
586,422
(10.85 %)
392,341
(12.38 %)
5,521,172
(28.56 %)
33,479
(3.29 %)
284 rock pigeon (racing homer maternal 2024)
GCA_036010775.1
n/a 12,450
(1.75 %)
25,274
(2.35 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
192
(0.00 %)
673
(100.00 %)
586,422
(10.85 %)
392,341
(12.38 %)
5,521,172
(28.56 %)
33,479
(3.29 %)
285 rock pigeon (v1 racing homer paternal W 2024)
GCA_036013475.1
n/a 13,145
(1.66 %)
28,883
(2.53 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
248
(0.00 %)
870
(100.00 %)
656,923
(11.76 %)
412,678
(12.92 %)
6,047,578
(29.90 %)
36,847
(3.12 %)
286 rock pigeon (v2 racing homer 2024 genbank)
GCA_036013475.2
n/a 13,146
(1.66 %)
25,463
(2.12 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
249
(0.00 %)
870
(100.00 %)
656,969
(11.76 %)
412,670
(12.92 %)
6,047,584
(29.90 %)
36,847
(3.12 %)
287 rock pigeon (v2 racing homer 2024 refseq)
GCF_036013475.1
70,874
(7.24 %)
13,145
(1.66 %)
25,462
(2.12 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
249
(0.00 %)
869
(100.00 %)
656,963
(11.76 %)
412,665
(12.92 %)
6,047,535
(29.90 %)
36,847
(3.12 %)
288 rock ptarmigan (bLagMut1 alternate hap 2022)
GCA_023344045.1
n/a 12,090
(2.36 %)
21,910
(2.57 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
13
(0.00 %)
3,212
(100.00 %)
585,577
(10.45 %)
202,342
(1.61 %)
5,390,780
(20.38 %)
19,210
(2.23 %)
289 rock ptarmigan (primary hap 2022 refseq)
GCF_023343835.1
51,619
(7.29 %)
12,832
(2.31 %)
23,047
(2.56 %)
n/a 41.57
(99.99 %)
210
(0.01 %)
165
(100.00 %)
526,839
(5.87 %)
268,431
(2.63 %)
5,885,345
(21.73 %)
21,346
(2.37 %)
290 ruddy duck
GCF_011077185.1
50,326
(5.76 %)
13,124
(1.98 %)
23,592
(2.23 %)
n/a 41.82
(97.27 %)
18,437
(2.73 %)
28,026
(97.27 %)
808,998
(7.97 %)
389,509
(1.34 %)
6,722,581
(21.16 %)
34,567
(3.30 %)
291 ruff
GCF_001431845.1
34,257
(4.61 %)
12,979
(1.79 %)
15,969
(2.42 %)
n/a 42.45
(96.26 %)
30,404
(3.75 %)
34,157
(96.25 %)
308,688
(1.08 %)
337,661
(3.70 %)
7,220,063
(20.45 %)
27,939
(1.42 %)
292 rufous-necked snowfinch
GCF_017590135.1
35,381
(4.92 %)
12,603
(1.95 %)
24,965
(2.42 %)
n/a 42.00
(99.80 %)
5,524
(0.20 %)
24,055
(100.00 %)
514,274
(6.32 %)
411,146
(2.77 %)
6,584,761
(19.85 %)
29,372
(2.28 %)
293 rusty-margined flycatcher (MyiCay16 2022)
GCF_022539395.1
40,473
(5.86 %)
12,903
(1.96 %)
23,477
(2.35 %)
n/a 42.26
(99.87 %)
181
(0.13 %)
1,692
(100.00 %)
439,625
(4.09 %)
338,042
(2.23 %)
6,366,832
(20.27 %)
28,572
(2.11 %)
294 saffron-crested tyrant-manakin
GCF_003984885.1
45,898
(5.06 %)
12,908
(1.86 %)
21,103
(2.48 %)
n/a 42.28
(99.01 %)
15,342
(0.99 %)
38,089
(100.00 %)
496,308
(7.14 %)
333,391
(1.97 %)
6,646,625
(20.87 %)
32,671
(2.19 %)
295 sage sparrow (canescens MVZ Bird 192114 alternate hap 2022)
GCA_021966175.1
n/a 16,893
(1.07 %)
43,426
(1.70 %)
n/a 44.67
(100.00 %)
12
(0.00 %)
43,047
(100.00 %)
1,180,596
(3.55 %)
1,932,696
(16.57 %)
6,340,063
(43.85 %)
66,996
(3.45 %)
296 sage sparrow (canescens MVZ Bird 192114 primary hap 2022)
GCA_021963965.1
n/a 12,804
(1.50 %)
25,425
(1.97 %)
n/a 43.46
(100.00 %)
200
(0.00 %)
1,339
(100.00 %)
699,755
(3.36 %)
1,030,540
(15.69 %)
5,226,748
(36.13 %)
36,539
(2.71 %)
297 Saker falcon (bFalChe1 alternate hap 2022)
GCA_023634115.1
n/a 12,258
(1.66 %)
25,579
(2.30 %)
n/a 43.39
(100.00 %)
2
(0.00 %)
4,162
(100.00 %)
506,343
(6.77 %)
182,589
(7.22 %)
