Fish Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of fish only.

See also: hub accessassembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 Acadian redfish (fSebFas1 primary hap 2024)
GCA_043250625.1
n/a 15,735
(2.44 %)
50,184
(6.16 %)
n/a 40.90
(99.99 %)
471
(0.01 %)
203
(100.00 %)
1,781,283
(37.65 %)
444,047
(7.93 %)
4,765,080
(37.01 %)
39,918
(2.01 %)
2 alligator pipefish (LvHL_M 2021)
GCF_019802595.1
54,226
(11.15 %)
13,427
(2.67 %)
46,903
(5.94 %)
n/a 42.94
(100.00 %)
144
(0.00 %)
143
(100.00 %)
1,200,994
(30.62 %)
143,062
(2.20 %)
3,921,676
(38.03 %)
67,978
(8.92 %)
3 allis shad
GCF_017589495.1
48,507
(8.47 %)
15,371
(2.28 %)
58,686
(5.84 %)
n/a 42.99
(99.91 %)
1,541
(0.09 %)
1,095
(100.00 %)
1,190,406
(9.30 %)
1,205,679
(11.28 %)
3,960,328
(38.81 %)
36,494
(1.83 %)
4 Amazon molly
GCF_000485575.1
56,958
(11.69 %)
15,117
(2.64 %)
30,114
(6.60 %)
n/a 39.16
(95.38 %)
36,429
(4.64 %)
31,058
(95.36 %)
346,461
(2.03 %)
188,557
(1.44 %)
5,139,633
(26.01 %)
35,229
(1.82 %)
5 amberjack S.aureovittata (China HTS-2021-v1 2021)
GCF_021018895.1
47,198
(13.10 %)
15,500
(3.14 %)
41,230
(6.67 %)
n/a 40.79
(99.99 %)
150
(0.01 %)
31
(100.00 %)
1,230,524
(26.57 %)
398,694
(5.41 %)
4,106,609
(25.60 %)
15,656
(0.99 %)
6 American shad (fAloSap1 alternate hap 2021)
GCA_018492705.1
n/a 15,901
(2.25 %)
61,133
(6.37 %)
n/a 43.14
(100.00 %)
1
(0.00 %)
5,411
(100.00 %)
2,043,181
(23.64 %)
1,141,539
(11.35 %)
3,668,314
(38.60 %)
40,218
(2.14 %)
7 American shad (primary hap 2021)
GCF_018492685.1
70,400
(9.39 %)
16,145
(2.29 %)
60,087
(6.26 %)
76,974
(8.55 %)
43.18
(99.45 %)
1,639
(0.55 %)
74
(100.00 %)
1,297,174
(9.39 %)
1,245,221
(12.59 %)
3,857,267
(39.43 %)
42,699
(2.23 %)
8 Andian cavefish (hap1 2023 genbank)
GCA_030014385.1
n/a 15,802
(1.97 %)
47,186
(4.62 %)
n/a 40.27
(100.00 %)
198
(0.00 %)
349
(100.00 %)
2,616,870
(40.73 %)
658,784
(9.71 %)
5,197,126
(48.95 %)
48,344
(2.62 %)
9 Andian cavefish (hap1 2023 refseq)
GCF_030014385.1
42,881
(5.97 %)
15,802
(1.97 %)
47,186
(4.62 %)
n/a 40.27
(100.00 %)
198
(0.00 %)
349
(100.00 %)
2,616,870
(40.73 %)
658,784
(9.71 %)
5,197,126
(48.95 %)
48,344
(2.62 %)
10 annual killifish
GCF_001266775.1
38,517
(8.87 %)
14,027
(2.45 %)
27,798
(5.86 %)
n/a 39.29
(80.23 %)
1,025,519
(19.94 %)
168,368
(80.17 %)
349,927
(2.63 %)
296,826
(3.18 %)
5,039,517
(28.69 %)
26,364
(1.18 %)
11 Antarctic jonasfish (primary hap 2024)
GCA_963971535.1
n/a 16,678
(0.56 %)
151,361
(4.03 %)
n/a 44.57
(99.91 %)
15,113
(0.09 %)
5,983
(100.00 %)
12,251,532
(51.73 %)
3,521,157
(17.69 %)
10,051,020
(68.37 %)
494,595
(10.52 %)
12 Antarctic lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_951214905.1
n/a 17,318
(1.49 %)
80,097
(5.79 %)
n/a 43.49
(100.00 %)
n/a 11,436
(100.00 %)
5,482,467
(36.71 %)
1,454,729
(18.84 %)
6,756,226
(47.56 %)
92,057
(3.50 %)
13 Antarctic lanternfish (primary hap 2023)
GCA_951216825.1
n/a 17,342
(1.44 %)
78,914
(5.48 %)
n/a 43.57
(99.96 %)
3,179
(0.04 %)
1,901
(100.00 %)
5,980,457
(37.18 %)
1,633,782
(21.76 %)
6,279,725
(52.83 %)
104,688
(3.57 %)
14 Antarctic spiny plunderfish (primary hap 2020)
GCA_902827135.1
n/a 14,859
(1.97 %)
60,431
(5.73 %)
n/a 41.82
(99.99 %)
1,039
(0.01 %)
1,541
(100.00 %)
461,253
(3.08 %)
434,124
(6.81 %)
3,499,945
(42.99 %)
60,941
(3.20 %)
15 Arctic char
GCF_002910315.2
67,196
(4.99 %)
23,967
(1.55 %)
45,775
(3.69 %)
n/a 43.16
(93.25 %)
1,718,015
(6.84 %)
16,700
(99.99 %)
1,011,348
(4.06 %)
1,666,148
(10.50 %)
10,597,529
(44.77 %)
76,282
(1.94 %)
16 Arctic char (CBP00131 primary hap 2024)
GCA_036784965.1
n/a 22,376
(1.44 %)
97,559
(4.71 %)
n/a 43.37
(99.97 %)
3,235
(0.03 %)
4,404
(99.97 %)
999,920
(4.22 %)
1,630,911
(26.08 %)
7,875,105
(58.08 %)
70,947
(2.59 %)
17 Aristotle's catfish (alternate hap 2022)
GCA_946807865.1
n/a 14,032
(2.44 %)
39,770
(4.92 %)
n/a 38.85
(100.00 %)
n/a 7,617
(100.00 %)
1,808,149
(37.98 %)
583,449
(10.56 %)
4,203,368
(40.67 %)
24,867
(2.06 %)
18 Aristotle's catfish (primary hap 2022)
GCA_946808225.1
n/a 15,455
(2.53 %)
40,077
(4.90 %)
86,346
(8.45 %)
38.90
(99.98 %)
795
(0.02 %)
241
(100.00 %)
2,045,691
(38.70 %)
669,975
(11.72 %)
4,638,765
(42.07 %)
28,277
(1.93 %)
19 Arkansas darter
GCF_013103735.1
51,282
(9.79 %)
14,588
(2.90 %)
42,306
(6.27 %)
n/a 40.52
(99.50 %)
35,052
(0.52 %)
4,664
(100.00 %)
418,294
(3.29 %)
331,380
(3.74 %)
4,153,309
(26.60 %)
15,489
(0.95 %)
20 arroyo chub (AC-1 alternate hap 2022)
GCA_026230005.1
n/a 17,862
(2.29 %)
70,667
(5.50 %)
n/a 40.01
(100.00 %)
327
(0.00 %)
179
(100.00 %)
2,876,989
(50.39 %)
700,511
(9.88 %)
5,977,913
(44.08 %)
104,320
(8.02 %)
21 arroyo chub (AC-1 primary hap 2022)
GCA_026230025.1
n/a 18,025
(2.28 %)
71,255
(5.50 %)
n/a 40.03
(100.00 %)
318
(0.00 %)
341
(100.00 %)
2,884,301
(50.42 %)
702,464
(9.98 %)
5,989,299
(44.18 %)
105,945
(8.03 %)
22 Asian bonytongue (2019)
GCF_900964775.1
50,315
(9.13 %)
16,526
(2.73 %)
38,780
(6.64 %)
72,662
(8.52 %)
44.16
(99.99 %)
145
(0.01 %)
72
(100.00 %)
504,673
(3.06 %)
216,136
(1.69 %)
4,323,242
(26.50 %)
88,517
(10.73 %)
23 Asian bonytongue (alternate hap)
GCA_900964985.2
n/a 16,053
(2.73 %)
74,777
(7.26 %)
n/a 44.15
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,006
(100.00 %)
482,351
(3.03 %)
207,018
(1.68 %)
4,139,370
(26.26 %)
85,546
(10.82 %)
24 Asian redtail catfish (EC202008001 2021)
GCF_019097595.1
51,017
(10.40 %)
15,549
(2.60 %)
42,858
(5.39 %)
n/a 39.70
(100.00 %)
107
(0.00 %)
73
(100.00 %)
1,718,992
(31.80 %)
749,009
(14.09 %)
4,206,758
(37.30 %)
19,230
(1.16 %)
25 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024 genbank)
GCA_963924715.1
n/a 15,722
(2.57 %)
43,026
(5.68 %)
n/a 39.77
(99.99 %)
468
(0.01 %)
120
(100.00 %)
1,608,686
(33.02 %)
253,749
(4.14 %)
5,181,115
(27.80 %)
14,488
(0.90 %)
26 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924715.1
54,426
(12.09 %)
15,720
(2.57 %)
43,026
(5.68 %)
n/a 39.77
(99.99 %)
468
(0.01 %)
119
(100.00 %)
1,608,682
(33.02 %)
253,749
(4.14 %)
5,181,078
(27.80 %)
14,488
(0.90 %)
27 Atlantic cod (2019)
GCF_902167405.1
51,642
(11.92 %)
14,055
(2.62 %)
36,761
(8.42 %)
68,438
(9.50 %)
45.64
(96.48 %)
1,216
(3.52 %)
227
(100.00 %)
790,946
(10.54 %)
855,327
(13.06 %)
2,851,161
(33.38 %)
97,133
(7.82 %)
28 Atlantic cod (alternate hap)
GCA_902167395.1
n/a 13,366
(2.68 %)
66,599
(9.29 %)
n/a 45.55
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3,592
(100.00 %)
696,727
(10.13 %)
749,876
(13.00 %)
2,554,769
(33.77 %)
87,167
(8.03 %)
29 Atlantic halibut (2019 refseq)
GCF_009819705.1
52,130
(11.46 %)
14,961
(3.19 %)
45,365
(7.48 %)
69,662
(10.94 %)
42.21
(99.43 %)
290
(0.57 %)
57
(100.00 %)
428,321
(4.16 %)
256,153
(3.73 %)
3,725,981
(24.13 %)
31,325
(2.25 %)
30 Atlantic halibut (alternate hap 2019)
GCA_009819745.1
n/a 16,554
(3.01 %)
54,832
(7.45 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
62
(0.00 %)
4,053
(100.00 %)
494,008
(4.23 %)
299,066
(3.87 %)
4,272,649
(24.46 %)
36,868
(2.33 %)
31 Atlantic herring (v2)
GCF_900700415.2
50,946
(10.35 %)
16,394
(2.60 %)
61,637
(7.20 %)
n/a 44.16
(99.89 %)
1,990
(0.11 %)
3,687
(99.89 %)
1,269,688
(11.71 %)
1,318,661
(13.43 %)
3,732,801
(32.49 %)
35,959
(1.97 %)
32 Atlantic horse mackerel (alternate hap 2021)
GCA_905171655.2
n/a 15,331
(2.42 %)
52,370
(6.91 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
74
(0.00 %)
1,049
(100.00 %)
1,454,631
(18.29 %)
383,946
(4.34 %)
4,363,016
(32.69 %)
56,416
(3.08 %)
33 Atlantic horse mackerel (primary hap 2021)
GCA_905171665.2
n/a 15,262
(2.42 %)
51,857
(6.86 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
222
(0.00 %)
153
(100.00 %)
1,454,219
(18.25 %)
384,609
(4.72 %)
4,338,083
(32.80 %)
56,553
(3.08 %)
34 Atlantic mackerel (primary hap 2023 genbank)
GCA_963691925.1
n/a 15,291
(2.56 %)
43,206
(5.92 %)
n/a 39.78
(99.96 %)
1,489
(0.04 %)
666
(100.00 %)
1,496,244
(26.83 %)
395,543
(8.92 %)
4,523,761
(29.92 %)
13,309
(0.75 %)
35 Atlantic mackerel (primary hap 2023 refseq)
GCF_963691925.1
34,357
(8.10 %)
15,289
(2.56 %)
43,205
(5.92 %)
n/a 39.78
(99.96 %)
1,489
(0.04 %)
665
(100.00 %)
1,496,240
(26.83 %)
395,543
(8.92 %)
4,523,726
(29.93 %)
13,308
(0.75 %)
36 Atlantic salmon (refseq 2021)
GCF_905237065.1
112,906
(5.61 %)
28,077
(1.40 %)
115,207
(3.75 %)
183,727
(7.26 %)
43.42
(100.00 %)
211
(0.00 %)
4,222
(100.00 %)
1,300,611
(4.84 %)
2,247,891
(25.01 %)
10,731,814
(59.31 %)
77,089
(1.86 %)
37 Atlantic salmon (Sally 2015)
GCF_000233375.1
109,794
(5.45 %)
26,968
(1.35 %)
202,772
(19.11 %)
n/a 43.10
(88.27 %)
138,207
(11.73 %)
241,570
(99.97 %)
1,628,119
(9.46 %)
2,496,917
(19.18 %)
10,390,780
(51.80 %)
79,791
(1.60 %)
38 Atlantic turbot (AOZZmale01 2020)
GCF_013347765.1
60,214
(14.44 %)
14,860
(3.40 %)
50,921
(8.07 %)
76,242
(9.93 %)
43.38
(100.00 %)
51
(0.00 %)
127
(100.00 %)
449,865
(5.00 %)
299,255
(7.03 %)
3,274,219
(25.77 %)
67,338
(7.00 %)
39 ballan wrasse (2016)
GCF_900080235.1
42,362
(9.30 %)
16,129
(2.44 %)
33,854
(5.87 %)
n/a 40.89
(99.98 %)
257
(0.02 %)
13,466
(100.00 %)
503,078
(3.93 %)
321,407
(5.60 %)
4,329,412
(30.36 %)
21,221
(1.07 %)
40 ballan wrasse (primary hap 2024 genbank)
GCA_963930695.1
n/a 15,142
(2.66 %)
43,601
(6.21 %)
n/a 40.59
(99.98 %)
815
(0.02 %)
133
(100.00 %)
1,221,802
(30.10 %)
290,738
(7.79 %)
4,164,845
(30.34 %)
17,126
(0.94 %)
41 ballan wrasse (primary hap 2024 refseq)
GCF_963930695.1
48,592
(12.09 %)
15,140
(2.66 %)
43,304
(6.14 %)
n/a 40.59
(99.98 %)
815
(0.02 %)
946
(99.98 %)
1,221,797
(30.10 %)
290,736
(7.79 %)
4,164,799
(30.34 %)
17,126
(0.94 %)
42 banded archerfish (alternate hap 2021)
GCA_017976295.1
n/a 15,211
(3.23 %)
41,620
(7.14 %)
n/a 41.08
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2,393
(100.00 %)
785,178
(17.57 %)
249,148
(8.36 %)
3,391,653
(26.49 %)
13,787
(0.93 %)
43 banded archerfish (primary hap 2021 refseq)
GCF_017976425.1
42,399
(11.11 %)
15,310
(3.17 %)
41,147
(7.01 %)
62,990
(9.37 %)
41.11
(99.82 %)
98
(0.18 %)
96
(100.00 %)
463,524
(3.35 %)
271,913
(9.55 %)
3,355,326
(28.08 %)
15,089
(0.96 %)
44 banded killifish (hap1 2024)
GCA_037039145.1
n/a 15,122
(1.44 %)
65,809
(4.50 %)
n/a 41.23
(99.74 %)
293
(0.26 %)
331
(100.00 %)
2,545,429
(50.53 %)
451,939
(5.50 %)
5,807,705
(42.18 %)
94,695
(3.92 %)
45 banded killifish (hap2 2024)
GCA_037038625.1
n/a 15,024
(1.45 %)
65,141
(4.53 %)
n/a 41.23
(99.52 %)
373
(0.48 %)
196
(100.00 %)
2,509,508
(50.53 %)
441,892
(5.11 %)
6,245,443
(38.22 %)
93,198
(3.82 %)
46 barbel (alternate hap 2022)
GCA_936446605.1
n/a 26,794
(3.15 %)
76,434
(5.64 %)
n/a 37.81
(100.00 %)
1
(0.00 %)
8,035
(100.00 %)
4,084,361
(52.18 %)
538,411
(4.25 %)
7,659,980
(38.94 %)
58,008
(2.90 %)
47 barbel (primary hap 2022)
GCA_936440315.1
n/a 31,876
(3.30 %)
85,063
(5.65 %)
n/a 37.89
(100.00 %)
108
(0.00 %)
92
(100.00 %)
4,839,533
(52.47 %)
646,636
(4.57 %)
8,240,279
(42.13 %)
71,384
(3.04 %)
48 barramundi perch (ASB-BC8 2022)
GCF_001640805.2
53,646
(13.68 %)
16,073
(3.06 %)
44,214
(6.63 %)
n/a 40.76
(98.88 %)
674
(1.12 %)
2,997
(100.00 %)
986,469
(19.78 %)
237,272
(4.32 %)
3,983,840
(23.58 %)
16,237
(1.03 %)
49 bicolor damselfish
GCF_000690725.1
32,951
(8.67 %)
15,181
(2.55 %)
31,420
(5.94 %)
n/a 41.66
(93.68 %)
44,409
(6.34 %)
42,059
(93.66 %)
351,453
(2.61 %)
180,113
(1.20 %)
5,016,154
(23.41 %)
46,423
(2.30 %)
50 black goby (alternate hap 2023)
GCA_951799965.1
n/a 14,534
(2.11 %)
56,906
(6.41 %)
n/a 42.10
(100.00 %)
n/a 3,523
(100.00 %)
2,445,373
(45.07 %)
452,878
(9.46 %)
4,195,077
(39.49 %)
77,592
(4.86 %)
51 black goby (primary hap 2023)
GCA_951799975.1
n/a 14,455
(2.06 %)
56,488
(6.31 %)
n/a 42.10
(99.99 %)
636
(0.01 %)
298
(100.00 %)
3,230,397
(55.09 %)
494,440
(10.43 %)
4,359,169
(40.46 %)
81,684
(4.81 %)
52 black perch (LCO1_2020_lvr alternate hap 2022)
GCA_022578405.1
n/a 31,847
(2.01 %)
153,565
(6.53 %)
n/a 41.78
(99.99 %)
639
(0.00 %)
63,422
(100.00 %)
2,786,840
(18.28 %)
1,016,389
(7.50 %)
8,844,631
(26.90 %)
130,556
(4.42 %)
53 black perch (LCO1_2020_lvr primary hap 2022 refseq)
GCF_022577435.1
42,351
(12.09 %)
14,988
(3.02 %)
47,106
(6.98 %)
n/a 41.61
(100.00 %)
234
(0.00 %)
463
(100.00 %)
1,017,142
(18.99 %)
360,899
