Birds Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of birds only.

See also: hub accessassembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 Abyssinian ground-hornbill (2019)
GCA_009769605.1
n/a 12,926
(1.90 %)
23,453
(2.26 %)
n/a 43.30
(99.29 %)
204
(0.71 %)
112
(100.00 %)
401,839
(5.61 %)
145,540
(0.78 %)
6,556,090
(19.22 %)
40,986
(3.65 %)
2 Abyssinian ground-hornbill (alternate hap 2019)
GCA_009769595.1
n/a 11,948
(1.86 %)
22,509
(2.24 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
n/a 3,527
(100.00 %)
361,147
(5.36 %)
125,372
(0.75 %)
5,917,083
(18.51 %)
38,787
(3.82 %)
3 acorn woodpecker (bairdi alternate hap 2022)
GCA_026170555.1
n/a 12,415
(1.42 %)
23,266
(1.78 %)
n/a 46.76
(99.99 %)
1,555
(0.01 %)
2,294
(100.00 %)
1,077,039
(17.72 %)
548,450
(13.79 %)
4,965,697
(43.00 %)
29,460
(3.04 %)
4 acorn woodpecker (bairdi primary hap 2022)
GCA_026170545.1
n/a 11,832
(1.45 %)
22,508
(1.87 %)
n/a 46.81
(99.99 %)
1,317
(0.01 %)
4,491
(99.99 %)
980,493
(17.23 %)
496,946
(14.39 %)
5,155,337
(42.38 %)
28,236
(3.22 %)
5 Adelie penguin
GCF_000699105.1
17,638
(3.05 %)
11,763
(1.71 %)
10,671
(1.99 %)
n/a 41.51
(95.58 %)
95,110
(4.45 %)
114,374
(95.55 %)
360,323
(4.64 %)
126,490
(0.70 %)
6,900,013
(18.31 %)
27,176
(0.96 %)
6 African ostrich
GCF_000698965.1
29,026
(4.42 %)
12,011
(1.64 %)
17,852
(1.82 %)
34,707
(3.37 %)
41.05
(96.74 %)
72,649
(3.29 %)
79,564
(96.71 %)
321,765
(3.17 %)
152,444
(0.82 %)
7,196,207
(17.79 %)
33,542
(1.33 %)
7 American crow
GCF_000691975.1
36,379
(6.32 %)
12,151
(1.86 %)
11,346
(2.24 %)
n/a 41.85
(96.40 %)
79,099
(3.62 %)
89,646
(96.38 %)
416,990
(6.08 %)
224,964
(1.60 %)
6,343,680
(18.42 %)
20,148
(0.77 %)
8 American flamingo (2019)
GCA_009819775.1
n/a 13,100
(1.79 %)
23,372
(2.04 %)
n/a 43.27
(99.31 %)
280
(0.69 %)
90
(100.00 %)
538,004
(7.73 %)
183,346
(0.79 %)
7,056,270
(20.92 %)
52,012
(5.96 %)
9 American flamingo (alternate hap 2019)
GCA_009819805.1
n/a 12,384
(1.73 %)
23,611
(2.05 %)
n/a 43.35
(100.00 %)
n/a 3,529
(100.00 %)
496,877
(7.22 %)
162,522
(0.74 %)
6,684,675
(20.14 %)
51,895
(5.89 %)
10 Anna's hummingbird (alternate hap BGI_N300 2018)
GCA_003957575.1
n/a 11,084
(1.90 %)
19,321
(2.14 %)
n/a 41.32
(100.00 %)
6
(0.00 %)
3,803
(100.00 %)
475,493
(7.41 %)
223,791
(1.37 %)
5,585,250
(20.30 %)
14,903
(1.46 %)
11 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 refseq)
GCF_003957555.1
31,091
(4.24 %)
12,257
(1.95 %)
14,633
(2.35 %)
n/a 41.49
(98.48 %)
429
(1.52 %)
159
(100.00 %)
535,315
(7.95 %)
262,055
(1.51 %)
6,092,276
(20.84 %)
17,130
(1.48 %)
12 bald eagle
GCF_000737465.1
26,869
(3.49 %)
13,007
(1.88 %)
15,874
(2.35 %)
n/a 41.68
(98.38 %)
30,862
(1.63 %)
31,786
(98.37 %)
355,319
(3.99 %)
119,526
(0.44 %)
6,923,742
(18.48 %)
33,353
(1.97 %)
13 bar-tailed trogon
GCF_000703405.1
15,393
(2.18 %)
11,432
(1.52 %)
23,733
(1.98 %)
n/a 41.38
(99.58 %)
50,921
(0.42 %)
105,649
(99.58 %)
386,871
(6.20 %)
142,825
(0.82 %)
6,474,942
(19.87 %)
18,662
(0.63 %)
14 barn owl (U. Lausanne 2021)
GCF_018691265.1
46,583
(5.22 %)
13,036
(1.82 %)
22,849
(2.14 %)
n/a 41.65
(95.89 %)
259
(4.11 %)
70
(100.00 %)
610,994
(5.59 %)
254,870
(1.12 %)
7,109,716
(19.00 %)
38,384
(2.94 %)
15 Barn swallow (bHirRus1 v3 alternate hap 2021)
GCA_015227815.3
n/a 11,132
(1.94 %)
20,993
(2.40 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
6
(0.00 %)
2,476
(100.00 %)
550,072
(10.78 %)
282,378
(2.00 %)
5,634,117
(20.43 %)
30,305
(2.79 %)
16 Barn swallow (bHirRus1 v3 primary hap 2021 refseq)
GCF_015227805.2
41,925
(5.13 %)
12,395
(1.89 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
664,757
(13.92 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
36,548
(2.85 %)
17 Bengalese finch
GCF_005870125.1
32,857
(5.06 %)
12,604
(1.98 %)
23,707
(2.41 %)
n/a 41.59
(97.06 %)
37,862
(2.95 %)
2,015
(100.00 %)
507,898
(7.97 %)
424,913
(2.80 %)
6,456,852
(20.03 %)
29,692
(2.46 %)
18 black-capped chickadee (hap1 2023)
GCF_030490865.1
44,388
(4.96 %)
13,738
(1.81 %)
26,691
(2.34 %)
n/a 42.41
(99.92 %)
404
(0.08 %)
307
(100.00 %)
730,165
(12.91 %)
566,529
(6.51 %)
6,499,984
(24.36 %)
42,650
(2.59 %)
19 black-capped chickadee (hap2 2023)
GCA_030490855.1
n/a 11,495
(1.90 %)
22,202
(2.49 %)
n/a 42.77
(99.94 %)
240
(0.06 %)
157
(100.00 %)
560,436
(11.20 %)
441,102
(7.11 %)
5,126,888
(23.42 %)
35,457
(2.90 %)
20 black-headed gull (Kunming 2023)
GCA_030820635.1
n/a 12,902
(1.75 %)
23,180
(2.09 %)
n/a 43.21
(100.00 %)
149
(0.00 %)
297
(100.00 %)
498,044
(5.37 %)
199,557
(4.44 %)
6,843,616
(23.12 %)
42,444
(3.62 %)
21 black-headed gull (primary hap 2024)
GCA_963924245.1
n/a 13,244
(1.58 %)
25,111
(1.96 %)
n/a 44.66
(99.99 %)
462
(0.01 %)
729
(100.00 %)
516,350
(4.84 %)
268,175
(14.83 %)
5,880,256
(31.31 %)
45,313
(4.92 %)
22 black-legged kittiwake (bRisTri1 2023 refseq)
GCF_028500815.1
51,115
(5.11 %)
13,211
(1.67 %)
24,108
(1.99 %)
n/a 44.40
(99.94 %)
283
(0.06 %)
716
(100.00 %)
521,275
(5.36 %)
236,727
(8.62 %)
5,684,588
(26.70 %)
45,318
(4.71 %)
23 black-legged kittiwake (bRisTri1.mat 2023)
GCA_028501385.1
n/a 12,650
(1.68 %)
22,959
(2.02 %)
n/a 44.62
(99.95 %)
223
(0.05 %)
733
(100.00 %)
483,413
(5.25 %)
221,284
(9.35 %)
6,264,499
(27.26 %)
42,776
(4.88 %)
24 blackcap (2019)
GCA_009819655.1
n/a 12,378
(1.92 %)
22,970
(2.37 %)
n/a 42.00
(98.88 %)
413
(1.12 %)
189
(100.00 %)
506,242
(6.14 %)
330,354
(2.12 %)
6,410,567
(19.76 %)
26,838
(2.34 %)
25 blackcap (alternate hap 2019)
GCA_009819715.1
n/a 11,586
(1.87 %)
22,618
(2.41 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
2
(0.00 %)
3,566
(100.00 %)
473,456
(5.97 %)
308,518
(2.29 %)
5,987,640
(19.64 %)
25,451
(2.38 %)
26 black swan (v2 Queensland, Australia AKBS03 2022)
GCF_013377495.2
41,421
(4.72 %)
13,027
(1.98 %)
22,616
(2.25 %)
n/a 41.96
(99.99 %)
130
(0.01 %)
568
(100.00 %)
636,501
(5.67 %)
297,964
(1.45 %)
6,820,083
(21.47 %)
31,725
(3.49 %)
27 black-throated flowerpiercer
GCA_019023105.1
n/a 12,249
(1.86 %)
23,692
(2.34 %)
n/a 42.36
(99.99 %)
970
(0.01 %)
600
(100.00 %)
491,914
(6.04 %)
365,884
(2.89 %)
6,453,998
(20.73 %)
30,076
(2.44 %)
28 blue tit
GCF_002901205.1
42,986
(5.81 %)
12,162
(1.76 %)
16,442
(2.29 %)
n/a 41.18
(92.58 %)
24,797
(7.42 %)
29,297
(100.00 %)
486,455
(6.02 %)
423,142
(2.68 %)
6,777,615
(18.84 %)
26,565
(0.98 %)
29 blue-and-yellow macaw (hap1 2023)
GCA_028858755.1
n/a 12,919
(1.77 %)
22,770
(2.15 %)
n/a 42.69
(99.92 %)
107
(0.08 %)
246
(100.00 %)
711,670
(17.55 %)
242,430
(5.04 %)
5,545,074
(24.84 %)
25,153
(2.06 %)
30 blue-and-yellow macaw (hap2 2023)
GCA_028858555.1
n/a 13,216
(1.69 %)
23,855
(2.07 %)
n/a 43.30
(99.92 %)
130
(0.08 %)
274
(100.00 %)
746,174
(21.96 %)
291,116
(9.91 %)
5,424,976
(28.69 %)
26,750
(2.02 %)
31 blue-crowned manakin
GCF_001604755.1
42,586
(5.25 %)
12,442
(1.93 %)
16,972
(2.49 %)
n/a 41.74
(97.93 %)
22,456
(2.07 %)
23,501
(97.93 %)
470,567
(6.92 %)
226,975
(1.27 %)
6,395,476
(19.17 %)
24,084
(1.85 %)
32 blue-fronted amazon (AMXYW 2021)
GCA_017639355.1
n/a 12,250
(1.92 %)
19,607
(2.10 %)
n/a 41.72
(93.42 %)
3,560,856
(6.92 %)
1,498
(100.00 %)
559,187
(10.05 %)
144,509
(0.66 %)
5,883,053
(17.90 %)
18,581
(1.17 %)
33 blue-fronted amazon (FVVF132 2015)
GCA_001420675.1
n/a 12,339
(1.91 %)
20,350
(2.13 %)
n/a 41.72
(93.49 %)
3,559,082
(6.85 %)
3,232
(100.00 %)
501,831
(8.21 %)
144,313
(0.66 %)
5,882,906
(17.92 %)
18,584
(1.17 %)
34 brown eared-pheasant
GCA_019593555.1
n/a 13,027
(2.37 %)
22,748
(2.48 %)
n/a 41.03
(98.67 %)
114,232
(1.35 %)
2,408
(100.00 %)
523,649
(0.00 %)
228,783
(1.17 %)
6,134,418
(20.24 %)
19,702
(2.00 %)
35 brown headed cowbird (v1.1 BHLD 08-10-18 2022)
GCF_012460135.2
31,871
(5.31 %)
12,561
(1.89 %)
24,218
(2.41 %)
n/a 42.40
(99.99 %)
318
(0.01 %)
692
(99.99 %)
598,355
(12.36 %)
420,712
(3.73 %)
6,496,704
(21.26 %)
28,568
(2.41 %)
36 brown kiwi
GCF_001039765.1
26,121
(3.23 %)
12,909
(1.54 %)
23,267
(1.91 %)
n/a 41.28
(86.08 %)
368,297
(13.97 %)
24,718
(100.00 %)
367,446
(2.94 %)
316,602
(7.36 %)
7,164,456
(14.67 %)
59,756
(2.40 %)
37 brown roatelo
GCF_000695765.1
16,756
(2.26 %)
12,208
(1.55 %)
27,079
(2.12 %)
n/a 41.32
(99.66 %)
51,602
(0.35 %)
119,122
(99.65 %)
345,102
(5.17 %)
194,444
(1.21 %)
6,441,258
(19.39 %)
19,018
(0.67 %)
38 budgerigar (v6.3 2021 WashU)
GCF_000238935.1
25,525
(4.05 %)
12,188
(1.82 %)
15,819
(2.26 %)
n/a 41.25
(97.26 %)
51,022
(2.75 %)
70,863
(97.25 %)
465,974
(9.37 %)
127,353
(0.54 %)
5,864,264
(19.05 %)
15,886
(0.88 %)
39 budgerigar (maternal 2020)
GCA_012275265.1
n/a 12,659
(1.89 %)
22,063
(2.28 %)
n/a 41.89
(94.20 %)
388
(5.80 %)
930
(100.00 %)
504,677
(9.95 %)
268,616
(3.12 %)
5,481,198
(20.78 %)
20,278
(1.55 %)
40 budgerigar (maternal Z 2020 refseq)
GCF_012275295.1
32,026
(4.32 %)
13,239
(1.87 %)
23,063
(2.25 %)
26,324
(3.11 %)
41.80
(99.72 %)
284
(0.28 %)
864
(100.00 %)
538,374
(10.19 %)
279,504
(3.12 %)
5,874,531
(22.08 %)
21,155
(1.61 %)
41 budgerigar (paternal 2020)
GCA_012275275.1
n/a 13,127
(1.94 %)
22,492
(2.30 %)
n/a 41.84
(98.98 %)
737
(1.02 %)
330
(100.00 %)
505,478
(9.66 %)
231,633
(2.15 %)
5,778,405
(20.30 %)
20,205
(1.61 %)
42 burrowing owl
GCF_003259725.1
30,559
(4.30 %)
11,741
(1.72 %)
10,976
(2.04 %)
n/a 40.92
(98.92 %)
33,737
