Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of mammals only.

See also: hub access, assembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 aardvark (SDZICR_OR568_19922 2012 Broad)
GCF_000298275.1		 25,607
(1.08 %)		 18,351
(1.06 %)		 20,358
(0.98 %)		 n/a 40.07
(76.89 %)		 411,144
(23.15 %)		 433,653
(76.85 %)		 n/a 536,700
(0.74 %)		 18,176,790
(39.08 %)		 26,235
(0.40 %)
2 African grass rat (maternal 2020)
GCA_011750645.1		 n/a 20,916
(2.01 %)		 19,513
(1.43 %)		 n/a 41.37
(98.89 %)		 1,526
(1.11 %)		 1,610
(100.00 %)		 4,928,847
(37.45 %)		 1,652,295
(5.20 %)		 13,507,965
(32.27 %)		 17,712
(0.51 %)
3 African grass rat (paternal 2020)
GCA_011762545.1		 n/a 20,796
(2.00 %)		 19,611
(1.43 %)		 n/a 41.42
(97.70 %)		 1,563
(2.30 %)		 1,740
(100.00 %)		 4,904,243
(37.25 %)		 1,672,608
(5.37 %)		 13,465,246
(32.19 %)		 17,677
(0.50 %)
4 African grass rat (paternal X 2020 refseq)
GCF_011762505.1		 45,963
(2.46 %)		 20,878
(1.99 %)		 19,613
(1.43 %)		 37,929
(2.32 %)		 41.39
(99.19 %)		 1,624
(0.81 %)		 1,595
(100.00 %)		 4,939,557
(37.33 %)		 1,674,970
(5.40 %)		 13,613,429
(32.71 %)		 17,767
(0.51 %)
5 African grass rat (v2 paternal X 2024 genbank)
GCA_011762505.2		 n/a 19,637
(1.95 %)		 19,610
(1.43 %)		 n/a 41.39
(99.19 %)		 1,624
(0.81 %)		 1,596
(100.00 %)		 5,399,465
(42.90 %)		 1,674,970
(5.40 %)		 13,613,540
(32.71 %)		 17,767
(0.51 %)
6 African grass rat (v3 paternal hap 2024)
GCA_011762505.3		 n/a 20,986
(2.01 %)		 19,611
(1.43 %)		 n/a 41.39
(99.19 %)		 1,624
(0.81 %)		 1,596
(100.00 %)		 4,532,782
(33.95 %)		 1,674,970
(5.40 %)		 13,612,916
(32.71 %)		 17,767
(0.51 %)
7 African hunting dog
GCA_001887905.1		 n/a 18,956
(1.75 %)		 17,562
(1.41 %)		 n/a 40.98
(92.89 %)		 1,415,298
(7.28 %)		 803
(100.00 %)		 4,458,183
(39.99 %)		 658,637
(1.13 %)		 13,671,493
(28.24 %)		 47,644
(1.64 %)
8 African hunting dog (LycPic1hap1 2024)
GCA_040955645.1		 n/a 18,688
(1.61 %)		 19,670
(1.44 %)		 n/a 41.35
(100.00 %)		 82
(0.00 %)		 86
(100.00 %)		 4,281,139
(31.62 %)		 959,378
(2.78 %)		 12,859,760
(32.95 %)		 49,122
(2.32 %)
9 African hunting dog (LycPic1hap2 2024)
GCA_040955705.1		 n/a 19,463
(1.58 %)		 20,378
(1.42 %)		 n/a 41.30
(100.00 %)		 91
(0.00 %)		 77
(100.00 %)		 4,513,580
(32.16 %)		 1,008,611
(2.91 %)		 13,570,452
(33.71 %)		 50,954
(2.21 %)
10 African savanna elephant (2009 refseq)
GCF_000001905.1		 46,043
(2.30 %)		 19,169
(1.26 %)		 19,664
(1.10 %)		 n/a 40.76
(97.57 %)		 93,514
(2.45 %)		 95,866
(97.55 %)		 6,363,315
(57.54 %)		 365,797
(0.88 %)		 16,073,053
(44.89 %)		 33,513
(0.68 %)
11 African savanna elephant (hap1 mLoxAfr1 2023)
GCA_030020305.1		 n/a 18,845
(1.07 %)		 22,426
(1.10 %)		 n/a 41.34
(99.85 %)		 169
(0.15 %)		 1,253
(99.85 %)		 4,406,744
(29.55 %)		 925,868
(4.71 %)		 15,966,881
(50.49 %)		 68,531
(1.61 %)
12 African savanna elephant (hap2 2023 genbank)
GCA_030014295.1		 n/a 18,981
(1.10 %)		 22,759
(1.12 %)		 n/a 41.25
(99.90 %)		 231
(0.10 %)		 880
(100.00 %)		 4,426,756
(29.95 %)		 832,908
(4.08 %)		 16,118,910
(49.47 %)		 62,315
(1.49 %)
13 African savanna elephant (hap2 2023 refseq)
GCF_030014295.1		 64,034
(3.35 %)		 18,980
(1.10 %)		 21,593
(1.06 %)		 n/a 41.25
(99.90 %)		 231
(0.10 %)		 879
(100.00 %)		 4,426,749
(29.95 %)		 832,904
(4.08 %)		 16,118,888
(49.47 %)		 62,314
(1.49 %)
14 agile gracile mouse opossum
GCF_016433145.1		 30,697
(1.32 %)		 17,361
(0.78 %)		 17,596
(0.81 %)		 n/a 37.86
(91.75 %)		 85,142
(8.25 %)		 60,714
(100.00 %)		 7,917,577
(49.04 %)		 1,054,566
(1.57 %)		 22,701,659
(37.69 %)		 27,301
(0.49 %)
15 alpaca (v3.2 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U)
GCF_000164845.4		 54,987
(3.56 %)		 18,439
(1.93 %)		 18,426
(1.63 %)		 n/a 41.40
(95.85 %)		 166,272
(4.17 %)		 77,389
(100.00 %)		 3,004,413
(33.17 %)		 315,092
(1.36 %)		 12,458,272
(24.89 %)		 54,502
(1.38 %)
16 Alpine marmot (2019)
GCF_001458135.2		 69,587
(3.43 %)		 19,047
(1.54 %)		 17,768
(1.39 %)		 n/a 39.80
(96.13 %)		 88,858
(3.88 %)		 14,031
(100.00 %)		 3,726,252
(26.48 %)		 746,953
(1.83 %)		 14,066,368
(30.30 %)		 30,191
(0.63 %)
17 Alvarez's mastiff bat (A012 2023)
GCA_031001765.1		 n/a 19,086
(1.55 %)		 22,040
(1.52 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 1,182
(0.01 %)		 1,369
(99.99 %)		 3,846,728
(31.78 %)		 639,852
(2.90 %)		 11,937,936
(38.98 %)		 75,377
(2.21 %)
18 Alvarez's mastiff bat (hap1 2024)
GCA_037157525.1		 n/a 18,980
(1.50 %)		 22,394
(1.50 %)		 n/a 42.30
(100.00 %)		 80
(0.00 %)		 326
(100.00 %)		 3,896,863
(31.56 %)		 659,711
(4.74 %)		 11,945,162
(40.81 %)		 76,769
(2.57 %)
19 Alvarez's mastiff bat (hap2 2024)
GCA_037176705.1		 n/a 19,066
(1.48 %)		 22,356
(1.48 %)		 n/a 42.25
(100.00 %)		 75
(0.00 %)		 287
(100.00 %)		 3,908,607
(31.48 %)		 664,931
(5.23 %)		 11,892,191
(41.08 %)		 76,453
(2.43 %)
20 Amazon manatee (hap1 2025)
GCA_046562985.1		 n/a 17,917
(1.26 %)		 20,499
(1.11 %)		 n/a 40.77
(100.00 %)		 377
(0.00 %)		 550
(100.00 %)		 5,812,915
(56.93 %)		 431,488
(2.57 %)		 14,336,638
(47.98 %)		 33,775
(0.84 %)
21 Amazon manatee (hap2 2025)
GCA_046562895.1		 n/a 18,949
(1.23 %)		 21,655
(1.08 %)		 n/a 40.80
(100.00 %)		 294
(0.00 %)		 401
(100.00 %)		 6,218,266
(57.31 %)		 470,437
(3.04 %)		 15,241,157
(48.91 %)		 37,124
(0.86 %)
22 American beaver (Ward 2017 refseq)
GCF_001984765.1		 40,013
(2.15 %)		 20,867
(1.53 %)		 24,201
(1.33 %)		 n/a 39.72
(99.99 %)		 3,321
(0.01 %)		 21,157
(100.00 %)		 4,526,430
(33.75 %)		 486,353
(1.30 %)		 14,347,145
(31.96 %)		 23,046
(0.72 %)
23 American beaver (hap1 2025)
GCA_047511655.1		 n/a 19,828
(1.45 %)		 20,376
(1.31 %)		 n/a 39.72
(100.00 %)		 181
(0.00 %)		 503
(100.00 %)		 4,030,880
(35.35 %)		 566,770
(2.63 %)		 14,198,970
(35.24 %)		 24,454
(0.96 %)
24 American beaver (hap2 2025)
GCA_047511605.1		 n/a 19,144
(1.44 %)		 18,959
(1.23 %)		 n/a 39.54
(100.00 %)		 194
(0.00 %)		 229
(100.00 %)		 3,981,637
(35.85 %)		 561,691
(2.26 %)		 14,374,940
(35.03 %)		 23,386
(0.80 %)
25 American bison (2014 refseq)
GCF_000754665.1		 38,686
(2.34 %)		 19,782
(1.47 %)		 20,444
(1.25 %)		 n/a 41.82
(93.12 %)		 341,984
(6.92 %)		 470,415
(93.08 %)		 n/a 419,596
(0.95 %)		 13,519,877
(37.66 %)		 60,388
(1.03 %)
26 American black bear (L20-20 alternate hap 2022)
GCA_024610745.1		 n/a 22,502
(1.17 %)		 43,431
(1.28 %)		 n/a 43.14
(99.99 %)		 n/a 77,311
(100.00 %)		 4,587,986
(32.30 %)		 773,829
(6.39 %)		 14,594,034
(35.67 %)		 78,849
(3.32 %)
27 American black bear (L20-20 primary hap 2022)
GCA_024610735.1		 n/a 18,458
(1.52 %)		 21,049
(1.43 %)		 n/a 42.93
(100.00 %)		 22
(0.00 %)		 317
(100.00 %)		 4,000,508
(32.69 %)		 641,903
(5.91 %)		 13,210,530
(35.54 %)		 68,981
(3.00 %)
28 American black bear (UA15103 2021)
GCF_020975775.1		 53,916
(3.11 %)		 18,840
(1.73 %)		 20,969
(1.50 %)		 n/a 42.09
(100.00 %)		 n/a 2,213
(100.00 %)		 3,936,528
(34.53 %)		 594,864
(2.90 %)		 13,725,005
(32.35 %)		 62,580
(1.91 %)
29 American mink (2018)
GCA_900108605.1		 n/a 18,686
(1.70 %)		 20,016
(1.50 %)		 36,997
(1.74 %)		 41.60
(92.95 %)		 154,172
(7.07 %)		 161,347
(92.93 %)		 4,350,343
(38.70 %)		 606,128
(1.17 %)		 13,605,797
(28.74 %)		 54,199
(1.98 %)
30 American mink (hap1 2024)
GCA_964106545.1		 n/a 19,203
(1.43 %)		 22,174
(1.33 %)		 n/a 42.39
(99.98 %)		 2,957
(0.02 %)		 435
(100.00 %)		 4,188,829
(30.04 %)		 802,295
(5.81 %)		 14,041,290
(37.98 %)		 65,430
(2.64 %)
31 American mink (hap2 2024)
GCA_964106205.1		 n/a 18,890
(1.43 %)		 21,684
(1.33 %)		 n/a 42.35
(99.98 %)		 2,849
(0.02 %)		 3,200
(99.98 %)		 4,158,563
(30.22 %)		 786,430
(5.25 %)		 13,845,377
(37.58 %)		 64,307
(2.75 %)
32 American mink (M4711 2021 Dalhousie U)
GCF_020171115.1		 50,253
(2.26 %)		 18,949
(1.49 %)		 20,914
(1.29 %)		 n/a 42.26
(100.00 %)		 n/a 183
(100.00 %)		 4,705,680
(39.15 %)		 795,684
(5.50 %)		 14,085,357
(37.99 %)		 63,307
(2.38 %)
33 American pika (hap1 2023)
GCF_030435755.1		 45,008
(1.93 %)		 17,997
(1.35 %)		 23,185
(1.49 %)		 n/a 44.16
(100.00 %)		 432
(0.00 %)		 5,864
(100.00 %)		 4,126,248
(43.60 %)		 628,344
(15.71 %)		 11,100,962
(42.69 %)		 60,350
(1.67 %)
34 American pika (hap2 2023)
GCA_030435715.1		 n/a 16,911
(1.23 %)		 21,107
(1.43 %)		 n/a 44.43
(100.00 %)		 375
(0.00 %)		 6,123
(100.00 %)		 1,808,768
(10.42 %)		 561,106
(21.05 %)		 10,283,513
(45.97 %)		 54,919
(1.33 %)
35 American pika 3.0 (2012 Broad refseq)
GCF_000292845.1		 26,253
(1.93 %)		 17,576
(1.61 %)		 20,076
(1.70 %)		 n/a 43.35
(87.20 %)		 122,542
(12.82 %)		 132,962
(87.18 %)		 2,761,257
(29.47 %)		 414,896
(1.07 %)		 10,968,698
(26.71 %)		 44,652
(1.14 %)
36 American pika 4.0 (UAM:Mamm:113957 2020)
GCF_014633375.1		 31,887
(1.92 %)		 17,532
(1.60 %)		 19,609
(1.65 %)		 n/a 43.35
(87.14 %)		 124,941
(12.88 %)		 9,351
(100.00 %)		 2,827,662
(29.77 %)		 414,980
(1.07 %)		 10,969,165
(26.69 %)		 44,743
(1.13 %)
37 American wolverine (FN33715 2022)
GCA_024509225.1		 n/a 18,360
(1.57 %)		 20,615
(1.47 %)		 n/a 41.70
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 758
(100.00 %)		 4,038,995
(32.25 %)		 664,825
(1.25 %)		 13,625,080
(33.05 %)		 56,595
(2.13 %)
38 Amur tiger (TaeGuk 2013 refseq)
GCF_000464555.1		 33,681
(2.23 %)		 17,929
(1.49 %)		 15,090
(1.29 %)		 n/a 41.40
(97.59 %)		 155,553
(2.44 %)		 157,032
(97.56 %)		 n/a 831,136
(1.67 %)		 13,654,437
(31.78 %)		 65,229
(1.60 %)
39 Angolan free-tailed bat (Cote d'Ivoire 20210831_DDa 2024)
GCA_043748645.1		 n/a 18,528
(1.65 %)		 22,359
(1.64 %)		 n/a 42.89
(100.00 %)		 88
(0.00 %)		 44
(100.00 %)		 3,531,044
(35.70 %)		 555,304
(2.07 %)		 11,439,853
(36.03 %)		 102,112
(3.75 %)
40 Antarctic minke whale
GCA_000978805.1		 n/a 23,312
(1.49 %)		 45,535
(1.26 %)		 n/a 40.73
(99.37 %)		 299,456
(0.64 %)		 720,900
(99.36 %)		 4,011,313
(41.13 %)		 504,837
(1.04 %)		 13,553,641
(30.96 %)		 56,223
(1.31 %)
41 Antillean ghost-faced bat
GCA_004026545.1		 n/a 20,088
(1.74 %)		 31,558
(1.63 %)		 n/a 41.74
(99.97 %)		 1,835
(0.01 %)		 207,094
(99.99 %)		 3,025,044
(30.67 %)		 332,606
(0.70 %)		 12,504,556
(28.79 %)		 65,503
(2.30 %)
42 aoudad
GCA_002201775.1		 n/a 19,905
(1.62 %)		 27,488
(1.60 %)		 n/a 42.01
(95.96 %)		 186,672
(4.05 %)		 263,992
(95.95 %)		 5,418,013
(45.05 %)		 471,426
(1.19 %)		 13,396,252
(36.94 %)		 48,844
(1.32 %)
43 Arabian camel (Drom800 2019 refseq)
GCF_000803125.2		 64,519
(3.85 %)		 18,483
(1.89 %)		 20,554
(1.62 %)		 n/a 41.51
(99.22 %)		 47,342
(0.79 %)		 21,070
(100.00 %)		 3,233,022
(34.07 %)		 345,049
(1.55 %)		 13,383,050
(26.19 %)		 58,872
(1.79 %)
44 Arabian camel (hap2 2024)
GCA_036321565.1		 n/a 17,085
(1.73 %)		 19,317
(1.59 %)		 n/a 41.75
(100.00 %)		 210
(0.00 %)		 173
(100.00 %)		 2,818,446
(29.44 %)		 316,646
(8.90 %)		 11,192,133
(31.47 %)		 52,135
(1.67 %)
45 Arabian camel (paternal hap 2024 genbank)
GCA_036321535.1		 n/a 18,080
(1.66 %)		 20,345
(1.52 %)		 n/a 41.64
(100.00 %)		 195
(0.00 %)		 172
(100.00 %)		 3,040,473
(29.22 %)		 343,482
(10.93 %)		 11,797,012
(33.50 %)		 55,428
(1.61 %)
46 Arabian camel (paternal hap 2024 refseq)
GCF_036321535.1		 62,940
(3.46 %)		 18,078
(1.66 %)		 21,071
(1.56 %)		 n/a 41.64
(100.00 %)		 195
(0.00 %)		 171
(100.00 %)		 3,040,467
(29.22 %)		 343,480
(10.93 %)		 11,796,955
(33.50 %)		 55,427
(1.61 %)
47 Arctic fox (Blue_001 2021 refseq)
GCF_018345385.1		 60,759
(3.11 %)		 19,942
(1.72 %)		 19,529
(1.38 %)		 n/a 41.27
(100.00 %)		 529
(0.00 %)		 929
(100.00 %)		 4,821,229
(41.22 %)		 1,006,124
(2.31 %)		 13,556,149
(32.92 %)		 49,997
(2.23 %)
48 Arctic ground squirrel (AGS 11-09-20 2018)
GCF_003426925.1		 39,569
(2.25 %)		 18,954
(1.74 %)		 19,372
(1.45 %)		 n/a 39.95
(89.51 %)		 2,429,461
(10.59 %)		 15,883
(100.00 %)		 4,400,304
(32.67 %)		 672,831
(1.50 %)		 13,913,477
(26.41 %)		 27,575
(0.72 %)
49 Arctic ground squirrel (hap1 2024)
GCA_045843805.1		 n/a 20,255
(1.35 %)		 21,401
(1.44 %)		 n/a 40.08
(100.00 %)		 694
(0.00 %)		 2,530
(100.00 %)		 4,287,108
(25.85 %)		 895,123
(5.96 %)		 15,722,314
(36.45 %)		 34,781
(0.82 %)
50 Arctic ground squirrel (hap2 2024)
GCA_045843765.1		 n/a 18,385
(1.31 %)		 19,099
(1.34 %)		 n/a 39.97
(100.00 %)		 590
(0.00 %)		 2,307
(100.00 %)		 4,314,945
(35.63 %)		 820,736
(6.65 %)		 14,490,422
(35.95 %)		 31,201
(0.78 %)
51 Asian palm civet
GCA_004024585.1		 n/a 22,124
(1.43 %)		 43,710
(1.39 %)		 n/a 42.52
(99.95 %)		 4,533
(0.02 %)		 442,658
(99.98 %)		 4,877,367
(40.32 %)		 754,440
(1.35 %)		 14,557,779
(32.29 %)		 148,246
(5.67 %)
52 Asiatic elephant (mEleMax1 alternate hap 2022)
GCA_024166345.1		 n/a 17,906
(1.18 %)		 21,966
(1.14 %)		 n/a 41.14
(100.00 %)		 n/a 6,361
(100.00 %)		 3,818,524
(29.72 %)		 533,426
(3.22 %)		 14,381,781
(47.30 %)		 50,264
(1.15 %)
53 Asiatic elephant (mEleMax1 primary hap 2022)
GCF_024166365.1		 61,202
(2.60 %)		 18,887
(1.13 %)		 21,194
(1.06 %)		 n/a 41.14
(99.90 %)		 126
(0.10 %)		 64
(100.00 %)		 4,358,470
(31.27 %)		 663,094
(4.56 %)		 16,261,778
(48.66 %)		 69,120
(1.32 %)
54 Asiatic mouflon (Amuf_v1 2020)
GCA_014523465.1		 n/a 19,569
(1.59 %)		 21,293
(1.35 %)		 n/a 41.97
(99.68 %)		 257
(0.32 %)		 128
(100.00 %)		 5,390,761
(47.15 %)		 451,837
(1.15 %)		 13,157,608
(40.67 %)		 44,158
(1.19 %)
55 Asiatic tapir (hap1 2023)
GCA_031878655.1		 n/a 18,969
(1.75 %)		 20,207
(1.36 %)		 n/a 41.25
(100.00 %)		 79
(0.00 %)		 262
(100.00 %)		 3,650,963
(38.06 %)		 355,322
(2.63 %)		 14,837,952
(31.37 %)		 37,174
(1.87 %)
56 Asiatic tapir (hap2 2023)
GCA_031878705.1		 n/a 18,931
(1.76 %)		 19,988
(1.37 %)		 n/a 41.16
(100.00 %)		 92
(0.00 %)		 193
(100.00 %)		 3,632,286
(38.21 %)		 350,074
(2.22 %)		 14,785,531
(30.90 %)		 36,699
(1.70 %)
57 ass (Dezhou 2021)
GCF_016077325.2		 84,046
(4.01 %)		 18,838
(1.75 %)		 20,239
(1.42 %)		 69,689
(3.29 %)		 41.42
(99.86 %)		 1,922
(0.15 %)		 50
(100.00 %)		 3,840,509
(41.57 %)		 319,943
(0.81 %)		 14,889,114
(29.46 %)		 41,082
(1.37 %)
58 ass (Donkey D_3611 2024)
GCF_041296235.1		 92,510
(3.84 %)		 18,566
(1.54 %)		 21,504
(1.32 %)		 n/a 42.37
(99.94 %)		 7
(0.06 %)		 849
(100.00 %)		 3,555,052
(38.38 %)		 658,645
(5.79 %)		 14,242,715
(36.79 %)		 43,875
(3.45 %)
59 ass (Maral har 2015 refseq)
GCF_001305755.1		 48,989
(3.12 %)		 18,838
(1.78 %)		 19,295
(1.44 %)		 n/a 41.28
(98.63 %)		 69,593
(1.38 %)		 2,167
(100.00 %)		 3,731,432
(40.84 %)		 289,737
(0.96 %)		 14,695,308
(28.58 %)		 40,025
(1.06 %)
60 Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap1.1 2024)
GCA_964270905.1		 n/a 18,773
(1.50 %)		 21,069
(1.29 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 1,034
(0.01 %)		 900
(100.00 %)		 3,975,427
(35.64 %)		 1,054,000
(10.27 %)		 12,281,095
(41.92 %)		 79,762
(4.08 %)
61 Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap2.1 2024)
GCA_964270935.1		 n/a 17,961
(1.59 %)		 20,087
(1.36 %)		 n/a 42.05
(99.99 %)		 917
(0.01 %)		 1,796
(99.99 %)		 3,626,392
(35.51 %)		 824,778
(7.32 %)		 11,499,904
(39.18 %)		 74,348
(3.46 %)
62 Australian echidna (mTacAcu1 alternate hap 2020)
GCA_015852515.1		 n/a 13,505
(1.03 %)		 18,978
(1.47 %)		 n/a 45.32
(99.98 %)		 26
(0.02 %)		 3,482
(100.00 %)		 6,880,857
(41.88 %)		 1,099,932
(7.47 %)		 8,156,735
(56.68 %)		 70,515
(2.88 %)
63 Australian echidna (mTacAcu1 primary hap 2020)
GCF_015852505.1		 42,938
(2.28 %)		 14,891
(1.01 %)		 19,714
(1.45 %)		 n/a 45.30
(98.61 %)		 524
(1.39 %)		 310
(100.00 %)		 7,814,876
(42.89 %)		 1,219,764
(6.93 %)		 9,488,325
(55.68 %)		 78,364
(2.73 %)
64 Bactrian camel (Alxa 2014 refseq)
GCF_000767855.1		 52,178
(3.64 %)		 18,303
(1.98 %)		 17,097
(1.64 %)		 n/a 41.32
(99.32 %)		 31,980
(0.69 %)		 67,435
(99.31 %)		 2,966,704
(34.06 %)		 306,997
(0.95 %)		 12,209,949
(25.43 %)		 49,790
(1.25 %)
65 banded mongoose
GCA_004023785.1		 n/a 21,568
(1.57 %)		 30,427
(1.43 %)		 n/a 42.00
(99.96 %)		 4,510
(0.02 %)		 316,874
(99.98 %)		 4,768,524
(40.51 %)		 684,187
(1.30 %)		 13,713,756
(33.42 %)		 78,648
(2.80 %)
66 bank vole
GCF_902806735.1		 56,410
(2.99 %)		 18,977
(1.71 %)		 18,408
(1.50 %)		 n/a 41.86
(98.62 %)		 53,506
(1.39 %)		 54,142
(98.61 %)		 3,222,366
(21.59 %)		 933,697
(2.20 %)		 12,831,232
(31.50 %)		 18,784
(0.42 %)
67 banner-tailed kangaroo rat
GCF_019054845.1		 43,753
(1.82 %)		 18,397
(1.18 %)		 24,180
(1.39 %)		 n/a 40.83
(100.00 %)		 n/a 2,026
(100.00 %)		 5,587,719
(30.97 %)		 1,363,513
(3.95 %)		 12,128,920
(48.74 %)		 36,371
(1.27 %)
68 banteng 2023
GCF_032452875.1		 71,974
(3.56 %)		 19,305
(1.36 %)		 21,174
(1.20 %)		 n/a 42.79
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 1,518
(100.00 %)		 3,344,481
(20.63 %)		 1,039,571
(11.74 %)		 13,031,356
(47.36 %)		 73,031
(1.72 %)
69 bat A.intermedius (hap2 2024)
GCA_038363225.1		 n/a 17,124
(1.63 %)		 18,342
(1.54 %)		 n/a 42.25
(100.00 %)		 56
(0.00 %)		 187
(100.00 %)		 2,597,378
(26.81 %)		 332,733
(4.43 %)		 10,957,327
(33.52 %)		 63,688
(2.22 %)
70 bat H.larvatus (China 20210929_DDb primary hap 2024)
GCA_043727955.1		 n/a 19,354
(1.74 %)		 21,367
(1.51 %)		 n/a 41.48
(100.00 %)		 190
(0.00 %)		 265
(100.00 %)		 3,860,506
(38.95 %)		 722,335
(7.13 %)		 11,994,816
(35.77 %)		 44,562
(1.21 %)
71 beluga whale (Cook Inlet, Alaska, USA DL-CIB17-05 2020)
GCA_009917745.1		 n/a 19,239
(1.79 %)		 22,513
(1.43 %)		 35,878
(1.82 %)		 41.25
(97.57 %)		 27,070
(2.43 %)		 52,780
(97.57 %)		 4,021,599
(43.53 %)		 544,323
(1.08 %)		 12,738,162
(33.47 %)		 59,710
(1.51 %)
72 beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v3 2019)
GCF_002288925.2		 59,400
(3.08 %)		 18,667
(1.79 %)		 20,314
(1.43 %)		 n/a 41.24
(98.49 %)		 24,414
(1.52 %)		 29,444
(98.48 %)		 4,001,248
(43.73 %)		 543,276
(1.11 %)		 12,802,735
(34.18 %)		 59,307
(1.53 %)
73 big brown bat (BU_THK_EF1 2012)
GCF_000308155.1		 59,162
(3.17 %)		 18,334
(1.94 %)		 20,121
(1.78 %)		 n/a 42.93
(89.41 %)		 160,269
(10.62 %)		 167,057
(89.38 %)		 2,842,065
(25.82 %)		 614,712
(1.89 %)		 10,407,733
(28.90 %)		 66,720
(2.99 %)
74 big brown bat (TK198812 2023)
GCF_027574615.1		 46,266
(2.61 %)		 18,620
(1.80 %)		 21,271
(1.72 %)		 n/a 43.51
(100.00 %)		 75
(0.00 %)		 48
(100.00 %)		 3,041,145
(25.08 %)		 904,075
(3.80 %)		 10,530,666
(37.05 %)		 77,605
(3.68 %)
75 bighorn sheep (v2 Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024)
GCF_042477335.2		 78,636
(2.63 %)		 19,459
(1.36 %)		 21,150
(1.33 %)		 n/a 43.91
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 42
(100.00 %)		 3,963,383
(22.89 %)		 826,353
(11.67 %)		 12,918,743
(46.86 %)		 52,254
(10.67 %)
76 bighorn sheep (BS48 2019)
GCA_004026945.1		 n/a 23,059
(1.34 %)		 36,486
(1.19 %)		 n/a 43.20
(99.90 %)		 9,412
(0.03 %)		 1,057,548
(99.97 %)		 6,321,577
(50.75 %)		 716,846
(1.66 %)		 13,904,326
(44.98 %)		 95,564
(1.72 %)
77 bilby (mMagLag1 2024)
GCA_037893015.1		 n/a 18,686
(0.72 %)		 17,238
(0.81 %)		 n/a 37.35
(99.66 %)		 4,431
(0.34 %)		 609
(100.00 %)		 6,263,094
(27.34 %)		 2,223,995
(5.89 %)		 23,994,844
(43.69 %)		 51,039
(3.47 %)
78 black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap1 2024)
GCA_043290085.1		 n/a 20,713
(0.64 %)		 21,469
(0.64 %)		 n/a 41.74
(100.00 %)		 770
(0.00 %)		 470
(100.00 %)		 3,860,121
(14.52 %)		 1,230,113
(2.81 %)		 1,239
(100.00 %)		 49,878
(0.73 %)
79 black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap2 2024)
GCA_043290065.1		 n/a 19,814
(0.63 %)		 20,140
(0.63 %)		 n/a 41.82
(100.00 %)		 723
(0.00 %)		 315
(100.00 %)		 3,657,357
(14.24 %)		 1,158,716
(2.84 %)		 22,924,986
(64.53 %)		 46,774
(0.90 %)
80 black flying fox
GCF_000325575.1		 46,978
(3.15 %)		 18,089
(2.00 %)		 20,668
(1.75 %)		 n/a 39.74
(97.93 %)		 104,566
(2.08 %)		 170,164
(97.92 %)		 2,975,186
(34.05 %)		 481,859
(1.45 %)		 12,582,349
(26.52 %)		 62,483
(3.88 %)
81 black rat
GCF_011064425.1		 39,601
(2.37 %)		 20,793
(1.98 %)		 17,944
(1.37 %)		 n/a 42.14
(99.98 %)		 6,158
(0.02 %)		 2,173
(100.00 %)		 4,715,157
(41.57 %)		 1,432,294
(3.45 %)		 13,275,550
(32.36 %)		 18,055
(0.48 %)
82 black rhinoceros (alternate hap 2021)
GCA_020826835.1		 n/a 19,000
(1.37 %)		 22,547
(1.26 %)		 n/a 41.56
(99.97 %)		 178
(0.03 %)		 1,199
(100.00 %)		 4,340,245
(37.22 %)		 564,468
(8.07 %)		 14,384,523
(40.40 %)		 44,971
(1.16 %)
83 black rhinoceros (BS38 2019 Broad)
GCA_004027315.1		 n/a 21,713
(1.32 %)		 32,731
(1.18 %)		 n/a 41.22
(99.85 %)		 7,256
(0.02 %)		 2,029,914
(99.98 %)		 4,618,655
(36.76 %)		 618,834
(2.21 %)		 16,248,532
(40.32 %)		 44,113
(0.97 %)
