Legacy Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of legacy only.

See also: hub access, assembly statistics


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The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 aardvark (BS58 2019 Broad)
GCA_004365145.1		 n/a 22,095
(0.63 %)		 44,942
(0.68 %)		 n/a 40.25
(99.86 %)		 15,429
(0.03 %)		 2,690,873
(99.97 %)		 8,755,250
(34.47 %)		 869,360
(1.26 %)		 22,002,517
(59.65 %)		 39,239
(0.49 %)
2 Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 genbank)
GCA_027172205.1		 57,514
(54.61 %)		 14,340
(1.37 %)		 20,053
(2.31 %)		 n/a 43.81
(100.00 %)		 30
(0.00 %)		 27
(100.00 %)		 832,937
(4.17 %)		 474,203
(4.04 %)		 7,020,288
(38.29 %)		 94,745
(2.70 %)
3 African clawed frog (2016)
GCF_001663975.1		 61,172
(3.82 %)		 23,424
(1.78 %)		 27,990
(2.23 %)		 n/a 38.98
(88.63 %)		 216,028
(11.39 %)		 324,061
(88.61 %)		 1,726,079
(12.81 %)		 680,428
(2.28 %)		 13,887,586
(35.94 %)		 85,680
(0.94 %)
4 African grass rat (paternal X 2020)
GCA_011762505.1		 45,963
(36.56 %)		 20,933
(2.00 %)		 19,613
(1.43 %)		 37,929
(2.32 %)		 41.39
(99.19 %)		 1,624
(0.81 %)		 1,596
(100.00 %)		 4,940,083
(37.33 %)		 1,674,970
(5.40 %)		 13,613,540
(32.71 %)		 17,767
(0.51 %)
5 African savanna elephant (2009 genbank)
GCA_000001905.1		 46,043
(34.84 %)		 19,181
(1.25 %)		 19,665
(1.10 %)		 n/a 40.76
(97.57 %)		 93,514
(2.45 %)		 95,866
(97.55 %)		 6,337,637
(57.82 %)		 365,796
(0.88 %)		 16,073,052
(44.89 %)		 33,513
(0.68 %)
6 alkali bee (v1.2 Touchet_males 2018)
GCF_003710045.1		 27,736
(10.71 %)		 4,020
(1.34 %)		 42,185
(10.12 %)		 n/a 40.41
(94.37 %)		 14,031
(5.59 %)		 95,883
(100.00 %)		 112,828
(2.21 %)		 95,886
(3.63 %)		 2,006,114
(27.47 %)		 23,832
(3.81 %)
7 alpaca (2015 BGI)
GCA_000767525.1		 n/a 18,513
(1.97 %)		 19,112
(1.70 %)		 31,905
(1.94 %)		 41.46
(99.38 %)		 23,458
(0.62 %)		 75,733
(99.38 %)		 3,095,742
(36.41 %)		 314,508
(1.07 %)		 12,365,152
(25.46 %)		 53,956
(1.50 %)
8 alpaca (v3.1 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U)
GCF_000164845.3		 55,014
(3.56 %)		 18,437
(1.94 %)		 18,446
(1.63 %)		 n/a 41.40
(95.85 %)		 166,280
(4.17 %)		 77,390
(100.00 %)		 3,150,224
(36.21 %)		 315,108
(1.36 %)		 12,461,739
(24.88 %)		 54,502
(1.38 %)
9 Alpine marmot (2015)
GCF_001458135.1		 35,350
(2.23 %)		 20,139
(1.58 %)		 18,286
(1.41 %)		 n/a 39.80
(96.07 %)		 89,362
(3.94 %)		 14,543
(100.00 %)		 n/a 747,129
(1.83 %)		 14,077,162
(30.27 %)		 30,224
(0.63 %)
10 American alligator (scaffold assembly 2023 genbank)
GCA_030867065.1		 n/a 14,487
(0.97 %)		 20,444
(1.61 %)		 n/a 45.04
(99.81 %)		 136
(0.19 %)		 806
(99.81 %)		 3,380,365
(43.12 %)		 560,127
(2.00 %)		 12,524,244
(32.47 %)		 50,852
(2.67 %)
11 American alligator (chrom assembly 2023 genbank)
GCA_030867095.1		 60,799
(51.66 %)		 14,382
(0.98 %)		 18,601
(1.45 %)		 n/a 45.01
(99.30 %)		 161
(0.70 %)		 194
(100.00 %)		 3,322,619
(43.19 %)		 478,206
(1.77 %)		 12,316,391
(32.01 %)		 49,792
(2.45 %)
12 American beaver (US014 2019 Broad)
GCA_004027675.1		 n/a 22,515
(1.25 %)		 34,527
(1.17 %)		 n/a 39.58
(99.92 %)		 5,769
(0.02 %)		 837,916
(99.98 %)		 5,101,904
(34.46 %)		 552,100
(1.02 %)		 15,150,706
(34.57 %)		 24,558
(0.63 %)
13 American bison (2014 genbank)
GCA_000754665.1		 38,686
(33.79 %)		 20,215
(1.44 %)		 20,845
(1.20 %)		 n/a 41.99
(93.39 %)		 341,984
(6.63 %)		 792,165
(93.37 %)		 6,006,931
(47.67 %)		 495,106
(1.11 %)		 13,902,115
(39.01 %)		 90,767
(1.29 %)
14 American pika 3.0 (2012 Broad genbank)
GCA_000292845.1		 26,240
(36.96 %)		 17,569
(1.60 %)		 20,092
(1.69 %)		 n/a 43.35
(87.20 %)		 122,542
(12.82 %)		 132,961
(87.18 %)		 2,829,934
(29.80 %)		 414,895
(1.07 %)		 10,968,663
(26.71 %)		 44,651
(1.14 %)
15 amphioxus (hap2 2024 genbank)
GCA_035083965.1		 n/a 5,217
(0.97 %)		 41,736
(12.73 %)		 n/a 41.61
(100.00 %)		 103
(0.00 %)		 34
(100.00 %)		 128,505
(1.65 %)		 182,123
(8.03 %)		 2,157,899
(27.45 %)		 44,261
(5.21 %)
16 amphipods H.azteca (HAZT.00-mixed v2.0 2016)
GCF_000764305.1		 24,008
(8.48 %)		 3,331
(0.47 %)		 38,201
(8.97 %)		 24,453
(8.50 %)		 38.47
(99.52 %)		 23,726
(0.48 %)		 23,426
(99.52 %)		 161,274
(1.72 %)		 432,436
(8.89 %)		 3,517,080
(28.92 %)		 50,987
(4.44 %)
17 Amur tiger (TaeGuk 2013 genbank)
GCA_000464555.1		 33,668
(37.51 %)		 18,213
(1.58 %)		 15,093
(1.29 %)		 n/a 41.40
(97.59 %)		 155,553
(2.44 %)		 157,031
(97.56 %)		 4,832,679
(42.49 %)		 831,134
(1.67 %)		 13,654,373
(31.78 %)		 65,229
(1.60 %)
18 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 genbank)
GCA_003957555.2		 n/a 12,258
(1.95 %)		 20,580
(2.26 %)		 n/a 41.49
(98.48 %)		 429
(1.52 %)		 160
(100.00 %)		 535,315
(7.95 %)		 262,056
(1.51 %)		 6,092,351
(20.84 %)		 17,130
(1.48 %)
19 ant C.costatus (v1 MS0001 2016)
GCF_001594065.1		 16,082
(8.44 %)		 4,038
(1.42 %)		 32,856
(9.80 %)		 n/a 34.73
(95.75 %)		 10,626
(4.26 %)		 26,005
(95.74 %)		 203,498
(3.41 %)		 100,483
(2.15 %)		 2,221,362
(35.19 %)		 18,108
(3.49 %)
20 ant N.fulva (TAMU-Nful-2015 v1.0 2019)
GCF_005281655.1		 28,261
(10.34 %)		 4,915
(1.27 %)		 40,257
(10.17 %)		 n/a 35.18
(99.51 %)		 1,076
(0.49 %)		 2,869
(100.00 %)		 322,753
(4.92 %)		 245,412
(6.65 %)		 1,952,946
(43.11 %)		 17,048
(6.08 %)
21 ant T.cornetzi (Tcor2-1 v1.0 2016 BGI)
GCF_001594075.1		 22,023
(8.25 %)		 4,211
(1.25 %)		 37,113
(9.30 %)		 n/a 35.01
(91.82 %)		 40,822
(8.21 %)		 60,583
(91.79 %)		 218,162
(3.24 %)		 139,385
(2.26 %)		 2,347,922
(34.62 %)		 23,814
(3.66 %)
22 apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 genbank)
GCA_002114115.1		 n/a 22,542
(3.52 %)		 67,060
(16.20 %)		 n/a 38.04
(88.95 %)		 7,175
(11.05 %)		 806
(100.00 %)		 692,611
(50.80 %)		 322,540
(4.42 %)		 3,033,193
(35.58 %)		 25,871
(1.75 %)
23 Arabian camel (2014 genbank)
GCA_000767585.1		 n/a 18,452
(1.96 %)		 16,975
(1.61 %)		 n/a 41.29
(98.88 %)		 72,775
(1.13 %)		 105,347
(98.87 %)		 3,079,920
(34.79 %)		 319,928
(0.96 %)		 12,281,845
(25.28 %)		 48,638
(1.17 %)
24 Arctic fox (US066 2019 Broad)
GCA_004023825.1		 n/a 22,910
(1.42 %)		 31,985
(1.20 %)		 35,342
(1.47 %)		 41.93
(99.87 %)		 9,604
(0.04 %)		 1,272,949
(99.96 %)		 6,096,013
(44.89 %)		 1,265,350
(2.67 %)		 14,617,986
(39.29 %)		 64,716
(1.93 %)
25 Asian corn borer (v1 ACB-3 2019)
GCF_004193835.1		 25,279
(7.94 %)		 4,931
(1.05 %)		 28,608
(7.16 %)		 n/a 37.50
(100.00 %)		 34,722
(0.01 %)		 7,722
(100.00 %)		 146,974
(1.35 %)		 89,987
(2.68 %)		 2,666,250
(38.74 %)		 39,696
(5.22 %)
26 Asian corn borer (v2 ACB-3 2019)
GCF_004193835.2		 25,169
(7.95 %)		 4,867
(1.05 %)		 28,255
(7.08 %)		 n/a 37.49
(100.00 %)		 34,702
(0.01 %)		 6,269
(100.00 %)		 150,783
(1.53 %)		 89,885
(2.69 %)		 2,627,296
(38.56 %)		 39,511
(5.22 %)
27 Asiatic tapir (BS100 BIUU 2019)
GCA_004024905.1		 n/a 20,854
(1.73 %)		 28,046
(1.39 %)		 n/a 40.91
(99.96 %)		 4,333
(0.02 %)		 284,468
(99.98 %)		 3,802,671
(39.88 %)		 335,521
(0.73 %)		 15,053,564
(30.25 %)		 39,691
(1.17 %)
28 ascomycetes A.fischeri (v3 NRRL 181 2006)
GCF_000149645.2		 10,390
(48.16 %)		 1,538
(3.76 %)		 6,155
(25.19 %)		 n/a 49.56
(99.97 %)		 90
(0.03 %)		 466
(99.97 %)		 5,026
(0.77 %)		 2,256
(0.38 %)		 68,790
(5.94 %)		 2,846
(42.44 %)
29 ascomycetes A.niger CBS 513.88 (v3 2007)
GCF_000002855.3		 10,608
(51.05 %)		 1,481
(3.36 %)		 5,692
(22.11 %)		 n/a 50.35
(99.87 %)		 662
(0.13 %)		 469
(99.87 %)		 9,986
(1.32 %)		 2,619
(0.36 %)		 106,480
(7.71 %)		 5,568
(53.86 %)
30 ascomycetes A.rabiei (Mel4 2019)
GCF_004011695.1		 11,257
(41.02 %)		 1,596
(2.91 %)		 8,283
(26.43 %)		 n/a 49.20
(100.00 %)		 n/a 34
(100.00 %)		 14,775
(2.01 %)		 16,031
(2.34 %)		 103,256
(17.19 %)		 805
(44.28 %)
31 ascomycetes B.dermatitidis (ER-3 2009 genbank)
GCA_000003525.2		 n/a 1,516
(1.76 %)		 5,714
(11.07 %)		 n/a 37.07
(99.50 %)		 566
(0.51 %)		 593
(99.49 %)		 38,696
(2.74 %)		 27,571
(2.05 %)		 270,617
(48.64 %)		 8,002
(10.69 %)
32 ascomycetes S.macrospora (v2 k-hell 2012)
GCF_000182805.2		 9,903
(39.44 %)		 1,311
(2.58 %)		 4,612
(17.66 %)		 n/a 52.11
(99.64 %)		 978
(0.36 %)		 1,583
(100.00 %)		 16,540
(1.85 %)		 7,316
(0.76 %)		 171,684
(11.10 %)		 1,770
(49.40 %)
33 ascomycetes S.schenckii (1099-18 2015 genbank)
GCA_000961545.1		 10,279
(51.22 %)		 1,134
(2.55 %)		 2,026
(10.60 %)		 n/a 54.96
(100.00 %)		 57
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 15,846
(2.28 %)		 8,000
(0.94 %)		 169,678
(13.75 %)		 22
(99.61 %)
34 ass (Maral har 2015 genbank)
GCA_001305755.1		 48,976
(40.12 %)		 18,884
(1.76 %)		 19,296
(1.44 %)		 n/a 41.28
(98.63 %)		 69,593
(1.38 %)		 2,166
(100.00 %)		 3,855,699
(41.69 %)		 289,735
(0.96 %)		 14,695,257
(28.58 %)		 40,025
(1.06 %)
35 Atlantic halibut (2019 genbank)
GCA_009819705.1		 52,117
(66.34 %)		 14,960
(3.20 %)		 45,365
(7.48 %)		 69,625
(10.94 %)		 42.21
(99.43 %)		 290
(0.57 %)		 57
(100.00 %)		 428,421
(4.16 %)		 256,153
(3.73 %)		 3,725,979
(24.13 %)		 31,325
(2.25 %)
36 Atlantic herring (v1)
GCF_900700415.1		 46,216
(9.88 %)		 15,249
(2.65 %)		 25,664
(6.68 %)		 n/a 44.24
(99.88 %)		 1,963
(0.12 %)		 1,990
(99.88 %)		 1,175,759
(12.03 %)		 1,231,613
(13.39 %)		 3,511,276
(32.20 %)		 33,465
(1.97 %)
37 Atlantic salmon (genbank 2021)
GCA_905237065.2		 n/a 28,077
(1.40 %)		 120,383
(3.99 %)		 183,727
(7.26 %)		 43.42
(100.00 %)		 211
(0.00 %)		 4,222
(100.00 %)		 4,501,521
(48.00 %)		 2,247,891
(25.01 %)		 10,731,814
(59.31 %)		 77,089
(1.86 %)
38 Atlantic stingray (hap1 2023 genbank)
GCA_030144855.1		 60,922
(45.62 %)		 12,545
(0.38 %)		 29,428
(1.34 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 1,648
(0.01 %)		 2,990
(100.00 %)		 8,579,105
(49.81 %)		 831,224
(15.75 %)		 21,718,213
(51.79 %)		 105,821
(2.42 %)
39 B.malayi (v3 2008 agent of lymphatic filariasis)
GCF_000002995.3		 11,472
(14.88 %)		 2,843
(2.29 %)		 3,797
(4.95 %)		 n/a 30.21
(92.98 %)		 58,744
(7.04 %)		 26,881
(93.03 %)		 147,614
(11.55 %)		 54,885
(7.91 %)		 647,155
(33.62 %)		 509
(0.15 %)
40 Bactrian camel (Alxa 2014 genbank)
GCA_000767855.1		 52,178
(47.52 %)		 18,330
(1.96 %)		 17,094
(1.64 %)		 n/a 41.32
(99.32 %)		 31,980
(0.69 %)		 67,434
(99.31 %)		 3,072,373
(34.88 %)		 306,996
(0.95 %)		 12,209,895
(25.43 %)		 49,789
(1.25 %)
41 banded archerfish (primary hap 2021 genbank)
GCA_017976425.1		 42,399
(57.52 %)		 15,312
(3.18 %)		 41,147
(7.01 %)		 62,990
(9.37 %)		 41.11
(99.82 %)		 98
(0.18 %)		 96
(100.00 %)		 811,892
(18.19 %)		 271,913
(9.55 %)		 3,355,326
(28.08 %)		 15,089
(0.96 %)
42 barn owl BGI_N341 (2014)
GCF_000687205.1		 15,006
(2.07 %)		 11,133
(1.44 %)		 21,138
(1.69 %)		 n/a 40.21
(99.24 %)		 109,223
(0.79 %)		 171,345
(99.21 %)		 413,761
(3.90 %)		 181,353
(0.91 %)		 6,776,326
(18.43 %)		 10,575
(0.29 %)
43 barn owl (2020)
GCF_902150015.1		 37,361
(4.54 %)		 12,958
(1.72 %)		 22,922
(1.99 %)		 26,976
(3.04 %)		 41.55
(99.23 %)		 177,340
(0.79 %)		 21,504
(100.00 %)		 585,627
(5.48 %)		 367,764
(2.44 %)		 7,399,161
(19.58 %)		 47,061
(3.25 %)
44 barn swallow (bHirRus1 v2 primary hap genbank 2021)
GCA_015227805.2		 n/a 12,385
(1.88 %)		 23,302
(2.31 %)		 n/a 42.54
(97.69 %)		 1,102
(2.31 %)		 617
(100.00 %)		 579,928
(6.20 %)		 364,636
(2.27 %)		 6,198,840
(21.01 %)		 36,546
(2.82 %)
45 barn swallow (bHirRus1 v2 primary hap refseq 2021)
GCF_015227805.1		 43,374
(5.14 %)		 12,385
(1.88 %)		 23,302
(2.31 %)		 n/a 42.54
(97.69 %)		 1,102
(2.31 %)		 617
(100.00 %)		 579,928
(6.20 %)		 364,636
(2.27 %)		 6,198,840
(21.01 %)		 36,546
(2.82 %)
46 Barn swallow (bHirRus1 v3 primary hap 2021 genbank)
GCA_015227805.3		 n/a 12,395
(1.89 %)		 23,302
(2.31 %)		 n/a 42.54
(97.69 %)		 1,102
(2.31 %)		 617
(100.00 %)		 664,757
(13.92 %)		 364,636
(2.27 %)		 6,198,840
(21.01 %)		 36,548
(2.85 %)
47 basidiomycetes A.bisporus (H97 2012)
GCF_000300575.1		 10,448
(49.20 %)		 1,066
(2.53 %)		 5,238
(16.95 %)		 n/a 46.48
(99.32 %)		 225
(0.68 %)		 254
(99.32 %)		 4,921
(0.90 %)		 2,352
(0.47 %)		 62,603
(9.90 %)		 5,244
(15.19 %)
48 basidiomycetes S.commune (v1 H4-8 2010)
GCF_000143185.1		 13,192
(49.72 %)		 894
(1.60 %)		 973
(2.80 %)		 n/a 57.50
(98.57 %)		 316
(1.43 %)		 352
(98.57 %)		 7,478
(4.11 %)		 7,640
(1.13 %)		 176,404
(11.51 %)		 38
(40.33 %)
49 ascomycetes Z.tritici (IPO323 2011 genbank)
GCA_000219625.1		 10,941
(44.32 %)		 1,451
(2.81 %)		 6,906
(25.36 %)		 n/a 52.14
(99.98 %)		 3
(0.02 %)		 24
(99.98 %)		 8,941
(1.69 %)		 8,367
(1.51 %)		 99,818
(11.14 %)		 27
(96.31 %)
50 barramundi perch (ASB-BC8 2016)
GCF_001640805.1		 50,205
(13.10 %)		 16,166
(3.05 %)		 25,084
(6.20 %)		 n/a 40.75
(100.00 %)		 110
(0.00 %)		 3,808
(100.00 %)		 465,997
(3.11 %)		 237,955
(4.36 %)		 4,027,027
(23.91 %)		 16,276
(1.04 %)
51 bee C.calcarata (v1 Rehan_Ccalc_2016 2016)
GCF_001652005.1		 25,020
(17.94 %)		 4,205
(2.34 %)		 27,352
(12.83 %)		 n/a 41.09
(91.93 %)		 19,248
(8.05 %)		 50,565
(100.00 %)		 57,833
(1.39 %)		 27,440
(2.49 %)		 1,173,760
(18.39 %)		 10,942
(2.61 %)
52 bee E.mexicana (v1 0111107269 2016)
GCF_001483705.1		 16,406
(4.01 %)		 4,087
(0.75 %)		 46,846
(6.53 %)		 16,764
(4.04 %)		 40.92
(95.72 %)		 25,039
(4.23 %)		 212,650
(95.77 %)		 641,987
(7.51 %)		 360,406
(11.43 %)		 3,411,951
(46.01 %)		 40,540
(3.99 %)
53 beet (2015)
GCF_000511025.2		 37,939
(8.78 %)		 12,044
(2.14 %)		 63,283
(17.52 %)		 n/a 36.14
(91.40 %)		 30,962
(8.61 %)		 71,208
(91.39 %)		 288,084
(4.25 %)		 299,650
(4.72 %)		 3,021,571
(30.10 %)		 32,547
(2.39 %)
54 beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v2 2017)
GCA_002288925.2		 n/a 18,686
(1.78 %)		 20,378
(1.43 %)		 n/a 41.24
(98.66 %)		 28,398
(1.35 %)		 35,369
(98.65 %)		 4,001,688
(43.72 %)		 542,326
(1.10 %)		 12,806,249
(34.24 %)		 59,279
(1.53 %)
55 black cottonwood (v3 Nisqually-1 2018)
GCF_000002775.4		 59,637
(15.47 %)		 20,361
(4.67 %)		 44,177
(15.83 %)		 n/a 33.75
(97.43 %)		 6,871
(2.58 %)		 8,318
(97.42 %)		 402,600
(27.63 %)		 177,746
(4.65 %)		 2,639,214
(36.04 %)		 4,559
(0.56 %)
56 black-legged kittiwake (bRisTri1.patW 2023 genbank)
GCA_028500815.1		 51,115
(48.16 %)		 13,211
(1.67 %)		 24,108
(1.99 %)		 n/a 44.40
(99.94 %)		 283
(0.06 %)		 716
(100.00 %)		 521,275
(5.36 %)		 236,727
(8.62 %)		 5,684,588
(26.70 %)		 45,318
(4.71 %)
57 black-legged tick (U.Maryland v1 2021)
GCF_016920785.1		 41,018
(2.61 %)		 4,064
(0.14 %)		 135,587
(7.67 %)		 n/a 46.27