(1.09 %)
445
(100.00 %)
492,320
(6.21 %)
182,281
(0.73 %)
6,811,984
(19.35 %)
22,840
(1.08 %)
43 California black rail (168171201 alternate hap 2022)
GCA_022605925.1
n/a 11,551
(1.57 %)
22,390
(2.09 %)
n/a 44.21
(99.99 %)
1,672
(0.01 %)
3,563
(100.00 %)
465,417
(6.39 %)
218,050
(11.40 %)
4,588,632
(30.42 %)
22,622
(2.16 %)
44 California black rail (168171201 primary hap 2022)
GCA_022605575.1
n/a 12,725
(1.54 %)
24,572
(2.13 %)
n/a 43.81
(100.00 %)
319
(0.00 %)
964
(100.00 %)
522,782
(6.36 %)
226,563
(14.09 %)
5,497,483
(32.27 %)
24,529
(1.77 %)
45 California condor (v2 813 2022 refseq)
GCF_018139145.2
27,527
(3.38 %)
12,653
(1.75 %)
21,924
(1.97 %)
n/a 42.16
(99.97 %)
632
(0.03 %)
542
(100.00 %)
434,141
(3.82 %)
177,389
(0.88 %)
7,171,770
(20.32 %)
34,918
(3.00 %)
46 California quail (MVZ:Bird:193975 alternate hap 2022)
GCA_023055725.1
n/a 12,948
(1.71 %)
24,838
(2.01 %)
n/a 43.36
(100.00 %)
248
(0.00 %)
1,601
(100.00 %)
1,359,516
(35.69 %)
599,039
(11.78 %)
3,454,101
(36.94 %)
36,496
(2.55 %)
47 California quail (MVZ:Bird:193975 primary hap 2022)
GCA_023055505.1
n/a 12,718
(2.12 %)
23,363
(2.40 %)
n/a 42.23
(100.00 %)
287
(0.00 %)
608
(100.00 %)
881,563
(19.85 %)
308,707
(5.50 %)
5,409,060
(25.34 %)
25,268
(2.42 %)
48 California towhee (CALT 2023)
GCF_028551555.1
28,823
(3.21 %)
12,791
(1.50 %)
26,511
(2.06 %)
n/a 44.24
(100.00 %)
n/a 627
(100.00 %)
473,712
(3.18 %)
586,987
(10.80 %)
4,965,312
(32.86 %)
48,369
(2.73 %)
49 Canada goose (SJ_97 2019)
GCA_006130075.1
n/a 13,061
(1.95 %)
24,149
(2.23 %)
n/a 42.13
(98.37 %)
15,389
(1.64 %)
28,876
(98.36 %)
715,113
(7.61 %)
319,386
(1.67 %)
6,810,836
(21.27 %)
40,389
(4.15 %)
50 carmine bee-eater alternate hap pseudohaplotype 2019)
GCA_009819585.1
n/a 12,381
(1.76 %)
28,865
(2.78 %)
n/a 43.05
(100.00 %)
n/a 3,296
(100.00 %)
542,765
(7.77 %)
204,389
(1.06 %)
6,415,832
(21.53 %)
31,638
(2.54 %)
51 carmine bee-eater (2019)
GCA_009819595.1
n/a 12,740
(1.82 %)
28,031
(2.77 %)
n/a 42.88
(99.47 %)
269
(0.53 %)
109
(100.00 %)
556,926
(7.87 %)
213,180
(1.09 %)
6,641,077
(21.58 %)
30,881
(2.41 %)
52 chaffinch (primary hap 2023)
GCA_963513975.1
n/a 12,708
(1.72 %)
24,978
(2.26 %)
n/a 44.06
(99.99 %)
573
(0.01 %)
467
(100.00 %)
495,590
(3.15 %)
493,628
(13.34 %)
6,163,336
(28.37 %)
39,042
(6.25 %)
53 chicken (GRCg6a 2018)
GCF_000002315.6
62,183
(8.40 %)
13,099
(2.32 %)
18,797
(2.76 %)
73,407
(9.29 %)
42.23
(99.08 %)
952
(0.92 %)
2,380
(99.08 %)
684,052
(12.74 %)
307,144
(2.92 %)
5,863,131
(21.16 %)
24,405
(2.72 %)
54 chicken (Cobb bGalGal5 alternate hap 2022)
GCA_027408205.1
n/a 11,740
(2.36 %)
21,473
(2.56 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
4
(0.00 %)
2,263
(100.00 %)
551,116
(10.78 %)
241,638
(4.43 %)
4,973,260
(21.77 %)
21,151
(2.71 %)
55 chicken (Cobb bGalGal5 primary hap 2022)
GCA_027408225.1
n/a 13,037
(2.20 %)
23,550
(2.37 %)
n/a 42.31
(99.81 %)
460
(0.19 %)
252
(100.00 %)
681,166
(12.04 %)
381,093
(7.09 %)
5,610,806
(24.65 %)
25,664
(2.75 %)
56 chicken (Huxu 2023)
GCA_024206055.2
n/a 13,405
(2.26 %)
24,435
(2.45 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
14
(0.00 %)
41
(100.00 %)
704,190
(12.54 %)
502,701
(5.74 %)
5,731,097
(23.50 %)
27,781
(2.90 %)
57 chicken (Ross bGalGal4 alternate hap 2022)
GCA_027408255.1
n/a 11,339
(2.33 %)
20,588
(2.51 %)
n/a 42.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,684
(100.00 %)
537,847
(10.84 %)
217,964
(3.81 %)
4,879,985
(21.43 %)
19,653
(2.66 %)
58 chicken (Ross bGalGal4 primary hap 2023)
GCA_027557775.1
n/a 12,855
(2.22 %)
23,147
(2.37 %)
n/a 42.15
(99.74 %)
566
(0.26 %)
246
(100.00 %)
672,973
(12.00 %)
342,156
(6.53 %)
5,690,712
(23.98 %)
24,413
(2.63 %)
59 chicken white leghorn layer X broiler (leghorn haplotype v2 2021)
GCF_016700215.2
83,834
(10.16 %)
13,005
(2.32 %)
23,329
(2.48 %)
72,360
(9.39 %)
42.16
(99.57 %)
409
(0.43 %)
685
(99.57 %)
536,869
(6.00 %)
268,230
(2.28 %)
5,845,184
(20.93 %)
24,409
(2.60 %)
60 chicken white leghorn layer X broiler (broiler haplotype 2021 v2 2021)
GCF_016699485.2
74,716
(9.14 %)
13,128
(2.33 %)
23,484
(2.48 %)
72,013
(9.34 %)
42.20
(99.68 %)
463
(0.32 %)
677
(99.68 %)
697,827
(12.53 %)
290,892
(2.63 %)
5,887,021
(21.30 %)
24,469
(2.59 %)
61 Chilean tinamou
GCF_003342845.1
24,894
(4.16 %)
12,545
(2.09 %)
18,167
(2.87 %)
n/a 42.04
(98.74 %)
1,226,739
(1.39 %)
2,217
(100.00 %)
496,518
(5.43 %)
290,573
(1.50 %)
5,870,743
(19.53 %)
44,640
(5.21 %)
62 chimney swift (M959 v1.1 2014)
GCF_000747805.2
15,969
(2.53 %)
12,045
(1.82 %)
18,580
(2.07 %)
n/a 41.40
(96.00 %)
65,471
(4.02 %)
84,174
(95.98 %)
469,979
(5.99 %)
194,781
(2.21 %)
6,361,618
(19.70 %)
12,438
(0.41 %)
63 chuck-will's-widow (BGI_N321 v2 2014)
GCF_000700745.2
17,193
(2.21 %)
12,092
(1.49 %)
28,685
(1.89 %)
n/a 40.76
(99.62 %)
56,333
(0.39 %)
125,214
(99.61 %)
516,189
(5.36 %)
202,882
(1.12 %)
6,588,198
(20.47 %)
8,029
(0.24 %)
64 collared flycatcher
GCF_000247815.1
28,360
(4.07 %)
12,200
(1.78 %)
14,028
(2.24 %)
33,113
(3.87 %)
44.22
(98.57 %)
11,403
(1.43 %)
30,843
(98.57 %)
559,053
(7.88 %)
597,207
(11.39 %)
6,656,400
(23.61 %)
29,879
(1.50 %)
65 common canary (domestic yellow sc_yellow_7_cibi 2019)
GCF_007115625.1
32,985
(4.99 %)
12,248
(1.89 %)
15,910
(2.38 %)
n/a 42.17
(98.21 %)
47,138
(1.81 %)
3,536
(100.00 %)
477,249
(6.30 %)
313,951
(2.10 %)
6,525,604
(19.58 %)
25,722
(1.90 %)
66 common canary (serCan28SL12 2022)
GCF_022539315.1
41,390
(5.57 %)
12,314
(1.93 %)
23,133
(2.37 %)
n/a 42.36
(99.95 %)
1,055
(0.05 %)
685
(100.00 %)
553,077
(10.89 %)
322,311
(2.75 %)
6,543,183
(20.47 %)
26,268
(2.31 %)
67 common cuckoo (bCucCan1 alternate hap 2021)
GCA_017976305.1
n/a 12,464
(1.91 %)
24,623
(2.50 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
8
(0.00 %)
1,004
(100.00 %)
505,582
(10.93 %)
292,484
(2.48 %)
6,061,828
(21.38 %)
24,010
(1.80 %)
68 common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 refseq)
GCF_017976375.1
50,206
(6.30 %)
13,190
(1.85 %)
24,284
(2.29 %)
n/a 42.18
(99.58 %)
296
(0.42 %)
150
(100.00 %)
566,161
(11.56 %)
310,430
(2.36 %)
6,712,791
(21.76 %)
25,268
(1.73 %)
69 common mallard (Pekin duck 2017)
GCA_002743455.1
n/a 12,871
(1.94 %)
25,038
(2.26 %)
n/a 41.42
(95.05 %)
25,623
(4.96 %)
21,442
(100.00 %)
760,634
(7.52 %)
360,866
(1.37 %)
6,710,465
(20.25 %)
32,823
(2.15 %)
70 common myna (bArcTri1 alternate hap 2023)
GCA_027559525.1
n/a 10,692
(1.77 %)
20,925
(2.29 %)
n/a 42.15
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,221
(100.00 %)
328,602
(4.16 %)
604,057
(8.02 %)
5,233,128
(25.06 %)
25,210
(3.70 %)
71 common myna (bArcTri1 primary hap 2023)
GCA_027559615.1
n/a 12,560
(1.73 %)
23,740
(2.16 %)
n/a 42.32
(99.80 %)
435
(0.20 %)
455
(100.00 %)
395,254
(5.40 %)
937,774
(11.00 %)
6,145,808
(28.07 %)
32,293
(3.87 %)
72 common starling
GCF_001447265.1
28,711
(4.57 %)
12,585
(2.01 %)
17,785
(2.59 %)
n/a 41.49
(97.70 %)
23,392
(2.31 %)
22,666
(97.69 %)
427,543
(5.30 %)
310,445
(1.74 %)
6,482,337
(19.49 %)
23,883
(1.99 %)
73 common swift (bApuApu2 alternate hap 2021)
GCA_020740585.1
n/a 11,653
(1.89 %)
19,731
(2.20 %)
n/a 42.01
(100.00 %)
5
(0.00 %)
1,697
(100.00 %)
443,384
(6.09 %)
185,968
(1.18 %)
5,916,553
(20.88 %)
18,864
(1.75 %)
74 common swift (bApuApu2 primary hap 2021 refseq)
GCF_020740795.1
39,986
(4.95 %)
12,292
(1.88 %)
20,379
(2.16 %)
n/a 41.95
(99.84 %)
256
(0.16 %)
110
(100.00 %)
499,695
(6.70 %)
199,749
(1.12 %)
6,354,003
(21.19 %)
20,393
(1.74 %)
75 common tern (alternate hap 2019)
GCA_009819645.1
n/a 12,773
(1.79 %)
24,751
(2.23 %)
n/a 43.24
(100.00 %)
n/a 2,235
(100.00 %)
549,460
(7.58 %)
204,051
(1.02 %)
6,880,566
(20.70 %)
47,352
(3.95 %)
76 common tern (2019)
GCA_009819605.1
n/a 13,103
(1.81 %)
24,044
(2.16 %)
n/a 43.03
(99.16 %)
205
(0.84 %)
123
(100.00 %)
570,312
(7.91 %)
216,895
(1.04 %)
7,043,151
(20.98 %)
45,694
(3.73 %)
77 common yellowthroat (alternate hap 2019)
GCA_009764545.1
n/a 10,611
(1.77 %)
21,125
(2.21 %)
n/a 41.77
(100.00 %)
1
(0.00 %)
4,976
(100.00 %)
422,889
(5.99 %)
294,928
(2.71 %)
5,928,421
(19.76 %)
21,397
(1.91 %)
78 common yellowthroat (2019)
GCA_009764595.1
n/a 11,741
(1.82 %)
22,382
(2.29 %)
n/a 42.01
(98.73 %)
1,479
(1.27 %)
278
(100.00 %)
476,049
(6.38 %)
367,108
(3.16 %)
6,576,957
(20.43 %)
25,004
(2.02 %)
79 crested ibis (BGI_Y956 2014)
GCF_000708225.1
17,134
(2.52 %)
12,801
(1.77 %)
14,062
(2.19 %)
n/a 41.83
(97.20 %)
70,475
(2.81 %)
130,030
(97.19 %)
395,055
(4.53 %)
182,744
(0.97 %)
7,244,849
(18.69 %)
39,156
(2.06 %)
80 cuckoo roller (BGI_N330 2014)
GCF_000691785.1
16,484
(2.21 %)
12,195
(1.53 %)
24,940
(1.96 %)
n/a 41.82
(99.74 %)
56,010
(0.27 %)
113,170
(99.73 %)
349,912
(4.65 %)
131,678
(0.66 %)
6,778,773
(18.46 %)
35,090
(1.44 %)
81 cuckoo roller (hap1 2023)
GCA_034619455.1
n/a 13,157
(1.67 %)
30,413
(2.59 %)
n/a 43.53
(100.00 %)
290
(0.00 %)
353
(100.00 %)
609,076
(8.83 %)
331,584
(6.01 %)
5,966,458
(23.99 %)
45,694
(7.05 %)
82 cuckoo roller (hap2 2023)
GCA_034619465.1
n/a 13,044
(1.66 %)
30,275
(2.65 %)
n/a 43.69
(100.00 %)
271
(0.00 %)
295
(100.00 %)
603,184
(8.76 %)
324,082
(7.37 %)
6,147,876
(25.10 %)
44,051
(8.95 %)
83 Dalmatian pelican (BGI_N334 2014)
GCF_000687375.1
16,438
(2.13 %)
11,927
(1.44 %)
