Legacy Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of legacy only.

See also: hub access, assembly statistics


Data resource links

NOTE: Click on the column headers to sort the table by that column
The link to genome browser will attach only that single assembly to the genome browser.
The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 aardvark (BS58 2019 Broad)
GCA_004365145.1		 n/a 22,095
(0.63 %)		 44,942
(0.68 %)		 n/a 40.25
(99.86 %)		 15,429
(0.03 %)		 2,690,873
(99.97 %)		 8,755,250
(34.47 %)		 869,360
(1.26 %)		 22,002,517
(59.65 %)		 39,239
(0.49 %)
2 Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 genbank)
GCA_027172205.1		 57,514
(54.61 %)		 14,340
(1.37 %)		 20,053
(2.31 %)		 n/a 43.81
(100.00 %)		 30
(0.00 %)		 27
(100.00 %)		 832,937
(4.17 %)		 474,203
(4.04 %)		 7,020,288
(38.29 %)		 94,745
(2.70 %)
3 African clawed frog (2016)
GCF_001663975.1		 61,172
(3.82 %)		 23,424
(1.78 %)		 27,990
(2.23 %)		 n/a 38.98
(88.63 %)		 216,028
(11.39 %)		 324,061
(88.61 %)		 1,726,079
(12.81 %)		 680,428
(2.28 %)		 13,887,586
(35.94 %)		 85,680
(0.94 %)
4 African grass rat (v1 paternal X 2020 genbank)
GCA_011762505.1		 45,963
(36.56 %)		 20,933
(2.00 %)		 19,613
(1.43 %)		 37,929
(2.32 %)		 41.39
(99.19 %)		 1,624
(0.81 %)		 1,596
(100.00 %)		 4,940,083
(37.33 %)		 1,674,970
(5.40 %)		 13,613,540
(32.71 %)		 17,767
(0.51 %)
5 African malaria mosquito (PEST 2006)
GCA_000005575.1		 n/a 5,478
(2.34 %)		 30,482
(13.88 %)		 n/a 44.27
(95.26 %)		 8,735
(4.75 %)		 8,115
(99.79 %)		 241,805
(14.48 %)		 72,702
(2.39 %)		 1,434,880
(21.28 %)		 25,507
(8.25 %)
6 African savanna elephant (2009 genbank)
GCA_000001905.1		 46,043
(34.84 %)		 19,181
(1.25 %)		 19,665
(1.10 %)		 n/a 40.76
(97.57 %)		 93,514
(2.45 %)		 95,866
(97.55 %)		 6,337,637
(57.82 %)		 365,796
(0.88 %)		 16,073,052
(44.89 %)		 33,513
(0.68 %)
7 alkali bee (v1.2 Touchet_males 2018)
GCF_003710045.1		 27,736
(10.71 %)		 4,020
(1.34 %)		 42,185
(10.12 %)		 n/a 40.41
(94.37 %)		 14,031
(5.59 %)		 95,883
(100.00 %)		 112,828
(2.21 %)		 95,886
(3.63 %)		 2,006,114
(27.47 %)		 23,832
(3.81 %)
8 alpaca (2015 BGI)
GCA_000767525.1		 n/a 18,513
(1.97 %)		 19,112
(1.70 %)		 31,905
(1.94 %)		 41.46
(99.38 %)		 23,458
(0.62 %)		 75,733
(99.38 %)		 3,095,742
(36.41 %)		 314,508
(1.07 %)		 12,365,152
(25.46 %)		 53,956
(1.50 %)
9 alpaca (v3.1 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U)
GCF_000164845.3		 55,014
(3.56 %)		 18,437
(1.94 %)		 18,446
(1.63 %)		 n/a 41.40
(95.85 %)		 166,280
(4.17 %)		 77,390
(100.00 %)		 3,150,224
(36.21 %)		 315,108
(1.36 %)		 12,461,739
(24.88 %)		 54,502
(1.38 %)
10 Alpine marmot (2015)
GCF_001458135.1		 35,350
(2.23 %)		 20,139
(1.58 %)		 18,286
(1.41 %)		 n/a 39.80
(96.07 %)		 89,362
(3.94 %)		 14,543
(100.00 %)		 n/a 747,129
(1.83 %)		 14,077,162
(30.27 %)		 30,224
(0.63 %)
11 American alligator (2023 genbank)
GCA_030867065.1		 n/a 14,487
(0.97 %)		 20,444
(1.61 %)		 n/a 45.04
(99.81 %)		 136
(0.19 %)		 806
(99.81 %)		 3,380,365
(43.12 %)		 560,127
(2.00 %)		 12,524,244
(32.47 %)		 50,852
(2.67 %)
12 American alligator (chrom assembly 2023 genbank)
GCA_030867095.1		 60,799
(51.66 %)		 14,382
(0.98 %)		 18,601
(1.45 %)		 n/a 45.01
(99.30 %)		 161
(0.70 %)		 194
(100.00 %)		 3,322,619
(43.19 %)		 478,206
(1.77 %)		 12,316,391
(32.01 %)		 49,792
(2.45 %)
13 American beaver (US014 2019 Broad)
GCA_004027675.1		 n/a 22,515
(1.25 %)		 34,527
(1.17 %)		 n/a 39.58
(99.92 %)		 5,769
(0.02 %)		 837,916
(99.98 %)		 5,101,904
(34.46 %)		 552,100
(1.02 %)		 15,150,706
(34.57 %)		 24,558
(0.63 %)
14 American bison (2014 genbank)
GCA_000754665.1		 38,686
(33.79 %)		 20,215
(1.44 %)		 20,845
(1.20 %)		 n/a 41.99
(93.39 %)		 341,984
(6.63 %)		 792,165
(93.37 %)		 6,006,931
(47.67 %)		 495,106
(1.11 %)		 13,902,115
(39.01 %)		 90,767
(1.29 %)
15 American pika 3.0 (2012 Broad genbank)
GCA_000292845.1		 26,240
(36.96 %)		 17,569
(1.60 %)		 20,092
(1.69 %)		 n/a 43.35
(87.20 %)		 122,542
(12.82 %)		 132,961
(87.18 %)		 2,829,934
(29.80 %)		 414,895
(1.07 %)		 10,968,663
(26.71 %)		 44,651
(1.14 %)
16 amphioxus (hap2 2024 genbank)
GCA_035083965.1		 n/a 5,217
(0.97 %)		 41,736
(12.73 %)		 n/a 41.61
(100.00 %)		 103
(0.00 %)		 34
(100.00 %)		 128,505
(1.65 %)		 182,123
(8.03 %)		 2,157,899
(27.45 %)		 44,261
(5.21 %)
17 amphipods H.azteca (HAZT.00-mixed v2.0 2016)
GCF_000764305.1		 24,008
(8.48 %)		 3,331
(0.47 %)		 38,201
(8.97 %)		 24,453
(8.50 %)		 38.47
(99.52 %)		 23,726
(0.48 %)		 23,426
(99.52 %)		 161,274
(1.72 %)		 432,436
(8.89 %)		 3,517,080
(28.92 %)		 50,987
(4.44 %)
18 Amur tiger (TaeGuk 2013 genbank)
GCA_000464555.1		 33,668
(37.51 %)		 18,213
(1.58 %)		 15,093
(1.29 %)		 n/a 41.40
(97.59 %)		 155,553
(2.44 %)		 157,031
(97.56 %)		 4,832,679
(42.49 %)		 831,134
(1.67 %)		 13,654,373
(31.78 %)		 65,229
(1.60 %)
19 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 genbank)
GCA_003957555.2		 n/a 12,258
(1.95 %)		 20,580
(2.26 %)		 n/a 41.49
(98.48 %)		 429
(1.52 %)		 160
(100.00 %)		 535,315
(7.95 %)		 262,056
(1.51 %)		 6,092,351
(20.84 %)		 17,130
(1.48 %)
20 ant C.costatus (v1 MS0001 2016)
GCF_001594065.1		 16,082
(8.44 %)		 4,038
(1.42 %)		 32,856
(9.80 %)		 n/a 34.73
(95.75 %)		 10,626
(4.26 %)		 26,005
(95.74 %)		 203,498
(3.41 %)		 100,483
(2.15 %)		 2,221,362
(35.19 %)		 18,108
(3.49 %)
21 ant N.fulva (TAMU-Nful-2015 v1.0 2019)
GCF_005281655.1		 28,261
(10.34 %)		 4,915
(1.27 %)		 40,257
(10.17 %)		 n/a 35.18
(99.51 %)		 1,076
(0.49 %)		 2,869
(100.00 %)		 322,753
(4.92 %)		 245,412
(6.65 %)		 1,952,946
(43.11 %)		 17,048
(6.08 %)
22 ant T.cornetzi (Tcor2-1 v1.0 2016 BGI)
GCF_001594075.1		 22,023
(8.25 %)		 4,211
(1.25 %)		 37,113
(9.30 %)		 n/a 35.01
(91.82 %)		 40,822
(8.21 %)		 60,583
(91.79 %)		 218,162
(3.24 %)		 139,385
(2.26 %)		 2,347,922
(34.62 %)		 23,814
(3.66 %)
23 apicomplexans C.sp. chipmunk genotype I (37763 2021 genbank)
GCA_004936735.2		 n/a 426
(3.03 %)		 203
(12.39 %)		 n/a 32.03
(100.00 %)		 10
(0.00 %)		 50
(100.00 %)		 3,358
(1.88 %)		 1,257
(0.81 %)		 67,711
(20.74 %)		 4
(0.02 %)
24 apicomplexans E.tenella (Houghton 2013)
GCA_000499545.1		 n/a 326
(0.37 %)		 1,632
(4.94 %)		 n/a 51.33
(98.72 %)		 8,063
(1.32 %)		 12,727
(98.68 %)		 127,265
(17.42 %)		 148,397
(16.77 %)		 326,694
(37.33 %)		 12,417
(22.22 %)
25 apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 genbank)
GCA_002114115.1		 n/a 22,542
(3.52 %)		 67,060
(16.20 %)		 n/a 38.04
(88.95 %)		 7,175
(11.05 %)		 806
(100.00 %)		 692,611
(50.80 %)		 322,540
(4.42 %)		 3,033,193
(35.58 %)		 25,871
(1.75 %)
26 Arabian camel (2014 genbank)
GCA_000767585.1		 n/a 18,452
(1.96 %)		 16,975
(1.61 %)		 n/a 41.29
(98.88 %)		 72,775
(1.13 %)		 105,347
(98.87 %)		 3,079,920
(34.79 %)		 319,928
(0.96 %)		 12,281,845
(25.28 %)		 48,638
(1.17 %)
27 Arctic fox (US066 2019 Broad)
GCA_004023825.1		 n/a 22,910
(1.42 %)		 31,985
(1.20 %)		 35,342
(1.47 %)		 41.93
(99.87 %)		 9,604
(0.04 %)		 1,272,949
(99.96 %)		 6,096,013
(44.89 %)		 1,265,350
(2.67 %)		 14,617,986
(39.29 %)		 64,716
(1.93 %)
28 ascomycetes A.fischeri (v3 NRRL 181 2006)
GCF_000149645.2		 10,390
(48.16 %)		 1,538
(3.76 %)		 6,155
(25.19 %)		 n/a 49.56
(99.97 %)		 90
(0.03 %)		 466
(99.97 %)		 5,026
(0.77 %)		 2,256
(0.38 %)		 68,790
(5.94 %)		 2,846
(42.44 %)
29 ascomycetes A.nidulans (FGSC A4 2012 genbank)
GCA_000149205.2		 n/a 1,524
(3.90 %)		 5,275
(23.90 %)		 n/a 50.30
(99.43 %)		 158
(0.58 %)		 249
(99.42 %)		 5,218
(3.22 %)		 2,452
(0.41 %)		 51,693
(4.64 %)		 1,128
(90.37 %)
30 ascomycetes A.niger CBS 513.88 (v3 2007)
GCF_000002855.3		 10,608
(51.05 %)		 1,481
(3.36 %)		 5,692
(22.11 %)		 n/a 50.35
(99.87 %)		 662
(0.13 %)		 469
(99.87 %)		 9,986
(1.32 %)		 2,619
(0.36 %)		 106,480
(7.71 %)		 5,568
(53.86 %)
31 ascomycetes A.rabiei (Mel4 2019)
GCF_004011695.1		 11,257
(41.02 %)		 1,596
(2.91 %)		 8,283
(26.43 %)		 n/a 49.20
(100.00 %)		 n/a 34
(100.00 %)		 14,775
(2.01 %)		 16,031
(2.34 %)		 103,256
(17.19 %)		 805
(44.28 %)
32 ascomycetes B.dermatitidis (ER-3 2009 genbank)
GCA_000003525.2		 n/a 1,516
(1.76 %)		 5,714
(11.07 %)		 n/a 37.07
(99.50 %)		 566
(0.51 %)		 593
(99.49 %)		 38,696
(2.74 %)		 27,571
(2.05 %)		 270,617
(48.64 %)		 8,002
(10.69 %)
33 ascomycetes B.gilchristii (SLH14081 2009 genbank)
GCA_000003855.2		 n/a 1,518
(1.57 %)		 5,702
(9.73 %)		 n/a 35.75
(98.67 %)		 1,691
(1.34 %)		 1,794
(98.66 %)		 42,930
(2.67 %)		 27,826
(1.78 %)		 328,698
(50.87 %)		 7,943
(9.35 %)
34 ascomycetes C.posadasii (C735 delta SOWgp 2009 genban)
GCA_000151335.1		 n/a 1,479
(4.26 %)		 5,283
(25.22 %)		 n/a 46.59
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 88
(100.00 %)		 10,463
(5.97 %)		 5,206
(0.91 %)		 74,027
(11.89 %)		 4,784
(34.49 %)
35 ascomycetes F.oxysporum (NRRL 32931 2014 genbank)
GCA_000271745.2		 n/a 1,503
(2.37 %)		 11,741
(30.20 %)		 n/a 47.63
(98.55 %)		 377
(1.46 %)		 545
(98.54 %)		 8,453
(2.23 %)		 3,560
(0.37 %)		 129,150
(7.65 %)		 14,398
(29.11 %)
36 ascomycetes P.destructans (20631-21 2010 genbank)
GCA_000184105.1		 n/a 1,446
(3.95 %)		 5,635
(25.84 %)		 n/a 50.12
(92.42 %)		 2,066
(7.59 %)		 3,579
(92.41 %)		 11,499
(5.71 %)		 11,754
(2.10 %)		 87,648
(13.51 %)		 4,483
(54.70 %)
37 ascomycetes P.digitatum (Pd1 2012 genbank)
GCA_000315645.2		 n/a 1,461
(4.51 %)		 5,599
(29.85 %)		 n/a 48.91
(95.53 %)		 516
(4.48 %)		 562
(95.52 %)		 3,575
(0.59 %)		 2,210
(0.38 %)		 66,810
(6.03 %)		 7,344
(38.10 %)
38 ascomycetes P.pennisetigena (Br36 2019 genbank)
GCA_004337985.1		 n/a 1,482
(2.32 %)		 7,302
(20.85 %)		 n/a 47.48
(99.41 %)		 1,281
(0.60 %)		 108
(100.00 %)		 24,268
(1.88 %)		 11,049
(1.23 %)		 163,225
(20.20 %)		 764
(17.56 %)
39 ascomycetes P.rubens (Wisconsin 54-1255 2008 genbank)
GCA_000226395.1		 n/a 1,550
(3.72 %)		 7,756
(30.06 %)		 n/a 48.96
(99.94 %)		 775
(0.06 %)		 49
(100.00 %)		 5,678
(0.78 %)		 4,560
(0.81 %)		 73,645
(5.86 %)		 7,807
(50.55 %)
40 ascomycetes R.enersibuu (CBS 393.64 2015 genbank)
GCA_000968595.1		 n/a 1,499
(4.04 %)		 3,608
(17.47 %)		 n/a 50.55
(99.99 %)		 76
(0.00 %)		 938
(100.00 %)		 12,877
(1.80 %)		 4,459
(0.56 %)		 116,737
(10.53 %)		 2,561
(81.62 %)
41 ascomycetes S.macrospora (v2 k-hell 2012)
GCF_000182805.2		 9,903
(39.44 %)		 1,311
(2.58 %)		 4,612
(17.66 %)		 n/a 52.11
(99.64 %)		 978
(0.36 %)		 1,583
(100.00 %)		 16,540
(1.85 %)		 7,316
(0.76 %)		 171,684
(11.10 %)		 1,770
(49.40 %)
42 ascomycetes S.schenckii (1099-18 2015 genbank)
GCA_000961545.1		 10,279
(51.22 %)		 1,134
(2.55 %)		 2,026
(10.60 %)		 n/a 54.96
(100.00 %)		 57
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 15,846
(2.28 %)		 8,000
(0.94 %)		 169,678
(13.75 %)		 22
(99.61 %)
43 ascomycetes T.marneffei (ATCC 18224 2008 genbank)
GCA_000001985.1		 n/a 1,532
(4.18 %)		 7,679
(34.14 %)		 n/a 46.67
(99.38 %)		 137
(0.62 %)		 589
(99.38 %)		 6,404
(1.04 %)		 2,594
(0.58 %)		 61,594
(6.70 %)		 5,746
(15.84 %)
44 ascomycetes Z.tritici (IPO323 2011 genbank)
GCA_000219625.1		 10,941
(44.32 %)		 1,451
(2.81 %)		 6,906
(25.36 %)		 n/a 52.14
(99.98 %)		 3
(0.02 %)		 24
(99.98 %)		 8,941
(1.69 %)		 8,367
(1.51 %)		 99,818
(11.14 %)		 27
(96.31 %)
45 Asian corn borer (v1 ACB-3 2019)
GCF_004193835.1		 25,279
(7.94 %)		 4,931
(1.05 %)		 28,608
(7.16 %)		 n/a 37.50
(100.00 %)		 34,722
(0.01 %)		 7,722
(100.00 %)		 146,974
(1.35 %)		 89,987
(2.68 %)		 2,666,250
(38.74 %)		 39,696
(5.22 %)
46 Asian corn borer (v2 ACB-3 2019)
GCF_004193835.2		 25,169
(7.95 %)		 4,867
(1.05 %)		 28,255
(7.08 %)		 n/a 37.49
(100.00 %)		 34,702
(0.01 %)		 6,269
(100.00 %)		 150,783
(1.53 %)		 89,885
(2.69 %)		 2,627,296
(38.56 %)		 39,511
(5.22 %)
47 Asian swallowtail (v1 2015)
GCF_000836235.1		 22,417
(13.18 %)		 5,290
(2.15 %)		 13,925
(7.00 %)		 n/a 33.81
(97.56 %)		 5,205
(2.44 %)		 10,777
(97.56 %)		 122,491
(2.29 %)		 27,169
(0.71 %)		 2,130,840
(38.92 %)		 11,899
(2.85 %)
48 Asian tiger mosquito (C6/36 2017 genbank)
GCA_001876365.2		 n/a 10,893
(0.53 %)		 128,502
(8.33 %)		 n/a 40.42
(100.00 %)		 n/a 2,434
(100.00 %)		 605,350
(2.88 %)		 921,761
(7.40 %)		 11,169,474
(57.07 %)		 220,674
(10.38 %)
49 Asian tiger mosquito (v1 FPA 2019 genbank
GCA_006496715.1		 n/a 10,347
(0.43 %)		 138,311
(7.69 %)		 n/a 40.40
(99.93 %)		 3,359
(0.07 %)		 2,196
(100.00 %)		 691,302
(2.69 %)		 1,084,185
(7.47 %)		 12,619,495
(57.66 %)		 250,421
(10.15 %)
50 Asian tiger mosquito (v1 FPA 2019 refseq)
GCF_006496715.1		 49,254
(2.57 %)		 10,500
(0.44 %)		 138,307
(7.69 %)		 n/a 40.40
(99.93 %)		 3,359
(0.07 %)		 2,197
(100.00 %)		 6,821,491
(69.74 %)		 1,084,205
(7.47 %)		 12,619,646
(57.66 %)		 250,420
(10.13 %)
51 Asiatic tapir (BS100 BIUU 2019)
GCA_004024905.1		 n/a 20,854
(1.73 %)		 28,046
(1.39 %)		 n/a 40.91
(99.96 %)		 4,333
(0.02 %)		 284,468
(99.98 %)		 3,802,671
(39.88 %)		 335,521
(0.73 %)		 15,053,564
(30.25 %)		 39,691
(1.17 %)
52 ass (Maral har 2015 genbank)
GCA_001305755.1		 48,976
(40.12 %)		 18,884
(1.76 %)		 19,296
(1.44 %)		 n/a 41.28
(98.63 %)		 69,593
(1.38 %)		 2,166
(100.00 %)		 3,855,699
(41.69 %)		 289,735
(0.96 %)		 14,695,257
(28.58 %)		 40,025
(1.06 %)
53 Atlantic halibut (primary hap 2019 genbank)
GCA_009819705.1		 52,117
(66.34 %)		 14,960
(3.20 %)		 45,365
(7.48 %)		 69,625
(10.94 %)		 42.21
(99.43 %)		 290
(0.57 %)		 57
(100.00 %)		 428,421
(4.16 %)		 256,153
(3.73 %)		 3,725,979
(24.13 %)		 31,325
(2.25 %)
54 Atlantic herring (v1)
GCF_900700415.1		 46,216
(9.88 %)		 15,249
(2.65 %)		 25,664
(6.68 %)		 n/a 44.24
(99.88 %)		 1,963
(0.12 %)		 1,990
(99.88 %)		 1,175,759
(12.03 %)		 1,231,613
(13.39 %)		 3,511,276
(32.20 %)		 33,465
(1.97 %)
55 Atlantic salmon (genbank 2021)
GCA_905237065.2		 n/a 28,077
(1.40 %)		 120,383
(3.99 %)		 183,727
(7.26 %)		 43.42
(100.00 %)		 211
(0.00 %)		 4,222
(100.00 %)		 4,501,521
(48.00 %)		 2,247,891
(25.01 %)		 10,731,814
(59.31 %)		 77,089
(1.86 %)
56 Atlantic stingray (hap1 2023 genbank)
GCA_030144855.1		 60,922
(45.62 %)		 12,545
(0.38 %)		 29,428
(1.34 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 1,648
(0.01 %)		 2,990
(100.00 %)		 8,579,105
(49.81 %)		 831,224
(15.75 %)		 21,718,213
(51.79 %)		 105,821
(2.42 %)
57 B.malayi (v3 2008 agent of lymphatic filariasis)
GCF_000002995.3		 11,472
(14.88 %)		 2,843
(2.29 %)		 3,797
(4.95 %)		 n/a 30.21
(92.98 %)		 58,744
(7.04 %)		 26,881
(93.03 %)		 147,614
(11.55 %)		 54,885
(7.91 %)		 647,155
(33.62 %)		 509
(0.15 %)
58 Bactrian camel (Alxa 2014 genbank)
GCA_000767855.1		 52,178
(47.52 %)		 18,330
(1.96 %)		 17,094
(1.64 %)		 n/a 41.32
(99.32 %)		 31,980
(0.69 %)		 67,434
(99.31 %)		 3,072,373
(34.88 %)		 306,996
(0.95 %)		 12,209,895
(25.43 %)		 49,789
(1.25 %)
59 band-tailed pigeon (v1 hap2 2024 genbank)
GCA_036971685.1		 n/a 13,319
(1.60 %)		 25,993
(2.05 %)		 n/a 43.83
(99.41 %)		 219
(0.59 %)		 453
(100.00 %)		 700,173
(13.18 %)		 457,546
(13.85 %)		 4,523,003
(31.73 %)		 42,686
(7.00 %)
60 banded archerfish (primary hap 2021 genbank)
GCA_017976425.1		 42,399
(57.52 %)		 15,312
(3.18 %)		 41,147
(7.01 %)		 62,990
(9.37 %)		 41.11
(99.82 %)		 98
(0.18 %)		 96
(100.00 %)		 811,892
(18.19 %)		 271,913
(9.55 %)		 3,355,326
(28.08 %)		 15,089
(0.96 %)
61 barn owl (2020)
GCF_902150015.1		 37,361
(4.54 %)		 12,958
(1.72 %)		 22,922
(1.99 %)		 26,976
(3.04 %)		 41.55
(99.23 %)		 177,340
(0.79 %)		 21,504
(100.00 %)		 585,627
(5.48 %)		 367,764
(2.44 %)		 7,399,161
(19.58 %)		 47,061
(3.25 %)
62 barn owl BGI_N341 (2014)
GCF_000687205.1		 15,006
(2.07 %)		 11,133
(1.44 %)		 21,138
(1.69 %)		 n/a 40.21
(99.24 %)		 109,223
(0.79 %)		 171,345
(99.21 %)		 413,761
(3.90 %)		 181,353
(0.91 %)		 6,776,326
(18.43 %)		 10,575
(0.29 %)
63 barn swallow (bHirRus1 v2 primary hap genbank 2021)
GCA_015227805.2		 n/a 12,385
(1.88 %)		 23,302
(2.31 %)		 n/a 42.54
(97.69 %)		 1,102
(2.31 %)		 617
(100.00 %)		 579,928
(6.20 %)		 364,636
(2.27 %)		 6,198,840
(21.01 %)		 36,546
(2.82 %)
64 barn swallow (v2 primary hap 2021 refseq)
GCF_015227805.1		 43,374
(5.14 %)		 12,385
(1.88 %)		 23,302
(2.31 %)		 n/a 42.54
(97.69 %)		 1,102
(2.31 %)		 617
(100.00 %)		 579,928
(6.20 %)		 364,636
(2.27 %)		 6,198,840
(21.01 %)		 36,546
(2.82 %)
65 barn swallow (v3 primary hap 2021 genbank)
GCA_015227805.3		 n/a 12,395
(1.89 %)		 23,302
(2.31 %)		 n/a 42.54
(97.69 %)		 1,102
(2.31 %)		 617
(100.00 %)		 664,757
(13.92 %)		 364,636
(2.27 %)		 6,198,840
(21.01 %)		 36,548
(2.85 %)
66 barramundi perch (ASB-BC8 2016)
GCF_001640805.1		 50,205
(13.10 %)		 16,166
(3.05 %)		 25,084
(6.20 %)		 n/a 40.75
(100.00 %)		 110
(0.00 %)		 3,808
(100.00 %)		 465,997
(3.11 %)		 237,955
(4.36 %)		 4,027,027
(23.91 %)		 16,276
(1.04 %)
67 basidiomycetes A.bisporus (H97 2012)
GCF_000300575.1		 10,448
(49.20 %)		 1,066
(2.53 %)		 5,238
(16.95 %)		 n/a 46.48
(99.32 %)		 225
(0.68 %)		 254
(99.32 %)		 4,921
(0.90 %)		 2,352
(0.47 %)		 62,603
(9.90 %)		 5,244
(15.19 %)
68 basidiomycetes C.cinerea (okayama7#130 2010 genbank)
GCA_000182895.1		 n/a 1,050
(2.04 %)		 3,917
(10.89 %)		 n/a 51.64
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 68
(100.00 %)		 n/a 3,805
(0.81 %)		 107,373
(7.81 %)		 81
(99.54 %)
69 basidiomycetes C.depauperatus (CBS 7841 2024 genbank)
GCA_001720195.2		 n/a 921
(4.16 %)		 4,119
(24.79 %)		 n/a 44.80
(100.00 %)		 n/a 8
(100.00 %)		 2,424
(0.66 %)		 1,011
(0.30 %)		 56,356
(7.99 %)		 1,869
(7.30 %)
70 basidiomycetes C.neoformans (JEC21 2005 genbank)
GCA_000091045.1		 n/a 957
(3.66 %)		 3,784
(19.12 %)		 n/a 48.54
(99.99 %)		 85
(0.01 %)		 99
(99.99 %)		 4,944
(5.25 %)		 1,808
(0.52 %)		 68,717
(8.41 %)		 5,128
(28.73 %)
71 basidiomycetes K.bestiolae (CBS 10118 2024 genbank)
GCA_000512585.3		 n/a 918
(2.66 %)		 4,907
(18.38 %)		 n/a 47.29
(100.00 %)		 n/a 8
(100.00 %)		 7,245
(1.32 %)		 2,141
(0.47 %)		 97,927
(9.78 %)		 4,995
(11.17 %)
72 basidiomycetes K.bestiolae (v1 CBS 10118 2016)
GCF_000512585.1		 9,187
(54.88 %)		 867
(2.56 %)		 4,441
(17.03 %)		 n/a 47.25
(99.94 %)		 30
(0.06 %)		 42
(99.94 %)		 7,231
(1.31 %)		 1,919
(0.32 %)		 110,288
(10.48 %)		 4,972
(10.95 %)
73 basidiomycetes K.dejecticola (CBS 10117 2024 genbank)
GCA_000512565.3		 n/a 910
(2.69 %)		 4,861
(19.78 %)		 n/a 48.39
(100.00 %)		 n/a 11
(100.00 %)		 7,778
(1.42 %)		 2,452
(0.43 %)		 86,630
(7.97 %)		 3,644
(14.24 %)
74 basidiomycetes K.dejecticola (v1 CBS 10117 2016)
GCF_000512565.1		 8,645
(55.47 %)		 908
(2.72 %)		 4,862
(19.87 %)		 n/a 48.38
(99.98 %)		 56
(0.02 %)		 69
(99.98 %)		 7,816
(1.43 %)		 2,425
(0.42 %)		 85,868
(7.91 %)		 3,698
(15.12 %)
75 basidiomycetes K.mangroviensis (v1 CBS 8507 2016 refseq)
GCF_000507465.1		 8,472
(55.96 %)		 884
(2.79 %)		 5,418
(21.48 %)		 n/a 44.88
(99.73 %)		 43
(0.27 %)		 105