84 black rhinoceros (primary hap 2021 refseq)
GCF_020826845.1		 56,255
(2.28 %)		 18,774
(1.38 %)		 22,348
(1.26 %)		 n/a 41.59
(99.95 %)		 215
(0.05 %)		 1,076
(100.00 %)		 4,200,390
(36.22 %)		 548,030
(8.34 %)		 14,347,693
(40.14 %)		 43,525
(1.14 %)
85 black-footed cat
GCA_004023925.1		 n/a 22,895
(1.14 %)		 51,789
(1.13 %)		 n/a 41.92
(99.90 %)		 13,476
(0.06 %)		 603,600
(99.94 %)		 5,261,265
(44.11 %)		 943,514
(1.77 %)		 13,681,435
(34.77 %)		 86,892
(2.23 %)
86 black-footed ferret (SB6536 2022)
GCF_022355385.1		 56,402
(2.78 %)		 18,681
(1.55 %)		 20,685
(1.40 %)		 n/a 41.55
(96.71 %)		 33,042
(3.30 %)		 20,575
(100.00 %)		 4,087,717
(30.94 %)		 695,805
(1.18 %)		 13,880,116
(32.08 %)		 54,060
(2.11 %)
87 black-lipped pika
GCF_017591425.1		 46,297
(2.64 %)		 18,529
(1.63 %)		 23,458
(1.83 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 54
(0.00 %)		 2,214
(100.00 %)		 1,843,705
(12.62 %)		 471,798
(2.76 %)		 11,394,992
(31.27 %)		 63,124
(1.85 %)
88 Blainville's beaked whale (alternate hap 2022)
GCA_025094165.1		 n/a 17,838
(1.54 %)		 21,389
(1.35 %)		 n/a 41.71
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,198
(100.00 %)		 3,542,727
(35.35 %)		 650,369
(8.86 %)		 10,971,320
(41.15 %)		 62,389
(1.68 %)
89 Blainville's beaked whale (primary hap 2022 refseq)
GCF_025265405.1		 47,540
(2.07 %)		 19,041
(1.52 %)		 20,766
(1.27 %)		 n/a 41.70
(99.97 %)		 97
(0.03 %)		 74
(100.00 %)		 3,964,038
(35.29 %)		 765,957
(8.74 %)		 12,128,229
(41.78 %)		 70,851
(1.80 %)
90 blue whale (alternate hap JJ_BM4_2016_0621 2019)
GCA_008658375.1		 n/a 17,285
(1.80 %)		 21,295
(1.43 %)		 n/a 41.22
(100.00 %)		 n/a 12,574
(100.00 %)		 3,196,354
(43.47 %)		 467,194
(1.26 %)		 10,176,588
(33.66 %)		 56,916
(1.85 %)
91 Blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 alternate hap 2020)
GCA_008658375.2		 n/a 16,997
(1.82 %)		 20,609
(1.44 %)		 n/a 41.20
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 10,999
(100.00 %)		 3,126,800
(43.49 %)		 454,452
(1.23 %)		 9,916,868
(33.63 %)		 55,436
(1.85 %)
92 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v3 primary hap 2020)
GCF_009873245.2		 58,750
(2.71 %)		 19,162
(1.80 %)		 20,576
(1.41 %)		 36,291
(1.99 %)		 40.88
(98.91 %)		 886
(1.09 %)		 106
(100.00 %)		 3,986,870
(44.21 %)		 579,629
(1.22 %)		 12,858,384
(34.60 %)		 67,032
(1.73 %)
93 bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 alternate hap 2022)
GCA_022079275.1		 n/a 24,877
(1.23 %)		 48,382
(1.39 %)		 n/a 42.05
(99.98 %)		 4,716
(0.01 %)		 72,827
(99.99 %)		 6,403,412
(33.31 %)		 1,269,531
(1.94 %)		 17,771,689
(33.82 %)		 100,915
(3.00 %)
94 bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 primary hap 2022)
GCF_022079265.1		 45,362
(2.39 %)		 18,576
(1.65 %)		 20,510
(1.41 %)		 n/a 41.80
(100.00 %)		 24
(0.00 %)		 75
(100.00 %)		 4,970,082
(43.28 %)		 894,002
(1.80 %)		 13,648,384
(34.21 %)		 69,211
(2.68 %)
95 boreal woodland reindeer (boreal CA-31 2023)
GCA_019903745.2		 n/a 20,135
(1.60 %)		 22,598
(1.47 %)		 n/a 41.46
(96.98 %)		 34,682
(3.03 %)		 12,266
(100.00 %)		 3,134,107
(24.41 %)		 394,920
(0.92 %)		 13,154,929
(36.43 %)		 48,826
(1.07 %)
96 Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 alternate hap 2022)
GCA_024803775.1		 n/a 18,647
(0.96 %)		 23,998
(1.13 %)		 n/a 41.67
(100.00 %)		 124
(0.00 %)		 3,340
(100.00 %)		 3,775,862
(22.40 %)		 1,257,803
(21.71 %)		 9,347,543
(61.85 %)		 33,757
(1.35 %)
97 Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 primary hap 2022)
GCA_024803745.1		 n/a 17,791
(1.12 %)		 22,667
(1.29 %)		 n/a 41.66
(100.00 %)		 106
(0.00 %)		 2,898
(100.00 %)		 6,293,452
(41.30 %)		 1,076,688
(17.94 %)		 8,553,272
(57.13 %)		 31,102
(1.31 %)
98 Botta's pocket gopher (hap1 2023)
GCA_031878675.1		 n/a 18,247
(1.61 %)		 22,673
(1.83 %)		 n/a 41.12
(99.99 %)		 775
(0.01 %)		 835
(100.00 %)		 2,918,285
(18.64 %)		 868,090
(5.77 %)		 9,427,604
(40.78 %)		 27,049
(1.25 %)
99 Botta's pocket gopher (hap2 2023)
GCA_031878665.1		 n/a 17,612
(1.68 %)		 22,099
(1.91 %)		 n/a 41.23
(99.99 %)		 541
(0.01 %)		 365
(100.00 %)		 2,748,918
(17.16 %)		 827,542
(4.51 %)		 8,832,809
(39.20 %)		 26,416
(1.35 %)
100 boutu (hap1 2024)
GCA_036417435.1		 n/a 18,667
(1.46 %)		 20,817
(1.26 %)		 n/a 42.07
(100.00 %)		 284
(0.00 %)		 903
(100.00 %)		 4,004,895
(35.23 %)		 925,158
(12.15 %)		 11,999,784
(42.65 %)		 63,428
(1.55 %)
101 boutu (hap2 2024)
GCA_036417475.1		 n/a 17,954
(1.51 %)		 19,994
(1.30 %)		 n/a 42.02
(100.00 %)		 240
(0.00 %)		 800
(100.00 %)		 3,723,164
(34.96 %)		 809,880
(11.02 %)		 11,359,211
(41.42 %)		 60,067
(1.55 %)
102 Brandt's bat
GCF_000412655.1		 46,912
(2.84 %)		 19,267
(1.75 %)		 18,495
(1.62 %)		 n/a 42.59
(94.06 %)		 155,664
(5.95 %)		 325,414
(94.05 %)		 2,897,662
(25.08 %)		 634,208
(3.20 %)		 11,323,618
(31.06 %)		 66,749
(1.59 %)
103 Brazilian free-tailed bat (primary hap 2023)
GCA_030848825.1		 n/a 19,039
(1.66 %)		 21,660
(1.59 %)		 n/a 42.29
(100.00 %)		 20
(0.00 %)		 148
(100.00 %)		 3,805,818
(31.80 %)		 640,446
(2.50 %)		 11,793,353
(36.15 %)		 68,896
(2.40 %)
104 Brazilian guinea pig
GCA_000688575.1		 n/a 16,531
(1.49 %)		 11,177
(1.44 %)		 n/a 39.81
(64.76 %)		 2,565,595
(35.61 %)		 3,131
(100.00 %)		 2,529,479
(25.87 %)		 342,907
(0.66 %)		 10,719,517
(21.05 %)		 19,508
(0.31 %)
105 Brazilian tapir
GCA_004025025.1		 n/a 21,581
(1.61 %)		 30,818
(1.32 %)		 n/a 41.12
(99.93 %)		 2,273
(0.01 %)		 805,779
(99.99 %)		 3,877,938
(38.36 %)		 344,032
(0.79 %)		 15,601,710
(32.81 %)		 43,382
(1.17 %)
106 brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v2 2018)
GCF_003584765.2		 50,242
(2.92 %)		 18,811
(1.77 %)		 21,073
(1.52 %)		 n/a 41.84
(99.31 %)		 17,380
(0.70 %)		 21,813
(99.30 %)		 4,201,043
(40.86 %)		 567,586
(1.23 %)		 13,807,211
(30.86 %)		 62,125
(1.80 %)
107 brown bear (v2.0 North America Adak 2023)
GCF_023065955.2		 66,371
(4.20 %)		 18,615
(1.68 %)		 21,434
(1.53 %)		 n/a 42.29
(100.00 %)		 250
(0.00 %)		 362
(100.00 %)		 4,030,019
(33.22 %)		 630,008
(4.17 %)		 13,240,060
(32.92 %)		 64,814
(2.05 %)
108 brown big-eared bat (primary hap 2023)
GCA_963455305.1		 n/a 19,138
(1.72 %)		 20,370
(1.54 %)		 n/a 43.08
(99.99 %)		 1,237
(0.01 %)		 65
(100.00 %)		 3,201,470
(26.24 %)		 957,903
(4.27 %)		 10,687,995
(39.65 %)		 60,671
(2.39 %)
109 brown-throated sloth
GCA_004027775.1		 n/a 17,043
(1.21 %)		 37,090
(1.36 %)		 n/a 42.76
(99.76 %)		 462
(0.00 %)		 1,772,267
(100.00 %)		 2,487,215
(36.18 %)		 316,812
(1.60 %)		 7,948,666
(37.96 %)		 62,325
(2.36 %)
110 cactus mouse (2023)
GCF_949786415.1		 47,524
(2.02 %)		 18,894
(1.46 %)		 20,159
(1.22 %)		 n/a 42.40
(99.98 %)		 2,603
(0.02 %)		 4,297
(100.00 %)		 7,181,232
(52.75 %)		 1,247,378
(18.35 %)		 13,329,318
(43.03 %)		 19,540
(0.49 %)
111 California mouse (IS 2022)
GCF_007827085.1		 62,274
(3.80 %)		 18,959
(1.75 %)		 19,378
(1.41 %)		 n/a 42.21
(100.00 %)		 547
(0.00 %)		 237
(100.00 %)		 5,970,582
(45.08 %)		 1,165,743
(3.67 %)		 13,734,349
(33.67 %)		 19,529
(0.58 %)
112 California sea lion (alternate hap 2019)
GCA_009762295.1		 n/a 18,348
(1.81 %)		 18,692
(1.47 %)		 n/a 41.58
(100.00 %)		 n/a 3,093
(100.00 %)		 3,722,619
(42.89 %)		 488,086
(1.26 %)		 10,893,132
(33.14 %)		 44,449
(1.57 %)
113 California sea lion (LMU 2018 refseq)
GCF_900631625.1		 69,240
(2.99 %)		 20,741
(1.78 %)		 20,298
(1.40 %)		 n/a 41.38
(99.81 %)		 47,716
(0.20 %)		 10,423
(100.00 %)		 4,530,259
(43.28 %)		 573,086
(1.12 %)		 13,442,336
(33.58 %)		 50,583
(1.46 %)
114 California sea lion (mZalCal1 alternate hap 2020)
GCA_009762295.2		 n/a 18,319
(1.81 %)		 18,772
(1.48 %)		 n/a 41.58
(100.00 %)		 n/a 3,096
(100.00 %)		 3,724,021
(42.91 %)		 488,356
(1.26 %)		 10,891,276
(33.15 %)		 44,467
(1.57 %)
115 California sea lion (v2 primary hap 2020)
GCF_009762305.2		 70,801
(3.05 %)		 20,915
(1.77 %)		 20,179
(1.40 %)		 44,926
(2.10 %)		 41.40
(99.23 %)		 185
(0.77 %)		 47
(100.00 %)		 4,525,652
(43.65 %)		 590,246
(1.24 %)		 13,263,648
(33.76 %)		 51,899
(1.50 %)
116 California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 alternate hap 2023)
GCA_028537755.1		 n/a 19,409
(1.86 %)		 20,578
(1.69 %)		 n/a 42.43
(100.00 %)		 43
(0.00 %)		 310
(100.00 %)		 3,161,054
(22.60 %)		 891,453
(5.62 %)		 11,087,206
(33.12 %)		 19,104
(0.65 %)
117 California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 primary hap 2023)
GCA_028537955.1		 n/a 19,681
(1.86 %)		 21,257
(1.62 %)		 n/a 42.24
(100.00 %)		 51
(0.00 %)		 350
(100.00 %)		 4,957,057
(42.33 %)		 943,226
(5.63 %)		 11,695,871
(33.83 %)		 20,062
(0.64 %)
118 Canada lynx (alternate hap LIC74 2019)
GCA_007474575.1		 n/a 12,029
(1.42 %)		 15,171
(1.16 %)		 n/a 41.46
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 15,036
(100.00 %)		 2,937,491
(43.50 %)		 544,410
(1.76 %)		 7,641,565
(32.72 %)		 39,082
(2.44 %)
119 Canada lynx (LIC74 v2 alternate hap 2020)
GCA_007474575.2		 n/a 12,041
(1.42 %)		 15,226
(1.16 %)		 n/a 41.46
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 15,046
(100.00 %)		 2,939,291
(43.50 %)		 544,849
(1.76 %)		 7,650,345
(32.74 %)		 39,099
(2.44 %)
120 Canada lynx (LIC74 v2 primary hap 2020)
GCF_007474595.2		 50,142
(2.69 %)		 18,273
(1.65 %)		 19,264
(1.35 %)		 n/a 41.70
(99.88 %)		 842
(0.12 %)		 54
(100.00 %)		 5,011,165
(43.72 %)		 904,525
(1.75 %)		 13,467,551
(34.19 %)		 66,799
(2.48 %)
121 Cantor's roundleaf bat
GCA_004027415.1		 n/a 23,788
(1.42 %)		 45,328
(1.68 %)		 38,254
(1.57 %)		 41.36
(99.91 %)		 6,366
(0.03 %)		 846,566
(99.97 %)		 3,997,370
(31.48 %)		 775,742
(1.42 %)		 12,770,948
(33.45 %)		 41,527
(1.41 %)
122 Cape elephant shrew
GCF_000299155.1		 25,406
(1.08 %)		 23,258
(1.07 %)		 24,266
(1.16 %)		 n/a 40.30
(86.29 %)		 279,394
(13.74 %)		 288,162
(86.26 %)		 3,765,232
(16.90 %)		 604,351
(0.89 %)		 20,072,078
(42.36 %)		 25,977
(0.42 %)
123 Cape golden mole (2012 Broad)
GCF_000296735.1		 25,323
(1.07 %)		 20,961
(1.07 %)		 21,723
(1.04 %)		 n/a 40.01
(79.93 %)		 370,844
(20.11 %)		 391,344
(79.89 %)		 4,924,640
(21.03 %)		 500,830
(1.95 %)		 18,946,663
(41.18 %)		 21,186
(0.33 %)
124 Cape rock hyrax (Dallas Zoo Isis #01D731 2014)
GCA_000152225.2		 n/a 18,455
(1.10 %)		 22,103
(1.12 %)		 n/a 41.00
(88.89 %)		 259,879
(11.14 %)		 325,568
(88.86 %)		 6,210,235
(51.92 %)		 381,915
(1.06 %)		 20,080,212
(36.28 %)		 29,690
(0.50 %)
125 Cape rock hyrax (US060 2019 Broad)
GCA_004026925.1		 n/a 21,401
(0.85 %)		 45,353
(1.14 %)		 n/a 41.08
(99.93 %)		 4,203
(0.01 %)		 1,048,940
(99.99 %)		 7,222,494
(54.48 %)		 430,286
(0.85 %)		 21,775,991
(44.61 %)		 37,158
(0.70 %)
126 capybara
GCA_004027455.1		 n/a 20,152
(1.22 %)		 28,931
(1.29 %)		 n/a 39.76
(99.93 %)		 5,747
(0.02 %)		 661,089
(99.98 %)		 4,220,878
(29.16 %)		 777,357
(2.04 %)		 15,214,944
(35.16 %)		 34,558
(0.85 %)
127 carabao (swamp buffalo K-KA32 2023)
GCF_029407905.1		 77,279
(2.89 %)		 19,433
(1.40 %)		 21,166
(1.23 %)		 n/a 42.77
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 115
(100.00 %)		 3,479,445
(21.92 %)		 547,054
(6.39 %)		 12,840,677
(45.22 %)		 99,752
(3.73 %)
128 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v2.0 2023 USDA)
GCF_002263795.3		 77,927
(4.11 %)		 19,428
(1.48 %)		 22,236
(1.33 %)		 n/a 42.01
(100.00 %)		 386
(0.00 %)		 1,958
(100.00 %)		 3,449,588
(22.63 %)		 596,092
(3.13 %)		 12,785,607
(42.11 %)		 46,864
(1.37 %)
129 cattle (Hereford UMD_3.1.1 2014)
GCF_000003055.6		 57,977
(2.74 %)		 19,583
(1.56 %)		 20,581
(1.31 %)		 n/a 41.82
(99.23 %)		 74,464
(0.78 %)		 75,598
(99.22 %)		 5,607,556
(49.02 %)		 440,521
(1.25 %)		 13,167,657
(40.78 %)		 42,869
(1.24 %)
130 Chacoan peccary (BS20 v2 2019 Broad)
GCA_004024745.2		 n/a 18,603
(1.52 %)		 22,330
(1.36 %)		 n/a 42.35
(98.12 %)		 57,013
(1.80 %)		 1,240,743
(98.20 %)		 5,255,211
(43.27 %)		 2,502,373
(4.37 %)		 12,968,788
(40.96 %)		 172,178
(3.66 %)
131 cheetah (Ajub_Pintada_27869175 2022)
GCF_027475565.1		 80,997
(4.53 %)		 18,420
(1.70 %)		 19,561
(1.40 %)		 n/a 41.59
(100.00 %)		 22
(0.00 %)		 195
(100.00 %)		 4,611,842
(35.10 %)		 837,685
(1.68 %)		 13,649,125
(33.06 %)		 60,367
(2.22 %)
132 cheetah (Rico 2018)
GCF_003709585.1		 72,154
(3.33 %)		 18,472
(1.70 %)		 20,443
(1.42 %)		 n/a 41.55
(99.55 %)		 24,173
(0.45 %)		 3,220
(100.00 %)		 4,853,945
(42.85 %)		 831,106
(1.53 %)		 13,663,571
(32.84 %)		 60,744
(2.17 %)
133 Chinese forest musk deer (Sichuan 2022)
GCF_022376915.1		 51,612
(2.80 %)		 19,565
(1.43 %)		 22,280
(1.29 %)		 n/a 42.30
(99.97 %)		 1,781
(0.03 %)		 2,446
(100.00 %)		 3,257,347
(21.65 %)		 399,120
(3.81 %)		 12,906,274
(43.79 %)		 46,689
(1.12 %)
134 Chinese hamster (17A/GY CHO 2020)
GCF_003668045.3		 55,440
(2.79 %)		 20,030
(1.84 %)		 18,721
(1.41 %)		 67,900
(3.41 %)		 41.51
(99.90 %)		 4,164
(0.10 %)		 647
(100.00 %)		 8,121,057
(33.74 %)		 1,095,058
(2.91 %)		 12,923,274
(32.25 %)		 19,341
(0.58 %)
135 Chinese hamster (CHO v1 2011 BGI)
GCF_000223135.1		 45,993
(2.59 %)		 20,602
(1.78 %)		 17,467
(1.35 %)		 n/a 41.37
(96.61 %)		 156,635
(3.40 %)		 265,787
(96.60 %)		 4,541,936
(33.03 %)		 1,072,129
(2.66 %)		 13,150,189
(30.04 %)		 12,522
(0.25 %)
136 Chinese hamster (CHO v2 2017 Eagle Genomics Ltd)
GCA_900186095.1		 n/a 19,874
(1.85 %)		 19,298
(1.44 %)		 n/a 41.45
(98.56 %)		 63,334
(1.45 %)		 71,598
(98.55 %)		 4,521,726
(33.66 %)		 1,060,619
(2.55 %)		 12,867,288
(31.26 %)		 17,960
(0.54 %)
137 Chinese hamster (CHO-K1 CHOZN v2.4 2022)
GCA_026545065.1		 n/a 20,293
(1.81 %)		 18,881
(1.42 %)		 n/a 41.62
(71.16 %)		 924,541
(28.93 %)		 1,236,122
(71.07 %)		 4,330,728
(30.92 %)		 987,319
(3.70 %)		 13,374,062
(21.92 %)		 18,838
(0.40 %)
138 Chinese pangolin (2020 Yunnan U)
GCF_014570555.1		 69,694
(3.21 %)		 18,206
(1.70 %)		 20,508
(1.48 %)		 n/a 40.79
(95.54 %)		 34,903
(4.47 %)		 4,694
(100.00 %)		 2,927,176
(35.60 %)		 269,964
(0.67 %)		 12,610,535
(29.10 %)		 35,278
(1.05 %)
139 Chinese pangolin (hap1 2023)
GCF_030020395.1		 71,445
(2.98 %)		 18,379
(1.34 %)		 21,837
(1.29 %)		 n/a 41.07
(99.77 %)		 383
(0.23 %)		 661
(100.00 %)		 3,318,871
(34.65 %)		 618,193
(3.68 %)		 12,009,669
(39.02 %)		 47,708
(1.22 %)
140 Chinese pangolin (hap2 mManPen7 2023)
GCA_030020945.1		 n/a 18,538
(1.34 %)		 21,724
(1.27 %)		 n/a 41.09
(99.48 %)		 190
(0.52 %)		 700
(100.00 %)		 3,362,899
(34.48 %)		 678,384
(4.11 %)		 12,024,241
(39.52 %)		 48,960
(1.19 %)
141 Chinese pangolin (MPE899 2014 WashU)
GCA_000738955.1		 n/a 18,749
(1.63 %)		 22,506
(1.40 %)		 n/a 40.93
(90.69 %)		 257,424
(9.33 %)		 230,927
(90.67 %)		 2,691,116
(34.48 %)		 316,518
(1.96 %)		 11,538,086
(25.40 %)		 30,693
(0.58 %)
142 Chinese rufous horseshoe bat
GCA_001888835.1		 n/a 26,871
(2.34 %)		 25,467
(1.89 %)		 n/a 40.52
(97.22 %)		 212,601
(2.80 %)		 63,439
(100.00 %)		 3,219,611
(33.86 %)		 495,126
(1.20 %)		 12,476,551
(27.16 %)		 32,993
(0.98 %)
143 Chinese rufous horseshoe bat (RSC01 2024)
GCA_036562045.1		 n/a 17,893
(1.95 %)		 19,249
(1.60 %)		 n/a 40.47
(100.00 %)		 286
(0.00 %)		 454
(100.00 %)		 3,055,304
(33.11 %)		 531,106
(1.34 %)		 11,858,144
(29.52 %)		 30,884
(1.08 %)
144 Chinese tree shrew
GCF_000334495.1		 47,005
(2.07 %)		 21,375
(1.39 %)		 19,231
(1.28 %)		 n/a 41.73
(95.10 %)		 191,695
(4.92 %)		 242,445
(95.08 %)		 5,060,321
(23.05 %)		 1,046,388
(4.15 %)		 14,978,259
(38.04 %)		 88,806
(1.44 %)
145 chiru
GCA_000400835.1		 n/a 20,320
(1.60 %)		 42,654
(2.51 %)		 n/a 42.01
(93.04 %)		 283,069
(7.00 %)		 298,127
(93.00 %)		 5,342,241
(43.54 %)		 425,329
(1.25 %)		 13,714,420
(34.66 %)		 43,135
(1.89 %)
146 clouded leopard (mNeoNeb1 alternate hap 2023)
GCA_028018655.1		 n/a 16,430
(1.52 %)		 21,057
(1.44 %)		 n/a 41.79
(100.00 %)		 n/a 10,377
(100.00 %)		 3,845,437
(33.39 %)		 794,587
(2.14 %)		 10,765,695
(33.40 %)		 56,375
(2.45 %)
147 clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018385.1		 81,219
(3.62 %)		 18,300
(1.65 %)		 20,361
(1.39 %)		 n/a 41.79
(99.94 %)		 181
(0.06 %)		 33
(100.00 %)		 4,224,269
(34.84 %)		 992,668
(2.08 %)		 13,618,866
(34.42 %)		 67,830
(2.45 %)
148 common bottlenose dolphin (maternal 2020)
GCA_011762535.1		 n/a 18,837
(1.77 %)		 20,857
(1.43 %)		 n/a 41.43
(99.73 %)		 649
(0.27 %)		 985
(100.00 %)		 4,073,893
(46.15 %)		 630,039
(2.15 %)		 12,628,219
(35.41 %)		 65,379
(1.89 %)
149 common bottlenose dolphin (maternal Y refseq 2020)
GCF_011762595.1		 67,207
(3.31 %)		 18,766
(1.77 %)		 20,528
(1.42 %)		 35,852
(1.58 %)		 41.44
(99.74 %)		 674
(0.26 %)		 362
(100.00 %)		 4,069,115
(46.17 %)		 628,982
(2.12 %)		 12,490,891
(35.29 %)		 65,551
(1.90 %)
150 common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 refseq)
GCF_001922835.1		 45,975
(2.99 %)		 17,255
(1.69 %)		 17,058
(1.34 %)		 n/a 40.85
(99.45 %)		 114,003
(0.57 %)		 2,648
(100.00 %)		 3,845,938
(43.89 %)		 514,631
(1.06 %)		 12,317,098
(32.18 %)		 48,030
(1.35 %)
151 common bottlenose dolphin (paternal 2020)
GCA_011762515.1		 n/a 18,537
(1.77 %)		 20,619
(1.44 %)		 n/a 41.42
(98.08 %)		 868
(1.92 %)		 1,166
(100.00 %)		 3,997,801
(45.93 %)		 609,838
(1.85 %)		 12,400,272
(34.53 %)		 64,630
(1.84 %)
152 common brushtail (alternate hap 2020)
GCA_011100645.1		 n/a 14,863
(0.75 %)		 15,426
(0.89 %)		 n/a 39.41
(100.00 %)		 313
(0.00 %)		 12,446
(100.00 %)		 5,846,769
(38.56 %)		 987,917
(1.99 %)		 16,764,356
(40.14 %)		 13,303
(0.35 %)
153 common brushtail (refseq 2020)
GCF_011100635.1		 37,674
(1.80 %)		 18,653
(0.80 %)		 15,375
(0.86 %)		 n/a 39.48
(99.44 %)		 1,796
(0.56 %)		 212
(100.00 %)		 7,598,116
(38.90 %)		 1,259,434
(1.97 %)		 22,071,306
(40.56 %)		 17,762
(0.38 %)
154 common pipistrelle (2020)
GCA_903992545.1		 n/a 17,216
(1.82 %)		 19,202
(1.79 %)		 n/a 42.55
(99.97 %)		 1,546
(0.03 %)		 323
(100.00 %)		 2,953,532
(23.94 %)		 805,142
(2.83 %)		 9,964,846
(34.69 %)		 57,295
(2.83 %)
155 common pipistrelle (alternate hap 2020)
GCA_903992515.1		 n/a 15,974
(1.72 %)		 20,563
(1.66 %)		 n/a 42.41
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 10,459
(100.00 %)		 2,634,333
(23.76 %)		 703,674
(2.65 %)		 8,909,525
(33.95 %)		 50,430
(2.54 %)
156 common pipistrelle (Broad 2019)
GCA_004026625.1		 n/a 21,938
(1.35 %)		 53,915
(1.60 %)		 n/a 42.88
(99.88 %)		 10,870
(0.05 %)		 736,974
(99.95 %)		 3,499,501
(22.91 %)		 1,046,301
(2.96 %)		 11,759,516
(37.96 %)		 92,062
(3.23 %)
157 common pipistrelle (hap1.1 2025)
GCA_965203405.1		 n/a 18,233
(1.77 %)		 21,445
(1.80 %)		 n/a 42.93
(99.98 %)		 1,650
(0.02 %)		 575
(100.00 %)		 3,324,262
(26.83 %)		 869,167
(7.44 %)		 10,218,519
(37.91 %)		 76,006
(3.29 %)
158 common pipistrelle (hap2.1 2025)
GCA_965204225.1		 n/a 18,115
(1.81 %)		 21,233
(1.83 %)		 n/a 42.89
(99.98 %)		 1,602
(0.02 %)		 1,971
(99.98 %)		 3,303,323
(27.28 %)		 852,756
(5.65 %)		 10,047,424
(36.41 %)		 69,105
(3.25 %)
159 common vampire bat (v2 HL8 alternate hap 2022 genbank)
GCA_022682395.2		 n/a 17,485
(1.76 %)		 18,907
(1.66 %)		 n/a 42.87
(99.99 %)		 576
(0.01 %)		 429
(100.00 %)		 2,592,246
(28.20 %)		 352,985
(2.87 %)		 10,737,944
(31.11 %)		 61,125
(2.28 %)
160 common vampire bat (v2 HL8 primary hap 2022 refseq)
GCF_022682495.2		 58,786
(3.38 %)		 18,507
(1.82 %)		 19,451
(1.59 %)		 n/a 42.99
(99.99 %)		 615
(0.01 %)		 574
(100.00 %)		 2,960,602
(36.90 %)		 431,577
(3.90 %)		 11,286,753
(32.62 %)		 71,507
(2.50 %)
161 common vampire bat (v3 DRU21DN04 2018)
GCF_002940915.2		 51,031
(3.24 %)		 18,503
(1.88 %)		 18,071
(1.68 %)		 n/a 42.15
(97.78 %)		 54,246
(2.23 %)		 83,364
(97.77 %)		 2,799,509
(29.62 %)		 275,242
(1.03 %)		 11,796,826
(28.19 %)		 51,634
(1.37 %)
162 common warthog (WHEZ1 2021)
GCF_016906955.1		 55,088
(2.64 %)		 18,264
(1.56 %)		 19,251
(1.34 %)		 54,816
(2.83 %)		 41.95
(99.61 %)		 523
(0.39 %)		 194
(100.00 %)		 3,898,243
(30.33 %)		 588,742
(1.17 %)		 12,955,929
(36.44 %)		 75,592
(1.86 %)
163 common wombat
GCF_900497805.2		 46,365
(1.78 %)		 19,437
(0.86 %)		 18,947
(0.96 %)		 n/a 38.86
(99.68 %)		 67,461
(0.33 %)		 14,183
(100.00 %)		 8,645,969
(41.99 %)		 1,203,246
(1.61 %)		 23,878,215
(39.11 %)		 18,752
(0.37 %)
164 Corsac fox (zsh2022 2023)
GCA_030463245.1		 n/a 19,527
(1.61 %)		 18,923
(1.35 %)		 n/a 41.24
(100.00 %)		 107
(0.00 %)		 202
(100.00 %)		 4,435,406
(32.05 %)		 981,019
(1.98 %)		 13,673,245
(32.65 %)		 49,252
(2.20 %)
165 coyote (coyote_06102 2023)
GCA_034620425.1		 n/a 19,251
(1.60 %)		 19,585
(1.40 %)		 n/a 41.18
(100.00 %)		 93