(8.75 %)
3,761,447
(28.91 %)
48,360
(4.43 %)
54 black rockcod
GCF_000735185.1
35,176
(8.54 %)
12,601
(2.15 %)
42,589
(6.13 %)
n/a 40.62
(97.93 %)
59,164
(2.09 %)
72,571
(97.92 %)
268,591
(2.71 %)
238,334
(3.18 %)
3,425,479
(29.48 %)
31,009
(2.11 %)
55 black seabass (Rhode Island RG_2023a 2023)
GCF_030273125.1
43,392
(8.45 %)
15,522
(2.13 %)
48,255
(5.50 %)
n/a 38.69
(100.00 %)
341
(0.00 %)
92
(100.00 %)
1,651,919
(22.26 %)
782,601
(7.55 %)
5,398,047
(38.87 %)
24,508
(1.19 %)
56 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 1 2023)
GCA_028021495.1
n/a 15,274
(2.92 %)
51,453
(7.45 %)
n/a 43.07
(99.99 %)
373
(0.01 %)
461
(100.00 %)
1,239,364
(29.69 %)
354,703
(9.63 %)
3,006,556
(30.35 %)
53,503
(4.48 %)
57 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 2 2023)
GCA_028022725.1
n/a 15,043
(2.96 %)
50,860
(7.54 %)
n/a 42.98
(99.99 %)
366
(0.01 %)
109
(100.00 %)
1,210,142
(29.44 %)
340,820
(9.19 %)
2,986,750
(29.89 %)
52,010
(4.20 %)
58 blackstripe livebearer (line A6 2022)
GCF_027474105.1
44,847
(11.30 %)
15,364
(2.86 %)
51,122
(6.88 %)
n/a 39.48
(99.99 %)
89
(0.01 %)
415
(100.00 %)
1,160,519
(28.33 %)
183,082
(4.75 %)
4,354,804
(27.83 %)
40,207
(2.97 %)
59 blacktail shiner (hap1 2024)
GCA_038021265.1
n/a 17,403
(2.99 %)
45,903
(5.38 %)
n/a 38.64
(99.99 %)
709
(0.01 %)
673
(100.00 %)
2,141,901
(35.77 %)
482,931
(17.18 %)
4,297,133
(46.82 %)
41,889
(2.32 %)
60 blacktail shiner (hap2 2024)
GCA_038024135.1
n/a 17,486
(2.97 %)
46,833
(5.41 %)
n/a 38.79
(99.99 %)
720
(0.01 %)
413
(100.00 %)
2,165,269
(36.18 %)
490,692
(17.84 %)
4,251,333
(47.54 %)
42,744
(2.37 %)
61 blue catfish (D&B 2022)
GCF_023375685.1
48,916
(10.27 %)
15,574
(2.62 %)
44,035
(5.21 %)
n/a 39.80
(98.04 %)
171
(1.96 %)
43
(100.00 %)
2,180,806
(45.14 %)
625,260
(6.63 %)
5,137,199
(35.52 %)
31,164
(1.89 %)
62 blue tilapia (BGI-SZ)
GCF_005870065.1
36,881
(7.40 %)
15,408
(2.38 %)
27,235
(5.59 %)
n/a 40.42
(89.87 %)
53,539
(10.15 %)
12,952
(100.00 %)
867,639
(16.39 %)
195,137
(1.62 %)
5,293,484
(23.10 %)
21,238
(1.02 %)
63 blue tilapia (Guangdong)
GCF_013358895.1
57,860
(9.04 %)
15,494
(1.98 %)
57,878
(5.63 %)
56,939
(8.11 %)
40.66
(99.97 %)
723
(0.03 %)
304
(100.00 %)
1,055,724
(20.14 %)
324,841
(3.27 %)
5,000,753
(32.08 %)
32,357
(1.59 %)
64 blue whiting (primary hap 2024)
GCA_964030765.1
n/a 13,097
(2.93 %)
55,097
(8.76 %)
n/a 45.82
(99.88 %)
3,055
(0.12 %)
3,832
(100.00 %)
1,337,604
(32.27 %)
749,185
(17.27 %)
2,363,606
(35.06 %)
78,815
(8.25 %)
65 bluestreak cleaner wrasse (JK-2023 2023)
GCA_030710495.1
n/a 14,996
(2.68 %)
44,244
(6.44 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
211
(0.00 %)
59
(100.00 %)
1,619,681
(30.07 %)
337,749
(4.31 %)
4,541,709
(29.20 %)
14,576
(0.85 %)
66 bluestripe pipefish (RoL2022-K1 2023)
GCF_030265055.1
63,345
(14.83 %)
14,387
(3.54 %)
43,563
(7.96 %)
n/a 41.68
(100.00 %)
12
(0.00 %)
57
(100.00 %)
842,739
(18.67 %)
356,558
(12.86 %)
2,720,911
(41.08 %)
40,187
(4.66 %)
67 blunt-snouted clingfish (alternate hap)
GCA_900650505.1
n/a 12,494
(1.93 %)
44,967
(5.14 %)
n/a 38.20
(100.00 %)
1
(0.00 %)
7,675
(100.00 %)
608,174
(4.23 %)
390,755
(4.71 %)
4,977,071
(42.41 %)
23,532
(1.46 %)
68 blunt-snouted clingfish (v2 2020 genbank)
GCA_900634775.2
n/a 14,499
(1.97 %)
51,213
(5.47 %)
n/a 38.27
(98.47 %)
1,160
(1.53 %)
442
(100.00 %)
731,731
(4.21 %)
471,623
(4.92 %)
5,974,055
(42.88 %)
29,052
(1.48 %)
69 Boeseman's rainbowfish (fMelBoe1 alternate hap 2021)
GCA_017639755.1
n/a 13,882
(2.27 %)
45,919
(5.98 %)
n/a 39.50
(99.99 %)
45
(0.01 %)
3,194
(100.00 %)
803,073
(13.60 %)
258,404
(4.19 %)
4,674,614
(28.36 %)
15,524
(1.02 %)
70 Boeseman's rainbowfish (primary hap 2021)
GCF_017639745.1
51,238
(8.77 %)
15,174
(2.24 %)
51,552
(6.21 %)
n/a 39.65
(99.63 %)
440
(0.37 %)
93
(100.00 %)
542,278
(3.15 %)
303,669
(4.77 %)
5,189,645
(29.11 %)
18,525
(1.10 %)
71 Bolin's lanternfish (primary hap 2024)
GCA_963924005.1
n/a 16,964
(1.77 %)
67,673
(5.93 %)
n/a 42.61
(99.97 %)
1,785
(0.03 %)
979
(100.00 %)
4,285,965
(30.73 %)
1,222,431
(20.69 %)
6,105,881
(46.99 %)
73,543
(3.28 %)
72 bonti-bonti (fTelBon1 alternate hap 2022)
GCA_933228925.1
n/a 12,424
(1.95 %)
46,550
(6.00 %)
n/a 41.63
(100.00 %)
n/a 4,619
(100.00 %)
789,207
(14.61 %)
348,482
(20.98 %)
3,447,241
(38.72 %)
27,035
(4.16 %)
73 bonti-bonti (primary hap 2022)
GCA_933228915.1
n/a 14,929
(1.93 %)
55,343
(5.90 %)
n/a 41.66
(99.97 %)
1,329
(0.03 %)
146
(100.00 %)
998,246
(14.90 %)
443,155
(22.40 %)
4,319,947
(40.01 %)
34,018
(4.16 %)
74 bony fish B.hirsutus (HB-005 2024)
GCF_040956055.1
24,050
(11.30 %)
14,596
(4.48 %)
52,760
(11.00 %)
n/a 44.75
(99.96 %)
1,486
(0.04 %)
1,370
(100.00 %)
471,281
(10.94 %)
181,798
(7.38 %)
2,008,576
(24.90 %)
46,438
(14.87 %)
75 bony fish P.dabryanus (BB 2023)
GCF_030506205.1
86,420
(8.25 %)
22,100
(2.28 %)
59,296
(4.66 %)
n/a 38.32
(100.00 %)
1
(0.00 %)
610
(100.00 %)
3,555,303
(40.49 %)
538,181
(9.64 %)
6,137,303
(50.16 %)
71,533
(4.06 %)
76 bony fish S.pulcher (SPU_LCO1_2020_fin primary hap 2022)
GCF_022749685.1
37,003
(8.79 %)
15,275
(2.46 %)
46,371
(5.95 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
8
(0.00 %)
186
(100.00 %)
1,369,180
(24.73 %)
232,889
(8.56 %)
4,426,024
(31.90 %)
27,133
(1.64 %)
77 bony fish T.vachellii (PV-2020 2023)
GCF_030014155.1
43,278
(10.19 %)
15,613
(2.96 %)
39,340
(5.77 %)
n/a 39.31
(99.98 %)
291
(0.02 %)
78
(100.00 %)
1,563,305
(33.23 %)
689,312
(9.96 %)
3,954,578
(35.31 %)
20,152
(1.50 %)
78 bowfin (hap1 2024 genbank)
GCA_036373705.1
n/a 13,851
(1.83 %)
27,058
(4.43 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
97
(0.00 %)
390
(100.00 %)
953,497
(13.69 %)
387,700
(7.91 %)
4,552,410
(37.72 %)
46,301
(2.99 %)
79 Brauer's lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_963281105.1
n/a 17,999
(1.60 %)
76,655
(5.58 %)
n/a 42.04
(100.00 %)
5
(0.00 %)
10,799
(100.00 %)
5,994,257
(39.29 %)
1,126,685
(10.35 %)
6,996,991
(46.02 %)
71,016
(3.36 %)
80 Brauer's lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963280865.1
n/a 17,865
(1.56 %)
76,506
(5.59 %)
n/a 42.15
(99.96 %)
2,704
(0.04 %)
676
(100.00 %)
6,391,921
(39.62 %)
1,227,487
(11.70 %)
6,669,558
(49.73 %)
76,828
(3.96 %)
81 broad-nosed pipefish (Sweden RoL2023-S1 2023)
GCF_033458585.1
49,639
(15.87 %)
13,630
(3.98 %)
43,263
(9.12 %)
n/a 43.65
(100.00 %)
40
(0.00 %)
495
(100.00 %)
727,223
(20.88 %)
290,624
(20.53 %)
1,369,709
(43.82 %)
51,671
(14.43 %)
82 brook trout (EN_2023a 2023)
GCF_029448725.1
92,568
(6.87 %)
26,875
(1.47 %)
114,101
(4.26 %)
n/a 43.70
(99.83 %)
4,299
(0.17 %)
2,721
(100.00 %)
5,005,012
(52.10 %)
2,055,293
(26.66 %)
9,701,968
(57.04 %)
89,897
(2.49 %)
83 brown-marbled grouper (2020)
GCF_011397635.1
49,205
(8.52 %)
15,634
(1.92 %)
53,710
(4.99 %)
n/a 41.33
(100.00 %)
205
(0.00 %)
26
(100.00 %)
632,147
(3.01 %)
371,482
(3.01 %)
6,438,110
(31.32 %)
26,136
(0.96 %)
84 Burton's mouthbrooder (Broad 2011)
GCF_000239415.1
47,805
(10.97 %)
14,997
(2.72 %)
25,504
(5.86 %)
n/a 40.51
(84.10 %)
61,073
(15.93 %)
69,067
(84.07 %)
311,174
(3.20 %)
125,534
(0.72 %)
4,461,288
(20.25 %)
17,722
(0.91 %)
85 Burton's mouthbrooder (NCSU 2021)
GCF_018398535.1
52,584
(12.38 %)
15,229
(2.54 %)
47,264
(5.92 %)
n/a 40.68
(89.05 %)
32,418
(10.97 %)
7,421
(100.00 %)
812,382
(17.52 %)
158,486
(1.12 %)
4,571,794
(23.61 %)
22,763
(1.21 %)
86 butterfish (fScaArg1 alternate hap 2021)
GCA_020382915.1
n/a 15,228
(3.42 %)
41,322
(7.36 %)
n/a 41.47
(100.00 %)
4
(0.00 %)
1,592
(100.00 %)
972,098
(18.43 %)
155,031
(1.41 %)
3,452,400
(21.36 %)
15,255
(1.12 %)
87 butterfish (primary hap 2021)
GCF_020382885.2
52,828
(14.10 %)
15,261
(3.43 %)
40,580
(7.38 %)
n/a 41.49
(99.70 %)
77
(0.30 %)
48
(100.00 %)
413,775
(3.11 %)
160,299
(1.55 %)
3,420,994
(21.24 %)
15,574
(1.13 %)
88 butterfly blenny (primary hap 2023)
GCA_963422515.1
n/a 14,403
(2.47 %)
61,860
(7.37 %)
n/a 43.15
(99.96 %)
1,625
(0.04 %)
525
(100.00 %)
959,651
(12.16 %)
517,137
(13.14 %)
3,775,081
(32.47 %)
81,881
(6.68 %)
89 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin alternate hap 2022)
GCA_022749735.1
n/a 19,842
(2.16 %)
72,007
(6.04 %)
n/a 41.70
(99.97 %)
2,679
(0.02 %)
15,877
(99.98 %)
1,911,945
(24.70 %)
364,933
(8.56 %)
6,201,042
(32.00 %)
39,114
(1.56 %)
90 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin primary hap 2022)
GCA_022749685.1
n/a 15,277
(2.46 %)
46,371
(5.95 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
8
(0.00 %)
179
(100.00 %)
1,369,186
(24.73 %)
232,889
(8.56 %)
4,426,065
(31.90 %)
27,134
(1.64 %)
91 channel bull blenny (2019 refseq)
GCF_900634415.1
40,788
(11.04 %)
14,472
(3.02 %)
24,012
(6.59 %)
60,720
(10.43 %)
40.96
(99.58 %)
445
(0.42 %)
322
(100.00 %)
420,697
(5.49 %)
320,518
(6.91 %)
3,394,846
(28.67 %)
20,453
(1.39 %)
92 channel bull blenny (alternate hap 2019)
GCA_900634435.1
n/a 15,980
(2.79 %)
53,680
(6.62 %)
n/a 40.96
(100.00 %)
10
(0.00 %)
11,565
(100.00 %)
451,656
(4.76 %)
321,158
(5.51 %)
3,800,099
(26.83 %)
20,338
(1.21 %)
93 channel catfish (USDA103 v2.0 2022)
GCF_001660625.3
59,187
(10.70 %)
15,782
(2.57 %)
45,562
(5.15 %)
n/a 39.82
(99.35 %)
100
(0.65 %)
137
(100.00 %)
2,257,240
(46.82 %)
671,926
(8.67 %)
5,043,664
(36.53 %)
34,284
(2.16 %)
94 cherry salmon (Uvic2021 2024)
GCF_036934945.1
80,307
(5.31 %)
27,171
(1.38 %)
123,048
(4.00 %)
n/a 44.12
(99.94 %)
4,047
(0.06 %)
18,306
(100.00 %)
1,207,353
(5.23 %)
2,779,869
(27.93 %)
11,429,057
(55.56 %)
83,137
(1.99 %)
95 chevron butterflyfish (hap1 2024)
GCA_039877785.1
n/a 15,255
(2.94 %)
48,037
(7.05 %)
n/a 42.79
(100.00 %)
49
(0.00 %)
37
(100.00 %)
465,710
(3.82 %)
254,015
(3.62 %)
3,657,999
(23.28 %)
30,971
(2.02 %)
96 chevron butterflyfish (hap2 2024)
GCA_039877575.1
n/a 15,116
(2.91 %)
47,839
(7.01 %)
n/a 42.73
(100.00 %)
43
(0.00 %)
71
(100.00 %)
463,848
(3.80 %)
254,561
(4.23 %)
3,654,295
(24.08 %)
30,593
(1.99 %)
97 chichlid (S. diagramma)
GCF_900408965.1
61,496
(12.33 %)
15,296
(2.30 %)
50,818
(6.10 %)
n/a 40.92
(100.00 %)
942
(0.00 %)
823
(100.00 %)
920,881
(19.96 %)
193,629
(1.36 %)
4,724,179
(28.98 %)
28,565
(1.65 %)
98 Chinese cavefish (2022)
GCF_024868665.1
48,058
(11.91 %)
16,738
(3.72 %)
46,295
(6.80 %)
n/a 39.61
(98.56 %)
9,510
(1.45 %)
1,039
(100.00 %)
1,469,931
(44.44 %)
188,838
(2.34 %)
3,624,116
(35.94 %)
44,615
(5.01 %)
99 Chinese large-mouth catfish (SWU-2019-XX 2020)
GCF_014805685.1
49,677
(9.64 %)
15,266
(2.70 %)
40,151
(5.21 %)
n/a 38.75
(99.82 %)
597
(0.18 %)
286
(100.00 %)
772,209
(6.45 %)
630,039
(7.45 %)
4,729,261
(37.48 %)
24,310
(1.76 %)
100 Chinese sucker (Aquarium Trade MX2 2022)
GCF_019703515.2
89,005
(6.31 %)
26,613
(1.64 %)
77,184
(3.14 %)
n/a 39.08
(100.00 %)
224
(0.00 %)
353
(100.00 %)
9,298,177
(59.91 %)
977,119
(3.49 %)
13,499,422
(52.38 %)
100,309
(2.90 %)
101 Chinook salmon (v1 2018 female)
GCF_002872995.1
81,340
(5.14 %)
27,462
(1.53 %)
54,538
(3.80 %)
n/a 43.55
(97.26 %)
272,151
(2.76 %)
15,944
(99.99 %)
1,207,194
(4.55 %)
2,524,408
(13.75 %)
12,127,831
(47.56 %)
87,959
(2.02 %)
102 Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male rfseq)
GCF_018296145.1
92,383
(5.73 %)
26,372
(1.57 %)
107,059
(4.12 %)
157,582
(6.65 %)
43.55
(99.99 %)
2,334
(0.01 %)
9,978
(99.99 %)
1,483,168
(7.79 %)
2,306,695
(23.48 %)
10,038,888
(54.54 %)
62,726
(1.40 %)
103 chub mackerel (fScoJap1 alternate hap 2022)
GCA_027409835.1
n/a 15,165
(2.44 %)
46,105
(6.16 %)
n/a 39.93
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,163
(100.00 %)
1,546,066
(27.08 %)
537,737
(9.87 %)
4,485,153
(30.70 %)
14,774
(0.81 %)
104 chub mackerel (primary hap 2022 refseq)
GCF_027409825.1
34,390
(6.95 %)
15,348
(2.35 %)
46,858
(6.07 %)
n/a 40.01
(99.92 %)
1,572
(0.08 %)
360
(100.00 %)
1,669,322
(28.44 %)
638,340
(11.55 %)
4,613,373
(32.38 %)
16,290
(0.85 %)
105 chum salmon (Oke142-1_Chum_Gynogen 2020)
GCF_012931545.1
76,338
(6.27 %)
23,186
(1.70 %)
90,881
(4.14 %)
n/a 43.06
(95.36 %)
242,238
(4.66 %)
28,109
(99.98 %)
1,143,292
(6.07 %)
1,487,818
(12.14 %)
8,992,314
(46.24 %)
51,797
(1.25 %)
106 chum salmon (PuntledgeMale-10-30-2019 2022)
GCF_023373465.1
205,915
(6.68 %)
26,582
(1.42 %)
119,437
