Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of mammals only.

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count	common name link to genome browser	ncbiRefSeq	xenoRefGene	augustus genes	Ensembl genes	gc5 base	gaps	assembly sequences	Repeat Masker	TRF simpleRepeat	window Masker	cpg islands
1	aardvark (SDZICR_OR568_19922 2012 Broad) GCF_000298275.1	25,594 (1.08 %)	18,351 (1.06 %)	20,358 (0.98 %)	n/a	40.07 (76.89 %)	411,144 (23.15 %)	433,653 (76.85 %)	n/a	536,700 (0.74 %)	18,176,790 (39.08 %)	26,235 (0.40 %)
2	African grass rat (maternal 2020) GCA_011750645.1	n/a	20,916 (2.01 %)	19,513 (1.43 %)	n/a	41.37 (98.89 %)	1,526 (1.11 %)	1,610 (100.00 %)	4,928,847 (37.45 %)	1,652,295 (5.20 %)	13,507,965 (32.27 %)	17,712 (0.51 %)
3	African grass rat (paternal 2020) GCA_011762545.1	n/a	20,796 (2.00 %)	19,611 (1.43 %)	n/a	41.42 (97.70 %)	1,563 (2.30 %)	1,740 (100.00 %)	4,904,243 (37.25 %)	1,672,608 (5.37 %)	13,465,246 (32.19 %)	17,677 (0.50 %)
4	African grass rat (paternal X 2020 refseq) GCF_011762505.1	45,963 (2.46 %)	20,878 (1.99 %)	19,613 (1.43 %)	37,929 (2.32 %)	41.39 (99.19 %)	1,624 (0.81 %)	1,595 (100.00 %)	4,939,557 (37.33 %)	1,674,970 (5.40 %)	13,613,429 (32.71 %)	17,767 (0.51 %)
5	African grass rat (v2 paternal X 2024 genbank) GCA_011762505.2	n/a	19,637 (1.95 %)	19,610 (1.43 %)	n/a	41.39 (99.19 %)	1,624 (0.81 %)	1,596 (100.00 %)	5,399,465 (42.90 %)	1,674,970 (5.40 %)	13,613,540 (32.71 %)	17,767 (0.51 %)
6	African grass rat (v3 paternal hap 2024) GCA_011762505.3	n/a	20,986 (2.01 %)	19,611 (1.43 %)	n/a	41.39 (99.19 %)	1,624 (0.81 %)	1,596 (100.00 %)	4,532,782 (33.95 %)	1,674,970 (5.40 %)	13,612,916 (32.71 %)	17,767 (0.51 %)
7	African hunting dog GCA_001887905.1	n/a	18,956 (1.75 %)	17,562 (1.41 %)	n/a	40.98 (92.89 %)	1,415,298 (7.28 %)	803 (100.00 %)	4,458,183 (39.99 %)	658,637 (1.13 %)	13,671,493 (28.24 %)	47,644 (1.64 %)
8	African hunting dog (LycPic1hap1 2024) GCA_040955645.1	n/a	18,688 (1.61 %)	19,670 (1.44 %)	n/a	41.35 (100.00 %)	82 (0.00 %)	86 (100.00 %)	4,281,139 (31.62 %)	959,378 (2.78 %)	12,859,760 (32.95 %)	49,122 (2.32 %)
9	African hunting dog (LycPic1hap2 2024) GCA_040955705.1	n/a	19,463 (1.58 %)	20,378 (1.42 %)	n/a	41.30 (100.00 %)	91 (0.00 %)	77 (100.00 %)	4,513,580 (32.16 %)	1,008,611 (2.91 %)	13,570,452 (33.71 %)	50,954 (2.21 %)
10	African savanna elephant (2009 refseq) GCF_000001905.1	46,043 (2.30 %)	19,169 (1.26 %)	19,664 (1.10 %)	n/a	40.76 (97.57 %)	93,514 (2.45 %)	95,866 (97.55 %)	6,363,315 (57.54 %)	365,797 (0.88 %)	16,073,053 (44.89 %)	33,513 (0.68 %)
11	African savanna elephant (hap1 mLoxAfr1 2023) GCA_030020305.1	n/a	18,845 (1.07 %)	22,426 (1.10 %)	n/a	41.34 (99.85 %)	169 (0.15 %)	1,253 (99.85 %)	4,406,744 (29.55 %)	925,868 (4.71 %)	15,966,881 (50.49 %)	68,531 (1.61 %)
12	African savanna elephant (hap2 2023 genbank) GCA_030014295.1	n/a	18,981 (1.10 %)	22,759 (1.12 %)	n/a	41.25 (99.90 %)	231 (0.10 %)	880 (100.00 %)	4,426,756 (29.95 %)	832,908 (4.08 %)	16,118,910 (49.47 %)	62,315 (1.49 %)
13	African savanna elephant (hap2 2023 refseq) GCF_030014295.1	64,034 (3.35 %)	18,980 (1.10 %)	21,593 (1.06 %)	n/a	41.25 (99.90 %)	231 (0.10 %)	879 (100.00 %)	4,426,749 (29.95 %)	832,904 (4.08 %)	16,118,888 (49.47 %)	62,314 (1.49 %)
14	agile gracile mouse opossum GCF_016433145.1	30,697 (1.32 %)	17,361 (0.78 %)	17,596 (0.81 %)	n/a	37.86 (91.75 %)	85,142 (8.25 %)	60,714 (100.00 %)	7,917,577 (49.04 %)	1,054,566 (1.57 %)	22,701,659 (37.69 %)	27,301 (0.49 %)
15	alpaca (2025) GCF_048564905.1	80,233 (3.11 %)	18,667 (1.53 %)	23,043 (1.52 %)	n/a	41.92 (99.91 %)	681 (0.09 %)	519 (100.00 %)	3,387,094 (33.34 %)	395,581 (10.22 %)	11,510,740 (36.96 %)	72,497 (1.98 %)
16	alpaca (v3.2 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U) GCF_000164845.4	54,987 (3.56 %)	18,439 (1.93 %)	18,426 (1.63 %)	n/a	41.40 (95.85 %)	166,272 (4.17 %)	77,389 (100.00 %)	3,004,413 (33.17 %)	315,092 (1.36 %)	12,458,272 (24.89 %)	54,502 (1.38 %)
17	Alpine marmot (2019) GCF_001458135.2	69,587 (3.43 %)	19,047 (1.54 %)	17,768 (1.39 %)	n/a	39.80 (96.13 %)	88,858 (3.88 %)	14,031 (100.00 %)	3,726,252 (26.48 %)	746,953 (1.83 %)	14,066,368 (30.30 %)	30,191 (0.63 %)
18	Alvarez's mastiff bat (A012 2023) GCA_031001765.1	n/a	19,086 (1.55 %)	22,040 (1.52 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	1,182 (0.01 %)	1,369 (99.99 %)	3,846,728 (31.78 %)	639,852 (2.90 %)	11,937,936 (38.98 %)	75,377 (2.21 %)
19	Alvarez's mastiff bat (hap1 2024) GCA_037157525.1	n/a	18,980 (1.50 %)	22,394 (1.50 %)	n/a	42.30 (100.00 %)	80 (0.00 %)	326 (100.00 %)	3,896,863 (31.56 %)	659,711 (4.74 %)	11,945,162 (40.81 %)	76,769 (2.57 %)
20	Alvarez's mastiff bat (hap2 2024) GCA_037176705.1	n/a	19,066 (1.48 %)	22,356 (1.48 %)	n/a	42.25 (100.00 %)	75 (0.00 %)	287 (100.00 %)	3,908,607 (31.48 %)	664,931 (5.23 %)	11,892,191 (41.08 %)	76,453 (2.43 %)
21	Amazon manatee (hap1 2025) GCA_046562985.1	n/a	17,917 (1.26 %)	20,499 (1.11 %)	n/a	40.77 (100.00 %)	377 (0.00 %)	550 (100.00 %)	5,812,915 (56.93 %)	431,488 (2.57 %)	14,336,638 (47.98 %)	33,775 (0.84 %)
22	Amazon manatee (hap2 2025) GCA_046562895.1	n/a	18,949 (1.23 %)	21,655 (1.08 %)	n/a	40.80 (100.00 %)	294 (0.00 %)	401 (100.00 %)	6,218,266 (57.31 %)	470,437 (3.04 %)	15,241,157 (48.91 %)	37,124 (0.86 %)
23	American beaver (hap1 2025) GCA_047511655.1	n/a	19,828 (1.45 %)	20,376 (1.31 %)	n/a	39.72 (100.00 %)	181 (0.00 %)	503 (100.00 %)	4,030,880 (35.35 %)	566,770 (2.63 %)	14,198,970 (35.24 %)	24,454 (0.96 %)
24	American beaver (hap2 2025) GCA_047511605.1	n/a	19,144 (1.44 %)	18,959 (1.23 %)	n/a	39.54 (100.00 %)	194 (0.00 %)	229 (100.00 %)	3,981,637 (35.85 %)	561,691 (2.26 %)	14,374,940 (35.03 %)	23,386 (0.80 %)
25	American beaver (mCasCan1.hap1v2 2025) GCF_047511655.1	79,343 (3.55 %)	19,759 (1.46 %)	19,920 (1.23 %)	n/a	39.67 (100.00 %)	181 (0.00 %)	181 (100.00 %)	4,023,733 (35.50 %)	563,158 (2.55 %)	14,502,226 (35.45 %)	23,983 (0.89 %)
26	American beaver (Ward 2017 refseq) GCF_001984765.1	40,013 (2.15 %)	20,867 (1.53 %)	24,201 (1.33 %)	n/a	39.72 (99.99 %)	3,321 (0.01 %)	21,157 (100.00 %)	4,526,430 (33.75 %)	486,353 (1.30 %)	14,347,145 (31.96 %)	23,046 (0.72 %)
27	American bison (2014 refseq) GCF_000754665.1	38,699 (2.34 %)	19,782 (1.47 %)	20,444 (1.25 %)	n/a	41.82 (93.12 %)	341,984 (6.92 %)	470,415 (93.08 %)	n/a	419,596 (0.95 %)	13,519,877 (37.66 %)	60,388 (1.03 %)
28	American black bear (L20-20 alternate hap 2022) GCA_024610745.1	n/a	22,502 (1.17 %)	43,431 (1.28 %)	n/a	43.14 (99.99 %)	n/a	77,311 (100.00 %)	4,587,986 (32.30 %)	773,829 (6.39 %)	14,594,034 (35.67 %)	78,849 (3.32 %)
29	American black bear (L20-20 primary hap 2022) GCA_024610735.1	n/a	18,458 (1.52 %)	21,049 (1.43 %)	n/a	42.93 (100.00 %)	22 (0.00 %)	317 (100.00 %)	4,000,508 (32.69 %)	641,903 (5.91 %)	13,210,530 (35.54 %)	68,981 (3.00 %)
30	American black bear (UA15103 2021) GCF_020975775.1	53,916 (3.11 %)	18,840 (1.73 %)	20,969 (1.50 %)	n/a	42.09 (100.00 %)	n/a	2,213 (100.00 %)	3,936,528 (34.53 %)	594,864 (2.90 %)	13,725,005 (32.35 %)	62,580 (1.91 %)
31	American mink (2018) GCA_900108605.1	n/a	18,686 (1.70 %)	20,016 (1.50 %)	36,997 (1.74 %)	41.60 (92.95 %)	154,172 (7.07 %)	161,347 (92.93 %)	4,350,343 (38.70 %)	606,128 (1.17 %)	13,605,797 (28.74 %)	54,199 (1.98 %)
32	American mink (hap1 2024) GCA_964106545.1	n/a	19,203 (1.43 %)	22,174 (1.33 %)	n/a	42.39 (99.98 %)	2,957 (0.02 %)	435 (100.00 %)	4,188,829 (30.04 %)	802,295 (5.81 %)	14,041,290 (37.98 %)	65,430 (2.64 %)
33	American mink (hap2 2024) GCA_964106205.1	n/a	18,890 (1.43 %)	21,684 (1.33 %)	n/a	42.35 (99.98 %)	2,849 (0.02 %)	3,200 (99.98 %)	4,158,563 (30.22 %)	786,430 (5.25 %)	13,845,377 (37.58 %)	64,307 (2.75 %)
34	American mink (M4711 2021 Dalhousie U) GCF_020171115.1	50,253 (2.26 %)	18,949 (1.49 %)	20,914 (1.29 %)	n/a	42.26 (100.00 %)	n/a	183 (100.00 %)	4,705,680 (39.15 %)	795,684 (5.50 %)	14,085,357 (37.99 %)	63,307 (2.38 %)
35	American pika (hap1 2023) GCF_030435755.1	45,008 (1.93 %)	17,997 (1.35 %)	23,185 (1.49 %)	n/a	44.16 (100.00 %)	432 (0.00 %)	5,864 (100.00 %)	4,126,248 (43.60 %)	628,344 (15.71 %)	11,100,962 (42.69 %)	60,350 (1.67 %)
36	American pika (hap2 2023) GCA_030435715.1	n/a	16,911 (1.23 %)	21,107 (1.43 %)	n/a	44.43 (100.00 %)	375 (0.00 %)	6,123 (100.00 %)	1,808,768 (10.42 %)	561,106 (21.05 %)	10,283,513 (45.97 %)	54,919 (1.33 %)
37	American pika 3.0 (2012 Broad refseq) GCF_000292845.1	26,240 (1.93 %)	17,576 (1.61 %)	20,076 (1.70 %)	n/a	43.35 (87.20 %)	122,542 (12.82 %)	132,962 (87.18 %)	2,761,257 (29.47 %)	414,896 (1.07 %)	10,968,698 (26.71 %)	44,652 (1.14 %)
38	American pika 4.0 (UAM:Mamm:113957 2020) GCF_014633375.1	31,887 (1.92 %)	17,532 (1.60 %)	19,609 (1.65 %)	n/a	43.35 (87.14 %)	124,941 (12.88 %)	9,351 (100.00 %)	2,827,662 (29.77 %)	414,980 (1.07 %)	10,969,165 (26.69 %)	44,743 (1.13 %)
39	American wolverine (FN33715 2022) GCA_024509225.1	n/a	18,360 (1.57 %)	20,615 (1.47 %)	n/a	41.70 (100.00 %)	53 (0.00 %)	758 (100.00 %)	4,038,995 (32.25 %)	664,825 (1.25 %)	13,625,080 (33.05 %)	56,595 (2.13 %)
40	Amur tiger (TaeGuk 2013 refseq) GCF_000464555.1	33,681 (2.23 %)	17,929 (1.49 %)	15,090 (1.29 %)	n/a	41.40 (97.59 %)	155,553 (2.44 %)	157,032 (97.56 %)	n/a	831,136 (1.67 %)	13,654,437 (31.78 %)	65,229 (1.60 %)
41	Angolan free-tailed bat (Cote d'Ivoire 20210831_DDa 2024) GCA_043748645.1	n/a	18,528 (1.65 %)	22,359 (1.64 %)	n/a	42.89 (100.00 %)	88 (0.00 %)	44 (100.00 %)	3,531,044 (35.70 %)	555,304 (2.07 %)	11,439,853 (36.03 %)	102,112 (3.75 %)
42	Angus cow (Angus x Brahman F1 Angus haplotype 2018) GCA_003369685.2	n/a	19,096 (1.59 %)	20,674 (1.34 %)	n/a	41.99 (99.75 %)	277 (0.25 %)	1,435 (100.00 %)	5,290,422 (47.51 %)	478,946 (1.94 %)	12,568,313 (41.15 %)	45,850 (1.37 %)
43	Antarctic minke whale GCA_000978805.1	n/a	23,312 (1.49 %)	45,535 (1.26 %)	n/a	40.73 (99.37 %)	299,456 (0.64 %)	720,900 (99.36 %)	4,011,313 (41.13 %)	504,837 (1.04 %)	13,553,641 (30.96 %)	56,223 (1.31 %)
44	Antillean ghost-faced bat GCA_004026545.1	n/a	20,088 (1.74 %)	31,558 (1.63 %)	n/a	41.74 (99.97 %)	1,835 (0.01 %)	207,094 (99.99 %)	3,025,044 (30.67 %)	332,606 (0.70 %)	12,504,556 (28.79 %)	65,503 (2.30 %)
45	aoudad GCA_002201775.1	n/a	19,905 (1.62 %)	27,488 (1.60 %)	n/a	42.01 (95.96 %)	186,672 (4.05 %)	263,992 (95.95 %)	5,418,013 (45.05 %)	471,426 (1.19 %)	13,396,252 (36.94 %)	48,844 (1.32 %)
46	Arabian camel (Drom800 2019 refseq) GCF_000803125.2	64,532 (3.85 %)	18,483 (1.89 %)	20,554 (1.62 %)	n/a	41.51 (99.22 %)	47,342 (0.79 %)	21,070 (100.00 %)	3,233,022 (34.07 %)	345,049 (1.55 %)	13,383,050 (26.19 %)	58,872 (1.79 %)
47	Arabian camel (hap2 2024) GCA_036321565.1	n/a	17,085 (1.73 %)	19,317 (1.59 %)	n/a	41.75 (100.00 %)	210 (0.00 %)	173 (100.00 %)	2,818,446 (29.44 %)	316,646 (8.90 %)	11,192,133 (31.47 %)	52,135 (1.67 %)
48	Arabian camel (paternal hap 2024 genbank) GCA_036321535.1	n/a	18,080 (1.66 %)	20,345 (1.52 %)	n/a	41.64 (100.00 %)	195 (0.00 %)	172 (100.00 %)	3,040,473 (29.22 %)	343,482 (10.93 %)	11,797,012 (33.50 %)	55,428 (1.61 %)
49	Arabian camel (paternal hap 2024 refseq) GCF_036321535.1	62,940 (3.46 %)	18,078 (1.66 %)	21,071 (1.56 %)	n/a	41.64 (100.00 %)	195 (0.00 %)	171 (100.00 %)	3,040,467 (29.22 %)	343,480 (10.93 %)	11,796,955 (33.50 %)	55,427 (1.61 %)
50	Arctic fox (Blue_001 2021 refseq) GCF_018345385.1	60,759 (3.11 %)	19,942 (1.72 %)	19,529 (1.38 %)	n/a	41.27 (100.00 %)	529 (0.00 %)	929 (100.00 %)	4,821,229 (41.22 %)	1,006,124 (2.31 %)	13,556,149 (32.92 %)	49,997 (2.23 %)
51	Arctic ground squirrel (AGS 11-09-20 2018) GCF_003426925.1	39,569 (2.25 %)	18,954 (1.74 %)	19,372 (1.45 %)	n/a	39.95 (89.51 %)	2,429,461 (10.59 %)	15,883 (100.00 %)	4,400,304 (32.67 %)	672,831 (1.50 %)	13,913,477 (26.41 %)	27,575 (0.72 %)
52	Arctic ground squirrel (hap1 2024) GCA_045843805.1	n/a	20,255 (1.35 %)	21,401 (1.44 %)	n/a	40.08 (100.00 %)	694 (0.00 %)	2,530 (100.00 %)	4,287,108 (25.85 %)	895,123 (5.96 %)	15,722,314 (36.45 %)	34,781 (0.82 %)
53	Arctic ground squirrel (hap2 2024) GCA_045843765.1	n/a	18,385 (1.31 %)	19,099 (1.34 %)	n/a	39.97 (100.00 %)	590 (0.00 %)	2,307 (100.00 %)	4,314,945 (35.63 %)	820,736 (6.65 %)	14,490,422 (35.95 %)	31,201 (0.78 %)
54	Asian palm civet GCA_004024585.1	n/a	22,124 (1.43 %)	43,710 (1.39 %)	n/a	42.52 (99.95 %)	4,533 (0.02 %)	442,658 (99.98 %)	4,877,367 (40.32 %)	754,440 (1.35 %)	14,557,779 (32.29 %)	148,246 (5.67 %)
55	Asiatic elephant (mEleMax1 alternate hap 2022) GCA_024166345.1	n/a	17,906 (1.18 %)	21,966 (1.14 %)	n/a	41.14 (100.00 %)	n/a	6,361 (100.00 %)	3,818,524 (29.72 %)	533,426 (3.22 %)	14,381,781 (47.30 %)	50,264 (1.15 %)
56	Asiatic elephant (mEleMax1 primary hap 2022) GCF_024166365.1	61,202 (2.60 %)	18,887 (1.13 %)	21,194 (1.06 %)	n/a	41.14 (99.90 %)	126 (0.10 %)	64 (100.00 %)	4,358,470 (31.27 %)	663,094 (4.56 %)	16,261,778 (48.66 %)	69,120 (1.32 %)
57	Asiatic mouflon (Amuf_v1 2020) GCA_014523465.1	n/a	19,569 (1.59 %)	21,293 (1.35 %)	n/a	41.97 (99.68 %)	257 (0.32 %)	128 (100.00 %)	5,390,761 (47.15 %)	451,837 (1.15 %)	13,157,608 (40.67 %)	44,158 (1.19 %)
58	Asiatic tapir (hap1 2023) GCA_031878655.1	n/a	18,969 (1.75 %)	20,207 (1.36 %)	n/a	41.25 (100.00 %)	79 (0.00 %)	262 (100.00 %)	3,650,963 (38.06 %)	355,322 (2.63 %)	14,837,952 (31.37 %)	37,174 (1.87 %)
59	Asiatic tapir (hap2 2023) GCA_031878705.1	n/a	18,931 (1.76 %)	19,988 (1.37 %)	n/a	41.16 (100.00 %)	92 (0.00 %)	193 (100.00 %)	3,632,286 (38.21 %)	350,074 (2.22 %)	14,785,531 (30.90 %)	36,699 (1.70 %)
60	ass (Dezhou 2021) GCF_016077325.2	84,046 (4.01 %)	18,838 (1.75 %)	20,239 (1.42 %)	69,689 (3.29 %)	41.42 (99.86 %)	1,922 (0.15 %)	50 (100.00 %)	3,840,509 (41.57 %)	319,943 (0.81 %)	14,889,114 (29.46 %)	41,082 (1.37 %)
61	ass (Donkey D_3611 2024) GCF_041296235.1	92,510 (3.84 %)	18,566 (1.54 %)	21,504 (1.32 %)	n/a	42.37 (99.94 %)	7 (0.06 %)	849 (100.00 %)	3,555,052 (38.38 %)	658,645 (5.79 %)	14,242,715 (36.79 %)	43,875 (3.45 %)
62	ass (Maral har 2015 refseq) GCF_001305755.1	48,976 (3.12 %)	18,838 (1.78 %)	19,295 (1.44 %)	n/a	41.28 (98.63 %)	69,593 (1.38 %)	2,167 (100.00 %)	3,731,432 (40.84 %)	289,737 (0.96 %)	14,695,308 (28.58 %)	40,025 (1.06 %)
63	Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap1.1 2024) GCA_964270905.1	n/a	18,773 (1.50 %)	21,069 (1.29 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	1,034 (0.01 %)	900 (100.00 %)	3,975,427 (35.64 %)	1,054,000 (10.27 %)	12,281,095 (41.92 %)	79,762 (4.08 %)
64	Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap2.1 2024) GCA_964270935.1	n/a	17,961 (1.59 %)	20,087 (1.36 %)	n/a	42.05 (99.99 %)	917 (0.01 %)	1,796 (99.99 %)	3,626,392 (35.51 %)	824,778 (7.32 %)	11,499,904 (39.18 %)	74,348 (3.46 %)
65	Australian echidna (mTacAcu1 alternate hap 2020) GCA_015852515.1	n/a	13,505 (1.03 %)	18,978 (1.47 %)	n/a	45.32 (99.98 %)	26 (0.02 %)	3,482 (100.00 %)	6,880,857 (41.88 %)	1,099,932 (7.47 %)	8,156,735 (56.68 %)	70,515 (2.88 %)
66	Australian echidna (mTacAcu1 primary hap 2020) GCF_015852505.1	42,938 (2.28 %)	14,891 (1.01 %)	19,714 (1.45 %)	n/a	45.30 (98.61 %)	524 (1.39 %)	310 (100.00 %)	7,814,876 (42.89 %)	1,219,764 (6.93 %)	9,488,325 (55.68 %)	78,364 (2.73 %)
67	Bactrian camel (Alxa 2014 refseq) GCF_000767855.1	52,191 (3.64 %)	18,303 (1.98 %)	17,097 (1.64 %)	n/a	41.32 (99.32 %)	31,980 (0.69 %)	67,435 (99.31 %)	2,966,704 (34.06 %)	306,997 (0.95 %)	12,209,949 (25.43 %)	49,790 (1.25 %)
68	Bactrian camel YW-2024 2025 GCF_048773025.1	76,927 (4.47 %)	18,239 (1.57 %)	22,111 (1.51 %)	n/a	41.95 (100.00 %)	127 (0.00 %)	158 (100.00 %)	3,258,307 (30.21 %)	377,352 (13.70 %)	11,533,205 (36.22 %)	65,887 (1.95 %)
69	banded mongoose GCA_004023785.1	n/a	21,568 (1.57 %)	30,427 (1.43 %)	n/a	42.00 (99.96 %)	4,510 (0.02 %)	316,874 (99.98 %)	4,768,524 (40.51 %)	684,187 (1.30 %)	13,713,756 (33.42 %)	78,648 (2.80 %)
70	bank vole GCF_902806735.1	56,423 (2.99 %)	18,977 (1.71 %)	18,408 (1.50 %)	n/a	41.86 (98.62 %)	53,506 (1.39 %)	54,142 (98.61 %)	3,222,366 (21.59 %)	933,697 (2.20 %)	12,831,232 (31.50 %)	18,784 (0.42 %)
71	banner-tailed kangaroo rat GCF_019054845.1	43,753 (1.82 %)	18,397 (1.18 %)	24,180 (1.39 %)	n/a	40.83 (100.00 %)	n/a	2,026 (100.00 %)	5,587,719 (30.97 %)	1,363,513 (3.95 %)	12,128,920 (48.74 %)	36,371 (1.27 %)
72	banteng 2023 GCF_032452875.1	71,974 (3.56 %)	19,305 (1.36 %)	21,174 (1.20 %)	n/a	42.79 (100.00 %)	84 (0.00 %)	1,518 (100.00 %)	3,344,481 (20.63 %)	1,039,571 (11.74 %)	13,031,356 (47.36 %)	73,031 (1.72 %)
73	bat A.intermedius (hap2 2024) GCA_038363225.1	n/a	17,124 (1.63 %)	18,342 (1.54 %)	n/a	42.25 (100.00 %)	56 (0.00 %)	187 (100.00 %)	2,597,378 (26.81 %)	332,733 (4.43 %)	10,957,327 (33.52 %)	63,688 (2.22 %)
74	bat H.larvatus (China 20210929_DDb primary hap 2024) GCA_043727955.1	n/a	19,354 (1.74 %)	21,367 (1.51 %)	n/a	41.48 (100.00 %)	190 (0.00 %)	265 (100.00 %)	3,860,506 (38.95 %)	722,335 (7.13 %)	11,994,816 (35.77 %)	44,562 (1.21 %)
75	beluga whale (Cook Inlet, Alaska, USA DL-CIB17-05 2020) GCA_009917745.1	n/a	19,239 (1.79 %)	22,513 (1.43 %)	35,878 (1.82 %)	41.25 (97.57 %)	27,070 (2.43 %)	52,780 (97.57 %)	4,021,599 (43.53 %)	544,323 (1.08 %)	12,738,162 (33.47 %)	59,710 (1.51 %)
76	beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v3 2019) GCF_002288925.2	59,413 (3.09 %)	18,667 (1.79 %)	20,314 (1.43 %)	n/a	41.24 (98.49 %)	24,414 (1.52 %)	29,444 (98.48 %)	4,001,248 (43.73 %)	543,276 (1.11 %)	12,802,735 (34.18 %)	59,307 (1.53 %)
77	big brown bat (BU_THK_EF1 2012) GCF_000308155.1	59,162 (3.17 %)	18,334 (1.94 %)	20,121 (1.78 %)	n/a	42.93 (89.41 %)	160,269 (10.62 %)	167,057 (89.38 %)	2,842,065 (25.82 %)	614,712 (1.89 %)	10,407,733 (28.90 %)	66,720 (2.99 %)
78	big brown bat (TK198812 2023) GCF_027574615.1	46,266 (2.61 %)	18,620 (1.80 %)	21,271 (1.72 %)	n/a	43.51 (100.00 %)	75 (0.00 %)	48 (100.00 %)	3,041,145 (25.08 %)	904,075 (3.80 %)	10,530,666 (37.05 %)	77,605 (3.68 %)
79	bighorn sheep (BS48 2019) GCA_004026945.1	n/a	23,059 (1.34 %)	36,486 (1.19 %)	n/a	43.20 (99.90 %)	9,412 (0.03 %)	1,057,548 (99.97 %)	6,321,577 (50.75 %)	716,846 (1.66 %)	13,904,326 (44.98 %)	95,564 (1.72 %)
80	bighorn sheep (v2 Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024) GCF_042477335.2	78,636 (2.63 %)	19,459 (1.36 %)	21,150 (1.33 %)	n/a	43.91 (100.00 %)	3 (0.00 %)	42 (100.00 %)	3,963,383 (22.89 %)	826,353 (11.67 %)	12,918,743 (46.86 %)	52,254 (10.67 %)
81	bilby (mMagLag1 2024) GCA_037893015.1	n/a	18,686 (0.72 %)	17,238 (0.81 %)	n/a	37.35 (99.66 %)	4,431 (0.34 %)	609 (100.00 %)	6,263,094 (27.34 %)	2,223,995 (5.89 %)	23,994,844 (43.69 %)	51,039 (3.47 %)
82	bilby (mMagLag1 2024) GCF_037893015.1	60,460 (3.10 %)	18,687 (0.72 %)	17,229 (0.81 %)	n/a	37.35 (99.66 %)	4,431 (0.34 %)	608 (100.00 %)	6,299,949 (27.49 %)	2,223,987 (5.89 %)	23,992,536 (43.69 %)	51,039 (3.47 %)
83	black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap1 2024) GCA_043290085.1	n/a	20,713 (0.64 %)	21,469 (0.64 %)	n/a	41.74 (100.00 %)	770 (0.00 %)	470 (100.00 %)	3,860,121 (14.52 %)	1,230,113 (2.81 %)	21,600,460 (65.53 %)	49,878 (0.73 %)
84	black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap2 2024) GCA_043290065.1	n/a	19,814 (0.63 %)	20,140 (0.63 %)	n/a	41.82 (100.00 %)	723 (0.00 %)	315 (100.00 %)	3,657,357 (14.24 %)	1,158,716 (2.84 %)	22,924,986 (64.53 %)	46,774 (0.90 %)
85	black flying fox GCF_000325575.1	46,991 (3.15 %)	18,089 (2.00 %)	20,668 (1.75 %)	n/a	39.74 (97.93 %)	104,566 (2.08 %)	170,164 (97.92 %)	2,975,186 (34.05 %)	481,859 (1.45 %)	12,582,349 (26.52 %)	62,483 (3.88 %)
86	black rat GCF_011064425.1	39,601 (2.37 %)	20,793 (1.98 %)	17,944 (1.37 %)	n/a	42.14 (99.98 %)	6,158 (0.02 %)	2,173 (100.00 %)	4,715,157 (41.57 %)	1,432,294 (3.45 %)	13,275,550 (32.36 %)	18,055 (0.48 %)
87	black rhinoceros (alternate hap 2021) GCA_020826835.1	n/a	19,000 (1.37 %)	22,547 (1.26 %)	n/a	41.56 (99.97 %)	178 (0.03 %)	1,199 (100.00 %)	4,340,245 (37.22 %)	564,468 (8.07 %)	14,384,523 (40.40 %)	44,971 (1.16 %)