5,435,776
(23.60 %)
29,420
(2.47 %)
298 Saker falcon (BGI 2013)
GCF_000337975.1
36,497
(5.34 %)
12,572
(1.79 %)
10,629
(2.08 %)
27,857
(3.09 %)
41.71
(98.00 %)
70,035
(2.03 %)
75,898
(97.97 %)
433,484
(5.29 %)
166,251
(1.03 %)
7,121,848
(18.23 %)
19,927
(0.72 %)
299 Saker falcon (primary hap 2022 refseq)
GCF_023634085.1
50,290
(5.75 %)
12,973
(1.67 %)
21,670
(1.90 %)
n/a 43.15
(99.70 %)
258
(0.30 %)
283
(100.00 %)
548,090
(7.21 %)
201,488
(8.55 %)
7,030,877
(24.94 %)
31,791
(2.57 %)
300 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 alternate hap 2023)
GCA_027887135.1
n/a 12,826
(1.74 %)
26,019
(2.35 %)
n/a 43.09
(100.00 %)
n/a 3,054
(100.00 %)
482,850
(3.37 %)
523,437
(10.15 %)
6,386,315
(26.20 %)
32,734
(4.25 %)
301 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887145.1
27,528
(4.03 %)
12,832
(1.69 %)
25,514
(2.23 %)
n/a 43.50
(99.76 %)
363
(0.24 %)
282
(100.00 %)
541,958
(3.43 %)
566,692
(13.38 %)
6,205,274
(28.98 %)
35,549
(5.05 %)
302 Savannah sparrow (FMNH 499929 alternate hap 2022)
GCA_022578375.1
n/a 16,954
(1.37 %)
46,692
(2.27 %)
n/a 43.66
(99.99 %)
1,822
(0.01 %)
31,565
(99.99 %)
680,766
(3.36 %)
930,904
(8.76 %)
7,502,726
(27.96 %)
56,390
(5.99 %)
303 Savannah sparrow (FMNH 499929 primary hap 2022)
GCA_022577445.1
n/a 12,665
(1.79 %)
25,654
(2.40 %)
n/a 43.10
(100.00 %)
339
(0.00 %)
337
(100.00 %)
428,675
(3.22 %)
588,040
(7.38 %)
6,466,447
(24.39 %)
33,599
(4.75 %)
304 Savannah sparrow (primary hap 2023)
GCA_031885435.1
n/a 12,986
(1.66 %)
27,028
(2.29 %)
n/a 43.66
(99.78 %)
249
(0.22 %)
110
(100.00 %)
464,600
(3.28 %)
681,402
(9.28 %)
6,314,744
(26.92 %)
39,406
(5.26 %)
305 scrub jay (FSJ_1873_10779 2024)
GCF_041296385.1
51,624
(5.10 %)
13,318
(1.64 %)
26,496
(2.22 %)
n/a 44.31
(100.00 %)
140
(0.00 %)
660
(100.00 %)
879,188
(16.59 %)
506,206
(7.16 %)
5,626,321
(29.85 %)
44,942
(4.68 %)
306 seaside sparrow (bAmmMar1 primary hap 2024)
GCA_036010785.1
n/a 12,858
(1.52 %)
25,777
(2.02 %)
n/a 44.04
(99.85 %)
365
(0.15 %)
501
(100.00 %)
580,376
(4.24 %)
636,266
(12.18 %)
4,804,433
(34.52 %)
48,871
(4.18 %)
307 small tree finch (2019)
GCF_901933205.1
30,090
(4.91 %)
12,645
(1.95 %)
17,146
(2.49 %)
n/a 42.38
(99.99 %)
185
(0.01 %)
1,527
(99.99 %)
457,266
(6.02 %)
477,426
(4.49 %)
6,482,932
(22.03 %)
27,271
(2.40 %)
308 small tree finch (2020)
GCA_902806625.1
n/a 12,662
(1.93 %)
23,695
(2.34 %)
25,763
(3.61 %)
42.49
(99.99 %)
224
(0.01 %)
1,951
(99.99 %)
458,154
(6.01 %)
482,974
(4.97 %)
6,466,067
(22.21 %)
27,890
(2.42 %)
309 song sparrow (gouldii PMB2087b alternate hap 2022)
GCA_022749775.1
n/a 15,672
(1.16 %)
40,690
(1.82 %)
n/a 45.19
(100.00 %)
5
(0.00 %)
34,693
(100.00 %)
1,068,703
(34.46 %)
796,004
(19.02 %)
6,315,990
(40.22 %)
57,647
(3.95 %)
310 song sparrow (gouldii PMB2087b primary hap 2022)
GCA_022749695.1
n/a 12,580
(1.53 %)
24,737
(2.00 %)
n/a 44.45
(100.00 %)
323
(0.00 %)
501
(100.00 %)
697,818
(28.44 %)
510,301
(17.90 %)
5,319,400
(34.64 %)
36,632
(3.59 %)
311 song sparrow (primary hap 2024 genbank)
GCA_035770615.1
n/a 12,940
(1.39 %)
26,698
(1.87 %)
n/a 44.96
(99.93 %)
299
(0.07 %)
354
(100.00 %)
515,857
(3.07 %)
681,436
(15.73 %)
5,004,880
(39.23 %)
47,269
(3.90 %)
312 song sparrow (primary hap 2024 refseq)
GCF_035770615.1
41,069
(3.95 %)
12,946
(1.39 %)
26,698
(1.87 %)
n/a 44.96
(99.93 %)
299
(0.07 %)