(0.00 %)		 120
(100.00 %)		 4,493,000
(32.28 %)		 982,814
(2.01 %)		 13,803,318
(33.09 %)		 50,777
(2.23 %)
166 creeping vole
GCF_018167655.1		 54,941
(2.31 %)		 23,033
(1.55 %)		 25,427
(1.53 %)		 n/a 44.23
(100.00 %)		 n/a 2,147
(100.00 %)		 4,549,519
(25.66 %)		 1,153,429
(13.60 %)		 13,568,297
(40.65 %)		 23,141
(0.54 %)
167 crested porcupine
GCA_004026905.1		 n/a 21,005
(1.32 %)		 35,975
(1.39 %)		 n/a 41.51
(99.89 %)		 4,351
(0.02 %)		 1,140,949
(99.98 %)		 4,303,147
(30.69 %)		 600,488
(1.19 %)		 14,049,490
(33.80 %)		 57,196
(1.33 %)
168 Crete spiny mouse (2024)
GCA_964271855.1		 n/a 19,467
(1.76 %)		 18,734
(1.43 %)		 n/a 42.87
(100.00 %)		 184
(0.00 %)		 113
(100.00 %)		 4,718,848
(32.83 %)		 1,327,449
(6.80 %)		 12,893,458
(34.03 %)		 21,236
(0.61 %)
169 Cuvier's beaked whale
GCA_004364475.1		 n/a 23,700
(0.90 %)		 51,715
(0.86 %)		 n/a 42.01
(99.76 %)		 3,229
(0.01 %)		 3,761,505
(99.99 %)		 6,544,424
(43.61 %)		 1,417,186
(3.11 %)		 16,127,873
(42.25 %)		 68,668
(1.15 %)
170 cyclops roundleaf bat (Cote d'Ivoire 20210929_DDa primary hap 2024)
GCA_043880285.1		 n/a 18,610
(1.67 %)		 19,098
(1.39 %)		 n/a 41.56
(99.99 %)		 334
(0.01 %)		 73
(100.00 %)		 4,077,286
(41.85 %)		 754,689
(2.64 %)		 11,873,386
(36.16 %)		 48,137
(1.04 %)
171 Damara mole-rat DMR 1.0 (2014 BGI)
GCF_000743615.1		 52,373
(2.57 %)		 17,983
(1.45 %)		 17,063
(1.43 %)		 n/a 40.34
(97.96 %)		 87,815
(2.05 %)		 162,545
(97.95 %)		 4,053,433
(30.86 %)		 545,281
(1.74 %)		 13,406,483
(30.65 %)		 37,008
(0.74 %)
172 Damara mole-rat DMR 1.0 HiC (2020 DNA Zoo)
GCF_012274545.1		 58,091
(2.74 %)		 17,780
(1.44 %)		 16,515
(1.42 %)		 n/a 40.34
(97.94 %)		 88,899
(2.07 %)		 73,970
(100.00 %)		 4,035,140
(30.95 %)		 544,772
(1.73 %)		 13,390,872
(30.61 %)		 37,008
(0.74 %)
173 dassie-rat
GCA_004026965.1		 n/a 20,479
(1.16 %)		 42,937
(1.41 %)		 n/a 41.86
(99.89 %)		 9,645
(0.04 %)		 920,324
(99.96 %)		 4,563,054
(28.83 %)		 660,623
(1.92 %)		 12,899,807
(34.48 %)		 46,569
(1.25 %)
174 Daubenton's bat (alternate hap 2023)
GCA_963242275.1		 n/a 18,895
(1.78 %)		 24,235
(1.81 %)		 n/a 43.39
(100.00 %)		 n/a 4,930
(100.00 %)		 2,813,870
(23.75 %)		 718,406
(5.18 %)		 9,977,320
(37.24 %)		 62,910
(2.66 %)
175 Daubenton's bat (primary hap 2023 refseq)
GCF_963259705.1		 64,558
(3.32 %)		 19,141
(1.72 %)		 22,133
(1.66 %)		 n/a 43.18
(99.99 %)		 1,099
(0.01 %)		 121
(100.00 %)		 3,040,232
(24.03 %)		 796,911
(6.38 %)		 10,478,180
(38.84 %)		 64,920
(2.51 %)
176 Daurian ground squirrel
GCA_002406435.1		 n/a 20,990
(1.31 %)		 17,575
(1.17 %)		 n/a 39.77
(96.15 %)		 141,850
(3.84 %)		 502,654
(96.16 %)		 5,783,538
(34.36 %)		 924,038
(3.73 %)		 17,533,301
(30.85 %)		 27,955
(0.39 %)
177 David's myotis bat
GCF_000327345.1		 37,645
(2.70 %)		 18,744
(1.78 %)		 17,565
(1.62 %)		 n/a 42.69
(91.23 %)		 223,511
(8.80 %)		 325,280
(91.20 %)		 2,680,166
(23.79 %)		 532,273
(1.90 %)		 11,016,028
(29.55 %)		 59,615
(1.59 %)
178 degu (3935 2012 refseq)
GCF_000260255.1		 48,152
(2.13 %)		 22,242
(1.41 %)		 22,101
(1.46 %)		 n/a 41.38
(84.36 %)		 252,772
(15.68 %)		 259,904
(84.32 %)		 4,901,673
(27.74 %)		 898,945
(1.50 %)		 14,282,003
(29.30 %)		 40,135
(0.82 %)
179 desert hamster (2022)
GCF_943737965.1		 37,279
(2.11 %)		 19,744
(1.74 %)		 20,215
(1.50 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 n/a 2,079
(100.00 %)		 4,038,079
(31.01 %)		 1,132,871
(2.71 %)		 11,946,112
(32.62 %)		 17,053
(0.51 %)
180 Desmarest's hutia
GCA_004027915.1		 n/a 23,535
(0.78 %)		 50,796
(0.95 %)		 n/a 42.03
(99.83 %)		 3,492
(0.01 %)		 2,355,850
(99.99 %)		 5,790,506
(26.72 %)		 1,062,134
(1.71 %)		 16,977,224
(35.29 %)		 54,479
(1.01 %)
181 dingo (2020 Alpine COOINDA U.NSW)
GCF_012295265.1		 102,060
(4.04 %)		 19,777
(1.69 %)		 20,341
(1.41 %)		 n/a 41.29
(99.69 %)		 325
(0.31 %)		 477
(100.00 %)		 4,950,808
(42.83 %)		 1,033,921
(2.36 %)		 13,745,703
(33.32 %)		 51,835
(2.25 %)
182 dingo (Sandy 2020 James Cook U)
GCF_003254725.2		 104,332
(4.50 %)		 19,710
(1.72 %)		 19,857
(1.42 %)		 n/a 41.24
(100.00 %)		 69
(0.00 %)		 159
(100.00 %)		 4,547,906
(33.32 %)		 993,474
(2.19 %)		 13,701,060
(33.18 %)		 51,216
(2.28 %)
183 dog (Basenji MU ID 185726 2019)
GCA_004886185.2		 n/a 19,889
(1.67 %)		 20,501
(1.39 %)		 n/a 41.36
(99.99 %)		 1,388
(0.01 %)		 3,630
(99.99 %)		 4,950,227
(43.32 %)		 1,059,639
(2.97 %)		 13,694,849
(33.70 %)		 51,443
(2.16 %)
184 dog (Basenji UNSW-BAS-2019 2021)
GCA_013276365.2		 n/a 19,310
(1.60 %)		 19,947
(1.42 %)		 n/a 41.21
(100.00 %)		 149
(0.00 %)		 631
(100.00 %)		 4,452,916
(32.14 %)		 960,590
(2.23 %)		 13,685,353
(33.01 %)		 50,715
(2.22 %)
185 dog (Bernese Mountain Dog BD 2023)
GCA_031010765.1		 n/a 19,211
(1.60 %)		 20,327
(1.44 %)		 n/a 41.20
(100.00 %)		 641
(0.00 %)		 175
(100.00 %)		 4,471,016
(32.18 %)		 984,776
(2.03 %)		 13,719,474
(32.88 %)		 51,050
(2.25 %)
186 dog (Bernese Mountain Dog OD 2023)
GCA_031010635.1		 n/a 19,279
(1.60 %)		 20,348
(1.44 %)		 n/a 41.21
(100.00 %)		 1,015
(0.00 %)		 159
(100.00 %)		 4,491,081
(32.21 %)		 996,142
(2.01 %)		 13,761,195
(32.97 %)		 51,490
(2.25 %)
187 dog (boxer Tasha 2011)
GCF_000002285.3		 82,549
(3.63 %)		 19,772
(1.66 %)		 19,565
(1.39 %)		 n/a 41.31
(99.25 %)		 23,876
(0.76 %)		 27,106
(99.24 %)		 4,918,098
(43.29 %)		 991,835
(2.81 %)		 13,644,959
(33.60 %)		 53,269
(2.07 %)
188 dog (boxer Tasha 2020)
GCF_000002285.5		 93,774
(3.84 %)		 19,392
(1.71 %)		 19,572
(1.42 %)		 52,141
(3.27 %)		 41.26
(100.00 %)		 1,028
(0.00 %)		 147
(100.00 %)		 23,927,903
(42.42 %)		 972,851
(2.05 %)		 13,611,845
(33.11 %)		 50,679
(2.26 %)
189 dog (Cairn Terrier CA611 2023)
GCA_031010295.1		 n/a 19,255
(1.61 %)		 20,479
(1.45 %)		 n/a 41.19
(100.00 %)		 262
(0.00 %)		 141
(100.00 %)		 4,490,019
(32.25 %)		 989,383
(1.99 %)		 13,710,808
(32.97 %)		 50,883
(2.22 %)
190 dog (German shepard Mischka 2020)
GCF_011100685.1		 96,734
(3.71 %)		 20,135
(1.64 %)		 20,871
(1.38 %)		 56,772
(3.19 %)		 41.50
(100.00 %)		 585
(0.00 %)		 2,782
(100.00 %)		 20,264,827
(43.87 %)		 1,152,879
(3.22 %)		 13,784,690
(34.30 %)		 53,518
(2.23 %)
191 dog (German Shepherd Nala 2020)
GCA_008641055.3		 n/a 19,757
(1.69 %)		 20,201
(1.41 %)		 n/a 41.32
(99.74 %)		 458
(0.26 %)		 410
(100.00 %)		 4,974,233
(43.03 %)		 1,048,366
(2.46 %)		 13,881,889
(33.61 %)		 51,900
(2.21 %)
192 dog (Labrador retriever 2023)
GCA_031165255.1		 n/a 19,256
(1.61 %)		 20,247
(1.44 %)		 n/a 41.18
(100.00 %)		 516
(0.00 %)		 675
(100.00 %)		 4,456,220
(32.19 %)		 960,584
(1.96 %)		 13,688,006
(32.82 %)		 50,670
(2.21 %)
193 dog (labrador SID07034 2020)
GCF_014441545.1		 99,420
(3.87 %)		 19,870
(1.70 %)		 20,252
(1.41 %)		 54,322
(3.23 %)		 41.19
(99.47 %)		 575
(0.53 %)		 376
(100.00 %)		 4,981,985
(42.28 %)		 1,019,772
(1.97 %)		 13,959,750
(32.77 %)		 52,469
(2.25 %)
194 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2017 WashU)
GCF_000181335.3		 72,089
(3.30 %)		 18,662
(1.64 %)		 20,897
(1.37 %)		 n/a 41.73
(98.20 %)		 436
(1.80 %)		 5,079
(98.20 %)		 5,086,462
(43.51 %)		 964,126
(2.68 %)		 13,947,871
(33.33 %)		 69,701
(2.41 %)
195 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021 WashU)
GCA_000181335.5		 n/a 18,378
(1.53 %)		 21,242
(1.40 %)		 n/a 41.73
(98.21 %)		 422
(1.79 %)		 5,010
(98.31 %)		 4,683,703
(33.33 %)		 964,129
(2.68 %)		 13,948,305
(33.33 %)		 69,725
(2.42 %)
196 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021)
GCA_000181335.6		 n/a 18,357
(1.55 %)		 20,085
(1.38 %)		 n/a 41.76
(98.18 %)		 422
(1.82 %)		 1,254
(98.28 %)		 4,661,997
(33.78 %)		 947,221
(2.58 %)		 13,867,949
(33.67 %)		 68,011
(2.41 %)
197 domestic cat (Fca126 2021 Texas A&M U)
GCF_018350175.1		 99,222
(4.40 %)		 18,456
(1.66 %)		 19,833
(1.39 %)		 94,133
(5.63 %)		 41.81
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 102
(100.00 %)		 4,965,571
(43.65 %)		 932,424
(1.95 %)		 13,596,808
(33.85 %)		 67,329
(2.48 %)
198 domestic ferret (JIRA1106 JCVI 2020)
GCF_011764305.1		 68,855
(3.09 %)		 19,019
(1.55 %)		 21,812
(1.42 %)		 n/a 41.90
(100.00 %)		 n/a 1,224
(100.00 %)		 4,650,028
(39.49 %)		 745,115
(2.02 %)		 13,758,447
(36.14 %)		 58,684
(2.16 %)
199 domestic ferret (Sable 2011 Broad)
GCA_000239315.1		 n/a 18,778
(1.67 %)		 19,571
(1.47 %)		 n/a 41.48
(96.89 %)		 72,670
(3.12 %)		 76,914
(96.88 %)		 4,491,876
(40.13 %)		 618,556
(1.07 %)		 13,721,938
(31.04 %)		 54,600
(1.94 %)
200 domestic guinea pig (051 PalLab524CR 2023)
GCF_034190915.1		 79,333
(3.55 %)		 17,999
(1.09 %)		 21,509
(1.20 %)		 n/a 40.64
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 672
(100.00 %)		 5,037,431
(41.68 %)		 886,785
(13.97 %)		 14,620,284
(42.71 %)		 39,682
(0.89 %)
201 domestic guinea pig (2N 2008 refseq)
GCF_000151735.1		 44,762
(2.31 %)		 18,301
(1.33 %)		 20,111
(1.34 %)		 n/a 39.95
(97.81 %)		 58,460
(2.20 %)		 61,604
(97.80 %)		 4,257,852
(38.85 %)		 658,533
(1.25 %)		 14,547,726
(34.19 %)		 37,093
(0.85 %)
202 domestic yak (maiwa yakHY00 2019)
GCA_005887515.3		 n/a 18,672
(1.39 %)		 19,408
(1.24 %)		 n/a 41.97
(100.00 %)		 646
(0.00 %)		 343
(100.00 %)		 3,570,978
(23.00 %)		 583,762
(8.57 %)		 14,055,227
(40.52 %)		 43,883
(1.17 %)
203 dugong (hap1 mDugDug1 2023)
GCA_030035585.1		 n/a 18,354
(1.22 %)		 20,434
(1.08 %)		 n/a 40.65
(100.00 %)		 96
(0.00 %)		 198
(100.00 %)		 4,458,084
(33.00 %)		 444,499
(1.79 %)		 15,031,940
(47.42 %)		 29,863
(0.83 %)
204 dugong (hap2 mDugDug1 2023)
GCA_030020955.1		 n/a 18,538
(1.23 %)		 20,775
(1.09 %)		 n/a 40.64
(100.00 %)		 89
(0.00 %)		 167
(100.00 %)		 4,455,227
(33.01 %)		 444,021
(1.73 %)		 14,946,847
(47.37 %)		 29,828
(0.79 %)
205 dwarf mongoose
GCA_004023845.1		 n/a 21,478
(1.57 %)		 32,174
(1.43 %)		 n/a 41.83
(99.94 %)		 10,815
(0.05 %)		 200,185
(99.95 %)		 4,574,991
(40.34 %)		 595,520
(1.11 %)		 13,720,585
(32.94 %)		 70,689
(2.42 %)
206 eastern cottontail (primary hap 2023)
GCA_949820135.1		 n/a 18,522
(1.26 %)		 22,314
(1.28 %)		 n/a 43.69
(100.00 %)		 316
(0.00 %)		 99
(100.00 %)		 3,699,683
(20.55 %)		 935,350
(11.22 %)		 13,112,318
(44.07 %)		 99,224
(2.27 %)
207 eastern European house mouse (PWK_PhJ v2 2022)
GCA_921998335.2		 n/a 21,903
(2.13 %)		 19,801
(1.40 %)		 108,675
(4.42 %)		 41.79
(99.89 %)		 207
(0.11 %)		 211
(100.00 %)		 4,630,645
(40.56 %)		 1,531,506
(3.70 %)		 13,011,312
(35.48 %)		 22,270
(0.54 %)
208 eastern mole
GCA_004024925.1		 n/a 19,631
(1.57 %)		 32,414
(1.63 %)		 n/a 42.02
(99.91 %)		 7,239
(0.03 %)		 647,535
(99.97 %)		 3,145,725
(29.42 %)		 554,620
(1.75 %)		 10,663,504
(32.88 %)		 55,063
(3.69 %)
209 eastern quoll
GCA_020854095.1		 n/a 15,715
(0.80 %)		 16,750
(0.93 %)		 n/a 36.19
(100.00 %)		 431
(0.00 %)		 76
(100.00 %)		 5,256,999
(24.81 %)		 1,280,160
(3.39 %)		 21,362,866
(41.74 %)		 24,508
(0.70 %)
210 eastern spiny mouse (2021)
GCA_907164435.1		 n/a 20,397
(1.93 %)		 20,515
(1.44 %)		 n/a 42.68
(98.12 %)		 109,220
(1.90 %)		 19,837
(99.90 %)		 4,701,702
(33.98 %)		 1,304,933
(2.91 %)		 13,145,044
(31.05 %)		 19,636
(0.56 %)
211 Egyptian rousette (1219 2016 Boston U)
GCF_001466805.2		 54,791
(4.93 %)		 18,221
(2.05 %)		 24,192
(1.88 %)		 46,601
(2.22 %)		 40.02
(99.97 %)		 638
(0.03 %)		 2,490
(100.00 %)		 2,815,693
(32.23 %)		 440,119
(1.01 %)		 12,346,041
(26.86 %)		 56,244
(6.54 %)
212 Egyptian rousette (v1 2020 refseq)
GCF_014176215.1		 65,163
(4.76 %)		 17,642
(2.07 %)		 22,317
(1.84 %)		 n/a 40.05
(98.59 %)		 242
(1.41 %)		 29
(100.00 %)		 2,821,248
(33.05 %)		 434,414
(1.02 %)		 12,031,597
(26.52 %)		 53,573
(4.84 %)
213 Egyptian spiny mouse (US019 2019)
GCA_004027535.1		 n/a 23,498
(1.69 %)		 36,970
(1.40 %)		 30,076
(1.58 %)		 42.71
(99.88 %)		 20,469
(0.09 %)		 391,811
(99.91 %)		 4,983,574
(35.17 %)		 1,342,514
(3.45 %)		 13,029,270
(32.79 %)		 19,944
(0.55 %)
214 elk (wapiti)
GCF_019320065.1		 66,846
(3.00 %)		 20,090
(1.67 %)		 21,999
(1.44 %)		 n/a 41.62
(99.93 %)		 6,643
(0.08 %)		 185
(100.00 %)		 4,884,711
(43.14 %)		 429,925
(1.65 %)		 13,135,255
(37.85 %)		 47,099
(1.31 %)
215 ermine (2020)
GCF_009829155.1		 74,332
(3.19 %)		 18,855
(1.65 %)		 20,667
(1.43 %)		 44,584
(2.07 %)		 41.56
(99.12 %)		 199
(0.88 %)		 94
(100.00 %)		 4,647,934
(41.44 %)		 714,174
(1.30 %)		 13,845,904
(33.42 %)		 56,065
(2.25 %)
216 ermine (alternate hap 2020)
GCA_009829165.1		 n/a 13,583
(1.65 %)		 15,403
(1.46 %)		 n/a 41.72
(100.00 %)		 n/a 3,327
(100.00 %)		 3,139,035
(40.57 %)		 480,111
(1.29 %)		 9,106,061
(31.93 %)		 39,139
(2.25 %)
217 Eurasian badger (2021)
GCA_922990625.1		 n/a 19,332
(1.42 %)		 22,424
(1.40 %)		 n/a 42.47
(100.00 %)		 27
(0.00 %)		 726
(100.00 %)		 4,362,536
(31.74 %)		 801,232
(4.02 %)		 13,893,672
(37.73 %)		 65,806
(4.13 %)
218 Eurasian badger (v3.2 2022)
GCA_922984935.2		 n/a 19,268
(1.40 %)		 22,121
(1.36 %)		 41,043
(1.93 %)		 42.48
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 538
(100.00 %)		 4,417,203
(31.72 %)		 821,664
(4.02 %)		 13,814,720
(38.08 %)		 66,524
(3.95 %)
219 Eurasian field mouse (2024)
GCA_964023405.1		 n/a 20,487
(1.88 %)		 19,707
(1.34 %)		 n/a 42.15
(100.00 %)		 182
(0.00 %)		 61
(100.00 %)		 5,115,510
(39.18 %)		 1,868,284
(4.29 %)		 13,503,826
(37.29 %)		 26,414
(0.61 %)
220 Eurasian red squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685485.1		 n/a 12,437
(1.51 %)		 12,702
(1.22 %)		 n/a 40.06
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 10,657
(100.00 %)		 2,303,176
(35.38 %)		 353,996
(1.49 %)		 7,218,556
(31.67 %)		 24,268
(1.07 %)
221 Eurasian red squirrel (v1.2 2020)
GCA_902686455.2		 n/a 21,309
(1.58 %)		 21,026
(1.36 %)		 33,465
(1.53 %)		 40.08
(94.33 %)		 1,177
(5.67 %)		 639
(100.00 %)		 4,677,412
(35.73 %)		 704,218
(1.42 %)		 14,992,063
(31.49 %)		 48,159
(1.04 %)
222 Eurasian river otter (2020)
GCF_902655055.1		 67,145
(2.95 %)		 18,842
(1.54 %)		 20,178
(1.40 %)		 n/a 41.59
(100.00 %)		 185
(0.00 %)		 44
(100.00 %)		 4,259,294
(33.39 %)		 713,721
(1.36 %)		 13,626,048
(34.37 %)		 57,073
(1.82 %)
223 Eurasian river otter (alternate hap 2019)
GCA_902653095.1		 n/a 9,910
(1.59 %)		 11,315
(1.31 %)		 n/a 41.85
(100.00 %)		 n/a 8,506
(100.00 %)		 2,052,338
(42.25 %)		 316,084
(1.64 %)		 6,222,460
(33.12 %)		 27,057
(1.96 %)
224 Eurasian water vole (alternate hap 2020)
GCA_903992525.1		 n/a 16,761
(1.66 %)		 19,715
(1.37 %)		 n/a 42.13
(100.00 %)		 105
(0.00 %)		 16,473
(100.00 %)		 3,118,266
(26.44 %)		 829,463
(2.82 %)		 9,700,482
(31.37 %)		 14,146
(0.57 %)
225 Eurasian water vole (v2 2021)
GCF_903992535.2		 45,544
(2.51 %)		 19,733
(1.78 %)		 19,053
(1.47 %)		 36,935
(2.27 %)		 42.15
(99.74 %)		 873
(0.26 %)		 215
(100.00 %)		 3,993,912
(25.74 %)		 1,088,163
(2.91 %)		 12,853,770
(32.42 %)		 19,000
(0.58 %)
226 European hare (LE1 primary hap 2023)
GCF_033115175.1		 46,528
(2.09 %)		 19,392
(1.25 %)		 23,070
(1.29 %)		 n/a 44.03
(100.00 %)		 418
(0.00 %)		 651
(100.00 %)		 4,011,592
(19.81 %)		 1,000,204
(8.44 %)		 13,414,251
(44.25 %)		 98,831
(2.33 %)
227 European harvest mouse (primary hap 2024)
GCA_963924665.1		 n/a 20,236
(1.71 %)		 19,368
(1.32 %)		 n/a 40.05
(99.99 %)		 2,020
(0.02 %)		 894
(100.00 %)		 4,892,811
(36.49 %)		 1,223,387
(18.26 %)		 11,907,631
(42.51 %)		 17,423
(0.62 %)
228 European mink (alternate hap 2023)
GCA_030435785.1		 n/a 15,419
(1.50 %)		 21,175
(1.51 %)		 n/a 42.09
(100.00 %)		 n/a 12,043
(100.00 %)		 2,952,218
(30.62 %)		 538,508
(2.18 %)		 9,303,303
(34.20 %)		 47,810
(2.50 %)
229 European mink (primary hap 2023 refseq)
GCF_030435805.1		 69,556
(3.13 %)		 18,706
(1.46 %)		 21,193
(1.37 %)		 n/a 41.85
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 25
(100.00 %)		 4,237,791
(30.90 %)		 792,897
(2.69 %)		 13,417,195
(36.59 %)		 67,132
(2.54 %)
230 European mole (hap1 2024)
GCA_964194135.1		 n/a 18,085
(1.69 %)		 19,509
(1.58 %)		 n/a 42.08
(99.99 %)		 1,056
(0.01 %)		 464
(100.00 %)		 2,569,380
(23.32 %)		 565,465
(2.18 %)		 10,506,666
(33.68 %)		 46,367
(3.09 %)
231 European mole (hap2 2024)
GCA_964194205.1		 n/a 18,064
(1.69 %)		 19,764
(1.59 %)		 n/a 42.07
(99.99 %)		 1,040
(0.01 %)		 1,396
(99.99 %)		 2,567,492
(23.34 %)		 570,250
(2.16 %)		 10,485,959
(33.56 %)		 46,213
(3.27 %)
232 European pine marten (primary hap 2023)
GCA_963455335.1		 n/a 18,336
(1.50 %)		 20,807
(1.41 %)		 n/a 42.38
(99.98 %)		 2,250
(0.02 %)		 477
(100.00 %)		 4,096,160
(31.55 %)		 707,337
(3.28 %)		 13,715,382
(34.73 %)		 61,481
(4.29 %)
233 European shrew (alternate hap 2023)
GCA_027595995.1		 n/a 17,506
(1.26 %)		 25,527
(1.52 %)		 n/a 43.20
(100.00 %)		 n/a 5,699
(100.00 %)		 2,400,784
(15.19 %)		 1,062,793
(3.20 %)		 13,284,496
(41.93 %)		 77,009
(2.86 %)
234 European shrew (GB8-d 2012)
GCF_000181275.1		 23,525
(1.54 %)		 17,290
(1.33 %)		 22,005
(1.50 %)		 n/a 42.90
(90.49 %)		 188,953
(9.54 %)		 201,798
(90.46 %)		 4,400,127
(33.22 %)		 946,629
(2.03 %)		 13,377,581
(35.30 %)		 77,851
(2.58 %)
235 European shrew (primary hap 2023)
GCF_027595985.1		 44,643
(2.60 %)		 17,479
(1.26 %)		 21,293
(1.37 %)		 n/a 43.24
(99.46 %)		 1,427
(0.54 %)		 65
(100.00 %)		 2,474,584
(15.18 %)		 1,107,884
(3.28 %)		 13,638,467
(41.72 %)		 79,785
(2.86 %)
236 European snow vole (alternate hap 2023)
GCA_950005115.1		 n/a 18,364
(1.79 %)		 20,379
(1.63 %)		 n/a 42.19
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 4,256
(100.00 %)		 3,049,618
(22.22 %)		 852,708
(4.50 %)		 10,501,392
(33.34 %)		 17,629
(0.60 %)
237 European snow vole (primary hap 2023 refseq)
GCF_950005125.1		 47,025
(2.69 %)		 19,592
(1.78 %)		 21,173
(1.56 %)		 n/a 41.98
(100.00 %)		 197
(0.00 %)		 160
(100.00 %)		 5,048,186
(44.12 %)		 998,537
(5.14 %)		 12,204,053
(34.97 %)		 20,725
(0.63 %)
238 European suslik (primary hap 2024)
GCA_964194105.1		 n/a 20,075
(1.28 %)		 20,274
(1.19 %)		 n/a 39.90
(99.99 %)		 1,436
(0.01 %)		 502
(100.00 %)		 4,357,247
(31.78 %)		 882,536
(12.27 %)		 14,882,486
(41.66 %)		 39,275
(0.88 %)
239 European woodmouse (2022 refseq)
GCF_947179515.1		 54,114
(2.24 %)		 19,959
(1.65 %)		 19,953
(1.25 %)		 n/a 41.23
(99.99 %)		 1,129
(0.01 %)		 497
(100.00 %)		 4,863,650
(37.41 %)		 1,795,997
(8.95 %)		 13,681,732
(40.58 %)		 23,961
(0.53 %)
240 European woodmouse (alternate hap 2022)
GCA_947179525.1		 n/a 18,692
(1.72 %)		 22,021
(1.36 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 10,863
(100.00 %)		 4,055,957
(36.08 %)		 1,513,576
(9.53 %)		 11,306,811
(39.67 %)		 20,865
(0.55 %)
241 fallow deer (Ldn47 2023)
GCF_033118175.1		 57,013
(2.35 %)		 20,187
(1.33 %)		 23,290
(1.33 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 44
(0.00 %)		 284
(100.00 %)		 3,308,241
(20.72 %)		 513,748
(18.20 %)		 12,996,819
(48.19 %)		 214,480
(2.98 %)
242 fallow deer (maternal hap SK-2024 2025)
GCA_048126745.1		 n/a 20,072
(1.51 %)		 22,668
(1.37 %)		 n/a 41.80
(100.00 %)		 147
(0.00 %)		 1,369
(100.00 %)		 4,623,335
(34.75 %)		 475,143
(7.51 %)		 13,000,703
(41.56 %)		 112,581
(2.00 %)
243 fallow deer (paternal hap SK-2024 2025)
GCA_048127045.1		 n/a 18,238
(1.57 %)		 20,307
(1.42 %)		 n/a 41.46
(100.00 %)		 242
(0.00 %)		 388
(100.00 %)		 4,244,450
(35.89 %)		 405,446
(2.83 %)		 12,211,643
(38.55 %)		 52,418
(1.36 %)
244 false killer whale (hap1 2024 genbank)
GCA_039906515.1		 n/a 18,718
(1.50 %)		 20,929
(1.32 %)		 n/a 42.08
(99.90 %)		 123
(0.10 %)		 439
(100.00 %)		 3,958,932
(35.76 %)		 1,002,329
(11.61 %)		 12,193,131
(41.85 %)		 79,158
(3.74 %)
245 false killer whale (hap1 2024 refseq)
GCF_039906515.1		 75,958
(3.31 %)		 18,718
(1.50 %)		 20,982
(1.32 %)		 n/a 42.08
(99.90 %)		 123
(0.10 %)		 438
(100.00 %)		 3,958,926
(35.76 %)		 1,002,329
(11.61 %)		 12,193,061
(41.85 %)		 79,158
(3.74 %)
246 false killer whale (hap2 2024)
GCA_039906525.1		 n/a 17,866
(1.45 %)		 21,079
(1.46 %)		 n/a 42.37
(99.08 %)		 133
(0.92 %)		 416
(100.00 %)		 3,852,502
(34.98 %)		 1,112,185
(16.42 %)		 11,435,533
(44.17 %)		 75,215
(4.36 %)
247 fat dormouse (US078 2019)
GCA_004027185.1		 n/a 23,122
(1.24 %)		 48,677
(1.27 %)		 n/a 42.33
(99.92 %)		 10,685
(0.04 %)		 444,115
(99.96 %)		 6,783,404
(37.03 %)		 1,642,515
(3.72 %)		 12,706,289
(39.97 %)		 65,521
(1.47 %)
248 fat sand rat (mPsaObe1 2021)
GCF_907164565.1		 43,211
(2.50 %)		 18,543
(1.78 %)		 20,094
(1.42 %)		 n/a 41.95
(99.11 %)		 50,482
(0.90 %)		 11,389
(100.00 %)		 4,686,377
(43.10 %)		 920,563
(1.85 %)		 12,813,848
(35.08 %)		 22,480
(0.71 %)
249 fat sand rat (Psa_ob012049795 2017)