88	black rhinoceros (BS38 2019 Broad) GCA_004027315.1	n/a	21,713 (1.32 %)	32,731 (1.18 %)	n/a	41.22 (99.85 %)	7,256 (0.02 %)	2,029,914 (99.98 %)	4,618,655 (36.76 %)	618,834 (2.21 %)	16,248,532 (40.32 %)	44,113 (0.97 %)
89	black rhinoceros (primary hap 2021 refseq) GCF_020826845.1	56,268 (2.28 %)	18,774 (1.38 %)	22,348 (1.26 %)	n/a	41.59 (99.95 %)	215 (0.05 %)	1,076 (100.00 %)	4,200,390 (36.22 %)	548,030 (8.34 %)	14,347,693 (40.14 %)	43,525 (1.14 %)
90	black-footed cat GCA_004023925.1	n/a	22,895 (1.14 %)	51,789 (1.13 %)	n/a	41.92 (99.90 %)	13,476 (0.06 %)	603,600 (99.94 %)	5,261,265 (44.11 %)	943,514 (1.77 %)	13,681,435 (34.77 %)	86,892 (2.23 %)
91	black-footed ferret (SB6536 2022) GCF_022355385.1	56,415 (2.78 %)	18,681 (1.55 %)	20,685 (1.40 %)	n/a	41.55 (96.71 %)	33,042 (3.30 %)	20,575 (100.00 %)	4,087,717 (30.94 %)	695,805 (1.18 %)	13,880,116 (32.08 %)	54,060 (2.11 %)
92	black-lipped pika GCF_017591425.1	46,297 (2.64 %)	18,529 (1.63 %)	23,458 (1.83 %)	n/a	43.71 (100.00 %)	54 (0.00 %)	2,214 (100.00 %)	1,843,705 (12.62 %)	471,798 (2.76 %)	11,394,992 (31.27 %)	63,124 (1.85 %)
93	Blainville's beaked whale (alternate hap 2022) GCA_025094165.1	n/a	17,838 (1.54 %)	21,389 (1.35 %)	n/a	41.71 (100.00 %)	1 (0.00 %)	5,198 (100.00 %)	3,542,727 (35.35 %)	650,369 (8.86 %)	10,971,320 (41.15 %)	62,389 (1.68 %)
94	Blainville's beaked whale (primary hap 2022 refseq) GCF_025265405.1	47,553 (2.07 %)	19,041 (1.52 %)	20,766 (1.27 %)	n/a	41.70 (99.97 %)	97 (0.03 %)	74 (100.00 %)	3,964,038 (35.29 %)	765,957 (8.74 %)	12,128,229 (41.78 %)	70,851 (1.80 %)
95	blue whale (alternate hap JJ_BM4_2016_0621 2019) GCA_008658375.1	n/a	17,285 (1.80 %)	21,295 (1.43 %)	n/a	41.22 (100.00 %)	n/a	12,574 (100.00 %)	3,196,354 (43.47 %)	467,194 (1.26 %)	10,176,588 (33.66 %)	56,916 (1.85 %)
96	Blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 alternate hap 2020) GCA_008658375.2	n/a	16,997 (1.82 %)	20,609 (1.44 %)	n/a	41.20 (100.00 %)	3 (0.00 %)	10,999 (100.00 %)	3,126,800 (43.49 %)	454,452 (1.23 %)	9,916,868 (33.63 %)	55,436 (1.85 %)
97	blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v3 primary hap 2020) GCF_009873245.2	58,737 (2.71 %)	19,162 (1.80 %)	20,576 (1.41 %)	36,291 (1.99 %)	40.88 (98.91 %)	886 (1.09 %)	106 (100.00 %)	3,986,870 (44.21 %)	579,629 (1.22 %)	12,858,384 (34.60 %)	67,032 (1.73 %)
98	bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 alternate hap 2022) GCA_022079275.1	n/a	24,877 (1.23 %)	48,382 (1.39 %)	n/a	42.05 (99.98 %)	4,716 (0.01 %)	72,827 (99.99 %)	6,403,412 (33.31 %)	1,269,531 (1.94 %)	17,771,689 (33.82 %)	100,915 (3.00 %)
99	bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 primary hap 2022) GCF_022079265.1	45,417 (2.39 %)	18,576 (1.65 %)	20,510 (1.41 %)	n/a	41.80 (100.00 %)	24 (0.00 %)	75 (100.00 %)	4,970,082 (43.28 %)	894,002 (1.80 %)	13,648,384 (34.21 %)	69,211 (2.68 %)
100	boreal woodland reindeer (boreal CA-31 2023) GCA_019903745.2	n/a	20,135 (1.60 %)	22,598 (1.47 %)	n/a	41.46 (96.98 %)	34,682 (3.03 %)	12,266 (100.00 %)	3,134,107 (24.41 %)	394,920 (0.92 %)	13,154,929 (36.43 %)	48,826 (1.07 %)
101	Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 alternate hap 2022) GCA_024803775.1	n/a	18,647 (0.96 %)	23,998 (1.13 %)	n/a	41.67 (100.00 %)	124 (0.00 %)	3,340 (100.00 %)	3,775,862 (22.40 %)	1,257,803 (21.71 %)	9,347,543 (61.85 %)	33,757 (1.35 %)
102	Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 primary hap 2022) GCA_024803745.1	n/a	17,791 (1.12 %)	22,667 (1.29 %)	n/a	41.66 (100.00 %)	106 (0.00 %)	2,898 (100.00 %)	6,293,452 (41.30 %)	1,076,688 (17.94 %)	8,553,272 (57.13 %)	31,102 (1.31 %)
103	Botta's pocket gopher (hap1 2023) GCA_031878675.1	n/a	18,247 (1.61 %)	22,673 (1.83 %)	n/a	41.12 (99.99 %)	775 (0.01 %)	835 (100.00 %)	2,918,285 (18.64 %)	868,090 (5.77 %)	9,427,604 (40.78 %)	27,049 (1.25 %)
104	Botta's pocket gopher (hap2 2023) GCA_031878665.1	n/a	17,612 (1.68 %)	22,099 (1.91 %)	n/a	41.23 (99.99 %)	541 (0.01 %)	365 (100.00 %)	2,748,918 (17.16 %)	827,542 (4.51 %)	8,832,809 (39.20 %)	26,416 (1.35 %)
105	boutu (hap1 2024) GCA_036417435.1	n/a	18,667 (1.46 %)	20,817 (1.26 %)	n/a	42.07 (100.00 %)	284 (0.00 %)	903 (100.00 %)	4,004,895 (35.23 %)	925,158 (12.15 %)	11,999,784 (42.65 %)	63,428 (1.55 %)
106	boutu (hap2 2024) GCA_036417475.1	n/a	17,954 (1.51 %)	19,994 (1.30 %)	n/a	42.02 (100.00 %)	240 (0.00 %)	800 (100.00 %)	3,723,164 (34.96 %)	809,880 (11.02 %)	11,359,211 (41.42 %)	60,067 (1.55 %)
107	Brahman cow (Angus x Brahman F1 Brahman haplotype 2018) GCF_003369695.1	63,234 (2.88 %)	19,601 (1.57 %)	21,699 (1.34 %)	n/a	41.83 (99.94 %)	302 (0.06 %)	1,250 (100.00 %)	5,524,454 (47.57 %)	459,928 (1.40 %)	13,208,799 (41.21 %)	41,359 (1.10 %)
108	Brandt's bat GCF_000412655.1	46,912 (2.84 %)	19,267 (1.75 %)	18,495 (1.62 %)	n/a	42.59 (94.06 %)	155,664 (5.95 %)	325,414 (94.05 %)	2,897,662 (25.08 %)	634,208 (3.20 %)	11,323,618 (31.06 %)	66,749 (1.59 %)
109	Brazilian free-tailed bat (primary hap 2023) GCA_030848825.1	n/a	19,039 (1.66 %)	21,660 (1.59 %)	n/a	42.29 (100.00 %)	20 (0.00 %)	148 (100.00 %)	3,805,818 (31.80 %)	640,446 (2.50 %)	11,793,353 (36.15 %)	68,896 (2.40 %)
110	Brazilian guinea pig GCA_000688575.1	n/a	16,531 (1.49 %)	11,177 (1.44 %)	n/a	39.81 (64.76 %)	2,565,595 (35.61 %)	3,131 (100.00 %)	2,529,479 (25.87 %)	342,907 (0.66 %)	10,719,517 (21.05 %)	19,508 (0.31 %)
111	Brazilian tapir GCA_004025025.1	n/a	21,581 (1.61 %)	30,818 (1.32 %)	n/a	41.12 (99.93 %)	2,273 (0.01 %)	805,779 (99.99 %)	3,877,938 (38.36 %)	344,032 (0.79 %)	15,601,710 (32.81 %)	43,382 (1.17 %)
112	brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v2 2018) GCF_003584765.2	50,229 (2.92 %)	18,811 (1.77 %)	21,073 (1.52 %)	n/a	41.84 (99.31 %)	17,380 (0.70 %)	21,813 (99.30 %)	4,201,043 (40.86 %)	567,586 (1.23 %)	13,807,211 (30.86 %)	62,125 (1.80 %)
113	brown bear (v2.0 North America Adak 2023) GCF_023065955.2	66,371 (4.20 %)	18,615 (1.68 %)	21,434 (1.53 %)	n/a	42.29 (100.00 %)	250 (0.00 %)	362 (100.00 %)	4,030,019 (33.22 %)	630,008 (4.17 %)	13,240,060 (32.92 %)	64,814 (2.05 %)
114	brown big-eared bat (primary hap 2023) GCA_963455305.1	n/a	19,138 (1.72 %)	20,370 (1.54 %)	n/a	43.08 (99.99 %)	1,237 (0.01 %)	65 (100.00 %)	3,201,470 (26.24 %)	957,903 (4.27 %)	10,687,995 (39.65 %)	60,671 (2.39 %)
115	brown-throated sloth GCA_004027775.1	n/a	17,043 (1.21 %)	37,090 (1.36 %)	n/a	42.76 (99.76 %)	462 (0.00 %)	1,772,267 (100.00 %)	2,487,215 (36.18 %)	316,812 (1.60 %)	7,948,666 (37.96 %)	62,325 (2.36 %)
116	cactus mouse (2023) GCF_949786415.1	47,537 (2.02 %)	18,894 (1.46 %)	20,159 (1.22 %)	n/a	42.40 (99.98 %)	2,603 (0.02 %)	4,297 (100.00 %)	7,181,232 (52.75 %)	1,247,378 (18.35 %)	13,329,318 (43.03 %)	19,540 (0.49 %)
117	California mouse (IS 2022) GCF_007827085.1	62,273 (3.80 %)	18,959 (1.75 %)	19,378 (1.41 %)	n/a	42.21 (100.00 %)	547 (0.00 %)	237 (100.00 %)	5,970,582 (45.08 %)	1,165,743 (3.67 %)	13,734,349 (33.67 %)	19,529 (0.58 %)
118	California sea lion (alternate hap 2019) GCA_009762295.1	n/a	18,348 (1.81 %)	18,692 (1.47 %)	n/a	41.58 (100.00 %)	n/a	3,093 (100.00 %)	3,722,619 (42.89 %)	488,086 (1.26 %)	10,893,132 (33.14 %)	44,449 (1.57 %)
119	California sea lion (LMU 2018 refseq) GCF_900631625.1	69,240 (2.99 %)	20,741 (1.78 %)	20,298 (1.40 %)	n/a	41.38 (99.81 %)	47,716 (0.20 %)	10,423 (100.00 %)	4,530,259 (43.28 %)	573,086 (1.12 %)	13,442,336 (33.58 %)	50,583 (1.46 %)
120	California sea lion (mZalCal1 alternate hap 2020) GCA_009762295.2	n/a	18,319 (1.81 %)	18,772 (1.48 %)	n/a	41.58 (100.00 %)	n/a	3,096 (100.00 %)	3,724,021 (42.91 %)	488,356 (1.26 %)	10,891,276 (33.15 %)	44,467 (1.57 %)
121	California sea lion (v2 primary hap 2020) GCF_009762305.2	70,801 (3.05 %)	20,915 (1.77 %)	20,179 (1.40 %)	44,926 (2.10 %)	41.40 (99.23 %)	185 (0.77 %)	47 (100.00 %)	4,525,652 (43.65 %)	590,246 (1.24 %)	13,263,648 (33.76 %)	51,899 (1.50 %)
122	California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 alternate hap 2023) GCA_028537755.1	n/a	19,409 (1.86 %)	20,578 (1.69 %)	n/a	42.43 (100.00 %)	43 (0.00 %)	310 (100.00 %)	3,161,054 (22.60 %)	891,453 (5.62 %)	11,087,206 (33.12 %)	19,104 (0.65 %)
123	California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 primary hap 2023) GCA_028537955.1	n/a	19,681 (1.86 %)	21,257 (1.62 %)	n/a	42.24 (100.00 %)	51 (0.00 %)	350 (100.00 %)	4,957,057 (42.33 %)	943,226 (5.63 %)	11,695,871 (33.83 %)	20,062 (0.64 %)
124	Canada lynx (alternate hap LIC74 2019) GCA_007474575.1	n/a	12,029 (1.42 %)	15,171 (1.16 %)	n/a	41.46 (100.00 %)	3 (0.00 %)	15,036 (100.00 %)	2,937,491 (43.50 %)	544,410 (1.76 %)	7,641,565 (32.72 %)	39,082 (2.44 %)
125	Canada lynx (LIC74 v2 alternate hap 2020) GCA_007474575.2	n/a	12,041 (1.42 %)	15,226 (1.16 %)	n/a	41.46 (100.00 %)	5 (0.00 %)	15,046 (100.00 %)	2,939,291 (43.50 %)	544,849 (1.76 %)	7,650,345 (32.74 %)	39,099 (2.44 %)
126	Canada lynx (LIC74 v2 primary hap 2020) GCF_007474595.2	50,142 (2.69 %)	18,273 (1.65 %)	19,264 (1.35 %)	n/a	41.70 (99.88 %)	842 (0.12 %)	54 (100.00 %)	5,011,165 (43.72 %)	904,525 (1.75 %)	13,467,551 (34.19 %)	66,799 (2.48 %)
127	Cantor's roundleaf bat GCA_004027415.1	n/a	23,788 (1.42 %)	45,328 (1.68 %)	38,254 (1.57 %)	41.36 (99.91 %)	6,366 (0.03 %)	846,566 (99.97 %)	3,997,370 (31.48 %)	775,742 (1.42 %)	12,770,948 (33.45 %)	41,527 (1.41 %)
128	Cape elephant shrew GCF_000299155.1	25,406 (1.08 %)	23,258 (1.07 %)	24,266 (1.16 %)	n/a	40.30 (86.29 %)	279,394 (13.74 %)	288,162 (86.26 %)	3,765,232 (16.90 %)	604,351 (0.89 %)	20,072,078 (42.36 %)	25,977 (0.42 %)
129	Cape golden mole (2012 Broad) GCF_000296735.1	25,323 (1.07 %)	20,961 (1.07 %)	21,723 (1.04 %)	n/a	40.01 (79.93 %)	370,844 (20.11 %)	391,344 (79.89 %)	4,924,640 (21.03 %)	500,830 (1.95 %)	18,946,663 (41.18 %)	21,186 (0.33 %)
130	Cape rock hyrax (Dallas Zoo Isis #01D731 2014) GCA_000152225.2	n/a	18,455 (1.10 %)	22,103 (1.12 %)	n/a	41.00 (88.89 %)	259,879 (11.14 %)	325,568 (88.86 %)	6,210,235 (51.92 %)	381,915 (1.06 %)	20,080,212 (36.28 %)	29,690 (0.50 %)
131	Cape rock hyrax (US060 2019 Broad) GCA_004026925.1	n/a	21,401 (0.85 %)	45,353 (1.14 %)	n/a	41.08 (99.93 %)	4,203 (0.01 %)	1,048,940 (99.99 %)	7,222,494 (54.48 %)	430,286 (0.85 %)	21,775,991 (44.61 %)	37,158 (0.70 %)
132	capybara GCA_004027455.1	n/a	20,152 (1.22 %)	28,931 (1.29 %)	n/a	39.76 (99.93 %)	5,747 (0.02 %)	661,089 (99.98 %)	4,220,878 (29.16 %)	777,357 (2.04 %)	15,214,944 (35.16 %)	34,558 (0.85 %)
133	carabao (swamp buffalo K-KA32 2023) GCF_029407905.1	77,279 (2.89 %)	19,433 (1.40 %)	21,166 (1.23 %)	n/a	42.77 (100.00 %)	21 (0.00 %)	115 (100.00 %)	3,479,445 (21.92 %)	547,054 (6.39 %)	12,840,677 (45.22 %)	99,752 (3.73 %)
134	cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v2.0 2023 USDA) GCF_002263795.3	77,808 (4.11 %)	19,428 (1.48 %)	22,236 (1.33 %)	n/a	42.01 (100.00 %)	386 (0.00 %)	1,958 (100.00 %)	3,449,588 (22.63 %)	596,092 (3.13 %)	12,785,607 (42.11 %)	46,864 (1.37 %)
135	cattle (Hereford UMD_3.1.1 2014) GCF_000003055.6	57,977 (2.74 %)	19,583 (1.56 %)	20,581 (1.31 %)	n/a	41.82 (99.23 %)	74,464 (0.78 %)	75,598 (99.22 %)	5,607,556 (49.02 %)	440,521 (1.25 %)	13,167,657 (40.78 %)	42,869 (1.24 %)
136	Chacoan peccary (BS20 v2 2019 Broad) GCA_004024745.2	n/a	18,603 (1.52 %)	22,330 (1.36 %)	n/a	42.35 (98.12 %)	57,013 (1.80 %)	1,240,743 (98.20 %)	5,255,211 (43.27 %)	2,502,373 (4.37 %)	12,968,788 (40.96 %)	172,178 (3.66 %)
137	cheetah (Ajub_Pintada_27869175 2022) GCF_027475565.1	80,997 (4.53 %)	18,420 (1.70 %)	19,561 (1.40 %)	n/a	41.59 (100.00 %)	22 (0.00 %)	195 (100.00 %)	4,611,842 (35.10 %)	837,685 (1.68 %)	13,649,125 (33.06 %)	60,367 (2.22 %)
138	cheetah (Rico 2018) GCF_003709585.1	72,154 (3.33 %)	18,472 (1.70 %)	20,443 (1.42 %)	n/a	41.55 (99.55 %)	24,173 (0.45 %)	3,220 (100.00 %)	4,853,945 (42.85 %)	831,106 (1.53 %)	13,663,571 (32.84 %)	60,744 (2.17 %)
139	Chinese forest musk deer (Sichuan 2022) GCF_022376915.1	51,625 (2.80 %)	19,565 (1.43 %)	22,280 (1.29 %)	n/a	42.30 (99.97 %)	1,781 (0.03 %)	2,446 (100.00 %)	3,257,347 (21.65 %)	399,120 (3.81 %)	12,906,274 (43.79 %)	46,689 (1.12 %)
140	Chinese hamster (17A/GY CHO 2020) GCF_003668045.3	55,440 (2.79 %)	20,030 (1.84 %)	18,721 (1.41 %)	67,900 (3.41 %)	41.51 (99.90 %)	4,164 (0.10 %)	647 (100.00 %)	8,121,057 (33.74 %)	1,095,058 (2.91 %)	12,923,274 (32.25 %)	19,341 (0.58 %)
141	Chinese hamster (CHO v1 2011 BGI) GCF_000223135.1	46,006 (2.59 %)	20,602 (1.78 %)	17,467 (1.35 %)	n/a	41.37 (96.61 %)	156,635 (3.40 %)	265,787 (96.60 %)	4,541,936 (33.03 %)	1,072,129 (2.66 %)	13,150,189 (30.04 %)	12,522 (0.25 %)
142	Chinese hamster (CHO v2 2017 Eagle Genomics Ltd) GCA_900186095.1	n/a	19,874 (1.85 %)	19,298 (1.44 %)	n/a	41.45 (98.56 %)	63,334 (1.45 %)	71,598 (98.55 %)	4,521,726 (33.66 %)	1,060,619 (2.55 %)	12,867,288 (31.26 %)	17,960 (0.54 %)
143	Chinese hamster (CHO-K1 CHOZN v2.4 2022) GCA_026545065.1	n/a	20,293 (1.81 %)	18,881 (1.42 %)	n/a	41.62 (71.16 %)	924,541 (28.93 %)	1,236,122 (71.07 %)	4,330,728 (30.92 %)	987,319 (3.70 %)	13,374,062 (21.92 %)	18,838 (0.40 %)
144	Chinese pangolin (2020 Yunnan U) GCF_014570555.1	69,694 (3.21 %)	18,206 (1.70 %)	20,508 (1.48 %)	n/a	40.79 (95.54 %)	34,903 (4.47 %)	4,694 (100.00 %)	2,927,176 (35.60 %)	269,964 (0.67 %)	12,610,535 (29.10 %)	35,278 (1.05 %)
145	Chinese pangolin (hap1 2023) GCF_030020395.1	71,445 (2.98 %)	18,379 (1.34 %)	21,837 (1.29 %)	n/a	41.07 (99.77 %)	383 (0.23 %)	661 (100.00 %)	3,318,871 (34.65 %)	618,193 (3.68 %)	12,009,669 (39.02 %)	47,708 (1.22 %)
146	Chinese pangolin (hap2 mManPen7 2023) GCA_030020945.1	n/a	18,538 (1.34 %)	21,724 (1.27 %)	n/a	41.09 (99.48 %)	190 (0.52 %)	700 (100.00 %)	3,362,899 (34.48 %)	678,384 (4.11 %)	12,024,241 (39.52 %)	48,960 (1.19 %)
147	Chinese pangolin (MPE899 2014 WashU) GCA_000738955.1	n/a	18,749 (1.63 %)	22,506 (1.40 %)	n/a	40.93 (90.69 %)	257,424 (9.33 %)	230,927 (90.67 %)	2,691,116 (34.48 %)	316,518 (1.96 %)	11,538,086 (25.40 %)	30,693 (0.58 %)
148	Chinese rufous horseshoe bat GCA_001888835.1	n/a	26,871 (2.34 %)	25,467 (1.89 %)	n/a	40.52 (97.22 %)	212,601 (2.80 %)	63,439 (100.00 %)	3,219,611 (33.86 %)	495,126 (1.20 %)	12,476,551 (27.16 %)	32,993 (0.98 %)
149	Chinese rufous horseshoe bat (RSC01 2024) GCA_036562045.1	n/a	17,893 (1.95 %)	19,249 (1.60 %)	n/a	40.47 (100.00 %)	286 (0.00 %)	454 (100.00 %)	3,055,304 (33.11 %)	531,106 (1.34 %)	11,858,144 (29.52 %)	30,884 (1.08 %)
150	Chinese rufous horseshoe bat (RSC01 2024) GCF_036562045.2	67,162 (3.87 %)	17,890 (1.94 %)	19,248 (1.60 %)	n/a	40.47 (100.00 %)	286 (0.00 %)	454 (100.00 %)	3,325,750 (39.02 %)	531,106 (1.34 %)	11,858,028 (29.52 %)	30,884 (1.08 %)
151	Chinese tree shrew GCF_000334495.1	47,005 (2.07 %)	21,375 (1.39 %)	19,231 (1.28 %)	n/a	41.73 (95.10 %)	191,695 (4.92 %)	242,445 (95.08 %)	5,060,321 (23.05 %)	1,046,388 (4.15 %)	14,978,259 (38.04 %)	88,806 (1.44 %)
152	chiru GCA_000400835.1	n/a	20,320 (1.60 %)	42,654 (2.51 %)	n/a	42.01 (93.04 %)	283,069 (7.00 %)	298,127 (93.00 %)	5,342,241 (43.54 %)	425,329 (1.25 %)	13,714,420 (34.66 %)	43,135 (1.89 %)
153	clouded leopard (mNeoNeb1 alternate hap 2023) GCA_028018655.1	n/a	16,430 (1.52 %)	21,057 (1.44 %)	n/a	41.79 (100.00 %)	n/a	10,377 (100.00 %)	3,845,437 (33.39 %)	794,587 (2.14 %)	10,765,695 (33.40 %)	56,375 (2.45 %)
154	clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 refseq) GCF_028018385.1	81,219 (3.62 %)	18,300 (1.65 %)	20,361 (1.39 %)	n/a	41.79 (99.94 %)	181 (0.06 %)	33 (100.00 %)	4,224,269 (34.84 %)	992,668 (2.08 %)	13,618,866 (34.42 %)	67,830 (2.45 %)
155	common bottlenose dolphin (maternal 2020) GCA_011762535.1	n/a	18,837 (1.77 %)	20,857 (1.43 %)	n/a	41.43 (99.73 %)	649 (0.27 %)	985 (100.00 %)	4,073,893 (46.15 %)	630,039 (2.15 %)	12,628,219 (35.41 %)	65,379 (1.89 %)
156	common bottlenose dolphin (maternal Y refseq 2020) GCF_011762595.1	67,220 (3.31 %)	18,766 (1.77 %)	20,528 (1.42 %)	35,852 (1.58 %)	41.44 (99.74 %)	674 (0.26 %)	362 (100.00 %)	4,069,115 (46.17 %)	628,982 (2.12 %)	12,490,891 (35.29 %)	65,551 (1.90 %)
157	common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 refseq) GCF_001922835.1	45,975 (2.99 %)	17,255 (1.69 %)	17,058 (1.34 %)	n/a	40.85 (99.45 %)	114,003 (0.57 %)	2,648 (100.00 %)	3,845,938 (43.89 %)	514,631 (1.06 %)	12,317,098 (32.18 %)	48,030 (1.35 %)
158	common bottlenose dolphin (mTurTru1 2024) GCF_011762595.2	80,385 (4.33 %)	18,770 (1.77 %)	20,525 (1.42 %)	n/a	41.44 (99.74 %)	674 (0.26 %)	361 (100.00 %)	3,981,744 (44.78 %)	628,982 (2.12 %)	12,490,558 (35.29 %)	65,551 (1.90 %)
159	common bottlenose dolphin (paternal 2020) GCA_011762515.1	n/a	18,537 (1.77 %)	20,619 (1.44 %)	n/a	41.42 (98.08 %)	868 (1.92 %)	1,166 (100.00 %)	3,997,801 (45.93 %)	609,838 (1.85 %)	12,400,272 (34.53 %)	64,630 (1.84 %)
160	common brushtail (alternate hap 2020) GCA_011100645.1	n/a	14,863 (0.75 %)	15,426 (0.89 %)	n/a	39.41 (100.00 %)	313 (0.00 %)	12,446 (100.00 %)	5,846,769 (38.56 %)	987,917 (1.99 %)	16,764,356 (40.14 %)	13,303 (0.35 %)
161	common brushtail (refseq 2020) GCF_011100635.1	37,661 (1.80 %)	18,653 (0.80 %)	15,375 (0.86 %)	n/a	39.48 (99.44 %)	1,796 (0.56 %)	212 (100.00 %)	7,598,116 (38.90 %)	1,259,434 (1.97 %)	22,071,306 (40.56 %)	17,762 (0.38 %)
162	common pipistrelle (2020) GCA_903992545.1	n/a	17,216 (1.82 %)	19,202 (1.79 %)	n/a	42.55 (99.97 %)	1,546 (0.03 %)	323 (100.00 %)	2,953,532 (23.94 %)	805,142 (2.83 %)	9,964,846 (34.69 %)	57,295 (2.83 %)
163	common pipistrelle (alternate hap 2020) GCA_903992515.1	n/a	15,974 (1.72 %)	20,563 (1.66 %)	n/a	42.41 (100.00 %)	12 (0.00 %)	10,459 (100.00 %)	2,634,333 (23.76 %)	703,674 (2.65 %)	8,909,525 (33.95 %)	50,430 (2.54 %)
164	common pipistrelle (Broad 2019) GCA_004026625.1	n/a	21,938 (1.35 %)	53,915 (1.60 %)	n/a	42.88 (99.88 %)	10,870 (0.05 %)	736,974 (99.95 %)	3,499,501 (22.91 %)	1,046,301 (2.96 %)	11,759,516 (37.96 %)	92,062 (3.23 %)
165	common pipistrelle (hap1.1 2025) GCA_965203405.1	n/a	18,233 (1.77 %)	21,445 (1.80 %)	n/a	42.93 (99.98 %)	1,650 (0.02 %)	575 (100.00 %)	3,324,262 (26.83 %)	869,167 (7.44 %)	10,218,519 (37.91 %)	76,006 (3.29 %)
166	common pipistrelle (hap2.1 2025) GCA_965204225.1	n/a	18,115 (1.81 %)	21,233 (1.83 %)	n/a	42.89 (99.98 %)	1,602 (0.02 %)	1,971 (99.98 %)	3,303,323 (27.28 %)	852,756 (5.65 %)	10,047,424 (36.41 %)	69,105 (3.25 %)
167	common vampire bat (v2 HL8 alternate hap 2022 genbank) GCA_022682395.2	n/a	17,485 (1.76 %)	18,907 (1.66 %)	n/a	42.87 (99.99 %)	576 (0.01 %)	429 (100.00 %)	2,592,246 (28.20 %)	352,985 (2.87 %)	10,737,944 (31.11 %)	61,125 (2.28 %)
168	common vampire bat (v2 HL8 primary hap 2022 refseq) GCF_022682495.2	58,786 (3.38 %)	18,507 (1.82 %)	19,451 (1.59 %)	n/a	42.99 (99.99 %)	615 (0.01 %)	574 (100.00 %)	2,960,602 (36.90 %)	431,577 (3.90 %)	11,286,753 (32.62 %)	71,507 (2.50 %)
169	common vampire bat (v3 DRU21DN04 2018) GCF_002940915.2	51,044 (3.24 %)	18,503 (1.88 %)	18,071 (1.68 %)	n/a	42.15 (97.78 %)	54,246 (2.23 %)	83,364 (97.77 %)	2,799,509 (29.62 %)	275,242 (1.03 %)	11,796,826 (28.19 %)	51,634 (1.37 %)
170	common warthog (WHEZ1 2021) GCF_016906955.1	55,156 (2.64 %)	18,264 (1.56 %)	19,251 (1.34 %)	54,816 (2.83 %)	41.95 (99.61 %)	523 (0.39 %)	194 (100.00 %)	3,898,243 (30.33 %)	588,742 (1.17 %)	12,955,929 (36.44 %)	75,592 (1.86 %)
171	common wombat GCF_900497805.2	46,365 (1.78 %)	19,437 (0.86 %)	18,947 (0.96 %)	n/a	38.86 (99.68 %)	67,461 (0.33 %)	14,183 (100.00 %)	8,645,969 (41.99 %)	1,203,246 (1.61 %)	23,878,215 (39.11 %)	18,752 (0.37 %)
172	Corsac fox (zsh2022 2023) GCA_030463245.1	n/a	19,527 (1.61 %)	18,923 (1.35 %)	n/a	41.24 (100.00 %)	107 (0.00 %)	202 (100.00 %)	4,435,406 (32.05 %)	981,019 (1.98 %)	13,673,245 (32.65 %)	49,252 (2.20 %)
