Legacy Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of legacy only.

See also: hub access, assembly statistics


Data resource links

NOTE: Click on the column headers to sort the table by that column
The link to genome browser will attach only that single assembly to the genome browser.
The numbers are: item count (percent coverage)
Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 aardvark (BS58 2019 Broad)
GCA_004365145.1		 n/a 22,095
(0.63 %)		 44,942
(0.68 %)		 n/a 40.25
(99.86 %)		 15,429
(0.03 %)		 2,690,873
(99.97 %)		 8,755,250
(34.47 %)		 869,360
(1.26 %)		 22,002,517
(59.65 %)		 39,239
(0.49 %)
2 Acadian redfish (fSebFas1 primary hap 2024 genbank)
GCA_043250625.1		 n/a 15,735
(2.44 %)		 50,184
(6.16 %)		 n/a 40.90
(99.99 %)		 471
(0.01 %)		 203
(100.00 %)		 1,781,283
(37.65 %)		 444,047
(7.93 %)		 4,765,080
(37.01 %)		 39,918
(2.01 %)
3 Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 genbank)
GCA_027172205.1		 57,514
(54.61 %)		 14,340
(1.37 %)		 20,053
(2.31 %)		 n/a 43.81
(100.00 %)		 30
(0.00 %)		 27
(100.00 %)		 832,937
(4.17 %)		 474,203
(4.04 %)		 7,020,288
(38.29 %)		 94,745
(2.70 %)
4 African clawed frog (2016)
GCF_001663975.1		 61,159
(3.82 %)		 23,424
(1.78 %)		 27,990
(2.23 %)		 n/a 38.98
(88.63 %)		 216,028
(11.39 %)		 324,061
(88.61 %)		 1,726,079
(12.81 %)		 680,428
(2.28 %)		 13,887,586
(35.94 %)		 85,680
(0.94 %)
5 African grass rat (v1 paternal X 2020 genbank)
GCA_011762505.1		 45,963
(36.56 %)		 20,933
(2.00 %)		 19,613
(1.43 %)		 37,929
(2.32 %)		 41.39
(99.19 %)		 1,624
(0.81 %)		 1,596
(100.00 %)		 4,940,083
(37.33 %)		 1,674,970
(5.40 %)		 13,613,540
(32.71 %)		 17,767
(0.51 %)
6 African malaria mosquito (PEST 2006)
GCA_000005575.1		 n/a 5,478
(2.34 %)		 30,482
(13.88 %)		 n/a 44.27
(95.26 %)		 8,735
(4.75 %)		 8,115
(99.79 %)		 241,805
(14.48 %)		 72,702
(2.39 %)		 1,434,880
(21.28 %)		 25,507
(8.25 %)
7 African savanna elephant (2009 genbank)
GCA_000001905.1		 46,043
(34.84 %)		 19,181
(1.25 %)		 19,665
(1.10 %)		 n/a 40.76
(97.57 %)		 93,514
(2.45 %)		 95,866
(97.55 %)		 6,337,637
(57.82 %)		 365,796
(0.88 %)		 16,073,052
(44.89 %)		 33,513
(0.68 %)
8 alkali bee (v1.2 Touchet_males 2018)
GCF_003710045.1		 27,736
(10.71 %)		 4,020
(1.34 %)		 42,185
(10.12 %)		 n/a 40.41
(94.37 %)		 14,031
(5.59 %)		 95,883
(100.00 %)		 112,828
(2.21 %)		 95,886
(3.63 %)		 2,006,114
(27.47 %)		 23,832
(3.81 %)
9 alpaca (2015 BGI)
GCA_000767525.1		 n/a 18,513
(1.97 %)		 19,112
(1.70 %)		 31,905
(1.94 %)		 41.46
(99.38 %)		 23,458
(0.62 %)		 75,733
(99.38 %)		 3,095,742
(36.41 %)		 314,508
(1.07 %)		 12,365,152
(25.46 %)		 53,956
(1.50 %)
10 alpaca (v3.1 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U)
GCF_000164845.3		 55,001
(3.56 %)		 18,437
(1.94 %)		 18,446
(1.63 %)		 n/a 41.40
(95.85 %)		 166,280
(4.17 %)		 77,390
(100.00 %)		 3,150,224
(36.21 %)		 315,108
(1.36 %)		 12,461,739
(24.88 %)		 54,502
(1.38 %)
11 Alpine marmot (2015)
GCF_001458135.1		 35,350
(2.23 %)		 20,139
(1.58 %)		 18,286
(1.41 %)		 n/a 39.80
(96.07 %)		 89,362
(3.94 %)		 14,543
(100.00 %)		 n/a 747,129
(1.83 %)		 14,077,162
(30.27 %)		 30,224
(0.63 %)
12 American alligator (2023 genbank)
GCA_030867065.1		 n/a 14,487
(0.97 %)		 20,444
(1.61 %)		 n/a 45.04
(99.81 %)		 136
(0.19 %)		 806
(99.81 %)		 3,380,365
(43.12 %)		 560,127
(2.00 %)		 12,524,244
(32.47 %)		 50,852
(2.67 %)
13 American alligator (chrom assembly 2023 genbank)
GCA_030867095.1		 60,799
(51.66 %)		 14,382
(0.98 %)		 18,601
(1.45 %)		 n/a 45.01
(99.30 %)		 161
(0.70 %)		 194
(100.00 %)		 3,322,619
(43.19 %)		 478,206
(1.77 %)		 12,316,391
(32.01 %)		 49,792
(2.45 %)
14 American beaver (US014 2019 Broad)
GCA_004027675.1		 n/a 22,515
(1.25 %)		 34,527
(1.17 %)		 n/a 39.58
(99.92 %)		 5,769
(0.02 %)		 837,916
(99.98 %)		 5,101,904
(34.46 %)		 552,100
(1.02 %)		 15,150,706
(34.57 %)		 24,558
(0.63 %)
15 American bison (2014 genbank)
GCA_000754665.1		 38,686
(33.79 %)		 20,215
(1.44 %)		 20,845
(1.20 %)		 n/a 41.99
(93.39 %)		 341,984
(6.63 %)		 792,165
(93.37 %)		 6,006,931
(47.67 %)		 495,106
(1.11 %)		 13,902,115
(39.01 %)		 90,767
(1.29 %)
16 American pika 3.0 (2012 Broad genbank)
GCA_000292845.1		 26,240
(36.96 %)		 17,569
(1.60 %)		 20,092
(1.69 %)		 n/a 43.35
(87.20 %)		 122,542
(12.82 %)		 132,961
(87.18 %)		 2,829,934
(29.80 %)		 414,895
(1.07 %)		 10,968,663
(26.71 %)		 44,651
(1.14 %)
17 amphioxus (hap2 2024 genbank)
GCA_035083965.1		 n/a 5,217
(0.97 %)		 41,736
(12.73 %)		 n/a 41.61
(100.00 %)		 103
(0.00 %)		 34
(100.00 %)		 128,505
(1.65 %)		 182,123
(8.03 %)		 2,157,899
(27.45 %)		 44,261
(5.21 %)
18 amphipods H.azteca (HAZT.00-mixed v2.0 2016)
GCF_000764305.1		 24,008
(8.48 %)		 3,331
(0.47 %)		 38,201
(8.97 %)		 24,453
(8.50 %)		 38.47
(99.52 %)		 23,726
(0.48 %)		 23,426
(99.52 %)		 161,274
(1.72 %)		 432,436
(8.89 %)		 3,517,080
(28.92 %)		 50,987
(4.44 %)
19 Amur tiger (TaeGuk 2013 genbank)
GCA_000464555.1		 33,668
(37.51 %)		 18,213
(1.58 %)		 15,093
(1.29 %)		 n/a 41.40
(97.59 %)		 155,553
(2.44 %)		 157,031
(97.56 %)		 4,832,679
(42.49 %)		 831,134
(1.67 %)		 13,654,373
(31.78 %)		 65,229
(1.60 %)
20 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 genbank)
GCA_003957555.2		 n/a 12,258
(1.95 %)		 20,580
(2.26 %)		 n/a 41.49
(98.48 %)		 429
(1.52 %)		 160
(100.00 %)		 535,315
(7.95 %)		 262,056
(1.51 %)		 6,092,351
(20.84 %)		 17,130
(1.48 %)
21 ant C.costatus (v1 MS0001 2016)
GCF_001594065.1		 16,082
(8.44 %)		 4,038
(1.42 %)		 32,856
(9.80 %)		 n/a 34.73
(95.75 %)		 10,626
(4.26 %)		 26,005
(95.74 %)		 203,498
(3.41 %)		 100,483
(2.15 %)		 2,221,362
(35.19 %)		 18,108
(3.49 %)
22 ant N.fulva (TAMU-Nful-2015 v1.0 2019)
GCF_005281655.1		 28,261
(10.34 %)		 4,915
(1.27 %)		 40,257
(10.17 %)		 n/a 35.18
(99.51 %)		 1,076
(0.49 %)		 2,869
(100.00 %)		 322,753
(4.92 %)		 245,412
(6.65 %)		 1,952,946
(43.11 %)		 17,048
(6.08 %)
23 ant T.cornetzi (Tcor2-1 v1.0 2016 BGI)
GCF_001594075.1		 22,023
(8.25 %)		 4,211
(1.25 %)		 37,113
(9.30 %)		 n/a 35.01
(91.82 %)		 40,822
(8.21 %)		 60,583
(91.79 %)		 218,162
(3.24 %)		 139,385
(2.26 %)		 2,347,922
(34.62 %)		 23,814
(3.66 %)
24 apicomplexans C.sp. chipmunk genotype I (37763 2021 genbank)
GCA_004936735.2		 n/a 426
(3.03 %)		 203
(12.39 %)		 n/a 32.03
(100.00 %)		 10
(0.00 %)		 50
(100.00 %)		 3,358
(1.88 %)		 1,257
(0.81 %)		 67,711
(20.74 %)		 4
(0.02 %)
25 apicomplexans E.tenella (Houghton 2013)
GCA_000499545.1		 n/a 326
(0.37 %)		 1,632
(4.94 %)		 n/a 51.33
(98.72 %)		 8,063
(1.32 %)		 12,727
(98.68 %)		 127,265
(17.42 %)		 148,397
(16.77 %)		 326,694
(37.33 %)		 12,417
(22.22 %)
26 apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 genbank)
GCA_002114115.1		 n/a 22,542
(3.52 %)		 67,060
(16.20 %)		 n/a 38.04
(88.95 %)		 7,175
(11.05 %)		 806
(100.00 %)		 692,611
(50.80 %)		 322,540
(4.42 %)		 3,033,193
(35.58 %)		 25,871
(1.75 %)
27 Arabian camel (2014 genbank)
GCA_000767585.1		 n/a 18,452
(1.96 %)		 16,975
(1.61 %)		 n/a 41.29
(98.88 %)		 72,775
(1.13 %)		 105,347
(98.87 %)		 3,079,920
(34.79 %)		 319,928
(0.96 %)		 12,281,845
(25.28 %)		 48,638
(1.17 %)
28 Arctic fox (US066 2019 Broad)
GCA_004023825.1		 n/a 22,910
(1.42 %)		 31,985
(1.20 %)		 35,342
(1.47 %)		 41.93
(99.87 %)		 9,604
(0.04 %)		 1,272,949
(99.96 %)		 6,096,013
(44.89 %)		 1,265,350
(2.67 %)		 14,617,986
(39.29 %)		 64,716
(1.93 %)
29 ascomycetes A.fischeri (v3 NRRL 181 2006)
GCF_000149645.2		 10,388
(48.16 %)		 1,538
(3.76 %)		 6,155
(25.19 %)		 n/a 49.56
(99.97 %)		 90
(0.03 %)		 466
(99.97 %)		 5,026
(0.77 %)		 2,256
(0.38 %)		 68,790
(5.94 %)		 2,846
(42.44 %)
30 ascomycetes A.nidulans (FGSC A4 2012 genbank)
GCA_000149205.2		 n/a 1,524
(3.90 %)		 5,275
(23.90 %)		 n/a 50.30
(99.43 %)		 158
(0.58 %)		 249
(99.42 %)		 5,218
(3.22 %)		 2,452
(0.41 %)		 51,693
(4.64 %)		 1,128
(90.37 %)
31 ascomycetes A.niger CBS 513.88 (v3 2007)
GCF_000002855.3		 10,609
(51.05 %)		 1,481
(3.36 %)		 5,692
(22.11 %)		 n/a 50.35
(99.87 %)		 662
(0.13 %)		 469
(99.87 %)		 9,986
(1.32 %)		 2,619
(0.36 %)		 106,480
(7.71 %)		 5,568
(53.86 %)
32 ascomycetes A.rabiei (Mel4 2019)
GCF_004011695.1		 11,257
(41.02 %)		 1,596
(2.91 %)		 8,283
(26.43 %)		 n/a 49.20
(100.00 %)		 n/a 34
(100.00 %)		 14,775
(2.01 %)		 16,031
(2.34 %)		 103,256
(17.19 %)		 805
(44.28 %)
33 ascomycetes B.dermatitidis (ER-3 2009 genbank)
GCA_000003525.2		 n/a 1,516
(1.76 %)		 5,714
(11.07 %)		 n/a 37.07
(99.50 %)		 566
(0.51 %)		 593
(99.49 %)		 38,696
(2.74 %)		 27,571
(2.05 %)		 270,617
(48.64 %)		 8,002
(10.69 %)
34 ascomycetes B.gilchristii (SLH14081 2009 genbank)
GCA_000003855.2		 n/a 1,518
(1.57 %)		 5,702
(9.73 %)		 n/a 35.75
(98.67 %)		 1,691
(1.34 %)		 1,794
(98.66 %)		 42,930
(2.67 %)		 27,826
(1.78 %)		 328,698
(50.87 %)		 7,943
(9.35 %)
35 ascomycetes C.auris (B8441 2017)
GCA_002759435.2		 n/a 1,944
(12.45 %)		 4,981
(62.59 %)		 n/a 45.21
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 15
(100.00 %)		 3,395
(1.46 %)		 2,375
(0.85 %)		 48,902
(8.34 %)		 1,576
(6.87 %)
36 ascomycetes C.posadasii (C735 delta SOWgp 2009 genban)
GCA_000151335.1		 n/a 1,479
(4.26 %)		 5,283
(25.22 %)		 n/a 46.59
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 88
(100.00 %)		 10,463
(5.97 %)		 5,206
(0.91 %)		 74,027
(11.89 %)		 4,784
(34.49 %)
37 ascomycetes F.oxysporum (NRRL 32931 2014 genbank)
GCA_000271745.2		 n/a 1,503
(2.37 %)		 11,741
(30.20 %)		 n/a 47.63
(98.55 %)		 377
(1.46 %)		 545
(98.54 %)		 8,453
(2.23 %)		 3,560
(0.37 %)		 129,150
(7.65 %)		 14,398
(29.11 %)
38 ascomycetes P.destructans (20631-21 2010 genbank)
GCA_000184105.1		 n/a 1,446
(3.95 %)		 5,635
(25.84 %)		 n/a 50.12
(92.42 %)		 2,066
(7.59 %)		 3,579
(92.41 %)		 11,499
(5.71 %)		 11,754
(2.10 %)		 87,648
(13.51 %)		 4,483
(54.70 %)
39 ascomycetes P.digitatum (Pd1 2012 genbank)
GCA_000315645.2		 n/a 1,461
(4.51 %)		 5,599
(29.85 %)		 n/a 48.91
(95.53 %)		 516
(4.48 %)		 562
(95.52 %)		 3,575
(0.59 %)		 2,210
(0.38 %)		 66,810
(6.03 %)		 7,344
(38.10 %)
40 ascomycetes P.pennisetigena (Br36 2019 genbank)
GCA_004337985.1		 n/a 1,482
(2.32 %)		 7,302
(20.85 %)		 n/a 47.48
(99.41 %)		 1,281
(0.60 %)		 108
(100.00 %)		 24,268
(1.88 %)		 11,049
(1.23 %)		 163,225
(20.20 %)		 764
(17.56 %)
41 ascomycetes P.rubens (Wisconsin 54-1255 2008 genbank)
GCA_000226395.1		 n/a 1,550
(3.72 %)		 7,756
(30.06 %)		 n/a 48.96
(99.94 %)		 775
(0.06 %)		 49
(100.00 %)		 5,678
(0.78 %)		 4,560
(0.81 %)		 73,645
(5.86 %)		 7,807
(50.55 %)
42 ascomycetes R.enersibuu (CBS 393.64 2015 genbank)
GCA_000968595.1		 n/a 1,499
(4.04 %)		 3,608
(17.47 %)		 n/a 50.55
(99.99 %)		 76
(0.00 %)		 938
(100.00 %)		 12,877
(1.80 %)		 4,459
(0.56 %)		 116,737
(10.53 %)		 2,561
(81.62 %)
43 ascomycetes S.macrospora (v2 k-hell 2012)
GCF_000182805.2		 9,903
(39.44 %)		 1,311
(2.58 %)		 4,612
(17.66 %)		 n/a 52.11
(99.64 %)		 978
(0.36 %)		 1,583
(100.00 %)		 16,540
(1.85 %)		 7,316
(0.76 %)		 171,684
(11.10 %)		 1,770
(49.40 %)
44 ascomycetes S.schenckii (1099-18 2015 genbank)
GCA_000961545.1		 10,279
(51.22 %)		 1,134
(2.55 %)		 2,026
(10.60 %)		 n/a 54.96
(100.00 %)		 57
(0.00 %)		 73
(100.00 %)		 15,846
(2.28 %)		 8,000
(0.94 %)		 169,678
(13.75 %)		 22
(99.61 %)
45 ascomycetes T.marneffei (ATCC 18224 2008 genbank)
GCA_000001985.1		 n/a 1,532
(4.18 %)		 7,679
(34.14 %)		 n/a 46.67
(99.38 %)		 137
(0.62 %)		 589
(99.38 %)		 6,404
(1.04 %)		 2,594
(0.58 %)		 61,594
(6.70 %)		 5,746
(15.84 %)
46 ascomycetes Z.tritici (IPO323 2011 genbank)
GCA_000219625.1		 10,941
(44.32 %)		 1,451
(2.81 %)		 6,906
(25.36 %)		 n/a 52.14
(99.98 %)		 3
(0.02 %)		 24
(99.98 %)		 8,941
(1.69 %)		 8,367
(1.51 %)		 99,818
(11.14 %)		 27
(96.31 %)
47 Asian corn borer (v1 ACB-3 2019)
GCF_004193835.1		 25,266
(7.93 %)		 4,931
(1.05 %)		 28,608
(7.16 %)		 n/a 37.50
(100.00 %)		 34,722
(0.01 %)		 7,722
(100.00 %)		 146,974
(1.35 %)		 89,987
(2.68 %)		 2,666,250
(38.74 %)		 39,696
(5.22 %)
48 Asian corn borer (v2 ACB-3 2019)
GCF_004193835.2		 25,169
(7.95 %)		 4,867
(1.05 %)		 28,255
(7.08 %)		 n/a 37.49
(100.00 %)		 34,702
(0.01 %)		 6,269
(100.00 %)		 150,783
(1.53 %)		 89,885
(2.69 %)		 2,627,296
(38.56 %)		 39,511
(5.22 %)
49 Asian swallowtail (v1 2015)
GCF_000836235.1		 22,417
(13.18 %)		 5,290
(2.15 %)		 13,925
(7.00 %)		 n/a 33.81
(97.56 %)		 5,205
(2.44 %)		 10,777
(97.56 %)		 122,491
(2.29 %)		 27,169
(0.71 %)		 2,130,840
(38.92 %)		 11,899
(2.85 %)
50 Asian tiger mosquito (C6/36 2017 genbank)
GCA_001876365.2		 n/a 10,893
(0.53 %)		 128,502
(8.33 %)		 n/a 40.42
(100.00 %)		 n/a 2,434
(100.00 %)		 605,350
(2.88 %)		 921,761
(7.40 %)		 11,169,474
(57.07 %)		 220,674
(10.38 %)
51 Asian tiger mosquito (v1 FPA 2019 genbank
GCA_006496715.1		 n/a 10,347
(0.43 %)		 138,311
(7.69 %)		 n/a 40.40
(99.93 %)		 3,359
(0.07 %)		 2,196
(100.00 %)		 691,302
(2.69 %)		 1,084,185
(7.47 %)		 12,619,495
(57.66 %)		 250,421
(10.15 %)
52 Asian tiger mosquito (v1 FPA 2019 refseq)
GCF_006496715.1		 49,254
(2.57 %)		 10,500
(0.44 %)		 138,307
(7.69 %)		 n/a 40.40
(99.93 %)		 3,359
(0.07 %)		 2,197
(100.00 %)		 6,821,491
(69.74 %)		 1,084,205
(7.47 %)		 12,619,646
(57.66 %)		 250,420
(10.13 %)
53 Asiatic tapir (BS100 BIUU 2019)
GCA_004024905.1		 n/a 20,854
(1.73 %)		 28,046
(1.39 %)		 n/a 40.91
(99.96 %)		 4,333
(0.02 %)		 284,468
(99.98 %)		 3,802,671
(39.88 %)		 335,521
(0.73 %)		 15,053,564
(30.25 %)		 39,691
(1.17 %)
54 ass (Maral har 2015 genbank)
GCA_001305755.1		 48,976
(40.12 %)		 18,884
(1.76 %)		 19,296
(1.44 %)		 n/a 41.28
(98.63 %)		 69,593
(1.38 %)		 2,166
(100.00 %)		 3,855,699
(41.69 %)		 289,735
(0.96 %)		 14,695,257
(28.58 %)		 40,025
(1.06 %)
55 Atlantic halibut (primary hap 2019 genbank)
GCA_009819705.1		 52,117
(66.34 %)		 14,960
(3.20 %)		 45,365
(7.48 %)		 69,625
(10.94 %)		 42.21
(99.43 %)		 290
(0.57 %)		 57
(100.00 %)		 428,421
(4.16 %)		 256,153
(3.73 %)		 3,725,979
(24.13 %)		 31,325
(2.25 %)
56 Atlantic ridley (rLepKem1 hap2 2025 genbank)
GCA_965140265.1		 n/a 14,601
(1.02 %)		 17,367
(1.50 %)		 n/a 44.08
(100.00 %)		 245
(0.00 %)		 332
(100.00 %)		 1,335,525
(12.58 %)		 314,640
(2.13 %)		 10,517,469
(34.27 %)		 45,940
(1.37 %)
57 Atlantic salmon (genbank 2021)
GCA_905237065.2		 n/a 28,077
(1.40 %)		 120,383
(3.99 %)		 183,727
(7.26 %)		 43.42
(100.00 %)		 211
(0.00 %)		 4,222
(100.00 %)		 4,501,521
(48.00 %)		 2,247,891
(25.01 %)		 10,731,814
(59.31 %)		 77,089
(1.86 %)
58 Atlantic stingray (hap1 2023 genbank)
GCA_030144855.1		 60,922
(45.62 %)		 12,545
(0.38 %)		 29,428
(1.34 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 1,648
(0.01 %)		 2,990
(100.00 %)		 8,579,105
(49.81 %)		 831,224
(15.75 %)		 21,718,213
(51.79 %)		 105,821
(2.42 %)
59 axolotl (Mex_15411 2024 genbank)
GCA_040938575.1		 n/a 18,563
(0.07 %)		 184,525
(1.17 %)		 n/a 46.34
(100.00 %)		 2,095
(0.00 %)		 220
(100.00 %)		 27,951,542
(67.11 %)		 8,561,024
(9.70 %)		 2,315
(100.00 %)		 2,452,305
(5.31 %)
60 B.malayi (v3 2008 agent of lymphatic filariasis)
GCF_000002995.3		 11,460
(14.87 %)		 2,843
(2.29 %)		 3,797
(4.95 %)		 n/a 30.21
(92.98 %)		 58,744
(7.04 %)		 26,881
(93.03 %)		 147,614
(11.55 %)		 54,885
(7.91 %)		 647,155
(33.62 %)		 509
(0.15 %)
61 Bactrian camel (Alxa 2014 genbank)
GCA_000767855.1		 52,178
(47.52 %)		 18,330
(1.96 %)		 17,094
(1.64 %)		 n/a 41.32
(99.32 %)		 31,980
(0.69 %)		 67,434
(99.31 %)		 3,072,373
(34.88 %)		 306,996
(0.95 %)		 12,209,895
(25.43 %)		 49,789
(1.25 %)
62 band-tailed pigeon (v1 hap2 2024 genbank)
GCA_036971685.1		 n/a 13,319
(1.60 %)		 25,993
(2.05 %)		 n/a 43.83
(99.41 %)		 219
(0.59 %)		 453
(100.00 %)		 700,173
(13.18 %)		 457,546
(13.85 %)		 4,523,003
(31.73 %)		 42,686
(7.00 %)
63 banded archerfish (primary hap 2021 genbank)
GCA_017976425.1		 42,399
(57.52 %)		 15,312
(3.18 %)		 41,147
(7.01 %)		 62,990
(9.37 %)		 41.11
(99.82 %)		 98
(0.18 %)		 96
(100.00 %)		 811,892
(18.19 %)		 271,913
(9.55 %)		 3,355,326
(28.08 %)		 15,089
(0.96 %)
64 barn owl (2020)
GCF_902150015.1		 37,361
(4.54 %)		 12,958
(1.72 %)		 22,922
(1.99 %)		 26,976
(3.04 %)		 41.55
(99.23 %)		 177,340
(0.79 %)		 21,504
(100.00 %)		 585,627
(5.48 %)		 367,764
(2.44 %)		 7,399,161
(19.58 %)		 47,061
(3.25 %)
65 barn owl BGI_N341 (2014)
GCF_000687205.1		 15,006
(2.07 %)		 11,133
(1.44 %)		 21,138
(1.69 %)		 n/a 40.21
(99.24 %)		 109,223
(0.79 %)		 171,345
(99.21 %)		 413,761
(3.90 %)		 181,353
(0.91 %)		 6,776,326
(18.43 %)		 10,575
(0.29 %)
66 barn swallow (bHirRus1 v2 primary hap genbank 2021)
GCA_015227805.2		 n/a 12,385
(1.88 %)		 23,302
(2.31 %)		 n/a 42.54
(97.69 %)		 1,102
(2.31 %)		 617
(100.00 %)		 579,928
(6.20 %)		 364,636
(2.27 %)		 6,198,840
(21.01 %)		 36,546
(2.82 %)
67 barn swallow (v2 primary hap 2021 refseq)
GCF_015227805.1		 43,374
(5.14 %)		 12,385
(1.88 %)		 23,302
(2.31 %)		 n/a 42.54
(97.69 %)		 1,102
(2.31 %)		 617
(100.00 %)		 579,928
(6.20 %)		 364,636
(2.27 %)		 6,198,840
(21.01 %)		 36,546
(2.82 %)
68 barn swallow (v3 primary hap 2021 genbank)
GCA_015227805.3		 n/a 12,395
(1.89 %)		 23,302
(2.31 %)		 n/a 42.54
(97.69 %)		 1,102
(2.31 %)		 617
(100.00 %)		 664,757
(13.92 %)		 364,636
(2.27 %)		 6,198,840
(21.01 %)		 36,548
(2.85 %)
69 barramundi perch (ASB-BC8 2016)
GCF_001640805.1		 50,205
(13.10 %)		 16,166
(3.05 %)		 25,084
(6.20 %)		 n/a 40.75
(100.00 %)		 110
(0.00 %)		 3,808
(100.00 %)		 465,997
(3.11 %)		 237,955
(4.36 %)		 4,027,027
(23.91 %)		 16,276
(1.04 %)
70 basidiomycetes A.bisporus (H97 2012)
GCF_000300575.1		 10,448
(49.20 %)		 1,066
(2.53 %)		 5,238
(16.95 %)		 n/a 46.48
(99.32 %)		 225
(0.68 %)		 254
(99.32 %)		 4,921
(0.90 %)		 2,352
(0.47 %)		 62,603
(9.90 %)		 5,244
(15.19 %)
71 basidiomycetes C.cinerea (okayama7#130 2010 genbank)
GCA_000182895.1		 n/a 1,050
(2.04 %)		 3,917
(10.89 %)		 n/a 51.64
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 68
(100.00 %)		 n/a 3,805
(0.81 %)		 107,373
(7.81 %)		 81
(99.54 %)
72 basidiomycetes C.depauperatus (CBS 7841 2024 genbank)
GCA_001720195.2		 n/a 921
(4.16 %)		 4,119
(24.79 %)		 n/a 44.80
(100.00 %)		 n/a 8
(100.00 %)		 2,424
(0.66 %)		 1,011
(0.30 %)		 56,356
(7.99 %)		 1,869
(7.30 %)
73 basidiomycetes C.neoformans (JEC21 2005 genbank)
GCA_000091045.1		 n/a 957
(3.66 %)		 3,784
(19.12 %)		 n/a 48.54
(99.99 %)		 85
(0.01 %)		 99
(99.99 %)		 4,944
(5.25 %)		 1,808
(0.52 %)		 68,717
(8.41 %)		 5,128
(28.73 %)
74 basidiomycetes K.bestiolae (CBS 10118 2024 genbank)
GCA_000512585.3		 n/a 918
(2.66 %)		 4,907
(18.38 %)		 n/a 47.29
(100.00 %)		 n/a 8
(100.00 %)		 7,245
(1.32 %)		 2,141
(0.47 %)		 97,927
(9.78 %)		 4,995
(11.17 %)
75 basidiomycetes K.bestiolae (v1 CBS 10118 2016)
GCF_000512585.1		 9,187
(54.88 %)		 867
(2.56 %)		 4,441
(17.03 %)		 n/a 47.25
(99.94 %)		 30
(0.06 %)		 42
(99.94 %)		 7,231
(1.31 %)		 1,919
(0.32 %)		 110,288
(10.48 %)		 4,972
(10.95 %)
76 basidiomycetes K.dejecticola (CBS 10117 2024 genbank)
GCA_000512565.3		 n/a 910
(2.69 %)		 4,861
(19.78 %)		 n/a 48.39
(100.00 %)		 n/a 11
(100.00 %)		 7,778
(1.42 %)		 2,452
(0.43 %)		 86,630
(7.97 %)		 3,644
(14.24 %)
77 basidiomycetes K.dejecticola (v1 CBS 10117 2016)
GCF_000512565.1		 8,645
(55.47 %)		 908
(2.72 %)		 4,862
(19.87 %)		 n/a 48.38
(99.98 %)		 56
(0.02 %)		 69
(99.98 %)		 7,816
(1.43 %)		 2,425
(0.42 %)		 85,868
(7.91 %)		 3,698
(15.12 %)
78 basidiomycetes K.mangroviensis (v1 CBS 8507 2016 refseq)
GCF_000507465.1		 8,471
(55.95 %)		 884
(2.79 %)		 5,418
(21.48 %)		 n/a 44.88
(99.73 %)		 43
(0.27 %)		 105
(99.73 %)		 6,509
(1.21 %)		 1,529
(0.25 %)		 101,733
(9.98 %)		 2,326
(4.59 %)
79 basidiomycetes K.mangroviensis (v2 CBS 8507 2024 genbank)
GCA_000507465.4		 n/a 886
(2.74 %)		 5,392
(21.25 %)		 n/a 44.92
(100.00 %)		 n/a 4
(100.00 %)		 6,585
(1.21 %)		 1,546
(0.27 %)		 104,495
(10.38 %)		 2,335
(5.10 %)
80 basidiomycetes K.pini (v1 CBS 10737 2016)
GCF_000512605.1		 7,854
(58.26 %)		 816
(2.92 %)		 5,392
(23.35 %)		 n/a 40.23
(99.94 %)		 24
(0.06 %)		 42
(99.94 %)		 6,502
(1.34 %)		 1,847
(0.36 %)		 99,393
(12.25 %)		 1,191
(2.91 %)
81 basidiomycetes K.shandongensis (v1 CBS 12478 2019)
GCF_008629635.1		 7,454
(55.86 %)		 893
(2.94 %)		 3,348
(15.13 %)		 n/a 49.82
(99.99 %)		 11
(0.01 %)		 132
(100.00 %)		 5,510
(1.13 %)		 1,598
(0.33 %)		 81,983
(9.00 %)		 512
(39.06 %)
82 basidiomycetes M.globosa (v1 CBS 7966 2007)
GCF_000181695.1		 4,286
(69.39 %)		 1,060
(8.79 %)		 2,585
(44.95 %)		 n/a 52.06
(100.00 %)		 22
(0.00 %)		 89
(100.00 %)		 1,777
(0.93 %)		 720
(0.48 %)		 22,182
(4.73 %)		 124
(60.74 %)
83 basidiomycetes S.commune (v1 H4-8 2010)
GCF_000143185.1		 13,192
(49.72 %)		 894
(1.60 %)		 973
(2.80 %)		 n/a 57.50
(98.57 %)		 316
(1.43 %)		 352
(98.57 %)		 7,478
(4.11 %)		 7,640
(1.13 %)		 176,404
(11.51 %)		 38
(40.33 %)
84 bee C.calcarata (v1 Rehan_Ccalc_2016 2016)
GCF_001652005.1		 25,020
(17.94 %)		 4,205
(2.34 %)		 27,352
(12.83 %)		 n/a 41.09
(91.93 %)		 19,248
(8.05 %)		 50,565
(100.00 %)		 57,833
(1.39 %)		 27,440
(2.49 %)		 1,173,760
(18.39 %)		 10,942
(2.61 %)
85 bee E.mexicana (v1 0111107269 2016)
GCF_001483705.1		 16,406
(4.01 %)		 4,087
(0.75 %)		 46,846
(6.53 %)		 16,764
(4.04 %)		 40.92
(95.72 %)		 25,039
(4.23 %)		 212,650
(95.77 %)		 641,987
(7.51 %)		 360,406
(11.43 %)		 3,411,951
(46.01 %)		 40,540
(3.99 %)
86 beet (2015)
GCF_000511025.2		 37,803
(8.76 %)		 12,044
(2.14 %)		 63,283
(17.52 %)		 n/a 36.14