353
(100.00 %)
515,851
(3.07 %)
681,436
(15.73 %)
5,004,851
(39.23 %)
47,268
(3.90 %)
313 South Island takahe (alternate hap 2021)
GCA_020801775.1
n/a 12,655
(1.70 %)
n/a n/a 43.63
(99.16 %)
238
(0.84 %)
178
(100.00 %)
554,912
(9.42 %)
230,808
(4.34 %)
6,406,358
(24.83 %)
22,941
(1.98 %)
314 South Island takahe (primary hap 2021)
GCA_020800305.1
n/a 12,942
(1.69 %)
23,221
(2.13 %)
n/a 43.74
(99.58 %)
327
(0.42 %)
174
(100.00 %)
577,553
(9.77 %)
259,017
(5.20 %)
6,430,968
(25.90 %)
23,810
(2.02 %)
315 speckled mousebird (bColStr4 hap2 2023)
GCA_028858625.2
n/a 12,332
(1.76 %)
22,895
(2.24 %)
n/a 42.74
(99.53 %)
136
(0.47 %)
242
(100.00 %)
521,023
(11.26 %)
304,406
(7.39 %)
5,319,571
(25.46 %)
27,299
(2.35 %)
316 speckled mousebird (BGI_N325 2014)
GCF_000690715.1
15,894
(2.09 %)
11,566
(1.44 %)
25,387
(1.84 %)
n/a 40.95
(99.65 %)
44,462
(0.35 %)
114,650
(99.65 %)
345,458
(6.87 %)
154,693
(1.27 %)
6,152,475
(19.42 %)
7,821
(0.23 %)
317 speckled mousebird (hap1 2023 genbank)
GCA_028858725.1
n/a 11,956
(1.78 %)
25,177
(2.60 %)
n/a 42.38
(99.48 %)
143
(0.52 %)
189
(100.00 %)
523,056
(12.47 %)
243,547
(3.72 %)
5,408,003
(23.43 %)
25,552
(2.34 %)
318 speckled mousebird (hap1 2023 refseq)
GCF_028858725.1
37,067
(4.23 %)
12,815
(1.76 %)
23,175
(2.17 %)
n/a 42.29
(99.52 %)
161
(0.48 %)
191
(100.00 %)
572,944
(12.88 %)
256,368
(3.55 %)
5,868,966
(23.42 %)
27,158
(2.30 %)
319 speckled mousebird (hap2 2023)
GCA_028858625.1
n/a 13,169
(1.74 %)
26,896
(2.47 %)
n/a 42.62
(99.56 %)
151
(0.44 %)
243
(100.00 %)
570,907
(11.75 %)
317,226
(6.96 %)
5,854,600
(25.51 %)
28,905
(2.31 %)
320 Steller's jay (frontalis alternate hap 2022)
GCA_026168045.1
n/a 12,217
(1.73 %)
25,261
(2.32 %)
n/a 44.10
(100.00 %)
200
(0.00 %)
957
(100.00 %)
423,239
(3.30 %)
362,061
(4.83 %)
4,954,262
(27.09 %)
42,188
(4.05 %)
321 Steller's jay (frontalis primary hap 2022)
GCA_026167965.1
n/a 12,789
(1.82 %)
24,509
(2.35 %)
n/a 43.18
(100.00 %)
223
(0.00 %)
352
(100.00 %)
413,598
(3.28 %)
318,919
(3.99 %)
5,977,564
(23.65 %)
33,675
(3.21 %)
322 sun parakeet (2019)
GCA_902168055.1
n/a 12,871
(1.88 %)
22,508
(2.20 %)
n/a 42.01
(96.97 %)
578,921
(3.08 %)
1,570
(100.00 %)
554,367
(10.05 %)
180,644
(0.89 %)
6,158,602
(21.14 %)
21,695
(1.62 %)
323 sunbittern
GCF_000690775.1
15,772
(2.11 %)
11,564
(1.45 %)
25,522
(1.98 %)
n/a 42.33
(99.55 %)
52,471
(0.46 %)
115,170
(99.54 %)
346,556
(5.38 %)
117,881
(0.88 %)
6,391,987
(18.82 %)
32,970
(1.31 %)
324 Suruca trogon (bTroSur1 alternate hap 2021)
GCA_020746095.1
n/a 11,628
(1.91 %)
21,635
(2.31 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
17
(0.00 %)
1,535
(100.00 %)
421,231
(6.57 %)
146,070
(1.11 %)
5,727,350
(21.91 %)
37,752
(3.68 %)
325 Suruca trogon (primary hap 2021)
GCA_020746105.1
n/a 12,884
(1.85 %)
23,805
(2.23 %)
n/a 42.80
(99.12 %)
253
(0.88 %)
182
(100.00 %)
539,771
(9.26 %)
181,564
(1.14 %)
6,538,228
(22.49 %)
41,376
(3.37 %)
326 Swainson's thrush (bCatUst1 v2 alternate hap 2020)
GCA_009819505.2
n/a 13,403
(1.85 %)
27,669
(2.52 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
13
(0.00 %)
3,601
(100.00 %)
704,976
(13.16 %)
649,859
(4.89 %)
6,740,713
(22.65 %)
49,076
(3.54 %)
327 Swainson's thrush (v2 primary hap 2020)
GCF_009819885.2
40,121
(5.41 %)
13,004
(1.87 %)
24,795
(2.41 %)
n/a 42.48
(98.86 %)
429
(1.14 %)
160