173	coyote (coyote_06102 2023) GCA_034620425.1	n/a	19,251 (1.60 %)	19,585 (1.40 %)	n/a	41.18 (100.00 %)	93 (0.00 %)	120 (100.00 %)	4,493,000 (32.28 %)	982,814 (2.01 %)	13,803,318 (33.09 %)	50,777 (2.23 %)
174	creeping vole GCF_018167655.1	54,941 (2.31 %)	23,033 (1.55 %)	25,427 (1.53 %)	n/a	44.23 (100.00 %)	n/a	2,147 (100.00 %)	4,549,519 (25.66 %)	1,153,429 (13.60 %)	13,568,297 (40.65 %)	23,141 (0.54 %)
175	crested porcupine GCA_004026905.1	n/a	21,005 (1.32 %)	35,975 (1.39 %)	n/a	41.51 (99.89 %)	4,351 (0.02 %)	1,140,949 (99.98 %)	4,303,147 (30.69 %)	600,488 (1.19 %)	14,049,490 (33.80 %)	57,196 (1.33 %)
176	Crete spiny mouse (2024) GCA_964271855.1	n/a	19,467 (1.76 %)	18,734 (1.43 %)	n/a	42.87 (100.00 %)	184 (0.00 %)	113 (100.00 %)	4,718,848 (32.83 %)	1,327,449 (6.80 %)	12,893,458 (34.03 %)	21,236 (0.61 %)
177	Cuvier's beaked whale GCA_004364475.1	n/a	23,700 (0.90 %)	51,715 (0.86 %)	n/a	42.01 (99.76 %)	3,229 (0.01 %)	3,761,505 (99.99 %)	6,544,424 (43.61 %)	1,417,186 (3.11 %)	16,127,873 (42.25 %)	68,668 (1.15 %)
178	cyclops roundleaf bat (Cote d'Ivoire 20210929_DDa primary hap 2024) GCA_043880285.1	n/a	18,610 (1.67 %)	19,098 (1.39 %)	n/a	41.56 (99.99 %)	334 (0.01 %)	73 (100.00 %)	4,077,286 (41.85 %)	754,689 (2.64 %)	11,873,386 (36.16 %)	48,137 (1.04 %)
179	Damara mole-rat DMR 1.0 (2014 BGI) GCF_000743615.1	52,373 (2.57 %)	17,983 (1.45 %)	17,063 (1.43 %)	n/a	40.34 (97.96 %)	87,815 (2.05 %)	162,545 (97.95 %)	4,053,433 (30.86 %)	545,281 (1.74 %)	13,406,483 (30.65 %)	37,008 (0.74 %)
180	Damara mole-rat DMR 1.0 HiC (2020 DNA Zoo) GCF_012274545.1	58,091 (2.74 %)	17,780 (1.44 %)	16,515 (1.42 %)	n/a	40.34 (97.94 %)	88,899 (2.07 %)	73,970 (100.00 %)	4,035,140 (30.95 %)	544,772 (1.73 %)	13,390,872 (30.61 %)	37,008 (0.74 %)
181	dassie-rat GCA_004026965.1	n/a	20,479 (1.16 %)	42,937 (1.41 %)	n/a	41.86 (99.89 %)	9,645 (0.04 %)	920,324 (99.96 %)	4,563,054 (28.83 %)	660,623 (1.92 %)	12,899,807 (34.48 %)	46,569 (1.25 %)
182	Daubenton's bat (alternate hap 2023) GCA_963242275.1	n/a	18,895 (1.78 %)	24,235 (1.81 %)	n/a	43.39 (100.00 %)	n/a	4,930 (100.00 %)	2,813,870 (23.75 %)	718,406 (5.18 %)	9,977,320 (37.24 %)	62,910 (2.66 %)
183	Daubenton's bat (primary hap 2023 refseq) GCF_963259705.1	64,558 (3.32 %)	19,141 (1.72 %)	22,133 (1.66 %)	n/a	43.18 (99.99 %)	1,099 (0.01 %)	121 (100.00 %)	3,040,232 (24.03 %)	796,911 (6.38 %)	10,478,180 (38.84 %)	64,920 (2.51 %)
184	Daurian ground squirrel GCA_002406435.1	n/a	20,990 (1.31 %)	17,575 (1.17 %)	n/a	39.77 (96.15 %)	141,850 (3.84 %)	502,654 (96.16 %)	5,783,538 (34.36 %)	924,038 (3.73 %)	17,533,301 (30.85 %)	27,955 (0.39 %)
185	David's myotis bat GCF_000327345.1	37,645 (2.70 %)	18,744 (1.78 %)	17,565 (1.62 %)	n/a	42.69 (91.23 %)	223,511 (8.80 %)	325,280 (91.20 %)	2,680,166 (23.79 %)	532,273 (1.90 %)	11,016,028 (29.55 %)	59,615 (1.59 %)
186	degu (3935 2012 refseq) GCF_000260255.1	48,165 (2.13 %)	22,242 (1.41 %)	22,101 (1.46 %)	n/a	41.38 (84.36 %)	252,772 (15.68 %)	259,904 (84.32 %)	4,901,673 (27.74 %)	898,945 (1.50 %)	14,282,003 (29.30 %)	40,135 (0.82 %)
187	desert hamster (2022) GCF_943737965.1	37,291 (2.11 %)	19,744 (1.74 %)	20,215 (1.50 %)	n/a	41.31 (100.00 %)	n/a	2,079 (100.00 %)	4,038,079 (31.01 %)	1,132,871 (2.71 %)	11,946,112 (32.62 %)	17,053 (0.51 %)
188	Desmarest's hutia GCA_004027915.1	n/a	23,535 (0.78 %)	50,796 (0.95 %)	n/a	42.03 (99.83 %)	3,492 (0.01 %)	2,355,850 (99.99 %)	5,790,506 (26.72 %)	1,062,134 (1.71 %)	16,977,224 (35.29 %)	54,479 (1.01 %)
189	dingo (2020 Alpine COOINDA U.NSW) GCF_012295265.1	102,060 (4.04 %)	19,777 (1.69 %)	20,341 (1.41 %)	n/a	41.29 (99.69 %)	325 (0.31 %)	477 (100.00 %)	4,950,808 (42.83 %)	1,033,921 (2.36 %)	13,745,703 (33.32 %)	51,835 (2.25 %)
190	dingo (Sandy 2020 James Cook U) GCF_003254725.2	104,332 (4.50 %)	19,710 (1.72 %)	19,857 (1.42 %)	n/a	41.24 (100.00 %)	69 (0.00 %)	159 (100.00 %)	4,547,906 (33.32 %)	993,474 (2.19 %)	13,701,060 (33.18 %)	51,216 (2.28 %)
191	dog (Basenji MU ID 185726 2019) GCA_004886185.2	n/a	19,889 (1.67 %)	20,501 (1.39 %)	n/a	41.36 (99.99 %)	1,388 (0.01 %)	3,630 (99.99 %)	4,950,227 (43.32 %)	1,059,639 (2.97 %)	13,694,849 (33.70 %)	51,443 (2.16 %)
192	dog (Basenji UNSW-BAS-2019 2021) GCA_013276365.2	n/a	19,310 (1.60 %)	19,947 (1.42 %)	n/a	41.21 (100.00 %)	149 (0.00 %)	631 (100.00 %)	4,452,916 (32.14 %)	960,590 (2.23 %)	13,685,353 (33.01 %)	50,715 (2.22 %)
193	dog (Bernese Mountain Dog BD 2023) GCA_031010765.1	n/a	19,211 (1.60 %)	20,327 (1.44 %)	n/a	41.20 (100.00 %)	641 (0.00 %)	175 (100.00 %)	4,471,016 (32.18 %)	984,776 (2.03 %)	13,719,474 (32.88 %)	51,050 (2.25 %)
194	dog (Bernese Mountain Dog OD 2023) GCA_031010635.1	n/a	19,279 (1.60 %)	20,348 (1.44 %)	n/a	41.21 (100.00 %)	1,015 (0.00 %)	159 (100.00 %)	4,491,081 (32.21 %)	996,142 (2.01 %)	13,761,195 (32.97 %)	51,490 (2.25 %)
195	dog (boxer Tasha 2011) GCF_000002285.3	82,536 (3.63 %)	19,772 (1.66 %)	19,565 (1.39 %)	n/a	41.31 (99.25 %)	23,876 (0.76 %)	27,106 (99.24 %)	4,918,098 (43.29 %)	991,835 (2.81 %)	13,644,959 (33.60 %)	53,269 (2.07 %)
196	dog (boxer Tasha 2020) GCF_000002285.5	93,761 (3.84 %)	19,392 (1.71 %)	19,572 (1.42 %)	52,141 (3.27 %)	41.26 (100.00 %)	1,028 (0.00 %)	147 (100.00 %)	23,927,903 (42.42 %)	972,851 (2.05 %)	13,611,845 (33.11 %)	50,679 (2.26 %)
197	dog (Cairn Terrier CA611 2023) GCA_031010295.1	n/a	19,255 (1.61 %)	20,479 (1.45 %)	n/a	41.19 (100.00 %)	262 (0.00 %)	141 (100.00 %)	4,490,019 (32.25 %)	989,383 (1.99 %)	13,710,808 (32.97 %)	50,883 (2.22 %)
198	dog (German shepard Mischka 2020) GCF_011100685.1	96,734 (3.71 %)	20,135 (1.64 %)	20,871 (1.38 %)	56,772 (3.19 %)	41.50 (100.00 %)	585 (0.00 %)	2,782 (100.00 %)	20,264,827 (43.87 %)	1,152,879 (3.22 %)	13,784,690 (34.30 %)	53,518 (2.23 %)
199	dog (German Shepherd Nala 2020) GCA_008641055.3	n/a	19,757 (1.69 %)	20,201 (1.41 %)	n/a	41.32 (99.74 %)	458 (0.26 %)	410 (100.00 %)	4,974,233 (43.03 %)	1,048,366 (2.46 %)	13,881,889 (33.61 %)	51,900 (2.21 %)
200	dog (Labrador retriever 2023) GCA_031165255.1	n/a	19,256 (1.61 %)	20,247 (1.44 %)	n/a	41.18 (100.00 %)	516 (0.00 %)	675 (100.00 %)	4,456,220 (32.19 %)	960,584 (1.96 %)	13,688,006 (32.82 %)	50,670 (2.21 %)
201	dog (labrador SID07034 2020) GCF_014441545.1	99,420 (3.87 %)	19,870 (1.70 %)	20,252 (1.41 %)	54,322 (3.23 %)	41.19 (99.47 %)	575 (0.53 %)	376 (100.00 %)	4,981,985 (42.28 %)	1,019,772 (1.97 %)	13,959,750 (32.77 %)	52,469 (2.25 %)
202	domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2017 WashU) GCF_000181335.3	72,076 (3.30 %)	18,662 (1.64 %)	20,897 (1.37 %)	n/a	41.73 (98.20 %)	436 (1.80 %)	5,079 (98.20 %)	5,086,462 (43.51 %)	964,126 (2.68 %)	13,947,871 (33.33 %)	69,701 (2.41 %)
203	domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021 WashU) GCA_000181335.5	n/a	18,378 (1.53 %)	21,242 (1.40 %)	n/a	41.73 (98.21 %)	422 (1.79 %)	5,010 (98.31 %)	4,683,703 (33.33 %)	964,129 (2.68 %)	13,948,305 (33.33 %)	69,725 (2.42 %)
204	domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021) GCA_000181335.6	n/a	18,357 (1.55 %)	20,085 (1.38 %)	n/a	41.76 (98.18 %)	422 (1.82 %)	1,254 (98.28 %)	4,661,997 (33.78 %)	947,221 (2.58 %)	13,867,949 (33.67 %)	68,011 (2.41 %)
205	domestic cat (Fca126 2021 Texas A&M U) GCF_018350175.1	99,222 (4.40 %)	18,456 (1.66 %)	19,833 (1.39 %)	94,133 (5.63 %)	41.81 (100.00 %)	39 (0.00 %)	102 (100.00 %)	4,965,571 (43.65 %)	932,424 (1.95 %)	13,596,808 (33.85 %)	67,329 (2.48 %)
206	domestic ferret (JIRA1106 JCVI 2020) GCF_011764305.1	68,868 (3.09 %)	19,019 (1.55 %)	21,812 (1.42 %)	n/a	41.90 (100.00 %)	n/a	1,224 (100.00 %)	4,650,028 (39.49 %)	745,115 (2.02 %)	13,758,447 (36.14 %)	58,684 (2.16 %)
207	domestic ferret (Sable 2011 Broad) GCA_000239315.1	n/a	18,778 (1.67 %)	19,571 (1.47 %)	n/a	41.48 (96.89 %)	72,670 (3.12 %)	76,914 (96.88 %)	4,491,876 (40.13 %)	618,556 (1.07 %)	13,721,938 (31.04 %)	54,600 (1.94 %)
208	domestic guinea pig (051 PalLab524CR 2023) GCF_034190915.1	79,333 (3.55 %)	17,999 (1.09 %)	21,509 (1.20 %)	n/a	40.64 (100.00 %)	84 (0.00 %)	672 (100.00 %)	5,037,431 (41.68 %)	886,785 (13.97 %)	14,620,284 (42.71 %)	39,682 (0.89 %)
209	domestic guinea pig (2N 2008 refseq) GCF_000151735.1	44,762 (2.31 %)	18,301 (1.33 %)	20,111 (1.34 %)	n/a	39.95 (97.81 %)	58,460 (2.20 %)	61,604 (97.80 %)	4,257,852 (38.85 %)	658,533 (1.25 %)	14,547,726 (34.19 %)	37,093 (0.85 %)
210	domestic yak (maiwa yakHY00 2019) GCA_005887515.3	n/a	18,672 (1.39 %)	19,408 (1.24 %)	n/a	41.97 (100.00 %)	646 (0.00 %)	343 (100.00 %)	3,570,978 (23.00 %)	583,762 (8.57 %)	14,055,227 (40.52 %)	43,883 (1.17 %)
211	dugong (hap1 mDugDug1 2023) GCA_030035585.1	n/a	18,354 (1.22 %)	20,434 (1.08 %)	n/a	40.65 (100.00 %)	96 (0.00 %)	198 (100.00 %)	4,458,084 (33.00 %)	444,499 (1.79 %)	15,031,940 (47.42 %)	29,863 (0.83 %)
212	dugong (hap2 mDugDug1 2023) GCA_030020955.1	n/a	18,538 (1.23 %)	20,775 (1.09 %)	n/a	40.64 (100.00 %)	89 (0.00 %)	167 (100.00 %)	4,455,227 (33.01 %)	444,021 (1.73 %)	14,946,847 (47.37 %)	29,828 (0.79 %)
213	dwarf mongoose GCA_004023845.1	n/a	21,478 (1.57 %)	32,174 (1.43 %)	n/a	41.83 (99.94 %)	10,815 (0.05 %)	200,185 (99.95 %)	4,574,991 (40.34 %)	595,520 (1.11 %)	13,720,585 (32.94 %)	70,689 (2.42 %)
214	eastern cottontail (primary hap 2023) GCA_949820135.1	n/a	18,522 (1.26 %)	22,314 (1.28 %)	n/a	43.69 (100.00 %)	316 (0.00 %)	99 (100.00 %)	3,699,683 (20.55 %)	935,350 (11.22 %)	13,112,318 (44.07 %)	99,224 (2.27 %)
215	eastern European house mouse (PWK_PhJ v2 2022) GCA_921998335.2	n/a	21,903 (2.13 %)	19,801 (1.40 %)	108,675 (4.42 %)	41.79 (99.89 %)	207 (0.11 %)	211 (100.00 %)	4,630,645 (40.56 %)	1,531,506 (3.70 %)	13,011,312 (35.48 %)	22,270 (0.54 %)
216	eastern mole GCA_004024925.1	n/a	19,631 (1.57 %)	32,414 (1.63 %)	n/a	42.02 (99.91 %)	7,239 (0.03 %)	647,535 (99.97 %)	3,145,725 (29.42 %)	554,620 (1.75 %)	10,663,504 (32.88 %)	55,063 (3.69 %)
217	eastern quoll GCA_020854095.1	n/a	15,715 (0.80 %)	16,750 (0.93 %)	n/a	36.19 (100.00 %)	431 (0.00 %)	76 (100.00 %)	5,256,999 (24.81 %)	1,280,160 (3.39 %)	21,362,866 (41.74 %)	24,508 (0.70 %)
218	eastern spiny mouse (2021) GCA_907164435.1	n/a	20,397 (1.93 %)	20,515 (1.44 %)	n/a	42.68 (98.12 %)	109,220 (1.90 %)	19,837 (99.90 %)	4,701,702 (33.98 %)	1,304,933 (2.91 %)	13,145,044 (31.05 %)	19,636 (0.56 %)
219	Egyptian rousette (1219 2016 Boston U) GCF_001466805.2	54,791 (4.93 %)	18,221 (2.05 %)	24,192 (1.88 %)	46,601 (2.22 %)	40.02 (99.97 %)	638 (0.03 %)	2,490 (100.00 %)	2,815,693 (32.23 %)	440,119 (1.01 %)	12,346,041 (26.86 %)	56,244 (6.54 %)
220	Egyptian rousette (v1 2020 refseq) GCF_014176215.1	65,163 (4.76 %)	17,642 (2.07 %)	22,317 (1.84 %)	n/a	40.05 (98.59 %)	242 (1.41 %)	29 (100.00 %)	2,821,248 (33.05 %)	434,414 (1.02 %)	12,031,597 (26.52 %)	53,573 (4.84 %)
221	Egyptian spiny mouse (US019 2019) GCA_004027535.1	n/a	23,498 (1.69 %)	36,970 (1.40 %)	30,076 (1.58 %)	42.71 (99.88 %)	20,469 (0.09 %)	391,811 (99.91 %)	4,983,574 (35.17 %)	1,342,514 (3.45 %)	13,029,270 (32.79 %)	19,944 (0.55 %)
222	elk (wapiti) GCF_019320065.1	66,846 (3.00 %)	20,090 (1.67 %)	21,999 (1.44 %)	n/a	41.62 (99.93 %)	6,643 (0.08 %)	185 (100.00 %)	4,884,711 (43.14 %)	429,925 (1.65 %)	13,135,255 (37.85 %)	47,099 (1.31 %)
223	ermine (2020) GCF_009829155.1	74,345 (3.19 %)	18,855 (1.65 %)	20,667 (1.43 %)	44,584 (2.07 %)	41.56 (99.12 %)	199 (0.88 %)	94 (100.00 %)	4,647,934 (41.44 %)	714,174 (1.30 %)	13,845,904 (33.42 %)	56,065 (2.25 %)
224	ermine (alternate hap 2020) GCA_009829165.1	n/a	13,583 (1.65 %)	15,403 (1.46 %)	n/a	41.72 (100.00 %)	n/a	3,327 (100.00 %)	3,139,035 (40.57 %)	480,111 (1.29 %)	9,106,061 (31.93 %)	39,139 (2.25 %)
225	Eurasian badger (2021) GCA_922990625.1	n/a	19,332 (1.42 %)	22,424 (1.40 %)	n/a	42.47 (100.00 %)	27 (0.00 %)	726 (100.00 %)	4,362,536 (31.74 %)	801,232 (4.02 %)	13,893,672 (37.73 %)	65,806 (4.13 %)
226	Eurasian badger (v3.2 2022) GCA_922984935.2	n/a	19,268 (1.40 %)	22,121 (1.36 %)	41,043 (1.93 %)	42.48 (100.00 %)	101 (0.00 %)	538 (100.00 %)	4,417,203 (31.72 %)	821,664 (4.02 %)	13,814,720 (38.08 %)	66,524 (3.95 %)
227	Eurasian field mouse (2024) GCA_964023405.1	n/a	20,487 (1.88 %)	19,707 (1.34 %)	n/a	42.15 (100.00 %)	182 (0.00 %)	61 (100.00 %)	5,115,510 (39.18 %)	1,868,284 (4.29 %)	13,503,826 (37.29 %)	26,414 (0.61 %)
228	Eurasian red squirrel (alternate hap 2019) GCA_902685485.1	n/a	12,437 (1.51 %)	12,702 (1.22 %)	n/a	40.06 (100.00 %)	2 (0.00 %)	10,657 (100.00 %)	2,303,176 (35.38 %)	353,996 (1.49 %)	7,218,556 (31.67 %)	24,268 (1.07 %)
229	Eurasian red squirrel (v1.2 2020) GCA_902686455.2	n/a	21,309 (1.58 %)	21,026 (1.36 %)	33,465 (1.53 %)	40.08 (94.33 %)	1,177 (5.67 %)	639 (100.00 %)	4,677,412 (35.73 %)	704,218 (1.42 %)	14,992,063 (31.49 %)	48,159 (1.04 %)
230	Eurasian river otter (2020) GCF_902655055.1	67,269 (2.96 %)	18,842 (1.54 %)	20,178 (1.40 %)	n/a	41.59 (100.00 %)	185 (0.00 %)	44 (100.00 %)	4,259,294 (33.39 %)	713,721 (1.36 %)	13,626,048 (34.37 %)	57,073 (1.82 %)
231	Eurasian river otter (alternate hap 2019) GCA_902653095.1	n/a	9,910 (1.59 %)	11,315 (1.31 %)	n/a	41.85 (100.00 %)	n/a	8,506 (100.00 %)	2,052,338 (42.25 %)	316,084 (1.64 %)	6,222,460 (33.12 %)	27,057 (1.96 %)
232	Eurasian water vole (alternate hap 2020) GCA_903992525.1	n/a	16,761 (1.66 %)	19,715 (1.37 %)	n/a	42.13 (100.00 %)	105 (0.00 %)	16,473 (100.00 %)	3,118,266 (26.44 %)	829,463 (2.82 %)	9,700,482 (31.37 %)	14,146 (0.57 %)
233	Eurasian water vole (v2 2021) GCF_903992535.2	45,544 (2.51 %)	19,733 (1.78 %)	19,053 (1.47 %)	36,935 (2.27 %)	42.15 (99.74 %)	873 (0.26 %)	215 (100.00 %)	3,993,912 (25.74 %)	1,088,163 (2.91 %)	12,853,770 (32.42 %)	19,000 (0.58 %)
234	European hare (LE1 primary hap 2023) GCF_033115175.1	46,528 (2.09 %)	19,392 (1.25 %)	23,070 (1.29 %)	n/a	44.03 (100.00 %)	418 (0.00 %)	651 (100.00 %)	4,011,592 (19.81 %)	1,000,204 (8.44 %)	13,414,251 (44.25 %)	98,831 (2.33 %)
235	European harvest mouse (primary hap 2024) GCA_963924665.1	n/a	20,236 (1.71 %)	19,368 (1.32 %)	n/a	40.05 (99.99 %)	2,020 (0.02 %)	894 (100.00 %)	4,892,811 (36.49 %)	1,223,387 (18.26 %)	11,907,631 (42.51 %)	17,423 (0.62 %)
236	European mink (alternate hap 2023) GCA_030435785.1	n/a	15,419 (1.50 %)	21,175 (1.51 %)	n/a	42.09 (100.00 %)	n/a	12,043 (100.00 %)	2,952,218 (30.62 %)	538,508 (2.18 %)	9,303,303 (34.20 %)	47,810 (2.50 %)
237	European mink (primary hap 2023 refseq) GCF_030435805.1	69,556 (3.13 %)	18,706 (1.46 %)	21,193 (1.37 %)	n/a	41.85 (100.00 %)	39 (0.00 %)	25 (100.00 %)	4,237,791 (30.90 %)	792,897 (2.69 %)	13,417,195 (36.59 %)	67,132 (2.54 %)
238	European mole (hap1 2024) GCA_964194135.1	n/a	18,085 (1.69 %)	19,509 (1.58 %)	n/a	42.08 (99.99 %)	1,056 (0.01 %)	464 (100.00 %)	2,569,380 (23.32 %)	565,465 (2.18 %)	10,506,666 (33.68 %)	46,367 (3.09 %)
239	European mole (hap2 2024) GCA_964194205.1	n/a	18,064 (1.69 %)	19,764 (1.59 %)	n/a	42.07 (99.99 %)	1,040 (0.01 %)	1,396 (99.99 %)	2,567,492 (23.34 %)	570,250 (2.16 %)	10,485,959 (33.56 %)	46,213 (3.27 %)
240	European pine marten (primary hap 2023) GCA_963455335.1	n/a	18,336 (1.50 %)	20,807 (1.41 %)	n/a	42.38 (99.98 %)	2,250 (0.02 %)	477 (100.00 %)	4,096,160 (31.55 %)	707,337 (3.28 %)	13,715,382 (34.73 %)	61,481 (4.29 %)
241	European shrew (alternate hap 2023) GCA_027595995.1	n/a	17,506 (1.26 %)	25,527 (1.52 %)	n/a	43.20 (100.00 %)	n/a	5,699 (100.00 %)	2,400,784 (15.19 %)	1,062,793 (3.20 %)	13,284,496 (41.93 %)	77,009 (2.86 %)
242	European shrew (GB8-d 2012) GCF_000181275.1	23,525 (1.54 %)	17,290 (1.33 %)	22,005 (1.50 %)	n/a	42.90 (90.49 %)	188,953 (9.54 %)	201,798 (90.46 %)	4,400,127 (33.22 %)	946,629 (2.03 %)	13,377,581 (35.30 %)	77,851 (2.58 %)
243	European shrew (primary hap 2023) GCF_027595985.1	44,643 (2.60 %)	17,479 (1.26 %)	21,293 (1.37 %)	n/a	43.24 (99.46 %)	1,427 (0.54 %)	65 (100.00 %)	2,474,584 (15.18 %)	1,107,884 (3.28 %)	13,638,467 (41.72 %)	79,785 (2.86 %)
244	European snow vole (alternate hap 2023) GCA_950005115.1	n/a	18,364 (1.79 %)	20,379 (1.63 %)	n/a	42.19 (100.00 %)	1 (0.00 %)	4,256 (100.00 %)	3,049,618 (22.22 %)	852,708 (4.50 %)	10,501,392 (33.34 %)	17,629 (0.60 %)
245	European snow vole (primary hap 2023 refseq) GCF_950005125.1	47,025 (2.69 %)	19,592 (1.78 %)	21,173 (1.56 %)	n/a	41.98 (100.00 %)	197 (0.00 %)	160 (100.00 %)	5,048,186 (44.12 %)	998,537 (5.14 %)	12,204,053 (34.97 %)	20,725 (0.63 %)
246	European suslik (primary hap 2024) GCA_964194105.1	n/a	20,075 (1.28 %)	20,274 (1.19 %)	n/a	39.90 (99.99 %)	1,436 (0.01 %)	502 (100.00 %)	4,357,247 (31.78 %)	882,536 (12.27 %)	14,882,486 (41.66 %)	39,275 (0.88 %)
247	European woodmouse (2022 refseq) GCF_947179515.1	54,113 (2.24 %)	19,959 (1.65 %)	19,953 (1.25 %)	n/a	41.23 (99.99 %)	1,129 (0.01 %)	497 (100.00 %)	4,863,650 (37.41 %)	1,795,997 (8.95 %)	13,681,732 (40.58 %)	23,961 (0.53 %)
248	European woodmouse (alternate hap 2022) GCA_947179525.1	n/a	18,692 (1.72 %)	22,021 (1.36 %)	n/a	41.56 (100.00 %)	2 (0.00 %)	10,863 (100.00 %)	4,055,957 (36.08 %)	1,513,576 (9.53 %)	11,306,811 (39.67 %)	20,865 (0.55 %)
249	fallow deer (Ldn47 2023) GCF_033118175.1	57,013 (2.35 %)	20,187 (1.33 %)	23,290 (1.33 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	44 (0.00 %)	284 (100.00 %)	3,308,241 (20.72 %)	513,748 (18.20 %)	12,996,819 (48.19 %)	214,480 (2.98 %)
250	fallow deer (maternal hap SK-2024 2025) GCA_048126745.1	n/a	20,072 (1.51 %)	22,668 (1.37 %)	n/a	41.80 (100.00 %)	147 (0.00 %)	1,369 (100.00 %)	4,623,335 (34.75 %)	475,143 (7.51 %)	13,000,703 (41.56 %)	112,581 (2.00 %)
251	fallow deer (paternal hap SK-2024 2025) GCA_048127045.1	n/a	18,238 (1.57 %)	20,307 (1.42 %)	n/a	41.46 (100.00 %)	242 (0.00 %)	388 (100.00 %)	4,244,450 (35.89 %)	405,446 (2.83 %)	12,211,643 (38.55 %)	52,418 (1.36 %)
252	false killer whale (hap1 2024 genbank) GCA_039906515.1	n/a	18,718 (1.50 %)	20,929 (1.32 %)	n/a	42.08 (99.90 %)	123 (0.10 %)	439 (100.00 %)	3,958,932 (35.76 %)	1,002,329 (11.61 %)	12,193,131 (41.85 %)	79,158 (3.74 %)
253	false killer whale (hap1 2024 refseq) GCF_039906515.1	75,958 (3.31 %)	18,718 (1.50 %)	20,982 (1.32 %)	n/a	42.08 (99.90 %)	123 (0.10 %)	438 (100.00 %)	3,958,926 (35.76 %)	1,002,329 (11.61 %)	12,193,061 (41.85 %)	79,158 (3.74 %)
254	false killer whale (hap2 2024) GCA_039906525.1	n/a	17,866 (1.45 %)	21,079 (1.46 %)	n/a	42.37 (99.08 %)	133 (0.92 %)	416 (100.00 %)	3,852,502 (34.98 %)	1,112,185 (16.42 %)	11,435,533 (44.17 %)	75,215 (4.36 %)
255	fat dormouse (US078 2019) GCA_004027185.1	n/a	23,122 (1.24 %)	48,677 (1.27 %)	n/a	42.33 (99.92 %)	10,685 (0.04 %)	444,115 (99.96 %)	6,783,404 (37.03 %)	1,642,515 (3.72 %)	12,706,289 (39.97 %)	65,521 (1.47 %)
256	fat sand rat (mPsaObe1 2021) GCF_907164565.1	43,224 (2.50 %)	18,543 (1.78 %)	20,094 (1.42 %)	n/a	41.95 (99.11 %)	50,482 (0.90 %)	11,389 (100.00 %)	4,686,377 (43.10 %)	920,563 (1.85 %)	12,813,848 (35.08 %)	22,480 (0.71 %)
257	fat sand rat (Psa_ob012049795 2017) GCA_002215935.1	n/a	21,644 (1.71 %)	31,665 (1.41 %)	n/a	41.99 (99.99 %)	n/a	96,427 (100.00 %)	4,646,110 (38.87 %)	946,664 (2.24 %)	13,134,526 (33.94 %)	26,411 (0.73 %)
258	fat-tailed dunnart (SCR6 2025) GCF_048593235.1	60,212 (2.43 %)	15,763 (0.77 %)	16,031 (0.89 %)	n/a	36.12 (99.99 %)	1,908 (0.01 %)	8 (100.00 %)	5,302,378 (24.47 %)	1,450,227 (3.79 %)	20,870,714 (44.26 %)	24,586 (0.65 %)
259	fat-tailed dunnart (SCR6 hap1 2025) GCA_048593235.1	n/a	15,762 (0.77 %)	16,035 (0.89 %)	n/a	36.12 (99.99 %)	1,908 (0.01 %)	1,915 (99.99 %)	5,302,372 (24.47 %)	1,450,220 (3.79 %)	20,870,654 (44.26 %)	24,585 (0.65 %)
260	fat-tailed dunnart (SCR6 hap2 2025) GCA_048593295.1	n/a	16,012 (0.77 %)	16,430 (0.90 %)	n/a	36.18 (99.99 %)	1,730 (0.01 %)	1,737 (99.99 %)	5,361,847 (24.48 %)	1,474,744 (3.79 %)	21,021,671 (44.20 %)	25,669 (0.69 %)
261	fin whale (hap1.1 2025) GCA_965194825.1	n/a	19,491 (1.21 %)	22,538 (1.06 %)	n/a	42.19 (99.99 %)	1,516 (0.01 %)	2,612 (100.00 %)	4,598,236 (35.34 %)	1,716,315 (24.14 %)	12,260,919 (52.40 %)	82,683 (1.47 %)