25,409
(1.84 %)
n/a 41.39
(99.65 %)
57,580
(0.36 %)
121,562
(99.64 %)
394,453
(5.19 %)
159,315
(0.83 %)
6,832,864
(19.52 %)
25,648
(0.91 %)
84 Dalmatian pelican (alternate hap 2023)
GCA_030449815.1
n/a 12,766
(1.68 %)
26,055
(2.18 %)
n/a 43.44
(100.00 %)
n/a 7,284
(100.00 %)
607,561
(13.23 %)
239,649
(4.41 %)
6,086,519
(23.21 %)
38,398
(5.49 %)
85 Dalmatian pelican (primary hap 2023)
GCA_030463565.1
n/a 13,457
(1.72 %)
25,299
(2.10 %)
n/a 43.41
(99.99 %)
390
(0.01 %)
311
(100.00 %)
660,747
(14.47 %)
294,268
(5.22 %)
6,840,996
(24.63 %)
39,705
(5.14 %)
86 Downy woodpecker (alternate hap 2020)
GCA_014839825.1
n/a 11,732
(1.74 %)
22,080
(2.25 %)
n/a 45.44
(100.00 %)
4
(0.00 %)
1,342
(100.00 %)
921,959
(20.95 %)
334,804
(3.26 %)
5,352,773
(31.27 %)
24,105
(1.81 %)
87 Downy woodpecker (primary hap 2020)
GCF_014839835.1
25,483
(3.24 %)
12,410
(1.70 %)
22,416
(2.11 %)
n/a 45.31
(99.66 %)
187
(0.34 %)
180
(100.00 %)
1,259,627
(26.52 %)
378,533
(3.38 %)
5,846,661
(32.04 %)
26,005
(1.75 %)
88 East African grey crowned-crane
GCF_000709895.1
16,274
(2.23 %)
12,032
(1.55 %)
26,131
(1.84 %)
n/a 41.21
(99.65 %)
58,359
(0.36 %)
111,850
(99.64 %)
374,845
(4.51 %)
130,655
(0.66 %)
6,753,184
(18.86 %)
26,202
(0.96 %)
89 East African grey crowned-crane (alternate hap 2020)
GCA_011004865.1
n/a 11,799
(1.88 %)
22,122
(2.30 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
4
(0.00 %)
971
(100.00 %)
457,930
(6.40 %)
150,544
(0.85 %)
6,074,490
(20.16 %)
33,323
(3.81 %)
90 East African grey crowned-crane (bBalReg1 2020)
GCA_011004875.1
n/a 13,276
(1.84 %)
25,393
(2.30 %)
n/a 42.38
(99.61 %)
144
(0.39 %)
105
(100.00 %)
548,862
(7.06 %)
187,966
(0.97 %)
7,004,597
(21.19 %)
36,626
(3.69 %)
91 Eastern black-eared wheatear (GR-GAL-2019-014 2023)
GCF_029582105.1
38,171
(5.79 %)
12,559
(1.96 %)
23,642
(2.48 %)
n/a 42.01
(99.99 %)
582
(0.01 %)
587
(100.00 %)
599,051
(9.46 %)
453,954
(3.77 %)
6,287,657
(20.75 %)
27,831
(2.52 %)
92 emperor penguin
GCF_000699145.1
20,055
(3.28 %)
12,513
(1.77 %)
11,986
(2.13 %)
n/a 41.62
(94.30 %)
72,501
(5.72 %)
83,173
(94.28 %)
478,239
(5.68 %)
200,181
(2.24 %)
7,154,684
(17.95 %)
31,615
(1.38 %)
93 emu (v2 ZJU1.0 2023)
GCA_016128335.2
n/a 13,213
(1.74 %)
24,562
(2.10 %)
n/a 42.41
(99.99 %)
539
(0.01 %)
767
(100.00 %)
567,285
(7.79 %)
258,030
(2.59 %)
7,108,005
(19.16 %)
41,752
(6.24 %)
94 emu (2018)
GCF_003342905.1
36,047
(5.11 %)
12,857
(1.77 %)
17,727
(2.32 %)
n/a 41.63
(99.02 %)
1,408,082
(1.11 %)
2,778
(100.00 %)
440,224
(4.29 %)
175,539
(0.70 %)
7,218,815
(17.59 %)
43,752
(4.64 %)
95 Eurasian nightjar (alternate hap 2021)
GCA_907165095.1
n/a 12,266
(1.90 %)
22,091
(2.30 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
25
(0.00 %)
2,502
(100.00 %)
458,278
(5.64 %)
212,205
(1.54 %)
6,032,224
(21.16 %)
21,942
(1.89 %)
96 Eurasian nightjar (primary hap 2021)
GCA_907165065.1
n/a 13,040
(1.86 %)
22,823
(2.21 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
153
(0.00 %)
121
(100.00 %)
595,803
(8.38 %)
248,128
(1.78 %)
6,744,611
(22.18 %)
24,805
(1.90 %)
97 Eurasian tree sparrow
GCF_014805655.1
43,477
(5.70 %)
12,550
(1.95 %)
24,541
(2.43 %)
n/a 42.02
(99.82 %)
4,765
(0.18 %)
18,975
(100.00 %)
464,973
(6.08 %)
492,684
(3.98 %)
6,663,773
(20.49 %)
28,741
(2.30 %)
98 Eurpoean golden plover (bPluApr1 alternate hap 2021)
GCA_017639475.1
n/a 11,836
(1.83 %)
21,119
(2.12 %)
n/a 42.78
(100.00 %)
5
(0.00 %)
1,147
(100.00 %)
443,887
(6.00 %)
149,233
(0.76 %)
6,328,128
(20.72 %)
37,413
(3.59 %)
99 European golden plover (bPluApr1 primary hap 2021)
GCA_017639485.1
n/a 12,984
(1.78 %)
22,854
(2.04 %)
n/a 42.70
(99.01 %)
268
(0.99 %)
107
(100.00 %)
558,587
(8.35 %)
180,400
(0.83 %)
7,132,381
(21.18 %)
40,661
(3.41 %)
100 European robin (alternate hap 2021)
GCA_903797565.2
n/a 11,359
(1.98 %)
21,437
(2.45 %)
n/a 41.70
(100.00 %)
18
(0.00 %)
3,668
(100.00 %)
346,477
(2.88 %)
283,542
(2.49 %)
5,597,130
(19.71 %)
22,977
(2.32 %)
101 European robin (primary hap 2021)
GCA_903797595.2
n/a 12,344
(1.85 %)
23,934
(2.37 %)
n/a 42.10
(99.97 %)
990
(0.03 %)
1,119
(100.00 %)
532,973
(5.96 %)
401,820
(3.43 %)
6,320,210
(21.42 %)
30,391
(2.60 %)
102 European shag (alternate hap 2023)
GCA_949628205.1
n/a 11,681
(1.64 %)
22,195
(2.04 %)
n/a 43.00
(100.00 %)
1
(0.00 %)
9,752
(100.00 %)
363,092
(4.61 %)
347,630
(2.63 %)
5,664,392
(21.56 %)
32,162
(3.60 %)
103 European shag (primary hap 2023)
GCA_949628215.1
n/a 13,203
(1.74 %)
22,959
(2.04 %)
n/a 43.10
(100.00 %)
222
(0.00 %)
356
(100.00 %)
436,838
(4.84 %)
471,070
(3.20 %)
6,601,537
(22.79 %)
37,247
(3.95 %)
104 European turtle dove (v1.2 alternate hap 2021)
GCA_901699165.2
n/a 11,276
(1.79 %)
21,210
(2.15 %)
n/a 41.73
(100.00 %)
n/a 3,334
(100.00 %)
426,785
(4.89 %)
182,446
(0.97 %)
6,038,491
(20.24 %)
29,692
(2.35 %)
105 European turtle dove (v1.2 2021)
GCA_901699155.2
n/a 12,391
(1.76 %)
23,333
(2.17 %)
n/a 41.84
(99.67 %)
940
(0.33 %)
311
(100.00 %)
550,895
(7.50 %)
227,532
(1.16 %)
6,767,530
(21.05 %)
34,682
(2.57 %)
106 garden warbler (bSylBor1 alternate hap 2020)
GCA_014839765.1
n/a 12,359
(1.95 %)
23,228
(2.46 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
n/a 775
(100.00 %)
485,213
(6.08 %)
333,505
(2.21 %)
6,358,327
(19.87 %)
26,594
(2.34 %)
107 garden warbler (bSylBor1 primary hap 2020)
GCA_014839755.1
n/a 12,520
(1.95 %)
23,459
(2.46 %)
n/a 42.08
(99.82 %)
134
(0.18 %)
176
(100.00 %)
491,810
(6.09 %)
376,746
(2.55 %)
6,461,292
(20.23 %)
27,799
(2.40 %)
108 golden-collared manakin
GCF_001715985.3
27,575
(4.33 %)
11,806
(1.85 %)
13,267
(2.32 %)
n/a 41.42
(97.44 %)
20,874
(2.57 %)
3,619
(100.00 %)
447,084
(7.00 %)
197,843
(1.19 %)
6,198,932
(18.50 %)
18,804
(1.03 %)
109 golden eagle (v1.4 alternate hap 2021)
GCA_902153765.2
n/a 9,172
(1.85 %)
16,917
(2.12 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
2
(0.00 %)
3,855
(100.00 %)
377,153
(8.49 %)
117,959
(0.78 %)
4,418,970
(18.34 %)
27,767
(3.57 %)
110 golden eagle (v1.4 2021)
GCF_900496995.4
60,920
(5.98 %)
13,334
(1.84 %)
23,261
(2.12 %)
n/a 42.16
(99.58 %)
228
(0.42 %)
144
(100.00 %)
544,341
(5.93 %)
186,461
(0.80 %)
7,090,610
(20.01 %)
38,495
(3.10 %)
111 golden pheasant
GCA_003413605.1
n/a 12,891
(2.28 %)
21,429
(2.37 %)
n/a 40.87
(97.55 %)
51,170
(2.47 %)
65,464
(97.53 %)
541,931
(8.01 %)
249,405
(2.01 %)
6,173,989
(19.98 %)
22,227
(1.31 %)
112 great cormorant (BGI_N336 2014)
GCF_000708925.1
15,472
(2.07 %)
11,547
(1.44 %)
22,727
(1.73 %)
n/a 41.28
(99.25 %)
98,475
(0.77 %)
162,787
(99.23 %)
324,530
(4.59 %)
144,409
(1.43 %)
6,724,538
(18.06 %)
14,330
(0.42 %)
113 great cormorant (primary hap 2024)
GCA_963921805.1
n/a 13,434
(1.76 %)
30,619
(3.17 %)
n/a 43.47
(99.99 %)
493
(0.01 %)
351
(100.00 %)
556,740
(10.18 %)
303,279
(3.45 %)
6,599,611
(22.65 %)
38,341
(5.45 %)
114 great potoo (bNycGra1 alternate hap 2020)
GCA_013368595.1
n/a 11,630
(1.85 %)
20,866
(2.20 %)
n/a 42.73
(100.00 %)
14
(0.00 %)
1,395
(100.00 %)
421,187
(9.08 %)
159,172
(0.96 %)
5,602,689
(22.75 %)
29,548
(2.77 %)
115 great potoo (bNycGra1 primary hap 2020)
GCA_013368605.1
n/a 13,116
(1.77 %)
23,657
(2.10 %)
n/a 42.67
(99.51 %)
243
(0.49 %)
191
(100.00 %)
514,142
(9.71 %)
210,381
(1.13 %)
6,501,989
(23.95 %)
35,785
(2.69 %)
116 great tit
GCF_001522545.3
46,201
(6.78 %)
12,250
(2.00 %)
16,577
(2.52 %)
n/a 41.37
(98.24 %)
24,615
(1.76 %)
24,044
(98.24 %)
447,566
(5.89 %)
249,384
(1.36 %)
6,330,291
(19.11 %)
23,876
(1.88 %)
117 greater honeyguide (239-I01 2023)
GCF_027791375.1
20,607
(2.63 %)
12,184
(1.76 %)
21,560
(2.12 %)
n/a 43.63
(100.00 %)
556
(0.00 %)
1,452
(100.00 %)
804,583
(12.49 %)
291,451
(3.14 %)
5,887,349
(28.34 %)
19,623
(1.55 %)
118 greater prairie chicken
GCA_001870855.1
n/a 12,923
(2.36 %)
24,062
(2.50 %)
n/a 41.23
(99.63 %)
48,408
(0.39 %)
60,594
(99.61 %)
544,139
(7.50 %)
214,682
(0.99 %)
6,153,628
(19.86 %)
23,154
(2.26 %)
119 greater rhea
GCA_003343005.1
n/a 12,895
(1.81 %)
20,976
(2.06 %)
n/a 40.79
(98.79 %)
2,075,293
(1.40 %)
2,162
(100.00 %)
509,589
(0.00 %)
196,258
(0.73 %)
6,982,184
(18.70 %)
41,811
(3.95 %)
120 greater sage-grouse
GCF_019232065.1
36,656
(5.50 %)
12,419
(2.36 %)
21,319
(2.40 %)
n/a 41.16
(96.34 %)
9,894
(3.66 %)
1,502
(100.00 %)
574,006
(8.05 %)
196,630
(0.72 %)
5,996,002
(19.65 %)
18,807
(1.81 %)
121 green peafowl
GCA_016647715.1
n/a 12,897
(2.25 %)
23,427
(2.41 %)
n/a 41.73
(98.15 %)
32,668
(1.85 %)
2,446
(100.00 %)
481,865
(6.04 %)
188,685
(1.04 %)
6,268,032
(20.57 %)
22,330
(1.85 %)
122 grey parrot (MU2MI4XJKV 2020)
GCA_009867235.1
n/a 13,159
(1.57 %)
41,528
(2.68 %)
n/a 41.82
(99.96 %)
4,777
(0.03 %)
54,154
(99.97 %)
525,535
(7.07 %)
222,932
(1.16 %)
6,301,005
(19.38 %)
28,978
(2.14 %)
123 ground parrot (Strahan ANWC-B61680 2023)
GCF_028554395.1
41,746
(4.05 %)
13,173
(1.89 %)
24,269
(2.31 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
n/a 8,090
(100.00 %)
468,845
(6.23 %)
261,918
(2.42 %)
5,956,005
(21.98 %)
25,573
(1.77 %)
124 gyrfalcon (bFalRus1 alternate hap 2020)
GCA_015220155.1
n/a 6,534
(1.74 %)
12,152
(1.97 %)
n/a 42.70
(100.00 %)
n/a 8,370
(100.00 %)
179,674
(3.19 %)
76,165
(0.79 %)
2,908,228
(16.85 %)
11,838
(2.15 %)
125 gyrfalcon (bFalRus1 primary hap 2020)