(100.00 %)
493,071
(5.80 %)
589,858
(4.32 %)
6,708,638
(22.44 %)
49,404
(3.53 %)
328 swamp sparrow (bMelGeo1 alternate hap 2023)
GCA_028019105.1
n/a 12,160
(1.83 %)
24,622
(2.46 %)
n/a 43.37
(100.00 %)
n/a 862
(100.00 %)
383,634
(3.06 %)
527,550
(8.40 %)
5,916,654
(24.97 %)
31,261
(3.21 %)
329 swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018845.1
29,544
(4.27 %)
12,375
(1.75 %)
24,577
(2.31 %)
n/a 43.08
(99.89 %)
236
(0.11 %)
40
(100.00 %)
419,473
(3.09 %)
439,909
(7.61 %)
6,077,743
(24.47 %)
32,064
(3.27 %)
330 Swan (goose HZ-2024a 2024)
GCF_040182565.1
68,379
(7.95 %)
13,715
(1.90 %)
24,704
(2.28 %)
n/a 43.07
(100.00 %)
42
(0.00 %)
75
(100.00 %)
780,603
(10.80 %)
463,894
(5.65 %)
6,593,404
(24.63 %)
41,265
(4.48 %)
331 swan goose (Sichuan white goose 2017)
GCF_002166845.1
62,728
(8.50 %)
12,903
(1.98 %)
21,943
(2.24 %)
n/a 41.68
(97.40 %)
63,061
(2.62 %)
64,863
(97.38 %)
590,350
(4.68 %)
253,525
(1.38 %)
6,926,961
(19.71 %)
40,011
(3.69 %)
332 swan goose (Tianfu 2020)
GCA_013030995.1
n/a 12,965
(1.97 %)
25,182
(2.35 %)
n/a 42.15
(99.99 %)
716
(0.01 %)
2,119
(100.00 %)
650,271
(7.44 %)
270,668
(1.26 %)
6,776,820
(21.19 %)
35,560
(4.27 %)
333 swan goose (Zhedong 2015)
GCF_000971095.1
43,215
(5.89 %)
12,148
(1.89 %)
19,386
(2.07 %)
29,870
(3.24 %)
41.36
(96.87 %)
84,351
(3.16 %)
91,944
(96.84 %)
481,707
(5.57 %)
230,143
(1.26 %)
6,665,312
(19.42 %)
38,930
(2.06 %)
334 swift parrot (hap1 2024)
GCF_037157495.1
50,082
(5.09 %)
12,974
(1.75 %)
22,545
(2.07 %)
n/a 42.67
(99.82 %)
186
(0.18 %)
367
(100.00 %)
541,918
(6.97 %)
347,387
(6.90 %)
5,657,314
(26.08 %)
25,816
(2.01 %)
335 Swift parrot (hap2 2024)
GCA_037157625.1
n/a 11,928
(1.78 %)
20,879
(2.12 %)
n/a 42.78
(99.75 %)
122
(0.25 %)
413
(100.00 %)
481,463
(6.65 %)
359,572
(7.59 %)
5,094,615
(26.27 %)
23,296
(2.08 %)
336 tawny frogmouth (bPodStr1 alternate hap 2023)
GCA_028020675.1
n/a 11,432
(1.95 %)
20,528
(2.37 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
1
(0.00 %)
911
(100.00 %)
470,125
(9.51 %)
140,846
(3.57 %)
5,002,695
(22.08 %)
22,424
(2.33 %)
337 tawny frogmouth (bPodStr1 primary hap 2023)
GCA_028020825.1
n/a 13,321
(1.76 %)
24,102
(2.15 %)
n/a 42.35
(99.83 %)
203
(0.17 %)
1,038
(100.00 %)
593,409
(10.51 %)
202,463
(9.29 %)
6,160,173
(27.65 %)
25,785
(2.35 %)
338 tawny owl (hap1 2023)
GCA_031877795.1
n/a 13,204
(1.60 %)
23,981
(1.99 %)
n/a 42.70
(99.70 %)
281
(0.30 %)
212
(99.85 %)
443,228
(4.74 %)
272,738
(10.86 %)
5,812,837
(27.42 %)
30,602
(2.52 %)
339 tawny owl (hap2 2023)
GCA_031877785.1
n/a 12,367
(1.72 %)
21,445
(2.03 %)
n/a 42.53
(99.88 %)
206
(0.12 %)
184
(100.00 %)
392,959
(4.59 %)
235,300
(7.72 %)
6,437,772
(24.82 %)
27,952
(2.71 %)
340 tawny-flanked prinia (Zambia CZ2003 2024)
GCF_021018805.1
40,939
(5.96 %)
12,510
(1.84 %)
24,378
(2.37 %)
n/a 42.64
(99.99 %)
378
(0.01 %)
538
(100.00 %)
384,533
(3.09 %)
345,667
(4.24 %)
6,199,979
(21.86 %)
33,587
(2.53 %)
341 Tibetan ground-tit
GCF_000331425.1
28,736
(4.57 %)
12,828
(2.02 %)
17,743
(2.65 %)
n/a 41.69
(98.76 %)
21,646
(1.24 %)
27,052
(98.76 %)
443,797
(5.51 %)
346,281
(2.29 %)
6,423,932
(19.90 %)
27,086
(2.31 %)
342 tourmaline sunangel (hap1 2024)
GCA_036169615.1
n/a 12,509
(1.97 %)
21,020
(2.33 %)
n/a 41.63
(99.99 %)
437
(0.01 %)
131
(100.00 %)
532,267
(5.46 %)
332,284
(2.69 %)
6,084,978
(21.20 %)