(100.00 %)		 n/a 2,977
(100.00 %)		 1,153,773
(4.93 %)		 754,711
(7.52 %)		 10,964,182
(43.13 %)		 138,831
(8.38 %)
58 black rhinoceros (mBicDic1 primary hap genbank 2021)
GCA_020826845.1		 56,255
(36.51 %)		 18,774
(1.38 %)		 22,346
(1.26 %)		 n/a 41.59
(99.95 %)		 215
(0.05 %)		 1,075
(100.00 %)		 4,200,385
(36.22 %)		 548,030
(8.34 %)		 14,347,639
(40.14 %)		 43,525
(1.14 %)
59 black snub-nosed monkey (Rb0 v1 refseq 2016)
GCF_001698545.1		 59,210
(2.48 %)		 21,256
(1.89 %)		 23,679
(1.25 %)		 n/a 40.94
(94.13 %)		 149,843
(5.88 %)		 105,031
(100.00 %)		 5,602,009
(50.58 %)		 991,745
(2.45 %)		 16,354,078
(34.26 %)		 81,205
(1.19 %)
60 black snub-nosed monkey (Rb0 v1 genbank 2016)
GCA_001698545.1		 59,197
(39.21 %)		 21,244
(1.88 %)		 23,681
(1.25 %)		 n/a 40.94
(94.13 %)		 149,843
(5.88 %)		 105,030
(100.00 %)		 5,600,915
(50.57 %)		 991,762
(2.45 %)		 16,353,992
(34.26 %)		 81,205
(1.19 %)
61 black swan (v1 Queensland, Australia AKBS03 2020)
GCF_013377495.1		 41,255
(4.77 %)		 12,955
(1.98 %)		 22,656
(2.28 %)		 31,476
(5.07 %)		 41.95
(100.00 %)		 n/a 396
(100.00 %)		 680,976
(7.66 %)		 296,152
(1.44 %)		 6,797,141
(21.40 %)		 31,750
(3.32 %)
62 black tiger shrimp (v1 SGIC_2016 2020)
GCF_015228065.1		 35,923
(2.41 %)		 3,903
(0.15 %)		 39,667
(2.27 %)		 40,959
(2.59 %)		 36.64
(83.75 %)		 1,158,725
(16.44 %)		 26,876
(100.00 %)		 5,488,723
(29.98 %)		 7,028,944
(21.91 %)		 10,445,796
(49.62 %)		 178,205
(3.43 %)
63 blackcap (primary hap 2019 genbank)
GCA_009819655.1		 n/a 12,378
(1.92 %)		 22,970
(2.37 %)		 n/a 42.00
(98.88 %)		 413
(1.12 %)		 189
(100.00 %)		 506,242
(6.14 %)		 330,354
(2.12 %)		 6,410,567
(19.76 %)		 26,838
(2.34 %)
64 Blainville's beaked whale (mMesDen1 primary hap 2022 genbank)
GCA_025265405.1		 47,540
(38.02 %)		 19,042
(1.52 %)		 20,766
(1.27 %)		 n/a 41.70
(99.97 %)		 97
(0.03 %)		 73
(100.00 %)		 3,964,035
(35.29 %)		 765,957
(8.74 %)		 12,128,162
(41.78 %)		 70,851
(1.80 %)
65 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 2020)
GCA_009873245.2		 n/a 19,164
(1.81 %)		 20,546
(1.41 %)		 34,210
(1.86 %)		 40.88
(98.91 %)		 936
(1.09 %)		 130
(100.00 %)		 3,999,202
(44.22 %)		 581,540
(1.22 %)		 12,900,977
(34.62 %)		 67,189
(1.73 %)
66 blunt-snouted clingfish (v1 2019 genbank)
GCA_900634775.1		 47,312
(59.52 %)		 14,496
(1.97 %)		 28,873
(5.58 %)		 60,981
(6.13 %)		 38.27
(98.47 %)		 1,160
(1.53 %)		 441
(100.00 %)		 731,730
(4.21 %)		 471,620
(4.92 %)		 5,974,002
(42.88 %)		 29,050
(1.48 %)
67 blunt-snouted clingfish (v1 2019 refseq)
GCF_900634775.1		 47,312
(7.12 %)		 14,496
(1.97 %)		 28,873
(5.58 %)		 60,981
(6.13 %)		 38.27
(98.47 %)		 1,160
(1.53 %)		 441
(100.00 %)		 731,730
(4.21 %)		 471,620
(4.92 %)		 5,974,002
(42.88 %)		 29,050
(1.48 %)
68 Bolivian squirrel monkey (3227 Broad 2011)
GCF_000235385.1		 39,820
(2.33 %)		 20,222
(2.04 %)		 18,404
(1.34 %)		 49,071
(2.26 %)		 40.77
(94.98 %)		 148,728
(5.04 %)		 151,414
(94.96 %)		 4,710,420
(46.30 %)		 767,602
(1.48 %)		 14,489,703
(32.96 %)		 32,474
(0.75 %)
69 Bolivian squirrel monkey (100643 v2.0 BCM 2021)
GCF_016699345.1		 53,030
(2.41 %)		 20,599
(1.98 %)		 21,182
(1.34 %)		 46,441
(1.87 %)		 40.95
(99.56 %)		 1,074
(0.44 %)		 2,790
(99.56 %)		 5,098,799
(47.87 %)		 946,231
(3.04 %)		 14,608,771
(36.99 %)		 37,273
(1.03 %)
70 Bornean orangutan (v1 AG05252 alternate hap 2023)
GCA_028885525.1		 n/a 19,820
(1.76 %)		 20,399
(1.15 %)		 n/a 40.98
(99.88 %)		 36
(0.12 %)		 251
(99.88 %)		 5,232,617
(54.01 %)		 1,003,539
(10.19 %)		 14,858,575
(42.10 %)		 42,467
(1.24 %)
71 Bornean orangutan (v1 AG05252 primary hap 2023)
GCF_028885625.1		 81,966
(2.93 %)		 20,794
(1.72 %)		 21,307
(1.13 %)		 n/a 41.13
(99.86 %)		 39
(0.14 %)		 1,593
(99.86 %)		 5,651,267
(54.21 %)		 1,155,151
(9.33 %)		 16,242,823
(42.82 %)		 52,294
(2.02 %)
72 boutu (BS63 2019)
GCA_004363515.1		 n/a 21,835
(1.38 %)		 35,087
(1.18 %)		 n/a 42.09
(99.89 %)		 5,072
(0.02 %)		 1,218,682
(99.98 %)		 5,098,108
(45.85 %)		 856,878
(2.32 %)		 13,046,921
(40.74 %)		 63,992
(1.47 %)
73 Brazilian free-tailed bat (US034 2019)
GCA_004025005.1		 n/a 23,562
(1.20 %)		 51,200
(1.27 %)		 n/a 42.40
(99.91 %)		 4,243
(0.02 %)		 1,071,858
(99.98 %)		 4,884,584
(32.93 %)		 777,032
(1.49 %)		 14,195,446
(36.38 %)		 89,940
(1.88 %)
74 brown anole (Geneva1000 2022 genbank)
GCA_025583915.1		 38,099
(52.40 %)		 14,028
(1.05 %)		 19,927
(1.81 %)		 n/a 41.14
(98.37 %)		 114,440
(1.64 %)		 3,738
(100.00 %)		 1,376,455
(6.78 %)		 1,094,843
(5.18 %)		 9,127,396
(44.98 %)		 46,291
(1.18 %)
75 brown argus (genbank 2021)
GCA_905147365.1		 23,611
(63.03 %)		 4,734
(1.03 %)		 24,267
(6.80 %)		 24,237
(6.16 %)		 36.86
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 26
(100.00 %)		 264,378
(2.90 %)		 144,255
(3.35 %)		 2,651,028
(48.44 %)		 35,431
(4.56 %)
76 brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v1 2018)
GCF_003584765.1		 54,006
(3.19 %)		 18,811
(1.78 %)		 21,058
(1.52 %)		 39,408
(1.98 %)		 41.84
(99.31 %)		 17,380
(0.70 %)		 21,814
(99.30 %)		 4,283,780
(41.29 %)		 567,588
(1.23 %)		 13,807,277
(30.86 %)		 62,126
(1.80 %)
77 brown bear (v1.0 2022 WashU)
GCF_023065955.1		 60,162
(4.01 %)		 18,920
(1.66 %)		 21,641
(1.49 %)		 n/a 42.51
(100.00 %)		 215
(0.00 %)		 902
(100.00 %)		 4,166,472
(34.00 %)		 659,124
(5.14 %)		 13,282,996
(33.88 %)		 68,113
(2.27 %)
78 brown dog tick (v1 Rsan-2018 2020)
GCF_013339695.1		 39,619
(2.36 %)		 3,965
(0.13 %)		 116,426
(5.96 %)		 45,849
(2.46 %)		 46.86
(99.96 %)		 10,359
(0.04 %)		 2,329
(100.00 %)		 1,064,424
(3.53 %)		 716,579
(3.47 %)		 10,608,171
(42.78 %)		 13,204
(0.97 %)
79 brown headed cowbird (v1.0 BHLD 08-10-18 2020)
GCF_012460135.1		 31,379
(5.19 %)		 12,572
(1.89 %)		 24,442
(2.44 %)		 26,137
(3.13 %)		 42.40
(99.99 %)		 278
(0.01 %)		 691
(99.99 %)		 504,872
(6.53 %)		 420,620
(3.73 %)		 6,496,619
(21.26 %)		 28,576
(2.39 %)
80 brown planthopper (BPH 2020 genbank)
GCA_014356525.1		 36,936
(60.13 %)		 4,416
(0.37 %)		 22,354
(3.57 %)		 37,534
(4.91 %)		 34.69
(99.96 %)		 4,529
(0.04 %)		 7,093
(100.00 %)		 597,351
(3.69 %)		 564,076
(6.64 %)		 6,601,703
(47.48 %)		 39,697
(1.55 %)
81 budgerigar (maternal Z 2020 genbank)
GCA_012275295.1		 32,026
(47.01 %)		 13,250
(1.87 %)		 23,063
(2.25 %)		 26,324
(3.11 %)		 41.80
(99.72 %)		 284
(0.28 %)		 865
(100.00 %)		 539,059
(10.20 %)		 279,511
(3.12 %)		 5,874,608
(22.08 %)		 21,155
(1.61 %)
82 butterfly L.sinapis (2021 genbank)
GCA_905404315.1		 25,882
(55.17 %)		 4,722
(0.65 %)		 16,896
(3.62 %)		 47,660
(8.03 %)		 35.73
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 50
(100.00 %)		 272,738
(1.92 %)		 98,053
(6.01 %)		 4,662,765
(51.79 %)		 43,150
(4.96 %)
83 butterfly P.napi (v1.1 genbank 2021)
GCA_905475465.1		 n/a 4,588
(1.37 %)		 11,218
(5.90 %)		 42,925
(13.84 %)		 33.95
(100.00 %)		 41
(0.00 %)		 43
(100.00 %)		 143,323
(2.19 %)		 45,473
(3.23 %)		 2,501,939
(42.55 %)		 11,070
(2.07 %)
84 cabbage white (genbank 2021)
GCA_905147795.1		 21,844
(65.09 %)		 4,557
(1.68 %)		 9,253
(6.32 %)		 30,285
(15.57 %)		 33.23
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 40
(100.00 %)		 116,781
(2.12 %)		 30,577
(1.24 %)		 2,300,336
(39.04 %)		 6,783
(2.24 %)
85 California condor (v1 813 2021 genbank)
GCA_018139145.1		 n/a 12,650
(1.75 %)		 21,946
(1.95 %)		 n/a 42.16
(99.97 %)		 632
(0.03 %)		 542
(100.00 %)		 518,393
(6.41 %)		 177,329
(0.88 %)		 7,168,675
(20.31 %)		 34,926
(2.94 %)
86 California sea lion (BS06 2019 Broad)
GCA_004024565.1		 n/a 23,668
(1.61 %)		 29,709
(1.32 %)		 n/a 41.56
(99.92 %)		 10,276
(0.04 %)		 582,272
(99.96 %)		 4,952,087
(44.00 %)		 651,744
(1.26 %)		 13,644,805
(35.79 %)		 62,245
(1.50 %)
87 California sea lion (v1 2019)
GCA_009762305.1		 n/a 21,020
(1.79 %)		 20,045
(1.39 %)		 45,176
(2.15 %)		 41.40
(99.28 %)		 122
(0.72 %)		 43
(100.00 %)		 4,529,949
(43.67 %)		 589,962
(1.24 %)		 13,266,465
(33.77 %)		 51,989
(1.50 %)
88 Canada lynx (LIC74 v1 2019)
GCF_007474595.1		 50,094
(2.69 %)		 18,283
(1.66 %)		 19,326
(1.35 %)		 38,985
(1.96 %)		 41.70
(99.88 %)		 848
(0.12 %)		 66
(100.00 %)		 5,016,399
(43.75 %)		 904,986
(1.75 %)		 13,476,288
(34.20 %)		 66,822
(2.52 %)
89 Cape golden mole (BS56 2019 Broad)
GCA_004027935.1		 n/a 25,543
(0.55 %)		 52,506
(0.63 %)		 n/a 40.04
(99.84 %)		 4,876
(0.01 %)		 3,432,954
(99.99 %)		 7,363,240
(21.82 %)		 876,677
(2.53 %)		 25,446,677
(58.18 %)		 25,319
(0.31 %)
90 capsicum (Zunla-1 2015 genbank)
GCA_000710875.1		 n/a 16,133
(0.56 %)		 62,445
(2.92 %)		 n/a 34.93
(96.78 %)		 107,172
(3.23 %)		 108,797
(96.77 %)		 1,171,727
(3.54 %)		 948,641
(4.39 %)		 21,533,236
(46.16 %)		 16,621
(0.21 %)
91 carmine bee-eater (2014 BGI)
GCF_000691845.1		 15,520
(2.12 %)		 11,303
(1.45 %)		 24,758
(1.84 %)		 n/a 41.67
(99.59 %)		 50,632
(0.42 %)		 104,131
(99.58 %)		 405,042
(5.66 %)		 161,525
(1.05 %)		 6,445,961
(19.27 %)		 11,477
(0.36 %)
92 cassava (v6 AM560-2 2016 DOE)
GCF_001659605.1		 48,199
(10.95 %)		 18,537
(3.62 %)		 45,536
(13.17 %)		 n/a 35.94
(85.14 %)		 37,896
(14.88 %)		 39,916
(85.12 %)		 295,656
(2.88 %)		 266,527
(3.40 %)		 2,434,269
(42.34 %)		 30,963
(1.41 %)
93 cattle (Hereford 2015)
GCA_000003205.6		 n/a 19,803
(1.54 %)		 21,001
(1.30 %)		 n/a 41.83
(99.57 %)		 41,517
(0.44 %)		 42,578
(99.56 %)		 5,725,274
(49.24 %)		 459,535
(1.33 %)		 12,905,109
(41.11 %)		 43,324
(1.28 %)
94 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.2 2018 USDA)
GCF_002263795.1		 76,369
(2.97 %)		 19,669
(1.56 %)		 21,999
(1.33 %)		 n/a 41.93
(100.00 %)		 386
(0.00 %)		 2,211
(100.00 %)		 5,643,592
(49.67 %)		 545,256
(2.90 %)		 13,085,601
(41.79 %)		 44,357
(1.24 %)
95 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.3 2018 USDA)
GCF_002263795.2		 76,293
(2.98 %)		 19,325
(1.49 %)		 21,665
(1.32 %)		 n/a 41.94
(100.00 %)		 386
(0.00 %)		 1,957
(100.00 %)		 3,550,686
(24.18 %)		 544,595
(2.90 %)		 13,050,221
(41.81 %)		 44,208
(1.24 %)
96 Chacoan peccary (BS18 v1 2019 Broad)
GCA_004024745.1		 n/a 21,372
(1.41 %)		 34,453
(1.31 %)		 n/a 42.35
(99.87 %)		 10,534
(0.04 %)		 1,240,696
(99.96 %)		 5,244,572
(43.13 %)		 2,503,015
(4.45 %)		 12,961,004
(41.69 %)		 173,264
(3.70 %)
97 channel bull blenny (2019 genbank)
GCA_900634415.1		 40,788
(61.50 %)		 14,472
(3.02 %)		 24,012
(6.59 %)		 60,720
(10.43 %)		 40.96
(99.58 %)		 445
(0.42 %)		 322
(100.00 %)		 420,697
(5.49 %)		 320,518
(6.91 %)		 3,394,846
(28.67 %)		 20,453
(1.39 %)
98 channel catfish (USDA103 v1 2016)
GCF_001660625.1		 53,933
(9.58 %)		 15,712
(2.71 %)		 25,639
(5.25 %)		 n/a 39.70
(98.56 %)		 25,203
(1.45 %)		 34,544
(98.55 %)		 871,222
(5.75 %)		 585,250
(4.19 %)		 5,150,651
(33.94 %)		 31,438
(1.87 %)
99 channel catfish (USDA103 v1.2 2019)
GCF_001660625.2		 57,087
(10.27 %)		 16,253
(2.68 %)		 44,936
(5.15 %)		 n/a 39.70
(98.57 %)		 25,285
(1.44 %)		 34,545
(98.61 %)		 900,327
(5.55 %)		 614,695
(4.28 %)		 5,348,266
(33.81 %)		 32,840
(1.87 %)
100 cheetah (AJU 981 2015)
GCA_001443585.1		 n/a 18,264
(1.57 %)		 14,665
(1.26 %)		 n/a 41.30
(98.26 %)		 183,260
(1.77 %)		 14,382
(100.00 %)		 4,777,041
(42.51 %)		 784,368
(1.53 %)		 13,503,827
(31.65 %)		 57,657
(1.31 %)
101 chimney swift (M959 v1.0 2014)
GCF_000747805.1		 15,979
(2.53 %)		 12,065
(1.82 %)		 10,050
(2.07 %)		 n/a 41.40
(95.99 %)		 65,523
(4.03 %)		 84,595
(95.97 %)		 453,775
(7.30 %)		 194,988
(2.21 %)		 6,363,949
(19.70 %)		 12,486
(0.42 %)
102 chimpanzee (Clint C0471 2018 genbank)
GCA_002880755.3		 n/a 20,378
(1.83 %)		 21,427
(1.19 %)		 n/a 40.71
(98.98 %)		 693
(1.02 %)		 5,037
(98.98 %)		 5,409,980
(53.76 %)		 984,231
(7.31 %)		 15,896,744
(39.56 %)		 45,870
(0.97 %)
103 chimpanzee (v1 AG18354 alternate hap 2023)
GCA_028858805.1		 n/a 20,001
(1.79 %)		 21,230
(1.19 %)		 n/a 40.62
(99.78 %)		 22
(0.22 %)		 141
(99.78 %)		 5,092,768
(48.83 %)		 946,933
(11.75 %)		 14,844,947
(42.39 %)		 47,662
(1.21 %)
104 chimpanzee (v1 AG18354 primary hap 2023)
GCF_028858775.1		 111,282
(4.36 %)		 20,990
(1.75 %)		 21,705
(1.15 %)		 n/a 40.94
(99.90 %)		 29
(0.10 %)		 1,500
(99.90 %)		 5,581,205
(50.06 %)		 1,158,792
(10.59 %)		 15,972,274
(43.09 %)		 61,901
(2.29 %)
105 China rose (Old Blush v1 2018)
GCF_002994745.1		 60,293
(11.65 %)		 15,433
(2.84 %)		 67,310
(21.70 %)		 n/a 38.83
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 45
(100.00 %)		 273,992
(2.25 %)		 228,466
(3.97 %)		 2,261,888
(35.14 %)		 37,317
(4.18 %)
106 Chinese hamster (17A/GY CHO 2018)
GCF_003668045.1		 55,529
(3.00 %)		 19,755
(1.76 %)		 20,017
(1.50 %)		 n/a 41.51
(99.88 %)		 4,356
(0.12 %)		 1,830
(100.00 %)		 4,544,603
(29.89 %)		 1,095,407
(2.92 %)		 12,942,232
(32.27 %)		 19,343
(0.58 %)
107 Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male genbank)
GCA_018296145.1		 92,370
(51.48 %)		 27,141
(1.63 %)		 113,328
(4.52 %)		 157,545
(6.65 %)		 43.55
(99.99 %)		 2,333
(0.01 %)		 9,977
(99.99 %)		 4,892,399
(55.31 %)		 2,306,695
(23.48 %)		 10,038,870
(54.55 %)		 62,726
(1.40 %)
108 chub mackerel (primary hap 2022 genbank)
GCA_027409825.1		 34,390
(49.60 %)		 15,350
(2.35 %)		 46,858
(6.07 %)		 n/a 40.01
(99.92 %)		 1,572
(0.08 %)		 361
(100.00 %)		 1,669,327
(28.44 %)		 638,340
(11.55 %)		 4,613,422
(32.38 %)		 16,290
(0.85 %)
109 chuck-will's-widow (BGI_N321 v1 2014)
GCF_000700745.1		 17,196
(2.21 %)		 12,140
(1.50 %)		 25,641
(1.91 %)		 n/a 40.76
(99.61 %)		 56,667
(0.39 %)		 126,789
(99.61 %)		 560,317
(7.62 %)		 203,204
(1.12 %)		 6,593,712
(20.47 %)		 8,105
(0.24 %)
110 climbing perch (v1.1 2018 refseq)
GCF_900324465.1		 42,930
(13.31 %)		 15,237
(3.47 %)		 22,710
(7.34 %)		 37,043
(11.25 %)		 40.40
(98.65 %)		 292
(1.35 %)		 70
(100.00 %)		 329,586
(2.67 %)		 133,519
(1.94 %)		 3,418,470
(21.84 %)		 10,698
(0.86 %)
111 climbing perch (v1.2 2018 genbank)
GCA_900324465.2		 42,746
(63.74 %)		 15,239
(3.53 %)		 39,067
(7.54 %)		 63,908
(10.45 %)		 40.40
(99.35 %)		 266
(0.65 %)		 50
(100.00 %)		 324,479
(2.66 %)		 130,248
(1.89 %)		 3,324,960
(21.31 %)		 10,500
(0.87 %)
112 climbing perch (v1.2 2018 refseq)
GCF_900324465.2		 42,746
(13.53 %)		 15,241
(3.53 %)		 39,067
(7.54 %)		 63,908
(10.45 %)		 40.40
(99.35 %)		 266
(0.65 %)		 51
(100.00 %)		 324,324
(2.66 %)		 130,249
(1.89 %)		 3,325,009
(21.31 %)		 10,500
(0.87 %)
113 clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028018385.1		 81,219