(99.73 %)		 6,509
(1.21 %)		 1,529
(0.25 %)		 101,733
(9.98 %)		 2,326
(4.59 %)
76 basidiomycetes K.mangroviensis (v2 CBS 8507 2024 genbank)
GCA_000507465.4		 n/a 886
(2.74 %)		 5,392
(21.25 %)		 n/a 44.92
(100.00 %)		 n/a 4
(100.00 %)		 6,585
(1.21 %)		 1,546
(0.27 %)		 104,495
(10.38 %)		 2,335
(5.10 %)
77 basidiomycetes K.pini (v1 CBS 10737 2016)
GCF_000512605.1		 7,854
(58.26 %)		 816
(2.92 %)		 5,392
(23.35 %)		 n/a 40.23
(99.94 %)		 24
(0.06 %)		 42
(99.94 %)		 6,502
(1.34 %)		 1,847
(0.36 %)		 99,393
(12.25 %)		 1,191
(2.91 %)
78 basidiomycetes K.shandongensis (v1 CBS 12478 2019)
GCF_008629635.1		 7,454
(55.86 %)		 893
(2.94 %)		 3,348
(15.13 %)		 n/a 49.82
(99.99 %)		 11
(0.01 %)		 132
(100.00 %)		 5,510
(1.13 %)		 1,598
(0.33 %)		 81,983
(9.00 %)		 512
(39.06 %)
79 basidiomycetes M.globosa (v1 CBS 7966 2007)
GCF_000181695.1		 4,286
(69.39 %)		 1,060
(8.79 %)		 2,585
(44.95 %)		 n/a 52.06
(100.00 %)		 22
(0.00 %)		 89
(100.00 %)		 1,777
(0.93 %)		 720
(0.48 %)		 22,182
(4.73 %)		 124
(60.74 %)
80 basidiomycetes S.commune (v1 H4-8 2010)
GCF_000143185.1		 13,192
(49.72 %)		 894
(1.60 %)		 973
(2.80 %)		 n/a 57.50
(98.57 %)		 316
(1.43 %)		 352
(98.57 %)		 7,478
(4.11 %)		 7,640
(1.13 %)		 176,404
(11.51 %)		 38
(40.33 %)
81 bee C.calcarata (v1 Rehan_Ccalc_2016 2016)
GCF_001652005.1		 25,020
(17.94 %)		 4,205
(2.34 %)		 27,352
(12.83 %)		 n/a 41.09
(91.93 %)		 19,248
(8.05 %)		 50,565
(100.00 %)		 57,833
(1.39 %)		 27,440
(2.49 %)		 1,173,760
(18.39 %)		 10,942
(2.61 %)
82 bee E.mexicana (v1 0111107269 2016)
GCF_001483705.1		 16,406
(4.01 %)		 4,087
(0.75 %)		 46,846
(6.53 %)		 16,764
(4.04 %)		 40.92
(95.72 %)		 25,039
(4.23 %)		 212,650
(95.77 %)		 641,987
(7.51 %)		 360,406
(11.43 %)		 3,411,951
(46.01 %)		 40,540
(3.99 %)
83 beet (2015)
GCF_000511025.2		 37,939
(8.78 %)		 12,044
(2.14 %)		 63,283
(17.52 %)		 n/a 36.14
(91.40 %)		 30,962
(8.61 %)		 71,208
(91.39 %)		 288,084
(4.25 %)		 299,650
(4.72 %)		 3,021,571
(30.10 %)		 32,547
(2.39 %)
84 Bellinger river turtle (v1 BRST_UC0152H_USYD 2024)
GCA_040894355.1		 n/a 14,732
(1.14 %)		 18,988
(1.77 %)		 n/a 43.21
(100.00 %)		 57
(0.00 %)		 129
(100.00 %)		 1,130,950
(11.22 %)		 213,212
(1.80 %)		 11,049,280
(26.48 %)		 53,923
(2.09 %)
85 beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v2 2017)
GCA_002288925.2		 n/a 18,686
(1.78 %)		 20,378
(1.43 %)		 n/a 41.24
(98.66 %)		 28,398
(1.35 %)		 35,369
(98.65 %)		 4,001,688
(43.72 %)		 542,326
(1.10 %)		 12,806,249
(34.24 %)		 59,279
(1.53 %)
86 Betapolyomavirus macacae (2000)
GCA_000837645.1		 n/a n/a n/a n/a 40.76
(99.94 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3
(4.54 %)		 15
(4.33 %)		 0
(0.00 %)
87 bighorn sheep (v1 Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024)
GCF_042477335.1		 75,387
(2.66 %)		 18,667
(1.37 %)		 20,248
(1.35 %)		 n/a 44.07
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 41
(100.00 %)		 3,081,260
(20.10 %)		 796,298
(12.14 %)		 12,235,764
(46.75 %)		 50,538
(11.18 %)
88 black cottonwood (v3 Nisqually-1 2018)
GCF_000002775.4		 59,637
(15.47 %)		 20,361
(4.67 %)		 44,177
(15.83 %)		 n/a 33.75
(97.43 %)		 6,871
(2.58 %)		 8,318
(97.42 %)		 402,600
(27.63 %)		 177,746
(4.65 %)		 2,639,214
(36.04 %)		 4,559
(0.56 %)
89 black perch (LCO1_2020_lvr primary hap 2022 genbank)
GCA_022577435.1		 n/a 14,991
(3.02 %)		 47,106
(6.98 %)		 n/a 41.61
(100.00 %)		 234
(0.00 %)		 230
(100.00 %)		 1,017,149
(18.99 %)		 360,899
(8.75 %)		 3,761,526
(28.91 %)		 48,360
(4.43 %)
90 black rhinoceros (primary hap 2021 genbank)
GCA_020826845.1		 56,255
(36.51 %)		 18,774
(1.38 %)		 22,346
(1.26 %)		 n/a 41.59
(99.95 %)		 215
(0.05 %)		 1,075
(100.00 %)		 4,200,385
(36.22 %)		 548,030
(8.34 %)		 14,347,639
(40.14 %)		 43,525
(1.14 %)
91 black snub-nosed monkey (Rb0 v1 genbank 2016)
GCA_001698545.1		 59,197
(39.21 %)		 21,244
(1.88 %)		 23,681
(1.25 %)		 n/a 40.94
(94.13 %)		 149,843
(5.88 %)		 105,030
(100.00 %)		 5,600,915
(50.57 %)		 991,762
(2.45 %)		 16,353,992
(34.26 %)		 81,205
(1.19 %)
92 black snub-nosed monkey (Rb0 v1 refseq 2016)
GCF_001698545.1		 59,210
(2.48 %)		 21,256
(1.89 %)		 23,679
(1.25 %)		 n/a 40.94
(94.13 %)		 149,843
(5.88 %)		 105,031
(100.00 %)		 5,602,009
(50.58 %)		 991,745
(2.45 %)		 16,354,078
(34.26 %)		 81,205
(1.19 %)
93 black swan (v1 Queensland, Australia AKBS03 2020)
GCF_013377495.1		 41,255
(4.77 %)		 12,955
(1.98 %)		 22,656
(2.28 %)		 31,476
(5.07 %)		 41.95
(100.00 %)		 n/a 396
(100.00 %)		 680,976
(7.66 %)		 296,152
(1.44 %)		 6,797,141
(21.40 %)		 31,750
(3.32 %)
94 black tiger shrimp (v1 SGIC_2016 2020)
GCF_015228065.1		 35,923
(2.41 %)		 3,903
(0.15 %)		 39,667
(2.27 %)		 40,959
(2.59 %)		 36.64
(83.75 %)		 1,158,725
(16.44 %)		 26,876
(100.00 %)		 5,488,723
(29.98 %)		 7,028,944
(21.91 %)		 10,445,796
(49.62 %)		 178,205
(3.43 %)
95 black-legged kittiwake (bRisTri1.patW 2023 genbank)
GCA_028500815.1		 51,115
(48.16 %)		 13,211
(1.67 %)		 24,108
(1.99 %)		 n/a 44.40
(99.94 %)		 283
(0.06 %)		 716
(100.00 %)		 521,275
(5.36 %)		 236,727
(8.62 %)		 5,684,588
(26.70 %)		 45,318
(4.71 %)
96 black-legged tick (U.Maryland v1 2021)
GCF_016920785.1		 41,018
(2.61 %)		 4,064
(0.14 %)		 135,587
(7.67 %)		 n/a 46.27
(100.00 %)		 n/a 2,977
(100.00 %)		 1,153,773
(4.93 %)		 754,711
(7.52 %)		 10,964,182
(43.13 %)		 138,831
(8.38 %)
97 black-legged tick (Wikel colony 2008 genbank)
GCA_000208615.1		 n/a 3,432
(0.19 %)		 108,471
(5.13 %)		 n/a 45.22
(78.65 %)		 201,145
(21.35 %)		 570,637
(78.65 %)		 656,957
(3.38 %)		 365,918
(1.61 %)		 8,574,437
(27.02 %)		 345,141
(14.15 %)
98 blackcap (primary hap 2019 genbank)
GCA_009819655.1		 n/a 12,378
(1.92 %)		 22,970
(2.37 %)		 n/a 42.00
(98.88 %)		 413
(1.12 %)		 189
(100.00 %)		 506,242
(6.14 %)		 330,354
(2.12 %)		 6,410,567
(19.76 %)		 26,838
(2.34 %)
99 Blainville's beaked whale (primary hap 2022 genbank)
GCA_025265405.1		 47,540
(38.02 %)		 19,042
(1.52 %)		 20,766
(1.27 %)		 n/a 41.70
(99.97 %)		 97
(0.03 %)		 73
(100.00 %)		 3,964,035
(35.29 %)		 765,957
(8.74 %)		 12,128,162
(41.78 %)		 70,851
(1.80 %)
100 bloodfluke planorb (v1 BB02 2013 refseq)
GCF_000457365.1		 42,229
(5.95 %)		 3,558
(0.29 %)		 24,115
(2.96 %)		 n/a 35.99
(98.05 %)		 76,921
(1.91 %)		 408,322
(98.09 %)		 629,362
(4.20 %)		 749,383
(9.40 %)		 6,932,184
(43.02 %)		 16,970
(0.64 %)
101 bloodfluke planorb (v2 BB02 2013 genbank)
GCA_000457365.2		 n/a 3,378
(0.29 %)		 23,684
(2.94 %)		 n/a 35.99
(98.05 %)		 76,903
(1.91 %)		 406,924
(98.09 %)		 587,583
(3.57 %)		 749,212
(9.41 %)		 6,921,847
(43.04 %)		 16,561
(0.63 %)
102 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 2020)
GCA_009873245.2		 n/a 19,164
(1.81 %)		 20,546
(1.41 %)		 34,210
(1.86 %)		 40.88
(98.91 %)		 936
(1.09 %)		 130
(100.00 %)		 3,999,202
(44.22 %)		 581,540
(1.22 %)		 12,900,977
(34.62 %)		 67,189
(1.73 %)
103 blunt-snouted clingfish (v1 2019 genbank)
GCA_900634775.1		 47,312
(59.52 %)		 14,496
(1.97 %)		 28,873
(5.58 %)		 60,981
(6.13 %)		 38.27
(98.47 %)		 1,160
(1.53 %)		 441
(100.00 %)		 731,730
(4.21 %)		 471,620
(4.92 %)		 5,974,002
(42.88 %)		 29,050
(1.48 %)
104 blunt-snouted clingfish (v1 2019 refseq)
GCF_900634775.1		 47,312
(7.12 %)		 14,496
(1.97 %)		 28,873
(5.58 %)		 60,981
(6.13 %)		 38.27
(98.47 %)		 1,160
(1.53 %)		 441
(100.00 %)		 731,730
(4.21 %)		 471,620
(4.92 %)		 5,974,002
(42.88 %)		 29,050
(1.48 %)
105 Bolivian squirrel monkey (100643 v2.0 BCM 2021)
GCF_016699345.1		 53,030
(2.41 %)		 20,599
(1.98 %)		 21,182
(1.34 %)		 46,441
(1.87 %)		 40.95
(99.56 %)		 1,074
(0.44 %)		 2,790
(99.56 %)		 5,098,799
(47.87 %)		 946,231
(3.04 %)		 14,608,771
(36.99 %)		 37,273
(1.03 %)
106 Bolivian squirrel monkey (3227 Broad 2011)
GCF_000235385.1		 39,820
(2.33 %)		 20,222
(2.04 %)		 18,404
(1.34 %)		 49,071
(2.26 %)		 40.77
(94.98 %)		 148,728
(5.04 %)		 151,414
(94.96 %)		 4,710,420
(46.30 %)		 767,602
(1.48 %)		 14,489,703
(32.96 %)		 32,474
(0.75 %)
107 Bornean orangutan (v1 AG05252 alternate hap 2023 genbank)
GCA_028885525.1		 n/a 19,820
(1.76 %)		 20,399
(1.15 %)		 n/a 40.98
(99.88 %)		 36
(0.12 %)		 251
(99.88 %)		 5,232,617
(54.01 %)		 1,003,539
(10.19 %)		 14,858,575
(42.10 %)		 42,467
(1.24 %)
108 Bornean orangutan (v1 AG05252 primary hap 2023 refseq)
GCF_028885625.1		 81,966
(2.93 %)		 20,794
(1.72 %)		 21,307
(1.13 %)		 n/a 41.13
(99.86 %)		 39
(0.14 %)		 1,593
(99.86 %)		 5,651,267
(54.21 %)		 1,155,151
(9.33 %)		 16,242,823
(42.82 %)		 52,294
(2.02 %)
109 boutu (BS63 2019)
GCA_004363515.1		 n/a 21,835
(1.38 %)		 35,087
(1.18 %)		 n/a 42.09
(99.89 %)		 5,072
(0.02 %)		 1,218,682
(99.98 %)		 5,098,108
(45.85 %)		 856,878
(2.32 %)		 13,046,921
(40.74 %)		 63,992
(1.47 %)
110 bowfin (hap1 2024 genbank)
GCA_036373705.1		 n/a 13,851
(1.83 %)		 27,058
(4.43 %)		 n/a 40.75
(100.00 %)		 97
(0.00 %)		 390
(100.00 %)		 953,497
(13.69 %)		 387,700
(7.91 %)		 4,552,410
(37.72 %)		 46,301
(2.99 %)
111 Brazilian free-tailed bat (US034 2019)
GCA_004025005.1		 n/a 23,562
(1.20 %)		 51,200
(1.27 %)		 n/a 42.40
(99.91 %)		 4,243
(0.02 %)		 1,071,858
(99.98 %)		 4,884,584
(32.93 %)		 777,032
(1.49 %)		 14,195,446
(36.38 %)		 89,940
(1.88 %)
112 brown anole (Geneva1000 2022 genbank)
GCA_025583915.1		 38,099
(52.40 %)		 14,028
(1.05 %)		 19,927
(1.81 %)		 n/a 41.14
(98.37 %)		 114,440
(1.64 %)		 3,738
(100.00 %)		 1,376,455
(6.78 %)		 1,094,843
(5.18 %)		 9,127,396
(44.98 %)		 46,291
(1.18 %)
113 brown argus (genbank 2021)
GCA_905147365.1		 23,611
(63.03 %)		 4,734
(1.03 %)		 24,267
(6.80 %)		 24,237
(6.16 %)		 36.86
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 26
(100.00 %)		 264,378
(2.90 %)		 144,255
(3.35 %)		 2,651,028
(48.44 %)		 35,431
(4.56 %)
114 brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v1 2018)
GCF_003584765.1		 54,006
(3.19 %)		 18,811
(1.78 %)		 21,058
(1.52 %)		 39,408
(1.98 %)		 41.84
(99.31 %)		 17,380
(0.70 %)		 21,814
(99.30 %)		 4,283,780
(41.29 %)		 567,588
(1.23 %)		 13,807,277
(30.86 %)		 62,126
(1.80 %)
115 brown bear (v1.0 2022 WashU)
GCF_023065955.1		 60,162
(4.01 %)		 18,920
(1.66 %)		 21,641
(1.49 %)		 n/a 42.51
(100.00 %)		 215
(0.00 %)		 902
(100.00 %)		 4,166,472
(34.00 %)		 659,124
(5.14 %)		 13,282,996
(33.88 %)		 68,113
(2.27 %)
116 brown dog tick (v1 Rsan-2018 2020)
GCF_013339695.1		 39,619
(2.36 %)		 3,965
(0.13 %)		 116,426
(5.96 %)		 45,849
(2.46 %)		 46.86
(99.96 %)		 10,359
(0.04 %)		 2,329
(100.00 %)		 1,064,424
(3.53 %)		 716,579
(3.47 %)		 10,608,171
(42.78 %)		 13,204
(0.97 %)
117 brown headed cowbird (v1.0 BHLD 08-10-18 2020)
GCF_012460135.1		 31,379
(5.19 %)		 12,572
(1.89 %)		 24,442
(2.44 %)		 26,137
(3.13 %)		 42.40
(99.99 %)		 278
(0.01 %)		 691
(99.99 %)		 504,872
(6.53 %)		 420,620
(3.73 %)		 6,496,619
(21.26 %)		 28,576
(2.39 %)
118 brown planthopper (v1 BPH 2020 genbank)
GCA_014356525.1		 36,936
(60.13 %)		 4,416
(0.37 %)		 22,354
(3.57 %)		 37,534
(4.91 %)		 34.69
(99.96 %)		 4,529
(0.04 %)		 7,093
(100.00 %)		 597,351
(3.69 %)		 564,076
(6.64 %)		 6,601,703
(47.48 %)		 39,697
(1.55 %)
119 brown planthopper (v1 BPH 2020 refseq)
GCF_014356525.1		 36,949
(4.89 %)		 4,427
(0.37 %)		 22,417
(3.57 %)		 37,573
(4.91 %)		 34.69
(99.96 %)		 4,529
(0.04 %)		 7,094
(100.00 %)		 597,178
(3.69 %)		 564,092
(6.64 %)		 6,601,918
(47.49 %)		 39,697
(1.55 %)
120 budding yeast C.auris (6684 2015 genbank)
GCA_001189475.1		 n/a 1,948
(12.61 %)		 4,664
(59.90 %)		 n/a 45.12
(98.69 %)		 689
(1.33 %)		 99
(100.00 %)		 3,478
(1.23 %)		 2,281
(0.83 %)		 48,703
(8.19 %)		 1,579
(6.36 %)
121 budding yeast C.auris (B11221 2017 genbank)
GCA_002775015.1		 n/a 2,030
(12.92 %)		 4,702
(58.30 %)		 n/a 45.32
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 20
(100.00 %)		 3,464
(2.27 %)		 2,436
(0.80 %)		 28,524
(6.96 %)		 1,757
(7.37 %)
122 budding yeast C.lusitaniae (ATCC 42720 2009 genbank)
GCA_000003835.1		 n/a 1,956
(12.86 %)		 4,335
(54.85 %)		 n/a 44.50
(99.71 %)		 79
(0.29 %)		 88
(99.71 %)		 2,272
(1.18 %)		 4,036
(1.77 %)		 48,188
(8.66 %)		 1,474
(15.82 %)
123 budding yeast C.oxycetoniae (v1 CBS 10844 2022)
GCF_023343755.1		 4,892
(62.35 %)		 1,845
(11.42 %)		 4,476
(56.70 %)		 n/a 37.84
(99.95 %)		 167
(0.05 %)		 148
(100.00 %)		 14,118
(4.93 %)		 19,713
(8.99 %)		 82,014
(21.64 %)		 201
(0.52 %)
124 budding yeast K.marxianus (DMKU3-1042 2014 genbank)
GCA_001417885.1		 n/a 3,349
(28.79 %)		 4,665
(66.28 %)		 n/a 40.12
(100.00 %)		 n/a 9
(100.00 %)		 7,406
(3.43 %)		 3,781
(1.46 %)		 51,732
(11.80 %)		 742
(4.91 %)
125 budding yeast L.elongisporus (NRRL YB-4239 2007 genbank)
GCA_000149685.1		 n/a 1,905
(9.82 %)		 5,004
(52.37 %)		 n/a 36.94
(99.45 %)		 117
(0.56 %)		 145
(99.44 %)		 30,880
(10.91 %)		 18,155
(4.10 %)		 100,210
(23.18 %)		 22
(0.04 %)
126 budding yeast N.glabratus (CBS 138 2008 genbank)
GCA_000002545.2		 n/a 3,553
(27.93 %)		 4,799
(61.37 %)		 n/a 38.65
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 16
(100.00 %)		 3,047
(1.32 %)		 2,546
(1.58 %)		 59,567
(11.20 %)		 635
(3.11 %)
127 budding yeast Y.lipolytica (CLIB122 2004 genbank)
GCA_000002525.1		 n/a 1,755
(6.59 %)		 4,802
(37.76 %)		 n/a 49.05
(99.99 %)		 28
(0.01 %)		 34
(99.99 %)		 7,553
(2.98 %)		 9,578
(2.12 %)		 81,595
(9.59 %)		 6,216
(33.42 %)
128 budgerigar (maternal Z 2020 genbank)
GCA_012275295.1		 32,026
(47.01 %)		 13,250
(1.87 %)		 23,063
(2.25 %)		 26,324
(3.11 %)		 41.80
(99.72 %)		 284
(0.28 %)		 865
(100.00 %)		 539,059
(10.20 %)		 279,511
(3.12 %)		 5,874,608
(22.08 %)		 21,155
(1.61 %)
129 butterfly L.sinapis (2021 genbank)
GCA_905404315.1		 25,882
(55.17 %)		 4,722
(0.65 %)		 16,896
(3.62 %)		 47,660
(8.03 %)		 35.73
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 50
(100.00 %)		 272,738
(1.92 %)		 98,053
(6.01 %)		 4,662,765
(51.79 %)		 43,150
(4.96 %)
130 butterfly P.napi (v1.1 genbank 2021)
GCA_905475465.1		 n/a 4,588
(1.37 %)		 11,218
(5.90 %)		 42,925
(13.84 %)		 33.95
(100.00 %)		 41
(0.00 %)		 43
(100.00 %)		 143,323
(2.19 %)		 45,473
(3.23 %)		 2,501,939
(42.55 %)		 11,070
(2.07 %)
131 cabbage white (genbank 2021)
GCA_905147795.1		 21,844
(65.09 %)		 4,557
(1.68 %)		 9,253
(6.32 %)		 30,285
(15.57 %)		 33.23
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 40
(100.00 %)		 116,781
(2.12 %)		 30,577
(1.24 %)		 2,300,336
(39.04 %)		 6,783
(2.24 %)
132 California condor (v1 813 2021 genbank)
GCA_018139145.1		 n/a 12,650
(1.75 %)		 21,946
(1.95 %)		 n/a 42.16
(99.97 %)		 632
(0.03 %)		 542
(100.00 %)		 518,393
(6.41 %)		 177,329
(0.88 %)		 7,168,675
(20.31 %)		 34,926
(2.94 %)
133 California sea lion (BS06 2019 Broad)
GCA_004024565.1		 n/a 23,668
(1.61 %)		 29,709
(1.32 %)		 n/a 41.56
(99.92 %)		 10,276
(0.04 %)		 582,272
(99.96 %)		 4,952,087
(44.00 %)		 651,744
(1.26 %)		 13,644,805
(35.79 %)		 62,245
(1.50 %)
134 California sea lion (v1 2019)
GCA_009762305.1		 n/a 21,020
(1.79 %)		 20,045
(1.39 %)		 45,176
(2.15 %)		 41.40
(99.28 %)		 122
(0.72 %)		 43
(100.00 %)		 4,529,949
(43.67 %)		 589,962
(1.24 %)		 13,266,465
(33.77 %)		 51,989
(1.50 %)
135 California two-spot octopus (v1 UCB-OBI-ISO-001 male 2015)
GCF_001194135.1		 26,135
(1.83 %)		 3,125
(0.12 %)		 17,875
(1.29 %)		 27,144
(1.85 %)		 36.03
(84.95 %)		 548,450
(15.13 %)		 700,124
(84.87 %)		 3,498,348
(13.19 %)		 3,005,729
(6.50 %)		 13,687,022
(41.09 %)		 22,984
(0.34 %)
136 Canada lynx (LIC74 v1 2019)
GCF_007474595.1		 50,094
(2.69 %)		 18,283
(1.66 %)		 19,326
(1.35 %)		 38,985
(1.96 %)		 41.70
(99.88 %)		 848
(0.12 %)		 66
(100.00 %)		 5,016,399
(43.75 %)		 904,986
(1.75 %)		 13,476,288
(34.20 %)		 66,822
(2.52 %)
137 Cape golden mole (BS56 2019 Broad)
GCA_004027935.1		 n/a 25,543
(0.55 %)		 52,506
(0.63 %)		 n/a 40.04
(99.84 %)		 4,876
(0.01 %)		 3,432,954
(99.99 %)		 7,363,240
(21.82 %)		 876,677
(2.53 %)		 25,446,677
(58.18 %)		 25,319
(0.31 %)
138 capsicum (Zunla-1 2015 genbank)
GCA_000710875.1		 n/a 16,133
(0.56 %)		 62,445
(2.92 %)		 n/a 34.93
(96.78 %)		 107,172
(3.23 %)		 108,797
(96.77 %)		 1,171,727
(3.54 %)		 948,641
(4.39 %)		 21,533,236
(46.16 %)		 16,621
(0.21 %)
139 Caribbean electric ray (hap1 2024 genbank)
GCA_036971445.1		 n/a 11,967
(0.44 %)		 20,851
(1.23 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 1,443
(0.01 %)		 596
(100.00 %)		 4,902,656
(34.96 %)		 1,040,893
(17.82 %)		 16,403,253
(54.79 %)		 113,936
(1.69 %)
140 carmine bee-eater (2014 BGI)
GCF_000691845.1		 15,520
(2.12 %)		 11,303
(1.45 %)		 24,758
(1.84 %)		 n/a 41.67
(99.59 %)		 50,632
(0.42 %)		 104,131
(99.58 %)		 405,042
(5.66 %)		 161,525
(1.05 %)		 6,445,961
(19.27 %)		 11,477
(0.36 %)
141 cassava (v6 AM560-2 2016 DOE)
GCF_001659605.1		 48,199
(10.95 %)		 18,537
(3.62 %)		 45,536
(13.17 %)		 n/a 35.94
(85.14 %)		 37,896
(14.88 %)		 39,916
(85.12 %)		 295,656
(2.88 %)		 266,527
(3.40 %)		 2,434,269
(42.34 %)		 30,963
(1.41 %)
142 cattle (Hereford 2015)
GCA_000003205.6		 n/a 19,803
(1.54 %)		 21,001
(1.30 %)		 n/a 41.83
(99.57 %)		 41,517
(0.44 %)		 42,578
(99.56 %)		 5,725,274
(49.24 %)		 459,535
(1.33 %)		 12,905,109
(41.11 %)		 43,324
(1.28 %)
143 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.2 2018 USDA)
GCF_002263795.1		 76,369
(2.97 %)		 19,669
(1.56 %)		 21,999
(1.33 %)		 n/a 41.93
(100.00 %)		 386
(0.00 %)		 2,211
(100.00 %)		 5,643,592
(49.67 %)		 545,256
(2.90 %)		 13,085,601
(41.79 %)		 44,357
(1.24 %)
144 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.3 2018 USDA)
GCF_002263795.2		 76,293
(2.98 %)		 19,325
(1.49 %)		 21,665
(1.32 %)		 n/a 41.94
(100.00 %)		 386
(0.00 %)		 1,957
(100.00 %)		 3,550,686
(24.18 %)		 544,595
(2.90 %)		 13,050,221
(41.81 %)		 44,208
(1.24 %)
145 Chacoan peccary (BS18 v1 2019 Broad)
GCA_004024745.1		 n/a 21,372
(1.41 %)		 34,453
(1.31 %)		 n/a 42.35
(99.87 %)		 10,534
(0.04 %)		 1,240,696
(99.96 %)		 5,244,572
(43.13 %)		 2,503,015
(4.45 %)		 12,961,004
(41.69 %)		 173,264
(3.70 %)
146 channel bull blenny (2019 genbank)
GCA_900634415.1		 40,788
(61.50 %)		 14,472
(3.02 %)		 24,012
(6.59 %)		 60,720
(10.43 %)		 40.96
(99.58 %)		 445
(0.42 %)		 322
(100.00 %)		 420,697
(5.49 %)		 320,518
(6.91 %)		 3,394,846
(28.67 %)		 20,453
(1.39 %)
147 channel catfish (USDA103 v1 2016)
GCF_001660625.1		 53,933
(9.58 %)		 15,712
(2.71 %)		 25,639
(5.25 %)		 n/a 39.70
(98.56 %)		 25,203
(1.45 %)		 34,544
(98.55 %)		 871,222
(5.75 %)		 585,250
(4.19 %)		 5,150,651
(33.94 %)		 31,438
(1.87 %)
148 channel catfish (USDA103 v1.2 2019)
GCF_001660625.2		 57,087
(10.27 %)		 16,253
(2.68 %)		 44,936
(5.15 %)		 n/a 39.70
(98.57 %)		 25,285
(1.44 %)		 34,545
(98.61 %)		 900,327
(5.55 %)		 614,695
(4.28 %)		 5,348,266
(33.81 %)		 32,840
(1.87 %)
149 cheetah (AJU 981 2015)
GCA_001443585.1		 n/a 18,264
(1.57 %)		 14,665