19,080
(1.72 %)
343 tourmaline sunangel (hap2 2024)
GCA_036172335.1
n/a 11,697
(2.00 %)
19,544
(2.34 %)
n/a 41.82
(99.99 %)
370
(0.01 %)
200
(100.00 %)
480,724
(5.14 %)
292,213
(3.66 %)
5,608,823
(21.79 %)
17,191
(1.69 %)
344 tricolored blackbird (1412-34295 alternate hap 2022)
GCA_023055385.1
n/a 12,203
(1.76 %)
25,216
(2.40 %)
n/a 43.65
(100.00 %)
97
(0.00 %)
450
(100.00 %)
430,792
(3.25 %)
542,908
(5.67 %)
5,289,916
(24.99 %)
36,805
(3.52 %)
345 tricolored blackbird (1412-34295 primary hap 2022)
GCA_023055355.1
n/a 12,867
(1.81 %)
26,393
(2.48 %)
n/a 42.85
(100.00 %)
97
(0.00 %)
311
(100.00 %)
429,011
(3.16 %)
564,849
(5.52 %)
6,336,716
(23.32 %)
33,378
(2.70 %)
346 tufted duck (2019)
GCF_009819795.1
29,492
(4.02 %)
12,972
(1.98 %)
22,757
(2.27 %)
n/a 41.66
(99.16 %)
163
(0.84 %)
105
(100.00 %)
826,451
(8.47 %)
411,356
(1.71 %)
6,691,445
(22.36 %)
29,882
(2.41 %)
347 tufted duck (alternate hap 2019)
GCA_009819845.1
n/a 12,117
(2.03 %)
21,464
(2.36 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
1
(0.00 %)
780
(100.00 %)
732,317
(7.82 %)
353,660
(1.57 %)
6,119,549
(21.70 %)
27,920
(2.56 %)
348 turkey (Aviagen NT-WF06-2002-E0010 2014)
GCF_000146605.3
38,427
(6.01 %)
13,095
(1.96 %)
23,974
(2.27 %)
30,549
(3.14 %)
41.35
(96.83 %)
65,045
(3.16 %)
250,220
(96.84 %)
609,750
(9.03 %)
243,534
(1.26 %)
6,043,889
(21.06 %)
31,818
(1.42 %)
349 turkey (WU_HG_1 2021)
GCA_905368555.1
n/a 12,910
(2.37 %)
23,038
(2.58 %)
53,269
(6.57 %)
41.12
(100.00 %)
81
(0.00 %)
151
(100.00 %)
618,023
(8.91 %)
227,783
(1.43 %)
6,123,721
(21.03 %)
20,379
(2.19 %)
350 village indigobird (merged hap OUT-0048 2022 genbank)
GCA_026979565.1
n/a 12,819
(1.94 %)
24,247
(2.44 %)
n/a 42.23
(99.98 %)
458
(0.02 %)
178
(100.00 %)
616,749
(11.96 %)
411,917
(3.56 %)
6,385,102
(20.91 %)
37,940
(2.83 %)
351 village indigobird (merged hap OUT-0048 2022 refseq)
GCF_026979565.1
44,961
(5.49 %)
12,817
(1.94 %)
24,245
(2.44 %)
n/a 42.23
(99.98 %)
458
(0.02 %)
177
(100.00 %)
616,746
(11.96 %)
411,917
(3.57 %)
6,385,057
(20.91 %)
37,940
(2.83 %)
352 village indigobird (purged dups hap OUT-0048 2022)
GCA_026979555.1
n/a 2,176
(1.79 %)
7,719
(4.37 %)
n/a 49.74
(100.00 %)
n/a 1,939
(100.00 %)
136,312
(29.31 %)
157,341
(15.03 %)
648,725
(34.67 %)
15,490
(8.23 %)
353 Virginia rail (171378401 alternate hap 2022)
GCA_022605895.1
n/a 12,732
(1.51 %)
23,395
(1.91 %)
n/a 44.28
(99.99 %)
668
(0.00 %)
4,450
(100.00 %)
526,500
(5.75 %)
269,598
(14.29 %)
4,825,913
(32.19 %)
27,465
(2.18 %)
354 Virginia rail (171378401 primary hap 2022)
GCA_022605955.1
n/a 12,760
(1.53 %)
23,262
(2.16 %)
n/a 44.16
(100.00 %)
197
(0.00 %)
1,299
(100.00 %)
497,104
(5.09 %)
271,530
(15.72 %)
5,291,065
(32.37 %)
24,669
(1.78 %)
355 western capercaillie (alternate hap 2023)
GCA_951394355.1
n/a 11,226
(2.33 %)
20,526
(2.54 %)
n/a 41.53
(100.00 %)
n/a 5,463
(100.00 %)
436,894
(5.48 %)
209,008
(1.73 %)
4,790,071
(20.27 %)
17,864
(2.58 %)
356 western capercaillie (primary hap 2023)
GCA_951394365.1
n/a 12,775
(2.33 %)
22,516
(2.50 %)
n/a 41.49
(99.98 %)
973
(0.02 %)
318
(100.00 %)
518,194
(5.54 %)
276,294
(2.21 %)
5,866,033
(21.12 %)
21,287
(2.50 %)
357 western scrub-jay (CA MVZ Bird 193978 2023)
GCA_028536645.1
n/a 12,480
(1.72 %)
22,915
(2.17 %)
n/a 44.29
(100.00 %)
168
(0.00 %)
1,631
(100.00 %)
394,733
(2.99 %)
364,498