(91.40 %)		 30,962
(8.61 %)		 71,208
(91.39 %)		 288,084
(4.25 %)		 299,650
(4.72 %)		 3,021,571
(30.10 %)		 32,547
(2.39 %)
87 Bellinger river turtle (v1 BRST_UC0152H_USYD 2024)
GCA_040894355.1		 n/a 14,732
(1.14 %)		 18,988
(1.77 %)		 n/a 43.21
(100.00 %)		 57
(0.00 %)		 129
(100.00 %)		 1,130,950
(11.22 %)		 213,212
(1.80 %)		 11,049,280
(26.48 %)		 53,923
(2.09 %)
88 beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v2 2017)
GCA_002288925.2		 n/a 18,686
(1.78 %)		 20,378
(1.43 %)		 n/a 41.24
(98.66 %)		 28,398
(1.35 %)		 35,369
(98.65 %)		 4,001,688
(43.72 %)		 542,326
(1.10 %)		 12,806,249
(34.24 %)		 59,279
(1.53 %)
89 Betapolyomavirus macacae (2000)
GCA_000837645.1		 n/a n/a n/a n/a 40.76
(99.94 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3
(4.54 %)		 15
(4.33 %)		 0
(0.00 %)
90 bighorn sheep (v1 Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024)
GCF_042477335.1		 75,387
(2.66 %)		 18,667
(1.37 %)		 20,248
(1.35 %)		 n/a 44.07
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 41
(100.00 %)		 3,081,260
(20.10 %)		 796,298
(12.14 %)		 12,235,764
(46.75 %)		 50,538
(11.18 %)
91 black cottonwood (v3 Nisqually-1 2018)
GCF_000002775.4		 59,636
(15.47 %)		 20,361
(4.67 %)		 44,177
(15.83 %)		 n/a 33.75
(97.43 %)		 6,871
(2.58 %)		 8,318
(97.42 %)		 402,600
(27.63 %)		 177,746
(4.65 %)		 2,639,214
(36.04 %)		 4,559
(0.56 %)
92 black perch (LCO1_2020_lvr primary hap 2022 genbank)
GCA_022577435.1		 n/a 14,991
(3.02 %)		 47,106
(6.98 %)		 n/a 41.61
(100.00 %)		 234
(0.00 %)		 230
(100.00 %)		 1,017,149
(18.99 %)		 360,899
(8.75 %)		 3,761,526
(28.91 %)		 48,360
(4.43 %)
93 black rhinoceros (primary hap 2021 genbank)
GCA_020826845.1		 56,255
(36.51 %)		 18,774
(1.38 %)		 22,346
(1.26 %)		 n/a 41.59
(99.95 %)		 215
(0.05 %)		 1,075
(100.00 %)		 4,200,385
(36.22 %)		 548,030
(8.34 %)		 14,347,639
(40.14 %)		 43,525
(1.14 %)
94 black snub-nosed monkey (Rb0 v1 genbank 2016)
GCA_001698545.1		 59,197
(39.21 %)		 21,244
(1.88 %)		 23,681
(1.25 %)		 n/a 40.94
(94.13 %)		 149,843
(5.88 %)		 105,030
(100.00 %)		 5,600,915
(50.57 %)		 991,762
(2.45 %)		 16,353,992
(34.26 %)		 81,205
(1.19 %)
95 black snub-nosed monkey (Rb0 v1 refseq 2016)
GCF_001698545.1		 59,210
(2.48 %)		 21,256
(1.89 %)		 23,679
(1.25 %)		 n/a 40.94
(94.13 %)		 149,843
(5.88 %)		 105,031
(100.00 %)		 5,602,009
(50.58 %)		 991,745
(2.45 %)		 16,354,078
(34.26 %)		 81,205
(1.19 %)
96 black swan (v1 Queensland, Australia AKBS03 2020)
GCF_013377495.1		 41,255
(4.77 %)		 12,955
(1.98 %)		 22,656
(2.28 %)		 31,476
(5.07 %)		 41.95
(100.00 %)		 n/a 396
(100.00 %)		 680,976
(7.66 %)		 296,152
(1.44 %)		 6,797,141
(21.40 %)		 31,750
(3.32 %)
97 black tiger shrimp (v1 SGIC_2016 2020)
GCF_015228065.1		 35,910
(2.41 %)		 3,903
(0.15 %)		 39,667
(2.27 %)		 40,959
(2.59 %)		 36.64
(83.75 %)		 1,158,725
(16.44 %)		 26,876
(100.00 %)		 5,488,723
(29.98 %)		 7,028,944
(21.91 %)		 10,445,796
(49.62 %)		 178,205
(3.43 %)
98 black-legged kittiwake (bRisTri1.patW 2023 genbank)
GCA_028500815.1		 51,115
(48.16 %)		 13,211
(1.67 %)		 24,108
(1.99 %)		 n/a 44.40
(99.94 %)		 283
(0.06 %)		 716
(100.00 %)		 521,275
(5.36 %)		 236,727
(8.62 %)		 5,684,588
(26.70 %)		 45,318
(4.71 %)
99 black-legged tick (U.Maryland v1 2021)
GCF_016920785.1		 41,018
(2.61 %)		 4,064
(0.14 %)		 135,587
(7.67 %)		 n/a 46.27
(100.00 %)		 n/a 2,977
(100.00 %)		 1,153,773
(4.93 %)		 754,711
(7.52 %)		 10,964,182
(43.13 %)		 138,831
(8.38 %)
100 black-legged tick (Wikel colony 2008 genbank)
GCA_000208615.1		 n/a 3,432
(0.19 %)		 108,471
(5.13 %)		 n/a 45.22
(78.65 %)		 201,145
(21.35 %)		 570,637
(78.65 %)		 656,957
(3.38 %)		 365,918
(1.61 %)		 8,574,437
(27.02 %)		 345,141
(14.15 %)
101 blackcap (primary hap 2019 genbank)
GCA_009819655.1		 n/a 12,378
(1.92 %)		 22,970
(2.37 %)		 n/a 42.00
(98.88 %)		 413
(1.12 %)		 189
(100.00 %)		 506,242
(6.14 %)		 330,354
(2.12 %)		 6,410,567
(19.76 %)		 26,838
(2.34 %)
102 Blainville's beaked whale (primary hap 2022 genbank)
GCA_025265405.1		 47,540
(38.02 %)		 19,042
(1.52 %)		 20,766
(1.27 %)		 n/a 41.70
(99.97 %)		 97
(0.03 %)		 73
(100.00 %)		 3,964,035
(35.29 %)		 765,957
(8.74 %)		 12,128,162
(41.78 %)		 70,851
(1.80 %)
103 bloodfluke planorb (v1 BB02 2013 refseq)
GCF_000457365.1		 42,216
(5.95 %)		 3,558
(0.29 %)		 24,115
(2.96 %)		 n/a 35.99
(98.05 %)		 76,921
(1.91 %)		 408,322
(98.09 %)		 629,362
(4.20 %)		 749,383
(9.40 %)		 6,932,184
(43.02 %)		 16,970
(0.64 %)
104 bloodfluke planorb (v2 BB02 2013 genbank)
GCA_000457365.2		 n/a 3,378
(0.29 %)		 23,684
(2.94 %)		 n/a 35.99
(98.05 %)		 76,903
(1.91 %)		 406,924
(98.09 %)		 587,583
(3.57 %)		 749,212
(9.41 %)		 6,921,847
(43.04 %)		 16,561
(0.63 %)
105 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 2020)
GCA_009873245.2		 n/a 19,164
(1.81 %)		 20,546
(1.41 %)		 34,210
(1.86 %)		 40.88
(98.91 %)		 936
(1.09 %)		 130
(100.00 %)		 3,999,202
(44.22 %)		 581,540
(1.22 %)		 12,900,977
(34.62 %)		 67,189
(1.73 %)
106 blunt-snouted clingfish (v1 2019 genbank)
GCA_900634775.1		 47,312
(59.52 %)		 14,496
(1.97 %)		 28,873
(5.58 %)		 60,981
(6.13 %)		 38.27
(98.47 %)		 1,160
(1.53 %)		 441
(100.00 %)		 731,730
(4.21 %)		 471,620
(4.92 %)		 5,974,002
(42.88 %)		 29,050
(1.48 %)
107 Bolivian squirrel monkey (100643 v2.0 BCM 2021)
GCF_016699345.1		 53,030
(2.41 %)		 20,599
(1.98 %)		 21,182
(1.34 %)		 46,441
(1.87 %)		 40.95
(99.56 %)		 1,074
(0.44 %)		 2,790
(99.56 %)		 5,098,799
(47.87 %)		 946,231
(3.04 %)		 14,608,771
(36.99 %)		 37,273
(1.03 %)
108 Bolivian squirrel monkey (3227 Broad 2011)
GCF_000235385.1		 39,820
(2.33 %)		 20,222
(2.04 %)		 18,404
(1.34 %)		 49,071
(2.26 %)		 40.77
(94.98 %)		 148,728
(5.04 %)		 151,414
(94.96 %)		 4,710,420
(46.30 %)		 767,602
(1.48 %)		 14,489,703
(32.96 %)		 32,474
(0.75 %)
109 Bornean orangutan (v1 AG05252 alternate hap 2023 genbank)
GCA_028885525.1		 n/a 19,820
(1.76 %)		 20,399
(1.15 %)		 n/a 40.98
(99.88 %)		 36
(0.12 %)		 251
(99.88 %)		 5,232,617
(54.01 %)		 1,003,539
(10.19 %)		 14,858,575
(42.10 %)		 42,467
(1.24 %)
110 Bornean orangutan (v1 AG05252 primary hap 2023 refseq)
GCF_028885625.1		 81,966
(2.93 %)		 20,794
(1.72 %)		 21,307
(1.13 %)		 n/a 41.13
(99.86 %)		 39
(0.14 %)		 1,593
(99.86 %)		 5,651,267
(54.21 %)		 1,155,151
(9.33 %)		 16,242,823
(42.82 %)		 52,294
(2.02 %)
111 boutu (BS63 2019)
GCA_004363515.1		 n/a 21,835
(1.38 %)		 35,087
(1.18 %)		 n/a 42.09
(99.89 %)		 5,072
(0.02 %)		 1,218,682
(99.98 %)		 5,098,108
(45.85 %)		 856,878
(2.32 %)		 13,046,921
(40.74 %)		 63,992
(1.47 %)
112 bowfin (hap1 2024 genbank)
GCA_036373705.1		 n/a 13,851
(1.83 %)		 27,058
(4.43 %)		 n/a 40.75
(100.00 %)		 97
(0.00 %)		 390
(100.00 %)		 953,497
(13.69 %)		 387,700
(7.91 %)		 4,552,410
(37.72 %)		 46,301
(2.99 %)
113 Brazilian free-tailed bat (US034 2019)
GCA_004025005.1		 n/a 23,562
(1.20 %)		 51,200
(1.27 %)		 n/a 42.40
(99.91 %)		 4,243
(0.02 %)		 1,071,858
(99.98 %)		 4,884,584
(32.93 %)		 777,032
(1.49 %)		 14,195,446
(36.38 %)		 89,940
(1.88 %)
114 brown anole (Geneva1000 2022 genbank)
GCA_025583915.1		 38,099
(52.40 %)		 14,028
(1.05 %)		 19,927
(1.81 %)		 n/a 41.14
(98.37 %)		 114,440
(1.64 %)		 3,738
(100.00 %)		 1,376,455
(6.78 %)		 1,094,843
(5.18 %)		 9,127,396
(44.98 %)		 46,291
(1.18 %)
115 brown argus (genbank 2021)
GCA_905147365.1		 23,611
(63.03 %)		 4,734
(1.03 %)		 24,267
(6.80 %)		 24,237
(6.16 %)		 36.86
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 26
(100.00 %)		 264,378
(2.90 %)		 144,255
(3.35 %)		 2,651,028
(48.44 %)		 35,431
(4.56 %)
116 brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v1 2018)
GCF_003584765.1		 53,993
(3.19 %)		 18,811
(1.78 %)		 21,058
(1.52 %)		 39,408
(1.98 %)		 41.84
(99.31 %)		 17,380
(0.70 %)		 21,814
(99.30 %)		 4,283,780
(41.29 %)		 567,588
(1.23 %)		 13,807,277
(30.86 %)		 62,126
(1.80 %)
117 brown bear (v1.0 2022 WashU)
GCF_023065955.1		 60,162
(4.01 %)		 18,920
(1.66 %)		 21,641
(1.49 %)		 n/a 42.51
(100.00 %)		 215
(0.00 %)		 902
(100.00 %)		 4,166,472
(34.00 %)		 659,124
(5.14 %)		 13,282,996
(33.88 %)		 68,113
(2.27 %)
118 brown dog tick (v1 Rsan-2018 2020)
GCF_013339695.1		 39,606
(2.36 %)		 3,965
(0.13 %)		 116,426
(5.96 %)		 45,849
(2.46 %)		 46.86
(99.96 %)		 10,359
(0.04 %)		 2,329
(100.00 %)		 1,064,424
(3.53 %)		 716,579
(3.47 %)		 10,608,171
(42.78 %)		 13,204
(0.97 %)
119 brown headed cowbird (v1.0 BHLD 08-10-18 2020)
GCF_012460135.1		 31,379
(5.19 %)		 12,572
(1.89 %)		 24,442
(2.44 %)		 26,137
(3.13 %)		 42.40
(99.99 %)		 278
(0.01 %)		 691
(99.99 %)		 504,872
(6.53 %)		 420,620
(3.73 %)		 6,496,619
(21.26 %)		 28,576
(2.39 %)
120 brown planthopper (v1 BPH 2020 genbank)
GCA_014356525.1		 36,936
(60.13 %)		 4,416
(0.37 %)		 22,354
(3.57 %)		 37,534
(4.91 %)		 34.69
(99.96 %)		 4,529
(0.04 %)		 7,093
(100.00 %)		 597,351
(3.69 %)		 564,076
(6.64 %)		 6,601,703
(47.48 %)		 39,697
(1.55 %)
121 brown planthopper (v1 BPH 2020 refseq)
GCF_014356525.1		 36,949
(4.89 %)		 4,427
(0.37 %)		 22,417
(3.57 %)		 37,573
(4.91 %)		 34.69
(99.96 %)		 4,529
(0.04 %)		 7,094
(100.00 %)		 597,178
(3.69 %)		 564,092
(6.64 %)		 6,601,918
(47.49 %)		 39,697
(1.55 %)
122 budding yeast C.auris (6684 2015 genbank)
GCA_001189475.1		 n/a 1,948
(12.61 %)		 4,664
(59.90 %)		 n/a 45.12
(98.69 %)		 689
(1.33 %)		 99
(100.00 %)		 3,478
(1.23 %)		 2,281
(0.83 %)		 48,703
(8.19 %)		 1,579
(6.36 %)
123 budding yeast C.auris (B11221 2017 genbank)
GCA_002775015.1		 n/a 2,030
(12.92 %)		 4,702
(58.30 %)		 n/a 45.32
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 20
(100.00 %)		 3,464
(2.27 %)		 2,436
(0.80 %)		 28,524
(6.96 %)		 1,757
(7.37 %)
124 budding yeast C.lusitaniae (ATCC 42720 2009 genbank)
GCA_000003835.1		 n/a 1,956
(12.86 %)		 4,335
(54.85 %)		 n/a 44.50
(99.71 %)		 79
(0.29 %)		 88
(99.71 %)		 2,272
(1.18 %)		 4,036
(1.77 %)		 48,188
(8.66 %)		 1,474
(15.82 %)
125 budding yeast C.oxycetoniae (v1 CBS 10844 2022)
GCF_023343755.1		 4,917
(62.59 %)		 1,845
(11.42 %)		 4,476
(56.70 %)		 n/a 37.84
(99.95 %)		 167
(0.05 %)		 148
(100.00 %)		 14,118
(4.93 %)		 19,713
(8.99 %)		 82,014
(21.64 %)		 201
(0.52 %)
126 budding yeast K.marxianus (DMKU3-1042 2014 genbank)
GCA_001417885.1		 n/a 3,349
(28.79 %)		 4,665
(66.28 %)		 n/a 40.12
(100.00 %)		 n/a 9
(100.00 %)		 7,406
(3.43 %)		 3,781
(1.46 %)		 51,732
(11.80 %)		 742
(4.91 %)
127 budding yeast L.elongisporus (NRRL YB-4239 2007 genbank)
GCA_000149685.1		 n/a 1,905
(9.82 %)		 5,004
(52.37 %)		 n/a 36.94
(99.45 %)		 117
(0.56 %)		 145
(99.44 %)		 30,880
(10.91 %)		 18,155
(4.10 %)		 100,210
(23.18 %)		 22
(0.04 %)
128 budding yeast N.glabratus (CBS 138 2008 genbank)
GCA_000002545.2		 n/a 3,553
(27.93 %)		 4,799
(61.37 %)		 n/a 38.65
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 16
(100.00 %)		 3,047
(1.32 %)		 2,546
(1.58 %)		 59,567
(11.20 %)		 635
(3.11 %)
129 budding yeast Y.lipolytica (CLIB122 2004 genbank)
GCA_000002525.1		 n/a 1,755
(6.59 %)		 4,802
(37.76 %)		 n/a 49.05
(99.99 %)		 28
(0.01 %)		 34
(99.99 %)		 7,553
(2.98 %)		 9,578
(2.12 %)		 81,595
(9.59 %)		 6,216
(33.42 %)
130 budgerigar (maternal Z 2020 genbank)
GCA_012275295.1		 32,026
(47.01 %)		 13,250
(1.87 %)		 23,063
(2.25 %)		 26,324
(3.11 %)		 41.80
(99.72 %)		 284
(0.28 %)		 865
(100.00 %)		 539,059
(10.20 %)		 279,511
(3.12 %)		 5,874,608
(22.08 %)		 21,155
(1.61 %)
131 butterfly L.sinapis (2021 genbank)
GCA_905404315.1		 25,882
(55.17 %)		 4,722
(0.65 %)		 16,896
(3.62 %)		 47,660
(8.03 %)		 35.73
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 50
(100.00 %)		 272,738
(1.92 %)		 98,053
(6.01 %)		 4,662,765
(51.79 %)		 43,150
(4.96 %)
132 butterfly P.napi (v1.1 genbank 2021)
GCA_905475465.1		 n/a 4,588
(1.37 %)		 11,218
(5.90 %)		 42,925
(13.84 %)		 33.95
(100.00 %)		 41
(0.00 %)		 43
(100.00 %)		 143,323
(2.19 %)		 45,473
(3.23 %)		 2,501,939
(42.55 %)		 11,070
(2.07 %)
133 cabbage white (genbank 2021)
GCA_905147795.1		 21,844
(65.09 %)		 4,557
(1.68 %)		 9,253
(6.32 %)		 30,285
(15.57 %)		 33.23
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 40
(100.00 %)		 116,781
(2.12 %)		 30,577
(1.24 %)		 2,300,336
(39.04 %)		 6,783
(2.24 %)
134 California condor (v1 813 2021 genbank)
GCA_018139145.1		 n/a 12,650
(1.75 %)		 21,946
(1.95 %)		 n/a 42.16
(99.97 %)		 632
(0.03 %)		 542
(100.00 %)		 518,393
(6.41 %)		 177,329
(0.88 %)		 7,168,675
(20.31 %)		 34,926
(2.94 %)
135 California sea lion (BS06 2019 Broad)
GCA_004024565.1		 n/a 23,668
(1.61 %)		 29,709
(1.32 %)		 n/a 41.56
(99.92 %)		 10,276
(0.04 %)		 582,272
(99.96 %)		 4,952,087
(44.00 %)		 651,744
(1.26 %)		 13,644,805
(35.79 %)		 62,245
(1.50 %)
136 California sea lion (v1 2019)
GCA_009762305.1		 n/a 21,020
(1.79 %)		 20,045
(1.39 %)		 45,176
(2.15 %)		 41.40
(99.28 %)		 122
(0.72 %)		 43
(100.00 %)		 4,529,949
(43.67 %)		 589,962
(1.24 %)		 13,266,465
(33.77 %)		 51,989
(1.50 %)
137 California two-spot octopus (v1 UCB-OBI-ISO-001 male 2015)
GCF_001194135.1		 26,135
(1.83 %)		 3,125
(0.12 %)		 17,875
(1.29 %)		 27,144
(1.85 %)		 36.03
(84.95 %)		 548,450
(15.13 %)		 700,124
(84.87 %)		 3,498,348
(13.19 %)		 3,005,729
(6.50 %)		 13,687,022
(41.09 %)		 22,984
(0.34 %)
138 Canada lynx (LIC74 v1 2019)
GCF_007474595.1		 50,094
(2.69 %)		 18,283
(1.66 %)		 19,326
(1.35 %)		 38,985
(1.96 %)		 41.70
(99.88 %)		 848
(0.12 %)		 66
(100.00 %)		 5,016,399
(43.75 %)		 904,986
(1.75 %)		 13,476,288
(34.20 %)		 66,822
(2.52 %)
139 Cape golden mole (BS56 2019 Broad)
GCA_004027935.1		 n/a 25,543
(0.55 %)		 52,506
(0.63 %)		 n/a 40.04
(99.84 %)		 4,876
(0.01 %)		 3,432,954
(99.99 %)		 7,363,240
(21.82 %)		 876,677
(2.53 %)		 25,446,677
(58.18 %)		 25,319
(0.31 %)
140 capsicum (Zunla-1 2015 genbank)
GCA_000710875.1		 n/a 16,133
(0.56 %)		 62,445
(2.92 %)		 n/a 34.93
(96.78 %)		 107,172
(3.23 %)		 108,797
(96.77 %)		 1,171,727
(3.54 %)		 948,641
(4.39 %)		 21,533,236
(46.16 %)		 16,621
(0.21 %)
141 Caribbean electric ray (hap1 2024 genbank)
GCA_036971445.1		 n/a 11,967
(0.44 %)		 20,851
(1.23 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 1,443
(0.01 %)		 596
(100.00 %)		 4,902,656
(34.96 %)		 1,040,893
(17.82 %)		 16,403,253
(54.79 %)		 113,936
(1.69 %)
142 carmine bee-eater (2014 BGI)
GCF_000691845.1		 15,520
(2.12 %)		 11,303
(1.45 %)		 24,758
(1.84 %)		 n/a 41.67
(99.59 %)		 50,632
(0.42 %)		 104,131
(99.58 %)		 405,042
(5.66 %)		 161,525
(1.05 %)		 6,445,961
(19.27 %)		 11,477
(0.36 %)
143 cassava (v6 AM560-2 2016 DOE)
GCF_001659605.1		 48,199
(10.95 %)		 18,537
(3.62 %)		 45,536
(13.17 %)		 n/a 35.94
(85.14 %)		 37,896
(14.88 %)		 39,916
(85.12 %)		 295,656
(2.88 %)		 266,527
(3.40 %)		 2,434,269
(42.34 %)		 30,963
(1.41 %)
144 cattle (Hereford 2015)
GCA_000003205.6		 n/a 19,803
(1.54 %)		 21,001
(1.30 %)		 n/a 41.83
(99.57 %)		 41,517
(0.44 %)		 42,578
(99.56 %)		 5,725,274
(49.24 %)		 459,535
(1.33 %)		 12,905,109
(41.11 %)		 43,324
(1.28 %)
145 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.2 2018 USDA)
GCF_002263795.1		 76,369
(2.97 %)		 19,669
(1.56 %)		 21,999
(1.33 %)		 n/a 41.93
(100.00 %)		 386
(0.00 %)		 2,211
(100.00 %)		 5,643,592
(49.67 %)		 545,256
(2.90 %)		 13,085,601
(41.79 %)		 44,357
(1.24 %)
146 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.3 2018 USDA)
GCF_002263795.2		 76,306
(2.98 %)		 19,325
(1.49 %)		 21,665
(1.32 %)		 n/a 41.94
(100.00 %)		 386
(0.00 %)		 1,957
(100.00 %)		 3,550,686
(24.18 %)		 544,595
(2.90 %)		 13,050,221
(41.81 %)		 44,208
(1.24 %)
147 Chacoan peccary (BS18 v1 2019 Broad)
GCA_004024745.1		 n/a 21,372
(1.41 %)		 34,453
(1.31 %)		 n/a 42.35
(99.87 %)		 10,534
(0.04 %)		 1,240,696
(99.96 %)		 5,244,572
(43.13 %)		 2,503,015
(4.45 %)		 12,961,004
(41.69 %)		 173,264
(3.70 %)
148 channel bull blenny (2019 genbank)
GCA_900634415.1		 40,788
(61.50 %)		 14,472
(3.02 %)		 24,012
(6.59 %)		 60,720
(10.43 %)		 40.96
(99.58 %)		 445
(0.42 %)		 322
(100.00 %)		 420,697
(5.49 %)		 320,518
(6.91 %)		 3,394,846
(28.67 %)		 20,453
(1.39 %)
149 channel catfish (USDA103 v1 2016)
GCF_001660625.1		 53,920
(9.58 %)		 15,712
(2.71 %)		 25,639
(5.25 %)		 n/a 39.70
(98.56 %)		 25,203
(1.45 %)		 34,544
(98.55 %)		 871,222
(5.75 %)		 585,250
(4.19 %)		 5,150,651
(33.94 %)		 31,438
(1.87 %)
150 channel catfish (USDA103 v1.2 2019)
GCF_001660625.2		 57,087
(10.27 %)		 16,253
(2.68 %)		 44,936
(5.15 %)		 n/a 39.70
(98.57 %)		 25,285
(1.44 %)		 34,545
(98.61 %)		 900,327
(5.55 %)		 614,695
(4.28 %)		 5,348,266
(33.81 %)		 32,840
(1.87 %)
151 cheetah (AJU 981 2015)
GCA_001443585.1		 n/a 18,264
(1.57 %)		 14,665
(1.26 %)		 n/a 41.30
(98.26 %)		 183,260
(1.77 %)		 14,382
(100.00 %)		 4,777,041
(42.51 %)		 784,368
(1.53 %)		 13,503,827
(31.65 %)		 57,657
(1.31 %)
152 chevron butterflyfish (hap1 2024 genbank)
GCA_039877785.1		 n/a 15,255
(2.94 %)		 48,037
(7.05 %)		 n/a 42.79
(100.00 %)		 49
(0.00 %)		 37
(100.00 %)		 465,710
(3.82 %)		 254,015
(3.62 %)		 3,657,999
(23.28 %)		 30,971
(2.02 %)
153 chicken (Cross of Broiler mother white leghorn layer father 2021)
GCA_016700215.2		 n/a 13,020
(2.33 %)		 23,329
(2.48 %)		 n/a 42.16
(99.57 %)		 409
(0.43 %)		 685
(99.57 %)		 520,941
(5.73 %)		 268,230
(2.28 %)		 5,845,051
(20.93 %)		 24,409
(2.60 %)
154 chimney swift (M959 v1.0 2014)
GCF_000747805.1		 15,979
(2.53 %)		 12,065
(1.82 %)		 10,050
(2.07 %)		 n/a 41.40
(95.99 %)		 65,523
(4.03 %)		 84,595
(95.97 %)		 453,775
(7.30 %)		 194,988
(2.21 %)		 6,363,949
(19.70 %)		 12,486
(0.42 %)
155 chimpanzee (Clint C0471 2018 genbank)
GCA_002880755.3		 n/a 20,378
(1.83 %)		 21,427
(1.19 %)		 n/a 40.71
(98.98 %)		 693
(1.02 %)		 5,037
(98.98 %)		 5,409,980
(53.76 %)		 984,231
(7.31 %)		 15,896,744
(39.56 %)		 45,870
(0.97 %)
156 chimpanzee (v1 AG18354 alternate hap 2023 genbank)
GCA_028858805.1		 n/a 20,001
(1.79 %)		 21,230
(1.19 %)		 n/a 40.62
(99.78 %)		 22
(0.22 %)		 141
(99.78 %)		 5,092,768
(48.83 %)		 946,933
(11.75 %)		 14,844,947
(42.39 %)		 47,662
(1.21 %)
157 chimpanzee (v1 AG18354 primary hap 2023 refseq)
GCF_028858775.1		 111,282
(4.36 %)		 20,990
(1.75 %)		 21,705
(1.15 %)		 n/a 40.94
(99.90 %)		 29
(0.10 %)		 1,500
(99.90 %)		 5,581,205
(50.06 %)		 1,158,792
(10.59 %)		 15,972,274
(43.09 %)		 61,901
(2.29 %)
158 China rose (Old Blush v1 2018)
GCF_002994745.1		 60,293
(11.65 %)		 15,433
(2.84 %)		 67,310
(21.70 %)		 n/a 38.83
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 45
(100.00 %)		 273,992
(2.25 %)		 228,466
(3.97 %)		 2,261,888
(35.14 %)		 37,317
(4.18 %)
159 Chinese hamster (17A/GY CHO 2018)
GCF_003668045.1		 55,529
(3.00 %)		 19,755
(1.76 %)		 20,017
(1.50 %)		 n/a 41.51
(99.88 %)		 4,356
(0.12 %)		 1,830
(100.00 %)		 4,544,603
(29.89 %)		 1,095,407
(2.92 %)		 12,942,232
(32.27 %)		 19,343
(0.58 %)
160 Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male genbank)
GCA_018296145.1		 92,370
(51.48 %)		 27,141
(1.63 %)		 113,328
(4.52 %)		 157,545
(6.65 %)		 43.55
(99.99 %)		 2,333
(0.01 %)		 9,977
(99.99 %)		 4,892,399
(55.31 %)		 2,306,695
(23.48 %)		 10,038,870
(54.55 %)		 62,726
(1.40 %)
161 chub mackerel (primary hap 2022 genbank)
GCA_027409825.1		 34,390
(49.60 %)		 15,350
(2.35 %)		 46,858
(6.07 %)		 n/a 40.01
(99.92 %)		 1,572
(0.08 %)		 361
(100.00 %)		 1,669,327
(28.44 %)		 638,340
(11.55 %)		 4,613,422
(32.38 %)		 16,290
(0.85 %)
162 chuck-will's-widow (BGI_N321 v1 2014)
GCF_000700745.1		 17,196
(2.21 %)		 12,140
(1.50 %)		 25,641
(1.91 %)		 n/a 40.76
(99.61 %)		 56,667
(0.39 %)		 126,789
(99.61 %)		 560,317
(7.62 %)		 203,204
(1.12 %)		 6,593,712
(20.47 %)		 8,105
(0.24 %)
163 chytrid fungus B.dendrobatidis (v1 JAM81 2011)
GCF_000203795.1		 8,677
(50.60 %)		 1,251
(4.00 %)		 7,681
(34.45 %)		 n/a 39.25
(99.25 %)		 383
(0.76 %)		 510
(99.24 %)		 2,585
(1.13 %)		 3,424
(1.20 %)		 81,225
(12.02 %)		 161
(0.21 %)
164 ciliates Oxytricha trifallax (v1 JRB310 2012)
GCA_000295675.1		 n/a 1,065
(1.03 %)		 1,781
(1.87 %)		 n/a 31.32
(99.93 %)		 1,347
(0.00 %)		 23,709
(100.00 %)		 29,228
(1.96 %)		 22,291
(1.48 %)		 550,667
(25.14 %)		 20
(0.01 %)
165 climbing perch (v1.2 2018 genbank)
GCA_900324465.2		 42,746
(63.74 %)		 15,239
(3.53 %)		 39,067
(7.54 %)		 63,908
(10.45 %)		 40.40
(99.35 %)		 266
(0.65 %)		 50
(100.00 %)		 324,479
(2.66 %)		 130,248
(1.89 %)		 3,324,960
(21.31 %)		 10,500
(0.87 %)
166 clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028018385.1		 81,219
(51.66 %)		 18,516
(1.55 %)		 20,363
(1.39 %)		 n/a 41.79
(99.94 %)		 181
(0.06 %)		 34
(100.00 %)		 4,798,634
(33.91 %)		 992,669
(2.08 %)		 13,618,933
(34.42 %)		 67,831
(2.45 %)
167 clouded yellow (genbank 2021)
GCA_905220415.1		 23,070
(64.23 %)		 4,767
(1.38 %)		 15,869
(7.12 %)		 34,699
(13.48 %)		 33.59
(100.00 %)		 9
(0.00 %)		 33
(100.00 %)		 161,872
(2.42 %)		 73,892
(2.86 %)		 2,544,844
(42.14 %)		 15,663
(2.98 %)
168 coho salmon (150728-3 2017)
GCF_002021735.1		 64,032
(4.29 %)		 24,727
(1.43 %)		 46,926
(3.38 %)		 n/a 43.33
(95.39 %)		 265,291
(4.63 %)		 22,810
(99.99 %)		 1,185,308
(5.22 %)		 2,455,045
(15.99 %)		 11,710,855
(46.53 %)		 72,061
(1.46 %)
169 common bottlenose dolphin (maternal Y genbank 2020)
GCA_011762595.1		 67,207
(45.84 %)		 18,772
(1.77 %)		 20,527
(1.42 %)		 35,815
(1.58 %)		 41.44
(99.74 %)		 674
(0.26 %)		 362
(100.00 %)		 4,067,521
(46.14 %)		 628,982
(2.12 %)		 12,490,896
(35.29 %)		 65,551