(51.66 %)		 18,516
(1.55 %)		 20,363
(1.39 %)		 n/a 41.79
(99.94 %)		 181
(0.06 %)		 34
(100.00 %)		 4,798,634
(33.91 %)		 992,669
(2.08 %)		 13,618,933
(34.42 %)		 67,831
(2.45 %)
114 clouded yellow (genbank 2021)
GCA_905220415.1		 23,070
(64.23 %)		 4,767
(1.38 %)		 15,869
(7.12 %)		 34,699
(13.48 %)		 33.59
(100.00 %)		 9
(0.00 %)		 33
(100.00 %)		 161,872
(2.42 %)		 73,892
(2.86 %)		 2,544,844
(42.14 %)		 15,663
(2.98 %)
115 coho salmon (150728-3 2017)
GCF_002021735.1		 64,032
(4.29 %)		 24,727
(1.43 %)		 46,926
(3.38 %)		 n/a 43.33
(95.39 %)		 265,291
(4.63 %)		 22,810
(99.99 %)		 1,185,308
(5.22 %)		 2,455,045
(15.99 %)		 11,710,855
(46.53 %)		 72,061
(1.46 %)
116 common bottlenose dolphin (maternal Y genbank 2020)
GCA_011762595.1		 67,207
(45.84 %)		 18,772
(1.77 %)		 20,527
(1.42 %)		 35,815
(1.58 %)		 41.44
(99.74 %)		 674
(0.26 %)		 362
(100.00 %)		 4,067,521
(46.14 %)		 628,982
(2.12 %)		 12,490,896
(35.29 %)		 65,551
(1.90 %)
117 common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 genbank)
GCA_001922835.1		 45,962
(43.27 %)		 17,254
(1.68 %)		 17,112
(1.34 %)		 n/a 40.85
(99.45 %)		 114,003
(0.57 %)		 2,647
(100.00 %)		 3,845,214
(43.88 %)		 514,631
(1.06 %)		 12,317,013
(32.18 %)		 48,030
(1.35 %)
118 common brushtail (genbank 2020)
GCA_011100635.1		 37,661
(35.20 %)		 18,681
(0.81 %)		 15,375
(0.86 %)		 n/a 39.48
(99.44 %)		 1,796
(0.56 %)		 212
(100.00 %)		 7,598,697
(38.92 %)		 1,259,434
(1.97 %)		 22,071,301
(40.56 %)		 17,762
(0.38 %)
119 common carp (2014)
GCF_000951615.1		 75,427
(5.81 %)		 27,632
(2.17 %)		 59,950
(5.28 %)		 n/a 37.00
(97.48 %)		 57,940
(2.53 %)		 9,378
(100.00 %)		 1,460,282
(5.17 %)		 987,356
(7.88 %)		 9,900,821
(37.41 %)		 48,702
(1.38 %)
120 common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 genbank)
GCA_017976375.1		 50,206
(57.28 %)		 13,179
(1.84 %)		 25,859
(2.41 %)		 n/a 42.18
(99.58 %)		 296
(0.42 %)		 151
(100.00 %)		 521,043
(9.61 %)		 310,469
(2.36 %)		 6,712,849
(21.76 %)		 25,267
(1.71 %)
121 common cuckoo (BGI 2014)
GCF_000709325.1		 16,827
(2.53 %)		 12,599
(1.80 %)		 12,623
(2.28 %)		 n/a 41.52
(97.64 %)		 56,977
(2.38 %)		 71,907
(97.62 %)		 418,870
(8.06 %)		 192,437
(2.08 %)		 6,576,259
(19.85 %)		 18,002
(0.74 %)
122 common house spider (v2 Geottingen 2017)
GCF_000365465.2		 30,064
(3.79 %)		 3,347
(0.23 %)		 7,571
(1.48 %)		 n/a 29.46
(81.63 %)		 247,378
(18.44 %)		 263,908
(81.56 %)		 587,943
(2.23 %)		 464,643
(2.90 %)		 10,795,253
(40.31 %)		 10,480
(0.23 %)
123 common house spider (v3 Goettingen 2019 genbank)
GCA_000365465.3		 37,121
(48.05 %)		 3,276
(0.22 %)		 9,098
(1.38 %)		 38,273
(4.24 %)		 29.40
(98.45 %)		 124,228
(1.55 %)		 84,235
(98.46 %)		 637,694
(2.45 %)		 527,781
(4.43 %)		 11,553,196
(51.16 %)		 11,998
(0.33 %)
124 common limpet (v1 primary hap 2022)
GCF_932274485.1		 41,888
(9.21 %)		 3,611
(0.43 %)		 13,244
(4.58 %)		 44,721
(6.30 %)		 36.11
(100.00 %)		 75
(0.00 %)		 13
(100.00 %)		 239,042
(1.40 %)		 359,961
(7.89 %)		 4,399,053
(45.69 %)		 33,411
(1.94 %)
125 common sole (primary hap 2023 genbank)
GCA_958295425.1		 55,359
(63.58 %)		 14,846
(2.94 %)		 42,832
(6.93 %)		 n/a 40.87
(99.99 %)		 373
(0.01 %)		 243
(100.00 %)		 1,149,249
(19.12 %)		 342,239
(9.71 %)		 3,906,839
(32.84 %)		 27,772
(2.71 %)
126 common swift (bApuApu2 2021 genbank)
GCA_020740795.1		 39,986
(53.94 %)		 12,277
(1.88 %)		 20,379
(2.16 %)		 n/a 41.95
(99.84 %)		 256
(0.16 %)		 109
(100.00 %)		 533,758
(8.66 %)		 199,748
(1.12 %)		 6,353,957
(21.19 %)		 20,393
(1.74 %)
127 common vampire bat (HL8 primary hap 2022 genbank)
GCA_022682495.1		 58,054
(45.51 %)		 18,280
(1.71 %)		 19,514
(1.59 %)		 n/a 42.98
(99.99 %)		 611
(0.01 %)		 572
(100.00 %)		 2,761,820
(28.38 %)		 427,940
(3.89 %)		 11,250,492
(32.57 %)		 70,700
(2.48 %)
128 common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 genbank)
GCA_002940915.2		 n/a 18,511
(1.87 %)		 18,170
(1.68 %)		 n/a 42.15
(97.78 %)		 54,308
(2.23 %)		 84,108
(97.77 %)		 2,860,991
(29.93 %)		 275,245
(1.03 %)		 11,798,152
(28.19 %)		 51,833
(1.38 %)
129 common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 refseq)
GCF_002940915.1		 51,034
(3.23 %)		 18,506
(1.88 %)		 18,166
(1.68 %)		 n/a 42.15
(97.78 %)		 54,308
(2.23 %)		 84,109
(97.77 %)		 2,861,697
(29.93 %)		 275,247
(1.03 %)		 11,798,198
(28.19 %)		 51,834
(1.38 %)
130 Coquerel's sifaka 6110/Marcella (2015 genbank)
GCA_000956105.1		 29,369
(33.72 %)		 19,335
(2.10 %)		 21,769
(1.63 %)		 n/a 41.24
(74.51 %)		 276,544
(25.53 %)		 299,069
(74.47 %)		 3,513,698
(39.82 %)		 304,033
(0.59 %)		 13,333,842
(21.06 %)		 56,694
(1.59 %)
131 cork oak (v1 HL8 2018)
GCF_002906115.1		 65,969
(8.84 %)		 20,226
(1.95 %)		 89,703
(16.66 %)		 n/a 36.19
(97.99 %)		 26,139
(2.01 %)		 23,344
(100.00 %)		 865,884
(3.63 %)		 491,126
(5.95 %)		 6,119,503
(36.10 %)		 21,505
(3.50 %)
132 corroboree frog (hap2 2023 genbank)
GCA_028390025.1		 n/a n/a 54,346
(1.07 %)		 n/a 45.66
(99.76 %)		 2,699
(0.24 %)		 3,127
(100.00 %)		 18,782,633
(75.22 %)		 5,902,115
(18.63 %)		 5,826
(99.76 %)		 990,274
(4.84 %)
133 cotton bollworm (Harm_GR_Male_#8 2017 genbank)
GCA_002156985.1		 21,972
(59.55 %)		 4,839
(1.54 %)		 21,045
(8.01 %)		 n/a 36.13
(89.02 %)		 26,910
(11.01 %)		 24,551
(88.99 %)		 115,046
(2.97 %)		 31,900
(0.85 %)		 2,230,382
(25.45 %)		 15,851
(2.18 %)
134 cowpea (IT97K-499-35 v1 2019)
GCF_004118075.1		 48,679
(10.56 %)		 16,927
(3.30 %)		 44,814
(13.06 %)		 54,348
(11.30 %)		 32.98
(99.48 %)		 68
(0.52 %)		 682
(100.00 %)		 352,238
(4.22 %)		 283,949
(8.14 %)		 3,092,021
(41.64 %)		 24,513
(2.40 %)
135 crab-eating macaque WashU 2013 genbank
GCA_000364345.1		 76,183
(45.03 %)		 20,283
(1.90 %)		 20,544
(1.22 %)		 n/a 40.90
(95.16 %)		 80,474
(4.85 %)		 87,763
(95.15 %)		 5,351,207
(51.35 %)		 941,514
(3.24 %)		 15,778,449
(35.74 %)		 76,963
(1.14 %)
136 crab-eating macaque WashU 2013 refseq
GCF_000364345.1		 76,196
(3.30 %)		 20,209
(1.91 %)		 51,427
(6.84 %)		 n/a 40.90
(95.16 %)		 80,474
(4.85 %)		 87,764
(95.15 %)		 5,251,819
(50.85 %)		 941,514
(3.24 %)		 15,778,510
(35.74 %)		 76,963
(1.14 %)
137 crucian carp (primary hap 2023 genbank)
GCA_963082965.1		 90,094
(55.93 %)		 29,389
(2.81 %)		 88,291
(5.37 %)		 n/a 38.31
(99.99 %)		 832
(0.01 %)		 278
(100.00 %)		 3,481,389
(45.81 %)		 802,775
(6.54 %)		 8,190,816
(44.41 %)		 83,696
(3.82 %)
138 crustacean D.carinata (v1 CSIRO-1 2022)
GCF_022539665.1		 22,902
(28.68 %)		 3,621
(2.94 %)		 11,430
(17.96 %)		 n/a 40.34
(99.47 %)		 2
(0.53 %)		 227
(100.00 %)		 81,008
(2.67 %)		 29,625
(4.98 %)		 609,395
(25.66 %)		 6,559
(5.05 %)
139 crustacean D.magna (SK Sungkyunkwan U. 2019 genbank)
GCA_003990815.1		 n/a 3,519
(2.64 %)		 12,174
(17.22 %)		 n/a 40.54
(93.29 %)		 13,228
(6.75 %)		 4,192
(100.00 %)		 63,254
(2.07 %)		 22,325
(1.44 %)		 728,942
(20.81 %)		 8,375
(4.98 %)
140 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 genbank)
GCA_021462225.2		 n/a 15,131
(1.68 %)		 50,084
(4.18 %)		 n/a 40.18
(99.46 %)		 409
(0.54 %)		 73
(100.00 %)		 2,175,293
(47.80 %)		 176,956
(1.87 %)		 6,142,692
(38.35 %)		 32,973
(1.28 %)
141 Daubenton's bat (primary hap 2023 genbank)
GCA_963259705.1		 64,558
(45.64 %)		 19,142
(1.72 %)		 22,139
(1.66 %)		 n/a 43.18
(99.99 %)		 1,099
(0.01 %)		 122
(100.00 %)		 3,040,239
(24.03 %)		 796,913
(6.38 %)		 10,478,261
(38.84 %)		 64,921
(2.50 %)
142 degu (3935 2012 genbank)
GCA_000260255.1		 48,152
(35.39 %)		 22,240
(1.40 %)		 22,108
(1.46 %)		 n/a 41.38
(84.36 %)		 252,770
(15.68 %)		 259,903
(84.32 %)		 4,890,270
(27.82 %)		 898,943
(1.50 %)		 14,281,942
(29.30 %)		 40,135
(0.82 %)
143 denticle herring (v1 2019)
GCF_900700375.1		 59,645
(12.74 %)		 16,556
(3.78 %)		 37,861
(8.42 %)		 72,719
(10.66 %)		 43.69
(99.18 %)		 464
(0.82 %)		 460
(100.00 %)		 403,512
(3.23 %)		 224,282
(4.61 %)		 2,948,671
(28.79 %)		 64,661
(9.49 %)
144 diamondback terrapin (hap1 2023 genbank)
GCA_027887155.1		 50,318
(52.07 %)		 15,109
(1.08 %)		 19,281
(1.62 %)		 n/a 44.46
(99.92 %)		 141
(0.08 %)		 76
(100.00 %)		 4,088,064
(46.33 %)		 403,943
(1.72 %)		 11,014,504
(33.74 %)		 110,838
(2.71 %)
145 dog (BS72 2019 Broad)
GCA_004027395.1		 n/a 22,343
(1.53 %)		 28,525
(1.27 %)		 n/a 41.66
(99.91 %)		 10,428
(0.04 %)		 667,170
(99.96 %)		 5,598,608
(45.38 %)		 1,220,686
(2.58 %)		 14,079,363
(36.37 %)		 62,881
(2.13 %)
146 domestic ferret (Sable ID 1420 FGSC 2011)
GCF_000215625.1		 55,980
(3.39 %)		 18,440
(1.59 %)		 19,474
(1.48 %)		 n/a 41.47
(94.51 %)		 109,700
(5.51 %)		 117,442
(94.49 %)		 n/a 606,818
(1.04 %)		 13,503,550
(29.63 %)		 53,376
(1.90 %)
147 domestic guinea pig (2N 2008 genbank)
GCA_000151735.1		 44,762
(33.07 %)		 18,297
(1.33 %)		 20,107
(1.34 %)		 n/a 39.95
(97.81 %)		 58,460
(2.20 %)		 61,603
(97.80 %)		 4,257,412
(38.85 %)		 658,532
(1.25 %)		 14,547,631
(34.19 %)		 37,092
(0.85 %)
148 domestic silkworm (genbank 2020)
GCA_014905235.2		 n/a 5,227
(1.28 %)		 18,795
(5.67 %)		 n/a 38.55
(99.90 %)		 30
(0.10 %)		 696
(100.00 %)		 615,428
(29.26 %)		 86,179
(1.65 %)		 2,607,325
(47.66 %)		 44,022
(10.06 %)
149 domesticated barley (H.vulgare 2021 genbank)
GCA_904849725.1		 63,294
(3.74 %)		 18,050
(0.43 %)		 260,902
(9.04 %)		 n/a 44.46
(99.97 %)		 162
(0.03 %)		 290
(100.00 %)		 1,274,894
(2.42 %)		 1,726,303
(5.40 %)		 14,010,542
(72.58 %)		 732,828
(17.24 %)
150 downy woodpecker (BGI 2014)
GCF_000699005.1		 15,850
(2.33 %)		 11,864
(1.67 %)		 11,795
(1.99 %)		 n/a 44.51
(96.31 %)		 96,471
(3.72 %)		 127,725
(96.28 %)		 842,281
(18.63 %)		 310,018
(2.09 %)		 5,822,687
(27.83 %)		 17,379
(0.69 %)
151 downy woodpecker (bDryPub1 primary hap 2020)
GCA_014839835.1		 25,483
(48.39 %)		 12,405
(1.70 %)		 23,073
(2.18 %)		 n/a 45.31
(99.66 %)		 187
(0.34 %)		 181
(100.00 %)		 1,008,118
(21.51 %)		 378,537
(3.38 %)		 5,846,717
(32.04 %)		 26,005
(1.75 %)
152 E. coli (K-12 BW25113 2014 genbank)
GCA_000750555.1		 n/a n/a n/a n/a 50.78
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 n/a 90
(0.38 %)		 19,508
(7.44 %)		 1
(99.99 %)
153 East African water lily (v1 Beijing-Zhang1983 2019)
GCF_008831285.1		 39,088
(10.61 %)		 11,569
(2.49 %)		 38,114
(15.67 %)		 n/a 38.59
(99.98 %)		 627
(0.02 %)		 1,425
(99.98 %)		 230,165
(2.88 %)		 153,929
(4.02 %)		 2,160,647
(26.81 %)		 24,567
(4.41 %)
154 eastern European house mouse (PWK_PhJ v1 2016)
GCA_001624775.1		 n/a 21,013
(2.21 %)		 18,237
(1.40 %)		 101,394
(4.09 %)		 41.76
(90.89 %)		 904,107
(9.24 %)		 30,233
(98.34 %)		 5,250,349
(40.55 %)		 1,508,787
(2.97 %)		 13,823,341
(28.09 %)		 16,695
(0.43 %)
155 eastern happy (v2 2018)
GCF_900246225.1		 57,615
(9.59 %)		 15,348
(2.22 %)		 28,518
(6.29 %)		 42,170
(8.31 %)		 41.07
(99.87 %)		 490
(0.13 %)		 364
(100.00 %)		 527,486
(5.98 %)		 217,915
(1.89 %)		 4,547,443
(30.78 %)		 33,005
(1.88 %)
156 Egyptian rousette (US006 2019 Broad)
GCA_004024865.1		 n/a 20,133
(1.87 %)		 36,361
(1.80 %)		 n/a 40.23
(99.96 %)		 4,332
(0.02 %)		 226,086
(99.98 %)		 2,985,622
(32.66 %)		 475,311
(1.11 %)		 12,612,081
(27.34 %)		 81,930
(5.75 %)
157 Egyptian rousette (v1 2020 genbank)
GCA_014176215.1		 65,163
(51.34 %)		 17,637
(2.08 %)		 22,318
(1.84 %)		 n/a 40.05
(98.59 %)		 242
(1.41 %)		 30
(100.00 %)		 2,821,248
(33.05 %)		 434,415
(1.02 %)		 12,031,652
(26.52 %)		 53,604
(6.69 %)
158 elephant shark (2013)
GCF_000165045.1		 30,695
(4.95 %)		 11,306
(1.54 %)		 18,189
(3.03 %)		 n/a 42.34
(96.16 %)		 46,232
(3.85 %)		 67,421
(96.15 %)		 1,405,480
(27.29 %)		 330,698
(2.60 %)		 5,549,534
(36.65 %)		 35,561
(2.16 %)
159 emu (v1 ZJU1.0 2020)
GCA_016128335.1		 n/a 13,181
(1.74 %)		 24,708
(2.10 %)		 33,433
(3.99 %)		 42.41
(100.00 %)		 512
(0.00 %)		 802
(100.00 %)		 504,527
(4.38 %)		 259,276
(2.59 %)		 7,105,965
(19.15 %)		 41,784
(5.52 %)
160 epaulette shark (2021 genbank)
GCA_020745735.1		 43,156
(39.58 %)		 12,439
(0.39 %)		 19,520
(1.06 %)		 n/a 42.76
(98.05 %)		 3,716
(1.95 %)		 1,963
(100.00 %)		 9,211,963
(69.93 %)		 935,037
(6.51 %)		 20,660,613
(43.88 %)		 41,682
(1.08 %)
161 eudicots lettuce (Salinas v7 2020)
GCF_002870075.2		 65,115
(2.96 %)		 16,271
(0.65 %)		 102,071
(6.37 %)		 n/a 37.79
(92.44 %)		 353,389
(7.60 %)		 11,454
(99.71 %)		 1,109,875
(4.83 %)		 983,866
(3.64 %)		 12,335,790
(52.95 %)		 117,743
(2.02 %)
162 Euphrates poplar (v1 2014)
GCF_000495115.1		 56,539
(12.93 %)		 20,844
(4.28 %)		 41,664
(12.47 %)		 n/a 32.08
(95.31 %)		 23,174
(4.71 %)		 32,789
(95.29 %)		 332,532
(5.23 %)		 246,766
(4.06 %)		 2,679,673
(43.30 %)		 2,781
(0.47 %)
163 Eurasian badger (v3.1 2021)
GCF_922984935.1		 57,138
(2.48 %)		 19,265
(1.40 %)		 22,121
(1.36 %)		 n/a 42.48
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 538
(100.00 %)		 4,487,951
(32.73 %)		 821,664
(4.02 %)		 13,814,723
(38.08 %)		 66,524
(3.95 %)
164 Eurasian red squirrel (v1.1 2019)
GCA_902686455.1		 n/a 21,298
(1.58 %)		 21,024
(1.36 %)		 36,645
(1.54 %)		 40.08
(94.33 %)		 1,177
(5.67 %)		 638
(100.00 %)		 4,680,964
(35.76 %)		 704,218
(1.42 %)		 14,991,981
(31.49 %)		 48,159
(1.04 %)
165 Eurasian water vole (v1 2020)
GCF_903992535.1		 45,658
(2.52 %)		 19,724
(1.77 %)		 19,069
(1.47 %)		 34,561
(2.01 %)		 42.15
(99.74 %)		 872
(0.26 %)		 216
(100.00 %)		 4,098,151
(26.75 %)		 1,088,237
(2.91 %)		 12,853,776
(32.42 %)		 19,000
(0.58 %)
166 European conger (primary hap 2023 genbank)
GCA_963514075.1		 54,631
(54.17 %)		 17,073
(1.89 %)		 34,794
(5.07 %)		 n/a 43.89
(99.98 %)		 1,009
(0.02 %)		 394
(100.00 %)		 761,527
(5.99 %)		 913,328
(13.25 %)		 5,768,003
(35.48 %)		 120,990
(6.12 %)
167 European eel (primary hap 2020 genbank)
GCA_013347855.1		 n/a 17,048
(2.22 %)		 34,271
(5.56 %)		 n/a 43.64
(99.61 %)		 640
(0.40 %)		 53
(100.00 %)		 831,037
(5.48 %)		 786,520
(8.15 %)		 5,700,818
(27.40 %)		 130,345
(8.19 %)
168 European mink (primary hap 2023 genbank)
GCA_030435805.1		 69,556
(45.15 %)		 18,706
(1.46 %)		 21,193
(1.37 %)		 n/a 41.85
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 26
(100.00 %)		 4,237,797
(30.90 %)		 792,898
(2.69 %)		 13,417,248
(36.59 %)		 67,133
(2.54 %)
169 European peacock (2021 genbank)
GCA_905147045.1		 22,557
(62.12 %)		 4,716
(1.16 %)		 12,599
(4.34 %)		 26,251
(7.81 %)		 33.70
(100.00 %)		 10
(0.00 %)		 42
(100.00 %)		 212,528
(2.58 %)		 60,682
(1.18 %)		 3,127,157
(46.89 %)		 24,620
(4.88 %)
170 European plaice (primary hap 2022 genbank)
GCA_947347685.1		 46,467
(52.27 %)		 14,820
(2.71 %)		 51,453
(7.41 %)		 n/a 42.51
(99.97 %)		 1,072
(0.03 %)		 356
(100.00 %)		 476,317
(3.63 %)		 520,730
(13.27 %)		 3,283,400
(33.55 %)		 47,051
(4.45 %)
171 European snow vole (primary hap 2023 genbank)
GCA_950005125.1		 47,025
(39.90 %)		 20,576
(1.75 %)		 21,171
(1.56 %)		 n/a 41.98
(100.00 %)		 197
(0.00 %)		 161
(100.00 %)		 3,580,811
(22.71 %)		 998,537
(5.14 %)		 12,204,125
(34.97 %)		 20,725
(0.63 %)
172 European turtle dove (v1.1 alternate hap 2019)
GCA_901699165.1		 n/a 11,276
(1.79 %)		 21,238
(2.15 %)		 n/a 41.73
(100.00 %)		 n/a 3,333
(100.00 %)		 466,567
(7.08 %)		 182,345
(0.97 %)		 6,037,183
(20.24 %)		 29,648
(2.35 %)
173 European turtle dove (v1.1 primary hap 2019)
GCA_901699155.1		 n/a 12,415
(1.77 %)		 23,484
(2.17 %)		 n/a 41.84
(99.67 %)		 894
(0.33 %)		 357
(100.00 %)		 539,737
(7.60 %)		 227,500
(1.16 %)		 6,768,805
(21.05 %)		 34,729
(2.65 %)
174 European woodmouse (2022 genbank)
GCA_947179515.1		 54,113
(34.13 %)		 19,960
(1.65 %)		 19,954
(1.25 %)		 n/a 41.23
(99.99 %)		 1,129
(0.01 %)		 498
(100.00 %)		 4,863,656
(37.41 %)		 1,795,997
(8.95 %)		 13,681,786
(40.58 %)		 23,961
(0.53 %)
175 fall armyworm (Faw-zju 2020 genbank)
GCA_011064685.1		 32,738
(63.63 %)		 5,744
(1.12 %)		 26,631
(7.08 %)		 n/a 36.43
(99.99 %)		 525
(0.01 %)		 91
(100.00 %)		 168,479
(1.60 %)		 72,876
(1.70 %)		 3,384,083
(37.35 %)		 30,753
(4.27 %)
176 fall armyworm (Faw-zju v1.0 refseq 2020)
GCF_011064685.1		 32,751
(9.65 %)		 5,744
(1.12 %)		 26,632
(7.08 %)		 n/a 36.43
(99.99 %)		 525
(0.01 %)		 92
(100.00 %)		 169,122
(1.61 %)		 72,892
(1.70 %)		 3,384,365
(37.36 %)		 30,753
(4.27 %)
177 fire-bellied toad (primary hap 2023 genbank)
GCA_027579735.1		 n/a 15,456
(0.21 %)		 47,501
(0.88 %)		 n/a 38.98
(98.02 %)		 7,009
(1.99 %)		 2,468
(100.00 %)		 20,643,710
(70.75 %)		 7,150,262
(12.27 %)		 9,477
(98.01 %)		 365,066
(1.20 %)
178 flier cichlid (MPI-CPG 2019 genbank)
GCA_007364275.2		 n/a 15,436
(2.15 %)		 26,448
(5.90 %)		 64,657
(6.60 %)		 41.23
(98.19 %)		 744
(1.81 %)		 189
(100.00 %)		 1,014,141
(16.95 %)		 287,037
(2.21 %)		 5,305,987
(30.67 %)		 24,130
(1.26 %)
179 Florida manatee (Lorelei 2012 genbank)
GCA_000243295.1		 39,651
(35.92 %)		 18,302
(1.36 %)		 20,592
(1.23 %)		 32,831
(1.38 %)		 40.73
(89.24 %)		 160,167
(10.78 %)		 166,489
(89.22 %)		 5,109,822
(37.03 %)		 389,314
(0.74 %)		 14,633,007
(38.46 %)		 27,461
(0.64 %)
180 fly D.albomicans (v1 15112-1751.03 2019)
GCF_009650485.1		 24,196
(18.66 %)		 10,065
(8.48 %)		 14,473
(13.61 %)		 n/a 38.15
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 11
(100.00 %)		 298,709
(14.86 %)		 80,048
(3.56 %)		 1,317,733
(33.56 %)		 18,849
(8.62 %)
181 fly D.santomea (v1.0 2021)
GCF_016746245.1		 25,550
(21.64 %)		 13,354
(17.52 %)		 20,540
(17.87 %)		 n/a 42.61
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 104
(100.00 %)		 169,365
(23.08 %)		 64,316
(3.47 %)		 791,743
(23.14 %)		 27,794
(16.15 %)
182 fly D.sechellia (sech25 v1 2019 UC Irvine)
GCF_004382195.1		 26,658
(22.06 %)		 13,461
(17.65 %)		 21,781
(17.83 %)		 n/a 42.26
(100.00 %)		 38
(0.00 %)		 402
(100.00 %)		 145,818
(25.16 %)		 34,869
(4.31 %)		 719,811
(25.74 %)		 30,130
(16.11 %)
183 fly D.serrata (v1.0 Fors4 2017)
GCF_002093755.1		 21,759
(15.21 %)		 12,488
(9.92 %)		 21,269
(14.06 %)		 n/a 39.11
(100.00 %)		 n/a 1,356
(100.00 %)		 314,594
(25.90 %)		 82,446
(12.33 %)		 1,113,448
(37.00 %)		 27,493
(12.03 %)
184 fly D.simulans (w501 v3.0 2021)
GCF_016746395.1		 28,595
(26.45 %)		 13,448
(20.44 %)		 18,989
(18.34 %)		 n/a 42.47
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 96
(100.00 %)		 126,424
(16.72 %)		 32,595
(4.31 %)		 759,296
(23.70 %)		 27,530
(17.02 %)
185 fly D.yakuba (2018)
GCF_000005975.2		 5,444
(4.10 %)		 13,713
(15.95 %)		 22,613
(16.71 %)		 n/a 42.28
(98.12 %)		 5,400
(1.88 %)		 13,440
(98.12 %)		 180,908
(22.48 %)		 68,911
(3.75 %)		 897,353
(23.94 %)		 31,387
(14.91 %)
186 fly D.yakuba (v1 2021)
GCF_016746365.1		 27,938
(24.60 %)		 13,343
(17.86 %)		 20,029
(17.64 %)		 n/a 42.55
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 54
(100.00 %)		 169,559
(23.47 %)		 60,591
(3.64 %)		 837,616
(23.40 %)		 28,204
(16.22 %)
187 Gaboon caecilian (v1.1 2019 genbank)
GCA_902459505.1		 54,713
(61.19 %)		 14,267
(0.51 %)		 29,026
(1.40 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 433
(0.15 %)		 163
(100.00 %)		 1,311,113
(1.64 %)		 1,364,596
(3.83 %)		 19,589,738
(52.85 %)		 270,923
(4.52 %)
188 Gaboon caecilian (v1.1 2019 refseq)
GCF_902459505.1		 54,713
(1.72 %)		 14,269
(0.51 %)		 29,026
(1.40 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 433
(0.15 %)		 164
(100.00 %)		 1,310,970
(1.64 %)		 1,364,597
(3.83 %)		 19,589,802
(52.85 %)		 270,923
(4.52 %)
189 giant panda (2009 BGI)
GCF_000004335.2		 40,432
(2.55 %)		 18,884
(1.76 %)		 18,919
(1.46 %)		 n/a 41.60
(97.66 %)		 119,126
(2.36 %)		 200,593
(97.64 %)		 4,236,423
(40.48 %)		 503,179
(1.10 %)		 13,781,487
(28.85 %)		 53,465
(1.34 %)
190 giant panda (Jingjing v1 2017)
GCA_002007445.1		 n/a 20,110
(1.71 %)		 22,288
(1.49 %)		 n/a 41.69
(98.08 %)		 186,846
(1.93 %)		 244,258
(98.07 %)		 4,464,041
(41.66 %)		 614,896
(2.00 %)		 14,294,774
(30.62 %)		 59,340
(1.50 %)
191 giant panda (Jingjing v2 refseq 2020)
GCF_002007445.1		 67,162
(3.32 %)		 20,374
(1.71 %)		 21,965
(1.44 %)		 43,086
(2.00 %)		 41.69
(98.09 %)		 190,364
(1.92 %)		 77,288
(100.00 %)		 4,476,689
(41.47 %)		 618,596
(2.00 %)		 14,236,463
(30.39 %)		 59,946
(1.50 %)
192 giant panda (Jingjing v2 genbank 2020)
GCA_002007445.2		 n/a 20,381
(1.71 %)		 21,979
(1.44 %)		 43,086
(2.00 %)		 41.69
(98.09 %)		 190,364
(1.92 %)		 77,287
(100.00 %)		 4,484,597
(41.53 %)		 618,595
(2.00 %)		 14,236,406
(30.39 %)		 59,945
(1.50 %)
193 gilthead seabream (v1 2019)
GCF_900880675.1		 59,027
(10.96 %)		 15,412
(2.36 %)		 31,802
(6.47 %)		 73,197
(7.97 %)		 41.94
(99.96 %)		 1,050
(0.04 %)		 176
(100.00 %)		 531,360
(3.04 %)		 305,809
(3.03 %)		 4,701,694
(25.69 %)		 47,327
(2.41 %)
194 Glanville fritillary (genbank 2021)
GCA_905220565.1		 17,520
(43.15 %)		 4,738
(0.89 %)		 16,197
(5.05 %)		 35,235
(7.97 %)		 34.09
(100.00 %)		 80
(0.01 %)		 32
(100.00 %)		 343,193
(3.25 %)		 144,286
(3.46 %)		 3,683,956
(48.60 %)		 30,200
(4.54 %)
195 globe artichoke (v1 2C 2018)
GCF_001531365.1		 42,119
(6.72 %)		 15,804
(2.23 %)		 49,721
(11.10 %)		 n/a 35.35
(90.31 %)		 310,473
(9.77 %)		 13,588
(99.93 %)		 394,687
(2.79 %)		 364,361
(3.37 %)		 4,191,676
(39.48 %)		 12,198
(0.64 %)
196 goat (v1 San Clemente 2016 USDA genbank)
GCA_001704415.1		 n/a 19,842
(1.43 %)		 22,426
(1.24 %)		 52,608
(1.64 %)		 43.16
(100.00 %)		 790
(0.00 %)		 29,906
(100.00 %)		 5,669,868
(50.59 %)		 760,836
(7.07 %)		 13,024,386
(44.85 %)		 125,682
(4.01 %)
197 goat (v1 San Clemente 2016 USDA refseq)
GCF_001704415.1		 47,206
(2.31 %)		 19,857
(1.43 %)		 22,880
(1.27 %)		 52,608
(1.64 %)		 43.16
(100.00 %)		 790
(0.00 %)		 29,907
(100.00 %)		 5,578,287
(50.22 %)		 760,837
(7.07 %)		 13,024,440
(44.85 %)		 125,682
(4.02 %)
198 golden eagle (v1.2 alternate hap 2019)
GCA_902153765.1		 n/a 9,334
(1.82 %)		 17,594
(2.12 %)		 n/a 42.53
(99.93 %)		 39
(0.07 %)		 3,860
(100.00 %)		 356,284
(6.03 %)		 123,430
(0.80 %)		 4,417,887
(19.25 %)		 28,919
(3.52 %)
199 golden eagle (v1.2 2019)
GCF_900496995.1		 55,164
(5.86 %)		 13,226
(1.87 %)		 23,033
(2.15 %)		 25,921
(3.22 %)		 42.11
(99.61 %)		 191
(0.39 %)		 142
(100.00 %)		 519,341
(5.86 %)		 180,990
(0.79 %)		 7,005,531
(19.25 %)		 37,343
(3.12 %)
200 golden hamster (Baylor 2013 genbank)
GCA_000349665.1		 n/a 18,965
(1.82 %)		 19,339
(1.52 %)		 n/a 42.01
(82.92 %)		 216,216
(17.12 %)		 237,699
(82.88 %)		 3,724,142
(27.19 %)		 790,256
(1.69 %)		 12,003,866
(24.29 %)		 18,591
(0.51 %)
201 golden snub-nosed monkey (2014 Novogene)
GCA_000769185.1		 n/a 21,341
(1.86 %)		 22,492
(1.24 %)		 n/a 40.87
(98.50 %)		 61,291
(1.50 %)		 196,804
(98.50 %)		 5,673,299
(51.36 %)		 1,080,627
(3.06 %)		 16,205,827
(36.77 %)		 79,387
(1.14 %)
202 gray mouse lemur genbank
GCA_000165445.3		 n/a 20,031
(1.89 %)		 22,619
(1.50 %)		 n/a 40.98
(95.94 %)		 43,363
(4.06 %)		 50,982
(95.94 %)		 4,082,873
(41.60 %)		 582,430
(1.47 %)		 14,808,558
(30.05 %)		 74,772
(2.61 %)
203 gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027887165.1		 73,383
(42.66 %)		 16,638
(0.72 %)		 16,171
(0.86 %)		 n/a 37.92
(99.11 %)		 2,255
(0.89 %)		 14
(100.00 %)		 5,562,366
(25.40 %)		 1,096,625
(2.60 %)		 22,322,798
(43.37 %)		 28,894
(0.57 %)
204 great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 genbank)
GCA_001890085.1		 50,937
(43.78 %)		 19,011
(2.00 %)		 19,882
(1.66 %)		 41,741
(2.41 %)		 41.11
(87.42 %)		 172,751
(12.60 %)		 7,570
(100.00 %)		 3,078,210
(32.07 %)		 495,290
(1.05 %)		 11,588,202
(25.43 %)		 33,101
(0.97 %)
205 great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 refseq)
GCF_001890085.1		 50,937
(3.26 %)		 18,992
(2.00 %)		 19,880
(1.66 %)		 41,778
(2.41 %)		 41.11
(87.42 %)		 172,751
(12.60 %)		 7,571
(100.00 %)		 3,285,971
(33.14 %)		 495,292
(1.05 %)		 11,588,248
(25.43 %)		 33,101
(0.97 %)
206 greater horseshoe bat (mRhiFer1 2020)
GCA_014108255.1		 n/a 18,531
(1.97 %)		 20,309
(1.67 %)		 n/a 40.52
(99.19 %)		 292
(0.81 %)		 50
(100.00 %)		 3,284,473
(35.00 %)		 559,653
(1.29 %)		 12,043,562
(29.15 %)		 32,047
(1.05 %)
207 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 genbank)
GCA_004115265.2		 53,353
(46.77 %)		 18,647
(1.97 %)		 20,359
(1.68 %)		 n/a 40.54
(99.64 %)		 158
(0.36 %)		 135
(100.00 %)		 3,301,020
(34.99 %)		 564,790
(1.35 %)		 12,217,069
(29.39 %)		 32,445
(1.06 %)
208 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 refseq)
GCF_004115265.1		 53,352
(3.13 %)		 18,647
(1.97 %)		 20,359
(1.68 %)		 n/a 40.54
(99.64 %)		 158
(0.36 %)		 134
(100.00 %)		 3,300,836
(34.99 %)		 564,789
(1.35 %)		 12,217,020
(29.39 %)		 32,445
(1.06 %)
209 greater mouse-eared bat (2019 Broad)
GCA_004026985.1		 n/a 23,153
(1.31 %)		 51,642
(1.43 %)		 n/a 43.16
(99.88 %)		 8,133
(0.04 %)		 1,053,330
(99.96 %)		 3,675,075
(25.48 %)		 938,700
(2.73 %)		 12,027,923
(39.01 %)		 80,955
(2.31 %)
210 greater pipefish (v1.1 2019)
GCA_901709675.1		 n/a 13,467
(5.26 %)		 42,380
(12.01 %)		 n/a 43.46
(100.00 %)		 43
(0.00 %)		 87
(100.00 %)		 193,442
(3.05 %)		 125,716
(4.25 %)		 1,676,004
(25.93 %)		 46,340
(13.40 %)
211 greater sac-winged bat (primary hap 2024 genbank)
GCA_036850765.1		 n/a 18,322
(1.40 %)		 21,049
(1.35 %)		 n/a 41.71
(98.73 %)		 468
(1.27 %)		 359
(99.59 %)		 4,247,148
(29.53 %)		 1,031,385
(2.50 %)		 12,465,194
(43.30 %)		 101,620
(2.01 %)
212 greater wax moth (Carbio01_MB 2019 genbank)
GCA_003640425.2		 20,814
(51.89 %)		 4,346
(0.99 %)		 12,930
(3.50 %)		 21,226
(7.60 %)		 33.06
(99.10 %)		 27,314
(0.92 %)		 13,303
(100.00 %)		 270,925
(3.18 %)		 86,050
(1.20 %)		 3,416,162
(48.29 %)		 11,043
(1.07 %)
213 green algae C.reinhardtii (v1 CC-503 cw92 v1 2007)
GCF_000002595.1		 14,484
(22.24 %)		 987
(0.55 %)		 11,299
(59.37 %)		 n/a 63.87
(87.58 %)		 10,425
(12.45 %)		 11,385
(87.55 %)		 167,652
(16.23 %)		 100,391
(4.60 %)		 734,057
(30.38 %)		 3,154
(63.45 %)
214 green algae C.variabilis (NC64A 2010 genbank)
GCA_000147415.1		 9,780
(62.01 %)		 743
(1.01 %)		 4,520
(67.55 %)		 n/a 67.14
(91.48 %)		 3,543
(8.55 %)		 3,810
(91.45 %)		 65,787
(8.35 %)		 28,736
(2.86 %)		 416,740
(37.15 %)		 776
(95.90 %)
215 green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 genbank)
GCA_000002595.3		 n/a 988
(0.56 %)		 9,689
(59.71 %)		 n/a 64.08
(96.36 %)		 1,459
(3.65 %)		 1,512
(96.35 %)		 171,684
(17.03 %)		 110,553
(6.12 %)		 748,240
(34.06 %)		 106
(99.48 %)
216 green monkey 1994-021 (2014 genbank)
GCA_000409795.2		 76,037
(46.89 %)		 20,079
(1.94 %)		 20,246
(1.25 %)		 n/a 40.81
(98.67 %)		 178,925
(1.35 %)		 163,017
(98.65 %)		 5,382,039
(50.20 %)		 980,479
(2.63 %)		 16,076,172
(35.62 %)		 50,033
(1.04 %)
217 green sea turtle (BGI 2013)
GCF_000344595.1		 31,786
(2.57 %)		 14,548
(1.02 %)		 15,297
(1.46 %)		 n/a 43.49
(95.57 %)		 134,344
(4.44 %)		 274,367
(95.56 %)		 1,615,553
(13.87 %)		 317,600
(2.08 %)		 11,732,990
(28.32 %)		 36,782
(0.70 %)
218 green sea turtle (v1 2020)
GCF_015237465.1		 56,917
(3.63 %)		 14,729
(1.06 %)		 17,439
(1.56 %)		 n/a 44.01
(99.44 %)		 294
(0.56 %)		 99
(100.00 %)		 1,641,730
(15.08 %)		 304,356
(1.25 %)		 11,136,918
(31.96 %)		 49,035
(1.44 %)
219 harbor porpoise (BS71 2019)
GCA_004363495.1		 n/a 21,044
(1.46 %)		 30,072
(1.23 %)		 n/a 41.83
(99.88 %)		 7,114
(0.03 %)		 1,338,272
(99.97 %)		 5,359,537
(46.83 %)		 772,736
(1.54 %)		 13,705,428
(42.29 %)		 80,965
(1.65 %)
220 Harpy eagle (primary hap 2022 genbank)
GCA_026419915.1		 51,641
(50.37 %)		 13,412
(1.70 %)		 24,002
(2.05 %)		 n/a 43.39
(99.80 %)		 342
(0.20 %)		 322
(100.00 %)		 456,476
(3.62 %)		 260,495
(7.70 %)		 5,658,773
(24.81 %)		 60,606
(5.66 %)
221 Hawaiian crow (2021 genbank)
GCA_020740725.1		 51,593
(54.67 %)		 12,737
(1.83 %)		 23,664
(2.30 %)		 n/a 43.30
(99.84 %)		 294
(0.16 %)		 187
(100.00 %)		 502,844
(6.10 %)		 304,680
(5.73 %)		 5,953,316
(23.59 %)		 46,108
(3.49 %)
222 Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U refseq)
GCF_002201575.1		 29,897
(1.95 %)		 19,404
(1.74 %)		 20,264
(1.41 %)		 33,412
(1.67 %)		 41.41
(97.77 %)		 38,833
(2.24 %)		 7,872
(100.00 %)		 4,547,865
(43.29 %)		 573,335
(1.09 %)		 13,374,928
(33.10 %)		 50,380
(1.45 %)
223 Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U genbank)
GCA_002201575.1		 n/a 19,385
(1.74 %)		 20,265
(1.41 %)		 33,375
(1.66 %)		 41.41
(97.77 %)		 38,833
(2.24 %)		 7,871
(100.00 %)		 4,629,031
(43.70 %)		 573,328
(1.09 %)		 13,374,887
(33.10 %)		 50,379
(1.45 %)
224 hippopotamus (v2 hap2 2023 genbank)
GCA_030028045.1		 64,153
(41.00 %)		 20,337
(1.62 %)		 20,633
(1.37 %)		 n/a 41.60
(100.00 %)		 226
(0.00 %)		 356
(100.00 %)		 3,783,435
(35.17 %)		 567,796
(3.38 %)		 13,462,481
(35.48 %)		 48,365
(1.91 %)
225 Honduran yellow-shouldered bat (v2.0 Veracruz 20B 2020)
GCF_014824575.1		 49,894
(2.81 %)		 18,317
(1.66 %)		 19,991
(1.63 %)		 n/a 42.33
(99.79 %)		 38,823
(0.21 %)		 27,486
(100.00 %)		 2,844,834
(29.10 %)		 367,443
(1.49 %)		 11,805,151
(31.26 %)		 59,262
(1.70 %)
226 hooded crow (v2 S_Up_H32 2017)
GCF_000738735.2		 35,874
(6.47 %)		 11,298
(1.84 %)		 17,627
(2.12 %)		 n/a 41.48
(97.07 %)		 27,795
(2.94 %)		 113
(100.00 %)		 392,199
(5.95 %)		 139,126
(0.76 %)		 6,141,002
(18.21 %)		 12,943
(0.48 %)
227 hooded crow (v5 S_Up_H32 2021)
GCF_000738735.5		 42,799
(57.51 %)		 11,845
(1.92 %)		 20,738
(2.23 %)		 n/a 42.10
(99.68 %)		 425
(0.32 %)		 47
(100.00 %)		 421,463
(6.12 %)		 164,830
(0.93 %)		 6,148,741
(19.00 %)		 25,266
(2.09 %)
228 horse (Twilight 2007 genbank)
GCA_000002305.1		 n/a 18,575
(1.67 %)		 17,121
(1.34 %)		 n/a 41.50
(98.14 %)		 45,680
(1.86 %)		 55,316
(98.14 %)		 3,941,878
(45.17 %)		 381,229
(1.99 %)		 14,674,265
(29.80 %)		 45,521
(1.52 %)
229 house finch (bHaeMex1 primary hap 2022 genbank)
GCA_027477595.1		 43,228
(49.63 %)		 12,700
(1.83 %)		 24,567
(2.38 %)		 n/a 42.91
(99.02 %)		 295
(0.98 %)		 183
(100.00 %)		 440,379
(3.17 %)		 463,164
(6.37 %)		 6,300,100
(23.47 %)		 30,897
(2.53 %)
230 house mouse (A_J v1 2016)
GCA_001624215.1		 n/a 21,171
(2.20 %)		 18,776
(1.40 %)		 102,254
(4.12 %)		 41.70
(89.34 %)		 365,877
(10.71 %)		 33,692
(96.01 %)		 5,186,523
(40.90 %)		 1,483,826
(3.06 %)		 13,614,266
(28.13 %)		 16,590
(0.42 %)
231 house mouse (AKR_J v1 2016)
GCA_001624295.1		 n/a 21,299
(2.19 %)		 18,730
(1.41 %)		 102,168
(4.09 %)		 41.70
(86.82 %)		 314,064
(13.22 %)		 40,550
(96.00 %)		 5,186,721
(40.97 %)		 1,485,719
(3.05 %)		 13,610,761
(27.42 %)		 16,745
(0.41 %)
232 house mouse (BALB_cJ v1 2016)
GCA_001632525.1		 n/a 21,337
(2.21 %)		 18,682
(1.41 %)		 102,138
(4.14 %)		 41.74
(88.91 %)		 361,689
(11.14 %)		 37,453
(95.84 %)		 5,096,953
(40.72 %)		 1,407,754
(2.90 %)		 13,416,041
(27.66 %)		 16,788
(0.42 %)
233 house mouse (CBA_J v1 2016)
GCA_001624475.1		 n/a 21,259
(2.23 %)		 18,593
(1.42 %)		 101,632
(4.14 %)		 41.78
(79.43 %)		 410,639
(20.63 %)		 42,242
(96.14 %)		 5,081,543
(40.40 %)		 1,393,763
(2.54 %)		 13,472,532
(24.46 %)		 16,809
(0.38 %)
234 house mouse (DBA_2J v1 2016)
GCA_001624505.1		 n/a 21,156
(2.23 %)		 18,610
(1.43 %)		 101,908
(4.18 %)		 41.80
(88.67 %)		 409,306
(11.39 %)		 42,324
(95.14 %)		 5,028,217
(40.37 %)		 1,364,702
(2.73 %)		 13,540,805
(27.33 %)		 16,544
(0.42 %)
235 house mouse (C3H_HeJ v1 2016)
GCA_001632575.1		 n/a 21,177
(2.22 %)		 18,550
(1.42 %)		 101,710
(4.15 %)		 41.74
(85.90 %)		 369,499
(14.15 %)		 37,497
(95.91 %)		 5,089,496
(40.41 %)		 1,399,438
(2.72 %)		 13,485,480
(26.52 %)		 16,675
(0.41 %)
236 house mouse (FVB_NJ v1 2016)
GCA_001624535.1		 n/a 21,195
(2.22 %)		 18,615
(1.42 %)		 101,520
(4.15 %)		 41.75
(89.39 %)		 380,840
(10.66 %)		 67,805
(93.73 %)		 5,037,447
(40.28 %)		 1,381,859
(2.89 %)		 13,440,164
(27.32 %)		 16,625
(0.42 %)
237 house mouse (GRCm38.p6 2017)
GCF_000001635.26		 123,667
(4.49 %)		 24,134
(2.09 %)		 22,855
(1.67 %)		 n/a 41.73
(97.18 %)		 904
(2.82 %)		 21,179
(97.18 %)		 5,554,281
(45.50 %)		 1,695,255
(3.40 %)		 13,041,229
(35.91 %)		 25,014
(0.54 %)
238 house mouse (LP_J v1 2016)
GCA_001632615.1		 n/a 21,012
(2.23 %)		 18,555
(1.43 %)		 101,892
(4.18 %)		 41.78
(84.14 %)		 402,247
(15.91 %)		 38,542
(95.89 %)		 5,032,748
(40.03 %)		 1,373,374
(2.60 %)		 13,411,126
(25.61 %)		 16,668
(0.40 %)
239 house mouse (NOD_ShiLtJ v1 2016)
GCA_001624675.1		 n/a 21,291
(2.24 %)		 19,697
(1.47 %)		 101,562
(4.18 %)		 42.00
(77.13 %)		 595,433
(22.95 %)		 66,154
(95.79 %)		 5,059,815
(40.57 %)		 1,370,443
(2.51 %)		 13,251,532
(23.62 %)		 18,188
(0.42 %)
240 house mouse (NZO_HlLtJ v1 2016)
GCA_001624745.1		 n/a 21,233
(2.22 %)		 18,805
(1.43 %)		 103,134
(4.18 %)		 41.74
(86.47 %)		 337,909
(13.58 %)		 57,439
(95.37 %)		 5,112,301
(40.60 %)		 1,418,629
(2.92 %)		 13,588,055
(27.01 %)		 16,857
(0.41 %)
241 human (GRCh38.p13 2019)
GCF_000001405.39		 172,809
(4.43 %)		 23,121
(1.97 %)		 27,697
(1.78 %)		 n/a 41.04
(95.07 %)		 1,268
(4.93 %)		 46,029
(95.07 %)		 5,859,855
(52.78 %)		 1,037,733
(4.60 %)		 16,933,424
(36.88 %)		 56,646
(1.06 %)
242 human (GRCh38.p14 2022)
GCF_000001405.40		 188,352
(5.12 %)		 23,474
(1.98 %)		 28,557
(1.86 %)		 n/a 41.05
(95.10 %)		 1,270
(4.90 %)		 46,502
(95.10 %)		 5,910,293
(52.77 %)		 1,047,827
(4.59 %)		 17,068,934
(36.82 %)		 57,427
(1.07 %)
243 human (NA24385.mat 2022)
GCA_021951015.1		 n/a 20,809
(1.82 %)		 21,369
(1.18 %)		 234,089
(4.92 %)		 40.85
(99.95 %)		 109
(0.05 %)		 355
(100.00 %)		 5,489,855
(53.93 %)		 1,085,681
(8.26 %)		 15,968,830
(40.95 %)		 53,511
(1.32 %)
244 human (NA24385.pat 2022)
GCA_021950905.1		 n/a 20,014
(1.81 %)		 20,716
(1.19 %)		 227,278
(4.91 %)		 40.87
(99.97 %)		 117
(0.03 %)		 514
(100.00 %)		 5,293,356
(54.01 %)		 1,100,786
(9.09 %)		 15,122,569
(41.27 %)		 52,546
(1.35 %)
245 human (NA24385.mat 2021)
GCA_018852615.1		 n/a 20,744
(1.84 %)		 21,968
(1.22 %)		 233,779
(4.92 %)		 40.85
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 445
(100.00 %)		 5,435,410
(53.40 %)		 1,086,871
(8.27 %)		 15,970,867
(40.97 %)		 53,581
(1.32 %)
246 human (NA24385.pat 2021)
GCA_018852605.1		 n/a 19,919
(1.83 %)		 21,582
(1.22 %)		 227,333
(4.91 %)		 40.87
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 610
(100.00 %)		 5,215,774
(53.54 %)		 1,094,036
(9.09 %)		 15,125,069
(41.29 %)		 52,653
(1.34 %)
247 human betaherpesvirus 6A (U1102 1995 genbank)
GCA_000845685.2		 n/a n/a n/a n/a 42.44
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 33
(1.67 %)		 36
(4.27 %)		 603
(9.83 %)		 3
(13.72 %)
248 human T2T CHM13 v2.0
GCA_009914755.4		 108,944
(51.73 %)		 20,844
(1.79 %)		 21,287
(1.16 %)		 n/a 40.75
(100.00 %)		 n/a 25
(100.00 %)		 5,591,082
(54.45 %)		 1,155,353
(8.89 %)		 16,163,340
(41.63 %)		 52,408
(1.38 %)
249 Iberian mole (v1 TD23 2020)
GCF_014898055.1		 46,872
(2.59 %)		 18,566
(1.67 %)		 20,793
(1.59 %)		 n/a 41.91
(99.98 %)		 3,640
(0.02 %)		 4,425
(100.00 %)		 3,269,038
(31.47 %)		 501,677
(1.32 %)		 11,176,747
(32.61 %)		 48,076
(2.80 %)
250 Iberian mole (v2 TD23 2020)
GCF_014898055.2		 46,746
(2.60 %)		 18,453
(1.69 %)		 20,410
(1.59 %)		 n/a 41.90
(99.98 %)		 3,639
(0.02 %)		 3,202
(100.00 %)		 2,637,156
(23.36 %)		 497,087
(1.30 %)		 10,984,260
(32.64 %)		 47,552
(2.89 %)
251 Indian glassy fish (v1 2019)
GCF_900634625.1		 44,096
(12.32 %)		 15,337
(3.60 %)		 23,988
(7.92 %)		 60,224
(10.41 %)		 42.38
(98.08 %)		 1,523
(1.92 %)		 156
(100.00 %)		 346,406
(3.02 %)		 163,522
(3.00 %)		 2,755,229
(25.07 %)		 17,930
(1.47 %)
252 Indian medaka
GCF_002922805.1		 47,300
(9.26 %)		 14,561
(2.50 %)		 31,867
(6.43 %)		 n/a 39.04
(94.73 %)		 51,440
(5.29 %)		 8,603
(100.00 %)		 319,637
(2.20 %)		 208,749
(2.67 %)		 5,412,794
(33.26 %)		 40,721
(2.36 %)
253 Jamaican fruit-eating bat (US092 2019 Broad)
GCA_004027435.1		 n/a 21,188
(1.26 %)		 41,550
(1.34 %)		 35,477
(1.51 %)		 42.19
(99.92 %)		 4,324
(0.02 %)		 798,700
(99.98 %)		 3,297,388
(28.66 %)		 476,792
(1.23 %)		 13,144,912
(34.13 %)		 81,685
(1.86 %)
254 Japanese quail
GCF_001577835.1		 47,008
(7.38 %)		 12,864
(2.55 %)		 36,126
(11.03 %)		 n/a 41.28
(98.88 %)		 11,601
(1.12 %)		 9,642
(98.88 %)		 466,141
(6.58 %)		 321,128
(2.22 %)		 5,497,911
(19.81 %)		 17,977
(1.86 %)
255 Jerdon's jumping ant (DR-91 v8.5 2018)
GCF_003227715.1		 29,097
(10.82 %)		 4,337
(1.33 %)		 43,907
(11.32 %)		 n/a 44.75
(99.72 %)		 499
(0.28 %)		 857
(100.00 %)		 439,110
(17.67 %)		 262,539
(5.69 %)		 1,834,301
(29.28 %)		 6,204
(9.08 %)
256 kakapo (Jane v1 2019)
GCF_004027225.1		 49,444
(5.77 %)		 13,114
(1.92 %)		 17,732
(2.50 %)		 29,004
(4.44 %)		 41.97
(97.63 %)		 362
(2.37 %)		 99
(100.00 %)		 548,758
(10.76 %)		 208,171
(1.07 %)		 6,258,082
(20.20 %)		 22,279
(1.75 %)
257 kakapo (Jane v2 2020 genbank)
GCA_004027225.2		 49,757
(54.33 %)		 13,112
(1.92 %)		 17,637
(2.48 %)		 n/a 41.97
(99.08 %)		 373
(0.92 %)		 90
(100.00 %)		 507,072
(7.85 %)		 208,180
(1.08 %)		 6,258,178
(20.50 %)		 22,278
(1.77 %)
258 koala (Bilbo 61053 2017)
GCF_002099425.1		 55,723
(2.15 %)		 17,500
(0.86 %)		 16,193
(0.94 %)		 n/a 39.05
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1,907
(100.00 %)		 7,814,631
(41.58 %)		 1,123,545
(2.03 %)		 21,796,057
(39.25 %)		 15,957
(0.35 %)
259 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 genbank)
GCA_009829125.1		 29,504
(53.56 %)		 14,221
(2.37 %)		 44,144
(5.80 %)		 41,384
(6.20 %)		 40.22
(99.05 %)		 700
(0.95 %)		 124
(100.00 %)		 423,338
(4.48 %)		 551,472
(7.22 %)		 4,887,148
(38.97 %)		 37,287
(2.58 %)
260 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 refseq)
GCF_009829125.1		 29,517
(6.48 %)		 14,243
(2.37 %)		 44,144
(5.80 %)		 41,421
(6.20 %)		 40.22
(99.05 %)		 700
(0.95 %)		 124
(100.00 %)		 423,274
(4.48 %)		 551,472
(7.22 %)		 4,887,142
(38.97 %)		 37,287
(2.58 %)
261 lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023638135.1		 48,561
(51.20 %)		 12,862
(1.69 %)		 21,562
(1.92 %)		 n/a 43.03
(99.83 %)		 158
(0.17 %)		 397
(100.00 %)		 439,975
(3.77 %)		 203,640
(6.96 %)		 6,921,438
(23.57 %)		 32,398
(2.65 %)
262 large cabbage white (genbank 2021)
GCA_905147105.1		 24,631
(60.59 %)		 4,550
(1.47 %)		 9,197
(5.18 %)		 30,394
(12.69 %)		 34.13
(100.00 %)		 29
(0.00 %)		 402
(100.00 %)		 123,352
(2.30 %)		 36,616
(6.05 %)		 2,431,238
(41.04 %)		 8,442
(2.49 %)
263 large tree shrew (BS70 2019 Broad)
GCA_004365275.1		 n/a 26,266
(0.71 %)		 59,868
(0.81 %)		 n/a 42.00
(99.77 %)		 6,466
(0.02 %)		 3,890,086
(99.98 %)		 7,163,973
(22.64 %)		 1,629,329
(2.64 %)		 18,970,992
(42.82 %)		 138,732
(1.75 %)
264 leatherback sea turtle (v3 2020 refseq G10K)
GCF_009764565.2		 62,576
(3.50 %)		 14,610
(1.03 %)		 16,359
(1.45 %)		 n/a 43.35
(99.74 %)		 667
(0.26 %)		 40
(100.00 %)		 1,637,236
(15.13 %)		 304,730
(1.14 %)		 11,121,967
(34.21 %)		 35,485
(1.36 %)
265 leatherback sea turtle (v1 2019 genbank G10K)
GCA_009764565.1		 n/a 14,572
(1.03 %)		 16,165
(1.42 %)		 n/a 43.36
(99.74 %)		 558
(0.26 %)		 55
(100.00 %)		 1,631,923
(15.09 %)		 303,440
(1.14 %)		 11,122,938
(34.12 %)		 35,505
(1.37 %)
266 leatherback sea turtle (v1 alternate hap 2019)
GCA_009762595.1		 n/a 10,857
(1.01 %)		 15,585
(1.46 %)		 n/a 43.54
(100.00 %)		 n/a 8,982
(100.00 %)		 1,090,219
(15.03 %)		 206,192
(1.19 %)		 7,154,939
(33.03 %)		 25,155
(1.42 %)
267 Leishmania infantum (JPCM5 2011 kinetoplastids genbank)
GCA_000002875.2		 n/a 591
(1.09 %)		 4,193
(46.51 %)		 n/a 59.58
(99.94 %)		 454
(0.06 %)		 76
(100.00 %)		 24,390
(4.61 %)		 4,228
(1.93 %)		 243,087
(20.97 %)		 92
(99.40 %)
268 Leishmania major (Friedlin 2011 kinetoplastids genbank)
GCA_000002725.2		 n/a 626
(1.15 %)		 4,290
(46.53 %)		 n/a 59.72
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 43
(100.00 %)		 33,021
(5.20 %)		 8,477
(2.43 %)		 238,932
(20.91 %)		 41
(99.80 %)
269 leopard (Maewha 2016 genbank)
GCA_001857705.1		 73,266
(49.50 %)		 18,874
(1.62 %)		 21,014
(1.44 %)		 n/a 41.71
(96.17 %)		 214,953
(3.85 %)		 265,329
(96.15 %)		 5,246,283
(42.87 %)		 1,059,443
(5.13 %)		 14,265,514
(32.20 %)		 77,000
(2.45 %)
270 lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 genbank)
GCA_000280705.1		 25,978
(33.60 %)		 19,393
(1.38 %)		 20,311
(1.35 %)		 n/a 41.87
(87.17 %)		 326,464
(12.87 %)		 337,359
(87.13 %)		 6,205,858
(38.76 %)		 832,823
(1.53 %)		 13,661,563
(33.98 %)		 26,669
(0.59 %)
271 lesser kestrel (v1 2021)
GCF_017639655.1		 47,420
(5.64 %)		 13,097
(1.80 %)		 22,203
(2.07 %)		 n/a 42.30
(99.66 %)		 298
(0.34 %)		 291
(100.00 %)		 516,498
(5.58 %)		 210,236
(1.26 %)		 7,133,927
(19.19 %)		 27,558
(2.21 %)
272 lesser rhea (primary hap 2023 genbank)
GCA_028389875.1		 39,024
(47.65 %)		 13,358
(1.72 %)		 23,870
(2.13 %)		 n/a 42.45
(99.89 %)		 128
(0.11 %)		 179
(100.00 %)		 674,141
(6.73 %)		 329,122
(5.34 %)		 6,820,211
(22.78 %)		 45,073
(5.83 %)
273 lesser sac-winged bat (primary hap 2024 genbank)
GCA_036850995.1		 n/a 18,322
(1.42 %)		 21,350
(1.39 %)		 n/a 41.84
(99.24 %)		 573
(0.76 %)		 345
(99.51 %)		 4,224,340
(28.69 %)		 1,030,574
(2.60 %)		 12,591,928
(42.30 %)		 98,189
(2.06 %)
274 lesser salmon catfish (fNeoGra1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027579695.1		 53,323
(53.05 %)		 15,841
(0.90 %)		 85,700
(3.30 %)		 n/a 42.44
(99.43 %)		 334
(0.57 %)		 38
(100.00 %)		 5,905,868
(49.76 %)		 1,126,468
(6.51 %)		 7,609,180
(62.74 %)		 166,630
(4.38 %)
275 lettuce (Salinas v7 2018)
GCF_002870075.1		 60,760
(2.83 %)		 16,272
(0.65 %)		 109,234
(6.86 %)		 n/a 37.79
(92.71 %)		 350,251
(7.33 %)		 11,453
(100.00 %)		 946,986
(1.96 %)		 983,572
(3.65 %)		 12,334,735
(53.11 %)		 117,678
(2.02 %)
276 lettuce (Salinas v8 2020)
GCF_002870075.3		 64,708
(2.94 %)		 16,252
(0.65 %)		 101,828
(6.36 %)		 n/a 37.79
(92.44 %)		 351,533
(7.59 %)		 9,960
(99.71 %)		 945,052
(1.95 %)		 983,641
(3.64 %)		 12,325,371
(53.00 %)		 117,703
(2.02 %)
277 live sharksucker (v1 2019)
GCF_900963305.1		 40,255
(11.91 %)		 14,975
(3.53 %)		 22,304
(7.09 %)		 56,266
(9.51 %)		 41.43
(99.89 %)		 140
(0.11 %)		 38
(100.00 %)		 448,828
(3.61 %)		 146,353
(1.65 %)		 3,204,476
(21.79 %)		 16,807
(1.33 %)
278 lumpfish (2019 genbank)
GCA_009769545.1		 41,612
(58.17 %)		 14,748
(3.32 %)		 49,223
(8.10 %)		 52,721
(8.34 %)		 42.83
(98.22 %)		 347
(1.78 %)		 49
(100.00 %)		 478,416
(6.02 %)		 421,634
(11.07 %)		 2,928,668
(27.98 %)		 53,323
(5.09 %)
279 Ma's night monkey genbank
GCA_000952055.2		 55,061
(41.68 %)		 21,084
(1.92 %)		 22,287
(1.31 %)		 n/a 40.74
(94.86 %)		 83,929
(5.15 %)		 112,850
(94.85 %)		 5,109,404
(47.71 %)		 734,754
(2.02 %)		 15,854,134
(33.62 %)		 36,070
(0.90 %)
280 Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 genbank)
GCA_001685135.1		 48,578
(30.31 %)		 19,449
(1.56 %)		 24,645
(1.37 %)		 41,235
(1.95 %)		 40.78
(92.27 %)		 984,656
(7.81 %)		 80,669
(100.00 %)		 3,063,619
(35.20 %)		 866,306
(3.08 %)		 13,310,826
(28.76 %)		 35,558
(0.84 %)
281 malo sina (v1 2012)
GCF_000231095.1		 29,549
(16.44 %)		 15,120
(6.45 %)		 49,515
(30.69 %)		 n/a 40.48
(93.32 %)		 20,693
(6.71 %)		 23,184
(93.29 %)		 115,049
(2.29 %)		 51,516
(1.90 %)		 1,488,940
(24.12 %)		 42,077
(12.05 %)
282 mangrove rivulus
GCF_001649575.1		 45,306
(11.02 %)		 14,510
(2.84 %)		 29,750
(6.81 %)		 n/a 40.03
(94.35 %)		 29,388
(5.66 %)		 3,073
(100.00 %)		 345,930
(2.32 %)		 146,268
(1.33 %)		 4,717,260
(27.31 %)		 39,557
(2.69 %)
283 meadow brown (genbank 2021)
GCA_905333055.1		 29,488
(69.09 %)		 4,863
(1.16 %)		 19,812
(6.60 %)		 27,763
(8.31 %)		 36.96
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 32
(100.00 %)		 227,482
(2.41 %)		 107,773
(3.02 %)		 2,456,144
(43.97 %)		 24,873
(3.15 %)
284 meerkat (BS45 2019 Broad)
GCA_004023905.1		 n/a 21,726
(1.54 %)		 31,908
(1.39 %)		 n/a 41.89
(99.96 %)		 4,153
(0.02 %)		 354,021
(99.98 %)		 4,835,157
(40.73 %)		 693,037
(1.32 %)		 13,779,279
(33.49 %)		 76,740
(2.37 %)
285 meercat (VVHF042 2019 DNA Zoo genbank)
GCA_006229205.1		 n/a 19,020
(1.63 %)		 19,812
(1.43 %)		 42,441
(2.08 %)		 41.68
(99.72 %)		 65,245
(0.28 %)		 63,791
(100.00 %)		 4,552,310
(40.02 %)		 634,179
(1.21 %)		 13,631,635
(32.17 %)		 64,849
(2.13 %)
286 melon fly (v1 USDA-PBARC White Pupae T1 2014)
GCF_000806345.1		 26,008
(10.49 %)		 7,743
(3.09 %)		 12,206
(6.18 %)		 n/a 35.15
(84.42 %)		 37,430
(15.62 %)		 43,002
(84.38 %)		 237,943
(3.36 %)		 74,977
(1.26 %)		 2,410,203
(31.96 %)		 15,259
(2.01 %)
287 minke whale (2013 genbank)
GCA_000493695.1		 42,553
(41.45 %)		 19,298
(1.81 %)		 18,661
(1.42 %)		 n/a 40.94
(94.06 %)		 173,296
(5.96 %)		 184,071
(94.04 %)		 4,041,828
(42.24 %)		 573,950
(1.48 %)		 13,504,295
(30.96 %)		 65,448
(1.38 %)
288 minke whale (primary hap 2023 genbank)
GCA_949987535.1		 61,711
(41.50 %)		 19,544
(1.49 %)		 21,502
(1.26 %)		 n/a 41.55
(99.99 %)		 1,177
(0.01 %)		 1,375
(100.00 %)		 4,006,932
(35.92 %)		 1,058,106
(12.08 %)		 12,708,154
(42.66 %)		 72,756
(1.59 %)
289 mites & ticks V.jacobsoni (v1 VJ856 2017)
GCF_002532875.1		 35,332
(12.83 %)		 2,750
(0.61 %)		 29,731
(8.07 %)		 n/a 40.94
(99.89 %)		 3,360
(0.11 %)		 8,241
(99.89 %)		 115,140
(1.18 %)		 39,880
(0.71 %)		 1,832,298
(14.55 %)		 31,479
(5.12 %)
290 Mongolian gerbil (US013 2019 Broad)
GCA_004026785.1		 n/a 21,302
(1.57 %)		 27,162
(1.27 %)		 40,982
(1.78 %)		 41.88
(99.90 %)		 11,139
(0.04 %)		 796,326
(99.96 %)		 5,253,752
(39.29 %)		 1,211,658
(3.13 %)		 13,894,596
(38.35 %)		 24,829
(0.69 %)
291 monito del monte (mDroGli1 primary hap 2021 genbank)
GCA_019393635.1		 47,034
(41.56 %)		 18,428
(0.81 %)		 15,519
(0.85 %)		 n/a 39.11
(99.91 %)		 260
(0.09 %)		 18
(100.00 %)		 7,426,369
(29.77 %)		 1,249,638
(2.12 %)		 21,135,395
(42.80 %)		 16,598
(0.36 %)
292 moth S.litura (Ishihara v1 2017)
GCF_002706865.1		 25,114
(8.87 %)		 5,088
(1.13 %)		 22,625
(7.19 %)		 n/a 36.56
(97.52 %)		 10,662
(2.49 %)		 13,637
(97.51 %)		 154,017
(1.49 %)		 50,642
(0.97 %)		 2,919,487
(37.00 %)		 34,396
(3.66 %)
293 mung bean (VC1973A 2015 genbank)
GCA_000741045.2		 n/a 16,645
(3.88 %)		 43,866
(14.64 %)		 n/a 33.16
(92.79 %)		 96,870
(7.25 %)		 2,463
(100.00 %)		 265,072
(3.32 %)		 198,918
(3.34 %)		 2,840,410
(34.89 %)		 13,926
(1.48 %)
294 mute swan (bCygOlo1 v1 primary hap 2019)
GCA_009769625.1		 n/a 12,973
(1.97 %)		 22,300
(2.18 %)		 n/a 41.92
(99.06 %)		 446
(0.94 %)		 181
(100.00 %)		 688,720
(7.65 %)		 301,358
(1.34 %)		 6,775,217
(21.21 %)		 31,271
(3.60 %)
295 mute swan (bCygOlo1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009769485.1		 n/a 10,083
(1.97 %)		 18,350
(2.23 %)		 n/a 42.22
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 5,616
(100.00 %)		 485,827
(7.06 %)		 212,892
(1.28 %)		 4,756,962
(19.95 %)		 25,670
(3.87 %)
296 naked mole-rat (NMR 29 2012 genbank)
GCA_000247695.1		 74,574
(44.06 %)		 21,317
(1.73 %)		 20,856
(1.51 %)		 n/a 40.21
(88.43 %)		 110,424
(11.59 %)		 114,652
(88.41 %)		 4,162,977
(32.77 %)		 484,933
(0.92 %)		 13,672,503
(27.63 %)		 31,950
(0.88 %)
297 narwhal (BS41 2019 Broad)
GCA_004026685.1		 n/a 21,418
(1.52 %)		 34,189
(1.28 %)		 n/a 41.35
(99.92 %)		 8,600
(0.03 %)		 653,473
(99.97 %)		 4,512,168
(44.82 %)		 592,047
(1.17 %)		 13,009,453
(37.18 %)		 63,033
(1.47 %)
298 Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027579445.1		 31,033
(46.15 %)		 12,385
(1.72 %)		 24,339
(2.24 %)		 n/a 43.01
(99.57 %)		 215
(0.43 %)		 77
(100.00 %)		 479,994
(3.33 %)		 443,098
(9.18 %)		 6,350,593
(25.82 %)		 31,693
(3.88 %)
299 nematode C.briggsae (AF16 v1 2008)
GCF_000004555.1		 19,404
(22.65 %)		 12,088
(12.63 %)		 7,533
(12.85 %)		 n/a 37.35
(97.22 %)		 6,713
(2.80 %)		 607
(99.95 %)		 116,909
(19.60 %)		 45,475
(4.23 %)		 820,686
(35.42 %)		 4,887
(1.65 %)
300 New South Wales waratah (AGSP 2013)
GCF_000471905.2		 36,251
(5.66 %)		 10,150
(1.34 %)		 42,117
(8.90 %)		 n/a 37.47
(94.63 %)		 39,556
(5.39 %)		 45,302
(94.61 %)		 396,916
(3.25 %)		 506,716
(6.41 %)		 4,768,175
(36.07 %)		 17,009
(0.90 %)
301 nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor genbank)
GCA_000208655.2		 n/a 21,293
(1.15 %)		 25,302
(1.09 %)		 n/a 40.77
(90.89 %)		 268,442
(9.13 %)		 314,971
(90.87 %)		 5,327,246
(49.09 %)		 651,311
(1.26 %)		 19,267,381
(38.27 %)		 139,552
(2.47 %)
302 nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor refseq)
GCF_000208655.1		 46,144
(1.87 %)		 21,316
(1.15 %)		 25,308
(1.09 %)		 n/a 40.77
(90.89 %)		 268,442
(9.13 %)		 314,972
(90.87 %)		 5,328,146
(49.10 %)		 651,316
(1.26 %)		 19,267,438
(38.27 %)		 139,552
(2.47 %)
303 North Atlantic right whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028564815.1		 n/a 19,541
(1.47 %)		 21,516
(1.25 %)		 n/a 41.69
(99.83 %)		 363
(0.17 %)		 779
(100.00 %)		 1,361,117
(2.23 %)		 836,632
(13.12 %)		 12,597,969
(44.00 %)		 93,862
(1.92 %)
304 northern elephant seal (v2 JK_09032017 2021)
GCF_021288785.1		 49,934
(2.73 %)		 20,106
(1.74 %)		 20,957
(1.35 %)		 n/a 41.51
(99.35 %)		 39,936
(0.65 %)		 142,455
(100.00 %)		 4,434,732
(35.01 %)		 588,877
(1.19 %)		 13,745,426
(32.96 %)		 52,064
(1.59 %)
305 northern house mosquito (v1 TS 2021)
GCF_016801865.1		 28,512
(7.14 %)		 5,830
(1.09 %)		 39,806
(8.27 %)		 n/a 36.76
(100.00 %)		 n/a 1,714
(100.00 %)		 222,294
(5.58 %)		 187,561
(9.87 %)		 3,009,613
(56.49 %)		 63,009
(9.78 %)
306 northern pike (2020 genbank)
GCA_011004845.1		 63,720
(60.35 %)		 16,616
(2.41 %)		 55,784
(5.64 %)		 82,918
(8.82 %)		 42.22
(99.89 %)		 112
(0.11 %)		 53
(100.00 %)		 1,039,521
(30.93 %)		 524,708
(7.32 %)		 4,691,094
(32.91 %)		 42,910
(2.52 %)
307 northern white-cheeked gibbon (2012 GGSC)
GCA_000146795.3		 n/a 20,134
(1.89 %)		 18,568
(1.14 %)		 n/a 40.76
(93.09 %)		 180,468
(6.94 %)		 197,908
(93.06 %)		 5,169,984
(51.90 %)		 831,865
(4.16 %)		 15,243,657
(35.77 %)		 65,761
(1.00 %)
308 Norway rat BN7 genbank
GCA_015227675.2		 n/a 21,523
(1.86 %)		 19,627
(1.36 %)		 54,530
(2.79 %)		 41.99
(99.19 %)		 581
(0.81 %)		 757
(99.19 %)		 4,895,563
(44.53 %)		 1,514,974
(3.57 %)		 13,450,428
(35.83 %)		 19,244
(0.46 %)
309 olive baboon (2017 HGSC RefSeq)
GCF_000264685.3		 84,433
(3.85 %)		 20,317
(1.83 %)		 21,239
(1.18 %)		 n/a 40.99
(99.25 %)		 58,981
(0.76 %)		 118,811
(99.24 %)		 5,525,293
(52.79 %)		 1,068,912
(5.55 %)		 16,068,088
(38.71 %)		 95,595
(1.41 %)
310 olive baboon (2017 HGSC genbank)
GCA_000264685.2		 n/a 20,319
(1.82 %)		 21,542
(1.19 %)		 n/a 40.99
(99.25 %)		 58,981
(0.76 %)		 118,810
(99.24 %)		 5,524,514
(52.78 %)		 1,068,912
(5.55 %)		 16,068,031
(38.71 %)		 95,595
(1.41 %)
311 painted lady (genbank 2021)
GCA_905220365.1		 20,948
(56.23 %)		 4,705
(1.06 %)		 15,277
(5.00 %)		 29,018
(10.11 %)		 33.42
(99.99 %)		 91
(0.01 %)		 37
(100.00 %)		 209,233
(2.16 %)		 56,676
(1.12 %)		 3,372,591
(44.40 %)		 13,547
(2.72 %)
312 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v1 2019)
GCF_004126475.1		 35,529
(2.39 %)		 18,185
(1.70 %)		 20,184
(1.64 %)		 41,094
(3.29 %)		 42.38
(98.92 %)		 831
(1.08 %)		 141
(100.00 %)		 3,072,951
(30.02 %)		 385,608
(0.80 %)		 12,060,365
(30.47 %)		 64,081
(4.30 %)
313 pea aphid (AL4f v1 2019)
GCF_005508785.1		 31,681
(7.81 %)		 4,257
(0.79 %)		 16,323
(3.39 %)		 n/a 29.76
(92.38 %)		 46,297
(7.65 %)		 21,920
(100.00 %)		 768,383
(18.87 %)		 135,468
(2.11 %)		 4,536,093
(48.39 %)		 16,332
(2.13 %)
314 peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634155.1		 49,100
(50.44 %)		 13,025
(1.67 %)		 24,167
(2.02 %)		 n/a 42.65
(99.69 %)		 232
(0.31 %)		 124
(100.00 %)		 586,316
(11.83 %)		 335,214
(8.05 %)		 7,038,700
(24.65 %)		 26,085
(2.25 %)
315 pigeon pea (v1 2016 BGI)
GCF_000340665.1		 46,646
(9.41 %)		 17,409
(3.12 %)		 51,529
(12.74 %)		 48,654
(8.33 %)		 32.79
(94.21 %)		 36,387
(5.81 %)		 72,923
(94.19 %)		 400,327
(3.60 %)		 306,656
(4.69 %)		 3,754,630
(39.24 %)		 26,578
(2.89 %)
316 pike-perch
GCF_008315115.1		 56,221
(8.23 %)		 15,677
(2.23 %)		 29,967
(5.65 %)		 62,989
(6.22 %)		 40.92
(100.00 %)		 94
(0.00 %)		 1,313
(100.00 %)		 591,660
(5.05 %)		 569,876
(7.39 %)		 4,713,605
(36.32 %)		 39,545
(1.93 %)
317 platypus (Pmale09 2018 BGI)
GCA_002966995.1		 n/a 15,042
(1.17 %)		 19,939
(1.55 %)		 n/a 46.64
(100.00 %)		 476
(0.00 %)		 4,568
(100.00 %)		 5,326,862
(52.88 %)		 879,598
(5.00 %)		 9,545,961
(50.95 %)		 94,468
(9.28 %)
318 platypus (Pmale09 v1 2019)
GCF_004115215.1		 56,708
(3.09 %)		 14,805
(1.26 %)		 18,918
(1.63 %)		 42,516
(2.60 %)		 46.13
(99.18 %)		 522
(0.82 %)		 305
(100.00 %)		 5,099,803
(51.62 %)		 577,434
(2.88 %)		 9,110,403
(48.91 %)		 87,829
(7.91 %)
319 platypus (Pmale09 v3 2020)
GCA_004115215.3		 n/a 14,805
(1.26 %)		 18,888
(1.63 %)		 n/a 46.14
(99.18 %)		 515
(0.82 %)		 322
(100.00 %)		 5,101,303
(51.62 %)		 578,617
(2.89 %)		 9,113,847
(48.93 %)		 87,861
(7.92 %)
320 polar bear (Baiyulong BGI 2014 genbank)
GCA_000687225.1		 35,751
(39.94 %)		 18,495
(1.67 %)		 15,243
(1.37 %)		 n/a 41.65
(98.35 %)		 110,343
(1.67 %)		 134,161
(98.33 %)		 4,221,025
(40.96 %)		 553,193
(1.29 %)		 13,765,526
(29.91 %)		 54,906
(1.17 %)
321 prehistoric monster fish (2019 genbank)
GCA_902500255.1		 45,404
(55.83 %)		 14,654
(0.76 %)		 72,609
(2.41 %)		 57,391
(2.04 %)		 41.99
(99.49 %)		 2,554
(0.51 %)		 464
(100.00 %)		 1,311,131
(2.79 %)		 786,401
(3.65 %)		 9,901,286
(59.90 %)		 172,199
(5.45 %)
322 pronghorn (BS35 2019 Broad)
GCA_004027515.1		 n/a 24,094
(1.34 %)		 35,119
(1.27 %)		 n/a 41.97
(99.87 %)		 6,569
(0.02 %)		 1,649,700
(99.98 %)		 5,613,563
(41.47 %)		 652,408
(1.55 %)		 13,943,055
(43.64 %)		 61,057
(1.17 %)
323 Przewalski's horse (Burgud 2014 genbank)
GCA_000696695.1		 45,076
(35.88 %)		 19,564
(1.68 %)		 22,124
(1.36 %)		 n/a 41.27
(99.13 %)		 80,963
(0.88 %)		 134,059
(99.12 %)		 3,917,534
(41.44 %)		 435,606
(1.73 %)		 14,738,354
(28.36 %)		 40,752
(0.94 %)
324 puma (SC36_Marlon 2018 genbank)
GCA_003327715.1		 25,575
(34.74 %)		 17,665
(1.56 %)		 16,565
(1.29 %)		 n/a 41.36
(95.34 %)		 178,992
(4.69 %)		 2,174
(100.00 %)		 4,884,619
(42.70 %)		 833,136
(1.76 %)		 13,705,706
(31.28 %)		 58,912
(1.65 %)
325 pygmy chimpanzee (Ulindi genbank 2015)
GCA_000258655.2		 59,332
(37.06 %)		 19,951
(1.94 %)		 19,039
(1.18 %)		 n/a 40.74
(82.95 %)		 156,797
(17.06 %)		 121,337
(82.94 %)		 5,136,492
(50.91 %)		 775,493
(1.63 %)		 15,570,612
(30.28 %)		 43,049
(0.71 %)
326 pygmy chimpanzee (v1 primary hap 2023)
GCF_029289425.1		 84,858
(3.73 %)		 20,765
(1.73 %)		 22,666
(1.18 %)		 n/a 40.49
(99.96 %)		 8
(0.04 %)		 443
(100.00 %)		 5,487,575
(50.65 %)		 1,054,555
(12.79 %)		 15,952,698
(43.80 %)		 53,329
(1.37 %)
327 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 1 2022 genbank)
GCA_026419965.1		 56,261
(41.31 %)		 18,495
(1.55 %)		 20,718
(1.32 %)		 n/a 42.05
(99.81 %)		 143
(0.19 %)		 580
(100.00 %)		 3,817,653
(34.51 %)		 758,297
(7.42 %)		 12,196,926
(39.96 %)		 101,353
(2.90 %)
328 rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 genbank)
GCA_009806435.2		 n/a 19,480
(1.31 %)		 23,335
(1.31 %)		 n/a 43.83
(97.68 %)		 18,178
(2.32 %)		 3,159
(100.00 %)		 4,179,975
(0.00 %)		 976,271
(2.33 %)		 13,766,353
(39.76 %)		 113,370
(2.46 %)
329 rabbit (Thorbecke 2009 Broad genbank)
GCA_000003625.1		 n/a 18,676
(1.38 %)		 20,095
(1.24 %)		 n/a 43.75
(95.14 %)		 80,789
(4.88 %)		 84,024
(95.12 %)		 4,884,561
(44.65 %)		 883,943
(1.73 %)		 13,254,559
(38.27 %)		 110,338
(2.33 %)
330 radish (v1 WS10039 2015)
GCF_000801105.1		 69,943
(20.66 %)		 33,762
(10.20 %)		 70,765
(28.80 %)		 n/a 35.29
(87.22 %)		 28,041
(12.80 %)		 10,676
(100.00 %)		 196,483
(2.53 %)		 150,132
(3.32 %)		 2,256,858
(26.65 %)		 23,381
(2.80 %)
331 red admiral (genbank 2021)
GCA_905147765.2		 n/a 4,641
(1.20 %)		 13,258
(4.79 %)		 32,725
(10.42 %)		 32.84
(100.00 %)		 18
(0.00 %)		 142
(100.00 %)		 184,094
(2.52 %)		 41,639
(1.23 %)		 3,193,736
(41.82 %)		 10,747
(2.25 %)
332 red-crested turaco (2014 BGI)
GCF_000709365.1		 16,151
(2.15 %)		 12,046
(1.50 %)		 25,077
(1.98 %)		 n/a 41.63
(99.43 %)		 75,085
(0.59 %)		 134,672
(99.41 %)		 401,465
(6.41 %)		 153,694
(0.86 %)		 6,705,299
(20.45 %)		 30,183
(1.07 %)
333 red-legged seriema (BGI_N322 2014 BGI)
GCF_000690535.1		 16,238
(2.21 %)		 12,016
(1.53 %)		 23,985
(1.93 %)		 n/a 41.20
(99.63 %)		 59,230
(0.38 %)		 112,704
(99.62 %)		 322,026
(4.02 %)		 121,725
(0.68 %)		 6,797,850
(18.25 %)		 18,873
(0.62 %)
334 red mason bee (LIB18336 2019)
GCF_004153925.1		 26,926
(16.13 %)		 4,185
(2.08 %)		 24,859
(11.07 %)		 n/a 39.77
(99.98 %)		 2,089
(0.02 %)		 10,222
(100.00 %)		 88,278
(1.96 %)		 74,016
(3.78 %)		 1,305,254
(28.61 %)		 10,712
(6.90 %)
335 red-throated loon (hap2 2023 genbank)
GCA_030936135.1		 25,173
(40.74 %)		 13,218
(1.71 %)		 28,120
(2.39 %)		 n/a 43.11
(100.00 %)		 249
(0.00 %)		 1,195
(100.00 %)		 544,427
(8.81 %)		 223,674
(5.77 %)		 6,669,469
(23.63 %)		 38,306
(3.37 %)
336 reedfish (2019)
GCF_900747795.1		 40,545
(1.73 %)		 13,154
(0.46 %)		 24,028
(1.29 %)		 34,856
(1.34 %)		 39.44
(93.75 %)		 5,614
(6.25 %)		 1,885
(100.00 %)		 1,834,613
(2.79 %)		 1,018,031
(2.36 %)		 20,081,632
(44.56 %)		 88,254
(1.06 %)
337 Rhesus monkey (2015 Baylor)
GCA_000772875.3		 n/a 20,558
(1.71 %)		 22,141
(1.12 %)		 n/a 40.95
(97.08 %)		 64,538
(2.91 %)		 348,579
(97.09 %)		 5,846,699
(54.61 %)		 1,429,378
(9.24 %)		 16,512,587
(40.26 %)		 98,572
(1.29 %)
338 Rice's whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028023285.1		 59,888
(43.60 %)		 19,291
(1.53 %)		 21,195
(1.30 %)		 n/a 41.44
(99.90 %)		 334
(0.10 %)		 774
(100.00 %)		 3,917,923
(36.26 %)		 828,521
(9.28 %)		 12,518,796
(41.08 %)		 73,126
(1.69 %)
339 rifleman (BGI 2014)
GCF_000695815.1		 16,166
(2.37 %)		 12,054
(1.65 %)		 23,851
(2.04 %)		 n/a 41.63
(99.55 %)		 66,437
(0.46 %)		 120,312
(99.54 %)		 392,481
(7.69 %)		 217,040
(2.27 %)		 5,855,355
(18.33 %)		 7,602
(0.24 %)
340 ring-tailed lemur BS26 Broad 2019
GCA_004024665.1		 n/a 21,125
(1.90 %)		 29,864
(1.51 %)		 65,909
(1.91 %)		 41.13
(99.93 %)		 4,599
(0.02 %)		 580,026
(99.98 %)		 3,840,645
(39.25 %)		 675,921
(1.83 %)		 13,841,750
(31.45 %)		 59,440
(1.72 %)
341 Rio pearlfish (Nwh7 v1 2020)
GCF_014905685.1		 25,353
(3.88 %)		 14,334
(1.56 %)		 58,475
(4.46 %)		 n/a 41.06
(92.01 %)		 100,521
(8.02 %)		 18,998
(100.00 %)		 642,988
(3.38 %)		 444,158
(3.06 %)		 6,203,124
(42.81 %)		 52,308
(2.11 %)
342 river trout (v1 2019)
GCF_901001165.1		 102,772
(6.02 %)		 27,413
(1.62 %)		 51,424
(4.17 %)		 121,979
(5.28 %)		 43.36
(96.90 %)		 3,941
(3.10 %)		 1,441
(100.00 %)		 1,438,988
(5.72 %)		 1,789,507
(15.87 %)		 9,819,761
(52.37 %)		 70,821
(1.77 %)
343 rock ptarmigan (primary hap 2022 genbank)
GCA_023343835.1		 51,619
(61.28 %)		 12,831
(2.31 %)		 n/a n/a 41.57
(99.99 %)		 210
(0.01 %)		 164
(100.00 %)		 667,924
(11.59 %)		 268,431
(2.63 %)		 5,885,274
(21.73 %)		 21,346
(2.37 %)
344 Ryukyu mouse (v1 2017 EBI genbank)
GCA_900094665.2		 53,779
(39.43 %)		 21,304
(2.26 %)		 18,211
(1.40 %)		 n/a 41.70
(89.05 %)		 306,650
(10.98 %)		 30,919
(92.71 %)		 4,878,260
(40.08 %)		 1,351,707
(2.59 %)		 12,965,226
(27.49 %)		 16,050
(0.44 %)
345 Ryukyu mouse (v1 2017 EBI refseq)
GCF_900094665.1		 53,855
(2.85 %)		 21,291
(2.26 %)		 19,256
(1.49 %)		 96,713
(4.05 %)		 41.70
(89.05 %)		 306,650
(10.98 %)		 30,920
(92.71 %)		 4,749,528
(39.06 %)		 1,351,707
(2.59 %)		 12,965,297
(27.49 %)		 16,050
(0.44 %)
346 saddleback dolphin (primary hap 2023 genbank)
GCA_949987515.1		 46,746
(40.70 %)		 18,625
(1.49 %)		 20,451
(1.28 %)		 n/a 42.06
(99.99 %)		 968
(0.01 %)		 631
(100.00 %)		 4,020,682
(35.99 %)		 1,259,549
(13.09 %)		 12,359,818
(42.64 %)		 66,179
(3.91 %)
347 Saker falcon (bFalChe1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634085.1		 50,290
(50.75 %)		 12,971
(1.67 %)		 23,351
(2.02 %)		 n/a 43.15
(99.70 %)		 258
(0.30 %)		 282
(100.00 %)		 548,087
(7.21 %)		 201,482
(8.55 %)		 7,030,761
(24.94 %)		 31,791
(2.57 %)
348 salmon louse (v1.1 2020)
GCF_016086655.2		 27,164
(5.26 %)		 3,465
(0.45 %)		 3,673
(1.75 %)		 n/a 30.90
(99.99 %)		 608
(0.01 %)		 10,436
(99.99 %)		 1,394,872
(53.53 %)		 76,419
(1.13 %)		 6,311,228
(43.85 %)		 647
(0.04 %)
349 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027887145.1		 27,528
(42.80 %)		 12,832
(1.69 %)		 25,514
(2.23 %)		 n/a 43.50
(99.76 %)		 363
(0.24 %)		 282
(100.00 %)		 541,958
(3.43 %)		 566,692
(13.38 %)		 6,205,274
(28.98 %)		 35,549
(5.05 %)
350 Sardinian treefrog (hap1 2023 genbank)
GCA_029499605.1		 108,406
(45.40 %)		 13,961
(0.46 %)		 36,603
(1.55 %)		 n/a 43.90
(99.99 %)		 2,297
(0.01 %)		 3,475
(100.00 %)		 1,903,658
(2.85 %)		 2,970,695
(16.56 %)		 15,354,615
(64.31 %)		 652,708
(8.36 %)
351 SARS-CoV-2 (Jan 2020 COVID-19)
GCF_009858895.2		 n/a n/a n/a n/a 37.98
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(0.24 %)		 1
(0.11 %)		 33
(1.38 %)		 1
(0.73 %)
352 sea anemones (CC7 2015 genbank)
GCA_001417965.1		 29,778
(59.32 %)		 3,020
(1.06 %)		 13,146
(12.99 %)		 30,497
(24.04 %)		 36.33
(82.34 %)		 637,478
(17.95 %)		 4,312
(100.00 %)		 74,671
(1.98 %)		 63,328
(2.24 %)		 1,417,036
(20.33 %)		 2,099
(0.38 %)
353 sea otter (GAN:26980312 2017 genbank)
GCA_002288905.2		 n/a 18,591
(1.64 %)		 20,913
(1.44 %)		 34,142
(1.77 %)		 41.56
(98.79 %)		 23,134
(1.21 %)		 29,588
(98.79 %)		 4,702,292
(41.42 %)		 721,749
(1.39 %)		 14,065,592
(32.89 %)		 55,388
(1.87 %)
354 segmented worms (v1 2012)
GCF_000326865.1		 23,426
(13.46 %)		 2,741
(0.95 %)		 3,156
(4.19 %)		 n/a 32.82
(91.54 %)		 11,185
(8.47 %)		 12,292
(91.53 %)		 572,062
(30.90 %)		 474,390
(10.49 %)		 1,741,644
(44.75 %)		 3,489
(0.51 %)
355 siamang (v1 Jambi primary hap 2023)
GCF_028878055.1		 79,118
(2.62 %)		 20,139
(1.70 %)		 21,232
(1.14 %)		 n/a 40.62
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 606
(100.00 %)		 5,278,880
(55.89 %)		 946,219
(14.68 %)		 14,395,605
(46.26 %)		 95,573
(1.75 %)
356 siamang (v2 Jambi primary hap 2024 genbank)
GCA_028878055.2		 105,360
(44.53 %)		 20,433
(1.69 %)		 21,357
(1.12 %)		 n/a 40.42
(99.97 %)		 1
(0.03 %)		 26
(100.00 %)		 5,354,441
(55.80 %)		 935,620
(14.70 %)		 14,917,483
(46.01 %)		 92,243
(1.42 %)
357 siamang (v2 Jambi primary hap 2024 refseq)
GCF_028878055.2		 105,373
(3.05 %)		 20,434
(1.69 %)		 21,357
(1.12 %)		 n/a 40.42
(99.97 %)		 2
(0.03 %)		 27
(100.00 %)		 5,354,446
(55.80 %)		 935,620
(14.70 %)		 14,917,515
(46.01 %)		 92,243
(1.42 %)
358 Siamese fighting fish (v2 2019)
GCF_900634795.2		 54,389
(16.95 %)		 14,745
(4.21 %)		 34,348
(10.09 %)		 62,673
(13.02 %)		 45.30
(99.99 %)		 328
(0.01 %)		 70
(100.00 %)		 252,955
(3.51 %)		 184,269
(4.62 %)		 2,010,934
(23.88 %)		 72,126
(13.08 %)
359 Siamese fighting fish (v3 2020)
GCF_900634795.3		 54,864
(17.78 %)		 14,745
(4.20 %)		 56,808
(10.87 %)		 69,466
(16.34 %)		 45.30
(99.99 %)		 328
(0.01 %)		 70
(100.00 %)		 255,550
(3.51 %)		 184,269
(4.62 %)		 2,010,934
(23.88 %)		 72,126
(13.08 %)
360 silvery gibbon (v1 HM0894 2020 UC Santa Cruz)
GCF_009828535.1		 54,238
(2.74 %)		 17,887
(2.00 %)		 18,517
(1.25 %)		 n/a 41.17
(98.20 %)		 18,567
(1.80 %)		 18,392
(100.00 %)		 4,399,357
(50.55 %)		 711,948
(2.37 %)		 12,623,705
(36.55 %)		 67,835
(1.30 %)
361 silvery gibbon (v2 HMO894 2020 UC Santa Cruz)
GCF_009828535.2		 63,475
(2.65 %)		 20,581
(1.94 %)		 21,181
(1.20 %)		 41,252
(1.46 %)		 41.02
(97.81 %)		 25,106
(2.19 %)		 18,395
(100.00 %)		 5,332,131
(51.09 %)		 857,562
(2.26 %)		 15,565,289
(36.84 %)		 80,124
(1.26 %)
362 slow loris (BS32 2019)
GCA_004027815.1		 n/a 26,771
(1.11 %)		 44,247
(1.00 %)		 n/a 40.68
(99.86 %)		 9,648
(0.03 %)		 1,946,791
(99.97 %)		 6,230,312
(41.68 %)		 688,924
(1.23 %)		 16,892,392
(43.00 %)		 39,326
(0.65 %)
363 slow loris (primary hap 2022 genbank)
GCA_027406575.1		 67,213
(41.75 %)		 22,195
(1.49 %)		 21,341
(1.28 %)		 n/a 40.82
(99.86 %)		 218
(0.14 %)		 85
(100.00 %)		 4,625,875
(39.88 %)		 579,984
(1.59 %)		 14,405,402
(40.78 %)		 38,257
(0.77 %)
364 small Madagascar hedgehog
GCA_000313985.1		 n/a 19,066
(1.18 %)		 19,334
(1.31 %)		 n/a 43.01
(88.44 %)		 269,444
(11.60 %)		 277,845
(88.40 %)		 3,789,866
(28.89 %)		 429,318
(0.87 %)		 16,950,647
(32.23 %)		 39,994
(0.70 %)
365 smaller spotted catshark (v1.1 primary hap 2020 refseq)
GCF_902713615.1		 55,762
(1.62 %)		 12,597
(0.36 %)		 23,987
(1.08 %)		 n/a 47.65
(98.48 %)		 7,146
(1.52 %)		 646
(100.00 %)		 1,185,832
(1.72 %)		 1,448,620
(6.25 %)		 20,884,767
(51.41 %)		 456,658
(8.18 %)
366 smalleye Pacific opah (hap2 2023 genbank)
GCA_029633865.1		 n/a 13,617
(1.10 %)		 74,639
(4.12 %)		 n/a 44.94
(99.96 %)		 3,115
(0.04 %)		 544
(100.00 %)		 4,603,649
(53.23 %)		 1,009,241
(18.00 %)		 5,236,063
(51.65 %)		 143,632
(7.43 %)
367 smalltooth sawfish (2019 genbank)
GCA_009764475.1		 n/a 11,828
(0.66 %)		 18,627
(1.55 %)		 n/a 42.38
(99.09 %)		 698
(0.91 %)		 173
(100.00 %)		 405,021
(1.14 %)		 391,531
(1.52 %)		 11,282,302
(38.19 %)		 45,398
(1.34 %)
368 snowberry fruit fly (East Lansing v1.0 2016)
GCF_001687245.1		 37,836
(4.45 %)		 10,526
(1.07 %)		 59,331
(6.34 %)		 n/a 36.53
(93.84 %)		 227,684
(6.18 %)		 139,583
(93.83 %)		 653,914
(2.87 %)		 386,956
(5.71 %)		 7,364,314
(43.00 %)		 60,636
(4.05 %)
369 sockeye salmon (On170113-E2 v1 2019)
GCF_006149115.1		 76,167
(6.12 %)		 24,114
(1.71 %)		 51,371
(4.08 %)		 102,891
(5.24 %)		 43.39
(96.16 %)		 25,659
(3.84 %)		 38,027
(99.99 %)		 1,300,179
(8.96 %)		 1,465,690
(10.81 %)		 8,849,714
(48.44 %)		 64,215
(1.55 %)
370 southern bluefin tuna (primary hap 2021 genbank)
GCA_910596095.1		 58,416
(66.24 %)		 15,695
(2.61 %)		 42,730
(5.74 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 95
(0.00 %)		 58
(100.00 %)		 1,591,314
(33.50 %)		 247,764
(2.94 %)		 5,176,850
(26.85 %)		 14,097
(0.88 %)
371 southern grasshopper mouse (US017 2019 Broad)
GCA_004026725.1		 n/a 24,302
(1.12 %)		 43,055
(0.98 %)		 n/a 41.63
(99.82 %)		 10,550
(0.03 %)		 2,272,285
(99.97 %)		 5,668,964
(24.75 %)		 1,628,683
(5.38 %)		 15,658,806
(41.85 %)		 21,801
(0.44 %)
372 southern tamandua (Broad 2019)
GCA_004025105.1		 n/a 25,638
(0.82 %)		 49,782
(0.86 %)		 n/a 39.53
(99.88 %)		 5,819
(0.02 %)		 2,150,023
(99.98 %)		 6,033,640
(37.10 %)		 708,890
(0.99 %)		 22,371,532
(41.88 %)		 80,897
(1.09 %)
373 southern two-toed sloth (US054 2019 Broad)
GCA_004027855.1		 n/a 25,877
(0.78 %)		 56,071
(0.82 %)		 n/a 39.82
(99.84 %)		 5,099
(0.02 %)		 2,537,432
(99.98 %)		 5,384,587
(37.86 %)		 724,925
(2.20 %)		 19,492,096
(41.12 %)		 55,674
(0.90 %)
374 southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 genbank)
GCA_000283155.1		 37,037
(37.57 %)		 18,551
(1.79 %)		 19,747
(1.44 %)		 n/a 40.90
(96.05 %)		 54,737
(3.96 %)		 57,823
(96.04 %)		 3,824,807
(39.33 %)		 421,693
(0.97 %)		 14,765,476
(28.93 %)		 36,281
(1.02 %)
375 soybean (US DOE JGI-PGF v2.0 2010)
GCF_000004515.4		 82,440
(9.65 %)		 27,682
(3.07 %)		 77,218
(11.84 %)		 n/a 34.77
(97.65 %)		 15,955
(2.35 %)		 17,146
(97.65 %)		 834,646
(37.35 %)		 436,219
(5.65 %)		 5,341,660
(45.30 %)		 35,897
(1.56 %)
376 soybean (US DOE JGI-PGF v2.1 2018)
GCF_000004515.5		 85,123
(9.72 %)		 27,647
(3.06 %)		 77,190
(11.83 %)		 n/a 34.77
(97.65 %)		 15,995
(2.36 %)		 17,187
(97.64 %)		 834,651
(37.35 %)		 436,225
(5.65 %)		 5,341,721
(45.30 %)		 35,897
(1.47 %)
377 speckled wood butterfly (genbank 2021)
GCA_905163445.1		 21,720
(55.73 %)		 4,713
(0.87 %)		 17,002
(4.33 %)		 29,238
(7.81 %)		 35.99
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 71
(100.00 %)		 304,077
(2.97 %)		 110,835
(4.09 %)		 3,704,355
(44.42 %)		 28,108
(2.75 %)
378 sperm whale (SW-GA 2019)
GCF_002837175.2		 60,921
(2.59 %)		 19,527
(1.73 %)		 25,114
(1.51 %)		 n/a 41.39
(95.90 %)		 128,928
(4.12 %)		 143,605
(95.88 %)		 4,365,057
(42.78 %)		 694,673
(2.40 %)		 13,518,590
(32.76 %)		 94,152
(2.52 %)
379 sponges A.queenslandica (v1.0 2010 JGI-PGF)
GCF_000090795.1		 31,248
(25.26 %)		 2,167
(1.08 %)		 6,648
(9.22 %)		 n/a 35.83
(86.92 %)		 14,944
(13.10 %)		 27,972
(86.90 %)		 108,973
(4.04 %)		 70,563
(4.66 %)		 881,116
(24.58 %)		 668
(0.62 %)
380 sterlet (v1 Gen_M01 2020)
GCF_010645085.1		 73,251
(5.76 %)		 24,411
(1.72 %)		 39,637
(3.96 %)		 n/a 39.76
(99.93 %)		 6,283
(0.07 %)		 3,404
(100.00 %)		 1,269,345
(3.50 %)		 1,095,665
(6.81 %)		 10,007,602
(39.30 %)		 60,475
(1.95 %)
381 sterlet (maternal hap 2022 genbank)
GCA_902713425.2		 n/a 25,364
(1.76 %)		 40,452
(4.10 %)		 n/a 40.11
(100.00 %)		 433
(0.00 %)		 1,731
(100.00 %)		 4,055,215
(43.14 %)		 1,124,096
(10.13 %)		 9,426,172
(41.81 %)		 64,522
(2.85 %)
382 stony coral S.pistillata (v1 CSM Monaco 2017)
GCF_002571385.1		 36,135
(16.45 %)		 3,324
(0.70 %)		 20,909
(10.93 %)		 38,198
(17.00 %)		 38.54
(89.50 %)		 49,077
(10.54 %)		 5,688
(100.00 %)		 111,077
(1.70 %)		 108,732
(2.95 %)		 2,009,396
(21.40 %)		 6,012
(0.58 %)
383 striped catfish (primary hap 2022 genbank)
GCA_027358585.1		 53,859
(65.52 %)		 16,035
(2.86 %)		 41,619
(5.48 %)		 n/a 38.99
(99.49 %)		 236
(0.51 %)		 59
(100.00 %)		 1,870,238
(37.80 %)		 605,571
(6.82 %)		 5,059,499
(32.43 %)		 17,919
(1.29 %)
384 Sumatran orangutan (Susie 2018 genbank)
GCA_002880775.3		 n/a 20,174
(1.79 %)		 20,994
(1.15 %)		 47,806
(1.68 %)		 40.80
(99.29 %)		 553
(0.70 %)		 5,813
(99.30 %)		 5,497,148
(54.41 %)		 1,048,361
(8.01 %)		 15,948,575
(40.68 %)		 39,481
(0.87 %)
385 Sumatran orangutan (v1 AG06213 primary hap 2023)
GCF_028885655.1		 98,046
(3.46 %)		 21,162
(1.68 %)		 21,714
(1.13 %)		 n/a 41.13
(99.79 %)		 59
(0.21 %)		 2,670
(99.79 %)		 5,730,768
(55.05 %)		 1,175,314
(11.19 %)		 16,323,507
(44.05 %)		 55,799
(2.08 %)
386 Swainson's thrush (bCatUst1 v1 primary hap 2019)
GCF_009819885.1		 40,128
(5.45 %)		 13,016
(1.88 %)		 24,787
(2.41 %)		 30,064
(2.94 %)		 42.48
(98.86 %)		 428
(1.14 %)		 161
(100.00 %)		 483,978
(5.85 %)		 589,859
(4.32 %)		 6,708,638
(22.44 %)		 49,404
(3.53 %)
387 Swainson's thrush (bCatUst1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009819505.1		 n/a 13,403
(1.85 %)		 27,456
(2.48 %)		 n/a 42.86
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 3,601
(100.00 %)		 497,374
(5.78 %)		 649,859
(4.89 %)		 6,740,713
(22.65 %)		 49,076
(3.54 %)
388 swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028018845.1		 29,544
(46.92 %)		 12,375
(1.75 %)		 24,577
(2.31 %)		 n/a 43.08
(99.89 %)		 236
(0.11 %)		 40
(100.00 %)		 419,473
(3.09 %)		 439,909
(7.61 %)		 6,077,743
(24.47 %)		 32,064
(3.27 %)
389 Tasmanian devil
GCF_000189315.1		 32,527
(1.79 %)		 16,112
(0.84 %)		 16,152
(0.94 %)		 n/a 36.05
(92.36 %)		 201,403
(7.66 %)		 237,291
(92.34 %)		 6,766,259
(42.85 %)		 1,240,681
(2.07 %)		 20,998,733
(36.61 %)		 23,155
(0.38 %)
390 thale cress (tair10 Columbia 2011)
GCF_000001735.3		 54,010
(40.19 %)		 26,552
(34.12 %)		 25,867
(35.78 %)		 n/a 36.06
(99.85 %)		 357
(0.16 %)		 7
(100.00 %)		 67,353
(16.32 %)		 27,063
(2.77 %)		 749,020
(22.64 %)		 4,599
(1.63 %)
391 thirteen-lined ground squirrel (2011)
GCF_000236235.1		 41,886
(2.61 %)		 19,165
(1.70 %)		 18,102
(1.44 %)		 n/a 39.91
(93.27 %)		 141,005
(6.75 %)		 153,488
(93.25 %)		 4,378,557
(36.61 %)		 640,337
(1.64 %)		 14,116,066
(27.91 %)		 28,321
(0.64 %)
392 thorny skate (CabotCenter1 v1 2020 genbank)
GCA_010909765.1		 45,969
(46.35 %)		 11,434
(0.60 %)		 26,342
(1.72 %)		 32,017
(1.87 %)		 44.30
(92.54 %)		 3,753
(7.46 %)		 958
(100.00 %)		 866,598
(2.58 %)		 1,176,350
(3.79 %)		 9,964,083
(52.25 %)		 242,676
(4.73 %)
393 thorny skate (CabotCenter1 v1 2020 refseq)
GCF_010909765.1		 45,969
(2.40 %)		 11,433
(0.60 %)		 26,341
(1.72 %)		 32,017
(1.87 %)		 44.30
(92.54 %)		 3,753
(7.46 %)		 957
(100.00 %)		 865,711
(2.57 %)		 1,176,348
(3.79 %)		 9,964,038
(52.25 %)		 242,676
(4.73 %)
394 tidepool copepod (San Diego 2019 genbank)
GCA_007210705.1		 23,429
(54.20 %)		 3,517
(1.61 %)		 18,910
(15.71 %)		 n/a 42.18
(97.94 %)		 14,007
(2.09 %)		 459
(100.00 %)		 52,042
(1.17 %)		 27,065
(1.23 %)		 928,666
(18.11 %)		 15,823
(5.51 %)
395 tiger tail seahorse (QL1 v1 2016)
GCF_001891065.1		 47,041
(13.29 %)		 13,817
(3.76 %)		 32,943
(8.81 %)		 n/a 43.30
(93.04 %)		 23,101
(6.97 %)		 60,478
(93.03 %)		 359,724
(3.91 %)		 155,380
(3.35 %)		 2,811,700
(24.51 %)		 61,685
(7.72 %)
396 tomato (v3.0 Heinz 1706 2018)
GCF_000188115.4		 46,015
(6.94 %)		 15,396
(2.15 %)		 38,462
(7.56 %)		 n/a 34.12
(90.18 %)		 19,634
(9.83 %)		 3,150
(100.00 %)		 417,162
(18.21 %)		 229,803
(3.18 %)		 5,370,478
(35.28 %)		 25,279
(1.28 %)
397 tsetse fly (v1 IAEA_lab_2018 2020)
GCF_014805625.1		 24,334
(8.13 %)		 7,223
(2.32 %)		 6,632
(3.62 %)		 n/a 33.80
(97.46 %)		 9,688
(2.55 %)		 7,986
(100.00 %)		 418,532
(4.76 %)		 185,734
(2.26 %)		 3,090,742
(35.34 %)		 3,487
(0.58 %)
398 two-lined caecilian (v1.1 2019 refseq)
GCF_901001135.1		 56,617
(1.50 %)		 14,448
(0.38 %)		 40,572
(1.31 %)		 n/a 44.40
(99.36 %)		 3,573
(0.64 %)		 1,330
(100.00 %)		 2,263,606
(1.94 %)		 2,036,108
(4.34 %)		 29,400,958
(44.09 %)		 602,912
(6.66 %)
399 Ugandan red Colobus (RC106 v1 2017)
GCA_002776525.1		 n/a 21,053
(1.88 %)		 23,024
(1.24 %)		 n/a 40.68
(96.59 %)		 77,615
(3.42 %)		 47,644
(100.00 %)		 5,478,730
(51.13 %)		 969,126
(2.63 %)		 16,127,854
(36.40 %)		 63,965
(1.04 %)
400 Ugandan red Colobus (RC106 v2 2018)
GCF_002776525.2		 66,965
(2.69 %)		 21,958
(1.85 %)		 24,388
(1.22 %)		 55,722
(1.95 %)		 40.60
(97.10 %)		 63,620
(2.91 %)		 47,449
(100.00 %)		 5,699,639
(51.61 %)		 1,066,606
(2.87 %)		 16,603,622
(37.49 %)		 71,084
(1.08 %)
401 Ugandan red Colobus (RC106 v3 2019)
GCF_002776525.3		 68,173
(2.68 %)		 21,804
(1.85 %)		 23,385
(1.18 %)		 n/a 40.60
(97.10 %)		 64,415
(2.91 %)		 46,654
(100.00 %)		 5,700,226
(51.61 %)		 1,066,759
(2.88 %)		 16,603,818
(37.49 %)		 71,078
(1.08 %)
402 Ugandan red Colobus (RC106 v4 2019)
GCF_002776525.4		 63,704
(2.55 %)		 21,347
(1.86 %)		 23,056
(1.19 %)		 n/a 40.84
(97.07 %)		 57,757
(2.93 %)		 34,372
(100.00 %)		 5,504,117
(51.70 %)		 961,351
(2.75 %)		 16,208,033
(37.10 %)		 71,046
(1.10 %)
403 Upper Galilee mountains blind mole rat (#2095 2014 genbank)
GCA_000622305.1		 54,667
(35.81 %)		 19,685
(1.25 %)		 21,268
(1.20 %)		 n/a 41.26
(95.18 %)		 201,121
(4.83 %)		 356,096
(95.17 %)		 6,165,270
(34.95 %)		 1,197,778
(2.77 %)		 16,282,333
(36.21 %)		 22,905
(0.49 %)
404 valley oak (v3.0 2019)
GCF_001633185.1		 63,555
(8.16 %)		 16,886
(1.90 %)		 72,876
(14.48 %)		 n/a 35.38
(99.77 %)		 1,674
(0.23 %)		 2,010
(100.00 %)		 800,389
(3.72 %)		 460,244
(7.41 %)		 5,439,256
(37.83 %)		 19,635
(1.10 %)
405 vegetable marrow (v1 mu-cu-16 2017)
GCF_002806865.1		 48,870
(21.91 %)		 19,421
(7.41 %)		 36,314
(20.76 %)		 n/a 36.49
(94.25 %)		 49,649
(5.76 %)		 25,263
(100.00 %)		 182,696
(3.35 %)		 143,269
(7.40 %)		 1,620,517
(29.12 %)		 13,323
(2.49 %)
406 wasp C.solmsi marchali (v1 2013)
GCF_000503995.1		 13,201
(7.14 %)		 3,474
(1.25 %)		 15,142
(4.89 %)		 n/a 30.36
(99.55 %)		 7,471
(0.46 %)		 9,928
(99.54 %)		 340,841
(7.52 %)		 251,386
(3.99 %)		 2,448,273
(49.27 %)		 16,346
(4.08 %)
407 water buffalo (Mediterranean 2013)
GCA_000471725.1		 n/a 20,245
(1.49 %)		 24,230
(1.29 %)		 n/a 42.11
(97.39 %)		 263,385
(2.62 %)		 630,367
(97.38 %)		 5,997,926
(47.35 %)		 466,019
(1.02 %)		 13,822,739
(40.29 %)		 93,080
(1.71 %)
408 Weddell seal (WS11-02 2013 genbank)
GCA_000349705.1		 48,251
(30.18 %)		 21,044
(1.72 %)		 22,320
(1.43 %)		 n/a 41.39
(70.44 %)		 152,836
(29.58 %)		 169,546
(70.42 %)		 4,420,479
(41.72 %)		 471,250
(0.66 %)		 13,410,191
(22.09 %)		 48,738
(1.01 %)
409 western European hedgehog (2012 genbank)
GCA_000296755.1		 29,923
(35.25 %)		 18,034
(1.33 %)		 19,779
(1.35 %)		 n/a 41.54
(85.94 %)		 219,764
(14.09 %)		 225,566
(85.91 %)		 6,527,125
(45.87 %)		 1,271,531
(2.29 %)		 12,374,069
(42.02 %)		 28,528
(0.71 %)
410 western European hedgehog (primary hap 2023 genbank)
GCA_950295315.1		 61,103
(44.10 %)		 18,126
(1.16 %)		 21,345
(1.28 %)		 n/a 42.00
(99.97 %)		 3,760
(0.03 %)		 1,175
(100.00 %)		 4,891,344
(19.68 %)		 1,507,933
(3.81 %)		 12,571,193
(54.50 %)		 32,667
(0.90 %)
411 western European house mouse (WSB_EiJ v1 2016)
GCA_001624835.1		 n/a 20,870
(2.26 %)		 18,535
(1.45 %)		 100,622
(4.22 %)		 41.80
(84.36 %)		 399,976
(15.70 %)		 72,315
(94.81 %)		 4,961,700
(39.53 %)		 1,345,987
(2.51 %)		 13,324,808
(25.23 %)		 16,556
(0.40 %)
412 western lowland gorilla (Susie 2016)
GCA_900006655.3		 n/a 20,323
(1.77 %)		 22,069
(1.15 %)		 n/a 40.71
(99.64 %)		 768
(0.36 %)		 16,065
(99.64 %)		 5,373,630
(50.30 %)		 1,025,389
(10.17 %)		 15,954,613
(41.78 %)		 53,557
(1.01 %)
413 western lowland gorilla (v1.1 KB3781 2023)
GCF_029281585.1		 101,242
(3.18 %)		 20,994
(1.57 %)		 41,945
(1.53 %)		 n/a 40.59
(99.85 %)		 38
(0.15 %)		 637
(100.00 %)		 5,526,927
(51.16 %)		 1,080,693
(20.38 %)		 15,929,020
(48.46 %)		 76,432
(1.35 %)
414 western painted turtle (v303 2014)
GCF_000241765.3		 51,681
(3.25 %)		 15,203
(1.04 %)		 22,272
(1.67 %)		 46,230
(2.32 %)		 44.19
(91.88 %)		 183,744
(8.14 %)		 262,326
(91.86 %)		 2,767,141
(30.92 %)		 316,971
(0.98 %)		 11,856,824
(28.95 %)		 104,231
(1.84 %)
415 western painted turtle (v304 RCT428 2020)
GCF_000241765.4		 64,798
(3.75 %)		 15,669
(1.09 %)		 21,663
(1.64 %)		 n/a 44.19
(87.54 %)		 184,311
(12.48 %)		 260,698
(87.52 %)		 3,780,252
(41.81 %)		 316,422
(0.93 %)		 11,852,305
(27.59 %)		 103,899
(1.75 %)
416 western predatory mite (v1.0 2012)
GCF_000255335.1		 12,199
(13.86 %)		 2,842
(1.49 %)		 27,198
(19.18 %)		 n/a 51.58
(99.74 %)		 1,901
(0.26 %)		 3,993
(99.74 %)		 33,136
(1.10 %)		 13,115
(0.57 %)		 612,854
(9.73 %)		 2,003
(54.71 %)
417 western wild mouse (SPRET_EiJ v1 2016)
GCA_001624865.1		 n/a 21,211
(2.19 %)		 17,797
(1.36 %)		 100,839
(4.01 %)		 41.65
(89.10 %)		 334,091
(10.95 %)		 29,259
(98.77 %)		 5,087,807
(40.60 %)		 1,402,357
(3.14 %)		 13,522,663
(27.99 %)		 16,888
(0.42 %)
418 wheat stem sawfly (v1 2014)
GCF_000341935.1		 37,175
(25.01 %)		 4,407
(2.81 %)		 15,504
(11.96 %)		 n/a 40.34
(98.12 %)		 8,733
(1.89 %)		 10,707
(98.11 %)		 87,084
(2.38 %)		 44,673
(2.55 %)		 1,001,343
(22.18 %)		 7,519
(2.78 %)
419 white-beaked dolphin (primary hap 2023 genbank)
GCA_949774975.1		 59,982
(41.87 %)		 18,737
(1.57 %)		 20,767
(1.34 %)		 n/a 41.91
(99.99 %)		 1,070
(0.01 %)		 410
(100.00 %)		 3,820,566
(36.21 %)		 922,103
(8.43 %)		 12,304,360
(39.74 %)		 68,551
(3.58 %)
420 white-footed mouse
GCF_004664715.1		 46,167
(2.56 %)		 20,406
(1.72 %)		 20,857
(1.46 %)		 39,081
(1.88 %)		 42.23
(100.00 %)		 79
(0.00 %)		 1,763
(100.00 %)		 5,064,597
(30.73 %)		 1,258,088
(2.85 %)		 14,005,845
(33.01 %)		 23,475
(0.69 %)
421 white leghorn X broiler chicken (leghorn haplotype v1 2021)
GCF_016700215.1		 55,865
(8.86 %)		 12,310
(2.41 %)		 22,056
(2.57 %)		 n/a 42.20
(99.65 %)		 254
(0.35 %)		 509
(99.65 %)		 604,452
(10.76 %)		 232,416
(2.03 %)		 5,541,059
(20.23 %)		 22,185
(2.62 %)
422 white-tailed deer (Pink-7 2017 genbank)
GCA_002102435.1		 57,774
(39.81 %)		 20,653
(1.75 %)		 23,083
(1.50 %)		 40,950
(1.94 %)		 41.55
(99.10 %)		 107,030
(0.91 %)		 48,652
(99.10 %)		 4,799,958
(41.28 %)		 413,128
(2.59 %)		 13,296,686
(34.22 %)		 44,165
(1.19 %)
423 white-tufted-ear marmoset (CJ-08-46 2017)
GCA_002754865.1		 n/a 21,754
(1.86 %)		 21,668
(1.22 %)		 n/a 40.77
(99.67 %)		 48,495
(0.33 %)		 88,439
(99.67 %)		 5,195,965
(48.83 %)		 825,714
(3.60 %)		 15,372,168
(38.05 %)		 34,994
(0.85 %)
424 white-tufted-ear marmoset (v1.0 paternal 2020)
GCA_011100535.1		 n/a 20,939
(1.94 %)		 20,416
(1.31 %)		 n/a 41.04
(99.58 %)		 788
(0.42 %)		 336
(100.00 %)		 4,869,007
(49.39 %)		 746,577
(2.68 %)		 14,347,286
(37.59 %)		 35,222
(0.94 %)
425 white-tufted-ear marmoset (v1.2 2021 genbank)
GCA_011100555.2		 n/a 21,801
(1.88 %)		 21,501
(1.28 %)		 n/a 40.92
(99.52 %)		 1,165
(0.48 %)		 1,234
(100.00 %)		 5,036,594
(47.71 %)		 842,846
(3.25 %)		 15,161,577
(38.08 %)		 37,603
(0.93 %)
426 white-tufted-ear marmoset (2010 Wash U)
GCF_000004665.1		 58,109
(2.92 %)		 21,699
(1.91 %)		 20,910
(1.24 %)		 n/a 40.85
(94.45 %)		 187,214
(5.57 %)		 201,523
(94.43 %)		 5,120,629
(48.95 %)		 768,432
(2.30 %)		 15,303,718
(34.75 %)		 35,805
(0.79 %)
427 white-tufted-ear marmoset (cj1700 genbank)
GCA_009663435.1		 n/a 21,729
(1.89 %)		 21,502
(1.30 %)		 n/a 40.85
(98.70 %)		 370
(1.30 %)		 1,360
(98.70 %)		 5,122,418
(49.40 %)		 818,502
(3.68 %)		 15,232,829
(38.20 %)		 36,656
(0.90 %)
428 whooping crane (maternal hap 2023 genbank)
GCA_028858705.1		 55,408
(53.40 %)		 13,572
(1.81 %)		 24,739
(2.19 %)		 n/a 43.07
(99.63 %)		 262
(0.37 %)		 929
(100.00 %)		 616,295
(10.57 %)		 211,557
(2.90 %)		 6,785,134
(22.11 %)		 42,795
(4.66 %)
429 wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 genbank)
GCA_000311805.2		 n/a 18,785
(1.94 %)		 17,252
(1.62 %)		 n/a 41.28
(98.83 %)		 60,971
(1.18 %)		 68,871
(98.82 %)		 3,098,525
(34.75 %)		 353,630
(1.23 %)		 12,349,553
(25.12 %)		 45,436
(1.02 %)
430 wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.0 2019)
GCF_002162155.1		 131,302
(1.34 %)		 33,079
(0.33 %)		 567,762
(8.14 %)		 n/a 45.99
(96.70 %)		 344,768
(3.31 %)		 148,396
(100.00 %)		 2,762,705
(2.81 %)		 2,991,142
(3.37 %)		 493,164
(96.69 %)		 2,220,897
(25.33 %)
431 wild peanut A.duranensis (v1 V14167 2017)
GCF_000817695.2		 69,091
(6.81 %)		 16,823
(1.67 %)		 75,740
(11.45 %)		 n/a 35.81
(86.74 %)		 133,967
(13.30 %)		 3,189
(98.45 %)		 588,761
(3.39 %)		 493,855
(3.35 %)		 5,206,772
(45.36 %)		 48,008
(1.88 %)
432 wild strawberry (2011 genbank)
GCA_000184155.1		 n/a 14,001
(6.64 %)		 34,562
(26.90 %)		 n/a 38.40
(94.26 %)		 16,253
(5.76 %)		 16,459
(94.24 %)		 152,427
(20.00 %)		 74,539
(2.79 %)		 1,032,592
(21.43 %)		 14,802
(3.20 %)
433 wire-tailed manakin (2018)
GCF_003945595.1		 50,529
(5.75 %)		 12,950
(1.89 %)		 19,252
(2.57 %)		 24,522
(2.44 %)		 42.30
(100.00 %)		 102
(0.00 %)		 3,744
(100.00 %)		 500,823
(7.17 %)		 300,638
(2.31 %)		 6,414,267
(20.54 %)		 28,268
(2.21 %)
434 woodchuck (CNAG 2019)
GCA_901343595.1		 n/a 20,813
(1.60 %)		 23,199
(1.43 %)		 45,153
(1.99 %)		 40.00
(97.18 %)		 57,045
(2.82 %)		 105,556
(97.18 %)		 4,756,333
(33.73 %)		 836,503
(2.41 %)		 14,755,960
(31.13 %)		 34,151
(0.87 %)
435 woodchuck (v1.0 LI92 2021)
GCF_021218885.1		 62,044
(2.80 %)		 19,783
(1.48 %)		 21,060
(1.38 %)		 n/a 39.92
(100.00 %)		 46
(0.00 %)		 3,381
(100.00 %)		 3,884,968
(28.12 %)		 912,591
(2.73 %)		 14,538,767
(35.15 %)		 36,919
(1.02 %)
436 Yangtze finless porpoise (v1 2018 refseq)
GCF_003031525.1		 43,312
(2.49 %)		 18,639
(1.72 %)		 19,645
(1.46 %)		 n/a 41.28
(99.29 %)		 52,647
(0.72 %)		 66,346
(99.28 %)		 n/a 540,765
(1.65 %)		 12,691,760
(32.87 %)		 59,052
(1.48 %)
437 Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 genbank)
GCA_000442215.1		 27,063
(35.76 %)		 19,219
(1.73 %)		 27,456
(1.66 %)		 n/a 41.30
(98.69 %)		 124,797
(1.33 %)		 155,509
(98.67 %)		 4,277,556
(44.10 %)		 690,534
(1.95 %)		 13,025,034
(35.19 %)		 67,035
(1.82 %)
438 Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 refseq)
GCF_000442215.1		 27,063
(1.65 %)		 19,227
(1.75 %)		 27,468
(1.66 %)		 n/a 41.30
(98.69 %)		 124,797
(1.33 %)		 155,510
(98.67 %)		 4,193,317
(43.38 %)		 690,534
(1.95 %)		 13,025,097
(35.19 %)		 67,035
(1.82 %)
439 Yangtze finless porpoise (v1 wild 2018 genbank)
GCA_003031525.1		 43,299
(41.33 %)		 18,726
(1.80 %)		 19,644
(1.46 %)		 n/a 41.28
(99.29 %)		 52,647
(0.72 %)		 66,345
(99.28 %)		 3,990,044
(42.54 %)		 540,765
(1.65 %)		 12,691,683
(32.88 %)		 59,052
(1.48 %)
440 yellow-bellied marmot (v1 2018)
GCF_003676075.1		 41,573
(2.14 %)		 19,845
(1.63 %)		 21,262
(1.39 %)		 n/a 39.88
(97.82 %)		 38,354
(2.18 %)		 69,503
(97.82 %)		 4,683,625
(34.38 %)		 799,659
(1.95 %)		 14,322,765
(32.58 %)		 34,127
(0.91 %)
441 yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.0 2019)
GCF_003676075.2		 42,715
(2.16 %)		 19,894
(1.62 %)		 21,366
(1.40 %)		 43,878
(1.99 %)		 39.89
(97.96 %)		 35,595
(2.04 %)		 66,624
(97.96 %)		 4,646,957
(34.05 %)		 800,897
(1.96 %)		 14,340,028
(32.63 %)		 34,125
(0.91 %)
442 yellow-footed antechinus (v1 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021)
GCA_016432865.1		 n/a 15,703
(0.78 %)		 16,184
(0.90 %)		 n/a 36.21
(99.99 %)		 620
(0.01 %)		 487
(100.00 %)		 5,424,579
(25.40 %)		 1,269,774
(2.59 %)		 21,430,550
(42.69 %)		 28,121
(0.66 %)
443 yellow-throated sandgrouse (BGI_N339 2014 BGI)
GCF_000699245.1		 15,990
(2.25 %)		 11,775
(1.55 %)		 23,935
(1.90 %)		 n/a 41.36
(99.67 %)		 48,553
(0.34 %)		 107,160
(99.66 %)		 384,032
(4.45 %)		 182,309
(1.03 %)		 6,529,534
(19.24 %)		 15,660
(0.55 %)
444 yellowtail amberjack (v1 SW California HSWRI2012SDOR001 2017)
GCF_002814215.1		 41,168
(9.96 %)		 15,861
(2.76 %)		 30,671
(6.00 %)		 n/a 40.75
(97.79 %)		 33,664
(2.20 %)		 99,598
(100.00 %)		 614,513
(4.16 %)		 522,349
(4.83 %)		 4,650,538
(24.98 %)		 18,054
(0.96 %)
445 wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 primary hap 2023 genbank)
GCA_029207755.1		 n/a 13,052
(1.78 %)		 24,950
(2.30 %)		 n/a 43.93
(100.00 %)		 353
(0.00 %)		 1,695
(100.00 %)		 444,866
(3.08 %)		 473,471
(7.97 %)		 5,336,498
(25.82 %)		 37,210
(3.14 %)
446 zebra finch (Black17 v1 2019 genbank)
GCA_003957565.2		 n/a 13,212
(2.02 %)		 25,117
(2.57 %)		 38,655
(7.10 %)		 42.04
(99.78 %)		 312
(0.22 %)		 135
(100.00 %)		 535,521
(8.50 %)		 550,118
(4.01 %)		 6,519,872
(21.47 %)		 30,053
(2.58 %)
447 zebra finch (Black17 v1 2019 refseq)
GCF_003957565.1		 51,472
(7.16 %)		 13,211
(2.02 %)		 17,812
(2.70 %)		 38,655
(7.10 %)		 42.04
(99.78 %)		 312
(0.22 %)		 135
(100.00 %)		 535,521
(8.50 %)		 550,118
(4.01 %)		 6,519,872
(21.47 %)		 30,053
(2.58 %)
448 zebra shark (hap1 2023 genbank)
GCA_030684315.1		 n/a 12,291
(0.48 %)		 16,769
(1.14 %)		 n/a 43.41
(99.47 %)		 1,159
(0.53 %)		 835
(100.00 %)		 8,087,543
(64.92 %)		 798,373
(9.17 %)		 14,838,773
(42.39 %)		 45,284
(1.67 %)
449 zebu cattle (Nelore 2014 genbank)
GCA_000247795.2		 n/a 18,599
(1.58 %)		 18,779
(1.29 %)		 n/a 41.75
(92.62 %)		 6,941,272
(7.66 %)		 253,769
(92.59 %)		 5,118,783
(46.84 %)		 358,908
(0.88 %)		 13,431,620
(36.60 %)		 35,241
(0.84 %)
450 zig-zag eel (v1.1 2018)
GCF_900324485.1		 44,813
(12.05 %)		 15,028
(3.35 %)		 21,782
(6.89 %)		 36,982
(11.22 %)		 40.66
(97.63 %)		 235
(2.37 %)		 126
(100.00 %)		 348,517
(2.87 %)		 157,776
(2.00 %)		 3,182,742
(23.42 %)		 12,824
(1.08 %)
TOTALS:total assembly count 450

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