(6.04 %)
4,803,453
(27.52 %)
42,022
(4.90 %)
358 western scrub-jay (CA MVZ Bird 193978 2023)
GCA_028536675.1
n/a 13,128
(1.62 %)
25,648
(2.11 %)
n/a 44.58
(100.00 %)
272
(0.00 %)
1,393
(100.00 %)
449,314
(3.08 %)
505,129
(6.52 %)
4,634,925
(31.99 %)
51,884
(4.81 %)
359 whiskered treeswift (bHemCom1 alternate hap 2021)
GCA_020745695.1
n/a 11,632
(1.83 %)
20,659
(2.18 %)
n/a 42.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,405
(100.00 %)
553,633
(11.80 %)
147,999
(0.81 %)
5,825,472
(20.55 %)
20,481
(1.61 %)
360 whiskered treeswift (primary hap 2021)
GCA_020745705.1
n/a 12,681
(1.84 %)
21,784
(2.14 %)
n/a 42.12
(99.13 %)
218
(0.87 %)
146
(100.00 %)
520,200
(9.32 %)
170,778
(0.83 %)
6,455,910
(21.44 %)
24,061
(1.62 %)
361 white leghorn X broiler chicken (v2 leghorn haplotype 2021)
GCF_016700215.2
83,834
(10.16 %)
13,005
(2.32 %)
23,329
(2.48 %)
72,360
(9.39 %)
42.16
(99.57 %)
409
(0.43 %)
685
(99.57 %)
536,869
(6.00 %)
268,230
(2.28 %)
5,845,184
(20.93 %)
24,409
(2.60 %)
362 white wagtail
GCF_015832195.1
47,145
(6.80 %)
12,127
(1.86 %)
22,301
(2.31 %)
n/a 42.72
(99.92 %)
906
(0.08 %)
619
(100.00 %)
479,546
(6.15 %)
349,751
(5.62 %)
6,384,256
(22.41 %)
28,008
(2.68 %)
363 white-collared manakin (Guabito, Panama 608988 2022)
GCF_025592945.1
53,731
(6.26 %)
12,981
(1.91 %)
23,916
(2.40 %)
n/a 42.43
(100.00 %)
n/a 643
(100.00 %)
417,020
(3.98 %)
366,209
(3.55 %)
5,992,950
(21.48 %)
28,964
(2.22 %)
364 white-crowned manakin (hap1 2024 genbank)
GCA_036250125.1
n/a 12,807
(1.82 %)
25,568
(2.46 %)
n/a 42.66
(99.99 %)
323
(0.01 %)
697
(100.00 %)
429,646
(4.10 %)
293,431
(3.59 %)
6,059,494
(21.89 %)
29,574
(2.42 %)
365 white-crowned manakin (hap1 2024 refseq)
GCF_036250125.1
55,558
(6.99 %)
12,807
(1.82 %)
23,359
(2.28 %)
n/a 42.66
(99.99 %)
323
(0.01 %)
696
(100.00 %)
429,643
(4.10 %)
293,428
(3.59 %)
6,059,402
(21.89 %)
29,574
(2.42 %)
366 white-crowned manakin (hap2 2024)
GCA_036250135.1
n/a 12,135
(1.94 %)
21,591
(2.38 %)
n/a 42.49
(99.99 %)
307
(0.01 %)
595
(100.00 %)
375,468
(3.93 %)
263,979
(3.93 %)
5,786,346
(21.36 %)
25,275
(2.50 %)
367 white-ruffed manakin
GCF_003945725.1
45,894
(5.34 %)
12,730
(1.91 %)
19,044
(2.50 %)
n/a 41.81
(99.24 %)
13,527
(0.76 %)
9,068
(100.00 %)
489,252
(7.14 %)
246,346
(1.38 %)
6,500,956
(19.79 %)
25,941
(1.84 %)
368 white-rumped snowfinch
GCF_017590055.1
34,717
(4.88 %)
12,599
(1.97 %)
24,083
(2.44 %)
n/a 42.03
(99.81 %)
4,869
(0.19 %)
11,576
(100.00 %)
502,151
(6.20 %)
449,641
(3.22 %)
6,554,257
(20.25 %)
28,891
(2.32 %)
369 white-tailed eagle (BGI_N329 2014)
GCF_000691405.1
20,744
(2.82 %)
11,490
(1.49 %)
22,258
(1.77 %)
n/a 40.90
(99.56 %)
60,579
(0.45 %)
111,484
(99.55 %)
325,669
(3.74 %)
116,707
(0.60 %)
6,725,133
(18.14 %)
11,615
(0.32 %)
370 white-tailed eagle (bHalAlb1.1 alternate hap 2022)
GCA_947461935.1
n/a 7,755
(1.71 %)
16,331
(2.39 %)
n/a 43.66
(100.00 %)
n/a 4,971
(100.00 %)
304,566
(13.21 %)
116,307
(6.64 %)
3,407,853
(22.91 %)
34,573
(4.56 %)
371 white-tailed eagle (primary hap 2022 refseq)
GCF_947461875.1
52,797
(5.74 %)
13,736
(1.76 %)
24,846
(2.12 %)
n/a 43.15
(99.99 %)
424
(0.01 %)
189
(100.00 %)
585,279
(12.89 %)
291,297
(6.10 %)
6,474,102
(23.66 %)
54,851
(4.05 %)
372 white-tailed ptarmigan
GCF_019238085.1
39,072
(5.37 %)
12,919
(2.36 %)
23,624
(2.48 %)
n/a 41.37
(97.63 %)
10,501