(1.90 %)
170 common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 genbank)
GCA_001922835.1		 45,962
(43.27 %)		 17,254
(1.68 %)		 17,112
(1.34 %)		 n/a 40.85
(99.45 %)		 114,003
(0.57 %)		 2,647
(100.00 %)		 3,845,214
(43.88 %)		 514,631
(1.06 %)		 12,317,013
(32.18 %)		 48,030
(1.35 %)
171 common brushtail (genbank 2020)
GCA_011100635.1		 37,661
(35.20 %)		 18,681
(0.81 %)		 15,375
(0.86 %)		 n/a 39.48
(99.44 %)		 1,796
(0.56 %)		 212
(100.00 %)		 7,598,697
(38.92 %)		 1,259,434
(1.97 %)		 22,071,301
(40.56 %)		 17,762
(0.38 %)
172 common buzzard (bButBut1.hap1.1 2024 genbank)
GCA_964188355.1		 n/a 13,512
(1.75 %)		 24,417
(2.13 %)		 n/a 43.17
(99.99 %)		 471
(0.01 %)		 546
(100.00 %)		 439,018
(4.62 %)		 244,865
(6.73 %)		 6,778,625
(23.94 %)		 43,400
(4.80 %)
173 common carp (2014)
GCF_000951615.1		 75,414
(5.81 %)		 27,632
(2.17 %)		 59,950
(5.28 %)		 n/a 37.00
(97.48 %)		 57,940
(2.53 %)		 9,378
(100.00 %)		 1,460,282
(5.17 %)		 987,356
(7.88 %)		 9,900,821
(37.41 %)		 48,702
(1.38 %)
174 common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 genbank)
GCA_017976375.1		 50,206
(57.28 %)		 13,179
(1.84 %)		 25,859
(2.41 %)		 n/a 42.18
(99.58 %)		 296
(0.42 %)		 151
(100.00 %)		 521,043
(9.61 %)		 310,469
(2.36 %)		 6,712,849
(21.76 %)		 25,267
(1.71 %)
175 common cuckoo (BGI 2014)
GCF_000709325.1		 16,827
(2.53 %)		 12,599
(1.80 %)		 12,623
(2.28 %)		 n/a 41.52
(97.64 %)		 56,977
(2.38 %)		 71,907
(97.62 %)		 418,870
(8.06 %)		 192,437
(2.08 %)		 6,576,259
(19.85 %)		 18,002
(0.74 %)
176 common house spider (v2 Geottingen 2017)
GCF_000365465.2		 30,064
(3.79 %)		 3,347
(0.23 %)		 7,571
(1.48 %)		 n/a 29.46
(81.63 %)		 247,378
(18.44 %)		 263,908
(81.56 %)		 587,943
(2.23 %)		 464,643
(2.90 %)		 10,795,253
(40.31 %)		 10,480
(0.23 %)
177 common house spider (v3 Goettingen 2019 genbank)
GCA_000365465.3		 37,121
(48.05 %)		 3,276
(0.22 %)		 9,098
(1.38 %)		 38,273
(4.24 %)		 29.40
(98.45 %)		 124,228
(1.55 %)		 84,235
(98.46 %)		 637,694
(2.45 %)		 527,781
(4.43 %)		 11,553,196
(51.16 %)		 11,998
(0.33 %)
178 common limpet (v1 primary hap 2022)
GCF_932274485.1		 41,888
(9.21 %)		 3,611
(0.43 %)		 13,244
(4.58 %)		 44,721
(6.30 %)		 36.11
(100.00 %)		 75
(0.00 %)		 13
(100.00 %)		 239,042
(1.40 %)		 359,961
(7.89 %)		 4,399,053
(45.69 %)		 33,411
(1.94 %)
179 common sole (primary hap 2023 genbank)
GCA_958295425.1		 55,359
(63.58 %)		 14,846
(2.94 %)		 42,832
(6.93 %)		 n/a 40.87
(99.99 %)		 373
(0.01 %)		 243
(100.00 %)		 1,149,249
(19.12 %)		 342,239
(9.71 %)		 3,906,839
(32.84 %)		 27,772
(2.71 %)
180 common swift (bApuApu2 2021 genbank)
GCA_020740795.1		 39,986
(53.94 %)		 12,277
(1.88 %)		 20,379
(2.16 %)		 n/a 41.95
(99.84 %)		 256
(0.16 %)		 109
(100.00 %)		 533,758
(8.66 %)		 199,748
(1.12 %)		 6,353,957
(21.19 %)		 20,393
(1.74 %)
181 common vampire bat (v1 HL8 alternate hap 2022 genbank)
GCA_022682395.1		 n/a 17,520
(1.75 %)		 18,995
(1.67 %)		 n/a 42.89
(99.99 %)		 580
(0.01 %)		 430
(100.00 %)		 2,597,497
(28.17 %)		 356,620
(2.88 %)		 10,797,225
(31.23 %)		 61,931
(2.30 %)
182 common vampire bat (v1 HL8 primary hap 2022 genbank)
GCA_022682495.1		 58,054
(45.51 %)		 18,280
(1.71 %)		 19,514
(1.59 %)		 n/a 42.98
(99.99 %)		 611
(0.01 %)		 572
(100.00 %)		 2,761,820
(28.38 %)		 427,940
(3.89 %)		 11,250,492
(32.57 %)		 70,700
(2.48 %)
183 common vampire bat (v1 HL8 primary hap 2022 refseq)
GCF_022682495.1		 58,067
(3.40 %)		 18,280
(1.71 %)		 19,515
(1.59 %)		 n/a 42.98
(99.99 %)		 611
(0.01 %)		 573
(100.00 %)		 2,761,826
(28.38 %)		 427,942
(3.89 %)		 11,250,529
(32.57 %)		 70,701
(2.48 %)
184 common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 genbank)
GCA_002940915.2		 n/a 18,511
(1.87 %)		 18,170
(1.68 %)		 n/a 42.15
(97.78 %)		 54,308
(2.23 %)		 84,108
(97.77 %)		 2,860,991
(29.93 %)		 275,245
(1.03 %)		 11,798,152
(28.19 %)		 51,833
(1.38 %)
185 common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 refseq)
GCF_002940915.1		 51,047
(3.24 %)		 18,506
(1.88 %)		 18,166
(1.68 %)		 n/a 42.15
(97.78 %)		 54,308
(2.23 %)		 84,109
(97.77 %)		 2,861,697
(29.93 %)		 275,247
(1.03 %)		 11,798,198
(28.19 %)		 51,834
(1.38 %)
186 common vampire bat (v2 HL8 primary hap 2022 genbank)
GCA_022682495.2		 n/a 18,311
(1.71 %)		 19,456
(1.59 %)		 n/a 42.99
(99.99 %)		 615
(0.01 %)		 573
(100.00 %)		 2,767,071
(28.35 %)		 431,575
(3.90 %)		 11,286,853
(32.63 %)		 71,506
(2.50 %)
187 Coquerel's sifaka 6110/Marcella (2015 genbank)
GCA_000956105.1		 29,369
(33.72 %)		 19,335
(2.10 %)		 21,769
(1.63 %)		 n/a 41.24
(74.51 %)		 276,544
(25.53 %)		 299,069
(74.47 %)		 3,513,698
(39.82 %)		 304,033
(0.59 %)		 13,333,842
(21.06 %)		 56,694
(1.59 %)
188 cork oak (v1 HL8 2018)
GCF_002906115.1		 65,969
(8.84 %)		 20,226
(1.95 %)		 89,703
(16.66 %)		 n/a 36.19
(97.99 %)		 26,139
(2.01 %)		 23,344
(100.00 %)		 865,884
(3.63 %)		 491,126
(5.95 %)		 6,119,503
(36.10 %)		 21,505
(3.50 %)
189 corroboree frog (hap2 2023 genbank)
GCA_028390025.1		 n/a n/a 54,346
(1.07 %)		 n/a 45.66
(99.76 %)		 2,699
(0.24 %)		 3,127
(100.00 %)		 18,782,633
(75.22 %)		 5,902,115
(18.63 %)		 5,826
(99.76 %)		 990,274
(4.84 %)
190 Cory's shearwater (hap1.1 2024)
GCA_964195595.1		 n/a 13,703
(1.71 %)		 26,310
(2.10 %)		 n/a 43.29
(99.99 %)		 525
(0.01 %)		 414
(100.00 %)		 479,045
(5.03 %)		 336,466
(4.95 %)		 5,910,298
(24.89 %)		 48,046
(4.19 %)
191 Cory's shearwater (hap2.1 2024)
GCA_964196065.1		 n/a 12,750
(1.85 %)		 23,191
(2.16 %)		 n/a 43.03
(99.99 %)		 477
(0.01 %)		 726
(99.99 %)		 403,846
(4.59 %)		 252,125
(3.30 %)		 6,206,493
(22.07 %)		 41,821
(4.50 %)
192 cotton bollworm (Harm_GR_Male_#8 2017 genbank)
GCA_002156985.1		 21,972
(59.55 %)		 4,839
(1.54 %)		 21,045
(8.01 %)		 n/a 36.13
(89.02 %)		 26,910
(11.01 %)		 24,551
(88.99 %)		 115,046
(2.97 %)		 31,900
(0.85 %)		 2,230,382
(25.45 %)		 15,851
(2.18 %)
193 cowpea (IT97K-499-35 v1 2019)
GCF_004118075.1		 48,678
(10.56 %)		 16,927
(3.30 %)		 44,814
(13.06 %)		 54,348
(11.30 %)		 32.98
(99.48 %)		 68
(0.52 %)		 682
(100.00 %)		 352,238
(4.22 %)		 283,949
(8.14 %)		 3,092,021
(41.64 %)		 24,513
(2.40 %)
194 crab-eating macaque (v1 582-1 2024)
GCF_037993035.1		 100,896
(3.93 %)		 20,528
(1.79 %)		 21,741
(1.19 %)		 n/a 41.05
(100.00 %)		 n/a 21
(100.00 %)		 5,357,498
(52.90 %)		 1,017,190
(8.58 %)		 15,617,344
(40.74 %)		 94,759
(1.56 %)
195 crab-eating macaque WashU 2013 genbank
GCA_000364345.1		 76,183
(45.03 %)		 20,283
(1.90 %)		 20,544
(1.22 %)		 n/a 40.90
(95.16 %)		 80,474
(4.85 %)		 87,763
(95.15 %)		 5,351,207
(51.35 %)		 941,514
(3.24 %)		 15,778,449
(35.74 %)		 76,963
(1.14 %)
196 crab-eating macaque WashU 2013 refseq
GCF_000364345.1		 76,196
(3.30 %)		 20,209
(1.91 %)		 51,427
(6.84 %)		 n/a 40.90
(95.16 %)		 80,474
(4.85 %)		 87,764
(95.15 %)		 5,251,819
(50.85 %)		 941,514
(3.24 %)		 15,778,510
(35.74 %)		 76,963
(1.14 %)
197 crucian carp (primary hap 2023 genbank)
GCA_963082965.1		 90,094
(55.93 %)		 29,389
(2.81 %)		 88,291
(5.37 %)		 n/a 38.31
(99.99 %)		 832
(0.01 %)		 278
(100.00 %)		 3,481,389
(45.81 %)		 802,775
(6.54 %)		 8,190,816
(44.41 %)		 83,696
(3.82 %)
198 crustacean D.carinata (v1 CSIRO-1 2022)
GCF_022539665.1		 22,915
(28.69 %)		 3,621
(2.94 %)		 11,430
(17.96 %)		 n/a 40.34
(99.47 %)		 2
(0.53 %)		 227
(100.00 %)		 81,008
(2.67 %)		 29,625
(4.98 %)		 609,395
(25.66 %)		 6,559
(5.05 %)
199 crustacean D.magna (SK Sungkyunkwan U. 2019 genbank)
GCA_003990815.1		 n/a 3,519
(2.64 %)		 12,174
(17.22 %)		 n/a 40.54
(93.29 %)		 13,228
(6.75 %)		 4,192
(100.00 %)		 63,254
(2.07 %)		 22,325
(1.44 %)		 728,942
(20.81 %)		 8,375
(4.98 %)
200 crustacean P.pollicipes (v2 AB1234 2020)
GCF_011947565.2		 30,025
(5.21 %)		 3,968
(0.39 %)		 56,084
(8.02 %)		 32,834
(5.48 %)		 52.34
(98.93 %)		 10,786
(1.08 %)		 1,254
(100.00 %)		 361,409
(3.23 %)		 533,046
(8.92 %)		 3,456,307
(19.29 %)		 6,722
(54.88 %)
201 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 genbank)
GCA_021462225.2		 n/a 15,131
(1.68 %)		 50,084
(4.18 %)		 n/a 40.18
(99.46 %)		 409
(0.54 %)		 73
(100.00 %)		 2,175,293
(47.80 %)		 176,956
(1.87 %)		 6,142,692
(38.35 %)		 32,973
(1.28 %)
202 Daubenton's bat (primary hap 2023 genbank)
GCA_963259705.1		 64,558
(45.64 %)		 19,142
(1.72 %)		 22,139
(1.66 %)		 n/a 43.18
(99.99 %)		 1,099
(0.01 %)		 122
(100.00 %)		 3,040,239
(24.03 %)		 796,913
(6.38 %)		 10,478,261
(38.84 %)		 64,921
(2.50 %)
203 degu (3935 2012 genbank)
GCA_000260255.1		 48,152
(35.39 %)		 22,240
(1.40 %)		 22,108
(1.46 %)		 n/a 41.38
(84.36 %)		 252,770
(15.68 %)		 259,903
(84.32 %)		 4,890,270
(27.82 %)		 898,943
(1.50 %)		 14,281,942
(29.30 %)		 40,135
(0.82 %)
204 diamondback terrapin (hap1 2023 genbank)
GCA_027887155.1		 50,318
(52.07 %)		 15,109
(1.08 %)		 19,281
(1.62 %)		 n/a 44.46
(99.92 %)		 141
(0.08 %)		 76
(100.00 %)		 4,088,064
(46.33 %)		 403,943
(1.72 %)		 11,014,504
(33.74 %)		 110,838
(2.71 %)
205 diplomonads (v1 WB C6 WB C6 2008)
GCF_000002435.1		 6,502
(71.82 %)		 251
(1.29 %)		 2,079
(62.62 %)		 n/a 49.25
(99.82 %)		 242
(0.19 %)		 306
(99.81 %)		 697
(1.34 %)		 335
(0.65 %)		 20,634
(5.24 %)		 2,275
(23.86 %)
206 dog (BS72 2019 Broad)
GCA_004027395.1		 n/a 22,343
(1.53 %)		 28,525
(1.27 %)		 n/a 41.66
(99.91 %)		 10,428
(0.04 %)		 667,170
(99.96 %)		 5,598,608
(45.38 %)		 1,220,686
(2.58 %)		 14,079,363
(36.37 %)		 62,881
(2.13 %)
207 domestic ferret (Sable ID 1420 FGSC 2011)
GCF_000215625.1		 55,980
(3.39 %)		 18,440
(1.59 %)		 19,474
(1.48 %)		 n/a 41.47
(94.51 %)		 109,700
(5.51 %)		 117,442
(94.49 %)		 n/a 606,818
(1.04 %)		 13,503,550
(29.63 %)		 53,376
(1.90 %)
208 domestic guinea pig (2N 2008 genbank)
GCA_000151735.1		 44,762
(33.07 %)		 18,297
(1.33 %)		 20,107
(1.34 %)		 n/a 39.95
(97.81 %)		 58,460
(2.20 %)		 61,603
(97.80 %)		 4,257,412
(38.85 %)		 658,532
(1.25 %)		 14,547,631
(34.19 %)		 37,092
(0.85 %)
209 domestic silkworm (genbank 2020)
GCA_014905235.2		 n/a 5,227
(1.28 %)		 18,795
(5.67 %)		 n/a 38.55
(99.90 %)		 30
(0.10 %)		 696
(100.00 %)		 615,428
(29.26 %)		 86,179
(1.65 %)		 2,607,325
(47.66 %)		 44,022
(10.06 %)
210 domesticated barley (H.vulgare 2021 genbank)
GCA_904849725.1		 63,294
(3.74 %)		 18,050
(0.43 %)		 260,902
(9.04 %)		 n/a 44.46
(99.97 %)		 162
(0.03 %)		 290
(100.00 %)		 1,274,894
(2.42 %)		 1,726,303
(5.40 %)		 14,010,542
(72.58 %)		 732,828
(17.24 %)
211 dorado (hap2 2023 genbank)
GCA_030463535.1		 n/a 16,799
(2.11 %)		 50,411
(4.67 %)		 n/a 41.29
(99.15 %)		 726
(0.85 %)		 104
(100.00 %)		 2,693,928
(34.60 %)		 805,807
(14.65 %)		 5,615,731
(36.69 %)		 30,083
(1.31 %)
212 downy mildews (GKB4 2021 genbank)
GCA_018691715.1		 n/a 1,641
(1.07 %)		 33,976
(44.50 %)		 n/a 54.16
(99.69 %)		 80
(0.31 %)		 133
(100.00 %)		 18,997
(0.80 %)		 16,094
(2.84 %)		 200,994
(27.68 %)		 232
(99.71 %)
213 downy woodpecker (bDryPub1 primary hap 2020)
GCA_014839835.1		 25,483
(48.39 %)		 12,405
(1.70 %)		 23,073
(2.18 %)		 n/a 45.31
(99.66 %)		 187
(0.34 %)		 181
(100.00 %)		 1,008,118
(21.51 %)		 378,537
(3.38 %)		 5,846,717
(32.04 %)		 26,005
(1.75 %)
214 downy woodpecker (BGI 2014)
GCF_000699005.1		 15,850
(2.33 %)		 11,864
(1.67 %)		 11,795
(1.99 %)		 n/a 44.51
(96.31 %)		 96,471
(3.72 %)		 127,725
(96.28 %)		 842,281
(18.63 %)		 310,018
(2.09 %)		 5,822,687
(27.83 %)		 17,379
(0.69 %)
215 E. coli (K-12 BW25113 2014 genbank)
GCA_000750555.1		 n/a n/a n/a n/a 50.78
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 n/a 90
(0.38 %)		 19,508
(7.44 %)		 1
(99.99 %)
216 East African water lily (v1 Beijing-Zhang1983 2019)
GCF_008831285.1		 39,088
(10.61 %)		 11,569
(2.49 %)		 38,114
(15.67 %)		 n/a 38.59
(99.98 %)		 627
(0.02 %)		 1,425
(99.98 %)		 230,165
(2.88 %)		 153,929
(4.02 %)		 2,160,647
(26.81 %)		 24,567
(4.41 %)
217 eastern European house mouse (PWK_PhJ v1 2016)
GCA_001624775.1		 n/a 21,013
(2.21 %)		 18,237
(1.40 %)		 101,394
(4.09 %)		 41.76
(90.89 %)		 904,107
(9.24 %)		 30,233
(98.34 %)		 5,250,349
(40.55 %)		 1,508,787
(2.97 %)		 13,823,341
(28.09 %)		 16,695
(0.43 %)
218 eastern happy (v2 2018)
GCF_900246225.1		 57,628
(9.59 %)		 15,348
(2.22 %)		 28,518
(6.29 %)		 42,170
(8.31 %)		 41.07
(99.87 %)		 490
(0.13 %)		 364
(100.00 %)		 527,486
(5.98 %)		 217,915
(1.89 %)		 4,547,443
(30.78 %)		 33,005
(1.88 %)
219 Egyptian rousette (US006 2019 Broad)
GCA_004024865.1		 n/a 20,133
(1.87 %)		 36,361
(1.80 %)		 n/a 40.23
(99.96 %)		 4,332
(0.02 %)		 226,086
(99.98 %)		 2,985,622
(32.66 %)		 475,311
(1.11 %)		 12,612,081
(27.34 %)		 81,930
(5.75 %)
220 Egyptian rousette (v1 2020 genbank)
GCA_014176215.1		 65,163
(51.34 %)		 17,637
(2.08 %)		 22,318
(1.84 %)		 n/a 40.05
(98.59 %)		 242
(1.41 %)		 30
(100.00 %)		 2,821,248
(33.05 %)		 434,415
(1.02 %)		 12,031,652
(26.52 %)		 53,604
(6.69 %)
221 electric eel (primary hap 2020 genbank)
GCA_013358815.1		 n/a 15,954
(3.67 %)		 48,976
(7.25 %)		 n/a 42.49
(98.20 %)		 227
(1.80 %)		 90
(100.00 %)		 567,621
(7.41 %)		 564,288
(10.86 %)		 2,935,361
(24.79 %)		 44,501
(3.93 %)
222 elephant shark (2013)
GCF_000165045.1		 30,695
(4.95 %)		 11,306
(1.54 %)		 18,189
(3.03 %)		 n/a 42.34
(96.16 %)		 46,232
(3.85 %)		 67,421
(96.15 %)		 1,405,480
(27.29 %)		 330,698
(2.60 %)		 5,549,534
(36.65 %)		 35,561
(2.16 %)
223 emu (v1 ZJU1.0 2020)
GCA_016128335.1		 n/a 13,181
(1.74 %)		 24,708
(2.10 %)		 33,433
(3.99 %)		 42.41
(100.00 %)		 512
(0.00 %)		 802
(100.00 %)		 504,527
(4.38 %)		 259,276
(2.59 %)		 7,105,965
(19.15 %)		 41,784
(5.52 %)
224 epaulette shark (2021 genbank)
GCA_020745735.1		 43,156
(39.58 %)		 12,439
(0.39 %)		 19,520
(1.06 %)		 n/a 42.76
(98.05 %)		 3,716
(1.95 %)		 1,963
(100.00 %)		 9,211,963
(69.93 %)		 935,037
(6.51 %)		 20,660,613
(43.88 %)		 41,682
(1.08 %)
225 Euphrates poplar (v1 2014)
GCF_000495115.1		 56,539
(12.93 %)		 20,844
(4.28 %)		 41,664
(12.47 %)		 n/a 32.08
(95.31 %)		 23,174
(4.71 %)		 32,789
(95.29 %)		 332,532
(5.23 %)		 246,766
(4.06 %)		 2,679,673
(43.30 %)		 2,781
(0.47 %)
226 Eurasian badger (v3.1 2021)
GCF_922984935.1		 57,151
(2.48 %)		 19,265
(1.40 %)		 22,121
(1.36 %)		 n/a 42.48
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 538
(100.00 %)		 4,487,951
(32.73 %)		 821,664
(4.02 %)		 13,814,723
(38.08 %)		 66,524
(3.95 %)
227 Eurasian red squirrel (v1.1 2019)
GCA_902686455.1		 n/a 21,298
(1.58 %)		 21,024
(1.36 %)		 36,645
(1.54 %)		 40.08
(94.33 %)		 1,177
(5.67 %)		 638
(100.00 %)		 4,680,964
(35.76 %)		 704,218
(1.42 %)		 14,991,981
(31.49 %)		 48,159
(1.04 %)
228 Eurasian water vole (v1 2020)
GCF_903992535.1		 45,658
(2.52 %)		 19,724
(1.77 %)		 19,069
(1.47 %)		 34,561
(2.01 %)		 42.15
(99.74 %)		 872
(0.26 %)		 216
(100.00 %)		 4,098,151
(26.75 %)		 1,088,237
(2.91 %)		 12,853,776
(32.42 %)		 19,000
(0.58 %)
229 European conger (primary hap 2023 genbank)
GCA_963514075.1		 54,631
(54.17 %)		 17,073
(1.89 %)		 34,794
(5.07 %)		 n/a 43.89
(99.98 %)		 1,009
(0.02 %)		 394
(100.00 %)		 761,527
(5.99 %)		 913,328
(13.25 %)		 5,768,003
(35.48 %)		 120,990
(6.12 %)
230 European eel (primary hap 2020 genbank)
GCA_013347855.1		 n/a 17,048
(2.22 %)		 34,271
(5.56 %)		 n/a 43.64
(99.61 %)		 640
(0.40 %)		 53
(100.00 %)		 831,037
(5.48 %)		 786,520
(8.15 %)		 5,700,818
(27.40 %)		 130,345
(8.19 %)
231 European mink (primary hap 2023 genbank)
GCA_030435805.1		 69,556
(45.15 %)		 18,706
(1.46 %)		 21,193
(1.37 %)		 n/a 41.85
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 26
(100.00 %)		 4,237,797
(30.90 %)		 792,898
(2.69 %)		 13,417,248
(36.59 %)		 67,133
(2.54 %)
232 European peacock (2021 genbank)
GCA_905147045.1		 22,557
(62.12 %)		 4,716
(1.16 %)		 12,599
(4.34 %)		 26,251
(7.81 %)		 33.70
(100.00 %)		 10
(0.00 %)		 42
(100.00 %)		 212,528
(2.58 %)		 60,682
(1.18 %)		 3,127,157
(46.89 %)		 24,620
(4.88 %)
233 European plaice (primary hap 2022 genbank)
GCA_947347685.1		 46,467
(52.27 %)		 14,820
(2.71 %)		 51,453
(7.41 %)		 n/a 42.51
(99.97 %)		 1,072
(0.03 %)		 356
(100.00 %)		 476,317
(3.63 %)		 520,730
(13.27 %)		 3,283,400
(33.55 %)		 47,051
(4.45 %)
234 European snow vole (primary hap 2023 genbank)
GCA_950005125.1		 47,025
(39.90 %)		 20,576
(1.75 %)		 21,171
(1.56 %)		 n/a 41.98
(100.00 %)		 197
(0.00 %)		 161
(100.00 %)		 3,580,811
(22.71 %)		 998,537
(5.14 %)		 12,204,125
(34.97 %)		 20,725
(0.63 %)
235 European turtle dove (v1.1 alternate hap 2019)
GCA_901699165.1		 n/a 11,276
(1.79 %)		 21,238
(2.15 %)		 n/a 41.73
(100.00 %)		 n/a 3,333
(100.00 %)		 466,567
(7.08 %)		 182,345
(0.97 %)		 6,037,183
(20.24 %)		 29,648
(2.35 %)
236 European turtle dove (v1.1 primary hap 2019)
GCA_901699155.1		 n/a 12,415
(1.77 %)		 23,484
(2.17 %)		 n/a 41.84
(99.67 %)		 894
(0.33 %)		 357
(100.00 %)		 539,737
(7.60 %)		 227,500
(1.16 %)		 6,768,805
(21.05 %)		 34,729
(2.65 %)
237 European woodmouse (2022 genbank)
GCA_947179515.1		 54,113
(34.13 %)		 19,960
(1.65 %)		 19,954
(1.25 %)		 n/a 41.23
(99.99 %)		 1,129
(0.01 %)		 498
(100.00 %)		 4,863,656
(37.41 %)		 1,795,997
(8.95 %)		 13,681,786
(40.58 %)		 23,961
(0.53 %)
238 fall armyworm (Faw-zju 2020 genbank)
GCA_011064685.1		 32,738
(63.63 %)		 5,744
(1.12 %)		 26,631
(7.08 %)		 n/a 36.43
(99.99 %)		 525
(0.01 %)		 91
(100.00 %)		 168,479
(1.60 %)		 72,876
(1.70 %)		 3,384,083
(37.35 %)		 30,753
(4.27 %)
239 fall armyworm (Faw-zju v1.0 refseq 2020)
GCF_011064685.1		 32,751
(9.65 %)		 5,744
(1.12 %)		 26,632
(7.08 %)		 n/a 36.43
(99.99 %)		 525
(0.01 %)		 92
(100.00 %)		 169,122
(1.61 %)		 72,892
(1.70 %)		 3,384,365
(37.36 %)		 30,753
(4.27 %)
240 fire-bellied toad (primary hap 2023 genbank)
GCA_027579735.1		 n/a 15,456
(0.21 %)		 47,501
(0.88 %)		 n/a 38.98
(98.02 %)		 7,009
(1.99 %)		 2,468
(100.00 %)		 20,643,710
(70.75 %)		 7,150,262
(12.27 %)		 9,477
(98.01 %)		 365,066
(1.20 %)
241 fission yeast (v1 972h- 2007 refseq)
GCF_000002945.1		 12,393
(87.51 %)		 5,085
(73.29 %)		 3,403
(39.29 %)		 n/a 36.05
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 4
(100.00 %)		 3,336
(2.63 %)		 1,034
(0.58 %)		 80,458
(16.22 %)		 105
(0.31 %)
242 fission yeast (v2 972h- 2019 genbank)
GCA_000002945.3		 n/a 5,084
(73.46 %)		 3,394
(39.28 %)		 n/a 36.06
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 9
(100.00 %)		 3,053
(1.03 %)		 1,034
(0.58 %)		 79,714
(16.06 %)		 105
(0.31 %)
243 flatback sea turtle (hap1 2025 genbank)
GCA_965152275.1		 n/a 15,046
(1.09 %)		 18,089
(1.57 %)		 n/a 44.23
(100.00 %)		 171
(0.00 %)		 43
(100.00 %)		 4,516,775
(43.62 %)		 319,645
(1.38 %)		 10,785,223
(32.95 %)		 52,168
(1.81 %)
244 flatworm S.haematobium (v2 2020)
GCF_000699445.2		 8,934
(5.16 %)		 1,548
(0.29 %)		 4,070
(2.36 %)		 8,934
(5.16 %)		 34.53
(99.76 %)		 15,128
(0.26 %)		 666
(100.00 %)		 124,259
(1.58 %)		 35,312
(1.17 %)		 2,638,150
(34.10 %)		 3,957
(0.38 %)
245 flier cichlid (MPI-CPG 2019 genbank)
GCA_007364275.2		 n/a 15,436
(2.15 %)		 26,448
(5.90 %)		 64,657
(6.60 %)		 41.23
(98.19 %)		 744
(1.81 %)		 189
(100.00 %)		 1,014,141
(16.95 %)		 287,037
(2.21 %)		 5,305,987
(30.67 %)		 24,130
(1.26 %)
246 Florida manatee (Lorelei 2012 genbank)
GCA_000243295.1		 39,651
(35.92 %)		 18,302
(1.36 %)		 20,592
(1.23 %)		 32,831
(1.38 %)		 40.73
(89.24 %)		 160,167
(10.78 %)		 166,489
(89.22 %)		 5,109,822
(37.03 %)		 389,314
(0.74 %)		 14,633,007
(38.46 %)		 27,461
(0.64 %)
247 fly D.albomicans (v1 15112-1751.03 2019)
GCF_009650485.1		 24,196
(18.66 %)		 10,065
(8.48 %)		 14,473
(13.61 %)		 n/a 38.15
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 11
(100.00 %)		 298,709
(14.86 %)		 80,048
(3.56 %)		 1,317,733
(33.56 %)		 18,849
(8.62 %)
248 fly D.santomea (v1.0 2021)
GCF_016746245.1		 25,550
(21.64 %)		 13,354
(17.52 %)		 20,540
(17.87 %)		 n/a 42.61
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 104
(100.00 %)		 169,365
(23.08 %)		 64,316
(3.47 %)		 791,743
(23.14 %)		 27,794
(16.15 %)
249 fly D.sechellia (sech25 v1 2019 UC Irvine)
GCF_004382195.1		 26,658
(22.06 %)		 13,461
(17.65 %)		 21,781
(17.83 %)		 n/a 42.26
(100.00 %)		 38
(0.00 %)		 402
(100.00 %)		 145,818
(25.16 %)		 34,869
(4.31 %)		 719,811
(25.74 %)		 30,130
(16.11 %)
250 fly D.serrata (v1.0 Fors4 2017)
GCF_002093755.1		 21,759
(15.21 %)		 12,488
(9.92 %)		 21,269
(14.06 %)		 n/a 39.11
(100.00 %)		 n/a 1,356
(100.00 %)		 314,594
(25.90 %)		 82,446
(12.33 %)		 1,113,448
(37.00 %)		 27,493
(12.03 %)
251 fly D.simulans (w501 v3.0 2021)
GCF_016746395.1		 28,582
(26.45 %)		 13,448
(20.44 %)		 18,989
(18.34 %)		 n/a 42.47
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 96
(100.00 %)		 126,424
(16.72 %)		 32,595
(4.31 %)		 759,296
(23.70 %)		 27,530
(17.02 %)
252 fly D.yakuba (2018)
GCF_000005975.2		 5,431
(4.09 %)		 13,713
(15.95 %)		 22,613
(16.71 %)		 n/a 42.28
(98.12 %)		 5,400
(1.88 %)		 13,440
(98.12 %)		 180,908
(22.48 %)		 68,911
(3.75 %)		 897,353
(23.94 %)		 31,387
(14.91 %)
253 fly D.yakuba (v1 2021)
GCF_016746365.1		 27,925
(24.59 %)		 13,343
(17.86 %)		 20,029
(17.64 %)		 n/a 42.55
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 54
(100.00 %)		 169,559
(23.47 %)		 60,591
(3.64 %)		 837,616
(23.40 %)		 28,204
(16.22 %)
254 Gaboon caecilian (v1.1 2019 genbank)
GCA_902459505.1		 54,713
(61.19 %)		 14,267
(0.51 %)		 29,026
(1.40 %)		 n/a 43.24
(99.85 %)		 433
(0.15 %)		 163
(100.00 %)		 1,311,113
(1.64 %)		 1,364,596
(3.83 %)		 19,589,738