GCA_002215935.1		 n/a 21,644
(1.71 %)		 31,665
(1.41 %)		 n/a 41.99
(99.99 %)		 n/a 96,427
(100.00 %)		 4,646,110
(38.87 %)		 946,664
(2.24 %)		 13,134,526
(33.94 %)		 26,411
(0.73 %)
250 fat-tailed dunnart (SCR6 hap1 2025)
GCA_048593235.1		 n/a 15,762
(0.77 %)		 16,035
(0.89 %)		 n/a 36.12
(99.99 %)		 1,908
(0.01 %)		 1,915
(99.99 %)		 5,302,372
(24.47 %)		 1,450,220
(3.79 %)		 20,870,654
(44.26 %)		 24,585
(0.65 %)
251 fat-tailed dunnart (SCR6 hap2 2025)
GCA_048593295.1		 n/a 16,012
(0.77 %)		 16,430
(0.90 %)		 n/a 36.18
(99.99 %)		 1,730
(0.01 %)		 1,737
(99.99 %)		 5,361,847
(24.48 %)		 1,474,744
(3.79 %)		 21,021,671
(44.20 %)		 25,669
(0.69 %)
252 fin whale (hap1.1 2025)
GCA_965194825.1		 n/a 19,491
(1.21 %)		 22,538
(1.06 %)		 n/a 42.19
(99.99 %)		 1,516
(0.01 %)		 2,612
(100.00 %)		 4,598,236
(35.34 %)		 1,716,315
(24.14 %)		 12,260,919
(52.40 %)		 82,683
(1.47 %)
253 fin whale (hap2.1 2025)
GCA_965194765.1		 n/a 18,684
(1.40 %)		 21,322
(1.20 %)		 n/a 41.87
(99.99 %)		 1,258
(0.01 %)		 3,706
(99.99 %)		 4,103,716
(36.69 %)		 1,030,821
(16.12 %)		 11,633,934
(45.82 %)		 74,782
(1.60 %)
254 fishing cat (Anna 2022 U Missouri)
GCF_022837055.1		 68,015
(2.86 %)		 18,432
(1.63 %)		 19,912
(1.37 %)		 n/a 41.91
(100.00 %)		 63
(0.00 %)		 192
(100.00 %)		 4,777,906
(34.85 %)		 937,432
(2.30 %)		 13,438,032
(34.55 %)		 70,402
(2.61 %)
255 Florida manatee (CSIC 2023)
GCA_030013775.1		 n/a 19,432
(1.24 %)		 24,035
(1.14 %)		 n/a 40.66
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 15,641
(100.00 %)		 4,400,331
(33.07 %)		 439,615
(1.04 %)		 14,884,753
(46.98 %)		 32,563
(0.80 %)
256 Florida manatee (Lorelei 2012 refseq)
GCF_000243295.1		 39,645
(2.08 %)		 18,308
(1.37 %)		 20,588
(1.23 %)		 32,868
(1.38 %)		 40.73
(89.24 %)		 160,167
(10.78 %)		 166,490
(89.22 %)		 n/a 389,315
(0.74 %)		 14,633,038
(38.46 %)		 27,462
(0.64 %)
257 fossa
GCA_004023885.1		 n/a 21,156
(1.56 %)		 29,809
(1.38 %)		 n/a 41.51
(99.94 %)		 6,335
(0.03 %)		 470,371
(99.97 %)		 4,962,168
(42.36 %)		 814,639
(1.52 %)		 13,708,904
(34.14 %)		 78,033
(2.52 %)
258 Gambian giant pouched rat
GCA_004027575.1		 n/a 21,189
(1.59 %)		 32,806
(1.43 %)		 n/a 42.11
(99.88 %)		 7,473
(0.03 %)		 1,110,425
(99.97 %)		 4,137,605
(24.57 %)		 1,071,627
(2.76 %)		 12,905,250
(32.78 %)		 32,359
(0.80 %)
259 gayal (CVASU_BF_001 2021)
GCA_017311355.1		 n/a 24,549
(1.09 %)		 55,194
(1.15 %)		 n/a 42.05
(99.91 %)		 n/a 1,262,134
(100.00 %)		 3,691,398
(22.78 %)		 677,397
(2.00 %)		 14,380,670
(42.36 %)		 75,114
(1.33 %)
260 gayal (Nagaland 2019)
GCA_007844835.1		 n/a 22,715
(1.55 %)		 23,635
(1.33 %)		 n/a 41.67
(96.51 %)		 301,761
(3.52 %)		 306,776
(96.48 %)		 6,243,468
(45.69 %)		 518,664
(1.99 %)		 15,147,647
(37.64 %)		 45,586
(0.89 %)
261 Geoffroy's bat (hap1.1 2025)
GCA_965115925.1		 n/a 19,320
(1.74 %)		 21,940
(1.65 %)		 n/a 42.55
(99.99 %)		 1,540
(0.01 %)		 404
(100.00 %)		 3,707,500
(37.60 %)		 733,107
(7.78 %)		 10,515,474
(39.35 %)		 60,200
(2.41 %)
262 Geoffroy's bat (hap2.1 2025)
GCA_965115945.1		 n/a 18,718
(1.71 %)		 20,961
(1.62 %)		 n/a 42.29
(99.98 %)		 1,597
(0.02 %)		 2,101
(99.98 %)		 3,662,405
(37.72 %)		 717,069
(7.80 %)		 10,298,372
(39.22 %)		 56,300
(2.26 %)
263 Geoffroy's cat
GCF_018350155.1		 85,331
(3.53 %)		 18,469
(1.66 %)		 19,516
(1.36 %)		 93,795
(4.83 %)		 41.75
(100.00 %)		 45
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 5,021,854
(43.23 %)		 930,175
(1.84 %)		 13,757,469
(34.29 %)		 65,918
(2.36 %)
264 giant anteater
GCA_004026745.1		 n/a 24,383
(0.91 %)		 44,315
(0.93 %)		 n/a 39.53
(99.88 %)		 8,283
(0.02 %)		 1,629,691
(99.98 %)		 5,333,757
(35.57 %)		 575,140
(0.91 %)		 21,181,213
(39.97 %)		 57,558
(0.94 %)
265 giant otter
GCA_004024605.1		 n/a 21,199
(1.46 %)		 30,565
(1.34 %)		 n/a 41.71
(99.93 %)		 7,431
(0.03 %)		 652,159
(99.97 %)		 5,113,769
(41.55 %)		 788,677
(1.46 %)		 14,385,279
(35.77 %)		 82,376
(2.05 %)
266 giant panda (Jingjing v3 2020)
GCF_002007445.2		 65,468
(3.27 %)		 19,077
(1.67 %)		 20,176
(1.39 %)		 n/a 41.68
(98.09 %)		 189,277
(1.92 %)		 73,514
(100.00 %)		 4,012,144
(34.40 %)		 617,803
(1.99 %)		 14,216,587
(30.41 %)		 59,449
(1.50 %)
267 goat (v2 San Clemente 2016 USDA)
GCF_001704415.2		 47,159
(2.31 %)		 19,342
(1.38 %)		 22,346
(1.24 %)		 n/a 43.16
(100.00 %)		 790
(0.00 %)		 29,886
(100.00 %)		 3,502,527
(22.45 %)		 760,831
(7.07 %)		 13,024,178
(44.85 %)		 125,662
(4.00 %)
268 Gobi jerboa
GCA_004027895.1		 n/a 22,410
(0.91 %)		 45,268
(1.02 %)		 n/a 41.94
(99.88 %)		 10,987
(0.04 %)		 1,295,369
(99.96 %)		 8,828,417
(40.19 %)		 1,979,806
(6.43 %)		 14,759,732
(47.73 %)		 24,314
(0.52 %)
269 golden hamster (Baylor 2021)
GCF_017639785.1		 67,831
(3.37 %)		 19,354
(1.71 %)		 19,863
(1.47 %)		 69,903
(4.39 %)		 42.04
(96.99 %)		 711
(3.01 %)		 7,058
(96.99 %)		 3,981,818
(27.65 %)		 976,456
(3.46 %)		 12,580,903
(32.87 %)		 21,268
(0.61 %)
270 golden hamster (Broad 2013 refseq)
GCF_000349665.1		 42,636
(2.91 %)		 18,976
(1.82 %)		 19,149
(1.51 %)		 29,936
(1.96 %)		 42.01
(82.92 %)		 216,216
(17.12 %)		 237,700
(82.88 %)		 3,599,795
(26.09 %)		 790,256
(1.69 %)		 12,003,956
(24.29 %)		 18,591
(0.51 %)
271 golden-mantled ground squirrel (hap1 2025)
GCA_048772815.1		 n/a 20,967
(0.89 %)		 24,137
(0.94 %)		 n/a 39.52
(99.99 %)		 1,448
(0.01 %)		 8,087
(100.00 %)		 5,547,018
(29.30 %)		 1,312,047
(10.07 %)		 15,174,898
(52.73 %)		 40,182
(0.59 %)
272 golden-mantled ground squirrel (hap2 2025)
GCA_048772825.1		 n/a 19,719
(1.16 %)		 22,611
(1.21 %)		 n/a 39.48
(100.00 %)		 643
(0.00 %)		 2,820
(100.00 %)		 4,725,546
(31.70 %)		 997,950
(3.53 %)		 14,753,550
(39.53 %)		 33,465
(0.69 %)
273 golden spiny mouse (2020)
GCF_903995435.1		 36,997
(1.96 %)		 20,006
(1.91 %)		 19,132
(1.50 %)		 n/a 42.51
(99.65 %)		 880
(0.35 %)		 623
(100.00 %)		 4,785,907
(32.61 %)		 1,305,613
(3.34 %)		 12,958,061
(32.33 %)		 20,760
(0.59 %)
274 gracile shrew mole
GCA_004024945.1		 n/a 19,165
(1.25 %)		 43,816
(1.48 %)		 n/a 41.08
(99.89 %)		 8,248
(0.04 %)		 732,083
(99.96 %)		 2,957,465
(23.76 %)		 783,289
(2.60 %)		 11,503,344
(31.38 %)		 92,729
(3.60 %)
275 gray fox (Vermont ataVT051 2023)
GCA_032313775.1		 n/a 19,352
(1.42 %)		 20,724
(1.33 %)		 n/a 42.10
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 898
(100.00 %)		 4,418,039
(36.90 %)		 1,050,244
(11.63 %)		 13,240,305
(39.50 %)		 89,246
(2.69 %)
276 gray seal (hap1.1 2025)
GCA_964656455.1		 n/a 19,291
(1.73 %)		 20,301
(1.41 %)		 n/a 41.56
(99.99 %)		 1,130
(0.01 %)		 171
(100.00 %)		 4,245,582
(34.81 %)		 600,624
(2.16 %)		 13,240,803
(34.28 %)		 56,932
(1.78 %)
277 gray seal (hap2.1 2025)
GCA_964656465.1		 n/a 19,222
(1.73 %)		 20,205
(1.41 %)		 n/a 41.54
(99.99 %)		 1,110
(0.01 %)		 1,233
(99.99 %)		 4,236,942
(34.95 %)		 601,409
(1.99 %)		 13,226,667
(34.03 %)		 57,067
(1.82 %)
278 gray seal (241Hg 2020)
GCF_012393455.1		 79,009
(3.73 %)		 19,882
(1.73 %)		 22,416
(1.46 %)		 n/a 41.44
(100.00 %)		 117
(0.00 %)		 6,880
(100.00 %)		 4,448,588
(43.28 %)		 557,710
(1.32 %)		 13,340,576
(33.41 %)		 55,637
(1.78 %)
279 gray short-tailed opossum (mMonDom1 alternate hap 2023)
GCA_027917375.1		 n/a 12,662
(0.70 %)		 15,124
(0.89 %)		 n/a 37.74
(100.00 %)		 24
(0.00 %)		 8,086
(100.00 %)		 4,098,004
(25.33 %)		 806,470
(2.98 %)		 16,244,072
(43.39 %)		 24,879
(0.67 %)
280 gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887165.1		 73,383
(3.04 %)		 16,637
(0.72 %)		 16,036
(0.85 %)		 n/a 37.92
(99.11 %)		 2,255
(0.89 %)		 13
(100.00 %)		 5,562,359
(25.40 %)		 1,096,620
(2.60 %)		 22,322,748
(43.37 %)		 28,894
(0.57 %)
281 gray short-tailed opossum (MonDom5 2007)
GCF_000002295.2		 68,375
(2.34 %)		 16,663
(0.75 %)		 16,162
(0.84 %)		 n/a 37.82
(97.26 %)		 67,660
(2.75 %)		 72,674
(97.25 %)		 7,753,175
(55.85 %)		 1,051,473
(2.34 %)		 22,274,001
(42.23 %)		 30,883
(0.53 %)
282 gray squirrel (2020)
GCF_902686445.1		 58,884
(2.46 %)		 20,752
(1.49 %)		 21,107
(1.31 %)		 32,732
(1.45 %)		 40.06
(99.98 %)		 1,824
(0.02 %)		 752
(100.00 %)		 4,605,578
(34.50 %)		 728,192
(1.65 %)		 15,467,412
(33.91 %)		 51,878
(1.11 %)
283 gray squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685475.1		 n/a 17,156
(1.53 %)		 18,190
(1.33 %)		 n/a 40.25
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 9,510
(100.00 %)		 3,455,580
(34.94 %)		 530,053
(1.56 %)		 10,927,458
(32.64 %)		 38,976
(1.13 %)
284 gray wolf (2021)
GCA_905319855.2		 n/a 19,474
(1.55 %)		 20,394
(1.40 %)		 72,806
(4.12 %)		 41.49
(100.00 %)		 166
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 4,550,524
(31.76 %)		 1,063,944
(3.96 %)		 13,588,117
(34.74 %)		 51,996
(2.15 %)
285 gray wolf (alternate hap 2021)
GCA_905319845.1		 n/a 12,760
(1.57 %)		 14,423
(1.42 %)		 n/a 41.35
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,537
(100.00 %)		 2,725,227
(31.66 %)		 616,862
(3.40 %)		 8,041,744
(32.68 %)		 32,293
(2.35 %)
286 great fruit-eating bat (hap1 2024)
GCA_038363145.1		 n/a 18,022
(1.56 %)		 19,824
(1.51 %)		 n/a 42.28
(100.00 %)		 81
(0.00 %)		 419
(100.00 %)		 2,827,417
(26.82 %)		 371,479
(4.97 %)		 11,603,093
(34.64 %)		 71,574
(2.28 %)
287 great fruit-eating bat (mArtLit1hap2 2024)
GCA_038363175.2		 n/a 16,978
(1.61 %)		 18,544
(1.54 %)		 n/a 42.42
(100.00 %)		 54
(0.00 %)		 312
(100.00 %)		 2,601,985
(26.67 %)		 331,187
(4.87 %)		 10,884,729
(33.93 %)		 63,610
(2.71 %)
288 great fruit-eating bat (v2 hap1 2024)
GCA_038363095.2		 n/a 18,051
(1.56 %)		 19,955
(1.51 %)		 n/a 42.45
(100.00 %)		 45
(0.00 %)		 487
(100.00 %)		 2,841,143
(26.67 %)		 379,430
(5.52 %)		 11,651,542
(35.11 %)		 72,337
(2.76 %)
289 great roundleaf bat (v2 ML-2016 2016)
GCF_001890085.2		 50,895
(3.26 %)		 18,993
(2.01 %)		 19,633
(1.65 %)		 41,769
(2.41 %)		 41.11
(87.42 %)		 172,750
(12.60 %)		 7,387
(100.00 %)		 2,946,981
(30.72 %)		 495,272
(1.05 %)		 11,587,728
(25.43 %)		 32,949
(0.96 %)
290 greater bulldog bat
GCA_004026585.1		 n/a 20,774
(1.62 %)		 28,140
(1.63 %)		 n/a 40.92
(99.94 %)		 6,171
(0.03 %)		 304,393
(99.97 %)		 3,288,598
(29.60 %)		 478,424
(1.16 %)		 11,427,553
(35.29 %)		 44,124
(1.99 %)
291 Greater cane rat
GCA_004025085.1		 n/a 20,383
(0.98 %)		 47,456
(1.25 %)		 n/a 42.85
(99.83 %)		 8,825
(0.03 %)		 1,898,466
(99.97 %)		 5,569,185
(30.19 %)		 946,696
(3.12 %)		 13,144,109
(41.83 %)		 97,686
(2.61 %)
292 greater horseshoe bat (MPI-CBG alternate hap 2019)
GCA_004115295.1		 n/a 14,896
(1.85 %)		 18,939
(1.59 %)		 n/a 40.69
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 13,426
(100.00 %)		 2,426,330
(34.43 %)		 418,341
(1.36 %)		 8,763,234
(27.86 %)		 24,370
(1.08 %)
293 greater horseshoe bat (v2 MPI-CBG 2019)
GCF_004115265.2		 53,353
(3.13 %)		 18,641
(1.97 %)		 20,359
(1.68 %)		 n/a 40.54
(99.64 %)		 158
(0.36 %)		 134
(100.00 %)		 3,218,744
(34.52 %)		 564,789
(1.35 %)		 12,217,020
(29.39 %)		 32,445
(1.06 %)
294 greater mouse-eared bat (2020 Bat1K)
GCF_014108235.1		 70,930
(3.43 %)		 19,052
(1.84 %)		 21,498
(1.73 %)		 n/a 43.11
(98.55 %)		 538
(1.45 %)		 93
(100.00 %)		 3,088,083
(26.27 %)		 753,124
(2.84 %)		 10,383,466
(35.84 %)		 61,023
(2.69 %)
295 greater mouse-tailed bat (20210906_DDa primary hap 2024)
GCA_043880545.1		 n/a 18,582
(1.55 %)		 20,954
(1.35 %)		 n/a 42.46
(100.00 %)		 152
(0.00 %)		 106
(100.00 %)		 4,158,629
(40.30 %)		 696,150
(4.67 %)		 12,702,667
(41.11 %)		 257,446
(3.38 %)
296 greater sac-winged bat (primary hap 2024 refseq)
GCF_036850765.1		 55,259
(2.53 %)		 18,321
(1.40 %)		 21,048
(1.35 %)		 n/a 41.71
(98.73 %)		 468
(1.27 %)		 256
(100.00 %)		 4,247,145
(29.53 %)		 1,031,385
(2.50 %)		 12,465,157
(43.30 %)		 101,620
(2.01 %)
297 greater spear-nosed bat (2021 Texas Tech U)
GCF_019186645.2		 50,563
(2.96 %)		 18,224
(1.70 %)		 20,689
(1.67 %)		 n/a 42.27
(100.00 %)		 55
(0.00 %)		 534
(100.00 %)		 2,961,591
(0.00 %)		 387,908
(0.97 %)		 12,179,612
(30.91 %)		 62,189
(5.35 %)
298 grey whale
GCA_004363415.1		 n/a 21,827
(1.52 %)		 32,191
(1.24 %)		 n/a 41.22
(99.88 %)		 10,622
(0.04 %)		 1,046,770
(99.96 %)		 4,841,166
(45.56 %)		 780,015
(1.83 %)		 13,559,563
(39.86 %)		 72,343
(1.59 %)
299 grey whale (mEscRob2 alternate hap 2023)
GCA_028021475.1		 n/a 19,129
(1.37 %)		 24,628
(1.24 %)		 n/a 41.83
(100.00 %)		 n/a 14,442
(100.00 %)		 3,892,130
(35.74 %)		 874,864
(15.70 %)		 11,484,916
(45.69 %)		 73,507
(1.72 %)
300 grey whale (primary hap 2023 genbank)
GCA_028021215.1		 n/a 19,288
(1.38 %)		 21,791
(1.21 %)		 n/a 41.74
(100.00 %)		 279
(0.00 %)		 704
(100.00 %)		 4,116,900
(35.85 %)		 966,065
(16.74 %)		 12,154,173
(46.39 %)		 77,011
(1.59 %)
301 grey whale (primary hap 2023 refseq)
GCF_028021215.1		 49,276
(1.90 %)		 19,295
(1.38 %)		 21,790
(1.21 %)		 n/a 41.74
(100.00 %)		 279
(0.00 %)		 703
(100.00 %)		 4,116,894
(35.85 %)		 966,064
(16.74 %)		 12,154,101
(46.39 %)		 77,011
(1.59 %)
302 hairy big-eared bat (US037 2019 Broad)
GCA_004026765.1		 n/a 21,360
(1.44 %)		 37,376
(1.52 %)		 n/a 42.38
(99.94 %)		 3,218
(0.01 %)		 553,308
(99.99 %)		 3,519,246
(30.77 %)		 393,318
(0.85 %)		 12,525,258
(34.42 %)		 84,875
(2.37 %)
303 Hanaki's dwarf bat (2024)
GCA_964339955.1		 n/a 17,856
(1.76 %)		 20,604
(1.75 %)		 n/a 42.55
(100.00 %)		 306
(0.00 %)		 141
(100.00 %)		 3,697,250
(33.21 %)		 842,827
(8.27 %)		 10,094,062
(38.40 %)		 61,715
(2.96 %)
304 harbor porpoise (primary hap 2024 genbank)
GCA_963924675.1		 n/a 18,529
(1.58 %)		 20,583
(1.34 %)		 n/a 41.72
(99.99 %)		 966
(0.01 %)		 442
(100.00 %)		 3,760,716
(36.18 %)		 888,368
(7.18 %)		 12,379,240
(39.04 %)		 71,530
(2.69 %)
305 harbor porpoise (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924675.1		 33,578
(1.54 %)		 18,528
(1.58 %)		 20,582
(1.34 %)		 n/a 41.72
(99.99 %)		 966
(0.01 %)		 1,405
(99.99 %)		 3,760,713
(36.18 %)		 888,368
(7.18 %)		 12,379,181
(39.04 %)		 71,530
(2.69 %)
306 harbor seal
GCF_004348235.1		 50,670
(2.98 %)		 19,484
(1.76 %)		 20,771
(1.44 %)		 33,296
(1.58 %)		 41.38
(99.09 %)		 16,480
(0.91 %)		 21,161
(99.09 %)		 4,526,182
(43.28 %)		 576,921
(1.11 %)		 13,421,780
(33.06 %)		 54,592
(1.70 %)
307 Hawaiian monk seal (2021 Johns Hopkins U)
GCF_002201575.2		 37,605
(1.99 %)		 19,483
(1.73 %)		 19,767
(1.35 %)		 n/a 41.41
(98.23 %)		 25,763
(1.77 %)		 7,487
(100.00 %)		 4,575,217
(43.59 %)		 583,394
(1.11 %)		 13,374,131
(33.69 %)		 52,067
(1.50 %)
308 hazel dormouse
GCA_004027005.1		 n/a 21,556
(1.24 %)		 40,971
(1.33 %)		 n/a 41.60
(99.91 %)		 15,076
(0.06 %)		 481,881
(99.94 %)		 6,679,641
(33.98 %)		 1,653,419
(3.72 %)		 12,685,676
(43.98 %)		 71,478
(1.57 %)
309 hazel dormouse (alternate hap 2023)
GCA_963383665.1		 n/a 11,130
(1.23 %)		 22,071
(1.36 %)		 n/a 42.15
(99.99 %)		 n/a 31,856
(100.00 %)		 2,958,239
(41.25 %)		 788,242
(4.52 %)		 6,056,268
(41.88 %)		 36,143
(1.96 %)
310 hazel dormouse (primary hap 2023)
GCA_963383645.1		 n/a 18,620
(1.42 %)		 22,403
(1.38 %)		 n/a 41.73
(99.99 %)		 1,805
(0.01 %)		 214
(100.00 %)		 6,063,911
(41.66 %)		 1,593,657
(4.46 %)		 12,229,281
(43.98 %)		 71,058
(1.88 %)
311 hippopotamus (BS01 2019 Broad)
GCA_004027065.1		 n/a 24,267
(1.55 %)		 34,820
(1.30 %)		 n/a 41.43
(99.91 %)		 4,730
(0.02 %)		 972,599
(99.98 %)		 4,579,311
(41.26 %)		 606,731
(1.02 %)		 14,514,493
(36.58 %)		 54,753
(1.59 %)
312 hippopotamus (HIP001 2018)
GCA_002995585.1		 n/a 22,343
(1.70 %)		 31,687
(1.45 %)		 n/a 40.96
(94.63 %)		 153,125
(5.38 %)		 281,897
(94.62 %)		 3,952,905
(38.55 %)		 476,243
(1.97 %)		 14,216,817
(27.43 %)		 48,380
(1.43 %)
313 hippopotamus (mHipAmp2 hap1 2023)
GCA_030028035.1		 n/a 20,391
(1.63 %)		 20,668
(1.37 %)		 n/a 41.62
(100.00 %)		 83
(0.00 %)		 545
(100.00 %)		 3,778,764
(35.17 %)		 563,345
(3.63 %)		 13,524,869
(35.56 %)		 48,164
(1.90 %)
314 hippopotamus (v2 hap2 2023 refseq)
GCF_030028045.1		 64,153
(2.73 %)		 20,331
(1.62 %)		 20,633
(1.37 %)		 n/a 41.60
(100.00 %)		 226
(0.00 %)		 357
(100.00 %)		 3,783,440
(35.17 %)		 567,797
(3.38 %)		 13,462,531
(35.48 %)		 48,365
(1.91 %)
315 hirola (BS46 2019 Broad)
GCA_004027495.1		 n/a 22,264
(1.40 %)		 36,984
(1.26 %)		 n/a 42.31
(99.93 %)		 9,287
(0.03 %)		 545,176
(99.97 %)		 5,809,405
(48.62 %)		 465,001
(1.08 %)		 13,326,245
(42.35 %)		 48,312
(1.15 %)
316 Hispaniolan solenodon
GCA_004363575.1		 n/a 18,805
(1.55 %)		 27,454
(1.64 %)		 n/a 39.98
(99.96 %)		 5,186
(0.02 %)		 181,804
(99.98 %)		 2,669,787
(26.78 %)		 431,610
(1.04 %)		 13,429,711
(27.35 %)		 53,444
(2.30 %)
317 hispid cotton rat
GCA_004025045.1		 n/a 25,324
(1.49 %)		 31,681
(1.31 %)		 39,953
(1.43 %)		 39.77
(99.89 %)		 13,744
(0.05 %)		 897,290
(99.95 %)		 4,384,099
(28.17 %)		 1,132,313
(3.34 %)		 14,729,737
(38.08 %)		 17,558
(0.40 %)
318 Hoffmann's two-fingered sloth
GCA_000164785.2		 n/a 24,546
(1.30 %)		 30,273
(1.15 %)		 n/a 39.80
(98.09 %)		 101,085
(1.91 %)		 370,035
(98.09 %)		 5,145,551
(52.20 %)		 614,819
(1.62 %)		 17,932,269
(39.26 %)		 55,943
(1.04 %)
319 hog-nosed bat
GCA_004027555.1		 n/a 20,591
(1.30 %)		 39,589
(1.39 %)		 n/a 40.99
(99.88 %)		 6,224
(0.03 %)		 1,230,480
(99.97 %)		 4,081,924
(31.12 %)		 1,008,077
(2.20 %)		 12,068,828
(39.98 %)		 55,567
(2.02 %)
320 Honduran yellow-shouldered bat (v2.1 Veracruz 20B 2020)
GCF_014824575.3		 49,071
(2.78 %)		 17,588
(1.64 %)		 19,357
(1.60 %)		 n/a 42.32
(99.79 %)		 38,648
(0.21 %)		 25,848
(100.00 %)		 2,708,400
(27.89 %)		 366,870
(1.48 %)		 11,795,308
(31.27 %)		 59,066
(1.72 %)
321 horse (maternal 2024)
GCA_036418255.1		 n/a 16,789
(1.65 %)		 18,017
(1.36 %)		 n/a 42.07
(100.00 %)		 210
(0.00 %)		 821
(100.00 %)		 3,146,381
(34.68 %)		 430,664
(5.91 %)		 13,246,059
(32.62 %)		 37,293
(2.80 %)
322 horse (paternal hap 2024)
GCA_036426135.1		 n/a 19,073
(1.67 %)		 20,636
(1.38 %)		 n/a 42.08
(100.00 %)		 114
(0.00 %)		 602
(100.00 %)		 3,521,953
(35.39 %)		 461,571
(5.26 %)		 14,833,688
(32.77 %)		 43,527
(2.54 %)
323 horse (thoroughbred H_3958 2024)
GCF_041296265.1		 124,629
(3.91 %)		 18,742
(1.47 %)		 21,901
(1.39 %)		 n/a 42.90
(99.96 %)		 5
(0.04 %)		 625
(100.00 %)		 3,600,073
(33.96 %)		 709,759
(8.89 %)		 14,396,691
(35.72 %)		 48,802
(5.67 %)
324 horse (Twilight 2018)
GCF_002863925.1		 76,567
(4.06 %)		 18,997
(1.73 %)		 20,914
(1.42 %)		 113,346
(6.08 %)		 41.50
(99.62 %)		 6,294
(0.38 %)		 4,701
(100.00 %)		 4,080,319
(44.85 %)		 395,037
(1.44 %)		 15,169,517
(29.93 %)		 44,825
(1.77 %)
325 house mouse (129S1_SvImJv1 2016)
GCA_001624185.1		 n/a 21,289
(2.22 %)		 18,626
(1.42 %)		 102,148
(4.16 %)		 41.77
(85.00 %)		 366,945
(15.05 %)		 62,882
(95.15 %)		 5,075,137
(40.38 %)		 1,400,072
(2.80 %)		 13,497,076
(26.20 %)		 16,957
(0.40 %)
326 house mouse (129S1_SvImJ_v3 2022)
GCA_921998555.2		 n/a 21,780
(2.13 %)		 19,436
(1.37 %)		 110,376
(4.47 %)		 41.79
(99.60 %)		 1,557
(0.40 %)		 188
(100.00 %)		 4,653,663
(40.74 %)		 1,550,342
(3.54 %)		 12,930,784
(35.48 %)		 23,211
(0.57 %)
327 house mouse (AKR_J v3 2022)
GCA_922000895.2		 n/a 21,721
(2.13 %)		 19,324
(1.37 %)		 110,654
(4.48 %)		 41.80
(99.85 %)		 2,714
(0.15 %)		 201
(100.00 %)		 4,645,513
(40.70 %)		 1,547,237
(3.56 %)		 13,016,932
(35.69 %)		 23,309
(0.57 %)
328 house mouse (alternate hap 2023)
GCA_949316305.1		 n/a 661
(0.88 %)		 720
(0.54 %)		 n/a 38.59
(100.00 %)		 n/a 1,806
(100.00 %)		 97,279
(72.21 %)		 40,071
(55.89 %)		 208,928
(64.94 %)		 506
(0.31 %)
329 house mouse (A_J v3 2022)
GCA_921998355.2		 n/a 21,869
(2.13 %)		 19,400
(1.37 %)		 110,389
(4.48 %)		 41.80
(99.39 %)		 608
(0.61 %)		 163
(100.00 %)		 4,668,553
(40.80 %)		 1,556,835
(3.58 %)		 12,995,938
(35.53 %)		 23,203
(0.56 %)
330 house mouse (BALB_cJ v3 2022)
GCA_921997145.2		 n/a 21,891
(2.13 %)		 19,499
(1.37 %)		 110,461
(4.47 %)		 41.79
(99.80 %)		 274
(0.20 %)		 217
(100.00 %)		 4,673,990
(40.79 %)		 1,560,327
(3.63 %)		 13,018,071
(35.70 %)		 23,196
(0.56 %)
331 house mouse (C3H_HeJ v3 2022)
GCA_921997125.2		 n/a 21,793
(2.13 %)		 19,516
(1.38 %)		 110,049
(4.46 %)		 41.79
(99.05 %)		 844
(0.95 %)		 174
(100.00 %)		 4,657,005
(40.76 %)		 1,551,107
(3.53 %)		 12,949,100
(35.32 %)		 23,262
(0.56 %)
332 house mouse (C57BL_6J T2T 2024)
GCA_964188535.1		 n/a 21,496
(1.92 %)		 19,278
(1.25 %)		 n/a 41.31
(99.85 %)		 108
(0.15 %)		 345
(99.85 %)		 4,519,975
(46.81 %)		 1,564,206
(14.33 %)		 12,267,542
(42.16 %)		 23,119
(0.55 %)
333 house mouse (CBA_J v3 2022)
GCA_921998905.2		 n/a 21,829
(2.13 %)		 19,841