(1.26 %)		 n/a 41.30
(98.26 %)		 183,260
(1.77 %)		 14,382
(100.00 %)		 4,777,041
(42.51 %)		 784,368
(1.53 %)		 13,503,827
(31.65 %)		 57,657
(1.31 %)
150 chevron butterflyfish (hap1 2024 genbank)
GCA_039877785.1		 n/a 15,255
(2.94 %)		 48,037
(7.05 %)		 n/a 42.79
(100.00 %)		 49
(0.00 %)		 37
(100.00 %)		 465,710
(3.82 %)		 254,015
(3.62 %)		 3,657,999
(23.28 %)		 30,971
(2.02 %)
151 chimney swift (M959 v1.0 2014)
GCF_000747805.1		 15,979
(2.53 %)		 12,065
(1.82 %)		 10,050
(2.07 %)		 n/a 41.40
(95.99 %)		 65,523
(4.03 %)		 84,595
(95.97 %)		 453,775
(7.30 %)		 194,988
(2.21 %)		 6,363,949
(19.70 %)		 12,486
(0.42 %)
152 chimpanzee (Clint C0471 2018 genbank)
GCA_002880755.3		 n/a 20,378
(1.83 %)		 21,427
(1.19 %)		 n/a 40.71
(98.98 %)		 693
(1.02 %)		 5,037
(98.98 %)		 5,409,980
(53.76 %)		 984,231
(7.31 %)		 15,896,744
(39.56 %)		 45,870
(0.97 %)
153 chimpanzee (v1 AG18354 alternate hap 2023 genbank)
GCA_028858805.1		 n/a 20,001
(1.79 %)		 21,230
(1.19 %)		 n/a 40.62
(99.78 %)		 22
(0.22 %)		 141
(99.78 %)		 5,092,768
(48.83 %)		 946,933
(11.75 %)		 14,844,947
(42.39 %)		 47,662
(1.21 %)
154 chimpanzee (v1 AG18354 primary hap 2023 refseq)
GCF_028858775.1		 111,282
(4.36 %)		 20,990
(1.75 %)		 21,705
(1.15 %)		 n/a 40.94
(99.90 %)		 29
(0.10 %)		 1,500
(99.90 %)		 5,581,205
(50.06 %)		 1,158,792
(10.59 %)		 15,972,274
(43.09 %)		 61,901
(2.29 %)
155 China rose (Old Blush v1 2018)
GCF_002994745.1		 60,293
(11.65 %)		 15,433
(2.84 %)		 67,310
(21.70 %)		 n/a 38.83
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 45
(100.00 %)		 273,992
(2.25 %)		 228,466
(3.97 %)		 2,261,888
(35.14 %)		 37,317
(4.18 %)
156 Chinese hamster (17A/GY CHO 2018)
GCF_003668045.1		 55,529
(3.00 %)		 19,755
(1.76 %)		 20,017
(1.50 %)		 n/a 41.51
(99.88 %)		 4,356
(0.12 %)		 1,830
(100.00 %)		 4,544,603
(29.89 %)		 1,095,407
(2.92 %)		 12,942,232
(32.27 %)		 19,343
(0.58 %)
157 Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male genbank)
GCA_018296145.1		 92,370
(51.48 %)		 27,141
(1.63 %)		 113,328
(4.52 %)		 157,545
(6.65 %)		 43.55
(99.99 %)		 2,333
(0.01 %)		 9,977
(99.99 %)		 4,892,399
(55.31 %)		 2,306,695
(23.48 %)		 10,038,870
(54.55 %)		 62,726
(1.40 %)
158 chub mackerel (primary hap 2022 genbank)
GCA_027409825.1		 34,390
(49.60 %)		 15,350
(2.35 %)		 46,858
(6.07 %)		 n/a 40.01
(99.92 %)		 1,572
(0.08 %)		 361
(100.00 %)		 1,669,327
(28.44 %)		 638,340
(11.55 %)		 4,613,422
(32.38 %)		 16,290
(0.85 %)
159 chuck-will's-widow (BGI_N321 v1 2014)
GCF_000700745.1		 17,196
(2.21 %)		 12,140
(1.50 %)		 25,641
(1.91 %)		 n/a 40.76
(99.61 %)		 56,667
(0.39 %)		 126,789
(99.61 %)		 560,317
(7.62 %)		 203,204
(1.12 %)		 6,593,712
(20.47 %)		 8,105
(0.24 %)
160 chytrid fungus B.dendrobatidis (v1 JAM81 2011)
GCF_000203795.1		 8,677
(50.60 %)		 1,251
(4.00 %)		 7,681
(34.45 %)		 n/a 39.25
(99.25 %)		 383
(0.76 %)		 510
(99.24 %)		 2,585
(1.13 %)		 3,424
(1.20 %)		 81,225
(12.02 %)		 161
(0.21 %)
161 ciliates Oxytricha trifallax (v1 JRB310 2012)
GCA_000295675.1		 n/a 1,065
(1.03 %)		 1,781
(1.87 %)		 n/a 31.32
(99.93 %)		 1,347
(0.00 %)		 23,709
(100.00 %)		 29,228
(1.96 %)		 22,291
(1.48 %)		 550,667
(25.14 %)		 20
(0.01 %)
162 climbing perch (v1.1 2018 refseq)
GCF_900324465.1		 42,930
(13.31 %)		 15,237
(3.47 %)		 22,710
(7.34 %)		 37,043
(11.25 %)		 40.40
(98.65 %)		 292
(1.35 %)		 70
(100.00 %)		 329,586
(2.67 %)		 133,519
(1.94 %)		 3,418,470
(21.84 %)		 10,698
(0.86 %)
163 climbing perch (v1.2 2018 genbank)
GCA_900324465.2		 42,746
(63.74 %)		 15,239
(3.53 %)		 39,067
(7.54 %)		 63,908
(10.45 %)		 40.40
(99.35 %)		 266
(0.65 %)		 50
(100.00 %)		 324,479
(2.66 %)		 130,248
(1.89 %)		 3,324,960
(21.31 %)		 10,500
(0.87 %)
164 climbing perch (v1.2 2018 refseq)
GCF_900324465.2		 42,746
(13.53 %)		 15,241
(3.53 %)		 39,067
(7.54 %)		 63,908
(10.45 %)		 40.40
(99.35 %)		 266
(0.65 %)		 51
(100.00 %)		 324,324
(2.66 %)		 130,249
(1.89 %)		 3,325,009
(21.31 %)		 10,500
(0.87 %)
165 clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028018385.1		 81,219
(51.66 %)		 18,516
(1.55 %)		 20,363
(1.39 %)		 n/a 41.79
(99.94 %)		 181
(0.06 %)		 34
(100.00 %)		 4,798,634
(33.91 %)		 992,669
(2.08 %)		 13,618,933
(34.42 %)		 67,831
(2.45 %)
166 clouded yellow (genbank 2021)
GCA_905220415.1		 23,070
(64.23 %)		 4,767
(1.38 %)		 15,869
(7.12 %)		 34,699
(13.48 %)		 33.59
(100.00 %)		 9
(0.00 %)		 33
(100.00 %)		 161,872
(2.42 %)		 73,892
(2.86 %)		 2,544,844
(42.14 %)		 15,663
(2.98 %)
167 coho salmon (150728-3 2017)
GCF_002021735.1		 64,032
(4.29 %)		 24,727
(1.43 %)		 46,926
(3.38 %)		 n/a 43.33
(95.39 %)		 265,291
(4.63 %)		 22,810
(99.99 %)		 1,185,308
(5.22 %)		 2,455,045
(15.99 %)		 11,710,855
(46.53 %)		 72,061
(1.46 %)
168 common bottlenose dolphin (maternal Y genbank 2020)
GCA_011762595.1		 67,207
(45.84 %)		 18,772
(1.77 %)		 20,527
(1.42 %)		 35,815
(1.58 %)		 41.44
(99.74 %)		 674
(0.26 %)		 362
(100.00 %)		 4,067,521
(46.14 %)		 628,982
(2.12 %)		 12,490,896
(35.29 %)		 65,551
(1.90 %)
169 common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 genbank)
GCA_001922835.1		 45,962
(43.27 %)		 17,254
(1.68 %)		 17,112
(1.34 %)		 n/a 40.85
(99.45 %)		 114,003
(0.57 %)		 2,647
(100.00 %)		 3,845,214
(43.88 %)		 514,631
(1.06 %)		 12,317,013
(32.18 %)		 48,030
(1.35 %)
170 common brushtail (genbank 2020)
GCA_011100635.1		 37,661
(35.20 %)		 18,681
(0.81 %)		 15,375
(0.86 %)		 n/a 39.48
(99.44 %)		 1,796
(0.56 %)		 212
(100.00 %)		 7,598,697
(38.92 %)		 1,259,434
(1.97 %)		 22,071,301
(40.56 %)		 17,762
(0.38 %)
171 common carp (2014)
GCF_000951615.1		 75,427
(5.81 %)		 27,632
(2.17 %)		 59,950
(5.28 %)		 n/a 37.00
(97.48 %)		 57,940
(2.53 %)		 9,378
(100.00 %)		 1,460,282
(5.17 %)		 987,356
(7.88 %)		 9,900,821
(37.41 %)		 48,702
(1.38 %)
172 common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 genbank)
GCA_017976375.1		 50,206
(57.28 %)		 13,179
(1.84 %)		 25,859
(2.41 %)		 n/a 42.18
(99.58 %)		 296
(0.42 %)		 151
(100.00 %)		 521,043
(9.61 %)		 310,469
(2.36 %)		 6,712,849
(21.76 %)		 25,267
(1.71 %)
173 common cuckoo (BGI 2014)
GCF_000709325.1		 16,827
(2.53 %)		 12,599
(1.80 %)		 12,623
(2.28 %)		 n/a 41.52
(97.64 %)		 56,977
(2.38 %)		 71,907
(97.62 %)		 418,870
(8.06 %)		 192,437
(2.08 %)		 6,576,259
(19.85 %)		 18,002
(0.74 %)
174 common house spider (v2 Geottingen 2017)
GCF_000365465.2		 30,064
(3.79 %)		 3,347
(0.23 %)		 7,571
(1.48 %)		 n/a 29.46
(81.63 %)		 247,378
(18.44 %)		 263,908
(81.56 %)		 587,943
(2.23 %)		 464,643
(2.90 %)		 10,795,253
(40.31 %)		 10,480
(0.23 %)
175 common house spider (v3 Goettingen 2019 genbank)
GCA_000365465.3		 37,121
(48.05 %)		 3,276
(0.22 %)		 9,098
(1.38 %)		 38,273
(4.24 %)		 29.40
(98.45 %)		 124,228
(1.55 %)		 84,235
(98.46 %)		 637,694
(2.45 %)		 527,781
(4.43 %)		 11,553,196
(51.16 %)		 11,998
(0.33 %)
176 common limpet (v1 primary hap 2022)
GCF_932274485.1		 41,888
(9.21 %)		 3,611
(0.43 %)		 13,244
(4.58 %)		 44,721
(6.30 %)		 36.11
(100.00 %)		 75
(0.00 %)		 13
(100.00 %)		 239,042
(1.40 %)		 359,961
(7.89 %)		 4,399,053
(45.69 %)		 33,411
(1.94 %)
177 common sole (primary hap 2023 genbank)
GCA_958295425.1		 55,359
(63.58 %)		 14,846
(2.94 %)		 42,832
(6.93 %)		 n/a 40.87
(99.99 %)		 373
(0.01 %)		 243
(100.00 %)		 1,149,249
(19.12 %)		 342,239
(9.71 %)		 3,906,839
(32.84 %)		 27,772
(2.71 %)
178 common swift (bApuApu2 2021 genbank)
GCA_020740795.1		 39,986
(53.94 %)		 12,277
(1.88 %)		 20,379
(2.16 %)		 n/a 41.95
(99.84 %)		 256
(0.16 %)		 109
(100.00 %)		 533,758
(8.66 %)		 199,748
(1.12 %)		 6,353,957
(21.19 %)		 20,393
(1.74 %)
179 common vampire bat (v1 HL8 primary hap 2022 genbank)
GCA_022682495.1		 58,054
(45.51 %)		 18,280
(1.71 %)		 19,514
(1.59 %)		 n/a 42.98
(99.99 %)		 611
(0.01 %)		 572
(100.00 %)		 2,761,820
(28.38 %)		 427,940
(3.89 %)		 11,250,492
(32.57 %)		 70,700
(2.48 %)
180 common vampire bat (v1 HL8 primary hap 2022 refseq)
GCF_022682495.1		 58,054
(3.40 %)		 18,280
(1.71 %)		 19,515
(1.59 %)		 n/a 42.98
(99.99 %)		 611
(0.01 %)		 573
(100.00 %)		 2,761,826
(28.38 %)		 427,942
(3.89 %)		 11,250,529
(32.57 %)		 70,701
(2.48 %)
181 common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 genbank)
GCA_002940915.2		 n/a 18,511
(1.87 %)		 18,170
(1.68 %)		 n/a 42.15
(97.78 %)		 54,308
(2.23 %)		 84,108
(97.77 %)		 2,860,991
(29.93 %)		 275,245
(1.03 %)		 11,798,152
(28.19 %)		 51,833
(1.38 %)
182 common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 refseq)
GCF_002940915.1		 51,034
(3.23 %)		 18,506
(1.88 %)		 18,166
(1.68 %)		 n/a 42.15
(97.78 %)		 54,308
(2.23 %)		 84,109
(97.77 %)		 2,861,697
(29.93 %)		 275,247
(1.03 %)		 11,798,198
(28.19 %)		 51,834
(1.38 %)
183 common vampire bat (v1 HL8 alternate hap 2022 genbank)
GCA_022682395.1		 n/a 17,520
(1.75 %)		 18,995
(1.67 %)		 n/a 42.89
(99.99 %)		 580
(0.01 %)		 430
(100.00 %)		 2,597,497
(28.17 %)		 356,620
(2.88 %)		 10,797,225
(31.23 %)		 61,931
(2.30 %)
184 common vampire bat (v2 HL8 primary hap 2022 genbank)
GCA_022682495.2		 n/a 18,311
(1.71 %)		 19,456
(1.59 %)		 n/a 42.99
(99.99 %)		 615
(0.01 %)		 573
(100.00 %)		 2,767,071
(28.35 %)		 431,575
(3.90 %)		 11,286,853
(32.63 %)		 71,506
(2.50 %)
185 Coquerel's sifaka 6110/Marcella (2015 genbank)
GCA_000956105.1		 29,369
(33.72 %)		 19,335
(2.10 %)		 21,769
(1.63 %)		 n/a 41.24
(74.51 %)		 276,544
(25.53 %)		 299,069
(74.47 %)		 3,513,698
(39.82 %)		 304,033
(0.59 %)		 13,333,842
(21.06 %)		 56,694
(1.59 %)
186 cork oak (v1 HL8 2018)
GCF_002906115.1		 65,969
(8.84 %)		 20,226
(1.95 %)		 89,703
(16.66 %)		 n/a 36.19
(97.99 %)		 26,139
(2.01 %)		 23,344
(100.00 %)		 865,884
(3.63 %)		 491,126
(5.95 %)		 6,119,503
(36.10 %)		 21,505
(3.50 %)
187 Cory's shearwater (hap1.1 2024)
GCA_964195595.1		 n/a 13,703
(1.71 %)		 26,310
(2.10 %)		 n/a 43.29
(99.99 %)		 525
(0.01 %)		 414
(100.00 %)		 479,045
(5.03 %)		 336,466
(4.95 %)		 5,910,298
(24.89 %)		 48,046
(4.19 %)
188 Cory's shearwater (hap2.1 2024)
GCA_964196065.1		 n/a 12,750
(1.85 %)		 23,191
(2.16 %)		 n/a 43.03
(99.99 %)		 477
(0.01 %)		 726
(99.99 %)		 403,846
(4.59 %)		 252,125
(3.30 %)		 6,206,493
(22.07 %)		 41,821
(4.50 %)
189 corroboree frog (hap2 2023 genbank)
GCA_028390025.1		 n/a n/a 54,346
(1.07 %)		 n/a 45.66
(99.76 %)		 2,699
(0.24 %)		 3,127
(100.00 %)		 18,782,633
(75.22 %)		 5,902,115
(18.63 %)		 5,826
(99.76 %)		 990,274
(4.84 %)
190 cotton bollworm (Harm_GR_Male_#8 2017 genbank)
GCA_002156985.1		 21,972
(59.55 %)		 4,839
(1.54 %)		 21,045
(8.01 %)		 n/a 36.13
(89.02 %)		 26,910
(11.01 %)		 24,551
(88.99 %)		 115,046
(2.97 %)		 31,900
(0.85 %)		 2,230,382
(25.45 %)		 15,851
(2.18 %)
191 cowpea (IT97K-499-35 v1 2019)
GCF_004118075.1		 48,679
(10.56 %)		 16,927
(3.30 %)		 44,814
(13.06 %)		 54,348
(11.30 %)		 32.98
(99.48 %)		 68
(0.52 %)		 682
(100.00 %)		 352,238
(4.22 %)		 283,949
(8.14 %)		 3,092,021
(41.64 %)		 24,513
(2.40 %)
192 crab-eating macaque WashU 2013 genbank
GCA_000364345.1		 76,183
(45.03 %)		 20,283
(1.90 %)		 20,544
(1.22 %)		 n/a 40.90
(95.16 %)		 80,474
(4.85 %)		 87,763
(95.15 %)		 5,351,207
(51.35 %)		 941,514
(3.24 %)		 15,778,449
(35.74 %)		 76,963
(1.14 %)
193 crab-eating macaque WashU 2013 refseq
GCF_000364345.1		 76,196
(3.30 %)		 20,209
(1.91 %)		 51,427
(6.84 %)		 n/a 40.90
(95.16 %)		 80,474
(4.85 %)		 87,764
(95.15 %)		 5,251,819
(50.85 %)		 941,514
(3.24 %)		 15,778,510
(35.74 %)		 76,963
(1.14 %)
194 crucian carp (primary hap 2023 genbank)
GCA_963082965.1		 90,094
(55.93 %)		 29,389
(2.81 %)		 88,291
(5.37 %)		 n/a 38.31
(99.99 %)		 832
(0.01 %)		 278
(100.00 %)		 3,481,389
(45.81 %)		 802,775
(6.54 %)		 8,190,816
(44.41 %)		 83,696
(3.82 %)
195 crustacean D.carinata (v1 CSIRO-1 2022)
GCF_022539665.1		 22,902
(28.68 %)		 3,621
(2.94 %)		 11,430
(17.96 %)		 n/a 40.34
(99.47 %)		 2
(0.53 %)		 227
(100.00 %)		 81,008
(2.67 %)		 29,625
(4.98 %)		 609,395
(25.66 %)		 6,559
(5.05 %)
196 crustacean D.magna (SK Sungkyunkwan U. 2019 genbank)
GCA_003990815.1		 n/a 3,519
(2.64 %)		 12,174
(17.22 %)		 n/a 40.54
(93.29 %)		 13,228
(6.75 %)		 4,192
(100.00 %)		 63,254
(2.07 %)		 22,325
(1.44 %)		 728,942
(20.81 %)		 8,375
(4.98 %)
197 crustacean P.pollicipes (v2 AB1234 2020)
GCF_011947565.2		 30,025
(5.21 %)		 3,968
(0.39 %)		 56,084
(8.02 %)		 32,834
(5.48 %)		 52.34
(98.93 %)		 10,786
(1.08 %)		 1,254
(100.00 %)		 361,409
(3.23 %)		 533,046
(8.92 %)		 3,456,307
(19.29 %)		 6,722
(54.88 %)
198 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 genbank)
GCA_021462225.2		 n/a 15,131
(1.68 %)		 50,084
(4.18 %)		 n/a 40.18
(99.46 %)		 409
(0.54 %)		 73
(100.00 %)		 2,175,293
(47.80 %)		 176,956
(1.87 %)		 6,142,692
(38.35 %)		 32,973
(1.28 %)
199 Daubenton's bat (primary hap 2023 genbank)
GCA_963259705.1		 64,558
(45.64 %)		 19,142
(1.72 %)		 22,139
(1.66 %)		 n/a 43.18
(99.99 %)		 1,099
(0.01 %)		 122
(100.00 %)		 3,040,239
(24.03 %)		 796,913
(6.38 %)		 10,478,261
(38.84 %)		 64,921
(2.50 %)
200 degu (3935 2012 genbank)
GCA_000260255.1		 48,152
(35.39 %)		 22,240
(1.40 %)		 22,108
(1.46 %)		 n/a 41.38
(84.36 %)		 252,770
(15.68 %)		 259,903
(84.32 %)		 4,890,270
(27.82 %)		 898,943
(1.50 %)		 14,281,942
(29.30 %)		 40,135
(0.82 %)
201 denticle herring (v1 2019)
GCF_900700375.1		 59,645
(12.74 %)		 16,556
(3.78 %)		 37,861
(8.42 %)		 72,719
(10.66 %)		 43.69
(99.18 %)		 464
(0.82 %)		 460
(100.00 %)		 403,512
(3.23 %)		 224,282
(4.61 %)		 2,948,671
(28.79 %)		 64,661
(9.49 %)
202 diamondback terrapin (hap1 2023 genbank)
GCA_027887155.1		 50,318
(52.07 %)		 15,109
(1.08 %)		 19,281
(1.62 %)		 n/a 44.46
(99.92 %)		 141
(0.08 %)		 76
(100.00 %)		 4,088,064
(46.33 %)		 403,943
(1.72 %)		 11,014,504
(33.74 %)		 110,838
(2.71 %)
203 diplomonads (v1 WB C6 WB C6 2008)
GCF_000002435.1		 6,502
(71.82 %)		 251
(1.29 %)		 2,079
(62.62 %)		 n/a 49.25
(99.82 %)		 242
(0.19 %)		 306
(99.81 %)		 697
(1.34 %)		 335
(0.65 %)		 20,634
(5.24 %)		 2,275
(23.86 %)
204 dog (BS72 2019 Broad)
GCA_004027395.1		 n/a 22,343
(1.53 %)		 28,525
(1.27 %)		 n/a 41.66
(99.91 %)		 10,428
(0.04 %)		 667,170
(99.96 %)		 5,598,608
(45.38 %)		 1,220,686
(2.58 %)		 14,079,363
(36.37 %)		 62,881
(2.13 %)
205 domestic ferret (Sable ID 1420 FGSC 2011)
GCF_000215625.1		 55,980
(3.39 %)		 18,440
(1.59 %)		 19,474
(1.48 %)		 n/a 41.47
(94.51 %)		 109,700
(5.51 %)		 117,442
(94.49 %)		 n/a 606,818
(1.04 %)		 13,503,550
(29.63 %)		 53,376
(1.90 %)
206 domestic guinea pig (2N 2008 genbank)
GCA_000151735.1		 44,762
(33.07 %)		 18,297
(1.33 %)		 20,107
(1.34 %)		 n/a 39.95
(97.81 %)		 58,460
(2.20 %)		 61,603
(97.80 %)		 4,257,412
(38.85 %)		 658,532
(1.25 %)		 14,547,631
(34.19 %)		 37,092
(0.85 %)
207 domestic silkworm (genbank 2020)
GCA_014905235.2		 n/a 5,227
(1.28 %)		 18,795
(5.67 %)		 n/a 38.55
(99.90 %)		 30
(0.10 %)		 696
(100.00 %)		 615,428
(29.26 %)		 86,179
(1.65 %)		 2,607,325
(47.66 %)		 44,022
(10.06 %)
208 domesticated barley (H.vulgare 2021 genbank)
GCA_904849725.1		 63,294
(3.74 %)		 18,050
(0.43 %)		 260,902
(9.04 %)		 n/a 44.46
(99.97 %)		 162
(0.03 %)		 290
(100.00 %)		 1,274,894
(2.42 %)		 1,726,303
(5.40 %)		 14,010,542
(72.58 %)		 732,828
(17.24 %)
209 dorado (hap2 2023 genbank)
GCA_030463535.1		 n/a 16,799
(2.11 %)		 50,411
(4.67 %)		 n/a 41.29
(99.15 %)		 726
(0.85 %)		 104
(100.00 %)		 2,693,928
(34.60 %)		 805,807
(14.65 %)		 5,615,731
(36.69 %)		 30,083
(1.31 %)
210 downy mildews (GKB4 2021 genbank)
GCA_018691715.1		 n/a 1,641
(1.07 %)		 33,976
(44.50 %)		 n/a 54.16
(99.69 %)		 80
(0.31 %)		 133
(100.00 %)		 18,997
(0.80 %)		 16,094
(2.84 %)		 200,994
(27.68 %)		 232
(99.71 %)
211 downy woodpecker (bDryPub1 primary hap 2020)
GCA_014839835.1		 25,483
(48.39 %)		 12,405
(1.70 %)		 23,073
(2.18 %)		 n/a 45.31
(99.66 %)		 187
(0.34 %)		 181
(100.00 %)		 1,008,118
(21.51 %)		 378,537
(3.38 %)		 5,846,717
(32.04 %)		 26,005
(1.75 %)
212 downy woodpecker (BGI 2014)
GCF_000699005.1		 15,850
(2.33 %)		 11,864
(1.67 %)		 11,795
(1.99 %)		 n/a 44.51
(96.31 %)		 96,471
(3.72 %)		 127,725
(96.28 %)		 842,281
(18.63 %)		 310,018
(2.09 %)		 5,822,687
(27.83 %)		 17,379
(0.69 %)
213 E. coli (K-12 BW25113 2014 genbank)
GCA_000750555.1		 n/a n/a n/a n/a 50.78
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 n/a 90
(0.38 %)		 19,508
(7.44 %)		 1
(99.99 %)
214 East African water lily (v1 Beijing-Zhang1983 2019)
GCF_008831285.1		 39,088
(10.61 %)		 11,569
(2.49 %)		 38,114
(15.67 %)		 n/a 38.59
(99.98 %)		 627
(0.02 %)		 1,425
(99.98 %)		 230,165
(2.88 %)		 153,929
(4.02 %)		 2,160,647
(26.81 %)		 24,567
(4.41 %)
215 eastern European house mouse (PWK_PhJ v1 2016)
GCA_001624775.1		 n/a 21,013
(2.21 %)		 18,237
(1.40 %)		 101,394
(4.09 %)		 41.76
(90.89 %)		 904,107
(9.24 %)		 30,233
(98.34 %)		 5,250,349
(40.55 %)		 1,508,787
(2.97 %)		 13,823,341
(28.09 %)		 16,695
(0.43 %)
216 eastern happy (v2 2018)
GCF_900246225.1		 57,615
(9.59 %)		 15,348
(2.22 %)		 28,518
(6.29 %)		 42,170
(8.31 %)		 41.07
(99.87 %)		 490
(0.13 %)		 364
(100.00 %)		 527,486
(5.98 %)		 217,915
(1.89 %)		 4,547,443
(30.78 %)		 33,005
(1.88 %)
217 Egyptian rousette (US006 2019 Broad)
GCA_004024865.1		 n/a 20,133
(1.87 %)		 36,361
(1.80 %)		 n/a 40.23
(99.96 %)		 4,332
(0.02 %)		 226,086
(99.98 %)		 2,985,622
(32.66 %)		 475,311
(1.11 %)		 12,612,081
(27.34 %)		 81,930
(5.75 %)
218 Egyptian rousette (v1 2020 genbank)
GCA_014176215.1		 65,163
(51.34 %)		 17,637
(2.08 %)		 22,318
(1.84 %)		 n/a 40.05
(98.59 %)		 242
(1.41 %)		 30
(100.00 %)		 2,821,248
(33.05 %)		 434,415
(1.02 %)		 12,031,652
(26.52 %)		 53,604
(6.69 %)
219 electric eel (primary hap 2020 genbank)
GCA_013358815.1		 n/a 15,954
(3.67 %)		 48,976
(7.25 %)		 n/a 42.49
(98.20 %)		 227
(1.80 %)		 90
(100.00 %)		 567,621
(7.41 %)		 564,288
(10.86 %)		 2,935,361
(24.79 %)		 44,501
(3.93 %)
220 elephant shark (2013)
GCF_000165045.1		 30,695
(4.95 %)		 11,306
(1.54 %)		 18,189
(3.03 %)		 n/a 42.34
(96.16 %)		 46,232
(3.85 %)		 67,421
(96.15 %)		 1,405,480
(27.29 %)		 330,698
(2.60 %)		 5,549,534
(36.65 %)		 35,561
(2.16 %)
221 emu (v1 ZJU1.0 2020)
GCA_016128335.1		 n/a 13,181
(1.74 %)		 24,708
(2.10 %)		 33,433
(3.99 %)		 42.41
(100.00 %)		 512
(0.00 %)		 802
(100.00 %)		 504,527
(4.38 %)		 259,276
(2.59 %)		 7,105,965
(19.15 %)		 41,784
(5.52 %)
222 epaulette shark (2021 genbank)
GCA_020745735.1		 43,156
(39.58 %)		 12,439
(0.39 %)		 19,520
(1.06 %)		 n/a 42.76
(98.05 %)		 3,716
(1.95 %)		 1,963
(100.00 %)		 9,211,963
(69.93 %)		 935,037
(6.51 %)		 20,660,613
(43.88 %)		 41,682
(1.08 %)
223 eudicots lettuce (Salinas v7 2020)
GCF_002870075.2		 65,115
(2.96 %)		 16,271
(0.65 %)		 102,071
(6.37 %)		 n/a 37.79
(92.44 %)		 353,389
(7.60 %)		 11,454