(2.38 %)
7,343
(100.00 %)
587,593
(8.19 %)
231,665
(1.12 %)
6,007,601
(20.08 %)
21,298
(2.05 %)
373 white-tailed tropicbird
GCF_000687285.1
16,342
(2.18 %)
12,040
(1.50 %)
26,704
(1.97 %)
n/a 41.51
(99.50 %)
65,286
(0.51 %)
132,071
(99.49 %)
353,892
(5.61 %)
125,195
(0.74 %)
6,873,137
(19.59 %)
41,005
(1.45 %)
374 white-throated dipper (primary hap 2023 genbank)
GCA_963662255.1
n/a 12,856
(1.79 %)
23,827
(2.25 %)
n/a 42.82
(99.99 %)
658
(0.01 %)
278
(100.00 %)
431,536
(3.38 %)
345,533
(10.59 %)
5,840,462
(26.59 %)
29,711
(3.56 %)
375 white-throated dipper (primary hap 2023 refseq)
GCF_963662255.1
29,618
(3.60 %)
12,854
(1.79 %)
23,825
(2.25 %)
n/a 42.82
(99.99 %)
658
(0.01 %)
277
(100.00 %)
431,531
(3.38 %)
345,532
(10.59 %)
5,840,421
(26.59 %)
29,711
(3.56 %)
376 white-throated sparrow
GCF_000385455.1
31,167
(5.71 %)
11,241
(1.81 %)
13,429
(2.26 %)
n/a 41.52
(95.61 %)
41,460
(4.40 %)
37,661
(95.60 %)
439,216
(5.96 %)
364,202
(2.52 %)
6,300,584
(19.09 %)
15,091
(0.85 %)
377 white-throated tinamou
GCF_000705375.1
18,997
(2.72 %)
12,287
(1.75 %)
20,132
(2.48 %)
n/a 41.41
(97.88 %)
59,853
(2.12 %)
142,367
(97.88 %)
366,311
(3.62 %)
226,347
(1.35 %)
6,300,683
(18.94 %)
47,608
(2.60 %)
378 whooping crane (maternal hap 2023 refseq)
GCF_028858705.1
55,408
(5.57 %)
13,574
(1.81 %)
24,739
(2.19 %)
n/a 43.07
(99.63 %)
262
(0.37 %)
930
(100.00 %)
616,300
(10.57 %)
211,558
(2.90 %)
6,785,192
(22.11 %)
42,795
(4.66 %)
379 whooping crane (paternal hap 2023)
GCA_028858595.1
n/a 13,284
(1.87 %)
23,528
(2.20 %)
n/a 42.47
(99.50 %)
586
(0.50 %)
395
(100.00 %)
569,940
(8.69 %)
162,569
(0.98 %)
7,021,319
(20.20 %)
38,582
(3.77 %)
380 willow flycatcher
GCF_003031625.1
37,909
(4.43 %)
12,708
(1.90 %)
19,591
(2.57 %)
n/a 42.01
(95.33 %)
39,319
(4.68 %)
7,791
(100.00 %)
550,172
(7.15 %)
242,394
(1.27 %)
6,421,292
(18.87 %)
27,080
(1.82 %)
381 wire-tailed manakin (2020)
GCF_003945595.2
42,551
(5.86 %)
12,535
(1.90 %)
23,300
(2.38 %)
n/a 42.06
(99.73 %)
758
(0.26 %)
1,768
(100.00 %)
480,705
(7.12 %)
240,463
(1.87 %)
6,316,566
(20.20 %)
25,317
(2.02 %)
382 wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 alternate hap 2023)
GCA_029207785.1
n/a 13,053
(1.78 %)
24,963
(2.30 %)
n/a 43.93
(100.00 %)
342
(0.00 %)
1,350
(100.00 %)
444,809
(3.08 %)
473,154
(7.96 %)
5,336,472
(25.82 %)
37,198
(3.14 %)
383 wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 primary hap 2023 refseq)
GCF_029207755.1
40,944
(5.15 %)
13,050
(1.78 %)
24,948
(2.30 %)
n/a 43.93
(100.00 %)
353
(0.00 %)
1,694
(100.00 %)
444,856
(3.08 %)
473,471
(7.97 %)
5,336,456
(25.82 %)
37,210
(3.14 %)
384 yellow warbler (LACM:Birds122168 alternate hap 2022)
GCA_024372515.1
n/a 12,426
(1.63 %)
27,565
(2.37 %)
n/a 43.59
(100.00 %)
246
(0.00 %)
776
(100.00 %)
447,274
(3.06 %)
612,008
(10.28 %)
5,606,168
(28.79 %)
39,449
(2.66 %)
385 yellow warbler (LACM:Birds122168 primary hap 2022)
GCA_024362935.1
n/a 12,556
(1.69 %)
26,545
(2.35 %)
n/a 43.09
(100.00 %)
284
(0.00 %)
971
(100.00 %)
440,673
(3.12 %)
581,112
(9.17 %)
6,158,372
(26.15 %)
35,577
(2.57 %)
386 yellow-crowned parrot (bAmaOch1hap1 2024)
GCA_039720435.1
n/a 13,169
(1.63 %)
23,545
(1.98 %)
n/a 43.42
(100.00 %)
198
(0.00 %)
1,679
(100.00 %)
579,903
(8.32 %)
295,345
(9.90 %)
4,361,776
(30.37 %)
28,647
(1.82 %)
387 yellow-crowned parrot (bAmaOch1hap2 2024)