(1.39 %)		 110,858
(4.48 %)		 41.79
(99.52 %)		 658
(0.48 %)		 145
(100.00 %)		 4,658,032
(40.77 %)		 1,552,298
(3.59 %)		 12,948,038
(35.52 %)		 23,232
(0.56 %)
334 house mouse (DBA_2J v3 2022)
GCA_921998315.2		 n/a 22,302
(2.08 %)		 19,749
(1.35 %)		 113,269
(4.42 %)		 41.72
(100.00 %)		 153
(0.00 %)		 361
(100.00 %)		 4,785,676
(41.69 %)		 1,597,598
(4.56 %)		 13,190,158
(36.58 %)		 24,140
(0.59 %)
335 house mouse (FVB_NJ v3 2022)
GCA_921998635.2		 n/a 21,633
(2.15 %)		 19,565
(1.40 %)		 110,246
(4.50 %)		 41.82
(98.35 %)		 6,244
(1.65 %)		 384
(100.00 %)		 4,621,601
(40.42 %)		 1,537,622
(3.48 %)		 12,818,729
(34.77 %)		 22,696
(0.55 %)
336 house mouse (LP_J v3 2022)
GCA_947599735.1		 n/a 22,452
(1.91 %)		 19,841
(1.23 %)		 110,073
(3.98 %)		 41.29
(99.99 %)		 386
(0.01 %)		 515
(100.00 %)		 4,839,574
(46.33 %)		 1,645,163
(11.88 %)		 12,936,515
(41.49 %)		 24,374
(0.54 %)
337 house mouse (NOD_ShiLtJ v3 2022)
GCA_921998325.2		 n/a 21,797
(2.13 %)		 19,521
(1.38 %)		 109,890
(4.48 %)		 41.80
(99.50 %)		 1,462
(0.50 %)		 170
(100.00 %)		 4,650,016
(40.74 %)		 1,547,220
(3.54 %)		 12,918,125
(35.45 %)		 23,253
(0.56 %)
338 house mouse (NZO_HlLtJ v3 2022)
GCA_947593165.1		 n/a 22,481
(1.93 %)		 19,932
(1.26 %)		 109,670
(4.03 %)		 41.34
(100.00 %)		 234
(0.00 %)		 441
(100.00 %)		 4,822,230
(45.92 %)		 1,637,027
(11.19 %)		 13,082,730
(41.04 %)		 24,187
(0.54 %)
339 house mouse (primary hap 2023)
GCA_949316315.1		 n/a 22,351
(1.96 %)		 19,629
(1.26 %)		 n/a 41.38
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 179
(100.00 %)		 4,774,018
(45.31 %)		 1,620,102
(10.50 %)		 13,181,250
(40.47 %)		 23,955
(0.54 %)
340 house mouse C57BL/6J 2020 GRC
GCF_000001635.27		 130,343
(4.85 %)		 22,409
(2.02 %)		 19,480
(1.31 %)		 140,725
(4.83 %)		 41.67
(97.30 %)		 334
(2.70 %)		 22,273
(97.30 %)		 5,361,085
(45.51 %)		 1,641,063
(3.41 %)		 12,722,791
(36.04 %)		 23,794
(0.53 %)
341 house mouse C57BL_6NJ (2016)
GCA_001632555.1		 n/a 21,177
(2.23 %)		 18,495
(1.42 %)		 103,002
(4.20 %)		 41.76
(82.53 %)		 410,660
(17.53 %)		 49,821
(96.37 %)		 5,081,049
(40.22 %)		 1,392,942
(2.58 %)		 13,476,268
(25.21 %)		 16,877
(0.39 %)
342 house mouse C57BL_6NJ (2022)
GCA_921999865.2		 n/a 21,817
(2.13 %)		 19,349
(1.37 %)		 n/a 41.79
(99.76 %)		 1,127
(0.24 %)		 214
(100.00 %)		 4,661,104
(40.76 %)		 1,552,079
(3.56 %)		 12,953,662
(35.57 %)		 23,204
(0.56 %)
343 humpback whale (KW2013002 2024)
GCA_041834305.1		 n/a 19,463
(1.32 %)		 22,424
(1.19 %)		 n/a 42.05
(100.00 %)		 88
(0.00 %)		 1,355
(100.00 %)		 4,164,459
(34.02 %)		 1,281,751
(18.33 %)		 12,412,281
(48.28 %)		 82,412
(1.67 %)
344 hybrid cattle (Angus x Brahman F1 Angus haplotype 2018)
GCA_003369685.2		 n/a 19,096
(1.59 %)		 20,674
(1.34 %)		 n/a 41.99
(99.75 %)		 277
(0.25 %)		 1,435
(100.00 %)		 5,290,422
(47.51 %)		 478,946
(1.94 %)		 12,568,313
(41.15 %)		 45,850
(1.37 %)
345 hybrid cattle (Angus x Brahman F1 Brahman haplotype 2018)
GCF_003369695.1		 63,234
(2.88 %)		 19,601
(1.57 %)		 21,699
(1.34 %)		 n/a 41.83
(99.94 %)		 302
(0.06 %)		 1,250
(100.00 %)		 5,524,454
(47.57 %)		 459,928
(1.40 %)		 13,208,799
(41.21 %)		 41,359
(1.10 %)
346 Iberian mole (v2.1 TD23 2020)
GCF_014898055.3		 56,973
(3.41 %)		 18,431
(1.69 %)		 20,317
(1.59 %)		 n/a 41.89
(99.89 %)		 3,575
(0.11 %)		 3,202
(100.00 %)		 2,635,974
(23.38 %)		 496,514
(1.29 %)		 10,969,546
(32.61 %)		 47,466
(2.89 %)
347 Indian false vampire
GCA_004026885.1		 n/a 20,067
(1.37 %)		 36,544
(1.53 %)		 32,548
(1.37 %)		 40.84
(99.83 %)		 6,266
(0.02 %)		 1,909,067
(99.98 %)		 4,096,409
(31.50 %)		 699,311
(1.81 %)		 12,307,198
(39.96 %)		 92,830
(3.12 %)
348 Indian flying fox
GCF_902729225.1		 64,763
(3.85 %)		 18,222
(2.01 %)		 23,187
(1.82 %)		 45,389
(2.18 %)		 39.83
(99.10 %)		 17,500
(0.90 %)		 16,113
(100.00 %)		 2,972,300
(34.11 %)		 487,157
(1.49 %)		 12,486,528
(27.37 %)		 57,869
(3.73 %)
349 Indian short-nosed fruit bat (CYSPWHU 2023)
GCA_030015415.1		 n/a 17,560
(2.04 %)		 21,687
(1.83 %)		 n/a 39.77
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 181
(100.00 %)		 2,598,385
(30.48 %)		 486,921
(1.41 %)		 11,828,726
(27.28 %)		 37,476
(5.58 %)
350 Indochinese shrew (US011 2019 Broad)
GCA_004027635.1		 n/a 18,870
(0.51 %)		 55,636
(0.81 %)		 n/a 39.81
(99.83 %)		 5,267
(0.02 %)		 2,420,679
(99.98 %)		 4,130,068
(16.60 %)		 1,663,335
(3.30 %)		 18,728,711
(46.19 %)		 31,453
(0.55 %)
351 Indus River dolphin
GCA_004363435.1		 n/a 24,321
(1.30 %)		 47,065
(1.14 %)		 n/a 41.72
(99.88 %)		 11,702
(0.04 %)		 1,110,492
(99.96 %)		 5,093,308
(45.60 %)		 845,860
(1.72 %)		 13,162,111
(41.37 %)		 68,257
(1.40 %)
352 Inner Mongolia cashmere goat (2024)
GCA_041735815.1		 n/a 19,123
(1.40 %)		 21,508
(1.26 %)		 n/a 43.19
(100.00 %)		 n/a 31
(100.00 %)		 3,982,368
(23.76 %)		 650,129
(7.44 %)		 12,858,872
(44.33 %)		 99,144
(2.87 %)
353 intermediate horseshoe bat (China 20211001_DDa primary hap 2024)
GCA_043728065.1		 n/a 18,239
(1.76 %)		 20,378
(1.53 %)		 n/a 41.40
(100.00 %)		 37
(0.00 %)		 2,195
(100.00 %)		 3,438,644
(42.82 %)		 584,006
(9.54 %)		 12,207,998
(35.49 %)		 34,491
(1.02 %)
354 intermediate roundleaf bat (primary hap 2023)
GCA_031876335.1		 n/a 19,064
(1.67 %)		 20,800
(1.49 %)		 n/a 41.55
(100.00 %)		 119
(0.00 %)		 69
(100.00 %)		 3,393,548
(30.92 %)		 723,545
(6.58 %)		 12,073,117
(35.40 %)		 43,736
(1.20 %)
355 jaguar (BS21 2019)
GCA_004023805.1		 n/a 21,431
(1.51 %)		 32,835
(1.35 %)		 n/a 41.70
(99.89 %)		 21,329
(0.09 %)		 460,121
(99.91 %)		 5,420,861
(43.75 %)		 1,049,353
(1.93 %)		 13,848,545
(34.90 %)		 71,066
(2.37 %)
356 jaguar (hap1 2025)
GCA_046562885.1		 n/a 17,882
(1.68 %)		 19,103
(1.41 %)		 n/a 41.66
(100.00 %)		 140
(0.00 %)		 115
(100.00 %)		 4,622,385
(41.25 %)		 893,297
(1.89 %)		 12,851,116
(33.53 %)		 61,319
(2.55 %)
357 jaguar (hap2 2025)
GCA_046562875.1		 n/a 18,867
(1.64 %)		 20,784
(1.40 %)		 n/a 41.76
(100.00 %)		 200
(0.00 %)		 85
(100.00 %)		 4,977,843
(41.75 %)		 982,064
(2.10 %)		 13,365,332
(34.16 %)		 66,000
(2.75 %)
358 jaguar (Sample0147 2023)
GCF_028533385.1		 71,565
(4.12 %)		 19,122
(1.67 %)		 21,950
(1.36 %)		 n/a 41.58
(99.31 %)		 56,371
(0.70 %)		 36,243
(100.00 %)		 4,552,854
(33.37 %)		 897,371
(1.63 %)		 13,732,912
(32.89 %)		 63,777
(2.41 %)
359 jaguarundi
GCF_014898765.1		 72,564
(3.15 %)		 18,602
(1.64 %)		 20,510
(1.39 %)		 n/a 41.75
(97.85 %)		 42,499
(2.16 %)		 10,948
(100.00 %)		 5,035,745
(43.29 %)		 907,329
(1.61 %)		 13,590,905
(33.57 %)		 69,090
(2.29 %)
360 Jamaican fruit-eating bat (1a 2020 Wuhan U)
GCF_014825515.1		 48,705
(2.72 %)		 19,921
(1.66 %)		 23,614
(1.68 %)		 39,384
(2.12 %)		 41.95
(98.87 %)		 110,840
(1.13 %)		 56,740
(100.00 %)		 2,972,388
(28.79 %)		 405,474
(2.15 %)		 12,458,880
(30.65 %)		 61,973
(1.87 %)
361 Jamaican fruit-eating bat (2021)
GCF_021234435.1		 55,114
(3.18 %)		 17,875
(1.68 %)		 19,958
(1.66 %)		 n/a 42.00
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 868
(100.00 %)		 2,697,287
(28.17 %)		 318,700
(0.84 %)		 11,750,329
(31.61 %)		 61,951
(1.93 %)
362 Japanese wild mouse (2022)
GCA_921999095.2		 n/a 23,292
(2.05 %)		 20,114
(1.31 %)		 n/a 41.71
(100.00 %)		 397
(0.00 %)		 1,449
(100.00 %)		 4,952,306
(42.53 %)		 1,635,456
(4.60 %)		 12,838,321
(38.56 %)		 24,168
(0.56 %)
363 Java mouse-deer (US108 2019 Broad)
GCA_004024965.1		 n/a 23,081
(1.38 %)		 38,181
(1.41 %)		 n/a 42.73
(99.91 %)		 2,829
(0.01 %)		 1,159,819
(99.99 %)		 4,791,310
(34.97 %)		 448,498
(1.92 %)		 13,175,375
(39.89 %)		 68,778
(2.92 %)
364 killer whale (2022)
GCF_937001465.1		 78,470
(3.76 %)		 18,710
(1.51 %)		 21,101
(1.30 %)		 34,448
(1.49 %)		 41.91
(100.00 %)		 123
(0.00 %)		 448
(100.00 %)		 3,955,401
(36.81 %)		 844,672
(9.94 %)		 12,233,568
(41.63 %)		 77,307
(3.08 %)
365 killer whale (alternate hap 2022)
GCA_937001455.1		 n/a 14,982
(1.50 %)		 19,185
(1.30 %)		 n/a 42.13
(100.00 %)		 n/a 12,410
(100.00 %)		 2,752,892
(35.61 %)		 589,217
(10.15 %)		 8,371,032
(41.11 %)		 57,347
(3.41 %)
366 killer whale (Morgan 2013)
GCF_000331955.2		 70,972
(3.55 %)		 18,736
(1.86 %)		 20,365
(1.48 %)		 n/a 41.35
(94.82 %)		 78,441
(5.20 %)		 80,100
(94.80 %)		 3,978,339
(43.98 %)		 555,737
(1.13 %)		 12,773,973
(31.51 %)		 61,145
(1.59 %)
367 koala (Bilbo 61053 2022)
GCA_003287225.2		 n/a 17,087
(0.81 %)		 14,711
(0.86 %)		 n/a 39.05
(100.00 %)		 669
(0.00 %)		 1,246
(100.00 %)		 6,280,029
(29.77 %)		 1,123,294
(2.02 %)		 21,796,316
(39.24 %)		 15,957
(0.35 %)
368 Kuhl's pipistrelle (2020)
GCF_014108245.1		 63,293
(2.96 %)		 17,918
(1.89 %)		 20,819
(1.86 %)		 n/a 42.57
(99.31 %)		 394
(0.69 %)		 202
(100.00 %)		 2,897,422
(23.58 %)		 797,420
(2.76 %)		 10,057,100
(34.56 %)		 55,965
(2.99 %)
369 large flying fox
GCF_000151845.1		 52,243
(3.10 %)		 18,454
(1.91 %)		 23,631
(1.73 %)		 n/a 39.82
(91.80 %)		 189,340
(8.24 %)		 225,433
(91.76 %)		 3,117,045
(36.49 %)		 504,277
(3.03 %)		 13,025,556
(25.00 %)		 78,404
(3.24 %)
370 large Japanese field mouse (IB14-021 2017)
GCA_002335545.1		 n/a 22,630
(1.74 %)		 33,810
(1.26 %)		 n/a 42.04
(57.78 %)		 4,289,924
(42.35 %)		 4,626,044
(57.65 %)		 3,638,537
(31.76 %)		 1,048,253
(1.87 %)		 12,039,926
(16.61 %)		 19,817
(0.34 %)
371 large tree shrew (BS70 2022)
GCA_026018925.1		 n/a 21,678
(1.34 %)		 22,317
(1.25 %)		 n/a 42.17
(100.00 %)		 1,188
(0.00 %)		 1,198
(100.00 %)		 5,530,547
(22.20 %)		 1,357,640
(10.13 %)		 14,334,312
(46.09 %)		 123,453
(2.17 %)
372 least weasel (hap1.1 2025)
GCA_964662115.1		 n/a 19,085
(1.11 %)		 23,074
(1.09 %)		 n/a 43.54
(99.98 %)		 2,938
(0.02 %)		 3,189
(100.00 %)		 4,687,333
(25.05 %)		 908,610
(10.98 %)		 12,922,050
(49.64 %)		 68,749
(2.22 %)
373 least weasel (hap2.1 2025)
GCA_964662095.1		 n/a 18,255
(1.29 %)		 22,201
(1.27 %)		 n/a 42.68
(99.98 %)		 2,709
(0.02 %)		 4,948
(99.98 %)		 4,268,233
(27.47 %)		 787,850
(6.40 %)		 12,592,088
(42.54 %)		 62,416
(2.34 %)
374 leopard (Hobbes primary hap 2022)
GCF_024362965.1		 70,488
(3.29 %)		 18,472
(1.56 %)		 20,388
(1.41 %)		 n/a 41.75
(99.99 %)		 335
(0.01 %)		 382
(100.00 %)		 4,634,038
(33.80 %)		 932,991
(2.25 %)		 13,686,652
(34.03 %)		 65,793
(2.64 %)
375 leopard (Maewha 2016 refseq)
GCF_001857705.1		 73,266
(3.20 %)		 18,881
(1.63 %)		 21,010
(1.44 %)		 n/a 41.71
(96.17 %)		 214,953
(3.85 %)		 265,330
(96.15 %)		 5,247,029
(42.87 %)		 1,059,446
(5.13 %)		 14,265,573
(32.20 %)		 77,001
(2.45 %)
376 leopard cat
GCF_016509475.1		 59,965
(3.05 %)		 18,472
(1.65 %)		 19,934
(1.38 %)		 n/a 41.80
(100.00 %)		 56
(0.00 %)		 123
(100.00 %)		 4,978,115
(43.28 %)		 901,754
(1.84 %)		 13,596,535
(34.23 %)		 67,390
(2.50 %)
377 Leschenault's rousette (2020)
GCA_015472975.1		 n/a 17,815
(2.05 %)		 23,917
(1.90 %)		 n/a 40.13
(99.14 %)		 100,669
(0.88 %)		 108,810
(99.12 %)		 2,688,705
(31.20 %)		 428,968
(1.19 %)		 12,245,385
(26.51 %)		 58,118
(6.81 %)
378 lesser Egyptian jerboa (2021)
GCF_020740685.1		 51,730
(1.99 %)		 20,129
(1.24 %)		 22,089
(1.24 %)		 40,414
(1.76 %)		 42.00
(99.52 %)		 561
(0.48 %)		 160
(100.00 %)		 7,346,291
(41.25 %)		 1,187,587
(2.92 %)		 14,222,177
(44.13 %)		 34,688
(0.86 %)
379 lesser Egyptian jerboa (alternate hap 2021)
GCA_020740715.1		 n/a 17,777
(1.27 %)		 19,232
(1.28 %)		 n/a 42.13
(92.75 %)		 2,875
(7.25 %)		 508
(100.00 %)		 6,476,967
(33.93 %)		 999,133
(2.78 %)		 11,809,834
(40.52 %)		 29,872
(0.82 %)
380 lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 refseq)
GCF_000280705.1		 25,991
(1.44 %)		 19,408
(1.38 %)		 20,312
(1.35 %)		 n/a 41.87
(87.17 %)		 326,464
(12.87 %)		 337,360
(87.13 %)		 6,125,934
(38.31 %)		 832,825
(1.53 %)		 13,661,612
(33.98 %)		 26,669
(0.59 %)
381 lesser false vampire bat (Vietnam 20211001_DDb primary hap 2024)
GCA_043880595.1		 n/a 18,484
(1.87 %)		 24,356
(1.84 %)		 n/a 41.88
(97.91 %)		 866
(2.09 %)		 617
(99.68 %)		 3,419,622
(36.65 %)		 663,182
(2.53 %)		 11,508,574
(30.58 %)		 84,174
(4.85 %)
382 lesser horseshoe bat (hap1 2024)
GCA_964194185.1		 n/a 19,031
(1.88 %)		 21,003
(1.63 %)		 n/a 40.81
(99.99 %)		 1,627
(0.01 %)		 723
(100.00 %)		 3,133,745
(33.46 %)		 660,064
(3.79 %)		 11,720,176
(32.32 %)		 35,414
(1.75 %)
383 lesser horseshoe bat (hap2 2024)
GCA_964194215.1		 n/a 18,875
(1.72 %)		 21,166
(1.58 %)		 n/a 41.18
(99.99 %)		 1,648
(0.01 %)		 2,727
(99.99 %)		 3,160,659
(34.00 %)		 696,130
(6.23 %)		 11,662,645
(34.26 %)		 36,176
(1.80 %)
384 lesser noctule (v2 hap1 2025)
GCA_964264875.2		 n/a 18,342
(1.54 %)		 22,974
(1.62 %)		 n/a 43.04
(100.00 %)		 302
(0.00 %)		 588
(100.00 %)		 4,258,096
(37.31 %)		 1,289,911
(11.51 %)		 9,694,758
(42.52 %)		 65,974
(2.80 %)
385 lesser noctule (v2 hap2 2025)
GCA_964264895.2		 n/a 17,492
(1.62 %)		 22,188
(1.72 %)		 n/a 43.10
(100.00 %)		 247
(0.00 %)		 920
(100.00 %)		 3,886,341
(36.52 %)		 1,139,308
(10.89 %)		 9,356,457
(40.65 %)		 62,254
(3.00 %)
386 lesser panda (RP43 2017)
GCA_002007465.1		 n/a 19,120
(1.69 %)		 20,591
(1.50 %)		 n/a 41.60
(98.56 %)		 137,333
(1.45 %)		 148,922
(98.55 %)		 4,513,888
(40.87 %)		 692,778
(1.62 %)		 13,691,859
(31.36 %)		 64,369
(2.52 %)
387 lesser sac-winged bat (primary hap 2024 refseq)
GCF_036850995.1		 53,210
(2.49 %)		 18,323
(1.42 %)		 21,350
(1.39 %)		 n/a 41.84
(99.24 %)		 573
(0.76 %)		 168
(100.00 %)		 4,224,344
(28.69 %)		 1,030,576
(2.60 %)		 12,591,989
(42.30 %)		 98,189
(2.06 %)
388 lion
GCF_018350215.1		 67,745
(2.86 %)		 17,956
(1.69 %)		 19,033
(1.40 %)		 61,242
(3.04 %)		 41.71
(100.00 %)		 55
(0.00 %)		 99
(100.00 %)		 4,666,951
(42.23 %)		 889,987
(1.87 %)		 13,151,686
(33.40 %)		 62,675
(2.56 %)
389 little brown bat
GCF_000147115.1		 50,660
(2.76 %)		 19,314
(1.86 %)		 22,683
(1.70 %)		 n/a 42.50
(96.66 %)		 61,131
(3.35 %)		 72,785
(96.65 %)		 3,682,263
(37.05 %)		 634,854
(2.15 %)		 10,841,759
(33.45 %)		 57,630
(1.79 %)
390 little pocket mouse (longimembris alternate hap 2022)
GCA_024363435.1		 n/a 19,150
(1.52 %)		 23,435
(1.64 %)		 n/a 42.08
(100.00 %)		 229
(0.00 %)		 718
(100.00 %)		 n/a 1,051,300
(12.43 %)		 9,858,628
(43.20 %)		 48,101
(2.62 %)
391 little pocket mouse (longimembris primary hap 2022)
GCA_024363575.1		 n/a 19,760
(1.50 %)		 24,317
(1.63 %)		 n/a 42.09
(100.00 %)		 215
(0.00 %)		 1,135
(100.00 %)		 3,913,744
(28.43 %)		 1,095,577
(12.70 %)		 10,273,833
(43.74 %)		 49,636
(2.61 %)
392 little tube-nosed bat
GCA_004026665.1		 n/a 22,009
(1.26 %)		 45,725
(1.35 %)		 n/a 43.80
(99.90 %)		 6,795
(0.03 %)		 886,972
(99.97 %)		 3,372,804
(23.57 %)		 1,014,476
(3.00 %)		 11,948,592
(41.18 %)		 71,530
(2.05 %)
393 long-finned pilot whale (v2 primary hap 2024 refseq)
GCF_963455315.2		 61,447
(2.80 %)		 18,725
(1.51 %)		 20,946
(1.39 %)		 n/a 42.38
(99.99 %)		 1,084
(0.01 %)		 2,076
(99.99 %)		 4,125,452
(35.62 %)		 1,577,896
(12.03 %)		 12,347,170
(42.01 %)		 71,822
(5.51 %)
394 long-finned pilot whale (X-22926-18 2019)
GCF_006547405.1		 66,104
(3.28 %)		 18,772
(1.80 %)		 21,031
(1.46 %)		 33,672
(1.78 %)		 41.29
(99.58 %)		 14,859
(0.42 %)		 20,999
(99.58 %)		 3,962,125
(45.58 %)		 557,247
(1.11 %)		 12,616,535
(34.70 %)		 62,905
(1.69 %)
395 long-tailed chinchilla
GCF_000276665.1		 54,841
(2.98 %)		 18,096
(1.59 %)		 19,514
(1.52 %)		 n/a 41.06
(95.56 %)		 78,817
(4.46 %)		 81,656
(95.54 %)		 4,018,866
(30.94 %)		 607,082
(1.15 %)		 13,528,234
(28.15 %)		 46,931
(1.25 %)
396 long-tongued fruit bat (US102 2019 Broad)
GCA_004027375.1		 n/a 19,208
(1.99 %)		 31,180
(1.92 %)		 n/a 39.56
(99.97 %)		 2,056
(0.01 %)		 174,041
(99.99 %)		 2,893,453
(32.61 %)		 597,516
(1.76 %)		 12,093,608
(28.14 %)		 63,015
(4.70 %)
397 Lowland paca
GCA_004365215.1		 n/a 21,953
(0.62 %)		 56,356
(0.80 %)		 n/a 40.83
(99.78 %)		 3,060
(0.01 %)		 3,771,510
(99.99 %)		 5,892,507
(29.20 %)		 802,811
(1.38 %)		 18,630,883
(38.61 %)		 61,715
(0.94 %)
398 Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 refseq)
GCF_001685135.1		 48,591
(2.76 %)		 19,458
(1.57 %)		 24,783
(1.38 %)		 41,272
(1.95 %)		 40.78
(92.27 %)		 984,658
(7.81 %)		 80,670
(100.00 %)		 3,064,599
(35.21 %)		 866,309
(3.08 %)		 13,310,859
(28.76 %)		 35,558
(0.84 %)
399 Malayan pangolin YNU ManJav 2.0
GCF_014570535.1		 68,043
(3.50 %)		 18,167
(1.72 %)		 20,453
(1.54 %)		 n/a 40.83
(91.78 %)		 57,746
(8.23 %)		 17,969
(100.00 %)		 2,864,567
(34.23 %)		 277,996
(1.69 %)		 12,659,207
(25.72 %)		 33,486
(1.00 %)
400 marsupial mole (Waite Creek area ABTC07570 2025)
GCA_048126345.1		 n/a 25,281
(0.80 %)		 18,740
(0.87 %)		 n/a 37.80
(99.99 %)		 196
(0.01 %)		 889
(99.99 %)		 6,538,990
(26.08 %)		 1,450,668
(2.40 %)		 21,374,371
(47.19 %)		 17,923
(0.30 %)
401 Masai giraffe (MA1 2016 Penn St)
GCA_001651235.1		 n/a 20,950
(1.52 %)		 28,854
(1.33 %)		 n/a 41.39
(96.50 %)		 257,672
(3.48 %)		 770,838
(96.52 %)		 5,502,479
(43.94 %)		 531,418
(2.64 %)		 13,936,018
(36.18 %)		 40,504
(1.02 %)
402 meadow jumping mouse
GCA_004024765.1		 n/a 22,236
(1.08 %)		 44,719
(1.21 %)		 n/a 42.31
(99.88 %)		 7,610
(0.03 %)		 1,165,710
(99.97 %)		 6,135,446
(33.31 %)		 1,525,146
(3.34 %)		 13,854,475
(39.91 %)		 26,633
(0.68 %)
403 meadow vole (hap1 2024)
GCA_037038515.1		 n/a 19,134
(1.78 %)		 20,672
(1.55 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 60
(0.00 %)		 181
(100.00 %)		 4,818,689
(41.90 %)		 962,362
(4.16 %)		 12,161,222
(34.42 %)		 23,781
(0.74 %)
404 meadow vole (hap2 2024)
GCA_037039175.1		 n/a 19,001
(1.82 %)		 20,271
(1.68 %)		 n/a 42.58
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 143
(100.00 %)		 3,141,368
(21.37 %)		 898,900
(4.24 %)		 11,475,531
(32.14 %)		 22,186
(0.75 %)
405 meerkat (VVHF042 2019 DNA Zoo refseq)
GCF_006229205.1		 58,806
(2.67 %)		 19,009
(1.64 %)		 19,088
(1.36 %)		 n/a 41.68
(99.72 %)		 65,245
(0.28 %)		 63,791
(100.00 %)		 4,564,931
(40.13 %)		 634,179
(1.21 %)		 13,631,635
(32.17 %)		 64,858
(2.22 %)
406 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 alternate hap 2022)
GCA_024711525.1		 n/a 18,555
(1.22 %)		 24,508
(1.35 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 181
(0.00 %)		 3,482
(100.00 %)		 6,419,007
(53.84 %)		 1,384,128
(15.63 %)		 11,486,822
(50.51 %)		 38,521
(1.60 %)
407 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022)
GCA_024711535.1		 n/a 21,281
(1.16 %)		 28,592
(1.34 %)		 n/a 42.27
(100.00 %)		 182
(0.00 %)		 4,354
(100.00 %)		 4,378,955
(29.66 %)		 1,568,842
(17.75 %)		 12,889,786
(51.96 %)		 46,167
(1.71 %)
408 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022)
GCF_024711535.1		 68,331
(2.37 %)		 21,280
(1.16 %)		 28,582
(1.34 %)		 n/a 42.27
(100.00 %)		 182
(0.00 %)		 4,535
(100.00 %)		 4,378,949
(29.66 %)		 1,568,842
(17.75 %)		 12,889,725
(51.96 %)		 46,167
(1.71 %)
409 Merriam's long-tongued bat (hap1 2024)
GCA_039655065.1		 n/a 18,172
(1.67 %)		 20,736
(1.60 %)		 n/a 42.19
(100.00 %)		 47
(0.00 %)		 82
(100.00 %)		 2,998,913
(29.48 %)		 418,833
(1.07 %)		 11,783,716
(32.96 %)		 65,956
(4.38 %)
410 Merriam's long-tongued bat (hap2 2024)
GCA_039656995.1		 n/a 18,105
(1.68 %)		 20,751
(1.60 %)		 n/a 42.18
(100.00 %)		 45
(0.00 %)		 71
(100.00 %)		 2,994,788
(29.48 %)		 415,375
(1.07 %)		 11,752,432
(32.88 %)		 65,597
(4.38 %)
411 Mexican gray wolf (hap1 2025 refseq)
GCF_048164855.1		 112,768
(4.40 %)		 19,582
(1.52 %)		 20,911
(1.39 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 167
(0.00 %)		 249
(100.00 %)		 4,598,813
(31.70 %)		 1,102,136
(4.40 %)		 13,591,364
(35.18 %)		 53,470
(2.24 %)
412 Mexican gray wolf (hap2 2025)
GCA_048164845.1		 n/a 18,738
(1.56 %)		 19,759
(1.41 %)		 n/a 41.58
(100.00 %)		 124
(0.00 %)		 155
(100.00 %)		 4,265,479
(32.40 %)		 1,030,876
(4.11 %)		 12,818,772
(34.22 %)		 50,269
(2.22 %)
413 minke whale (2013 refseq)
GCF_000493695.1		 42,553
(2.38 %)		 19,159
(1.73 %)		 18,656
(1.42 %)		 n/a 40.94
(94.06 %)		 173,296
(5.96 %)		 184,072
(94.04 %)		 n/a 573,951
(1.48 %)		 13,504,347
(30.96 %)		 65,448
(1.38 %)
414 minke whale (alternate hap 2023)
GCA_950005055.1		 n/a 20,412
(1.46 %)		 27,421
(1.34 %)		 n/a 41.50
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 21,272
(100.00 %)		 3,811,435
(36.24 %)		 959,712
(10.27 %)		 12,159,896
(41.30 %)		 69,852
(1.62 %)
415 minke whale (primary hap 2023 refseq)
GCF_949987535.1		 61,711
(2.51 %)		 19,550
(1.49 %)		 21,499
(1.26 %)		 n/a 41.55
(99.99 %)		 1,177
(0.01 %)		 1,374
(100.00 %)		 4,006,927
(35.92 %)		 1,058,105
(12.08 %)		 12,708,103
(42.66 %)		 72,756
(1.59 %)