(52.85 %)		 270,923
(4.52 %)
255 giant manta (hap1 2023 genbank)
GCA_030028105.1		 n/a 12,432
(0.38 %)		 24,821
(1.16 %)		 n/a 43.26
(99.23 %)		 1,810
(0.77 %)		 4,715
(100.00 %)		 7,913,208
(49.68 %)		 969,352
(14.22 %)		 20,235,210
(54.42 %)		 110,678
(1.74 %)
256 giant panda (2009 BGI)
GCF_000004335.2		 40,432
(2.55 %)		 18,884
(1.76 %)		 18,919
(1.46 %)		 n/a 41.60
(97.66 %)		 119,126
(2.36 %)		 200,593
(97.64 %)		 4,236,423
(40.48 %)		 503,179
(1.10 %)		 13,781,487
(28.85 %)		 53,465
(1.34 %)
257 giant panda (Jingjing v1 2017)
GCA_002007445.1		 n/a 20,110
(1.71 %)		 22,288
(1.49 %)		 n/a 41.69
(98.08 %)		 186,846
(1.93 %)		 244,258
(98.07 %)		 4,464,041
(41.66 %)		 614,896
(2.00 %)		 14,294,774
(30.62 %)		 59,340
(1.50 %)
258 giant panda (Jingjing v2 genbank 2020)
GCA_002007445.2		 n/a 20,381
(1.71 %)		 21,979
(1.44 %)		 43,086
(2.00 %)		 41.69
(98.09 %)		 190,364
(1.92 %)		 77,287
(100.00 %)		 4,484,597
(41.53 %)		 618,595
(2.00 %)		 14,236,406
(30.39 %)		 59,945
(1.50 %)
259 giant panda (Jingjing v2 refseq 2020)
GCF_002007445.1		 67,162
(3.32 %)		 20,374
(1.71 %)		 21,965
(1.44 %)		 43,086
(2.00 %)		 41.69
(98.09 %)		 190,364
(1.92 %)		 77,288
(100.00 %)		 4,476,689
(41.47 %)		 618,596
(2.00 %)		 14,236,463
(30.39 %)		 59,946
(1.50 %)
260 Glanville fritillary (genbank 2021)
GCA_905220565.1		 17,520
(43.15 %)		 4,738
(0.89 %)		 16,197
(5.05 %)		 35,235
(7.97 %)		 34.09
(100.00 %)		 80
(0.01 %)		 32
(100.00 %)		 343,193
(3.25 %)		 144,286
(3.46 %)		 3,683,956
(48.60 %)		 30,200
(4.54 %)
261 globe artichoke (v1 2C 2018)
GCF_001531365.1		 42,119
(6.72 %)		 15,804
(2.23 %)		 49,721
(11.10 %)		 n/a 35.35
(90.31 %)		 310,473
(9.77 %)		 13,588
(99.93 %)		 394,687
(2.79 %)		 364,361
(3.37 %)		 4,191,676
(39.48 %)		 12,198
(0.64 %)
262 goat (v1 San Clemente 2016 USDA genbank)
GCA_001704415.1		 0
(0.00 %)		 19,842
(1.43 %)		 22,426
(1.24 %)		 52,608
(1.64 %)		 43.16
(100.00 %)		 790
(0.00 %)		 29,906
(100.00 %)		 5,669,868
(50.59 %)		 760,836
(7.07 %)		 13,024,386
(44.85 %)		 125,682
(4.01 %)
263 goat (v1 San Clemente 2016 USDA refseq)
GCF_001704415.1		 47,206
(2.31 %)		 19,859
(1.44 %)		 22,429
(1.24 %)		 n/a 43.16
(100.00 %)		 790
(0.00 %)		 29,907
(100.00 %)		 5,670,600
(50.59 %)		 760,837
(7.07 %)		 13,024,197
(44.85 %)		 125,682
(4.01 %)
264 golden eagle (v1.2 2019)
GCF_900496995.1		 55,164
(5.86 %)		 13,226
(1.87 %)		 23,033
(2.15 %)		 25,921
(3.22 %)		 42.11
(99.61 %)		 191
(0.39 %)		 142
(100.00 %)		 519,341
(5.86 %)		 180,990
(0.79 %)		 7,005,531
(19.25 %)		 37,343
(3.12 %)
265 golden eagle (v1.2 alternate hap 2019)
GCA_902153765.1		 n/a 9,334
(1.82 %)		 17,594
(2.12 %)		 n/a 42.53
(99.93 %)		 39
(0.07 %)		 3,860
(100.00 %)		 356,284
(6.03 %)		 123,430
(0.80 %)		 4,417,887
(19.25 %)		 28,919
(3.52 %)
266 golden hamster (Baylor 2013 genbank)
GCA_000349665.1		 0
(0.00 %)		 18,965
(1.82 %)		 19,339
(1.52 %)		 n/a 42.01
(82.92 %)		 216,216
(17.12 %)		 237,699
(82.88 %)		 3,724,142
(27.19 %)		 790,256
(1.69 %)		 12,003,866
(24.29 %)		 18,591
(0.51 %)
267 golden snub-nosed monkey (2014 Novogene)
GCA_000769185.1		 n/a 21,341
(1.86 %)		 22,492
(1.24 %)		 n/a 40.87
(98.50 %)		 61,291
(1.50 %)		 196,804
(98.50 %)		 5,673,299
(51.36 %)		 1,080,627
(3.06 %)		 16,205,827
(36.77 %)		 79,387
(1.14 %)
268 gopher snake (HBS135680 alternate hap 2023 genbank)
GCA_029215685.1		 n/a 12,291
(1.06 %)		 19,125
(2.02 %)		 n/a 40.55
(100.00 %)		 584
(0.00 %)		 1,233
(100.00 %)		 1,259,781
(7.92 %)		 925,571
(7.56 %)		 7,739,320
(45.92 %)		 73,681
(2.81 %)
269 grape phylloxera (Bord-2020 2022 genbank)
GCA_025091365.1		 n/a 2,982
(0.90 %)		 5,710
(2.77 %)		 n/a 27.24
(97.73 %)		 41,970
(2.29 %)		 8,544
(100.00 %)		 195,538
(3.32 %)		 65,664
(2.79 %)		 2,529,566
(54.06 %)		 4,357
(1.18 %)
270 gray mouse lemur genbank
GCA_000165445.3		 n/a 20,031
(1.89 %)		 22,619
(1.50 %)		 n/a 40.98
(95.94 %)		 43,363
(4.06 %)		 50,982
(95.94 %)		 4,082,873
(41.60 %)		 582,430
(1.47 %)		 14,808,558
(30.05 %)		 74,772
(2.61 %)
271 gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027887165.1		 73,383
(42.66 %)		 16,638
(0.72 %)		 16,171
(0.86 %)		 n/a 37.92
(99.11 %)		 2,255
(0.89 %)		 14
(100.00 %)		 5,562,366
(25.40 %)		 1,096,625
(2.60 %)		 22,322,798
(43.37 %)		 28,894
(0.57 %)
272 great fruit-eating bat (v1 hap1 2024)
GCA_038363095.1		 n/a 18,022
(1.56 %)		 20,018
(1.52 %)		 n/a 42.28
(100.00 %)		 81
(0.00 %)		 419
(100.00 %)		 2,827,417
(26.82 %)		 371,479
(4.97 %)		 11,603,093
(34.64 %)		 71,574
(2.28 %)
273 great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 genbank)
GCA_001890085.1		 50,937
(43.78 %)		 19,011
(2.00 %)		 19,882
(1.66 %)		 41,741
(2.41 %)		 41.11
(87.42 %)		 172,751
(12.60 %)		 7,570
(100.00 %)		 3,078,210
(32.07 %)		 495,290
(1.05 %)		 11,588,202
(25.43 %)		 33,101
(0.97 %)
274 great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 refseq)
GCF_001890085.1		 50,950
(3.26 %)		 18,992
(2.00 %)		 19,880
(1.66 %)		 41,778
(2.41 %)		 41.11
(87.42 %)		 172,751
(12.60 %)		 7,571
(100.00 %)		 3,285,971
(33.14 %)		 495,292
(1.05 %)		 11,588,248
(25.43 %)		 33,101
(0.97 %)
275 greater horseshoe bat (mRhiFer1 2020)
GCA_014108255.1		 n/a 18,531
(1.97 %)		 20,309
(1.67 %)		 n/a 40.52
(99.19 %)		 292
(0.81 %)		 50
(100.00 %)		 3,284,473
(35.00 %)		 559,653
(1.29 %)		 12,043,562
(29.15 %)		 32,047
(1.05 %)
276 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 genbank)
GCA_004115265.2		 53,353
(46.77 %)		 18,647
(1.97 %)		 20,359
(1.68 %)		 n/a 40.54
(99.64 %)		 158
(0.36 %)		 135
(100.00 %)		 3,301,020
(34.99 %)		 564,790
(1.35 %)		 12,217,069
(29.39 %)		 32,445
(1.06 %)
277 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 refseq)
GCF_004115265.1		 53,352
(3.13 %)		 18,647
(1.97 %)		 20,359
(1.68 %)		 n/a 40.54
(99.64 %)		 158
(0.36 %)		 134
(100.00 %)		 3,300,836
(34.99 %)		 564,789
(1.35 %)		 12,217,020
(29.39 %)		 32,445
(1.06 %)
278 greater mouse-eared bat (2019 Broad)
GCA_004026985.1		 n/a 23,153
(1.31 %)		 51,642
(1.43 %)		 n/a 43.16
(99.88 %)		 8,133
(0.04 %)		 1,053,330
(99.96 %)		 3,675,075
(25.48 %)		 938,700
(2.73 %)		 12,027,923
(39.01 %)		 80,955
(2.31 %)
279 greater pipefish (v1.1 2019)
GCA_901709675.1		 n/a 13,467
(5.26 %)		 42,380
(12.01 %)		 n/a 43.46
(100.00 %)		 43
(0.00 %)		 87
(100.00 %)		 193,442
(3.05 %)		 125,716
(4.25 %)		 1,676,004
(25.93 %)		 46,340
(13.40 %)
280 greater sac-winged bat (primary hap 2024 genbank)
GCA_036850765.1		 n/a 18,322
(1.40 %)		 21,049
(1.35 %)		 n/a 41.71
(98.73 %)		 468
(1.27 %)		 359
(99.59 %)		 4,247,148
(29.53 %)		 1,031,385
(2.50 %)		 12,465,194
(43.30 %)		 101,620
(2.01 %)
281 greater wax moth (Carbio01_MB 2019 genbank)
GCA_003640425.2		 20,814
(51.89 %)		 4,346
(0.99 %)		 12,930
(3.50 %)		 21,226
(7.60 %)		 33.06
(99.10 %)		 27,314
(0.92 %)		 13,303
(100.00 %)		 270,925
(3.18 %)		 86,050
(1.20 %)		 3,416,162
(48.29 %)		 11,043
(1.07 %)
282 green algae C.reinhardtii (v1 CC-503 cw92 v1 2007)
GCF_000002595.1		 14,410
(22.17 %)		 987
(0.55 %)		 11,299
(59.37 %)		 n/a 63.87
(87.58 %)		 10,425
(12.45 %)		 11,385
(87.55 %)		 167,652
(16.23 %)		 100,391
(4.60 %)		 734,057
(30.38 %)		 3,154
(63.45 %)
283 green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 genbank)
GCA_000002595.3		 n/a 988
(0.56 %)		 9,689
(59.71 %)		 n/a 64.08
(96.36 %)		 1,459
(3.65 %)		 1,512
(96.35 %)		 171,684
(17.03 %)		 110,553
(6.12 %)		 748,240
(34.06 %)		 106
(99.48 %)
284 green algae C.variabilis (NC64A 2010 genbank)
GCA_000147415.1		 9,780
(62.01 %)		 743
(1.01 %)		 4,520
(67.55 %)		 n/a 67.14
(91.48 %)		 3,543
(8.55 %)		 3,810
(91.45 %)		 65,787
(8.35 %)		 28,736
(2.86 %)		 416,740
(37.15 %)		 776
(95.90 %)
285 green monkey 1994-021 (2014 genbank)
GCA_000409795.2		 76,037
(46.89 %)		 20,079
(1.94 %)		 20,246
(1.25 %)		 n/a 40.81
(98.67 %)		 178,925
(1.35 %)		 163,017
(98.65 %)		 5,382,039
(50.20 %)		 980,479
(2.63 %)		 16,076,172
(35.62 %)		 50,033
(1.04 %)
286 green sea turtle (BGI 2013)
GCF_000344595.1		 31,773
(2.57 %)		 14,548
(1.02 %)		 15,297
(1.46 %)		 n/a 43.49
(95.57 %)		 134,344
(4.44 %)		 274,367
(95.56 %)		 1,615,553
(13.87 %)		 317,600
(2.08 %)		 11,732,990
(28.32 %)		 36,782
(0.70 %)
287 green sea turtle (v1 2020)
GCF_015237465.1		 56,904
(3.63 %)		 14,729
(1.06 %)		 17,439
(1.56 %)		 n/a 44.01
(99.44 %)		 294
(0.56 %)		 99
(100.00 %)		 1,641,730
(15.08 %)		 304,356
(1.25 %)		 11,136,918
(31.96 %)		 49,035
(1.44 %)
288 harbor porpoise (BS71 2019)
GCA_004363495.1		 n/a 21,044
(1.46 %)		 30,072
(1.23 %)		 n/a 41.83
(99.88 %)		 7,114
(0.03 %)		 1,338,272
(99.97 %)		 5,359,537
(46.83 %)		 772,736
(1.54 %)		 13,705,428
(42.29 %)		 80,965
(1.65 %)
289 Harpy eagle (primary hap 2022 genbank)
GCA_026419915.1		 51,641
(50.37 %)		 13,412
(1.70 %)		 24,002
(2.05 %)		 n/a 43.39
(99.80 %)		 342
(0.20 %)		 322
(100.00 %)		 456,476
(3.62 %)		 260,495
(7.70 %)		 5,658,773
(24.81 %)		 60,606
(5.66 %)
290 Hawaiian crow (2021 genbank)
GCA_020740725.1		 51,593
(54.67 %)		 12,737
(1.83 %)		 23,664
(2.30 %)		 n/a 43.30
(99.84 %)		 294
(0.16 %)		 187
(100.00 %)		 502,844
(6.10 %)		 304,680
(5.73 %)		 5,953,316
(23.59 %)		 46,108
(3.49 %)
291 Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U genbank)
GCA_002201575.1		 0
(0.00 %)		 19,385
(1.74 %)		 20,265
(1.41 %)		 33,375
(1.66 %)		 41.41
(97.77 %)		 38,833
(2.24 %)		 7,871
(100.00 %)		 4,629,031
(43.70 %)		 573,328
(1.09 %)		 13,374,887
(33.10 %)		 50,379
(1.45 %)
292 Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U refseq)
GCF_002201575.1		 29,897
(1.95 %)		 19,380
(1.75 %)		 20,272
(1.41 %)		 n/a 41.41
(97.77 %)		 38,833
(2.24 %)		 7,872
(100.00 %)		 4,629,766
(43.70 %)		 573,335
(1.09 %)		 13,369,616
(33.10 %)		 50,380
(1.45 %)
293 hemichordates Saccoglossus HW-2024a (v1 hap1 2024)
GCA_040954625.1		 n/a 4,944
(1.30 %)		 35,031
(15.53 %)		 n/a 39.72
(99.96 %)		 254
(0.04 %)		 77
(100.00 %)		 87,841
(1.67 %)		 119,697
(13.20 %)		 1,309,907
(29.40 %)		 21,623
(4.17 %)
294 hemichordates Saccoglossus HW-2024a (v1 hap2 2024)
GCA_040954595.1		 n/a 4,919
(1.33 %)		 34,873
(16.02 %)		 n/a 39.72
(99.96 %)		 254
(0.04 %)		 56
(100.00 %)		 84,495
(1.58 %)		 118,073
(13.23 %)		 1,301,514
(28.77 %)		 20,511
(4.03 %)
295 hippopotamus (v2 hap2 2023 genbank)
GCA_030028045.1		 64,153
(41.00 %)		 20,337
(1.62 %)		 20,633
(1.37 %)		 n/a 41.60
(100.00 %)		 226
(0.00 %)		 356
(100.00 %)		 3,783,435
(35.17 %)		 567,796
(3.38 %)		 13,462,481
(35.48 %)		 48,365
(1.91 %)
296 Honduran yellow-shouldered bat (v2.0 Veracruz 20B 2020)
GCF_014824575.1		 49,894
(2.81 %)		 18,317
(1.66 %)		 19,991
(1.63 %)		 n/a 42.33
(99.79 %)		 38,823
(0.21 %)		 27,486
(100.00 %)		 2,844,834
(29.10 %)		 367,443
(1.49 %)		 11,805,151
(31.26 %)		 59,262
(1.70 %)
297 honeybee mite (v1 2017)
GCF_002443255.1		 35,641
(12.86 %)		 2,741
(0.61 %)		 28,868
(8.05 %)		 n/a 40.92
(99.93 %)		 3,073
(0.07 %)		 1,426
(100.00 %)		 117,879
(1.26 %)		 43,685
(1.30 %)		 1,858,762
(15.09 %)		 31,400
(5.04 %)
298 hooded crow (v2 S_Up_H32 2017)
GCF_000738735.2		 35,874
(6.47 %)		 11,298
(1.84 %)		 17,627
(2.12 %)		 n/a 41.48
(97.07 %)		 27,795
(2.94 %)		 113
(100.00 %)		 392,199
(5.95 %)		 139,126
(0.76 %)		 6,141,002
(18.21 %)		 12,943
(0.48 %)
299 hooded crow (v5 S_Up_H32 2021)
GCF_000738735.5		 42,799
(6.57 %)		 11,845
(1.92 %)		 20,738
(2.23 %)		 n/a 42.10
(99.68 %)		 425
(0.32 %)		 47
(100.00 %)		 421,463
(6.12 %)		 164,830
(0.93 %)		 6,148,741
(19.00 %)		 25,266
(2.09 %)
300 horse (Twilight 2007 genbank)
GCA_000002305.1		 n/a 18,575
(1.67 %)		 17,121
(1.34 %)		 n/a 41.50
(98.14 %)		 45,680
(1.86 %)		 55,316
(98.14 %)		 3,941,878
(45.17 %)		 381,229
(1.99 %)		 14,674,265
(29.80 %)		 45,521
(1.52 %)
301 hourglass treefrog (paternal 2023 genbank)
GCA_027789765.1		 n/a 14,058
(0.89 %)		 31,050
(2.69 %)		 n/a 43.97
(99.70 %)		 804
(0.30 %)		 2,200
(100.00 %)		 906,816
(2.43 %)		 1,710,859
(17.48 %)		 10,069,798
(51.41 %)		 235,277
(5.56 %)
302 house finch (primary hap 2022 genbank)
GCA_027477595.1		 43,228
(49.63 %)		 12,700
(1.83 %)		 24,567
(2.38 %)		 n/a 42.91
(99.02 %)		 295
(0.98 %)		 183
(100.00 %)		 440,379
(3.17 %)		 463,164
(6.37 %)		 6,300,100
(23.47 %)		 30,897
(2.53 %)
303 house fly (aabys 2013 genbank)
GCA_000371365.1		 n/a 7,825
(1.36 %)		 12,819
(3.07 %)		 n/a 35.11
(92.22 %)		 102,610
(7.82 %)		 104,053
(92.18 %)		 415,874
(2.30 %)		 376,409
(8.80 %)		 4,931,104
(52.61 %)		 7,139
(0.35 %)
304 house mouse (AKR_J v1 2016)
GCA_001624295.1		 n/a 21,299
(2.19 %)		 18,730
(1.41 %)		 102,168
(4.09 %)		 41.70
(86.82 %)		 314,064
(13.22 %)		 40,550
(96.00 %)		 5,186,721
(40.97 %)		 1,485,719
(3.05 %)		 13,610,761
(27.42 %)		 16,745
(0.41 %)
305 house mouse (A_J v1 2016)
GCA_001624215.1		 n/a 21,171
(2.20 %)		 18,776
(1.40 %)		 102,254
(4.12 %)		 41.70
(89.34 %)		 365,877
(10.71 %)		 33,692
(96.01 %)		 5,186,523
(40.90 %)		 1,483,826
(3.06 %)		 13,614,266
(28.13 %)		 16,590
(0.42 %)
306 house mouse (BALB_cJ v1 2016)
GCA_001632525.1		 n/a 21,337
(2.21 %)		 18,682
(1.41 %)		 102,138
(4.14 %)		 41.74
(88.91 %)		 361,689
(11.14 %)		 37,453
(95.84 %)		 5,096,953
(40.72 %)		 1,407,754
(2.90 %)		 13,416,041
(27.66 %)		 16,788
(0.42 %)
307 house mouse (C3H_HeJ v1 2016)
GCA_001632575.1		 n/a 21,177
(2.22 %)		 18,550
(1.42 %)		 101,710
(4.15 %)		 41.74
(85.90 %)		 369,499
(14.15 %)		 37,497
(95.91 %)		 5,089,496
(40.41 %)		 1,399,438
(2.72 %)		 13,485,480
(26.52 %)		 16,675
(0.41 %)
308 house mouse (CBA_J v1 2016)
GCA_001624475.1		 n/a 21,259
(2.23 %)		 18,593
(1.42 %)		 101,632
(4.14 %)		 41.78
(79.43 %)		 410,639
(20.63 %)		 42,242
(96.14 %)		 5,081,543
(40.40 %)		 1,393,763
(2.54 %)		 13,472,532
(24.46 %)		 16,809
(0.38 %)
309 house mouse (DBA_2J v1 2016)
GCA_001624505.1		 n/a 21,156
(2.23 %)		 18,610
(1.43 %)		 101,908
(4.18 %)		 41.80
(88.67 %)		 409,306
(11.39 %)		 42,324
(95.14 %)		 5,028,217
(40.37 %)		 1,364,702
(2.73 %)		 13,540,805
(27.33 %)		 16,544
(0.42 %)
310 house mouse (FVB_NJ v1 2016)
GCA_001624535.1		 n/a 21,195
(2.22 %)		 18,615
(1.42 %)		 101,520
(4.15 %)		 41.75
(89.39 %)		 380,840
(10.66 %)		 67,805
(93.73 %)		 5,037,447
(40.28 %)		 1,381,859
(2.89 %)		 13,440,164
(27.32 %)		 16,625
(0.42 %)
311 house mouse (GRCm38.p6 2017)
GCF_000001635.26		 123,654
(4.49 %)		 24,134
(2.09 %)		 22,855
(1.67 %)		 n/a 41.73
(97.18 %)		 904
(2.82 %)		 21,179
(97.18 %)		 5,554,281
(45.50 %)		 1,695,255
(3.40 %)		 13,041,229
(35.91 %)		 25,014
(0.54 %)
312 house mouse (LP_J v1 2016)
GCA_001632615.1		 n/a 21,012
(2.23 %)		 18,555
(1.43 %)		 101,892
(4.18 %)		 41.78
(84.14 %)		 402,247
(15.91 %)		 38,542
(95.89 %)		 5,032,748
(40.03 %)		 1,373,374
(2.60 %)		 13,411,126
(25.61 %)		 16,668
(0.40 %)
313 house mouse (NOD_ShiLtJ v1 2016)
GCA_001624675.1		 n/a 21,291
(2.24 %)		 19,697
(1.47 %)		 101,562
(4.18 %)		 42.00
(77.13 %)		 595,433
(22.95 %)		 66,154
(95.79 %)		 5,059,815
(40.57 %)		 1,370,443
(2.51 %)		 13,251,532
(23.62 %)		 18,188
(0.42 %)
314 house mouse (NZO_HlLtJ v1 2016)
GCA_001624745.1		 n/a 21,233
(2.22 %)		 18,805
(1.43 %)		 103,134
(4.18 %)		 41.74
(86.47 %)		 337,909
(13.58 %)		 57,439
(95.37 %)		 5,112,301
(40.60 %)		 1,418,629
(2.92 %)		 13,588,055
(27.01 %)		 16,857
(0.41 %)
315 human (HG00438.mat 2021)
GCA_018471515.1		 n/a 20,788
(1.85 %)		 22,424
(1.25 %)		 233,427
(57.20 %)		 40.83
(100.00 %)		 n/a 258
(100.00 %)		 5,426,471
(53.12 %)		 1,085,458
(7.66 %)		 16,023,596
(40.44 %)		 52,702
(1.17 %)
316 human (HG00438.pat 2021)
GCA_018472595.1		 n/a 20,627
(1.85 %)		 22,176
(1.24 %)		 233,698
(4.96 %)		 40.82
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 276
(100.00 %)		 5,419,334
(52.97 %)		 1,071,302
(7.38 %)		 15,894,505
(40.10 %)		 52,377
(1.20 %)
317 human (HG00621.mat 2021)
GCA_018472605.1		 n/a 20,611
(1.85 %)		 22,275
(1.25 %)		 233,258
(4.96 %)		 40.86
(100.00 %)		 n/a 253
(100.00 %)		 5,392,161
(53.03 %)		 1,048,372
(7.50 %)		 15,960,374
(40.31 %)		 52,502
(1.20 %)
318 human (HG00621.pat 2021)
GCA_018472575.1		 n/a 19,907
(1.86 %)		 21,558
(1.26 %)		 227,172
(5.00 %)		 40.88
(100.00 %)		 n/a 287
(100.00 %)		 5,174,496
(52.83 %)		 1,030,071
(7.85 %)		 15,147,153
(40.18 %)		 50,988
(1.20 %)
319 human (HG00673.mat 2021)
GCA_018472565.1		 n/a 20,805
(1.84 %)		 22,193
(1.24 %)		 233,975
(4.93 %)		 40.84
(100.00 %)		 n/a 348
(100.00 %)		 5,408,639
(53.33 %)		 1,056,398
(8.05 %)		 16,117,475
(40.76 %)		 52,411
(1.14 %)
320 human (HG00673.pat 2021)
GCA_018472585.1		 n/a 19,963
(1.85 %)		 21,514
(1.25 %)		 227,480
(4.97 %)		 40.84
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 420
(100.00 %)		 5,185,516
(53.08 %)		 1,065,657
(8.25 %)		 15,183,778
(40.61 %)		 50,883
(1.20 %)
321 human (HG00733 mat 2021)
GCA_018506975.1		 n/a 20,626
(1.85 %)		 22,511
(1.25 %)		 233,295
(4.96 %)		 40.87
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 609
(100.00 %)		 5,412,701
(52.97 %)		 1,052,600
(7.34 %)		 15,895,725
(40.14 %)		 53,216
(1.22 %)
322 human (HG00733 pat 2021)
GCA_018506955.1		 n/a 20,749
(1.85 %)		 22,251
(1.24 %)		 233,792
(4.94 %)		 40.83
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 695
(100.00 %)		 5,420,299
(53.15 %)		 1,076,604
(7.72 %)		 15,964,663
(40.46 %)		 53,315
(1.19 %)
323 human (HG00735.mat 2021)
GCA_018472765.1		 n/a 20,674
(1.84 %)		 22,283
(1.25 %)		 233,363
(4.94 %)		 40.80
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 244
(100.00 %)		 5,406,821
(53.15 %)		 1,060,553
(7.74 %)		 16,051,646
(40.51 %)		 52,343
(1.14 %)
324 human (HG00735.pat 2021)
GCA_018472715.1		 n/a 20,688
(1.84 %)		 22,080
(1.23 %)		 233,237
(4.95 %)		 40.80
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 299
(100.00 %)		 5,391,900
(53.13 %)		 1,050,251
(7.66 %)		 16,052,188
(40.43 %)		 52,436
(1.14 %)
325 human (HG00741.mat 2021)
GCA_018471095.1		 n/a 20,654
(1.85 %)		 22,309
(1.25 %)		 233,294
(4.94 %)		 40.83
(100.00 %)		 n/a 297
(100.00 %)		 5,410,814
(53.14 %)		 1,059,472
(7.72 %)		 16,043,406
(40.45 %)		 52,535
(1.14 %)
326 human (HG00741.pat 2021)
GCA_018471105.1		 n/a 20,657
(1.85 %)		 22,458
(1.25 %)		 233,356
(4.95 %)		 40.86
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 289
(100.00 %)		 5,397,570
(53.08 %)		 1,046,743
(7.55 %)		 16,021,887
(40.41 %)		 52,164
(1.20 %)
327 human (HG01071.mat 2021)
GCA_018472685.1		 n/a 20,742
(1.86 %)		 22,169
(1.25 %)		 233,386
(4.98 %)		 40.86
(100.00 %)		 n/a 236
(100.00 %)		 5,380,815
(52.80 %)		 1,031,609
(7.04 %)		 16,008,178
(39.99 %)		 52,233
(1.13 %)
328 human (HG01071.pat 2021)
GCA_018472725.1		 n/a 20,694
(1.84 %)		 22,451
(1.25 %)		 232,969
(4.90 %)		 40.75
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 330
(100.00 %)		 5,420,540
(53.42 %)		 1,100,044
(8.26 %)		 15,926,032
(40.73 %)		 52,706
(1.14 %)
329 human (HG01106.mat 2021)
GCA_018471345.1		 n/a 20,635
(1.85 %)		 22,311
(1.24 %)		 233,162
(4.93 %)		 40.84
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 272
(100.00 %)		 5,394,949
(53.13 %)		 1,045,161
(7.68 %)		 15,896,292
(40.33 %)		 52,604
(1.18 %)
330 human (HG01106.pat 2021)
GCA_018471075.1		 n/a 19,939
(1.84 %)		 21,482
(1.25 %)		 227,418
(4.97 %)		 40.82
(100.00 %)		 n/a 284
(100.00 %)		 5,199,262
(53.10 %)		 1,073,766
(8.08 %)		 15,085,301
(40.44 %)		 51,050
(1.19 %)
331 human (HG01109.mat 2021)
GCA_018504365.1		 n/a 20,638
(1.84 %)		 22,373
(1.25 %)		 233,201
(4.94 %)		 40.83
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 399
(100.00 %)		 5,405,239
(53.13 %)		 1,058,194
(7.69 %)		 15,910,496
(40.38 %)		 53,236
(1.22 %)
332 human (HG01109.pat 2021)
GCA_018504645.1		 n/a 19,870
(1.85 %)		 21,659
(1.26 %)		 227,481
(4.98 %)		 40.81
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 473
(100.00 %)		 5,197,395
(52.95 %)		 1,071,566
(7.99 %)		 15,109,996
(40.28 %)		 51,315
(1.20 %)
333 human (HG01123.mat 2021)
GCA_018469665.1		 n/a 20,643
(1.86 %)		 22,373
(1.25 %)		 233,154
(4.98 %)		 40.85
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 340
(100.00 %)		 5,382,379
(52.86 %)		 1,029,500
(7.16 %)		 15,979,100
(40.07 %)		 52,346
(1.15 %)
334 human (HG01123.pat 2021)
GCA_018469695.1		 n/a 20,631
(1.86 %)		 22,210
(1.24 %)		 233,273
(4.97 %)		 40.86
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 436
(100.00 %)		 5,391,322
(52.85 %)		 1,041,900
(7.14 %)		 15,985,878
(40.09 %)		 52,630
(1.16 %)
335 human (HG01175.mat 2021)
GCA_018471085.1		 n/a 20,587
(1.84 %)		 22,094
(1.24 %)		 232,602
(4.93 %)		 40.81
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 315
(100.00 %)		 5,397,845
(53.20 %)		 1,069,444
(7.79 %)		 15,978,901
(40.45 %)		 51,968
(1.14 %)
336 human (HG01175.pat 2021)
GCA_018471065.1		 n/a 20,651
(1.85 %)		 22,302
(1.25 %)		 233,105
(4.94 %)		 40.83
(100.00 %)		 n/a 365
(100.00 %)		 5,401,789
(53.10 %)		 1,061,956
(7.62 %)		 16,016,635
(40.44 %)		 52,440
(1.16 %)
337 human (HG01243.mat 2021)
GCA_018504375.1		 n/a 20,701
(1.85 %)		 22,327
(1.24 %)		 232,970
(4.94 %)		 40.84
(100.00 %)		 n/a 345
(100.00 %)		 5,384,218
(53.11 %)		 1,029,835
(7.61 %)		 15,997,541
(40.37 %)		 52,287
(1.16 %)
338 human (HG01243.pat 2021)
GCA_018504045.1		 n/a 19,886
(1.86 %)		 21,597
(1.26 %)		 227,249
(5.00 %)		 40.90
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 436
(100.00 %)		 5,188,879
(52.80 %)		 1,041,178
(7.85 %)		 15,168,227
(40.25 %)		 51,387
(1.26 %)
339 human (HG01258.mat 2021)
GCA_018469405.1		 n/a 20,652