GCA_039720425.1
n/a 12,079
(1.50 %)
21,895
(1.84 %)
n/a 44.31
(100.00 %)
138
(0.00 %)
2,468
(100.00 %)
514,155
(7.08 %)
298,648
(19.26 %)
3,943,979
(37.27 %)
27,272
(1.79 %)
388 yellow-legged gull (bLarMic1.1_alternate_haplotype 2024)
GCA_964199725.1
n/a 12,692
(1.61 %)
24,720
(2.07 %)
n/a 44.79
(100.00 %)
n/a 4,673
(100.00 %)
486,967
(5.03 %)
248,816
(10.71 %)
6,176,494
(29.58 %)
44,101
(6.72 %)
389 yellow-legged gull (primary hap 2024)
GCA_964199755.1
n/a 13,396
(1.62 %)
25,176
(2.03 %)
n/a 44.64
(99.99 %)
500
(0.01 %)
618
(100.00 %)
521,539
(5.15 %)
267,365
(11.68 %)
5,827,639
(29.76 %)
44,532
(6.28 %)
390 yellow-throated sandgrouse (alternate hap 2019)
GCA_009769505.1
n/a 11,788
(1.85 %)
23,306
(2.45 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
n/a 1,958
(100.00 %)
467,960
(6.96 %)
182,645
(0.99 %)
6,050,545
(20.78 %)
26,357
(2.20 %)
391 yellow-throated sandgrouse (primary hap 2019)
GCA_009769525.1
n/a 12,697
(1.89 %)
25,289
(2.53 %)
n/a 42.40
(99.62 %)
242
(0.38 %)
89
(100.00 %)
510,633
(7.10 %)
213,742
(1.12 %)
6,627,716
(21.17 %)
28,848
(2.23 %)
392 zebra finch (alternate hap Black17 2018)
GCA_003957525.1
n/a 11,340
(1.85 %)
22,921
(2.37 %)
n/a 41.73
(99.98 %)
45
(0.01 %)
5,381
(99.99 %)
480,647
(8.44 %)
365,668
(2.89 %)
5,859,698
(20.27 %)
24,649
(2.35 %)
393 zebra finch (alternate hap Blue55 v1 2020)
GCA_009859025.1
n/a 10,734
(1.84 %)
19,978
(2.21 %)
n/a 41.07
(99.99 %)
16
(0.01 %)
4,677
(100.00 %)
436,071
(7.44 %)
217,580
(1.43 %)
5,800,691
(19.24 %)
19,512
(1.90 %)
394 zebra finch (Black17 v1.4 alternate hap 2021)
GCA_003957525.2
n/a 11,213
(2.01 %)
21,533
(2.54 %)
n/a 41.92
(100.00 %)
10
(0.00 %)
1,646
(100.00 %)
470,860
(9.54 %)
387,943
(3.32 %)
5,428,128
(20.68 %)
23,838
(2.47 %)
395 zebra finch (Blue55 female 2020 genbank)
GCA_009859065.2
n/a 12,796
(1.92 %)
24,658
(2.44 %)
n/a 41.91
(98.03 %)
789
(1.97 %)
541
(100.00 %)
554,338
(9.67 %)
339,851
(2.27 %)
6,613,146
(20.04 %)
28,678
(2.32 %)
396 zebra finch (Blue55 paternal 2019)
GCA_008822125.1
n/a 12,384
(1.97 %)
23,021
(2.44 %)
n/a 41.74
(98.02 %)
828
(1.98 %)
202
(100.00 %)
511,324
(8.38 %)
351,624
(2.53 %)
6,328,918
(19.99 %)
25,871
(2.29 %)
397 zebra finch (Blue55 paternal W 2020)
GCF_008822105.2
50,407
(7.20 %)
12,470
(1.95 %)
23,352
(2.42 %)
n/a 41.81
(97.98 %)
857
(2.02 %)
205
(100.00 %)
529,829
(9.55 %)
357,586
(2.56 %)
6,359,599
(20.12 %)
27,755
(2.36 %)
398 zebra finch (v1.4 Blue55 female primary hap 2021 refseq)
GCF_003957565.2
49,311
(7.41 %)
12,747
(1.97 %)
24,009
(2.47 %)
n/a 41.86
(99.66 %)
352
(0.34 %)
199
(100.00 %)
544,577
(9.57 %)
458,903
(3.33 %)
6,338,748
(20.92 %)
29,202
(2.47 %)
399 zebra finch (v3 Blue55 maternal 2020)
GCA_008822115.3
n/a 11,950
(2.00 %)
22,828
(2.51 %)
n/a 42.06
(98.45 %)
583
(1.55 %)
206
(100.00 %)
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TOTALS:total assembly count 399

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Plants 305 assemblies assembly stats track stats
Fungi 918 assemblies assembly stats track stats
Viruses 287 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 110 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 527 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1067 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 778 assemblies assembly stats track stats