(99.71 %)		 1,109,875
(4.83 %)		 983,866
(3.64 %)		 12,335,790
(52.95 %)		 117,743
(2.02 %)
224 Euphrates poplar (v1 2014)
GCF_000495115.1		 56,539
(12.93 %)		 20,844
(4.28 %)		 41,664
(12.47 %)		 n/a 32.08
(95.31 %)		 23,174
(4.71 %)		 32,789
(95.29 %)		 332,532
(5.23 %)		 246,766
(4.06 %)		 2,679,673
(43.30 %)		 2,781
(0.47 %)
225 Eurasian badger (v3.1 2021)
GCF_922984935.1		 57,138
(2.48 %)		 19,265
(1.40 %)		 22,121
(1.36 %)		 n/a 42.48
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 538
(100.00 %)		 4,487,951
(32.73 %)		 821,664
(4.02 %)		 13,814,723
(38.08 %)		 66,524
(3.95 %)
226 Eurasian red squirrel (v1.1 2019)
GCA_902686455.1		 n/a 21,298
(1.58 %)		 21,024
(1.36 %)		 36,645
(1.54 %)		 40.08
(94.33 %)		 1,177
(5.67 %)		 638
(100.00 %)		 4,680,964
(35.76 %)		 704,218
(1.42 %)		 14,991,981
(31.49 %)		 48,159
(1.04 %)
227 Eurasian water vole (v1 2020)
GCF_903992535.1		 45,658
(2.52 %)		 19,724
(1.77 %)		 19,069
(1.47 %)		 34,561
(2.01 %)		 42.15
(99.74 %)		 872
(0.26 %)		 216
(100.00 %)		 4,098,151
(26.75 %)		 1,088,237
(2.91 %)		 12,853,776
(32.42 %)		 19,000
(0.58 %)
228 European conger (primary hap 2023 genbank)
GCA_963514075.1		 54,631
(54.17 %)		 17,073
(1.89 %)		 34,794
(5.07 %)		 n/a 43.89
(99.98 %)		 1,009
(0.02 %)		 394
(100.00 %)		 761,527
(5.99 %)		 913,328
(13.25 %)		 5,768,003
(35.48 %)		 120,990
(6.12 %)
229 European eel (primary hap 2020 genbank)
GCA_013347855.1		 n/a 17,048
(2.22 %)		 34,271
(5.56 %)		 n/a 43.64
(99.61 %)		 640
(0.40 %)		 53
(100.00 %)		 831,037
(5.48 %)		 786,520
(8.15 %)		 5,700,818
(27.40 %)		 130,345
(8.19 %)
230 European mink (primary hap 2023 genbank)
GCA_030435805.1		 69,556
(45.15 %)		 18,706
(1.46 %)		 21,193
(1.37 %)		 n/a 41.85
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 26
(100.00 %)		 4,237,797
(30.90 %)		 792,898
(2.69 %)		 13,417,248
(36.59 %)		 67,133
(2.54 %)
231 European peacock (2021 genbank)
GCA_905147045.1		 22,557
(62.12 %)		 4,716
(1.16 %)		 12,599
(4.34 %)		 26,251
(7.81 %)		 33.70
(100.00 %)		 10
(0.00 %)		 42
(100.00 %)		 212,528
(2.58 %)		 60,682
(1.18 %)		 3,127,157
(46.89 %)		 24,620
(4.88 %)
232 European plaice (primary hap 2022 genbank)
GCA_947347685.1		 46,467
(52.27 %)		 14,820
(2.71 %)		 51,453
(7.41 %)		 n/a 42.51
(99.97 %)		 1,072
(0.03 %)		 356
(100.00 %)		 476,317
(3.63 %)		 520,730
(13.27 %)		 3,283,400
(33.55 %)		 47,051
(4.45 %)
233 European snow vole (primary hap 2023 genbank)
GCA_950005125.1		 47,025
(39.90 %)		 20,576
(1.75 %)		 21,171
(1.56 %)		 n/a 41.98
(100.00 %)		 197
(0.00 %)		 161
(100.00 %)		 3,580,811
(22.71 %)		 998,537
(5.14 %)		 12,204,125
(34.97 %)		 20,725
(0.63 %)
234 European turtle dove (v1.1 alternate hap 2019)
GCA_901699165.1		 n/a 11,276
(1.79 %)		 21,238
(2.15 %)		 n/a 41.73
(100.00 %)		 n/a 3,333
(100.00 %)		 466,567
(7.08 %)		 182,345
(0.97 %)		 6,037,183
(20.24 %)		 29,648
(2.35 %)
235 European turtle dove (v1.1 primary hap 2019)
GCA_901699155.1		 n/a 12,415
(1.77 %)		 23,484
(2.17 %)		 n/a 41.84
(99.67 %)		 894
(0.33 %)		 357
(100.00 %)		 539,737
(7.60 %)		 227,500
(1.16 %)		 6,768,805
(21.05 %)		 34,729
(2.65 %)
236 European woodmouse (2022 genbank)
GCA_947179515.1		 54,113
(34.13 %)		 19,960
(1.65 %)		 19,954
(1.25 %)		 n/a 41.23
(99.99 %)		 1,129
(0.01 %)		 498
(100.00 %)		 4,863,656
(37.41 %)		 1,795,997
(8.95 %)		 13,681,786
(40.58 %)		 23,961
(0.53 %)
237 fall armyworm (Faw-zju 2020 genbank)
GCA_011064685.1		 32,738
(63.63 %)		 5,744
(1.12 %)		 26,631
(7.08 %)		 n/a 36.43
(99.99 %)		 525
(0.01 %)		 91
(100.00 %)		 168,479
(1.60 %)		 72,876
(1.70 %)		 3,384,083
(37.35 %)		 30,753
(4.27 %)
238 fall armyworm (Faw-zju v1.0 refseq 2020)
GCF_011064685.1		 32,751
(9.65 %)		 5,744
(1.12 %)		 26,632
(7.08 %)		 n/a 36.43
(99.99 %)		 525
(0.01 %)		 92
(100.00 %)		 169,122
(1.61 %)		 72,892
(1.70 %)		 3,384,365
(37.36 %)		 30,753
(4.27 %)
239 fire-bellied toad (primary hap 2023 genbank)
GCA_027579735.1		 n/a 15,456
(0.21 %)		 47,501
(0.88 %)		 n/a 38.98
(98.02 %)		 7,009
(1.99 %)		 2,468
(100.00 %)		 20,643,710
(70.75 %)		 7,150,262
(12.27 %)		 9,477
(98.01 %)		 365,066
(1.20 %)
240 fission yeast (v1 972h- 2007 refseq)
GCF_000002945.1		 6,744
(82.69 %)		 5,085
(73.29 %)		 3,403
(39.29 %)		 n/a 36.05
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 4
(100.00 %)		 3,336
(2.63 %)		 1,034
(0.58 %)		 80,458
(16.22 %)		 105
(0.31 %)
241 fission yeast (v2 972h- 2019 genbank)
GCA_000002945.3		 n/a 5,084
(73.46 %)		 3,394
(39.28 %)		 n/a 36.06
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 9
(100.00 %)		 3,053
(1.03 %)		 1,034
(0.58 %)		 79,714
(16.06 %)		 105
(0.31 %)
242 flatworm S.haematobium (v2 2020)
GCF_000699445.2		 8,934
(5.16 %)		 1,548
(0.29 %)		 4,070
(2.36 %)		 8,934
(5.16 %)		 34.53
(99.76 %)		 15,128
(0.26 %)		 666
(100.00 %)		 124,259
(1.58 %)		 35,312
(1.17 %)		 2,638,150
(34.10 %)		 3,957
(0.38 %)
243 flier cichlid (MPI-CPG 2019 genbank)
GCA_007364275.2		 n/a 15,436
(2.15 %)		 26,448
(5.90 %)		 64,657
(6.60 %)		 41.23
(98.19 %)		 744
(1.81 %)		 189
(100.00 %)		 1,014,141
(16.95 %)		 287,037
(2.21 %)		 5,305,987
(30.67 %)		 24,130
(1.26 %)
244 Florida manatee (Lorelei 2012 genbank)
GCA_000243295.1		 39,651
(35.92 %)		 18,302
(1.36 %)		 20,592
(1.23 %)		 32,831
(1.38 %)		 40.73
(89.24 %)		 160,167
(10.78 %)		 166,489
(89.22 %)		 5,109,822
(37.03 %)		 389,314
(0.74 %)		 14,633,007
(38.46 %)		 27,461
(0.64 %)
245 fly D.albomicans (v1 15112-1751.03 2019)
GCF_009650485.1		 24,196
(18.66 %)		 10,065
(8.48 %)		 14,473
(13.61 %)		 n/a 38.15
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 11
(100.00 %)		 298,709
(14.86 %)		 80,048
(3.56 %)		 1,317,733
(33.56 %)		 18,849
(8.62 %)
246 fly D.santomea (v1.0 2021)
GCF_016746245.1		 25,550
(21.64 %)		 13,354
(17.52 %)		 20,540
(17.87 %)		 n/a 42.61
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 104
(100.00 %)		 169,365
(23.08 %)		 64,316
(3.47 %)		 791,743
(23.14 %)		 27,794
(16.15 %)
247 fly D.sechellia (sech25 v1 2019 UC Irvine)
GCF_004382195.1		 26,658
(22.06 %)		 13,461
(17.65 %)		 21,781
(17.83 %)		 n/a 42.26
(100.00 %)		 38
(0.00 %)		 402
(100.00 %)		 145,818
(25.16 %)		 34,869
(4.31 %)		 719,811
(25.74 %)		 30,130
(16.11 %)
248 fly D.serrata (v1.0 Fors4 2017)
GCF_002093755.1		 21,759
(15.21 %)		 12,488
(9.92 %)		 21,269
(14.06 %)		 n/a 39.11
(100.00 %)		 n/a 1,356
(100.00 %)		 314,594
(25.90 %)		 82,446
(12.33 %)		 1,113,448
(37.00 %)		 27,493
(12.03 %)
249 fly D.simulans (w501 v3.0 2021)
GCF_016746395.1		 28,595
(26.45 %)		 13,448
(20.44 %)		 18,989
(18.34 %)		 n/a 42.47
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 96
(100.00 %)		 126,424
(16.72 %)		 32,595
(4.31 %)		 759,296
(23.70 %)		 27,530
(17.02 %)
250 fly D.yakuba (2018)
GCF_000005975.2		 5,444
(4.10 %)		 13,713
(15.95 %)		 22,613
(16.71 %)		 n/a 42.28
(98.12 %)		 5,400
(1.88 %)		 13,440
(98.12 %)		 180,908
(22.48 %)		 68,911
(3.75 %)		 897,353
(23.94 %)		 31,387
(14.91 %)
251 fly D.yakuba (v1 2021)
GCF_016746365.1		 27,938
(24.60 %)		 13,343
(17.86 %)		 20,029
(17.64 %)		 n/a 42.55
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 54
(100.00 %)		 169,559
(23.47 %)		 60,591
(3.64 %)		 837,616
(23.40 %)		 28,204
(16.22 %)
252 Gaboon caecilian (v1.1 2019 genbank)
GCA_902459505.1		 54,713
(61.19 %)		 14,267
(0.51 %)		 29,026
(1.40 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 433
(0.15 %)		 163
(100.00 %)		 1,311,113
(1.64 %)		 1,364,596
(3.83 %)		 19,589,738
(52.85 %)		 270,923
(4.52 %)
253 Gaboon caecilian (v1.1 2019 refseq)
GCF_902459505.1		 54,713
(1.72 %)		 14,269
(0.51 %)		 29,026
(1.40 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 433
(0.15 %)		 164
(100.00 %)		 1,310,970
(1.64 %)		 1,364,597
(3.83 %)		 19,589,802
(52.85 %)		 270,923
(4.52 %)
254 giant manta (hap1 2023 genbank)
GCA_030028105.1		 n/a 12,432
(0.38 %)		 24,821
(1.16 %)		 n/a 43.26
(99.23 %)		 1,810
(0.77 %)		 4,715
(100.00 %)		 7,913,208
(49.68 %)		 969,352
(14.22 %)		 20,235,210
(54.42 %)		 110,678
(1.74 %)
255 giant panda (2009 BGI)
GCF_000004335.2		 40,432
(2.55 %)		 18,884
(1.76 %)		 18,919
(1.46 %)		 n/a 41.60
(97.66 %)		 119,126
(2.36 %)		 200,593
(97.64 %)		 4,236,423
(40.48 %)		 503,179
(1.10 %)		 13,781,487
(28.85 %)		 53,465
(1.34 %)
256 giant panda (Jingjing v1 2017)
GCA_002007445.1		 n/a 20,110
(1.71 %)		 22,288
(1.49 %)		 n/a 41.69
(98.08 %)		 186,846
(1.93 %)		 244,258
(98.07 %)		 4,464,041
(41.66 %)		 614,896
(2.00 %)		 14,294,774
(30.62 %)		 59,340
(1.50 %)
257 giant panda (Jingjing v2 genbank 2020)
GCA_002007445.2		 n/a 20,381
(1.71 %)		 21,979
(1.44 %)		 43,086
(2.00 %)		 41.69
(98.09 %)		 190,364
(1.92 %)		 77,287
(100.00 %)		 4,484,597
(41.53 %)		 618,595
(2.00 %)		 14,236,406
(30.39 %)		 59,945
(1.50 %)
258 giant panda (Jingjing v2 refseq 2020)
GCF_002007445.1		 67,162
(3.32 %)		 20,374
(1.71 %)		 21,965
(1.44 %)		 43,086
(2.00 %)		 41.69
(98.09 %)		 190,364
(1.92 %)		 77,288
(100.00 %)		 4,476,689
(41.47 %)		 618,596
(2.00 %)		 14,236,463
(30.39 %)		 59,946
(1.50 %)
259 gilthead seabream (v1 2019)
GCF_900880675.1		 59,027
(10.96 %)		 15,412
(2.36 %)		 31,802
(6.47 %)		 73,197
(7.97 %)		 41.94
(99.96 %)		 1,050
(0.04 %)		 176
(100.00 %)		 531,360
(3.04 %)		 305,809
(3.03 %)		 4,701,694
(25.69 %)		 47,327
(2.41 %)
260 Glanville fritillary (genbank 2021)
GCA_905220565.1		 17,520
(43.15 %)		 4,738
(0.89 %)		 16,197
(5.05 %)		 35,235
(7.97 %)		 34.09
(100.00 %)		 80
(0.01 %)		 32
(100.00 %)		 343,193
(3.25 %)		 144,286
(3.46 %)		 3,683,956
(48.60 %)		 30,200
(4.54 %)
261 globe artichoke (v1 2C 2018)
GCF_001531365.1		 42,119
(6.72 %)		 15,804
(2.23 %)		 49,721
(11.10 %)		 n/a 35.35
(90.31 %)		 310,473
(9.77 %)		 13,588
(99.93 %)		 394,687
(2.79 %)		 364,361
(3.37 %)		 4,191,676
(39.48 %)		 12,198
(0.64 %)
262 goat (v1 San Clemente 2016 USDA genbank)
GCA_001704415.1		 0
(0.00 %)		 19,842
(1.43 %)		 22,426
(1.24 %)		 52,608
(1.64 %)		 43.16
(100.00 %)		 790
(0.00 %)		 29,906
(100.00 %)		 5,669,868
(50.59 %)		 760,836
(7.07 %)		 13,024,386
(44.85 %)		 125,682
(4.01 %)
263 goat (v1 San Clemente 2016 USDA refseq)
GCF_001704415.1		 47,206
(2.31 %)		 19,857
(1.43 %)		 22,880
(1.27 %)		 52,608
(1.64 %)		 43.16
(100.00 %)		 790
(0.00 %)		 29,907
(100.00 %)		 5,578,287
(50.22 %)		 760,837
(7.07 %)		 13,024,440
(44.85 %)		 125,682
(4.02 %)
264 golden eagle (v1.2 2019)
GCF_900496995.1		 55,164
(5.86 %)		 13,226
(1.87 %)		 23,033
(2.15 %)		 25,921
(3.22 %)		 42.11
(99.61 %)		 191
(0.39 %)		 142
(100.00 %)		 519,341
(5.86 %)		 180,990
(0.79 %)		 7,005,531
(19.25 %)		 37,343
(3.12 %)
265 golden eagle (v1.2 alternate hap 2019)
GCA_902153765.1		 n/a 9,334
(1.82 %)		 17,594
(2.12 %)		 n/a 42.53
(99.93 %)		 39
(0.07 %)		 3,860
(100.00 %)		 356,284
(6.03 %)		 123,430
(0.80 %)		 4,417,887
(19.25 %)		 28,919
(3.52 %)
266 golden hamster (Baylor 2013 genbank)
GCA_000349665.1		 0
(0.00 %)		 18,965
(1.82 %)		 19,339
(1.52 %)		 n/a 42.01
(82.92 %)		 216,216
(17.12 %)		 237,699
(82.88 %)		 3,724,142
(27.19 %)		 790,256
(1.69 %)		 12,003,866
(24.29 %)		 18,591
(0.51 %)
267 golden snub-nosed monkey (2014 Novogene)
GCA_000769185.1		 n/a 21,341
(1.86 %)		 22,492
(1.24 %)		 n/a 40.87
(98.50 %)		 61,291
(1.50 %)		 196,804
(98.50 %)		 5,673,299
(51.36 %)		 1,080,627
(3.06 %)		 16,205,827
(36.77 %)		 79,387
(1.14 %)
268 gopher snake (HBS135680 alternate hap 2023 genbank)
GCA_029215685.1		 n/a 12,291
(1.06 %)		 19,125
(2.02 %)		 n/a 40.55
(100.00 %)		 584
(0.00 %)		 1,233
(100.00 %)		 1,259,781
(7.92 %)		 925,571
(7.56 %)		 7,739,320
(45.92 %)		 73,681
(2.81 %)
269 grape phylloxera (Bord-2020 2022 genbank)
GCA_025091365.1		 n/a 2,982
(0.90 %)		 5,710
(2.77 %)		 n/a 27.24
(97.73 %)		 41,970
(2.29 %)		 8,544
(100.00 %)		 195,538
(3.32 %)		 65,664
(2.79 %)		 2,529,566
(54.06 %)		 4,357
(1.18 %)
270 gray mouse lemur genbank
GCA_000165445.3		 n/a 20,031
(1.89 %)		 22,619
(1.50 %)		 n/a 40.98
(95.94 %)		 43,363
(4.06 %)		 50,982
(95.94 %)		 4,082,873
(41.60 %)		 582,430
(1.47 %)		 14,808,558
(30.05 %)		 74,772
(2.61 %)
271 gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027887165.1		 73,383
(42.66 %)		 16,638
(0.72 %)		 16,171
(0.86 %)		 n/a 37.92
(99.11 %)		 2,255
(0.89 %)		 14
(100.00 %)		 5,562,366
(25.40 %)		 1,096,625
(2.60 %)		 22,322,798
(43.37 %)		 28,894
(0.57 %)
272 great fruit-eating bat (v1 hap1 2024)
GCA_038363095.1		 n/a 18,022
(1.56 %)		 20,018
(1.52 %)		 n/a 42.28
(100.00 %)		 81
(0.00 %)		 419
(100.00 %)		 2,827,417
(26.82 %)		 371,479
(4.97 %)		 11,603,093
(34.64 %)		 71,574
(2.28 %)
273 great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 genbank)
GCA_001890085.1		 50,937
(43.78 %)		 19,011
(2.00 %)		 19,882
(1.66 %)		 41,741
(2.41 %)		 41.11
(87.42 %)		 172,751
(12.60 %)		 7,570
(100.00 %)		 3,078,210
(32.07 %)		 495,290
(1.05 %)		 11,588,202
(25.43 %)		 33,101
(0.97 %)
274 great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 refseq)
GCF_001890085.1		 50,937
(3.26 %)		 18,992
(2.00 %)		 19,880
(1.66 %)		 41,778
(2.41 %)		 41.11
(87.42 %)		 172,751
(12.60 %)		 7,571
(100.00 %)		 3,285,971
(33.14 %)		 495,292
(1.05 %)		 11,588,248
(25.43 %)		 33,101
(0.97 %)
275 greater horseshoe bat (mRhiFer1 2020)
GCA_014108255.1		 n/a 18,531
(1.97 %)		 20,309
(1.67 %)		 n/a 40.52
(99.19 %)		 292
(0.81 %)		 50
(100.00 %)		 3,284,473
(35.00 %)		 559,653
(1.29 %)		 12,043,562
(29.15 %)		 32,047
(1.05 %)
276 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 genbank)
GCA_004115265.2		 53,353
(46.77 %)		 18,647
(1.97 %)		 20,359
(1.68 %)		 n/a 40.54
(99.64 %)		 158
(0.36 %)		 135
(100.00 %)		 3,301,020
(34.99 %)		 564,790
(1.35 %)		 12,217,069
(29.39 %)		 32,445
(1.06 %)
277 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 refseq)
GCF_004115265.1		 53,352
(3.13 %)		 18,647
(1.97 %)		 20,359
(1.68 %)		 n/a 40.54
(99.64 %)		 158
(0.36 %)		 134
(100.00 %)		 3,300,836
(34.99 %)		 564,789
(1.35 %)		 12,217,020
(29.39 %)		 32,445
(1.06 %)
278 greater mouse-eared bat (2019 Broad)
GCA_004026985.1		 n/a 23,153
(1.31 %)		 51,642
(1.43 %)		 n/a 43.16
(99.88 %)		 8,133
(0.04 %)		 1,053,330
(99.96 %)		 3,675,075
(25.48 %)		 938,700
(2.73 %)		 12,027,923
(39.01 %)		 80,955
(2.31 %)
279 greater pipefish (v1.1 2019)
GCA_901709675.1		 n/a 13,467
(5.26 %)		 42,380
(12.01 %)		 n/a 43.46
(100.00 %)		 43
(0.00 %)		 87
(100.00 %)		 193,442
(3.05 %)		 125,716
(4.25 %)		 1,676,004
(25.93 %)		 46,340
(13.40 %)
280 greater sac-winged bat (primary hap 2024 genbank)
GCA_036850765.1		 n/a 18,322
(1.40 %)		 21,049
(1.35 %)		 n/a 41.71
(98.73 %)		 468
(1.27 %)		 359
(99.59 %)		 4,247,148
(29.53 %)		 1,031,385
(2.50 %)		 12,465,194
(43.30 %)		 101,620
(2.01 %)
281 greater wax moth (Carbio01_MB 2019 genbank)
GCA_003640425.2		 20,814
(51.89 %)		 4,346
(0.99 %)		 12,930
(3.50 %)		 21,226
(7.60 %)		 33.06
(99.10 %)		 27,314
(0.92 %)		 13,303
(100.00 %)		 270,925
(3.18 %)		 86,050
(1.20 %)		 3,416,162
(48.29 %)		 11,043
(1.07 %)
282 green algae C.reinhardtii (v1 CC-503 cw92 v1 2007)
GCF_000002595.1		 14,484
(22.24 %)		 987
(0.55 %)		 11,299
(59.37 %)		 n/a 63.87
(87.58 %)		 10,425
(12.45 %)		 11,385
(87.55 %)		 167,652
(16.23 %)		 100,391
(4.60 %)		 734,057
(30.38 %)		 3,154
(63.45 %)
283 green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 genbank)
GCA_000002595.3		 n/a 988
(0.56 %)		 9,689
(59.71 %)		 n/a 64.08
(96.36 %)		 1,459
(3.65 %)		 1,512
(96.35 %)		 171,684
(17.03 %)		 110,553
(6.12 %)		 748,240
(34.06 %)		 106
(99.48 %)
284 green algae C.variabilis (NC64A 2010 genbank)
GCA_000147415.1		 9,780
(62.01 %)		 743
(1.01 %)		 4,520
(67.55 %)		 n/a 67.14
(91.48 %)		 3,543
(8.55 %)		 3,810
(91.45 %)		 65,787
(8.35 %)		 28,736
(2.86 %)		 416,740
(37.15 %)		 776
(95.90 %)
285 green monkey 1994-021 (2014 genbank)
GCA_000409795.2		 76,037
(46.89 %)		 20,079
(1.94 %)		 20,246
(1.25 %)		 n/a 40.81
(98.67 %)		 178,925
(1.35 %)		 163,017
(98.65 %)		 5,382,039
(50.20 %)		 980,479
(2.63 %)		 16,076,172
(35.62 %)		 50,033
(1.04 %)
286 green sea turtle (BGI 2013)
GCF_000344595.1		 31,786
(2.57 %)		 14,548
(1.02 %)		 15,297
(1.46 %)		 n/a 43.49
(95.57 %)		 134,344
(4.44 %)		 274,367
(95.56 %)		 1,615,553
(13.87 %)		 317,600
(2.08 %)		 11,732,990
(28.32 %)		 36,782
(0.70 %)
287 green sea turtle (v1 2020)
GCF_015237465.1		 56,917
(3.63 %)		 14,729
(1.06 %)		 17,439
(1.56 %)		 n/a 44.01
(99.44 %)		 294
(0.56 %)		 99
(100.00 %)		 1,641,730
(15.08 %)		 304,356
(1.25 %)		 11,136,918
(31.96 %)		 49,035
(1.44 %)
288 harbor porpoise (BS71 2019)
GCA_004363495.1		 n/a 21,044
(1.46 %)		 30,072
(1.23 %)		 n/a 41.83
(99.88 %)		 7,114
(0.03 %)		 1,338,272
(99.97 %)		 5,359,537
(46.83 %)		 772,736
(1.54 %)		 13,705,428
(42.29 %)		 80,965
(1.65 %)
289 Harpy eagle (primary hap 2022 genbank)
GCA_026419915.1		 51,641
(50.37 %)		 13,412
(1.70 %)		 24,002
(2.05 %)		 n/a 43.39
(99.80 %)		 342
(0.20 %)		 322
(100.00 %)		 456,476
(3.62 %)		 260,495
(7.70 %)		 5,658,773
(24.81 %)		 60,606
(5.66 %)
290 Hawaiian crow (2021 genbank)
GCA_020740725.1		 51,593
(54.67 %)		 12,737
(1.83 %)		 23,664
(2.30 %)		 n/a 43.30
(99.84 %)		 294
(0.16 %)		 187
(100.00 %)		 502,844
(6.10 %)		 304,680
(5.73 %)		 5,953,316
(23.59 %)		 46,108
(3.49 %)
291 Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U genbank)
GCA_002201575.1		 0
(0.00 %)		 19,385
(1.74 %)		 20,265
(1.41 %)		 33,375
(1.66 %)		 41.41
(97.77 %)		 38,833
(2.24 %)		 7,871
(100.00 %)		 4,629,031
(43.70 %)		 573,328
(1.09 %)		 13,374,887
(33.10 %)		 50,379
(1.45 %)
292 Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U refseq)
GCF_002201575.1		 29,897
(1.95 %)		 19,404
(1.74 %)		 20,264
(1.41 %)		 33,412
(1.67 %)		 41.41
(97.77 %)		 38,833
(2.24 %)		 7,872
(100.00 %)		 4,547,865
(43.29 %)		 573,335
(1.09 %)		 13,374,928
(33.10 %)		 50,380
(1.45 %)
293 hemichordates Saccoglossus HW-2024a (v1 hap1 2024)
GCA_040954625.1		 n/a 4,944
(1.30 %)		 35,031
(15.53 %)		 n/a 39.72
(99.96 %)		 254
(0.04 %)		 77
(100.00 %)		 87,841
(1.67 %)		 119,697
(13.20 %)		 1,309,907
(29.40 %)		 21,623
(4.17 %)
294 hemichordates Saccoglossus HW-2024a (v1 hap2 2024)
GCA_040954595.1		 n/a 4,919
(1.33 %)		 34,873
(16.02 %)		 n/a 39.72
(99.96 %)		 254
(0.04 %)		 56
(100.00 %)		 84,495
(1.58 %)		 118,073
(13.23 %)		 1,301,514
(28.77 %)		 20,511
(4.03 %)
295 hippopotamus (v2 hap2 2023 genbank)
GCA_030028045.1		 64,153
(41.00 %)		 20,337
(1.62 %)		 20,633
(1.37 %)		 n/a 41.60
(100.00 %)		 226
(0.00 %)		 356
(100.00 %)		 3,783,435
(35.17 %)		 567,796
(3.38 %)		 13,462,481
(35.48 %)		 48,365
(1.91 %)
296 Honduran yellow-shouldered bat (v2.0 Veracruz 20B 2020)
GCF_014824575.1		 49,894
(2.81 %)		 18,317
(1.66 %)		 19,991
(1.63 %)		 n/a 42.33
(99.79 %)		 38,823
(0.21 %)		 27,486
(100.00 %)		 2,844,834
(29.10 %)		 367,443