416 Mongolian gerbil (243 2017 Lucigen Corp.)
GCF_002204375.1		 40,346
(2.29 %)		 21,215
(1.83 %)		 24,305
(1.47 %)		 n/a 42.09
(95.23 %)		 91,601
(4.78 %)		 68,793
(100.00 %)		 4,821,343
(37.74 %)		 940,776
(1.82 %)		 13,848,274
(31.31 %)		 24,154
(0.74 %)
417 Mongolian gerbil (EAM2014 2019 BGI)
GCA_008131255.1		 n/a 19,952
(1.59 %)		 23,462
(1.36 %)		 n/a 41.98
(99.01 %)		 103,843
(0.97 %)		 412,933
(99.03 %)		 5,009,454
(0.00 %)		 1,042,929
(2.52 %)		 14,121,194
(34.63 %)		 26,044
(0.71 %)
418 Mongolian gerbil (TT.TT164.6M 2023)
GCF_030254825.1		 65,502
(2.97 %)		 19,045
(1.53 %)		 20,203
(1.29 %)		 n/a 41.87
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 193
(100.00 %)		 4,477,607
(37.21 %)		 1,124,432
(5.22 %)		 13,244,320
(39.20 %)		 25,300
(0.76 %)
419 monito del monte (mDroGli1 alternate hap 2021)
GCA_019395325.1		 n/a 16,419
(0.77 %)		 17,219
(0.89 %)		 n/a 39.03
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 9,959
(100.00 %)		 6,332,360
(29.69 %)		 1,065,454
(2.09 %)		 17,908,986
(42.25 %)		 13,856
(0.35 %)
420 monito del monte (primary hap 2021 refseq)
GCF_019393635.1		 47,034
(2.02 %)		 18,399
(0.80 %)		 15,519
(0.85 %)		 n/a 39.11
(99.91 %)		 260
(0.09 %)		 17
(100.00 %)		 9,107,968
(41.08 %)		 1,249,635
(2.12 %)		 21,135,324
(42.80 %)		 16,598
(0.36 %)
421 Montane guinea pig
GCA_004027695.1		 n/a 20,064
(1.06 %)		 31,321
(1.18 %)		 39,905
(1.42 %)		 40.09
(99.88 %)		 11,321
(0.04 %)		 1,379,500
(99.96 %)		 4,730,634
(30.02 %)		 1,583,664
(6.57 %)		 15,806,339
(40.40 %)		 37,371
(0.76 %)
422 moose/elk (2024)
GCA_964270355.1		 n/a 19,816
(1.60 %)		 22,341
(1.44 %)		 n/a 41.70
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 1,737
(100.00 %)		 3,099,775
(24.20 %)		 406,796
(2.52 %)		 13,117,056
(38.34 %)		 50,644
(1.33 %)
423 moose/elk (AALL_1980 2023)
GCA_015832495.2		 n/a 19,116
(1.66 %)		 21,184
(1.45 %)		 n/a 41.55
(95.50 %)		 71,769
(4.51 %)		 77,708
(95.49 %)		 3,026,678
(23.77 %)		 373,266
(0.91 %)		 13,167,376
(34.08 %)		 44,302
(1.21 %)
424 moose/elk (MIG12-28694850 2019)
GCA_007570765.1		 n/a 21,375
(1.65 %)		 26,769
(1.42 %)		 n/a 41.64
(92.66 %)		 83,831
(7.35 %)		 131,373
(92.65 %)		 5,022,053
(43.27 %)		 384,658
(1.22 %)		 13,422,381
(34.52 %)		 49,216
(1.18 %)
425 mountain beaver
GCA_004027875.1		 n/a 22,428
(1.10 %)		 38,670
(1.12 %)		 n/a 40.58
(99.89 %)		 7,253
(0.02 %)		 1,286,779
(99.98 %)		 5,859,004
(32.29 %)		 914,052
(2.37 %)		 16,249,666
(38.21 %)		 39,133
(0.76 %)
426 muskrat
GCA_004026605.1		 n/a 22,540
(1.52 %)		 32,136
(1.35 %)		 n/a 41.59
(99.93 %)		 6,243
(0.02 %)		 571,599
(99.98 %)		 4,437,736
(28.49 %)		 922,826
(2.38 %)		 13,945,732
(35.23 %)		 19,876
(0.50 %)
427 naked mole-rat (MEF-2018 2020)
GCA_014060925.1		 n/a 22,011
(1.30 %)		 21,392
(1.22 %)		 n/a 40.13
(95.11 %)		 139,535
(4.91 %)		 148,797
(95.09 %)		 4,885,102
(35.91 %)		 654,418
(1.90 %)		 16,401,315
(34.21 %)		 40,717
(0.98 %)
428 naked mole-rat (NMR 29 2012 refseq)
GCF_000247695.1		 74,574
(3.56 %)		 21,332
(1.74 %)		 20,861
(1.51 %)		 n/a 40.21
(88.43 %)		 110,424
(11.59 %)		 114,653
(88.41 %)		 4,179,991
(32.69 %)		 484,933
(0.92 %)		 13,672,561
(27.63 %)		 31,950
(0.88 %)
429 narwhal (Baffin Bay 2019)
GCF_005190385.1		 51,639
(2.71 %)		 18,741
(1.78 %)		 20,365
(1.40 %)		 33,148
(1.79 %)		 41.22
(99.52 %)		 18,323
(0.49 %)		 6,972
(100.00 %)		 4,011,742
(43.97 %)		 565,367
(1.22 %)		 12,720,018
(34.85 %)		 60,492
(1.58 %)
430 narwhal (Baffin Bay Population NGI 2022)
GCA_005190385.3		 n/a 18,681
(1.79 %)		 19,816
(1.40 %)		 n/a 41.26
(100.00 %)		 313
(0.00 %)		 101
(100.00 %)		 3,618,235
(37.24 %)		 612,229
(1.52 %)		 12,641,632
(35.02 %)		 60,518
(1.78 %)
431 Natal long-fingered bat
GCF_001595765.1		 32,050
(3.03 %)		 18,015
(2.17 %)		 18,293
(1.87 %)		 n/a 42.07
(96.24 %)		 204,616
(3.79 %)		 1,269
(100.00 %)		 2,565,457
(28.95 %)		 376,532
(1.91 %)		 10,427,823
(26.35 %)		 63,261
(2.07 %)
432 Nathusius's pipistrelle (primary hap 2024)
GCA_963693515.1		 n/a 17,944
(1.86 %)		 20,545
(1.83 %)		 n/a 42.45
(100.00 %)		 263
(0.00 %)		 154
(100.00 %)		 3,628,328
(34.57 %)		 838,723
(4.04 %)		 10,155,601
(35.22 %)		 56,332
(2.92 %)
433 Nathusius's pipistrelle (hap1.1 2025)
GCA_964656225.1		 n/a 18,001
(1.75 %)		 21,219
(1.77 %)		 n/a 42.26
(99.98 %)		 1,836
(0.02 %)		 1,062
(100.00 %)		 3,664,854
(32.90 %)		 906,692
(8.55 %)		 10,164,440
(37.98 %)		 56,705
(2.75 %)
434 Nathusius's pipistrelle (hap2.1 2025)
GCA_964656075.1		 n/a 17,899
(1.71 %)		 20,808
(1.69 %)		 n/a 42.15
(99.98 %)		 1,832
(0.02 %)		 2,485
(99.98 %)		 3,637,576
(31.92 %)		 930,013
(11.25 %)		 9,967,930
(39.61 %)		 56,237
(2.62 %)
435 Natterer's bat (hap1.2 2025)
GCA_964212035.2		 n/a 19,475
(1.82 %)		 22,424
(1.68 %)		 n/a 43.15
(100.00 %)		 225
(0.00 %)		 212
(100.00 %)		 3,841,654
(38.99 %)		 801,041
(5.78 %)		 10,278,311
(38.66 %)		 64,639
(2.57 %)
436 Natterer's bat (hap2.2 2025)
GCA_964212025.2		 n/a 18,368
(1.91 %)		 21,701
(1.80 %)		 n/a 43.27
(100.00 %)		 136
(0.00 %)		 309
(100.00 %)		 3,509,151
(38.16 %)		 704,537
(5.21 %)		 9,806,703
(36.74 %)		 61,004
(2.65 %)
437 neotropical fruit bat
GCF_014824575.2		 49,109
(2.78 %)		 17,703
(1.63 %)		 19,389
(1.60 %)		 n/a 42.32
(99.79 %)		 38,675
(0.21 %)		 26,068
(100.00 %)		 2,862,405
(29.31 %)		 366,960
(1.48 %)		 11,796,203
(31.27 %)		 59,091
(1.70 %)
438 Nilgiri tahr
GCA_004026825.1		 n/a 22,735
(1.44 %)		 34,961
(1.27 %)		 n/a 42.37
(99.93 %)		 10,387
(0.04 %)		 479,550
(99.96 %)		 5,793,761
(48.50 %)		 535,297
(1.34 %)		 13,378,352
(42.46 %)		 57,653
(1.29 %)
439 nine-banded armadillo (v2 hap1 2023)
GCA_030445055.2		 n/a 19,350
(1.07 %)		 22,207
(1.07 %)		 n/a 40.97
(99.27 %)		 823
(0.73 %)		 588
(100.00 %)		 4,330,716
(32.85 %)		 661,966
(1.52 %)		 18,302,021
(42.22 %)		 130,245
(2.79 %)
440 nine-banded armadillo (v2 hap2 2023)
GCF_030445035.2		 72,174
(2.47 %)		 21,051
(1.11 %)		 24,418
(1.07 %)		 n/a 41.00
(99.67 %)		 793
(0.33 %)		 546
(100.00 %)		 5,412,063
(53.31 %)		 738,320
(2.02 %)		 19,755,423
(43.69 %)		 142,597
(2.85 %)
441 nine-banded armadillo (v3.2 3-136 2012 Baylor)
GCF_000208655.3		 46,110
(1.87 %)		 20,820
(1.08 %)		 25,226
(1.08 %)		 n/a 40.77
(90.89 %)		 268,437
(9.13 %)		 314,788
(90.87 %)		 4,552,770
(34.01 %)		 651,225
(1.26 %)		 19,266,969
(38.27 %)		 139,490
(2.47 %)
442 North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 alternate hap 2022)
GCA_026167925.1		 n/a 19,342
(1.57 %)		 20,947
(1.48 %)		 n/a 42.40
(100.00 %)		 229
(0.00 %)		 1,006
(100.00 %)		 4,161,568
(23.13 %)		 1,278,205
(8.22 %)		 13,148,019
(37.60 %)		 23,523
(0.71 %)
443 North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 primary hap 2022)
GCA_026229955.1		 n/a 19,700
(1.54 %)		 22,354
(1.46 %)		 n/a 42.19
(100.00 %)		 244
(0.00 %)		 2,082
(100.00 %)		 6,089,884
(47.99 %)		 1,358,786
(9.39 %)		 13,799,349
(39.08 %)		 24,733
(0.70 %)
444 North American porcupine (mEreDor1 alternate hap 2023)
GCA_028500835.1		 n/a 15,210
(1.55 %)		 18,316
(1.43 %)		 n/a 41.06
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,051
(100.00 %)		 3,911,633
(40.55 %)		 565,546
(1.54 %)		 10,853,726
(32.61 %)		 40,925
(1.35 %)
445 North American porcupine (mEreDor1 primary hap 2023)
GCA_028451465.1		 n/a 18,102
(1.58 %)		 20,073
(1.40 %)		 n/a 41.03
(100.00 %)		 277
(0.00 %)		 116
(100.00 %)		 4,958,089
(41.64 %)		 719,163
(1.59 %)		 13,867,662
(33.89 %)		 51,299
(1.36 %)
446 North Atlantic right whale (hap1 2023)
GCA_028571275.1		 n/a 18,699
(1.61 %)		 20,354
(1.28 %)		 n/a 41.64
(99.84 %)		 385
(0.16 %)		 947
(100.00 %)		 3,815,900
(43.46 %)		 718,935
(11.38 %)		 11,928,210
(42.25 %)		 85,881
(1.90 %)
447 North Atlantic right whale (hap2 + XY 2023 refseq)
GCF_028564815.1		 49,646
(1.86 %)		 19,562
(1.46 %)		 21,631
(1.25 %)		 n/a 41.69
(99.83 %)		 367
(0.17 %)		 789
(100.00 %)		 1,368,536
(2.24 %)		 841,303
(13.08 %)		 12,527,582
(43.92 %)		 94,259
(1.92 %)
448 North Pacific right whale
GCA_004363455.1		 n/a 23,145
(1.43 %)		 38,161
(1.21 %)		 n/a 41.15
(99.88 %)		 7,094
(0.03 %)		 1,361,057
(99.97 %)		 5,039,622
(45.69 %)		 694,986
(1.31 %)		 14,063,101
(40.51 %)		 74,800
(1.52 %)
449 northern American river otter
GCF_010015895.1		 53,945
(2.18 %)		 18,974
(1.68 %)		 21,247
(1.45 %)		 n/a 41.41
(99.58 %)		 7,620
(0.42 %)		 13,541
(99.58 %)		 4,538,847
(41.18 %)		 685,281
(1.20 %)		 13,840,953
(32.61 %)		 53,559
(1.88 %)
450 northern bat (alternate hap 2023)
GCA_951640545.1		 n/a 18,343
(1.80 %)		 23,253
(1.77 %)		 n/a 43.55
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 4,899
(100.00 %)		 1,174,241
(2.96 %)		 825,170
(5.11 %)		 9,889,579
(36.12 %)		 76,164
(3.52 %)
451 northern bat (primary hap 2023)
GCA_951640355.1		 n/a 18,636
(1.75 %)		 21,446
(1.68 %)		 n/a 43.32
(99.99 %)		 1,423
(0.01 %)		 207
(100.00 %)		 1,259,729
(2.95 %)		 905,676
(6.25 %)		 10,554,535
(38.21 %)		 77,656
(3.27 %)
452 northern black mastiff bat (mMolNig1 2022)
GCA_026936385.1		 n/a 18,924
(1.53 %)		 22,934
(1.58 %)		 n/a 42.38
(100.00 %)		 199
(0.00 %)		 146
(100.00 %)		 3,850,624
(31.21 %)		 648,359
(3.76 %)		 11,788,702
(39.25 %)		 85,908
(2.60 %)
453 northern black mastiff bat (mMolNig1hap1 2024)
GCA_039880945.1		 n/a 18,933
(1.44 %)		 23,629
(1.50 %)		 n/a 42.60
(100.00 %)		 113
(0.00 %)		 366
(100.00 %)		 4,027,155
(30.73 %)		 712,278
(5.22 %)		 12,003,034
(41.58 %)		 96,116
(3.02 %)
454 northern black mastiff bat (mMolNig1hap2 2024)
GCA_039880925.1		 n/a 18,305
(1.49 %)		 22,534
(1.56 %)		 n/a 42.75
(100.00 %)		 80
(0.00 %)		 282
(100.00 %)		 3,783,543
(30.10 %)		 656,592
(4.68 %)		 11,353,707
(40.26 %)		 92,041
(3.01 %)
455 northern bottlenose whale (alternate hap 2023)
GCA_949752845.1		 n/a 19,537
(1.44 %)		 27,826
(1.30 %)		 n/a 41.67
(100.00 %)		 n/a 23,401
(100.00 %)		 3,634,923
(35.56 %)		 672,860
(11.00 %)		 11,175,398
(41.72 %)		 62,007
(1.94 %)
456 northern bottlenose whale (primary hap 2023)
GCA_949752795.1		 n/a 19,073
(1.44 %)		 20,821
(1.21 %)		 n/a 41.81
(99.99 %)		 1,098
(0.01 %)		 757
(100.00 %)		 3,997,911
(34.76 %)		 769,275
(14.94 %)		 12,133,820
(44.83 %)		 67,258
(2.00 %)
457 northern elephant seal (BS05 2019 Broad)
GCA_004023865.1		 n/a 22,834
(1.54 %)		 36,083
(1.32 %)		 n/a 41.52
(99.94 %)		 9,483
(0.04 %)		 330,739
(99.96 %)		 4,849,944
(43.83 %)		 600,306
(1.16 %)		 13,420,049
(34.43 %)		 57,236
(1.62 %)
458 northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 genbank)
GCA_029215605.1		 n/a 19,278
(1.60 %)		 19,908
(1.39 %)		 n/a 41.84
(100.00 %)		 98
(0.00 %)		 596
(100.00 %)		 4,348,333
(34.40 %)		 621,985
(2.21 %)		 13,251,768
(35.32 %)		 69,898
(2.38 %)
459 Northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 refseq)
GCF_029215605.1		 74,106
(3.88 %)		 19,277
(1.60 %)		 20,000
(1.36 %)		 n/a 41.84
(100.00 %)		 98
(0.00 %)		 595
(100.00 %)		 4,348,327
(34.40 %)		 621,980
(2.21 %)		 13,251,706
(35.32 %)		 69,897
(2.38 %)
460 northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap2 2023)
GCA_029215635.1		 n/a 19,340
(1.59 %)		 19,732
(1.37 %)		 n/a 41.91
(100.00 %)		 60
(0.00 %)		 482
(100.00 %)		 4,365,070
(34.26 %)		 627,639
(2.43 %)		 13,174,494
(35.47 %)		 74,314
(2.49 %)
461 northern elephant seal (v3 JK_09032017 2022)
GCF_021288785.2		 53,819
(3.32 %)		 20,099
(1.75 %)		 20,957
(1.35 %)		 n/a 41.51
(99.35 %)		 39,936
(0.65 %)		 142,455
(100.00 %)		 4,368,400
(33.93 %)		 588,877
(1.19 %)		 13,745,426
(32.96 %)		 52,064
(1.59 %)
462 northern fur seal
GCF_003265705.1		 54,940
(2.43 %)		 23,408
(1.78 %)		 23,666
(1.43 %)		 52,089
(2.17 %)		 41.48
(98.01 %)		 38,666
(1.99 %)		 52,469
(98.01 %)		 5,047,032
(43.38 %)		 638,130
(1.06 %)		 14,922,442
(33.12 %)		 57,281
(1.44 %)
463 northern gundi (US049 2019)
GCA_004027205.1		 n/a 18,035
(1.39 %)		 27,379
(1.57 %)		 n/a 42.68
(99.91 %)		 5,037
(0.02 %)		 865,110
(99.98 %)		 4,149,883
(27.83 %)		 654,063
(1.64 %)		 12,342,565
(33.72 %)		 47,533
(1.43 %)
464 northern gundi (hap1 2025)
GCA_048771875.1		 n/a 16,996
(1.51 %)		 21,787
(1.66 %)		 n/a 42.28
(100.00 %)		 117
(0.00 %)		 535
(100.00 %)		 3,293,772
(27.51 %)		 602,403
(3.02 %)		 11,827,700
(30.64 %)		 44,220
(1.55 %)
465 northern gundi (hap2 2025)
GCA_048771865.1		 n/a 17,037
(1.43 %)		 21,690
(1.55 %)		 n/a 42.88
(100.00 %)		 115
(0.00 %)		 1,031
(100.00 %)		 3,527,940
(26.81 %)		 646,620
(6.32 %)		 11,343,462
(34.09 %)		 47,125
(1.51 %)
466 northern mole vole
GCA_001685095.1		 n/a 23,252
(1.39 %)		 44,209
(1.25 %)		 n/a 41.68
(99.04 %)		 371,627
(0.98 %)		 722,087
(99.02 %)		 3,923,814
(25.79 %)		 898,453
(2.47 %)		 13,708,986
(29.04 %)		 16,583
(0.36 %)
467 northern white rhinoceros
GCA_004027795.1		 n/a 25,328
(1.34 %)		 61,003
(1.95 %)		 n/a 41.32
(99.90 %)		 7,054
(0.03 %)		 949,480
(99.97 %)		 4,330,882
(38.89 %)		 484,754
(1.12 %)		 15,544,248
(33.11 %)		 43,689
(2.08 %)
468 northern woolly horseshoe bat (20210929_DDc primary hap 2024)
GCA_043748575.1		 n/a 18,475
(1.82 %)		 19,990
(1.56 %)		 n/a 40.72
(100.00 %)		 63
(0.00 %)		 68
(100.00 %)		 3,507,612
(39.92 %)		 711,081
(2.15 %)		 11,788,205
(32.17 %)		 35,670
(1.25 %)
469 Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 genbank)
GCA_036323735.1		 114,725
(42.69 %)		 21,917
(1.75 %)		 19,476
(1.26 %)		 n/a 41.82
(99.86 %)		 220
(0.14 %)		 77
(100.00 %)		 4,700,726
(39.99 %)		 1,603,005
(5.45 %)		 13,451,813
(38.68 %)		 20,118
(0.44 %)
470 Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 refseq)
GCF_036323735.1		 114,725
(5.38 %)		 21,870
(1.74 %)		 19,989
(1.27 %)		 n/a 41.82
(99.86 %)		 220
(0.14 %)		 76
(100.00 %)		 5,294,185
(42.75 %)		 1,603,005
(5.45 %)		 13,451,760
(38.68 %)		 20,118
(0.44 %)
471 Norway rat (F344/Stm 2024)
GCA_041222355.1		 n/a 21,764
(1.78 %)		 20,141
(1.30 %)		 n/a 41.87
(99.96 %)		 234
(0.04 %)		 120
(100.00 %)		 4,636,987
(39.98 %)		 1,579,595
(5.22 %)		 13,544,768
(38.06 %)		 20,127
(0.46 %)
472 Norway rat BN7 haplotype
GCA_015244455.1		 n/a 3,096
(1.64 %)		 2,450
(1.02 %)		 n/a 41.23
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 3,156
(100.00 %)		 517,347
(50.76 %)		 157,701
(3.90 %)		 1,502,752
(34.14 %)		 1,806
(0.40 %)
473 Norway rat BN7.2
GCF_015227675.2		 99,139
(4.10 %)		 21,526
(1.86 %)		 19,266
(1.33 %)		 54,530
(2.79 %)		 41.99
(99.19 %)		 581
(0.81 %)		 757
(99.19 %)		 5,029,005
(45.44 %)		 1,514,974
(3.57 %)		 13,450,428
(35.83 %)		 19,244
(0.46 %)
474 Norway rat celera
GCF_000002265.2		 39,745
(2.91 %)		 21,492
(1.95 %)		 19,112
(1.38 %)		 n/a 41.98
(95.28 %)		 111,391
(4.74 %)		 118,423
(95.26 %)		 9,721,869
(43.57 %)		 1,387,703
(3.05 %)		 13,224,921
(32.45 %)		 18,944
(0.42 %)
475 Norway rat Rnor6.0
GCF_000001895.5		 69,456
(3.34 %)		 22,369
(1.83 %)		 20,269
(1.32 %)		 n/a 41.93
(95.13 %)		 145,731
(4.89 %)		 76,195
(95.16 %)		 5,329,187
(44.14 %)		 1,620,304
(3.72 %)		 14,520,050
(33.09 %)		 22,600
(0.47 %)
476 Norway rat SHR/Utx RGD_8142385 2022
GCA_023515785.1		 n/a 21,116
(1.68 %)		 20,103
(1.27 %)		 57,027
(2.45 %)		 41.85
(99.82 %)		 1,256
(0.18 %)		 2,151
(100.00 %)		 4,704,388
(38.22 %)		 1,611,144
(5.76 %)		 13,524,575
(38.35 %)		 20,720
(0.48 %)
477 Norway rat SHRSP/BppUtx 2022
GCA_021556685.1		 n/a 22,366
(1.71 %)		 20,531
(1.26 %)		 57,580
(2.44 %)		 41.86
(99.94 %)		 1,610
(0.06 %)		 2,734
(100.00 %)		 5,238,574
(46.36 %)		 1,638,412
(5.87 %)		 13,769,141
(38.49 %)		 21,006
(0.49 %)
478 Norway rat WKY/Bbb 2022
GCA_023515805.1		 n/a 21,607
(1.68 %)		 21,244
(1.28 %)		 58,136
(2.47 %)		 41.92
(99.80 %)		 1,456
(0.20 %)		 3,553
(100.00 %)		 4,811,412
(38.21 %)		 1,650,950
(5.41 %)		 13,740,644
(38.24 %)		 21,449
(0.51 %)
479 nutria
GCA_004027025.1		 n/a 24,707
(1.00 %)		 47,533
(1.18 %)		 n/a 41.70
(99.84 %)		 15,249
(0.05 %)		 1,684,916
(99.95 %)		 6,961,690
(30.09 %)		 1,698,977
(3.31 %)		 15,207,563
(42.57 %)		 59,854
(1.00 %)
480 okapi
GCA_001660835.1		 n/a 21,483
(1.43 %)		 31,061
(1.26 %)		 n/a 41.48
(95.11 %)		 376,008
(4.86 %)		 1,213,177
(95.14 %)		 5,808,036
(42.90 %)		 619,044
(4.22 %)		 14,940,153
(35.17 %)		 47,417
(1.12 %)
481 Ord's kangaroo rat
GCF_000151885.1		 30,625
(2.21 %)		 17,959
(1.54 %)		 19,318
(1.54 %)		 n/a 42.06
(92.36 %)		 83,035
(7.65 %)		 148,226
(92.35 %)		 4,337,455
(33.76 %)		 1,140,316
(7.60 %)		 10,422,685
(36.59 %)		 61,921
(3.56 %)
482 pacarana
GCA_004027595.1		 n/a 20,748
(1.20 %)		 33,195
(1.31 %)		 n/a 41.81
(99.90 %)		 6,392
(0.02 %)		 1,164,830
(99.98 %)		 4,374,443
(30.16 %)		 660,811
(1.38 %)		 14,062,133
(35.99 %)		 59,382
(1.23 %)
483 Pacific pocket mouse (BS65 2019 Broad)
GCA_004363475.1		 n/a 21,575
(1.07 %)		 47,478
(1.31 %)		 n/a 41.87
(99.76 %)		 18,801
(0.07 %)		 2,428,619
(99.93 %)		 4,881,232
(20.80 %)		 1,352,971
(4.11 %)		 12,583,960
(48.42 %)		 74,961
(2.33 %)
484 Pacific pocket mouse (PPM17 2022 San Diego Zoo)
GCF_023159225.1		 46,202
(2.48 %)		 18,752
(1.50 %)		 22,526
(1.60 %)		 n/a 41.98
(99.96 %)		 1,807
(0.04 %)		 6,180
(100.00 %)		 3,313,319
(16.79 %)		 1,066,382
(10.88 %)		 9,981,468
(42.63 %)		 49,134
(2.83 %)
485 Pacific walrus
GCF_000321225.1		 27,163
(1.89 %)		 20,293
(1.71 %)		 20,982
(1.48 %)		 n/a 41.36
(95.85 %)		 66,766
(4.16 %)		 70,656
(95.84 %)		 4,372,578
(41.12 %)		 511,500
(1.05 %)		 13,507,582
(30.43 %)		 45,142
(1.29 %)
486 Pacific white-sided dolphin
GCF_003676395.1		 65,947
(3.26 %)		 18,743
(1.79 %)		 20,862
(1.45 %)		 31,917
(1.69 %)		 41.28
(99.56 %)		 16,699
(0.44 %)		 21,350
(99.56 %)		 3,971,820
(45.64 %)		 574,056
(1.14 %)		 12,602,965
(34.83 %)		 62,275
(1.67 %)
487 pale spear-nosed bat (alternate hap MPI-MPIP 2019)
GCA_004115245.1		 n/a 18,118
(1.63 %)		 23,536
(1.65 %)		 n/a 42.48
(100.00 %)		 38
(0.00 %)		 10,873
(100.00 %)		 3,001,130
(29.46 %)		 375,042
(0.79 %)		 11,813,971
(29.64 %)		 67,712
(4.23 %)
488 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 alternate hap 2020)
GCA_004115245.2		 n/a 18,116
(1.63 %)		 23,608
(1.65 %)		 n/a 42.48
(100.00 %)		 38
(0.00 %)		 10,895
(100.00 %)		 3,002,448
(29.46 %)		 375,226
(0.79 %)		 11,824,034
(29.65 %)		 67,718
(4.23 %)
489 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 primary hap 2020)
GCF_004126475.2		 54,932
(3.31 %)		 18,171
(1.69 %)		 20,025
(1.62 %)		 42,786
(3.39 %)		 42.38
(99.28 %)		 884
(0.72 %)		 77
(100.00 %)		 3,069,141
(30.00 %)		 385,664
(0.81 %)		 12,050,232
(30.57 %)		 63,905
(3.75 %)
490 Pallas's mastiff bat
GCF_014108415.1		 48,421
(2.20 %)		 18,667
(1.61 %)		 21,915
(1.59 %)		 n/a 42.35
(97.95 %)		 349
(2.05 %)		 60
(100.00 %)		 3,863,217
(32.76 %)		 624,933
(1.88 %)		 11,572,319
(37.09 %)		 79,984
(2.45 %)
491 pallid bat (TK200870 primary hap 2023)
GCA_027563665.1		 n/a 19,688
(1.69 %)		 21,998
(1.64 %)		 n/a 43.04
(99.72 %)		 234
(0.28 %)		 112
(99.99 %)		 2,794,986
(22.60 %)		 938,016
(3.72 %)		 11,241,518
(39.41 %)		 70,272
(2.89 %)
492 Parnell's mustached bat (2013)
GCA_000465405.1		 n/a 21,436
(1.40 %)		 57,232
(2.18 %)		 n/a 40.82
(99.34 %)		 265,720
(0.70 %)		 443,121
(99.30 %)		 2,780,805
(29.26 %)		 290,520
(0.63 %)		 12,354,814
(27.13 %)		 69,806
(1.89 %)
493 Parnell's mustached bat (Mesoamerican 2021)
GCF_021234165.1		 37,033
(2.48 %)		 18,339
(1.76 %)		 21,630
(1.69 %)		 n/a 41.32
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 333
(100.00 %)		 2,828,339
(30.56 %)		 333,670
(0.75 %)		 12,444,271
(30.90 %)		 53,180
(4.61 %)
494 particolored bat (primary hap 2024)
GCA_963924515.1		 n/a 17,913
(1.72 %)		 20,720
(1.72 %)		 n/a 43.54
(99.99 %)		 980
(0.01 %)		 185
(100.00 %)		 2,932,869
(21.94 %)		 874,665
(4.83 %)		 10,263,103
(37.46 %)		 77,397
(4.55 %)
495 Patagonian cavy
GCA_004027295.1		 n/a 21,143
(0.94 %)		 40,887
(1.10 %)		 n/a 39.86
(99.87 %)		 6,223
(0.02 %)		 1,911,987
(99.98 %)		 5,194,890
(30.95 %)		 892,551
(2.11 %)		 17,052,577
(40.22 %)		 45,730
(0.84 %)
496 Pere David's deer
GCA_002443075.1		 n/a 20,723
(1.65 %)		 23,551
(1.43 %)		 n/a 41.58
(97.49 %)		 144,642
(2.51 %)		 339,454
(97.49 %)		 5,171,293
(43.30 %)		 427,987
(1.20 %)		 13,665,133
(35.97 %)		 48,374
(1.14 %)
497 Philippine flying lemur (mCynVol1 alternate hap 2022)
GCA_027409165.1		 n/a 18,794
(1.72 %)		 21,421
(1.40 %)		 n/a 40.18
(100.00 %)		 n/a 1,750
(100.00 %)		 4,001,442
(39.37 %)		 547,894
(2.75 %)		 13,870,563
(34.33 %)		 40,162
(1.31 %)
498 Philippine flying lemur (primary hap 2022 genbank)
GCA_027409185.1		 n/a 20,384
(1.64 %)		 22,124
(1.29 %)		 n/a 40.24
(100.00 %)		 116
(0.00 %)		 131
(100.00 %)		 4,492,423
(39.31 %)		 627,842
(4.79 %)		 15,561,515
(36.57 %)		 45,336
(1.27 %)
499 Philippine flying lemur (primary hap 2022 refseq)
GCF_027409185.1		 44,950
(1.91 %)		 20,385
(1.64 %)		 22,123
(1.29 %)		 n/a 40.24
(100.00 %)		 116
(0.00 %)		 130
(100.00 %)		 4,492,417
(39.31 %)		 627,841
(4.79 %)		 15,561,458
(36.57 %)		 45,336
(1.27 %)
500 pig (Bamei 2023)
GCA_030704935.1		 n/a 18,472
(1.44 %)		 19,911
(1.28 %)		 n/a 42.63
(99.98 %)		 878
(0.02 %)		 379
(100.00 %)		 3,996,827
(27.97 %)		 2,094,728
(7.23 %)		 12,677,118
(40.57 %)		 81,791
(2.82 %)
501 pig (Duroc 2017)
GCF_000003025.6		 77,695
(4.05 %)		 18,980
(1.64 %)		 19,453
(1.32 %)		 59,876
(4.84 %)		 41.87
(98.81 %)		 544
(1.19 %)		 1,313
(98.81 %)		 5,021,184
(45.67 %)		 710,994
(1.32 %)		 13,243,289
(36.33 %)		 79,132
(1.82 %)
502 pig (Norwegian landrace 2024)
GCA_963921485.1		 n/a 18,500
(1.46 %)		 19,718
(1.29 %)		 n/a 42.45
(100.00 %)		 n/a 54
(100.00 %)		 4,068,783
(28.54 %)		 1,511,605
(5.52 %)		 12,867,101
(39.59 %)		 82,002
(2.44 %)
503 pig (USMARCv1 2017)
GCA_002844635.1		 n/a 19,458
(1.54 %)		 21,487
(1.27 %)		 58,655
(2.58 %)		 42.49
(95.20 %)		 661
(4.80 %)		 14,157
(100.00 %)		 5,159,244
(47.53 %)		 902,079
(3.63 %)		 13,145,120
(36.86 %)		 82,442
(2.62 %)
504 pig (Wuzhishan WZS1 2025)
GCA_048338725.1		 n/a 18,525
(1.46 %)		 19,792
(1.29 %)		 n/a 42.55
(100.00 %)		 n/a 20
(100.00 %)		 4,084,482
(28.40 %)		 1,424,314
(5.35 %)		 12,927,595
(39.56 %)		 81,967
(2.96 %)
505 plains zebra (Etosha38 2022 UCLA)
GCF_021613505.1		 55,779
(2.87 %)		 19,529
(1.76 %)		 21,214
(1.39 %)		 n/a 41.38
(99.04 %)		 14,595
(0.96 %)		 11,098
(100.00 %)		 3,683,862
(38.74 %)		 314,723
(0.68 %)		 15,217,328