(4.14 %)
120,379
(5.87 %)
43.89
(99.99 %)
3,433
(0.01 %)
17,480
(99.99 %)
1,160,500
(5.63 %)
2,584,312
(31.72 %)
10,621,107
(55.67 %)
68,538
(1.53 %)
107 climbing perch (alternate hap 2019)
GCA_900650485.1
n/a 14,940
(3.51 %)
39,688
(7.41 %)
n/a 40.40
(99.61 %)
36
(0.39 %)
2,641
(100.00 %)
307,993
(2.63 %)
121,935
(1.79 %)
3,190,928
(20.98 %)
10,131
(0.86 %)
108 climbing perch (v1.3 2021)
GCA_900324465.3
n/a 15,241
(3.53 %)
39,067
(7.54 %)
67,055
(11.68 %)
40.40
(99.35 %)
266
(0.65 %)
51
(100.00 %)
633,883
(15.28 %)
130,249
(1.89 %)
3,325,008
(21.31 %)
10,500
(0.87 %)
109 clown anemonefish (DU_AmpOce 2017)
GCF_002776465.1
53,567
(9.24 %)
15,685
(2.23 %)
33,477
(5.63 %)
n/a 39.47
(99.94 %)
1,406
(0.06 %)
6,405
(100.00 %)
431,950
(2.92 %)
381,394
(4.84 %)
4,952,343
(31.95 %)
23,543
(1.15 %)
110 clown anemonefish (Okinawa individual 3 2022)
GCF_022539595.1
53,912
(11.11 %)
15,702
(2.37 %)
47,805
(5.50 %)
n/a 39.59
(99.98 %)
1,454
(0.02 %)
354
(100.00 %)
1,346,903
(35.25 %)
401,782
(5.36 %)
4,891,035
(31.59 %)
23,489
(1.28 %)
111 coho salmon (150728-3 2019)
GCF_002021735.2
100,850
(6.58 %)
27,072
(1.56 %)
50,811
(3.95 %)
125,873
(5.26 %)
43.55
(99.98 %)
5,631
(0.02 %)
4,482
(100.00 %)
1,491,966
(6.88 %)
2,135,217
(25.52 %)
10,152,659
(54.74 %)
65,662
(1.36 %)
112 common bream (primary hap 2024)
GCA_963993115.1
n/a 18,114
(2.63 %)
66,549
(6.11 %)
n/a 38.62
(99.99 %)
685
(0.01 %)
215
(100.00 %)
2,639,968
(48.46 %)
659,243
(7.55 %)
5,950,358
(40.47 %)
62,337
(3.61 %)
113 common carp (R8XR3 2021)
GCA_905221575.1
n/a 30,973
(3.47 %)
83,657
(5.95 %)
n/a 37.06
(100.00 %)
372
(0.00 %)
674
(100.00 %)
3,324,121
(41.45 %)
707,134
(4.72 %)
8,110,561
(39.08 %)
44,388
(1.60 %)
114 common carp (SPL01 2021)
GCF_018340385.1
91,210
(7.89 %)
31,041
(2.89 %)
89,244
(5.01 %)
n/a 37.11
(99.53 %)
26,351
(0.48 %)
6,701
(100.00 %)
1,634,612
(6.00 %)
919,239
(3.97 %)
10,192,037
(38.56 %)
52,638
(1.62 %)
115 common dab (primary hap 2023)
GCF_963576545.1
36,211
(8.34 %)
14,995
(2.62 %)
50,844
(6.89 %)
n/a 42.67
(99.99 %)
275
(0.01 %)
338
(100.00 %)
1,186,799
(32.17 %)
307,864
(16.34 %)
3,562,802
(35.00 %)
41,657
(2.72 %)
116 common seadragon (TA_2022b 2022)
GCF_024500385.1
60,947
(12.28 %)
13,706
(2.67 %)
42,956
(5.71 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
196
(0.00 %)
1,259
(100.00 %)
1,417,848
(37.47 %)
173,323
(3.85 %)
3,968,694
(40.23 %)
70,253
(6.29 %)
117 common sole (alternate hap 2023)
GCA_958295035.1
n/a 14,904
(2.99 %)
43,194
(7.09 %)
n/a 40.77
(100.00 %)
n/a 1,318
(100.00 %)
1,128,080
(18.77 %)
328,975
(8.35 %)
3,952,898
(31.64 %)
26,979
(2.08 %)
118 common sole (primary hap 2023 refseq)
GCF_958295425.1
55,359
(12.02 %)
14,844
(2.94 %)
42,832
(6.93 %)
n/a 40.87
(99.99 %)
373
(0.01 %)
242
(100.00 %)
1,149,243
(19.12 %)
342,238
(9.71 %)
3,906,753
(32.84 %)
27,772
(2.71 %)
119 common whitefish (fCorLav1.hap1.1 2024)
GCA_964263955.1
n/a 29,103
(1.36 %)
124,287
(3.94 %)
n/a 43.87
(99.96 %)
5,995
(0.04 %)
11,150
(100.00 %)
1,655,140
(4.68 %)
1,843,550
(17.63 %)
9,367,555
(61.56 %)
112,654
(3.84 %)
120 common whitefish (fCorLav1.hap2.1 2024)
GCA_964263835.1
n/a 25,968
(1.48 %)
104,922
(4.18 %)
n/a 43.67
(99.96 %)
4,689
(0.04 %)
8,669
(99.96 %)
1,320,339
(4.08 %)
1,364,334
(15.61 %)
7,674,742
(61.10 %)
94,019
(3.82 %)
121 convict blenny (fPhoLeu1 alternate hap 2021)
GCA_020510965.1
n/a 5,231
(0.27 %)
47,644
(1.48 %)
n/a 44.62
(99.99 %)
144
(0.01 %)
21,561
(99.99 %)
2,803,873
(49.20 %)
655,416
(2.69 %)
7,558,550
(67.05 %)
181,626
(10.52 %)
122 convict blenny (primary hap 2021)
GCA_020510985.1
n/a n/a 134,417
(1.50 %)
n/a 44.52
(99.13 %)
2,580
(0.87 %)
512
(100.00 %)
9,062,541
(49.33 %)
2,097,650
(2.66 %)
3,092
(99.13 %)
568,042
(10.14 %)
123 copperband butterflyfish (fCheRos1 alternate hap 2021)
GCA_017976315.1
n/a 13,622
(2.81 %)
43,285
(6.93 %)
n/a 42.59
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,125
(100.00 %)
1,741,373
(32.89 %)
182,926
(2.01 %)
3,659,106
(21.68 %)
27,693
(1.89 %)
124 copperband butterflyfish (primary hap 2021)
GCF_017976325.1
35,291
(10.46 %)
15,210
(3.03 %)
44,916
(6.99 %)
61,755
(8.99 %)
42.57
(100.00 %)
60
(0.00 %)
29
(100.00 %)
406,118
(2.95 %)
199,450
(2.10 %)
3,861,745
(21.57 %)
29,106
(1.85 %)
125 corkwing wrasse (primary hap 2022)
GCA_947650265.1
n/a 14,740
(2.91 %)
45,483
(7.26 %)
n/a 41.82
(99.96 %)
1,379
(0.04 %)
395
(100.00 %)
936,676
(24.41 %)
306,192
(9.29 %)
3,495,456
(28.75 %)
29,142
(2.35 %)
126 Corydoras catfish unclassified (C115 2021)
GCA_019802505.1
n/a 14,695
(2.68 %)
51,799
(6.37 %)
n/a 42.12
(100.00 %)
n/a 2,080
(100.00 %)
1,969,654
(37.02 %)
663,295
(11.19 %)
3,764,275
(45.19 %)
67,226
(8.43 %)
127 crucian carp (alternate hap 2023)
GCA_963082795.1
n/a 4,509
(3.03 %)
16,936
(7.22 %)
n/a 38.67
(100.00 %)
n/a 3,713
(100.00 %)
430,197
(46.38 %)
101,926
(7.54 %)
1,077,239
(32.21 %)
10,612
(4.11 %)
128 crucian carp (primary hap 2023 refseq)
GCF_963082965.1
90,094
(6.75 %)
29,386
(2.81 %)
88,291
(5.37 %)
n/a 38.31
(99.99 %)
832
(0.01 %)
277
(100.00 %)
3,481,382
(45.81 %)
802,773
(6.54 %)
8,190,783
(44.41 %)
83,696
(3.82 %)
129 cuckoo wrasse (primary hap 2023)
GCF_963584025.1
51,190
(10.37 %)
15,144
(2.59 %)
43,207
(5.98 %)
n/a 40.77
(99.98 %)
570
(0.02 %)
324
(100.00 %)
1,435,625
(29.39 %)
330,276
(12.54 %)
4,196,830
(33.83 %)
19,310
(1.01 %)
130 cunner (fTauAds1 alternate hap 2021)
GCA_020745675.1
n/a 14,861
(2.74 %)
42,996
(6.34 %)
n/a 41.31
(99.99 %)
31
(0.01 %)
1,476
(100.00 %)
1,373,727
(30.17 %)
220,572
(4.38 %)
4,176,936
(27.32 %)
17,129
(1.04 %)
131 cunner (primary hap 2021)
GCA_020745685.1
n/a 15,192
(2.74 %)
43,564
(6.38 %)
n/a 41.31
(99.41 %)
283
(0.59 %)
64
(100.00 %)
1,419,667
(30.50 %)
243,024
(4.81 %)
4,334,690
(27.65 %)
17,974
(1.06 %)
132 Dalai köbertrulling (WHDGS20190420 2020)
GCF_015846415.1
49,108
(12.72 %)
16,501
(4.06 %)
40,671
(7.11 %)
n/a 38.77
(100.00 %)
116
(0.00 %)
167
(100.00 %)
1,213,719
(40.21 %)
134,299
(3.43 %)
3,676,403
(30.98 %)
29,879
(3.18 %)
133 Danionella translucida (Bolton 2019)
GCA_007224835.1
n/a 16,341
(3.18 %)
41,545
(5.47 %)
n/a 38.57
(98.69 %)
8,366
(1.31 %)
36,005
(98.69 %)
300,659
(2.50 %)
212,357
(6.15 %)
4,267,143
(35.05 %)
23,311
(2.18 %)
134 Danionella translucida (fDanTra1 2020)
GCA_903798025.1
n/a 15,965
(3.73 %)
37,421
(5.87 %)
n/a 38.52
(94.12 %)
18,487
(5.88 %)
29,831
(94.12 %)
251,333
(2.28 %)
132,120
(1.41 %)
4,061,554
(28.83 %)
16,871
(1.57 %)
135 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 refseq)
GCF_021462225.1
56,220
(7.59 %)
15,422
(1.71 %)
50,084
(4.18 %)
n/a 40.18
(99.46 %)
409
(0.54 %)
72
(100.00 %)
369,606
(1.86 %)
176,954
(1.87 %)
6,142,638
(38.35 %)
32,973
(1.28 %)
136 delta smelt
GCF_021917145.1
41,807
(14.97 %)
14,549
(4.09 %)
44,849
(9.74 %)
n/a 44.99
(99.92 %)
1,474
(0.08 %)
376
(100.00 %)
387,882
(5.57 %)
383,522
(9.22 %)
1,814,696
(32.48 %)
28,299
(3.33 %)
137 denticle herring (alternate hap 2019)
GCA_900700345.2
n/a 14,119
(3.95 %)
47,988
(8.57 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
4
(0.00 %)
1,972
(100.00 %)
312,660
(2.77 %)
160,575
(2.83 %)
2,525,528
(27.70 %)
50,830
(8.72 %)
138 denticle herring (v2 2020)
GCA_900700375.2
n/a 16,559
(3.78 %)
58,823
(8.66 %)
74,128
(10.47 %)
43.69
(99.18 %)
464
(0.82 %)
461
(100.00 %)
403,512
(3.23 %)
224,284
(4.61 %)
2,948,738
(28.79 %)
64,661
(9.49 %)
139 dorado (hap1 2023)
GCA_030448965.1
n/a 16,788
(2.12 %)
50,338
(4.68 %)
n/a 41.27
(98.12 %)
641
(1.88 %)
182
(100.00 %)
2,709,759
(34.74 %)
798,364
(14.84 %)
5,418,190
(36.02 %)
30,055
(1.31 %)
140 dorado (hap2 2023)
GCA_030463535.1
n/a 16,799
(2.11 %)
50,411
(4.67 %)
n/a 41.29
(99.15 %)
726
(0.85 %)
104
(100.00 %)
2,693,928
(34.60 %)
805,807
(14.65 %)
5,615,731
(36.69 %)
30,083
(1.31 %)
141 double-spotted pufferfish T.bimaculatus (TB-2018 2019)
GCA_004026145.2
n/a 14,760
(4.56 %)
56,353
(11.37 %)
n/a 45.56
(99.97 %)
1,033
(0.03 %)
1,158
(100.00 %)
292,029
(9.69 %)
192,568
(5.53 %)
1,623,924
(22.71 %)
51,743
(9.31 %)
142 dwarf seahorse (Florida 2022)
GCF_025434085.1
51,353
(12.50 %)
13,736
(3.19 %)
50,537
(7.64 %)
n/a 44.73
(100.00 %)
79
(0.00 %)
213
(100.00 %)
986,789
(36.30 %)
235,862
(13.25 %)
2,323,084
(41.85 %)
68,121
(17.75 %)
143 eastern happy (v3 2021)
GCA_900246225.5
n/a 15,552
(2.29 %)
52,465
(6.26 %)
86,437
(9.40 %)
41.07
(99.87 %)
490
(0.13 %)
364
(100.00 %)
1,309,350
(35.93 %)
217,916
(1.89 %)
4,547,434
(30.78 %)
33,005
(1.88 %)
144 electric eel (fEleEle1 alternate hap 2020)
GCA_013347915.1
n/a 12,020
(3.63 %)
38,881
(7.31 %)
n/a 42.77
(100.00 %)
n/a 2,629
(100.00 %)
429,509
(7.66 %)
432,260
(11.41 %)
2,049,609
(24.32 %)
35,597
(4.37 %)
145 electric eel (fEleEle1 primary hap 2020)
GCF_013358815.1
48,958
(12.10 %)
15,950
(3.66 %)
48,976
(7.25 %)
54,541
(8.42 %)
42.49
(98.20 %)
227
(1.80 %)
89
(100.00 %)
567,625
(7.41 %)
564,286
(10.86 %)
2,935,360
(24.79 %)
44,501
(3.93 %)
146 electric eel (MRS-EE1 2018 U Wisconsin)
GCF_003665695.1
40,618
(11.48 %)
15,837
(3.85 %)
23,074
(6.63 %)
n/a 42.56
(96.95 %)
119,361
(3.09 %)
8,786
(100.00 %)
519,014
(5.41 %)
516,718
(6.65 %)
3,020,801
(21.49 %)
41,947
(3.71 %)
147 elephant fish B.brachyistius (T26 2022)
GCF_023856365.1
82,153
(9.98 %)
16,513
(2.13 %)
79,047
(6.37 %)
n/a 44.15
(99.99 %)
234
(0.01 %)
1,425
(100.00 %)
923,543
(11.79 %)
425,650
(9.45 %)
3,525,237
(34.97 %)
91,552
(5.39 %)
148 emerald rockcod
GCF_902827165.1
44,179
(8.48 %)
15,275
(2.20 %)
57,830
(6.43 %)
63,731
(6.65 %)
40.94
(99.99 %)
932
(0.01 %)
864
(100.00 %)
460,185
(3.64 %)
399,729
(6.87 %)
3,533,188
(40.09 %)
52,191
(2.51 %)
149 Eurasian minnow (alternate hap 2023)
GCA_949152275.1
n/a 17,920
(3.03 %)
59,697
(6.61 %)
n/a 39.13
(100.00 %)
8
(0.00 %)
4,949
(100.00 %)
2,285,870
(44.17 %)
480,649
(10.13 %)
4,833,803
(39.56 %)
57,737
(4.15 %)
150 Eurasian minnow (primary hap 2023)
GCA_949152265.1
n/a 17,661
(3.01 %)
58,218
(6.54 %)
n/a 39.21
(99.98 %)
881
(0.02 %)
125
(100.00 %)
2,346,939
(44.27 %)
502,415
(11.23 %)
4,890,830
(40.45 %)
60,482
(4.22 %)
151 European anchovy (BLACKSEA-1 2023)
GCF_034702125.1
48,154
(5.87 %)
15,415
(1.33 %)
77,712
(5.08 %)
n/a 44.45
(99.99 %)
9,202
(0.02 %)
1,922
(100.00 %)
4,406,534
(31.73 %)
2,331,293
(15.35 %)
6,863,540
(50.47 %)
80,927
(2.32 %)
152 European chub (alternate hap 2023)
GCA_949319155.1
n/a 17,416
(2.74 %)
60,936
(6.02 %)
n/a 38.65
(100.00 %)
12
(0.00 %)
7,437
(100.00 %)
2,377,147
(47.98 %)
578,235
(8.27 %)
5,267,308
(40.22 %)
50,909
(3.45 %)
153 European chub (primary hap 2023)
GCA_949319135.1
n/a 18,028
(2.64 %)
64,206
(6.04 %)
n/a 38.73
(99.99 %)
588
(0.01 %)
106
(100.00 %)
2,649,943
(48.88 %)
666,129
(9.08 %)
5,751,610
(41.56 %)
58,471
(3.64 %)
154 European flounder (alternate hap 2023)
GCA_949316195.1
n/a 14,690
(3.17 %)
48,422
(7.90 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
n/a 1,915
(100.00 %)
1,138,190
(26.31 %)
249,865
(4.72 %)
3,352,038
(25.55 %)
36,828
(3.13 %)
155 European flounder (primary hap 2023 genbank)
GCA_949316205.1
n/a 14,753
(3.17 %)
47,618
(7.81 %)
n/a 42.59
(99.98 %)
482
(0.02 %)
109
(100.00 %)
1,160,784
(27.06 %)
251,985
(5.23 %)
3,353,121
(26.00 %)
37,130
(2.79 %)
156 European flounder (primary hap 2023 refseq)
GCF_949316205.1
48,969
(12.45 %)
14,751
(3.17 %)
47,618
(7.81 %)
n/a 42.59
(99.98 %)
482
(0.02 %)
108
(100.00 %)
1,160,781
(27.06 %)
251,983
(5.23 %)
3,353,086
(26.00 %)
37,129
(2.79 %)
157 European perch
GCF_010015445.1
55,605
(8.20 %)
15,430
(2.07 %)
55,499
(5.43 %)
n/a 40.90
(99.97 %)
801
(0.03 %)
303
(100.00 %)
684,094
(5.16 %)
634,788
(7.48 %)
5,182,241
(37.07 %)
44,049
(1.94 %)
158 European plaice (alternate hap 2022)
GCA_947347695.1
n/a 14,619
(2.94 %)
50,389
(7.92 %)
n/a 42.58
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3,222
(100.00 %)
430,112
(3.88 %)
299,581
(6.89 %)
3,182,258
(27.97 %)
40,094
(3.66 %)
159 European plaice (primary hap 2022 refseq)
GCF_947347685.1
46,468
(10.51 %)
14,818
(2.71 %)
51,453
(7.41 %)
n/a 42.51
(99.97 %)
1,072
(0.03 %)
355
(100.00 %)
476,314
(3.63 %)
520,729
(13.27 %)
3,283,360
(33.55 %)
47,050
(4.45 %)
160 European seabass (2021)
GCF_905237075.1