(1.49 %)		 11,805,151
(31.26 %)		 59,262
(1.70 %)
297 honeybee mite (v1 2017)
GCF_002443255.1		 35,654
(12.86 %)		 2,741
(0.61 %)		 28,868
(8.05 %)		 n/a 40.92
(99.93 %)		 3,073
(0.07 %)		 1,426
(100.00 %)		 117,879
(1.26 %)		 43,685
(1.30 %)		 1,858,762
(15.09 %)		 31,400
(5.04 %)
298 hooded crow (v2 S_Up_H32 2017)
GCF_000738735.2		 35,874
(6.47 %)		 11,298
(1.84 %)		 17,627
(2.12 %)		 n/a 41.48
(97.07 %)		 27,795
(2.94 %)		 113
(100.00 %)		 392,199
(5.95 %)		 139,126
(0.76 %)		 6,141,002
(18.21 %)		 12,943
(0.48 %)
299 hooded crow (v5 S_Up_H32 2021)
GCF_000738735.5		 42,799
(57.51 %)		 11,845
(1.92 %)		 20,738
(2.23 %)		 n/a 42.10
(99.68 %)		 425
(0.32 %)		 47
(100.00 %)		 421,463
(6.12 %)		 164,830
(0.93 %)		 6,148,741
(19.00 %)		 25,266
(2.09 %)
300 horse (Twilight 2007 genbank)
GCA_000002305.1		 n/a 18,575
(1.67 %)		 17,121
(1.34 %)		 n/a 41.50
(98.14 %)		 45,680
(1.86 %)		 55,316
(98.14 %)		 3,941,878
(45.17 %)		 381,229
(1.99 %)		 14,674,265
(29.80 %)		 45,521
(1.52 %)
301 hourglass treefrog (paternal 2023 genbank)
GCA_027789765.1		 n/a 14,058
(0.89 %)		 31,050
(2.69 %)		 n/a 43.97
(99.70 %)		 804
(0.30 %)		 2,200
(100.00 %)		 906,816
(2.43 %)		 1,710,859
(17.48 %)		 10,069,798
(51.41 %)		 235,277
(5.56 %)
302 house finch (primary hap 2022 genbank)
GCA_027477595.1		 43,228
(49.63 %)		 12,700
(1.83 %)		 24,567
(2.38 %)		 n/a 42.91
(99.02 %)		 295
(0.98 %)		 183
(100.00 %)		 440,379
(3.17 %)		 463,164
(6.37 %)		 6,300,100
(23.47 %)		 30,897
(2.53 %)
303 house fly (aabys 2013 genbank)
GCA_000371365.1		 n/a 7,825
(1.36 %)		 12,819
(3.07 %)		 n/a 35.11
(92.22 %)		 102,610
(7.82 %)		 104,053
(92.18 %)		 415,874
(2.30 %)		 376,409
(8.80 %)		 4,931,104
(52.61 %)		 7,139
(0.35 %)
304 house mouse (AKR_J v1 2016)
GCA_001624295.1		 n/a 21,299
(2.19 %)		 18,730
(1.41 %)		 102,168
(4.09 %)		 41.70
(86.82 %)		 314,064
(13.22 %)		 40,550
(96.00 %)		 5,186,721
(40.97 %)		 1,485,719
(3.05 %)		 13,610,761
(27.42 %)		 16,745
(0.41 %)
305 house mouse (A_J v1 2016)
GCA_001624215.1		 n/a 21,171
(2.20 %)		 18,776
(1.40 %)		 102,254
(4.12 %)		 41.70
(89.34 %)		 365,877
(10.71 %)		 33,692
(96.01 %)		 5,186,523
(40.90 %)		 1,483,826
(3.06 %)		 13,614,266
(28.13 %)		 16,590
(0.42 %)
306 house mouse (BALB_cJ v1 2016)
GCA_001632525.1		 n/a 21,337
(2.21 %)		 18,682
(1.41 %)		 102,138
(4.14 %)		 41.74
(88.91 %)		 361,689
(11.14 %)		 37,453
(95.84 %)		 5,096,953
(40.72 %)		 1,407,754
(2.90 %)		 13,416,041
(27.66 %)		 16,788
(0.42 %)
307 house mouse (C3H_HeJ v1 2016)
GCA_001632575.1		 n/a 21,177
(2.22 %)		 18,550
(1.42 %)		 101,710
(4.15 %)		 41.74
(85.90 %)		 369,499
(14.15 %)		 37,497
(95.91 %)		 5,089,496
(40.41 %)		 1,399,438
(2.72 %)		 13,485,480
(26.52 %)		 16,675
(0.41 %)
308 house mouse (CBA_J v1 2016)
GCA_001624475.1		 n/a 21,259
(2.23 %)		 18,593
(1.42 %)		 101,632
(4.14 %)		 41.78
(79.43 %)		 410,639
(20.63 %)		 42,242
(96.14 %)		 5,081,543
(40.40 %)		 1,393,763
(2.54 %)		 13,472,532
(24.46 %)		 16,809
(0.38 %)
309 house mouse (DBA_2J v1 2016)
GCA_001624505.1		 n/a 21,156
(2.23 %)		 18,610
(1.43 %)		 101,908
(4.18 %)		 41.80
(88.67 %)		 409,306
(11.39 %)		 42,324
(95.14 %)		 5,028,217
(40.37 %)		 1,364,702
(2.73 %)		 13,540,805
(27.33 %)		 16,544
(0.42 %)
310 house mouse (FVB_NJ v1 2016)
GCA_001624535.1		 n/a 21,195
(2.22 %)		 18,615
(1.42 %)		 101,520
(4.15 %)		 41.75
(89.39 %)		 380,840
(10.66 %)		 67,805
(93.73 %)		 5,037,447
(40.28 %)		 1,381,859
(2.89 %)		 13,440,164
(27.32 %)		 16,625
(0.42 %)
311 house mouse (GRCm38.p6 2017)
GCF_000001635.26		 123,667
(4.49 %)		 24,134
(2.09 %)		 22,855
(1.67 %)		 n/a 41.73
(97.18 %)		 904
(2.82 %)		 21,179
(97.18 %)		 5,554,281
(45.50 %)		 1,695,255
(3.40 %)		 13,041,229
(35.91 %)		 25,014
(0.54 %)
312 house mouse (LP_J v1 2016)
GCA_001632615.1		 n/a 21,012
(2.23 %)		 18,555
(1.43 %)		 101,892
(4.18 %)		 41.78
(84.14 %)		 402,247
(15.91 %)		 38,542
(95.89 %)		 5,032,748
(40.03 %)		 1,373,374
(2.60 %)		 13,411,126
(25.61 %)		 16,668
(0.40 %)
313 house mouse (NOD_ShiLtJ v1 2016)
GCA_001624675.1		 n/a 21,291
(2.24 %)		 19,697
(1.47 %)		 101,562
(4.18 %)		 42.00
(77.13 %)		 595,433
(22.95 %)		 66,154
(95.79 %)		 5,059,815
(40.57 %)		 1,370,443
(2.51 %)		 13,251,532
(23.62 %)		 18,188
(0.42 %)
314 house mouse (NZO_HlLtJ v1 2016)
GCA_001624745.1		 n/a 21,233
(2.22 %)		 18,805
(1.43 %)		 103,134
(4.18 %)		 41.74
(86.47 %)		 337,909
(13.58 %)		 57,439
(95.37 %)		 5,112,301
(40.60 %)		 1,418,629
(2.92 %)		 13,588,055
(27.01 %)		 16,857
(0.41 %)
315 human (GRCh38.p13 2019)
GCF_000001405.39		 172,809
(4.43 %)		 23,121
(1.97 %)		 27,697
(1.78 %)		 n/a 41.04
(95.07 %)		 1,268
(4.93 %)		 46,029
(95.07 %)		 5,859,855
(52.78 %)		 1,037,733
(4.60 %)		 16,933,424
(36.88 %)		 56,646
(1.06 %)
316 human (GRCh38.p14 2022)
GCF_000001405.40		 188,352
(5.12 %)		 23,474
(1.98 %)		 28,557
(1.86 %)		 n/a 41.05
(95.10 %)		 1,270
(4.90 %)		 46,502
(95.10 %)		 5,910,293
(52.77 %)		 1,047,827
(4.59 %)		 17,068,934
(36.82 %)		 57,427
(1.07 %)
317 human (NA24385.mat 2021)
GCA_018852615.1		 n/a 20,744
(1.84 %)		 21,968
(1.22 %)		 233,779
(4.92 %)		 40.85
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 445
(100.00 %)		 5,435,410
(53.40 %)		 1,086,871
(8.27 %)		 15,970,867
(40.97 %)		 53,581
(1.32 %)
318 human (NA24385.mat 2022)
GCA_021951015.1		 n/a 20,809
(1.82 %)		 21,369
(1.18 %)		 234,089
(4.92 %)		 40.85
(99.95 %)		 109
(0.05 %)		 355
(100.00 %)		 5,489,855
(53.93 %)		 1,085,681
(8.26 %)		 15,968,830
(40.95 %)		 53,511
(1.32 %)
319 human (NA24385.pat 2021)
GCA_018852605.1		 n/a 19,919
(1.83 %)		 21,582
(1.22 %)		 227,333
(4.91 %)		 40.87
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 610
(100.00 %)		 5,215,774
(53.54 %)		 1,094,036
(9.09 %)		 15,125,069
(41.29 %)		 52,653
(1.34 %)
320 human (NA24385.pat 2022)
GCA_021950905.1		 n/a 20,014
(1.81 %)		 20,716
(1.19 %)		 227,278
(4.91 %)		 40.87
(99.97 %)		 117
(0.03 %)		 514
(100.00 %)		 5,293,356
(54.01 %)		 1,100,786
(9.09 %)		 15,122,569
(41.27 %)		 52,546
(1.35 %)
321 human betaherpesvirus 6A (U1102 1995 genbank)
GCA_000845685.2		 n/a n/a n/a n/a 42.44
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 33
(1.67 %)		 36
(4.27 %)		 603
(9.83 %)		 3
(13.72 %)
322 human T2T CHM13 v2.0
GCA_009914755.4		 108,944
(51.73 %)		 20,844
(1.79 %)		 21,287
(1.16 %)		 n/a 40.75
(100.00 %)		 n/a 25
(100.00 %)		 5,591,082
(54.45 %)		 1,155,353
(8.89 %)		 16,163,340
(41.63 %)		 52,408
(1.38 %)
323 Iberian mole (v1 TD23 2020)
GCF_014898055.1		 46,872
(2.59 %)		 18,566
(1.67 %)		 20,793
(1.59 %)		 n/a 41.91
(99.98 %)		 3,640
(0.02 %)		 4,425
(100.00 %)		 3,269,038
(31.47 %)		 501,677
(1.32 %)		 11,176,747
(32.61 %)		 48,076
(2.80 %)
324 Iberian mole (v2 TD23 2020)
GCF_014898055.2		 46,746
(2.60 %)		 18,453
(1.69 %)		 20,410
(1.59 %)		 n/a 41.90
(99.98 %)		 3,639
(0.02 %)		 3,202
(100.00 %)		 2,637,156
(23.36 %)		 497,087
(1.30 %)		 10,984,260
(32.64 %)		 47,552
(2.89 %)
325 Indian glassy fish (v1 2019)
GCF_900634625.1		 44,096
(12.32 %)		 15,337
(3.60 %)		 23,988
(7.92 %)		 60,224
(10.41 %)		 42.38
(98.08 %)		 1,523
(1.92 %)		 156
(100.00 %)		 346,406
(3.02 %)		 163,522
(3.00 %)		 2,755,229
(25.07 %)		 17,930
(1.47 %)
326 Indian medaka
GCF_002922805.1		 47,300
(9.26 %)		 14,561
(2.50 %)		 31,867
(6.43 %)		 n/a 39.04
(94.73 %)		 51,440
(5.29 %)		 8,603
(100.00 %)		 319,637
(2.20 %)		 208,749
(2.67 %)		 5,412,794
(33.26 %)		 40,721
(2.36 %)
327 Indianmeal moth (v1 USDA-ARS_2022_Savannah primary hap 2023)
GCF_027563975.1		 28,377
(14.36 %)		 4,799
(1.56 %)		 15,737
(7.20 %)		 n/a 35.38
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 46
(100.00 %)		 136,242
(3.33 %)		 48,275
(1.61 %)		 2,518,372
(36.69 %)		 14,106
(2.86 %)
328 Jamaican fruit-eating bat (US092 2019 Broad)
GCA_004027435.1		 n/a 21,188
(1.26 %)		 41,550
(1.34 %)		 35,477
(1.51 %)		 42.19
(99.92 %)		 4,324
(0.02 %)		 798,700
(99.98 %)		 3,297,388
(28.66 %)		 476,792
(1.23 %)		 13,144,912
(34.13 %)		 81,685
(1.86 %)
329 Japanese quail
GCF_001577835.1		 47,008
(7.38 %)		 12,864
(2.55 %)		 36,126
(11.03 %)		 n/a 41.28
(98.88 %)		 11,601
(1.12 %)		 9,642
(98.88 %)		 466,141
(6.58 %)		 321,128
(2.22 %)		 5,497,911
(19.81 %)		 17,977
(1.86 %)
330 Japanese sawshark (hap1 2024 genbank)
GCA_044704955.1		 n/a 14,672
(0.28 %)		 30,181
(0.79 %)		 n/a 47.02
(99.98 %)		 5,985
(0.02 %)		 4,317
(100.00 %)		 1,167,498
(3.08 %)		 2,399,496
(18.16 %)		 10,302
(99.98 %)		 503,637
(6.56 %)
331 Jerdon's jumping ant (DR-91 v8.5 2018)
GCF_003227715.1		 29,097
(10.82 %)		 4,337
(1.33 %)		 43,907
(11.32 %)		 n/a 44.75
(99.72 %)		 499
(0.28 %)		 857
(100.00 %)		 439,110
(17.67 %)		 262,539
(5.69 %)		 1,834,301
(29.28 %)		 6,204
(9.08 %)
332 kakapo (Jane v1 2019)
GCF_004027225.1		 49,444
(5.77 %)		 13,114
(1.92 %)		 17,732
(2.50 %)		 29,004
(4.44 %)		 41.97
(97.63 %)		 362
(2.37 %)		 99
(100.00 %)		 548,758
(10.76 %)		 208,171
(1.07 %)		 6,258,082
(20.20 %)		 22,279
(1.75 %)
333 kakapo (Jane v2 2020 genbank)
GCA_004027225.2		 49,757
(54.33 %)		 13,112
(1.92 %)		 17,637
(2.48 %)		 n/a 41.97
(99.08 %)		 373
(0.92 %)		 90
(100.00 %)		 507,072
(7.85 %)		 208,180
(1.08 %)		 6,258,178
(20.50 %)		 22,278
(1.77 %)
334 koala (Bilbo 61053 2017)
GCF_002099425.1		 55,723
(2.15 %)		 17,500
(0.86 %)		 16,193
(0.94 %)		 n/a 39.05
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1,907
(100.00 %)		 7,814,631
(41.58 %)		 1,123,545
(2.03 %)		 21,796,057
(39.25 %)		 15,957
(0.35 %)
335 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 genbank)
GCA_009829125.1		 29,504
(53.56 %)		 14,221
(2.37 %)		 44,144
(5.80 %)		 41,384
(6.20 %)		 40.22
(99.05 %)		 700
(0.95 %)		 124
(100.00 %)		 423,338
(4.48 %)		 551,472
(7.22 %)		 4,887,148
(38.97 %)		 37,287
(2.58 %)
336 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 refseq)
GCF_009829125.1		 29,517
(6.48 %)		 14,243
(2.37 %)		 44,144
(5.80 %)		 41,421
(6.20 %)		 40.22
(99.05 %)		 700
(0.95 %)		 124
(100.00 %)		 423,274
(4.48 %)		 551,472
(7.22 %)		 4,887,142
(38.97 %)		 37,287
(2.58 %)
337 lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023638135.1		 48,561
(51.20 %)		 12,862
(1.69 %)		 21,562
(1.92 %)		 n/a 43.03
(99.83 %)		 158
(0.17 %)		 397
(100.00 %)		 439,975
(3.77 %)		 203,640
(6.96 %)		 6,921,438
(23.57 %)		 32,398
(2.65 %)
338 large cabbage white (genbank 2021)
GCA_905147105.1		 24,631
(60.59 %)		 4,550
(1.47 %)		 9,197
(5.18 %)		 30,394
(12.69 %)		 34.13
(100.00 %)		 29
(0.00 %)		 402
(100.00 %)		 123,352
(2.30 %)		 36,616
(6.05 %)		 2,431,238
(41.04 %)		 8,442
(2.49 %)
339 large tree shrew (BS70 2019 Broad)
GCA_004365275.1		 n/a 26,266
(0.71 %)		 59,868
(0.81 %)		 n/a 42.00
(99.77 %)		 6,466
(0.02 %)		 3,890,086
(99.98 %)		 7,163,973
(22.64 %)		 1,629,329
(2.64 %)		 18,970,992
(42.82 %)		 138,732
(1.75 %)
340 leatherback sea turtle (v1 2019 genbank G10K)
GCA_009764565.1		 n/a 14,572
(1.03 %)		 16,165
(1.42 %)		 n/a 43.36
(99.74 %)		 558
(0.26 %)		 55
(100.00 %)		 1,631,923
(15.09 %)		 303,440
(1.14 %)		 11,122,938
(34.12 %)		 35,505
(1.37 %)
341 leatherback sea turtle (v1 alternate hap 2019)
GCA_009762595.1		 n/a 10,857
(1.01 %)		 15,585
(1.46 %)		 n/a 43.54
(100.00 %)		 n/a 8,982
(100.00 %)		 1,090,219
(15.03 %)		 206,192
(1.19 %)		 7,154,939
(33.03 %)		 25,155
(1.42 %)
342 leatherback sea turtle (v3 2020 refseq G10K)
GCF_009764565.2		 62,576
(3.50 %)		 14,610
(1.03 %)		 16,359
(1.45 %)		 n/a 43.35
(99.74 %)		 667
(0.26 %)		 40
(100.00 %)		 1,637,236
(15.13 %)		 304,730
(1.14 %)		 11,121,967
(34.21 %)		 35,485
(1.36 %)
343 Leishmania infantum (JPCM5 2011 kinetoplastids genbank)
GCA_000002875.2		 n/a 591
(1.09 %)		 4,193
(46.51 %)		 n/a 59.58
(99.94 %)		 454
(0.06 %)		 76
(100.00 %)		 24,390
(4.61 %)		 4,228
(1.93 %)		 243,087
(20.97 %)		 92
(99.40 %)
344 Leishmania major (Friedlin 2011 kinetoplastids genbank)
GCA_000002725.2		 n/a 626
(1.15 %)		 4,290
(46.53 %)		 n/a 59.72
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 43
(100.00 %)		 33,021
(5.20 %)		 8,477
(2.43 %)		 238,932
(20.91 %)		 41
(99.80 %)
345 Leishmania martiniquensis (LSCM1 2021 genbank)
GCA_017916325.1		 n/a 619
(1.14 %)		 3,882
(44.58 %)		 n/a 59.85
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 42
(100.00 %)		 20,726
(2.91 %)		 2,267
(2.64 %)		 232,973
(20.45 %)		 44
(99.29 %)
346 Leishmania orientalis (LSCM4 2021 genbank)
GCA_017916335.1		 n/a 643
(1.12 %)		 4,666
(45.26 %)		 n/a 59.72
(99.99 %)		 11
(0.00 %)		 98
(100.00 %)		 22,632
(2.47 %)		 4,241
(2.74 %)		 231,120
(20.18 %)		 100
(99.82 %)
347 leopard (Maewha 2016 genbank)
GCA_001857705.1		 73,266
(49.50 %)		 18,874
(1.62 %)		 21,014
(1.44 %)		 n/a 41.71
(96.17 %)		 214,953
(3.85 %)		 265,329
(96.15 %)		 5,246,283
(42.87 %)		 1,059,443
(5.13 %)		 14,265,514
(32.20 %)		 77,000
(2.45 %)
348 lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 genbank)
GCA_000280705.1		 25,978
(33.60 %)		 19,393
(1.38 %)		 20,311
(1.35 %)		 n/a 41.87
(87.17 %)		 326,464
(12.87 %)		 337,359
(87.13 %)		 6,205,858
(38.76 %)		 832,823
(1.53 %)		 13,661,563
(33.98 %)		 26,669
(0.59 %)
349 lesser kestrel (v1 2021)
GCF_017639655.1		 47,420
(5.64 %)		 13,097
(1.80 %)		 22,203
(2.07 %)		 n/a 42.30
(99.66 %)		 298
(0.34 %)		 291
(100.00 %)		 516,498
(5.58 %)		 210,236
(1.26 %)		 7,133,927
(19.19 %)		 27,558
(2.21 %)
350 lesser noctule (v1 hap1 2024)
GCA_964264875.1		 n/a 18,260
(1.53 %)		 23,046
(1.60 %)		 n/a 43.05
(99.99 %)		 1,662
(0.01 %)		 1,281
(100.00 %)		 3,246,021
(21.13 %)		 1,298,965
(12.06 %)		 9,752,193
(42.90 %)		 66,137
(2.85 %)
351 lesser noctule (v1 hap2 2024)
GCA_964264895.1		 n/a 17,557
(1.64 %)		 22,484
(1.74 %)		 n/a 43.06
(99.98 %)		 1,563
(0.02 %)		 2,898
(99.98 %)		 2,999,553
(21.19 %)		 1,122,371
(10.04 %)		 9,331,392
(40.02 %)		 61,834
(2.95 %)
352 lesser rhea (primary hap 2023 genbank)
GCA_028389875.1		 39,024
(47.65 %)		 13,358
(1.72 %)		 23,870
(2.13 %)		 n/a 42.45
(99.89 %)		 128
(0.11 %)		 179
(100.00 %)		 674,141
(6.73 %)		 329,122
(5.34 %)		 6,820,211
(22.78 %)		 45,073
(5.83 %)
353 lesser sac-winged bat (primary hap 2024 genbank)
GCA_036850995.1		 n/a 18,322
(1.42 %)		 21,350
(1.39 %)		 n/a 41.84
(99.24 %)		 573
(0.76 %)		 345
(99.51 %)		 4,224,340
(28.69 %)		 1,030,574
(2.60 %)		 12,591,928
(42.30 %)		 98,189
(2.06 %)
354 lesser salmon catfish (primary hap 2023 genbank)
GCA_027579695.1		 53,323
(53.05 %)		 15,841
(0.90 %)		 85,700
(3.30 %)		 n/a 42.44
(99.43 %)		 334
(0.57 %)		 38
(100.00 %)		 5,905,868
(49.76 %)		 1,126,468
(6.51 %)		 7,609,180
(62.74 %)		 166,630
(4.38 %)
355 lettuce (Salinas v7 2018)
GCF_002870075.1		 60,760
(2.83 %)		 16,272
(0.65 %)		 109,234
(6.86 %)		 n/a 37.79
(92.71 %)		 350,251
(7.33 %)		 11,453
(100.00 %)		 946,986
(1.96 %)		 983,572
(3.65 %)		 12,334,735
(53.11 %)		 117,678
(2.02 %)
356 lettuce (Salinas v8 2020)
GCF_002870075.3		 64,708
(2.94 %)		 16,252
(0.65 %)		 101,828
(6.36 %)		 n/a 37.79
(92.44 %)		 351,533
(7.59 %)		 9,960
(99.71 %)		 945,052
(1.95 %)		 983,641
(3.64 %)		 12,325,371
(53.00 %)		 117,703
(2.02 %)
357 live sharksucker (v1 2019)
GCF_900963305.1		 40,255
(11.91 %)		 14,975
(3.53 %)		 22,304
(7.09 %)		 56,266
(9.51 %)		 41.43
(99.89 %)		 140
(0.11 %)		 38
(100.00 %)		 448,828
(3.61 %)		 146,353
(1.65 %)		 3,204,476
(21.79 %)		 16,807
(1.33 %)
358 long-finned pilot whale (v1 primary hap 2023)
GCF_963455315.1		 61,797
(2.84 %)		 18,712
(1.51 %)		 20,920
(1.39 %)		 n/a 42.38
(99.99 %)		 1,084
(0.01 %)		 993
(100.00 %)		 4,125,420
(35.62 %)		 1,577,899
(12.03 %)		 12,347,226
(42.01 %)		 71,821
(5.51 %)
359 long-finned pilot whale (v2 primary hap 2024 genbank)
GCA_963455315.2		 n/a 18,726
(1.51 %)		 20,948
(1.39 %)		 n/a 42.38
(99.99 %)		 1,084
(0.01 %)		 995
(100.00 %)		 4,125,459
(35.62 %)		 1,577,896
(12.03 %)		 12,347,226
(42.01 %)		 71,822
(5.51 %)
360 long-tailed hermit (v1 PSU5 primary hap 2022)
GCA_023637945.1		 n/a 12,328
(2.02 %)		 20,312
(2.34 %)		 n/a 41.00
(99.63 %)		 141
(0.37 %)		 211
(99.63 %)		 497,506
(5.06 %)		 265,815
(1.51 %)		 6,045,702
(20.10 %)		 15,922
(1.43 %)
361 lumpfish (primary hap 2019 genbank)
GCA_009769545.1		 41,612
(58.17 %)		 14,748
(3.32 %)		 49,223
(8.10 %)		 52,721
(8.34 %)		 42.83
(98.22 %)		 347
(1.78 %)		 49
(100.00 %)		 478,416
(6.02 %)		 421,634
(11.07 %)		 2,928,668
(27.98 %)		 53,323
(5.09 %)
362 Ma's night monkey genbank
GCA_000952055.2		 55,061
(41.68 %)		 21,084
(1.92 %)		 22,287
(1.31 %)		 n/a 40.74
(94.86 %)		 83,929
(5.15 %)		 112,850
(94.85 %)		 5,109,404
(47.71 %)		 734,754
(2.02 %)		 15,854,134
(33.62 %)		 36,070
(0.90 %)
363 malaria parasite P. falciparum (3D7 2016 genbank)
GCA_000002765.3		 n/a n/a n/a n/a 19.34
(100.00 %)		 n/a 16
(100.00 %)		 79,857
(19.18 %)		 78,154
(15.50 %)		 186,960
(66.90 %)		 22
(0.04 %)
364 Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 genbank)
GCA_001685135.1		 48,578
(30.31 %)		 19,449
(1.56 %)		 24,645
(1.37 %)		 41,235
(1.95 %)		 40.78
(92.27 %)		 984,656
(7.81 %)		 80,669
(100.00 %)		 3,063,619
(35.20 %)		 866,306
(3.08 %)		 13,310,826
(28.76 %)		 35,558
(0.84 %)
365 malo sina (v1 2012)
GCF_000231095.1		 29,549
(16.44 %)		 15,120
(6.45 %)		 49,515
(30.69 %)		 n/a 40.48
(93.32 %)		 20,693
(6.71 %)		 23,184
(93.29 %)		 115,049
(2.29 %)		 51,516
(1.90 %)		 1,488,940
(24.12 %)		 42,077
(12.05 %)
366 mangrove rivulus
GCF_001649575.1		 45,306
(11.02 %)		 14,510
(2.84 %)		 29,750
(6.81 %)		 n/a 40.03
(94.35 %)		 29,388
(5.66 %)		 3,073
(100.00 %)		 345,930
(2.32 %)		 146,268
(1.33 %)		 4,717,260
(27.31 %)		 39,557
(2.69 %)
367 meadow brown (genbank 2021)
GCA_905333055.1		 29,488
(69.09 %)		 4,863
(1.16 %)		 19,812
(6.60 %)		 27,763
(8.31 %)		 36.96
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 32
(100.00 %)		 227,482
(2.41 %)		 107,773
(3.02 %)		 2,456,144
(43.97 %)		 24,873
(3.15 %)
368 meercat (VVHF042 2019 DNA Zoo genbank)
GCA_006229205.1		 n/a 19,020
(1.63 %)		 19,812
(1.43 %)		 42,441
(2.08 %)		 41.68
(99.72 %)		 65,245
(0.28 %)		 63,791
(100.00 %)		 4,552,310
(40.02 %)		 634,179
(1.21 %)		 13,631,635
(32.17 %)		 64,849
(2.13 %)
369 meerkat (BS45 2019 Broad)
GCA_004023905.1		 n/a 21,726
(1.54 %)		 31,908
(1.39 %)		 n/a 41.89
(99.96 %)		 4,153
(0.02 %)		 354,021
(99.98 %)		 4,835,157
(40.73 %)		 693,037
(1.32 %)		 13,779,279
(33.49 %)		 76,740
(2.37 %)
370 melon fly (v1 USDA-PBARC White Pupae T1 2014)
GCF_000806345.1		 26,008
(10.49 %)		 7,743
(3.09 %)		 12,206
(6.18 %)		 n/a 35.15
(84.42 %)		 37,430
(15.62 %)		 43,002
(84.38 %)		 237,943
(3.36 %)		 74,977
(1.26 %)		 2,410,203
(31.96 %)		 15,259
(2.01 %)
371 Mexican gray wolf (hap1 2025 genbank)
GCA_048164855.1		 n/a 19,584
(1.52 %)		 20,783
(1.39 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 167
(0.00 %)		 250
(100.00 %)		 4,643,072