(1.85 %)		 22,270
(1.25 %)		 233,297
(4.95 %)		 40.86
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 346
(100.00 %)		 5,421,505
(53.06 %)		 1,070,796
(7.57 %)		 15,904,078
(40.29 %)		 52,952
(1.24 %)
340 human (HG01258.pat 2021)
GCA_018469675.1		 n/a 19,899
(1.85 %)		 21,663
(1.25 %)		 227,048
(4.98 %)		 40.83
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 324
(100.00 %)		 5,179,894
(52.93 %)		 1,053,273
(8.01 %)		 15,211,574
(40.34 %)		 50,868
(1.15 %)
341 human (HG01358.mat 2021)
GCA_018469865.1		 n/a 20,620
(1.85 %)		 22,173
(1.24 %)		 232,988
(57.14 %)		 40.83
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 334
(100.00 %)		 5,408,314
(53.13 %)		 1,082,369
(7.68 %)		 15,986,592
(40.42 %)		 52,497
(1.15 %)
342 human (HG01358.pat 2021)
GCA_018469965.1		 n/a 19,983
(1.85 %)		 21,787
(1.25 %)		 227,373
(4.96 %)		 40.85
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 441
(100.00 %)		 5,212,793
(53.10 %)		 1,073,348
(8.29 %)		 15,098,284
(40.47 %)		 51,706
(1.21 %)
343 human (HG01361.mat 2021)
GCA_018469685.1		 n/a 20,709
(1.85 %)		 22,220
(1.24 %)		 233,019
(4.95 %)		 40.82
(100.00 %)		 n/a 295
(100.00 %)		 5,400,880
(53.06 %)		 1,072,673
(7.57 %)		 15,970,600
(40.36 %)		 52,279
(1.19 %)
344 human (HG01361.pat 2021)
GCA_018469705.1		 n/a 20,643
(1.86 %)		 22,265
(1.25 %)		 233,156
(4.98 %)		 40.88
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 288
(100.00 %)		 5,389,985
(52.82 %)		 1,039,540
(7.07 %)		 15,972,086
(40.01 %)		 52,246
(1.17 %)
345 human (HG01891.mat 2021)
GCA_018467155.1		 n/a 20,644
(1.86 %)		 22,204
(1.24 %)		 233,342
(4.96 %)		 40.82
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 331
(100.00 %)		 5,394,888
(53.00 %)		 1,057,773
(7.41 %)		 16,010,248
(40.29 %)		 52,761
(1.18 %)
346 human (HG01891.pat 2021)
GCA_018467165.1		 n/a 20,737
(1.84 %)		 22,422
(1.25 %)		 233,650
(4.94 %)		 40.86
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 427
(100.00 %)		 5,403,741
(53.18 %)		 1,044,828
(7.78 %)		 15,926,586
(40.45 %)		 52,966
(1.19 %)
347 human (HG01928.mat 2021)
GCA_018472695.1		 n/a 20,608
(1.85 %)		 22,133
(1.24 %)		 232,837
(4.94 %)		 40.81
(100.00 %)		 n/a 244
(100.00 %)		 5,393,247
(53.12 %)		 1,066,426
(7.67 %)		 15,949,983
(40.40 %)		 51,940
(1.16 %)
348 human (HG01928.pat 2021)
GCA_018472705.1		 n/a 19,872
(1.85 %)		 21,396
(1.24 %)		 226,741
(4.96 %)		 40.86
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 317
(100.00 %)		 5,191,849
(53.05 %)		 1,052,422
(8.21 %)		 15,216,610
(40.53 %)		 50,940
(1.18 %)
349 human (HG01952.mat 2021)
GCA_018471545.1		 n/a 20,679
(1.86 %)		 22,204
(1.25 %)		 233,578
(4.98 %)		 40.85
(100.00 %)		 n/a 307
(100.00 %)		 5,393,904
(52.87 %)		 1,041,237
(7.18 %)		 15,894,360
(39.98 %)		 52,866
(1.21 %)
350 human (HG01952.pat 2021)
GCA_018471555.1		 n/a 19,863
(1.85 %)		 21,383
(1.24 %)		 226,809
(4.97 %)		 40.86
(100.00 %)		 n/a 378
(100.00 %)		 5,181,545
(52.95 %)		 1,053,224
(8.07 %)		 15,149,369
(40.47 %)		 51,292
(1.24 %)
351 human (HG01978.mat 2021)
GCA_018472865.1		 n/a 20,711
(1.84 %)		 22,195
(1.24 %)		 233,223
(4.92 %)		 40.84
(100.00 %)		 n/a 247
(100.00 %)		 5,415,439
(53.41 %)		 1,076,389
(8.28 %)		 16,001,461
(40.83 %)		 52,688
(1.16 %)
352 human (HG01978.pat 2021)
GCA_018472845.1		 n/a 20,727
(1.84 %)		 22,443
(1.25 %)		 233,592
(4.92 %)		 40.83
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 286
(100.00 %)		 5,424,250
(53.38 %)		 1,090,520
(8.17 %)		 15,938,736
(40.68 %)		 52,674
(1.19 %)
353 human (HG02055 mat 2021)
GCA_018506125.1		 n/a 20,668
(1.86 %)		 22,497
(1.26 %)		 233,148
(4.96 %)		 40.83
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 306
(100.00 %)		 5,394,664
(52.96 %)		 1,054,907
(7.31 %)		 16,015,246
(40.18 %)		 52,182
(1.14 %)
354 human (HG02055 pat 2021)
GCA_018505855.1		 n/a 19,927
(1.83 %)		 21,549
(1.23 %)		 227,271
(4.93 %)		 40.82
(100.00 %)		 n/a 367
(100.00 %)		 5,216,705
(53.37 %)		 1,083,360
(8.82 %)		 15,156,062
(40.89 %)		 51,291
(1.20 %)
355 human (HG02080.mat 2021)
GCA_018504085.1		 n/a 20,633
(1.85 %)		 22,288
(1.24 %)		 233,237
(4.94 %)		 40.84
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 422
(100.00 %)		 5,403,587
(53.12 %)		 1,056,798
(7.68 %)		 15,880,598
(40.28 %)		 52,572
(1.21 %)
356 human (HG02080.pat 2021)
GCA_018504055.1		 n/a 20,645
(1.85 %)		 22,426
(1.26 %)		 233,357
(4.96 %)		 40.84
(100.00 %)		 n/a 485
(100.00 %)		 5,400,305
(52.99 %)		 1,056,100
(7.39 %)		 15,866,266
(40.12 %)		 52,798
(1.20 %)
357 human (HG02109 mat 2021)
GCA_018505825.1		 n/a 20,672
(1.85 %)		 22,359
(1.25 %)		 233,217
(4.95 %)		 40.86
(100.00 %)		 n/a 445
(100.00 %)		 5,404,232
(52.99 %)		 1,059,138
(7.38 %)		 15,909,866
(40.16 %)		 52,821
(1.21 %)
358 human (HG02109 pat 2021)
GCA_018505865.1		 n/a 20,726
(1.85 %)		 22,416
(1.25 %)		 233,280
(4.94 %)		 40.84
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 481
(100.00 %)		 5,415,046
(53.08 %)		 1,053,373
(7.55 %)		 15,926,813
(40.27 %)		 52,917
(1.18 %)
359 human (HG02145 mat 2021)
GCA_018852585.1		 n/a 20,626
(1.85 %)		 22,340
(1.25 %)		 233,065
(4.94 %)		 40.85
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 437
(100.00 %)		 5,406,959
(53.08 %)		 1,055,638
(7.58 %)		 15,881,847
(40.24 %)		 52,888
(1.19 %)
360 human (HG02145 pat 2021)
GCA_018852595.1		 n/a 19,971
(1.84 %)		 23,489
(1.40 %)		 227,332
(4.94 %)		 40.91
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 817
(100.00 %)		 5,210,152
(53.01 %)		 1,080,455
(8.52 %)		 14,936,162
(40.43 %)		 52,745
(1.32 %)
361 human (HG02148.mat 2021)
GCA_018471535.1		 n/a 20,622
(1.85 %)		 22,230
(1.24 %)		 233,267
(4.94 %)		 40.81
(100.00 %)		 n/a 423
(100.00 %)		 5,415,368
(53.22 %)		 1,083,752
(7.85 %)		 16,009,690
(40.54 %)		 52,324
(1.14 %)
362 human (HG02148.pat 2021)
GCA_018471525.1		 n/a 20,675
(1.85 %)		 22,449
(1.25 %)		 233,621
(4.96 %)		 40.87
(100.00 %)		 n/a 487
(100.00 %)		 5,408,728
(53.04 %)		 1,060,811
(7.55 %)		 15,818,402
(40.19 %)		 52,717
(1.23 %)
363 human (HG02257.mat 2021)
GCA_018466845.1		 n/a 20,636
(1.85 %)		 22,298
(1.24 %)		 233,236
(4.95 %)		 40.84
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 292
(100.00 %)		 5,409,203
(53.10 %)		 1,060,311
(7.60 %)		 16,026,213
(40.43 %)		 52,647
(1.16 %)
364 human (HG02257.pat 2021)
GCA_018466835.1		 n/a 20,659
(1.84 %)		 22,252
(1.23 %)		 233,332
(4.93 %)		 40.78
(100.00 %)		 n/a 306
(100.00 %)		 5,414,841
(53.29 %)		 1,077,125
(7.99 %)		 15,891,119
(40.53 %)		 52,638
(1.18 %)
365 human (HG02486.mat 2021)
GCA_018467015.1		 n/a 20,626
(1.85 %)		 22,072
(1.24 %)		 232,923
(4.95 %)		 40.80
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 283
(100.00 %)		 5,409,820
(53.15 %)		 1,075,146
(7.68 %)		 15,995,649
(40.44 %)		 52,593
(1.16 %)
366 human (HG02486.pat 2021)
GCA_018467005.1		 n/a 20,047
(1.86 %)		 21,511
(1.24 %)		 227,472
(4.97 %)		 40.80
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 342
(100.00 %)		 5,191,769
(53.10 %)		 1,044,947
(8.26 %)		 15,239,696
(40.62 %)		 51,172
(1.16 %)
367 human (HG02559.mat 2021)
GCA_018466985.1		 n/a 20,748
(1.85 %)		 22,425
(1.25 %)		 233,661
(4.95 %)		 40.84
(100.00 %)		 n/a 329
(100.00 %)		 5,409,998
(53.11 %)		 1,067,279
(7.64 %)		 15,944,107
(40.38 %)		 53,297
(1.22 %)
368 human (HG02559.pat 2021)
GCA_018466855.1		 n/a 20,684
(1.85 %)		 22,457
(1.26 %)		 233,500
(4.96 %)		 40.86
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 260
(100.00 %)		 5,394,499
(53.00 %)		 1,048,556
(7.39 %)		 16,015,449
(40.28 %)		 52,834
(1.17 %)
369 human (HG02572.mat 2021)
GCA_018470445.1		 n/a 20,823
(1.84 %)		 22,634
(1.24 %)		 232,547
(4.89 %)		 40.83
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 632
(100.00 %)		 5,435,641
(53.28 %)		 1,076,981
(7.96 %)		 15,851,923
(40.45 %)		 53,410
(1.21 %)
370 human (HG02572.pat 2021)
GCA_018470435.1		 n/a 20,054
(1.85 %)		 21,827
(1.25 %)		 225,951
(4.91 %)		 40.85
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 641
(100.00 %)		 5,213,929
(53.30 %)		 1,082,137
(8.76 %)		 15,068,577
(40.69 %)		 51,312
(1.19 %)
371 human (HG02622.mat 2021)
GCA_018469875.1		 n/a 20,669
(1.84 %)		 22,455
(1.24 %)		 233,354
(4.93 %)		 40.86
(100.00 %)		 n/a 292
(100.00 %)		 5,446,540
(53.17 %)		 1,085,576
(7.76 %)		 15,975,207
(40.52 %)		 53,535
(1.26 %)
372 human (HG02622.pat 2021)
GCA_018469925.1		 n/a 20,698
(1.84 %)		 22,536
(1.25 %)		 233,733
(4.94 %)		 40.84
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 270
(100.00 %)		 5,421,378
(53.22 %)		 1,062,842
(7.81 %)		 15,934,809
(40.46 %)		 52,975
(1.21 %)
373 human (HG02630.mat 2021)
GCA_018469955.1		 n/a 20,674
(1.84 %)		 22,467
(1.25 %)		 233,172
(4.93 %)		 40.87
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 497
(100.00 %)		 5,432,857
(53.10 %)		 1,072,648
(7.64 %)		 15,990,876
(40.53 %)		 54,101
(1.32 %)
374 human (HG02630.pat 2021)
GCA_018469945.1		 n/a 20,722
(1.83 %)		 22,445
(1.24 %)		 233,268
(4.91 %)		 40.85
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 534
(100.00 %)		 5,449,816
(53.34 %)		 1,108,461
(8.05 %)		 15,985,498
(40.79 %)		 53,746
(1.28 %)
375 human (HG02717.mat 2021)
GCA_018469935.1		 n/a 20,621
(1.84 %)		 22,396
(1.25 %)		 233,096
(4.93 %)		 40.81
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 323
(100.00 %)		 5,411,829
(53.22 %)		 1,079,483
(7.87 %)		 15,854,981
(40.43 %)		 53,155
(1.21 %)
376 human (HG02717.pat 2021)
GCA_018470425.1		 n/a 19,952
(1.84 %)		 21,767
(1.25 %)		 227,273
(4.93 %)		 40.83
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 399
(100.00 %)		 5,216,997
(53.34 %)		 1,089,537
(8.70 %)		 15,132,132
(40.83 %)		 51,815
(1.21 %)
377 human (HG02723.mat 2021)
GCA_018504065.1		 n/a 20,697
(1.85 %)		 22,322
(1.25 %)		 233,152
(4.95 %)		 40.83
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 429
(100.00 %)		 5,403,282
(53.05 %)		 1,062,881
(7.52 %)		 15,861,495
(40.19 %)		 52,733
(1.19 %)
378 human (HG02723.pat 2021)
GCA_018504075.1		 n/a 20,606
(1.84 %)		 22,627
(1.25 %)		 233,499
(4.92 %)		 40.82
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 529
(100.00 %)		 5,419,888
(53.29 %)		 1,079,052
(8.00 %)		 15,778,626
(40.44 %)		 53,133
(1.23 %)
379 human (HG02818.mat 2021)
GCA_018503585.1		 n/a 20,695
(1.85 %)		 22,489
(1.25 %)		 233,161
(4.93 %)		 40.80
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 620
(100.00 %)		 5,406,404
(53.21 %)		 1,061,348
(7.77 %)		 15,879,759
(40.38 %)		 52,992
(1.18 %)
380 human (HG02818.pat 2021)
GCA_018503575.1		 n/a 20,696
(1.86 %)		 22,490
(1.27 %)		 233,253
(4.97 %)		 40.87
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 566
(100.00 %)		 5,397,389
(52.88 %)		 1,044,887
(7.21 %)		 16,011,018
(40.13 %)		 52,793
(1.17 %)
381 human (HG02886.mat 2021)
GCA_018470455.1		 n/a 20,740
(1.84 %)		 22,693
(1.25 %)		 233,895
(4.94 %)		 40.87
(100.00 %)		 n/a 461
(100.00 %)		 5,448,421
(53.12 %)		 1,077,973
(7.55 %)		 15,956,661
(40.38 %)		 53,701
(1.29 %)
382 human (HG02886.pat 2021)
GCA_018470465.1		 n/a 20,705
(1.84 %)		 22,599
(1.26 %)		 233,328
(4.93 %)		 40.85
(100.00 %)		 n/a 503
(100.00 %)		 5,438,367
(53.15 %)		 1,090,141
(7.70 %)		 16,016,158
(40.57 %)		 53,652
(1.26 %)
383 human (HG03098 mat 2021)
GCA_018506165.1		 n/a 20,700
(1.83 %)		 22,200
(1.24 %)		 233,714
(4.91 %)		 40.79
(100.00 %)		 n/a 331
(100.00 %)		 5,414,502
(53.46 %)		 1,066,527
(8.36 %)		 15,926,377
(40.78 %)		 52,417
(1.18 %)
384 human (HG03098 pat 2021)
GCA_018506155.1		 n/a 19,900
(1.84 %)		 21,567
(1.24 %)		 226,998
(4.94 %)		 40.84
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 445
(100.00 %)		 5,201,143
(53.24 %)		 1,083,861
(8.56 %)		 15,069,721
(40.64 %)		 51,389
(1.21 %)
385 human (HG03453.mat 2021)
GCA_018472855.1		 n/a 20,710
(1.84 %)		 22,595
(1.25 %)		 233,614
(4.93 %)		 40.83
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 439
(100.00 %)		 5,436,784
(53.21 %)		 1,094,451
(7.82 %)		 15,990,282
(40.60 %)		 53,318
(1.27 %)
386 human (HG03453.pat 2021)
GCA_018473305.1		 n/a 20,661
(1.84 %)		 22,407
(1.25 %)		 233,945
(4.93 %)		 40.80
(100.00 %)		 n/a 480
(100.00 %)		 5,418,964
(53.30 %)		 1,060,724
(7.98 %)		 15,795,098
(40.40 %)		 53,149
(1.21 %)
387 human (HG03486 pat 2021)
GCA_018503245.1		 n/a 20,698
(1.84 %)		 22,539
(1.24 %)		 233,646
(4.92 %)		 40.84
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 519
(100.00 %)		 5,426,413
(53.27 %)		 1,068,800
(7.93 %)		 15,812,092
(40.41 %)		 53,143
(1.26 %)
388 human (HG03486.mat 2021)
GCA_018503525.1		 n/a 20,760
(1.85 %)		 22,730
(1.26 %)		 233,655
(4.96 %)		 40.87
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 480
(100.00 %)		 5,422,116
(53.02 %)		 1,069,864
(7.46 %)		 15,951,020
(40.27 %)		 53,338
(1.19 %)
389 human (HG03516.mat 2021)
GCA_018469425.1		 n/a 20,766
(1.85 %)		 22,424
(1.25 %)		 233,619
(4.96 %)		 40.85
(100.00 %)		 n/a 320
(100.00 %)		 5,437,541
(52.96 %)		 1,084,729
(7.35 %)		 16,097,675
(40.30 %)		 52,953
(1.18 %)
390 human (HG03516.pat 2021)
GCA_018469415.1		 n/a 20,820
(1.84 %)		 22,672
(1.25 %)		 234,068
(4.91 %)		 40.85
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 369
(100.00 %)		 5,451,270
(53.44 %)		 1,086,645
(8.28 %)		 15,991,774
(40.84 %)		 53,435
(1.18 %)
391 human (HG03540.mat 2021)
GCA_018473295.1		 n/a 20,665
(1.84 %)		 22,566
(1.26 %)		 233,386
(4.92 %)		 40.85
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 435
(100.00 %)		 5,436,802
(53.34 %)		 1,105,174
(8.06 %)		 15,931,296
(40.72 %)		 53,436
(1.26 %)
392 human (HG03540.pat 2021)
GCA_018473315.1		 n/a 20,724
(1.83 %)		 22,627
(1.25 %)		 233,360
(4.91 %)		 40.83
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 512
(100.00 %)		 5,449,110
(53.39 %)		 1,087,677
(8.16 %)		 15,936,844
(40.79 %)		 53,859
(1.30 %)
393 human (HG03579.mat 2021)
GCA_018472825.1		 n/a 20,702
(1.85 %)		 22,327
(1.25 %)		 233,403
(4.95 %)		 40.84
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 456
(100.00 %)		 5,423,189
(53.07 %)		 1,075,620
(7.56 %)		 15,928,710
(40.31 %)		 53,423
(1.24 %)
394 human (HG03579.pat 2021)
GCA_018472835.1		 n/a 19,942
(1.84 %)		 21,710
(1.25 %)		 227,313
(4.94 %)		 40.82
(100.00 %)		 n/a 499
(100.00 %)		 5,226,752
(53.28 %)		 1,092,235
(8.58 %)		 15,143,136
(40.79 %)		 51,622
(1.24 %)
395 human (NA18906.mat 2021)
GCA_018503255.1		 n/a 20,739
(1.84 %)		 22,340
(1.25 %)		 233,812
(4.92 %)		 40.86
(100.00 %)		 n/a 271
(100.00 %)		 5,464,910
(53.26 %)		 1,101,031
(7.88 %)		 15,871,098
(40.43 %)		 53,290
(1.27 %)
396 human (NA18906.pat 2021)
GCA_018503285.1		 n/a 20,765
(1.85 %)		 22,414
(1.25 %)		 234,102
(4.95 %)		 40.84
(100.00 %)		 n/a 304
(100.00 %)		 5,443,478
(53.06 %)		 1,085,707
(7.53 %)		 15,888,465
(40.19 %)		 53,328
(1.24 %)
397 human (NA19240.mat 2021)
GCA_018503275.1		 n/a 20,678
(1.85 %)		 22,534
(1.26 %)		 233,508
(4.96 %)		 40.82
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 387
(100.00 %)		 5,404,648
(52.98 %)		 1,047,126
(7.31 %)		 15,970,133
(40.15 %)		 52,529
(1.17 %)
398 human (NA19240.pat 2021)
GCA_018503265.1		 n/a 20,772
(1.85 %)		 22,461
(1.25 %)		 233,684
(4.95 %)		 40.86
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 453
(100.00 %)		 5,424,224
(53.08 %)		 1,063,925
(7.53 %)		 15,954,132
(40.32 %)		 53,106
(1.23 %)
399 human (NA20129 mat 2021)
GCA_018504635.1		 n/a 20,664
(1.84 %)		 22,511
(1.24 %)		 233,033
(4.92 %)		 40.85
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 448
(100.00 %)		 5,420,332
(53.24 %)		 1,067,867
(7.86 %)		 15,932,491
(40.50 %)		 53,011
(1.20 %)
400 human (NA20129 pat 2021)
GCA_018504625.1		 n/a 20,706
(1.85 %)		 22,365
(1.26 %)		 233,543
(4.96 %)		 40.84
(100.00 %)		 n/a 481
(100.00 %)		 5,401,495
(53.02 %)		 1,051,311
(7.46 %)		 16,041,778
(40.34 %)		 52,911
(1.18 %)
401 human (NA21309 pat 2021)
GCA_018504665.1		 n/a 20,685
(1.85 %)		 22,478
(1.25 %)		 233,394
(4.95 %)		 40.81
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 608
(100.00 %)		 5,399,150
(53.06 %)		 1,053,638
(7.58 %)		 15,999,929
(40.35 %)		 52,798
(1.17 %)
402 human (NA21309.mat 2021)
GCA_018504655.1		 n/a 20,635
(1.84 %)		 22,458
(1.25 %)		 233,555
(4.94 %)		 40.84
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 508
(100.00 %)		 5,389,804
(53.21 %)		 1,045,498
(7.82 %)		 15,862,735
(40.38 %)		 52,479
(1.17 %)
403 human (NA24385 HG002 alt pat 2023)
GCA_018852605.2		 n/a 19,964
(1.84 %)		 20,479
(1.19 %)		 n/a 40.79
(99.74 %)		 4
(0.26 %)		 27
(99.74 %)		 5,394,200
(53.47 %)		 1,082,908
(8.63 %)		 15,221,566
(40.81 %)		 50,569
(1.11 %)
404 human (NA24385 HG002 pri mat 2023)
GCA_018852615.2		 n/a 20,637
(1.85 %)		 21,256
(1.20 %)		 n/a 40.82
(99.23 %)		 5
(0.77 %)		 24
(100.00 %)		 5,394,439
(53.04 %)		 1,041,946
(7.44 %)		 16,039,487
(40.04 %)		 52,111
(1.11 %)
405 human (NA24385.mat 2021)
GCA_018852615.1		 n/a 20,744
(1.84 %)		 21,968
(1.22 %)		 233,779
(4.92 %)		 40.85
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 445
(100.00 %)		 5,435,410
(53.40 %)		 1,086,871
(8.27 %)		 15,970,867
(40.97 %)		 53,581
(1.32 %)
406 human (NA24385.mat 2022)
GCA_021951015.1		 n/a 20,809
(1.82 %)		 21,369
(1.18 %)		 234,089
(4.92 %)		 40.85
(99.95 %)		 109
(0.05 %)		 355
(100.00 %)		 5,489,855
(53.93 %)		 1,085,681
(8.26 %)		 15,968,830
(40.95 %)		 53,511
(1.32 %)
407 human (NA24385.pat 2021)
GCA_018852605.1		 n/a 19,919
(1.83 %)		 21,582
(1.22 %)		 227,333
(4.91 %)		 40.87
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 610
(100.00 %)		 5,215,774
(53.54 %)		 1,094,036
(9.09 %)		 15,125,069
(41.29 %)		 52,653
(1.34 %)
408 human (NA24385.pat 2022)
GCA_021950905.1		 n/a 20,014
(1.81 %)		 20,716
(1.19 %)		 227,278
(4.91 %)		 40.87
(99.97 %)		 117
(0.03 %)		 514
(100.00 %)		 5,293,356
(54.01 %)		 1,100,786
(9.09 %)		 15,122,569
(41.27 %)		 52,546
(1.35 %)
409 human (NA24631 mat 2021)
GCA_018506965.1		 n/a 20,683
(1.85 %)		 22,446
(1.25 %)		 233,691
(4.96 %)		 40.88
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 503
(100.00 %)		 5,423,411
(52.98 %)		 1,075,094
(7.46 %)		 15,897,770
(40.32 %)		 53,731
(1.31 %)
410 human (NA24631 pat 2021)
GCA_018506945.1		 n/a 19,910
(1.84 %)		 21,610
(1.24 %)		 227,521
(4.95 %)		 40.90
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 682
(100.00 %)		 5,224,127
(53.12 %)		 1,078,588
(8.33 %)		 15,264,128
(40.95 %)		 53,164
(1.35 %)
411 human betaherpesvirus 6A (U1102 1995 genbank)
GCA_000845685.2		 n/a n/a n/a n/a 42.44
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 33
(1.67 %)		 36
(4.27 %)		 603
(9.83 %)		 3
(13.72 %)
412 Iberian mole (v1 TD23 2020)
GCF_014898055.1		 46,872
(2.59 %)		 18,566
(1.67 %)		 20,793
(1.59 %)		 n/a 41.91
(99.98 %)		 3,640
(0.02 %)		 4,425
(100.00 %)		 3,269,038
(31.47 %)		 501,677
(1.32 %)		 11,176,747
(32.61 %)		 48,076
(2.80 %)
413 Iberian mole (v2 TD23 2020)
GCF_014898055.2		 46,759
(2.60 %)		 18,453
(1.69 %)		 20,410
(1.59 %)		 n/a 41.90
(99.98 %)		 3,639
(0.02 %)		 3,202
(100.00 %)		 2,637,156
(23.36 %)		 497,087
(1.30 %)		 10,984,260
(32.64 %)		 47,552
(2.89 %)
414 Indian medaka
GCF_002922805.1		 47,300
(9.26 %)		 14,561
(2.50 %)		 31,867
(6.43 %)		 n/a 39.04
(94.73 %)		 51,440
(5.29 %)		 8,603
(100.00 %)		 319,637
(2.20 %)		 208,749
(2.67 %)		 5,412,794
(33.26 %)		 40,721
(2.36 %)
415 Indianmeal moth (v1 USDA-ARS_2022_Savannah primary hap 2023)
GCF_027563975.1		 28,390
(14.36 %)		 4,799
(1.56 %)		 15,737
(7.20 %)		 n/a 35.38
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 46
(100.00 %)		 136,242
(3.33 %)		 48,275
(1.61 %)		 2,518,372
(36.69 %)		 14,106
(2.86 %)
416 Jamaican fruit-eating bat (US092 2019 Broad)
GCA_004027435.1		 n/a 21,188
(1.26 %)		 41,550
(1.34 %)		 35,477
(1.51 %)		 42.19
(99.92 %)		 4,324
(0.02 %)		 798,700
(99.98 %)		 3,297,388
(28.66 %)		 476,792
(1.23 %)		 13,144,912
(34.13 %)		 81,685
(1.86 %)
417 Japanese quail
GCF_001577835.1		 46,995
(7.38 %)		 12,864
(2.55 %)		 36,126
(11.03 %)		 n/a 41.28
(98.88 %)		 11,601
(1.12 %)		 9,642
(98.88 %)		 466,141
(6.58 %)		 321,128
(2.22 %)		 5,497,911
(19.81 %)		 17,977
(1.86 %)
418 Japanese sawshark (hap1 2024 genbank)
GCA_044704955.1		 n/a 14,672
(0.28 %)		 30,181
(0.79 %)		 n/a 47.02
(99.98 %)		 5,985
(0.02 %)		 4,317
(100.00 %)		 1,167,498
(3.08 %)		 2,399,496
(18.16 %)		 10,302
(99.98 %)		 503,637
(6.56 %)
419 Jerdon's jumping ant (DR-91 v8.5 2018)
GCF_003227715.1		 29,097
(10.82 %)		 4,337
(1.33 %)		 43,907
(11.32 %)		 n/a 44.75
(99.72 %)		 499
(0.28 %)		 857
(100.00 %)		 439,110
(17.67 %)		 262,539
(5.69 %)		 1,834,301
(29.28 %)		 6,204
(9.08 %)
420 kakapo (Jane v1 2019)
GCF_004027225.1		 49,444
(5.77 %)		 13,114
(1.92 %)		 17,732
(2.50 %)		 29,004
(4.44 %)		 41.97
(97.63 %)		 362
(2.37 %)		 99
(100.00 %)		 548,758
(10.76 %)		 208,171
(1.07 %)		 6,258,082
(20.20 %)		 22,279
(1.75 %)
421 kakapo (Jane v2 2020 genbank)
GCA_004027225.2		 49,757
(54.33 %)		 13,112
(1.92 %)		 17,637
(2.48 %)		 n/a 41.97
(99.08 %)		 373
(0.92 %)		 90
(100.00 %)		 507,072
(7.85 %)		 208,180
(1.08 %)		 6,258,178
(20.50 %)		 22,278
(1.77 %)
422 koala (Bilbo 61053 2017)
GCF_002099425.1		 55,736
(2.16 %)		 17,500
(0.86 %)		 16,193
(0.94 %)		 n/a 39.05
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1,907
(100.00 %)		 7,814,631
(41.58 %)		 1,123,545
(2.03 %)		 21,796,057
(39.25 %)		 15,957
(0.35 %)
423 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 genbank)