GCF_015220075.1
47,961
(5.90 %)
13,016
(1.82 %)
21,266
(2.02 %)
n/a 42.20
(99.55 %)
635
(0.45 %)
133
(100.00 %)
484,104
(5.60 %)
186,430
(0.85 %)
7,162,723
(18.83 %)
24,760
(2.03 %)
126 Harpy eagle (bHarHar1 alternate hap 2022)
GCA_026419925.1
n/a 11,838
(1.64 %)
24,014
(2.16 %)
n/a 43.80
(100.00 %)
1
(0.00 %)
5,969
(100.00 %)
405,109
(3.51 %)
220,222
(6.17 %)
4,708,177
(25.30 %)
58,446
(5.44 %)
127 Harpy eagle (primary hap 2022 refseq)
GCF_026419915.1
51,641
(5.08 %)
13,412
(1.70 %)
24,002
(2.05 %)
n/a 43.39
(99.80 %)
342
(0.20 %)
322
(100.00 %)
456,476
(3.62 %)
260,495
(7.70 %)
5,658,773
(24.81 %)
60,606
(5.66 %)
128 Hawaiian crow (bCorHaw1 alternate hap 2021)
GCA_020740675.1
n/a 7,477
(1.92 %)
14,094
(2.40 %)
n/a 43.16
(100.00 %)
n/a 2,762
(100.00 %)
296,732
(12.20 %)
135,408
(4.08 %)
3,123,655
(20.92 %)
23,288
(3.74 %)
129 Hawaiian crow (bCorHaw1 primary hap 2021 refseq)
GCF_020740725.1
51,593
(6.18 %)
12,739
(1.83 %)
23,664
(2.30 %)
n/a 43.30
(99.84 %)
294
(0.16 %)
188
(100.00 %)
409,129
(0.00 %)
304,680
(5.73 %)
5,953,375
(23.59 %)
46,118
(3.85 %)
130 helmeted guineafowl
GCF_002078875.1
55,435
(7.96 %)
12,866
(2.29 %)
18,391
(2.68 %)
n/a 41.73
(98.08 %)
15,598
(1.93 %)
2,739
(100.00 %)
486,655
(7.97 %)
173,056
(0.98 %)
6,144,176
(20.18 %)
26,577
(2.39 %)
131 hoatzin (BGI_N306 2014)
GCF_000692075.1
14,928
(2.31 %)
11,454
(1.65 %)
11,717
(2.07 %)
n/a 42.42
(94.92 %)
99,371
(5.11 %)
109,627
(94.89 %)
360,821
(6.34 %)
145,440
(1.01 %)
6,679,356
(18.72 %)
40,581
(1.42 %)
132 hoatzin (hap1 2023)
GCA_030867145.1
n/a 13,089
(1.50 %)
29,621
(2.22 %)
n/a 45.56
(100.00 %)
268
(0.00 %)
683
(100.00 %)
610,333
(22.07 %)
252,997
(12.56 %)
5,154,598
(31.67 %)
58,754
(5.54 %)
133 hoatzin (hap2 2023)
GCA_030867165.1
n/a 12,349
(1.54 %)
27,206
(2.21 %)
n/a 45.91
(100.00 %)
212
(0.00 %)
535
(100.00 %)
529,757
(21.69 %)
235,999
(14.32 %)
4,845,810
(31.86 %)
53,781
(5.77 %)
134 hooded crow (v6 S_Up_H32 2022)
GCF_000738735.6
42,787
(6.57 %)
11,856
(1.93 %)
20,738
(2.23 %)
n/a 42.10
(99.68 %)
425
(0.32 %)
47
(100.00 %)
458,399
(8.32 %)
164,830
(0.93 %)
6,148,741
(19.00 %)
25,266
(2.09 %)
135 house finch (bHaeMex1 alternate hap 2022)
GCA_027406555.1
n/a 12,027
(1.89 %)
23,973
(2.49 %)
n/a 43.03
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1,004
(100.00 %)
385,230
(3.05 %)
398,497
(5.70 %)
5,772,203
(22.69 %)
28,740
(2.98 %)
136 house finch (bHaeMex1 primary hap 2022 refseq)
GCF_027477595.1
43,228
(5.71 %)
12,702
(1.83 %)
24,568
(2.38 %)
n/a 42.91
(99.02 %)
296
(0.98 %)
184
(100.00 %)
440,384
(3.17 %)
463,164
(6.37 %)
6,300,138
(23.47 %)
30,897
(2.53 %)
137 house sparrow (hap1 2024)
GCA_036417665.1
n/a 12,831
(1.61 %)
26,124
(2.26 %)
n/a 43.99
(100.00 %)
202
(0.00 %)
334
(100.00 %)
647,396
(12.37 %)
646,615
(14.14 %)
5,906,524
(30.36 %)
36,193
(2.91 %)
138 House sparrow (hap2 2024)
GCA_036417895.1
n/a 12,201
(1.59 %)
24,721
(2.19 %)
n/a 44.46
(100.00 %)
182
(0.00 %)
482
(100.00 %)
629,688
(12.73 %)
644,409
(14.12 %)
5,103,050
(31.93 %)
33,424
(2.42 %)
139 Humboldt's penguin (bSphHub1 alternate hap 2022)
GCA_027474345.1
n/a 11,806
(1.66 %)
21,429
(1.97 %)
n/a 43.73
(100.00 %)
1
(0.00 %)
4,343
(100.00 %)
508,803
(10.25 %)
162,918
(5.44 %)
6,029,969
(24.67 %)
27,953
(3.83 %)
140 Humboldt's penguin (bSphHub1 primary hap 2022)
GCA_027474245.1
n/a 13,233
(1.67 %)
23,010
(1.93 %)
n/a 43.91
(99.92 %)
253
(0.08 %)
136
(100.00 %)
610,144
(11.51 %)
214,393
(5.75 %)
6,069,916
(25.74 %)
33,172
(3.38 %)
141 hyacinth macaw (LEKZKR9XQ3 2022)
GCA_009936445.2
n/a 12,424
(1.21 %)
43,440
(2.06 %)
n/a 41.86
(99.95 %)
1,098
(0.00 %)
260,829
(100.00 %)
497,886
(5.29 %)
184,967
(0.96 %)
6,167,538
(20.22 %)
33,529
(1.55 %)
142 jackdaw
GCA_013407035.1
n/a 12,072
(1.93 %)
20,925
(2.08 %)
n/a 42.15
(99.72 %)
511
(0.28 %)
41
(100.00 %)
428,760
(6.13 %)
173,436
(1.02 %)
6,231,317
(19.25 %)
26,177
(2.17 %)
143 Japanese quail
GCF_001577835.2
49,210
(7.77 %)
12,864
(2.54 %)
22,540
(2.69 %)
37,604
(4.36 %)
41.28
(98.88 %)
11,601
(1.12 %)
9,642
(98.88 %)
559,601
(7.91 %)
321,128
(2.22 %)
5,497,911
(19.81 %)
17,977
(1.86 %)
144 kagu (bRhyJub1 alternate hap 2023)
GCA_027595965.1
n/a 8,732
(1.74 %)
16,473
(2.17 %)
n/a 45.10
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,819
(100.00 %)
314,902
(10.49 %)
133,061
(10.84 %)
3,656,435
(25.68 %)
32,592
(5.25 %)
145 kagu (bRhyJub1 primary hap 2023)
GCA_027574665.1
n/a 13,042
(1.63 %)
24,142
(2.01 %)
n/a 45.07
(99.96 %)
300
(0.04 %)
148
(100.00 %)
563,851
(12.90 %)
270,861
(12.36 %)
6,191,106
(28.24 %)
54,426
(4.92 %)
146 kakapo (Jane alternate hap 2019)
GCA_004011185.1
n/a 3,256
(1.65 %)
6,220
(1.98 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
11
(0.00 %)
3,728
(100.00 %)
127,817
(7.83 %)
53,447
(1.21 %)
1,502,789
(18.09 %)
5,487
(1.71 %)
147 kakapo (Jane v2 2020 refseq)
GCF_004027225.2
49,757
(5.76 %)
13,110
(1.92 %)
22,782
(2.26 %)
n/a 41.97
(99.08 %)
373
(0.92 %)
89
(100.00 %)
507,148
(7.85 %)
208,178
(1.08 %)
6,258,087
(20.50 %)
22,278
(1.77 %)
148 kea
GCF_000696875.1
15,953
(2.35 %)
11,985
(1.66 %)
22,107
(2.01 %)
n/a 41.09
(99.60 %)
51,381
(0.42 %)
93,561
(99.58 %)
368,226
(5.60 %)
138,157
(0.75 %)
5,905,331
(18.06 %)
7,218
(0.22 %)
149 killdeer
GCF_000708025.1
16,480
(2.43 %)
12,356
(1.72 %)
12,853
(2.15 %)
n/a 41.88
(97.24 %)
63,995
(2.78 %)
79,162
(97.22 %)
424,095
(5.93 %)
167,406
(0.94 %)
7,070,701
(19.44 %)
37,082
(1.57 %)
150 lammergeier (bGypBar2 alternate hap 2023)
GCA_028017155.1
n/a 10,584
(1.75 %)
19,112
(2.09 %)
n/a 43.19
(100.00 %)
n/a 2,892
(100.00 %)
363,564
(3.53 %)
235,220
(7.22 %)
5,072,834
(23.83 %)
24,909
(2.64 %)
151 lammergeier (bGypBar2 primary hap 2023)
GCA_028022735.1
n/a 13,529
(1.69 %)
23,672
(1.98 %)
n/a 43.50
(99.85 %)
259
(0.15 %)
232
(100.00 %)
491,653
(3.53 %)
349,011
(9.83 %)
5,955,030
(26.51 %)
32,237
(2.61 %)
152 lance-tailed manakin (2020)
GCF_009829145.1
46,366
(5.56 %)
12,594
(1.91 %)
22,763
(2.31 %)
26,057
(3.91 %)
41.97
(99.70 %)
206
(0.30 %)
93
(100.00 %)
485,121
(7.13 %)
247,189
(1.64 %)
6,498,294
(20.04 %)
25,377
(1.97 %)
153 lance-tailed manakin (alternate hap 2020)
GCA_009829205.1
n/a 12,282
(1.85 %)
23,867
(2.36 %)
n/a 42.20
(100.00 %)
n/a 4,269
(100.00 %)
472,384
(7.01 %)
237,680
(1.65 %)
6,121,661
(19.48 %)
25,589
(2.05 %)
154 lanner falcon (bFalBia1 alternate hap 2022)
GCA_023634305.1
n/a 12,458
(1.70 %)
22,259
(2.05 %)
n/a 43.23
(100.00 %)
n/a 3,090
(100.00 %)
413,301
(3.46 %)
189,449
(5.28 %)
5,962,597
(22.07 %)
31,611
(2.72 %)
155 lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023638135.1
48,561
(5.70 %)
12,862
(1.69 %)
21,562
(1.92 %)
n/a 43.03
(99.83 %)
158
(0.17 %)
397
(100.00 %)
439,975
(3.77 %)
203,640
(6.96 %)
6,921,438
(23.57 %)
32,398
(2.65 %)
156 lesser black-backed gull (primary hap 2024)
GCA_963932225.1
n/a 13,333
(1.68 %)
24,731
(2.05 %)
n/a 44.40
(99.99 %)
537
(0.01 %)
1,382
(100.00 %)
509,160
(5.11 %)
266,609
(9.64 %)
6,827,304
(27.15 %)
44,108
(6.34 %)
157 lesser kestrel (alternate hap 2021)
GCA_017639645.1
n/a 12,578
(1.83 %)
22,257
(2.16 %)
n/a 42.51
(98.97 %)
258
(1.03 %)
551
(100.00 %)
431,717
(3.61 %)
201,876
(1.38 %)
6,620,060
(19.16 %)
27,552
(2.26 %)
158 lesser kestrel (v2 2021)
GCF_017639655.2
47,420
(5.64 %)
13,098
(1.80 %)
22,203
(2.07 %)
n/a 42.30
(99.66 %)
298
(0.34 %)
291
(100.00 %)
516,499
(5.58 %)
210,234
(1.26 %)
7,133,934
(19.19 %)
27,558
(2.21 %)
159 lesser prairie-chicken (F22 2022)
GCF_026119805.1
51,352
(6.92 %)
12,689
(2.35 %)
22,377
(2.51 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
58
(0.00 %)
206
(100.00 %)
498,179
(5.36 %)
218,390
(1.80 %)
6,038,211
(20.76 %)
20,648
(2.33 %)
160 lesser rhea (bPtePen1 alternate hap 2023)
GCA_028389885.1
n/a 10,465
(1.71 %)
19,083
(2.16 %)
n/a 42.10
(100.00 %)
n/a 910
(100.00 %)
520,125
(6.78 %)
251,547
(4.21 %)
5,321,207
(21.53 %)
34,698
(5.69 %)
161 lesser rhea (bPtePen1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028389875.1
39,024
(4.18 %)
13,360
(1.72 %)
23,870
(2.13 %)
n/a 42.45
(99.89 %)
128
(0.11 %)
180
(100.00 %)
674,149
(6.73 %)
329,124
(5.34 %)
6,820,245
(22.78 %)
45,073
(5.83 %)
162 lesser rhea (206185 2018)
GCA_003342835.1
n/a 13,105
(1.81 %)
25,654
(2.45 %)
n/a 40.86
(98.66 %)
1,039,616
(1.43 %)
3,019
(100.00 %)
522,333
(5.61 %)
208,867
(0.79 %)
7,080,214
(19.15 %)
42,016
(4.35 %)
163 little egret
GCF_000687185.1
25,843
(3.55 %)
12,162
(1.73 %)
10,954
(2.03 %)
n/a 42.25
(95.99 %)
88,871
(4.04 %)
100,662
(95.96 %)
490,997
(6.84 %)
165,380
(1.23 %)
6,955,585
(18.98 %)
31,136
(1.15 %)
164 long-tailed hermit (PSU5 alternate hap 2022)
GCA_023637925.1
n/a 12,264
(2.01 %)
20,528
(2.37 %)
n/a 40.99
(100.00 %)
n/a 230
(100.00 %)
498,393
(5.07 %)
266,700
(1.49 %)
6,131,743
(20.45 %)
15,809
(1.43 %)
165 long-tailed hermit (PSU5 primary hap 2022)
GCA_023637945.1
n/a 12,328
(2.02 %)
20,312
(2.34 %)
n/a 41.00
(99.63 %)
141
(0.37 %)
211
(99.63 %)
497,506
(5.06 %)
265,815
(1.51 %)
6,045,702
(20.10 %)
15,922
(1.43 %)
166 Macqueen's bustard (BGI_N324 2014)
GCF_000695195.1
15,790
(2.21 %)
11,632
(1.52 %)
24,790
(1.96 %)
n/a 41.10
(99.68 %)
56,130
(0.33 %)
115,823
(99.67 %)
391,856
(4.80 %)
148,075
(0.90 %)
6,682,530
(20.03 %)
27,675
(1.15 %)