(34.73 %)		 1,102,137
(4.40 %)		 13,591,414
(35.18 %)		 53,471
(2.24 %)
372 microsporidians E.bieneusi (H348 2009 genbank)
GCA_000209485.1		 n/a 238
(3.03 %)		 394
(8.09 %)		 n/a 33.70
(99.89 %)		 437
(0.04 %)		 1,743
(99.97 %)		 1,511
(2.99 %)		 268
(0.36 %)		 31,900
(26.59 %)		 373
(7.62 %)
373 microsporidians E.cuniculi (v1 GB-M1 2002)
GCF_000091225.1		 1,996
(85.79 %)		 1,569
(68.26 %)		 596
(33.73 %)		 n/a 47.31
(99.97 %)		 4
(0.03 %)		 15
(99.97 %)		 257
(0.70 %)		 199
(0.40 %)		 10,819
(8.68 %)		 126
(3.52 %)
374 microsporidians N.ceranae (BRL01 2009 genbank)
GCA_000182985.1		 n/a 348
(2.68 %)		 284
(3.31 %)		 n/a 25.26
(99.86 %)		 n/a 5,465
(100.00 %)		 3,179
(1.99 %)		 1,572
(1.39 %)		 85,189
(41.34 %)		 4
(0.02 %)
375 minke whale (2013 genbank)
GCA_000493695.1		 42,553
(41.45 %)		 19,298
(1.81 %)		 18,661
(1.42 %)		 n/a 40.94
(94.06 %)		 173,296
(5.96 %)		 184,071
(94.04 %)		 4,041,828
(42.24 %)		 573,950
(1.48 %)		 13,504,295
(30.96 %)		 65,448
(1.38 %)
376 minke whale (primary hap 2023 genbank)
GCA_949987535.1		 61,711
(41.50 %)		 19,544
(1.49 %)		 21,502
(1.26 %)		 n/a 41.55
(99.99 %)		 1,177
(0.01 %)		 1,375
(100.00 %)		 4,006,932
(35.92 %)		 1,058,106
(12.08 %)		 12,708,154
(42.66 %)		 72,756
(1.59 %)
377 mites & ticks V.jacobsoni (v1 VJ856 2017)
GCF_002532875.1		 35,332
(12.83 %)		 2,750
(0.61 %)		 29,731
(8.07 %)		 n/a 40.94
(99.89 %)		 3,360
(0.11 %)		 8,241
(99.89 %)		 115,140
(1.18 %)		 39,880
(0.71 %)		 1,832,298
(14.55 %)		 31,479
(5.12 %)
378 Mongolian gerbil (US013 2019 Broad)
GCA_004026785.1		 n/a 21,302
(1.57 %)		 27,162
(1.27 %)		 40,982
(1.78 %)		 41.88
(99.90 %)		 11,139
(0.04 %)		 796,326
(99.96 %)		 5,253,752
(39.29 %)		 1,211,658
(3.13 %)		 13,894,596
(38.35 %)		 24,829
(0.69 %)
379 monito del monte (mDroGli1 primary hap 2021 genbank)
GCA_019393635.1		 47,034
(41.56 %)		 18,428
(0.81 %)		 15,519
(0.85 %)		 n/a 39.11
(99.91 %)		 260
(0.09 %)		 18
(100.00 %)		 7,426,369
(29.77 %)		 1,249,638
(2.12 %)		 21,135,395
(42.80 %)		 16,598
(0.36 %)
380 moth C.splendana (v1 2021 genbank)
GCA_910591565.1		 n/a 4,930
(0.75 %)		 38,413
(8.53 %)		 35,924
(4.55 %)		 38.08
(99.99 %)		 150
(0.01 %)		 112
(100.00 %)		 261,421
(1.99 %)		 175,466
(5.62 %)		 3,107,482
(46.30 %)		 58,547
(5.75 %)
381 moth S.litura (Ishihara v1 2017)
GCF_002706865.1		 25,114
(8.87 %)		 5,088
(1.13 %)		 22,625
(7.19 %)		 n/a 36.56
(97.52 %)		 10,662
(2.49 %)		 13,637
(97.51 %)		 154,017
(1.49 %)		 50,642
(0.97 %)		 2,919,487
(37.00 %)		 34,396
(3.66 %)
382 mung bean (VC1973A 2015 genbank)
GCA_000741045.2		 n/a 16,645
(3.88 %)		 43,866
(14.64 %)		 n/a 33.16
(92.79 %)		 96,870
(7.25 %)		 2,463
(100.00 %)		 265,072
(3.32 %)		 198,918
(3.34 %)		 2,840,410
(34.89 %)		 13,926
(1.48 %)
383 mute swan (bCygOlo1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009769485.1		 n/a 10,083
(1.97 %)		 18,350
(2.23 %)		 n/a 42.22
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 5,616
(100.00 %)		 485,827
(7.06 %)		 212,892
(1.28 %)		 4,756,962
(19.95 %)		 25,670
(3.87 %)
384 mute swan (v1 primary hap 2019)
GCA_009769625.1		 n/a 12,973
(1.97 %)		 22,300
(2.18 %)		 n/a 41.92
(99.06 %)		 446
(0.94 %)		 181
(100.00 %)		 688,720
(7.65 %)		 301,358
(1.34 %)		 6,775,217
(21.21 %)		 31,271
(3.60 %)
385 naked mole-rat (NMR 29 2012 genbank)
GCA_000247695.1		 74,574
(44.06 %)		 21,317
(1.73 %)		 20,856
(1.51 %)		 n/a 40.21
(88.43 %)		 110,424
(11.59 %)		 114,652
(88.41 %)		 4,162,977
(32.77 %)		 484,933
(0.92 %)		 13,672,503
(27.63 %)		 31,950
(0.88 %)
386 narwhal (BS41 2019 Broad)
GCA_004026685.1		 n/a 21,418
(1.52 %)		 34,189
(1.28 %)		 n/a 41.35
(99.92 %)		 8,600
(0.03 %)		 653,473
(99.97 %)		 4,512,168
(44.82 %)		 592,047
(1.17 %)		 13,009,453
(37.18 %)		 63,033
(1.47 %)
387 Natterer's bat (hap1.1 2024)
GCA_964212035.1		 n/a 19,180
(1.72 %)		 22,635
(1.71 %)		 n/a 43.18
(99.99 %)		 1,620
(0.02 %)		 343
(100.00 %)		 3,081,500
(24.27 %)		 797,071
(5.37 %)		 10,372,159
(38.30 %)		 64,460
(2.57 %)
388 Natterer's bat (hap2.1 2024)
GCA_964212025.1		 n/a 18,275
(1.81 %)		 21,799
(1.80 %)		 n/a 43.28
(99.99 %)		 1,387
(0.01 %)		 1,706
(99.99 %)		 2,833,193
(23.73 %)		 705,278
(5.10 %)		 9,802,564
(36.67 %)		 61,024
(2.68 %)
389 Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027579445.1		 31,033
(46.15 %)		 12,385
(1.72 %)		 24,339
(2.24 %)		 n/a 43.01
(99.57 %)		 215
(0.43 %)		 77
(100.00 %)		 479,994
(3.33 %)		 443,098
(9.18 %)		 6,350,593
(25.82 %)		 31,693
(3.88 %)
390 nematode C.briggsae (AF16 v1 2008)
GCF_000004555.1		 19,404
(22.65 %)		 12,088
(12.63 %)		 7,533
(12.85 %)		 n/a 37.35
(97.22 %)		 6,713
(2.80 %)		 607
(99.95 %)		 116,909
(19.60 %)		 45,475
(4.23 %)		 820,686
(35.42 %)		 4,887
(1.65 %)
391 New South Wales waratah (AGSP 2013)
GCF_000471905.2		 36,251
(5.66 %)		 10,150
(1.34 %)		 42,117
(8.90 %)		 n/a 37.47
(94.63 %)		 39,556
(5.39 %)		 45,302
(94.61 %)		 396,916
(3.25 %)		 506,716
(6.41 %)		 4,768,175
(36.07 %)		 17,009
(0.90 %)
392 nine-banded armadillo (v1 hap1 2023)
GCA_030445055.1		 n/a 19,429
(1.06 %)		 22,396
(1.07 %)		 n/a 40.96
(99.27 %)		 845
(0.73 %)		 594
(100.00 %)		 4,369,568
(32.83 %)		 673,707
(1.55 %)		 18,586,102
(42.41 %)		 131,852
(2.78 %)
393 nine-banded armadillo (v1 hap2 2023)
GCF_030445035.1		 69,043
(2.70 %)		 20,516
(1.05 %)		 n/a n/a 41.00
(99.68 %)		 771
(0.32 %)		 539
(100.00 %)		 4,656,325
(32.86 %)		 726,574
(1.99 %)		 19,585,522
(43.65 %)		 140,990
(2.86 %)
394 nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor genbank)
GCA_000208655.2		 n/a 21,293
(1.15 %)		 25,302
(1.09 %)		 n/a 40.77
(90.89 %)		 268,442
(9.13 %)		 314,971
(90.87 %)		 5,327,246
(49.09 %)		 651,311
(1.26 %)		 19,267,381
(38.27 %)		 139,552
(2.47 %)
395 nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor refseq)
GCF_000208655.1		 46,144
(1.87 %)		 21,316
(1.15 %)		 25,308
(1.09 %)		 n/a 40.77
(90.89 %)		 268,442
(9.13 %)		 314,972
(90.87 %)		 5,328,146
(49.10 %)		 651,316
(1.26 %)		 19,267,438
(38.27 %)		 139,552
(2.47 %)
396 North Atlantic right whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028564815.1		 n/a 19,541
(1.47 %)		 21,516
(1.25 %)		 n/a 41.69
(99.83 %)		 363
(0.17 %)		 779
(100.00 %)		 1,361,117
(2.23 %)		 836,632
(13.12 %)		 12,597,969
(44.00 %)		 93,862
(1.92 %)
397 northern elephant seal (v2 JK_09032017 2021)
GCF_021288785.1		 49,934
(2.73 %)		 20,106
(1.74 %)		 20,957
(1.35 %)		 n/a 41.51
(99.35 %)		 39,936
(0.65 %)		 142,455
(100.00 %)		 4,434,732
(35.01 %)		 588,877
(1.19 %)		 13,745,426
(32.96 %)		 52,064
(1.59 %)
398 northern goshawk (v1 primary hap 2022 refseq)
GCF_929443795.1		 50,663
(4.74 %)		 13,528
(1.65 %)		 24,595
(1.99 %)		 n/a 43.78
(100.00 %)		 183
(0.00 %)		 454
(100.00 %)		 521,768
(3.86 %)		 325,987
(9.82 %)		 5,542,269
(27.30 %)		 43,070
(4.44 %)
399 northern house mosquito (v1 TS 2021)
GCF_016801865.1		 28,512
(7.14 %)		 5,830
(1.09 %)		 39,806
(8.27 %)		 n/a 36.76
(100.00 %)		 n/a 1,714
(100.00 %)		 222,294
(5.58 %)		 187,561
(9.87 %)		 3,009,613
(56.49 %)		 63,009
(9.78 %)
400 northern pike (primary hap 2020 genbank)
GCA_011004845.1		 63,720
(60.35 %)		 16,616
(2.41 %)		 55,784
(5.64 %)		 82,918
(8.82 %)		 42.22
(99.89 %)		 112
(0.11 %)		 53
(100.00 %)		 1,039,521
(30.93 %)		 524,708
(7.32 %)		 4,691,094
(32.91 %)		 42,910
(2.52 %)
401 northern white-cheeked gibbon (2012 GGSC)
GCA_000146795.3		 n/a 20,134
(1.89 %)		 18,568
(1.14 %)		 n/a 40.76
(93.09 %)		 180,468
(6.94 %)		 197,908
(93.06 %)		 5,169,984
(51.90 %)		 831,865
(4.16 %)		 15,243,657
(35.77 %)		 65,761
(1.00 %)
402 Norway rat BN7 genbank
GCA_015227675.2		 97,432
(43.01 %)		 21,523
(1.86 %)		 19,627
(1.36 %)		 54,530
(2.79 %)		 41.99
(99.19 %)		 581
(0.81 %)		 757
(99.19 %)		 4,895,563
(44.53 %)		 1,514,974
(3.57 %)		 13,450,428
(35.83 %)		 19,244
(0.46 %)
403 olive baboon (2017 HGSC genbank)
GCA_000264685.2		 n/a 20,319
(1.82 %)		 21,542
(1.19 %)		 n/a 40.99
(99.25 %)		 58,981
(0.76 %)		 118,810
(99.24 %)		 5,524,514
(52.78 %)		 1,068,912
(5.55 %)		 16,068,031
(38.71 %)		 95,595
(1.41 %)
404 olive baboon (2017 HGSC RefSeq)
GCF_000264685.3		 84,433
(3.85 %)		 20,317
(1.83 %)		 21,239
(1.18 %)		 n/a 40.99
(99.25 %)		 58,981
(0.76 %)		 118,811
(99.24 %)		 5,525,293
(52.79 %)		 1,068,912
(5.55 %)		 16,068,088
(38.71 %)		 95,595
(1.41 %)
405 oriental river prawn (v1 FS-2020 2020 genbank)
GCA_015104395.1		 n/a 1,945
(0.08 %)		 23,579
(1.88 %)		 n/a 36.81
(99.60 %)		 16,132
(0.41 %)		 16,156
(99.59 %)		 2,706,474
(10.11 %)		 2,525,264
(12.75 %)		 9,704,257
(48.31 %)		 77,313
(3.01 %)
406 painted lady (genbank 2021)
GCA_905220365.1		 20,948
(56.23 %)		 4,705
(1.06 %)		 15,277
(5.00 %)		 29,018
(10.11 %)		 33.42
(99.99 %)		 91
(0.01 %)		 37
(100.00 %)		 209,233
(2.16 %)		 56,676
(1.12 %)		 3,372,591
(44.40 %)		 13,547
(2.72 %)
407 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v1 2019)
GCF_004126475.1		 35,529
(2.39 %)		 18,185
(1.70 %)		 20,184
(1.64 %)		 41,094
(3.29 %)		 42.38
(98.92 %)		 831
(1.08 %)		 141
(100.00 %)		 3,072,951
(30.02 %)		 385,608
(0.80 %)		 12,060,365
(30.47 %)		 64,081
(4.30 %)
408 pea aphid (AL4f v1 2019)
GCF_005508785.1		 31,681
(7.81 %)		 4,257
(0.79 %)		 16,323
(3.39 %)		 n/a 29.76
(92.38 %)		 46,297
(7.65 %)		 21,920
(100.00 %)		 768,383
(18.87 %)		 135,468
(2.11 %)		 4,536,093
(48.39 %)		 16,332
(2.13 %)
409 peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634155.1		 49,100
(50.44 %)		 13,025
(1.67 %)		 24,167
(2.02 %)		 n/a 42.65
(99.69 %)		 232
(0.31 %)		 124
(100.00 %)		 586,316
(11.83 %)		 335,214
(8.05 %)		 7,038,700
(24.65 %)		 26,085
(2.25 %)
410 pig-tailed macaque (mMacNem1hap1 2024 genbank)
GCA_043159975.1		 n/a 20,768
(1.76 %)		 21,550
(1.18 %)		 n/a 41.04
(100.00 %)		 260
(0.00 %)		 362
(100.00 %)		 5,387,919
(53.48 %)		 1,027,640
(9.31 %)		 15,407,988
(41.73 %)		 99,854
(1.52 %)
411 pigeon pea (v1 2016 BGI)
GCF_000340665.1		 46,646
(9.41 %)		 17,409
(3.12 %)		 51,529
(12.74 %)		 48,654
(8.33 %)		 32.79
(94.21 %)		 36,387
(5.81 %)		 72,923
(94.19 %)		 400,327
(3.60 %)		 306,656
(4.69 %)		 3,754,630
(39.24 %)		 26,578
(2.89 %)
412 pike-perch
GCF_008315115.1		 56,221
(8.23 %)		 15,677
(2.23 %)		 29,967
(5.65 %)		 62,989
(6.22 %)		 40.92
(100.00 %)		 94
(0.00 %)		 1,313
(100.00 %)		 591,660
(5.05 %)		 569,876
(7.39 %)		 4,713,605
(36.32 %)		 39,545
(1.93 %)
413 platypus (Pmale09 2018 BGI)
GCA_002966995.1		 n/a 15,042
(1.17 %)		 19,939
(1.55 %)		 n/a 46.64
(100.00 %)		 476
(0.00 %)		 4,568
(100.00 %)		 5,326,862
(52.88 %)		 879,598
(5.00 %)		 9,545,961
(50.95 %)		 94,468
(9.28 %)
414 platypus (Pmale09 v1 2019)
GCF_004115215.1		 56,708
(3.09 %)		 14,805
(1.26 %)		 18,918
(1.63 %)		 42,516
(2.60 %)		 46.13
(99.18 %)		 522
(0.82 %)		 305
(100.00 %)		 5,099,803
(51.62 %)		 577,434
(2.88 %)		 9,110,403
(48.91 %)		 87,829
(7.91 %)
415 platypus (Pmale09 v3 2020)
GCA_004115215.3		 n/a 14,805
(1.26 %)		 18,888
(1.63 %)		 n/a 46.14
(99.18 %)		 515
(0.82 %)		 322
(100.00 %)		 5,101,303
(51.62 %)		 578,617
(2.89 %)		 9,113,847
(48.93 %)		 87,861
(7.92 %)
416 polar bear (Baiyulong BGI 2014 genbank)
GCA_000687225.1		 35,751
(39.94 %)		 18,495
(1.67 %)		 15,243
(1.37 %)		 n/a 41.65
(98.35 %)		 110,343
(1.67 %)		 134,161
(98.33 %)		 4,221,025
(40.96 %)		 553,193
(1.29 %)		 13,765,526
(29.91 %)		 54,906
(1.17 %)
417 prehistoric monster fish (2019 genbank)
GCA_902500255.1		 45,404
(55.83 %)		 14,654
(0.76 %)		 72,609
(2.41 %)		 57,391
(2.04 %)		 41.99
(99.49 %)		 2,554
(0.51 %)		 464
(100.00 %)		 1,311,131
(2.79 %)		 786,401
(3.65 %)		 9,901,286
(59.90 %)		 172,199
(5.45 %)
418 pronghorn (BS35 2019 Broad)
GCA_004027515.1		 n/a 24,094
(1.34 %)		 35,119
(1.27 %)		 n/a 41.97
(99.87 %)		 6,569
(0.02 %)		 1,649,700
(99.98 %)		 5,613,563
(41.47 %)		 652,408
(1.55 %)		 13,943,055
(43.64 %)		 61,057
(1.17 %)
419 Przewalski's horse (Burgud 2014 genbank)
GCA_000696695.1		 45,076
(35.88 %)		 19,564
(1.68 %)		 22,124
(1.36 %)		 n/a 41.27
(99.13 %)		 80,963
(0.88 %)		 134,059
(99.12 %)		 3,917,534
(41.44 %)		 435,606
(1.73 %)		 14,738,354
(28.36 %)		 40,752
(0.94 %)
420 Puerto Rican coqui (hap1 2024 genbank)
GCA_035609145.1		 n/a 13,881
(0.57 %)		 32,313
(1.67 %)		 n/a 44.91
(100.00 %)		 659
(0.00 %)		 963
(100.00 %)		 1,044,181
(1.98 %)		 1,442,189
(16.51 %)		 14,710,175
(54.00 %)		 501,931
(8.81 %)
421 puma (SC36_Marlon 2018 genbank)
GCA_003327715.1		 25,575
(34.74 %)		 17,665
(1.56 %)		 16,565
(1.29 %)		 n/a 41.36
(95.34 %)		 178,992
(4.69 %)		 2,174
(100.00 %)		 4,884,619
(42.70 %)		 833,136
(1.76 %)		 13,705,706
(31.28 %)		 58,912
(1.65 %)
422 pygmy chimpanzee (Ulindi genbank 2015)
GCA_000258655.2		 59,332
(37.06 %)		 19,951
(1.94 %)		 19,039
(1.18 %)		 n/a 40.74
(82.95 %)		 156,797
(17.06 %)		 121,337
(82.94 %)		 5,136,492
(50.91 %)		 775,493
(1.63 %)		 15,570,612
(30.28 %)		 43,049
(0.71 %)
423 pygmy chimpanzee (v1 primary hap 2023)
GCF_029289425.1		 84,858
(3.73 %)		 20,765
(1.73 %)		 22,666
(1.18 %)		 n/a 40.49
(99.96 %)		 8
(0.04 %)		 443
(100.00 %)		 5,487,575
(50.65 %)		 1,054,555
(12.79 %)		 15,952,698
(43.80 %)		 53,329
(1.37 %)
424 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 1 2022 genbank)
GCA_026419965.1		 56,261
(41.31 %)		 18,495
(1.55 %)		 20,718
(1.32 %)		 n/a 42.05
(99.81 %)		 143
(0.19 %)		 580
(100.00 %)		 3,817,653
(34.51 %)		 758,297
(7.42 %)		 12,196,926
(39.96 %)		 101,353
(2.90 %)
425 rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 genbank)
GCA_009806435.2		 n/a 19,480
(1.31 %)		 23,335
(1.31 %)		 n/a 43.83
(97.68 %)		 18,178
(2.32 %)		 3,159
(100.00 %)		 4,179,975
(0.00 %)		 976,271
(2.33 %)		 13,766,353
(39.76 %)		 113,370
(2.46 %)
426 rabbit (primary hap 2024 genbank)
GCA_964237555.1		 n/a 19,386
(1.31 %)		 22,863
(1.35 %)		 n/a 44.02
(99.98 %)		 2,276
(0.02 %)		 222
(100.00 %)		 4,099,590
(21.20 %)		 1,062,902
(3.78 %)		 13,416,878
(41.72 %)		 116,524
(2.66 %)
427 rabbit (Thorbecke 2009 Broad genbank)
GCA_000003625.1		 n/a 18,676
(1.38 %)		 20,095
(1.24 %)		 n/a 43.75
(95.14 %)		 80,789
(4.88 %)		 84,024
(95.12 %)		 4,884,561
(44.65 %)		 883,943
(1.73 %)		 13,254,559
(38.27 %)		 110,338
(2.33 %)
428 radish (v1 WS10039 2015)
GCF_000801105.1		 69,943
(20.66 %)		 33,762
(10.20 %)		 70,765
(28.80 %)		 n/a 35.29
(87.22 %)		 28,041
(12.80 %)		 10,676
(100.00 %)		 196,483
(2.53 %)		 150,132
(3.32 %)		 2,256,858
(26.65 %)		 23,381
(2.80 %)
429 red admiral (genbank 2021)
GCA_905147765.2		 n/a 4,641
(1.20 %)		 13,258
(4.79 %)		 32,725
(10.42 %)		 32.84
(100.00 %)		 18
(0.00 %)		 142
(100.00 %)		 184,094
(2.52 %)		 41,639
(1.23 %)		 3,193,736
(41.82 %)		 10,747
(2.25 %)
430 red mason bee (LIB18336 2019)
GCF_004153925.1		 26,926
(16.13 %)		 4,185
(2.08 %)		 24,859
(11.07 %)		 n/a 39.77
(99.98 %)		 2,089
(0.02 %)		 10,222
(100.00 %)		 88,278
(1.96 %)		 74,016
(3.78 %)		 1,305,254
(28.61 %)		 10,712
(6.90 %)
431 red-crested turaco (2014 BGI)
GCF_000709365.1		 16,151
(2.15 %)		 12,046
(1.50 %)		 25,077
(1.98 %)		 n/a 41.63
(99.43 %)		 75,085
(0.59 %)		 134,672
(99.41 %)		 401,465
(6.41 %)		 153,694
(0.86 %)		 6,705,299
(20.45 %)		 30,183
(1.07 %)
432 red-legged seriema (BGI_N322 2014 BGI)
GCF_000690535.1		 16,238
(2.21 %)		 12,016
(1.53 %)		 23,985
(1.93 %)		 n/a 41.20
(99.63 %)		 59,230
(0.38 %)		 112,704
(99.62 %)		 322,026
(4.02 %)		 121,725
(0.68 %)		 6,797,850
(18.25 %)		 18,873
(0.62 %)
433 red-throated loon (hap2 2023 genbank)
GCA_030936135.1		 25,173
(40.74 %)		 13,218
(1.71 %)		 28,120
(2.39 %)		 n/a 43.11
(100.00 %)		 249
(0.00 %)		 1,195
(100.00 %)		 544,427
(8.81 %)		 223,674
(5.77 %)		 6,669,469
(23.63 %)		 38,306
(3.37 %)
434 reedfish (2019)
GCF_900747795.1		 40,545
(1.73 %)		 13,154
(0.46 %)		 24,028
(1.29 %)		 34,856
(1.34 %)		 39.44
(93.75 %)		 5,614
(6.25 %)		 1,885
(100.00 %)		 1,834,613
(2.79 %)		 1,018,031
(2.36 %)		 20,081,632
(44.56 %)		 88,254
(1.06 %)
435 Rhesus monkey (2015 Baylor)
GCA_000772875.3		 n/a 20,558
(1.71 %)		 22,141
(1.12 %)		 n/a 40.95
(97.08 %)		 64,538
(2.91 %)		 348,579
(97.09 %)		 5,846,699
(54.61 %)		 1,429,378
(9.24 %)		 16,512,587
(40.26 %)		 98,572
(1.29 %)
436 Rice's whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028023285.1		 59,888
(43.60 %)		 19,291
(1.53 %)		 21,195
(1.30 %)		 n/a 41.44
(99.90 %)		 334
(0.10 %)		 774
(100.00 %)		 3,917,923
(36.26 %)		 828,521
(9.28 %)		 12,518,796
(41.08 %)		 73,126
(1.69 %)
437 rifleman (BGI 2014)
GCF_000695815.1		 16,166
(2.37 %)		 12,054
(1.65 %)		 23,851
(2.04 %)		 n/a 41.63
(99.55 %)		 66,437
(0.46 %)		 120,312
(99.54 %)		 392,481
(7.69 %)		 217,040
(2.27 %)		 5,855,355
(18.33 %)		 7,602
(0.24 %)
438 ring-tailed lemur BS26 Broad 2019
GCA_004024665.1		 n/a 21,125
(1.90 %)		 29,864
(1.51 %)		 65,909
(1.91 %)		 41.13
(99.93 %)		 4,599
(0.02 %)		 580,026
(99.98 %)		 3,840,645
(39.25 %)		 675,921
(1.83 %)		 13,841,750
(31.45 %)		 59,440
(1.72 %)
439 Rio pearlfish (Nwh7 v1 2020)
GCF_014905685.1		 25,353
(3.88 %)		 14,334
(1.56 %)		 58,475
(4.46 %)		 n/a 41.06
(92.01 %)		 100,521
(8.02 %)		 18,998
(100.00 %)		 642,988
(3.38 %)		 444,158
(3.06 %)		 6,203,124
(42.81 %)		 52,308
(2.11 %)
440 river trout (v1 2019)
GCF_901001165.1		 102,772
(6.02 %)		 27,413
(1.62 %)		 51,424
(4.17 %)		 121,979
(5.28 %)		 43.36
(96.90 %)		 3,941
(3.10 %)		 1,441
(100.00 %)		 1,438,988
(5.72 %)		 1,789,507
(15.87 %)		 9,819,761
(52.37 %)		 70,821
(1.77 %)
441 rock pigeon (v1 racing homer maternal hap 2024)
GCA_036010775.1		 n/a 12,450
(1.75 %)		 25,274
(2.35 %)		 n/a 42.27
(100.00 %)		 192
(0.00 %)		 673
(100.00 %)		 586,422
(10.85 %)		 392,341
(12.38 %)		 5,521,172
(28.56 %)		 33,479
(3.29 %)
442 rock pigeon (v1 racing homer paternal W 2024)
GCA_036013475.1		 n/a 13,145
(1.66 %)		 28,883
(2.53 %)		 n/a 42.00
(100.00 %)		 248
(0.00 %)		 870
(100.00 %)		 656,923
(11.76 %)		 412,678
(12.92 %)		 6,047,578
(29.90 %)		 36,847
(3.12 %)
443 rock pigeon (v2 racing homer 2024 genbank)
GCA_036013475.2		 n/a 13,146
(1.66 %)		 25,463
(2.12 %)		 n/a 42.00
(100.00 %)		 249
(0.00 %)		 870
(100.00 %)		 656,969
(11.76 %)		 412,670
(12.92 %)		 6,047,584
(29.90 %)		 36,847
(3.12 %)
444 rock ptarmigan (primary hap 2022 genbank)
GCA_023343835.1		 51,619
(61.28 %)		 12,831
(2.31 %)		 n/a n/a 41.57
(99.99 %)		 210
(0.01 %)		 164
(100.00 %)		 667,924
(11.59 %)		 268,431
(2.63 %)		 5,885,274
(21.73 %)		 21,346
(2.37 %)
445 rose-grain aphid (CAU 2021 genbank)
GCA_019925205.1		 n/a 4,332
(0.82 %)		 15,532
(3.91 %)		 n/a 30.24
(99.98 %)		 240
(0.02 %)		 67
(100.00 %)		 481,097
(4.72 %)		 135,266
(7.01 %)		 4,093,473
(52.65 %)		 12,709
(2.68 %)
446 rough bullseye (RE-2024b hap1 2024 genbank)
GCA_042242105.1		 n/a 14,592
(2.84 %)		 44,299
(6.93 %)		 n/a 41.85
(100.00 %)		 87
(0.00 %)		 442
(100.00 %)		 1,764,545
(30.13 %)		 271,391
(5.93 %)		 3,651,092
(24.53 %)		 19,771
(1.39 %)
447 royal ground snake (hap1 2023 genbank)
GCA_031021105.1		 n/a 13,327
(0.96 %)		 20,347
(1.68 %)		 n/a 41.25
(99.99 %)		 1,391
(0.01 %)		 400
(100.00 %)		 1,983,903
(10.40 %)		 1,698,731
(7.29 %)		 9,084,707
(53.44 %)		 130,852
(4.47 %)
448 Ryukyu mouse (v1 2017 EBI genbank)
GCA_900094665.2		 53,779
(39.43 %)		 21,304
(2.26 %)		 18,211
(1.40 %)		 n/a 41.70
(89.05 %)		 306,650
(10.98 %)		 30,919
(92.71 %)		 4,878,260
(40.08 %)		 1,351,707
(2.59 %)		 12,965,226
(27.49 %)		 16,050
(0.44 %)
449 Ryukyu mouse (v1 2017 EBI refseq)
GCF_900094665.1		 53,855
(2.85 %)		 21,291
(2.26 %)		 19,256
(1.49 %)		 96,713
(4.05 %)		 41.70
(89.05 %)		 306,650
(10.98 %)		 30,920
(92.71 %)		 4,749,528
(39.06 %)		 1,351,707
(2.59 %)		 12,965,297
(27.49 %)		 16,050
(0.44 %)
450 saddleback dolphin (v1 primary hap 2023 genbank)
GCA_949987515.1		 46,746
(40.70 %)		 18,625
(1.49 %)		 20,451
(1.28 %)		 n/a 42.06
(99.99 %)		 968
(0.01 %)		 631
(100.00 %)		 4,020,682
(35.99 %)		 1,259,549
(13.09 %)		 12,359,818
(42.64 %)		 66,179
(3.91 %)
451 Saker falcon (bFalChe1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634085.1		 50,290
(50.75 %)		 12,971
(1.67 %)		 23,351
(2.02 %)		 n/a 43.15
(99.70 %)		 258
(0.30 %)		 282
(100.00 %)		 548,087
(7.21 %)		 201,482
(8.55 %)		 7,030,761
(24.94 %)		 31,791
(2.57 %)
452 salmon louse (v1.1 2020)
GCF_016086655.2		 27,164
(5.26 %)		 3,465
(0.45 %)		 3,673
(1.75 %)		 n/a 30.90
(99.99 %)		 608
(0.01 %)		 10,436
(99.99 %)		 1,394,872
(53.53 %)		 76,419
(1.13 %)		 6,311,228
(43.85 %)		 647
(0.04 %)
453 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027887145.1		 27,528
(42.80 %)		 12,832
(1.69 %)		 25,514
(2.23 %)		 n/a 43.50
(99.76 %)		 363
(0.24 %)		 282
(100.00 %)		 541,958
(3.43 %)		 566,692
(13.38 %)		 6,205,274
(28.98 %)		 35,549
(5.05 %)
454 San Diegan tiger whiptail (v1.0 HBS 135688 primary hap 2022)
GCA_023333525.1		 n/a 10,727
(1.18 %)		 14,669
(1.99 %)		 n/a 43.32
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 113
(100.00 %)		 741,937
(6.29 %)		 448,194
(5.60 %)		 7,227,870
(36.97 %)		 42,621
(2.15 %)
455 Sardinian treefrog (hap1 2023 genbank)
GCA_029499605.1		 108,406
(45.40 %)		 13,961
(0.46 %)		 36,603
(1.55 %)		 n/a 43.90
(99.99 %)		 2,297
(0.01 %)		 3,475
(100.00 %)		 1,903,658
(2.85 %)		 2,970,695
(16.56 %)		 15,354,615
(64.31 %)		 652,708
(8.36 %)
456 SARS-CoV-2 (Jan 2020 COVID-19)
GCF_009858895.2		 n/a n/a n/a n/a 37.98
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(0.24 %)		 1
(0.11 %)		 33
(1.38 %)		 1
(0.73 %)
457 Schreibers' long-fingered bat (v1 hap1 2024)
GCA_964146895.1		 n/a 17,882
(1.96 %)		 21,291
(1.88 %)		 n/a 42.53
(99.99 %)		 1,322
(0.01 %)		 265
(100.00 %)		 2,639,522
(28.12 %)		 453,024
(5.66 %)		 10,206,715
(31.11 %)		 59,363
(2.86 %)
458 Schreibers' long-fingered bat (v1 hap2 2024)
GCA_964145185.1		 n/a 17,115
(2.05 %)		 19,972
(1.93 %)		 n/a 42.62
(99.99 %)		 1,137
(0.01 %)		 1,305
(99.99 %)		 2,445,695
(27.61 %)		 386,295
(4.40 %)		 9,657,997
(29.32 %)		 56,451
(2.93 %)
459 sea anemones (CC7 2015 genbank)
GCA_001417965.1		 29,778
(59.32 %)		 3,020
(1.06 %)		 13,146
(12.99 %)		 30,497
(24.04 %)		 36.33
(82.34 %)		 637,478
(17.95 %)		 4,312
(100.00 %)		 74,671
(1.98 %)		 63,328
(2.24 %)		 1,417,036
(20.33 %)		 2,099
(0.38 %)
460 sea lamprey (kPetMar1 primary hap 2020)
GCA_010993605.1		 n/a 8,130
(0.73 %)		 36,343
(4.06 %)		 n/a 48.31
(98.62 %)		 930
(1.38 %)		 1,433
(100.00 %)		 3,309,659
(59.73 %)		 1,194,161
(21.47 %)		 5,320,564
(50.50 %)		 178,590
(35.88 %)
461 sea otter (GAN:26980312 2017 genbank)
GCA_002288905.2		 n/a 18,591
(1.64 %)		 20,913
(1.44 %)		 34,142
(1.77 %)		 41.56
(98.79 %)		 23,134
(1.21 %)		 29,588
(98.79 %)		 4,702,292
(41.42 %)		 721,749
(1.39 %)		 14,065,592
(32.89 %)		 55,388
(1.87 %)
462 segmented worms (v1 2012)
GCF_000326865.1		 23,426
(13.46 %)		 2,741
(0.95 %)		 3,156
(4.19 %)		 n/a 32.82
(91.54 %)		 11,185
(8.47 %)		 12,292
(91.53 %)		 572,062
(30.90 %)		 474,390
(10.49 %)		 1,741,644
(44.75 %)		 3,489
(0.51 %)
463 siamang (v1 Jambi primary hap 2023)
GCF_028878055.1		 79,118
(2.62 %)		 20,139
(1.70 %)		 21,232
(1.14 %)		 n/a 40.62
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 606
(100.00 %)		 5,278,880
(55.89 %)		 946,219
(14.68 %)		 14,395,605
(46.26 %)		 95,573
(1.75 %)
464 siamang (v2 Jambi primary hap 2024 genbank)
GCA_028878055.2		 105,360
(44.53 %)		 20,433
(1.69 %)		 21,357
(1.12 %)		 n/a 40.42
(99.97 %)		 1
(0.03 %)		 26
(100.00 %)		 5,354,441
(55.80 %)		 935,620
(14.70 %)		 14,917,483
(46.01 %)		 92,243
(1.42 %)
465 siamang (v2 Jambi primary hap 2024 refseq)
GCF_028878055.2		 105,373
(3.05 %)		 20,434
(1.69 %)		 21,357
(1.12 %)		 n/a 40.42
(99.97 %)		 2
(0.03 %)		 27
(100.00 %)		 5,354,446
(55.80 %)		 935,620
(14.70 %)		 14,917,515
(46.01 %)		 92,243
(1.42 %)
466 Siamese fighting fish (v2 primary hap 2019)
GCF_900634795.2		 54,389
(16.95 %)		 14,745
(4.21 %)		 34,348
(10.09 %)		 62,673
(13.02 %)		 45.30
(99.99 %)		 328
(0.01 %)		 70
(100.00 %)		 252,955
(3.51 %)		 184,269
(4.62 %)		 2,010,934
(23.88 %)		 72,126
(13.08 %)
467 Siamese fighting fish (v3 primary hap 2020)
GCF_900634795.3		 54,864
(17.78 %)		 14,745
(4.20 %)		 56,808
(10.87 %)		 69,466
(16.34 %)		 45.30
(99.99 %)		 328
(0.01 %)		 70
(100.00 %)		 255,550
(3.51 %)		 184,269
(4.62 %)		 2,010,934
(23.88 %)		 72,126
(13.08 %)
468 silvery gibbon (v1 HM0894 2020 UC Santa Cruz)
GCF_009828535.1		 54,238
(2.74 %)		 17,887
(2.00 %)		 18,517
(1.25 %)		 n/a 41.17
(98.20 %)		 18,567
(1.80 %)		 18,392
(100.00 %)		 4,399,357
(50.55 %)		 711,948
(2.37 %)		 12,623,705
(36.55 %)		 67,835
(1.30 %)
469 silvery gibbon (v2 HMO894 2020 UC Santa Cruz)
GCF_009828535.2		 63,475
(2.65 %)		 20,581
(1.94 %)		 21,181
(1.20 %)		 41,252
(1.46 %)		 41.02
(97.81 %)		 25,106
(2.19 %)		 18,395
(100.00 %)		 5,332,131
(51.09 %)		 857,562
(2.26 %)		 15,565,289
(36.84 %)		 80,124
(1.26 %)
470 slow loris (BS32 2019)
GCA_004027815.1		 n/a 26,771
(1.11 %)		 44,247
(1.00 %)		 n/a 40.68
(99.86 %)		 9,648
(0.03 %)		 1,946,791
(99.97 %)		 6,230,312
(41.68 %)		 688,924
(1.23 %)		 16,892,392
(43.00 %)		 39,326
(0.65 %)
471 slow loris (primary hap 2022 genbank)
GCA_027406575.1		 67,213
(41.75 %)		 22,195
(1.49 %)		 21,341
(1.28 %)		 n/a 40.82
(99.86 %)		 218
(0.14 %)		 85
(100.00 %)		 4,625,875
(39.88 %)		 579,984
(1.59 %)		 14,405,402
(40.78 %)		 38,257
(0.77 %)
472 small Madagascar hedgehog
GCA_000313985.1		 n/a 19,066
(1.18 %)		 19,334
(1.31 %)		 n/a 43.01
(88.44 %)		 269,444
(11.60 %)		 277,845
(88.40 %)		 3,789,866
(28.89 %)		 429,318
(0.87 %)		 16,950,647
(32.23 %)		 39,994
(0.70 %)
473 smaller spotted catshark (v1.1 primary hap 2020 refseq)
GCF_902713615.1		 55,762
(1.62 %)		 12,597
(0.36 %)		 23,987
(1.08 %)		 n/a 47.65
(98.48 %)		 7,146
(1.52 %)		 646
(100.00 %)		 1,185,832
(1.72 %)		 1,448,620
(6.25 %)		 20,884,767
(51.41 %)		 456,658
(8.18 %)
474 smalleye Pacific opah (hap2 2023 genbank)
GCA_029633865.1		 n/a 13,617
(1.10 %)		 74,639
(4.12 %)		 n/a 44.94
(99.96 %)		 3,115
(0.04 %)		 544
(100.00 %)		 4,603,649
(53.23 %)		 1,009,241
(18.00 %)		 5,236,063
(51.65 %)		 143,632
(7.43 %)
475 smalltooth sawfish (v2 primary hap 2019 genbank)
GCA_009764475.1		 n/a 11,828
(0.66 %)		 18,627
(1.55 %)		 n/a 42.38
(99.09 %)		 698
(0.91 %)		 173
(100.00 %)		 405,021
(1.14 %)		 391,531
(1.52 %)		 11,282,302
(38.19 %)		 45,398
(1.34 %)
476 snowberry fruit fly (East Lansing v1.0 2016)
GCF_001687245.1		 37,836
(4.45 %)		 10,526
(1.07 %)		 59,331
(6.34 %)		 n/a 36.53
(93.84 %)		 227,684
(6.18 %)		 139,583
(93.83 %)		 653,914
(2.87 %)		 386,956
(5.71 %)		 7,364,314
(43.00 %)		 60,636
(4.05 %)
477 sockeye salmon (On170113-E2 v1 2019)
GCF_006149115.1		 76,167
(6.12 %)		 24,114
(1.71 %)		 51,371
(4.08 %)		 102,891
(5.24 %)		 43.39
(96.16 %)		 25,659
(3.84 %)		 38,027
(99.99 %)		 1,300,179
(8.96 %)		 1,465,690
(10.81 %)		 8,849,714
(48.44 %)		 64,215
(1.55 %)
478 South Georgia icefish (v1 primary hap 2020)
GCF_902827115.1		 41,307
(6.47 %)		 14,776
(1.79 %)		 68,734
(6.16 %)		 61,643
(5.52 %)		 42.07
(99.94 %)		 2,461
(0.06 %)		 1,563
(100.00 %)		 498,451
(3.42 %)		 474,032
(7.20 %)		 3,613,731
(45.83 %)		 88,984
(4.31 %)
479 southern bluefin tuna (primary hap 2021 genbank)
GCA_910596095.1		 58,416
(66.24 %)		 15,695
(2.61 %)		 42,730
(5.74 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 95
(0.00 %)		 58
(100.00 %)		 1,591,314
(33.50 %)		 247,764
(2.94 %)		 5,176,850
(26.85 %)		 14,097
(0.88 %)
480 southern cattle tick (Rmic-2018 2020 genbank)
GCA_013339725.1		 n/a 3,698
(0.12 %)		 117,910
(5.00 %)		 35,315
(1.88 %)		 45.79
(99.99 %)		 1,576
(0.01 %)		 7,048
(100.00 %)		 770,997
(2.03 %)		 680,149
(3.55 %)		 10,994,272
(39.37 %)		 304,620
(17.03 %)
481 southern grasshopper mouse (US017 2019 Broad)
GCA_004026725.1		 n/a 24,302
(1.12 %)		 43,055
(0.98 %)		 n/a 41.63
(99.82 %)		 10,550
(0.03 %)		 2,272,285
(99.97 %)		 5,668,964
(24.75 %)		 1,628,683
(5.38 %)		 15,658,806
(41.85 %)		 21,801
(0.44 %)
482 southern house mosquito (JHB 2007 genbank)
GCA_000209185.1		 n/a 5,905
(1.14 %)		 41,195
(8.84 %)		 n/a 37.42
(93.28 %)		 45,500
(6.75 %)		 48,671
(93.25 %)		 738,398
(35.22 %)		 171,041
(5.71 %)		 3,037,349
(50.41 %)		 65,784
(9.49 %)
483 southern tamandua (Broad 2019)
GCA_004025105.1		 n/a 25,638
(0.82 %)		 49,782
(0.86 %)		 n/a 39.53
(99.88 %)		 5,819
(0.02 %)		 2,150,023
(99.98 %)		 6,033,640
(37.10 %)		 708,890
(0.99 %)		 22,371,532
(41.88 %)		 80,897
(1.09 %)
484 southern two-toed sloth (US054 2019 Broad)
GCA_004027855.1		 n/a 25,877
(0.78 %)		 56,071
(0.82 %)		 n/a 39.82
(99.84 %)		 5,099
(0.02 %)		 2,537,432
(99.98 %)		 5,384,587
(37.86 %)		 724,925
(2.20 %)		 19,492,096
(41.12 %)		 55,674
(0.90 %)
485 southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 genbank)
GCA_000283155.1		 37,037
(37.57 %)		 18,551
(1.79 %)		 19,747
(1.44 %)		 n/a 40.90
(96.05 %)		 54,737
(3.96 %)		 57,823
(96.04 %)		 3,824,807
(39.33 %)		 421,693
(0.97 %)		 14,765,476
(28.93 %)		 36,281
(1.02 %)
486 soybean (US DOE JGI-PGF v2.0 2010)
GCF_000004515.4		 82,440
(9.65 %)		 27,682
(3.07 %)		 77,218
(11.84 %)		 n/a 34.77
(97.65 %)		 15,955
(2.35 %)		 17,146
(97.65 %)		 834,646
(37.35 %)		 436,219
(5.65 %)		 5,341,660
(45.30 %)		 35,897
(1.56 %)
487 soybean (US DOE JGI-PGF v2.1 2018)
GCF_000004515.5		 85,123
(9.72 %)		 27,647
(3.06 %)		 77,190
(11.83 %)		 n/a 34.77
(97.65 %)		 15,995
(2.36 %)		 17,187
(97.64 %)		 834,651
(37.35 %)		 436,225
(5.65 %)		 5,341,721
(45.30 %)		 35,897
(1.47 %)
488 speckled mousebird (hap1 2023 genbank)
GCA_028858725.1		 n/a 11,956
(1.78 %)		 25,177
(2.60 %)		 n/a 42.38
(99.48 %)		 143
(0.52 %)		 189
(100.00 %)		 523,056
(12.47 %)		 243,547
(3.72 %)		 5,408,003
(23.43 %)		 25,552
(2.34 %)
489 speckled mousebird (v1 hap2 2023)
GCA_028858625.1		 n/a 13,169
(1.74 %)		 26,896
(2.47 %)		 n/a 42.62
(99.56 %)		 151
(0.44 %)		 243
(100.00 %)		 570,907
(11.75 %)		 317,226
(6.96 %)		 5,854,600
(25.51 %)		 28,905
(2.31 %)
490 speckled wood butterfly (genbank 2021)
GCA_905163445.1		 21,720
(55.73 %)		 4,713
(0.87 %)		 17,002
(4.33 %)		 29,238
(7.81 %)		 35.99
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 71
(100.00 %)		 304,077
(2.97 %)		 110,835
(4.09 %)		 3,704,355
(44.42 %)		 28,108
(2.75 %)
491 sperm whale (SW-GA 2019)
GCF_002837175.2		 60,921
(2.59 %)		 19,527
(1.73 %)		 25,114
(1.51 %)		 n/a 41.39
(95.90 %)		 128,928
(4.12 %)		 143,605
(95.88 %)		 4,365,057
(42.78 %)		 694,673
(2.40 %)		 13,518,590
(32.76 %)		 94,152
(2.52 %)
492 sponges A.queenslandica (v1.0 2010 JGI-PGF)
GCF_000090795.1		 31,248
(25.26 %)		 2,167
(1.08 %)		 6,648
(9.22 %)		 n/a 35.83
(86.92 %)		 14,944
(13.10 %)		 27,972
(86.90 %)		 108,973
(4.04 %)		 70,563
(4.66 %)		 881,116
(24.58 %)		 668
(0.62 %)
493 stable fly (8C7A2A5H3J4 2015 genbank)
GCA_001015335.1		 n/a 7,737
(1.16 %)		 11,972
(2.65 %)		 n/a 38.85
(84.55 %)		 129,113
(15.50 %)		 125,702
(84.50 %)		 310,342
(1.75 %)		 391,619
(8.42 %)		 5,616,633
(48.71 %)		 38,246
(1.55 %)
494 sterlet (maternal hap 2022 genbank)
GCA_902713425.1		 n/a 22,306
(1.80 %)		 33,366
(4.09 %)		 n/a 39.56
(99.99 %)		 402
(0.01 %)		 245
(100.00 %)		 1,126,738
(3.36 %)		 889,853
(6.73 %)		 8,766,715
(39.22 %)		 51,356
(1.84 %)
495 sterlet (maternal hap 2022 genbank)
GCA_902713425.2		 n/a 25,364
(1.76 %)		 40,452
(4.10 %)		 n/a 40.11
(100.00 %)		 433
(0.00 %)		 1,731
(100.00 %)		 4,055,215
(43.14 %)		 1,124,096
(10.13 %)		 9,426,172
(41.81 %)		 64,522
(2.85 %)
496 sterlet (v1 paternal hap 2020)
GCA_902713435.1		 n/a 22,718
(1.81 %)		 34,093
(4.15 %)		 57,768
(4.88 %)		 39.60
(100.00 %)		 422
(0.01 %)		 224
(100.00 %)		 1,145,503
(3.39 %)		 912,936
(6.84 %)		 8,839,174
(39.17 %)		 52,560
(1.82 %)
497 sterlet (v1 Gen_M01 2020)
GCF_010645085.1		 73,251
(5.76 %)		 24,411
(1.72 %)		 39,637
(3.96 %)		 n/a 39.76
(99.93 %)		 6,283
(0.07 %)		 3,404
(100.00 %)		 1,269,345
(3.50 %)		 1,095,665
(6.81 %)		 10,007,602
(39.30 %)		 60,475
(1.95 %)
498 stony coral S.pistillata (v1 CSM Monaco 2017)
GCF_002571385.1		 36,135
(16.45 %)		 3,324
(0.70 %)		 20,909
(10.93 %)		 38,198
(17.00 %)		 38.54
(89.50 %)		 49,077
(10.54 %)		 5,688
(100.00 %)		 111,077
(1.70 %)		 108,732
(2.95 %)		 2,009,396
(21.40 %)		 6,012
(0.58 %)
499 striped catfish (primary hap 2022 genbank)
GCA_027358585.1		 53,859
(65.52 %)		 16,035
(2.86 %)		 41,619
(5.48 %)		 n/a 38.99
(99.49 %)		 236
(0.51 %)		 59
(100.00 %)		 1,870,238
(37.80 %)		 605,571
(6.82 %)		 5,059,499
(32.43 %)		 17,919
(1.29 %)
500 sudden oak death agent (Pr-102 primary hap 2021 genbank)
GCA_020800215.1		 n/a 1,461
(1.76 %)		 22,413
(61.13 %)		 n/a 54.37
(99.66 %)		 50
(0.34 %)		 28
(100.00 %)		 8,935
(0.72 %)		 9,528
(3.65 %)		 117,380
(14.16 %)		 34
(99.96 %)
501 Sumatran orangutan (Susie 2018 genbank)
GCA_002880775.3		 n/a 20,174
(1.79 %)		 20,994
(1.15 %)		 47,806
(1.68 %)		 40.80
(99.29 %)		 553
(0.70 %)		 5,813
(99.30 %)		 5,497,148
(54.41 %)		 1,048,361
(8.01 %)		 15,948,575
(40.68 %)		 39,481
(0.87 %)
502 Sumatran orangutan (v1 AG06213 primary hap 2023)
GCF_028885655.1		 98,046
(3.46 %)		 21,162
(1.68 %)		 21,714
(1.13 %)		 n/a 41.13
(99.79 %)		 59
(0.21 %)		 2,670
(99.79 %)		 5,730,768
(55.05 %)		 1,175,314
(11.19 %)		 16,323,507
(44.05 %)		 55,799
(2.08 %)
503 Swainson's thrush (bCatUst1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009819505.1		 n/a 13,403
(1.85 %)		 27,456
(2.48 %)		 n/a 42.86
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 3,601
(100.00 %)		 497,374
(5.78 %)		 649,859
(4.89 %)		 6,740,713
(22.65 %)		 49,076
(3.54 %)
504 Swainson's thrush (v1 primary hap 2019)
GCF_009819885.1		 40,128
(5.45 %)		 13,016
(1.88 %)		 24,787
(2.41 %)		 30,064
(2.94 %)		 42.48
(98.86 %)		 428
(1.14 %)		 161
(100.00 %)		 483,978
(5.85 %)		 589,859
(4.32 %)		 6,708,638
(22.44 %)		 49,404
(3.53 %)
505 swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028018845.1		 29,544
(46.92 %)		 12,375
(1.75 %)		 24,577
(2.31 %)		 n/a 43.08
(99.89 %)		 236
(0.11 %)		 40
(100.00 %)		 419,473
(3.09 %)		 439,909
(7.61 %)		 6,077,743
(24.47 %)		 32,064
(3.27 %)
506 tammar wallaby (v1 primary hap 2023)
GCA_028372415.1		 n/a 17,652
(0.77 %)		 15,774
(0.88 %)		 n/a 38.73
(99.81 %)		 515
(0.19 %)		 315
(100.00 %)		 5,836,160
(26.14 %)		 1,193,709
(2.72 %)		 22,682,658
(39.52 %)		 23,629
(0.48 %)
507 tammar wallaby (v2 primary hap 2023 genbank)
GCA_028372415.2		 n/a 17,617
(0.77 %)		 15,414
(0.86 %)		 n/a 38.73
(99.81 %)		 515
(0.19 %)		 273
(100.00 %)		 5,866,321
(26.30 %)		 1,193,604
(2.72 %)		 22,677,517
(39.53 %)		 23,590
(0.47 %)
508 Tasmanian devil
GCF_000189315.1		 32,527
(1.79 %)		 16,112
(0.84 %)		 16,152
(0.94 %)		 n/a 36.05
(92.36 %)		 201,403
(7.66 %)		 237,291
(92.34 %)		 6,766,259
(42.85 %)		 1,240,681
(2.07 %)		 20,998,733
(36.61 %)		 23,155
(0.38 %)
509 thale cress (tair10 Columbia 2011)
GCF_000001735.3		 54,010
(40.19 %)		 26,552
(34.12 %)		 25,867
(35.78 %)		 n/a 36.06
(99.85 %)		 357
(0.16 %)		 7
(100.00 %)		 67,353
(16.32 %)		 27,063
(2.77 %)		 749,020
(22.64 %)		 4,599
(1.63 %)
510 thirteen-lined ground squirrel (2011)
GCF_000236235.1		 41,886
(2.61 %)		 19,165
(1.70 %)		 18,102
(1.44 %)		 n/a 39.91
(93.27 %)		 141,005
(6.75 %)		 153,488
(93.25 %)		 4,378,557
(36.61 %)		 640,337
(1.64 %)		 14,116,066
(27.91 %)		 28,321
(0.64 %)
511 thorny skate (v1 CabotCenter1 v1 2020 refseq)
GCF_010909765.1		 45,969
(2.40 %)		 11,433
(0.60 %)		 26,341
(1.72 %)		 32,017
(1.87 %)		 44.30
(92.54 %)		 3,753
(7.46 %)		 957
(100.00 %)		 865,711
(2.57 %)		 1,176,348
(3.79 %)		 9,964,038
(52.25 %)		 242,676
(4.73 %)
512 thorny skate (v1 primary hap CabotCenter1 2020 genbank)
GCA_010909765.1		 45,969
(46.35 %)		 11,434
(0.60 %)		 26,342
(1.72 %)		 32,017
(1.87 %)		 44.30
(92.54 %)		 3,753
(7.46 %)		 958
(100.00 %)		 866,598
(2.58 %)		 1,176,350
(3.79 %)		 9,964,083
(52.25 %)		 242,676
(4.73 %)
513 tick D.silvarum (v1 2020)
GCF_013339745.1		 36,084
(1.94 %)		 4,032
(0.13 %)		 128,567
(5.82 %)		 43,960
(2.05 %)		 46.91
(99.95 %)		 13,519
(0.05 %)		 1,665
(100.00 %)		 1,116,542
(2.95 %)		 642,860
(3.16 %)		 10,429,455
(39.18 %)		 37,849
(2.30 %)
514 tidepool copepod (San Diego 2019 genbank)
GCA_007210705.1		 23,429
(54.20 %)		 3,517
(1.61 %)		 18,910
(15.71 %)		 n/a 42.18
(97.94 %)		 14,007
(2.09 %)		 459
(100.00 %)		 52,042
(1.17 %)		 27,065
(1.23 %)		 928,666
(18.11 %)		 15,823
(5.51 %)
515 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022 genbank)
GCA_026437365.1		 n/a 14,276
(1.78 %)		 66,576
(6.32 %)		 n/a 42.96
(99.99 %)		 794
(0.01 %)		 820
(100.00 %)		 2,127,818
(38.86 %)		 708,255
(30.28 %)		 3,809,452
(49.66 %)		 101,682
(8.04 %)
516 tiger tail seahorse (QL1 v1 2016)
GCF_001891065.1		 47,041
(13.29 %)		 13,817
(3.76 %)		 32,943
(8.81 %)		 n/a 43.30
(93.04 %)		 23,101
(6.97 %)		 60,478
(93.03 %)		 359,724
(3.91 %)		 155,380
(3.35 %)		 2,811,700
(24.51 %)		 61,685
(7.72 %)
517 tiny Cayenne caecilian (v1 2019)
GCF_901765095.1		 41,333
(1.27 %)		 14,569
(0.43 %)		 30,499
(1.16 %)		 n/a 44.01
(98.99 %)		 2,452
(1.01 %)		 1,081
(100.00 %)		 1,835,191
(1.59 %)		 1,670,443
(3.30 %)		 22,207,145
(52.43 %)		 414,828
(3.91 %)
518 tomato (v3.0 Heinz 1706 2018)
GCF_000188115.4		 46,015
(6.94 %)		 15,396
(2.15 %)		 38,462
(7.56 %)		 n/a 34.12
(90.18 %)		 19,634
(9.83 %)		 3,150
(100.00 %)		 417,162
(18.21 %)		 229,803
(3.18 %)		 5,370,478
(35.28 %)		 25,279
(1.28 %)
519 tourmaline sunangel (hap1 2024 genbank)
GCA_036169615.1		 n/a 12,509
(1.97 %)		 21,020
(2.33 %)		 n/a 41.63
(99.99 %)		 437
(0.01 %)		 131
(100.00 %)		 532,267
(5.46 %)		 332,284
(2.69 %)		 6,084,978
(21.20 %)		 19,080
(1.72 %)
520 trahira (v1 hap1 2023)