GCA_009829125.1		 29,504
(53.56 %)		 14,221
(2.37 %)		 44,144
(5.80 %)		 41,384
(6.20 %)		 40.22
(99.05 %)		 700
(0.95 %)		 124
(100.00 %)		 423,338
(4.48 %)		 551,472
(7.22 %)		 4,887,148
(38.97 %)		 37,287
(2.58 %)
424 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 refseq)
GCF_009829125.1		 29,517
(6.48 %)		 14,243
(2.37 %)		 44,144
(5.80 %)		 41,421
(6.20 %)		 40.22
(99.05 %)		 700
(0.95 %)		 124
(100.00 %)		 423,274
(4.48 %)		 551,472
(7.22 %)		 4,887,142
(38.97 %)		 37,287
(2.58 %)
425 lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023638135.1		 48,561
(51.20 %)		 12,862
(1.69 %)		 21,562
(1.92 %)		 n/a 43.03
(99.83 %)		 158
(0.17 %)		 397
(100.00 %)		 439,975
(3.77 %)		 203,640
(6.96 %)		 6,921,438
(23.57 %)		 32,398
(2.65 %)
426 large cabbage white (genbank 2021)
GCA_905147105.1		 24,631
(60.59 %)		 4,550
(1.47 %)		 9,197
(5.18 %)		 30,394
(12.69 %)		 34.13
(100.00 %)		 29
(0.00 %)		 402
(100.00 %)		 123,352
(2.30 %)		 36,616
(6.05 %)		 2,431,238
(41.04 %)		 8,442
(2.49 %)
427 large tree shrew (BS70 2019 Broad)
GCA_004365275.1		 n/a 26,266
(0.71 %)		 59,868
(0.81 %)		 n/a 42.00
(99.77 %)		 6,466
(0.02 %)		 3,890,086
(99.98 %)		 7,163,973
(22.64 %)		 1,629,329
(2.64 %)		 18,970,992
(42.82 %)		 138,732
(1.75 %)
428 leatherback sea turtle (v1 2019 genbank G10K)
GCA_009764565.1		 n/a 14,572
(1.03 %)		 16,165
(1.42 %)		 n/a 43.36
(99.74 %)		 558
(0.26 %)		 55
(100.00 %)		 1,631,923
(15.09 %)		 303,440
(1.14 %)		 11,122,938
(34.12 %)		 35,505
(1.37 %)
429 leatherback sea turtle (v1 alternate hap 2019)
GCA_009762595.1		 n/a 10,857
(1.01 %)		 15,585
(1.46 %)		 n/a 43.54
(100.00 %)		 n/a 8,982
(100.00 %)		 1,090,219
(15.03 %)		 206,192
(1.19 %)		 7,154,939
(33.03 %)		 25,155
(1.42 %)
430 leatherback sea turtle (v3 2020 refseq G10K)
GCF_009764565.2		 62,576
(3.50 %)		 14,610
(1.03 %)		 16,359
(1.45 %)		 n/a 43.35
(99.74 %)		 667
(0.26 %)		 40
(100.00 %)		 1,637,236
(15.13 %)		 304,730
(1.14 %)		 11,121,967
(34.21 %)		 35,485
(1.36 %)
431 Leishmania infantum (JPCM5 2011 kinetoplastids genbank)
GCA_000002875.2		 n/a 591
(1.09 %)		 4,193
(46.51 %)		 n/a 59.58
(99.94 %)		 454
(0.06 %)		 76
(100.00 %)		 24,390
(4.61 %)		 4,228
(1.93 %)		 243,087
(20.97 %)		 92
(99.40 %)
432 Leishmania major (Friedlin 2011 kinetoplastids genbank)
GCA_000002725.2		 n/a 626
(1.15 %)		 4,290
(46.53 %)		 n/a 59.72
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 43
(100.00 %)		 33,021
(5.20 %)		 8,477
(2.43 %)		 238,932
(20.91 %)		 41
(99.80 %)
433 Leishmania martiniquensis (LSCM1 2021 genbank)
GCA_017916325.1		 n/a 619
(1.14 %)		 3,882
(44.58 %)		 n/a 59.85
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 42
(100.00 %)		 20,726
(2.91 %)		 2,267
(2.64 %)		 232,973
(20.45 %)		 44
(99.29 %)
434 Leishmania orientalis (LSCM4 2021 genbank)
GCA_017916335.1		 n/a 643
(1.12 %)		 4,666
(45.26 %)		 n/a 59.72
(99.99 %)		 11
(0.00 %)		 98
(100.00 %)		 22,632
(2.47 %)		 4,241
(2.74 %)		 231,120
(20.18 %)		 100
(99.82 %)
435 leopard (Maewha 2016 genbank)
GCA_001857705.1		 73,266
(49.50 %)		 18,874
(1.62 %)		 21,014
(1.44 %)		 n/a 41.71
(96.17 %)		 214,953
(3.85 %)		 265,329
(96.15 %)		 5,246,283
(42.87 %)		 1,059,443
(5.13 %)		 14,265,514
(32.20 %)		 77,000
(2.45 %)
436 lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 genbank)
GCA_000280705.1		 25,978
(33.60 %)		 19,393
(1.38 %)		 20,311
(1.35 %)		 n/a 41.87
(87.17 %)		 326,464
(12.87 %)		 337,359
(87.13 %)		 6,205,858
(38.76 %)		 832,823
(1.53 %)		 13,661,563
(33.98 %)		 26,669
(0.59 %)
437 lesser kestrel (v1 2021)
GCF_017639655.1		 47,420
(5.64 %)		 13,097
(1.80 %)		 22,203
(2.07 %)		 n/a 42.30
(99.66 %)		 298
(0.34 %)		 291
(100.00 %)		 516,498
(5.58 %)		 210,236
(1.26 %)		 7,133,927
(19.19 %)		 27,558
(2.21 %)
438 lesser noctule (v1 hap1 2024)
GCA_964264875.1		 n/a 18,260
(1.53 %)		 23,046
(1.60 %)		 n/a 43.05
(99.99 %)		 1,662
(0.01 %)		 1,281
(100.00 %)		 3,246,021
(21.13 %)		 1,298,965
(12.06 %)		 9,752,193
(42.90 %)		 66,137
(2.85 %)
439 lesser noctule (v1 hap2 2024)
GCA_964264895.1		 n/a 17,557
(1.64 %)		 22,484
(1.74 %)		 n/a 43.06
(99.98 %)		 1,563
(0.02 %)		 2,898
(99.98 %)		 2,999,553
(21.19 %)		 1,122,371
(10.04 %)		 9,331,392
(40.02 %)		 61,834
(2.95 %)
440 lesser rhea (primary hap 2023 genbank)
GCA_028389875.1		 39,024
(47.65 %)		 13,358
(1.72 %)		 23,870
(2.13 %)		 n/a 42.45
(99.89 %)		 128
(0.11 %)		 179
(100.00 %)		 674,141
(6.73 %)		 329,122
(5.34 %)		 6,820,211
(22.78 %)		 45,073
(5.83 %)
441 lesser sac-winged bat (primary hap 2024 genbank)
GCA_036850995.1		 n/a 18,322
(1.42 %)		 21,350
(1.39 %)		 n/a 41.84
(99.24 %)		 573
(0.76 %)		 345
(99.51 %)		 4,224,340
(28.69 %)		 1,030,574
(2.60 %)		 12,591,928
(42.30 %)		 98,189
(2.06 %)
442 lesser salmon catfish (primary hap 2023 genbank)
GCA_027579695.1		 53,323
(53.05 %)		 15,841
(0.90 %)		 85,700
(3.30 %)		 n/a 42.44
(99.43 %)		 334
(0.57 %)		 38
(100.00 %)		 5,905,868
(49.76 %)		 1,126,468
(6.51 %)		 7,609,180
(62.74 %)		 166,630
(4.38 %)
443 lettuce (Salinas v8 2020)
GCF_002870075.3		 64,818
(2.94 %)		 16,252
(0.65 %)		 101,828
(6.36 %)		 n/a 37.79
(92.44 %)		 351,533
(7.59 %)		 9,960
(99.71 %)		 945,052
(1.95 %)		 983,641
(3.64 %)		 12,325,371
(53.00 %)		 117,703
(2.02 %)
444 long-finned pilot whale (v1 primary hap 2023)
GCF_963455315.1		 61,810
(2.84 %)		 18,712
(1.51 %)		 20,920
(1.39 %)		 n/a 42.38
(99.99 %)		 1,084
(0.01 %)		 993
(100.00 %)		 4,125,420
(35.62 %)		 1,577,899
(12.03 %)		 12,347,226
(42.01 %)		 71,821
(5.51 %)
445 long-finned pilot whale (v2 primary hap 2024 genbank)
GCA_963455315.2		 n/a 18,726
(1.51 %)		 20,948
(1.39 %)		 n/a 42.38
(99.99 %)		 1,084
(0.01 %)		 995
(100.00 %)		 4,125,459
(35.62 %)		 1,577,896
(12.03 %)		 12,347,226
(42.01 %)		 71,822
(5.51 %)
446 long-tailed hermit (v1 PSU5 primary hap 2022)
GCA_023637945.1		 n/a 12,328
(2.02 %)		 20,312
(2.34 %)		 n/a 41.00
(99.63 %)		 141
(0.37 %)		 211
(99.63 %)		 497,506
(5.06 %)		 265,815
(1.51 %)		 6,045,702
(20.10 %)		 15,922
(1.43 %)
447 lumpfish (primary hap 2019 genbank)
GCA_009769545.1		 41,612
(58.17 %)		 14,748
(3.32 %)		 49,223
(8.10 %)		 52,721
(8.34 %)		 42.83
(98.22 %)		 347
(1.78 %)		 49
(100.00 %)		 478,416
(6.02 %)		 421,634
(11.07 %)		 2,928,668
(27.98 %)		 53,323
(5.09 %)
448 Ma's night monkey genbank
GCA_000952055.2		 55,061
(41.68 %)		 21,084
(1.92 %)		 22,287
(1.31 %)		 n/a 40.74
(94.86 %)		 83,929
(5.15 %)		 112,850
(94.85 %)		 5,109,404
(47.71 %)		 734,754
(2.02 %)		 15,854,134
(33.62 %)		 36,070
(0.90 %)
449 malaria parasite P. falciparum (3D7 2016 genbank)
GCA_000002765.3		 n/a n/a n/a n/a 19.34
(100.00 %)		 n/a 16
(100.00 %)		 79,857
(19.18 %)		 78,154
(15.50 %)		 186,960
(66.90 %)		 22
(0.04 %)
450 Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 genbank)
GCA_001685135.1		 48,578
(30.31 %)		 19,449
(1.56 %)		 24,645
(1.37 %)		 41,235
(1.95 %)		 40.78
(92.27 %)		 984,656
(7.81 %)		 80,669
(100.00 %)		 3,063,619
(35.20 %)		 866,306
(3.08 %)		 13,310,826
(28.76 %)		 35,558
(0.84 %)
451 malo sina (v1 2012)
GCF_000231095.1		 29,549
(16.44 %)		 15,120
(6.45 %)		 49,515
(30.69 %)		 n/a 40.48
(93.32 %)		 20,693
(6.71 %)		 23,184
(93.29 %)		 115,049
(2.29 %)		 51,516
(1.90 %)		 1,488,940
(24.12 %)		 42,077
(12.05 %)
452 mangrove rivulus
GCF_001649575.1		 45,293
(11.01 %)		 14,510
(2.84 %)		 29,750
(6.81 %)		 n/a 40.03
(94.35 %)		 29,388
(5.66 %)		 3,073
(100.00 %)		 345,930
(2.32 %)		 146,268
(1.33 %)		 4,717,260
(27.31 %)		 39,557
(2.69 %)
453 meadow brown (genbank 2021)
GCA_905333055.1		 29,488
(69.09 %)		 4,863
(1.16 %)		 19,812
(6.60 %)		 27,763
(8.31 %)		 36.96
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 32
(100.00 %)		 227,482
(2.41 %)		 107,773
(3.02 %)		 2,456,144
(43.97 %)		 24,873
(3.15 %)
454 meercat (VVHF042 2019 DNA Zoo genbank)
GCA_006229205.1		 n/a 19,020
(1.63 %)		 19,812
(1.43 %)		 42,441
(2.08 %)		 41.68
(99.72 %)		 65,245
(0.28 %)		 63,791
(100.00 %)		 4,552,310
(40.02 %)		 634,179
(1.21 %)		 13,631,635
(32.17 %)		 64,849
(2.13 %)
455 meerkat (BS45 2019 Broad)
GCA_004023905.1		 n/a 21,726
(1.54 %)		 31,908
(1.39 %)		 n/a 41.89
(99.96 %)		 4,153
(0.02 %)		 354,021
(99.98 %)		 4,835,157
(40.73 %)		 693,037
(1.32 %)		 13,779,279
(33.49 %)		 76,740
(2.37 %)
456 melon fly (v1 USDA-PBARC White Pupae T1 2014)
GCF_000806345.1		 26,008
(10.49 %)		 7,743
(3.09 %)		 12,206
(6.18 %)		 n/a 35.15
(84.42 %)		 37,430
(15.62 %)		 43,002
(84.38 %)		 237,943
(3.36 %)		 74,977
(1.26 %)		 2,410,203
(31.96 %)		 15,259
(2.01 %)
457 Mexican gray wolf (hap1 2025 genbank)
GCA_048164855.1		 n/a 19,584
(1.52 %)		 20,783
(1.39 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 167
(0.00 %)		 250
(100.00 %)		 4,643,072
(34.73 %)		 1,102,137
(4.40 %)		 13,591,414
(35.18 %)		 53,471
(2.24 %)
458 Microcystis aeruginosa (PCC 7806 2024 genbank)
GCA_041506625.1		 n/a n/a n/a n/a 42.08
(100.00 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 n/a 1,266
(2.35 %)		 23,848
(10.41 %)		 410
(6.99 %)
459 microsporidians E.bieneusi (H348 2009 genbank)
GCA_000209485.1		 n/a 238
(3.03 %)		 394
(8.09 %)		 n/a 33.70
(99.89 %)		 437
(0.04 %)		 1,743
(99.97 %)		 1,511
(2.99 %)		 268
(0.36 %)		 31,900
(26.59 %)		 373
(7.62 %)
460 microsporidians E.cuniculi (v1 GB-M1 2002)
GCF_000091225.1		 1,996
(85.79 %)		 1,569
(68.26 %)		 596
(33.73 %)		 n/a 47.31
(99.97 %)		 4
(0.03 %)		 15
(99.97 %)		 257
(0.70 %)		 199
(0.40 %)		 10,819
(8.68 %)		 126
(3.52 %)
461 microsporidians N.ceranae (BRL01 2009 genbank)
GCA_000182985.1		 n/a 348
(2.68 %)		 284
(3.31 %)		 n/a 25.26
(99.86 %)		 n/a 5,465
(100.00 %)		 3,179
(1.99 %)		 1,572
(1.39 %)		 85,189
(41.34 %)		 4
(0.02 %)
462 minke whale (2013 genbank)
GCA_000493695.1		 42,553
(41.45 %)		 19,298
(1.81 %)		 18,661
(1.42 %)		 n/a 40.94
(94.06 %)		 173,296
(5.96 %)		 184,071
(94.04 %)		 4,041,828
(42.24 %)		 573,950
(1.48 %)		 13,504,295
(30.96 %)		 65,448
(1.38 %)
463 minke whale (primary hap 2023 genbank)
GCA_949987535.1		 61,711
(41.50 %)		 19,544
(1.49 %)		 21,502
(1.26 %)		 n/a 41.55
(99.99 %)		 1,177
(0.01 %)		 1,375
(100.00 %)		 4,006,932
(35.92 %)		 1,058,106
(12.08 %)		 12,708,154
(42.66 %)		 72,756
(1.59 %)
464 mites & ticks V.jacobsoni (v1 VJ856 2017)
GCF_002532875.1		 35,332
(12.83 %)		 2,750
(0.61 %)		 29,731
(8.07 %)		 n/a 40.94
(99.89 %)		 3,360
(0.11 %)		 8,241
(99.89 %)		 115,140
(1.18 %)		 39,880
(0.71 %)		 1,832,298
(14.55 %)		 31,479
(5.12 %)
465 Mongolian gerbil (US013 2019 Broad)
GCA_004026785.1		 n/a 21,302
(1.57 %)		 27,162
(1.27 %)		 40,982
(1.78 %)		 41.88
(99.90 %)		 11,139
(0.04 %)		 796,326
(99.96 %)		 5,253,752
(39.29 %)		 1,211,658
(3.13 %)		 13,894,596
(38.35 %)		 24,829
(0.69 %)
466 monito del monte (mDroGli1 primary hap 2021 genbank)
GCA_019393635.1		 47,034
(41.56 %)		 18,428
(0.81 %)		 15,519
(0.85 %)		 n/a 39.11
(99.91 %)		 260
(0.09 %)		 18
(100.00 %)		 7,426,369
(29.77 %)		 1,249,638
(2.12 %)		 21,135,395
(42.80 %)		 16,598
(0.36 %)
467 moth C.splendana (v1 2021 genbank)
GCA_910591565.1		 n/a 4,930
(0.75 %)		 38,413
(8.53 %)		 35,924
(4.55 %)		 38.08
(99.99 %)		 150
(0.01 %)		 112
(100.00 %)		 261,421
(1.99 %)		 175,466
(5.62 %)		 3,107,482
(46.30 %)		 58,547
(5.75 %)
468 moth S.litura (Ishihara v1 2017)
GCF_002706865.1		 25,114
(8.87 %)		 5,088
(1.13 %)		 22,625
(7.19 %)		 n/a 36.56
(97.52 %)		 10,662
(2.49 %)		 13,637
(97.51 %)		 154,017
(1.49 %)		 50,642
(0.97 %)		 2,919,487
(37.00 %)		 34,396
(3.66 %)
469 mung bean (VC1973A 2015 genbank)
GCA_000741045.2		 n/a 16,645
(3.88 %)		 43,866
(14.64 %)		 n/a 33.16
(92.79 %)		 96,870
(7.25 %)		 2,463
(100.00 %)		 265,072
(3.32 %)		 198,918
(3.34 %)		 2,840,410
(34.89 %)		 13,926
(1.48 %)
470 mute swan (bCygOlo1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009769485.1		 n/a 10,083
(1.97 %)		 18,350
(2.23 %)		 n/a 42.22
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 5,616
(100.00 %)		 485,827
(7.06 %)		 212,892
(1.28 %)		 4,756,962
(19.95 %)		 25,670
(3.87 %)
471 mute swan (v1 primary hap 2019)
GCA_009769625.1		 n/a 12,973
(1.97 %)		 22,300
(2.18 %)		 n/a 41.92
(99.06 %)		 446
(0.94 %)		 181
(100.00 %)		 688,720
(7.65 %)		 301,358
(1.34 %)		 6,775,217
(21.21 %)		 31,271
(3.60 %)
472 naked mole-rat (NMR 29 2012 genbank)
GCA_000247695.1		 74,574
(44.06 %)		 21,317
(1.73 %)		 20,856
(1.51 %)		 n/a 40.21
(88.43 %)		 110,424
(11.59 %)		 114,652
(88.41 %)		 4,162,977
(32.77 %)		 484,933
(0.92 %)		 13,672,503
(27.63 %)		 31,950
(0.88 %)
473 narwhal (BS41 2019 Broad)
GCA_004026685.1		 n/a 21,418
(1.52 %)		 34,189
(1.28 %)		 n/a 41.35
(99.92 %)		 8,600
(0.03 %)		 653,473
(99.97 %)		 4,512,168
(44.82 %)		 592,047
(1.17 %)		 13,009,453
(37.18 %)		 63,033
(1.47 %)
474 Natterer's bat (hap1.1 2024)
GCA_964212035.1		 n/a 19,180
(1.72 %)		 22,635
(1.71 %)		 n/a 43.18
(99.99 %)		 1,620
(0.02 %)		 343
(100.00 %)		 3,081,500
(24.27 %)		 797,071
(5.37 %)		 10,372,159
(38.30 %)		 64,460
(2.57 %)
475 Natterer's bat (hap2.1 2024)
GCA_964212025.1		 n/a 18,275
(1.81 %)		 21,799
(1.80 %)		 n/a 43.28
(99.99 %)		 1,387
(0.01 %)		 1,706
(99.99 %)		 2,833,193
(23.73 %)		 705,278
(5.10 %)		 9,802,564
(36.67 %)		 61,024
(2.68 %)
476 Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027579445.1		 31,033
(46.15 %)		 12,385
(1.72 %)		 24,339
(2.24 %)		 n/a 43.01
(99.57 %)		 215
(0.43 %)		 77
(100.00 %)		 479,994
(3.33 %)		 443,098
(9.18 %)		 6,350,593
(25.82 %)		 31,693
(3.88 %)
477 nematode C.briggsae (AF16 v1 2008)
GCF_000004555.1		 19,404
(22.65 %)		 12,088
(12.63 %)		 7,533
(12.85 %)		 n/a 37.35
(97.22 %)		 6,713
(2.80 %)		 607
(99.95 %)		 116,909
(19.60 %)		 45,475
(4.23 %)		 820,686
(35.42 %)		 4,887
(1.65 %)
478 New South Wales waratah (AGSP 2013)
GCF_000471905.2		 36,181
(5.65 %)		 10,150
(1.34 %)		 42,117
(8.90 %)		 n/a 37.47
(94.63 %)		 39,556
(5.39 %)		 45,302
(94.61 %)		 396,916
(3.25 %)		 506,716
(6.41 %)		 4,768,175
(36.07 %)		 17,009
(0.90 %)
479 nine-banded armadillo (v1 hap1 2023)
GCA_030445055.1		 n/a 19,429
(1.06 %)		 22,396
(1.07 %)		 n/a 40.96
(99.27 %)		 845
(0.73 %)		 594
(100.00 %)		 4,369,568
(32.83 %)		 673,707
(1.55 %)		 18,586,102
(42.41 %)		 131,852
(2.78 %)
480 nine-banded armadillo (v1 hap2 2023)
GCF_030445035.1		 69,043
(2.70 %)		 20,516
(1.05 %)		 n/a n/a 41.00
(99.68 %)		 771
(0.32 %)		 539
(100.00 %)		 4,656,325
(32.86 %)		 726,574
(1.99 %)		 19,585,522
(43.65 %)		 140,990
(2.86 %)
481 nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor genbank)
GCA_000208655.2		 n/a 21,293
(1.15 %)		 25,302
(1.09 %)		 n/a 40.77
(90.89 %)		 268,442
(9.13 %)		 314,971
(90.87 %)		 5,327,246
(49.09 %)		 651,311
(1.26 %)		 19,267,381
(38.27 %)		 139,552
(2.47 %)
482 nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor refseq)
GCF_000208655.1		 46,131
(1.87 %)		 21,316
(1.15 %)		 25,308
(1.09 %)		 n/a 40.77
(90.89 %)		 268,442
(9.13 %)		 314,972
(90.87 %)		 5,328,146
(49.10 %)		 651,316
(1.26 %)		 19,267,438
(38.27 %)		 139,552
(2.47 %)
483 North Atlantic right whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028564815.1		 n/a 19,541
(1.47 %)		 21,516
(1.25 %)		 n/a 41.69
(99.83 %)		 363
(0.17 %)		 779
(100.00 %)		 1,361,117
(2.23 %)		 836,632
(13.12 %)		 12,597,969
(44.00 %)		 93,862
(1.92 %)
484 northern elephant seal (v2 JK_09032017 2021)
GCF_021288785.1		 49,934
(2.73 %)		 20,106
(1.74 %)		 20,957
(1.35 %)		 n/a 41.51
(99.35 %)		 39,936
(0.65 %)		 142,455
(100.00 %)		 4,434,732
(35.01 %)		 588,877
(1.19 %)		 13,745,426
(32.96 %)		 52,064
(1.59 %)
485 northern goshawk (v1 primary hap 2022 refseq)
GCF_929443795.1		 50,662
(4.74 %)		 13,528
(1.65 %)		 24,595
(1.99 %)		 n/a 43.78
(100.00 %)		 183
(0.00 %)		 454
(100.00 %)		 521,768
(3.86 %)		 325,987
(9.82 %)		 5,542,269
(27.30 %)		 43,070
(4.44 %)
486 northern house mosquito (v1 TS 2021)
GCF_016801865.1		 28,512
(7.14 %)		 5,830
(1.09 %)		 39,806
(8.27 %)		 n/a 36.76
(100.00 %)		 n/a 1,714
(100.00 %)		 222,294
(5.58 %)		 187,561
(9.87 %)		 3,009,613
(56.49 %)		 63,009
(9.78 %)
487 northern pike (primary hap 2020 genbank)
GCA_011004845.1		 63,720
(60.35 %)		 16,616
(2.41 %)		 55,784
(5.64 %)		 82,918
(8.82 %)		 42.22
(99.89 %)		 112
(0.11 %)		 53
(100.00 %)		 1,039,521
(30.93 %)		 524,708
(7.32 %)		 4,691,094
(32.91 %)		 42,910
(2.52 %)
488 northern white-cheeked gibbon (2012 GGSC)
GCA_000146795.3		 n/a 20,134
(1.89 %)		 18,568
(1.14 %)		 n/a 40.76
(93.09 %)		 180,468
(6.94 %)		 197,908
(93.06 %)		 5,169,984
(51.90 %)		 831,865
(4.16 %)		 15,243,657
(35.77 %)		 65,761
(1.00 %)
489 Norway rat BN7 genbank
GCA_015227675.2		 97,432
(43.01 %)		 21,523
(1.86 %)		 19,627
(1.36 %)		 54,530
(2.79 %)		 41.99
(99.19 %)		 581
(0.81 %)		 757
(99.19 %)		 4,895,563
(44.53 %)		 1,514,974
(3.57 %)		 13,450,428
(35.83 %)		 19,244
(0.46 %)
490 olive baboon (2017 HGSC genbank)
GCA_000264685.2		 n/a 20,319
(1.82 %)		 21,542
(1.19 %)		 n/a 40.99
(99.25 %)		 58,981
(0.76 %)		 118,810
(99.24 %)		 5,524,514
(52.78 %)		 1,068,912
(5.55 %)		 16,068,031
(38.71 %)		 95,595
(1.41 %)
491 olive baboon (2017 HGSC RefSeq)
GCF_000264685.3		 84,433
(3.85 %)		 20,317
(1.83 %)		 21,239
(1.18 %)		 n/a 40.99
(99.25 %)		 58,981
(0.76 %)		 118,811
(99.24 %)		 5,525,293
(52.79 %)		 1,068,912
(5.55 %)		 16,068,088
(38.71 %)		 95,595
(1.41 %)
492 oriental river prawn (v1 FS-2020 2020 genbank)
GCA_015104395.1		 n/a 1,945
(0.08 %)		 23,579
(1.88 %)		 n/a 36.81
(99.60 %)		 16,132
(0.41 %)		 16,156
(99.59 %)		 2,706,474
(10.11 %)		 2,525,264
(12.75 %)		 9,704,257
(48.31 %)		 77,313
(3.01 %)
493 painted lady (genbank 2021)
GCA_905220365.1		 20,948
(56.23 %)		 4,705
(1.06 %)		 15,277
(5.00 %)		 29,018
(10.11 %)		 33.42
(99.99 %)		 91
(0.01 %)		 37
(100.00 %)		 209,233
(2.16 %)		 56,676
(1.12 %)		 3,372,591
(44.40 %)		 13,547
(2.72 %)
494 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v1 2019)
GCF_004126475.1		 35,529
(2.39 %)		 18,185
(1.70 %)		 20,184
(1.64 %)		 41,094
(3.29 %)		 42.38
(98.92 %)		 831
(1.08 %)		 141
(100.00 %)		 3,072,951
(30.02 %)		 385,608
(0.80 %)		 12,060,365
(30.47 %)		 64,081
(4.30 %)
495 pea aphid (AL4f v1 2019)
GCF_005508785.1		 31,681
(7.81 %)		 4,257
(0.79 %)		 16,323
(3.39 %)		 n/a 29.76
(92.38 %)		 46,297
(7.65 %)		 21,920
(100.00 %)		 768,383
(18.87 %)		 135,468
(2.11 %)		 4,536,093
(48.39 %)		 16,332
(2.13 %)
496 peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634155.1		 49,100
(50.44 %)		 13,025
(1.67 %)		 24,167
(2.02 %)		 n/a 42.65
(99.69 %)		 232
(0.31 %)		 124
(100.00 %)		 586,316
(11.83 %)		 335,214
(8.05 %)		 7,038,700
(24.65 %)		 26,085
(2.25 %)
497 pig-tailed macaque (mMacNem1hap1 2024 genbank)
GCA_043159975.1		 n/a 20,768
(1.76 %)		 21,550
(1.18 %)		 n/a 41.04
(100.00 %)		 260
(0.00 %)		 362
(100.00 %)		 5,387,919
(53.48 %)		 1,027,640
(9.31 %)		 15,407,988
(41.73 %)		 99,854
(1.52 %)
498 pigeon pea (v1 2016 BGI)
GCF_000340665.1		 46,646
(9.41 %)		 17,409
(3.12 %)		 51,529
(12.74 %)		 48,654
(8.33 %)		 32.79
(94.21 %)		 36,387
(5.81 %)		 72,923
(94.19 %)		 400,327
(3.60 %)		 306,656
(4.69 %)		 3,754,630
(39.24 %)		 26,578
(2.89 %)
499 pike-perch
GCF_008315115.1		 56,221
(8.23 %)		 15,677
(2.23 %)		 29,967
(5.65 %)		 62,989
(6.22 %)		 40.92
(100.00 %)		 94
(0.00 %)		 1,313
(100.00 %)		 591,660
(5.05 %)		 569,876
(7.39 %)		 4,713,605
(36.32 %)		 39,545
(1.93 %)
500 platypus (Pmale09 2018 BGI)
GCA_002966995.1		 n/a 15,042
(1.17 %)		 19,939
(1.55 %)		 n/a 46.64
(100.00 %)		 476
(0.00 %)		 4,568
(100.00 %)		 5,326,862
(52.88 %)		 879,598
(5.00 %)		 9,545,961
(50.95 %)		 94,468
(9.28 %)
501 platypus (Pmale09 v1 2019)
GCF_004115215.1		 56,695
(3.09 %)		 14,805
(1.26 %)		 18,918
(1.63 %)		 42,516
(2.60 %)		 46.13
(99.18 %)		 522
(0.82 %)		 305
(100.00 %)		 5,099,803
(51.62 %)		 577,434
(2.88 %)		 9,110,403
(48.91 %)		 87,829
(7.91 %)
502 platypus (Pmale09 v3 2020)
GCA_004115215.3		 n/a 14,805
(1.26 %)		 18,888
(1.63 %)		 n/a 46.14
(99.18 %)		 515
(0.82 %)		 322
(100.00 %)		 5,101,303
(51.62 %)		 578,617
(2.89 %)		 9,113,847
(48.93 %)		 87,861
(7.92 %)
503 polar bear (Baiyulong BGI 2014 genbank)
GCA_000687225.1		 35,751
(39.94 %)		 18,495
(1.67 %)		 15,243
(1.37 %)		 n/a 41.65
(98.35 %)		 110,343
(1.67 %)		 134,161
(98.33 %)		 4,221,025
(40.96 %)		 553,193
(1.29 %)		 13,765,526
(29.91 %)		 54,906
(1.17 %)
504 Porcisia hertigi (C119 2021 genbank)
GCA_017918235.1		 n/a 695
(1.21 %)		 2,951
(42.86 %)		 n/a 56.02
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 74
(100.00 %)		 41,628
(4.32 %)		 12,596
(4.67 %)		 201,002
(23.43 %)		 106
(99.30 %)
505 prehistoric monster fish (2019 genbank)
GCA_902500255.1		 45,404
(55.83 %)		 14,654
(0.76 %)		 72,609
(2.41 %)		 57,391
(2.04 %)		 41.99
(99.49 %)		 2,554
(0.51 %)		 464
(100.00 %)		 1,311,131
(2.79 %)		 786,401
(3.65 %)		 9,901,286
(59.90 %)		 172,199
(5.45 %)
506 pronghorn (BS35 2019 Broad)
GCA_004027515.1		 n/a 24,094
(1.34 %)		 35,119
(1.27 %)		 n/a 41.97
(99.87 %)		 6,569
(0.02 %)		 1,649,700
(99.98 %)		 5,613,563
(41.47 %)		 652,408
(1.55 %)		 13,943,055
(43.64 %)		 61,057
(1.17 %)
507 Przewalski's horse (Burgud 2014 genbank)
GCA_000696695.1		 45,076
(35.88 %)		 19,564
(1.68 %)		 22,124
(1.36 %)		 n/a 41.27
(99.13 %)		 80,963
(0.88 %)		 134,059
(99.12 %)		 3,917,534
(41.44 %)		 435,606
(1.73 %)		 14,738,354
(28.36 %)		 40,752
(0.94 %)
508 Puerto Rican coqui (hap1 2024 genbank)
GCA_035609145.1		 n/a 13,881
(0.57 %)		 32,313
(1.67 %)		 n/a 44.91
(100.00 %)		 659
(0.00 %)		 963
(100.00 %)		 1,044,181
(1.98 %)		 1,442,189
(16.51 %)		 14,710,175
(54.00 %)		 501,931
(8.81 %)
509 puma (SC36_Marlon 2018 genbank)
GCA_003327715.1		 25,575
(34.74 %)		 17,665
(1.56 %)		 16,565
(1.29 %)		 n/a 41.36
(95.34 %)		 178,992
(4.69 %)		 2,174
(100.00 %)		 4,884,619
(42.70 %)		 833,136
(1.76 %)		 13,705,706
(31.28 %)		 58,912
(1.65 %)
510 pygmy chimpanzee (Ulindi genbank 2015)
GCA_000258655.2		 59,332
(37.06 %)		 19,951
(1.94 %)		 19,039
(1.18 %)		 n/a 40.74
(82.95 %)		 156,797
(17.06 %)		 121,337
(82.94 %)		 5,136,492
(50.91 %)		 775,493
(1.63 %)		 15,570,612
(30.28 %)		 43,049
(0.71 %)
511 pygmy chimpanzee (v1 primary hap 2023)
GCF_029289425.1		 88,587
(3.87 %)		 20,765
(1.73 %)		 22,666
(1.18 %)		 n/a 40.49
(99.96 %)		 8
(0.04 %)		 443
(100.00 %)		 5,487,575
(50.65 %)		 1,054,555
(12.79 %)		 15,952,698
(43.80 %)		 53,329
(1.37 %)
512 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 1 2022 genbank)
GCA_026419965.1		 56,261
(41.31 %)		 18,495
(1.55 %)		 20,718
(1.32 %)		 n/a 42.05
(99.81 %)		 143
(0.19 %)		 580
(100.00 %)		 3,817,653
(34.51 %)		 758,297
(7.42 %)		 12,196,926
(39.96 %)		 101,353
(2.90 %)
513 rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 genbank)
GCA_009806435.2		 n/a 19,480
(1.31 %)		 23,335
(1.31 %)		 n/a 43.83
(97.68 %)		 18,178
(2.32 %)		 3,159
(100.00 %)		 4,179,975
(0.00 %)		 976,271
(2.33 %)		 13,766,353
(39.76 %)		 113,370
(2.46 %)
514 rabbit (primary hap 2024 genbank)
GCA_964237555.1		 n/a 19,386
(1.31 %)		 22,863
(1.35 %)		 n/a 44.02
(99.98 %)		 2,276
(0.02 %)		 222
(100.00 %)		 4,099,590
(21.20 %)		 1,062,902
(3.78 %)		 13,416,878
(41.72 %)		 116,524
(2.66 %)
515 rabbit (Thorbecke 2009 Broad genbank)
GCA_000003625.1		 n/a 18,676
(1.38 %)		 20,095
(1.24 %)		 n/a 43.75
(95.14 %)		 80,789
(4.88 %)		 84,024
(95.12 %)		 4,884,561
(44.65 %)		 883,943
(1.73 %)		 13,254,559
(38.27 %)		 110,338
(2.33 %)
516 radish (v1 WS10039 2015)
GCF_000801105.1		 69,941
(20.66 %)		 33,762
(10.20 %)		 70,765
(28.80 %)		 n/a 35.29
(87.22 %)		 28,041
(12.80 %)		 10,676
(100.00 %)		 196,483
(2.53 %)		 150,132
(3.32 %)		 2,256,858
(26.65 %)		 23,381
(2.80 %)
517 red admiral (genbank 2021)
GCA_905147765.2		 n/a 4,641
(1.20 %)		 13,258
(4.79 %)		 32,725
(10.42 %)		 32.84
(100.00 %)		 18
(0.00 %)		 142
(100.00 %)		 184,094
(2.52 %)		 41,639
(1.23 %)		 3,193,736
(41.82 %)		 10,747
(2.25 %)
518 red mason bee (LIB18336 2019)
GCF_004153925.1		 26,926
(16.13 %)		 4,185
(2.08 %)		 24,859
(11.07 %)		 n/a 39.77
(99.98 %)		 2,089
(0.02 %)		 10,222
(100.00 %)		 88,278
(1.96 %)		 74,016
(3.78 %)		 1,305,254
(28.61 %)		 10,712
(6.90 %)
519 red-crested turaco (2014 BGI)
GCF_000709365.1		 16,151
(2.15 %)		 12,046
(1.50 %)		 25,077
(1.98 %)		 n/a 41.63
(99.43 %)		 75,085
(0.59 %)		 134,672
(99.41 %)		 401,465
(6.41 %)		 153,694
(0.86 %)		 6,705,299
(20.45 %)		 30,183
(1.07 %)
520 red-legged seriema (BGI_N322 2014 BGI)
GCF_000690535.1		 16,238
(2.21 %)		 12,016
(1.53 %)		 23,985
(1.93 %)		 n/a 41.20
(99.63 %)		 59,230
(0.38 %)		 112,704
(99.62 %)		 322,026
(4.02 %)		 121,725
(0.68 %)		 6,797,850
(18.25 %)		 18,873
(0.62 %)
521 red-throated loon (hap2 2023 genbank)
GCA_030936135.1		 25,173
(40.74 %)		 13,218
(1.71 %)		 28,120
(2.39 %)		 n/a 43.11
(100.00 %)		 249
(0.00 %)		 1,195
(100.00 %)		 544,427
(8.81 %)		 223,674
(5.77 %)		 6,669,469
(23.63 %)		 38,306
(3.37 %)
522 reedfish (2019)
GCF_900747795.1		 40,545
(1.73 %)		 13,154
(0.46 %)		 24,028
(1.29 %)		 34,856
(1.34 %)		 39.44
(93.75 %)		 5,614
(6.25 %)		 1,885
(100.00 %)		 1,834,613
(2.79 %)		 1,018,031
(2.36 %)		 20,081,632
(44.56 %)		 88,254
(1.06 %)
523 Rhesus monkey (2015 Baylor)
GCA_000772875.3		 n/a 20,558
(1.71 %)		 22,141
(1.12 %)		 n/a 40.95
(97.08 %)		 64,538
(2.91 %)		 348,579
(97.09 %)		 5,846,699
(54.61 %)		 1,429,378
(9.24 %)		 16,512,587
(40.26 %)		 98,572
(1.29 %)
524 Rice's whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028023285.1		 59,888
(43.60 %)		 19,291
(1.53 %)		 21,195
(1.30 %)		 n/a 41.44
(99.90 %)		 334
(0.10 %)		 774
(100.00 %)		 3,917,923
(36.26 %)		 828,521
(9.28 %)		 12,518,796
(41.08 %)		 73,126
(1.69 %)
525 rifleman (BGI 2014)
GCF_000695815.1		 16,166
(2.37 %)		 12,054
(1.65 %)		 23,851
(2.04 %)		 n/a 41.63
(99.55 %)		 66,437
(0.46 %)		 120,312
(99.54 %)		 392,481
(7.69 %)		 217,040
(2.27 %)		 5,855,355
(18.33 %)		 7,602
(0.24 %)
526 ring-tailed lemur BS26 Broad 2019
GCA_004024665.1		 n/a 21,125
(1.90 %)		 29,864
(1.51 %)		 65,909
(1.91 %)		 41.13
(99.93 %)		 4,599
(0.02 %)		 580,026
(99.98 %)		 3,840,645
(39.25 %)		 675,921
(1.83 %)		 13,841,750
(31.45 %)		 59,440
(1.72 %)
527 Rio pearlfish (Nwh7 v1 2020)
GCF_014905685.1		 25,353
(3.88 %)		 14,334
(1.56 %)		 58,475
(4.46 %)		 n/a 41.06
(92.01 %)		 100,521
(8.02 %)		 18,998
(100.00 %)		 642,988
(3.38 %)		 444,158
(3.06 %)		 6,203,124
(42.81 %)		 52,308
(2.11 %)
528 rock pigeon (v1 racing homer maternal hap 2024)
GCA_036010775.1		 n/a 12,450
(1.75 %)		 25,274
(2.35 %)		 n/a 42.27
(100.00 %)		 192
(0.00 %)		 673
(100.00 %)		 586,422
(10.85 %)		 392,341
(12.38 %)		 5,521,172
(28.56 %)		 33,479
(3.29 %)
529 rock pigeon (v1 racing homer paternal W 2024)
GCA_036013475.1		 n/a 13,145
(1.66 %)		 28,883
(2.53 %)		 n/a 42.00
(100.00 %)		 248
(0.00 %)		 870
(100.00 %)		 656,923
(11.76 %)		 412,678
(12.92 %)		 6,047,578
(29.90 %)		 36,847
(3.12 %)
530 rock pigeon (v2 racing homer 2024 genbank)
GCA_036013475.2		 n/a 13,146
(1.66 %)		 25,463
(2.12 %)		 n/a 42.00
(100.00 %)		 249
(0.00 %)		 870
(100.00 %)		 656,969
(11.76 %)		 412,670
(12.92 %)		 6,047,584
(29.90 %)		 36,847
(3.12 %)
531 rock ptarmigan (primary hap 2022 genbank)
GCA_023343835.1		 51,619
(61.28 %)		 12,831
(2.31 %)		 n/a n/a 41.57
(99.99 %)		 210
(0.01 %)		 164
(100.00 %)		 667,924
(11.59 %)		 268,431
(2.63 %)		 5,885,274
(21.73 %)		 21,346
(2.37 %)
532 rose-grain aphid (CAU 2021 genbank)
GCA_019925205.1		 n/a 4,332
(0.82 %)		 15,532
(3.91 %)		 n/a 30.24
(99.98 %)		 240
(0.02 %)		 67
(100.00 %)		 481,097
(4.72 %)		 135,266
(7.01 %)		 4,093,473
(52.65 %)		 12,709
(2.68 %)
533 rough bullseye (RE-2024b hap1 2024 genbank)
GCA_042242105.1		 n/a 14,592
(2.84 %)		 44,299
(6.93 %)		 n/a 41.85
(100.00 %)		 87
(0.00 %)		 442
(100.00 %)		 1,764,545
(30.13 %)		 271,391
(5.93 %)		 3,651,092
(24.53 %)		 19,771
(1.39 %)
534 royal ground snake (hap1 2023 genbank)
GCA_031021105.1		 n/a 13,327
(0.96 %)		 20,347
(1.68 %)		 n/a 41.25
(99.99 %)		 1,391
(0.01 %)		 400
(100.00 %)		 1,983,903
(10.40 %)		 1,698,731
(7.29 %)		 9,084,707
(53.44 %)		 130,852
(4.47 %)
535 Ryukyu mouse (v1 2017 EBI genbank)
GCA_900094665.2		 53,779
(39.43 %)		 21,304
(2.26 %)		 18,211
(1.40 %)		 n/a 41.70
(89.05 %)		 306,650
(10.98 %)		 30,919
(92.71 %)		 4,878,260
(40.08 %)		 1,351,707
(2.59 %)		 12,965,226
(27.49 %)		 16,050
(0.44 %)
536 Ryukyu mouse (v1 2017 EBI refseq)
GCF_900094665.1		 53,855
(2.85 %)		 21,291
(2.26 %)		 19,256
(1.49 %)		 96,713
(4.05 %)		 41.70
(89.05 %)		 306,650
(10.98 %)		 30,920
(92.71 %)		 4,749,528
(39.06 %)		 1,351,707
(2.59 %)		 12,965,297
(27.49 %)		 16,050
(0.44 %)
537 saddleback dolphin (v1 primary hap 2023 genbank)
GCA_949987515.1		 46,746
(40.70 %)		 18,625
(1.49 %)		 20,451
(1.28 %)		 n/a 42.06
(99.99 %)		 968
(0.01 %)		 631
(100.00 %)		 4,020,682
(35.99 %)		 1,259,549
(13.09 %)		 12,359,818
(42.64 %)		 66,179
(3.91 %)
538 Saker falcon (bFalChe1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634085.1		 50,290
(50.75 %)		 12,971
(1.67 %)		 23,351
(2.02 %)		 n/a 43.15
(99.70 %)		 258
(0.30 %)		 282
(100.00 %)		 548,087
(7.21 %)		 201,482
(8.55 %)		 7,030,761
(24.94 %)		 31,791
(2.57 %)
539 salmon louse (v1.1 2020)
GCF_016086655.2		 27,164
(5.26 %)		 3,465
(0.45 %)		 3,673
(1.75 %)		 n/a 30.90
(99.99 %)		 608
(0.01 %)		 10,436
(99.99 %)		 1,394,872
(53.53 %)		 76,419
(1.13 %)		 6,311,228
(43.85 %)		 647
(0.04 %)
540 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027887145.1		 27,528
(42.80 %)		 12,832
(1.69 %)		 25,514
(2.23 %)		 n/a 43.50
(99.76 %)		 363
(0.24 %)		 282
(100.00 %)		 541,958
(3.43 %)		 566,692
(13.38 %)		 6,205,274
(28.98 %)		 35,549
(5.05 %)
541 San Diegan tiger whiptail (v1.0 HBS 135688 primary hap 2022)
GCA_023333525.1		 n/a 10,727
(1.18 %)		 14,669
(1.99 %)		 n/a 43.32
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 113
(100.00 %)		 741,937
(6.29 %)		 448,194
(5.60 %)		 7,227,870
(36.97 %)		 42,621
(2.15 %)
542 Sardinian treefrog (hap1 2023 genbank)
GCA_029499605.1		 108,406
(45.40 %)		 13,961
(0.46 %)		 36,603
(1.55 %)		 n/a 43.90
(99.99 %)		 2,297
(0.01 %)		 3,475
(100.00 %)		 1,903,658
(2.85 %)		 2,970,695
(16.56 %)		 15,354,615
(64.31 %)		 652,708
(8.36 %)
543 SARS-CoV-2 (Jan 2020 COVID-19)
GCF_009858895.2		 n/a n/a n/a n/a 37.98
(99.99 %)		 n/a 1
(100.00 %)		 5
(0.24 %)		 1
(0.11 %)		 33
(1.38 %)		 1
(0.73 %)
544 Schreibers' long-fingered bat (v1 hap1 2024)
GCA_964146895.1		 n/a 17,882
(1.96 %)		 21,291
(1.88 %)		 n/a 42.53
(99.99 %)		 1,322
(0.01 %)		 265
(100.00 %)		 2,639,522
(28.12 %)		 453,024
(5.66 %)		 10,206,715
(31.11 %)		 59,363
(2.86 %)
545 Schreibers' long-fingered bat (v1 hap2 2024)
GCA_964145185.1		 n/a 17,115
(2.05 %)		 19,972
(1.93 %)		 n/a 42.62
(99.99 %)		 1,137
(0.01 %)		 1,305
(99.99 %)		 2,445,695
(27.61 %)		 386,295
(4.40 %)		 9,657,997
(29.32 %)		 56,451
(2.93 %)
546 sea anemones (CC7 2015 genbank)
GCA_001417965.1		 29,778
(59.32 %)		 3,020
(1.06 %)		 13,146
(12.99 %)		 30,497
(24.04 %)		 36.33
(82.34 %)		 637,478
(17.95 %)		 4,312
(100.00 %)		 74,671
(1.98 %)		 63,328
(2.24 %)		 1,417,036
(20.33 %)		 2,099
(0.38 %)
547 sea lamprey (kPetMar1 primary hap 2020)
GCA_010993605.1		 n/a 8,130
(0.73 %)		 36,343
(4.06 %)		 n/a 48.31
(98.62 %)		 930
(1.38 %)		 1,433
(100.00 %)		 3,309,659
(59.73 %)		 1,194,161
(21.47 %)		 5,320,564
(50.50 %)		 178,590
(35.88 %)
548 sea otter (GAN:26980312 2017 genbank)
GCA_002288905.2		 n/a 18,591
(1.64 %)		 20,913
(1.44 %)		 34,142
(1.77 %)		 41.56
(98.79 %)		 23,134
(1.21 %)		 29,588
(98.79 %)		 4,702,292
(41.42 %)		 721,749
(1.39 %)		 14,065,592
(32.89 %)		 55,388
(1.87 %)
549 segmented worms (v1 2012)
GCF_000326865.1		 23,426
(13.46 %)		 2,741
(0.95 %)		 3,156
(4.19 %)		 n/a 32.82
(91.54 %)		 11,185
(8.47 %)		 12,292
(91.53 %)		 572,062
(30.90 %)		 474,390
(10.49 %)		 1,741,644
(44.75 %)		 3,489
(0.51 %)
550 siamang (v1 Jambi primary hap 2023)
GCF_028878055.1		 79,118
(2.62 %)		 20,139
(1.70 %)		 21,232
(1.14 %)		 n/a 40.62
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 606
(100.00 %)		 5,278,880
(55.89 %)		 946,219
(14.68 %)		 14,395,605
(46.26 %)		 95,573
(1.75 %)
551 siamang (v2 Jambi alternate hap 2024)
GCA_028878085.2		 n/a 19,572
(1.70 %)		 20,107
(1.11 %)		 n/a 40.45
(99.93 %)		 3
(0.07 %)		 40
(100.00 %)		 5,057,491
(55.54 %)		 869,279
(15.07 %)		 14,090,400
(46.04 %)		 87,907
(1.41 %)
552 siamang (v2 Jambi primary hap 2024 genbank)
GCA_028878055.2		 105,360
(44.53 %)		 20,433
(1.69 %)		 21,357
(1.12 %)		 n/a 40.42
(99.97 %)		 1
(0.03 %)		 26
(100.00 %)		 5,354,441
(55.80 %)		 935,620
(14.70 %)		 14,917,483
(46.01 %)		 92,243
(1.42 %)
553 siamang (v2 Jambi primary hap 2024 refseq)
GCF_028878055.2		 105,373
(3.05 %)		 20,434
(1.69 %)		 21,357
(1.12 %)		 n/a 40.42
(99.97 %)		 2
(0.03 %)		 27
(100.00 %)		 5,354,446
(55.80 %)		 935,620
(14.70 %)		 14,917,515
(46.01 %)		 92,243
(1.42 %)
554 silvery gibbon (v1 HM0894 2020 UC Santa Cruz)
GCF_009828535.1		 54,238
(2.74 %)		 17,887
(2.00 %)		 18,517
(1.25 %)		 n/a 41.17
(98.20 %)		 18,567
(1.80 %)		 18,392
(100.00 %)		 4,399,357
(50.55 %)		 711,948
(2.37 %)		 12,623,705
(36.55 %)		 67,835
(1.30 %)
555 silvery gibbon (v2 HMO894 2020 UC Santa Cruz)
GCF_009828535.2		 63,475
(2.65 %)		 20,581
(1.94 %)		 21,181
(1.20 %)		 41,252
(1.46 %)		 41.02
(97.81 %)		 25,106
(2.19 %)		 18,395
(100.00 %)		 5,332,131
(51.09 %)		 857,562
(2.26 %)		 15,565,289
(36.84 %)		 80,124
(1.26 %)
556 slow loris (BS32 2019)
GCA_004027815.1		 n/a 26,771
(1.11 %)		 44,247
(1.00 %)		 n/a 40.68
(99.86 %)		 9,648
(0.03 %)		 1,946,791
(99.97 %)		 6,230,312
(41.68 %)		 688,924
(1.23 %)		 16,892,392
(43.00 %)		 39,326
(0.65 %)
557 slow loris (primary hap 2022 genbank)
GCA_027406575.1		 67,213
(41.75 %)		 22,195
(1.49 %)		 21,341
(1.28 %)		 n/a 40.82
(99.86 %)		 218
(0.14 %)		 85
(100.00 %)		 4,625,875
(39.88 %)		 579,984
(1.59 %)		 14,405,402
(40.78 %)		 38,257
(0.77 %)
558 small Madagascar hedgehog
GCA_000313985.1		 n/a 19,066
(1.18 %)		 19,334
(1.31 %)		 n/a 43.01
(88.44 %)		 269,444
(11.60 %)		 277,845
(88.40 %)		 3,789,866
(28.89 %)		 429,318
(0.87 %)		 16,950,647
(32.23 %)		 39,994
(0.70 %)
559 smaller spotted catshark (v1.1 primary hap 2020 refseq)
GCF_902713615.1		 55,749
(1.62 %)		 12,597
(0.36 %)		 23,987
(1.08 %)		 n/a 47.65
(98.48 %)		 7,146
(1.52 %)		 646
(100.00 %)		 1,185,832
(1.72 %)		 1,448,620
(6.25 %)		 20,884,767
(51.41 %)		 456,658
(8.18 %)
560 smalleye Pacific opah (hap2 2023 genbank)
GCA_029633865.1		 n/a 13,617
(1.10 %)		 74,639
(4.12 %)		 n/a 44.94
(99.96 %)		 3,115
(0.04 %)		 544
(100.00 %)		 4,603,649
(53.23 %)		 1,009,241
(18.00 %)		 5,236,063
(51.65 %)		 143,632
(7.43 %)
561 smalltooth sawfish (v2 primary hap 2019 genbank)
GCA_009764475.1		 n/a 11,828
(0.66 %)		 18,627
(1.55 %)		 n/a 42.38
(99.09 %)		 698
(0.91 %)		 173
(100.00 %)		 405,021
(1.14 %)		 391,531
(1.52 %)		 11,282,302
(38.19 %)		 45,398
(1.34 %)
562 snowberry fruit fly (East Lansing v1.0 2016)
GCF_001687245.1		 37,836
(4.45 %)		 10,526
(1.07 %)		 59,331
(6.34 %)		 n/a 36.53
(93.84 %)		 227,684
(6.18 %)		 139,583
(93.83 %)		 653,914
(2.87 %)		 386,956
(5.71 %)		 7,364,314
(43.00 %)		 60,636
(4.05 %)
563 sockeye salmon (On170113-E2 v1 2019)
GCF_006149115.1		 76,167
(6.12 %)		 24,114
(1.71 %)		 51,371
(4.08 %)		 102,891
(5.24 %)		 43.39
(96.16 %)		 25,659
(3.84 %)		 38,027
(99.99 %)		 1,300,179
(8.96 %)		 1,465,690
(10.81 %)		 8,849,714
(48.44 %)		 64,215
(1.55 %)
564 South Georgia icefish (v1 primary hap 2020)
GCF_902827115.1		 41,307
(6.47 %)		 14,776
(1.79 %)		 68,734
(6.16 %)		 61,643
(5.52 %)		 42.07
(99.94 %)		 2,461
(0.06 %)		 1,563
(100.00 %)		 498,451
(3.42 %)		 474,032
(7.20 %)		 3,613,731
(45.83 %)		 88,984
(4.31 %)
565 southern bluefin tuna (primary hap 2021 genbank)
GCA_910596095.1		 58,416
(66.24 %)		 15,695
(2.61 %)		 42,730
(5.74 %)		 n/a 39.73
(100.00 %)		 95
(0.00 %)		 58
(100.00 %)		 1,591,314
(33.50 %)		 247,764
(2.94 %)		 5,176,850
(26.85 %)		 14,097
(0.88 %)
566 southern cattle tick (Rmic-2018 2020 genbank)
GCA_013339725.1		 n/a 3,698
(0.12 %)		 117,910
(5.00 %)		 35,315
(1.88 %)		 45.79
(99.99 %)		 1,576
(0.01 %)		 7,048
(100.00 %)		 770,997
(2.03 %)		 680,149
(3.55 %)		 10,994,272
(39.37 %)		 304,620
(17.03 %)
567 southern grasshopper mouse (US017 2019 Broad)
GCA_004026725.1		 n/a 24,302
(1.12 %)		 43,055
(0.98 %)		 n/a 41.63
(99.82 %)		 10,550
(0.03 %)		 2,272,285
(99.97 %)		 5,668,964
(24.75 %)		 1,628,683
(5.38 %)		 15,658,806
(41.85 %)		 21,801
(0.44 %)
568 southern house mosquito (JHB 2007 genbank)
GCA_000209185.1		 n/a 5,905
(1.14 %)		 41,195
(8.84 %)		 n/a 37.42
(93.28 %)		 45,500
(6.75 %)		 48,671
(93.25 %)		 738,398
(35.22 %)		 171,041
(5.71 %)		 3,037,349
(50.41 %)		 65,784
(9.49 %)
569 southern tamandua (Broad 2019)
GCA_004025105.1		 n/a 25,638
(0.82 %)		 49,782
(0.86 %)		 n/a 39.53
(99.88 %)		 5,819
(0.02 %)		 2,150,023
(99.98 %)		 6,033,640
(37.10 %)		 708,890
(0.99 %)		 22,371,532
(41.88 %)		 80,897
(1.09 %)
570 southern two-toed sloth (US054 2019 Broad)
GCA_004027855.1		 n/a 25,877
(0.78 %)		 56,071
(0.82 %)		 n/a 39.82
(99.84 %)		 5,099
(0.02 %)		 2,537,432
(99.98 %)		 5,384,587
(37.86 %)		 724,925
(2.20 %)		 19,492,096
(41.12 %)		 55,674
(0.90 %)
571 southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 genbank)
GCA_000283155.1		 37,037
(37.57 %)		 18,551
(1.79 %)		 19,747
(1.44 %)		 n/a 40.90
(96.05 %)		 54,737
(3.96 %)		 57,823
(96.04 %)		 3,824,807
(39.33 %)		 421,693
(0.97 %)		 14,765,476
(28.93 %)		 36,281
(1.02 %)
572 soybean (US DOE JGI-PGF v2.0 2010)
GCF_000004515.4		 82,440
(9.65 %)		 27,682
(3.07 %)		 77,218
(11.84 %)		 n/a 34.77
(97.65 %)		 15,955
(2.35 %)		 17,146
(97.65 %)		 834,646
(37.35 %)		 436,219
(5.65 %)		 5,341,660
(45.30 %)		 35,897
(1.56 %)
573 soybean (US DOE JGI-PGF v2.1 2018)
GCF_000004515.5		 85,123
(9.72 %)		 27,647
(3.06 %)		 77,190
(11.83 %)		 n/a 34.77
(97.65 %)		 15,995
(2.36 %)		 17,187
(97.64 %)		 834,651
(37.35 %)		 436,225
(5.65 %)		 5,341,721
(45.30 %)		 35,897
(1.47 %)
574 speckled mousebird (hap1 2023 genbank)
GCA_028858725.1		 n/a 11,956
(1.78 %)		 25,177
(2.60 %)		 n/a 42.38
(99.48 %)		 143
(0.52 %)		 189
(100.00 %)		 523,056
(12.47 %)		 243,547
(3.72 %)		 5,408,003
(23.43 %)		 25,552
(2.34 %)
575 speckled mousebird (v1 hap2 2023)
GCA_028858625.1		 n/a 13,169
(1.74 %)		 26,896
(2.47 %)		 n/a 42.62
(99.56 %)		 151
(0.44 %)		 243
(100.00 %)		 570,907
(11.75 %)		 317,226
(6.96 %)		 5,854,600
(25.51 %)		 28,905
(2.31 %)
576 speckled wood butterfly (genbank 2021)
GCA_905163445.1		 21,720
(55.73 %)		 4,713
(0.87 %)		 17,002
(4.33 %)		 29,238
(7.81 %)		 35.99
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 71
(100.00 %)		 304,077
(2.97 %)		 110,835
(4.09 %)		 3,704,355
(44.42 %)		 28,108
(2.75 %)
577 sperm whale (SW-GA 2019)
GCF_002837175.2		 60,921
(2.59 %)		 19,527
(1.73 %)		 25,114
(1.51 %)		 n/a 41.39
(95.90 %)		 128,928
(4.12 %)		 143,605
(95.88 %)		 4,365,057
(42.78 %)		 694,673
(2.40 %)		 13,518,590
(32.76 %)		 94,152
(2.52 %)
578 sponges A.queenslandica (v1.0 2010 JGI-PGF)
GCF_000090795.1		 31,248
(25.26 %)		 2,167
(1.08 %)		 6,648
(9.22 %)		 n/a 35.83
(86.92 %)		 14,944
(13.10 %)		 27,972
(86.90 %)		 108,973
(4.04 %)		 70,563
(4.66 %)		 881,116
(24.58 %)		 668
(0.62 %)
579 stable fly (8C7A2A5H3J4 2015 genbank)
GCA_001015335.1		 n/a 7,737
(1.16 %)		 11,972
(2.65 %)		 n/a 38.85
(84.55 %)		 129,113
(15.50 %)		 125,702
(84.50 %)		 310,342
(1.75 %)		 391,619
(8.42 %)		 5,616,633
(48.71 %)		 38,246
(1.55 %)
580 sterlet (maternal hap 2022 genbank)
GCA_902713425.1		 n/a 22,306
(1.80 %)		 33,366
(4.09 %)		 n/a 39.56
(99.99 %)		 402
(0.01 %)		 245
(100.00 %)		 1,126,738
(3.36 %)		 889,853
(6.73 %)		 8,766,715
(39.22 %)		 51,356
(1.84 %)
581 sterlet (maternal hap 2022 genbank)
GCA_902713425.2		 n/a 25,364
(1.76 %)		 40,452
(4.10 %)		 n/a 40.11
(100.00 %)		 433
(0.00 %)		 1,731
(100.00 %)		 4,055,215
(43.14 %)		 1,124,096
(10.13 %)		 9,426,172
(41.81 %)		 64,522
(2.85 %)
582 sterlet (v1 Gen_M01 2020)
GCF_010645085.1		 73,251
(5.76 %)		 24,411
(1.72 %)		 39,637
(3.96 %)		 n/a 39.76
(99.93 %)		 6,283
(0.07 %)		 3,404
(100.00 %)		 1,269,345
(3.50 %)		 1,095,665
(6.81 %)		 10,007,602
(39.30 %)		 60,475
(1.95 %)
583 sterlet (v1 paternal hap 2020)
GCA_902713435.1		 n/a 22,718
(1.81 %)		 34,093
(4.15 %)		 57,768
(4.88 %)		 39.60
(100.00 %)		 422
(0.01 %)		 224
(100.00 %)		 1,145,503
(3.39 %)		 912,936
(6.84 %)		 8,839,174
(39.17 %)		 52,560
(1.82 %)
584 stony coral S.pistillata (v1 CSM Monaco 2017)
GCF_002571385.1		 36,135
(16.45 %)		 3,324
(0.70 %)		 20,909
(10.93 %)		 38,198
(17.00 %)		 38.54
(89.50 %)		 49,077
(10.54 %)		 5,688
(100.00 %)		 111,077
(1.70 %)		 108,732
(2.95 %)		 2,009,396
(21.40 %)		 6,012
(0.58 %)
585 striped catfish (primary hap 2022 genbank)
GCA_027358585.1		 53,859
(65.52 %)		 16,035
(2.86 %)		 41,619
(5.48 %)		 n/a 38.99
(99.49 %)		 236
(0.51 %)		 59
(100.00 %)		 1,870,238
(37.80 %)		 605,571
(6.82 %)		 5,059,499
(32.43 %)		 17,919
(1.29 %)
586 sudden oak death agent (Pr-102 primary hap 2021 genbank)
GCA_020800215.1		 n/a 1,461
(1.76 %)		 22,413
(61.13 %)		 n/a 54.37
(99.66 %)		 50
(0.34 %)		 28
(100.00 %)		 8,935
(0.72 %)		 9,528
(3.65 %)		 117,380
(14.16 %)		 34
(99.96 %)
587 Sumatran orangutan (Susie 2018 genbank)
GCA_002880775.3		 n/a 20,174
(1.79 %)		 20,994
(1.15 %)		 47,806
(1.68 %)		 40.80
(99.29 %)		 553
(0.70 %)		 5,813
(99.30 %)		 5,497,148
(54.41 %)		 1,048,361
(8.01 %)		 15,948,575
(40.68 %)		 39,481
(0.87 %)
588 Sumatran orangutan (v1 AG06213 primary hap 2023)
GCF_028885655.1		 98,046
(3.46 %)		 21,162
(1.68 %)		 21,714
(1.13 %)		 n/a 41.13
(99.79 %)		 59
(0.21 %)		 2,670
(99.79 %)		 5,730,768
(55.05 %)		 1,175,314
(11.19 %)		 16,323,507
(44.05 %)		 55,799
(2.08 %)
589 Swainson's thrush (bCatUst1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009819505.1		 n/a 13,403
(1.85 %)		 27,456
(2.48 %)		 n/a 42.86
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 3,601
(100.00 %)		 497,374
(5.78 %)		 649,859
(4.89 %)		 6,740,713
(22.65 %)		 49,076
(3.54 %)
590 Swainson's thrush (v1 primary hap 2019)
GCF_009819885.1		 40,128
(5.45 %)		 13,016
(1.88 %)		 24,787
(2.41 %)		 30,064
(2.94 %)		 42.48
(98.86 %)		 428
(1.14 %)		 161
(100.00 %)		 483,978
(5.85 %)		 589,859
(4.32 %)		 6,708,638
(22.44 %)		 49,404
(3.53 %)
591 swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028018845.1		 29,544
(46.92 %)		 12,375
(1.75 %)		 24,577
(2.31 %)		 n/a 43.08
(99.89 %)		 236
(0.11 %)		 40
(100.00 %)		 419,473
(3.09 %)		 439,909
(7.61 %)		 6,077,743
(24.47 %)		 32,064
(3.27 %)
592 tammar wallaby (v1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028372415.1		 n/a 17,652
(0.77 %)		 15,774
(0.88 %)		 n/a 38.73
(99.81 %)		 515
(0.19 %)		 315
(100.00 %)		 5,836,160
(26.14 %)		 1,193,709
(2.72 %)		 22,682,658