167 Macqueen's bustard (maternal 2024)
GCA_036417535.1
n/a 13,082
(1.73 %)
27,150
(2.44 %)
n/a 43.25
(100.00 %)
100
(0.00 %)
329
(100.00 %)
669,243
(14.71 %)
211,387
(6.69 %)
6,514,716
(27.07 %)
47,331
(8.09 %)
168 Macqueen's bustard (paternal 2024)
GCA_036418225.1
n/a 11,814
(1.80 %)
23,161
(2.38 %)
n/a 43.09
(100.00 %)
84
(0.00 %)
343
(100.00 %)
586,864
(13.28 %)
184,036
(5.91 %)
5,606,205
(25.25 %)
42,560
(7.71 %)
169 maguari stork (bCicMag1 alternate hap 2021)
GCA_017639665.1
n/a 10,658
(1.74 %)
18,941
(1.98 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
5
(0.00 %)
4,278
(100.00 %)
326,479
(4.02 %)
141,715
(0.74 %)
5,600,372
(19.59 %)
27,330
(3.35 %)
170 maguari stork (bCicMag1 primary hap 2021)
GCA_017639555.1
n/a 12,905
(1.81 %)
22,204
(2.01 %)
n/a 42.12
(98.21 %)
232
(1.79 %)
153
(100.00 %)
485,318
(6.35 %)
184,992
(0.78 %)
7,064,965
(19.56 %)
31,653
(3.02 %)
171 mallard CAU_Wild1.0
GCA_008746955.1
n/a 13,260
(1.85 %)
25,071
(2.17 %)
n/a 42.41
(99.90 %)
318
(0.10 %)
1,665
(100.00 %)
849,782
(8.18 %)
438,622
(5.10 %)
6,729,782
(25.03 %)
34,670
(3.03 %)
172 mallard PBH1.5
GCF_003850225.1
54,114
(7.47 %)
12,199
(1.86 %)
15,363
(2.33 %)
n/a 41.63
(99.77 %)
71,703
(0.26 %)
2,150
(100.00 %)
770,322
(8.16 %)
357,617
(3.09 %)
6,587,406
(21.92 %)
29,913
(2.33 %)
173 mallard ZJU1.0
GCF_015476345.1
59,854
(7.33 %)
12,988
(1.87 %)
23,709
(2.20 %)
86,787
(8.80 %)
42.27
(99.64 %)
905
(0.36 %)
756
(100.00 %)
803,558
(8.04 %)
417,575
(5.02 %)
6,627,843
(24.59 %)
35,030
(3.06 %)
174 Mariana crow
GCF_017639235.1
48,460
(7.00 %)
12,506
(1.97 %)
22,580
(2.35 %)
n/a 42.14
(98.94 %)
10,579
(1.06 %)
1,443
(100.00 %)
434,280
(5.91 %)
169,629
(0.82 %)
6,323,058
(18.94 %)
27,390
(2.04 %)
175 Mauritius kestrel (alternate hap 2023)
GCA_963210275.1
n/a 4,774
(1.89 %)
8,695
(2.32 %)
n/a 43.52
(100.00 %)
n/a 2,259
(100.00 %)
135,092
(3.67 %)
112,042
(8.63 %)
1,739,144
(22.50 %)
12,908
(3.26 %)
176 Mauritius kestrel (primary hap 2023)
GCA_963210335.1
n/a 13,064
(1.72 %)
22,269
(1.98 %)
n/a 42.67
(99.99 %)
407
(0.01 %)
316
(100.00 %)
459,578
(3.87 %)
315,686
(6.19 %)
6,650,507
(22.84 %)
36,076
(2.82 %)
177 Mauritius parakeet (alternate hap 2023)
GCA_963243765.1
n/a 8,873
(1.81 %)
16,175
(2.24 %)
n/a 42.92
(100.00 %)
n/a 2,130
(100.00 %)
331,293
(6.89 %)
161,393
(5.94 %)
3,516,196
(24.86 %)
16,659
(1.74 %)
178 Mauritius parakeet (primary hap 2023)
GCA_963264785.1
n/a 13,133
(1.81 %)
23,396
(2.19 %)
n/a 42.66
(99.99 %)
358
(0.01 %)
172
(100.00 %)
511,156
(7.05 %)
238,915
(5.05 %)
5,764,523
(25.19 %)
24,675
(1.70 %)
179 medium ground-finch
GCF_000277835.1
22,226
(4.24 %)
11,887
(1.83 %)
11,438
(2.19 %)
n/a 41.61
(97.77 %)
68,589
(2.25 %)
95,828
(97.75 %)
433,244
(5.91 %)
322,831
(2.24 %)
6,548,136
(19.49 %)
18,135
(0.69 %)
180 monk parakeet
GCA_017639245.1
n/a 13,067
(1.85 %)
n/a n/a 42.29
(99.99 %)
352
(0.01 %)
291
(100.00 %)
582,436
(9.49 %)
253,709
(2.79 %)
5,820,920
(22.52 %)
23,101
(1.75 %)
181 mute swan (bCygOlo1 v2 alternate hap 2021)
GCA_009769485.2
n/a 10,145
(1.98 %)
18,617
(2.30 %)
n/a 42.21
(100.00 %)
14
(0.00 %)
5,640
(100.00 %)
533,330
(9.11 %)
213,518
(1.29 %)
4,813,886
(20.16 %)
25,667
(3.86 %)
182 mute swan (bCygOlo1 v2 primary hap 2021)
GCF_009769625.2
59,524
(6.76 %)
12,983
(1.98 %)
22,400
(2.22 %)
33,839
(5.17 %)
41.92
(99.13 %)
451
(0.87 %)
171
(100.00 %)
700,051
(7.55 %)
301,579
(1.34 %)
6,791,838
(21.30 %)
31,278
(3.07 %)
183 Nelson's sparrow (bAmmNel1 alternate hap 2023)
GCA_027579665.1
n/a 11,687
(1.78 %)
24,169
(2.43 %)
n/a 43.32
(100.00 %)
n/a 2,834
(100.00 %)
414,780
(3.26 %)
491,012
(10.03 %)
5,570,475
(26.24 %)
29,485
(4.55 %)
184 Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027579445.1
31,033
(4.42 %)
12,385
(1.72 %)
24,339
(2.24 %)
n/a 43.01
(99.57 %)
215
(0.43 %)
77
(100.00 %)
479,994
(3.33 %)
443,098
(9.18 %)
6,350,593
(25.82 %)
31,693
(3.88 %)
185 New Caledonian crow (2019)
GCF_009650955.1
50,821
(6.95 %)
12,747
(1.94 %)
23,372
(2.37 %)
30,299
(3.60 %)
42.57
(97.41 %)
289
(2.59 %)
105
(100.00 %)
452,690
(6.21 %)
231,546
(1.70 %)
6,265,995
(19.54 %)
31,909
(2.48 %)
186 New Caledonian crow (alternate hap 2019)
GCA_009651025.1
n/a 11,097
(1.99 %)
20,436
(2.45 %)
n/a 42.67
(100.00 %)
n/a 894
(100.00 %)
377,050
(6.03 %)
178,064
(1.53 %)
5,305,126
(19.49 %)
26,107
(2.52 %)
187 Nicobar pigeon (hap1 2024)
GCA_036013445.1
n/a 13,359
(1.72 %)
24,921
(2.13 %)
n/a 44.64
(100.00 %)
117
(0.00 %)
807
(100.00 %)
705,078
(18.28 %)
342,299
(9.55 %)
6,410,095
(28.06 %)
38,589
(9.40 %)
188 Nicobar pigeon (hap2 2024)
GCA_036010745.1
n/a 13,270
(1.84 %)
24,753
(2.28 %)
n/a 42.94
(100.00 %)
118
(0.00 %)
226
(100.00 %)
675,092
(12.72 %)
313,111
(3.64 %)
6,547,843
(23.22 %)
37,728
(3.88 %)
189 North Island brown kiwi (hap1 2024)
GCA_036417845.1
n/a 13,670
(1.52 %)
33,383
(2.64 %)
n/a 44.01
(100.00 %)
170
(0.00 %)
409
(100.00 %)
713,271
(8.42 %)
603,937
(6.25 %)
5,379,113
(27.65 %)
50,913
(9.74 %)
190 North Island brown kiwi (hap2 2024)
GCA_036417975.1
n/a 13,664
(1.44 %)
37,696
(2.80 %)
n/a 44.42
(100.00 %)
155
(0.00 %)
349
(100.00 %)
760,455
(8.84 %)
626,528
(6.85 %)
5,029,822
(30.45 %)
54,278
(9.43 %)
191 northern bobwhite
GCA_008692595.2
n/a 12,584
(2.37 %)
22,327
(2.53 %)
n/a 41.41
(99.04 %)
33,134
(0.97 %)
39,169
(99.03 %)
460,369
(4.63 %)
213,800
(1.34 %)
5,813,961
(19.54 %)
22,156
(2.37 %)
192 northern fulmar
GCF_000690835.1
16,383
(2.20 %)
11,965
(1.51 %)
24,294
(1.87 %)
n/a 41.17
(99.50 %)
54,825
(0.51 %)
112,214
(99.49 %)
330,541
(3.74 %)
146,735
(0.83 %)
6,838,937
(18.42 %)
24,859
(0.79 %)
193 northern gannet (hap1 2023)
GCA_031468805.1
n/a 13,367
(1.65 %)
24,403
(2.00 %)
n/a 42.94
(100.00 %)
263
(0.00 %)
829
(100.00 %)
498,574
(4.51 %)
273,984
(5.20 %)
5,544,122
(27.29 %)
34,879
(3.83 %)
194 northern gannet (hap2 2023)
GCA_031468815.1
n/a 13,477
(1.77 %)
23,613
(2.08 %)
n/a 42.44
(100.00 %)
248
(0.00 %)
427
(100.00 %)
474,930
(4.45 %)
237,604
(2.75 %)
5,847,260
(21.07 %)
30,873
(3.03 %)
195 northern goshawk (bAccGen1 v1 alternate hap 2022)
GCA_929447715.1
n/a 12,115
(1.73 %)
22,764
(2.15 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
2
(0.00 %)
4,484
(100.00 %)
417,395
(3.68 %)
231,908
(7.24 %)
5,424,533
(24.05 %)
35,691
(4.26 %)
196 northern goshawk (bAccGen1 primary hap v2 2022 genbank)
GCA_929443795.2
n/a 13,527
(1.65 %)
24,595
(1.99 %)
n/a 43.78
(100.00 %)
183
(0.00 %)
455
(100.00 %)
511,000
(3.76 %)
325,992
(9.82 %)
5,542,342
(27.30 %)
43,070
(4.44 %)
197 northern goshawk (bAccGen1 primary hap v1 2022 refseq)
GCF_929443795.1
50,663
(4.74 %)
13,528
(1.65 %)
24,595
(1.99 %)
n/a 43.78
(100.00 %)
183
(0.00 %)
454
(100.00 %)
521,768
(3.86 %)
325,987
(9.82 %)
5,542,269
(27.30 %)
43,070
(4.44 %)
198 northern pintail (primary hap 2024)
GCA_963932015.1
n/a 13,218
(1.88 %)
23,888
(2.27 %)
n/a 42.56
(99.99 %)
631
(0.01 %)
395
(100.00 %)
734,763
(5.74 %)
422,947
(7.08 %)
6,491,165
(25.88 %)
34,601
(2.98 %)
199 Obi paradise-crow (lycPyr6 2020)
GCA_014706295.1
n/a 12,592
(1.89 %)
24,002
(2.35 %)
n/a 42.94
(99.48 %)
1,602
(0.52 %)
1,695
(100.00 %)
466,546
(6.40 %)
235,283
(1.98 %)
6,371,421
(20.17 %)
34,247
(3.02 %)
200 Okarito brown kiwi
GCF_003343035.1
43,838
(4.59 %)
13,232
(1.76 %)
18,641
(2.35 %)
n/a 41.52
(98.49 %)
696,987
(1.57 %)
4,120
(100.00 %)
482,272
(4.98 %)
178,540
(0.70 %)
7,407,982
(18.33 %)
43,081
(4.88 %)
201 Oriental scops-owl (oso-nibr-517 2020)
GCA_010365825.1
n/a 12,953
(1.76 %)
25,275
(2.07 %)
24,636
(2.89 %)
41.70
(98.42 %)
42,691
(1.58 %)
151,517
(98.42 %)
494,677
(6.28 %)
222,654
(1.07 %)
7,211,171
(19.25 %)
41,048
(2.24 %)
202 peregrine falcon (bFalPer1 alternate hap 2022)
GCA_023634185.1
n/a 12,529
(1.75 %)
24,654
(2.25 %)
n/a 42.72
(100.00 %)
n/a 2,745
(100.00 %)
517,204
(7.95 %)
218,606
(4.15 %)
6,216,533
(21.16 %)
26,313
(2.41 %)
203 peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023634155.1
49,100
(5.64 %)
13,021
(1.66 %)
21,794
(1.95 %)
n/a 42.65
(99.69 %)
241
(0.31 %)
125
(100.00 %)
586,320
(11.83 %)
335,218
(8.05 %)
7,038,851
(24.65 %)
26,085
(2.25 %)
204 peregrine falcon (BGI 2013)
GCF_000337955.1
37,506
(5.42 %)
12,670
(1.80 %)
11,311
(2.11 %)
n/a 41.77
(98.44 %)
76,069
(1.58 %)
83,081
(98.42 %)
437,234
(5.32 %)
170,160
(0.93 %)
7,157,857
(18.38 %)
22,325
(0.89 %)
205 pin-tailed whydah (BioBank_ID:100142 2022)
GCF_024509145.1
41,770
(4.95 %)
12,712
(1.86 %)
24,157
(2.37 %)
n/a 42.69
(100.00 %)
338
(0.00 %)
484
(100.00 %)
641,523
(14.11 %)
414,142
(6.03 %)
6,230,412
(23.70 %)
49,402
(3.94 %)
206 pink pigeon (alternate hap 2023)
GCA_963082445.1
n/a 10,425
(1.96 %)
20,219
(2.49 %)
n/a 42.52
(100.00 %)
n/a 1,277
(100.00 %)
344,711
(4.99 %)
225,902
(3.41 %)
4,563,425
(21.61 %)
28,391
(3.74 %)
207 pink pigeon (primary hap 2023)
GCA_963082525.1
n/a 13,140
(1.85 %)
25,111
(2.31 %)
n/a 42.27
(99.99 %)
509
(0.01 %)
143
(100.00 %)
488,313
(5.48 %)
331,962
(3.50 %)
6,243,204
(22.87 %)
36,343
(3.63 %)
208 plumbeous ibis (bTheCae1 alternate hap 2021)
GCA_020745805.1
n/a 11,774
(1.90 %)
20,857
(2.20 %)
n/a 42.59
(100.00 %)
4
(0.00 %)
749
(100.00 %)
356,053
(4.37 %)
157,695
(0.93 %)
5,995,637
(19.60 %)
30,478
(4.03 %)
209 plumbeous ibis (bTheCae1 primary hap 2021)
GCA_020745775.1