262	fin whale (hap2.1 2025) GCA_965194765.1	n/a	18,684 (1.40 %)	21,322 (1.20 %)	n/a	41.87 (99.99 %)	1,258 (0.01 %)	3,706 (99.99 %)	4,103,716 (36.69 %)	1,030,821 (16.12 %)	11,633,934 (45.82 %)	74,782 (1.60 %)
263	fishing cat (Anna 2022 U Missouri) GCF_022837055.1	68,085 (2.86 %)	18,432 (1.63 %)	19,912 (1.37 %)	n/a	41.91 (100.00 %)	63 (0.00 %)	192 (100.00 %)	4,777,906 (34.85 %)	937,432 (2.30 %)	13,438,032 (34.55 %)	70,402 (2.61 %)
264	Florida manatee (CSIC 2023) GCA_030013775.1	n/a	19,432 (1.24 %)	24,035 (1.14 %)	n/a	40.66 (100.00 %)	33 (0.00 %)	15,641 (100.00 %)	4,400,331 (33.07 %)	439,615 (1.04 %)	14,884,753 (46.98 %)	32,563 (0.80 %)
265	Florida manatee (Lorelei 2012 refseq) GCF_000243295.1	39,664 (2.08 %)	18,308 (1.37 %)	20,588 (1.23 %)	32,868 (1.38 %)	40.73 (89.24 %)	160,167 (10.78 %)	166,490 (89.22 %)	n/a	389,315 (0.74 %)	14,633,038 (38.46 %)	27,462 (0.64 %)
266	fossa GCA_004023885.1	n/a	21,156 (1.56 %)	29,809 (1.38 %)	n/a	41.51 (99.94 %)	6,335 (0.03 %)	470,371 (99.97 %)	4,962,168 (42.36 %)	814,639 (1.52 %)	13,708,904 (34.14 %)	78,033 (2.52 %)
267	Gambian giant pouched rat GCA_004027575.1	n/a	21,189 (1.59 %)	32,806 (1.43 %)	n/a	42.11 (99.88 %)	7,473 (0.03 %)	1,110,425 (99.97 %)	4,137,605 (24.57 %)	1,071,627 (2.76 %)	12,905,250 (32.78 %)	32,359 (0.80 %)
268	gayal (CVASU_BF_001 2021) GCA_017311355.1	n/a	24,549 (1.09 %)	55,194 (1.15 %)	n/a	42.05 (99.91 %)	n/a	1,262,134 (100.00 %)	3,691,398 (22.78 %)	677,397 (2.00 %)	14,380,670 (42.36 %)	75,114 (1.33 %)
269	gayal (Nagaland 2019) GCA_007844835.1	n/a	22,715 (1.55 %)	23,635 (1.33 %)	n/a	41.67 (96.51 %)	301,761 (3.52 %)	306,776 (96.48 %)	6,243,468 (45.69 %)	518,664 (1.99 %)	15,147,647 (37.64 %)	45,586 (0.89 %)
270	Geoffroy's bat (hap1.1 2025) GCA_965115925.1	n/a	19,320 (1.74 %)	21,940 (1.65 %)	n/a	42.55 (99.99 %)	1,540 (0.01 %)	404 (100.00 %)	3,707,500 (37.60 %)	733,107 (7.78 %)	10,515,474 (39.35 %)	60,200 (2.41 %)
271	Geoffroy's bat (hap2.1 2025) GCA_965115945.1	n/a	18,718 (1.71 %)	20,961 (1.62 %)	n/a	42.29 (99.98 %)	1,597 (0.02 %)	2,101 (99.98 %)	3,662,405 (37.72 %)	717,069 (7.80 %)	10,298,372 (39.22 %)	56,300 (2.26 %)
272	Geoffroy's cat GCF_018350155.1	85,344 (3.53 %)	18,469 (1.66 %)	19,516 (1.36 %)	93,795 (4.83 %)	41.75 (100.00 %)	45 (0.00 %)	82 (100.00 %)	5,021,854 (43.23 %)	930,175 (1.84 %)	13,757,469 (34.29 %)	65,918 (2.36 %)
273	giant anteater GCA_004026745.1	n/a	24,383 (0.91 %)	44,315 (0.93 %)	n/a	39.53 (99.88 %)	8,283 (0.02 %)	1,629,691 (99.98 %)	5,333,757 (35.57 %)	575,140 (0.91 %)	21,181,213 (39.97 %)	57,558 (0.94 %)
274	giant otter GCA_004024605.1	n/a	21,199 (1.46 %)	30,565 (1.34 %)	n/a	41.71 (99.93 %)	7,431 (0.03 %)	652,159 (99.97 %)	5,113,769 (41.55 %)	788,677 (1.46 %)	14,385,279 (35.77 %)	82,376 (2.05 %)
275	giant panda (Jingjing v3 2020) GCF_002007445.2	65,481 (3.27 %)	19,077 (1.67 %)	20,176 (1.39 %)	n/a	41.68 (98.09 %)	189,277 (1.92 %)	73,514 (100.00 %)	4,012,144 (34.40 %)	617,803 (1.99 %)	14,216,587 (30.41 %)	59,449 (1.50 %)
276	goat (v2 San Clemente 2016 USDA) GCF_001704415.2	47,172 (2.31 %)	19,342 (1.38 %)	22,346 (1.24 %)	n/a	43.16 (100.00 %)	790 (0.00 %)	29,886 (100.00 %)	3,502,527 (22.45 %)	760,831 (7.07 %)	13,024,178 (44.85 %)	125,662 (4.00 %)
277	Gobi jerboa GCA_004027895.1	n/a	22,410 (0.91 %)	45,268 (1.02 %)	n/a	41.94 (99.88 %)	10,987 (0.04 %)	1,295,369 (99.96 %)	8,828,417 (40.19 %)	1,979,806 (6.43 %)	14,759,732 (47.73 %)	24,314 (0.52 %)
278	golden hamster (Baylor 2021) GCF_017639785.1	67,831 (3.37 %)	19,354 (1.71 %)	19,863 (1.47 %)	69,903 (4.39 %)	42.04 (96.99 %)	711 (3.01 %)	7,058 (96.99 %)	3,981,818 (27.65 %)	976,456 (3.46 %)	12,580,903 (32.87 %)	21,268 (0.61 %)
279	golden hamster (Broad 2013 refseq) GCF_000349665.1	42,636 (2.91 %)	18,976 (1.82 %)	19,149 (1.51 %)	29,936 (1.96 %)	42.01 (82.92 %)	216,216 (17.12 %)	237,700 (82.88 %)	3,599,795 (26.09 %)	790,256 (1.69 %)	12,003,956 (24.29 %)	18,591 (0.51 %)
280	golden spiny mouse (2020) GCF_903995435.1	36,997 (1.96 %)	20,006 (1.91 %)	19,132 (1.50 %)	n/a	42.51 (99.65 %)	880 (0.35 %)	623 (100.00 %)	4,785,907 (32.61 %)	1,305,613 (3.34 %)	12,958,061 (32.33 %)	20,760 (0.59 %)
281	golden-mantled ground squirrel (hap1 2025) GCA_048772815.1	n/a	20,967 (0.89 %)	24,137 (0.94 %)	n/a	39.52 (99.99 %)	1,448 (0.01 %)	8,087 (100.00 %)	5,547,018 (29.30 %)	1,312,047 (10.07 %)	15,174,898 (52.73 %)	40,182 (0.59 %)
282	golden-mantled ground squirrel (hap2 2025) GCA_048772825.1	n/a	19,719 (1.16 %)	22,611 (1.21 %)	n/a	39.48 (100.00 %)	643 (0.00 %)	2,820 (100.00 %)	4,725,546 (31.70 %)	997,950 (3.53 %)	14,753,550 (39.53 %)	33,465 (0.69 %)
283	gracile shrew mole GCA_004024945.1	n/a	19,165 (1.25 %)	43,816 (1.48 %)	n/a	41.08 (99.89 %)	8,248 (0.04 %)	732,083 (99.96 %)	2,957,465 (23.76 %)	783,289 (2.60 %)	11,503,344 (31.38 %)	92,729 (3.60 %)
284	gray fox (Vermont ataVT051 2023) GCA_032313775.1	n/a	19,352 (1.42 %)	20,724 (1.33 %)	n/a	42.10 (100.00 %)	26 (0.00 %)	898 (100.00 %)	4,418,039 (36.90 %)	1,050,244 (11.63 %)	13,240,305 (39.50 %)	89,246 (2.69 %)
285	gray seal (241Hg 2020) GCF_012393455.1	79,009 (3.73 %)	19,882 (1.73 %)	22,416 (1.46 %)	n/a	41.44 (100.00 %)	117 (0.00 %)	6,880 (100.00 %)	4,448,588 (43.28 %)	557,710 (1.32 %)	13,340,576 (33.41 %)	55,637 (1.78 %)
286	gray seal (hap1.1 2025) GCA_964656455.1	n/a	19,291 (1.73 %)	20,301 (1.41 %)	n/a	41.56 (99.99 %)	1,130 (0.01 %)	171 (100.00 %)	4,245,582 (34.81 %)	600,624 (2.16 %)	13,240,803 (34.28 %)	56,932 (1.78 %)
287	gray seal (hap2.1 2025) GCA_964656465.1	n/a	19,222 (1.73 %)	20,205 (1.41 %)	n/a	41.54 (99.99 %)	1,110 (0.01 %)	1,233 (99.99 %)	4,236,942 (34.95 %)	601,409 (1.99 %)	13,226,667 (34.03 %)	57,067 (1.82 %)
288	gray short-tailed opossum (mMonDom1 alternate hap 2023) GCA_027917375.1	n/a	12,662 (0.70 %)	15,124 (0.89 %)	n/a	37.74 (100.00 %)	24 (0.00 %)	8,086 (100.00 %)	4,098,004 (25.33 %)	806,470 (2.98 %)	16,244,072 (43.39 %)	24,879 (0.67 %)
289	gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 refseq) GCF_027887165.1	73,383 (3.04 %)	16,637 (0.72 %)	16,036 (0.85 %)	n/a	37.92 (99.11 %)	2,255 (0.89 %)	13 (100.00 %)	5,562,359 (25.40 %)	1,096,620 (2.60 %)	22,322,748 (43.37 %)	28,894 (0.57 %)
290	gray short-tailed opossum (MonDom5 2007) GCF_000002295.2	68,388 (2.34 %)	16,663 (0.75 %)	16,162 (0.84 %)	n/a	37.82 (97.26 %)	67,660 (2.75 %)	72,674 (97.25 %)	7,753,175 (55.85 %)	1,051,473 (2.34 %)	22,274,001 (42.23 %)	30,883 (0.53 %)
291	gray squirrel (2020) GCF_902686445.1	59,073 (2.48 %)	20,752 (1.49 %)	21,107 (1.31 %)	32,732 (1.45 %)	40.06 (99.98 %)	1,824 (0.02 %)	752 (100.00 %)	4,605,578 (34.50 %)	728,192 (1.65 %)	15,467,412 (33.91 %)	51,878 (1.11 %)
292	gray squirrel (alternate hap 2019) GCA_902685475.1	n/a	17,156 (1.53 %)	18,190 (1.33 %)	n/a	40.25 (100.00 %)	2 (0.00 %)	9,510 (100.00 %)	3,455,580 (34.94 %)	530,053 (1.56 %)	10,927,458 (32.64 %)	38,976 (1.13 %)
293	gray wolf (2021) GCA_905319855.2	n/a	19,474 (1.55 %)	20,394 (1.40 %)	72,806 (4.12 %)	41.49 (100.00 %)	166 (0.00 %)	82 (100.00 %)	4,550,524 (31.76 %)	1,063,944 (3.96 %)	13,588,117 (34.74 %)	51,996 (2.15 %)
294	gray wolf (alternate hap 2021) GCA_905319845.1	n/a	12,760 (1.57 %)	14,423 (1.42 %)	n/a	41.35 (100.00 %)	1 (0.00 %)	5,537 (100.00 %)	2,725,227 (31.66 %)	616,862 (3.40 %)	8,041,744 (32.68 %)	32,293 (2.35 %)
295	great fruit-eating bat (hap1 2024) GCA_038363145.1	n/a	18,022 (1.56 %)	19,824 (1.51 %)	n/a	42.28 (100.00 %)	81 (0.00 %)	419 (100.00 %)	2,827,417 (26.82 %)	371,479 (4.97 %)	11,603,093 (34.64 %)	71,574 (2.28 %)
296	great fruit-eating bat (mArtLit1hap2 2024) GCA_038363175.2	n/a	16,978 (1.61 %)	18,544 (1.54 %)	n/a	42.42 (100.00 %)	54 (0.00 %)	312 (100.00 %)	2,601,985 (26.67 %)	331,187 (4.87 %)	10,884,729 (33.93 %)	63,610 (2.71 %)
297	great fruit-eating bat (v2 hap1 2024) GCA_038363095.2	n/a	18,051 (1.56 %)	19,955 (1.51 %)	n/a	42.45 (100.00 %)	45 (0.00 %)	487 (100.00 %)	2,841,143 (26.67 %)	379,430 (5.52 %)	11,651,542 (35.11 %)	72,337 (2.76 %)
298	great roundleaf bat (v2 ML-2016 2016) GCF_001890085.2	50,908 (3.26 %)	18,993 (2.01 %)	19,633 (1.65 %)	41,769 (2.41 %)	41.11 (87.42 %)	172,750 (12.60 %)	7,387 (100.00 %)	2,946,981 (30.72 %)	495,272 (1.05 %)	11,587,728 (25.43 %)	32,949 (0.96 %)
299	greater bulldog bat GCA_004026585.1	n/a	20,774 (1.62 %)	28,140 (1.63 %)	n/a	40.92 (99.94 %)	6,171 (0.03 %)	304,393 (99.97 %)	3,288,598 (29.60 %)	478,424 (1.16 %)	11,427,553 (35.29 %)	44,124 (1.99 %)
300	Greater cane rat GCA_004025085.1	n/a	20,383 (0.98 %)	47,456 (1.25 %)	n/a	42.85 (99.83 %)	8,825 (0.03 %)	1,898,466 (99.97 %)	5,569,185 (30.19 %)	946,696 (3.12 %)	13,144,109 (41.83 %)	97,686 (2.61 %)
301	greater horseshoe bat (MPI-CBG alternate hap 2019) GCA_004115295.1	n/a	14,896 (1.85 %)	18,939 (1.59 %)	n/a	40.69 (100.00 %)	2 (0.00 %)	13,426 (100.00 %)	2,426,330 (34.43 %)	418,341 (1.36 %)	8,763,234 (27.86 %)	24,370 (1.08 %)
302	greater horseshoe bat (v2 MPI-CBG 2019) GCF_004115265.2	53,353 (3.13 %)	18,641 (1.97 %)	20,359 (1.68 %)	n/a	40.54 (99.64 %)	158 (0.36 %)	134 (100.00 %)	3,218,744 (34.52 %)	564,789 (1.35 %)	12,217,020 (29.39 %)	32,445 (1.06 %)
303	greater mouse-eared bat (2020 Bat1K) GCF_014108235.1	70,930 (3.43 %)	19,052 (1.84 %)	21,498 (1.73 %)	n/a	43.11 (98.55 %)	538 (1.45 %)	93 (100.00 %)	3,088,083 (26.27 %)	753,124 (2.84 %)	10,383,466 (35.84 %)	61,023 (2.69 %)
304	greater mouse-tailed bat (20210906_DDa primary hap 2024) GCA_043880545.1	n/a	18,582 (1.55 %)	20,954 (1.35 %)	n/a	42.46 (100.00 %)	152 (0.00 %)	106 (100.00 %)	4,158,629 (40.30 %)	696,150 (4.67 %)	12,702,667 (41.11 %)	257,446 (3.38 %)
305	greater sac-winged bat (primary hap 2024 refseq) GCF_036850765.1	55,259 (2.53 %)	18,321 (1.40 %)	21,048 (1.35 %)	n/a	41.71 (98.73 %)	468 (1.27 %)	256 (100.00 %)	4,247,145 (29.53 %)	1,031,385 (2.50 %)	12,465,157 (43.30 %)	101,620 (2.01 %)
306	greater spear-nosed bat (2021 Texas Tech U) GCF_019186645.2	50,563 (2.96 %)	18,224 (1.70 %)	20,689 (1.67 %)	n/a	42.27 (100.00 %)	55 (0.00 %)	534 (100.00 %)	2,961,591 (0.00 %)	387,908 (0.97 %)	12,179,612 (30.91 %)	62,189 (5.35 %)
307	grey whale GCA_004363415.1	n/a	21,827 (1.52 %)	32,191 (1.24 %)	n/a	41.22 (99.88 %)	10,622 (0.04 %)	1,046,770 (99.96 %)	4,841,166 (45.56 %)	780,015 (1.83 %)	13,559,563 (39.86 %)	72,343 (1.59 %)
308	grey whale (mEscRob2 alternate hap 2023) GCA_028021475.1	n/a	19,129 (1.37 %)	24,628 (1.24 %)	n/a	41.83 (100.00 %)	n/a	14,442 (100.00 %)	3,892,130 (35.74 %)	874,864 (15.70 %)	11,484,916 (45.69 %)	73,507 (1.72 %)
309	grey whale (primary hap 2023 genbank) GCA_028021215.1	n/a	19,288 (1.38 %)	21,791 (1.21 %)	n/a	41.74 (100.00 %)	279 (0.00 %)	704 (100.00 %)	4,116,900 (35.85 %)	966,065 (16.74 %)	12,154,173 (46.39 %)	77,011 (1.59 %)
310	grey whale (primary hap 2023 refseq) GCF_028021215.1	49,276 (1.90 %)	19,295 (1.38 %)	21,790 (1.21 %)	n/a	41.74 (100.00 %)	279 (0.00 %)	703 (100.00 %)	4,116,894 (35.85 %)	966,064 (16.74 %)	12,154,101 (46.39 %)	77,011 (1.59 %)
311	hairy big-eared bat (US037 2019 Broad) GCA_004026765.1	n/a	21,360 (1.44 %)	37,376 (1.52 %)	n/a	42.38 (99.94 %)	3,218 (0.01 %)	553,308 (99.99 %)	3,519,246 (30.77 %)	393,318 (0.85 %)	12,525,258 (34.42 %)	84,875 (2.37 %)
312	Hanaki's dwarf bat (2024) GCA_964339955.1	n/a	17,856 (1.76 %)	20,604 (1.75 %)	n/a	42.55 (100.00 %)	306 (0.00 %)	141 (100.00 %)	3,697,250 (33.21 %)	842,827 (8.27 %)	10,094,062 (38.40 %)	61,715 (2.96 %)
313	harbor porpoise (primary hap 2024 genbank) GCA_963924675.1	n/a	18,529 (1.58 %)	20,583 (1.34 %)	n/a	41.72 (99.99 %)	966 (0.01 %)	442 (100.00 %)	3,760,716 (36.18 %)	888,368 (7.18 %)	12,379,240 (39.04 %)	71,530 (2.69 %)
314	harbor porpoise (primary hap 2024 refseq) GCF_963924675.1	33,578 (1.54 %)	18,528 (1.58 %)	20,582 (1.34 %)	n/a	41.72 (99.99 %)	966 (0.01 %)	1,405 (99.99 %)	3,760,713 (36.18 %)	888,368 (7.18 %)	12,379,181 (39.04 %)	71,530 (2.69 %)
315	harbor seal GCF_004348235.1	50,657 (2.98 %)	19,484 (1.76 %)	20,771 (1.44 %)	33,296 (1.58 %)	41.38 (99.09 %)	16,480 (0.91 %)	21,161 (99.09 %)	4,526,182 (43.28 %)	576,921 (1.11 %)	13,421,780 (33.06 %)	54,592 (1.70 %)
316	Hawaiian monk seal (2021 Johns Hopkins U) GCF_002201575.2	37,605 (1.99 %)	19,483 (1.73 %)	19,767 (1.35 %)	n/a	41.41 (98.23 %)	25,763 (1.77 %)	7,487 (100.00 %)	4,575,217 (43.59 %)	583,394 (1.11 %)	13,374,131 (33.69 %)	52,067 (1.50 %)
317	hazel dormouse GCA_004027005.1	n/a	21,556 (1.24 %)	40,971 (1.33 %)	n/a	41.60 (99.91 %)	15,076 (0.06 %)	481,881 (99.94 %)	6,679,641 (33.98 %)	1,653,419 (3.72 %)	12,685,676 (43.98 %)	71,478 (1.57 %)
318	hazel dormouse (alternate hap 2023) GCA_963383665.1	n/a	11,130 (1.23 %)	22,071 (1.36 %)	n/a	42.15 (99.99 %)	n/a	31,856 (100.00 %)	2,958,239 (41.25 %)	788,242 (4.52 %)	6,056,268 (41.88 %)	36,143 (1.96 %)
319	hazel dormouse (primary hap 2023) GCA_963383645.1	n/a	18,620 (1.42 %)	22,403 (1.38 %)	n/a	41.73 (99.99 %)	1,805 (0.01 %)	214 (100.00 %)	6,063,911 (41.66 %)	1,593,657 (4.46 %)	12,229,281 (43.98 %)	71,058 (1.88 %)
320	hippopotamus (BS01 2019 Broad) GCA_004027065.1	n/a	24,267 (1.55 %)	34,820 (1.30 %)	n/a	41.43 (99.91 %)	4,730 (0.02 %)	972,599 (99.98 %)	4,579,311 (41.26 %)	606,731 (1.02 %)	14,514,493 (36.58 %)	54,753 (1.59 %)
321	hippopotamus (HIP001 2018) GCA_002995585.1	n/a	22,343 (1.70 %)	31,687 (1.45 %)	n/a	40.96 (94.63 %)	153,125 (5.38 %)	281,897 (94.62 %)	3,952,905 (38.55 %)	476,243 (1.97 %)	14,216,817 (27.43 %)	48,380 (1.43 %)
322	hippopotamus (mHipAmp2 hap1 2023) GCA_030028035.1	n/a	20,391 (1.63 %)	20,668 (1.37 %)	n/a	41.62 (100.00 %)	83 (0.00 %)	545 (100.00 %)	3,778,764 (35.17 %)	563,345 (3.63 %)	13,524,869 (35.56 %)	48,164 (1.90 %)
323	hippopotamus (v2 hap2 2023 refseq) GCF_030028045.1	64,153 (2.73 %)	20,331 (1.62 %)	20,633 (1.37 %)	n/a	41.60 (100.00 %)	226 (0.00 %)	357 (100.00 %)	3,783,440 (35.17 %)	567,797 (3.38 %)	13,462,531 (35.48 %)	48,365 (1.91 %)
324	hirola (BS46 2019 Broad) GCA_004027495.1	n/a	22,264 (1.40 %)	36,984 (1.26 %)	n/a	42.31 (99.93 %)	9,287 (0.03 %)	545,176 (99.97 %)	5,809,405 (48.62 %)	465,001 (1.08 %)	13,326,245 (42.35 %)	48,312 (1.15 %)
325	Hispaniolan solenodon GCA_004363575.1	n/a	18,805 (1.55 %)	27,454 (1.64 %)	n/a	39.98 (99.96 %)	5,186 (0.02 %)	181,804 (99.98 %)	2,669,787 (26.78 %)	431,610 (1.04 %)	13,429,711 (27.35 %)	53,444 (2.30 %)
326	hispid cotton rat GCA_004025045.1	n/a	25,324 (1.49 %)	31,681 (1.31 %)	39,953 (1.43 %)	39.77 (99.89 %)	13,744 (0.05 %)	897,290 (99.95 %)	4,384,099 (28.17 %)	1,132,313 (3.34 %)	14,729,737 (38.08 %)	17,558 (0.40 %)
327	Hoffmann's two-fingered sloth GCA_000164785.2	n/a	24,546 (1.30 %)	30,273 (1.15 %)	n/a	39.80 (98.09 %)	101,085 (1.91 %)	370,035 (98.09 %)	5,145,551 (52.20 %)	614,819 (1.62 %)	17,932,269 (39.26 %)	55,943 (1.04 %)
328	hog-nosed bat GCA_004027555.1	n/a	20,591 (1.30 %)	39,589 (1.39 %)	n/a	40.99 (99.88 %)	6,224 (0.03 %)	1,230,480 (99.97 %)	4,081,924 (31.12 %)	1,008,077 (2.20 %)	12,068,828 (39.98 %)	55,567 (2.02 %)
329	Honduran yellow-shouldered bat (v2.1 Veracruz 20B 2020) GCF_014824575.3	49,071 (2.78 %)	17,588 (1.64 %)	19,357 (1.60 %)	n/a	42.32 (99.79 %)	38,648 (0.21 %)	25,848 (100.00 %)	2,708,400 (27.89 %)	366,870 (1.48 %)	11,795,308 (31.27 %)	59,066 (1.72 %)
330	horse (maternal 2024) GCA_036418255.1	n/a	16,789 (1.65 %)	18,017 (1.36 %)	n/a	42.07 (100.00 %)	210 (0.00 %)	821 (100.00 %)	3,146,381 (34.68 %)	430,664 (5.91 %)	13,246,059 (32.62 %)	37,293 (2.80 %)
331	horse (paternal hap 2024) GCA_036426135.1	n/a	19,073 (1.67 %)	20,636 (1.38 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	114 (0.00 %)	602 (100.00 %)	3,521,953 (35.39 %)	461,571 (5.26 %)	14,833,688 (32.77 %)	43,527 (2.54 %)
332	horse (thoroughbred H_3958 2024) GCF_041296265.1	124,629 (3.91 %)	18,742 (1.47 %)	21,901 (1.39 %)	n/a	42.90 (99.96 %)	5 (0.04 %)	625 (100.00 %)	3,600,073 (33.96 %)	709,759 (8.89 %)	14,396,691 (35.72 %)	48,802 (5.67 %)
333	horse (Twilight 2018) GCF_002863925.1	76,388 (4.03 %)	18,997 (1.73 %)	20,914 (1.42 %)	113,346 (6.08 %)	41.50 (99.62 %)	6,294 (0.38 %)	4,701 (100.00 %)	4,080,319 (44.85 %)	395,037 (1.44 %)	15,169,517 (29.93 %)	44,825 (1.77 %)
334	house mouse (129S1_SvImJv1 2016) GCA_001624185.1	n/a	21,289 (2.22 %)	18,626 (1.42 %)	102,148 (4.16 %)	41.77 (85.00 %)	366,945 (15.05 %)	62,882 (95.15 %)	5,075,137 (40.38 %)	1,400,072 (2.80 %)	13,497,076 (26.20 %)	16,957 (0.40 %)
335	house mouse (129S1_SvImJ_v3 2022) GCA_921998555.2	n/a	21,780 (2.13 %)	19,436 (1.37 %)	110,376 (4.47 %)	41.79 (99.60 %)	1,557 (0.40 %)	188 (100.00 %)	4,653,663 (40.74 %)	1,550,342 (3.54 %)	12,930,784 (35.48 %)	23,211 (0.57 %)
336	house mouse (AKR_J v3 2022) GCA_922000895.2	n/a	21,721 (2.13 %)	19,324 (1.37 %)	110,654 (4.48 %)	41.80 (99.85 %)	2,714 (0.15 %)	201 (100.00 %)	4,645,513 (40.70 %)	1,547,237 (3.56 %)	13,016,932 (35.69 %)	23,309 (0.57 %)
337	house mouse (alternate hap 2023) GCA_949316305.1	n/a	661 (0.88 %)	720 (0.54 %)	n/a	38.59 (100.00 %)	n/a	1,806 (100.00 %)	97,279 (72.21 %)	40,071 (55.89 %)	208,928 (64.94 %)	506 (0.31 %)
338	house mouse (A_J v3 2022) GCA_921998355.2	n/a	21,869 (2.13 %)	19,400 (1.37 %)	110,389 (4.48 %)	41.80 (99.39 %)	608 (0.61 %)	163 (100.00 %)	4,668,553 (40.80 %)	1,556,835 (3.58 %)	12,995,938 (35.53 %)	23,203 (0.56 %)
339	house mouse (BALB_cJ v3 2022) GCA_921997145.2	n/a	21,891 (2.13 %)	19,499 (1.37 %)	110,461 (4.47 %)	41.79 (99.80 %)	274 (0.20 %)	217 (100.00 %)	4,673,990 (40.79 %)	1,560,327 (3.63 %)	13,018,071 (35.70 %)	23,196 (0.56 %)
340	house mouse (C3H_HeJ v3 2022) GCA_921997125.2	n/a	21,793 (2.13 %)	19,516 (1.38 %)	110,049 (4.46 %)	41.79 (99.05 %)	844 (0.95 %)	174 (100.00 %)	4,657,005 (40.76 %)	1,551,107 (3.53 %)	12,949,100 (35.32 %)	23,262 (0.56 %)
341	house mouse (C57BL_6J T2T 2024) GCA_964188535.1	n/a	21,496 (1.92 %)	19,278 (1.25 %)	n/a	41.31 (99.85 %)	108 (0.15 %)	345 (99.85 %)	4,519,975 (46.81 %)	1,564,206 (14.33 %)	12,267,542 (42.16 %)	23,119 (0.55 %)
342	house mouse (CBA_J v3 2022) GCA_921998905.2	n/a	21,829 (2.13 %)	19,841 (1.39 %)	110,858 (4.48 %)	41.79 (99.52 %)	658 (0.48 %)	145 (100.00 %)	4,658,032 (40.77 %)	1,552,298 (3.59 %)	12,948,038 (35.52 %)	23,232 (0.56 %)
343	house mouse (DBA_2J v3 2022) GCA_921998315.2	n/a	22,302 (2.08 %)	19,749 (1.35 %)	113,269 (4.42 %)	41.72 (100.00 %)	153 (0.00 %)	361 (100.00 %)	4,785,676 (41.69 %)	1,597,598 (4.56 %)	13,190,158 (36.58 %)	24,140 (0.59 %)
344	house mouse (FVB_NJ v3 2022) GCA_921998635.2	n/a	21,633 (2.15 %)	19,565 (1.40 %)	110,246 (4.50 %)	41.82 (98.35 %)	6,244 (1.65 %)	384 (100.00 %)	4,621,601 (40.42 %)	1,537,622 (3.48 %)	12,818,729 (34.77 %)	22,696 (0.55 %)
345	house mouse (LP_J v3 2022) GCA_947599735.1	n/a	22,452 (1.91 %)	19,841 (1.23 %)	110,073 (3.98 %)	41.29 (99.99 %)	386 (0.01 %)	515 (100.00 %)	4,839,574 (46.33 %)	1,645,163 (11.88 %)	12,936,515 (41.49 %)	24,374 (0.54 %)
346	house mouse (NOD_ShiLtJ v3 2022) GCA_921998325.2	n/a	21,797 (2.13 %)	19,521 (1.38 %)	109,890 (4.48 %)	41.80 (99.50 %)	1,462 (0.50 %)	170 (100.00 %)	4,650,016 (40.74 %)	1,547,220 (3.54 %)	12,918,125 (35.45 %)	23,253 (0.56 %)
347	house mouse (NZO_HlLtJ v3 2022) GCA_947593165.1	n/a	22,481 (1.93 %)	19,932 (1.26 %)	109,670 (4.03 %)	41.34 (100.00 %)	234 (0.00 %)	441 (100.00 %)	4,822,230 (45.92 %)	1,637,027 (11.19 %)	13,082,730 (41.04 %)	24,187 (0.54 %)
348	house mouse (primary hap 2023) GCA_949316315.1	n/a	22,351 (1.96 %)	19,629 (1.26 %)	n/a	41.38 (100.00 %)	101 (0.00 %)	179 (100.00 %)	4,774,018 (45.31 %)	1,620,102 (10.50 %)	13,181,250 (40.47 %)	23,955 (0.54 %)
349	house mouse C57BL/6J 2020 GRC GCF_000001635.27	136,224 (4.84 %)	22,409 (2.02 %)	19,480 (1.31 %)	140,725 (4.83 %)	41.67 (97.30 %)	334 (2.70 %)	22,273 (97.30 %)	5,361,085 (45.51 %)	1,641,063 (3.41 %)	12,722,791 (36.04 %)	23,794 (0.53 %)
350	house mouse C57BL_6NJ (2016) GCA_001632555.1	n/a	21,177 (2.23 %)	18,495 (1.42 %)	103,002 (4.20 %)	41.76 (82.53 %)	410,660 (17.53 %)	49,821 (96.37 %)	5,081,049 (40.22 %)	1,392,942 (2.58 %)	13,476,268 (25.21 %)	16,877 (0.39 %)