(39.52 %)		 23,629
(0.48 %)
593 tammar wallaby (v2 primary hap 2023 genbank)
GCA_028372415.2		 n/a 17,617
(0.77 %)		 15,414
(0.86 %)		 n/a 38.73
(99.81 %)		 515
(0.19 %)		 273
(100.00 %)		 5,866,321
(26.30 %)		 1,193,604
(2.72 %)		 22,677,517
(39.53 %)		 23,590
(0.47 %)
594 Tasmanian devil
GCF_000189315.1		 32,527
(1.79 %)		 16,112
(0.84 %)		 16,152
(0.94 %)		 n/a 36.05
(92.36 %)		 201,403
(7.66 %)		 237,291
(92.34 %)		 6,766,259
(42.85 %)		 1,240,681
(2.07 %)		 20,998,733
(36.61 %)		 23,155
(0.38 %)
595 thale cress (tair10 Columbia 2011)
GCF_000001735.3		 53,828
(40.09 %)		 26,552
(34.12 %)		 25,867
(35.78 %)		 n/a 36.06
(99.85 %)		 357
(0.16 %)		 7
(100.00 %)		 67,353
(16.32 %)		 27,063
(2.77 %)		 749,020
(22.64 %)		 4,599
(1.63 %)
596 thirteen-lined ground squirrel (2011)
GCF_000236235.1		 41,886
(2.61 %)		 19,165
(1.70 %)		 18,102
(1.44 %)		 n/a 39.91
(93.27 %)		 141,005
(6.75 %)		 153,488
(93.25 %)		 4,378,557
(36.61 %)		 640,337
(1.64 %)		 14,116,066
(27.91 %)		 28,321
(0.64 %)
597 thorny skate (v1 CabotCenter1 v1 2020 refseq)
GCF_010909765.1		 45,969
(2.40 %)		 11,433
(0.60 %)		 26,341
(1.72 %)		 32,017
(1.87 %)		 44.30
(92.54 %)		 3,753
(7.46 %)		 957
(100.00 %)		 865,711
(2.57 %)		 1,176,348
(3.79 %)		 9,964,038
(52.25 %)		 242,676
(4.73 %)
598 thorny skate (v1 primary hap CabotCenter1 2020 genbank)
GCA_010909765.1		 45,969
(46.35 %)		 11,434
(0.60 %)		 26,342
(1.72 %)		 32,017
(1.87 %)		 44.30
(92.54 %)		 3,753
(7.46 %)		 958
(100.00 %)		 866,598
(2.58 %)		 1,176,350
(3.79 %)		 9,964,083
(52.25 %)		 242,676
(4.73 %)
599 tick D.silvarum (v1 2020)
GCF_013339745.1		 36,084
(1.94 %)		 4,032
(0.13 %)		 128,567
(5.82 %)		 43,960
(2.05 %)		 46.91
(99.95 %)		 13,519
(0.05 %)		 1,665
(100.00 %)		 1,116,542
(2.95 %)		 642,860
(3.16 %)		 10,429,455
(39.18 %)		 37,849
(2.30 %)
600 tidepool copepod (San Diego 2019 genbank)
GCA_007210705.1		 23,429
(54.20 %)		 3,517
(1.61 %)		 18,910
(15.71 %)		 n/a 42.18
(97.94 %)		 14,007
(2.09 %)		 459
(100.00 %)		 52,042
(1.17 %)		 27,065
(1.23 %)		 928,666
(18.11 %)		 15,823
(5.51 %)
601 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022 genbank)
GCA_026437365.1		 n/a 14,276
(1.78 %)		 66,576
(6.32 %)		 n/a 42.96
(99.99 %)		 794
(0.01 %)		 820
(100.00 %)		 2,127,818
(38.86 %)		 708,255
(30.28 %)		 3,809,452
(49.66 %)		 101,682
(8.04 %)
602 tiger tail seahorse (QL1 v1 2016)
GCF_001891065.1		 47,041
(13.29 %)		 13,817
(3.76 %)		 32,943
(8.81 %)		 n/a 43.30
(93.04 %)		 23,101
(6.97 %)		 60,478
(93.03 %)		 359,724
(3.91 %)		 155,380
(3.35 %)		 2,811,700
(24.51 %)		 61,685
(7.72 %)
603 tomato (v3.0 Heinz 1706 2018)
GCF_000188115.4		 46,014
(6.94 %)		 15,396
(2.15 %)		 38,462
(7.56 %)		 n/a 34.12
(90.18 %)		 19,634
(9.83 %)		 3,150
(100.00 %)		 417,162
(18.21 %)		 229,803
(3.18 %)		 5,370,478
(35.28 %)		 25,279
(1.28 %)
604 tourmaline sunangel (hap1 2024 genbank)
GCA_036169615.1		 n/a 12,509
(1.97 %)		 21,020
(2.33 %)		 n/a 41.63
(99.99 %)		 437
(0.01 %)		 131
(100.00 %)		 532,267
(5.46 %)		 332,284
(2.69 %)		 6,084,978
(21.20 %)		 19,080
(1.72 %)
605 trahira (v1 hap1 2023)
GCA_029633855.1		 n/a 16,039
(2.06 %)		 44,287
(4.38 %)		 n/a 40.99
(92.91 %)		 867
(7.09 %)		 597
(100.00 %)		 2,228,831
(30.95 %)		 687,495
(13.85 %)		 5,309,097
(36.70 %)		 27,070
(2.09 %)
606 trahira (v1 hap2 2023)
GCA_029633875.1		 n/a 16,216
(2.00 %)		 45,209
(4.32 %)		 n/a 41.03
(96.02 %)		 907
(3.98 %)		 452
(100.00 %)		 2,280,303
(30.80 %)		 708,327
(15.59 %)		 5,394,248
(39.01 %)		 28,386
(2.18 %)
607 tricolored blackbird (1412-34295 primary hap 2022 genbank)
GCA_023055355.1		 n/a 12,867
(1.81 %)		 26,393
(2.48 %)		 n/a 42.85
(100.00 %)		 97
(0.00 %)		 311
(100.00 %)		 429,011
(3.16 %)		 564,849
(5.52 %)		 6,336,716
(23.32 %)		 33,378
(2.70 %)
608 Trypanosoma equiperdum (OVI 2016 genbank)
GCA_001457755.2		 n/a 576
(1.36 %)		 2,999
(35.93 %)		 n/a 45.94
(99.65 %)		 6,447
(0.44 %)		 2,026
(100.00 %)		 16,807
(2.60 %)		 3,925
(0.79 %)		 141,656
(16.64 %)		 4,877
(34.82 %)
609 Trypanosoma melophagium (St. Kilda St. Kilda 2022 genbank)
GCA_022059095.1		 n/a 742
(1.83 %)		 848
(40.20 %)		 n/a 41.23
(100.00 %)		 n/a 64
(100.00 %)		 39,141
(7.68 %)		 14,366
(6.71 %)		 131,898
(25.19 %)		 4,119
(14.82 %)
610 tsetse fly (v1 IAEA_lab_2018 2020)
GCF_014805625.1		 24,334
(8.13 %)		 7,223
(2.32 %)		 6,632
(3.62 %)		 n/a 33.80
(97.46 %)		 9,688
(2.55 %)		 7,986
(100.00 %)		 418,532
(4.76 %)		 185,734
(2.26 %)		 3,090,742
(35.34 %)		 3,487
(0.58 %)
611 Tungara frog (aEngPut4 maternal hap 2024 genbank)
GCA_040894005.1		 n/a 13,678
(0.88 %)		 29,720
(2.41 %)		 n/a 43.19
(100.00 %)		 436
(0.00 %)		 961
(100.00 %)		 734,036
(2.54 %)		 1,217,326
(21.42 %)		 8,925,883
(52.53 %)		 211,590
(5.08 %)
612 Ugandan red Colobus (RC106 v1 2017)
GCA_002776525.1		 n/a 21,053
(1.88 %)		 23,024
(1.24 %)		 n/a 40.68
(96.59 %)		 77,615
(3.42 %)		 47,644
(100.00 %)		 5,478,730
(51.13 %)		 969,126
(2.63 %)		 16,127,854
(36.40 %)		 63,965
(1.04 %)
613 Ugandan red Colobus (RC106 v2 2018)
GCF_002776525.2		 66,965
(2.69 %)		 21,958
(1.85 %)		 24,388
(1.22 %)		 55,722
(1.95 %)		 40.60
(97.10 %)		 63,620
(2.91 %)		 47,449
(100.00 %)		 5,699,639
(51.61 %)		 1,066,606
(2.87 %)		 16,603,622
(37.49 %)		 71,084
(1.08 %)
614 Ugandan red Colobus (RC106 v3 2019)
GCF_002776525.3		 68,173
(2.68 %)		 21,804
(1.85 %)		 23,385
(1.18 %)		 n/a 40.60
(97.10 %)		 64,415
(2.91 %)		 46,654
(100.00 %)		 5,700,226
(51.61 %)		 1,066,759
(2.88 %)		 16,603,818
(37.49 %)		 71,078
(1.08 %)
615 Ugandan red Colobus (RC106 v4 2019)
GCF_002776525.4		 63,704
(2.55 %)		 21,347
(1.86 %)		 23,056
(1.19 %)		 n/a 40.84
(97.07 %)		 57,757
(2.93 %)		 34,372
(100.00 %)		 5,504,117
(51.70 %)		 961,351
(2.75 %)		 16,208,033
(37.10 %)		 71,046
(1.10 %)
616 Upper Galilee mountains blind mole rat (#2095 2014 genbank)
GCA_000622305.1		 54,667
(35.81 %)		 19,685
(1.25 %)		 21,268
(1.20 %)		 n/a 41.26
(95.18 %)		 201,121
(4.83 %)		 356,096
(95.17 %)		 6,165,270
(34.95 %)		 1,197,778
(2.77 %)		 16,282,333
(36.21 %)		 22,905
(0.49 %)
617 valley oak (v3.0 2019)
GCF_001633185.1		 63,555
(8.16 %)		 16,886
(1.90 %)		 72,876
(14.48 %)		 n/a 35.38
(99.77 %)		 1,674
(0.23 %)		 2,010
(100.00 %)		 800,389
(3.72 %)		 460,244
(7.41 %)		 5,439,256
(37.83 %)		 19,635
(1.10 %)
618 vegetable marrow (v1 mu-cu-16 2017)
GCF_002806865.1		 48,870
(21.91 %)		 19,421
(7.41 %)		 36,314
(20.76 %)		 n/a 36.49
(94.25 %)		 49,649
(5.76 %)		 25,263
(100.00 %)		 182,696
(3.35 %)		 143,269
(7.40 %)		 1,620,517
(29.12 %)		 13,323
(2.49 %)
619 velvet spider S.dumicola (v1 Namibia, Etosha 2020)
GCF_010614865.1		 34,675
(2.01 %)		 3,329
(0.10 %)		 24,015
(1.20 %)		 n/a 33.26
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 16,531
(100.00 %)		 1,258,301
(2.08 %)		 828,332
(2.42 %)		 17,994,342
(48.98 %)		 63,015
(0.95 %)
620 wasp C.solmsi marchali (v1 2013)
GCF_000503995.1		 13,201
(7.14 %)		 3,474
(1.25 %)		 15,142
(4.89 %)		 n/a 30.36
(99.55 %)		 7,471
(0.46 %)		 9,928
(99.54 %)		 340,841
(7.52 %)		 251,386
(3.99 %)		 2,448,273
(49.27 %)		 16,346
(4.08 %)
621 water buffalo (Mediterranean 2013)
GCA_000471725.1		 n/a 20,245
(1.49 %)		 24,230
(1.29 %)		 n/a 42.11
(97.39 %)		 263,385
(2.62 %)		 630,367
(97.38 %)		 5,997,926
(47.35 %)		 466,019
(1.02 %)		 13,822,739
(40.29 %)		 93,080
(1.71 %)
622 Weddell seal (WS11-02 2013 genbank)
GCA_000349705.1		 48,251
(30.18 %)		 21,044
(1.72 %)		 22,320
(1.43 %)		 n/a 41.39
(70.44 %)		 152,836
(29.58 %)		 169,546
(70.42 %)		 4,420,479
(41.72 %)		 471,250
(0.66 %)		 13,410,191
(22.09 %)		 48,738
(1.01 %)
623 western European hedgehog (2012 genbank)
GCA_000296755.1		 29,923
(35.25 %)		 18,034
(1.33 %)		 19,779
(1.35 %)		 n/a 41.54
(85.94 %)		 219,764
(14.09 %)		 225,566
(85.91 %)		 6,527,125
(45.87 %)		 1,271,531
(2.29 %)		 12,374,069
(42.02 %)		 28,528
(0.71 %)
624 western European hedgehog (primary hap 2023 genbank)
GCA_950295315.1		 61,103
(44.10 %)		 18,126
(1.16 %)		 21,345
(1.28 %)		 n/a 42.00
(99.97 %)		 3,760
(0.03 %)		 1,175
(100.00 %)		 4,891,344
(19.68 %)		 1,507,933
(3.81 %)		 12,571,193
(54.50 %)		 32,667
(0.90 %)
625 western European house mouse (WSB_EiJ v1 2016)
GCA_001624835.1		 n/a 20,870
(2.26 %)		 18,535
(1.45 %)		 100,622
(4.22 %)		 41.80
(84.36 %)		 399,976
(15.70 %)		 72,315
(94.81 %)		 4,961,700
(39.53 %)		 1,345,987
(2.51 %)		 13,324,808
(25.23 %)		 16,556
(0.40 %)
626 western flower thrips (v2 FOCC.00 2017)
GCF_000697945.2		 24,277
(14.78 %)		 4,066
(1.46 %)		 26,743
(11.40 %)		 n/a 51.10
(94.72 %)		 60,375
(5.31 %)		 34,226
(94.71 %)		 275,482
(4.88 %)		 167,812
(3.67 %)		 1,832,537
(24.44 %)		 26,406
(36.85 %)
627 western lowland gorilla (Susie 2016)
GCA_900006655.3		 n/a 20,323
(1.77 %)		 22,069
(1.15 %)		 n/a 40.71
(99.64 %)		 768
(0.36 %)		 16,065
(99.64 %)		 5,373,630
(50.30 %)		 1,025,389
(10.17 %)		 15,954,613
(41.78 %)		 53,557
(1.01 %)
628 western lowland gorilla (v1.1 KB3781 2023)
GCF_029281585.1		 101,242
(3.18 %)		 20,994
(1.57 %)		 41,945
(1.53 %)		 n/a 40.59
(99.85 %)		 38
(0.15 %)		 637
(100.00 %)		 5,526,927
(51.16 %)		 1,080,693
(20.38 %)		 15,929,020
(48.46 %)		 76,432
(1.35 %)
629 western lowland gorilla (v2.0 KB3781 2024 genbank)
GCA_029281585.2		 98,415
(41.67 %)		 21,010
(1.59 %)		 50,696
(1.83 %)		 n/a 40.49
(99.94 %)		 2
(0.06 %)		 25
(100.00 %)		 5,456,267
(50.77 %)		 1,060,267
(19.55 %)		 15,870,191
(47.77 %)		 69,745
(1.19 %)
630 western lowland gorilla (v2.1 KB3781 2024 genbank)
GCA_029281585.3		 n/a 21,010
(1.59 %)		 50,695
(1.83 %)		 n/a 40.49
(99.94 %)		 2
(0.06 %)		 26
(100.00 %)		 5,456,271
(50.77 %)		 1,060,267
(19.55 %)		 15,870,225
(47.77 %)		 69,745
(1.19 %)
631 western painted turtle (v303 2014)
GCF_000241765.3		 51,681
(3.25 %)		 15,203
(1.04 %)		 22,272
(1.67 %)		 46,230
(2.32 %)		 44.19
(91.88 %)		 183,744
(8.14 %)		 262,326
(91.86 %)		 2,767,141
(30.92 %)		 316,971
(0.98 %)		 11,856,824
(28.95 %)		 104,231
(1.84 %)
632 western painted turtle (v304 RCT428 2020)
GCF_000241765.4		 64,798
(3.75 %)		 15,669
(1.09 %)		 21,663
(1.64 %)		 n/a 44.19
(87.54 %)		 184,311
(12.48 %)		 260,698
(87.52 %)		 3,780,252
(41.81 %)		 316,422
(0.93 %)		 11,852,305
(27.59 %)		 103,899
(1.75 %)
633 western predatory mite (v1.0 2012)
GCF_000255335.1		 12,199
(13.86 %)		 2,842
(1.49 %)		 27,198
(19.18 %)		 n/a 51.58
(99.74 %)		 1,901
(0.26 %)		 3,993
(99.74 %)		 33,136
(1.10 %)		 13,115
(0.57 %)		 612,854
(9.73 %)		 2,003
(54.71 %)
634 western wild mouse (SPRET_EiJ v1 2016)
GCA_001624865.1		 n/a 21,211
(2.19 %)		 17,797
(1.36 %)		 100,839
(4.01 %)		 41.65
(89.10 %)		 334,091
(10.95 %)		 29,259
(98.77 %)		 5,087,807
(40.60 %)		 1,402,357
(3.14 %)		 13,522,663
(27.99 %)		 16,888
(0.42 %)
635 wheat stem sawfly (v1 2014)
GCF_000341935.1		 37,175
(25.01 %)		 4,407
(2.81 %)		 15,504
(11.96 %)		 n/a 40.34
(98.12 %)		 8,733
(1.89 %)		 10,707
(98.11 %)		 87,084
(2.38 %)		 44,673
(2.55 %)		 1,001,343
(22.18 %)		 7,519
(2.78 %)
636 white leghorn X broiler chicken (v1 leghorn haplotype v1 2021)
GCF_016700215.1		 55,865
(8.86 %)		 12,310
(2.41 %)		 22,056
(2.57 %)		 n/a 42.20
(99.65 %)		 254
(0.35 %)		 509
(99.65 %)		 604,452
(10.76 %)		 232,416
(2.03 %)		 5,541,059
(20.23 %)		 22,185
(2.62 %)
637 white-beaked dolphin (primary hap 2023 genbank)
GCA_949774975.1		 59,982
(41.87 %)		 18,737
(1.57 %)		 20,767
(1.34 %)		 n/a 41.91
(99.99 %)		 1,070
(0.01 %)		 410
(100.00 %)		 3,820,566
(36.21 %)		 922,103
(8.43 %)		 12,304,360
(39.74 %)		 68,551
(3.58 %)
638 white-footed mouse
GCF_004664715.1		 46,167
(2.56 %)		 20,406
(1.72 %)		 20,857
(1.46 %)		 39,081
(1.88 %)		 42.23
(100.00 %)		 79
(0.00 %)		 1,763
(100.00 %)		 5,064,597
(30.73 %)		 1,258,088
(2.85 %)		 14,005,845
(33.01 %)		 23,475
(0.69 %)
639 white-tailed deer (Pink-7 2017 genbank)
GCA_002102435.1		 57,774
(39.81 %)		 20,653
(1.75 %)		 23,083
(1.50 %)		 40,950
(1.94 %)		 41.55
(99.10 %)		 107,030
(0.91 %)		 48,652
(99.10 %)		 4,799,958
(41.28 %)		 413,128
(2.59 %)		 13,296,686
(34.22 %)		 44,165
(1.19 %)
640 white-tailed eagle (primary hap 2022 genbank)
GCA_947461875.1		 n/a 13,735
(1.76 %)		 28,993
(2.53 %)		 n/a 43.15
(99.99 %)		 424
(0.01 %)		 188
(100.00 %)		 585,276
(12.89 %)		 291,289
(6.10 %)		 6,474,027
(23.66 %)		 54,851
(4.05 %)
641 white-tufted-ear marmoset (2010 Wash U)
GCF_000004665.1		 58,109
(2.92 %)		 21,699
(1.91 %)		 20,910
(1.24 %)		 n/a 40.85
(94.45 %)		 187,214
(5.57 %)		 201,523
(94.43 %)		 5,120,629
(48.95 %)		 768,432
(2.30 %)		 15,303,718
(34.75 %)		 35,805
(0.79 %)
642 white-tufted-ear marmoset (CJ-08-46 2017)
GCA_002754865.1		 n/a 21,754
(1.86 %)		 21,668
(1.22 %)		 n/a 40.77
(99.67 %)		 48,495
(0.33 %)		 88,439
(99.67 %)		 5,195,965
(48.83 %)		 825,714
(3.60 %)		 15,372,168
(38.05 %)		 34,994
(0.85 %)
643 white-tufted-ear marmoset (cj1700 genbank)
GCA_009663435.1		 n/a 21,729
(1.89 %)		 21,502
(1.30 %)		 n/a 40.85
(98.70 %)		 370
(1.30 %)		 1,360
(98.70 %)		 5,122,418
(49.40 %)		 818,502
(3.68 %)		 15,232,829
(38.20 %)		 36,656
(0.90 %)
644 white-tufted-ear marmoset (v1 paternal hap 2020)
GCA_011100535.1		 n/a 20,939
(1.94 %)		 20,416
(1.31 %)		 n/a 41.04
(99.58 %)		 788
(0.42 %)		 336
(100.00 %)		 4,869,007
(49.39 %)		 746,577
(2.68 %)		 14,347,286
(37.59 %)		 35,222
(0.94 %)
645 white-tufted-ear marmoset (v1.2 2021 genbank)
GCA_011100555.2		 n/a 21,801
(1.88 %)		 21,501
(1.28 %)		 n/a 40.92
(99.52 %)		 1,165
(0.48 %)		 1,234
(100.00 %)		 5,036,594
(47.71 %)		 842,846
(3.25 %)		 15,161,577
(38.08 %)		 37,603
(0.93 %)
646 whooping crane (maternal hap 2023 genbank)
GCA_028858705.1		 55,408
(53.40 %)		 13,572
(1.81 %)		 24,739
(2.19 %)		 n/a 43.07
(99.63 %)		 262
(0.37 %)		 929
(100.00 %)		 616,295
(10.57 %)		 211,557
(2.90 %)		 6,785,134
(22.11 %)		 42,795
(4.66 %)
647 wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 genbank)
GCA_000311805.2		 n/a 18,785
(1.94 %)		 17,252
(1.62 %)		 n/a 41.28
(98.83 %)		 60,971
(1.18 %)		 68,871
(98.82 %)		 3,098,525
(34.75 %)		 353,630
(1.23 %)		 12,349,553
(25.12 %)		 45,436
(1.02 %)
648 wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.0 2019)
GCF_002162155.1		 131,302
(1.34 %)		 33,079
(0.33 %)		 567,762
(8.14 %)		 n/a 45.99
(96.70 %)		 344,768
(3.31 %)		 148,396
(100.00 %)		 2,762,705
(2.81 %)		 2,991,142
(3.37 %)		 493,164
(96.69 %)		 2,220,897
(25.33 %)
649 wild peanut A.duranensis (v1 V14167 2017)
GCF_000817695.2		 69,091
(6.81 %)		 16,823
(1.67 %)		 75,740
(11.45 %)		 n/a 35.81
(86.74 %)		 133,967
(13.30 %)		 3,189
(98.45 %)		 588,761
(3.39 %)		 493,855
(3.35 %)		 5,206,772
(45.36 %)		 48,008
(1.88 %)
650 wild strawberry (2011 genbank)
GCA_000184155.1		 n/a 14,001
(6.64 %)		 34,562
(26.90 %)		 n/a 38.40
(94.26 %)		 16,253
(5.76 %)		 16,459
(94.24 %)		 152,427
(20.00 %)		 74,539
(2.79 %)		 1,032,592
(21.43 %)		 14,802
(3.20 %)
651 wire-tailed manakin (2018)
GCF_003945595.1		 50,529
(5.75 %)		 12,950
(1.89 %)		 19,252
(2.57 %)		 24,522
(2.44 %)		 42.30
(100.00 %)		 102
(0.00 %)		 3,744
(100.00 %)		 500,823
(7.17 %)		 300,638
(2.31 %)		 6,414,267
(20.54 %)		 28,268
(2.21 %)
652 woodchuck (CNAG 2019)
GCA_901343595.1		 n/a 20,813
(1.60 %)		 23,199
(1.43 %)		 45,153
(1.99 %)		 40.00
(97.18 %)		 57,045
(2.82 %)		 105,556
(97.18 %)		 4,756,333
(33.73 %)		 836,503
(2.41 %)		 14,755,960
(31.13 %)		 34,151
(0.87 %)
653 woodchuck (v1.0 LI92 2021)
GCF_021218885.1		 62,044
(2.80 %)		 19,783
(1.48 %)		 21,060
(1.38 %)		 n/a 39.92
(100.00 %)		 46
(0.00 %)		 3,381
(100.00 %)		 3,884,968
(28.12 %)		 912,591
(2.73 %)		 14,538,767
(35.15 %)		 36,919
(1.02 %)
654 worm pipefish (v1 RoL_2023-P1 2023)
GCF_033978685.1		 73,681
(3.43 %)		 25,892
(1.02 %)		 114,154
(3.30 %)		 n/a 39.45
(100.00 %)		 146
(0.00 %)		 630
(100.00 %)		 4,795,312
(24.37 %)		 2,093,730
(16.74 %)		 13,132,465
(67.32 %)		 248,526
(4.59 %)
655 wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 primary hap 2023 genbank)
GCA_029207755.1		 n/a 13,052
(1.78 %)		 24,950
(2.30 %)		 n/a 43.93
(100.00 %)		 353
(0.00 %)		 1,695
(100.00 %)		 444,866
(3.08 %)		 473,471
(7.97 %)		 5,336,498
(25.82 %)		 37,210
(3.14 %)
656 Yangtze finless porpoise (v1 2018 refseq)
GCF_003031525.1		 43,312
(2.49 %)		 18,639
(1.72 %)		 19,645
(1.46 %)		 n/a 41.28
(99.29 %)		 52,647
(0.72 %)		 66,346
(99.28 %)		 n/a 540,765
(1.65 %)		 12,691,760
(32.87 %)		 59,052
(1.48 %)
657 Yangtze finless porpoise (v1 wild 2018 genbank)
GCA_003031525.1		 43,299
(41.33 %)		 18,726
(1.80 %)		 19,644
(1.46 %)		 n/a 41.28
(99.29 %)		 52,647
(0.72 %)		 66,345
(99.28 %)		 3,990,044
(42.54 %)		 540,765
(1.65 %)		 12,691,683
(32.88 %)		 59,052
(1.48 %)
658 Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 genbank)
GCA_000442215.1		 27,063
(35.76 %)		 19,219
(1.73 %)		 27,456
(1.66 %)		 n/a 41.30
(98.69 %)		 124,797
(1.33 %)		 155,509
(98.67 %)		 4,277,556
(44.10 %)		 690,534
(1.95 %)		 13,025,034
(35.19 %)		 67,035
(1.82 %)
659 Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 refseq)
GCF_000442215.1		 27,076
(1.65 %)		 19,227
(1.75 %)		 27,468
(1.66 %)		 n/a 41.30
(98.69 %)		 124,797
(1.33 %)		 155,510
(98.67 %)		 4,193,317
(43.38 %)		 690,534
(1.95 %)		 13,025,097
(35.19 %)		 67,035
(1.82 %)
660 yellow fever mosquito (LVP_AGWG 2017 genbank)
GCA_002204515.1		 n/a 8,814
(0.51 %)		 152,909
(17.36 %)		 n/a 38.16
(100.00 %)		 229
(0.00 %)		 6,534
(100.00 %)		 2,912,289
(46.74 %)		 533,475
(4.34 %)		 10,210,670
(53.65 %)		 132,732
(6.12 %)
661 yellow-bellied marmot (hap1 2025 genbank)
GCA_047511675.1		 n/a 19,503
(1.44 %)		 20,301
(1.35 %)		 n/a 39.90
(100.00 %)		 330
(0.00 %)		 814
(100.00 %)		 4,038,897
(29.07 %)		 978,915
(3.28 %)		 14,404,740
(34.97 %)		 36,674
(1.05 %)
662 yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.0 2019)
GCF_003676075.2		 42,715
(2.16 %)		 19,894
(1.62 %)		 21,366
(1.40 %)		 43,878
(1.99 %)		 39.89
(97.96 %)		 35,595
(2.04 %)		 66,624
(97.96 %)		 4,646,957
(34.05 %)		 800,897
(1.96 %)		 14,340,028
(32.63 %)		 34,125
(0.91 %)
663 yellow-bellied marmot (v1 2018)
GCF_003676075.1		 41,573
(2.14 %)		 19,845
(1.63 %)		 21,262
(1.39 %)		 n/a 39.88
(97.82 %)		 38,354
(2.18 %)		 69,503
(97.82 %)		 4,683,625
(34.38 %)		 799,659
(1.95 %)		 14,322,765
(32.58 %)		 34,127
(0.91 %)
664 yellow-footed antechinus (v1 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021)
GCA_016432865.1		 n/a 15,703
(0.78 %)		 16,184
(0.90 %)		 n/a 36.21
(99.99 %)		 620
(0.01 %)		 487
(100.00 %)		 5,424,579
(25.40 %)		 1,269,774
(2.59 %)		 21,430,550
(42.69 %)		 28,121
(0.66 %)
665 yellow-throated sandgrouse (BGI_N339 2014 BGI)
GCF_000699245.1		 15,990
(2.25 %)		 11,775
(1.55 %)		 23,935
(1.90 %)		 n/a 41.36
(99.67 %)		 48,553
(0.34 %)		 107,160
(99.66 %)		 384,032
(4.45 %)		 182,309
(1.03 %)		 6,529,534
(19.24 %)		 15,660
(0.55 %)
666 yellowtail amberjack (v1 SW California HSWRI2012SDOR001 2017)
GCF_002814215.1		 41,181
(9.96 %)		 15,861
(2.76 %)		 30,671
(6.00 %)		 n/a 40.75
(97.79 %)		 33,664
(2.20 %)		 99,598
(100.00 %)		 614,513
(4.16 %)		 522,349
(4.83 %)		 4,650,538
(24.98 %)		 18,054
(0.96 %)
667 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP primary hap 2023 genbank)
GCA_028538775.1		 n/a 18,587
(1.82 %)		 21,049
(1.76 %)		 n/a 43.22
(100.00 %)		 209
(0.00 %)		 685
(100.00 %)		 2,890,086
(24.28 %)		 719,555
(4.26 %)		 10,089,514
(36.35 %)		 60,975
(2.61 %)
668 zebra finch (v1 Black17 2019 refseq)
GCF_003957565.1		 51,472
(7.16 %)		 13,211
(2.02 %)		 17,812
(2.70 %)		 38,655
(7.10 %)		 42.04
(99.78 %)		 312
(0.22 %)		 135
(100.00 %)		 535,521
(8.50 %)		 550,118
(4.01 %)		 6,519,872
(21.47 %)		 30,053
(2.58 %)
669 zebra finch (v1 Black17 male 2019 genbank)
GCA_003957565.2		 n/a 13,212
(2.02 %)		 25,117
(2.57 %)		 38,655
(7.10 %)		 42.04
(99.78 %)		 312
(0.22 %)		 135
(100.00 %)		 535,521
(8.50 %)		 550,118
(4.01 %)		 6,519,872
(21.47 %)		 30,053
(2.58 %)
670 zebra finch (v1.4 Blue55 primary hap 2021 genbank)
GCA_003957565.4		 n/a 12,755
(1.97 %)		 24,009
(2.47 %)		 n/a 41.86
(99.66 %)		 352
(0.34 %)		 199
(100.00 %)		 389,146
(3.10 %)		 458,903
(3.33 %)		 6,338,599
(20.92 %)		 29,203
(2.49 %)
671 zebra shark (hap1 2023 genbank)
GCA_030684315.1		 n/a 12,291
(0.48 %)		 16,769
(1.14 %)		 n/a 43.41
(99.47 %)		 1,159
(0.53 %)		 835
(100.00 %)		 8,087,543
(64.92 %)		 798,373
(9.17 %)		 14,838,773
(42.39 %)		 45,284
(1.67 %)
672 zebu cattle (Nelore 2014 genbank)
GCA_000247795.2		 n/a 18,599
(1.58 %)		 18,779
(1.29 %)		 n/a 41.75
(92.62 %)		 6,941,272
(7.66 %)		 253,769
(92.59 %)		 5,118,783
(46.84 %)		 358,908
(0.88 %)		 13,431,620
(36.60 %)		 35,241
(0.84 %)
TOTALS:total assembly count 689 (672 build completed, 97.53 % finished)

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 616 assemblies assembly stats track stats
Mammals 836 assemblies assembly stats track stats
Birds 543 assemblies assembly stats track stats
Fishes 634 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 406 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1941 assemblies assembly stats track stats
Plants 444 assemblies assembly stats track stats
Fungi 4128 assemblies assembly stats track stats
Viruses 15060 assemblies assembly stats track stats
Archaea 2702 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 22332 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 689 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 5519 assemblies assembly stats track stats