n/a 13,028
(1.84 %)
22,722
(2.10 %)
n/a 42.37
(99.81 %)
104
(0.19 %)
88
(100.00 %)
488,030
(6.66 %)
188,606
(1.01 %)
6,982,793
(20.08 %)
32,920
(3.37 %)
210 Puerto Rican parrot (LU 182127 2020)
GCA_000332375.2
n/a 12,000
(1.69 %)
22,393
(2.01 %)
n/a 41.66
(74.61 %)
137,572
(25.41 %)
200,284
(74.59 %)
536,198
(8.55 %)
200,698
(0.96 %)
5,147,882
(14.30 %)
14,572
(0.41 %)
211 razorbill (2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019)
GCA_008658365.1
n/a 12,787
(1.83 %)
22,839
(2.13 %)
n/a 42.67
(99.70 %)
227
(0.30 %)
95
(100.00 %)
543,517
(7.16 %)
212,546
(1.12 %)
6,930,708
(20.10 %)
38,960
(3.02 %)
212 razorbill (alternate hap 2006_11_07_Graehlm_vinge_78 2019)
GCA_008658355.1
n/a 12,937
(1.75 %)
24,253
(2.09 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
n/a 3,309
(100.00 %)
562,549
(7.14 %)
210,852
(1.04 %)
7,264,995
(20.26 %)
40,926
(2.91 %)
213 red-backed fairy wren (Western Australia 2023)
GCF_030028575.1
29,027
(5.08 %)
12,371
(2.00 %)
24,297
(2.42 %)
n/a 41.70
(96.94 %)
3,337,637
(3.40 %)
10,634
(100.00 %)
349,349
(2.76 %)
398,866
(2.71 %)
6,299,092
(18.40 %)
27,078
(2.11 %)
214 red-crested turaco (2019)
GCA_009769465.1
n/a 12,744
(1.75 %)
25,706
(2.29 %)
n/a 42.60
(97.89 %)
344
(2.11 %)
140
(100.00 %)
551,885
(8.95 %)
176,530
(0.80 %)
6,805,042
(22.19 %)
43,051
(3.40 %)
215 red-crested turaco (alternate hap 2019)
GCA_009764505.1
n/a 11,247
(1.70 %)
23,705
(2.27 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
n/a 3,476
(100.00 %)
482,817
(8.51 %)
153,169
(0.81 %)
5,919,109
(21.87 %)
39,766
(3.41 %)
216 red-fronted tinkerbird (bPogPus1 alternate hap 2020)
GCA_015220175.1
n/a 11,434
(1.65 %)
21,710
(2.11 %)
n/a 46.12
(100.00 %)
12
(0.00 %)
2,748
(100.00 %)
859,899
(15.52 %)
319,622
(3.85 %)
5,367,970
(34.63 %)
23,381
(1.81 %)
217 red-fronted tinkerbird (bPogPus1 primary hap 2020)
GCA_015220805.1
n/a 12,345
(1.60 %)
23,206
(2.02 %)
n/a 45.96
(99.53 %)
307
(0.47 %)
253
(100.00 %)
1,082,064
(22.90 %)
378,866
(4.28 %)
6,003,548
(35.88 %)
26,519
(1.76 %)
218 red-legged partridge
GCA_019345075.1
n/a 12,441
(2.23 %)
20,933
(2.29 %)
n/a 41.44
(96.96 %)
18,534
(3.05 %)
29,132
(96.95 %)
543,702
(6.02 %)
222,583
(0.97 %)
5,978,744
(20.17 %)
19,970
(0.97 %)
219 red-legged seriema (2019)
GCA_009819825.1
n/a 13,229
(1.84 %)
25,580
(2.35 %)
n/a 42.20
(99.59 %)
194
(0.41 %)
110
(100.00 %)
483,784
(6.50 %)
160,481
(0.73 %)
6,960,060
(19.71 %)
32,899
(2.77 %)
220 red-legged seriema (alternate hap 2019)
GCA_009819485.1
n/a 10,131
(1.78 %)
19,775
(2.21 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,840
(100.00 %)
366,591
(6.01 %)
117,928
(0.90 %)
5,340,048
(18.90 %)
26,293
(2.86 %)
221 red-throated loon (BGI_N328 2014)
GCF_000690875.1
15,829
(2.14 %)
11,589
(1.46 %)
22,840
(1.76 %)
n/a 41.12
(99.40 %)
64,882
(0.61 %)
126,713
(99.39 %)
293,224
(3.50 %)
123,593
(0.80 %)
6,849,573
(18.22 %)
17,100
(0.51 %)
222 red-throated loon (hap1 2023)
GCA_030936125.1
n/a 13,357
(1.64 %)
29,603
(2.35 %)
n/a 43.54
(100.00 %)
260
(0.00 %)
3,225
(100.00 %)
549,694
(8.44 %)
246,171
(10.46 %)
5,258,356
(27.36 %)
39,810
(3.37 %)
223 red-throated loon (hap2 2023 refseq)
GCF_030936135.1
25,173
(3.02 %)
13,216
(1.71 %)
24,050
(2.10 %)
n/a 43.11
(100.00 %)
249
(0.00 %)
1,185
(100.00 %)
544,422
(8.81 %)
223,672
(5.77 %)
6,669,433
(23.63 %)
38,305
(3.37 %)
224 red-winged blackbird (BioBank_ID:100140 2023)
GCF_020745825.1
29,994
(3.93 %)
12,687
(1.75 %)
25,287
(2.30 %)
n/a 43.15
(100.00 %)
106
(0.00 %)
516
(100.00 %)
785,960
(17.62 %)
522,256
(9.27 %)
6,371,580
(25.40 %)
32,643
(2.66 %)
225 rhinoceros hornbill
GCF_000710305.1
15,595
(2.24 %)
11,495
(1.55 %)
25,766
(1.88 %)
n/a 42.65
(98.44 %)
118,543
(1.60 %)
180,800
(98.40 %)
271,331
(3.93 %)
134,645
(1.25 %)
6,383,631
(17.75 %)
24,531
(0.79 %)
226 rifleman (bAcaChl1 alternate hap 2021)
GCA_016880875.1
n/a 9,867
(1.89 %)
19,635
(2.52 %)
n/a 42.54
(100.00 %)
20
(0.00 %)
2,879
(100.00 %)
394,769
(10.00 %)
186,556
(1.91 %)
4,428,687
(19.09 %)
15,730
(1.88 %)
227 rifleman (bAcaChl1 primary hap 2021)
GCA_016904835.1
n/a 12,620
(1.92 %)
24,568
(2.61 %)
n/a 42.41
(99.61 %)
195
(0.39 %)
206
(100.00 %)
495,673
(9.14 %)
253,008
(2.04 %)
5,936,177
(19.93 %)
20,145
(1.83 %)
228 ring-necked pheasant
GCF_004143745.1
33,221
(6.38 %)
13,027
(2.35 %)
19,960
(2.74 %)
n/a 41.21
(99.22 %)
19,995
(0.78 %)
39,678
(100.00 %)
586,827
(8.20 %)
291,437
(1.68 %)
6,237,616
(20.77 %)
22,365
(2.11 %)
229 rock pigeon (Danish tumbler 2013 BGI)
GCF_000337935.1
52,369
(6.40 %)
12,577
(1.87 %)
14,272
(2.42 %)
n/a 41.48
(98.13 %)
85,176
(1.90 %)
100,099
(98.10 %)
480,221
(6.94 %)
268,561
(1.86 %)
6,408,260
(19.42 %)
29,801
(1.43 %)
230 rock pigeon (racing homer maternal 2024)
GCA_036010775.1
n/a 12,450
(1.75 %)
25,274
(2.35 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
192
(0.00 %)
673
(100.00 %)
586,422
(10.85 %)
392,341
(12.38 %)
5,521,172
(28.56 %)
33,479
(3.29 %)
231 rock pigeon (racing homer paternal W 2024)
GCA_036013475.1
n/a 13,145
(1.66 %)
28,883
(2.53 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
248
(0.00 %)
870
(100.00 %)
656,923
(11.76 %)
412,678
(12.92 %)
6,047,578
(29.90 %)
36,847
(3.12 %)
232 rock ptarmigan (bLagMut1 alternate hap 2022)
GCA_023344045.1
n/a 12,090
(2.36 %)
21,910
(2.57 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
13
(0.00 %)
3,212
(100.00 %)
585,577
(10.45 %)
202,342
(1.61 %)
5,390,780
(20.38 %)
19,210
(2.23 %)
233 rock ptarmigan (primary hap 2022 refseq)
GCF_023343835.1
51,619
(7.29 %)
12,832
(2.31 %)
23,047
(2.56 %)
n/a 41.57
(99.99 %)
210
(0.01 %)
165
(100.00 %)
526,839
(5.87 %)
268,431
(2.63 %)
5,885,345
(21.73 %)
21,346
(2.37 %)
234 ruddy duck
GCF_011077185.1
50,326
(5.76 %)
13,124
(1.98 %)
23,592
(2.23 %)
n/a 41.82
(97.27 %)
18,437
(2.73 %)
28,026
(97.27 %)
808,998
(7.97 %)
389,509
(1.34 %)
6,722,581
(21.16 %)
34,567
(3.30 %)
235 ruff
GCF_001431845.1
34,257
(4.61 %)
12,979
(1.79 %)
15,969
(2.42 %)
n/a 42.45
(96.26 %)
30,404
(3.75 %)
34,157
(96.25 %)
308,688
(1.08 %)
337,661
(3.70 %)
7,220,063
(20.45 %)
27,939
(1.42 %)
236 rufous-necked snowfinch
GCF_017590135.1
35,381
(4.92 %)
12,603
(1.95 %)
24,965
(2.42 %)
n/a 42.00
(99.80 %)
5,524
(0.20 %)
24,055
(100.00 %)
514,274
(6.32 %)
411,146
(2.77 %)
6,584,761
(19.85 %)
29,372
(2.28 %)
237 rusty-margined flycatcher (MyiCay16 2022)
GCF_022539395.1
40,473
(5.86 %)
12,903
(1.96 %)
23,477
(2.35 %)
n/a 42.26
(99.87 %)
181
(0.13 %)
1,692
(100.00 %)
439,625
(4.09 %)
338,042
(2.23 %)
6,366,832
(20.27 %)
28,572
(2.11 %)
238 saffron-crested tyrant-manakin
GCF_003984885.1
45,898
(5.06 %)
12,908
(1.86 %)
21,103
(2.48 %)
n/a 42.28
(99.01 %)
15,342
(0.99 %)
38,089
(100.00 %)
496,308
(7.14 %)
333,391
(1.97 %)
6,646,625
(20.87 %)
32,671
(2.19 %)
239 sage sparrow (canescens MVZ Bird 192114 alternate hap 2022)
GCA_021966175.1
n/a 16,893
(1.07 %)
43,426
(1.70 %)
n/a 44.67
(100.00 %)
12
(0.00 %)
43,047
(100.00 %)
1,180,596
(3.55 %)
1,932,696
(16.57 %)
6,340,063
(43.85 %)
66,996
(3.45 %)
240 sage sparrow (canescens MVZ Bird 192114 primary hap 2022)
GCA_021963965.1
n/a 12,804
(1.50 %)
25,425
(1.97 %)
n/a 43.46
(100.00 %)
200
(0.00 %)
1,339
(100.00 %)
699,755
(3.36 %)
1,030,540
(15.69 %)
5,226,748
(36.13 %)
36,539
(2.71 %)
241 Saker falcon (bFalChe1 alternate hap 2022)
GCA_023634115.1
n/a 12,258
(1.66 %)
25,579
(2.30 %)
n/a 43.39
(100.00 %)
2
(0.00 %)
4,162
(100.00 %)
506,343
(6.77 %)
182,589
(7.22 %)
5,435,776
(23.60 %)
29,420
(2.47 %)
242 Saker falcon (bFalChe1 primary hap 2022 refseq)
GCF_023634085.1
50,290
(5.75 %)
12,973
(1.67 %)
21,670
(1.90 %)
n/a 43.15
(99.70 %)
258
(0.30 %)
283
(100.00 %)
548,090
(7.21 %)
201,488
(8.55 %)
7,030,877
(24.94 %)
31,791
(2.57 %)
243 Saker falcon (BGI 2013)
GCF_000337975.1
36,497
(5.34 %)
12,572
(1.79 %)
10,629
(2.08 %)
27,857
(3.09 %)
41.71
(98.00 %)
70,035
(2.03 %)
75,898
(97.97 %)
433,484
(5.29 %)
166,251
(1.03 %)
7,121,848
(18.23 %)
19,927
(0.72 %)
244 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 alternate hap 2023)
GCA_027887135.1
n/a 12,826
(1.74 %)
26,019
(2.35 %)
n/a 43.09
(100.00 %)
n/a 3,054
(100.00 %)
482,850
(3.37 %)
523,437
(10.15 %)
6,386,315
(26.20 %)
32,734
(4.25 %)
245 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887145.1
27,528
(4.03 %)
12,832
(1.69 %)
25,514
(2.23 %)
n/a 43.50
(99.76 %)
363
(0.24 %)
282
(100.00 %)
541,958
(3.43 %)
566,692
(13.38 %)
6,205,274
(28.98 %)
35,549
(5.05 %)
246 Savannah sparrow (FMNH 499929 alternate hap 2022)
GCA_022578375.1
n/a 16,954
(1.37 %)
46,692
(2.27 %)
n/a 43.66
(99.99 %)
1,822
(0.01 %)
31,565
(99.99 %)
680,766
(3.36 %)
930,904
(8.76 %)
7,502,726
(27.96 %)
56,390
(5.99 %)
247 Savannah sparrow (primary hap 2023)
GCA_031885435.1
n/a 12,986
(1.66 %)
27,028
(2.29 %)
n/a 43.66
(99.78 %)
249
(0.22 %)
110
(100.00 %)
464,600
(3.28 %)
681,402
(9.28 %)
6,314,744
(26.92 %)
39,406
(5.26 %)
248 Savannah sparrow (FMNH 499929 primary hap 2022)
GCA_022577445.1
n/a 12,665
(1.79 %)
25,654
(2.40 %)
n/a 43.10
(100.00 %)
339
(0.00 %)
337
(100.00 %)
428,675
(3.22 %)
588,040
(7.38 %)
6,466,447
(24.39 %)
33,599
(4.75 %)
249 seaside sparrow (bAmmMar1 primary hap 2024)
GCA_036010785.1
n/a 12,858
(1.52 %)
25,777
(2.02 %)
n/a 44.04
(99.85 %)