62,457
(13.08 %)
15,582
(2.89 %)
44,472
(6.56 %)
69,435
(12.92 %)
40.38
(99.85 %)
272
(0.15 %)
303
(100.00 %)
1,210,970
(24.30 %)
278,140
(4.02 %)
4,343,442
(26.18 %)
15,975
(0.93 %)
161 European smelt (primary hap 2023 genbank)
GCA_963692335.1
n/a 15,640
(3.79 %)
50,248
(9.36 %)
n/a 45.42
(99.90 %)
2,462
(0.10 %)
1,038
(100.00 %)
1,648,435
(31.35 %)
508,368
(13.05 %)
1,992,832
(35.86 %)
33,284
(4.05 %)
162 European smelt (primary hap 2023 refseq)
GCF_963692335.1
46,762
(14.07 %)
15,639
(3.79 %)
50,238
(9.36 %)
n/a 45.42
(99.90 %)
2,462
(0.10 %)
1,007
(100.00 %)
1,648,428
(31.34 %)
508,368
(13.05 %)
1,992,793
(35.86 %)
33,284
(4.05 %)
163 European sprat (primary hap 2023)
GCA_963457725.1
n/a 16,181
(2.44 %)
63,544
(7.17 %)
n/a 43.83
(99.96 %)
1,501
(0.04 %)
387
(100.00 %)
2,109,362
(31.42 %)
1,300,159
(14.91 %)
3,634,744
(35.44 %)
35,552
(1.87 %)
164 fathead minnow
GCF_016745375.1
57,312
(8.34 %)
18,039
(3.02 %)
52,431
(6.01 %)
n/a 38.45
(86.78 %)
5,594
(13.23 %)
911
(100.00 %)
657,027
(4.09 %)
444,571
(6.23 %)
4,902,960
(35.69 %)
49,361
(2.78 %)
165 flathead mullet
GCF_022458985.1
48,689
(12.71 %)
14,908
(3.00 %)
45,084
(6.96 %)
75,582
(11.23 %)
41.90
(99.97 %)
445
(0.04 %)
24
(100.00 %)
469,841
(3.23 %)
207,738
(2.31 %)
3,955,233
(24.74 %)
45,885
(3.03 %)
166 flier cichlid (alternate hap MPI-CPG 2019)
GCA_007364235.1
n/a 17,494
(2.06 %)
62,257
(5.73 %)
n/a 41.17
(99.98 %)
13
(0.02 %)
9,305
(99.98 %)
1,140,986
(16.60 %)
316,083
(2.17 %)
6,036,560
(30.48 %)
26,445
(1.22 %)
167 flier cichlid (MPI-CPG 2019 refseq)
GCF_007364275.1
43,842
(8.12 %)
15,434
(2.15 %)
26,448
(5.90 %)
64,657
(6.60 %)
41.23
(98.19 %)
744
(1.81 %)
188
(100.00 %)
1,014,141
(16.95 %)
287,035
(2.21 %)
5,305,890
(30.67 %)
24,130
(1.26 %)
168 freshwater garfish (fXenCan1 alternate hap 2020)
GCA_014839645.1
n/a 13,745
(2.58 %)
50,416
(6.72 %)
n/a 41.33
(100.00 %)
2
(0.00 %)
5,171
(100.00 %)
442,646
(4.09 %)
276,927
(5.42 %)
3,741,267
(26.25 %)
28,827
(2.28 %)
169 freshwater garfish (primary hap 2020)
GCA_014839995.1
n/a 14,625
(2.57 %)
52,879
(6.72 %)
n/a 41.41
(98.98 %)
1,373
(1.02 %)
410
(100.00 %)
492,828
(4.29 %)
318,631
(5.94 %)
3,977,536
(27.41 %)
32,390
(2.33 %)
170 giant grouper
GCF_005281545.1
45,328
(7.65 %)
15,661
(1.91 %)
53,910
(4.91 %)
n/a 41.26
(96.40 %)
23,415
(3.61 %)
4,201
(100.00 %)
604,763
(2.71 %)
357,944
(2.52 %)
6,501,327
(30.28 %)
26,431
(0.91 %)
171 gilthead seabream (alternate hap 2019)
GCA_900880695.1
n/a 13,090
(2.37 %)
48,927
(6.41 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
2
(0.00 %)
7,241
(100.00 %)
422,758
(2.89 %)
231,452
(2.54 %)
3,818,141
(24.36 %)
38,368
(2.40 %)
172 gilthead seabream (v2 2021)
GCA_900880675.2
n/a 15,752
(2.45 %)
56,395
(6.58 %)
n/a 41.94
(99.96 %)
1,050
(0.04 %)
176
(100.00 %)
1,474,134
(29.50 %)
305,809
(3.03 %)
4,701,691
(25.69 %)
47,327
(2.41 %)
173 golden-line barbel
GCF_001515645.1
74,071
(6.71 %)
29,486
(2.77 %)
55,545
(5.32 %)
n/a 37.54
(89.58 %)
136,894
(10.45 %)
168,074
(89.55 %)
1,118,646
(5.04 %)
718,426
(6.54 %)
9,092,306
(37.16 %)
70,606
(1.91 %)
174 goldfish
GCF_003368295.1
116,745
(8.75 %)
35,097
(2.94 %)
68,251
(6.12 %)
n/a 37.48
(99.99 %)
2,247
(0.01 %)
8,463
(99.99 %)
1,693,800
(5.39 %)
916,195
(5.01 %)
9,731,118
(40.19 %)
66,585
(2.06 %)
175 grass carp (HZGC_01 2021)
GCF_019924925.1
67,810
(11.16 %)
18,195
(3.27 %)
48,459
(5.67 %)
n/a 37.48
(99.98 %)
150
(0.02 %)
31
(100.00 %)
654,416
(3.33 %)
429,734
(3.77 %)
5,501,085
(40.21 %)
26,282
(1.58 %)
176 great blue-spotted mudskipper (Guang Dong 2022)
GCF_026225935.1
36,344
(7.09 %)
14,512
(1.92 %)
45,809
(4.61 %)
n/a 39.76
(99.63 %)
3,407
(0.37 %)
600
(100.00 %)
2,662,894
(54.47 %)
803,911
(10.32 %)
5,763,692
(48.31 %)
53,808
(2.65 %)
177 great blue-spotted mudskipper (pooled male+femail 2014 BGI)
GCF_000788275.1
25,822
(5.19 %)
14,212
(1.97 %)
27,894
(4.68 %)
n/a 39.49
(93.15 %)
92,327
(6.89 %)
108,947
(93.11 %)
552,368
(5.00 %)
742,395
(8.07 %)
5,901,720
(42.46 %)
44,972
(1.97 %)
178 greater amberjack
GCF_002260705.1
33,756
(9.11 %)
15,336
(2.93 %)
22,220
(6.07 %)
n/a 40.86
(99.17 %)
9,742
(0.82 %)
34,656
(100.00 %)
573,770
(4.04 %)
368,800
(3.72 %)
4,449,534
(24.71 %)
15,850
(0.98 %)
179 greater argentine (alternate hap 2023)
GCA_951799415.1
n/a 15,483
(3.45 %)
47,484
(7.95 %)
n/a 44.71
(100.00 %)
n/a 4,805
(100.00 %)
1,400,150
(23.78 %)
738,163
(17.35 %)
2,460,977
(35.90 %)
20,794
(2.09 %)
180 greater argentine (primary hap 2023)
GCA_951799395.1
n/a 16,553
(3.15 %)
51,766
(7.37 %)
n/a 44.75
(99.95 %)
1,752
(0.05 %)
1,085
(100.00 %)
1,674,762
(26.07 %)
900,455
(18.62 %)
2,849,256
(39.22 %)
26,022
(2.30 %)
181 greater pipefish (v1 alternate hap 2019)
GCA_901709685.1
n/a 10,795
(5.59 %)
33,380
(12.07 %)
n/a 43.29
(100.00 %)
2
(0.00 %)
1,848
(100.00 %)
140,376
(2.96 %)
81,000
(3.32 %)
1,318,564
(23.30 %)
34,104
(12.82 %)
182 greater pipefish (v1.2 2020 refseq)
GCF_901709675.1
47,335
(18.32 %)
13,477
(5.26 %)
42,380
(12.01 %)
37,563
(15.76 %)
43.46
(100.00 %)
43
(0.00 %)
87
(100.00 %)
193,407
(3.05 %)
125,716
(4.25 %)
1,676,004
(25.93 %)
46,327
(10.97 %)
183 greater pipefish (v2 2023 genbank)
GCA_948146105.1
n/a 13,412
(4.76 %)
45,946
(11.50 %)
n/a 44.34
(99.99 %)
95
(0.01 %)
251
(100.00 %)
494,547
(20.10 %)
204,804
(10.66 %)
1,444,044
(34.08 %)
47,904
(17.47 %)
184 greater pipefish (v2 alternate haplotype 2023)
GCA_948146095.1
n/a 13,681
(4.93 %)
45,034
(11.64 %)
n/a 43.88
(100.00 %)
n/a 4,533
(100.00 %)
460,038
(18.47 %)
163,838
(7.90 %)
1,681,190
(29.08 %)
47,523
(15.60 %)
185 greater sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_949358355.1
n/a 13,432
(2.10 %)
50,930
(6.39 %)
n/a 41.05
(100.00 %)
n/a 4,952
(100.00 %)
2,495,763
(38.80 %)
473,105
(6.27 %)
3,444,123
(38.56 %)
35,298
(1.94 %)
186 greater sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949357725.1
n/a 15,028
(2.35 %)
50,436
(6.30 %)
n/a 41.10
(99.97 %)
1,188
(0.03 %)
1,568
(100.00 %)
2,688,222
(39.74 %)
549,362
(7.60 %)
3,564,661
(40.05 %)
37,043
(1.94 %)
187 green swordtail
GCF_003331165.1
52,602
(11.81 %)
14,955
(2.58 %)
47,115
(6.33 %)
n/a 39.09
(99.71 %)
661
(0.29 %)
272
(100.00 %)
328,469
(2.10 %)
162,178
(2.35 %)
4,801,050
(28.86 %)
37,217
(2.39 %)
188 grey gurnard (primary hap 2023)
GCA_963514095.1
n/a 14,752
(2.74 %)
58,725
(8.49 %)
n/a 43.13
(99.98 %)
553
(0.02 %)
322
(100.00 %)
1,860,845
(35.64 %)
378,045
(9.39 %)
3,208,482
(30.12 %)
66,857
(4.99 %)
189 gudgeon (alternate hap 2023)
GCA_949357705.1
n/a 16,645
(1.92 %)
62,533
(4.55 %)
n/a 39.69
(100.00 %)
8
(0.00 %)
7,253
(100.00 %)
5,166,731
(67.78 %)
750,850
(11.35 %)
5,903,440
(54.20 %)
90,235
(5.58 %)
190 gudgeon (primary hap 2023)
GCA_949357685.1
n/a 17,136
(1.90 %)
63,611
(4.50 %)
n/a 39.74
(99.99 %)
1,046
(0.01 %)
233
(100.00 %)
5,662,029
(68.75 %)
825,757
(11.99 %)
6,236,024
(55.15 %)
99,559
(5.68 %)
191 Gulf pipefish (Florida 2022)
GCF_024217435.2
53,176
(17.83 %)
13,439
(4.00 %)
41,519
(8.87 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
11
(0.00 %)
495
(100.00 %)
644,597
(20.82 %)
180,309
(16.78 %)
1,339,434
(43.63 %)
51,080
(18.49 %)
192 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.1 Florida 2022 refseq)
GCF_024217435.1
58,587
(18.27 %)
13,442
(4.00 %)
41,565
(8.87 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
11
(0.00 %)
496
(100.00 %)
253,033
(3.86 %)
180,311
(16.78 %)
1,339,521
(43.63 %)
51,080
(18.49 %)
193 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.2 Florida 2022 genbank)
GCA_024217435.4
n/a 13,441
(4.00 %)
41,519
(8.87 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
11
(0.00 %)
496
(100.00 %)
644,601
(20.82 %)
180,310
(16.78 %)
1,339,461
(43.63 %)
51,080
(18.49 %)
194 guppy
GCF_000633615.1
48,290
(11.24 %)
14,436
(2.72 %)
44,759
(6.24 %)
n/a 39.33
(90.86 %)
458,354
(9.22 %)
40,143
(90.84 %)
340,480
(2.43 %)
167,943
(1.50 %)
4,695,380
(25.63 %)
35,188
(1.91 %)
195 honeycomb rockfish (fSebUmb1 alternate hap 2020)
GCA_015220095.1
n/a 15,058
(2.50 %)
46,340
(5.85 %)
n/a 40.71
(100.00 %)
21
(0.00 %)
2,131
(100.00 %)
1,642,351
(37.42 %)
389,169
(5.43 %)
4,687,710
(35.55 %)
34,408
(1.75 %)
196 honeycomb rockfish (primary hap 2020)
GCF_015220745.1
57,752
(9.94 %)
15,244
(2.44 %)
47,034
(5.98 %)
63,546
(8.88 %)
40.77
(99.83 %)
215
(0.17 %)
138
(100.00 %)
524,161
(3.79 %)
422,265
(6.20 %)
4,827,148
(36.22 %)
37,878
(1.84 %)
197 horned golden-line barbel
GCF_001515625.1
74,585
(6.94 %)
30,802
(3.11 %)
57,655
(5.63 %)
n/a 37.18
(91.91 %)
150,790
(8.11 %)
314,962
(91.89 %)
1,147,234
(4.93 %)
708,513
(4.77 %)
9,080,512
(35.95 %)
63,217
(1.71 %)
198 humphead wrasse
GCF_018320785.1
42,229
(6.60 %)
15,287
(1.66 %)
47,025
(4.13 %)
n/a 39.53
(100.00 %)
284
(0.00 %)
46
(100.00 %)
447,458
(2.27 %)
310,170
(4.65 %)
8,002,463
(32.97 %)
12,252
(0.38 %)
199 Indian glassy fish (alternate hap 2019)
GCA_900651595.1
n/a 14,412
(3.70 %)
41,944
(8.58 %)
n/a 42.27
(99.58 %)
230
(0.42 %)
2,242
(100.00 %)
304,774
(2.86 %)
140,555
(2.80 %)
2,689,154
(24.08 %)
15,419
(1.38 %)
200 Indian glassy fish (v2 2020)
GCA_900634625.2
n/a 15,339
(3.60 %)
44,099
(8.47 %)
57,867
(10.10 %)
42.38
(98.08 %)
1,523
(1.92 %)
157
(100.00 %)
346,399
(3.02 %)
163,524
(3.00 %)
2,755,274
(25.07 %)
17,931
(1.47 %)
201 Indian medaka
GCF_002922805.2
49,295
(10.27 %)
14,591
(2.49 %)
52,982
(6.37 %)
n/a 39.04
(94.83 %)
51,550
(5.20 %)
8,493
(100.00 %)
319,151
(2.20 %)
208,690
(2.67 %)
5,412,546
(33.29 %)
40,721
(2.36 %)
202 Indo-Pacific tarpon (2020)
GCF_013368585.1
41,583
(6.91 %)
18,302
(2.47 %)
29,762
(5.45 %)
74,968
(7.01 %)
43.02
(99.97 %)
63
(0.03 %)
207
(100.00 %)
603,558
(3.71 %)
433,446
(4.32 %)
5,341,985
(22.07 %)
78,561
(3.69 %)
203 Japanese flounder
GCF_001970005.1
37,838
(12.25 %)
14,521
(3.39 %)
30,773
(7.34 %)
n/a 41.64
(81.04 %)
40,314
(18.97 %)
9,525
(100.00 %)
332,322
(2.84 %)
164,916
(1.16 %)
3,476,344
(17.36 %)
21,768
(1.42 %)
204 Japanese flounder (ysfri-2021 2022)
GCF_024713975.1
60,200
(14.08 %)
14,987
(3.26 %)
42,919
(7.40 %)
n/a 41.54
(100.00 %)
21
(0.00 %)
25
(100.00 %)
850,797
(19.88 %)
308,390
(6.45 %)
3,329,304
(26.55 %)
23,373
(1.76 %)
205 Japanese medaka
GCF_002234675.1
50,526
(10.32 %)
14,325
(2.50 %)
27,912
(6.71 %)
91,652
(11.67 %)
40.84
(99.93 %)
491
(0.07 %)
25
(100.00 %)
384,317
(4.42 %)
163,041
(3.07 %)
4,631,750
(34.91 %)
41,215
(2.89 %)
206 jewelled blenny (2019)
GCF_902148845.1
42,877
(8.61 %)
15,188
(2.40 %)
41,262
(7.86 %)
58,418
(6.97 %)
44.34
(98.69 %)
602
(1.31 %)
203
(100.00 %)
667,122
(4.21 %)
442,004
(5.09 %)
4,388,570
(26.54 %)
121,464
(9.36 %)
207 jewelled blenny (alternate hap 2019)
GCA_902148835.1
n/a 15,945
(2.17 %)
101,825
(8.93 %)
n/a 44.49
(99.63 %)
9
(0.37 %)
4,516
(100.00 %)
744,228
(4.25 %)
519,896
(5.73 %)
4,677,160
(28.52 %)
138,484
(9.55 %)
208 John dory (alternate hap 2023)
GCA_960530785.1
n/a 14,960
(2.23 %)
74,436
(6.65 %)
n/a 43.94
(100.00 %)
n/a 5,370
(100.00 %)
1,620,688
(23.00 %)
902,057
(13.66 %)
4,547,953
(39.90 %)
129,990
(12.07 %)
209 John dory (primary hap 2023)
GCA_960531495.1
n/a 14,906
(2.33 %)
72,029
(6.72 %)
n/a 43.92
(99.98 %)
887
(0.02 %)
191
(100.00 %)
1,609,654
(22.82 %)
897,264
(13.58 %)
4,548,467
(39.80 %)
129,147
(11.75 %)
210 kelp grouper (mb 2019)
GCF_006386435.1
45,779
(8.57 %)
15,561
(1.99 %)
53,188
(5.12 %)
n/a 41.32
(97.02 %)
48,394
(2.99 %)
4,563
(100.00 %)
574,889
(2.73 %)
367,135
(2.64 %)
6,420,280
(29.10 %)
28,979
(1.07 %)
211 kelp perch (BFR_SWC_R1_liver_20210118 2023)
GCF_029030835.1
40,680
(11.49 %)
14,847
(3.17 %)
46,307
(7.10 %)
n/a 41.87
(100.00 %)
n/a 1,003
(100.00 %)
967,639
(17.54 %)
319,567
(5.43 %)
3,743,006
(26.82 %)
47,481
(4.63 %)
212 Korean giant-fin mudskipper (v1 alternate hap 2020 genbank)
GCA_009829135.1
n/a 13,470
(2.34 %)
42,799
(5.73 %)
n/a 40.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,799
(100.00 %)
394,414
(4.41 %)
509,973
(7.17 %)
4,581,968
(38.91 %)
34,522
(2.54 %)
213 Korean giant-fin mudskipper (v1.2 primary hap 2023)
GCF_009829125.3
33,236
(8.44 %)
14,601
(2.46 %)
44,145
(5.80 %)
n/a 40.22
(99.05 %)
701
(0.95 %)
122
(100.00 %)
1,755,227
(42.93 %)
551,482
(7.22 %)
4,887,087
(38.97 %)
37,287
(2.58 %)
214 lake trout
GCF_016432855.1
65,012
(4.57 %)
26,528
(1.53 %)
112,119
(4.47 %)
76,885
(3.80 %)
43.50
(99.99 %)
3,264
(0.01 %)
4,121
(100.00 %)
1,387,896
(5.81 %)
1,797,785
(19.28 %)
9,643,314
(54.44 %)
85,419
(2.52 %)
215 lake whitefish (EN20210322 male 2021 Laval U)
GCF_018398675.1
78,867
(4.31 %)
27,579
(1.38 %)
113,850
(3.63 %)
n/a 44.18
(100.00 %)
1,716
(0.00 %)
6,355
(100.00 %)
1,729,029
(6.03 %)
1,781,307
(15.24 %)
9,311,548
(61.16 %)
126,142
(4.04 %)
216 lake whitefish (EN_2021a female 2021 Laval U)
GCF_020615455.1
87,246
(4.53 %)
28,366
(1.38 %)
117,266
(3.71 %)
n/a 44.12
(100.00 %)
1,159
(0.00 %)
7,334
(100.00 %)
1,768,537
(6.02 %)
1,793,716
(15.51 %)
9,525,312
(61.13 %)
126,485
(3.95 %)
217 lantern fish (primary hap 2024)
GCA_963921795.1
n/a 17,851
(1.28 %)
83,249
(5.18 %)
n/a 42.69
(99.97 %)
2,397
(0.03 %)
709
(100.00 %)
7,797,173
(37.37 %)
1,593,818
(10.64 %)
7,610,300
(54.05 %)
127,942
(3.84 %)
218 large yellow croaker
GCF_000972845.2
49,914
(11.76 %)
15,365
(3.00 %)
26,101
(6.66 %)
n/a 41.34
(99.67 %)
7,424
(0.33 %)
9,998
(100.00 %)
478,685
(3.50 %)
306,063
(3.37 %)
4,199,578
(24.80 %)
28,138
(2.09 %)
219 large-eye snaggletooth (alternate hap 2023)
GCA_949987545.1
n/a 15,841
(2.36 %)
79,276
(8.51 %)
n/a 46.35
(100.00 %)
n/a 5,761
(100.00 %)
2,935,570
(42.17 %)
1,208,602
(21.28 %)
3,157,730
(42.63 %)
88,759
(6.30 %)
220 large-eye snaggletooth (primary hap 2023)
GCA_949987555.1
n/a 16,376
(2.19 %)
82,947
(7.99 %)
n/a 46.31
(99.94 %)
2,631
(0.06 %)
1,522
(100.00 %)
3,333,323
(43.58 %)
1,553,932
(25.91 %)
3,393,507
(46.78 %)
99,668
(6.39 %)
221 largemouth bass (2-A1 2021)
GCA_019677235.1
n/a 15,790
(2.31 %)
50,332
(5.65 %)
n/a 40.87
(99.96 %)
672
(0.04 %)
202
(100.00 %)
464,845
(2.71 %)
255,513
(3.69 %)
5,124,388
(29.65 %)
25,920
(1.67 %)
222 largemouth bass (LMB-PRFRI aquatic 2020)
GCF_014851395.1
55,170
(9.49 %)
16,635
(2.18 %)
56,707
(5.52 %)
n/a 40.86
(99.85 %)
2,909
(0.15 %)
4,753
(100.00 %)
497,281
(2.60 %)
269,495
(3.70 %)
5,496,732
(29.60 %)
28,733
(1.66 %)
223 largescale foureyes (fAnaAna1 alternate hap 2020)
GCA_014839705.1
n/a 8,132
(2.11 %)
25,878
(4.67 %)
n/a 38.55
(100.00 %)
n/a 5,088
(100.00 %)
260,789
(2.73 %)
158,564
(2.12 %)
3,023,128
(27.39 %)
9,678
(1.02 %)
224 largescale foureyes (primary hap 2020)
GCA_014839685.1
n/a 14,774
(2.18 %)
42,858
(4.83 %)
58,247
(6.94 %)
38.54
(99.96 %)
107
(0.04 %)
33
(100.00 %)
506,950
(2.73 %)
305,170
(2.13 %)
6,194,879
(29.85 %)
17,881
(0.94 %)
225 leafy seadragon (BA_2022a 2022)
GCF_024500275.1
46,242
(10.23 %)
13,712
(2.62 %)
43,369
(5.56 %)
n/a 42.40
(100.00 %)
76
(0.00 %)
1,537
(100.00 %)
1,406,779
(35.37 %)
202,983
(7.44 %)
3,933,128
(41.19 %)
70,560
(7.78 %)
226 lemon sole (primary hap 2024)
GCA_964266715.1
n/a 14,961
(2.55 %)
52,234
(6.83 %)
n/a 41.57
(99.99 %)
409
(0.01 %)
1,601
(100.00 %)
1,233,052
(39.33 %)
366,741
(18.98 %)
3,296,338
(36.77 %)
44,712
(2.85 %)
227 leopard coralgrouper
GCF_008729295.1
38,671
(7.52 %)
15,538
(2.18 %)
57,480
(5.26 %)
n/a 39.54
(98.22 %)
3,611
(1.77 %)
94,260
(100.00 %)
629,451
(3.42 %)
385,539
(3.83 %)
6,343,655
(29.35 %)
27,018
(1.26 %)
228 lesser salmon catfish (fNeoGra1 alternate hap 2023)
GCA_027579805.1
n/a 15,487
(0.88 %)
85,135
(3.39 %)
n/a 42.43
(100.00 %)
3
(0.00 %)
6,593
(100.00 %)
5,572,163
(49.59 %)
1,052,072
(6.02 %)
7,246,646
(62.69 %)
157,768
(4.38 %)
229 lesser salmon catfish (primary hap 2023 refseq)
GCF_027579695.1
53,323
(3.35 %)
15,955
(0.92 %)
85,700
(3.30 %)
n/a 42.44
(99.43 %)
334
(0.57 %)
38
(100.00 %)
6,041,262
(71.88 %)
1,126,468
(6.51 %)
7,609,180
(62.74 %)
166,630
(4.38 %)
230 lesser sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_950004245.1
n/a 13,792
(2.19 %)
51,353
(6.60 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
3,620
(100.00 %)
2,536,362
(38.05 %)
513,115
(7.50 %)
3,542,854
(37.60 %)
31,814
(1.79 %)
231 lesser sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949987685.1
n/a 13,908
(2.19 %)
50,634
(6.50 %)
n/a 41.22
(99.97 %)
1,017
(0.03 %)
701
(100.00 %)
2,698,640
(39.19 %)
577,328
(8.51 %)
3,615,231
(39.17 %)
33,251
(1.82 %)
232 lesser weever (primary hap 2023)
GCA_963691815.1
n/a 15,269
(2.44 %)
52,449
(6.28 %)
n/a 41.81
(99.99 %)
606
(0.02 %)
133
(100.00 %)
1,879,201
(31.40 %)
449,901
(9.89 %)
4,248,556
(33.21 %)
43,864
(3.01 %)
233 limp eelpout (alternate hap 2023)
GCA_949748265.1
n/a 15,033
(2.98 %)
51,296
(7.68 %)
n/a 43.01
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2,700
(100.00 %)
1,099,919
(28.68 %)
314,919
(9.57 %)
2,620,601
(30.23 %)
49,248
(4.19 %)
234 limp eelpout (primary hap 2023)
GCA_949748355.1
n/a 15,060
(2.89 %)
50,064
(7.31 %)
n/a 41.88
(99.98 %)
589
(0.02 %)
534
(100.00 %)
1,116,427
(28.18 %)
315,489
(13.14 %)
2,598,812
(33.21 %)
50,192
(3.82 %)
235 live sharksucker (alternate hap 2019)
GCA_900963505.1
n/a 14,632
(3.51 %)
40,441
(7.51 %)
n/a 41.42
(99.96 %)
19
(0.04 %)
1,405
(100.00 %)
435,742
(3.57 %)
139,003
(1.51 %)
3,161,165
(22.06 %)
16,302
(1.34 %)
236 live sharksucker (v2 2021)
GCA_900963305.2
n/a 14,975
(3.53 %)
40,908
(7.56 %)
n/a 41.43
(99.89 %)
140
(0.11 %)
38
(100.00 %)
772,309
(14.49 %)
146,353
(1.65 %)
3,204,473
(21.79 %)
16,807
(1.33 %)
237 longspined bullhead (.1 primary hap 2021)
GCA_910589615.1
n/a 15,027
(3.10 %)
51,137
(7.71 %)
n/a 42.22
(99.99 %)
242
(0.01 %)
27
(100.00 %)
452,844
(4.81 %)
417,308
(9.63 %)
3,262,282
(28.51 %)
55,527
(4.38 %)
238 longspined bullhead (fTauBub2.1 alternate hap 2021)
GCA_910589325.1
n/a 15,137
(3.09 %)
52,499
(7.75 %)
n/a 42.22
(100.00 %)
n/a 1,778
(100.00 %)
448,166
(4.67 %)
416,181
(8.95 %)
3,288,388
(27.99 %)
55,747
(4.41 %)
239 lumpfish (alternate hap 2019)
GCA_009769515.1
n/a 12,848
(3.32 %)
43,711
(8.09 %)
n/a 42.84
(100.00 %)
n/a 1,866
(100.00 %)
407,698
(6.03 %)
360,501
(11.29 %)
2,456,041
(28.07 %)
45,916
(5.21 %)
240 lumpfish (primary hap v2.1 2023 genbank)
GCA_963457625.1
n/a 14,944
(3.23 %)
50,328
(8.09 %)
n/a 42.82
(99.97 %)
954
(0.03 %)
232
(100.00 %)
1,034,598
(25.93 %)
434,819
(13.21 %)
2,907,371
(30.18 %)
55,066
(5.20 %)
241 lumpfish (v1 primary hap 2019 refseq)
GCF_009769545.1
41,612
(11.11 %)
14,752
(3.31 %)
49,223
(8.10 %)
52,721
(8.34 %)
42.83
(98.22 %)
347
(1.78 %)
48
(100.00 %)
478,386
(6.02 %)
421,632
(11.07 %)
2,928,619
(27.99 %)
53,321
(5.09 %)
242 lyretail cichlid
GCF_000239395.1
38,260
(10.03 %)
14,804
(2.69 %)
23,751
(5.79 %)
n/a 40.44
(80.94 %)
109,100
(19.10 %)
118,181
(80.90 %)
695,696
(14.49 %)
119,381
(1.10 %)
4,539,429
(19.49 %)
18,098
(0.91 %)
243 Malawi cichlid R.sp.'chilingali' (2024)
GCA_963969265.1
n/a 15,501
(2.18 %)
54,090
(6.20 %)
n/a 41.17
(99.99 %)
422
(0.01 %)
82
(100.00 %)
1,727,328
(38.16 %)
259,351
(4.71 %)
4,381,278
(33.25 %)
35,281
(1.93 %)
244 mandarin fish (FFG_IHB_CAS 2021)
GCF_020085105.1
64,831
(12.89 %)
15,283
(2.75 %)
43,349
(6.02 %)
n/a 40.35
(100.00 %)
93
(0.00 %)
65
(100.00 %)
441,324
(3.38 %)
206,420
(2.54 %)
4,582,841
(27.41 %)
15,999
(1.17 %)
245 mandarin fish (RoL2022-P1 2023)
GCF_027744825.2
49,016
(12.41 %)
14,186
(3.08 %)
55,502
(8.05 %)
n/a 43.27
(100.00 %)
19
(0.00 %)
97
(100.00 %)
321,832
(4.91 %)
114,318
(16.04 %)
2,300,636
(32.10 %)
46,312
(5.05 %)
246 mangrove rivulus
GCF_001649575.2
46,200
(11.83 %)
14,522
(2.87 %)
46,641
(6.86 %)
n/a 40.03
(94.31 %)
32,278
(5.70 %)
300
(100.00 %)
345,678
(2.32 %)
146,263
(1.33 %)
4,718,292
(27.30 %)
39,541
(2.69 %)
247 marbled rockcod (alternate hap 2023)
GCA_949606865.1
n/a 14,564
(1.72 %)
71,604
(6.41 %)
n/a 41.49
(100.00 %)
n/a 8,737
(100.00 %)
1,662,251
(42.29 %)
439,119
(12.96 %)
3,776,125
(45.00 %)
56,507
(2.83 %)
248 marbled rockcod (primary hap 2023)
GCA_949606895.1
n/a 15,070
(1.79 %)
71,367
(6.50 %)
n/a 41.46
(99.92 %)
4,157
(0.08 %)
943
(100.00 %)
1,717,591
(42.63 %)
474,348
(12.30 %)
4,011,319
(44.93 %)
59,531
(2.83 %)
249 Mariana snailfish (Mariana Trench HS2019 2023)
GCF_029220125.1
44,363
(10.91 %)
14,032
(2.80 %)
60,400
(8.09 %)
n/a 43.84
(99.86 %)
974
(0.14 %)
200
(100.00 %)
1,157,953
(36.57 %)
569,832
(12.19 %)
2,864,996
(37.65 %)
98,423
(9.53 %)
250 Mexican tetra (2017 WashU)
GCF_000372685.2
47,018
(6.00 %)
16,516
(1.68 %)
33,920
(4.24 %)
n/a 38.00
(96.73 %)
621
(3.27 %)
2,415
(100.00 %)
1,125,511
(6.89 %)
1,113,607
(11.76 %)
8,546,053
(42.44 %)
44,933
(1.77 %)
251 Mexican tetra (ESR-SI-001 2022)
GCF_023375975.1
71,254
(7.50 %)
16,674
(1.63 %)
52,903
(4.12 %)
101,896
(6.64 %)
38.24
(100.00 %)
14
(0.00 %)
109
(100.00 %)
1,155,823
(4.90 %)
1,363,316
(12.23 %)
7,667,721
(47.23 %)
48,358
(1.88 %)
252 Mexican tetra (Pach_M1 Pachon cave 2021)
GCA_019721115.1
n/a 16,698
(1.62 %)
62,818
(5.14 %)
74,339
(6.58 %)
38.41
(99.99 %)
334
(0.01 %)
195
(100.00 %)
1,194,830
(5.04 %)
1,460,981
(11.81 %)
7,590,179
(47.66 %)
50,533
(2.46 %)
253 milkfish (2019)
GCF_902362185.1
30,812
(7.61 %)
16,869
(3.41 %)
21,377
(6.58 %)
n/a 41.53
(99.36 %)
112
(0.64 %)
31
(100.00 %)
958,774
(8.18 %)
731,733
(9.10 %)
3,702,024
(26.31 %)
22,089
(1.27 %)
254 milkfish (alternate hap 2019)
GCA_902362175.1
n/a 16,565
(3.38 %)
42,094
(6.75 %)
n/a 41.51
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1,937
(100.00 %)
930,392
(8.11 %)
708,375
(9.04 %)
3,612,575
(26.46 %)
21,531
(1.27 %)
255 minispotted lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963454915.1
n/a 17,701
(1.62 %)
73,433
(5.69 %)
n/a 42.20
(99.98 %)
1,398
(0.02 %)
388
(100.00 %)
6,438,444
(40.32 %)
1,202,669
(11.51 %)
7,055,665
(47.04 %)
74,954
(3.44 %)
256 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 alternate hap 2022)
GCA_023349535.1
n/a 15,176
(3.17 %)
47,458
(7.48 %)
n/a 42.05
(99.99 %)
927
(0.02 %)
486
(100.00 %)
1,167,409
(26.98 %)
438,114
(8.08 %)
3,351,987
(27.25 %)
45,298
(3.39 %)
257 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 primary hap 2022)
GCA_023349555.1
n/a 14,480
(3.19 %)
44,951
(7.47 %)
n/a 42.05
(99.98 %)
936
(0.02 %)
725
(100.00 %)
1,101,582
(26.86 %)
415,846
(8.16 %)
3,162,480
(27.08 %)
42,657
(3.44 %)
258 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 primary hap 2022)
GCF_023349555.1
40,276
(12.25 %)
14,478
(3.19 %)
44,951
(7.47 %)
n/a 42.05
(99.98 %)
936
(0.02 %)
1,660
(99.98 %)
1,101,578
(26.86 %)
415,846
(8.16 %)
3,162,428
(27.08 %)
42,657
(3.44 %)
259 Monterrey platyfish
GCF_001444195.1
53,087
(12.11 %)
14,672
(2.71 %)
27,552
(6.74 %)
n/a 39.02
(99.85 %)
229
(0.15 %)
68
(100.00 %)
305,761
(2.11 %)
134,157
(2.14 %)
4,687,726
(28.26 %)
33,082
(2.28 %)
260 mummichog (Maine)
GCF_000826765.1
41,183
(7.38 %)
14,602
(1.92 %)
57,194
(5.03 %)
35,597
(6.40 %)
40.58
(91.29 %)
123,625
(8.75 %)
120,723
(91.25 %)
447,158
(2.19 %)
235,336
(1.39 %)
6,518,990
(26.03 %)
54,589
(2.39 %)
261 mummichog (U. Missouri)
GCF_011125445.2
56,612
(6.89 %)
15,361
(1.60 %)
69,801
(5.20 %)
n/a 40.76
(99.88 %)
2,820
(0.12 %)
1,031
(100.00 %)
636,480
(2.75 %)
392,130
(3.32 %)
7,023,777
(32.98 %)
81,101
(3.45 %)
262 New Zealand spotty (alternate hap 2019 genbank)
GCA_009762545.1
n/a 13,566
(2.17 %)
40,774
(5.21 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
n/a 3,286
(100.00 %)
472,659
(4.46 %)
348,429
(5.17 %)
4,169,213
(33.57 %)
16,368
(0.83 %)
263 New Zealand spotty (primary hap 2019 genbank)
GCA_009762535.1
n/a 14,609
(2.22 %)
43,262
(5.33 %)
60,241
(8.02 %)
40.86
(98.32 %)
1,135
(1.69 %)
468
(100.00 %)
519,324
(4.65 %)
393,329
(5.54 %)
4,522,265
(33.34 %)
18,302
(0.85 %)
264 New Zealand spotty (primary hap refseq)
GCF_009762535.1
45,555
(9.06 %)
14,609
(2.22 %)
43,259
(5.33 %)
60,241
(8.02 %)
40.86
(98.32 %)
1,135
(1.69 %)
467
(100.00 %)
517,755
(4.63 %)
393,328
(5.54 %)
4,522,224
(33.34 %)
18,299
(0.85 %)
265 Nile tilapia
GCF_001858045.2
77,384
(10.86 %)
15,599
(1.99 %)
32,839
(6.04 %)
n/a 40.73
(99.99 %)
551
(0.01 %)
2,460
(100.00 %)
600,869
(5.40 %)
291,105
(3.17 %)
4,958,128
(31.15 %)
32,038
(1.81 %)
266 ninespine stickleback (alternate hap 2023)
GCA_949316245.1
n/a 13,050
(3.93 %)
44,650
(10.12 %)
n/a 44.10
(100.00 %)
n/a 1,934
(100.00 %)
512,583
(14.83 %)
156,305
(8.46 %)
2,005,803
(27.09 %)
59,674
(9.19 %)
267 ninespine stickleback (NSP_V7 2020)
GCF_902500615.1
51,166
(15.31 %)
14,765
(3.99 %)
49,191
(9.80 %)
n/a 44.37
(99.99 %)
341
(0.01 %)
1,667
(100.00 %)
380,357
(3.60 %)
188,301
(6.29 %)
2,422,266
(25.70 %)
72,584
(9.69 %)
268 ninespine stickleback (primary hap 2023 genbank)
GCA_949316345.1
n/a 14,600
(3.83 %)
49,927
(9.98 %)
n/a 44.12
(99.97 %)
738
(0.03 %)
175
(100.00 %)
599,088
(14.68 %)
186,747
(10.27 %)
2,273,942
(28.36 %)
70,136
(9.39 %)
269 ninespine stickleback (primary hap 2023 refseq)
GCF_949316345.1
57,816
(15.11 %)
14,598
(3.83 %)
49,473
(9.87 %)
n/a 44.12
(99.97 %)
738
(0.03 %)
174
(100.00 %)
599,085
(14.68 %)
186,746
(10.27 %)
2,273,889
(28.36 %)
70,136
(9.39 %)
270 North African catfish (Netherlands MV-2021 2022)
GCF_024256425.1
51,073
(7.42 %)
15,809
(2.17 %)
43,728
(4.54 %)
n/a 39.00
(100.00 %)
n/a 48
(100.00 %)
2,472,286
(44.73 %)
560,123
(5.68 %)
6,203,876
(38.64 %)
42,187
(2.72 %)
271 northern pike
GCF_004634155.1
66,389
(9.11 %)
16,778
(2.37 %)
27,040
(5.41 %)
n/a 42.29
(99.99 %)
584
(0.01 %)
908
(100.00 %)
1,065,458
(31.14 %)
531,451
(7.80 %)
4,677,366
(33.26 %)
44,793
(2.82 %)
272 northern pike (alternate hap 2020)
GCA_011004835.1
n/a 11,782
(2.41 %)
40,748
(5.68 %)
n/a 42.32
(99.93 %)
11
(0.07 %)
3,813
(100.00 %)
700,818
(30.15 %)
372,729
(7.71 %)
3,058,655
(31.76 %)
29,687
(2.57 %)
273 northern pike (primary hap 2020 refseq)
GCF_011004845.1
63,733
(9.28 %)
16,618
(2.41 %)
55,784
(5.64 %)
82,941
(8.82 %)
42.22
(99.89 %)
112
(0.11 %)
53
(100.00 %)
984,415
(29.15 %)
524,708
(7.32 %)
4,691,096
(32.91 %)
42,910
(2.52 %)
274 northern snakehead (prfri 2023)
GCF_033026475.1
61,639
(13.32 %)
15,131
(2.87 %)
35,444
(5.74 %)
n/a 39.76
(100.00 %)
52
(0.00 %)
291
(100.00 %)
830,033
(26.45 %)
152,304
(8.77 %)
3,778,846
(29.39 %)
8,436
(0.70 %)
275 Old Calabar mormyrid
GCF_002872115.1
61,915
(11.48 %)
15,987
(2.73 %)
33,963
(6.66 %)
n/a 43.93
(92.03 %)
49,579
(7.99 %)
4,666
(100.00 %)
348,463
(2.27 %)
314,129
(2.95 %)
4,259,711
(20.83 %)
76,846
(4.18 %)
276 orangethroat darter
GCF_008692095.1
55,448
(8.29 %)
15,000
(2.25 %)
49,918
(5.41 %)
n/a 40.91
(99.57 %)
101,221
(0.47 %)
3,119
(100.00 %)
566,915
(3.75 %)
509,018
(6.60 %)
5,142,090
(31.18 %)
26,702
(1.46 %)
277 orbiculate cardinalfish (2019)
GCF_902148855.1
46,571
(5.47 %)
15,761
(1.50 %)
31,563
(4.00 %)
59,905
(3.98 %)
37.90
(99.73 %)
1,844
(0.27 %)
340
(100.00 %)
1,257,250
(5.57 %)
979,214
(8.64 %)
6,386,731
(48.59 %)
29,320
(0.87 %)
278 orbiculate cardinalfish (alternate hap 2019)
GCA_902148825.1
n/a 14,018
(1.51 %)
45,251
(3.61 %)
n/a 37.73
(99.94 %)
142
(0.06 %)
7,038
(99.94 %)
1,041,393
(5.09 %)
744,623
(6.94 %)
6,250,631
(45.53 %)
22,522
(0.77 %)
279 oriental weatherfish (BS_2022a 2023)
GCF_027580225.1
68,779
(8.54 %)
17,223
(2.28 %)
49,697
(5.11 %)
n/a 38.10
(99.99 %)
614
(0.01 %)
358
(100.00 %)
2,925,549
(40.35 %)
402,676
(5.35 %)
5,933,365
(45.71 %)
56,843
(3.18 %)
280 P.nyererei 1_Seehausen
GCF_000239375.1
40,001
(9.36 %)
14,904
(2.72 %)
24,732
(5.87 %)
n/a 40.60
(84.20 %)
60,817
(15.83 %)
68,050
(84.17 %)
306,171
(3.27 %)
124,292
(0.75 %)
4,414,831
(20.66 %)
18,455
(0.96 %)
281 Pacific cod (2023)
GCF_031168955.1
49,417
(13.66 %)
13,542
(2.89 %)
64,214
(9.77 %)
n/a 45.55
(99.92 %)
4,826
(0.09 %)
24
(100.00 %)
1,117,561
(38.30 %)
685,851
(13.38 %)
2,330,116
(34.15 %)
87,761
(8.68 %)
282 Pacific halibut (PH-IPHC-18 2020)
GCF_013339905.1
48,776
(12.61 %)
14,747
(3.15 %)
45,075
(7.30 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
219
(0.00 %)
120
(100.00 %)
410,917
(4.22 %)
246,500
(4.66 %)
3,680,698
(25.23 %)
31,508
(2.30 %)
283 Pacific halibut (QCI-W04-F060 2022)
GCF_022539355.2
46,684
(12.50 %)
14,862
(3.15 %)
45,824
(7.30 %)
n/a 42.17
(99.95 %)
1,131
(0.05 %)
53
(100.00 %)
407,699
(3.94 %)
247,330
(3.84 %)
3,838,896
(24.75 %)
31,782
(2.27 %)
284 Pacific saury (AMF1-May2022 2023)
GCF_033807715.1
54,344
(6.52 %)
15,214
(1.67 %)
74,345
(6.13 %)
n/a 41.49
(99.96 %)
900
(0.04 %)
759
(100.00 %)
805,776
(5.16 %)
849,901
(11.48 %)
4,645,552
(43.92 %)
106,026
(5.14 %)
285 panther danio (primary hap 2020)
GCF_903798145.1
40,657
(5.52 %)
17,858
(2.46 %)
42,119
(3.16 %)
n/a 36.32
(98.82 %)
1,821
(1.18 %)
342
(100.00 %)
3,973,354
(56.67 %)
940,639
(7.81 %)
8,701,639
(50.54 %)
29,684
(1.18 %)
286 parallel lanternfish (alternate hap 2024)
GCA_964188415.1
n/a 15,421
(1.80 %)
62,324
(6.15 %)
n/a 42.79
(99.90 %)
4,955
(0.10 %)
4,978
(99.90 %)
4,032,523
(34.18 %)
982,411
(16.51 %)
5,189,655
(46.47 %)
64,543
(3.14 %)
287 parallel lanternfish (primary hap 2024)
GCA_964188405.1
n/a 16,917
(1.64 %)
72,190
(5.85 %)
n/a 42.91
(99.96 %)
2,729
(0.04 %)
24
(100.00 %)
4,976,327
(35.08 %)
1,258,755
(18.52 %)
6,268,804
(48.21 %)
81,193
(3.23 %)
288 Patagonian blennie (Puerto Natales JMC-PN-2008 2024)
GCF_036324505.1
42,701
(12.59 %)
14,986
(3.15 %)
46,289
(7.75 %)
n/a 40.99
(99.97 %)
380
(0.03 %)
27
(100.00 %)
1,031,762
(25.30 %)
219,393
(4.63 %)
3,436,780
(25.57 %)
16,570
(1.12 %)
289 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 1 2023)
GCA_027942865.1
n/a 15,242
(2.07 %)
60,994
(6.53 %)
n/a 41.51
(99.99 %)
282
(0.01 %)
189
(100.00 %)
975,354
(15.76 %)
315,625
(10.49 %)
3,601,904
(35.09 %)
49,121
(3.07 %)
290 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 2 2023)
GCA_027942885.1
n/a 15,317
(2.02 %)
61,647
(6.35 %)
n/a 41.37
(99.99 %)
135
(0.01 %)
469
(99.99 %)
981,519
(15.40 %)
319,637
(12.45 %)
3,706,473
(36.77 %)
50,353
(2.98 %)
291 peladilla (fAplTae1 alternate hap 2021)
GCA_017639685.1
n/a 16,729
(3.56 %)
56,451
(8.61 %)
n/a 45.00
(100.00 %)
11
(0.00 %)
5,701
(100.00 %)
1,153,359
(18.94 %)
829,887
(14.54 %)
2,793,018
(28.79 %)
49,469
(4.32 %)
292 peladilla (primary hap 2021)
GCA_017639675.1
n/a 13,829
(3.83 %)
41,932
(8.64 %)
n/a 45.01
(98.24 %)
1,158
(1.77 %)
41
(100.00 %)
930,246
(18.49 %)
660,569
(13.71 %)
2,316,198
(27.66 %)
41,023
(4.40 %)
293 pencil smelt N.antarctica (primary hap 2024)
GCA_963989245.1
n/a 17,996
(2.00 %)
89,591
(7.93 %)
n/a 45.22
(99.94 %)
3,299
(0.06 %)
1,177
(100.00 %)
2,828,457
(30.93 %)
1,676,413
(19.87 %)
4,137,400
(48.69 %)
78,669
(4.37 %)
294 pike-perch
GCF_008315115.2
65,418
(8.54 %)
15,731
(2.23 %)
52,240
(5.69 %)
n/a 40.87
(99.98 %)
711
(0.02 %)
337
(100.00 %)
629,999
(5.16 %)
567,578
(7.41 %)
4,697,709
(36.49 %)
39,666
(1.93 %)
295 pinecone soldierfish (2019)
GCF_902150065.1
40,770
(8.72 %)
15,738
(2.42 %)
26,691
(5.69 %)
57,069
(6.14 %)
41.83
(99.78 %)
253
(0.22 %)
87
(100.00 %)
1,063,888
(5.90 %)
646,820
(4.30 %)
4,938,857
(28.11 %)
41,636
(2.04 %)
296 pinecone soldierfish (alternate hap 2019)
GCA_902148815.1
n/a 15,563
(2.38 %)
54,264
(6.19 %)
n/a 41.81
(100.00 %)
6
(0.00 %)
2,193
(100.00 %)
1,040,418
(5.81 %)
623,499
(4.08 %)
4,888,400
(27.89 %)
40,331
(2.02 %)
297 pink salmon
GCF_021184085.1
91,127
(4.89 %)
27,187
(1.37 %)
124,120
(3.88 %)
n/a 44.28
(99.96 %)
5,213
(0.04 %)
22,556
(99.99 %)
1,343,135
(0.00 %)
2,906,520
(28.95 %)
10,882,087
(57.26 %)
97,805
(3.04 %)
298 ploughfish
GCF_902827175.1
50,551
(7.66 %)
14,699
(1.83 %)
66,348
(6.06 %)
62,492
(5.74 %)
41.52
(99.98 %)
1,569
(0.02 %)
2,618
(100.00 %)
467,937
(3.05 %)
412,361
(6.64 %)
3,498,382
(45.08 %)
73,879
(3.55 %)
299 pollack (alternate hap 2023)
GCA_949987605.1
n/a 14,050
(2.77 %)
63,249
(8.86 %)
n/a 45.41
(100.00 %)
n/a 4,970
(100.00 %)
708,455
(9.71 %)
797,241
(15.67 %)
2,785,159
(33.18 %)
78,151
(7.95 %)
300 pollack (primary hap 2023)
GCA_949987615.1
n/a 14,126
(2.81 %)
61,907
(8.75 %)
n/a 45.67
(99.94 %)
1,810
(0.06 %)
616
(100.00 %)
753,034
(10.17 %)
850,189
(15.72 %)
2,888,555
(33.70 %)
80,883
(8.43 %)
301 predatory carp (Z2021 2022)
GCF_024489055.1
56,688
(7.63 %)
17,670
(2.67 %)
54,522
(5.25 %)
n/a 37.95
(100.00 %)
181
(0.00 %)
51
(100.00 %)
3,087,358
(61.37 %)
553,846
(7.14 %)
6,036,124
(43.52 %)
47,942
(3.56 %)
302 prehistoric monster fish (2019 refseq)
GCF_902500255.1
45,404
(2.55 %)
14,664
(0.76 %)
72,609
(2.41 %)
57,391
(2.04 %)
41.99
(99.49 %)
2,554
(0.51 %)
464
(100.00 %)
1,310,663
(2.79 %)
786,401
(3.65 %)
9,901,286
(59.90 %)
172,199
(5.45 %)
303 prehistoric monster fish (alternate hap 2019)
GCA_902500245.1
n/a 10,944
(0.64 %)
59,123
(2.21 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
8
(0.00 %)
19,587
(100.00 %)
947,336
(2.69 %)
554,284
(3.27 %)
7,314,941
(58.56 %)
125,285
(5.42 %)
304 rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024)
GCA_038355195.1
n/a 15,639
(3.89 %)
49,368
(9.40 %)
n/a 45.55
(99.93 %)
1,907
(0.07 %)
365
(100.00 %)
1,655,350
(30.53 %)
511,512
(12.09 %)
2,015,264
(35.19 %)
32,410
(4.33 %)
305 rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024)
GCF_038355195.1
39,606
(12.43 %)
15,641
(3.89 %)
49,368
(9.40 %)
n/a 45.55
(99.93 %)
1,907
(0.07 %)
366
(100.00 %)
1,655,356
(30.53 %)
511,513
(12.09 %)
2,015,303
(35.19 %)
32,410
(4.33 %)
306 rainbow trout (Arlee)
GCF_013265735.2
119,284
(6.51 %)
27,513
(1.62 %)
109,524
(4.38 %)
138,073
(5.21 %)
43.45
(99.74 %)
486
(0.26 %)
939
(100.00 %)
1,537,455
(7.32 %)
2,083,211
(23.10 %)
10,092,840
(53.71 %)
73,586
(2.16 %)
307 rainbow trout (Swanson)
GCF_002163495.1
79,299
(6.41 %)
25,179
(1.70 %)
98,339
(4.18 %)
115,853
(5.33 %)
42.67
(88.52 %)
427,894
(11.54 %)
139,800
(99.96 %)
1,332,141
(5.52 %)
1,604,760
(8.18 %)
9,451,984
(44.00 %)
56,604
(1.05 %)
308 razorback sucker (HMW12.3.18 2022)
GCF_025860055.1
71,991
(5.94 %)
27,195
(1.88 %)
81,269
(3.63 %)
n/a 39.59
(99.96 %)
1,873
(0.04 %)
1,746
(100.00 %)
7,035,382
(51.89 %)
1,021,269
(5.98 %)
12,768,853
(46.85 %)
109,185
(4.70 %)
309 red drum (XU1910 2020)
GCA_014183145.1
n/a 15,655
(3.01 %)
47,717
(6.87 %)
n/a 40.98
(95.57 %)
11,577
(4.42 %)
34,462
(100.00 %)
470,579
(3.16 %)
231,051
(1.91 %)
4,345,700
(23.24 %)
20,149
(1.25 %)
310 red-bellied piranha (fPygNat1 alternate hap 2020)
GCA_015220065.1
n/a 4,539
(2.01 %)
14,061
(4.35 %)
n/a 40.48
(100.00 %)
n/a 1,751
(100.00 %)
759,605
(49.59 %)
161,693
(7.99 %)
1,684,737
(29.93 %)
7,525
(1.31 %)
311 red-bellied piranha (Pna-1 2016)
GCF_001682695.1
47,129
(6.06 %)
17,089
(1.80 %)
33,378
(4.02 %)
n/a 40.45
(97.38 %)
62,964
(2.59 %)
325,620
(97.41 %)
898,445
(4.81 %)
863,000
(6.48 %)
7,757,382
(34.74 %)
34,329
(1.24 %)
312 red-bellied piranha (primary hap 2020)
GCF_015220715.1
54,818
(7.05 %)
16,817
(1.87 %)
52,672
(4.24 %)
76,011
(5.65 %)
40.58
(99.17 %)
303
(0.83 %)
55
(100.00 %)
817,566
(5.40 %)
689,236
(8.30 %)
7,296,459
(35.73 %)
33,087
(1.38 %)
313 reedfish (2021)
GCF_900747795.2
44,479
(2.01 %)
13,108
(0.46 %)
23,157
(1.29 %)
n/a 39.37
(99.18 %)
1,431
(0.82 %)
169
(100.00 %)
8,636,520
(39.34 %)
1,069,643
(2.91 %)
19,980,572
(47.52 %)
89,023
(1.13 %)
314 reedfish (v1 alternate hap 2019)
GCA_900700845.2
n/a 9,950
(0.37 %)
31,611
(1.22 %)
n/a 39.44
(100.00 %)
5
(0.00 %)
38,598
(100.00 %)
1,300,565
(2.57 %)
685,834
(2.21 %)
14,691,576
(45.66 %)
63,365
(1.11 %)
315 ringed pipefish (RoL2022-P2 2023)
GCF_027744805.1
56,261
(13.18 %)
14,197
(2.71 %)
45,193
(6.30 %)
n/a 41.67
(100.00 %)
14
(0.00 %)
157
(100.00 %)
941,095
(17.66 %)
238,999
(5.27 %)
4,283,692
(41.06 %)
43,014
(4.07 %)
316 Rio pearlfish (Nwh7 v2 2021)
GCF_014905685.2
25,353
(3.88 %)
14,334
(1.56 %)
137,348
(9.74 %)
n/a 41.06
(92.01 %)
100,521
(8.02 %)
18,998
(100.00 %)
635,526
(3.14 %)
444,158
(3.06 %)
6,203,124
(42.81 %)
52,308
(2.11 %)
317 river trout (v2 2021)
GCA_901001165.2
n/a 27,928
(1.66 %)
110,791
(4.44 %)
n/a 43.36
(96.90 %)
3,941
(3.10 %)
1,441
(100.00 %)
4,690,842
(57.30 %)
1,789,507
(15.87 %)
9,819,763
(52.37 %)
70,821
(1.77 %)
318 roach minnow (alternate hap 2023)
GCA_951802655.1
n/a 18,165
(2.73 %)
62,580
(6.00 %)
n/a 38.74
(100.00 %)
6
(0.00 %)
4,612
(100.00 %)
2,483,904
(48.29 %)
584,363
(7.55 %)
5,582,076
(40.38 %)
60,229
(3.53 %)
319 roach minnow (primary hap 2023)
GCA_951802725.1
n/a 18,132
(2.65 %)
63,523
(6.01 %)
n/a 38.80
(99.99 %)
471
(0.01 %)
86
(100.00 %)
2,613,900
(48.90 %)
625,102
(8.21 %)
5,738,444
(41.24 %)
65,328
(3.68 %)
320 rock gunnel (alternate hap 2021)
GCA_910591705.2
n/a 15,291
(3.29 %)
45,865
(7.56 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,165
(100.00 %)
1,131,154
(25.69 %)
269,583
(5.08 %)
3,371,712
(24.64 %)
36,810
(2.68 %)
321 rock gunnel (primary hap 2021)
GCA_910591455.2
n/a 15,181
(3.34 %)
44,153
(7.53 %)
51,135
(7.40 %)
42.31
(99.98 %)
418
(0.02 %)
101
(100.00 %)
1,121,704
(25.48 %)
269,467
(4.88 %)
3,358,709
(24.69 %)
36,987
(3.02 %)
322 rohu (BAU-BD-2019 2022)
GCF_022985175.1
52,554
(8.81 %)
17,664
(3.05 %)
48,403
(5.24 %)
n/a 36.06
(83.93 %)
5,144
(16.07 %)
2,870
(100.00 %)
2,600,095
(49.94 %)
683,499
(4.34 %)
6,000,462
(35.96 %)
33,741
(1.62 %)
323 Rosablanca catfish (hap2 2023)
GCA_030015355.1
n/a 15,434
(2.01 %)
44,991
(4.63 %)
n/a 40.24
(100.00 %)
192
(0.00 %)
302
(100.00 %)
2,506,810
(40.54 %)
613,867
(8.67 %)
5,070,851
(48.32 %)
46,071
(2.57 %)
324 rough bullseye (RE-2024b hap1 2024)
GCA_042242105.1
n/a 14,592
(2.84 %)
44,299
(6.93 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
87
(0.00 %)
442
(100.00 %)
1,764,545
(30.13 %)
271,391
(5.93 %)
3,651,092
(24.53 %)
19,771
(1.39 %)
325 rough bullseye (RE-2024b hap2 2024)
GCA_042242125.1
n/a 14,475
(2.89 %)
44,413
(7.11 %)
n/a 42.15
(100.00 %)
93
(0.00 %)
84
(100.00 %)
1,762,151
(30.90 %)
262,291
(5.80 %)
3,580,461
(24.37 %)
19,851
(1.40 %)
326 rudd (Europe DD20220513a primary hap 2022)
GCA_024453875.1
n/a 17,895
(2.55 %)
64,448
(5.84 %)
n/a 38.93
(99.99 %)
418
(0.01 %)
110
(100.00 %)
2,661,155
(49.83 %)
673,071
(10.59 %)
5,755,954
(42.48 %)
66,952
(4.46 %)
327 rudd (fScaEry2.hap1.1 2024)
GCA_964197995.1
n/a 18,254
(2.38 %)
68,852
(5.71 %)
n/a 39.02
(99.99 %)
836
(0.01 %)
759
(100.00 %)
2,854,977
(51.13 %)
754,287
(11.81 %)
5,942,764
(44.17 %)
72,686
(4.52 %)
328 sablefish (Golden Eagle Sablefish UVic2021 2023)
GCF_027596085.1
34,548
(9.49 %)
15,280
(3.00 %)
46,259
(6.95 %)
n/a 40.45
(99.99 %)
723
(0.01 %)
8,212
(99.99 %)
1,335,152
(28.19 %)
415,384
(6.53 %)
3,948,379
(27.81 %)
22,854
(1.61 %)
329 sailfin molly
GCF_001443285.1
53,986
(11.41 %)
15,048
(2.71 %)
33,482
(6.71 %)
n/a 39.18
(83.41 %)
41,735
(16.61 %)
54,623
(83.39 %)
357,919
(2.18 %)
189,502
(1.23 %)
4,873,063
(22.51 %)
34,138
(1.62 %)
330 sansaifugu (HTHZ2018 2019)
GCF_003711565.1
56,010
(20.10 %)
13,998
(4.84 %)
48,737
(11.56 %)
n/a 45.63
(99.99 %)
250
(0.01 %)
868
(100.00 %)
304,980
(15.98 %)
171,631
(4.98 %)
1,616,965
(21.60 %)
48,338
(9.79 %)
331 sardine (primary hap 2023 genbank)
GCA_963854185.1
n/a 16,071
(2.33 %)
64,180
(7.08 %)
n/a 44.44
(99.96 %)
1,654
(0.04 %)
241
(100.00 %)
1,503,111
(11.74 %)
1,507,024
(15.48 %)
4,027,638
(37.52 %)
68,874
(3.56 %)
332 sardine (primary hap 2023 refseq)
GCF_963854185.1
48,146
(9.15 %)
16,069
(2.33 %)
64,178
(7.08 %)
n/a 44.44
(99.96 %)
1,654
(0.04 %)
240
(100.00 %)
1,503,108
(11.74 %)
1,507,022
(15.48 %)
4,027,614
(37.52 %)
68,873
(3.56 %)
333 scribbled pipefish (RoL2023-P3 2023)
GCF_030265065.1
51,270
(7.00 %)
13,854
(1.32 %)
48,980
(3.46 %)
n/a 39.44
(100.00 %)
9
(0.00 %)
109
(100.00 %)
1,805,346
(21.21 %)
512,153
(12.76 %)
6,260,589
(63.96 %)
96,908
(3.65 %)
334 Senegalese sole
GCF_019176455.1
46,446
(12.02 %)
15,155
(3.15 %)
43,828
(7.31 %)
n/a 40.92
(99.99 %)
662
(0.01 %)
1,937
(100.00 %)
522,618
(4.22 %)
317,280
(4.23 %)
4,040,245
(28.25 %)
26,946
(1.79 %)
335 shanny (alternate hap 2023)
GCA_963383635.1
n/a 14,728
(2.46 %)
62,094
(7.09 %)
n/a 42.32
(100.00 %)
1
(0.00 %)
3,847
(100.00 %)
939,151
(11.90 %)
472,983
(7.68 %)
4,326,183
(28.40 %)
64,290
(4.16 %)
336 shanny (primary hap 2023)
GCA_963383615.1
n/a 15,032
(2.44 %)
62,625
(6.97 %)
n/a 42.07
(99.98 %)
598
(0.02 %)
847
(100.00 %)
967,197
(11.85 %)
498,286
(8.15 %)
4,397,828
(28.96 %)
65,744
(4.06 %)
337 sheepshead minnow
GCF_000732505.1
37,879
(7.01 %)
14,749
(2.02 %)
25,480
(4.66 %)
n/a 38.19
(86.93 %)
113,210
(13.10 %)
110,959
(86.90 %)
363,397
(1.88 %)
195,191
(1.43 %)
6,444,762
(27.47 %)
18,269
(0.66 %)
338 shortfin molly
GCF_001443325.1
54,473
(11.42 %)
15,104
(2.72 %)
33,717
(6.74 %)
n/a 39.23
(84.81 %)
37,507
(15.20 %)
50,598
(84.80 %)
328,347
(2.03 %)
172,112
(1.18 %)
4,876,942
(22.80 %)
34,271
(1.66 %)
339 Siamese fighting fish (v1 alternate hap 2019)
GCA_900651605.1
n/a 14,510
(4.12 %)
60,058
(10.77 %)
n/a 45.51
(100.00 %)
2
(0.00 %)
3,705
(100.00 %)
249,671
(3.68 %)
182,366
(4.87 %)
1,939,533
(22.55 %)
72,474
(13.55 %)
340 Siamese fighting fish (v4 primary hap 2023)
GCF_900634795.4
59,278
(19.85 %)
14,594
(4.32 %)
55,265
(10.96 %)
n/a 45.31
(99.99 %)
321
(0.01 %)
36
(100.00 %)
384,203
(19.38 %)
175,898
(4.39 %)
1,946,630
(23.16 %)
70,331
(13.13 %)
341 Siamese fighting fish (v5.4 alternate hap 2023)
GCA_900651605.2
n/a 14,737
(4.05 %)
61,568
(10.70 %)
n/a 45.50
(100.00 %)
108
(0.00 %)
3,872
(100.00 %)
392,585
(19.23 %)
190,741
(5.09 %)
1,994,824
(23.20 %)
74,259
(13.49 %)
342 silver crucian carp (wild population from Czech Republic Cgi1373 2022)
GCF_023724105.1
131,166
(9.80 %)
29,612
(2.99 %)
81,338
(5.43 %)
n/a 37.63
(99.92 %)
2,597
(0.08 %)
51
(100.00 %)
3,277,259
(45.05 %)
801,192
(7.96 %)
7,910,205
(42.51 %)
60,236
(2.18 %)
343 smalleye Pacific opah (hap1 2023)
GCA_029633845.1
n/a 13,661
(1.11 %)
75,418
(4.21 %)
n/a 45.01
(99.96 %)
3,120
(0.04 %)
1,059
(100.00 %)
4,634,757
(53.53 %)
1,006,319
(17.13 %)
5,273,732
(51.16 %)
145,115
(7.59 %)
344 smalleye Pacific opah (hap2 2023 refseq)
GCF_029633865.1
34,018
(4.17 %)
13,617
(1.10 %)
74,639
(4.12 %)
n/a 44.94
(99.96 %)
3,115
(0.04 %)
544
(100.00 %)
4,603,649
(53.23 %)
1,009,241
(18.00 %)
5,236,063
(51.65 %)
143,632
(7.43 %)
345 smallmouth bass
GCF_021292245.1
55,919
(9.40 %)
15,509
(2.37 %)
49,387
(5.61 %)
n/a 40.72
(99.65 %)
34,581
(0.36 %)
15,020
(100.00 %)
445,979
(2.50 %)
249,630
(2.49 %)
5,071,015
(28.28 %)
23,875
(1.36 %)
346 snake pipefish (RoL-2023_Sb 2023)
GCF_033978785.1
57,883
(4.39 %)
15,654
(1.03 %)
72,123
(3.58 %)
n/a 38.64
(100.00 %)
2,564
(0.00 %)
424
(100.00 %)
3,149,025
(23.73 %)
1,621,410
(19.58 %)
7,534,195
(67.22 %)
122,765
(3.07 %)
347 sockeye salmon (On170113-E2 v2 2019)
GCF_006149115.2
75,628
(6.10 %)
24,075
(1.71 %)
98,364
(4.30 %)
n/a 43.37
(96.15 %)
25,658
(3.85 %)
36,660
(99.99 %)
949,725
(3.53 %)
1,465,583
(10.82 %)
8,853,884
(48.52 %)
62,850
(1.45 %)
348 sockeye salmon (Pitt River 2024)
GCF_034236695.1
80,798
(5.59 %)
26,218
(1.35 %)
116,746
(3.87 %)
n/a 44.03
(99.93 %)
4,351
(0.07 %)
12,436
(100.00 %)
6,356,046
(54.95 %)
2,840,516
(31.41 %)
10,575,179
(57.52 %)
77,648
(1.61 %)
349 South Georgia icefish
GCF_902827115.1
41,307
(6.47 %)
14,776
(1.79 %)
68,734
(6.16 %)
61,643
(5.52 %)
42.07
(99.94 %)
2,461
(0.06 %)
1,563
(100.00 %)
498,451
(3.42 %)
474,032
(7.20 %)
3,613,731
(45.83 %)
88,984
(4.31 %)
350 southern bluefin tuna (alternate hap 2021)
GCA_910596085.1
n/a 15,727
(2.61 %)
43,177
(5.74 %)
n/a 39.72
(100.00 %)
n/a 895
(100.00 %)
1,590,386
(33.53 %)
246,800
(2.86 %)
5,173,834
(26.85 %)
14,473
(0.87 %)
351 southern bluefin tuna (primary hap 2021 refseq)
GCF_910596095.1
58,429
(11.06 %)
15,626
(2.56 %)
42,730
(5.74 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
184
(0.00 %)
58
(100.00 %)
554,276
(3.42 %)
247,764
(2.94 %)
5,176,851
(26.85 %)
14,097
(0.88 %)
352 southern platyfish
GCF_002775205.1
46,367
(11.15 %)
14,674
(2.66 %)
28,368
(6.82 %)
n/a 38.97
(99.53 %)
156
(0.47 %)
102
(100.00 %)
323,402
(2.76 %)
146,477
(2.33 %)
4,741,552
(28.27 %)
34,667
(2.13 %)
353 Southwestern China cavefish
GCF_001515605.1
74,317
(6.97 %)
30,906
(3.19 %)
55,474
(5.66 %)
n/a 37.28
(92.69 %)
168,741
(7.34 %)
254,423
(92.66 %)
1,129,104
(5.02 %)
730,197
(4.59 %)
8,910,005
(36.97 %)
64,238
(1.79 %)
354 spiny chromis (Palm Island Apoly-LR-REF 2022)
GCF_021347895.1
57,720
(10.03 %)
15,810
(2.14 %)
58,218
(5.77 %)
n/a 40.33
(99.99 %)
871
(0.01 %)
81
(100.00 %)
1,505,948
(35.31 %)
346,542
(4.71 %)
5,210,329
(31.65 %)
36,529
(1.65 %)
355 spiny chromis (Palm Islands 2017)
GCF_002109545.1
38,931
(8.84 %)
15,624
(2.29 %)
35,942
(5.59 %)
n/a 40.01
(85.05 %)
209,115
(15.01 %)
30,414
(100.00 %)
372,901
(2.33 %)
278,854
(1.99 %)
5,622,334
(22.61 %)
25,079
(0.95 %)
356 spotted green pufferfish (2004)
GCA_000180735.1
n/a 13,641
(5.13 %)
57,982
(13.46 %)
n/a 46.43
(91.24 %)
18,974
(8.76 %)
44,686
(91.24 %)
252,877
(4.38 %)
159,939
(3.51 %)
1,689,462
(18.66 %)
51,580
(13.42 %)
357 spotted tilapia (v1 MD_Pm_ZW 2024)
GCF_036321145.1
46,818
(8.35 %)
14,938
(2.04 %)
55,475
(6.12 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
23
(0.00 %)
792
(100.00 %)
505,488
(2.57 %)
269,742
(4.14 %)
4,697,020
(30.74 %)
30,399
(1.90 %)
358 spotted tilapia (v2 MD_Pm_ZW 2024)
GCF_036321145.2
48,380
(8.37 %)
15,470
(2.04 %)
57,237
(6.11 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
24
(0.00 %)
791
(100.00 %)
523,070
(2.57 %)
277,554
(4.08 %)
4,872,723
(30.67 %)
31,383
(1.89 %)
359 sterlet (maternal 2020)
GCA_902713425.1
n/a 22,306
(1.80 %)
33,366
(4.09 %)
n/a 39.56
(99.99 %)
402
(0.01 %)
245
(100.00 %)
1,126,738
(3.36 %)
889,853
(6.73 %)
8,766,715
(39.22 %)
51,356
(1.84 %)
360 sterlet (paternal 2020)
GCA_902713435.1
n/a 22,718
(1.81 %)
34,093
(4.15 %)
57,768
(4.88 %)
39.60
(100.00 %)
422
(0.01 %)
224
(100.00 %)
1,145,503
(3.39 %)
912,936
(6.84 %)
8,839,174
(39.17 %)
52,560
(1.82 %)
361 stone loach (alternate hap 2022)
GCA_947034905.1
n/a 16,177
(4.18 %)
40,160
(7.35 %)
n/a 39.58
(100.00 %)
n/a 2,237
(100.00 %)
1,208,781
(38.02 %)
121,854
(7.96 %)
2,956,942
(32.61 %)
27,787
(3.58 %)
362 stone loach (primary hap 2022)
GCA_947034865.1
n/a 16,419
(3.98 %)
40,677
(7.21 %)
n/a 39.69
(99.97 %)
825
(0.03 %)
100
(100.00 %)
1,324,513
(39.84 %)
143,170
(9.30 %)
3,000,881
(34.30 %)
30,130
(3.71 %)
363 stone moroko (DD20220531a primary hap 2022)
GCF_024679245.1
59,497
(6.82 %)
17,172
(2.25 %)
57,383
(4.85 %)
n/a 39.18
(99.99 %)
497
(0.01 %)
81
(100.00 %)
4,750,810
(63.58 %)
649,426
(10.14 %)
6,511,384
(46.74 %)
74,723
(4.45 %)
364 straightnose pipefish (RoL-2023_Sa 2023)
GCF_033978795.1
56,498
(4.86 %)
14,602
(1.00 %)
64,279
(2.96 %)
n/a 39.74
(100.00 %)
1,172
(0.00 %)
473
(100.00 %)
2,984,285
(27.54 %)
1,402,691
(20.35 %)
7,915,062
(67.02 %)
140,374
(3.90 %)
365 striated frogfish (MH-2024 2024)
GCF_040054535.1
45,220
(12.66 %)
14,509
(3.35 %)
46,221
(7.95 %)
n/a 42.02
(100.00 %)
18
(0.00 %)
42
(100.00 %)
791,570
(25.79 %)
305,491
(6.68 %)
3,000,938
(29.61 %)
36,818
(4.17 %)
366 striped catfish (fPanHyp1 alternate hap 2022)
GCA_027382375.1
n/a 15,871
(2.85 %)
42,287
(5.51 %)
n/a 38.96
(100.00 %)
1
(0.00 %)
3,274
(100.00 %)
1,826,752
(37.53 %)
592,022
(6.69 %)
4,899,884
(32.33 %)
17,357
(1.25 %)
367 striped catfish (primary hap 2022 refseq)
GCF_027358585.1
53,860
(11.99 %)
16,033
(2.86 %)
41,619
(5.48 %)
n/a 38.99
(99.49 %)
236
(0.51 %)
58
(100.00 %)
1,870,234
(37.80 %)
605,570
(6.82 %)
5,059,429
(32.43 %)
17,919
(1.29 %)
368 striped catfish Indonesia
GCF_009078355.1
50,044
(9.61 %)
15,665
(2.76 %)
41,398
(5.35 %)
n/a 38.86
(99.98 %)
463
(0.02 %)
150
(100.00 %)
777,186
(5.69 %)
603,962
(6.24 %)
5,141,987
(32.41 %)
17,264
(1.20 %)
369 striped catfish Vietnam
GCF_003671635.1
40,992
(9.44 %)
15,295
(2.91 %)
20,865
(5.31 %)
n/a 38.71
(97.32 %)
23,755
(2.69 %)
567
(100.00 %)
693,498
(4.75 %)
489,286
(3.69 %)
4,849,313
(30.04 %)
15,076
(0.95 %)
370 striped sea-bass
GCF_004916995.1
32,103
(10.78 %)
14,422
(3.07 %)
38,188
(6.41 %)
n/a 40.19
(99.19 %)
73,335
(0.86 %)
630
(100.00 %)
365,581
(2.59 %)
142,967
(0.99 %)
4,151,813
(22.73 %)
13,730
(0.95 %)
371 Sumatra barb
GCF_018831695.1
54,947
(11.16 %)
18,745
(3.98 %)
49,520
(6.36 %)
n/a 38.24
(99.95 %)
5,075
(0.05 %)
1,122
(100.00 %)
638,783
(6.33 %)
357,159
(7.71 %)
4,520,846
(32.46 %)
46,339
(3.96 %)
372 swamp eel
GCF_001952655.1
43,831
(10.64 %)
14,741
(2.98 %)
20,099
(5.80 %)
n/a 40.90
(92.01 %)
51,257
(8.01 %)
71,879
(91.99 %)
266,195
(1.84 %)
95,726
(1.16 %)
3,596,747
(21.95 %)
7,065
(0.42 %)
373 swordfish
GCF_016859285.1
47,986
(9.92 %)
15,208
(2.84 %)
42,556
(5.91 %)
n/a 40.69
(99.97 %)
449
(0.03 %)
1,482
(100.00 %)
484,543
(3.59 %)
230,762
(3.41 %)
4,496,150
(23.94 %)
27,129
(2.10 %)
374 tambaqui
GCF_904425465.1
46,601
(6.55 %)
17,150
(1.88 %)
50,327
(4.03 %)
n/a 39.33
(100.00 %)
420
(0.00 %)
1,269
(100.00 %)
753,112
(4.00 %)
676,948
(5.71 %)
8,317,676
(35.32 %)
25,784
(0.92 %)
375 thickback sole (primary hap 2023)
GCA_963457635.1
n/a 14,720
(2.58 %)
45,918
(6.44 %)
n/a 40.37
(99.99 %)
454
(0.01 %)
188
(100.00 %)
1,242,704
(17.37 %)
518,293
(15.23 %)
3,986,694
(40.18 %)
51,441
(3.53 %)
376 thicklip grey mullet (primary hap 2023)
GCA_963514085.1
n/a 15,347
(2.73 %)
50,294
(7.25 %)
n/a 42.30
(99.98 %)
610
(0.02 %)
393
(100.00 %)
1,157,324
(26.70 %)
229,196
(4.33 %)
3,694,790
(27.54 %)
38,929
(2.20 %)
377 three-spined stickleback
GCF_016920845.1
50,181
(16.09 %)
14,935
(3.99 %)
53,773
(9.96 %)
n/a 44.66
(99.24 %)
3,125
(0.76 %)
2,937
(100.00 %)
368,987
(9.09 %)
160,564
(2.89 %)
2,308,841
(21.91 %)
80,336
(11.49 %)
378 three-spined stickleback (hap1 2024)
GCA_964276395.1
n/a 14,939
(3.72 %)
56,284
(10.07 %)
n/a 44.71
(99.99 %)
331
(0.01 %)
133
(100.00 %)
573,569
(20.53 %)
206,699
(9.01 %)
2,335,009
(27.29 %)
84,009
(12.41 %)
379 three-spined stickleback (hap2 2024)
GCA_964276385.1
n/a 13,591
(3.79 %)
50,693
(10.19 %)
n/a 44.72
(99.99 %)
309
(0.01 %)
479
(99.99 %)
505,547
(19.86 %)
181,092
(8.75 %)
2,117,454
(27.02 %)
75,434
(12.33 %)
380 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022)
GCA_026437355.1
n/a 13,912
(1.87 %)
62,727
(6.28 %)
n/a 42.90
(99.99 %)
894
(0.01 %)
755
(100.00 %)
1,981,480
(37.86 %)
652,950
(27.50 %)
3,680,829
(47.75 %)
96,414
(8.01 %)
381 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022)
GCA_026437365.1
n/a 14,276
(1.78 %)
66,576
(6.32 %)
n/a 42.96
(99.99 %)
794
(0.01 %)
820
(100.00 %)
2,127,818
(38.86 %)
708,255
(30.28 %)
3,809,452
(49.66 %)
101,682
(8.04 %)
382 tiger tail seahorse (QL1 v2 2016)
GCF_001891065.2
47,024
(13.33 %)
13,806
(3.76 %)
52,367
(8.81 %)
n/a 43.30
(93.08 %)
22,977
(6.92 %)
55,891
(93.08 %)
356,857
(3.66 %)
155,338
(3.36 %)
2,806,278
(24.56 %)
61,010
(7.71 %)
383 tongue sole
GCF_000523025.1
45,186
(16.40 %)
14,186
(3.98 %)
20,816
(8.22 %)
n/a 40.82
(94.88 %)
33,269
(5.14 %)
62,912
(94.86 %)
423,833
(4.34 %)
235,739
(3.33 %)
3,085,031
(24.78 %)
17,094
(1.42 %)
384 torafugu (alternate hap 2019)
GCA_901000745.3
n/a 13,635
(4.82 %)
48,723
(11.83 %)
n/a 45.60
(99.82 %)
38
(0.18 %)
2,012
(100.00 %)
249,793
(9.32 %)
151,193
(4.49 %)
1,577,144
(20.25 %)
46,936
(9.72 %)
385 torafugu (fTakRub1.2 2019 refseq)
GCF_901000725.2
53,479
(18.31 %)
14,527
(4.79 %)
28,597
(10.65 %)
55,587
(14.38 %)
45.67
(99.04 %)
402
(0.96 %)
128
(100.00 %)
281,011
(10.36 %)
178,921
(5.32 %)
1,642,756
(20.86 %)
49,975
(9.63 %)
386 torafugu (fTakRub1.3 2021 genbank)
GCA_901000725.3
n/a 14,527
(4.79 %)
51,181
(11.72 %)
n/a 45.67
(99.04 %)
402
(0.96 %)
128
(100.00 %)
325,077
(14.03 %)
178,921
(5.32 %)
1,642,754
(20.86 %)
49,975
(9.63 %)
387 trahira (hap2 2023)
GCA_029633875.1
n/a 16,216
(2.00 %)
45,209
(4.32 %)
n/a 41.03
(96.02 %)
907
(3.98 %)
452
(100.00 %)
2,280,303
(30.80 %)
708,327
(15.59 %)
5,394,248
(39.01 %)
28,386
(2.18 %)
388 trahira (v1 hap1 2024 refseq)
GCF_029633855.1
55,764
(7.71 %)
17,259
(2.05 %)
47,792
(4.36 %)
n/a 40.99
(94.51 %)
989
(5.49 %)
598
(100.00 %)
2,407,637
(30.93 %)
742,073
(14.33 %)
5,715,475
(37.52 %)
29,012
(2.12 %)
389 trahira (v2 hap1 2024 genbank)
GCA_029633855.2
n/a 17,256
(2.05 %)
47,792
(4.36 %)
n/a 40.99
(94.51 %)
989
(5.49 %)
597
(100.00 %)
2,407,631
(30.93 %)
742,073
(14.33 %)
5,715,418
(37.52 %)
29,012
(2.12 %)
390 turbot (primary hap 2023)
GCA_963854745.1
n/a 14,816
(3.44 %)
49,680
(8.16 %)
n/a 43.40
(99.97 %)
805
(0.03 %)
108
(100.00 %)
808,348
(19.20 %)
301,230
(7.15 %)
3,267,772
(25.91 %)
66,132
(6.90 %)
391 turbot (ysfricsl-2021 2022)
GCF_022379125.1
57,285
(14.93 %)
14,887
(3.52 %)
49,403
(8.32 %)
87,351
(14.65 %)
43.54
(100.00 %)
n/a 28
(100.00 %)
455,017
(0.00 %)
297,185
(5.03 %)
3,312,612
(24.33 %)
65,633
(7.08 %)
392 turquoise killifish (GRZ 2015)
GCF_001465895.1
40,373
(7.85 %)
14,339
(2.08 %)
84,906
(20.47 %)
57,218
(6.01 %)
42.51
(68.98 %)
85,562
(31.04 %)
68,911
(68.97 %)
392,114
(2.78 %)
307,607
(2.09 %)
4,777,941
(27.62 %)
61,105
(2.15 %)
393 turquoise killifish (MZM-0403 2023)
GCF_027789165.1
54,488
(6.75 %)
14,227
(1.27 %)
69,161
(4.33 %)
n/a 44.33
(93.22 %)
3,093
(6.78 %)
2,681
(100.00 %)
2,760,581
(47.64 %)
635,213
(25.56 %)
4,136,925
(56.55 %)
110,696
(10.50 %)
394 walking catfish (CIFAMagur01 2020)
GCA_013621035.1
n/a 15,895
(2.18 %)
46,934
(4.73 %)
n/a 39.83
(99.95 %)
605
(0.05 %)
3,484
(100.00 %)
1,061,538
(6.25 %)
611,618
(5.19 %)
5,978,835
(37.11 %)
54,666
(3.50 %)
395 walleye pollock (NIFS_2021 2022)
GCF_026213295.1
49,084
(12.15 %)
14,241
(2.71 %)
70,653
(9.29 %)
n/a 45.59
(99.96 %)
2,816
(0.04 %)
168
(100.00 %)
1,274,742
(38.63 %)
797,757
(14.11 %)
2,725,416
(34.38 %)
95,149
(8.09 %)
396 warty frogfish (fAntMac1 alternate hap 2020)
GCA_013347815.1
n/a 14,197
(3.33 %)
44,782
(7.70 %)
n/a 41.82
(100.00 %)
n/a 2,294
(100.00 %)
396,279
(4.74 %)
275,154
(5.76 %)
2,933,132
(29.41 %)
35,104
(4.08 %)
397 warty frogfish (primary hap 2020)
GCA_013358685.1
n/a 14,494
(3.34 %)
45,310
(7.77 %)
n/a 41.86
(99.87 %)
219
(0.13 %)
155
(100.00 %)
413,753
(4.95 %)
290,313
(6.11 %)
3,010,996
(29.71 %)
36,840
(4.18 %)
398 western mosquitofish
GCF_019740435.1
54,029
(12.31 %)
14,667
(2.80 %)
44,358
(6.62 %)
n/a 38.94
(97.42 %)
181
(2.58 %)
37
(100.00 %)
348,476
(2.56 %)
158,728
(2.21 %)
4,604,959
(26.85 %)
30,624
(1.94 %)
399 western speckled dace (OS25496 2023)
GCF_029890125.1
46,203
(5.36 %)
16,945
(2.57 %)
65,343
(6.35 %)
n/a 39.74
(100.00 %)
n/a 930
(100.00 %)
2,528,154
(48.24 %)
549,447
(8.24 %)
5,157,802
(41.42 %)
84,874
(6.05 %)
400 White Sands pupfish
GCF_016077235.1
46,084
(6.27 %)
14,817
(1.71 %)
52,055
(4.88 %)
n/a 39.01
(100.00 %)
n/a 2,003
(100.00 %)
489,894
(2.67 %)
304,277
(3.91 %)
6,371,712
(38.05 %)
41,820
(1.75 %)
401 wolf-eel
GCF_004355925.1
43,625
(14.00 %)
14,930
(3.24 %)
31,372
(7.30 %)
n/a 42.10
(92.86 %)
23,891
(7.15 %)
33,400
(92.85 %)
379,343
(3.26 %)
244,853
(2.39 %)
3,432,622
(22.07 %)
30,581
(2.04 %)
402 woolly sculpin (alternate hap CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055415.1
n/a 14,753
(3.49 %)
49,516
(8.47 %)
n/a 43.00
(100.00 %)
222
(0.00 %)
171
(100.00 %)
458,382
(5.18 %)
420,718
(8.01 %)
3,146,054
(25.71 %)
69,817
(7.20 %)
403 woolly sculpin (CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055335.1
n/a 14,847
(3.48 %)
50,136
(8.43 %)
n/a 42.99
(100.00 %)
219
(0.00 %)
443
(100.00 %)
461,903
(5.20 %)
422,251
(8.03 %)
3,180,804
(25.81 %)
70,183
(7.15 %)
404 woolly sculpin (CAN_PGR_092001 primary hap 2022)
GCF_023055335.1
42,410
(12.47 %)
14,845
(3.48 %)
50,132
(8.43 %)
n/a 42.99
(100.00 %)
219
(0.00 %)
661
(100.00 %)
461,895
(5.20 %)
422,249
(8.03 %)
3,180,722
(25.81 %)
70,181
(7.15 %)
405 worm pipefish (RoL_2023-P1 2023)
GCF_033978685.1
73,681
(3.43 %)
25,892
(1.02 %)
114,154
(3.30 %)
n/a 39.45
(100.00 %)
146
(0.00 %)
630
(100.00 %)
4,795,312
(24.37 %)
2,093,730
(16.74 %)
13,132,465
(67.32 %)
248,526
(4.59 %)
406 Wuchang bream
GCF_018812025.1
68,768
(8.86 %)
18,247
(2.62 %)
57,323
(5.24 %)
n/a 37.64
(99.83 %)
1,281
(0.17 %)
243
(100.00 %)
801,110
(0.00 %)
559,399
(5.04 %)
6,340,567
(43.09 %)
45,067
(2.52 %)
407 Yangtze koukloug (SWU-2019 2020)
GCF_012432095.1
63,925
(10.50 %)
17,502
(3.25 %)
52,519
(5.86 %)
n/a 37.23
(99.62 %)
617
(0.38 %)
353
(100.00 %)
2,297,102
(50.34 %)
368,423
(3.28 %)
5,171,389
(38.98 %)
32,824
(2.00 %)
408 yellow catfish (hzauxx_2018 2022)
GCF_022655615.1
64,819
(11.15 %)
15,680
(2.87 %)
41,108
(5.68 %)
n/a 39.49
(99.94 %)
817
(0.06 %)
517
(100.00 %)
839,496
(9.42 %)
756,396
(11.12 %)
4,051,149
(35.45 %)
24,342
(1.72 %)
409 yellow catfish (Tf-2017 2018)
GCF_003724035.1
54,374
(10.66 %)
15,584
(2.85 %)
22,598
(5.58 %)
n/a 39.55
(99.11 %)
1,760
(0.89 %)
663
(100.00 %)
883,218
(10.65 %)
797,020
(11.09 %)
4,092,065
(35.46 %)
24,238
(1.72 %)
410 yellow perch (YP-PL-M2 2019)
GCF_004354835.1
47,108
(7.77 %)
15,458
(2.26 %)
28,572
(5.62 %)
n/a 40.84
(99.95 %)
831
(0.05 %)
268
(100.00 %)
620,402
(4.92 %)
540,302
(7.26 %)
4,770,842
(35.92 %)
35,251
(1.63 %)
411 yellowfin seabream (v.2019 alternate hap 2020)
GCA_904848175.1
n/a 814
(1.87 %)
3,814
(6.84 %)
n/a 42.36
(99.98 %)
80
(0.02 %)
349
(100.00 %)
38,000
(5.03 %)
29,516
(7.35 %)
232,988
(20.37 %)
2,289
(2.07 %)
412 yellowfin seabream (v.2019 primary hap 2020)
GCF_904848185.1
63,974
(13.26 %)
15,178
(2.82 %)
46,332
(6.73 %)
84,160
(11.62 %)
42.09
(100.00 %)
149
(0.00 %)
66
(100.00 %)
499,939
(3.43 %)
254,361
(2.64 %)
4,420,217
(22.81 %)
31,005
(1.79 %)
413 yellowfin tuna (alternate hap 2021)
GCA_914744365.1
n/a 15,959
(2.63 %)
43,025
(5.73 %)
n/a 39.71
(100.00 %)
n/a 640
(100.00 %)
1,427,221
(28.44 %)
257,108
(3.15 %)
5,197,531
(26.91 %)
13,909
(0.83 %)
414 yellowfin tuna (primary hap 2021)
GCF_914725855.1
57,835
(11.36 %)
15,616
(2.53 %)
42,750
(5.72 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
70
(0.00 %)
68
(100.00 %)
569,665
(3.53 %)
259,656
(3.34 %)
5,175,692
(27.05 %)
14,420
(0.88 %)
415 yellowtail amberjack (v2 SW California HSWRI2012SDOR001 2017)
GCF_002814215.2
40,935
(9.94 %)
15,673
(2.75 %)
53,235
(6.33 %)
n/a 40.72
(97.79 %)
33,661
(2.21 %)
98,345
(100.00 %)
1,337,427
(24.48 %)
522,121
(4.83 %)
4,649,096
(25.00 %)
16,819
(0.86 %)
416 zebra mbuna
GCF_000238955.4
51,012
(8.37 %)
15,901
(2.10 %)
32,136
(6.12 %)
n/a 41.16
(99.99 %)
641
(0.01 %)
1,690
(100.00 %)
565,771
(6.22 %)
253,037
(2.53 %)
4,679,743
(31.57 %)
36,689
(2.00 %)
417 zebrafish (fDanRer4 alternate hap 2022)
GCA_944039255.1
n/a 6,365
(2.41 %)
16,467
(3.26 %)
n/a 36.72
(100.00 %)
n/a 4,719
(100.00 %)
1,317,027
(59.43 %)
323,062
(10.58 %)
3,014,570
(45.46 %)
14,563
(1.98 %)
418 zebrafish (T5D 2021)
GCA_018400075.1
n/a 17,774
(2.54 %)
44,221
(3.24 %)
n/a 36.52
(99.87 %)
20,876
(0.14 %)
20,901
(99.86 %)
4,138,008
(61.22 %)
894,145
(6.79 %)
9,494,379
(47.68 %)
42,482
(2.03 %)
419 zebrafish (WGS:CAHPTA01 2020)
GCA_903684865.1
n/a 17,535
(2.50 %)
44,169
(3.34 %)
n/a 36.57
(99.99 %)
712
(0.01 %)
1,252
(100.00 %)
3,891,854
(61.07 %)
927,173
(7.78 %)
8,621,517
(50.27 %)
44,554
(2.12 %)
420 zebrafish (WGS:CAHPTB02 2020)
GCA_903684855.2
n/a 17,692
(2.51 %)
43,578
(3.27 %)
n/a 36.56
(99.99 %)
1,352
(0.01 %)
755
(100.00 %)
3,937,397
(60.86 %)
936,258
(7.76 %)
8,732,369
(50.44 %)
44,812
(2.09 %)
421 zebrafish (WGS:CALUEM01 primary hap 2022)
GCA_944039275.1
n/a 18,065
(2.46 %)
44,526
(3.30 %)
n/a 37.08
(99.99 %)
381
(0.01 %)
73
(100.00 %)
4,804,769
(44.04 %)
954,645
(10.72 %)
8,694,743
(51.88 %)
44,936
(2.02 %)
422 zebrafish GRCz11
GCF_000002035.6
65,219
(5.63 %)
22,246
(2.54 %)
51,134
(7.13 %)
n/a 36.60
(99.72 %)
20,258
(0.28 %)
34,617
(99.73 %)
4,595,932
(57.92 %)
1,077,677
(6.47 %)
10,772,232
(49.45 %)
53,471
(2.06 %)
423 zig-zag eel (alternate hap)
GCA_900700395.1
n/a 1,204
(2.88 %)
4,065
(7.13 %)
n/a 41.24
(99.99 %)
n/a 1,437
(100.00 %)
26,319
(3.19 %)
14,209
(3.21 %)
211,357
(18.05 %)
1,253
(1.49 %)
424 zig-zag eel (v1.2 2019 refseq)
GCF_900324485.2
44,988
(12.00 %)
15,037
(3.35 %)
40,235
(7.28 %)
60,496
(9.39 %)
40.66
(97.76 %)
238
(2.24 %)
123
(100.00 %)
348,230
(2.87 %)
157,728
(2.01 %)
3,180,025
(23.44 %)
12,807
(1.08 %)
425 zig-zag eel (v1.3 2021 genbank)
GCA_900324485.3
n/a 15,036
(3.35 %)
40,234
(7.28 %)
n/a 40.66
(97.76 %)
238
(2.24 %)
123
(100.00 %)
671,614
(20.98 %)
157,728
(2.01 %)
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(23.44 %)
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(1.08 %)
TOTALS:total assembly count 425

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Primates 221 assemblies assembly stats track stats
Mammals 608 assemblies assembly stats track stats
Birds 399 assemblies assembly stats track stats
Fishes 425 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 280 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1114 assemblies assembly stats track stats
Plants 305 assemblies assembly stats track stats
Fungi 918 assemblies assembly stats track stats
Viruses 287 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 110 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 527 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1067 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 778 assemblies assembly stats track stats