(29.38 %)		 41,391
(1.27 %)
506 platypus (alternate hap Pmale09 2020)
GCA_004115175.2		 n/a 13,244
(1.26 %)		 19,241
(1.68 %)		 n/a 46.27
(100.00 %)		 25
(0.00 %)		 5,868
(100.00 %)		 4,420,884
(51.59 %)		 513,006
(3.13 %)		 7,749,797
(49.18 %)		 81,538
(8.24 %)
507 platypus (Pmale09 v4 2020)
GCF_004115215.2		 51,392
(3.07 %)		 14,778
(1.26 %)		 18,888
(1.63 %)		 n/a 46.14
(99.18 %)		 515
(0.82 %)		 322
(100.00 %)		 5,071,089
(51.34 %)		 578,614
(2.89 %)		 9,113,848
(48.93 %)		 87,796
(6.47 %)
508 polar bear (Baiyulong BGI 2014 refseq)
GCF_000687225.1		 35,764
(2.39 %)		 18,466
(1.69 %)		 15,384
(1.38 %)		 n/a 41.65
(98.35 %)		 110,343
(1.67 %)		 134,162
(98.33 %)		 4,123,540
(40.16 %)		 553,196
(1.29 %)		 13,765,581
(29.91 %)		 54,907
(1.17 %)
509 polar bear (UCSC 2021)
GCF_017311325.1		 52,188
(2.92 %)		 18,588
(1.75 %)		 20,731
(1.54 %)		 n/a 41.88
(99.60 %)		 45,532
(0.41 %)		 3,900
(100.00 %)		 4,204,162
(40.75 %)		 572,129
(1.75 %)		 13,926,894
(30.79 %)		 63,315
(1.93 %)
510 prairie deer mouse (Baylor 2013)
GCF_000500345.1		 50,187
(2.51 %)		 20,427
(1.69 %)		 20,874
(1.45 %)		 n/a 42.34
(94.06 %)		 182,263
(5.97 %)		 212,962
(94.03 %)		 n/a 1,229,123
(2.83 %)		 14,447,916
(30.09 %)		 23,246
(0.56 %)
511 prairie deer mouse (Harvard 2020)
GCF_003704035.1		 69,779
(3.28 %)		 19,755
(1.73 %)		 19,194
(1.43 %)		 n/a 42.28
(95.07 %)		 147,442
(4.96 %)		 155,966
(95.04 %)		 4,751,621
(29.04 %)		 1,172,212
(2.66 %)		 13,934,672
(29.87 %)		 22,444
(0.57 %)
512 prairie vole
GCF_000317375.1		 40,484
(2.72 %)		 19,648
(1.91 %)		 19,489
(1.62 %)		 n/a 42.25
(92.03 %)		 180,677
(8.00 %)		 187,012
(92.00 %)		 3,779,126
(25.51 %)		 879,192
(2.11 %)		 12,360,347
(27.34 %)		 18,233
(0.52 %)
513 proboscis bat (hap1 2024)
GCA_037038545.1		 n/a 17,919
(1.46 %)		 19,330
(1.31 %)		 n/a 40.78
(100.00 %)		 68
(0.00 %)		 41
(100.00 %)		 3,707,234
(28.28 %)		 643,817
(2.22 %)		 12,106,384
(41.48 %)		 54,438
(1.38 %)
514 proboscis bat (hap2 2024)
GCA_037038555.1		 n/a 17,253
(1.51 %)		 18,507
(1.35 %)		 n/a 40.91
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 38
(100.00 %)		 3,466,835
(27.96 %)		 585,261
(1.91 %)		 11,364,898
(40.65 %)		 50,527
(1.37 %)
515 pronghorn (PH2016 2021)
GCA_021018645.1		 n/a 21,848
(1.58 %)		 27,614
(1.56 %)		 n/a 41.70
(96.83 %)		 74,027
(3.17 %)		 140,480
(96.83 %)		 3,335,744
(24.40 %)		 405,435
(4.11 %)		 13,855,606
(34.67 %)		 48,670
(1.19 %)
516 Przewalski's horse (Burgud 2014 refseq)
GCF_000696695.1		 45,076
(2.76 %)		 19,546
(1.69 %)		 22,107
(1.36 %)		 n/a 41.27
(99.13 %)		 80,963
(0.88 %)		 134,060
(99.12 %)		 3,787,533
(40.54 %)		 435,607
(1.73 %)		 14,738,418
(28.36 %)		 40,752
(0.94 %)
517 Przewalski's horse (Varuska primary hap 2024)
GCF_037783145.1		 117,131
(4.09 %)		 18,569
(1.70 %)		 20,018
(1.38 %)		 n/a 42.23
(100.00 %)		 310
(0.00 %)		 2,146
(100.00 %)		 3,768,149
(39.86 %)		 632,308
(5.35 %)		 14,449,518
(32.71 %)		 42,166
(4.46 %)
518 puma (L17-30 alternate hap 2023)
GCA_028749965.1		 n/a 18,380
(1.53 %)		 20,701
(1.40 %)		 n/a 41.91
(100.00 %)		 96
(0.00 %)		 304
(100.00 %)		 4,881,674
(33.96 %)		 978,817
(2.17 %)		 13,422,986
(35.08 %)		 69,437
(2.62 %)
519 puma (L17-30 primary hap 2023)
GCA_028749985.1		 n/a 17,553
(1.53 %)		 19,299
(1.39 %)		 n/a 41.89
(100.00 %)		 134
(0.00 %)		 390
(100.00 %)		 4,629,539
(33.53 %)		 919,008
(2.02 %)		 12,766,157
(34.70 %)		 65,437
(2.53 %)
520 puma (SC36_Marlon 2018 refseq)
GCF_003327715.1		 25,575
(1.43 %)		 17,664
(1.57 %)		 16,565
(1.29 %)		 n/a 41.36
(95.34 %)		 178,992
(4.69 %)		 2,175
(100.00 %)		 4,885,335
(42.70 %)		 833,138
(1.76 %)		 13,705,778
(31.28 %)		 58,912
(1.65 %)
521 punctate agouti
GCA_004363535.1		 n/a 22,612
(1.05 %)		 45,433
(1.19 %)		 n/a 40.79
(99.92 %)		 6,459
(0.02 %)		 993,123
(99.98 %)		 5,671,738
(32.53 %)		 945,722
(1.69 %)		 17,003,309
(36.58 %)		 85,696
(1.65 %)
522 pygmy sperm whale
GCA_004363705.1		 n/a 22,661
(1.30 %)		 42,546
(1.15 %)		 n/a 41.89
(99.89 %)		 6,053
(0.02 %)		 1,258,125
(99.98 %)		 5,185,912
(43.65 %)		 836,752
(1.88 %)		 14,150,125
(39.88 %)		 95,344
(2.15 %)
523 pygmy sperm whale (haplotype 1 2022 refseq)
GCF_026419965.1		 56,261
(2.22 %)		 18,496
(1.55 %)		 20,718
(1.32 %)		 n/a 42.05
(99.81 %)		 143
(0.19 %)		 581
(100.00 %)		 3,817,659
(34.51 %)		 758,297
(7.42 %)		 12,196,998
(39.96 %)		 101,353
(2.90 %)
524 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 2 2022)
GCA_026419985.1		 n/a 18,550
(1.51 %)		 20,491
(1.29 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 138
(0.01 %)		 391
(100.00 %)		 3,860,112
(33.83 %)		 820,375
(9.58 %)		 12,159,196
(41.59 %)		 106,168
(2.78 %)
525 Pyrenean desman (IBE-C5619 2021)
GCA_019455555.1		 n/a 17,527
(1.87 %)		 20,474
(1.83 %)		 n/a 41.67
(98.52 %)		 63,679
(1.49 %)		 75,985
(98.51 %)		 2,147,379
(23.41 %)		 327,740
(0.98 %)		 10,539,226
(28.05 %)		 44,487
(4.39 %)
526 rabbit (A946 2020)
GCA_013371645.1		 n/a 19,881
(1.40 %)		 22,566
(1.32 %)		 n/a 44.09
(99.92 %)		 4,254
(0.08 %)		 5,157
(99.93 %)		 5,202,709
(44.78 %)		 1,059,544
(2.39 %)		 13,897,372
(40.69 %)		 119,691
(2.74 %)
527 rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 refseq)
GCF_009806435.1		 83,045
(4.16 %)		 19,486
(1.31 %)		 23,267
(1.31 %)		 n/a 43.83
(97.68 %)		 18,178
(2.32 %)		 3,160
(100.00 %)		 4,072,524
(21.41 %)		 976,273
(2.33 %)		 13,766,413
(39.76 %)		 113,371
(2.46 %)
528 rabbit (primary hap 2024 refseq)
GCF_964237555.1		 95,289
(4.22 %)		 19,385
(1.31 %)		 22,631
(1.31 %)		 n/a 44.02
(99.98 %)		 2,276
(0.02 %)		 221
(100.00 %)		 4,099,586
(21.20 %)		 1,062,900
(3.78 %)		 13,416,814
(41.72 %)		 116,523
(2.66 %)
529 rabbit (Thorbecke 2009 Broad refseq)
GCF_000003625.3		 43,655
(2.34 %)		 18,665
(1.39 %)		 20,095
(1.24 %)		 n/a 43.75
(95.14 %)		 80,789
(4.88 %)		 84,024
(95.12 %)		 4,890,480
(44.71 %)		 883,939
(1.73 %)		 13,254,520
(38.27 %)		 110,337
(2.33 %)
530 raccoon dog (2021)
GCF_905146905.1		 52,564
(2.89 %)		 19,628
(1.60 %)		 20,274
(1.43 %)		 n/a 41.28
(99.98 %)		 70
(0.02 %)		 811
(100.00 %)		 4,499,368
(31.98 %)		 1,005,212
(2.04 %)		 13,884,201
(32.95 %)		 52,450
(2.27 %)
531 Rambouillet sheep (Baylor 2017)
GCF_002742125.1		 50,096
(2.48 %)		 19,992
(1.47 %)		 22,506
(1.31 %)		 41,290
(1.46 %)		 41.91
(99.99 %)		 4,847
(0.01 %)		 7,486
(99.99 %)		 5,764,757
(47.38 %)		 507,629
(1.55 %)		 14,138,601
(41.27 %)		 51,748
(1.29 %)
532 Rambouillet sheep (U.Idaho 2021)
GCF_016772045.1		 70,474
(3.21 %)		 19,413
(1.59 %)		 21,222
(1.35 %)		 n/a 41.99
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 142
(100.00 %)		 5,300,958
(46.83 %)		 455,553
(1.24 %)		 13,023,443
(40.62 %)		 43,959
(1.30 %)
533 ratel
GCA_004024625.1		 n/a 22,196
(1.21 %)		 35,937
(1.18 %)		 n/a 42.00
(99.85 %)		 6,511
(0.02 %)		 2,074,823
(99.98 %)		 6,171,383
(41.93 %)		 877,669
(1.49 %)		 15,269,908
(41.22 %)		 95,094
(1.91 %)
534 red bat
GCA_004026805.1		 n/a 27,510
(1.22 %)		 65,467
(1.48 %)		 n/a 42.69
(99.94 %)		 6,380
(0.02 %)		 525,280
(99.98 %)		 4,644,227
(28.24 %)		 1,170,868
(2.68 %)		 15,628,238
(39.97 %)		 125,564
(3.55 %)
535 red deer (2021)
GCF_910594005.1		 68,992
(2.68 %)		 20,470
(1.48 %)		 22,563
(1.32 %)		 n/a 42.98
(100.00 %)		 40
(0.00 %)		 144
(100.00 %)		 5,501,063
(44.60 %)		 503,301
(12.23 %)		 13,102,622
(44.55 %)		 88,756
(1.66 %)
536 red deer (alternate hap 2021)
GCA_910593805.1		 n/a 18,817
(1.29 %)		 21,916
(1.20 %)		 n/a 44.23
(100.00 %)		 22
(0.00 %)		 4,021
(100.00 %)		 3,279,005
(20.48 %)		 472,706
(21.87 %)		 11,466,609
(50.26 %)		 128,858
(2.07 %)
537 red fox (BD-2025 2025)
GCF_048418805.1		 84,632
(3.45 %)		 19,565
(1.57 %)		 19,909
(1.38 %)		 n/a 41.31
(100.00 %)		 104
(0.00 %)		 289
(100.00 %)		 4,480,315
(31.76 %)		 1,010,887
(2.70 %)		 13,766,344
(33.12 %)		 50,763
(2.22 %)
538 red fox (hap1 2024)
GCA_964106825.2		 n/a 19,622
(1.57 %)		 20,371
(1.38 %)		 n/a 41.34
(99.98 %)		 1,845
(0.02 %)		 461
(100.00 %)		 4,519,485
(31.91 %)		 1,018,114
(2.59 %)		 13,810,284
(32.99 %)		 52,053
(2.31 %)
539 red fox (hap2 2024)
GCA_964106925.2		 n/a 19,517
(1.57 %)		 20,105
(1.37 %)		 n/a 41.31
(99.99 %)		 1,819
(0.02 %)		 350
(100.00 %)		 4,487,839
(31.79 %)		 1,010,106
(2.64 %)		 13,838,711
(33.07 %)		 51,373
(2.26 %)
540 red fox (tameXaggressive cross 2018)
GCF_003160815.1		 43,495
(2.67 %)		 19,826
(1.69 %)		 18,893
(1.40 %)		 n/a 41.08
(97.06 %)		 246,167
(2.96 %)		 82,424
(100.00 %)		 4,919,102
(40.79 %)		 954,461
(2.46 %)		 14,190,625
(30.86 %)		 53,204
(1.88 %)
541 reed vole (MF-2015 2020)
GCF_014885135.2		 55,722
(3.60 %)		 19,808
(1.93 %)		 20,787
(1.69 %)		 n/a 42.36
(95.60 %)		 67,118
(4.40 %)		 10,460
(100.00 %)		 3,130,955
(20.09 %)		 831,969
(2.09 %)		 11,985,657
(28.48 %)		 18,764
(0.58 %)
542 Reeves' muntjac (alternate hap 2024)
GCA_963930665.1		 n/a 18,947
(1.29 %)		 24,114
(1.28 %)		 n/a 42.75
(100.00 %)		 n/a 8,892
(100.00 %)		 3,375,476
(23.21 %)		 654,539
(6.64 %)		 11,132,469
(48.29 %)		 79,357
(2.66 %)
543 Reeves' muntjac (primary hap 2024)
GCF_963930625.1		 52,442
(2.57 %)		 19,577
(1.52 %)		 22,283
(1.38 %)		 n/a 41.89
(99.99 %)		 682
(0.01 %)		 267
(100.00 %)		 3,294,672
(23.89 %)		 527,436
(2.98 %)		 13,137,581
(39.89 %)		 57,436
(1.81 %)
544 reindeer (2023)
GCA_963422255.1		 n/a 21,329
(1.58 %)		 25,201
(1.59 %)		 n/a 41.46
(98.35 %)		 131,886
(1.65 %)		 259,765
(98.35 %)		 3,254,173
(23.49 %)		 440,431
(2.00 %)		 14,258,607
(36.17 %)		 48,931
(1.20 %)
545 reindeer (US061 2019)
GCA_004026565.1		 n/a 24,150
(1.39 %)		 39,911
(1.41 %)		 n/a 42.08
(99.89 %)		 4,769
(0.02 %)		 1,365,508
(99.98 %)		 6,083,178
(46.10 %)		 546,470
(1.23 %)		 14,434,855
(43.16 %)		 55,319
(1.23 %)
546 Rice's whale (hap1 2023)
GCA_028017805.1		 n/a 19,396
(1.48 %)		 21,693
(1.26 %)		 n/a 41.62
(97.80 %)		 131
(2.20 %)		 1,039
(100.00 %)		 3,973,936
(35.55 %)		 987,571
(11.66 %)		 12,473,459
(42.11 %)		 74,971
(1.64 %)
547 Rice's whale (hap2 2023 refseq)
GCF_028023285.1		 59,888
(2.34 %)		 19,291
(1.53 %)		 21,195
(1.30 %)		 n/a 41.44
(99.90 %)		 334
(0.10 %)		 774
(100.00 %)		 3,917,923
(36.26 %)		 828,521
(9.28 %)		 12,518,796
(41.08 %)		 73,126
(1.69 %)
548 Rickett's big-footed myotis (AB-2021 2024)
GCA_036010255.1		 n/a 18,982
(1.81 %)		 22,002
(1.76 %)		 n/a 43.12
(100.00 %)		 n/a 105
(100.00 %)		 2,909,847
(24.53 %)		 757,964
(3.03 %)		 10,561,925
(36.25 %)		 57,318
(2.32 %)
549 Risso's dolphin (hap1.1 2024)
GCA_964374135.1		 n/a 18,825
(1.58 %)		 20,986
(1.29 %)		 n/a 42.25
(99.99 %)		 1,138
(0.01 %)		 1,150
(100.00 %)		 4,405,513
(43.51 %)		 1,342,544
(11.28 %)		 12,274,096
(41.76 %)		 76,936
(4.65 %)
550 Risso's dolphin (hap2.1 2024)
GCA_964374185.1		 n/a 18,061
(1.68 %)		 20,080
(1.36 %)		 n/a 41.97
(99.99 %)		 1,073
(0.01 %)		 2,135
(99.99 %)		 3,948,427
(43.52 %)		 848,222
(8.00 %)		 11,527,950
(38.76 %)		 70,117
(3.31 %)
551 Ryukyu mouse (v2 2017)
GCF_900094665.2		 53,779
(2.85 %)		 21,351
(2.29 %)		 18,073
(1.39 %)		 n/a 41.70
(89.05 %)		 306,599
(10.98 %)		 30,835
(92.70 %)		 4,479,912
(35.83 %)		 1,351,677
(2.59 %)		 12,964,608
(27.49 %)		 15,963
(0.43 %)
552 Saanen dairy goat
GCA_015443085.1		 n/a 19,257
(1.54 %)		 21,221
(1.32 %)		 n/a 42.30
(100.00 %)		 170
(0.00 %)		 1,362
(100.00 %)		 5,336,862
(47.58 %)		 515,161
(2.87 %)		 13,144,895
(41.67 %)		 58,623
(2.22 %)
553 saddleback dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949987525.1		 n/a 18,509
(1.54 %)		 22,514
(1.36 %)		 n/a 41.95
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 7,427
(100.00 %)		 3,675,922
(35.75 %)		 950,374
(10.49 %)		 11,670,399
(40.31 %)		 63,587
(3.15 %)
554 saddleback dolphin (v1 primary hap 2023 refseq)
GCF_949987515.1		 46,746
(2.39 %)		 18,624
(1.49 %)		 20,662
(1.31 %)		 n/a 42.06
(99.99 %)		 968
(0.01 %)		 630
(100.00 %)		 4,020,676
(35.99 %)		 1,259,549
(13.09 %)		 12,359,748
(42.64 %)		 66,179
(3.91 %)
555 saddleback dolphin (v2 primary hap 2024 refseq)
GCF_949987515.2		 46,014
(2.36 %)		 18,616
(1.49 %)		 20,618
(1.32 %)		 n/a 42.06
(99.99 %)		 968
(0.01 %)		 1,598
(99.99 %)		 4,020,525
(35.99 %)		 1,258,165
(13.09 %)		 12,359,758
(42.64 %)		 66,188
(3.91 %)
556 saiga antelope
GCA_004024985.1		 n/a 23,736
(0.84 %)		 55,133
(0.88 %)		 n/a 42.52
(99.87 %)		 2,867
(0.01 %)		 1,775,066
(99.99 %)		 6,485,113
(49.43 %)		 447,097
(0.88 %)		 13,972,753
(44.46 %)		 46,883
(0.82 %)
557 Schreibers' long-fingered bat (v2 hap1 2025)
GCA_964146895.2		 n/a 18,109
(2.10 %)		 21,263
(1.89 %)		 n/a 42.51
(100.00 %)		 140
(0.00 %)		 186
(100.00 %)		 2,812,261
(34.39 %)		 457,565
(5.58 %)		 10,220,083
(31.02 %)		 59,522
(2.81 %)
558 Schreibers' long-fingered bat (v2 hap2 2025)
GCA_964145185.2		 n/a 17,286
(2.19 %)		 20,474
(1.95 %)		 n/a 42.64
(100.00 %)		 86
(0.00 %)		 254
(100.00 %)		 2,610,773
(33.65 %)		 389,844
(4.42 %)		 9,728,138
(29.49 %)		 56,508
(2.97 %)
559 Schreibers' long-fingered bat (US075 2019)
GCA_004026525.1		 n/a 20,147
(2.06 %)		 31,271
(1.82 %)		 n/a 42.27
(99.94 %)		 6,918
(0.04 %)		 184,538
(99.96 %)		 2,772,932
(29.66 %)		 366,782
(1.13 %)		 10,477,531
(28.60 %)		 62,520
(2.73 %)
560 scimitar-horned oryx
GCF_014754425.2		 51,527
(2.72 %)		 19,713
(1.57 %)		 21,928
(1.32 %)		 n/a 41.74
(99.30 %)		 16,241
(0.70 %)		 9,089
(100.00 %)		 5,435,109
(46.76 %)		 414,279
(0.98 %)		 13,490,956
(40.45 %)		 42,961
(1.10 %)
561 Screaming hairy armadillo
GCA_004027955.1		 n/a 24,532
(0.39 %)		 56,725
(0.46 %)		 n/a 39.68
(99.70 %)		 2,747
(0.01 %)		 7,680,080
(99.99 %)		 8,978,735
(36.02 %)		 1,516,551
(1.58 %)		 32,918,217
(47.67 %)		 234,762
(1.56 %)
562 sea otter (GAN:26980312 2017 refseq)
GCF_002288905.1		 38,127
(2.16 %)		 18,578
(1.64 %)		 20,913
(1.44 %)		 34,179
(1.77 %)		 41.56
(98.79 %)		 23,134
(1.21 %)		 29,589
(98.79 %)		 4,703,044
(41.42 %)		 721,750
(1.39 %)		 14,065,653
(32.89 %)		 55,388
(1.87 %)
563 Seba's short-tailed bat
GCA_004027735.1		 n/a 21,878
(0.94 %)		 55,858
(1.10 %)		 n/a 42.70
(99.84 %)		 3,864
(0.01 %)		 1,929,203
(99.99 %)		 3,802,235
(28.35 %)		 606,320
(1.03 %)		 15,171,250
(31.99 %)		 118,227
(2.28 %)
564 sei whale (hap1.1 2025)
GCA_965194805.1		 n/a 19,292
(1.27 %)		 21,865
(1.14 %)		 n/a 41.99
(99.99 %)		 1,179
(0.01 %)		 2,572
(100.00 %)		 4,525,289
(42.25 %)		 1,097,216
(21.14 %)		 12,203,884
(50.47 %)		 80,128
(1.58 %)
565 sei whale (hap2.1 2025)
GCA_965194725.1		 n/a 19,313
(1.37 %)		 21,662
(1.17 %)		 n/a 41.68
(99.99 %)		 1,066
(0.01 %)		 2,917
(99.99 %)		 4,418,625
(42.98 %)		 875,114
(15.81 %)		 12,360,254
(46.52 %)		 78,537
(1.66 %)
566 sheep (hu hu3095 2024)
GCA_040805955.1		 n/a 19,388
(1.42 %)		 21,612
(1.28 %)		 n/a 43.17
(100.00 %)		 n/a 28
(100.00 %)		 5,311,536
(44.06 %)		 653,238
(7.29 %)		 12,937,231
(44.10 %)		 63,230
(6.03 %)
567 sheep (OAR_USU_Benz2616 2023)
GCF_016772045.2		 89,680
(5.44 %)		 19,308
(1.52 %)		 21,506
(1.35 %)		 n/a 42.01
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 143
(100.00 %)		 3,275,767
(22.85 %)		 464,346
(1.26 %)		 12,987,607
(40.61 %)		 44,477
(1.28 %)
568 sheep (Texel 2015)
GCA_000298735.2		 n/a 19,179
(1.56 %)		 19,001
(1.26 %)		 48,105
(1.85 %)		 41.90
(98.94 %)		 44,566
(1.07 %)		 48,481
(98.93 %)		 5,429,824
(46.13 %)		 540,267
(1.64 %)		 13,509,668
(38.83 %)		 43,911
(1.13 %)
569 shrew mouse
GCF_900095145.1		 46,279
(2.64 %)		 20,549
(2.23 %)		 18,979
(1.49 %)		 94,079
(3.98 %)		 41.89
(90.53 %)		 269,643
(9.50 %)		 17,879
(93.73 %)		 4,788,498
(38.32 %)		 1,499,714
(3.03 %)		 13,021,757
(27.83 %)		 16,787
(0.47 %)
570 Siberian hamster (SSSS 2022)
GCA_023856395.1		 n/a 18,375
(1.83 %)		 17,066
(1.44 %)		 n/a 41.27
(99.64 %)		 88,601
(0.37 %)		 7,756
(100.00 %)		 3,152,242
(21.63 %)		 1,087,009
(2.64 %)		 12,055,167
(29.20 %)		 15,455
(0.48 %)
571 Siberian musk deer (BS20 2019 Broad)
GCA_004024705.1		 n/a 23,440
(1.32 %)		 37,497
(1.19 %)		 n/a 42.32
(99.86 %)		 19,764
(0.07 %)		 1,195,467
(99.93 %)		 6,726,950
(49.79 %)		 437,480
(1.57 %)		 14,155,240
(46.22 %)		 49,177
(1.05 %)
572 small Madagascar hedgehog
GCF_000313985.2		 37,090
(1.93 %)		 18,969
(1.19 %)		 19,298
(1.31 %)		 n/a 43.01
(88.43 %)		 270,406
(11.60 %)		 7,490
(100.00 %)		 3,789,337
(28.89 %)		 429,226
(0.87 %)		 16,951,112
(32.23 %)		 39,993
(0.70 %)
573 smoky shrew (2023)
GCF_029834395.1		 37,165
(1.66 %)		 17,572
(1.06 %)		 24,146
(1.29 %)		 n/a 43.43
(100.00 %)		 n/a 497
(100.00 %)		 2,593,080
(14.11 %)		 1,194,567
(7.25 %)		 14,051,522
(48.20 %)		 107,473
(2.80 %)
574 snow leopard (11264 2022)
GCF_023721935.1		 53,556
(3.37 %)		 18,780
(1.67 %)		 21,038
(1.40 %)		 n/a 41.60
(99.30 %)		 23,786
(0.70 %)		 2,636
(100.00 %)		 4,714,429
(34.93 %)		 919,518
(1.59 %)		 13,711,504
(33.24 %)		 64,690
(2.41 %)
575 snowshoe hare
GCA_004026855.1		 n/a 23,263
(0.88 %)		 55,811
(1.01 %)		 n/a 44.12
(99.87 %)		 10,153
(0.03 %)		 1,602,982
(99.97 %)		 4,767,120
(21.29 %)		 1,040,992
(2.22 %)		 15,680,144
(43.23 %)		 126,152
(2.28 %)
576 social tuco-tuco
GCA_004027165.1		 n/a 25,166
(1.12 %)		 41,316
(1.26 %)		 n/a 40.71
(99.89 %)		 16,191
(0.06 %)		 823,762
(99.94 %)		 5,390,906
(28.28 %)		 1,027,922
(2.15 %)		 15,241,308
(38.39 %)		 31,883
(0.72 %)
577 soprano pipistrelle (alternate hap 2023)
GCA_949987765.1		 n/a 17,590
(1.81 %)		 21,597
(1.85 %)		 n/a 42.88
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,717
(100.00 %)		 2,734,555
(21.46 %)		 795,752
(6.56 %)		 9,601,735
(36.35 %)		 62,524
(3.25 %)
578 soprano pipistrelle (primary hap 2023)
GCA_949987585.1		 n/a 18,056
(1.78 %)		 21,158
(1.79 %)		 n/a 42.67
(100.00 %)		 161
(0.00 %)		 249
(100.00 %)		 2,899,535
(21.64 %)		 853,717
(7.80 %)		 10,162,216
(37.72 %)		 63,256
(3.06 %)
579 South African ground squirrel
GCA_004024805.1		 n/a 22,802
(1.44 %)		 33,892
(1.27 %)		 n/a 39.97
(99.92 %)		 9,745
(0.04 %)		 587,115
(99.96 %)		 5,256,998
(34.93 %)		 594,122
(1.27 %)		 14,462,947
(33.96 %)		 34,141
(0.80 %)
580 Southeastern Asian house mouse (2016)
GCA_001624445.1		 n/a 21,103
(2.24 %)		 18,682
(1.45 %)		 102,099
(4.16 %)		 41.83
(86.23 %)		 424,005
(13.83 %)		 52,352
(97.85 %)		 4,990,851
(39.88 %)		 1,356,202
(2.67 %)		 13,469,640
(26.15 %)		 16,724
(0.41 %)
581 Southeastern Asian house mouse (2022)
GCA_921999005.2		 n/a 21,799
(2.13 %)		 19,729
(1.40 %)		 110,356
(4.43 %)		 41.78
(99.19 %)		 278
(0.81 %)		 151
(100.00 %)		 4,663,228
(40.41 %)		 1,549,985
(3.70 %)		 13,012,600
(34.99 %)		 21,349
(0.52 %)
582 Southeastern Asian house mouse (T2T 2024)
GCA_964188545.1		 n/a 22,529
(1.85 %)		 20,409
(1.22 %)		 n/a 41.10
(99.90 %)		 78
(0.10 %)		 416
(99.90 %)		 4,880,101
(47.77 %)		 1,689,287
(15.13 %)		 12,822,147
(42.92 %)		 22,642
(0.54 %)
583 southern elephant seal
GCF_011800145.1		 53,210
(2.86 %)		 19,520
(1.73 %)		 20,727
(1.41 %)		 39,634
(1.86 %)		 41.45
(99.36 %)		 22,850
(0.64 %)		 1,115
(100.00 %)		 4,728,105
(43.75 %)		 585,443
(1.13 %)		 13,463,979
(33.65 %)		 53,182
(1.62 %)
584 southern grasshopper mouse (2020)
GCF_903995425.1		 47,152
(2.39 %)		 19,356
(1.68 %)		 18,821
(1.36 %)		 n/a 41.81
(98.94 %)		 2,143
(1.06 %)		 2,949
(100.00 %)		 4,850,460
(28.64 %)		 1,195,836
(2.72 %)		 13,540,762
(32.73 %)		 18,046
(0.54 %)
585 southern multimammate mouse
GCF_008632895.1		 69,045
(3.04 %)		 20,313
(2.11 %)		 17,745
(1.38 %)		 n/a 41.39
(91.90 %)		 146,713
(8.12 %)		 28
(100.00 %)		 4,875,400
(38.43 %)		 1,454,350
(2.93 %)		 13,104,717
(28.82 %)		 16,715
(0.45 %)
586 southern tamandua (mTamTet1 alternate hap 2022)
GCA_023853755.1		 n/a 20,179
(1.21 %)		 24,249
(1.19 %)		 n/a 39.54
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 7,866
(100.00 %)		 3,953,031
(35.88 %)		 531,111
(1.14 %)		 16,354,874
(39.96 %)		 59,907
(1.35 %)
587 southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022)
GCA_023851605.1		 n/a 20,058
(1.26 %)		 22,196
(1.13 %)		 n/a 39.48
(99.44 %)		 961
(0.56 %)		 201
(100.00 %)		 4,037,291
(46.02 %)		 593,019
(1.17 %)		 18,033,833
(40.56 %)		 65,039
(1.33 %)
588 southern three-banded armadillo
GCA_004025125.1		 n/a 29,138
(0.73 %)		 56,522
(0.75 %)		 n/a 39.20
(99.82 %)		 15,801
(0.04 %)		 2,941,308
(99.96 %)		 6,990,740
(38.88 %)		 839,452
(1.23 %)		 24,805,397
(43.95 %)		 71,951
(0.98 %)
589 southern two-toed sloth (mChoDid1 alternate hap 2020)
GCA_015220265.1		 n/a 22,897
(1.23 %)		 27,007
(1.18 %)		 n/a 39.87
(100.00 %)		 70
(0.00 %)		 12,050
(100.00 %)		 4,502,020
(38.27 %)		 576,759
(1.02 %)		 17,143,050
(40.65 %)		 51,339
(1.15 %)
590 southern two-toed sloth (mChoDid1 primary hap 2020)
GCF_015220235.1		 63,054
(2.39 %)		 21,998
(1.29 %)		 23,177
(1.18 %)		 45,345
(1.69 %)		 39.89
(97.48 %)		 1,243
(2.52 %)		 146
(100.00 %)		 4,559,690
(39.66 %)		 577,607
(1.02 %)		 16,594,630
(40.50 %)		 51,430
(1.14 %)
591 southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 refseq)
GCF_000283155.1		 37,037
(2.11 %)		 18,398
(1.71 %)		 19,753
(1.44 %)		 n/a 40.90
(96.05 %)		 54,737
(3.96 %)		 57,824
(96.04 %)		 3,685,898
(38.31 %)		 421,694
(0.97 %)		 14,765,529
(28.93 %)		 36,281
(1.02 %)
592 Sowerby's beaked whale (hap1 2024)
GCA_964165515.1		 n/a 19,471
(1.39 %)		 22,951
(1.24 %)		 n/a 42.04
(99.99 %)		 1,095
(0.01 %)		 1,604
(100.00 %)		 4,307,839
(34.31 %)		 825,475
(10.97 %)		 11,375,945
(45.31 %)		 76,527
(3.10 %)
593 Sowerby's beaked whale (hap2 2024)
GCA_964148845.1		 n/a 18,591
(1.46 %)		 21,588
(1.27 %)		 n/a 42.00
(99.99 %)		 974
(0.01 %)		 2,126
(99.99 %)		 3,961,403
(34.20 %)		 742,897
(9.73 %)		 10,832,739
(43.68 %)		 70,803
(2.85 %)
594 Sowerby's beaked whale (US080 2019)
GCA_004027085.1		 n/a 22,800
(1.32 %)		 38,247
(1.17 %)		 n/a 41.68
(99.84 %)		 8,597
(0.03 %)		 1,810,317
(99.97 %)		 5,520,986
(45.05 %)		 1,081,962
(2.69 %)		 13,480,261
(43.01 %)		 69,001
(1.39 %)
595 sperm whale (SW-GA 2023)
GCF_002837175.3		 62,615
(2.83 %)		 19,485
(1.75 %)		 22,707
(1.41 %)		 n/a 41.33
(95.82 %)		 121,387
(4.20 %)		 133,555
(95.80 %)		 3,906,439
(36.43 %)		 691,647
(2.39 %)		 13,489,368
(32.95 %)		 86,751
(2.23 %)
596 spotted-tailed quoll (Chaos hap1 2025)
GCA_048593285.1		 n/a 15,188
(0.80 %)		 15,406
(0.90 %)		 n/a 36.07
(99.97 %)		 151
(0.03 %)		 157
(99.97 %)		 4,933,924
(23.65 %)		 1,239,006
(2.76 %)		 20,612,787
(41.98 %)		 21,700
(0.64 %)
597 spotted-tailed quoll (Chaos hap2 2025)
GCA_048593245.1		 n/a 15,441
(0.80 %)		 15,791
(0.92 %)		 n/a 36.12
(99.99 %)		 118
(0.01 %)		 124
(99.99 %)		 4,962,547
(23.62 %)		 1,257,253
(2.87 %)		 20,652,321
(42.01 %)		 22,718
(0.69 %)
598 star-nosed mole
GCF_000260355.1		 30,444
(2.86 %)		 16,116
(1.82 %)		 17,403
(1.78 %)		 n/a 41.55
(95.10 %)		 82,557
(4.92 %)		 84,595
(95.08 %)		 1,855,039
(18.90 %)		 308,473
(0.86 %)		 9,571,561
(26.02 %)		 48,079
(2.76 %)
599 Steller sea lion
GCF_004028035.1		 46,044
(2.38 %)		 21,171
(1.78 %)		 21,626
(1.43 %)		 36,701
(1.75 %)		 41.38
(99.41 %)		 18,994
(0.59 %)		 24,485
(99.41 %)		 4,556,415
(43.53 %)		 577,797
(1.09 %)		 13,545,012
(33.71 %)		 51,355
(1.45 %)
600 Stephens's kangaroo rat
GCA_004024685.1		 n/a 20,638
(1.19 %)		 43,541
(1.37 %)		 n/a 41.90
(99.85 %)		 8,882
(0.04 %)		 1,278,525
(99.96 %)		 4,886,095
(30.36 %)		 1,229,832
(5.30 %)		 11,334,494
(44.33 %)		 38,450
(1.17 %)
601 steppe mouse (ZRU 2018)
GCA_003336285.1		 n/a 22,032
(2.17 %)		 20,891
(1.41 %)		 n/a 41.70
(95.78 %)		 123,681
(4.24 %)		 161,217
(95.76 %)		 4,964,415
(42.35 %)		 1,414,584
(2.75 %)		 12,989,925
(31.80 %)		 17,544
(0.44 %)
602 Stoliczka's trident bat (China 2021113_DDA primary hap 2024)
GCA_043727835.1		 n/a 19,605
(1.80 %)		 20,075
(1.48 %)		 n/a 41.32
(100.00 %)		 87
(0.00 %)		 80
(100.00 %)		 4,110,913
(40.46 %)		 838,212
(2.48 %)		 11,938,168
(33.52 %)		 40,424
(1.32 %)
603 straw-colored fruit bat
GCA_000465285.1		 n/a 20,161
(1.66 %)		 40,283
(1.50 %)		 n/a 39.24
(99.62 %)		 154,908
(0.40 %)		 288,446
(99.60 %)		 2,814,732
(32.92 %)		 372,539
(1.01 %)		 12,351,823
(25.93 %)		 67,245
(2.34 %)
604 stripe-headed round-eared bat
GCA_004024845.1		 n/a 20,248
(1.62 %)		 29,173
(1.61 %)		 n/a 42.04
(99.96 %)		 2,860
(0.01 %)		 252,670
(99.99 %)		 3,018,746
(29.48 %)		 333,243
(0.74 %)		 12,128,116
(30.51 %)		 59,513
(1.87 %)
605 striped dolphin (alternate hap 2023)
GCA_951394445.1		 n/a 18,204
(1.54 %)		 21,036
(1.34 %)		 n/a 42.07
(100.00 %)		 n/a 3,464
(100.00 %)		 3,767,720
(35.65 %)		 1,102,723
(10.92 %)		 11,794,617
(40.96 %)		 67,537
(3.57 %)
606 striped dolphin (primary hap 2023)
GCA_951394435.1		 n/a 18,595
(1.48 %)		 20,637
(1.29 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 993
(0.01 %)		 639
(100.00 %)		 4,097,623
(35.88 %)		 1,442,973
(13.60 %)		 12,327,244
(43.08 %)		 68,498
(4.29 %)
607 striped hyena (BS54 2019 Broad)
GCA_004023945.1		 n/a 22,373
(1.45 %)		 39,382
(1.45 %)		 n/a 41.66
(99.93 %)		 11,849
(0.05 %)		 362,072
(99.95 %)		 5,048,667
(42.42 %)		 712,073
(1.24 %)		 13,879,012
(34.58 %)		 69,835
(2.20 %)
608 striped hyena (Hyena2069 2018 Potsdam U)
GCF_003009895.1		 48,870
(2.41 %)		 18,793
(1.67 %)		 20,950
(1.44 %)		 n/a 41.56
(99.29 %)		 23,058
(0.71 %)		 5,761
(100.00 %)		 4,782,500
(41.88 %)		 701,157
(1.32 %)		 13,436,624
(33.05 %)		 58,977
(2.20 %)
609 sugar glider (PSGF00001 2023)
GCA_028583685.1		 n/a 19,326
(0.81 %)		 17,560
(0.95 %)		 n/a 38.95
(98.12 %)		 85,933
(1.89 %)		 1,895
(100.00 %)		 6,382,198
(27.07 %)		 1,058,207
(1.74 %)		 22,508,040
(39.84 %)		 16,224
(0.33 %)
610 sugar glider (PSGF00001 2023)
GCF_028583685.1		 55,990
(2.41 %)		 19,328
(0.81 %)		 17,559
(0.95 %)		 n/a 38.95
(98.12 %)		 85,933
(1.89 %)		 1,896
(100.00 %)		 6,382,203
(27.07 %)		 1,058,208
(1.74 %)		 22,508,106
(39.84 %)		 16,224
(0.33 %)
611 Sumatran rhinoceros (Ipuh 2017)
GCA_002844835.1		 n/a 20,368
(1.53 %)		 24,204
(1.23 %)		 n/a 41.05
(95.54 %)		 50,876
(4.40 %)		 1,112,463
(95.60 %)		 4,516,240
(39.90 %)		 561,540
(1.56 %)		 15,821,451
(34.68 %)		 45,201
(1.03 %)
612 Sumatran serow (serow.1 2024)
GCF_032405125.1		 36,400
(1.65 %)		 19,192
(1.42 %)		 22,014
(1.41 %)		 n/a 43.08
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 159
(100.00 %)		 3,242,768
(21.18 %)		 612,565
(8.05 %)		 12,812,990
(44.37 %)		 75,177
(5.86 %)
613 Sunda flying lemur (2014 WashU)
GCF_000696425.1		 34,734
(1.83 %)		 21,356
(1.55 %)		 25,832
(1.21 %)		 n/a 40.21
(87.96 %)		 412,608
(12.07 %)		 511,878
(87.93 %)		 4,961,153
(38.35 %)		 854,441
(3.33 %)		 17,562,576
(28.82 %)		 82,988
(1.05 %)
614 Sunda flying lemur (US047 2019 Broad)
GCA_004027255.1		 n/a 24,882
(1.29 %)		 43,546
(1.12 %)		 n/a 40.46
(99.88 %)		 5,895
(0.02 %)		 1,655,642
(99.98 %)		 5,807,241
(38.62 %)		 953,765
(2.48 %)		 18,836,777
(37.68 %)		 114,955
(1.43 %)
615 tailed tailless bat
GCA_004027475.1		 n/a 19,920
(1.58 %)		 28,017
(1.58 %)		 n/a 41.76
(99.95 %)		 4,640
(0.02 %)		 341,895
(99.98 %)		 3,139,817
(30.43 %)		 381,536
(0.81 %)		 12,069,229
(32.73 %)		 54,528
(2.15 %)
616 takin (Tak-1 2022)
GCF_023091745.1		 31,914
(1.65 %)		 19,290
(1.42 %)		 21,656
(1.27 %)		 n/a 43.32
(100.00 %)		 152
(0.00 %)		 1,363
(100.00 %)		 3,256,033
(21.01 %)		 714,375
(8.32 %)		 13,010,154
(44.58 %)		 49,134
(7.43 %)
617 Talazac's shrew tenrec
GCA_004026705.1		 n/a 22,605
(0.81 %)		 50,725
(1.09 %)		 n/a 43.03
(99.93 %)		 6,619
(0.02 %)		 795,514
(99.98 %)		 3,493,378
(14.58 %)		 705,274
(1.31 %)		 20,975,335
(36.85 %)		 70,793
(1.26 %)
618 tammar wallaby (alternate hap 2023)
GCA_028389975.1		 n/a 11,133
(0.77 %)		 13,869
(0.98 %)		 n/a 38.63
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 14,285
(100.00 %)		 3,114,522
(26.10 %)		 661,874
(3.02 %)		 11,667,649
(38.41 %)		 12,393
(0.46 %)
619 tammar wallaby (Barry hap1 2025)
GCA_048593335.1		 n/a 17,491
(0.79 %)		 15,701
(0.88 %)		 n/a 38.69
(100.00 %)		 32
(0.00 %)		 40
(100.00 %)		 5,762,317
(26.52 %)		 1,078,692
(1.83 %)		 22,476,051
(38.99 %)		 22,756
(0.48 %)
620 tammar wallaby (Barry hap2 2025)
GCA_048593345.1		 n/a 17,037
(0.79 %)		 15,066
(0.87 %)		 n/a 38.62
(100.00 %)		 16
(0.00 %)		 24
(100.00 %)		 5,608,153
(26.57 %)		 1,050,173
(1.77 %)		 21,856,273
(38.96 %)		 21,811
(0.47 %)
621 tammar wallaby (v2 primary hap 2023 refseq)
GCF_028372415.1		 73,219
(3.07 %)		 17,615
(0.77 %)		 15,415
(0.86 %)		 n/a 38.73
(99.81 %)		 515
(0.19 %)		 272
(100.00 %)		 5,866,314
(26.30 %)		 1,193,604
(2.72 %)		 22,677,480
(39.53 %)		 23,590
(0.47 %)
622 Tasmanian devil (McLovin hap1 2025)
GCA_048593225.1		 n/a 15,725
(0.77 %)		 16,721
(0.92 %)		 n/a 36.17
(99.49 %)		 1,514
(0.51 %)		 1,521
(99.49 %)		 5,222,976
(23.42 %)		 1,357,438
(3.95 %)		 21,705,122
(42.26 %)		 24,443
(0.70 %)
623 Tasmanian devil (McLovin hap2 2025)
GCA_048593325.1		 n/a 15,165
(0.76 %)		 15,663
(0.91 %)		 n/a 36.00
(99.11 %)		 2,578
(0.89 %)		 2,584
(99.11 %)		 5,039,957
(23.64 %)		 1,257,168
(2.97 %)		 20,893,744
(41.44 %)		 22,574
(0.67 %)
624 Tasmanian devil (primary hap 2019)
GCF_902635505.1		 52,057
(2.36 %)		 15,918
(0.85 %)		 16,111
(0.91 %)		 n/a 36.16
(100.00 %)		 354
(0.00 %)		 106
(100.00 %)		 6,789,158
(44.28 %)		 1,246,027
(2.19 %)		 21,434,803
(41.20 %)		 23,609
(0.65 %)
625 thirteen-lined ground squirrel (2021 HiC)
GCF_016881025.1		 69,352
(3.50 %)		 18,934
(1.68 %)		 16,775
(1.37 %)		 n/a 39.91
(93.25 %)		 146,412
(6.77 %)		 7,132
(100.00 %)		 4,262,890
(35.64 %)		 640,624
(1.64 %)		 14,118,452
(27.90 %)		 28,317
(0.64 %)
626 Tibetan sand fox (lyu1992 2022)
GCA_024500485.1		 n/a 19,552
(1.59 %)		 19,307
(1.35 %)		 n/a 41.25
(100.00 %)		 145
(0.00 %)		 234
(100.00 %)		 4,500,832
(32.18 %)		 999,068
(2.01 %)		 13,646,015
(32.98 %)		 49,402
(2.19 %)
627 tiger
GCF_018350195.1		 71,226
(2.84 %)		 18,513
(1.68 %)		 19,919
(1.39 %)		 n/a 41.64
(100.00 %)		 65
(0.00 %)		 131
(100.00 %)		 4,878,003
(42.77 %)		 912,595
(1.82 %)		 13,804,650
(33.76 %)		 64,312
(2.55 %)
628 Townsend's big-eared bat (haplotype 1 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230055.1		 n/a 19,370
(1.77 %)		 21,062
(1.61 %)		 n/a 42.81
(100.00 %)		 219
(0.00 %)		 610
(100.00 %)		 2,923,694
(25.49 %)		 772,382
(3.25 %)		 10,654,074
(37.41 %)		 48,226
(2.42 %)
629 Townsend's big-eared bat (haplotype 2 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230045.1		 n/a 18,627
(1.82 %)		 20,108
(1.67 %)		 n/a 42.95
(100.00 %)		 217
(0.00 %)		 182
(100.00 %)		 2,733,927
(24.79 %)		 715,258
(3.17 %)		 10,099,456
(36.35 %)		 47,139
(2.58 %)
630 Transcaucasian mole vole
GCA_001685075.1		 n/a 20,173
(1.62 %)		 18,627
(1.30 %)		 n/a 41.51
(96.09 %)		 440,846
(3.96 %)		 499,269
(96.04 %)		 3,827,136
(25.51 %)		 810,597
(2.65 %)		 13,634,524
(27.54 %)		 9,596
(0.16 %)
631 trefoil horseshoe bat (Malaysia primary hap 2024)
GCA_043728145.1		 n/a 18,871
(1.79 %)		 20,351
(1.55 %)		 n/a 40.66
(99.99 %)		 397
(0.01 %)		 136
(100.00 %)		 3,580,957
(40.75 %)		 683,947
(2.19 %)		 11,464,418
(33.39 %)		 37,175
(1.31 %)
632 True's beaked whale (hap1.1 2024)
GCA_964341445.1		 n/a 19,530
(1.21 %)		 24,576
(1.13 %)		 n/a 42.48
(99.99 %)		 1,240
(0.01 %)		 2,757
(100.00 %)		 4,847,855
(34.88 %)		 949,927
(20.01 %)		 10,981,914
(51.51 %)		 91,880
(2.74 %)
633 True's beaked whale (hap2.1 2024)
GCA_964341485.1		 n/a 19,313
(1.40 %)		 22,642
(1.25 %)		 n/a 42.03
(99.99 %)		 1,073
(0.01 %)		 2,457
(99.99 %)		 4,540,507
(37.61 %)		 826,104
(12.82 %)		 11,296,445
(45.25 %)		 80,840
(2.24 %)
634 Upper Galilee mountains blind mole rat (2095 2014 refseq)
GCF_000622305.1		 54,667
(2.07 %)		 19,704
(1.26 %)		 21,262
(1.20 %)		 n/a 41.26
(95.18 %)		 201,121
(4.83 %)		 356,097
(95.17 %)		 6,165,645
(34.95 %)		 1,197,750
(2.77 %)		 16,282,383
(36.21 %)		 22,905
(0.49 %)
635 Vancouver Island marmot (RANI-1049 2019)
GCA_005458795.1		 n/a 19,867
(1.62 %)		 15,893
(1.33 %)		 n/a 39.77
(94.43 %)		 296,819
(5.60 %)		 315,631
(94.40 %)		 4,452,628
(33.94 %)		 751,210
(1.84 %)		 13,917,879
(30.08 %)		 26,541
(0.58 %)
636 vaquita (alternate hap mPhoSin1 2019)
GCA_008692045.1		 n/a 9,367
(1.66 %)		 11,297
(1.30 %)		 n/a 41.50
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 9,470
(100.00 %)		 1,708,360
(43.81 %)		 267,584
(1.67 %)		 5,373,410
(33.52 %)		 29,783
(1.94 %)
637 vaquita (mPhoSin1 2019)
GCF_008692025.1		 60,106
(3.00 %)		 18,611
(1.76 %)		 20,103
(1.39 %)		 35,176
(2.22 %)		 41.36
(99.66 %)		 212
(0.34 %)		 64
(100.00 %)		 4,067,454
(44.25 %)		 602,407
(1.34 %)		 12,468,582
(35.55 %)		 66,806
(1.79 %)
638 water buffalo (Mediterranean 2018)
GCF_003121395.1		 69,771
(3.14 %)		 19,465
(1.58 %)		 21,849
(1.37 %)		 46,051
(1.86 %)		 41.81
(99.99 %)		 410
(0.01 %)		 509
(100.00 %)		 5,407,697
(47.11 %)		 473,976
(1.54 %)		 13,015,899
(41.23 %)		 43,120
(1.15 %)
639 water buffalo (Murrah 2021)
GCF_019923935.1		 80,552
(3.26 %)		 19,402
(1.59 %)		 20,375
(1.31 %)		 n/a 41.75
(100.00 %)		 659
(0.00 %)		 26
(100.00 %)		 5,358,548
(47.11 %)		 447,338
(1.14 %)		 13,034,537
(41.28 %)		 40,189
(1.07 %)
640 Weddell seal (WS11-02 2013 refseq)
GCF_000349705.1		 48,251
(2.73 %)		 21,063
(1.73 %)		 22,333
(1.43 %)		 n/a 41.39
(70.44 %)		 152,836
(29.58 %)		 169,547
(70.42 %)		 4,420,479
(41.72 %)		 471,256
(0.66 %)		 13,410,237
(22.09 %)		 48,738
(1.01 %)
641 western European hedgehog (2012 refseq)
GCF_000296755.1		 29,923
(1.67 %)		 18,067
(1.33 %)		 19,777
(1.35 %)		 n/a 41.54
(85.94 %)		 219,764
(14.09 %)		 225,567
(85.91 %)		 6,594,783
(45.66 %)		 1,271,533
(2.29 %)		 12,374,161
(42.02 %)		 28,528
(0.71 %)
642 western European hedgehog (alternate hap 2023)
GCA_950295305.1		 n/a 14,370
(1.06 %)		 24,297
(1.27 %)		 n/a 42.08
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 26,601
(100.00 %)		 3,360,923
(19.59 %)		 1,043,098
(3.92 %)		 8,511,380
(53.68 %)		 23,321
(0.97 %)
643 western European hedgehog (primary hap 2023 refseq)
GCF_950295315.1		 61,103
(2.36 %)		 18,125
(1.16 %)		 20,689
(1.21 %)		 n/a 42.00
(99.97 %)		 3,760
(0.03 %)		 1,174
(100.00 %)		 4,891,329
(19.68 %)		 1,507,929
(3.81 %)		 12,571,105
(54.50 %)		 32,667
(0.90 %)
644 western European house mouse (WSB_EiJ v3 2022)
GCA_921998345.2		 n/a 21,722
(2.14 %)		 19,586
(1.39 %)		 108,856
(4.46 %)		 41.81
(98.87 %)		 1,233
(1.13 %)		 233
(100.00 %)		 4,634,551
(40.61 %)		 1,541,826
(3.49 %)		 13,030,566
(35.21 %)		 22,985
(0.56 %)
645 western roe deer (2023)
GCA_951849835.1		 n/a 20,291
(1.29 %)		 23,555
(1.23 %)		 n/a 42.31
(100.00 %)		 n/a 212
(100.00 %)		 4,204,612
(25.49 %)		 848,463
(7.79 %)		 12,687,776
(48.28 %)		 57,315
(1.25 %)
646 western spotted skunk
GCA_004023965.1		 n/a 21,665
(1.46 %)		 34,370
(1.32 %)		 n/a 41.61
(99.92 %)		 11,822
(0.05 %)		 433,831
(99.95 %)		 4,889,781
(40.77 %)		 901,906
(2.30 %)		 13,931,764
(34.80 %)		 54,394
(1.54 %)
647 western wild mouse (SPRET_EiJ v3 2022)
GCA_921997135.2		 n/a 21,699
(2.10 %)		 18,837
(1.32 %)		 n/a 41.69
(99.51 %)		 1,576
(0.49 %)		 143
(100.00 %)		 4,507,329
(41.24 %)		 1,517,241
(3.77 %)		 12,832,499
(36.17 %)		 22,568
(0.53 %)
648 whiskered bat (hap1 2024)
GCA_964094495.2		 n/a 19,504
(1.78 %)		 22,272
(1.73 %)		 n/a 42.99
(99.99 %)		 1,566
(0.02 %)		 533
(100.00 %)		 3,046,246
(25.06 %)		 753,151
(4.86 %)		 10,596,418
(37.62 %)		 66,785
(2.55 %)
649 whiskered bat (hap2 2024)
GCA_964195625.1		 n/a 18,681
(1.83 %)		 21,523
(1.79 %)		 n/a 43.13
(99.99 %)		 1,414
(0.01 %)		 1,741
(99.99 %)		 2,849,223
(24.50 %)		 688,594
(4.80 %)		 9,968,980
(36.80 %)		 64,365
(2.68 %)
650 white-beaked dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949774935.1		 n/a 17,639
(1.50 %)		 25,684
(1.35 %)		 n/a 42.08
(100.00 %)		 n/a 25,619
(100.00 %)		 3,039,324
(36.05 %)		 637,912
(8.02 %)		 9,746,398
(38.98 %)		 56,325
(3.33 %)
651 white-beaked dolphin (primary hap 2023 refseq)
GCF_949774975.1		 59,982
(2.43 %)		 18,737
(1.57 %)		 20,767
(1.34 %)		 n/a 41.91
(99.99 %)		 1,070
(0.01 %)		 410
(100.00 %)		 3,820,566
(36.21 %)		 922,103
(8.43 %)		 12,304,360
(39.74 %)		 68,551
(3.58 %)
652 white-footed mouse (LL stock 2020)
GCF_004664715.2		 54,479
(2.82 %)		 19,971
(1.69 %)		 20,132
(1.42 %)		 n/a 42.23
(99.95 %)		 2,299
(0.05 %)		 1,857
(100.00 %)		 5,060,487
(30.71 %)		 1,258,073
(2.85 %)		 14,007,098
(32.99 %)		 23,456
(0.67 %)
653 white-tailed deer (Illinois 20LAN1187 2024)
GCF_023699985.2		 68,660
(3.60 %)		 19,951
(1.73 %)		 21,804
(1.48 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 294
(0.00 %)		 718
(100.00 %)		 4,512,173
(43.10 %)		 402,481
(1.14 %)		 12,813,223
(37.56 %)		 45,863
(1.30 %)
654 white-tailed deer (Pink-7 2017 refseq)
GCF_002102435.1		 57,774
(2.93 %)		 20,661
(1.75 %)		 23,085
(1.50 %)		 40,987
(1.94 %)		 41.55
(99.10 %)		 107,058
(0.91 %)		 48,653
(99.10 %)		 4,800,704
(41.29 %)		 413,129
(2.59 %)		 13,296,779
(34.22 %)		 44,165
(1.19 %)
655 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 alternate hap 2022)
GCA_024140225.1		 n/a 12,198
(1.10 %)		 18,494
(1.29 %)		 n/a 39.87
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 14,841
(100.00 %)		 1,725,021
(17.81 %)		 802,415
(4.26 %)		 8,321,474
(45.72 %)		 15,669
(0.79 %)
656 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 primary hap 2022)
GCF_024139225.1		 40,430
(1.81 %)		 17,575
(1.21 %)		 21,880
(1.35 %)		 47,496
(1.55 %)		 39.81
(99.57 %)		 1,010
(0.43 %)		 147
(100.00 %)		 2,846,063
(18.57 %)		 1,252,362
(3.89 %)		 13,776,063
(46.50 %)		 24,589
(0.78 %)
657 wild Bactrian camel (BCGSAC Cfer 1.0 YT-003-E 2020)
GCF_009834535.1		 70,235
(4.11 %)		 18,202
(1.93 %)		 20,199
(1.66 %)		 42,728
(2.35 %)		 41.66
(99.99 %)		 2,345
(0.01 %)		 2,043
(100.00 %)		 3,091,018
(33.31 %)		 332,720
(5.33 %)		 12,161,286
(28.79 %)		 55,524
(1.75 %)
658 wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 refseq)
GCF_000311805.1		 34,726
(2.40 %)		 18,746
(1.96 %)		 17,104
(1.61 %)		 n/a 41.28
(98.83 %)		 60,971
(1.18 %)		 68,872
(98.82 %)		 2,991,821
(33.93 %)		 353,632
(1.23 %)		 12,349,615
(25.12 %)		 45,437
(1.02 %)
659 wild goat
GCA_000978405.1		 n/a 19,104
(1.48 %)		 16,198
(1.21 %)		 n/a 41.91
(91.72 %)		 279,195
(8.31 %)		 368,693
(91.69 %)		 5,563,294
(45.39 %)		 452,402
(1.99 %)		 13,802,376
(35.47 %)		 41,935
(0.63 %)
660 wild yak (GX-2022 2023)
GCF_027580195.1		 52,505
(2.90 %)		 19,278
(1.60 %)		 20,813
(1.31 %)		 n/a 41.87
(100.00 %)		 196
(0.00 %)		 2,040
(100.00 %)		 5,706,841
(46.71 %)		 464,013
(1.82 %)		 12,973,198
(41.46 %)		 42,508
(1.32 %)
661 wild yak (yakQH1 2013)
GCF_000298355.1		 29,776
(1.92 %)		 19,936
(1.62 %)		 19,914
(1.32 %)		 n/a 41.71
(95.48 %)		 192,006
(4.54 %)		 233,198
(95.46 %)		 5,348,663
(46.08 %)		 449,880
(1.38 %)		 13,572,902
(36.62 %)		 41,147
(0.82 %)
662 woodchuck (v1.1 L192 2022)
GCF_021218885.2		 68,030
(3.47 %)		 19,116
(1.55 %)		 21,017
(1.38 %)		 n/a 39.92
(100.00 %)		 47
(0.00 %)		 3,380
(100.00 %)		 5,285,788
(43.20 %)		 912,552
(2.73 %)		 14,538,866
(35.15 %)		 36,914
(1.02 %)
663 woodland dormouse
GCA_004027655.1		 n/a 23,556
(1.09 %)		 55,517
(1.33 %)		 n/a 41.52
(99.86 %)		 15,691
(0.06 %)		 1,283,630
(99.94 %)		 7,674,195
(34.99 %)		 1,698,258
(3.76 %)		 13,705,886
(42.23 %)		 68,562
(1.41 %)
664 woodland thicket rat
GCF_004785775.1		 43,129
(2.40 %)		 22,710
(2.13 %)		 21,042
(1.49 %)		 n/a 41.17
(98.57 %)		 76,623
(1.44 %)		 23,656
(100.00 %)		 4,732,544
(38.04 %)		 1,424,025
(3.23 %)		 13,549,399
(30.42 %)		 18,232
(0.48 %)
665 woolly hare (The Qinghai-Tibet Plateau SH-2023 2024)
GCA_036325905.1		 n/a 19,363
(1.28 %)		 22,239
(1.28 %)		 n/a 44.08
(100.00 %)		 240
(0.00 %)		 112
(100.00 %)		 4,432,114
(42.23 %)		 966,165
(7.11 %)		 13,263,822
(43.77 %)		 96,755
(2.28 %)
666 Yangtze finless porpoise (v2 wild 2018 refseq)
GCF_003031525.2		 43,297
(2.49 %)		 18,747
(1.81 %)		 19,638
(1.46 %)		 n/a 41.28
(99.29 %)		 52,647
(0.72 %)		 66,343
(99.28 %)		 3,547,466
(35.83 %)		 540,760
(1.65 %)		 12,691,756
(32.88 %)		 59,050
(1.48 %)
667 Yangtze River dolphin (v1.1 BGI 2013 refseq)
GCF_000442215.2		 26,115
(1.61 %)		 18,978
(1.74 %)		 20,661
(1.39 %)		 n/a 41.24
(98.69 %)		 123,788
(1.33 %)		 148,598
(98.67 %)		 3,788,303
(37.04 %)		 690,288
(1.96 %)		 12,841,906
(35.04 %)		 62,458
(1.54 %)
668 yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.1 2019)
GCF_003676075.3		 42,654
(2.16 %)		 19,547
(1.52 %)		 21,406
(1.40 %)		 n/a 39.89
(97.96 %)		 35,509
(2.04 %)		 66,442
(97.96 %)		 3,814,223
(27.39 %)		 800,865
(1.96 %)		 14,323,977
(32.63 %)		 34,122
(0.91 %)
669 yellow-bellied marmot (hap1 2025 refseq)
GCF_047511675.1		 55,299
(2.52 %)		 19,502
(1.44 %)		 20,297
(1.34 %)		 n/a 39.90
(100.00 %)		 330
(0.00 %)		 813
(100.00 %)		 4,038,893
(29.07 %)		 978,915
(3.28 %)		 14,404,633
(34.97 %)		 36,674
(1.05 %)
670 yellow-bellied marmot (hap2 2025)
GCA_047512175.1		 n/a 18,677
(1.51 %)		 19,370
(1.40 %)		 n/a 40.03
(100.00 %)		 307
(0.00 %)		 329
(100.00 %)		 3,694,109
(28.05 %)		 793,102
(2.43 %)		 13,585,913
(33.39 %)		 33,990
(1.02 %)
671 yellow-footed antechinus (v2 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021)
GCF_016432865.1		 47,606
(2.50 %)		 15,703
(0.78 %)		 16,155
(0.90 %)		 n/a 36.21
(99.99 %)		 620
(0.01 %)		 486
(100.00 %)		 5,191,383
(23.81 %)		 1,269,772
(2.59 %)		 21,430,585
(42.69 %)		 28,118
(0.66 %)
672 yellow-spotted hyrax
GCA_004026845.1		 n/a 20,424
(0.86 %)		 43,984
(1.27 %)		 n/a 40.93
(99.94 %)		 3,815
(0.01 %)		 971,748
(99.99 %)		 5,365,974
(31.41 %)		 435,699
(1.22 %)		 21,229,266
(45.17 %)		 38,521
(0.68 %)
673 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 2023)
GCA_028571685.1		 n/a 17,610
(1.00 %)		 20,322
(1.04 %)		 n/a 40.80
(100.00 %)		 276
(0.00 %)		 62
(100.00 %)		 3,295,935
(23.58 %)		 389,907
(6.37 %)		 19,525,382
(45.90 %)		 31,831
(0.63 %)
674 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 alternate hap 2023)
GCA_028571665.1		 n/a 16,320
(1.03 %)		 20,318
(1.13 %)		 n/a 40.93
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 4,169
(100.00 %)		 2,911,332
(23.50 %)		 347,110
(4.57 %)		 17,256,419
(44.04 %)		 28,674
(0.68 %)
675 Yong Hoi Sen's woolly horseshoe bat (Malaysia 20210929_DDd primary hap 2024)
GCA_043880425.1		 n/a 18,352
(1.71 %)		 20,233
(1.46 %)		 n/a 41.73
(100.00 %)		 196
(0.00 %)		 1,530
(100.00 %)		 3,466,695
(41.95 %)		 934,524
(8.81 %)		 11,690,112
(36.30 %)		 35,257
(5.20 %)
676 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP alternate hap 2023)
GCA_028536395.1		 n/a 19,188
(1.79 %)		 21,673
(1.72 %)		 n/a 43.03
(100.00 %)		 215
(0.00 %)		 250
(100.00 %)		 3,043,589
(24.76 %)		 773,853
(4.49 %)		 10,648,494
(37.26 %)		 61,910
(2.52 %)
677 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP primary hap 2023 refseq)
GCF_028538775.1		 48,707
(3.25 %)		 18,807
(1.93 %)		 21,046
(1.76 %)		 n/a 43.22
(100.00 %)		 209
(0.00 %)		 684
(100.00 %)		 3,552,235
(38.46 %)		 719,552
(4.26 %)		 10,089,365
(36.35 %)		 60,974
(2.61 %)
678 zebu cattle (Hainan HN024 2024)
GCA_039881165.1		 n/a 19,162
(1.53 %)		 20,991
(1.34 %)		 n/a 41.77
(99.99 %)		 350
(0.01 %)		 292
(100.00 %)		 3,296,209
(23.14 %)		 440,574
(1.28 %)		 12,824,144
(40.98 %)		 39,400
(1.07 %)
679 zebu cattle (Nelore 2014 refseq)
GCF_000247795.1		 39,817
(2.52 %)		 18,603
(1.59 %)		 18,779
(1.29 %)		 n/a 41.75
(92.62 %)		 6,941,272
(7.66 %)		 253,770
(92.59 %)		 5,119,428
(46.84 %)		 358,908
(0.88 %)		 13,431,672
(36.60 %)		 35,241
(0.84 %)
680 zebu cattle (Sahiwal x Tharparkar maternal NIAB-ARS_2022 2023)
GCF_029378745.1		 70,745
(4.27 %)		 19,546
(1.58 %)		 21,187
(1.33 %)		 n/a 41.86
(100.00 %)		 283
(0.00 %)		 67
(100.00 %)		 5,530,890
(46.61 %)		 459,827
(1.43 %)		 13,190,355
(41.36 %)		 42,544
(1.21 %)
TOTALS:total assembly count 680

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Primates 226 assemblies assembly stats track stats
Mammals 680 assemblies assembly stats track stats
Birds 433 assemblies assembly stats track stats
Fishes 493 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 314 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1173 assemblies assembly stats track stats
Plants 316 assemblies assembly stats track stats
Fungi 921 assemblies assembly stats track stats
Viruses 421 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 123 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 588 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1300 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 96 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 982 assemblies assembly stats track stats