365
(0.15 %)
501
(100.00 %)
580,376
(4.24 %)
636,266
(12.18 %)
4,804,433
(34.52 %)
48,871
(4.18 %)
250 small tree finch (2019)
GCF_901933205.1
30,090
(4.91 %)
12,645
(1.95 %)
17,146
(2.49 %)
n/a 42.38
(99.99 %)
185
(0.01 %)
1,527
(99.99 %)
457,266
(6.02 %)
477,426
(4.49 %)
6,482,932
(22.03 %)
27,271
(2.40 %)
251 small tree finch (2020)
GCA_902806625.1
n/a 12,662
(1.93 %)
23,695
(2.34 %)
25,763
(3.61 %)
42.49
(99.99 %)
224
(0.01 %)
1,951
(99.99 %)
458,154
(6.01 %)
482,974
(4.97 %)
6,466,067
(22.21 %)
27,890
(2.42 %)
252 song sparrow (gouldii PMB2087b alternate hap 2022)
GCA_022749775.1
n/a 15,672
(1.16 %)
40,690
(1.82 %)
n/a 45.19
(100.00 %)
5
(0.00 %)
34,693
(100.00 %)
1,068,703
(34.46 %)
796,004
(19.02 %)
6,315,990
(40.22 %)
57,647
(3.95 %)
253 song sparrow (primary hap 2024)
GCA_035770615.1
n/a 12,940
(1.39 %)
26,698
(1.87 %)
n/a 44.96
(99.93 %)
299
(0.07 %)
354
(100.00 %)
515,857
(3.07 %)
681,436
(15.73 %)
5,004,880
(39.23 %)
47,269
(3.90 %)
254 song sparrow (gouldii PMB2087b primary hap 2022)
GCA_022749695.1
n/a 12,580
(1.53 %)
24,737
(2.00 %)
n/a 44.45
(100.00 %)
323
(0.00 %)
501
(100.00 %)
697,818
(28.44 %)
510,301
(17.90 %)
5,319,400
(34.64 %)
36,632
(3.59 %)
255 South Island takahe (alternate 2021)
GCA_020801775.1
n/a 12,655
(1.70 %)
n/a n/a 43.63
(99.16 %)
238
(0.84 %)
178
(100.00 %)
554,912
(9.42 %)
230,808
(4.34 %)
6,406,358
(24.83 %)
22,941
(1.98 %)
256 South Island takahe (primary 2021)
GCA_020800305.1
n/a 12,942
(1.69 %)
23,221
(2.13 %)
n/a 43.74
(99.58 %)
327
(0.42 %)
174
(100.00 %)
577,553
(9.77 %)
259,017
(5.20 %)
6,430,968
(25.90 %)
23,810
(2.02 %)
257 speckled mousebird (BGI_N325 2014)
GCF_000690715.1
15,894
(2.09 %)
11,566
(1.44 %)
25,387
(1.84 %)
n/a 40.95
(99.65 %)
44,462
(0.35 %)
114,650
(99.65 %)
345,458
(6.87 %)
154,693
(1.27 %)
6,152,475
(19.42 %)
7,821
(0.23 %)
258 speckled mousebird (hap1 2023)
GCA_028858725.1
n/a 11,956
(1.78 %)
25,177
(2.60 %)
n/a 42.38
(99.48 %)
143
(0.52 %)
189
(100.00 %)
523,056
(12.47 %)
243,547
(3.72 %)
5,408,003
(23.43 %)
25,552
(2.34 %)
259 speckled mousebird (hap2 2023)
GCA_028858625.1
n/a 13,169
(1.74 %)
26,896
(2.47 %)
n/a 42.62
(99.56 %)
151
(0.44 %)
243
(100.00 %)
570,907
(11.75 %)
317,226
(6.96 %)
5,854,600
(25.51 %)
28,905
(2.31 %)
260 steelblue widowfinch (purged dups hap OUT-0048 2022)
GCA_026979555.1
n/a 2,176
(1.79 %)
7,719
(4.37 %)
n/a 49.74
(100.00 %)
n/a 1,939
(100.00 %)
136,312
(29.31 %)
157,341
(15.03 %)
648,725
(34.67 %)
15,490
(8.23 %)
261 steelblue widowfinch (merged hap OUT-0048 2022)
GCA_026979565.1
n/a 12,819
(1.94 %)
24,247
(2.44 %)
n/a 42.23
(99.98 %)
458
(0.02 %)
178
(100.00 %)
616,749
(11.96 %)
411,917
(3.56 %)
6,385,102
(20.91 %)
37,940
(2.83 %)
262 Steller's jay (frontalis alternate hap 2022)
GCA_026168045.1
n/a 12,217
(1.73 %)
25,261
(2.32 %)
n/a 44.10
(100.00 %)
200
(0.00 %)
957
(100.00 %)
423,239
(3.30 %)
362,061
(4.83 %)
4,954,262
(27.09 %)
42,188
(4.05 %)
263 Steller's jay (frontalis primary hap 2022)
GCA_026167965.1
n/a 12,789
(1.82 %)
24,509
(2.35 %)
n/a 43.18
(100.00 %)
223
(0.00 %)
352
(100.00 %)
413,598
(3.28 %)
318,919
(3.99 %)
5,977,564
(23.65 %)
33,675
(3.21 %)
264 sun parakeet (2019)
GCA_902168055.1
n/a 12,871
(1.88 %)
22,508
(2.20 %)
n/a 42.01
(96.97 %)
578,921
(3.08 %)
1,570
(100.00 %)
554,367
(10.05 %)
180,644
(0.89 %)
6,158,602
(21.14 %)
21,695
(1.62 %)
265 sunbittern
GCF_000690775.1
15,772
(2.11 %)
11,564
(1.45 %)
25,522
(1.98 %)
n/a 42.33
(99.55 %)
52,471
(0.46 %)
115,170
(99.54 %)
346,556
(5.38 %)
117,881
(0.88 %)
6,391,987
(18.82 %)
32,970
(1.31 %)
266 Suruca trogon (bTroSur1 alternate hap 2021)
GCA_020746095.1
n/a 11,628
(1.91 %)
21,635
(2.31 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
17
(0.00 %)
1,535
(100.00 %)
421,231
(6.57 %)
146,070
(1.11 %)
5,727,350
(21.91 %)
37,752
(3.68 %)
267 Suruca trogon (bRtoSur1 primary hap 2021)
GCA_020746105.1
n/a 12,884
(1.85 %)
23,805
(2.23 %)
n/a 42.80
(99.12 %)
253
(0.88 %)
182
(100.00 %)
539,771
(9.26 %)
181,564
(1.14 %)
6,538,228
(22.49 %)
41,376
(3.37 %)
268 Swainson's thrush (bCatUst1 v2 alternate hap 2020)
GCA_009819505.2
n/a 13,403
(1.85 %)
27,669
(2.52 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
13
(0.00 %)
3,601
(100.00 %)
704,976
(13.16 %)
649,859
(4.89 %)
6,740,713
(22.65 %)
49,076
(3.54 %)
269 Swainson's thrush (bCatUst1 v2 primary hap 2020)
GCF_009819885.2
40,121
(5.41 %)
13,004
(1.87 %)
24,795
(2.41 %)
n/a 42.48
(98.86 %)
429
(1.14 %)
160
(100.00 %)
493,071
(5.80 %)
589,858
(4.32 %)
6,708,638
(22.44 %)
49,404
(3.53 %)
270 swamp sparrow (bMelGeo1 alternate hap 2023)
GCA_028019105.1
n/a 12,160
(1.83 %)
24,622
(2.46 %)
n/a 43.37
(100.00 %)
n/a 862
(100.00 %)
383,634
(3.06 %)
527,550
(8.40 %)
5,916,654
(24.97 %)
31,261
(3.21 %)
271 swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018845.1
29,544
(4.27 %)
12,375
(1.75 %)
24,577
(2.31 %)
n/a 43.08
(99.89 %)
236
(0.11 %)
40
(100.00 %)
419,473
(3.09 %)
439,909
(7.61 %)
6,077,743
(24.47 %)
32,064
(3.27 %)
272 swan goose (Sichuan white goose 2017)
GCF_002166845.1
62,728
(8.50 %)
12,903
(1.98 %)
21,943
(2.24 %)
n/a 41.68
(97.40 %)
63,061
(2.62 %)
64,863
(97.38 %)
590,350
(4.68 %)
253,525
(1.38 %)
6,926,961
(19.71 %)
40,011
(3.69 %)
273 swan goose (Tianfu 2020)
GCA_013030995.1
n/a 12,965
(1.97 %)
25,182
(2.35 %)
n/a 42.15
(99.99 %)
716
(0.01 %)
2,119
(100.00 %)
650,271
(7.44 %)
270,668
(1.26 %)
6,776,820
(21.19 %)
35,560
(4.27 %)
274 swan goose (Zhedong 2015)
GCF_000971095.1
43,215
(5.89 %)
12,148
(1.89 %)
19,386
(2.07 %)
29,870
(3.24 %)
41.36
(96.87 %)
84,351
(3.16 %)
91,944
(96.84 %)
481,707
(5.57 %)
230,143
(1.26 %)
6,665,312
(19.42 %)
38,930
(2.06 %)
275 tawny frogmouth (bPodStr1 alternate hap 2023)
GCA_028020675.1
n/a 11,432
(1.95 %)
20,528
(2.37 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
1
(0.00 %)
911
(100.00 %)
470,125
(9.51 %)
140,846
(3.57 %)
5,002,695
(22.08 %)
22,424
(2.33 %)
276 tawny frogmouth (bPodStr1 primary hap 2023)
GCA_028020825.1
n/a 13,321
(1.76 %)
24,102
(2.15 %)
n/a 42.35
(99.83 %)
203
(0.17 %)
1,038
(100.00 %)
593,409
(10.51 %)
202,463
(9.29 %)
6,160,173
(27.65 %)
25,785
(2.35 %)
277 tawny owl (hap1 2023)
GCA_031877795.1
n/a 13,204
(1.60 %)
23,981
(1.99 %)
n/a 42.70
(99.70 %)
281
(0.30 %)
212
(99.85 %)
443,228
(4.74 %)
272,738
(10.86 %)
5,812,837
(27.42 %)
30,602
(2.52 %)
278 tawny owl (hap2 2023)
GCA_031877785.1
n/a 12,367
(1.72 %)
21,445
(2.03 %)
n/a 42.53
(99.88 %)
206
(0.12 %)
184
(100.00 %)
392,959
(4.59 %)
235,300
(7.72 %)
6,437,772
(24.82 %)
27,952
(2.71 %)
279 Tibetan ground-tit
GCF_000331425.1
28,736
(4.57 %)
12,828
(2.02 %)
17,743
(2.65 %)
n/a 41.69
(98.76 %)
21,646
(1.24 %)
27,052
(98.76 %)
443,797
(5.51 %)
346,281
(2.29 %)
6,423,932
(19.90 %)
27,086
(2.31 %)
280 tourmaline sunangel (hap1 2024)
GCA_036169615.1
n/a 12,509
(1.97 %)
21,020
(2.33 %)
n/a 41.63
(99.99 %)
437
(0.01 %)
131
(100.00 %)
532,267
(5.46 %)
332,284
(2.69 %)
6,084,978
(21.20 %)
19,080
(1.72 %)
281 tourmaline sunangel (hap2 2024)
GCA_036172335.1
n/a 11,697
(2.00 %)
19,544
(2.34 %)
n/a 41.82
(99.99 %)
370
(0.01 %)
200
(100.00 %)
480,724
(5.14 %)
292,213
(3.66 %)
5,608,823
(21.79 %)
17,191
(1.69 %)
282 tricolored blackbird (1412-34295 alternate hap 2022)
GCA_023055385.1
n/a 12,203
(1.76 %)
25,216
(2.40 %)
n/a 43.65
(100.00 %)
97
(0.00 %)
450
(100.00 %)
430,792
(3.25 %)
542,908
(5.67 %)
5,289,916
(24.99 %)
36,805
(3.52 %)
283 tricolored blackbird (1412-34295 primary hap 2022)
GCA_023055355.1
n/a 12,867
(1.81 %)
26,393
(2.48 %)
n/a 42.85
(100.00 %)
97
(0.00 %)
311
(100.00 %)
429,011
(3.16 %)
564,849
(5.52 %)
6,336,716
(23.32 %)
33,378
(2.70 %)
284 tufted duck (alternate hap 2019)
GCA_009819845.1
n/a 12,117
(2.03 %)
21,464
(2.36 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
1
(0.00 %)
780
(100.00 %)
732,317
(7.82 %)
353,660
(1.57 %)
6,119,549
(21.70 %)
27,920
(2.56 %)
285 tufted duck (2019)
GCF_009819795.1
29,492
(4.02 %)
12,972
(1.98 %)
22,757
(2.27 %)
n/a 41.66
(99.16 %)
163
(0.84 %)
105
(100.00 %)
826,451
(8.47 %)
411,356
(1.71 %)
6,691,445
(22.36 %)
29,882
(2.41 %)
286 turkey (Aviagen NT-WF06-2002-E0010 2014)
GCF_000146605.3
38,427
(6.01 %)
13,095
(1.96 %)
23,974
(2.27 %)
30,549
(3.14 %)
41.35
(96.83 %)
65,045
(3.16 %)
250,220
(96.84 %)
609,750
(9.03 %)
243,534
(1.26 %)
6,043,889
(21.06 %)
31,818
(1.42 %)
287 turkey (WU_HG_1 2021)
GCA_905368555.1
n/a 12,910
(2.37 %)
23,038
(2.58 %)
53,269
(6.57 %)
41.12
(100.00 %)
81
(0.00 %)
151
(100.00 %)
618,023
(8.91 %)
227,783
(1.43 %)
6,123,721
(21.03 %)
20,379
(2.19 %)
288 village indigobird (OUT-0048 2022)
GCF_026979565.1
44,961
(5.49 %)
12,817
(1.94 %)
24,245
(2.44 %)
n/a 42.23
(99.98 %)
458
(0.02 %)
177
(100.00 %)
616,746
(11.96 %)
411,917
(3.57 %)
6,385,057
(20.91 %)
37,940
(2.83 %)
289 Virginia rail (171378401 alternate hap 2022)
GCA_022605895.1
n/a 12,732
(1.51 %)
23,395
(1.91 %)
n/a 44.28
(99.99 %)
668
(0.00 %)
4,450
(100.00 %)
526,500
(5.75 %)
269,598
(14.29 %)
4,825,913
(32.19 %)
27,465
(2.18 %)
290 Virginia rail (171378401 primary hap 2022)
GCA_022605955.1
n/a 12,760
(1.53 %)
23,262
(2.16 %)
n/a 44.16
(100.00 %)
197
(0.00 %)
1,299
(100.00 %)
497,104
(5.09 %)
271,530
(15.72 %)
5,291,065
(32.37 %)
24,669
(1.78 %)