GCA_029633855.1		 n/a 16,039
(2.06 %)		 44,287
(4.38 %)		 n/a 40.99
(92.91 %)		 867
(7.09 %)		 597
(100.00 %)		 2,228,831
(30.95 %)		 687,495
(13.85 %)		 5,309,097
(36.70 %)		 27,070
(2.09 %)
521 trahira (v1 hap2 2023)
GCA_029633875.1		 n/a 16,216
(2.00 %)		 45,209
(4.32 %)		 n/a 41.03
(96.02 %)		 907
(3.98 %)		 452
(100.00 %)		 2,280,303
(30.80 %)		 708,327
(15.59 %)		 5,394,248
(39.01 %)		 28,386
(2.18 %)
522 tricolored blackbird (1412-34295 primary hap 2022 genbank)
GCA_023055355.1		 n/a 12,867
(1.81 %)		 26,393
(2.48 %)		 n/a 42.85
(100.00 %)		 97
(0.00 %)		 311
(100.00 %)		 429,011
(3.16 %)		 564,849
(5.52 %)		 6,336,716
(23.32 %)		 33,378
(2.70 %)
523 Trypanosoma equiperdum (OVI 2016 genbank)
GCA_001457755.2		 n/a 576
(1.36 %)		 2,999
(35.93 %)		 n/a 45.94
(99.65 %)		 6,447
(0.44 %)		 2,026
(100.00 %)		 16,807
(2.60 %)		 3,925
(0.79 %)		 141,656
(16.64 %)		 4,877
(34.82 %)
524 Trypanosoma melophagium (St. Kilda St. Kilda 2022 genbank)
GCA_022059095.1		 n/a 742
(1.83 %)		 848
(40.20 %)		 n/a 41.23
(100.00 %)		 n/a 64
(100.00 %)		 39,141
(7.68 %)		 14,366
(6.71 %)		 131,898
(25.19 %)		 4,119
(14.82 %)
525 tsetse fly (v1 IAEA_lab_2018 2020)
GCF_014805625.1		 24,334
(8.13 %)		 7,223
(2.32 %)		 6,632
(3.62 %)		 n/a 33.80
(97.46 %)		 9,688
(2.55 %)		 7,986
(100.00 %)		 418,532
(4.76 %)		 185,734
(2.26 %)		 3,090,742
(35.34 %)		 3,487
(0.58 %)
526 Tungara frog (aEngPut4 maternal hap 2024 genbank)
GCA_040894005.1		 n/a 13,678
(0.88 %)		 29,720
(2.41 %)		 n/a 43.19
(100.00 %)		 436
(0.00 %)		 961
(100.00 %)		 734,036
(2.54 %)		 1,217,326
(21.42 %)		 8,925,883
(52.53 %)		 211,590
(5.08 %)
527 two-lined caecilian (v1.1 2019 refseq)
GCF_901001135.1		 56,617
(1.50 %)		 14,448
(0.38 %)		 40,572
(1.31 %)		 n/a 44.40
(99.36 %)		 3,573
(0.64 %)		 1,330
(100.00 %)		 2,263,606
(1.94 %)		 2,036,108
(4.34 %)		 29,400,958
(44.09 %)		 602,912
(6.66 %)
528 Ugandan red Colobus (RC106 v1 2017)
GCA_002776525.1		 n/a 21,053
(1.88 %)		 23,024
(1.24 %)		 n/a 40.68
(96.59 %)		 77,615
(3.42 %)		 47,644
(100.00 %)		 5,478,730
(51.13 %)		 969,126
(2.63 %)		 16,127,854
(36.40 %)		 63,965
(1.04 %)
529 Ugandan red Colobus (RC106 v2 2018)
GCF_002776525.2		 66,965
(2.69 %)		 21,958
(1.85 %)		 24,388
(1.22 %)		 55,722
(1.95 %)		 40.60
(97.10 %)		 63,620
(2.91 %)		 47,449
(100.00 %)		 5,699,639
(51.61 %)		 1,066,606
(2.87 %)		 16,603,622
(37.49 %)		 71,084
(1.08 %)
530 Ugandan red Colobus (RC106 v3 2019)
GCF_002776525.3		 68,173
(2.68 %)		 21,804
(1.85 %)		 23,385
(1.18 %)		 n/a 40.60
(97.10 %)		 64,415
(2.91 %)		 46,654
(100.00 %)		 5,700,226
(51.61 %)		 1,066,759
(2.88 %)		 16,603,818
(37.49 %)		 71,078
(1.08 %)
531 Ugandan red Colobus (RC106 v4 2019)
GCF_002776525.4		 63,704
(2.55 %)		 21,347
(1.86 %)		 23,056
(1.19 %)		 n/a 40.84
(97.07 %)		 57,757
(2.93 %)		 34,372
(100.00 %)		 5,504,117
(51.70 %)		 961,351
(2.75 %)		 16,208,033
(37.10 %)		 71,046
(1.10 %)
532 Upper Galilee mountains blind mole rat (#2095 2014 genbank)
GCA_000622305.1		 54,667
(35.81 %)		 19,685
(1.25 %)		 21,268
(1.20 %)		 n/a 41.26
(95.18 %)		 201,121
(4.83 %)		 356,096
(95.17 %)		 6,165,270
(34.95 %)		 1,197,778
(2.77 %)		 16,282,333
(36.21 %)		 22,905
(0.49 %)
533 valley oak (v3.0 2019)
GCF_001633185.1		 63,555
(8.16 %)		 16,886
(1.90 %)		 72,876
(14.48 %)		 n/a 35.38
(99.77 %)		 1,674
(0.23 %)		 2,010
(100.00 %)		 800,389
(3.72 %)		 460,244
(7.41 %)		 5,439,256
(37.83 %)		 19,635
(1.10 %)
534 vegetable marrow (v1 mu-cu-16 2017)
GCF_002806865.1		 48,870
(21.91 %)		 19,421
(7.41 %)		 36,314
(20.76 %)		 n/a 36.49
(94.25 %)		 49,649
(5.76 %)		 25,263
(100.00 %)		 182,696
(3.35 %)		 143,269
(7.40 %)		 1,620,517
(29.12 %)		 13,323
(2.49 %)
535 velvet spider S.dumicola (v1 Namibia, Etosha 2020)
GCF_010614865.1		 34,675
(2.01 %)		 3,329
(0.10 %)		 24,015
(1.20 %)		 n/a 33.26
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 16,531
(100.00 %)		 1,258,301
(2.08 %)		 828,332
(2.42 %)		 17,994,342
(48.98 %)		 63,015
(0.95 %)
536 wasp C.solmsi marchali (v1 2013)
GCF_000503995.1		 13,201
(7.14 %)		 3,474
(1.25 %)		 15,142
(4.89 %)		 n/a 30.36
(99.55 %)		 7,471
(0.46 %)		 9,928
(99.54 %)		 340,841
(7.52 %)		 251,386
(3.99 %)		 2,448,273
(49.27 %)		 16,346
(4.08 %)
537 water buffalo (Mediterranean 2013)
GCA_000471725.1		 n/a 20,245
(1.49 %)		 24,230
(1.29 %)		 n/a 42.11
(97.39 %)		 263,385
(2.62 %)		 630,367
(97.38 %)		 5,997,926
(47.35 %)		 466,019
(1.02 %)		 13,822,739
(40.29 %)		 93,080
(1.71 %)
538 Weddell seal (WS11-02 2013 genbank)
GCA_000349705.1		 48,251
(30.18 %)		 21,044
(1.72 %)		 22,320
(1.43 %)		 n/a 41.39
(70.44 %)		 152,836
(29.58 %)		 169,546
(70.42 %)		 4,420,479
(41.72 %)		 471,250
(0.66 %)		 13,410,191
(22.09 %)		 48,738
(1.01 %)
539 western European hedgehog (2012 genbank)
GCA_000296755.1		 29,923
(35.25 %)		 18,034
(1.33 %)		 19,779
(1.35 %)		 n/a 41.54
(85.94 %)		 219,764
(14.09 %)		 225,566
(85.91 %)		 6,527,125
(45.87 %)		 1,271,531
(2.29 %)		 12,374,069
(42.02 %)		 28,528
(0.71 %)
540 western European hedgehog (primary hap 2023 genbank)
GCA_950295315.1		 61,103
(44.10 %)		 18,126
(1.16 %)		 21,345
(1.28 %)		 n/a 42.00
(99.97 %)		 3,760
(0.03 %)		 1,175
(100.00 %)		 4,891,344
(19.68 %)		 1,507,933
(3.81 %)		 12,571,193
(54.50 %)		 32,667
(0.90 %)
541 western European house mouse (WSB_EiJ v1 2016)
GCA_001624835.1		 n/a 20,870
(2.26 %)		 18,535
(1.45 %)		 100,622
(4.22 %)		 41.80
(84.36 %)		 399,976
(15.70 %)		 72,315
(94.81 %)		 4,961,700
(39.53 %)		 1,345,987
(2.51 %)		 13,324,808
(25.23 %)		 16,556
(0.40 %)
542 western flower thrips (v2 FOCC.00 2017)
GCF_000697945.2		 24,277
(14.78 %)		 4,066
(1.46 %)		 26,743
(11.40 %)		 n/a 51.10
(94.72 %)		 60,375
(5.31 %)		 34,226
(94.71 %)		 275,482
(4.88 %)		 167,812
(3.67 %)		 1,832,537
(24.44 %)		 26,406
(36.85 %)
543 western lowland gorilla (Susie 2016)
GCA_900006655.3		 n/a 20,323
(1.77 %)		 22,069
(1.15 %)		 n/a 40.71
(99.64 %)		 768
(0.36 %)		 16,065
(99.64 %)		 5,373,630
(50.30 %)		 1,025,389
(10.17 %)		 15,954,613
(41.78 %)		 53,557
(1.01 %)
544 western lowland gorilla (v1.1 KB3781 2023)
GCF_029281585.1		 101,242
(3.18 %)		 20,994
(1.57 %)		 41,945
(1.53 %)		 n/a 40.59
(99.85 %)		 38
(0.15 %)		 637
(100.00 %)		 5,526,927
(51.16 %)		 1,080,693
(20.38 %)		 15,929,020
(48.46 %)		 76,432
(1.35 %)
545 western lowland gorilla (v2.0 KB3781 2024 genbank)
GCA_029281585.2		 98,415
(41.67 %)		 21,010
(1.59 %)		 50,696
(1.83 %)		 n/a 40.49
(99.94 %)		 2
(0.06 %)		 25
(100.00 %)		 5,456,267
(50.77 %)		 1,060,267
(19.55 %)		 15,870,191
(47.77 %)		 69,745
(1.19 %)
546 western lowland gorilla (v2.1 KB3781 2024 genbank)
GCA_029281585.3		 n/a 21,010
(1.59 %)		 50,695
(1.83 %)		 n/a 40.49
(99.94 %)		 2
(0.06 %)		 26
(100.00 %)		 5,456,271
(50.77 %)		 1,060,267
(19.55 %)		 15,870,225
(47.77 %)		 69,745
(1.19 %)
547 western painted turtle (v303 2014)
GCF_000241765.3		 51,681
(3.25 %)		 15,203
(1.04 %)		 22,272
(1.67 %)		 46,230
(2.32 %)		 44.19
(91.88 %)		 183,744
(8.14 %)		 262,326
(91.86 %)		 2,767,141
(30.92 %)		 316,971
(0.98 %)		 11,856,824
(28.95 %)		 104,231
(1.84 %)
548 western painted turtle (v304 RCT428 2020)
GCF_000241765.4		 64,798
(3.75 %)		 15,669
(1.09 %)		 21,663
(1.64 %)		 n/a 44.19
(87.54 %)		 184,311
(12.48 %)		 260,698
(87.52 %)		 3,780,252
(41.81 %)		 316,422
(0.93 %)		 11,852,305
(27.59 %)		 103,899
(1.75 %)
549 western predatory mite (v1.0 2012)
GCF_000255335.1		 12,199
(13.86 %)		 2,842
(1.49 %)		 27,198
(19.18 %)		 n/a 51.58
(99.74 %)		 1,901
(0.26 %)		 3,993
(99.74 %)		 33,136
(1.10 %)		 13,115
(0.57 %)		 612,854
(9.73 %)		 2,003
(54.71 %)
550 western wild mouse (SPRET_EiJ v1 2016)
GCA_001624865.1		 n/a 21,211
(2.19 %)		 17,797
(1.36 %)		 100,839
(4.01 %)		 41.65
(89.10 %)		 334,091
(10.95 %)		 29,259
(98.77 %)		 5,087,807
(40.60 %)		 1,402,357
(3.14 %)		 13,522,663
(27.99 %)		 16,888
(0.42 %)
551 wheat stem sawfly (v1 2014)
GCF_000341935.1		 37,175
(25.01 %)		 4,407
(2.81 %)		 15,504
(11.96 %)		 n/a 40.34
(98.12 %)		 8,733
(1.89 %)		 10,707
(98.11 %)		 87,084
(2.38 %)		 44,673
(2.55 %)		 1,001,343
(22.18 %)		 7,519
(2.78 %)
552 white leghorn X broiler chicken (v1 leghorn haplotype v1 2021)
GCF_016700215.1		 55,865
(8.86 %)		 12,310
(2.41 %)		 22,056
(2.57 %)		 n/a 42.20
(99.65 %)		 254
(0.35 %)		 509
(99.65 %)		 604,452
(10.76 %)		 232,416
(2.03 %)		 5,541,059
(20.23 %)		 22,185
(2.62 %)
553 white-beaked dolphin (primary hap 2023 genbank)
GCA_949774975.1		 59,982
(41.87 %)		 18,737
(1.57 %)		 20,767
(1.34 %)		 n/a 41.91
(99.99 %)		 1,070
(0.01 %)		 410
(100.00 %)		 3,820,566
(36.21 %)		 922,103
(8.43 %)		 12,304,360
(39.74 %)		 68,551
(3.58 %)
554 white-footed mouse
GCF_004664715.1		 46,167
(2.56 %)		 20,406
(1.72 %)		 20,857
(1.46 %)		 39,081
(1.88 %)		 42.23
(100.00 %)		 79
(0.00 %)		 1,763
(100.00 %)		 5,064,597
(30.73 %)		 1,258,088
(2.85 %)		 14,005,845
(33.01 %)		 23,475
(0.69 %)
555 white-tailed deer (Pink-7 2017 genbank)
GCA_002102435.1		 57,774
(39.81 %)		 20,653
(1.75 %)		 23,083
(1.50 %)		 40,950
(1.94 %)		 41.55
(99.10 %)		 107,030
(0.91 %)		 48,652
(99.10 %)		 4,799,958
(41.28 %)		 413,128
(2.59 %)		 13,296,686
(34.22 %)		 44,165
(1.19 %)
556 white-tailed eagle (primary hap 2022 genbank)
GCA_947461875.1		 n/a 13,735
(1.76 %)		 28,993
(2.53 %)		 n/a 43.15
(99.99 %)		 424
(0.01 %)		 188
(100.00 %)		 585,276
(12.89 %)		 291,289
(6.10 %)		 6,474,027
(23.66 %)		 54,851
(4.05 %)
557 white-tufted-ear marmoset (2010 Wash U)
GCF_000004665.1		 58,109
(2.92 %)		 21,699
(1.91 %)		 20,910
(1.24 %)		 n/a 40.85
(94.45 %)		 187,214
(5.57 %)		 201,523
(94.43 %)		 5,120,629
(48.95 %)		 768,432
(2.30 %)		 15,303,718
(34.75 %)		 35,805
(0.79 %)
558 white-tufted-ear marmoset (CJ-08-46 2017)
GCA_002754865.1		 n/a 21,754
(1.86 %)		 21,668
(1.22 %)		 n/a 40.77
(99.67 %)		 48,495
(0.33 %)		 88,439
(99.67 %)		 5,195,965
(48.83 %)		 825,714
(3.60 %)		 15,372,168
(38.05 %)		 34,994
(0.85 %)
559 white-tufted-ear marmoset (cj1700 genbank)
GCA_009663435.1		 n/a 21,729
(1.89 %)		 21,502
(1.30 %)		 n/a 40.85
(98.70 %)		 370
(1.30 %)		 1,360
(98.70 %)		 5,122,418
(49.40 %)		 818,502
(3.68 %)		 15,232,829
(38.20 %)		 36,656
(0.90 %)
560 white-tufted-ear marmoset (v1 paternal hap 2020)
GCA_011100535.1		 n/a 20,939
(1.94 %)		 20,416
(1.31 %)		 n/a 41.04
(99.58 %)		 788
(0.42 %)		 336
(100.00 %)		 4,869,007
(49.39 %)		 746,577
(2.68 %)		 14,347,286
(37.59 %)		 35,222
(0.94 %)
561 white-tufted-ear marmoset (v1.2 2021 genbank)
GCA_011100555.2		 n/a 21,801
(1.88 %)		 21,501
(1.28 %)		 n/a 40.92
(99.52 %)		 1,165
(0.48 %)		 1,234
(100.00 %)		 5,036,594
(47.71 %)		 842,846
(3.25 %)		 15,161,577
(38.08 %)		 37,603
(0.93 %)
562 whooping crane (maternal hap 2023 genbank)
GCA_028858705.1		 55,408
(53.40 %)		 13,572
(1.81 %)		 24,739
(2.19 %)		 n/a 43.07
(99.63 %)		 262
(0.37 %)		 929
(100.00 %)		 616,295
(10.57 %)		 211,557
(2.90 %)		 6,785,134
(22.11 %)		 42,795
(4.66 %)
563 wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 genbank)
GCA_000311805.2		 n/a 18,785
(1.94 %)		 17,252
(1.62 %)		 n/a 41.28
(98.83 %)		 60,971
(1.18 %)		 68,871
(98.82 %)		 3,098,525
(34.75 %)		 353,630
(1.23 %)		 12,349,553
(25.12 %)		 45,436
(1.02 %)
564 wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.0 2019)
GCF_002162155.1		 131,302
(1.34 %)		 33,079
(0.33 %)		 567,762
(8.14 %)		 n/a 45.99
(96.70 %)		 344,768
(3.31 %)		 148,396
(100.00 %)		 2,762,705
(2.81 %)		 2,991,142
(3.37 %)		 493,164
(96.69 %)		 2,220,897
(25.33 %)
565 wild peanut A.duranensis (v1 V14167 2017)
GCF_000817695.2		 69,091
(6.81 %)		 16,823
(1.67 %)		 75,740
(11.45 %)		 n/a 35.81
(86.74 %)		 133,967
(13.30 %)		 3,189
(98.45 %)		 588,761
(3.39 %)		 493,855
(3.35 %)		 5,206,772
(45.36 %)		 48,008
(1.88 %)
566 wild strawberry (2011 genbank)
GCA_000184155.1		 n/a 14,001
(6.64 %)		 34,562
(26.90 %)		 n/a 38.40
(94.26 %)		 16,253
(5.76 %)		 16,459
(94.24 %)		 152,427
(20.00 %)		 74,539
(2.79 %)		 1,032,592
(21.43 %)		 14,802
(3.20 %)
567 wire-tailed manakin (2018)
GCF_003945595.1		 50,529
(5.75 %)		 12,950
(1.89 %)		 19,252
(2.57 %)		 24,522
(2.44 %)		 42.30
(100.00 %)		 102
(0.00 %)		 3,744
(100.00 %)		 500,823
(7.17 %)		 300,638
(2.31 %)		 6,414,267
(20.54 %)		 28,268
(2.21 %)
568 woodchuck (CNAG 2019)
GCA_901343595.1		 n/a 20,813
(1.60 %)		 23,199
(1.43 %)		 45,153
(1.99 %)		 40.00
(97.18 %)		 57,045
(2.82 %)		 105,556
(97.18 %)		 4,756,333
(33.73 %)		 836,503
(2.41 %)		 14,755,960
(31.13 %)		 34,151
(0.87 %)
569 woodchuck (v1.0 LI92 2021)
GCF_021218885.1		 62,044
(2.80 %)		 19,783
(1.48 %)		 21,060
(1.38 %)		 n/a 39.92
(100.00 %)		 46
(0.00 %)		 3,381
(100.00 %)		 3,884,968
(28.12 %)		 912,591
(2.73 %)		 14,538,767
(35.15 %)		 36,919
(1.02 %)
570 worm pipefish (v1 RoL_2023-P1 2023)
GCF_033978685.1		 73,681
(3.43 %)		 25,892
(1.02 %)		 114,154
(3.30 %)		 n/a 39.45
(100.00 %)		 146
(0.00 %)		 630
(100.00 %)		 4,795,312
(24.37 %)		 2,093,730
(16.74 %)		 13,132,465
(67.32 %)		 248,526
(4.59 %)
571 wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 primary hap 2023 genbank)
GCA_029207755.1		 n/a 13,052
(1.78 %)		 24,950
(2.30 %)		 n/a 43.93
(100.00 %)		 353
(0.00 %)		 1,695
(100.00 %)		 444,866
(3.08 %)		 473,471
(7.97 %)		 5,336,498
(25.82 %)		 37,210
(3.14 %)
572 Yangtze finless porpoise (v1 2018 refseq)
GCF_003031525.1		 43,312
(2.49 %)		 18,639
(1.72 %)		 19,645
(1.46 %)		 n/a 41.28
(99.29 %)		 52,647
(0.72 %)		 66,346
(99.28 %)		 n/a 540,765
(1.65 %)		 12,691,760
(32.87 %)		 59,052
(1.48 %)
573 Yangtze finless porpoise (v1 wild 2018 genbank)
GCA_003031525.1		 43,299
(41.33 %)		 18,726
(1.80 %)		 19,644
(1.46 %)		 n/a 41.28
(99.29 %)		 52,647
(0.72 %)		 66,345
(99.28 %)		 3,990,044
(42.54 %)		 540,765
(1.65 %)		 12,691,683
(32.88 %)		 59,052
(1.48 %)
574 Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 genbank)
GCA_000442215.1		 27,063
(35.76 %)		 19,219
(1.73 %)		 27,456
(1.66 %)		 n/a 41.30
(98.69 %)		 124,797
(1.33 %)		 155,509
(98.67 %)		 4,277,556
(44.10 %)		 690,534
(1.95 %)		 13,025,034
(35.19 %)		 67,035
(1.82 %)
575 Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 refseq)
GCF_000442215.1		 27,063
(1.65 %)		 19,227
(1.75 %)		 27,468
(1.66 %)		 n/a 41.30
(98.69 %)		 124,797
(1.33 %)		 155,510
(98.67 %)		 4,193,317
(43.38 %)		 690,534
(1.95 %)		 13,025,097
(35.19 %)		 67,035
(1.82 %)
576 yellow fever mosquito (LVP_AGWG 2017 genbank)
GCA_002204515.1		 n/a 8,814
(0.51 %)		 152,909
(17.36 %)		 n/a 38.16
(100.00 %)		 229
(0.00 %)		 6,534
(100.00 %)		 2,912,289
(46.74 %)		 533,475
(4.34 %)		 10,210,670
(53.65 %)		 132,732
(6.12 %)
577 yellow-bellied marmot (hap1 2025 genbank)
GCA_047511675.1		 n/a 19,503
(1.44 %)		 20,301
(1.35 %)		 n/a 39.90
(100.00 %)		 330
(0.00 %)		 814
(100.00 %)		 4,038,897
(29.07 %)		 978,915
(3.28 %)		 14,404,740
(34.97 %)		 36,674
(1.05 %)
578 yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.0 2019)
GCF_003676075.2		 42,715
(2.16 %)		 19,894
(1.62 %)		 21,366
(1.40 %)		 43,878
(1.99 %)		 39.89
(97.96 %)		 35,595
(2.04 %)		 66,624
(97.96 %)		 4,646,957
(34.05 %)		 800,897
(1.96 %)		 14,340,028
(32.63 %)		 34,125
(0.91 %)
579 yellow-bellied marmot (v1 2018)
GCF_003676075.1		 41,573
(2.14 %)		 19,845
(1.63 %)		 21,262
(1.39 %)		 n/a 39.88
(97.82 %)		 38,354
(2.18 %)		 69,503
(97.82 %)		 4,683,625
(34.38 %)		 799,659
(1.95 %)		 14,322,765
(32.58 %)		 34,127
(0.91 %)
580 yellow-footed antechinus (v1 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021)
GCA_016432865.1		 n/a 15,703
(0.78 %)		 16,184
(0.90 %)		 n/a 36.21
(99.99 %)		 620
(0.01 %)		 487
(100.00 %)		 5,424,579
(25.40 %)		 1,269,774
(2.59 %)		 21,430,550
(42.69 %)		 28,121
(0.66 %)
581 yellow-throated sandgrouse (BGI_N339 2014 BGI)
GCF_000699245.1		 15,990
(2.25 %)		 11,775
(1.55 %)		 23,935
(1.90 %)		 n/a 41.36
(99.67 %)		 48,553
(0.34 %)		 107,160
(99.66 %)		 384,032
(4.45 %)		 182,309
(1.03 %)		 6,529,534
(19.24 %)		 15,660
(0.55 %)
582 yellowtail amberjack (v1 SW California HSWRI2012SDOR001 2017)
GCF_002814215.1		 41,168
(9.96 %)		 15,861
(2.76 %)		 30,671
(6.00 %)		 n/a 40.75
(97.79 %)		 33,664
(2.20 %)		 99,598
(100.00 %)		 614,513
(4.16 %)		 522,349
(4.83 %)		 4,650,538
(24.98 %)		 18,054
(0.96 %)
583 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP primary hap 2023 genbank)
GCA_028538775.1		 n/a 18,587
(1.82 %)		 21,049
(1.76 %)		 n/a 43.22
(100.00 %)		 209
(0.00 %)		 685
(100.00 %)		 2,890,086
(24.28 %)		 719,555
(4.26 %)		 10,089,514
(36.35 %)		 60,975
(2.61 %)
584 zebra finch (v1 Black17 2019 refseq)
GCF_003957565.1		 51,472
(7.16 %)		 13,211
(2.02 %)		 17,812
(2.70 %)		 38,655
(7.10 %)		 42.04
(99.78 %)		 312
(0.22 %)		 135
(100.00 %)		 535,521
(8.50 %)		 550,118
(4.01 %)		 6,519,872
(21.47 %)		 30,053
(2.58 %)
585 zebra finch (v1 Black17 male 2019 genbank)
GCA_003957565.2		 n/a 13,212
(2.02 %)		 25,117
(2.57 %)		 38,655
(7.10 %)		 42.04
(99.78 %)		 312
(0.22 %)		 135
(100.00 %)		 535,521
(8.50 %)		 550,118
(4.01 %)		 6,519,872
(21.47 %)		 30,053
(2.58 %)
586 zebra finch (v1.4 Blue55 primary hap 2021 genbank)
GCA_003957565.4		 n/a 12,755
(1.97 %)		 24,009
(2.47 %)		 n/a 41.86
(99.66 %)		 352
(0.34 %)		 199
(100.00 %)		 389,146
(3.10 %)		 458,903
(3.33 %)		 6,338,599
(20.92 %)		 29,203
(2.49 %)
587 zebra shark (hap1 2023 genbank)
GCA_030684315.1		 n/a 12,291
(0.48 %)		 16,769
(1.14 %)		 n/a 43.41
(99.47 %)		 1,159
(0.53 %)		 835
(100.00 %)		 8,087,543
(64.92 %)		 798,373
(9.17 %)		 14,838,773
(42.39 %)		 45,284
(1.67 %)
588 zebu cattle (Nelore 2014 genbank)
GCA_000247795.2		 n/a 18,599
(1.58 %)		 18,779
(1.29 %)		 n/a 41.75
(92.62 %)		 6,941,272
(7.66 %)		 253,769
(92.59 %)		 5,118,783
(46.84 %)		 358,908
(0.88 %)		 13,431,620
(36.60 %)		 35,241
(0.84 %)
589 zig-zag eel (v1.1 2018)
GCF_900324485.1		 44,813
(12.05 %)		 15,028
(3.35 %)		 21,782
(6.89 %)		 36,982
(11.22 %)		 40.66
(97.63 %)		 235
(2.37 %)		 126
(100.00 %)		 348,517
(2.87 %)		 157,776
(2.00 %)		 3,182,742
(23.42 %)		 12,824
(1.08 %)
TOTALS:total assembly count 589

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 226 assemblies assembly stats track stats
Mammals 680 assemblies assembly stats track stats
Birds 433 assemblies assembly stats track stats
Fishes 493 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 314 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1173 assemblies assembly stats track stats
Plants 316 assemblies assembly stats track stats
Fungi 921 assemblies assembly stats track stats
Viruses 421 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 123 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 588 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1300 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 982 assemblies assembly stats track stats