351	house mouse C57BL_6NJ (2022) GCA_921999865.2	n/a	21,817 (2.13 %)	19,349 (1.37 %)	n/a	41.79 (99.76 %)	1,127 (0.24 %)	214 (100.00 %)	4,661,104 (40.76 %)	1,552,079 (3.56 %)	12,953,662 (35.57 %)	23,204 (0.56 %)
352	humpback whale (KW2013002 2024) GCA_041834305.1	n/a	19,463 (1.32 %)	22,424 (1.19 %)	n/a	42.05 (100.00 %)	88 (0.00 %)	1,355 (100.00 %)	4,164,459 (34.02 %)	1,281,751 (18.33 %)	12,412,281 (48.28 %)	82,412 (1.67 %)
353	Iberian mole (v2.1 TD23 2020) GCF_014898055.3	56,986 (3.41 %)	18,431 (1.69 %)	20,317 (1.59 %)	n/a	41.89 (99.89 %)	3,575 (0.11 %)	3,202 (100.00 %)	2,635,974 (23.38 %)	496,514 (1.29 %)	10,969,546 (32.61 %)	47,466 (2.89 %)
354	Indian false vampire GCA_004026885.1	n/a	20,067 (1.37 %)	36,544 (1.53 %)	32,548 (1.37 %)	40.84 (99.83 %)	6,266 (0.02 %)	1,909,067 (99.98 %)	4,096,409 (31.50 %)	699,311 (1.81 %)	12,307,198 (39.96 %)	92,830 (3.12 %)
355	Indian flying fox GCF_902729225.1	64,763 (3.85 %)	18,222 (2.01 %)	23,187 (1.82 %)	45,389 (2.18 %)	39.83 (99.10 %)	17,500 (0.90 %)	16,113 (100.00 %)	2,972,300 (34.11 %)	487,157 (1.49 %)	12,486,528 (27.37 %)	57,869 (3.73 %)
356	Indian short-nosed fruit bat (CYSPWHU 2023) GCA_030015415.1	n/a	17,560 (2.04 %)	21,687 (1.83 %)	n/a	39.77 (100.00 %)	26 (0.00 %)	181 (100.00 %)	2,598,385 (30.48 %)	486,921 (1.41 %)	11,828,726 (27.28 %)	37,476 (5.58 %)
357	Indochinese shrew (US011 2019 Broad) GCA_004027635.1	n/a	18,870 (0.51 %)	55,636 (0.81 %)	n/a	39.81 (99.83 %)	5,267 (0.02 %)	2,420,679 (99.98 %)	4,130,068 (16.60 %)	1,663,335 (3.30 %)	18,728,711 (46.19 %)	31,453 (0.55 %)
358	Indus River dolphin GCA_004363435.1	n/a	24,321 (1.30 %)	47,065 (1.14 %)	n/a	41.72 (99.88 %)	11,702 (0.04 %)	1,110,492 (99.96 %)	5,093,308 (45.60 %)	845,860 (1.72 %)	13,162,111 (41.37 %)	68,257 (1.40 %)
359	Inner Mongolia cashmere goat (2024) GCA_041735815.1	n/a	19,123 (1.40 %)	21,508 (1.26 %)	n/a	43.19 (100.00 %)	n/a	31 (100.00 %)	3,982,368 (23.76 %)	650,129 (7.44 %)	12,858,872 (44.33 %)	99,144 (2.87 %)
360	intermediate horseshoe bat (China 20211001_DDa primary hap 2024) GCA_043728065.1	n/a	18,239 (1.76 %)	20,378 (1.53 %)	n/a	41.40 (100.00 %)	37 (0.00 %)	2,195 (100.00 %)	3,438,644 (42.82 %)	584,006 (9.54 %)	12,207,998 (35.49 %)	34,491 (1.02 %)
361	intermediate roundleaf bat (primary hap 2023) GCA_031876335.1	n/a	19,064 (1.67 %)	20,800 (1.49 %)	n/a	41.55 (100.00 %)	119 (0.00 %)	69 (100.00 %)	3,393,548 (30.92 %)	723,545 (6.58 %)	12,073,117 (35.40 %)	43,736 (1.20 %)
362	jaguar (BS21 2019) GCA_004023805.1	n/a	21,431 (1.51 %)	32,835 (1.35 %)	n/a	41.70 (99.89 %)	21,329 (0.09 %)	460,121 (99.91 %)	5,420,861 (43.75 %)	1,049,353 (1.93 %)	13,848,545 (34.90 %)	71,066 (2.37 %)
363	jaguar (hap1 2025) GCA_046562885.1	n/a	17,882 (1.68 %)	19,103 (1.41 %)	n/a	41.66 (100.00 %)	140 (0.00 %)	115 (100.00 %)	4,622,385 (41.25 %)	893,297 (1.89 %)	12,851,116 (33.53 %)	61,319 (2.55 %)
364	jaguar (hap2 2025) GCA_046562875.1	n/a	18,867 (1.64 %)	20,784 (1.40 %)	n/a	41.76 (100.00 %)	200 (0.00 %)	85 (100.00 %)	4,977,843 (41.75 %)	982,064 (2.10 %)	13,365,332 (34.16 %)	66,000 (2.75 %)
365	jaguar (Sample0147 2023) GCF_028533385.1	71,578 (4.12 %)	19,122 (1.67 %)	21,950 (1.36 %)	n/a	41.58 (99.31 %)	56,371 (0.70 %)	36,243 (100.00 %)	4,552,854 (33.37 %)	897,371 (1.63 %)	13,732,912 (32.89 %)	63,777 (2.41 %)
366	jaguarundi GCF_014898765.1	72,564 (3.15 %)	18,602 (1.64 %)	20,510 (1.39 %)	n/a	41.75 (97.85 %)	42,499 (2.16 %)	10,948 (100.00 %)	5,035,745 (43.29 %)	907,329 (1.61 %)	13,590,905 (33.57 %)	69,090 (2.29 %)
367	Jamaican fruit-eating bat (1a 2020 Wuhan U) GCF_014825515.1	48,692 (2.72 %)	19,921 (1.66 %)	23,614 (1.68 %)	39,384 (2.12 %)	41.95 (98.87 %)	110,840 (1.13 %)	56,740 (100.00 %)	2,972,388 (28.79 %)	405,474 (2.15 %)	12,458,880 (30.65 %)	61,973 (1.87 %)
368	Jamaican fruit-eating bat (2021) GCF_021234435.1	55,114 (3.18 %)	17,875 (1.68 %)	19,958 (1.66 %)	n/a	42.00 (100.00 %)	3 (0.00 %)	868 (100.00 %)	2,697,287 (28.17 %)	318,700 (0.84 %)	11,750,329 (31.61 %)	61,951 (1.93 %)
369	Japanese wild mouse (2022) GCA_921999095.2	n/a	23,292 (2.05 %)	20,114 (1.31 %)	n/a	41.71 (100.00 %)	397 (0.00 %)	1,449 (100.00 %)	4,952,306 (42.53 %)	1,635,456 (4.60 %)	12,838,321 (38.56 %)	24,168 (0.56 %)
370	Java mouse-deer (US108 2019 Broad) GCA_004024965.1	n/a	23,081 (1.38 %)	38,181 (1.41 %)	n/a	42.73 (99.91 %)	2,829 (0.01 %)	1,159,819 (99.99 %)	4,791,310 (34.97 %)	448,498 (1.92 %)	13,175,375 (39.89 %)	68,778 (2.92 %)
371	killer whale (2022) GCF_937001465.1	78,479 (3.76 %)	18,710 (1.51 %)	21,101 (1.30 %)	34,448 (1.49 %)	41.91 (100.00 %)	123 (0.00 %)	448 (100.00 %)	3,955,401 (36.81 %)	844,672 (9.94 %)	12,233,568 (41.63 %)	77,307 (3.08 %)
372	killer whale (alternate hap 2022) GCA_937001455.1	n/a	14,982 (1.50 %)	19,185 (1.30 %)	n/a	42.13 (100.00 %)	n/a	12,410 (100.00 %)	2,752,892 (35.61 %)	589,217 (10.15 %)	8,371,032 (41.11 %)	57,347 (3.41 %)
373	killer whale (Morgan 2013) GCF_000331955.2	70,972 (3.55 %)	18,736 (1.86 %)	20,365 (1.48 %)	n/a	41.35 (94.82 %)	78,441 (5.20 %)	80,100 (94.80 %)	3,978,339 (43.98 %)	555,737 (1.13 %)	12,773,973 (31.51 %)	61,145 (1.59 %)
374	koala (Bilbo 61053 2022) GCA_003287225.2	n/a	17,087 (0.81 %)	14,711 (0.86 %)	n/a	39.05 (100.00 %)	669 (0.00 %)	1,246 (100.00 %)	6,280,029 (29.77 %)	1,123,294 (2.02 %)	21,796,316 (39.24 %)	15,957 (0.35 %)
375	Kuhl's pipistrelle (2020) GCF_014108245.1	65,654 (3.37 %)	17,918 (1.89 %)	20,819 (1.86 %)	n/a	42.57 (99.31 %)	394 (0.69 %)	202 (100.00 %)	2,897,422 (23.58 %)	797,420 (2.76 %)	10,057,100 (34.56 %)	55,965 (2.99 %)
376	large flying fox GCF_000151845.1	52,243 (3.10 %)	18,454 (1.91 %)	23,631 (1.73 %)	n/a	39.82 (91.80 %)	189,340 (8.24 %)	225,433 (91.76 %)	3,117,045 (36.49 %)	504,277 (3.03 %)	13,025,556 (25.00 %)	78,404 (3.24 %)
377	large Japanese field mouse (IB14-021 2017) GCA_002335545.1	n/a	22,630 (1.74 %)	33,810 (1.26 %)	n/a	42.04 (57.78 %)	4,289,924 (42.35 %)	4,626,044 (57.65 %)	3,638,537 (31.76 %)	1,048,253 (1.87 %)	12,039,926 (16.61 %)	19,817 (0.34 %)
378	large tree shrew (BS70 2022) GCA_026018925.1	n/a	21,678 (1.34 %)	22,317 (1.25 %)	n/a	42.17 (100.00 %)	1,188 (0.00 %)	1,198 (100.00 %)	5,530,547 (22.20 %)	1,357,640 (10.13 %)	14,334,312 (46.09 %)	123,453 (2.17 %)
379	least weasel (hap1.1 2025) GCA_964662115.1	n/a	19,085 (1.11 %)	23,074 (1.09 %)	n/a	43.54 (99.98 %)	2,938 (0.02 %)	3,189 (100.00 %)	4,687,333 (25.05 %)	908,610 (10.98 %)	12,922,050 (49.64 %)	68,749 (2.22 %)
380	least weasel (hap2.1 2025) GCA_964662095.1	n/a	18,255 (1.29 %)	22,201 (1.27 %)	n/a	42.68 (99.98 %)	2,709 (0.02 %)	4,948 (99.98 %)	4,268,233 (27.47 %)	787,850 (6.40 %)	12,592,088 (42.54 %)	62,416 (2.34 %)
381	leopard (Hobbes primary hap 2022) GCF_024362965.1	70,501 (3.29 %)	18,472 (1.56 %)	20,388 (1.41 %)	n/a	41.75 (99.99 %)	335 (0.01 %)	382 (100.00 %)	4,634,038 (33.80 %)	932,991 (2.25 %)	13,686,652 (34.03 %)	65,793 (2.64 %)
382	leopard (Maewha 2016 refseq) GCF_001857705.1	73,279 (3.20 %)	18,881 (1.63 %)	21,010 (1.44 %)	n/a	41.71 (96.17 %)	214,953 (3.85 %)	265,330 (96.15 %)	5,247,029 (42.87 %)	1,059,446 (5.13 %)	14,265,573 (32.20 %)	77,001 (2.45 %)
383	leopard cat GCF_016509475.1	59,965 (3.05 %)	18,472 (1.65 %)	19,934 (1.38 %)	n/a	41.80 (100.00 %)	56 (0.00 %)	123 (100.00 %)	4,978,115 (43.28 %)	901,754 (1.84 %)	13,596,535 (34.23 %)	67,390 (2.50 %)
384	Leschenault's rousette (2020) GCA_015472975.1	n/a	17,815 (2.05 %)	23,917 (1.90 %)	n/a	40.13 (99.14 %)	100,669 (0.88 %)	108,810 (99.12 %)	2,688,705 (31.20 %)	428,968 (1.19 %)	12,245,385 (26.51 %)	58,118 (6.81 %)
385	lesser Egyptian jerboa (2021) GCF_020740685.1	51,730 (1.99 %)	20,129 (1.24 %)	22,089 (1.24 %)	40,414 (1.76 %)	42.00 (99.52 %)	561 (0.48 %)	160 (100.00 %)	7,346,291 (41.25 %)	1,187,587 (2.92 %)	14,222,177 (44.13 %)	34,688 (0.86 %)
386	lesser Egyptian jerboa (alternate hap 2021) GCA_020740715.1	n/a	17,777 (1.27 %)	19,232 (1.28 %)	n/a	42.13 (92.75 %)	2,875 (7.25 %)	508 (100.00 %)	6,476,967 (33.93 %)	999,133 (2.78 %)	11,809,834 (40.52 %)	29,872 (0.82 %)
387	lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 refseq) GCF_000280705.1	25,978 (1.44 %)	19,408 (1.38 %)	20,312 (1.35 %)	n/a	41.87 (87.17 %)	326,464 (12.87 %)	337,360 (87.13 %)	6,125,934 (38.31 %)	832,825 (1.53 %)	13,661,612 (33.98 %)	26,669 (0.59 %)
388	lesser false vampire bat (Vietnam 20211001_DDb primary hap 2024) GCA_043880595.1	n/a	18,484 (1.87 %)	24,356 (1.84 %)	n/a	41.88 (97.91 %)	866 (2.09 %)	617 (99.68 %)	3,419,622 (36.65 %)	663,182 (2.53 %)	11,508,574 (30.58 %)	84,174 (4.85 %)
389	lesser horseshoe bat (hap1 2024) GCA_964194185.1	n/a	19,031 (1.88 %)	21,003 (1.63 %)	n/a	40.81 (99.99 %)	1,627 (0.01 %)	723 (100.00 %)	3,133,745 (33.46 %)	660,064 (3.79 %)	11,720,176 (32.32 %)	35,414 (1.75 %)
390	lesser horseshoe bat (hap2 2024) GCA_964194215.1	n/a	18,875 (1.72 %)	21,166 (1.58 %)	n/a	41.18 (99.99 %)	1,648 (0.01 %)	2,727 (99.99 %)	3,160,659 (34.00 %)	696,130 (6.23 %)	11,662,645 (34.26 %)	36,176 (1.80 %)
391	lesser noctule (v2 hap1 2025) GCA_964264875.2	n/a	18,342 (1.54 %)	22,974 (1.62 %)	n/a	43.04 (100.00 %)	302 (0.00 %)	588 (100.00 %)	4,258,096 (37.31 %)	1,289,911 (11.51 %)	9,694,758 (42.52 %)	65,974 (2.80 %)
392	lesser noctule (v2 hap2 2025) GCA_964264895.2	n/a	17,492 (1.62 %)	22,188 (1.72 %)	n/a	43.10 (100.00 %)	247 (0.00 %)	920 (100.00 %)	3,886,341 (36.52 %)	1,139,308 (10.89 %)	9,356,457 (40.65 %)	62,254 (3.00 %)
393	lesser panda (RP43 2017) GCA_002007465.1	n/a	19,120 (1.69 %)	20,591 (1.50 %)	n/a	41.60 (98.56 %)	137,333 (1.45 %)	148,922 (98.55 %)	4,513,888 (40.87 %)	692,778 (1.62 %)	13,691,859 (31.36 %)	64,369 (2.52 %)
394	lesser sac-winged bat (primary hap 2024 refseq) GCF_036850995.1	53,210 (2.49 %)	18,323 (1.42 %)	21,350 (1.39 %)	n/a	41.84 (99.24 %)	573 (0.76 %)	168 (100.00 %)	4,224,344 (28.69 %)	1,030,576 (2.60 %)	12,591,989 (42.30 %)	98,189 (2.06 %)
395	lion GCF_018350215.1	67,745 (2.86 %)	17,956 (1.69 %)	19,033 (1.40 %)	61,242 (3.04 %)	41.71 (100.00 %)	55 (0.00 %)	99 (100.00 %)	4,666,951 (42.23 %)	889,987 (1.87 %)	13,151,686 (33.40 %)	62,675 (2.56 %)
396	little brown bat GCF_000147115.1	50,660 (2.76 %)	19,314 (1.86 %)	22,683 (1.70 %)	n/a	42.50 (96.66 %)	61,131 (3.35 %)	72,785 (96.65 %)	3,682,263 (37.05 %)	634,854 (2.15 %)	10,841,759 (33.45 %)	57,630 (1.79 %)
397	little pocket mouse (longimembris alternate hap 2022) GCA_024363435.1	n/a	19,150 (1.52 %)	23,435 (1.64 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	229 (0.00 %)	718 (100.00 %)	n/a	1,051,300 (12.43 %)	9,858,628 (43.20 %)	48,101 (2.62 %)
398	little pocket mouse (longimembris primary hap 2022) GCA_024363575.1	n/a	19,760 (1.50 %)	24,317 (1.63 %)	n/a	42.09 (100.00 %)	215 (0.00 %)	1,135 (100.00 %)	3,913,744 (28.43 %)	1,095,577 (12.70 %)	10,273,833 (43.74 %)	49,636 (2.61 %)
399	little tube-nosed bat GCA_004026665.1	n/a	22,009 (1.26 %)	45,725 (1.35 %)	n/a	43.80 (99.90 %)	6,795 (0.03 %)	886,972 (99.97 %)	3,372,804 (23.57 %)	1,014,476 (3.00 %)	11,948,592 (41.18 %)	71,530 (2.05 %)
400	long-finned pilot whale (v2 primary hap 2024 refseq) GCF_963455315.2	61,447 (2.80 %)	18,725 (1.51 %)	20,946 (1.39 %)	n/a	42.38 (99.99 %)	1,084 (0.01 %)	2,076 (99.99 %)	4,125,452 (35.62 %)	1,577,896 (12.03 %)	12,347,170 (42.01 %)	71,822 (5.51 %)
401	long-finned pilot whale (X-22926-18 2019) GCF_006547405.1	66,117 (3.28 %)	18,772 (1.80 %)	21,031 (1.46 %)	33,672 (1.78 %)	41.29 (99.58 %)	14,859 (0.42 %)	20,999 (99.58 %)	3,962,125 (45.58 %)	557,247 (1.11 %)	12,616,535 (34.70 %)	62,905 (1.69 %)
402	long-tailed chinchilla GCF_000276665.1	54,854 (2.98 %)	18,096 (1.59 %)	19,514 (1.52 %)	n/a	41.06 (95.56 %)	78,817 (4.46 %)	81,656 (95.54 %)	4,018,866 (30.94 %)	607,082 (1.15 %)	13,528,234 (28.15 %)	46,931 (1.25 %)
403	long-tongued fruit bat (US102 2019 Broad) GCA_004027375.1	n/a	19,208 (1.99 %)	31,180 (1.92 %)	n/a	39.56 (99.97 %)	2,056 (0.01 %)	174,041 (99.99 %)	2,893,453 (32.61 %)	597,516 (1.76 %)	12,093,608 (28.14 %)	63,015 (4.70 %)
404	Lowland paca GCA_004365215.1	n/a	21,953 (0.62 %)	56,356 (0.80 %)	n/a	40.83 (99.78 %)	3,060 (0.01 %)	3,771,510 (99.99 %)	5,892,507 (29.20 %)	802,811 (1.38 %)	18,630,883 (38.61 %)	61,715 (0.94 %)
405	Malayan pangolin (MJ-LG 2024) GCF_040802235.1	87,404 (4.24 %)	18,382 (1.54 %)	19,802 (1.30 %)	n/a	41.03 (100.00 %)	90 (0.00 %)	63 (100.00 %)	3,146,889 (38.39 %)	384,539 (2.15 %)	12,642,995 (34.68 %)	48,454 (1.30 %)
406	Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 refseq) GCF_001685135.1	48,591 (2.76 %)	19,458 (1.57 %)	24,783 (1.38 %)	41,272 (1.95 %)	40.78 (92.27 %)	984,658 (7.81 %)	80,670 (100.00 %)	3,064,599 (35.21 %)	866,309 (3.08 %)	13,310,859 (28.76 %)	35,558 (0.84 %)
407	Malayan pangolin YNU ManJav 2.0 GCF_014570535.1	68,043 (3.50 %)	18,167 (1.72 %)	20,453 (1.54 %)	n/a	40.83 (91.78 %)	57,746 (8.23 %)	17,969 (100.00 %)	2,864,567 (34.23 %)	277,996 (1.69 %)	12,659,207 (25.72 %)	33,486 (1.00 %)
408	marsupial mole (Waite Creek area ABTC07570 2025) GCA_048126345.1	n/a	25,281 (0.80 %)	18,740 (0.87 %)	n/a	37.80 (99.99 %)	196 (0.01 %)	889 (99.99 %)	6,538,990 (26.08 %)	1,450,668 (2.40 %)	21,374,371 (47.19 %)	17,923 (0.30 %)
409	Masai giraffe (MA1 2016 Penn St) GCA_001651235.1	n/a	20,950 (1.52 %)	28,854 (1.33 %)	n/a	41.39 (96.50 %)	257,672 (3.48 %)	770,838 (96.52 %)	5,502,479 (43.94 %)	531,418 (2.64 %)	13,936,018 (36.18 %)	40,504 (1.02 %)
410	meadow jumping mouse GCA_004024765.1	n/a	22,236 (1.08 %)	44,719 (1.21 %)	n/a	42.31 (99.88 %)	7,610 (0.03 %)	1,165,710 (99.97 %)	6,135,446 (33.31 %)	1,525,146 (3.34 %)	13,854,475 (39.91 %)	26,633 (0.68 %)
411	meadow vole (hap1 2024 genbank) GCA_037038515.1	n/a	19,134 (1.78 %)	20,672 (1.55 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	60 (0.00 %)	181 (100.00 %)	4,818,689 (41.90 %)	962,362 (4.16 %)	12,161,222 (34.42 %)	23,781 (0.74 %)
412	meadow vole (hap1 2024 refseq) GCF_037038515.1	56,969 (2.88 %)	19,974 (1.74 %)	20,672 (1.55 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	60 (0.00 %)	180 (100.00 %)	4,116,239 (33.62 %)	962,362 (4.16 %)	12,161,153 (34.42 %)	23,781 (0.74 %)
413	meadow vole (hap2 2024) GCA_037039175.1	n/a	19,001 (1.82 %)	20,271 (1.68 %)	n/a	42.58 (100.00 %)	53 (0.00 %)	143 (100.00 %)	3,141,368 (21.37 %)	898,900 (4.24 %)	11,475,531 (32.14 %)	22,186 (0.75 %)
414	meerkat (VVHF042 2019 DNA Zoo refseq) GCF_006229205.1	58,806 (2.67 %)	19,009 (1.64 %)	19,088 (1.36 %)	n/a	41.68 (99.72 %)	65,245 (0.28 %)	63,791 (100.00 %)	4,564,931 (40.13 %)	634,179 (1.21 %)	13,631,635 (32.17 %)	64,858 (2.22 %)
415	Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 alternate hap 2022) GCA_024711525.1	n/a	18,555 (1.22 %)	24,508 (1.35 %)	n/a	42.04 (100.00 %)	181 (0.00 %)	3,482 (100.00 %)	6,419,007 (53.84 %)	1,384,128 (15.63 %)	11,486,822 (50.51 %)	38,521 (1.60 %)
416	Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022) GCA_024711535.1	n/a	21,281 (1.16 %)	28,592 (1.34 %)	n/a	42.27 (100.00 %)	182 (0.00 %)	4,354 (100.00 %)	4,378,955 (29.66 %)	1,568,842 (17.75 %)	12,889,786 (51.96 %)	46,167 (1.71 %)
417	Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022) GCF_024711535.1	68,331 (2.37 %)	21,280 (1.16 %)	28,582 (1.34 %)	n/a	42.27 (100.00 %)	182 (0.00 %)	4,535 (100.00 %)	4,378,949 (29.66 %)	1,568,842 (17.75 %)	12,889,725 (51.96 %)	46,167 (1.71 %)
418	Merriam's long-tongued bat (hap1 2024) GCA_039655065.1	n/a	18,172 (1.67 %)	20,736 (1.60 %)	n/a	42.19 (100.00 %)	47 (0.00 %)	82 (100.00 %)	2,998,913 (29.48 %)	418,833 (1.07 %)	11,783,716 (32.96 %)	65,956 (4.38 %)
419	Merriam's long-tongued bat (hap2 2024) GCA_039656995.1	n/a	18,105 (1.68 %)	20,751 (1.60 %)	n/a	42.18 (100.00 %)	45 (0.00 %)	71 (100.00 %)	2,994,788 (29.48 %)	415,375 (1.07 %)	11,752,432 (32.88 %)	65,597 (4.38 %)
420	Mexican gray wolf (hap1 2025 refseq) GCF_048164855.1	112,768 (4.40 %)	19,582 (1.52 %)	20,911 (1.39 %)	n/a	41.56 (100.00 %)	167 (0.00 %)	249 (100.00 %)	4,598,813 (31.70 %)	1,102,136 (4.40 %)	13,591,364 (35.18 %)	53,470 (2.24 %)
421	Mexican gray wolf (hap2 2025) GCA_048164845.1	n/a	18,738 (1.56 %)	19,759 (1.41 %)	n/a	41.58 (100.00 %)	124 (0.00 %)	155 (100.00 %)	4,265,479 (32.40 %)	1,030,876 (4.11 %)	12,818,772 (34.22 %)	50,269 (2.22 %)
422	minke whale (2013 refseq) GCF_000493695.1	42,553 (2.38 %)	19,159 (1.73 %)	18,656 (1.42 %)	n/a	40.94 (94.06 %)	173,296 (5.96 %)	184,072 (94.04 %)	n/a	573,951 (1.48 %)	13,504,347 (30.96 %)	65,448 (1.38 %)
423	minke whale (alternate hap 2023) GCA_950005055.1	n/a	20,412 (1.46 %)	27,421 (1.34 %)	n/a	41.50 (100.00 %)	1 (0.00 %)	21,272 (100.00 %)	3,811,435 (36.24 %)	959,712 (10.27 %)	12,159,896 (41.30 %)	69,852 (1.62 %)
424	minke whale (primary hap 2023 refseq) GCF_949987535.1	61,711 (2.51 %)	19,550 (1.49 %)	21,499 (1.26 %)	n/a	41.55 (99.99 %)	1,177 (0.01 %)	1,374 (100.00 %)	4,006,927 (35.92 %)	1,058,105 (12.08 %)	12,708,103 (42.66 %)	72,756 (1.59 %)
425	Mongolian gerbil (243 2017 Lucigen Corp.) GCF_002204375.1	40,359 (2.29 %)	21,215 (1.83 %)	24,305 (1.47 %)	n/a	42.09 (95.23 %)	91,601 (4.78 %)	68,793 (100.00 %)	4,821,343 (37.74 %)	940,776 (1.82 %)	13,848,274 (31.31 %)	24,154 (0.74 %)
426	Mongolian gerbil (EAM2014 2019 BGI) GCA_008131255.1	n/a	19,952 (1.59 %)	23,462 (1.36 %)	n/a	41.98 (99.01 %)	103,843 (0.97 %)	412,933 (99.03 %)	5,009,454 (0.00 %)	1,042,929 (2.52 %)	14,121,194 (34.63 %)	26,044 (0.71 %)
427	Mongolian gerbil (TT.TT164.6M 2023) GCF_030254825.1	65,502 (2.97 %)	19,045 (1.53 %)	20,203 (1.29 %)	n/a	41.87 (100.00 %)	53 (0.00 %)	193 (100.00 %)	4,477,607 (37.21 %)	1,124,432 (5.22 %)	13,244,320 (39.20 %)	25,300 (0.76 %)
428	monito del monte (mDroGli1 alternate hap 2021) GCA_019395325.1	n/a	16,419 (0.77 %)	17,219 (0.89 %)	n/a	39.03 (100.00 %)	33 (0.00 %)	9,959 (100.00 %)	6,332,360 (29.69 %)	1,065,454 (2.09 %)	17,908,986 (42.25 %)	13,856 (0.35 %)
429	monito del monte (primary hap 2021 refseq) GCF_019393635.1	47,034 (2.02 %)	18,399 (0.80 %)	15,519 (0.85 %)	n/a	39.11 (99.91 %)	260 (0.09 %)	17 (100.00 %)	9,107,968 (41.08 %)	1,249,635 (2.12 %)	21,135,324 (42.80 %)	16,598 (0.36 %)
430	Montane guinea pig GCA_004027695.1	n/a	20,064 (1.06 %)	31,321 (1.18 %)	39,905 (1.42 %)	40.09 (99.88 %)	11,321 (0.04 %)	1,379,500 (99.96 %)	4,730,634 (30.02 %)	1,583,664 (6.57 %)	15,806,339 (40.40 %)	37,371 (0.76 %)
431	moose/elk (2024) GCA_964270355.1	n/a	19,816 (1.60 %)	22,341 (1.44 %)	n/a	41.70 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1,737 (100.00 %)	3,099,775 (24.20 %)	406,796 (2.52 %)	13,117,056 (38.34 %)	50,644 (1.33 %)
432	moose/elk (AALL_1980 2023) GCA_015832495.2	n/a	19,116 (1.66 %)	21,184 (1.45 %)	n/a	41.55 (95.50 %)	71,769 (4.51 %)	77,708 (95.49 %)	3,026,678 (23.77 %)	373,266 (0.91 %)	13,167,376 (34.08 %)	44,302 (1.21 %)
433	moose/elk (MIG12-28694850 2019) GCA_007570765.1	n/a	21,375 (1.65 %)	26,769 (1.42 %)	n/a	41.64 (92.66 %)	83,831 (7.35 %)	131,373 (92.65 %)	5,022,053 (43.27 %)	384,658 (1.22 %)	13,422,381 (34.52 %)	49,216 (1.18 %)
434	mountain beaver GCA_004027875.1	n/a	22,428 (1.10 %)	38,670 (1.12 %)	n/a	40.58 (99.89 %)	7,253 (0.02 %)	1,286,779 (99.98 %)	5,859,004 (32.29 %)	914,052 (2.37 %)	16,249,666 (38.21 %)	39,133 (0.76 %)
435	muskrat GCA_004026605.1	n/a	22,540 (1.52 %)	32,136 (1.35 %)	n/a	41.59 (99.93 %)	6,243 (0.02 %)	571,599 (99.98 %)	4,437,736 (28.49 %)	922,826 (2.38 %)	13,945,732 (35.23 %)	19,876 (0.50 %)
436	naked mole-rat (2022) GCA_944319725.1	n/a	20,755 (1.51 %)	20,024 (1.35 %)	n/a	39.98 (99.96 %)	2,332 (0.04 %)	264 (100.00 %)	3,593,261 (30.76 %)	529,045 (1.14 %)	13,294,831 (36.07 %)	32,235 (0.93 %)
437	naked mole-rat (MEF-2018 2020) GCA_014060925.1	n/a	22,011 (1.30 %)	21,392 (1.22 %)	n/a	40.13 (95.11 %)	139,535 (4.91 %)	148,797 (95.09 %)	4,885,102 (35.91 %)	654,418 (1.90 %)	16,401,315 (34.21 %)	40,717 (0.98 %)
438	naked mole-rat (NMR 29 2012 refseq) GCF_000247695.1	74,587 (3.56 %)	21,332 (1.74 %)	20,861 (1.51 %)	n/a	40.21 (88.43 %)	110,424 (11.59 %)	114,653 (88.41 %)	4,179,991 (32.69 %)	484,933 (0.92 %)	13,672,561 (27.63 %)	31,950 (0.88 %)
439	narwhal (Baffin Bay 2019) GCF_005190385.1	51,639 (2.71 %)	18,741 (1.78 %)	20,365 (1.40 %)	33,148 (1.79 %)	41.22 (99.52 %)	18,323 (0.49 %)	6,972 (100.00 %)	4,011,742 (43.97 %)	565,367 (1.22 %)	12,720,018 (34.85 %)	60,492 (1.58 %)
440	narwhal (Baffin Bay Population NGI 2022) GCA_005190385.3	n/a	18,681 (1.79 %)	19,816 (1.40 %)	n/a	41.26 (100.00 %)	313 (0.00 %)	101 (100.00 %)	3,618,235 (37.24 %)	612,229 (1.52 %)	12,641,632 (35.02 %)	60,518 (1.78 %)
441	Natal long-fingered bat GCF_001595765.1	32,050 (3.03 %)	18,015 (2.17 %)	18,293 (1.87 %)	n/a	42.07 (96.24 %)	204,616 (3.79 %)	1,269 (100.00 %)	2,565,457 (28.95 %)	376,532 (1.91 %)	10,427,823 (26.35 %)	63,261 (2.07 %)
442	Nathusius's pipistrelle (hap1.1 2025) GCA_964656225.1	n/a	18,001 (1.75 %)	21,219 (1.77 %)	n/a	42.26 (99.98 %)	1,836 (0.02 %)	1,062 (100.00 %)	3,664,854 (32.90 %)	906,692 (8.55 %)	10,164,440 (37.98 %)	56,705 (2.75 %)
443	Nathusius's pipistrelle (hap2.1 2025) GCA_964656075.1	n/a	17,899 (1.71 %)	20,808 (1.69 %)	n/a	42.15 (99.98 %)	1,832 (0.02 %)	2,485 (99.98 %)	3,637,576 (31.92 %)	930,013 (11.25 %)	9,967,930 (39.61 %)	56,237 (2.62 %)
444	Nathusius's pipistrelle (primary hap 2024) GCA_963693515.1	n/a	17,944 (1.86 %)	20,545 (1.83 %)	n/a	42.45 (100.00 %)	263 (0.00 %)	154 (100.00 %)	3,628,328 (34.57 %)	838,723 (4.04 %)	10,155,601 (35.22 %)	56,332 (2.92 %)
445	Natterer's bat (hap1.2 2025) GCA_964212035.2	n/a	19,475 (1.82 %)	22,424 (1.68 %)	n/a	43.15 (100.00 %)	225 (0.00 %)	212 (100.00 %)	3,841,654 (38.99 %)	801,041 (5.78 %)	10,278,311 (38.66 %)	64,639 (2.57 %)
446	Natterer's bat (hap2.2 2025) GCA_964212025.2	n/a	18,368 (1.91 %)	21,701 (1.80 %)	n/a	43.27 (100.00 %)	136 (0.00 %)	309 (100.00 %)	3,509,151 (38.16 %)	704,537 (5.21 %)	9,806,703 (36.74 %)	61,004 (2.65 %)
447	neotropical fruit bat GCF_014824575.2	49,109 (2.78 %)	17,703 (1.63 %)	19,389 (1.60 %)	n/a	42.32 (99.79 %)	38,675 (0.21 %)	26,068 (100.00 %)	2,862,405 (29.31 %)	366,960 (1.48 %)	11,796,203 (31.27 %)	59,091 (1.70 %)
448	Nilgiri tahr GCA_004026825.1	n/a	22,735 (1.44 %)	34,961 (1.27 %)	n/a	42.37 (99.93 %)	10,387 (0.04 %)	479,550 (99.96 %)	5,793,761 (48.50 %)	535,297 (1.34 %)	13,378,352 (42.46 %)	57,653 (1.29 %)
449	nine-banded armadillo (v2 hap1 2023) GCA_030445055.2	n/a	19,350 (1.07 %)	22,207 (1.07 %)	n/a	40.97 (99.27 %)	823 (0.73 %)	588 (100.00 %)	4,330,716 (32.85 %)	661,966 (1.52 %)	18,302,021 (42.22 %)	130,245 (2.79 %)
450	nine-banded armadillo (v2 hap2 2023) GCF_030445035.2	72,174 (2.47 %)	21,051 (1.11 %)	24,418 (1.07 %)	n/a	41.00 (99.67 %)	793 (0.33 %)	546 (100.00 %)	5,412,063 (53.31 %)	738,320 (2.02 %)	19,755,423 (43.69 %)	142,597 (2.85 %)
451	nine-banded armadillo (v3.2 3-136 2012 Baylor) GCF_000208655.3	46,110 (1.87 %)	20,820 (1.08 %)	25,226 (1.08 %)	n/a	40.77 (90.89 %)	268,437 (9.13 %)	314,788 (90.87 %)	4,552,770 (34.01 %)	651,225 (1.26 %)	19,266,969 (38.27 %)	139,490 (2.47 %)
452	North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 alternate hap 2022) GCA_026167925.1	n/a	19,342 (1.57 %)	20,947 (1.48 %)	n/a	42.40 (100.00 %)	229 (0.00 %)	1,006 (100.00 %)	4,161,568 (23.13 %)	1,278,205 (8.22 %)	13,148,019 (37.60 %)	23,523 (0.71 %)
453	North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 primary hap 2022) GCA_026229955.1	n/a	19,700 (1.54 %)	22,354 (1.46 %)	n/a	42.19 (100.00 %)	244 (0.00 %)	2,082 (100.00 %)	6,089,884 (47.99 %)	1,358,786 (9.39 %)	13,799,349 (39.08 %)	24,733 (0.70 %)
454	North American porcupine (mEreDor1 alternate hap 2023) GCA_028500835.1	n/a	15,210 (1.55 %)	18,316 (1.43 %)	n/a	41.06 (100.00 %)	1 (0.00 %)	5,051 (100.00 %)	3,911,633 (40.55 %)	565,546 (1.54 %)	10,853,726 (32.61 %)	40,925 (1.35 %)
455	North American porcupine (mEreDor1 primary hap 2023) GCA_028451465.1	n/a	18,102 (1.58 %)	20,073 (1.40 %)	n/a	41.03 (100.00 %)	277 (0.00 %)	116 (100.00 %)	4,958,089 (41.64 %)	719,163 (1.59 %)	13,867,662 (33.89 %)	51,299 (1.36 %)
456	North Atlantic right whale (hap1 2023) GCA_028571275.1	n/a	18,699 (1.61 %)	20,354 (1.28 %)	n/a	41.64 (99.84 %)	385 (0.16 %)	947 (100.00 %)	3,815,900 (43.46 %)	718,935 (11.38 %)	11,928,210 (42.25 %)	85,881 (1.90 %)
457	North Atlantic right whale (hap2 + XY 2023 refseq) GCF_028564815.1	49,646 (1.86 %)	19,562 (1.46 %)	21,631 (1.25 %)	n/a	41.69 (99.83 %)	367 (0.17 %)	789 (100.00 %)	1,368,536 (2.24 %)	841,303 (13.08 %)	12,527,582 (43.92 %)	94,259 (1.92 %)
458	North Pacific right whale GCA_004363455.1	n/a	23,145 (1.43 %)	38,161 (1.21 %)	n/a	41.15 (99.88 %)	7,094 (0.03 %)	1,361,057 (99.97 %)	5,039,622 (45.69 %)	694,986 (1.31 %)	14,063,101 (40.51 %)	74,800 (1.52 %)
459	northern American river otter GCF_010015895.1	53,945 (2.18 %)	18,974 (1.68 %)	21,247 (1.45 %)	n/a	41.41 (99.58 %)	7,620 (0.42 %)	13,541 (99.58 %)	4,538,847 (41.18 %)	685,281 (1.20 %)	13,840,953 (32.61 %)	53,559 (1.88 %)
460	northern bat (alternate hap 2023) GCA_951640545.1	n/a	18,343 (1.80 %)	23,253 (1.77 %)	n/a	43.55 (100.00 %)	3 (0.00 %)	4,899 (100.00 %)	1,174,241 (2.96 %)	825,170 (5.11 %)	9,889,579 (36.12 %)	76,164 (3.52 %)
461	northern bat (primary hap 2023) GCA_951640355.1	n/a	18,636 (1.75 %)	21,446 (1.68 %)	n/a	43.32 (99.99 %)	1,423 (0.01 %)	207 (100.00 %)	1,259,729 (2.95 %)	905,676 (6.25 %)	10,554,535 (38.21 %)	77,656 (3.27 %)
462	northern black mastiff bat (mMolNig1 2022) GCA_026936385.1	n/a	18,924 (1.53 %)	22,934 (1.58 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	199 (0.00 %)	146 (100.00 %)	3,850,624 (31.21 %)	648,359 (3.76 %)	11,788,702 (39.25 %)	85,908 (2.60 %)
463	northern black mastiff bat (mMolNig1hap1 2024) GCA_039880945.1	n/a	18,933 (1.44 %)	23,629 (1.50 %)	n/a	42.60 (100.00 %)	113 (0.00 %)	366 (100.00 %)	4,027,155 (30.73 %)	712,278 (5.22 %)	12,003,034 (41.58 %)	96,116 (3.02 %)
464	northern black mastiff bat (mMolNig1hap2 2024) GCA_039880925.1	n/a	18,305 (1.49 %)	22,534 (1.56 %)	n/a	42.75 (100.00 %)	80 (0.00 %)	282 (100.00 %)	3,783,543 (30.10 %)	656,592 (4.68 %)	11,353,707 (40.26 %)	92,041 (3.01 %)
465	northern bottlenose whale (alternate hap 2023) GCA_949752845.1	n/a	19,537 (1.44 %)	27,826 (1.30 %)	n/a	41.67 (100.00 %)	n/a	23,401 (100.00 %)	3,634,923 (35.56 %)	672,860 (11.00 %)	11,175,398 (41.72 %)	62,007 (1.94 %)
466	northern bottlenose whale (primary hap 2023) GCA_949752795.1	n/a	19,073 (1.44 %)	20,821 (1.21 %)	n/a	41.81 (99.99 %)	1,098 (0.01 %)	757 (100.00 %)	3,997,911 (34.76 %)	769,275 (14.94 %)	12,133,820 (44.83 %)	67,258 (2.00 %)
467	northern elephant seal (BS05 2019 Broad) GCA_004023865.1	n/a	22,834 (1.54 %)	36,083 (1.32 %)	n/a	41.52 (99.94 %)	9,483 (0.04 %)	330,739 (99.96 %)	4,849,944 (43.83 %)	600,306 (1.16 %)	13,420,049 (34.43 %)	57,236 (1.62 %)
468	northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 genbank) GCA_029215605.1	n/a	19,278 (1.60 %)	19,908 (1.39 %)	n/a	41.84 (100.00 %)	98 (0.00 %)	596 (100.00 %)	4,348,333 (34.40 %)	621,985 (2.21 %)	13,251,768 (35.32 %)	69,898 (2.38 %)
469	Northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 refseq) GCF_029215605.1	74,106 (3.88 %)	19,277 (1.60 %)	20,000 (1.36 %)	n/a	41.84 (100.00 %)	98 (0.00 %)	595 (100.00 %)	4,348,327 (34.40 %)	621,980 (2.21 %)	13,251,706 (35.32 %)	69,897 (2.38 %)
470	northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap2 2023) GCA_029215635.1	n/a	19,340 (1.59 %)	19,732 (1.37 %)	n/a	41.91 (100.00 %)	60 (0.00 %)	482 (100.00 %)	4,365,070 (34.26 %)	627,639 (2.43 %)	13,174,494 (35.47 %)	74,314 (2.49 %)
471	northern elephant seal (v3 JK_09032017 2022) GCF_021288785.2	53,819 (3.32 %)	20,099 (1.75 %)	20,957 (1.35 %)	n/a	41.51 (99.35 %)	39,936 (0.65 %)	142,455 (100.00 %)	4,368,400 (33.93 %)	588,877 (1.19 %)	13,745,426 (32.96 %)	52,064 (1.59 %)
472	northern fur seal GCF_003265705.1	54,953 (2.43 %)	23,408 (1.78 %)	23,666 (1.43 %)	52,089 (2.17 %)	41.48 (98.01 %)	38,666 (1.99 %)	52,469 (98.01 %)	5,047,032 (43.38 %)	638,130 (1.06 %)	14,922,442 (33.12 %)	57,281 (1.44 %)
473	northern fur seal (GAN/ISIS: 27379988/994484 2025) GCF_003265705.2	71,169 (3.14 %)	21,276 (1.78 %)	21,276 (1.42 %)	n/a	41.44 (98.05 %)	30,369 (1.95 %)	43,734 (98.05 %)	4,118,994 (34.95 %)	578,801 (1.07 %)	13,530,999 (33.27 %)	51,258 (1.43 %)
474	northern gundi (hap1 2025) GCA_048771875.1	n/a	16,996 (1.51 %)	21,787 (1.66 %)	n/a	42.28 (100.00 %)	117 (0.00 %)	535 (100.00 %)	3,293,772 (27.51 %)	602,403 (3.02 %)	11,827,700 (30.64 %)	44,220 (1.55 %)
475	northern gundi (hap2 2025) GCA_048771865.1	n/a	17,037 (1.43 %)	21,690 (1.55 %)	n/a	42.88 (100.00 %)	115 (0.00 %)	1,031 (100.00 %)	3,527,940 (26.81 %)	646,620 (6.32 %)	11,343,462 (34.09 %)	47,125 (1.51 %)
476	northern gundi (US049 2019) GCA_004027205.1	n/a	18,035 (1.39 %)	27,379 (1.57 %)	n/a	42.68 (99.91 %)	5,037 (0.02 %)	865,110 (99.98 %)	4,149,883 (27.83 %)	654,063 (1.64 %)	12,342,565 (33.72 %)	47,533 (1.43 %)
477	northern mole vole GCA_001685095.1	n/a	23,252 (1.39 %)	44,209 (1.25 %)	n/a	41.68 (99.04 %)	371,627 (0.98 %)	722,087 (99.02 %)	3,923,814 (25.79 %)	898,453 (2.47 %)	13,708,986 (29.04 %)	16,583 (0.36 %)
478	northern white rhinoceros GCA_004027795.1	n/a	25,328 (1.34 %)	61,003 (1.95 %)	n/a	41.32 (99.90 %)	7,054 (0.03 %)	949,480 (99.97 %)	4,330,882 (38.89 %)	484,754 (1.12 %)	15,544,248 (33.11 %)	43,689 (2.08 %)
479	northern woolly horseshoe bat (20210929_DDc primary hap 2024) GCA_043748575.1	n/a	18,475 (1.82 %)	19,990 (1.56 %)	n/a	40.72 (100.00 %)	63 (0.00 %)	68 (100.00 %)	3,507,612 (39.92 %)	711,081 (2.15 %)	11,788,205 (32.17 %)	35,670 (1.25 %)
480	Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 genbank) GCA_036323735.1	114,725 (42.69 %)	21,917 (1.75 %)	19,476 (1.26 %)	n/a	41.82 (99.86 %)	220 (0.14 %)	77 (100.00 %)	4,700,726 (39.99 %)	1,603,005 (5.45 %)	13,451,813 (38.68 %)	20,118 (0.44 %)
481	Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 refseq) GCF_036323735.1	114,725 (5.38 %)	21,870 (1.74 %)	19,989 (1.27 %)	n/a	41.82 (99.86 %)	220 (0.14 %)	76 (100.00 %)	5,294,185 (42.75 %)	1,603,005 (5.45 %)	13,451,760 (38.68 %)	20,118 (0.44 %)
482	Norway rat (F344/Stm 2024) GCA_041222355.1	n/a	21,764 (1.78 %)	20,141 (1.30 %)	n/a	41.87 (99.96 %)	234 (0.04 %)	120 (100.00 %)	4,636,987 (39.98 %)	1,579,595 (5.22 %)	13,544,768 (38.06 %)	20,127 (0.46 %)
483	Norway rat BN7 haplotype GCA_015244455.1	n/a	3,096 (1.64 %)	2,450 (1.02 %)	n/a	41.23 (100.00 %)	6 (0.00 %)	3,156 (100.00 %)	517,347 (50.76 %)	157,701 (3.90 %)	1,502,752 (34.14 %)	1,806 (0.40 %)
484	Norway rat BN7.2 GCF_015227675.2	97,432 (4.08 %)	21,526 (1.86 %)	19,266 (1.33 %)	54,530 (2.79 %)	41.99 (99.19 %)	581 (0.81 %)	757 (99.19 %)	5,029,005 (45.44 %)	1,514,974 (3.57 %)	13,450,428 (35.83 %)	19,244 (0.46 %)
485	Norway rat celera GCF_000002265.2	39,745 (2.91 %)	21,492 (1.95 %)	19,112 (1.38 %)	n/a	41.98 (95.28 %)	111,391 (4.74 %)	118,423 (95.26 %)	9,721,869 (43.57 %)	1,387,703 (3.05 %)	13,224,921 (32.45 %)	18,944 (0.42 %)
486	Norway rat Rnor6.0 GCF_000001895.5	69,456 (3.34 %)	22,369 (1.83 %)	20,269 (1.32 %)	n/a	41.93 (95.13 %)	145,731 (4.89 %)	76,195 (95.16 %)	5,329,187 (44.14 %)	1,620,304 (3.72 %)	14,520,050 (33.09 %)	22,600 (0.47 %)
487	Norway rat SHR/Utx RGD_8142385 2022 GCA_023515785.1	n/a	21,116 (1.68 %)	20,103 (1.27 %)	57,027 (2.45 %)	41.85 (99.82 %)	1,256 (0.18 %)	2,151 (100.00 %)	4,704,388 (38.22 %)	1,611,144 (5.76 %)	13,524,575 (38.35 %)	20,720 (0.48 %)
488	Norway rat SHRSP/BppUtx 2022 GCA_021556685.1	n/a	22,366 (1.71 %)	20,531 (1.26 %)	57,580 (2.44 %)	41.86 (99.94 %)	1,610 (0.06 %)	2,734 (100.00 %)	5,238,574 (46.36 %)	1,638,412 (5.87 %)	13,769,141 (38.49 %)	21,006 (0.49 %)
489	Norway rat WKY/Bbb 2022 GCA_023515805.1	n/a	21,607 (1.68 %)	21,244 (1.28 %)	58,136 (2.47 %)	41.92 (99.80 %)	1,456 (0.20 %)	3,553 (100.00 %)	4,811,412 (38.21 %)	1,650,950 (5.41 %)	13,740,644 (38.24 %)	21,449 (0.51 %)
490	nutria GCA_004027025.1	n/a	24,707 (1.00 %)	47,533 (1.18 %)	n/a	41.70 (99.84 %)	15,249 (0.05 %)	1,684,916 (99.95 %)	6,961,690 (30.09 %)	1,698,977 (3.31 %)	15,207,563 (42.57 %)	59,854 (1.00 %)
491	okapi GCA_001660835.1	n/a	21,483 (1.43 %)	31,061 (1.26 %)	n/a	41.48 (95.11 %)	376,008 (4.86 %)	1,213,177 (95.14 %)	5,808,036 (42.90 %)	619,044 (4.22 %)	14,940,153 (35.17 %)	47,417 (1.12 %)
492	Ord's kangaroo rat GCF_000151885.1	30,625 (2.21 %)	17,959 (1.54 %)	19,318 (1.54 %)	n/a	42.06 (92.36 %)	83,035 (7.65 %)	148,226 (92.35 %)	4,337,455 (33.76 %)	1,140,316 (7.60 %)	10,422,685 (36.59 %)	61,921 (3.56 %)
493	pacarana GCA_004027595.1	n/a	20,748 (1.20 %)	33,195 (1.31 %)	n/a	41.81 (99.90 %)	6,392 (0.02 %)	1,164,830 (99.98 %)	4,374,443 (30.16 %)	660,811 (1.38 %)	14,062,133 (35.99 %)	59,382 (1.23 %)
494	Pacific pocket mouse (BS65 2019 Broad) GCA_004363475.1	n/a	21,575 (1.07 %)	47,478 (1.31 %)	n/a	41.87 (99.76 %)	18,801 (0.07 %)	2,428,619 (99.93 %)	4,881,232 (20.80 %)	1,352,971 (4.11 %)	12,583,960 (48.42 %)	74,961 (2.33 %)
495	Pacific pocket mouse (PPM17 2022 San Diego Zoo) GCF_023159225.1	46,202 (2.48 %)	18,752 (1.50 %)	22,526 (1.60 %)	n/a	41.98 (99.96 %)	1,807 (0.04 %)	6,180 (100.00 %)	3,313,319 (16.79 %)	1,066,382 (10.88 %)	9,981,468 (42.63 %)	49,134 (2.83 %)
496	Pacific walrus GCF_000321225.1	27,163 (1.89 %)	20,293 (1.71 %)	20,982 (1.48 %)	n/a	41.36 (95.85 %)	66,766 (4.16 %)	70,656 (95.84 %)	4,372,578 (41.12 %)	511,500 (1.05 %)	13,507,582 (30.43 %)	45,142 (1.29 %)
497	Pacific white-sided dolphin GCF_003676395.1	65,970 (3.26 %)	18,743 (1.79 %)	20,862 (1.45 %)	31,917 (1.69 %)	41.28 (99.56 %)	16,699 (0.44 %)	21,350 (99.56 %)	3,971,820 (45.64 %)	574,056 (1.14 %)	12,602,965 (34.83 %)	62,275 (1.67 %)
498	pale spear-nosed bat (alternate hap MPI-MPIP 2019) GCA_004115245.1	n/a	18,118 (1.63 %)	23,536 (1.65 %)	n/a	42.48 (100.00 %)	38 (0.00 %)	10,873 (100.00 %)	3,001,130 (29.46 %)	375,042 (0.79 %)	11,813,971 (29.64 %)	67,712 (4.23 %)
499	pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 alternate hap 2020) GCA_004115245.2	n/a	18,116 (1.63 %)	23,608 (1.65 %)	n/a	42.48 (100.00 %)	38 (0.00 %)	10,895 (100.00 %)	3,002,448 (29.46 %)	375,226 (0.79 %)	11,824,034 (29.65 %)	67,718 (4.23 %)
500	pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 primary hap 2020) GCF_004126475.2	54,932 (3.31 %)	18,171 (1.69 %)	20,025 (1.62 %)	42,786 (3.39 %)	42.38 (99.28 %)	884 (0.72 %)	77 (100.00 %)	3,069,141 (30.00 %)	385,664 (0.81 %)	12,050,232 (30.57 %)	63,905 (3.75 %)
501	Pallas's mastiff bat GCF_014108415.1	48,421 (2.20 %)	18,667 (1.61 %)	21,915 (1.59 %)	n/a	42.35 (97.95 %)	349 (2.05 %)	60 (100.00 %)	3,863,217 (32.76 %)	624,933 (1.88 %)	11,572,319 (37.09 %)	79,984 (2.45 %)
502	pallid bat (TK200870 primary hap 2023) GCA_027563665.1	n/a	19,688 (1.69 %)	21,998 (1.64 %)	n/a	43.04 (99.72 %)	234 (0.28 %)	112 (99.99 %)	2,794,986 (22.60 %)	938,016 (3.72 %)	11,241,518 (39.41 %)	70,272 (2.89 %)
503	Parnell's mustached bat (2013) GCA_000465405.1	n/a	21,436 (1.40 %)	57,232 (2.18 %)	n/a	40.82 (99.34 %)	265,720 (0.70 %)	443,121 (99.30 %)	2,780,805 (29.26 %)	290,520 (0.63 %)	12,354,814 (27.13 %)	69,806 (1.89 %)
504	Parnell's mustached bat (Mesoamerican 2021) GCF_021234165.1	37,033 (2.48 %)	18,339 (1.76 %)	21,630 (1.69 %)	n/a	41.32 (100.00 %)	12 (0.00 %)	333 (100.00 %)	2,828,339 (30.56 %)	333,670 (0.75 %)	12,444,271 (30.90 %)	53,180 (4.61 %)
505	particolored bat (primary hap 2024) GCA_963924515.1	n/a	17,913 (1.72 %)	20,720 (1.72 %)	n/a	43.54 (99.99 %)	980 (0.01 %)	185 (100.00 %)	2,932,869 (21.94 %)	874,665 (4.83 %)	10,263,103 (37.46 %)	77,397 (4.55 %)
506	Patagonian cavy GCA_004027295.1	n/a	21,143 (0.94 %)	40,887 (1.10 %)	n/a	39.86 (99.87 %)	6,223 (0.02 %)	1,911,987 (99.98 %)	5,194,890 (30.95 %)	892,551 (2.11 %)	17,052,577 (40.22 %)	45,730 (0.84 %)
507	Pere David's deer GCA_002443075.1	n/a	20,723 (1.65 %)	23,551 (1.43 %)	n/a	41.58 (97.49 %)	144,642 (2.51 %)	339,454 (97.49 %)	5,171,293 (43.30 %)	427,987 (1.20 %)	13,665,133 (35.97 %)	48,374 (1.14 %)
508	Philippine flying lemur (mCynVol1 alternate hap 2022) GCA_027409165.1	n/a	18,794 (1.72 %)	21,421 (1.40 %)	n/a	40.18 (100.00 %)	n/a	1,750 (100.00 %)	4,001,442 (39.37 %)	547,894 (2.75 %)	13,870,563 (34.33 %)	40,162 (1.31 %)
509	Philippine flying lemur (primary hap 2022 genbank) GCA_027409185.1	n/a	20,384 (1.64 %)	22,124 (1.29 %)	n/a	40.24 (100.00 %)	116 (0.00 %)	131 (100.00 %)	4,492,423 (39.31 %)	627,842 (4.79 %)	15,561,515 (36.57 %)	45,336 (1.27 %)
510	Philippine flying lemur (primary hap 2022 refseq) GCF_027409185.1	44,950 (1.91 %)	20,385 (1.64 %)	22,123 (1.29 %)	n/a	40.24 (100.00 %)	116 (0.00 %)	130 (100.00 %)	4,492,417 (39.31 %)	627,841 (4.79 %)	15,561,458 (36.57 %)	45,336 (1.27 %)
511	pig (Bamei 2023) GCA_030704935.1	n/a	18,472 (1.44 %)	19,911 (1.28 %)	n/a	42.63 (99.98 %)	878 (0.02 %)	379 (100.00 %)	3,996,827 (27.97 %)	2,094,728 (7.23 %)	12,677,118 (40.57 %)	81,791 (2.82 %)
512	pig (Duroc 2017) GCF_000003025.6	77,695 (4.05 %)	18,980 (1.64 %)	19,453 (1.32 %)	59,876 (4.84 %)	41.87 (98.81 %)	544 (1.19 %)	1,313 (98.81 %)	5,021,184 (45.67 %)	710,994 (1.32 %)	13,243,289 (36.33 %)	79,132 (1.82 %)
513	pig (Norwegian landrace 2024) GCA_963921485.1	n/a	18,500 (1.46 %)	19,718 (1.29 %)	n/a	42.45 (100.00 %)	n/a	54 (100.00 %)	4,068,783 (28.54 %)	1,511,605 (5.52 %)	12,867,101 (39.59 %)	82,002 (2.44 %)
514	pig (USMARCv1 2017) GCA_002844635.1	n/a	19,458 (1.54 %)	21,487 (1.27 %)	58,655 (2.58 %)	42.49 (95.20 %)	661 (4.80 %)	14,157 (100.00 %)	5,159,244 (47.53 %)	902,079 (3.63 %)	13,145,120 (36.86 %)	82,442 (2.62 %)
515	pig (Wuzhishan WZS1 2025) GCA_048338725.1	n/a	18,525 (1.46 %)	19,792 (1.29 %)	n/a	42.55 (100.00 %)	n/a	20 (100.00 %)	4,084,482 (28.40 %)	1,424,314 (5.35 %)	12,927,595 (39.56 %)	81,967 (2.96 %)
516	plains zebra (Etosha38 2022 UCLA) GCF_021613505.1	55,794 (2.87 %)	19,529 (1.76 %)	21,214 (1.39 %)	n/a	41.38 (99.04 %)	14,595 (0.96 %)	11,098 (100.00 %)	3,683,862 (38.74 %)	314,723 (0.68 %)	15,217,328 (29.38 %)	41,391 (1.27 %)
517	platypus (alternate hap Pmale09 2020) GCA_004115175.2	n/a	13,244 (1.26 %)	19,241 (1.68 %)	n/a	46.27 (100.00 %)	25 (0.00 %)	5,868 (100.00 %)	4,420,884 (51.59 %)	513,006 (3.13 %)	7,749,797 (49.18 %)	81,538 (8.24 %)
518	platypus (Pmale09 v4 2020) GCF_004115215.2	51,379 (3.07 %)	14,778 (1.26 %)	18,888 (1.63 %)	n/a	46.14 (99.18 %)	515 (0.82 %)	322 (100.00 %)	5,071,089 (51.34 %)	578,614 (2.89 %)	9,113,848 (48.93 %)	87,796 (6.47 %)
519	polar bear (Baiyulong BGI 2014 refseq) GCF_000687225.1	35,751 (2.39 %)	18,466 (1.69 %)	15,384 (1.38 %)	n/a	41.65 (98.35 %)	110,343 (1.67 %)	134,162 (98.33 %)	4,123,540 (40.16 %)	553,196 (1.29 %)	13,765,581 (29.91 %)	54,907 (1.17 %)
520	polar bear (UCSC 2021) GCF_017311325.1	52,175 (2.92 %)	18,588 (1.75 %)	20,731 (1.54 %)	n/a	41.88 (99.60 %)	45,532 (0.41 %)	3,900 (100.00 %)	4,204,162 (40.75 %)	572,129 (1.75 %)	13,926,894 (30.79 %)	63,315 (1.93 %)
521	prairie deer mouse (Baylor 2013) GCF_000500345.1	50,187 (2.51 %)	20,427 (1.69 %)	20,874 (1.45 %)	n/a	42.34 (94.06 %)	182,263 (5.97 %)	212,962 (94.03 %)	n/a	1,229,123 (2.83 %)	14,447,916 (30.09 %)	23,246 (0.56 %)
522	prairie deer mouse (Harvard 2020) GCF_003704035.1	69,779 (3.28 %)	19,755 (1.73 %)	19,194 (1.43 %)	n/a	42.28 (95.07 %)	147,442 (4.96 %)	155,966 (95.04 %)	4,751,621 (29.04 %)	1,172,212 (2.66 %)	13,934,672 (29.87 %)	22,444 (0.57 %)
523	prairie vole GCF_000317375.1	40,484 (2.72 %)	19,648 (1.91 %)	19,489 (1.62 %)	n/a	42.25 (92.03 %)	180,677 (8.00 %)	187,012 (92.00 %)	3,779,126 (25.51 %)	879,192 (2.11 %)	12,360,347 (27.34 %)	18,233 (0.52 %)
524	proboscis bat (hap1 2024) GCA_037038545.1	n/a	17,919 (1.46 %)	19,330 (1.31 %)	n/a	40.78 (100.00 %)	68 (0.00 %)	41 (100.00 %)	3,707,234 (28.28 %)	643,817 (2.22 %)	12,106,384 (41.48 %)	54,438 (1.38 %)
525	proboscis bat (hap2 2024) GCA_037038555.1	n/a	17,253 (1.51 %)	18,507 (1.35 %)	n/a	40.91 (100.00 %)	39 (0.00 %)	38 (100.00 %)	3,466,835 (27.96 %)	585,261 (1.91 %)	11,364,898 (40.65 %)	50,527 (1.37 %)
526	pronghorn (PH2016 2021) GCA_021018645.1	n/a	21,848 (1.58 %)	27,614 (1.56 %)	n/a	41.70 (96.83 %)	74,027 (3.17 %)	140,480 (96.83 %)	3,335,744 (24.40 %)	405,435 (4.11 %)	13,855,606 (34.67 %)	48,670 (1.19 %)
527	Przewalski's horse (Burgud 2014 refseq) GCF_000696695.1	45,089 (2.76 %)	19,546 (1.69 %)	22,107 (1.36 %)	n/a	41.27 (99.13 %)	80,963 (0.88 %)	134,060 (99.12 %)	3,787,533 (40.54 %)	435,607 (1.73 %)	14,738,418 (28.36 %)	40,752 (0.94 %)
528	Przewalski's horse (Varuska primary hap 2024) GCF_037783145.1	117,131 (4.09 %)	18,569 (1.70 %)	20,018 (1.38 %)	n/a	42.23 (100.00 %)	310 (0.00 %)	2,146 (100.00 %)	3,768,149 (39.86 %)	632,308 (5.35 %)	14,449,518 (32.71 %)	42,166 (4.46 %)
529	puma (L17-30 alternate hap 2023) GCA_028749965.1	n/a	18,380 (1.53 %)	20,701 (1.40 %)	n/a	41.91 (100.00 %)	96 (0.00 %)	304 (100.00 %)	4,881,674 (33.96 %)	978,817 (2.17 %)	13,422,986 (35.08 %)	69,437 (2.62 %)
530	puma (L17-30 primary hap 2023) GCA_028749985.1	n/a	17,553 (1.53 %)	19,299 (1.39 %)	n/a	41.89 (100.00 %)	134 (0.00 %)	390 (100.00 %)	4,629,539 (33.53 %)	919,008 (2.02 %)	12,766,157 (34.70 %)	65,437 (2.53 %)
531	puma (SC36_Marlon 2018 refseq) GCF_003327715.1	25,588 (1.44 %)	17,664 (1.57 %)	16,565 (1.29 %)	n/a	41.36 (95.34 %)	178,992 (4.69 %)	2,175 (100.00 %)	4,885,335 (42.70 %)	833,138 (1.76 %)	13,705,778 (31.28 %)	58,912 (1.65 %)
532	punctate agouti GCA_004363535.1	n/a	22,612 (1.05 %)	45,433 (1.19 %)	n/a	40.79 (99.92 %)	6,459 (0.02 %)	993,123 (99.98 %)	5,671,738 (32.53 %)	945,722 (1.69 %)	17,003,309 (36.58 %)	85,696 (1.65 %)
533	pygmy sperm whale GCA_004363705.1	n/a	22,661 (1.30 %)	42,546 (1.15 %)	n/a	41.89 (99.89 %)	6,053 (0.02 %)	1,258,125 (99.98 %)	5,185,912 (43.65 %)	836,752 (1.88 %)	14,150,125 (39.88 %)	95,344 (2.15 %)
534	pygmy sperm whale (haplotype 1 2022 refseq) GCF_026419965.1	73,518 (2.67 %)	18,496 (1.55 %)	20,718 (1.32 %)	n/a	42.05 (99.81 %)	143 (0.19 %)	581 (100.00 %)	3,817,659 (34.51 %)	758,297 (7.42 %)	12,196,998 (39.96 %)	101,353 (2.90 %)
535	pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 2 2022) GCA_026419985.1	n/a	18,550 (1.51 %)	20,491 (1.29 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	138 (0.01 %)	391 (100.00 %)	3,860,112 (33.83 %)	820,375 (9.58 %)	12,159,196 (41.59 %)	106,168 (2.78 %)
536	Pyrenean desman (IBE-C5619 2021) GCA_019455555.1	n/a	17,527 (1.87 %)	20,474 (1.83 %)	n/a	41.67 (98.52 %)	63,679 (1.49 %)	75,985 (98.51 %)	2,147,379 (23.41 %)	327,740 (0.98 %)	10,539,226 (28.05 %)	44,487 (4.39 %)
537	rabbit (A946 2020) GCA_013371645.1	n/a	19,881 (1.40 %)	22,566 (1.32 %)	n/a	44.09 (99.92 %)	4,254 (0.08 %)	5,157 (99.93 %)	5,202,709 (44.78 %)	1,059,544 (2.39 %)	13,897,372 (40.69 %)	119,691 (2.74 %)
538	rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 refseq) GCF_009806435.1	83,033 (4.16 %)	19,486 (1.31 %)	23,267 (1.31 %)	n/a	43.83 (97.68 %)	18,178 (2.32 %)	3,160 (100.00 %)	4,072,524 (21.41 %)	976,273 (2.33 %)	13,766,413 (39.76 %)	113,371 (2.46 %)
539	rabbit (primary hap 2024 refseq) GCF_964237555.1	95,289 (4.22 %)	19,385 (1.31 %)	22,631 (1.31 %)	n/a	44.02 (99.98 %)	2,276 (0.02 %)	221 (100.00 %)	4,099,586 (21.20 %)	1,062,900 (3.78 %)	13,416,814 (41.72 %)	116,523 (2.66 %)
540	rabbit (Thorbecke 2009 Broad refseq) GCF_000003625.3	43,642 (2.34 %)	18,665 (1.39 %)	20,095 (1.24 %)	n/a	43.75 (95.14 %)	80,789 (4.88 %)	84,024 (95.12 %)	4,890,480 (44.71 %)	883,939 (1.73 %)	13,254,520 (38.27 %)	110,337 (2.33 %)
541	raccoon dog (2021) GCF_905146905.1	52,577 (2.89 %)	19,628 (1.60 %)	20,274 (1.43 %)	n/a	41.28 (99.98 %)	70 (0.02 %)	811 (100.00 %)	4,499,368 (31.98 %)	1,005,212 (2.04 %)	13,884,201 (32.95 %)	52,450 (2.27 %)
542	Rambouillet sheep (Baylor 2017) GCF_002742125.1	50,083 (2.48 %)	19,992 (1.47 %)	22,506 (1.31 %)	41,290 (1.46 %)	41.91 (99.99 %)	4,847 (0.01 %)	7,486 (99.99 %)	5,764,757 (47.38 %)	507,629 (1.55 %)	14,138,601 (41.27 %)	51,748 (1.29 %)
543	Rambouillet sheep (U.Idaho 2021) GCF_016772045.1	70,461 (3.21 %)	19,413 (1.59 %)	21,222 (1.35 %)	n/a	41.99 (100.00 %)	84 (0.00 %)	142 (100.00 %)	5,300,958 (46.83 %)	455,553 (1.24 %)	13,023,443 (40.62 %)	43,959 (1.30 %)
544	ratel GCA_004024625.1	n/a	22,196 (1.21 %)	35,937 (1.18 %)	n/a	42.00 (99.85 %)	6,511 (0.02 %)	2,074,823 (99.98 %)	6,171,383 (41.93 %)	877,669 (1.49 %)	15,269,908 (41.22 %)	95,094 (1.91 %)
545	red bat GCA_004026805.1	n/a	27,510 (1.22 %)	65,467 (1.48 %)	n/a	42.69 (99.94 %)	6,380 (0.02 %)	525,280 (99.98 %)	4,644,227 (28.24 %)	1,170,868 (2.68 %)	15,628,238 (39.97 %)	125,564 (3.55 %)
546	red deer (2021) GCF_910594005.1	68,992 (2.68 %)	20,470 (1.48 %)	22,563 (1.32 %)	n/a	42.98 (100.00 %)	40 (0.00 %)	144 (100.00 %)	5,501,063 (44.60 %)	503,301 (12.23 %)	13,102,622 (44.55 %)	88,756 (1.66 %)
547	red deer (alternate hap 2021) GCA_910593805.1	n/a	18,817 (1.29 %)	21,916 (1.20 %)	n/a	44.23 (100.00 %)	22 (0.00 %)	4,021 (100.00 %)	3,279,005 (20.48 %)	472,706 (21.87 %)	11,466,609 (50.26 %)	128,858 (2.07 %)
548	red fox (BD-2025 2025) GCF_048418805.1	84,632 (3.45 %)	19,565 (1.57 %)	19,909 (1.38 %)	n/a	41.31 (100.00 %)	104 (0.00 %)	289 (100.00 %)	4,480,315 (31.76 %)	1,010,887 (2.70 %)	13,766,344 (33.12 %)	50,763 (2.22 %)
549	red fox (hap1 2024) GCA_964106825.2	n/a	19,622 (1.57 %)	20,371 (1.38 %)	n/a	41.34 (99.98 %)	1,845 (0.02 %)	461 (100.00 %)	4,519,485 (31.91 %)	1,018,114 (2.59 %)	13,810,284 (32.99 %)	52,053 (2.31 %)
550	red fox (hap2 2024) GCA_964106925.2	n/a	19,517 (1.57 %)	20,105 (1.37 %)	n/a	41.31 (99.99 %)	1,819 (0.02 %)	350 (100.00 %)	4,487,839 (31.79 %)	1,010,106 (2.64 %)	13,838,711 (33.07 %)	51,373 (2.26 %)
551	red fox (tameXaggressive cross 2018) GCF_003160815.1	43,508 (2.67 %)	19,826 (1.69 %)	18,893 (1.40 %)	n/a	41.08 (97.06 %)	246,167 (2.96 %)	82,424 (100.00 %)	4,919,102 (40.79 %)	954,461 (2.46 %)	14,190,625 (30.86 %)	53,204 (1.88 %)
552	reed vole (MF-2015 2020) GCF_014885135.2	55,722 (3.60 %)	19,808 (1.93 %)	20,787 (1.69 %)	n/a	42.36 (95.60 %)	67,118 (4.40 %)	10,460 (100.00 %)	3,130,955 (20.09 %)	831,969 (2.09 %)	11,985,657 (28.48 %)	18,764 (0.58 %)
553	Reeves' muntjac (alternate hap 2024) GCA_963930665.1	n/a	18,947 (1.29 %)	24,114 (1.28 %)	n/a	42.75 (100.00 %)	n/a	8,892 (100.00 %)	3,375,476 (23.21 %)	654,539 (6.64 %)	11,132,469 (48.29 %)	79,357 (2.66 %)
554	Reeves' muntjac (primary hap 2024) GCF_963930625.1	52,442 (2.57 %)	19,577 (1.52 %)	22,283 (1.38 %)	n/a	41.89 (99.99 %)	682 (0.01 %)	267 (100.00 %)	3,294,672 (23.89 %)	527,436 (2.98 %)	13,137,581 (39.89 %)	57,436 (1.81 %)
555	reindeer (2023) GCA_963422255.1	n/a	21,329 (1.58 %)	25,201 (1.59 %)	n/a	41.46 (98.35 %)	131,886 (1.65 %)	259,765 (98.35 %)	3,254,173 (23.49 %)	440,431 (2.00 %)	14,258,607 (36.17 %)	48,931 (1.20 %)
556	reindeer (US061 2019) GCA_004026565.1	n/a	24,150 (1.39 %)	39,911 (1.41 %)	n/a	42.08 (99.89 %)	4,769 (0.02 %)	1,365,508 (99.98 %)	6,083,178 (46.10 %)	546,470 (1.23 %)	14,434,855 (43.16 %)	55,319 (1.23 %)
557	Rice's whale (hap1 2023) GCA_028017805.1	n/a	19,396 (1.48 %)	21,693 (1.26 %)	n/a	41.62 (97.80 %)	131 (2.20 %)	1,039 (100.00 %)	3,973,936 (35.55 %)	987,571 (11.66 %)	12,473,459 (42.11 %)	74,971 (1.64 %)
558	Rice's whale (hap2 2023 refseq) GCF_028023285.1	59,888 (2.34 %)	19,291 (1.53 %)	21,195 (1.30 %)	n/a	41.44 (99.90 %)	334 (0.10 %)	774 (100.00 %)	3,917,923 (36.26 %)	828,521 (9.28 %)	12,518,796 (41.08 %)	73,126 (1.69 %)
559	Rickett's big-footed myotis (AB-2021 2024) GCA_036010255.1	n/a	18,982 (1.81 %)	22,002 (1.76 %)	n/a	43.12 (100.00 %)	n/a	105 (100.00 %)	2,909,847 (24.53 %)	757,964 (3.03 %)	10,561,925 (36.25 %)	57,318 (2.32 %)
560	Risso's dolphin (hap1.1 2024) GCA_964374135.1	n/a	18,825 (1.58 %)	20,986 (1.29 %)	n/a	42.25 (99.99 %)	1,138 (0.01 %)	1,150 (100.00 %)	4,405,513 (43.51 %)	1,342,544 (11.28 %)	12,274,096 (41.76 %)	76,936 (4.65 %)
561	Risso's dolphin (hap2.1 2024) GCA_964374185.1	n/a	18,061 (1.68 %)	20,080 (1.36 %)	n/a	41.97 (99.99 %)	1,073 (0.01 %)	2,135 (99.99 %)	3,948,427 (43.52 %)	848,222 (8.00 %)	11,527,950 (38.76 %)	70,117 (3.31 %)
562	Ryukyu mouse (v2 2017) GCF_900094665.2	53,792 (2.85 %)	21,351 (2.29 %)	18,073 (1.39 %)	n/a	41.70 (89.05 %)	306,599 (10.98 %)	30,835 (92.70 %)	4,479,912 (35.83 %)	1,351,677 (2.59 %)	12,964,608 (27.49 %)	15,963 (0.43 %)
563	Saanen dairy goat GCA_015443085.1	n/a	19,257 (1.54 %)	21,221 (1.32 %)	n/a	42.30 (100.00 %)	170 (0.00 %)	1,362 (100.00 %)	5,336,862 (47.58 %)	515,161 (2.87 %)	13,144,895 (41.67 %)	58,623 (2.22 %)
564	saddleback dolphin (alternate hap 2023) GCA_949987525.1	n/a	18,509 (1.54 %)	22,514 (1.36 %)	n/a	41.95 (100.00 %)	1 (0.00 %)	7,427 (100.00 %)	3,675,922 (35.75 %)	950,374 (10.49 %)	11,670,399 (40.31 %)	63,587 (3.15 %)
565	saddleback dolphin (v1 primary hap 2023 refseq) GCF_949987515.1	46,746 (2.39 %)	18,624 (1.49 %)	20,662 (1.31 %)	n/a	42.06 (99.99 %)	968 (0.01 %)	630 (100.00 %)	4,020,676 (35.99 %)	1,259,549 (13.09 %)	12,359,748 (42.64 %)	66,179 (3.91 %)
566	saddleback dolphin (v2 primary hap 2024 refseq) GCF_949987515.2	46,014 (2.36 %)	18,616 (1.49 %)	20,618 (1.32 %)	n/a	42.06 (99.99 %)	968 (0.01 %)	1,598 (99.99 %)	4,020,525 (35.99 %)	1,258,165 (13.09 %)	12,359,758 (42.64 %)	66,188 (3.91 %)
567	saiga antelope GCA_004024985.1	n/a	23,736 (0.84 %)	55,133 (0.88 %)	n/a	42.52 (99.87 %)	2,867 (0.01 %)	1,775,066 (99.99 %)	6,485,113 (49.43 %)	447,097 (0.88 %)	13,972,753 (44.46 %)	46,883 (0.82 %)
568	Schreibers' long-fingered bat (US075 2019) GCA_004026525.1	n/a	20,147 (2.06 %)	31,271 (1.82 %)	n/a	42.27 (99.94 %)	6,918 (0.04 %)	184,538 (99.96 %)	2,772,932 (29.66 %)	366,782 (1.13 %)	10,477,531 (28.60 %)	62,520 (2.73 %)
569	Schreibers' long-fingered bat (v2 hap1 2025) GCA_964146895.2	n/a	18,109 (2.10 %)	21,263 (1.89 %)	n/a	42.51 (100.00 %)	140 (0.00 %)	186 (100.00 %)	2,812,261 (34.39 %)	457,565 (5.58 %)	10,220,083 (31.02 %)	59,522 (2.81 %)
570	Schreibers' long-fingered bat (v2 hap2 2025) GCA_964145185.2	n/a	17,286 (2.19 %)	20,474 (1.95 %)	n/a	42.64 (100.00 %)	86 (0.00 %)	254 (100.00 %)	2,610,773 (33.65 %)	389,844 (4.42 %)	9,728,138 (29.49 %)	56,508 (2.97 %)
571	scimitar-horned oryx GCF_014754425.2	51,527 (2.72 %)	19,713 (1.57 %)	21,928 (1.32 %)	n/a	41.74 (99.30 %)	16,241 (0.70 %)	9,089 (100.00 %)	5,435,109 (46.76 %)	414,279 (0.98 %)	13,490,956 (40.45 %)	42,961 (1.10 %)
572	Screaming hairy armadillo GCA_004027955.1	n/a	24,532 (0.39 %)	56,725 (0.46 %)	n/a	39.68 (99.70 %)	2,747 (0.01 %)	7,680,080 (99.99 %)	8,978,735 (36.02 %)	1,516,551 (1.58 %)	32,918,217 (47.67 %)	234,762 (1.56 %)
573	sea otter (GAN:26980312 2017 refseq) GCF_002288905.1	38,140 (2.17 %)	18,578 (1.64 %)	20,913 (1.44 %)	34,179 (1.77 %)	41.56 (98.79 %)	23,134 (1.21 %)	29,589 (98.79 %)	4,703,044 (41.42 %)	721,750 (1.39 %)	14,065,653 (32.89 %)	55,388 (1.87 %)
574	Seba's short-tailed bat GCA_004027735.1	n/a	21,878 (0.94 %)	55,858 (1.10 %)	n/a	42.70 (99.84 %)	3,864 (0.01 %)	1,929,203 (99.99 %)	3,802,235 (28.35 %)	606,320 (1.03 %)	15,171,250 (31.99 %)	118,227 (2.28 %)
575	sei whale (hap1.1 2025) GCA_965194805.1	n/a	19,292 (1.27 %)	21,865 (1.14 %)	n/a	41.99 (99.99 %)	1,179 (0.01 %)	2,572 (100.00 %)	4,525,289 (42.25 %)	1,097,216 (21.14 %)	12,203,884 (50.47 %)	80,128 (1.58 %)
576	sei whale (hap2.1 2025) GCA_965194725.1	n/a	19,313 (1.37 %)	21,662 (1.17 %)	n/a	41.68 (99.99 %)	1,066 (0.01 %)	2,917 (99.99 %)	4,418,625 (42.98 %)	875,114 (15.81 %)	12,360,254 (46.52 %)	78,537 (1.66 %)
577	sheep (hu hu3095 2024) GCA_040805955.1	n/a	19,388 (1.42 %)	21,612 (1.28 %)	n/a	43.17 (100.00 %)	n/a	28 (100.00 %)	5,311,536 (44.06 %)	653,238 (7.29 %)	12,937,231 (44.10 %)	63,230 (6.03 %)
578	sheep (OAR_USU_Benz2616 2023) GCF_016772045.2	89,680 (5.44 %)	19,308 (1.52 %)	21,506 (1.35 %)	n/a	42.01 (100.00 %)	84 (0.00 %)	143 (100.00 %)	3,275,767 (22.85 %)	464,346 (1.26 %)	12,987,607 (40.61 %)	44,477 (1.28 %)
579	sheep (Texel 2015) GCA_000298735.2	n/a	19,179 (1.56 %)	19,001 (1.26 %)	48,105 (1.85 %)	41.90 (98.94 %)	44,566 (1.07 %)	48,481 (98.93 %)	5,429,824 (46.13 %)	540,267 (1.64 %)	13,509,668 (38.83 %)	43,911 (1.13 %)
580	shrew mouse GCF_900095145.1	46,279 (2.64 %)	20,549 (2.23 %)	18,979 (1.49 %)	94,079 (3.98 %)	41.89 (90.53 %)	269,643 (9.50 %)	17,879 (93.73 %)	4,788,498 (38.32 %)	1,499,714 (3.03 %)	13,021,757 (27.83 %)	16,787 (0.47 %)
581	Siberian hamster (SSSS 2022) GCA_023856395.1	n/a	18,375 (1.83 %)	17,066 (1.44 %)	n/a	41.27 (99.64 %)	88,601 (0.37 %)	7,756 (100.00 %)	3,152,242 (21.63 %)	1,087,009 (2.64 %)	12,055,167 (29.20 %)	15,455 (0.48 %)
582	Siberian musk deer (BS20 2019 Broad) GCA_004024705.1	n/a	23,440 (1.32 %)	37,497 (1.19 %)	n/a	42.32 (99.86 %)	19,764 (0.07 %)	1,195,467 (99.93 %)	6,726,950 (49.79 %)	437,480 (1.57 %)	14,155,240 (46.22 %)	49,177 (1.05 %)
583	sika deer (Changchun, China MLH-2022 2023) GCA_034195675.1	n/a	20,087 (1.59 %)	23,556 (1.46 %)	n/a	41.66 (99.97 %)	1,724 (0.03 %)	1,889 (100.00 %)	3,925,148 (27.17 %)	419,490 (1.24 %)	13,364,988 (37.79 %)	47,630 (1.31 %)
584	small Madagascar hedgehog GCF_000313985.2	37,090 (1.93 %)	18,969 (1.19 %)	19,298 (1.31 %)	n/a	43.01 (88.43 %)	270,406 (11.60 %)	7,490 (100.00 %)	3,789,337 (28.89 %)	429,226 (0.87 %)	16,951,112 (32.23 %)	39,993 (0.70 %)
585	smoky shrew (2023) GCF_029834395.1	37,165 (1.66 %)	17,572 (1.06 %)	24,146 (1.29 %)	n/a	43.43 (100.00 %)	n/a	497 (100.00 %)	2,593,080 (14.11 %)	1,194,567 (7.25 %)	14,051,522 (48.20 %)	107,473 (2.80 %)
586	snow leopard (11264 2022) GCF_023721935.1	53,569 (3.37 %)	18,780 (1.67 %)	21,038 (1.40 %)	n/a	41.60 (99.30 %)	23,786 (0.70 %)	2,636 (100.00 %)	4,714,429 (34.93 %)	919,518 (1.59 %)	13,711,504 (33.24 %)	64,690 (2.41 %)
587	snowshoe hare GCA_004026855.1	n/a	23,263 (0.88 %)	55,811 (1.01 %)	n/a	44.12 (99.87 %)	10,153 (0.03 %)	1,602,982 (99.97 %)	4,767,120 (21.29 %)	1,040,992 (2.22 %)	15,680,144 (43.23 %)	126,152 (2.28 %)
588	social tuco-tuco GCA_004027165.1	n/a	25,166 (1.12 %)	41,316 (1.26 %)	n/a	40.71 (99.89 %)	16,191 (0.06 %)	823,762 (99.94 %)	5,390,906 (28.28 %)	1,027,922 (2.15 %)	15,241,308 (38.39 %)	31,883 (0.72 %)
589	soprano pipistrelle (alternate hap 2023) GCA_949987765.1	n/a	17,590 (1.81 %)	21,597 (1.85 %)	n/a	42.88 (100.00 %)	1 (0.00 %)	2,717 (100.00 %)	2,734,555 (21.46 %)	795,752 (6.56 %)	9,601,735 (36.35 %)	62,524 (3.25 %)
590	soprano pipistrelle (primary hap 2023) GCA_949987585.1	n/a	18,056 (1.78 %)	21,158 (1.79 %)	n/a	42.67 (100.00 %)	161 (0.00 %)	249 (100.00 %)	2,899,535 (21.64 %)	853,717 (7.80 %)	10,162,216 (37.72 %)	63,256 (3.06 %)
591	South African ground squirrel GCA_004024805.1	n/a	22,802 (1.44 %)	33,892 (1.27 %)	n/a	39.97 (99.92 %)	9,745 (0.04 %)	587,115 (99.96 %)	5,256,998 (34.93 %)	594,122 (1.27 %)	14,462,947 (33.96 %)	34,141 (0.80 %)
592	Southeastern Asian house mouse (2016) GCA_001624445.1	n/a	21,103 (2.24 %)	18,682 (1.45 %)	102,099 (4.16 %)	41.83 (86.23 %)	424,005 (13.83 %)	52,352 (97.85 %)	4,990,851 (39.88 %)	1,356,202 (2.67 %)	13,469,640 (26.15 %)	16,724 (0.41 %)
593	Southeastern Asian house mouse (2022) GCA_921999005.2	n/a	21,799 (2.13 %)	19,729 (1.40 %)	110,356 (4.43 %)	41.78 (99.19 %)	278 (0.81 %)	151 (100.00 %)	4,663,228 (40.41 %)	1,549,985 (3.70 %)	13,012,600 (34.99 %)	21,349 (0.52 %)
594	Southeastern Asian house mouse (T2T 2024) GCA_964188545.1	n/a	22,529 (1.85 %)	20,409 (1.22 %)	n/a	41.10 (99.90 %)	78 (0.10 %)	416 (99.90 %)	4,880,101 (47.77 %)	1,689,287 (15.13 %)	12,822,147 (42.92 %)	22,642 (0.54 %)
595	southern elephant seal GCF_011800145.1	53,210 (2.86 %)	19,520 (1.73 %)	20,727 (1.41 %)	39,634 (1.86 %)	41.45 (99.36 %)	22,850 (0.64 %)	1,115 (100.00 %)	4,728,105 (43.75 %)	585,443 (1.13 %)	13,463,979 (33.65 %)	53,182 (1.62 %)
596	southern grasshopper mouse (2020) GCF_903995425.1	47,152 (2.39 %)	19,356 (1.68 %)	18,821 (1.36 %)	n/a	41.81 (98.94 %)	2,143 (1.06 %)	2,949 (100.00 %)	4,850,460 (28.64 %)	1,195,836 (2.72 %)	13,540,762 (32.73 %)	18,046 (0.54 %)
597	southern multimammate mouse GCF_008632895.1	69,058 (3.04 %)	20,313 (2.11 %)	17,745 (1.38 %)	n/a	41.39 (91.90 %)	146,713 (8.12 %)	28 (100.00 %)	4,875,400 (38.43 %)	1,454,350 (2.93 %)	13,104,717 (28.82 %)	16,715 (0.45 %)
598	southern tamandua (mTamTet1 alternate hap 2022) GCA_023853755.1	n/a	20,179 (1.21 %)	24,249 (1.19 %)	n/a	39.54 (100.00 %)	4 (0.00 %)	7,866 (100.00 %)	3,953,031 (35.88 %)	531,111 (1.14 %)	16,354,874 (39.96 %)	59,907 (1.35 %)
599	southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022) GCA_023851605.1	n/a	20,058 (1.26 %)	22,196 (1.13 %)	n/a	39.48 (99.44 %)	961 (0.56 %)	201 (100.00 %)	4,037,291 (46.02 %)	593,019 (1.17 %)	18,033,833 (40.56 %)	65,039 (1.33 %)
600	southern three-banded armadillo GCA_004025125.1	n/a	29,138 (0.73 %)	56,522 (0.75 %)	n/a	39.20 (99.82 %)	15,801 (0.04 %)	2,941,308 (99.96 %)	6,990,740 (38.88 %)	839,452 (1.23 %)	24,805,397 (43.95 %)	71,951 (0.98 %)
601	southern two-toed sloth (mChoDid1 alternate hap 2020) GCA_015220265.1	n/a	22,897 (1.23 %)	27,007 (1.18 %)	n/a	39.87 (100.00 %)	70 (0.00 %)	12,050 (100.00 %)	4,502,020 (38.27 %)	576,759 (1.02 %)	17,143,050 (40.65 %)	51,339 (1.15 %)
602	southern two-toed sloth (mChoDid1 primary hap 2020) GCF_015220235.1	63,054 (2.39 %)	21,998 (1.29 %)	23,177 (1.18 %)	45,345 (1.69 %)	39.89 (97.48 %)	1,243 (2.52 %)	146 (100.00 %)	4,559,690 (39.66 %)	577,607 (1.02 %)	16,594,630 (40.50 %)	51,430 (1.14 %)
603	southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 refseq) GCF_000283155.1	37,037 (2.11 %)	18,398 (1.71 %)	19,753 (1.44 %)	n/a	40.90 (96.05 %)	54,737 (3.96 %)	57,824 (96.04 %)	3,685,898 (38.31 %)	421,694 (0.97 %)	14,765,529 (28.93 %)	36,281 (1.02 %)
604	Sowerby's beaked whale (hap1 2024) GCA_964165515.1	n/a	19,471 (1.39 %)	22,951 (1.24 %)	n/a	42.04 (99.99 %)	1,095 (0.01 %)	1,604 (100.00 %)	4,307,839 (34.31 %)	825,475 (10.97 %)	11,375,945 (45.31 %)	76,527 (3.10 %)
605	Sowerby's beaked whale (hap2 2024) GCA_964148845.1	n/a	18,591 (1.46 %)	21,588 (1.27 %)	n/a	42.00 (99.99 %)	974 (0.01 %)	2,126 (99.99 %)	3,961,403 (34.20 %)	742,897 (9.73 %)	10,832,739 (43.68 %)	70,803 (2.85 %)
606	Sowerby's beaked whale (US080 2019) GCA_004027085.1	n/a	22,800 (1.32 %)	38,247 (1.17 %)	n/a	41.68 (99.84 %)	8,597 (0.03 %)	1,810,317 (99.97 %)	5,520,986 (45.05 %)	1,081,962 (2.69 %)	13,480,261 (43.01 %)	69,001 (1.39 %)
607	sperm whale (SW-GA 2023) GCF_002837175.3	62,616 (2.83 %)	19,485 (1.75 %)	22,707 (1.41 %)	n/a	41.33 (95.82 %)	121,387 (4.20 %)	133,555 (95.80 %)	3,906,439 (36.43 %)	691,647 (2.39 %)	13,489,368 (32.95 %)	86,751 (2.23 %)
608	spotted-tailed quoll (Chaos hap1 2025) GCA_048593285.1	n/a	15,188 (0.80 %)	15,406 (0.90 %)	n/a	36.07 (99.97 %)	151 (0.03 %)	157 (99.97 %)	4,933,924 (23.65 %)	1,239,006 (2.76 %)	20,612,787 (41.98 %)	21,700 (0.64 %)
609	spotted-tailed quoll (Chaos hap2 2025) GCA_048593245.1	n/a	15,441 (0.80 %)	15,791 (0.92 %)	n/a	36.12 (99.99 %)	118 (0.01 %)	124 (99.99 %)	4,962,547 (23.62 %)	1,257,253 (2.87 %)	20,652,321 (42.01 %)	22,718 (0.69 %)
610	star-nosed mole GCF_000260355.1	30,444 (2.86 %)	16,116 (1.82 %)	17,403 (1.78 %)	n/a	41.55 (95.10 %)	82,557 (4.92 %)	84,595 (95.08 %)	1,855,039 (18.90 %)	308,473 (0.86 %)	9,571,561 (26.02 %)	48,079 (2.76 %)
611	Steller sea lion GCF_004028035.1	46,044 (2.38 %)	21,171 (1.78 %)	21,626 (1.43 %)	36,701 (1.75 %)	41.38 (99.41 %)	18,994 (0.59 %)	24,485 (99.41 %)	4,556,415 (43.53 %)	577,797 (1.09 %)	13,545,012 (33.71 %)	51,355 (1.45 %)
612	Stephens's kangaroo rat GCA_004024685.1	n/a	20,638 (1.19 %)	43,541 (1.37 %)	n/a	41.90 (99.85 %)	8,882 (0.04 %)	1,278,525 (99.96 %)	4,886,095 (30.36 %)	1,229,832 (5.30 %)	11,334,494 (44.33 %)	38,450 (1.17 %)
613	steppe mouse (ZRU 2018) GCA_003336285.1	n/a	22,032 (2.17 %)	20,891 (1.41 %)	n/a	41.70 (95.78 %)	123,681 (4.24 %)	161,217 (95.76 %)	4,964,415 (42.35 %)	1,414,584 (2.75 %)	12,989,925 (31.80 %)	17,544 (0.44 %)
614	Stoliczka's trident bat (China 2021113_DDA primary hap 2024) GCA_043727835.1	n/a	19,605 (1.80 %)	20,075 (1.48 %)	n/a	41.32 (100.00 %)	87 (0.00 %)	80 (100.00 %)	4,110,913 (40.46 %)	838,212 (2.48 %)	11,938,168 (33.52 %)	40,424 (1.32 %)
615	straw-colored fruit bat GCA_000465285.1	n/a	20,161 (1.66 %)	40,283 (1.50 %)	n/a	39.24 (99.62 %)	154,908 (0.40 %)	288,446 (99.60 %)	2,814,732 (32.92 %)	372,539 (1.01 %)	12,351,823 (25.93 %)	67,245 (2.34 %)
616	stripe-headed round-eared bat GCA_004024845.1	n/a	20,248 (1.62 %)	29,173 (1.61 %)	n/a	42.04 (99.96 %)	2,860 (0.01 %)	252,670 (99.99 %)	3,018,746 (29.48 %)	333,243 (0.74 %)	12,128,116 (30.51 %)	59,513 (1.87 %)
617	striped dolphin (alternate hap 2023) GCA_951394445.1	n/a	18,204 (1.54 %)	21,036 (1.34 %)	n/a	42.07 (100.00 %)	n/a	3,464 (100.00 %)	3,767,720 (35.65 %)	1,102,723 (10.92 %)	11,794,617 (40.96 %)	67,537 (3.57 %)
618	striped dolphin (primary hap 2023) GCA_951394435.1	n/a	18,595 (1.48 %)	20,637 (1.29 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	993 (0.01 %)	639 (100.00 %)	4,097,623 (35.88 %)	1,442,973 (13.60 %)	12,327,244 (43.08 %)	68,498 (4.29 %)
619	striped hyena (BS54 2019 Broad) GCA_004023945.1	n/a	22,373 (1.45 %)	39,382 (1.45 %)	n/a	41.66 (99.93 %)	11,849 (0.05 %)	362,072 (99.95 %)	5,048,667 (42.42 %)	712,073 (1.24 %)	13,879,012 (34.58 %)	69,835 (2.20 %)
620	striped hyena (Hyena2069 2018 Potsdam U) GCF_003009895.1	48,870 (2.41 %)	18,793 (1.67 %)	20,950 (1.44 %)	n/a	41.56 (99.29 %)	23,058 (0.71 %)	5,761 (100.00 %)	4,782,500 (41.88 %)	701,157 (1.32 %)	13,436,624 (33.05 %)	58,977 (2.20 %)
621	sugar glider (PSGF00001 2023) GCA_028583685.1	n/a	19,326 (0.81 %)	17,560 (0.95 %)	n/a	38.95 (98.12 %)	85,933 (1.89 %)	1,895 (100.00 %)	6,382,198 (27.07 %)	1,058,207 (1.74 %)	22,508,040 (39.84 %)	16,224 (0.33 %)
622	sugar glider (PSGF00001 2023) GCF_028583685.1	55,990 (2.41 %)	19,328 (0.81 %)	17,559 (0.95 %)	n/a	38.95 (98.12 %)	85,933 (1.89 %)	1,896 (100.00 %)	6,382,203 (27.07 %)	1,058,208 (1.74 %)	22,508,106 (39.84 %)	16,224 (0.33 %)
623	Sumatran rhinoceros (Ipuh 2017) GCA_002844835.1	n/a	20,368 (1.53 %)	24,204 (1.23 %)	n/a	41.05 (95.54 %)	50,876 (4.40 %)	1,112,463 (95.60 %)	4,516,240 (39.90 %)	561,540 (1.56 %)	15,821,451 (34.68 %)	45,201 (1.03 %)
624	Sumatran serow (serow.1 2024) GCF_032405125.1	36,400 (1.65 %)	19,192 (1.42 %)	22,014 (1.41 %)	n/a	43.08 (100.00 %)	6 (0.00 %)	159 (100.00 %)	3,242,768 (21.18 %)	612,565 (8.05 %)	12,812,990 (44.37 %)	75,177 (5.86 %)
625	Sunda flying lemur (2014 WashU) GCF_000696425.1	34,734 (1.83 %)	21,356 (1.55 %)	25,832 (1.21 %)	n/a	40.21 (87.96 %)	412,608 (12.07 %)	511,878 (87.93 %)	4,961,153 (38.35 %)	854,441 (3.33 %)	17,562,576 (28.82 %)	82,988 (1.05 %)
626	Sunda flying lemur (US047 2019 Broad) GCA_004027255.1	n/a	24,882 (1.29 %)	43,546 (1.12 %)	n/a	40.46 (99.88 %)	5,895 (0.02 %)	1,655,642 (99.98 %)	5,807,241 (38.62 %)	953,765 (2.48 %)	18,836,777 (37.68 %)	114,955 (1.43 %)
627	tailed tailless bat GCA_004027475.1	n/a	19,920 (1.58 %)	28,017 (1.58 %)	n/a	41.76 (99.95 %)	4,640 (0.02 %)	341,895 (99.98 %)	3,139,817 (30.43 %)	381,536 (0.81 %)	12,069,229 (32.73 %)	54,528 (2.15 %)
628	tailess tenrec (hap1 2025) GCF_050624435.1	45,770 (1.60 %)	21,323 (0.86 %)	25,223 (1.02 %)	n/a	44.80 (100.00 %)	175 (0.00 %)	2,180 (100.00 %)	5,633,466 (38.91 %)	1,001,072 (14.26 %)	17,866,411 (50.04 %)	53,320 (1.01 %)
629	takin (Tak-1 2022) GCF_023091745.1	31,927 (1.65 %)	19,290 (1.42 %)	21,656 (1.27 %)	n/a	43.32 (100.00 %)	152 (0.00 %)	1,363 (100.00 %)	3,256,033 (21.01 %)	714,375 (8.32 %)	13,010,154 (44.58 %)	49,134 (7.43 %)
630	Talazac's shrew tenrec GCA_004026705.1	n/a	22,605 (0.81 %)	50,725 (1.09 %)	n/a	43.03 (99.93 %)	6,619 (0.02 %)	795,514 (99.98 %)	3,493,378 (14.58 %)	705,274 (1.31 %)	20,975,335 (36.85 %)	70,793 (1.26 %)
631	tammar wallaby (alternate hap 2023) GCA_028389975.1	n/a	11,133 (0.77 %)	13,869 (0.98 %)	n/a	38.63 (100.00 %)	2 (0.00 %)	14,285 (100.00 %)	3,114,522 (26.10 %)	661,874 (3.02 %)	11,667,649 (38.41 %)	12,393 (0.46 %)
632	tammar wallaby (Barry hap1 2025) GCA_048593335.1	n/a	17,491 (0.79 %)	15,701 (0.88 %)	n/a	38.69 (100.00 %)	32 (0.00 %)	40 (100.00 %)	5,762,317 (26.52 %)	1,078,692 (1.83 %)	22,476,051 (38.99 %)	22,756 (0.48 %)
633	tammar wallaby (Barry hap2 2025) GCA_048593345.1	n/a	17,037 (0.79 %)	15,066 (0.87 %)	n/a	38.62 (100.00 %)	16 (0.00 %)	24 (100.00 %)	5,608,153 (26.57 %)	1,050,173 (1.77 %)	21,856,273 (38.96 %)	21,811 (0.47 %)
634	tammar wallaby (v2 primary hap 2023 refseq) GCF_028372415.1	73,219 (3.07 %)	17,615 (0.77 %)	15,415 (0.86 %)	n/a	38.73 (99.81 %)	515 (0.19 %)	272 (100.00 %)	5,866,314 (26.30 %)	1,193,604 (2.72 %)	22,677,480 (39.53 %)	23,590 (0.47 %)
635	Tasmanian devil (McLovin hap1 2025) GCA_048593225.1	n/a	15,725 (0.77 %)	16,721 (0.92 %)	n/a	36.17 (99.49 %)	1,514 (0.51 %)	1,521 (99.49 %)	5,222,976 (23.42 %)	1,357,438 (3.95 %)	21,705,122 (42.26 %)	24,443 (0.70 %)
636	Tasmanian devil (McLovin hap2 2025) GCA_048593325.1	n/a	15,165 (0.76 %)	15,663 (0.91 %)	n/a	36.00 (99.11 %)	2,578 (0.89 %)	2,584 (99.11 %)	5,039,957 (23.64 %)	1,257,168 (2.97 %)	20,893,744 (41.44 %)	22,574 (0.67 %)
637	Tasmanian devil (primary hap 2019) GCF_902635505.1	52,070 (2.36 %)	15,918 (0.85 %)	16,111 (0.91 %)	n/a	36.16 (100.00 %)	354 (0.00 %)	106 (100.00 %)	6,789,158 (44.28 %)	1,246,027 (2.19 %)	21,434,803 (41.20 %)	23,609 (0.65 %)
638	thirteen-lined ground squirrel (2021 HiC) GCF_016881025.1	69,352 (3.50 %)	18,934 (1.68 %)	16,775 (1.37 %)	n/a	39.91 (93.25 %)	146,412 (6.77 %)	7,132 (100.00 %)	4,262,890 (35.64 %)	640,624 (1.64 %)	14,118,452 (27.90 %)	28,317 (0.64 %)
639	Tibetan sand fox (lyu1992 2022) GCA_024500485.1	n/a	19,552 (1.59 %)	19,307 (1.35 %)	n/a	41.25 (100.00 %)	145 (0.00 %)	234 (100.00 %)	4,500,832 (32.18 %)	999,068 (2.01 %)	13,646,015 (32.98 %)	49,402 (2.19 %)
640	tiger GCF_018350195.1	71,226 (2.84 %)	18,513 (1.68 %)	19,919 (1.39 %)	n/a	41.64 (100.00 %)	65 (0.00 %)	131 (100.00 %)	4,878,003 (42.77 %)	912,595 (1.82 %)	13,804,650 (33.76 %)	64,312 (2.55 %)
641	Townsend's big-eared bat (haplotype 1 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022) GCA_026230055.1	n/a	19,370 (1.77 %)	21,062 (1.61 %)	n/a	42.81 (100.00 %)	219 (0.00 %)	610 (100.00 %)	2,923,694 (25.49 %)	772,382 (3.25 %)	10,654,074 (37.41 %)	48,226 (2.42 %)
642	Townsend's big-eared bat (haplotype 2 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022) GCA_026230045.1	n/a	18,627 (1.82 %)	20,108 (1.67 %)	n/a	42.95 (100.00 %)	217 (0.00 %)	182 (100.00 %)	2,733,927 (24.79 %)	715,258 (3.17 %)	10,099,456 (36.35 %)	47,139 (2.58 %)
643	Transcaucasian mole vole GCA_001685075.1	n/a	20,173 (1.62 %)	18,627 (1.30 %)	n/a	41.51 (96.09 %)	440,846 (3.96 %)	499,269 (96.04 %)	3,827,136 (25.51 %)	810,597 (2.65 %)	13,634,524 (27.54 %)	9,596 (0.16 %)
644	trefoil horseshoe bat (Malaysia primary hap 2024) GCA_043728145.1	n/a	18,871 (1.79 %)	20,351 (1.55 %)	n/a	40.66 (99.99 %)	397 (0.01 %)	136 (100.00 %)	3,580,957 (40.75 %)	683,947 (2.19 %)	11,464,418 (33.39 %)	37,175 (1.31 %)
645	True's beaked whale (hap1.1 2024) GCA_964341445.1	n/a	19,530 (1.21 %)	24,576 (1.13 %)	n/a	42.48 (99.99 %)	1,240 (0.01 %)	2,757 (100.00 %)	4,847,855 (34.88 %)	949,927 (20.01 %)	10,981,914 (51.51 %)	91,880 (2.74 %)
646	True's beaked whale (hap2.1 2024) GCA_964341485.1	n/a	19,313 (1.40 %)	22,642 (1.25 %)	n/a	42.03 (99.99 %)	1,073 (0.01 %)	2,457 (99.99 %)	4,540,507 (37.61 %)	826,104 (12.82 %)	11,296,445 (45.25 %)	80,840 (2.24 %)
647	Upper Galilee mountains blind mole rat (2095 2014 refseq) GCF_000622305.1	54,680 (2.07 %)	19,704 (1.26 %)	21,262 (1.20 %)	n/a	41.26 (95.18 %)	201,121 (4.83 %)	356,097 (95.17 %)	6,165,645 (34.95 %)	1,197,750 (2.77 %)	16,282,383 (36.21 %)	22,905 (0.49 %)
648	Vancouver Island marmot (RANI-1049 2019) GCA_005458795.1	n/a	19,867 (1.62 %)	15,893 (1.33 %)	n/a	39.77 (94.43 %)	296,819 (5.60 %)	315,631 (94.40 %)	4,452,628 (33.94 %)	751,210 (1.84 %)	13,917,879 (30.08 %)	26,541 (0.58 %)
649	vaquita (alternate hap mPhoSin1 2019) GCA_008692045.1	n/a	9,367 (1.66 %)	11,297 (1.30 %)	n/a	41.50 (100.00 %)	1 (0.00 %)	9,470 (100.00 %)	1,708,360 (43.81 %)	267,584 (1.67 %)	5,373,410 (33.52 %)	29,783 (1.94 %)
650	vaquita (mPhoSin1 2019) GCF_008692025.1	60,106 (3.00 %)	18,611 (1.76 %)	20,103 (1.39 %)	35,176 (2.22 %)	41.36 (99.66 %)	212 (0.34 %)	64 (100.00 %)	4,067,454 (44.25 %)	602,407 (1.34 %)	12,468,582 (35.55 %)	66,806 (1.79 %)
651	water buffalo (Mediterranean 2018) GCF_003121395.1	69,771 (3.14 %)	19,465 (1.58 %)	21,849 (1.37 %)	46,051 (1.86 %)	41.81 (99.99 %)	410 (0.01 %)	509 (100.00 %)	5,407,697 (47.11 %)	473,976 (1.54 %)	13,015,899 (41.23 %)	43,120 (1.15 %)
652	water buffalo (Murrah 2021) GCF_019923935.1	80,565 (3.26 %)	19,402 (1.59 %)	20,375 (1.31 %)	n/a	41.75 (100.00 %)	659 (0.00 %)	26 (100.00 %)	5,358,548 (47.11 %)	447,338 (1.14 %)	13,034,537 (41.28 %)	40,189 (1.07 %)
653	Weddell seal (WS11-02 2013 refseq) GCF_000349705.1	48,264 (2.73 %)	21,063 (1.73 %)	22,333 (1.43 %)	n/a	41.39 (70.44 %)	152,836 (29.58 %)	169,547 (70.42 %)	4,420,479 (41.72 %)	471,256 (0.66 %)	13,410,237 (22.09 %)	48,738 (1.01 %)
654	western European hedgehog (2012 refseq) GCF_000296755.1	29,923 (1.67 %)	18,067 (1.33 %)	19,777 (1.35 %)	n/a	41.54 (85.94 %)	219,764 (14.09 %)	225,567 (85.91 %)	6,594,783 (45.66 %)	1,271,533 (2.29 %)	12,374,161 (42.02 %)	28,528 (0.71 %)
655	western European hedgehog (alternate hap 2023) GCA_950295305.1	n/a	14,370 (1.06 %)	24,297 (1.27 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	1 (0.00 %)	26,601 (100.00 %)	3,360,923 (19.59 %)	1,043,098 (3.92 %)	8,511,380 (53.68 %)	23,321 (0.97 %)
656	western European hedgehog (primary hap 2023 refseq) GCF_950295315.1	61,103 (2.36 %)	18,125 (1.16 %)	20,689 (1.21 %)	n/a	42.00 (99.97 %)	3,760 (0.03 %)	1,174 (100.00 %)	4,891,329 (19.68 %)	1,507,929 (3.81 %)	12,571,105 (54.50 %)	32,667 (0.90 %)
657	western European house mouse (WSB_EiJ v3 2022) GCA_921998345.2	n/a	21,722 (2.14 %)	19,586 (1.39 %)	108,856 (4.46 %)	41.81 (98.87 %)	1,233 (1.13 %)	233 (100.00 %)	4,634,551 (40.61 %)	1,541,826 (3.49 %)	13,030,566 (35.21 %)	22,985 (0.56 %)
658	western roe deer (2023) GCA_951849835.1	n/a	20,291 (1.29 %)	23,555 (1.23 %)	n/a	42.31 (100.00 %)	n/a	212 (100.00 %)	4,204,612 (25.49 %)	848,463 (7.79 %)	12,687,776 (48.28 %)	57,315 (1.25 %)
659	western spotted skunk GCA_004023965.1	n/a	21,665 (1.46 %)	34,370 (1.32 %)	n/a	41.61 (99.92 %)	11,822 (0.05 %)	433,831 (99.95 %)	4,889,781 (40.77 %)	901,906 (2.30 %)	13,931,764 (34.80 %)	54,394 (1.54 %)
660	western wild mouse (SPRET_EiJ v3 2022) GCA_921997135.2	n/a	21,699 (2.10 %)	18,837 (1.32 %)	n/a	41.69 (99.51 %)	1,576 (0.49 %)	143 (100.00 %)	4,507,329 (41.24 %)	1,517,241 (3.77 %)	12,832,499 (36.17 %)	22,568 (0.53 %)
661	whiskered bat (hap1 2024) GCA_964094495.2	n/a	19,504 (1.78 %)	22,272 (1.73 %)	n/a	42.99 (99.99 %)	1,566 (0.02 %)	533 (100.00 %)	3,046,246 (25.06 %)	753,151 (4.86 %)	10,596,418 (37.62 %)	66,785 (2.55 %)
662	whiskered bat (hap2 2024) GCA_964195625.1	n/a	18,681 (1.83 %)	21,523 (1.79 %)	n/a	43.13 (99.99 %)	1,414 (0.01 %)	1,741 (99.99 %)	2,849,223 (24.50 %)	688,594 (4.80 %)	9,968,980 (36.80 %)	64,365 (2.68 %)
663	white-beaked dolphin (alternate hap 2023) GCA_949774935.1	n/a	17,639 (1.50 %)	25,684 (1.35 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	n/a	25,619 (100.00 %)	3,039,324 (36.05 %)	637,912 (8.02 %)	9,746,398 (38.98 %)	56,325 (3.33 %)
664	white-beaked dolphin (primary hap 2023 refseq) GCF_949774975.1	59,995 (2.43 %)	18,737 (1.57 %)	20,767 (1.34 %)	n/a	41.91 (99.99 %)	1,070 (0.01 %)	410 (100.00 %)	3,820,566 (36.21 %)	922,103 (8.43 %)	12,304,360 (39.74 %)	68,551 (3.58 %)
665	white-footed mouse (LL stock 2020) GCF_004664715.2	54,479 (2.82 %)	19,971 (1.69 %)	20,132 (1.42 %)	n/a	42.23 (99.95 %)	2,299 (0.05 %)	1,857 (100.00 %)	5,060,487 (30.71 %)	1,258,073 (2.85 %)	14,007,098 (32.99 %)	23,456 (0.67 %)
666	white-tailed deer (Illinois 20LAN1187 2024) GCF_023699985.2	68,660 (3.60 %)	19,951 (1.73 %)	21,804 (1.48 %)	n/a	41.56 (100.00 %)	294 (0.00 %)	718 (100.00 %)	4,512,173 (43.10 %)	402,481 (1.14 %)	12,813,223 (37.56 %)	45,863 (1.30 %)
667	white-tailed deer (Pink-7 2017 refseq) GCF_002102435.1	57,787 (2.93 %)	20,661 (1.75 %)	23,085 (1.50 %)	40,987 (1.94 %)	41.55 (99.10 %)	107,058 (0.91 %)	48,653 (99.10 %)	4,800,704 (41.29 %)	413,129 (2.59 %)	13,296,779 (34.22 %)	44,165 (1.19 %)
668	white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 alternate hap 2022) GCA_024140225.1	n/a	12,198 (1.10 %)	18,494 (1.29 %)	n/a	39.87 (100.00 %)	26 (0.00 %)	14,841 (100.00 %)	1,725,021 (17.81 %)	802,415 (4.26 %)	8,321,474 (45.72 %)	15,669 (0.79 %)
669	white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 primary hap 2022) GCF_024139225.1	40,430 (1.81 %)	17,575 (1.21 %)	21,880 (1.35 %)	47,496 (1.55 %)	39.81 (99.57 %)	1,010 (0.43 %)	147 (100.00 %)	2,846,063 (18.57 %)	1,252,362 (3.89 %)	13,776,063 (46.50 %)	24,589 (0.78 %)
670	wild Bactrian camel (BCGSAC Cfer 1.0 YT-003-E 2020) GCF_009834535.1	70,235 (4.11 %)	18,202 (1.93 %)	20,199 (1.66 %)	42,728 (2.35 %)	41.66 (99.99 %)	2,345 (0.01 %)	2,043 (100.00 %)	3,091,018 (33.31 %)	332,720 (5.33 %)	12,161,286 (28.79 %)	55,524 (1.75 %)
671	wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 refseq) GCF_000311805.1	34,726 (2.40 %)	18,746 (1.96 %)	17,104 (1.61 %)	n/a	41.28 (98.83 %)	60,971 (1.18 %)	68,872 (98.82 %)	2,991,821 (33.93 %)	353,632 (1.23 %)	12,349,615 (25.12 %)	45,437 (1.02 %)
672	wild goat GCA_000978405.1	n/a	19,104 (1.48 %)	16,198 (1.21 %)	n/a	41.91 (91.72 %)	279,195 (8.31 %)	368,693 (91.69 %)	5,563,294 (45.39 %)	452,402 (1.99 %)	13,802,376 (35.47 %)	41,935 (0.63 %)
673	wild yak (GX-2022 2023) GCF_027580195.1	52,505 (2.90 %)	19,278 (1.60 %)	20,813 (1.31 %)	n/a	41.87 (100.00 %)	196 (0.00 %)	2,040 (100.00 %)	5,706,841 (46.71 %)	464,013 (1.82 %)	12,973,198 (41.46 %)	42,508 (1.32 %)
674	wild yak (yakQH1 2013) GCF_000298355.1	29,789 (1.92 %)	19,936 (1.62 %)	19,914 (1.32 %)	n/a	41.71 (95.48 %)	192,006 (4.54 %)	233,198 (95.46 %)	5,348,663 (46.08 %)	449,880 (1.38 %)	13,572,902 (36.62 %)	41,147 (0.82 %)
675	woodchuck (v1.1 L192 2022) GCF_021218885.2	68,030 (3.47 %)	19,116 (1.55 %)	21,017 (1.38 %)	n/a	39.92 (100.00 %)	47 (0.00 %)	3,380 (100.00 %)	5,285,788 (43.20 %)	912,552 (2.73 %)	14,538,866 (35.15 %)	36,914 (1.02 %)
676	woodland dormouse GCA_004027655.1	n/a	23,556 (1.09 %)	55,517 (1.33 %)	n/a	41.52 (99.86 %)	15,691 (0.06 %)	1,283,630 (99.94 %)	7,674,195 (34.99 %)	1,698,258 (3.76 %)	13,705,886 (42.23 %)	68,562 (1.41 %)
677	woodland thicket rat GCF_004785775.1	43,129 (2.40 %)	22,710 (2.13 %)	21,042 (1.49 %)	n/a	41.17 (98.57 %)	76,623 (1.44 %)	23,656 (100.00 %)	4,732,544 (38.04 %)	1,424,025 (3.23 %)	13,549,399 (30.42 %)	18,232 (0.48 %)
678	woolly hare (The Qinghai-Tibet Plateau SH-2023 2024) GCA_036325905.1	n/a	19,363 (1.28 %)	22,239 (1.28 %)	n/a	44.08 (100.00 %)	240 (0.00 %)	112 (100.00 %)	4,432,114 (42.23 %)	966,165 (7.11 %)	13,263,822 (43.77 %)	96,755 (2.28 %)
679	Yangtze finless porpoise (v2 wild 2018 refseq) GCF_003031525.2	43,310 (2.49 %)	18,747 (1.81 %)	19,638 (1.46 %)	n/a	41.28 (99.29 %)	52,647 (0.72 %)	66,343 (99.28 %)	3,547,466 (35.83 %)	540,760 (1.65 %)	12,691,756 (32.88 %)	59,050 (1.48 %)
680	Yangtze River dolphin (v1.1 BGI 2013 refseq) GCF_000442215.2	26,128 (1.61 %)	18,978 (1.74 %)	20,661 (1.39 %)	n/a	41.24 (98.69 %)	123,788 (1.33 %)	148,598 (98.67 %)	3,788,303 (37.04 %)	690,288 (1.96 %)	12,841,906 (35.04 %)	62,458 (1.54 %)
681	yellow-bellied marmot (hap1 2025 refseq) GCF_047511675.1	55,299 (2.52 %)	19,502 (1.44 %)	20,297 (1.34 %)	n/a	39.90 (100.00 %)	330 (0.00 %)	813 (100.00 %)	4,038,893 (29.07 %)	978,915 (3.28 %)	14,404,633 (34.97 %)	36,674 (1.05 %)
682	yellow-bellied marmot (hap2 2025) GCA_047512175.1	n/a	18,677 (1.51 %)	19,370 (1.40 %)	n/a	40.03 (100.00 %)	307 (0.00 %)	329 (100.00 %)	3,694,109 (28.05 %)	793,102 (2.43 %)	13,585,913 (33.39 %)	33,990 (1.02 %)
683	yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.1 2019) GCF_003676075.3	42,667 (2.16 %)	19,547 (1.52 %)	21,406 (1.40 %)	n/a	39.89 (97.96 %)	35,509 (2.04 %)	66,442 (97.96 %)	3,814,223 (27.39 %)	800,865 (1.96 %)	14,323,977 (32.63 %)	34,122 (0.91 %)
684	yellow-footed antechinus (v2 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021) GCF_016432865.1	47,618 (2.51 %)	15,703 (0.78 %)	16,155 (0.90 %)	n/a	36.21 (99.99 %)	620 (0.01 %)	486 (100.00 %)	5,191,383 (23.81 %)	1,269,772 (2.59 %)	21,430,585 (42.69 %)	28,118 (0.66 %)
685	yellow-spotted hyrax GCA_004026845.1	n/a	20,424 (0.86 %)	43,984 (1.27 %)	n/a	40.93 (99.94 %)	3,815 (0.01 %)	971,748 (99.99 %)	5,365,974 (31.41 %)	435,699 (1.22 %)	21,229,266 (45.17 %)	38,521 (0.68 %)
686	yellow-spotted hyrax (mHetBru1 2023) GCA_028571685.1	n/a	17,610 (1.00 %)	20,322 (1.04 %)	n/a	40.80 (100.00 %)	276 (0.00 %)	62 (100.00 %)	3,295,935 (23.58 %)	389,907 (6.37 %)	19,525,382 (45.90 %)	31,831 (0.63 %)
687	yellow-spotted hyrax (mHetBru1 alternate hap 2023) GCA_028571665.1	n/a	16,320 (1.03 %)	20,318 (1.13 %)	n/a	40.93 (100.00 %)	1 (0.00 %)	4,169 (100.00 %)	2,911,332 (23.50 %)	347,110 (4.57 %)	17,256,419 (44.04 %)	28,674 (0.68 %)
688	Yong Hoi Sen's woolly horseshoe bat (Malaysia 20210929_DDd primary hap 2024) GCA_043880425.1	n/a	18,352 (1.71 %)	20,233 (1.46 %)	n/a	41.73 (100.00 %)	196 (0.00 %)	1,530 (100.00 %)	3,466,695 (41.95 %)	934,524 (8.81 %)	11,690,112 (36.30 %)	35,257 (5.20 %)
689	Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP alternate hap 2023) GCA_028536395.1	n/a	19,188 (1.79 %)	21,673 (1.72 %)	n/a	43.03 (100.00 %)	215 (0.00 %)	250 (100.00 %)	3,043,589 (24.76 %)	773,853 (4.49 %)	10,648,494 (37.26 %)	61,910 (2.52 %)
690	Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP primary hap 2023 refseq) GCF_028538775.1	48,707 (3.25 %)	18,807 (1.93 %)	21,046 (1.76 %)	n/a	43.22 (100.00 %)	209 (0.00 %)	684 (100.00 %)	3,552,235 (38.46 %)	719,552 (4.26 %)	10,089,365 (36.35 %)	60,974 (2.61 %)
691	zebu cattle (Hainan HN024 2024) GCA_039881165.1	n/a	19,162 (1.53 %)	20,991 (1.34 %)	n/a	41.77 (99.99 %)	350 (0.01 %)	292 (100.00 %)	3,296,209 (23.14 %)	440,574 (1.28 %)	12,824,144 (40.98 %)	39,400 (1.07 %)
692	zebu cattle (Nelore 2014 refseq) GCF_000247795.1	39,830 (2.52 %)	18,603 (1.59 %)	18,779 (1.29 %)	n/a	41.75 (92.62 %)	6,941,272 (7.66 %)	253,770 (92.59 %)	5,119,428 (46.84 %)	358,908 (0.88 %)	13,431,672 (36.60 %)	35,241 (0.84 %)
693	zebu cattle (Sahiwal x Tharparkar maternal NIAB-ARS_2022 2023) GCF_029378745.1	70,745 (4.27 %)	19,546 (1.58 %)	21,187 (1.33 %)	n/a	41.86 (100.00 %)	283 (0.00 %)	67 (100.00 %)	5,530,890 (46.61 %)	459,827 (1.43 %)	13,190,355 (41.36 %)	42,544 (1.21 %)
TOTALS:	total assembly count 693

Additional hubs with collections of assemblies
Collection	Hub index pages:	Assembly statistics:	Track statistics:
Primates	602 assemblies	assembly stats	track stats
Mammals	693 assemblies	assembly stats	track stats
Birds	450 assemblies	assembly stats	track stats
Fishes	504 assemblies	assembly stats	track stats
other vertebrates	331 assemblies	assembly stats	track stats
Invertebrates	1379 assemblies	assembly stats	track stats
Plants	345 assemblies	assembly stats	track stats
Fungi	948 assemblies	assembly stats	track stats
Viruses	14945 assemblies	assembly stats	track stats
Archaea	2622 assemblies	assembly stats	track stats
Bacteria	21462 assemblies	assembly stats	track stats
legacy/superseded	687 assemblies	assembly stats	track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project	1303 assemblies	assembly stats	track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project	126 assemblies	assembly stats	track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium	464 assemblies	assembly stats	track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center	1965 assemblies	assembly stats	track stats

Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

See also: hub access, assembly statistics

Data resource links