291 western capercaillie (alternate hap 2023)
GCA_951394355.1
n/a 11,226
(2.33 %)
20,526
(2.54 %)
n/a 41.53
(100.00 %)
n/a 5,463
(100.00 %)
436,894
(5.48 %)
209,008
(1.73 %)
4,790,071
(20.27 %)
17,864
(2.58 %)
292 western capercaillie (primary hap 2023)
GCA_951394365.1
n/a 12,775
(2.33 %)
22,516
(2.50 %)
n/a 41.49
(99.98 %)
973
(0.02 %)
318
(100.00 %)
518,194
(5.54 %)
276,294
(2.21 %)
5,866,033
(21.12 %)
21,287
(2.50 %)
293 western scrub-jay (CA MVZ Bird 193978 2023)
GCA_028536645.1
n/a 12,480
(1.72 %)
22,915
(2.17 %)
n/a 44.29
(100.00 %)
168
(0.00 %)
1,631
(100.00 %)
394,733
(2.99 %)
364,498
(6.04 %)
4,803,453
(27.52 %)
42,022
(4.90 %)
294 western scrub-jay (CA MVZ Bird 193978 2023)
GCA_028536675.1
n/a 13,128
(1.62 %)
25,648
(2.11 %)
n/a 44.58
(100.00 %)
272
(0.00 %)
1,393
(100.00 %)
449,314
(3.08 %)
505,129
(6.52 %)
4,634,925
(31.99 %)
51,884
(4.81 %)
295 whiskered treeswift (bHemCom1 alternate hap 2021)
GCA_020745695.1
n/a 11,632
(1.83 %)
20,659
(2.18 %)
n/a 42.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,405
(100.00 %)
553,633
(11.80 %)
147,999
(0.81 %)
5,825,472
(20.55 %)
20,481
(1.61 %)
296 whiskered treeswift (bHemCor1 primary hap 2021)
GCA_020745705.1
n/a 12,681
(1.84 %)
21,784
(2.14 %)
n/a 42.12
(99.13 %)
218
(0.87 %)
146
(100.00 %)
520,200
(9.32 %)
170,778
(0.83 %)
6,455,910
(21.44 %)
24,061
(1.62 %)
297 white wagtail
GCF_015832195.1
47,145
(6.80 %)
12,127
(1.86 %)
22,301
(2.31 %)
n/a 42.72
(99.92 %)
906
(0.08 %)
619
(100.00 %)
479,546
(6.15 %)
349,751
(5.62 %)
6,384,256
(22.41 %)
28,008
(2.68 %)
298 white-collared manakin (Guabito, Panama 608988 2022)
GCF_025592945.1
53,731
(6.26 %)
12,981
(1.91 %)
23,916
(2.40 %)
n/a 42.43
(100.00 %)
n/a 643
(100.00 %)
417,020
(3.98 %)
366,209
(3.55 %)
5,992,950
(21.48 %)
28,964
(2.22 %)
299 white-crowned manakin (hap1 2024)
GCA_036250125.1
n/a 12,807
(1.82 %)
25,568
(2.46 %)
n/a 42.66
(99.99 %)
323
(0.01 %)
697
(100.00 %)
429,646
(4.10 %)
293,431
(3.59 %)
6,059,494
(21.89 %)
29,574
(2.42 %)
300 white-crowned manakin (hap2 2024)
GCA_036250135.1
n/a 12,135
(1.94 %)
21,591
(2.38 %)
n/a 42.49
(99.99 %)
307
(0.01 %)
595
(100.00 %)
375,468
(3.93 %)
263,979
(3.93 %)
5,786,346
(21.36 %)
25,275
(2.50 %)
301 white-ruffed manakin
GCF_003945725.1
45,894
(5.34 %)
12,730
(1.91 %)
19,044
(2.50 %)
n/a 41.81
(99.24 %)
13,527
(0.76 %)
9,068
(100.00 %)
489,252
(7.14 %)
246,346
(1.38 %)
6,500,956
(19.79 %)
25,941
(1.84 %)
302 white-rumped snowfinch
GCF_017590055.1
34,717
(4.88 %)
12,599
(1.97 %)
24,083
(2.44 %)
n/a 42.03
(99.81 %)
4,869
(0.19 %)
11,576
(100.00 %)
502,151
(6.20 %)
449,641
(3.22 %)
6,554,257
(20.25 %)
28,891
(2.32 %)
303 white-tailed eagle (BGI_N329 2014)
GCF_000691405.1
20,744
(2.82 %)
11,490
(1.49 %)
22,258
(1.77 %)
n/a 40.90
(99.56 %)
60,579
(0.45 %)
111,484
(99.55 %)
325,669
(3.74 %)
116,707
(0.60 %)
6,725,133
(18.14 %)
11,615
(0.32 %)
304 white-tailed eagle (bHalAlb1.1 2022)
GCA_947461875.1
n/a 13,735
(1.76 %)
28,993
(2.53 %)
n/a 43.15
(99.99 %)
424
(0.01 %)
188
(100.00 %)
585,276
(12.89 %)
291,289
(6.10 %)
6,474,027
(23.66 %)
54,851
(4.05 %)
305 white-tailed eagle (bHalAlb1.1 alternate hap 2022)
GCA_947461935.1
n/a 7,755
(1.71 %)
16,331
(2.39 %)
n/a 43.66
(100.00 %)
n/a 4,971
(100.00 %)
304,566
(13.21 %)
116,307
(6.64 %)
3,407,853
(22.91 %)
34,573
(4.56 %)
306 white-tailed ptarmigan
GCF_019238085.1
39,072
(5.37 %)
12,919
(2.36 %)
23,624
(2.48 %)
n/a 41.37
(97.63 %)
10,501
(2.38 %)
7,343
(100.00 %)
587,593
(8.19 %)
231,665
(1.12 %)
6,007,601
(20.08 %)
21,298
(2.05 %)
307 white-tailed tropicbird
GCF_000687285.1
16,342
(2.18 %)
12,040
(1.50 %)
26,704
(1.97 %)
n/a 41.51
(99.50 %)
65,286
(0.51 %)
132,071
(99.49 %)
353,892
(5.61 %)
125,195
(0.74 %)
6,873,137
(19.59 %)
41,005
(1.45 %)
308 white-throated dipper (primary hap 2023)
GCA_963662255.1
n/a 12,856
(1.79 %)
23,827
(2.25 %)
n/a 42.82
(99.99 %)
658
(0.01 %)
278
(100.00 %)
431,536
(3.38 %)
345,533
(10.59 %)
5,840,462
(26.59 %)
29,711
(3.56 %)
309 white-throated sparrow
GCF_000385455.1
31,167
(5.71 %)
11,241
(1.81 %)
13,429
(2.26 %)
n/a 41.52
(95.61 %)
41,460
(4.40 %)
37,661
(95.60 %)
439,216
(5.96 %)
364,202
(2.52 %)
6,300,584
(19.09 %)
15,091
(0.85 %)
310 white-throated tinamou
GCF_000705375.1
18,997
(2.72 %)
12,287
(1.75 %)
20,132
(2.48 %)
n/a 41.41
(97.88 %)
59,853
(2.12 %)
142,367
(97.88 %)
366,311
(3.62 %)
226,347
(1.35 %)
6,300,683
(18.94 %)
47,608
(2.60 %)
311 whooping crane (maternal hap 2023 refseq)
GCF_028858705.1
55,408
(5.57 %)
13,574
(1.81 %)
24,739
(2.19 %)
n/a 43.07
(99.63 %)
262
(0.37 %)
930
(100.00 %)
616,300
(10.57 %)
211,558
(2.90 %)
6,785,192
(22.11 %)
42,795
(4.66 %)
312 whooping crane (paternal hap 2023)
GCA_028858595.1
n/a 13,284
(1.87 %)
23,528
(2.20 %)
n/a 42.47
(99.50 %)
586
(0.50 %)
395
(100.00 %)
569,940
(8.69 %)
162,569
(0.98 %)
7,021,319
(20.20 %)
38,582
(3.77 %)
313 willow flycatcher
GCF_003031625.1
37,909
(4.43 %)
12,708
(1.90 %)
19,591
(2.57 %)
n/a 42.01
(95.33 %)
39,319
(4.68 %)
7,791
(100.00 %)
550,172
(7.15 %)
242,394
(1.27 %)
6,421,292
(18.87 %)
27,080
(1.82 %)
314 wire-tailed manakin (2020)
GCF_003945595.2
42,551
(5.86 %)
12,535
(1.90 %)
23,300
(2.38 %)
n/a 42.06
(99.73 %)
758
(0.26 %)
1,768
(100.00 %)
480,705
(7.12 %)
240,463
(1.87 %)
6,316,566
(20.20 %)
25,317
(2.02 %)
315 wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 alternate hap 2023)
GCA_029207785.1
n/a 13,053
(1.78 %)
24,963
(2.30 %)
n/a 43.93
(100.00 %)
342
(0.00 %)
1,350
(100.00 %)
444,809
(3.08 %)
473,154
(7.96 %)
5,336,472
(25.82 %)
37,198
(3.14 %)
316 wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 primary hap 2023)
GCA_029207755.1
n/a 13,052
(1.78 %)
24,950
(2.30 %)
n/a 43.93
(100.00 %)
353
(0.00 %)
1,695
(100.00 %)
444,866
(3.08 %)
473,471
(7.97 %)
5,336,498
(25.82 %)
37,210
(3.14 %)
317 yellow warbler (LACM:Birds122168 alternate hap 2022)
GCA_024372515.1
n/a 12,426
(1.63 %)
27,565
(2.37 %)
n/a 43.59
(100.00 %)
246
(0.00 %)
776
(100.00 %)
447,274
(3.06 %)
612,008
(10.28 %)
5,606,168
(28.79 %)
39,449
(2.66 %)
318 yellow warbler (LACM:Birds122168 primary hap 2022)
GCA_024362935.1
n/a 12,556
(1.69 %)
26,545
(2.35 %)
n/a 43.09
(100.00 %)
284
(0.00 %)
971
(100.00 %)
440,673
(3.12 %)
581,112
(9.17 %)
6,158,372
(26.15 %)
35,577
(2.57 %)
319 yellow-throated sandgrouse (2019)
GCA_009769525.1
n/a 12,697
(1.89 %)
25,289
(2.53 %)
n/a 42.40
(99.62 %)
242
(0.38 %)
89
(100.00 %)
510,633
(7.10 %)
213,742
(1.12 %)
6,627,716
(21.17 %)
28,848
(2.23 %)
320 yellow-throated sandgrouse (alternate hap 2019)
GCA_009769505.1
n/a 11,788
(1.85 %)
23,306
(2.45 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
n/a 1,958
(100.00 %)
467,960
(6.96 %)
182,645
(0.99 %)
6,050,545
(20.78 %)
26,357
(2.20 %)
321 zebra finch (Black17 v1.4 alternate hap 2021)
GCA_003957525.2
n/a 11,213
(2.01 %)
21,533
(2.54 %)
n/a 41.92
(100.00 %)
10
(0.00 %)
1,646
(100.00 %)
470,860
(9.54 %)
387,943
(3.32 %)
5,428,128
(20.68 %)
23,838
(2.47 %)
322 zebra finch (Blue55 v1.4 primary hap 2021)
GCF_003957565.2
49,311
(7.41 %)
12,747
(1.97 %)
24,009
(2.47 %)
n/a 41.86
(99.66 %)
352
(0.34 %)
199
(100.00 %)
544,577
(9.57 %)
458,903
(3.33 %)
6,338,748
(20.92 %)
29,202
(2.47 %)
323 zebra finch (Blue55 2020)
GCA_009859065.2
n/a 12,796
(1.92 %)
24,658
(2.44 %)
n/a 41.91
(98.03 %)
789
(1.97 %)
541
(100.00 %)
554,338
(9.67 %)
339,851
(2.27 %)
6,613,146
(20.04 %)
28,678
(2.32 %)
324 zebra finch (alternate hap Black17 2018)
GCA_003957525.1
n/a 11,340
(1.85 %)
22,921
(2.37 %)
n/a 41.73
(99.98 %)
45
(0.01 %)
5,381
(99.99 %)
480,647
(8.44 %)
365,668
(2.89 %)
5,859,698
(20.27 %)
24,649
(2.35 %)
325 zebra finch (alternate hap Blue55 v1 2020)
GCA_009859025.1
n/a 10,734
(1.84 %)
19,978
(2.21 %)
n/a 41.07
(99.99 %)
16
(0.01 %)
4,677
(100.00 %)
436,071
(7.44 %)
217,580
(1.43 %)
5,800,691
(19.24 %)
19,512
(1.90 %)
326 zebra finch (Blue55 maternal v3 2020)
GCA_008822115.3
n/a 11,950
(2.00 %)
22,828
(2.51 %)
n/a 42.06
(98.45 %)
583
(1.55 %)
206
(100.00 %)
494,110
(9.54 %)
347,933
(2.80 %)
5,875,448
(20.29 %)
27,387
(2.57 %)
327 zebra finch (Blue55 paternal 2019)
GCA_008822125.1
n/a 12,384
(1.97 %)
23,021
(2.44 %)
n/a 41.74
(98.02 %)
828
(1.98 %)
202
(100.00 %)
511,324
(8.38 %)
351,624
(2.53 %)
6,328,918
(19.99 %)
25,871
(2.29 %)
328 zebra finch (Blue55 paternal W 2020)
GCF_008822105.2
50,407
(7.20 %)
12,470
(1.95 %)
23,352
(2.42 %)
n/a 41.81
(97.98 %)
857
(2.02 %)
205
(100.00 %)
529,829
(9.55 %)
357,586
(2.56 %)
6,359,599
(20.12 %)
27,755
(2.36 %)
TOTALS:total assembly count 328

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 212 assemblies assembly stats track stats
Mammals 513 assemblies assembly stats track stats
Birds 328 assemblies assembly stats track stats
Fishes 358 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 201 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 648 assemblies assembly stats track stats
Plants 253 assemblies assembly stats track stats
Fungi 612 assemblies assembly stats track stats
Viruses 265 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 75 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 437 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 798 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats