Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of mammals only.

See also: hub accessassembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 aardvark (SDZICR_OR568_19922 2012 Broad)
GCF_000298275.1
25,594
(1.08 %)
18,351
(1.06 %)
20,358
(0.98 %)
n/a 40.07
(76.89 %)
411,144
(23.15 %)
433,653
(76.85 %)
n/a 536,700
(0.74 %)
18,176,790
(39.08 %)
26,235
(0.40 %)
2 African grass rat (maternal 2020)
GCA_011750645.1
n/a 20,916
(2.01 %)
19,513
(1.43 %)
n/a 41.37
(98.89 %)
1,526
(1.11 %)
1,610
(100.00 %)
4,928,847
(37.45 %)
1,652,295
(5.20 %)
13,507,965
(32.27 %)
17,712
(0.51 %)
3 African grass rat (paternal 2020)
GCA_011762545.1
n/a 20,796
(2.00 %)
19,611
(1.43 %)
n/a 41.42
(97.70 %)
1,563
(2.30 %)
1,740
(100.00 %)
4,904,243
(37.25 %)
1,672,608
(5.37 %)
13,465,246
(32.19 %)
17,677
(0.50 %)
4 African grass rat (v1 paternal X 2020 refseq)
GCF_011762505.1
45,963
(2.46 %)
20,878
(1.99 %)
19,613
(1.43 %)
37,929
(2.32 %)
41.39
(99.19 %)
1,624
(0.81 %)
1,595
(100.00 %)
4,939,557
(37.33 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,613,429
(32.71 %)
17,767
(0.51 %)
5 African grass rat (v2 paternal X 2024 genbank)
GCA_011762505.2
n/a 19,637
(1.95 %)
19,610
(1.43 %)
n/a 41.39
(99.19 %)
1,624
(0.81 %)
1,596
(100.00 %)
5,399,465
(42.90 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,613,540
(32.71 %)
17,767
(0.51 %)
6 African grass rat (v2 paternal X 2025 refseq)
GCF_011762505.2
70,837
(3.51 %)
19,640
(1.95 %)
19,607
(1.43 %)
n/a 41.39
(99.19 %)
1,624
(0.81 %)
1,595
(100.00 %)
5,625,390
(42.96 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,612,806
(32.71 %)
17,767
(0.51 %)
7 African grass rat (v3 paternal hap 2024)
GCA_011762505.3
n/a 20,986
(2.01 %)
19,611
(1.43 %)
n/a 41.39
(99.19 %)
1,624
(0.81 %)
1,596
(100.00 %)
4,532,782
(33.95 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,612,916
(32.71 %)
17,767
(0.51 %)
8 African hunting dog
GCA_001887905.1
n/a 18,956
(1.75 %)
17,562
(1.41 %)
n/a 40.98
(92.89 %)
1,415,298
(7.28 %)
803
(100.00 %)
4,458,183
(39.99 %)
658,637
(1.13 %)
13,671,493
(28.24 %)
47,644
(1.64 %)
9 African hunting dog (LycPic1hap1 2024)
GCA_040955645.1
n/a 18,688
(1.61 %)
19,670
(1.44 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
82
(0.00 %)
86
(100.00 %)
4,281,139
(31.62 %)
959,378
(2.78 %)
12,859,760
(32.95 %)
49,122
(2.32 %)
10 African hunting dog (LycPic1hap2 2024)
GCA_040955705.1
n/a 19,463
(1.58 %)
20,378
(1.42 %)
n/a 41.30
(100.00 %)
91
(0.00 %)
77
(100.00 %)
4,513,580
(32.16 %)
1,008,611
(2.91 %)
13,570,452
(33.71 %)
50,954
(2.21 %)
11 African savanna elephant (2009 refseq)
GCF_000001905.1
46,043
(2.30 %)
19,169
(1.26 %)
19,664
(1.10 %)
n/a 40.76
(97.57 %)
93,514
(2.45 %)
95,866
(97.55 %)
6,363,315
(57.54 %)
365,797
(0.88 %)
16,073,053
(44.89 %)
33,513
(0.68 %)
12 African savanna elephant (hap1 mLoxAfr1 2023)
GCA_030020305.1
n/a 18,845
(1.07 %)
22,426
(1.10 %)
n/a 41.34
(99.85 %)
169
(0.15 %)
1,253
(99.85 %)
4,406,744
(29.55 %)
925,868
(4.71 %)
15,966,881
(50.49 %)
68,531
(1.61 %)
13 African savanna elephant (hap2 2023 genbank)
GCA_030014295.1
n/a 18,981
(1.10 %)
22,759
(1.12 %)
n/a 41.25
(99.90 %)
231
(0.10 %)
880
(100.00 %)
4,426,756
(29.95 %)
832,908
(4.08 %)
16,118,910
(49.47 %)
62,315
(1.49 %)
14 African savanna elephant (hap2 2023 refseq)
GCF_030014295.1
64,034
(3.35 %)
18,980
(1.10 %)
21,593
(1.06 %)
n/a 41.25
(99.90 %)
231
(0.10 %)
879
(100.00 %)
4,426,749
(29.95 %)
832,904
(4.08 %)
16,118,888
(49.47 %)
62,314
(1.49 %)
15 agile gracile mouse opossum
GCF_016433145.1
30,697
(1.32 %)
17,361
(0.78 %)
17,596
(0.81 %)
n/a 37.86
(91.75 %)
85,142
(8.25 %)
60,714
(100.00 %)
7,917,577
(49.04 %)
1,054,566
(1.57 %)
22,701,659
(37.69 %)
27,301
(0.49 %)
16 Allen's wood mouse (MVZ Mamm 196246 2021)
GCA_019843855.1
n/a 22,687
(1.16 %)
46,299
(0.94 %)
n/a 41.37
(99.72 %)
75,967
(0.24 %)
659,537
(99.76 %)
6,139,432
(45.57 %)
1,339,550
(3.13 %)
12,293,115
(32.34 %)
16,575
(0.44 %)
17 alpaca (2025)
GCF_048564905.1
80,233
(3.11 %)
18,667
(1.53 %)
23,043
(1.52 %)
n/a 41.92
(99.91 %)
681
(0.09 %)
519
(100.00 %)
3,387,094
(33.34 %)
395,581
(10.22 %)
11,510,740
(36.96 %)
72,497
(1.98 %)
18 alpaca (v3.2 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U)
GCF_000164845.4
54,987
(3.56 %)
18,439
(1.93 %)
18,426
(1.63 %)
n/a 41.40
(95.85 %)
166,272
(4.17 %)
77,389
(100.00 %)
3,004,413
(33.17 %)
315,092
(1.36 %)
12,458,272
(24.89 %)
54,502
(1.38 %)
19 Alpine marmot (2019)
GCF_001458135.2
69,587
(3.43 %)
19,047
(1.54 %)
17,768
(1.39 %)
n/a 39.80
(96.13 %)
88,858
(3.88 %)
14,031
(100.00 %)
3,726,252
(26.48 %)
746,953
(1.83 %)
14,066,368
(30.30 %)
30,191
(0.63 %)
20 Alvarez's mastiff bat (A012 2023)
GCA_031001765.1
n/a 19,086
(1.55 %)
22,040
(1.52 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
1,182
(0.01 %)
1,369
(99.99 %)
3,846,728
(31.78 %)
639,852
(2.90 %)
11,937,936
(38.98 %)
75,377
(2.21 %)
21 Alvarez's mastiff bat (hap1 2024)
GCA_037157525.1
n/a 18,980
(1.50 %)
22,394
(1.50 %)
n/a 42.30
(100.00 %)
80
(0.00 %)
326
(100.00 %)
3,896,863
(31.56 %)
659,711
(4.74 %)
11,945,162
(40.81 %)
76,769
(2.57 %)
22 Alvarez's mastiff bat (hap2 2024)
GCA_037176705.1
n/a 19,066
(1.48 %)
22,356
(1.48 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
75
(0.00 %)
287
(100.00 %)
3,908,607
(31.48 %)
664,931
(5.23 %)
11,892,191
(41.08 %)
76,453
(2.43 %)
23 Amazon manatee (hap1 2025)
GCA_046562985.1
n/a 17,917
(1.26 %)
20,499
(1.11 %)
n/a 40.77
(100.00 %)
377
(0.00 %)
550
(100.00 %)
5,812,915
(56.93 %)
431,488
(2.57 %)
14,336,638
(47.98 %)
33,775
(0.84 %)
24 Amazon manatee (hap2 2025)
GCA_046562895.1
n/a 18,949
(1.23 %)
21,655
(1.08 %)
n/a 40.80
(100.00 %)
294
(0.00 %)
401
(100.00 %)
6,218,266
(57.31 %)
470,437
(3.04 %)
15,241,157
(48.91 %)
37,124
(0.86 %)
25 American beaver (hap1 2025)
GCA_047511655.1
n/a 19,828
(1.45 %)
20,376
(1.31 %)
n/a 39.72
(100.00 %)
181
(0.00 %)
503
(100.00 %)
4,030,880
(35.35 %)
566,770
(2.63 %)
14,198,970
(35.24 %)
24,454
(0.96 %)
26 American beaver (hap2 2025)
GCA_047511605.1
n/a 19,144
(1.44 %)
18,959
(1.23 %)
n/a 39.54
(100.00 %)
194
(0.00 %)
229
(100.00 %)
3,981,637
(35.85 %)
561,691
(2.26 %)
14,374,940
(35.03 %)
23,386
(0.80 %)
27 American beaver (mCasCan1.hap1v2 2025)
GCF_047511655.1
79,343
(3.55 %)
19,759
(1.46 %)
19,920
(1.23 %)
n/a 39.67
(100.00 %)
181
(0.00 %)
181
(100.00 %)
4,023,733
(35.50 %)
563,158
(2.55 %)
14,502,226
(35.45 %)
23,983
(0.89 %)
28 American beaver (Ward 2017 refseq)
GCF_001984765.1
40,013
(2.15 %)
20,867
(1.53 %)
24,201
(1.33 %)
n/a 39.72
(99.99 %)
3,321
(0.01 %)
21,157
(100.00 %)
4,526,430
(33.75 %)
486,353
(1.30 %)
14,347,145
(31.96 %)
23,046
(0.72 %)
29 American bison (2014 refseq)
GCF_000754665.1
38,699
(2.34 %)
19,782
(1.47 %)
20,444
(1.25 %)
n/a 41.82
(93.12 %)
341,984
(6.92 %)
470,415
(93.08 %)
n/a 419,596
(0.95 %)
13,519,877
(37.66 %)
60,388
(1.03 %)
30 American black bear (L20-20 alternate hap 2022)
GCA_024610745.1
n/a 22,502
(1.17 %)
43,431
(1.28 %)
n/a 43.14
(99.99 %)
n/a 77,311
(100.00 %)
4,587,986
(32.30 %)
773,829
(6.39 %)
14,594,034
(35.67 %)
78,849
(3.32 %)
31 American black bear (L20-20 primary hap 2022)
GCA_024610735.1
n/a 18,458
(1.52 %)
21,049
(1.43 %)
n/a 42.93
(100.00 %)
22
(0.00 %)
317
(100.00 %)
4,000,508
(32.69 %)
641,903
(5.91 %)
13,210,530
(35.54 %)
68,981
(3.00 %)
32 American black bear (UA15103 2021)
GCF_020975775.1
53,916
(3.11 %)
18,840
(1.73 %)
20,969
(1.50 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
n/a 2,213
(100.00 %)
3,936,528
(34.53 %)
594,864
(2.90 %)
13,725,005
(32.35 %)
62,580
(1.91 %)
33 American mink (2018)
GCA_900108605.1
n/a 18,686
(1.70 %)
20,016
(1.50 %)
36,997
(1.74 %)
41.60
(92.95 %)
154,172
(7.07 %)
161,347
(92.93 %)
4,350,343
(38.70 %)
606,128
(1.17 %)
13,605,797
(28.74 %)
54,199
(1.98 %)
34 American mink (hap1 2024)
GCA_964106545.1
n/a 19,203
(1.43 %)
22,174
(1.33 %)
n/a 42.39
(99.98 %)
2,957
(0.02 %)
435
(100.00 %)
4,188,829
(30.04 %)
802,295
(5.81 %)
14,041,290
(37.98 %)
65,430
(2.64 %)
35 American mink (hap2 2024)
GCA_964106205.1
n/a 18,890
(1.43 %)
21,684
(1.33 %)
n/a 42.35
(99.98 %)
2,849
(0.02 %)
3,200
(99.98 %)
4,158,563
(30.22 %)
786,430
(5.25 %)
13,845,377
(37.58 %)
64,307
(2.75 %)
36 American mink (M4711 2021 Dalhousie U)
GCF_020171115.1
50,253
(2.26 %)
18,949
(1.49 %)
20,914
(1.29 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
n/a 183
(100.00 %)
4,705,680
(39.15 %)
795,684
(5.50 %)
14,085,357
(37.99 %)
63,307
(2.38 %)
37 American pika (hap1 2023)
GCF_030435755.1
45,008
(1.93 %)
17,997
(1.35 %)
23,185
(1.49 %)
n/a 44.16
(100.00 %)
432
(0.00 %)
5,864
(100.00 %)
4,126,248
(43.60 %)
628,344
(15.71 %)
11,100,962
(42.69 %)
60,350
(1.67 %)
38 American pika (hap2 2023)
GCA_030435715.1
n/a 16,911
(1.23 %)
21,107
(1.43 %)
n/a 44.43
(100.00 %)
375
(0.00 %)
6,123
(100.00 %)
1,808,768
(10.42 %)
561,106
(21.05 %)
10,283,513
(45.97 %)
54,919
(1.33 %)
39 American pika 3.0 (2012 Broad refseq)
GCF_000292845.1
26,240
(1.93 %)
17,576
(1.61 %)
20,076
(1.70 %)
n/a 43.35
(87.20 %)
122,542
(12.82 %)
132,962
(87.18 %)
2,761,257
(29.47 %)
414,896
(1.07 %)
10,968,698
(26.71 %)
44,652
(1.14 %)
40 American pika 4.0 (UAM:Mamm:113957 2020)
GCF_014633375.1
31,887
(1.92 %)
17,532
(1.60 %)
19,609
(1.65 %)
n/a 43.35
(87.14 %)
124,941
(12.88 %)
9,351
(100.00 %)
2,827,662
(29.77 %)
414,980
(1.07 %)
10,969,165
(26.69 %)
44,743
(1.13 %)
41 American wolverine (FN33715 2022)
GCA_024509225.1
n/a 18,360
(1.57 %)
20,615
(1.47 %)
n/a 41.70
(100.00 %)
53
(0.00 %)
758
(100.00 %)
4,038,995
(32.25 %)
664,825
(1.25 %)
13,625,080
(33.05 %)
56,595
(2.13 %)
42 Amur tiger (TaeGuk 2013 refseq)
GCF_000464555.1
33,681
(2.23 %)
17,929
(1.49 %)
15,090
(1.29 %)
n/a 41.40
(97.59 %)
155,553
(2.44 %)
157,032
(97.56 %)
n/a 831,136
(1.67 %)
13,654,437
(31.78 %)
65,229
(1.60 %)
43 Angolan free-tailed bat (Cote d'Ivoire 20210831_DDa 2024)
GCA_043748645.1
n/a 18,528
(1.65 %)
22,359
(1.64 %)
n/a 42.89
(100.00 %)
88
(0.00 %)
44
(100.00 %)
3,531,044
(35.70 %)
555,304
(2.07 %)
11,439,853
(36.03 %)
102,112
(3.75 %)
44 Angus cow (Angus x Brahman F1 Angus haplotype 2018)
GCA_003369685.2
n/a 19,096
(1.59 %)
20,674
(1.34 %)
n/a 41.99
(99.75 %)
277
(0.25 %)
1,435
(100.00 %)
5,290,422
(47.51 %)
478,946
(1.94 %)
12,568,313
(41.15 %)
45,850
(1.37 %)
45 Antarctic minke whale
GCA_000978805.1
n/a 23,312
(1.49 %)
45,535
(1.26 %)
n/a 40.73
(99.37 %)
299,456
(0.64 %)
720,900
(99.36 %)
4,011,313
(41.13 %)
504,837
(1.04 %)
13,553,641
(30.96 %)
56,223
(1.31 %)
46 Antillean ghost-faced bat
GCA_004026545.1
n/a 20,088
(1.74 %)
31,558
(1.63 %)
n/a 41.74
(99.97 %)
1,835
(0.01 %)
207,094
(99.99 %)
3,025,044
(30.67 %)
332,606
(0.70 %)
12,504,556
(28.79 %)
65,503
(2.30 %)
47 aoudad
GCA_002201775.1
n/a 19,905
(1.62 %)
27,488
(1.60 %)
n/a 42.01
(95.96 %)
186,672
(4.05 %)
263,992
(95.95 %)
5,418,013
(45.05 %)
471,426
(1.19 %)
13,396,252
(36.94 %)
48,844
(1.32 %)
48 Arabian camel (Drom800 2019 refseq)
GCF_000803125.2
64,532
(3.85 %)
18,483
(1.89 %)
20,554
(1.62 %)
n/a 41.51
(99.22 %)
47,342
(0.79 %)
21,070
(100.00 %)
3,233,022
(34.07 %)
345,049
(1.55 %)
13,383,050
(26.19 %)
58,872
(1.79 %)
49 Arabian camel (hap2 2024)
GCA_036321565.1
n/a 17,085
(1.73 %)
19,317
(1.59 %)
n/a 41.75
(100.00 %)
210
(0.00 %)
173
(100.00 %)
2,818,446
(29.44 %)
316,646
(8.90 %)
11,192,133
(31.47 %)
52,135
(1.67 %)
50 Arabian camel (paternal hap 2024 genbank)
GCA_036321535.1
n/a 18,080
(1.66 %)
20,345
(1.52 %)
n/a 41.64
(100.00 %)
195
(0.00 %)
172
(100.00 %)
3,040,473
(29.22 %)
343,482
(10.93 %)
11,797,012
(33.50 %)
55,428
(1.61 %)
51 Arabian camel (paternal hap 2024 refseq)
GCF_036321535.1
62,940
(3.46 %)
18,078
(1.66 %)
21,071
(1.56 %)
n/a 41.64
(100.00 %)
195
(0.00 %)
171
(100.00 %)
3,040,467
(29.22 %)
343,480
(10.93 %)
11,796,955
(33.50 %)
55,427
(1.61 %)
52 Arctic fox (Blue_001 2021 refseq)
GCF_018345385.1
60,759
(3.11 %)
19,942
(1.72 %)
19,529
(1.38 %)
n/a 41.27
(100.00 %)
529
(0.00 %)
929
(100.00 %)
4,821,229
(41.22 %)
1,006,124
(2.31 %)
13,556,149
(32.92 %)
49,997
(2.23 %)
53 Arctic ground squirrel (AGS 11-09-20 2018)
GCF_003426925.1
39,569
(2.25 %)
18,954
(1.74 %)
19,372
(1.45 %)
n/a 39.95
(89.51 %)
2,429,461
(10.59 %)
15,883
(100.00 %)
4,400,304
(32.67 %)
672,831
(1.50 %)
13,913,477
(26.41 %)
27,575
(0.72 %)
54 Arctic ground squirrel (hap1 2024)
GCA_045843805.1
n/a 20,255
(1.35 %)
21,401
(1.44 %)
n/a 40.08
(100.00 %)
694
(0.00 %)
2,530
(100.00 %)
4,287,108
(25.85 %)
895,123
(5.96 %)
15,722,314
(36.45 %)
34,781
(0.82 %)
55 Arctic ground squirrel (hap2 2024)
GCA_045843765.1
n/a 18,385
(1.31 %)
19,099
(1.34 %)
n/a 39.97
(100.00 %)
590
(0.00 %)
2,307
(100.00 %)
4,314,945
(35.63 %)
820,736
(6.65 %)
14,490,422
(35.95 %)
31,201
(0.78 %)
56 Asian palm civet
GCA_004024585.1
n/a 22,124
(1.43 %)
43,710
(1.39 %)
n/a 42.52
(99.95 %)
4,533
(0.02 %)
442,658
(99.98 %)
4,877,367
(40.32 %)
754,440
(1.35 %)
14,557,779
(32.29 %)
148,246
(5.67 %)
57 Asiatic elephant (mEleMax1 alternate hap 2022)
GCA_024166345.1
n/a 17,906
(1.18 %)
21,966
(1.14 %)
n/a 41.14
(100.00 %)
n/a 6,361
(100.00 %)
3,818,524
(29.72 %)
533,426
(3.22 %)
14,381,781
(47.30 %)
50,264
(1.15 %)
58 Asiatic elephant (mEleMax1 primary hap 2022)
GCF_024166365.1
61,202
(2.60 %)
18,887
(1.13 %)
21,194
(1.06 %)
n/a 41.14
(99.90 %)
126
(0.10 %)
64
(100.00 %)
4,358,470
(31.27 %)
663,094
(4.56 %)
16,261,778
(48.66 %)
69,120
(1.32 %)
59 Asiatic mouflon (Amuf_v1 2020)
GCA_014523465.1
n/a 19,569
(1.59 %)
21,293
(1.35 %)
n/a 41.97
(99.68 %)
257
(0.32 %)
128
(100.00 %)
5,390,761
(47.15 %)
451,837
(1.15 %)
13,157,608
(40.67 %)
44,158
(1.19 %)
60 Asiatic tapir (hap1 2023)
GCA_031878655.1
n/a 18,969
(1.75 %)
20,207
(1.36 %)
n/a 41.25
(100.00 %)
79
(0.00 %)
262
(100.00 %)
3,650,963
(38.06 %)
355,322
(2.63 %)
14,837,952
(31.37 %)
37,174
(1.87 %)
61 Asiatic tapir (hap2 2023)
GCA_031878705.1
n/a 18,931
(1.76 %)
19,988
(1.37 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
92
(0.00 %)
193
(100.00 %)
3,632,286
(38.21 %)
350,074
(2.22 %)
14,785,531
(30.90 %)
36,699
(1.70 %)
62 ass (Dezhou 2021)
GCF_016077325.2
84,046
(4.01 %)
18,838
(1.75 %)
20,239
(1.42 %)
69,689
(3.29 %)
41.42
(99.86 %)
1,922
(0.15 %)
50
(100.00 %)
3,840,509
(41.57 %)
319,943
(0.81 %)
14,889,114
(29.46 %)
41,082
(1.37 %)
63 ass (Donkey D_3611 2024)
GCF_041296235.1
92,510
(3.84 %)
18,566
(1.54 %)
21,504
(1.32 %)
n/a 42.37
(99.94 %)
7
(0.06 %)
849
(100.00 %)
3,555,052
(38.38 %)
658,645
(5.79 %)
14,242,715
(36.79 %)
43,875
(3.45 %)
64 ass (Maral har 2015 refseq)
GCF_001305755.1
48,976
(3.12 %)
18,838
(1.78 %)
19,295
(1.44 %)
n/a 41.28
(98.63 %)
69,593
(1.38 %)
2,167
(100.00 %)
3,731,432
(40.84 %)
289,737
(0.96 %)
14,695,308
(28.58 %)
40,025
(1.06 %)
65 Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap1.1 2024)
GCA_964270905.1
n/a 18,773
(1.50 %)
21,069
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
1,034
(0.01 %)
900
(100.00 %)
3,975,427
(35.64 %)
1,054,000
(10.27 %)
12,281,095
(41.92 %)
79,762
(4.08 %)
66 Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap2.1 2024)
GCA_964270935.1
n/a 17,961
(1.59 %)
20,087
(1.36 %)
n/a 42.05
(99.99 %)
917
(0.01 %)
1,796
(99.99 %)
3,626,392
(35.51 %)
824,778
(7.32 %)
11,499,904
(39.18 %)
74,348
(3.46 %)
67 Australian echidna (mTacAcu1 alternate hap 2020)
GCA_015852515.1
n/a 13,505
(1.03 %)
18,978
(1.47 %)
n/a 45.32
(99.98 %)
26
(0.02 %)
3,482
(100.00 %)
6,880,857
(41.88 %)
1,099,932
(7.47 %)
8,156,735
(56.68 %)
70,515
(2.88 %)
68 Australian echidna (mTacAcu1 primary hap 2020)
GCF_015852505.1
42,938
(2.28 %)
14,891
(1.01 %)
19,714
(1.45 %)
n/a 45.30
(98.61 %)
524
(1.39 %)
310
(100.00 %)
7,814,876
(42.89 %)
1,219,764
(6.93 %)
9,488,325
(55.68 %)
78,364
(2.73 %)
69 Bactrian camel (Alxa 2014 refseq)
GCF_000767855.1
52,191
(3.64 %)
18,303
(1.98 %)
17,097
(1.64 %)
n/a 41.32
(99.32 %)
31,980
(0.69 %)
67,435
(99.31 %)
2,966,704
(34.06 %)
306,997
(0.95 %)
12,209,949
(25.43 %)
49,790
(1.25 %)
70 Bactrian camel YW-2024 2025
GCF_048773025.1
76,927
(4.47 %)
18,239
(1.57 %)
22,111
(1.51 %)
n/a 41.95
(100.00 %)
127
(0.00 %)
158
(100.00 %)
3,258,307
(30.21 %)
377,352
(13.70 %)
11,533,205
(36.22 %)
65,887
(1.95 %)
71 banded mongoose
GCA_004023785.1
n/a 21,568
(1.57 %)
30,427
(1.43 %)
n/a 42.00
(99.96 %)
4,510
(0.02 %)
316,874
(99.98 %)
4,768,524
(40.51 %)
684,187
(1.30 %)
13,713,756
(33.42 %)
78,648
(2.80 %)
72 bank vole
GCF_902806735.1
56,423
(2.99 %)
18,977
(1.71 %)
18,408
(1.50 %)
n/a 41.86
(98.62 %)
53,506
(1.39 %)
54,142
(98.61 %)
3,222,366
(21.59 %)
933,697
(2.20 %)
12,831,232
(31.50 %)
18,784
(0.42 %)
73 banner-tailed kangaroo rat
GCF_019054845.1
43,753
(1.82 %)
18,397
(1.18 %)
24,180
(1.39 %)
n/a 40.83
(100.00 %)
n/a 2,026
(100.00 %)
5,587,719
(30.97 %)
1,363,513
(3.95 %)
12,128,920
(48.74 %)
36,371
(1.27 %)
74 banteng 2023
GCF_032452875.1
71,974
(3.56 %)
19,305
(1.36 %)
21,174
(1.20 %)
n/a 42.79
(100.00 %)
84
(0.00 %)
1,518
(100.00 %)
3,344,481
(20.63 %)
1,039,571
(11.74 %)
13,031,356
(47.36 %)
73,031
(1.72 %)
75 bat A.intermedius (hap2 2024)
GCA_038363225.1
n/a 17,124
(1.63 %)
18,342
(1.54 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
56
(0.00 %)
187
(100.00 %)
2,597,378
(26.81 %)
332,733
(4.43 %)
10,957,327
(33.52 %)
63,688
(2.22 %)
76 bat H.larvatus (China 20210929_DDb primary hap 2024)
GCA_043727955.1
n/a 19,354
(1.74 %)
21,367
(1.51 %)
n/a 41.48
(100.00 %)
190
(0.00 %)
265
(100.00 %)
3,860,506
(38.95 %)
722,335
(7.13 %)
11,994,816
(35.77 %)
44,562
(1.21 %)
77 beluga whale (Cook Inlet, Alaska, USA DL-CIB17-05 2020)
GCA_009917745.1
n/a 19,239
(1.79 %)
22,513
(1.43 %)
35,878
(1.82 %)
41.25
(97.57 %)
27,070
(2.43 %)
52,780
(97.57 %)
4,021,599
(43.53 %)
544,323
(1.08 %)
12,738,162
(33.47 %)
59,710
(1.51 %)
78 beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v3 2019)
GCF_002288925.2
59,413
(3.09 %)
18,667
(1.79 %)
20,314
(1.43 %)
n/a 41.24
(98.49 %)
24,414
(1.52 %)
29,444
(98.48 %)
4,001,248
(43.73 %)
543,276
(1.11 %)
12,802,735
(34.18 %)
59,307
(1.53 %)
79 big brown bat (BU_THK_EF1 2012)
GCF_000308155.1
59,162
(3.17 %)
18,334
(1.94 %)
20,121
(1.78 %)
n/a 42.93
(89.41 %)
160,269
(10.62 %)
167,057
(89.38 %)
2,842,065
(25.82 %)
614,712
(1.89 %)
10,407,733
(28.90 %)
66,720
(2.99 %)
80 big brown bat (TK198812 2023)
GCF_027574615.1
46,266
(2.61 %)
18,620
(1.80 %)
21,271
(1.72 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
75
(0.00 %)
48
(100.00 %)
3,041,145
(25.08 %)
904,075
(3.80 %)
10,530,666
(37.05 %)
77,605
(3.68 %)
81 bighorn sheep (BS48 2019)
GCA_004026945.1
n/a 23,059
(1.34 %)
36,486
(1.19 %)
n/a 43.20
(99.90 %)
9,412
(0.03 %)
1,057,548
(99.97 %)
6,321,577
(50.75 %)
716,846
(1.66 %)
13,904,326
(44.98 %)
95,564
(1.72 %)
82 bighorn sheep (v2 Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024)
GCF_042477335.2
78,636
(2.63 %)
19,459
(1.36 %)
21,150
(1.33 %)
n/a 43.91
(100.00 %)
3
(0.00 %)
42
(100.00 %)
3,963,383
(22.89 %)
826,353
(11.67 %)
12,918,743
(46.86 %)
52,254
(10.67 %)
83 bilby (mMagLag1 2024)
GCA_037893015.1
n/a 18,686
(0.72 %)
17,238
(0.81 %)
n/a 37.35
(99.66 %)
4,431
(0.34 %)
609
(100.00 %)
6,263,094
(27.34 %)
2,223,995
(5.89 %)
23,994,844
(43.69 %)
51,039
(3.47 %)
84 bilby (mMagLag1 2024)
GCF_037893015.1
60,460
(3.10 %)
18,687
(0.72 %)
17,229
(0.81 %)
n/a 37.35
(99.66 %)
4,431
(0.34 %)
608
(100.00 %)
6,299,949
(27.49 %)
2,223,987
(5.89 %)
23,992,536
(43.69 %)
51,039
(3.47 %)
85 black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap1 2024)
GCA_043290085.1
n/a 20,713
(0.64 %)
21,469
(0.64 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
770
(0.00 %)
470
(100.00 %)
3,860,121
(14.52 %)
1,230,113
(2.81 %)
21,600,460
(65.53 %)
49,878
(0.73 %)
86 black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap2 2024)
GCA_043290065.1
n/a 19,814
(0.63 %)
20,140
(0.63 %)
n/a 41.82
(100.00 %)
723
(0.00 %)
315
(100.00 %)
3,657,357
(14.24 %)
1,158,716
(2.84 %)
22,924,986
(64.53 %)
46,774
(0.90 %)
87 black flying fox
GCF_000325575.1
46,991
(3.15 %)
18,089
(2.00 %)
20,668
(1.75 %)
n/a 39.74
(97.93 %)
104,566
(2.08 %)
170,164
(97.92 %)
2,975,186
(34.05 %)
481,859
(1.45 %)
12,582,349
(26.52 %)
62,483
(3.88 %)
88 black rat
GCF_011064425.1
39,601
(2.37 %)
20,793
(1.98 %)
17,944
(1.37 %)
n/a 42.14
(99.98 %)
6,158
(0.02 %)
2,173
(100.00 %)
4,715,157
(41.57 %)
1,432,294
(3.45 %)
13,275,550
(32.36 %)
18,055
(0.48 %)
89 black rhinoceros (alternate hap 2021)
GCA_020826835.1
n/a 19,000
(1.37 %)
22,547
(1.26 %)
n/a 41.56
(99.97 %)
178
(0.03 %)
1,199
(100.00 %)
4,340,245
(37.22 %)
564,468
(8.07 %)
14,384,523
(40.40 %)
44,971
(1.16 %)
90 black rhinoceros (BS38 2019 Broad)
GCA_004027315.1
n/a 21,713
(1.32 %)
32,731
(1.18 %)
n/a 41.22
(99.85 %)
7,256
(0.02 %)
2,029,914
(99.98 %)
4,618,655
(36.76 %)
618,834
(2.21 %)
16,248,532
(40.32 %)
44,113
(0.97 %)
91 black rhinoceros (primary hap 2021 refseq)
GCF_020826845.1
56,268
(2.28 %)
18,774
(1.38 %)
22,348
(1.26 %)
n/a 41.59
(99.95 %)
215
(0.05 %)
1,076
(100.00 %)
4,200,390
(36.22 %)
548,030
(8.34 %)
14,347,693
(40.14 %)
43,525
(1.14 %)
92 black-footed cat
GCA_004023925.1
n/a 22,895
(1.14 %)
51,789
(1.13 %)
n/a 41.92
(99.90 %)
13,476
(0.06 %)
603,600
(99.94 %)
5,261,265
(44.11 %)
943,514
(1.77 %)
13,681,435
(34.77 %)
86,892
(2.23 %)
93 black-footed ferret (SB6536 2022)
GCF_022355385.1
56,415
(2.78 %)
18,681
(1.55 %)
20,685
(1.40 %)
n/a 41.55
(96.71 %)
33,042
(3.30 %)
20,575
(100.00 %)
4,087,717
(30.94 %)
695,805
(1.18 %)
13,880,116
(32.08 %)
54,060
(2.11 %)
94 black-lipped pika
GCF_017591425.1
46,297
(2.64 %)
18,529
(1.63 %)
23,458
(1.83 %)
n/a 43.71
(100.00 %)
54
(0.00 %)
2,214
(100.00 %)
1,843,705
(12.62 %)
471,798
(2.76 %)
11,394,992
(31.27 %)
63,124
(1.85 %)
95 Blainville's beaked whale (alternate hap 2022)
GCA_025094165.1
n/a 17,838
(1.54 %)
21,389
(1.35 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
1
(0.00 %)
5,198
(100.00 %)
3,542,727
(35.35 %)
650,369
(8.86 %)
10,971,320
(41.15 %)
62,389
(1.68 %)
96 Blainville's beaked whale (primary hap 2022 refseq)
GCF_025265405.1
47,553
(2.07 %)
19,041
(1.52 %)
20,766
(1.27 %)
n/a 41.70
(99.97 %)
97
(0.03 %)
74
(100.00 %)
3,964,038
(35.29 %)
765,957
(8.74 %)
12,128,229
(41.78 %)
70,851
(1.80 %)
97 blue whale (alternate hap JJ_BM4_2016_0621 2019)
GCA_008658375.1
n/a 17,285
(1.80 %)
21,295
(1.43 %)
n/a 41.22
(100.00 %)
n/a 12,574
(100.00 %)
3,196,354
(43.47 %)
467,194
(1.26 %)
10,176,588
(33.66 %)
56,916
(1.85 %)
98 Blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 alternate hap 2020)
GCA_008658375.2
n/a 16,997
(1.82 %)
20,609
(1.44 %)
n/a 41.20
(100.00 %)
3
(0.00 %)
10,999
(100.00 %)
3,126,800
(43.49 %)
454,452
(1.23 %)
9,916,868
(33.63 %)
55,436
(1.85 %)
99 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v3 primary hap 2020)
GCF_009873245.2
58,737
(2.71 %)
19,162
(1.80 %)
20,576
(1.41 %)
36,291
(1.99 %)
40.88
(98.91 %)
886
(1.09 %)
106
(100.00 %)
3,986,870
(44.21 %)
579,629
(1.22 %)
12,858,384
(34.60 %)
67,032
(1.73 %)
100 bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 alternate hap 2022)
GCA_022079275.1
n/a 24,877
(1.23 %)
48,382
(1.39 %)
n/a 42.05
(99.98 %)
4,716
(0.01 %)
72,827
(99.99 %)
6,403,412
(33.31 %)
1,269,531
(1.94 %)
17,771,689
(33.82 %)
100,915
(3.00 %)
101 bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 primary hap 2022)
GCF_022079265.1
45,417
(2.39 %)
18,576
(1.65 %)
20,510
(1.41 %)
n/a 41.80
(100.00 %)
24
(0.00 %)
75
(100.00 %)
4,970,082
(43.28 %)
894,002
(1.80 %)
13,648,384
(34.21 %)
69,211
(2.68 %)
102 boreal woodland reindeer (boreal CA-31 2023)
GCA_019903745.2
n/a 20,135
(1.60 %)
22,598
(1.47 %)
n/a 41.46
(96.98 %)
34,682
(3.03 %)
12,266
(100.00 %)
3,134,107
(24.41 %)
394,920
(0.92 %)
13,154,929
(36.43 %)
48,826
(1.07 %)
103 Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 alternate hap 2022)
GCA_024803775.1
n/a 18,647
(0.96 %)
23,998
(1.13 %)
n/a 41.67
(100.00 %)
124
(0.00 %)
3,340
(100.00 %)
3,775,862
(22.40 %)
1,257,803
(21.71 %)
9,347,543
(61.85 %)
33,757
(1.35 %)
104 Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 primary hap 2022)
GCA_024803745.1
n/a 17,791
(1.12 %)
22,667
(1.29 %)
n/a 41.66
(100.00 %)
106
(0.00 %)
2,898
(100.00 %)
6,293,452
(41.30 %)
1,076,688
(17.94 %)
8,553,272
(57.13 %)
31,102
(1.31 %)
105 Botta's pocket gopher (hap1 2023)
GCA_031878675.1
n/a 18,247
(1.61 %)
22,673
(1.83 %)
n/a 41.12
(99.99 %)
775
(0.01 %)
835
(100.00 %)
2,918,285
(18.64 %)
868,090
(5.77 %)
9,427,604
(40.78 %)
27,049
(1.25 %)
106 Botta's pocket gopher (hap2 2023)
GCA_031878665.1
n/a 17,612
(1.68 %)
22,099
(1.91 %)
n/a 41.23
(99.99 %)
541
(0.01 %)
365
(100.00 %)
2,748,918
(17.16 %)
827,542
(4.51 %)
8,832,809
(39.20 %)
26,416
(1.35 %)
107 boutu (hap1 2024)
GCA_036417435.1
n/a 18,667
(1.46 %)
20,817
(1.26 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
284
(0.00 %)
903
(100.00 %)
4,004,895
(35.23 %)
925,158
(12.15 %)
11,999,784
(42.65 %)
63,428
(1.55 %)
108 boutu (hap2 2024)
GCA_036417475.1
n/a 17,954
(1.51 %)
19,994
(1.30 %)
n/a 42.02
(100.00 %)
240
(0.00 %)
800
(100.00 %)
3,723,164
(34.96 %)
809,880
(11.02 %)
11,359,211
(41.42 %)
60,067
(1.55 %)
109 Brahman cow (Angus x Brahman F1 Brahman haplotype 2018)
GCF_003369695.1
63,234
(2.88 %)
19,601
(1.57 %)
21,699
(1.34 %)
n/a 41.83
(99.94 %)
302
(0.06 %)
1,250
(100.00 %)
5,524,454
(47.57 %)
459,928
(1.40 %)
13,208,799
(41.21 %)
41,359
(1.10 %)
110 Brandt's bat
GCF_000412655.1
46,912
(2.84 %)
19,267
(1.75 %)
18,495
(1.62 %)
n/a 42.59
(94.06 %)
155,664
(5.95 %)
325,414
(94.05 %)
2,897,662
(25.08 %)
634,208
(3.20 %)
11,323,618
(31.06 %)
66,749
(1.59 %)
111 Brazilian free-tailed bat (primary hap 2023)
GCA_030848825.1
n/a 19,039
(1.66 %)
21,660
(1.59 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
20
(0.00 %)
148
(100.00 %)
3,805,818
(31.80 %)
640,446
(2.50 %)
11,793,353
(36.15 %)
68,896
(2.40 %)
112 Brazilian guinea pig
GCA_000688575.1
n/a 16,531
(1.49 %)
11,177
(1.44 %)
n/a 39.81
(64.76 %)
2,565,595
(35.61 %)
3,131
(100.00 %)
2,529,479
(25.87 %)
342,907
(0.66 %)
10,719,517
(21.05 %)
19,508
(0.31 %)
113 Brazilian tapir
GCA_004025025.1
n/a 21,581
(1.61 %)
30,818
(1.32 %)
n/a 41.12
(99.93 %)
2,273
(0.01 %)
805,779
(99.99 %)
3,877,938
(38.36 %)
344,032
(0.79 %)
15,601,710
(32.81 %)
43,382
(1.17 %)
114 brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v2 2018)
GCF_003584765.2
50,229
(2.92 %)
18,811
(1.77 %)
21,073
(1.52 %)
n/a 41.84
(99.31 %)
17,380
(0.70 %)
21,813
(99.30 %)
4,201,043
(40.86 %)
567,586
(1.23 %)
13,807,211
(30.86 %)
62,125
(1.80 %)
115 brown bear (v2.0 North America Adak 2023)
GCF_023065955.2
66,371
(4.20 %)
18,615
(1.68 %)
21,434
(1.53 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
250
(0.00 %)
362
(100.00 %)
4,030,019
(33.22 %)
630,008
(4.17 %)
13,240,060
(32.92 %)
64,814
(2.05 %)
116 brown big-eared bat (primary hap 2023)
GCA_963455305.1
n/a 19,138
(1.72 %)
20,370
(1.54 %)
n/a 43.08
(99.99 %)
1,237
(0.01 %)
65
(100.00 %)
3,201,470
(26.24 %)
957,903
(4.27 %)
10,687,995
(39.65 %)
60,671
(2.39 %)
117 brown-throated sloth
GCA_004027775.1
n/a 17,043
(1.21 %)
37,090
(1.36 %)
n/a 42.76
(99.76 %)
462
(0.00 %)
1,772,267
(100.00 %)
2,487,215
(36.18 %)
316,812
(1.60 %)
7,948,666
(37.96 %)
62,325
(2.36 %)
118 cactus mouse (2023)
GCF_949786415.1
47,537
(2.02 %)
18,894
(1.46 %)
20,159
(1.22 %)
n/a 42.40
(99.98 %)
2,603
(0.02 %)
4,297
(100.00 %)
7,181,232
(52.75 %)
1,247,378
(18.35 %)
13,329,318
(43.03 %)
19,540
(0.49 %)
119 California mouse (IS 2022)
GCF_007827085.1
62,273
(3.80 %)
18,959
(1.75 %)
19,378
(1.41 %)
n/a 42.21
(100.00 %)
547
(0.00 %)
237
(100.00 %)
5,970,582
(45.08 %)
1,165,743
(3.67 %)
13,734,349
(33.67 %)
19,529
(0.58 %)
120 California sea lion (alternate hap 2019)
GCA_009762295.1
n/a 18,348
(1.81 %)
18,692
(1.47 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
n/a 3,093
(100.00 %)
3,722,619
(42.89 %)
488,086
(1.26 %)
10,893,132
(33.14 %)
44,449
(1.57 %)
121 California sea lion (LMU 2018 refseq)
GCF_900631625.1
69,240
(2.99 %)
20,741
(1.78 %)
20,298
(1.40 %)
n/a 41.38
(99.81 %)
47,716
(0.20 %)
10,423
(100.00 %)
4,530,259
(43.28 %)
573,086
(1.12 %)
13,442,336
(33.58 %)
50,583
(1.46 %)
122 California sea lion (mZalCal1 alternate hap 2020)
GCA_009762295.2
n/a 18,319
(1.81 %)
18,772
(1.48 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
n/a 3,096
(100.00 %)
3,724,021
(42.91 %)
488,356
(1.26 %)
10,891,276
(33.15 %)
44,467
(1.57 %)
123 California sea lion (v2 primary hap 2020)
GCF_009762305.2
70,801
(3.05 %)
20,915
(1.77 %)
20,179
(1.40 %)
44,926
(2.10 %)
41.40
(99.23 %)
185
(0.77 %)
47
(100.00 %)
4,525,652
(43.65 %)
590,246
(1.24 %)
13,263,648
(33.76 %)
51,899
(1.50 %)
124 California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 alternate hap 2023)
GCA_028537755.1
n/a 19,409
(1.86 %)
20,578
(1.69 %)
n/a 42.43
(100.00 %)
43
(0.00 %)
310
(100.00 %)
3,161,054
(22.60 %)
891,453
(5.62 %)
11,087,206
(33.12 %)
19,104
(0.65 %)
125 California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 primary hap 2023)
GCA_028537955.1
n/a 19,681
(1.86 %)
21,257
(1.62 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
51
(0.00 %)
350
(100.00 %)
4,957,057
(42.33 %)
943,226
(5.63 %)
11,695,871
(33.83 %)
20,062
(0.64 %)
126 Canada lynx (alternate hap LIC74 2019)
GCA_007474575.1
n/a 12,029
(1.42 %)
15,171
(1.16 %)
n/a 41.46
(100.00 %)
3
(0.00 %)
15,036
(100.00 %)
2,937,491
(43.50 %)
544,410
(1.76 %)
7,641,565
(32.72 %)
39,082
(2.44 %)
127 Canada lynx (LIC74 v2 alternate hap 2020)
GCA_007474575.2
n/a 12,041
(1.42 %)
15,226
(1.16 %)
n/a 41.46
(100.00 %)
5
(0.00 %)
15,046
(100.00 %)
2,939,291
(43.50 %)
544,849
(1.76 %)
7,650,345
(32.74 %)
39,099
(2.44 %)
128 Canada lynx (LIC74 v2 primary hap 2020)
GCF_007474595.2
50,142
(2.69 %)
18,273
(1.65 %)
19,264
(1.35 %)
n/a 41.70
(99.88 %)
842
(0.12 %)
54
(100.00 %)
5,011,165
(43.72 %)
904,525
(1.75 %)
13,467,551
(34.19 %)
66,799
(2.48 %)
129 Cantor's roundleaf bat
GCA_004027415.1
n/a 23,788
(1.42 %)
45,328
(1.68 %)
38,254
(1.57 %)
41.36
(99.91 %)
6,366
(0.03 %)
846,566
(99.97 %)
3,997,370
(31.48 %)
775,742
(1.42 %)
12,770,948
(33.45 %)
41,527
(1.41 %)
130 Cape elephant shrew
GCF_000299155.1
25,406
(1.08 %)
23,258
(1.07 %)
24,266
(1.16 %)
n/a 40.30
(86.29 %)
279,394
(13.74 %)
288,162
(86.26 %)
3,765,232
(16.90 %)
604,351
(0.89 %)
20,072,078
(42.36 %)
25,977
(0.42 %)
131 Cape golden mole (2012 Broad)
GCF_000296735.1
25,323
(1.07 %)
20,961
(1.07 %)
21,723
(1.04 %)
n/a 40.01
(79.93 %)
370,844
(20.11 %)
391,344
(79.89 %)
4,924,640
(21.03 %)
500,830
(1.95 %)
18,946,663
(41.18 %)
21,186
(0.33 %)
132 Cape rock hyrax (Dallas Zoo Isis #01D731 2014)
GCA_000152225.2
n/a 18,455
(1.10 %)
22,103
(1.12 %)
n/a 41.00
(88.89 %)
259,879
(11.14 %)
325,568
(88.86 %)
6,210,235
(51.92 %)
381,915
(1.06 %)
20,080,212
(36.28 %)
29,690
(0.50 %)
133 Cape rock hyrax (US060 2019 Broad)
GCA_004026925.1
n/a 21,401
(0.85 %)
45,353
(1.14 %)
n/a 41.08
(99.93 %)
4,203
(0.01 %)
1,048,940
(99.99 %)
7,222,494
(54.48 %)
430,286
(0.85 %)
21,775,991
(44.61 %)
37,158
(0.70 %)
134 capybara
GCA_004027455.1
n/a 20,152
(1.22 %)
28,931
(1.29 %)
n/a 39.76
(99.93 %)
5,747
(0.02 %)
661,089
(99.98 %)
4,220,878
(29.16 %)
777,357
(2.04 %)
15,214,944
(35.16 %)
34,558
(0.85 %)
135 carabao (swamp buffalo K-KA32 2023)
GCF_029407905.1
77,279
(2.89 %)
19,433
(1.40 %)
21,166
(1.23 %)
n/a 42.77
(100.00 %)
21
(0.00 %)
115
(100.00 %)
3,479,445
(21.92 %)
547,054
(6.39 %)
12,840,677
(45.22 %)
99,752
(3.73 %)
136 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v2.0 2023 USDA)
GCF_002263795.3
77,808
(4.11 %)
19,428
(1.48 %)
22,236
(1.33 %)
n/a 42.01
(100.00 %)
386
(0.00 %)
1,958
(100.00 %)
3,449,588
(22.63 %)
596,092
(3.13 %)
12,785,607
(42.11 %)
46,864
(1.37 %)
137 cattle (Hereford UMD_3.1.1 2014)
GCF_000003055.6
57,977
(2.74 %)
19,583
(1.56 %)
20,581
(1.31 %)
n/a 41.82
(99.23 %)
74,464
(0.78 %)
75,598
(99.22 %)
5,607,556
(49.02 %)
440,521
(1.25 %)
13,167,657
(40.78 %)
42,869
(1.24 %)
138 Chacoan peccary (BS20 v2 2019 Broad)
GCA_004024745.2
n/a 18,603
(1.52 %)
22,330
(1.36 %)
n/a 42.35
(98.12 %)
57,013
(1.80 %)
1,240,743
(98.20 %)
5,255,211
(43.27 %)
2,502,373
(4.37 %)
12,968,788
(40.96 %)
172,178
(3.66 %)
139 cheetah (Ajub_Pintada_27869175 2022)
GCF_027475565.1
80,997
(4.53 %)
18,420
(1.70 %)
19,561
(1.40 %)
n/a 41.59
(100.00 %)
22
(0.00 %)
195
(100.00 %)
4,611,842
(35.10 %)
837,685
(1.68 %)
13,649,125
(33.06 %)
60,367
(2.22 %)
140 cheetah (Rico 2018)
GCF_003709585.1
72,154
(3.33 %)
18,472
(1.70 %)
20,443
(1.42 %)
n/a 41.55
(99.55 %)
24,173
(0.45 %)
3,220
(100.00 %)
4,853,945
(42.85 %)
831,106
(1.53 %)
13,663,571
(32.84 %)
60,744
(2.17 %)
141 Chinese forest musk deer (Sichuan 2022)
GCF_022376915.1
51,625
(2.80 %)
19,565
(1.43 %)
22,280
(1.29 %)
n/a 42.30
(99.97 %)
1,781
(0.03 %)
2,446
(100.00 %)
3,257,347
(21.65 %)
399,120
(3.81 %)
12,906,274
(43.79 %)
46,689
(1.12 %)
142 Chinese hamster (17A/GY CHO 2020)
GCF_003668045.3
55,440
(2.79 %)
20,030
(1.84 %)
18,721
(1.41 %)
67,900
(3.41 %)
41.51
(99.90 %)
4,164
(0.10 %)
647
(100.00 %)
8,121,057
(33.74 %)
1,095,058
(2.91 %)
12,923,274
(32.25 %)
19,341
(0.58 %)
143 Chinese hamster (CHO v1 2011 BGI)
GCF_000223135.1
46,006
(2.59 %)
20,602
(1.78 %)
17,467
(1.35 %)
n/a 41.37
(96.61 %)
156,635
(3.40 %)
265,787
(96.60 %)
4,541,936
(33.03 %)
1,072,129
(2.66 %)
13,150,189
(30.04 %)
12,522
(0.25 %)
144 Chinese hamster (CHO v2 2017 Eagle Genomics Ltd)
GCA_900186095.1
n/a 19,874
(1.85 %)
19,298
(1.44 %)
n/a 41.45
(98.56 %)
63,334
(1.45 %)
71,598
(98.55 %)
4,521,726
(33.66 %)
1,060,619
(2.55 %)
12,867,288
(31.26 %)
17,960
(0.54 %)
145 Chinese hamster (CHO-K1 CHOZN v2.4 2022)
GCA_026545065.1
n/a 20,293
(1.81 %)
18,881
(1.42 %)
n/a 41.62
(71.16 %)
924,541
(28.93 %)
1,236,122
(71.07 %)
4,330,728
(30.92 %)
987,319
(3.70 %)
13,374,062
(21.92 %)
18,838
(0.40 %)
146 Chinese pangolin (2020 Yunnan U)
GCF_014570555.1
69,694
(3.21 %)
18,206
(1.70 %)
20,508
(1.48 %)
n/a 40.79
(95.54 %)
34,903
(4.47 %)
4,694
(100.00 %)
2,927,176
(35.60 %)
269,964
(0.67 %)
12,610,535
(29.10 %)
35,278
(1.05 %)
147 Chinese pangolin (hap1 2023)
GCF_030020395.1
71,445
(2.98 %)
18,379
(1.34 %)
21,837
(1.29 %)
n/a 41.07
(99.77 %)
383
(0.23 %)
661
(100.00 %)
3,318,871
(34.65 %)
618,193
(3.68 %)
12,009,669
(39.02 %)
47,708
(1.22 %)
148 Chinese pangolin (hap2 mManPen7 2023)
GCA_030020945.1
n/a 18,538
(1.34 %)
21,724
(1.27 %)
n/a 41.09
(99.48 %)
190
(0.52 %)
700
(100.00 %)
3,362,899
(34.48 %)
678,384
(4.11 %)
12,024,241
(39.52 %)
48,960
(1.19 %)
149 Chinese pangolin (MPE899 2014 WashU)
GCA_000738955.1
n/a 18,749
(1.63 %)
22,506
(1.40 %)
n/a 40.93
(90.69 %)
257,424
(9.33 %)
230,927
(90.67 %)
2,691,116
(34.48 %)
316,518
(1.96 %)
11,538,086
(25.40 %)
30,693
(0.58 %)
150 Chinese rufous horseshoe bat
GCA_001888835.1
n/a 26,871
(2.34 %)
25,467
(1.89 %)
n/a 40.52
(97.22 %)
212,601
(2.80 %)
63,439
(100.00 %)
3,219,611
(33.86 %)
495,126
(1.20 %)
12,476,551
(27.16 %)
32,993
(0.98 %)
151 Chinese rufous horseshoe bat (RSC01 2024)
GCA_036562045.1
n/a 17,893
(1.95 %)
19,249
(1.60 %)
n/a 40.47
(100.00 %)
286
(0.00 %)
454
(100.00 %)
3,055,304
(33.11 %)
531,106
(1.34 %)
11,858,144
(29.52 %)
30,884
(1.08 %)
152 Chinese rufous horseshoe bat (RSC01 2024)
GCF_036562045.2
67,162
(3.87 %)
17,890
(1.94 %)
19,248
(1.60 %)
n/a 40.47
(100.00 %)
286
(0.00 %)
454
(100.00 %)
3,325,750
(39.02 %)
531,106
(1.34 %)
11,858,028
(29.52 %)
30,884
(1.08 %)
153 Chinese tree shrew (2013 BGI)
GCF_000334495.1
47,005
(2.07 %)
21,375
(1.39 %)
19,231
(1.28 %)
n/a 41.73
(95.10 %)
191,695
(4.92 %)
242,445
(95.08 %)
5,060,321
(23.05 %)
1,046,388
(4.15 %)
14,978,259
(38.04 %)
88,806
(1.44 %)
154 Chinese tree shrew (KIZ-2021 2023)
GCA_033439345.1
n/a 22,218
(1.55 %)
22,364
(1.36 %)
n/a 41.78
(99.99 %)
1,697
(0.01 %)
1,645
(100.00 %)
6,126,341
(42.08 %)
1,035,957
(2.47 %)
14,328,193
(41.14 %)
90,914
(1.82 %)
155 chiru
GCA_000400835.1
n/a 20,320
(1.60 %)
42,654
(2.51 %)
n/a 42.01
(93.04 %)
283,069
(7.00 %)
298,127
(93.00 %)
5,342,241
(43.54 %)
425,329
(1.25 %)
13,714,420
(34.66 %)
43,135
(1.89 %)
156 clouded leopard (mNeoNeb1 alternate hap 2023)
GCA_028018655.1
n/a 16,430
(1.52 %)
21,057
(1.44 %)
n/a 41.79
(100.00 %)
n/a 10,377
(100.00 %)
3,845,437
(33.39 %)
794,587
(2.14 %)
10,765,695
(33.40 %)
56,375
(2.45 %)
157 clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018385.1
81,219
(3.62 %)
18,300
(1.65 %)
20,361
(1.39 %)
n/a 41.79
(99.94 %)
181
(0.06 %)
33
(100.00 %)
4,224,269
(34.84 %)
992,668
(2.08 %)
13,618,866
(34.42 %)
67,830
(2.45 %)
158 common bottlenose dolphin (maternal 2020)
GCA_011762535.1
n/a 18,837
(1.77 %)
20,857
(1.43 %)
n/a 41.43
(99.73 %)
649
(0.27 %)
985
(100.00 %)
4,073,893
(46.15 %)
630,039
(2.15 %)
12,628,219
(35.41 %)
65,379
(1.89 %)
159 common bottlenose dolphin (maternal Y refseq 2020)
GCF_011762595.1
67,220
(3.31 %)
18,766
(1.77 %)
20,528
(1.42 %)
35,852
(1.58 %)
41.44
(99.74 %)
674
(0.26 %)
362
(100.00 %)
4,069,115
(46.17 %)
628,982
(2.12 %)
12,490,891
(35.29 %)
65,551
(1.90 %)
160 common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 refseq)
GCF_001922835.1
45,975
(2.99 %)
17,255
(1.69 %)
17,058
(1.34 %)
n/a 40.85
(99.45 %)
114,003
(0.57 %)
2,648
(100.00 %)
3,845,938
(43.89 %)
514,631
(1.06 %)
12,317,098
(32.18 %)
48,030
(1.35 %)
161 common bottlenose dolphin (mTurTru1 2024)
GCF_011762595.2
80,385
(4.33 %)
18,770
(1.77 %)
20,525
(1.42 %)
n/a 41.44
(99.74 %)
674
(0.26 %)
361
(100.00 %)
3,981,744
(44.78 %)
628,982
(2.12 %)
12,490,558
(35.29 %)
65,551
(1.90 %)
162 common bottlenose dolphin (paternal 2020)
GCA_011762515.1
n/a 18,537
(1.77 %)
20,619
(1.44 %)
n/a 41.42
(98.08 %)
868
(1.92 %)
1,166
(100.00 %)
3,997,801
(45.93 %)
609,838
(1.85 %)
12,400,272
(34.53 %)
64,630
(1.84 %)
163 common brushtail (alternate hap 2020)
GCA_011100645.1
n/a 14,863
(0.75 %)
15,426
(0.89 %)
n/a 39.41
(100.00 %)
313
(0.00 %)
12,446
(100.00 %)
5,846,769
(38.56 %)
987,917
(1.99 %)
16,764,356
(40.14 %)
13,303
(0.35 %)
164 common brushtail (refseq 2020)
GCF_011100635.1
37,661
(1.80 %)
18,653
(0.80 %)
15,375
(0.86 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
1,796
(0.56 %)
212
(100.00 %)
7,598,116
(38.90 %)
1,259,434
(1.97 %)
22,071,306
(40.56 %)
17,762
(0.38 %)
165 common pipistrelle (2020)
GCA_903992545.1
n/a 17,216
(1.82 %)
19,202
(1.79 %)
n/a 42.55
(99.97 %)
1,546
(0.03 %)
323
(100.00 %)
2,953,532
(23.94 %)
805,142
(2.83 %)
9,964,846
(34.69 %)
57,295
(2.83 %)
166 common pipistrelle (alternate hap 2020)
GCA_903992515.1
n/a 15,974
(1.72 %)
20,563
(1.66 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
12
(0.00 %)
10,459
(100.00 %)
2,634,333
(23.76 %)
703,674
(2.65 %)
8,909,525
(33.95 %)
50,430
(2.54 %)
167 common pipistrelle (Broad 2019)
GCA_004026625.1
n/a 21,938
(1.35 %)
53,915
(1.60 %)
n/a 42.88
(99.88 %)
10,870
(0.05 %)
736,974
(99.95 %)
3,499,501
(22.91 %)
1,046,301
(2.96 %)
11,759,516
(37.96 %)
92,062
(3.23 %)
168 common pipistrelle (hap1.1 2025)
GCA_965203405.1
n/a 18,233
(1.77 %)
21,445
(1.80 %)
n/a 42.93
(99.98 %)
1,650
(0.02 %)
575
(100.00 %)
3,324,262
(26.83 %)
869,167
(7.44 %)
10,218,519
(37.91 %)
76,006
(3.29 %)
169 common pipistrelle (hap2.1 2025)
GCA_965204225.1
n/a 18,115
(1.81 %)
21,233
(1.83 %)
n/a 42.89
(99.98 %)
1,602
(0.02 %)
1,971
(99.98 %)
3,303,323
(27.28 %)
852,756
(5.65 %)
10,047,424
(36.41 %)
69,105
(3.25 %)
170 common vampire bat (v2 HL8 alternate hap 2022 genbank)
GCA_022682395.2
n/a 17,485
(1.76 %)
18,907
(1.66 %)
n/a 42.87
(99.99 %)
576
(0.01 %)
429
(100.00 %)
2,592,246
(28.20 %)
352,985
(2.87 %)
10,737,944
(31.11 %)
61,125
(2.28 %)
171 common vampire bat (v2 HL8 primary hap 2022 refseq)
GCF_022682495.2
58,786
(3.38 %)
18,507
(1.82 %)
19,451
(1.59 %)
n/a 42.99
(99.99 %)
615
(0.01 %)
574
(100.00 %)
2,960,602
(36.90 %)
431,577
(3.90 %)
11,286,753
(32.62 %)
71,507
(2.50 %)
172 common vampire bat (v3 DRU21DN04 2018)
GCF_002940915.2
51,044
(3.24 %)
18,503
(1.88 %)
18,071
(1.68 %)
n/a 42.15
(97.78 %)
54,246
(2.23 %)
83,364
(97.77 %)
2,799,509
(29.62 %)
275,242
(1.03 %)
11,796,826
(28.19 %)
51,634
(1.37 %)
173 common warthog (WHEZ1 2021)
GCF_016906955.1
55,156
(2.64 %)
18,264
(1.56 %)
19,251
(1.34 %)
54,816
(2.83 %)
41.95
(99.61 %)
523
(0.39 %)
194
(100.00 %)
3,898,243
(30.33 %)
588,742
(1.17 %)
12,955,929
(36.44 %)
75,592
(1.86 %)
174 common wombat
GCF_900497805.2
46,365
(1.78 %)
19,437
(0.86 %)
18,947
(0.96 %)
n/a 38.86
(99.68 %)
67,461
(0.33 %)
14,183
(100.00 %)
8,645,969
(41.99 %)
1,203,246
(1.61 %)
23,878,215
(39.11 %)
18,752
(0.37 %)
175 Corsac fox (zsh2022 2023)
GCA_030463245.1
n/a 19,527
(1.61 %)
18,923
(1.35 %)
n/a 41.24
(100.00 %)
107
(0.00 %)
202
(100.00 %)
4,435,406
(32.05 %)
981,019
(1.98 %)
13,673,245
(32.65 %)
49,252
(2.20 %)
176 coyote (coyote_06102 2023)
GCA_034620425.1
n/a 19,251
(1.60 %)
19,585
(1.40 %)
n/a 41.18
(100.00 %)
93
(0.00 %)
120
(100.00 %)
4,493,000
(32.28 %)
982,814
(2.01 %)
13,803,318
(33.09 %)
50,777
(2.23 %)
177 creeping vole
GCF_018167655.1
54,941
(2.31 %)
23,033
(1.55 %)
25,427
(1.53 %)
n/a 44.23
(100.00 %)
n/a 2,147
(100.00 %)
4,549,519
(25.66 %)
1,153,429
(13.60 %)
13,568,297
(40.65 %)
23,141
(0.54 %)
178 crested porcupine
GCA_004026905.1
n/a 21,005
(1.32 %)
35,975
(1.39 %)
n/a 41.51
(99.89 %)
4,351
(0.02 %)
1,140,949
(99.98 %)
4,303,147
(30.69 %)
600,488
(1.19 %)
14,049,490
(33.80 %)
57,196
(1.33 %)
179 Crete spiny mouse (2024)
GCA_964271855.1
n/a 19,467
(1.76 %)
18,734
(1.43 %)
n/a 42.87
(100.00 %)
184
(0.00 %)
113
(100.00 %)
4,718,848
(32.83 %)
1,327,449
(6.80 %)
12,893,458
(34.03 %)
21,236
(0.61 %)
180 Cuvier's beaked whale
GCA_004364475.1
n/a 23,700
(0.90 %)
51,715
(0.86 %)
n/a 42.01
(99.76 %)
3,229
(0.01 %)
3,761,505
(99.99 %)
6,544,424
(43.61 %)
1,417,186
(3.11 %)
16,127,873
(42.25 %)
68,668
(1.15 %)
181 cyclops roundleaf bat (Cote d'Ivoire 20210929_DDa primary hap 2024)
GCA_043880285.1
n/a 18,610
(1.67 %)
19,098
(1.39 %)
n/a 41.56
(99.99 %)
334
(0.01 %)
73
(100.00 %)
4,077,286
(41.85 %)
754,689
(2.64 %)
11,873,386
(36.16 %)
48,137
(1.04 %)
182 Damara mole-rat DMR 1.0 (2014 BGI)
GCF_000743615.1
52,373
(2.57 %)
17,983
(1.45 %)
17,063
(1.43 %)
n/a 40.34
(97.96 %)
87,815
(2.05 %)
162,545
(97.95 %)
4,053,433
(30.86 %)
545,281
(1.74 %)
13,406,483
(30.65 %)
37,008
(0.74 %)
183 Damara mole-rat DMR 1.0 HiC (2020 DNA Zoo)
GCF_012274545.1
58,091
(2.74 %)
17,780
(1.44 %)
16,515
(1.42 %)
n/a 40.34
(97.94 %)
88,899
(2.07 %)
73,970
(100.00 %)
4,035,140
(30.95 %)
544,772
(1.73 %)
13,390,872
(30.61 %)
37,008
(0.74 %)
184 dassie-rat
GCA_004026965.1
n/a 20,479
(1.16 %)
42,937
(1.41 %)
n/a 41.86
(99.89 %)
9,645
(0.04 %)
920,324
(99.96 %)
4,563,054
(28.83 %)
660,623
(1.92 %)
12,899,807
(34.48 %)
46,569
(1.25 %)
185 Daubenton's bat (alternate hap 2023)
GCA_963242275.1
n/a 18,895
(1.78 %)
24,235
(1.81 %)
n/a 43.39
(100.00 %)
n/a 4,930
(100.00 %)
2,813,870
(23.75 %)
718,406
(5.18 %)
9,977,320
(37.24 %)
62,910
(2.66 %)
186 Daubenton's bat (primary hap 2023 refseq)
GCF_963259705.1
64,558
(3.32 %)
19,141
(1.72 %)
22,133
(1.66 %)
n/a 43.18
(99.99 %)
1,099
(0.01 %)
121
(100.00 %)
3,040,232
(24.03 %)
796,911
(6.38 %)
10,478,180
(38.84 %)
64,920
(2.51 %)
187 Daurian ground squirrel
GCA_002406435.1
n/a 20,990
(1.31 %)
17,575
(1.17 %)
n/a 39.77
(96.15 %)
141,850
(3.84 %)
502,654
(96.16 %)
5,783,538
(34.36 %)
924,038
(3.73 %)
17,533,301
(30.85 %)
27,955
(0.39 %)
188 David's myotis bat
GCF_000327345.1
37,645
(2.70 %)
18,744
(1.78 %)
17,565
(1.62 %)
n/a 42.69
(91.23 %)
223,511
(8.80 %)
325,280
(91.20 %)
2,680,166
(23.79 %)
532,273
(1.90 %)
11,016,028
(29.55 %)
59,615
(1.59 %)
189 degu (3935 2012 refseq)
GCF_000260255.1
48,165
(2.13 %)
22,242
(1.41 %)
22,101
(1.46 %)
n/a 41.38
(84.36 %)
252,772
(15.68 %)
259,904
(84.32 %)
4,901,673
(27.74 %)
898,945
(1.50 %)
14,282,003
(29.30 %)
40,135
(0.82 %)
190 desert hamster (2022)
GCF_943737965.1
37,291
(2.11 %)
19,744
(1.74 %)
20,215
(1.50 %)
n/a 41.31
(100.00 %)
n/a 2,079
(100.00 %)
4,038,079
(31.01 %)
1,132,871
(2.71 %)
11,946,112
(32.62 %)
17,053
(0.51 %)
191 Desmarest's hutia
GCA_004027915.1
n/a 23,535
(0.78 %)
50,796
(0.95 %)
n/a 42.03
(99.83 %)
3,492
(0.01 %)
2,355,850
(99.99 %)
5,790,506
(26.72 %)
1,062,134
(1.71 %)
16,977,224
(35.29 %)
54,479
(1.01 %)
192 dingo (2020 Alpine COOINDA U.NSW)
GCF_012295265.1
102,060
(4.04 %)
19,777
(1.69 %)
20,341
(1.41 %)
n/a 41.29
(99.69 %)
325
(0.31 %)
477
(100.00 %)
4,950,808
(42.83 %)
1,033,921
(2.36 %)
13,745,703
(33.32 %)
51,835
(2.25 %)
193 dingo (Sandy 2020 James Cook U)
GCF_003254725.2
104,332
(4.50 %)
19,710
(1.72 %)
19,857
(1.42 %)
n/a 41.24
(100.00 %)
69
(0.00 %)
159
(100.00 %)
4,547,906
(33.32 %)
993,474
(2.19 %)
13,701,060
(33.18 %)
51,216
(2.28 %)
194 dog (Basenji MU ID 185726 2019)
GCA_004886185.2
n/a 19,889
(1.67 %)
20,501
(1.39 %)
n/a 41.36
(99.99 %)
1,388
(0.01 %)
3,630
(99.99 %)
4,950,227
(43.32 %)
1,059,639
(2.97 %)
13,694,849
(33.70 %)
51,443
(2.16 %)
195 dog (Basenji UNSW-BAS-2019 2021)
GCA_013276365.2
n/a 19,310
(1.60 %)
19,947
(1.42 %)
n/a 41.21
(100.00 %)
149
(0.00 %)
631
(100.00 %)
4,452,916
(32.14 %)
960,590
(2.23 %)
13,685,353
(33.01 %)
50,715
(2.22 %)
196 dog (Bernese Mountain Dog BD 2023)
GCA_031010765.1
n/a 19,211
(1.60 %)
20,327
(1.44 %)
n/a 41.20
(100.00 %)
641
(0.00 %)
175
(100.00 %)
4,471,016
(32.18 %)
984,776
(2.03 %)
13,719,474
(32.88 %)
51,050
(2.25 %)
197 dog (Bernese Mountain Dog OD 2023)
GCA_031010635.1
n/a 19,279
(1.60 %)
20,348
(1.44 %)
n/a 41.21
(100.00 %)
1,015
(0.00 %)
159
(100.00 %)
4,491,081
(32.21 %)
996,142
(2.01 %)
13,761,195
(32.97 %)
51,490
(2.25 %)
198 dog (boxer Tasha 2011)
GCF_000002285.3
82,536
(3.63 %)
19,772
(1.66 %)
19,565
(1.39 %)
n/a 41.31
(99.25 %)
23,876
(0.76 %)
27,106
(99.24 %)
4,918,098
(43.29 %)
991,835
(2.81 %)
13,644,959
(33.60 %)
53,269
(2.07 %)
199 dog (boxer Tasha 2020)
GCF_000002285.5
93,761
(3.84 %)
19,392
(1.71 %)
19,572
(1.42 %)
52,141
(3.27 %)
41.26
(100.00 %)
1,028
(0.00 %)
147
(100.00 %)
23,927,903
(42.42 %)
972,851
(2.05 %)
13,611,845
(33.11 %)
50,679
(2.26 %)
200 dog (Cairn Terrier CA611 2023)
GCA_031010295.1
n/a 19,255
(1.61 %)
20,479
(1.45 %)
n/a 41.19
(100.00 %)
262
(0.00 %)
141
(100.00 %)
4,490,019
(32.25 %)
989,383
(1.99 %)
13,710,808
(32.97 %)
50,883
(2.22 %)
201 dog (German shepard Mischka 2020)
GCF_011100685.1
96,734
(3.71 %)
20,135
(1.64 %)
20,871
(1.38 %)
56,772
(3.19 %)
41.50
(100.00 %)
585
(0.00 %)
2,782
(100.00 %)
20,264,827
(43.87 %)
1,152,879
(3.22 %)
13,784,690
(34.30 %)
53,518
(2.23 %)
202 dog (German Shepherd Nala 2020)
GCA_008641055.3
n/a 19,757
(1.69 %)
20,201
(1.41 %)
n/a 41.32
(99.74 %)
458
(0.26 %)
410
(100.00 %)
4,974,233
(43.03 %)
1,048,366
(2.46 %)
13,881,889
(33.61 %)
51,900
(2.21 %)
203 dog (Labrador retriever 2023)
GCA_031165255.1
n/a 19,256
(1.61 %)
20,247
(1.44 %)
n/a 41.18
(100.00 %)
516
(0.00 %)
675
(100.00 %)
4,456,220
(32.19 %)
960,584
(1.96 %)
13,688,006
(32.82 %)
50,670
(2.21 %)
204 dog (labrador SID07034 2020)
GCF_014441545.1
99,420
(3.87 %)
19,870
(1.70 %)
20,252
(1.41 %)
54,322
(3.23 %)
41.19
(99.47 %)
575
(0.53 %)
376
(100.00 %)
4,981,985
(42.28 %)
1,019,772
(1.97 %)
13,959,750
(32.77 %)
52,469
(2.25 %)
205 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2017 WashU)
GCF_000181335.3
72,076
(3.30 %)
18,662
(1.64 %)
20,897
(1.37 %)
n/a 41.73
(98.20 %)
436
(1.80 %)
5,079
(98.20 %)
5,086,462
(43.51 %)
964,126
(2.68 %)
13,947,871
(33.33 %)
69,701
(2.41 %)
206 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021 WashU)
GCA_000181335.5
n/a 18,378
(1.53 %)
21,242
(1.40 %)
n/a 41.73
(98.21 %)
422
(1.79 %)
5,010
(98.31 %)
4,683,703
(33.33 %)
964,129
(2.68 %)
13,948,305
(33.33 %)
69,725
(2.42 %)
207 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021)
GCA_000181335.6
n/a 18,357
(1.55 %)
20,085
(1.38 %)
n/a 41.76
(98.18 %)
422
(1.82 %)
1,254
(98.28 %)
4,661,997
(33.78 %)
947,221
(2.58 %)
13,867,949
(33.67 %)
68,011
(2.41 %)
208 domestic cat (Fca126 2021 Texas A&M U)
GCF_018350175.1
99,222
(4.40 %)
18,456
(1.66 %)
19,833
(1.39 %)
94,133
(5.63 %)
41.81
(100.00 %)
39
(0.00 %)
102
(100.00 %)
4,965,571
(43.65 %)
932,424
(1.95 %)
13,596,808
(33.85 %)
67,329
(2.48 %)
209 domestic ferret (JIRA1106 JCVI 2020)
GCF_011764305.1
68,868
(3.09 %)
19,019
(1.55 %)
21,812
(1.42 %)
n/a 41.90
(100.00 %)
n/a 1,224
(100.00 %)
4,650,028
(39.49 %)
745,115
(2.02 %)
13,758,447
(36.14 %)
58,684
(2.16 %)
210 domestic ferret (Sable 2011 Broad)
GCA_000239315.1
n/a 18,778
(1.67 %)
19,571
(1.47 %)
n/a 41.48
(96.89 %)
72,670
(3.12 %)
76,914
(96.88 %)
4,491,876
(40.13 %)
618,556
(1.07 %)
13,721,938
(31.04 %)
54,600
(1.94 %)
211 domestic guinea pig (051 PalLab524CR 2023)
GCF_034190915.1
79,333
(3.55 %)
17,999
(1.09 %)
21,509
(1.20 %)
n/a 40.64
(100.00 %)
84
(0.00 %)
672
(100.00 %)
5,037,431
(41.68 %)
886,785
(13.97 %)
14,620,284
(42.71 %)
39,682
(0.89 %)
212 domestic guinea pig (2N 2008 refseq)
GCF_000151735.1
44,762
(2.31 %)
18,301
(1.33 %)
20,111
(1.34 %)
n/a 39.95
(97.81 %)
58,460
(2.20 %)
61,604
(97.80 %)
4,257,852
(38.85 %)
658,533
(1.25 %)
14,547,726
(34.19 %)
37,093
(0.85 %)
213 domestic yak (maiwa yakHY00 2019)
GCA_005887515.3
n/a 18,672
(1.39 %)
19,408
(1.24 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
646
(0.00 %)
343
(100.00 %)
3,570,978
(23.00 %)
583,762
(8.57 %)
14,055,227
(40.52 %)
43,883
(1.17 %)
214 dugong (hap1 mDugDug1 2023)
GCA_030035585.1
n/a 18,354
(1.22 %)
20,434
(1.08 %)
n/a 40.65
(100.00 %)
96
(0.00 %)
198
(100.00 %)
4,458,084
(33.00 %)
444,499
(1.79 %)
15,031,940
(47.42 %)
29,863
(0.83 %)
215 dugong (hap2 mDugDug1 2023)
GCA_030020955.1
n/a 18,538
(1.23 %)
20,775
(1.09 %)
n/a 40.64
(100.00 %)
89
(0.00 %)
167
(100.00 %)
4,455,227
(33.01 %)
444,021
(1.73 %)
14,946,847
(47.37 %)
29,828
(0.79 %)
216 dwarf mongoose
GCA_004023845.1
n/a 21,478
(1.57 %)
32,174
(1.43 %)
n/a 41.83
(99.94 %)
10,815
(0.05 %)
200,185
(99.95 %)
4,574,991
(40.34 %)
595,520
(1.11 %)
13,720,585
(32.94 %)
70,689
(2.42 %)
217 eastern cottontail (primary hap 2023)
GCA_949820135.1
n/a 18,522
(1.26 %)
22,314
(1.28 %)
n/a 43.69
(100.00 %)
316
(0.00 %)
99
(100.00 %)
3,699,683
(20.55 %)
935,350
(11.22 %)
13,112,318
(44.07 %)
99,224
(2.27 %)
218 eastern European house mouse (PWK_PhJ v2 2022)
GCA_921998335.2
n/a 21,903
(2.13 %)
19,801
(1.40 %)
108,675
(4.42 %)
41.79
(99.89 %)
207
(0.11 %)
211
(100.00 %)
4,630,645
(40.56 %)
1,531,506
(3.70 %)
13,011,312
(35.48 %)
22,270
(0.54 %)
219 eastern mole
GCA_004024925.1
n/a 19,631
(1.57 %)
32,414
(1.63 %)
n/a 42.02
(99.91 %)
7,239
(0.03 %)
647,535
(99.97 %)
3,145,725
(29.42 %)
554,620
(1.75 %)
10,663,504
(32.88 %)
55,063
(3.69 %)
220 eastern quoll
GCA_020854095.1
n/a 15,715
(0.80 %)
16,750
(0.93 %)
n/a 36.19
(100.00 %)
431
(0.00 %)
76
(100.00 %)
5,256,999
(24.81 %)
1,280,160
(3.39 %)
21,362,866
(41.74 %)
24,508
(0.70 %)
221 eastern spiny mouse (2021)
GCA_907164435.1
n/a 20,397
(1.93 %)
20,515
(1.44 %)
n/a 42.68
(98.12 %)
109,220
(1.90 %)
19,837
(99.90 %)
4,701,702
(33.98 %)
1,304,933
(2.91 %)
13,145,044
(31.05 %)
19,636
(0.56 %)
222 Egyptian rousette (1219 2016 Boston U)
GCF_001466805.2
54,791
(4.93 %)
18,221
(2.05 %)
24,192
(1.88 %)
46,601
(2.22 %)
40.02
(99.97 %)
638
(0.03 %)
2,490
(100.00 %)
2,815,693
(32.23 %)
440,119
(1.01 %)
12,346,041
(26.86 %)
56,244
(6.54 %)
223 Egyptian rousette (v1 2020 refseq)
GCF_014176215.1
65,163
(4.76 %)
17,642
(2.07 %)
22,317
(1.84 %)
n/a 40.05
(98.59 %)
242
(1.41 %)
29
(100.00 %)
2,821,248
(33.05 %)
434,414
(1.02 %)
12,031,597
(26.52 %)
53,573
(4.84 %)
224 Egyptian spiny mouse (US019 2019)
GCA_004027535.1
n/a 23,498
(1.69 %)
36,970
(1.40 %)
30,076
(1.58 %)
42.71
(99.88 %)
20,469
(0.09 %)
391,811
(99.91 %)
4,983,574
(35.17 %)
1,342,514
(3.45 %)
13,029,270
(32.79 %)
19,944
(0.55 %)
225 elk (wapiti)
GCF_019320065.1
66,846
(3.00 %)
20,090
(1.67 %)
21,999
(1.44 %)
n/a 41.62
(99.93 %)
6,643
(0.08 %)
185
(100.00 %)
4,884,711
(43.14 %)
429,925
(1.65 %)
13,135,255
(37.85 %)
47,099
(1.31 %)
226 ermine (2020)
GCF_009829155.1
74,345
(3.19 %)
18,855
(1.65 %)
20,667
(1.43 %)
44,584
(2.07 %)
41.56
(99.12 %)
199
(0.88 %)
94
(100.00 %)
4,647,934
(41.44 %)
714,174
(1.30 %)
13,845,904
(33.42 %)
56,065
(2.25 %)
227 ermine (alternate hap 2020)
GCA_009829165.1
n/a 13,583
(1.65 %)
15,403
(1.46 %)
n/a 41.72
(100.00 %)
n/a 3,327
(100.00 %)
3,139,035
(40.57 %)
480,111
(1.29 %)
9,106,061
(31.93 %)
39,139
(2.25 %)
228 Eurasian badger (2021)
GCA_922990625.1
n/a 19,332
(1.42 %)
22,424
(1.40 %)
n/a 42.47
(100.00 %)
27
(0.00 %)
726
(100.00 %)
4,362,536
(31.74 %)
801,232
(4.02 %)
13,893,672
(37.73 %)
65,806
(4.13 %)
229 Eurasian badger (v3.2 2022)
GCA_922984935.2
n/a 19,268
(1.40 %)
22,121
(1.36 %)
41,043
(1.93 %)
42.48
(100.00 %)
101
(0.00 %)
538
(100.00 %)
4,417,203
(31.72 %)
821,664
(4.02 %)
13,814,720
(38.08 %)
66,524
(3.95 %)
230 Eurasian field mouse (2024)
GCA_964023405.1
n/a 20,487
(1.88 %)
19,707
(1.34 %)
n/a 42.15
(100.00 %)
182
(0.00 %)
61
(100.00 %)
5,115,510
(39.18 %)
1,868,284
(4.29 %)
13,503,826
(37.29 %)
26,414
(0.61 %)
231 Eurasian red squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685485.1
n/a 12,437
(1.51 %)
12,702
(1.22 %)
n/a 40.06
(100.00 %)
2
(0.00 %)
10,657
(100.00 %)
2,303,176
(35.38 %)
353,996
(1.49 %)
7,218,556
(31.67 %)
24,268
(1.07 %)
232 Eurasian red squirrel (v1.2 2020)
GCA_902686455.2
n/a 21,309
(1.58 %)
21,026
(1.36 %)
33,465
(1.53 %)
40.08
(94.33 %)
1,177
(5.67 %)
639
(100.00 %)
4,677,412
(35.73 %)
704,218
(1.42 %)
14,992,063
(31.49 %)
48,159
(1.04 %)
233 Eurasian river otter (2020)
GCF_902655055.1
67,269
(2.96 %)
18,842
(1.54 %)
20,178
(1.40 %)
n/a 41.59
(100.00 %)
185
(0.00 %)
44
(100.00 %)
4,259,294
(33.39 %)
713,721
(1.36 %)
13,626,048
(34.37 %)
57,073
(1.82 %)
234 Eurasian river otter (alternate hap 2019)
GCA_902653095.1
n/a 9,910
(1.59 %)
11,315
(1.31 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
n/a 8,506
(100.00 %)
2,052,338
(42.25 %)
316,084
(1.64 %)
6,222,460
(33.12 %)
27,057
(1.96 %)
235 Eurasian water vole (alternate hap 2020)
GCA_903992525.1
n/a 16,761
(1.66 %)
19,715
(1.37 %)
n/a 42.13
(100.00 %)
105
(0.00 %)
16,473
(100.00 %)
3,118,266
(26.44 %)
829,463
(2.82 %)
9,700,482
(31.37 %)
14,146
(0.57 %)
236 Eurasian water vole (v2 2021)
GCF_903992535.2
45,544
(2.51 %)
19,733
(1.78 %)
19,053
(1.47 %)
36,935
(2.27 %)
42.15
(99.74 %)
873
(0.26 %)
215
(100.00 %)
3,993,912
(25.74 %)
1,088,163
(2.91 %)
12,853,770
(32.42 %)
19,000
(0.58 %)
237 European hare (LE1 primary hap 2023)
GCF_033115175.1
46,528
(2.09 %)
19,392
(1.25 %)
23,070
(1.29 %)
n/a 44.03
(100.00 %)
418
(0.00 %)
651
(100.00 %)
4,011,592
(19.81 %)
1,000,204
(8.44 %)
13,414,251
(44.25 %)
98,831
(2.33 %)
238 European harvest mouse (primary hap 2024)
GCA_963924665.1
n/a 20,236
(1.71 %)
19,368
(1.32 %)
n/a 40.05
(99.99 %)
2,020
(0.02 %)
894
(100.00 %)
4,892,811
(36.49 %)
1,223,387
(18.26 %)
11,907,631
(42.51 %)
17,423
(0.62 %)
239 European mink (alternate hap 2023)
GCA_030435785.1
n/a 15,419
(1.50 %)
21,175
(1.51 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
n/a 12,043
(100.00 %)
2,952,218
(30.62 %)
538,508
(2.18 %)
9,303,303
(34.20 %)
47,810
(2.50 %)
240 European mink (primary hap 2023 refseq)
GCF_030435805.1
69,556
(3.13 %)
18,706
(1.46 %)
21,193
(1.37 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
39
(0.00 %)
25
(100.00 %)
4,237,791
(30.90 %)
792,897
(2.69 %)
13,417,195
(36.59 %)
67,132
(2.54 %)
241 European mole (hap1 2024)
GCA_964194135.1
n/a 18,085
(1.69 %)
19,509
(1.58 %)
n/a 42.08
(99.99 %)
1,056
(0.01 %)
464
(100.00 %)
2,569,380
(23.32 %)
565,465
(2.18 %)
10,506,666
(33.68 %)
46,367
(3.09 %)
242 European mole (hap2 2024)
GCA_964194205.1
n/a 18,064
(1.69 %)
19,764
(1.59 %)
n/a 42.07
(99.99 %)
1,040
(0.01 %)
1,396
(99.99 %)
2,567,492
(23.34 %)
570,250
(2.16 %)
10,485,959
(33.56 %)
46,213
(3.27 %)
243 European pine marten (primary hap 2023)
GCA_963455335.1
n/a 18,336
(1.50 %)
20,807
(1.41 %)
n/a 42.38
(99.98 %)
2,250
(0.02 %)
477
(100.00 %)
4,096,160
(31.55 %)
707,337
(3.28 %)
13,715,382
(34.73 %)
61,481
(4.29 %)
244 European shrew (alternate hap 2023)
GCA_027595995.1
n/a 17,506
(1.26 %)
25,527
(1.52 %)
n/a 43.20
(100.00 %)
n/a 5,699
(100.00 %)
2,400,784
(15.19 %)
1,062,793
(3.20 %)
13,284,496
(41.93 %)
77,009
(2.86 %)
245 European shrew (GB8-d 2012)
GCF_000181275.1
23,525
(1.54 %)
17,290
(1.33 %)
22,005
(1.50 %)
n/a 42.90
(90.49 %)
188,953
(9.54 %)
201,798
(90.46 %)
4,400,127
(33.22 %)
946,629
(2.03 %)
13,377,581
(35.30 %)
77,851
(2.58 %)
246 European shrew (primary hap 2023)
GCF_027595985.1
44,643
(2.60 %)
17,479
(1.26 %)
21,293
(1.37 %)
n/a 43.24
(99.46 %)
1,427
(0.54 %)
65
(100.00 %)
2,474,584
(15.18 %)
1,107,884
(3.28 %)
13,638,467
(41.72 %)
79,785
(2.86 %)
247 European snow vole (alternate hap 2023)
GCA_950005115.1
n/a 18,364
(1.79 %)
20,379
(1.63 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
1
(0.00 %)
4,256
(100.00 %)
3,049,618
(22.22 %)
852,708
(4.50 %)
10,501,392
(33.34 %)
17,629
(0.60 %)
248 European snow vole (primary hap 2023 refseq)
GCF_950005125.1
47,025
(2.69 %)
19,592
(1.78 %)
21,173
(1.56 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
197
(0.00 %)
160
(100.00 %)
5,048,186
(44.12 %)
998,537
(5.14 %)
12,204,053
(34.97 %)
20,725
(0.63 %)
249 European suslik (primary hap 2024)
GCA_964194105.1
n/a 20,075
(1.28 %)
20,274
(1.19 %)
n/a 39.90
(99.99 %)
1,436
(0.01 %)
502
(100.00 %)
4,357,247
(31.78 %)
882,536
(12.27 %)
14,882,486
(41.66 %)
39,275
(0.88 %)
250 European woodmouse (2022 refseq)
GCF_947179515.1
54,113
(2.24 %)
19,959
(1.65 %)
19,953
(1.25 %)
n/a 41.23
(99.99 %)
1,129
(0.01 %)
497
(100.00 %)
4,863,650
(37.41 %)
1,795,997
(8.95 %)
13,681,732
(40.58 %)
23,961
(0.53 %)
251 European woodmouse (alternate hap 2022)
GCA_947179525.1
n/a 18,692
(1.72 %)
22,021
(1.36 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
2
(0.00 %)
10,863
(100.00 %)
4,055,957
(36.08 %)
1,513,576
(9.53 %)
11,306,811
(39.67 %)
20,865
(0.55 %)
252 fallow deer (Ldn47 2023)
GCF_033118175.1
57,013
(2.35 %)
20,187
(1.33 %)
23,290
(1.33 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
44
(0.00 %)
284
(100.00 %)
3,308,241
(20.72 %)
513,748
(18.20 %)
12,996,819
(48.19 %)
214,480
(2.98 %)
253 fallow deer (maternal hap SK-2024 2025)
GCA_048126745.1
n/a 20,072
(1.51 %)
22,668
(1.37 %)
n/a 41.80
(100.00 %)
147
(0.00 %)
1,369
(100.00 %)
4,623,335
(34.75 %)
475,143
(7.51 %)
13,000,703
(41.56 %)
112,581
(2.00 %)
254 fallow deer (paternal hap SK-2024 2025)
GCA_048127045.1
n/a 18,238
(1.57 %)
20,307
(1.42 %)
n/a 41.46
(100.00 %)
242
(0.00 %)
388
(100.00 %)
4,244,450
(35.89 %)
405,446
(2.83 %)
12,211,643
(38.55 %)
52,418
(1.36 %)
255 false killer whale (hap1 2024 genbank)
GCA_039906515.1
n/a 18,718
(1.50 %)
20,929
(1.32 %)
n/a 42.08
(99.90 %)
123
(0.10 %)
439
(100.00 %)
3,958,932
(35.76 %)
1,002,329
(11.61 %)
12,193,131
(41.85 %)
79,158
(3.74 %)
256 false killer whale (hap1 2024 refseq)
GCF_039906515.1
75,958
(3.31 %)
18,718
(1.50 %)
20,982
(1.32 %)
n/a 42.08
(99.90 %)
123
(0.10 %)
438
(100.00 %)
3,958,926
(35.76 %)
1,002,329
(11.61 %)
12,193,061
(41.85 %)
79,158
(3.74 %)
257 false killer whale (hap2 2024)
GCA_039906525.1
n/a 17,866
(1.45 %)
21,079
(1.46 %)
n/a 42.37
(99.08 %)
133
(0.92 %)
416
(100.00 %)
3,852,502
(34.98 %)
1,112,185
(16.42 %)
11,435,533
(44.17 %)
75,215
(4.36 %)
258 fat dormouse (US078 2019)
GCA_004027185.1
n/a 23,122
(1.24 %)
48,677
(1.27 %)
n/a 42.33
(99.92 %)
10,685
(0.04 %)
444,115
(99.96 %)
6,783,404
(37.03 %)
1,642,515
(3.72 %)
12,706,289
(39.97 %)
65,521
(1.47 %)
259 fat sand rat (mPsaObe1 2021)
GCF_907164565.1
43,224
(2.50 %)
18,543
(1.78 %)
20,094
(1.42 %)
n/a 41.95
(99.11 %)
50,482
(0.90 %)
11,389
(100.00 %)
4,686,377
(43.10 %)
920,563
(1.85 %)
12,813,848
(35.08 %)
22,480
(0.71 %)
260 fat sand rat (Psa_ob012049795 2017)
GCA_002215935.1
n/a 21,644
(1.71 %)
31,665
(1.41 %)
n/a 41.99
(99.99 %)
n/a 96,427
(100.00 %)
4,646,110
(38.87 %)
946,664
(2.24 %)
13,134,526
(33.94 %)
26,411
(0.73 %)
261 fat-tailed dunnart (SCR6 2025)
GCF_048593235.1
60,212
(2.43 %)
15,763
(0.77 %)
16,031
(0.89 %)
n/a 36.12
(99.99 %)
1,908
(0.01 %)
8
(100.00 %)
5,302,378
(24.47 %)
1,450,227
(3.79 %)
20,870,714
(44.26 %)
24,586
(0.65 %)
262 fat-tailed dunnart (SCR6 hap1 2025)
GCA_048593235.1
n/a 15,762
(0.77 %)
16,035
(0.89 %)
n/a 36.12
(99.99 %)
1,908
(0.01 %)
1,915
(99.99 %)
5,302,372
(24.47 %)
1,450,220
(3.79 %)
20,870,654
(44.26 %)
24,585
(0.65 %)
263 fat-tailed dunnart (SCR6 hap2 2025)
GCA_048593295.1
n/a 16,012
(0.77 %)
16,430
(0.90 %)
n/a 36.18
(99.99 %)
1,730
(0.01 %)
1,737
(99.99 %)
5,361,847
(24.48 %)
1,474,744
(3.79 %)
21,021,671
(44.20 %)
25,669
(0.69 %)
264 fin whale (hap1.1 2025)
GCA_965194825.1
n/a 19,491
(1.21 %)
22,538
(1.06 %)
n/a 42.19
(99.99 %)
1,516
(0.01 %)
2,612
(100.00 %)
4,598,236
(35.34 %)
1,716,315
(24.14 %)
12,260,919
(52.40 %)
82,683
(1.47 %)
265 fin whale (hap2.1 2025)
GCA_965194765.1
n/a 18,684
(1.40 %)
21,322
(1.20 %)
n/a 41.87
(99.99 %)
1,258
(0.01 %)
3,706
(99.99 %)
4,103,716
(36.69 %)
1,030,821
(16.12 %)
11,633,934
(45.82 %)
74,782
(1.60 %)
266 fishing cat (Anna 2022 U Missouri)
GCF_022837055.1
68,085
(2.86 %)
18,432
(1.63 %)
19,912
(1.37 %)
n/a 41.91
(100.00 %)
63
(0.00 %)
192
(100.00 %)
4,777,906
(34.85 %)
937,432
(2.30 %)
13,438,032
(34.55 %)
70,402
(2.61 %)
267 Florida manatee (CSIC 2023)
GCA_030013775.1
n/a 19,432
(1.24 %)
24,035
(1.14 %)
n/a 40.66
(100.00 %)
33
(0.00 %)
15,641
(100.00 %)
4,400,331
(33.07 %)
439,615
(1.04 %)
14,884,753
(46.98 %)
32,563
(0.80 %)
268 Florida manatee (Lorelei 2012 refseq)
GCF_000243295.1
39,664
(2.08 %)
18,308
(1.37 %)
20,588
(1.23 %)
32,868
(1.38 %)
40.73
(89.24 %)
160,167
(10.78 %)
166,490
(89.22 %)
n/a 389,315
(0.74 %)
14,633,038
(38.46 %)
27,462
(0.64 %)
269 fossa
GCA_004023885.1
n/a 21,156
(1.56 %)
29,809
(1.38 %)
n/a 41.51
(99.94 %)
6,335
(0.03 %)
470,371
(99.97 %)
4,962,168
(42.36 %)
814,639
(1.52 %)
13,708,904
(34.14 %)
78,033
(2.52 %)
270 Gambian giant pouched rat
GCA_004027575.1
n/a 21,189
(1.59 %)
32,806
(1.43 %)
n/a 42.11
(99.88 %)
7,473
(0.03 %)
1,110,425
(99.97 %)
4,137,605
(24.57 %)
1,071,627
(2.76 %)
12,905,250
(32.78 %)
32,359
(0.80 %)
271 gayal (CVASU_BF_001 2021)
GCA_017311355.1
n/a 24,549
(1.09 %)
55,194
(1.15 %)
n/a 42.05
(99.91 %)
n/a 1,262,134
(100.00 %)
3,691,398
(22.78 %)
677,397
(2.00 %)
14,380,670
(42.36 %)
75,114
(1.33 %)
272 gayal (Nagaland 2019)
GCA_007844835.1
n/a 22,715
(1.55 %)
23,635
(1.33 %)
n/a 41.67
(96.51 %)
301,761
(3.52 %)
306,776
(96.48 %)
6,243,468
(45.69 %)
518,664
(1.99 %)
15,147,647
(37.64 %)
45,586
(0.89 %)
273 Geoffroy's bat (hap1.1 2025)
GCA_965115925.1
n/a 19,320
(1.74 %)
21,940
(1.65 %)
n/a 42.55
(99.99 %)
1,540
(0.01 %)
404
(100.00 %)
3,707,500
(37.60 %)
733,107
(7.78 %)
10,515,474
(39.35 %)
60,200
(2.41 %)
274 Geoffroy's bat (hap2.1 2025)
GCA_965115945.1
n/a 18,718
(1.71 %)
20,961
(1.62 %)
n/a 42.29
(99.98 %)
1,597
(0.02 %)
2,101
(99.98 %)
3,662,405
(37.72 %)
717,069
(7.80 %)
10,298,372
(39.22 %)
56,300
(2.26 %)
275 Geoffroy's cat
GCF_018350155.1
85,344
(3.53 %)
18,469
(1.66 %)
19,516
(1.36 %)
93,795
(4.83 %)
41.75
(100.00 %)
45
(0.00 %)
82
(100.00 %)
5,021,854
(43.23 %)
930,175
(1.84 %)
13,757,469
(34.29 %)
65,918
(2.36 %)
276 giant anteater
GCA_004026745.1
n/a 24,383
(0.91 %)
44,315
(0.93 %)
n/a 39.53
(99.88 %)
8,283
(0.02 %)
1,629,691
(99.98 %)
5,333,757
(35.57 %)
575,140
(0.91 %)
21,181,213
(39.97 %)
57,558
(0.94 %)
277 giant otter
GCA_004024605.1
n/a 21,199
(1.46 %)
30,565
(1.34 %)
n/a 41.71
(99.93 %)
7,431
(0.03 %)
652,159
(99.97 %)
5,113,769
(41.55 %)
788,677
(1.46 %)
14,385,279
(35.77 %)
82,376
(2.05 %)
278 giant panda (Jingjing v3 2020)
GCF_002007445.2
65,481
(3.27 %)
19,077
(1.67 %)
20,176
(1.39 %)
n/a 41.68
(98.09 %)
189,277
(1.92 %)
73,514
(100.00 %)
4,012,144
(34.40 %)
617,803
(1.99 %)
14,216,587
(30.41 %)
59,449
(1.50 %)
279 goat (v2 San Clemente 2016 USDA)
GCF_001704415.2
47,172
(2.31 %)
19,342
(1.38 %)
22,346
(1.24 %)
n/a 43.16
(100.00 %)
790
(0.00 %)
29,886
(100.00 %)
3,502,527
(22.45 %)
760,831
(7.07 %)
13,024,178
(44.85 %)
125,662
(4.00 %)
280 Gobi jerboa
GCA_004027895.1
n/a 22,410
(0.91 %)
45,268
(1.02 %)
n/a 41.94
(99.88 %)
10,987
(0.04 %)
1,295,369
(99.96 %)
8,828,417
(40.19 %)
1,979,806
(6.43 %)
14,759,732
(47.73 %)
24,314
(0.52 %)
281 golden hamster (Baylor 2021)
GCF_017639785.1
67,831
(3.37 %)
19,354
(1.71 %)
19,863
(1.47 %)
69,903
(4.39 %)
42.04
(96.99 %)
711
(3.01 %)
7,058
(96.99 %)
3,981,818
(27.65 %)
976,456
(3.46 %)
12,580,903
(32.87 %)
21,268
(0.61 %)
282 golden hamster (Broad 2013 refseq)
GCF_000349665.1
42,636
(2.91 %)
18,976
(1.82 %)
19,149
(1.51 %)
29,936
(1.96 %)
42.01
(82.92 %)
216,216
(17.12 %)
237,700
(82.88 %)
3,599,795
(26.09 %)
790,256
(1.69 %)
12,003,956
(24.29 %)
18,591
(0.51 %)
283 golden spiny mouse (2020)
GCF_903995435.1
36,997
(1.96 %)
20,006
(1.91 %)
19,132
(1.50 %)
n/a 42.51
(99.65 %)
880
(0.35 %)
623
(100.00 %)
4,785,907
(32.61 %)
1,305,613
(3.34 %)
12,958,061
(32.33 %)
20,760
(0.59 %)
284 golden-mantled ground squirrel (hap1 2025)
GCA_048772815.1
n/a 20,967
(0.89 %)
24,137
(0.94 %)
n/a 39.52
(99.99 %)
1,448
(0.01 %)
8,087
(100.00 %)
5,547,018
(29.30 %)
1,312,047
(10.07 %)
15,174,898
(52.73 %)
40,182
(0.59 %)
285 golden-mantled ground squirrel (hap2 2025 genbank)
GCA_048772825.1
n/a 19,719
(1.16 %)
22,611
(1.21 %)
n/a 39.48
(100.00 %)
643
(0.00 %)
2,820
(100.00 %)
4,725,546
(31.70 %)
997,950
(3.53 %)
14,753,550
(39.53 %)
33,465
(0.69 %)
286 golden-mantled ground squirrel (hap2 2025 refseq)
GCF_048772825.1
46,395
(1.71 %)
18,853
(1.19 %)
22,613
(1.21 %)
n/a 39.48
(100.00 %)
643
(0.00 %)
2,821
(100.00 %)
6,984,115
(50.68 %)
997,950
(3.53 %)
14,753,604
(39.53 %)
33,465
(0.69 %)
287 gracile shrew mole
GCA_004024945.1
n/a 19,165
(1.25 %)
43,816
(1.48 %)
n/a 41.08
(99.89 %)
8,248
(0.04 %)
732,083
(99.96 %)
2,957,465
(23.76 %)
783,289
(2.60 %)
11,503,344
(31.38 %)
92,729
(3.60 %)
288 gray fox (Vermont ataVT051 2023)
GCA_032313775.1
n/a 19,352
(1.42 %)
20,724
(1.33 %)
n/a 42.10
(100.00 %)
26
(0.00 %)
898
(100.00 %)
4,418,039
(36.90 %)
1,050,244
(11.63 %)
13,240,305
(39.50 %)
89,246
(2.69 %)
289 gray seal (241Hg 2020)
GCF_012393455.1
79,009
(3.73 %)
19,882
(1.73 %)
22,416
(1.46 %)
n/a 41.44
(100.00 %)
117
(0.00 %)
6,880
(100.00 %)
4,448,588
(43.28 %)
557,710
(1.32 %)
13,340,576
(33.41 %)
55,637
(1.78 %)
290 gray seal (hap1.1 2025)
GCA_964656455.1
n/a 19,291
(1.73 %)
20,301
(1.41 %)
n/a 41.56
(99.99 %)
1,130
(0.01 %)
171
(100.00 %)
4,245,582
(34.81 %)
600,624
(2.16 %)
13,240,803
(34.28 %)
56,932
(1.78 %)
291 gray seal (hap2.1 2025)
GCA_964656465.1
n/a 19,222
(1.73 %)
20,205
(1.41 %)
n/a 41.54
(99.99 %)
1,110
(0.01 %)
1,233
(99.99 %)
4,236,942
(34.95 %)
601,409
(1.99 %)
13,226,667
(34.03 %)
57,067
(1.82 %)
292 gray short-tailed opossum (mMonDom1 alternate hap 2023)
GCA_027917375.1
n/a 12,662
(0.70 %)
15,124
(0.89 %)
n/a 37.74
(100.00 %)
24
(0.00 %)
8,086
(100.00 %)
4,098,004
(25.33 %)
806,470
(2.98 %)
16,244,072
(43.39 %)
24,879
(0.67 %)
293 gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887165.1
73,383
(3.04 %)
16,637
(0.72 %)
16,036
(0.85 %)
n/a 37.92
(99.11 %)
2,255
(0.89 %)
13
(100.00 %)
5,562,359
(25.40 %)
1,096,620
(2.60 %)
22,322,748
(43.37 %)
28,894
(0.57 %)
294 gray short-tailed opossum (MonDom5 2007)
GCF_000002295.2
68,388
(2.34 %)
16,663
(0.75 %)
16,162
(0.84 %)
n/a 37.82
(97.26 %)
67,660
(2.75 %)
72,674
(97.25 %)
7,753,175
(55.85 %)
1,051,473
(2.34 %)
22,274,001
(42.23 %)
30,883
(0.53 %)
295 gray squirrel (2020)
GCF_902686445.1
59,073
(2.48 %)
20,752
(1.49 %)
21,107
(1.31 %)
32,732
(1.45 %)
40.06
(99.98 %)
1,824
(0.02 %)
752
(100.00 %)
4,605,578
(34.50 %)
728,192
(1.65 %)
15,467,412
(33.91 %)
51,878
(1.11 %)
296 gray squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685475.1
n/a 17,156
(1.53 %)
18,190
(1.33 %)
n/a 40.25
(100.00 %)
2
(0.00 %)
9,510
(100.00 %)
3,455,580
(34.94 %)
530,053
(1.56 %)
10,927,458
(32.64 %)
38,976
(1.13 %)
297 gray wolf (2021)
GCA_905319855.2
n/a 19,474
(1.55 %)
20,394
(1.40 %)
72,806
(4.12 %)
41.49
(100.00 %)
166
(0.00 %)
82
(100.00 %)
4,550,524
(31.76 %)
1,063,944
(3.96 %)
13,588,117
(34.74 %)
51,996
(2.15 %)
298 gray wolf (alternate hap 2021)
GCA_905319845.1
n/a 12,760
(1.57 %)
14,423
(1.42 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
1
(0.00 %)
5,537
(100.00 %)
2,725,227
(31.66 %)
616,862
(3.40 %)
8,041,744
(32.68 %)
32,293
(2.35 %)
299 great fruit-eating bat (hap1 2024)
GCA_038363145.1
n/a 18,022
(1.56 %)
19,824
(1.51 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
81
(0.00 %)
419
(100.00 %)
2,827,417
(26.82 %)
371,479
(4.97 %)
11,603,093
(34.64 %)
71,574
(2.28 %)
300 great fruit-eating bat (mArtLit1hap2 2024)
GCA_038363175.2
n/a 16,978
(1.61 %)
18,544
(1.54 %)
n/a 42.42
(100.00 %)
54
(0.00 %)
312
(100.00 %)
2,601,985
(26.67 %)
331,187
(4.87 %)
10,884,729
(33.93 %)
63,610
(2.71 %)
301 great fruit-eating bat (v2 hap1 2024)
GCA_038363095.2
n/a 18,051
(1.56 %)
19,955
(1.51 %)
n/a 42.45
(100.00 %)
45
(0.00 %)
487
(100.00 %)
2,841,143
(26.67 %)
379,430
(5.52 %)
11,651,542
(35.11 %)
72,337
(2.76 %)
302 great roundleaf bat (v2 ML-2016 2016)
GCF_001890085.2
50,908
(3.26 %)
18,993
(2.01 %)
19,633
(1.65 %)
41,769
(2.41 %)
41.11
(87.42 %)
172,750
(12.60 %)
7,387
(100.00 %)
2,946,981
(30.72 %)
495,272
(1.05 %)
11,587,728
(25.43 %)
32,949
(0.96 %)
303 greater bulldog bat
GCA_004026585.1
n/a 20,774
(1.62 %)
28,140
(1.63 %)
n/a 40.92
(99.94 %)
6,171
(0.03 %)
304,393
(99.97 %)
3,288,598
(29.60 %)
478,424
(1.16 %)
11,427,553
(35.29 %)
44,124
(1.99 %)
304 Greater cane rat
GCA_004025085.1
n/a 20,383
(0.98 %)
47,456
(1.25 %)
n/a 42.85
(99.83 %)
8,825
(0.03 %)
1,898,466
(99.97 %)
5,569,185
(30.19 %)
946,696
(3.12 %)
13,144,109
(41.83 %)
97,686
(2.61 %)
305 greater horseshoe bat (MPI-CBG alternate hap 2019)
GCA_004115295.1
n/a 14,896
(1.85 %)
18,939
(1.59 %)
n/a 40.69
(100.00 %)
2
(0.00 %)
13,426
(100.00 %)
2,426,330
(34.43 %)
418,341
(1.36 %)
8,763,234
(27.86 %)
24,370
(1.08 %)
306 greater horseshoe bat (v2 MPI-CBG 2019)
GCF_004115265.2
53,353
(3.13 %)
18,641
(1.97 %)
20,359
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
158
(0.36 %)
134
(100.00 %)
3,218,744
(34.52 %)
564,789
(1.35 %)
12,217,020
(29.39 %)
32,445
(1.06 %)
307 greater mouse-eared bat (2020 Bat1K)
GCF_014108235.1
70,930
(3.43 %)
19,052
(1.84 %)
21,498
(1.73 %)
n/a 43.11
(98.55 %)
538
(1.45 %)
93
(100.00 %)
3,088,083
(26.27 %)
753,124
(2.84 %)
10,383,466
(35.84 %)
61,023
(2.69 %)
308 greater mouse-tailed bat (20210906_DDa primary hap 2024)
GCA_043880545.1
n/a 18,582
(1.55 %)
20,954
(1.35 %)
n/a 42.46
(100.00 %)
152
(0.00 %)
106
(100.00 %)
4,158,629
(40.30 %)
696,150
(4.67 %)
12,702,667
(41.11 %)
257,446
(3.38 %)
309 greater sac-winged bat (primary hap 2024 refseq)
GCF_036850765.1
55,259
(2.53 %)
18,321
(1.40 %)
21,048
(1.35 %)
n/a 41.71
(98.73 %)
468
(1.27 %)
256
(100.00 %)
4,247,145
(29.53 %)
1,031,385
(2.50 %)
12,465,157
(43.30 %)
101,620
(2.01 %)
310 greater spear-nosed bat (2021 Texas Tech U)
GCF_019186645.2
50,563
(2.96 %)
18,224
(1.70 %)
20,689
(1.67 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
55
(0.00 %)
534
(100.00 %)
2,961,591
(0.00 %)
387,908
(0.97 %)
12,179,612
(30.91 %)
62,189
(5.35 %)
311 grey whale
GCA_004363415.1
n/a 21,827
(1.52 %)
32,191
(1.24 %)
n/a 41.22
(99.88 %)
10,622
(0.04 %)
1,046,770
(99.96 %)
4,841,166
(45.56 %)
780,015
(1.83 %)
13,559,563
(39.86 %)
72,343
(1.59 %)
312 grey whale (mEscRob2 alternate hap 2023)
GCA_028021475.1
n/a 19,129
(1.37 %)
24,628
(1.24 %)
n/a 41.83
(100.00 %)
n/a 14,442
(100.00 %)
3,892,130
(35.74 %)
874,864
(15.70 %)
11,484,916
(45.69 %)
73,507
(1.72 %)
313 grey whale (primary hap 2023 genbank)
GCA_028021215.1
n/a 19,288
(1.38 %)
21,791
(1.21 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
279
(0.00 %)
704
(100.00 %)
4,116,900
(35.85 %)
966,065
(16.74 %)
12,154,173
(46.39 %)
77,011
(1.59 %)
314 grey whale (primary hap 2023 refseq)
GCF_028021215.1
49,276
(1.90 %)
19,295
(1.38 %)
21,790
(1.21 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
279
(0.00 %)
703
(100.00 %)
4,116,894
(35.85 %)
966,064
(16.74 %)
12,154,101
(46.39 %)
77,011
(1.59 %)
315 hairy big-eared bat (US037 2019 Broad)
GCA_004026765.1
n/a 21,360
(1.44 %)
37,376
(1.52 %)
n/a 42.38
(99.94 %)
3,218
(0.01 %)
553,308
(99.99 %)
3,519,246
(30.77 %)
393,318
(0.85 %)
12,525,258
(34.42 %)
84,875
(2.37 %)
316 Hanaki's dwarf bat (2024)
GCA_964339955.1
n/a 17,856
(1.76 %)
20,604
(1.75 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
306
(0.00 %)
141
(100.00 %)
3,697,250
(33.21 %)
842,827
(8.27 %)
10,094,062
(38.40 %)
61,715
(2.96 %)
317 harbor porpoise (primary hap 2024 genbank)
GCA_963924675.1
n/a 18,529
(1.58 %)
20,583
(1.34 %)
n/a 41.72
(99.99 %)
966
(0.01 %)
442
(100.00 %)
3,760,716
(36.18 %)
888,368
(7.18 %)
12,379,240
(39.04 %)
71,530
(2.69 %)
318 harbor porpoise (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924675.1
33,578
(1.54 %)
18,528
(1.58 %)
20,582
(1.34 %)
n/a 41.72
(99.99 %)
966
(0.01 %)
1,405
(99.99 %)
3,760,713
(36.18 %)
888,368
(7.18 %)
12,379,181
(39.04 %)
71,530
(2.69 %)
319 harbor seal
GCF_004348235.1
50,657
(2.98 %)
19,484
(1.76 %)
20,771
(1.44 %)
33,296
(1.58 %)
41.38
(99.09 %)
16,480
(0.91 %)
21,161
(99.09 %)
4,526,182
(43.28 %)
576,921
(1.11 %)
13,421,780
(33.06 %)
54,592
(1.70 %)
320 Hawaiian monk seal (2021 Johns Hopkins U)
GCF_002201575.2
37,605
(1.99 %)
19,483
(1.73 %)
19,767
(1.35 %)
n/a 41.41
(98.23 %)
25,763
(1.77 %)
7,487
(100.00 %)
4,575,217
(43.59 %)
583,394
(1.11 %)
13,374,131
(33.69 %)
52,067
(1.50 %)
321 hazel dormouse
GCA_004027005.1
n/a 21,556
(1.24 %)
40,971
(1.33 %)
n/a 41.60
(99.91 %)
15,076
(0.06 %)
481,881
(99.94 %)
6,679,641
(33.98 %)
1,653,419
(3.72 %)
12,685,676
(43.98 %)
71,478
(1.57 %)
322 hazel dormouse (alternate hap 2023)
GCA_963383665.1
n/a 11,130
(1.23 %)
22,071
(1.36 %)
n/a 42.15
(99.99 %)
n/a 31,856
(100.00 %)
2,958,239
(41.25 %)
788,242
(4.52 %)
6,056,268
(41.88 %)
36,143
(1.96 %)
323 hazel dormouse (primary hap 2023)
GCA_963383645.1
n/a 18,620
(1.42 %)
22,403
(1.38 %)
n/a 41.73
(99.99 %)
1,805
(0.01 %)
214
(100.00 %)
6,063,911
(41.66 %)
1,593,657
(4.46 %)
12,229,281
(43.98 %)
71,058
(1.88 %)
324 hippopotamus (BS01 2019 Broad)
GCA_004027065.1
n/a 24,267
(1.55 %)
34,820
(1.30 %)
n/a 41.43
(99.91 %)
4,730
(0.02 %)
972,599
(99.98 %)
4,579,311
(41.26 %)
606,731
(1.02 %)
14,514,493
(36.58 %)
54,753
(1.59 %)
325 hippopotamus (HIP001 2018)
GCA_002995585.1
n/a 22,343
(1.70 %)
31,687
(1.45 %)
n/a 40.96
(94.63 %)
153,125
(5.38 %)
281,897
(94.62 %)
3,952,905
(38.55 %)
476,243
(1.97 %)
14,216,817
(27.43 %)
48,380
(1.43 %)
326 hippopotamus (mHipAmp2 hap1 2023)
GCA_030028035.1
n/a 20,391
(1.63 %)
20,668
(1.37 %)
n/a 41.62
(100.00 %)
83
(0.00 %)
545
(100.00 %)
3,778,764
(35.17 %)
563,345
(3.63 %)
13,524,869
(35.56 %)
48,164
(1.90 %)
327 hippopotamus (v2 hap2 2023 refseq)
GCF_030028045.1
64,153
(2.73 %)
20,331
(1.62 %)
20,633
(1.37 %)
n/a 41.60
(100.00 %)
226
(0.00 %)
357
(100.00 %)
3,783,440
(35.17 %)
567,797
(3.38 %)
13,462,531
(35.48 %)
48,365
(1.91 %)
328 hirola (BS46 2019 Broad)
GCA_004027495.1
n/a 22,264
(1.40 %)
36,984
(1.26 %)
n/a 42.31
(99.93 %)
9,287
(0.03 %)
545,176
(99.97 %)
5,809,405
(48.62 %)
465,001
(1.08 %)
13,326,245
(42.35 %)
48,312
(1.15 %)
329 Hispaniolan solenodon
GCA_004363575.1
n/a 18,805
(1.55 %)
27,454
(1.64 %)
n/a 39.98
(99.96 %)
5,186
(0.02 %)
181,804
(99.98 %)
2,669,787
(26.78 %)
431,610
(1.04 %)
13,429,711
(27.35 %)
53,444
(2.30 %)
330 hispid cotton rat
GCA_004025045.1
n/a 25,324
(1.49 %)
31,681
(1.31 %)
39,953
(1.43 %)
39.77
(99.89 %)
13,744
(0.05 %)
897,290
(99.95 %)
4,384,099
(28.17 %)
1,132,313
(3.34 %)
14,729,737
(38.08 %)
17,558
(0.40 %)
331 Hoffmann's two-fingered sloth
GCA_000164785.2
n/a 24,546
(1.30 %)
30,273
(1.15 %)
n/a 39.80
(98.09 %)
101,085
(1.91 %)
370,035
(98.09 %)
5,145,551
(52.20 %)
614,819
(1.62 %)
17,932,269
(39.26 %)
55,943
(1.04 %)
332 hog-nosed bat
GCA_004027555.1
n/a 20,591
(1.30 %)
39,589
(1.39 %)
n/a 40.99
(99.88 %)
6,224
(0.03 %)
1,230,480
(99.97 %)
4,081,924
(31.12 %)
1,008,077
(2.20 %)
12,068,828
(39.98 %)
55,567
(2.02 %)
333 Honduran yellow-shouldered bat (v2.1 Veracruz 20B 2020)
GCF_014824575.3
49,071
(2.78 %)
17,588
(1.64 %)
19,357
(1.60 %)
n/a 42.32
(99.79 %)
38,648
(0.21 %)
25,848
(100.00 %)
2,708,400
(27.89 %)
366,870
(1.48 %)
11,795,308
(31.27 %)
59,066
(1.72 %)
334 horse (maternal 2024)
GCA_036418255.1
n/a 16,789
(1.65 %)
18,017
(1.36 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
210
(0.00 %)
821
(100.00 %)
3,146,381
(34.68 %)
430,664
(5.91 %)
13,246,059
(32.62 %)
37,293
(2.80 %)
335 horse (paternal hap 2024)
GCA_036426135.1
n/a 19,073
(1.67 %)
20,636
(1.38 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
114
(0.00 %)
602
(100.00 %)
3,521,953
(35.39 %)
461,571
(5.26 %)
14,833,688
(32.77 %)
43,527
(2.54 %)
336 horse (thoroughbred H_3958 2024)
GCF_041296265.1
124,629
(3.91 %)
18,742
(1.47 %)
21,901
(1.39 %)
n/a 42.90
(99.96 %)
5
(0.04 %)
625
(100.00 %)
3,600,073
(33.96 %)
709,759
(8.89 %)
14,396,691
(35.72 %)
48,802
(5.67 %)
337 horse (Twilight 2018)
GCF_002863925.1
76,388
(4.03 %)
18,997
(1.73 %)
20,914
(1.42 %)
113,346
(6.08 %)
41.50
(99.62 %)
6,294
(0.38 %)
4,701
(100.00 %)
4,080,319
(44.85 %)
395,037
(1.44 %)
15,169,517
(29.93 %)
44,825
(1.77 %)
338 house mouse (129S1_SvImJv1 2016)
GCA_001624185.1
n/a 21,289
(2.22 %)
18,626
(1.42 %)
102,148
(4.16 %)
41.77
(85.00 %)
366,945
(15.05 %)
62,882
(95.15 %)
5,075,137
(40.38 %)
1,400,072
(2.80 %)
13,497,076
(26.20 %)
16,957
(0.40 %)
339 house mouse (129S1_SvImJ_v3 2022)
GCA_921998555.2
n/a 21,780
(2.13 %)
19,436
(1.37 %)
110,376
(4.47 %)
41.79
(99.60 %)
1,557
(0.40 %)
188
(100.00 %)
4,653,663
(40.74 %)
1,550,342
(3.54 %)
12,930,784
(35.48 %)
23,211
(0.57 %)
340 house mouse (AKR_J v3 2022)
GCA_922000895.2
n/a 21,721
(2.13 %)
19,324
(1.37 %)
110,654
(4.48 %)
41.80
(99.85 %)
2,714
(0.15 %)
201
(100.00 %)
4,645,513
(40.70 %)
1,547,237
(3.56 %)
13,016,932
(35.69 %)
23,309
(0.57 %)
341 house mouse (alternate hap 2023)
GCA_949316305.1
n/a 661
(0.88 %)
720
(0.54 %)
n/a 38.59
(100.00 %)
n/a 1,806
(100.00 %)
97,279
(72.21 %)
40,071
(55.89 %)
208,928
(64.94 %)
506
(0.31 %)
342 house mouse (A_J v3 2022)
GCA_921998355.2
n/a 21,869
(2.13 %)
19,400
(1.37 %)
110,389
(4.48 %)
41.80
(99.39 %)
608
(0.61 %)
163
(100.00 %)
4,668,553
(40.80 %)
1,556,835
(3.58 %)
12,995,938
(35.53 %)
23,203
(0.56 %)
343 house mouse (BALB_cJ v3 2022)
GCA_921997145.2
n/a 21,891
(2.13 %)
19,499
(1.37 %)
110,461
(4.47 %)
41.79
(99.80 %)
274
(0.20 %)
217
(100.00 %)
4,673,990
(40.79 %)
1,560,327
(3.63 %)
13,018,071
(35.70 %)
23,196
(0.56 %)
344 house mouse (C3H_HeJ v3 2022)
GCA_921997125.2
n/a 21,793
(2.13 %)
19,516
(1.38 %)
110,049
(4.46 %)
41.79
(99.05 %)
844
(0.95 %)
174
(100.00 %)
4,657,005
(40.76 %)
1,551,107
(3.53 %)
12,949,100
(35.32 %)
23,262
(0.56 %)
345 house mouse (C57BL_6J T2T 2024)
GCA_964188535.1
n/a 21,496
(1.92 %)
19,278
(1.25 %)
n/a 41.31
(99.85 %)
108
(0.15 %)
345
(99.85 %)
4,519,975
(46.81 %)
1,564,206
(14.33 %)
12,267,542
(42.16 %)
23,119
(0.55 %)
346 house mouse (CBA_J v3 2022)
GCA_921998905.2
n/a 21,829
(2.13 %)
19,841
(1.39 %)
110,858
(4.48 %)
41.79
(99.52 %)
658
(0.48 %)
145
(100.00 %)
4,658,032
(40.77 %)
1,552,298
(3.59 %)
12,948,038
(35.52 %)
23,232
(0.56 %)
347 house mouse (DBA_2J v3 2022)
GCA_921998315.2
n/a 22,302
(2.08 %)
19,749
(1.35 %)
113,269
(4.42 %)
41.72
(100.00 %)
153
(0.00 %)
361
(100.00 %)
4,785,676
(41.69 %)
1,597,598
(4.56 %)
13,190,158
(36.58 %)
24,140
(0.59 %)
348 house mouse (FVB_NJ v3 2022)
GCA_921998635.2
n/a 21,633
(2.15 %)
19,565
(1.40 %)
110,246
(4.50 %)
41.82
(98.35 %)
6,244
(1.65 %)
384
(100.00 %)
4,621,601
(40.42 %)
1,537,622
(3.48 %)
12,818,729
(34.77 %)
22,696
(0.55 %)
349 house mouse (LP_J v3 2022)
GCA_947599735.1
n/a 22,452
(1.91 %)
19,841
(1.23 %)
110,073
(3.98 %)
41.29
(99.99 %)
386
(0.01 %)
515
(100.00 %)
4,839,574
(46.33 %)
1,645,163
(11.88 %)
12,936,515
(41.49 %)
24,374
(0.54 %)
350 house mouse (NOD_ShiLtJ v3 2022)
GCA_921998325.2
n/a 21,797
(2.13 %)
19,521
(1.38 %)
109,890
(4.48 %)
41.80
(99.50 %)
1,462
(0.50 %)
170
(100.00 %)
4,650,016
(40.74 %)
1,547,220
(3.54 %)
12,918,125
(35.45 %)
23,253
(0.56 %)
351 house mouse (NZO_HlLtJ v3 2022)
GCA_947593165.1
n/a 22,481
(1.93 %)
19,932
(1.26 %)
109,670
(4.03 %)
41.34
(100.00 %)
234
(0.00 %)
441
(100.00 %)
4,822,230
(45.92 %)
1,637,027
(11.19 %)
13,082,730
(41.04 %)
24,187
(0.54 %)
352 house mouse (primary hap 2023)
GCA_949316315.1
n/a 22,351
(1.96 %)
19,629
(1.26 %)
n/a 41.38
(100.00 %)
101
(0.00 %)
179
(100.00 %)
4,774,018
(45.31 %)
1,620,102
(10.50 %)
13,181,250
(40.47 %)
23,955
(0.54 %)
353 house mouse C57BL/6J 2020 GRC
GCF_000001635.27
136,224
(4.84 %)
22,409
(2.02 %)
19,480
(1.31 %)
140,725
(4.83 %)
41.67
(97.30 %)
334
(2.70 %)
22,273
(97.30 %)
5,361,085
(45.51 %)
1,641,063
(3.41 %)
12,722,791
(36.04 %)
23,794
(0.53 %)
354 house mouse C57BL_6NJ (2016)
GCA_001632555.1
n/a 21,177
(2.23 %)
18,495
(1.42 %)
103,002
(4.20 %)
41.76
(82.53 %)
410,660
(17.53 %)
49,821
(96.37 %)
5,081,049
(40.22 %)
1,392,942
(2.58 %)
13,476,268
(25.21 %)
16,877
(0.39 %)
355 house mouse C57BL_6NJ (2022)
GCA_921999865.2
n/a 21,817
(2.13 %)
19,349
(1.37 %)
n/a 41.79
(99.76 %)
1,127
(0.24 %)
214
(100.00 %)
4,661,104
(40.76 %)
1,552,079
(3.56 %)
12,953,662
(35.57 %)
23,204
(0.56 %)
356 humpback whale (KW2013002 2024)
GCA_041834305.1
n/a 19,463
(1.32 %)
22,424
(1.19 %)
n/a 42.05
(100.00 %)
88
(0.00 %)
1,355
(100.00 %)
4,164,459
(34.02 %)
1,281,751
(18.33 %)
12,412,281
(48.28 %)
82,412
(1.67 %)
357 Iberian mole (v2.1 TD23 2020)
GCF_014898055.3
56,986
(3.41 %)
18,431
(1.69 %)
20,317
(1.59 %)
n/a 41.89
(99.89 %)
3,575
(0.11 %)
3,202
(100.00 %)
2,635,974
(23.38 %)
496,514
(1.29 %)
10,969,546
(32.61 %)
47,466
(2.89 %)
358 Indian false vampire
GCA_004026885.1
n/a 20,067
(1.37 %)
36,544
(1.53 %)
32,548
(1.37 %)
40.84
(99.83 %)
6,266
(0.02 %)
1,909,067
(99.98 %)
4,096,409
(31.50 %)
699,311
(1.81 %)
12,307,198
(39.96 %)
92,830
(3.12 %)
359 Indian flying fox
GCF_902729225.1
64,763
(3.85 %)
18,222
(2.01 %)
23,187
(1.82 %)
45,389
(2.18 %)
39.83
(99.10 %)
17,500
(0.90 %)
16,113
(100.00 %)
2,972,300
(34.11 %)
487,157
(1.49 %)
12,486,528
(27.37 %)
57,869
(3.73 %)
360 Indian short-nosed fruit bat (CYSPWHU 2023)
GCA_030015415.1
n/a 17,560
(2.04 %)
21,687
(1.83 %)
n/a 39.77
(100.00 %)
26
(0.00 %)
181
(100.00 %)
2,598,385
(30.48 %)
486,921
(1.41 %)
11,828,726
(27.28 %)
37,476
(5.58 %)
361 Indochinese shrew (US011 2019 Broad)
GCA_004027635.1
n/a 18,870
(0.51 %)
55,636
(0.81 %)
n/a 39.81
(99.83 %)
5,267
(0.02 %)
2,420,679
(99.98 %)
4,130,068
(16.60 %)
1,663,335
(3.30 %)
18,728,711
(46.19 %)
31,453
(0.55 %)
362 Indus River dolphin
GCA_004363435.1
n/a 24,321
(1.30 %)
47,065
(1.14 %)
n/a 41.72
(99.88 %)
11,702
(0.04 %)
1,110,492
(99.96 %)
5,093,308
(45.60 %)
845,860
(1.72 %)
13,162,111
(41.37 %)
68,257
(1.40 %)
363 Inner Mongolia cashmere goat (2024)
GCA_041735815.1
n/a 19,123
(1.40 %)
21,508
(1.26 %)
n/a 43.19
(100.00 %)
n/a 31
(100.00 %)
3,982,368
(23.76 %)
650,129
(7.44 %)
12,858,872
(44.33 %)
99,144
(2.87 %)
364 intermediate horseshoe bat (China 20211001_DDa primary hap 2024)
GCA_043728065.1
n/a 18,239
(1.76 %)
20,378
(1.53 %)
n/a 41.40
(100.00 %)
37
(0.00 %)
2,195
(100.00 %)
3,438,644
(42.82 %)
584,006
(9.54 %)
12,207,998
(35.49 %)
34,491
(1.02 %)
365 intermediate roundleaf bat (primary hap 2023)
GCA_031876335.1
n/a 19,064
(1.67 %)
20,800
(1.49 %)
n/a 41.55
(100.00 %)
119
(0.00 %)
69
(100.00 %)
3,393,548
(30.92 %)
723,545
(6.58 %)
12,073,117
(35.40 %)
43,736
(1.20 %)
366 jaguar (BS21 2019)
GCA_004023805.1
n/a 21,431
(1.51 %)
32,835
(1.35 %)
n/a 41.70
(99.89 %)
21,329
(0.09 %)
460,121
(99.91 %)
5,420,861
(43.75 %)
1,049,353
(1.93 %)
13,848,545
(34.90 %)
71,066
(2.37 %)
367 jaguar (hap1 2025)
GCA_046562885.1
n/a 17,882
(1.68 %)
19,103
(1.41 %)
n/a 41.66
(100.00 %)
140
(0.00 %)
115
(100.00 %)
4,622,385
(41.25 %)
893,297
(1.89 %)
12,851,116
(33.53 %)
61,319
(2.55 %)
368 jaguar (hap2 2025)
GCA_046562875.1
n/a 18,867
(1.64 %)
20,784
(1.40 %)
n/a 41.76
(100.00 %)
200
(0.00 %)
85
(100.00 %)
4,977,843
(41.75 %)
982,064
(2.10 %)
13,365,332
(34.16 %)
66,000
(2.75 %)
369 jaguar (Sample0147 2023)
GCF_028533385.1
71,578
(4.12 %)
19,122
(1.67 %)
21,950
(1.36 %)
n/a 41.58
(99.31 %)
56,371
(0.70 %)
36,243
(100.00 %)
4,552,854
(33.37 %)
897,371
(1.63 %)
13,732,912
(32.89 %)
63,777
(2.41 %)
370 jaguarundi
GCF_014898765.1
72,564
(3.15 %)
18,602
(1.64 %)
20,510
(1.39 %)
n/a 41.75
(97.85 %)
42,499
(2.16 %)
10,948
(100.00 %)
5,035,745
(43.29 %)
907,329
(1.61 %)
13,590,905
(33.57 %)
69,090
(2.29 %)
371 Jamaican fruit-eating bat (1a 2020 Wuhan U)
GCF_014825515.1
48,692
(2.72 %)
19,921
(1.66 %)
23,614
(1.68 %)
39,384
(2.12 %)
41.95
(98.87 %)
110,840
(1.13 %)
56,740
(100.00 %)
2,972,388
(28.79 %)
405,474
(2.15 %)
12,458,880
(30.65 %)
61,973
(1.87 %)
372 Jamaican fruit-eating bat (2021)
GCF_021234435.1
55,114
(3.18 %)
17,875
(1.68 %)
19,958
(1.66 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
3
(0.00 %)
868
(100.00 %)
2,697,287
(28.17 %)
318,700
(0.84 %)
11,750,329
(31.61 %)
61,951
(1.93 %)
373 Japanese wild mouse (2022)
GCA_921999095.2
n/a 23,292
(2.05 %)
20,114
(1.31 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
397
(0.00 %)
1,449
(100.00 %)
4,952,306
(42.53 %)
1,635,456
(4.60 %)
12,838,321
(38.56 %)
24,168
(0.56 %)
374 Java mouse-deer (US108 2019 Broad)
GCA_004024965.1
n/a 23,081
(1.38 %)
38,181
(1.41 %)
n/a 42.73
(99.91 %)
2,829
(0.01 %)
1,159,819
(99.99 %)
4,791,310
(34.97 %)
448,498
(1.92 %)
13,175,375
(39.89 %)
68,778
(2.92 %)
375 killer whale (2022)
GCF_937001465.1
78,479
(3.76 %)
18,710
(1.51 %)
21,101
(1.30 %)
34,448
(1.49 %)
41.91
(100.00 %)
123
(0.00 %)
448
(100.00 %)
3,955,401
(36.81 %)
844,672
(9.94 %)
12,233,568
(41.63 %)
77,307
(3.08 %)
376 killer whale (alternate hap 2022)
GCA_937001455.1
n/a 14,982
(1.50 %)
19,185
(1.30 %)
n/a 42.13
(100.00 %)
n/a 12,410
(100.00 %)
2,752,892
(35.61 %)
589,217
(10.15 %)
8,371,032
(41.11 %)
57,347
(3.41 %)
377 killer whale (Morgan 2013)
GCF_000331955.2
70,972
(3.55 %)
18,736
(1.86 %)
20,365
(1.48 %)
n/a 41.35
(94.82 %)
78,441
(5.20 %)
80,100
(94.80 %)
3,978,339
(43.98 %)
555,737
(1.13 %)
12,773,973
(31.51 %)
61,145
(1.59 %)
378 koala (Bilbo 61053 2022)
GCA_003287225.2
n/a 17,087
(0.81 %)
14,711
(0.86 %)
n/a 39.05
(100.00 %)
669
(0.00 %)
1,246
(100.00 %)
6,280,029
(29.77 %)
1,123,294
(2.02 %)
21,796,316
(39.24 %)
15,957
(0.35 %)
379 Kuhl's pipistrelle (2020)
GCF_014108245.1
65,654
(3.37 %)
17,918
(1.89 %)
20,819
(1.86 %)
n/a 42.57
(99.31 %)
394
(0.69 %)
202
(100.00 %)
2,897,422
(23.58 %)
797,420
(2.76 %)
10,057,100
(34.56 %)
55,965
(2.99 %)
380 large flying fox
GCF_000151845.1
52,243
(3.10 %)
18,454
(1.91 %)
23,631
(1.73 %)
n/a 39.82
(91.80 %)
189,340
(8.24 %)
225,433
(91.76 %)
3,117,045
(36.49 %)
504,277
(3.03 %)
13,025,556
(25.00 %)
78,404
(3.24 %)
381 large Japanese field mouse (IB14-021 2017)
GCA_002335545.1
n/a 22,630
(1.74 %)
33,810
(1.26 %)
n/a 42.04
(57.78 %)
4,289,924
(42.35 %)
4,626,044
(57.65 %)
3,638,537
(31.76 %)
1,048,253
(1.87 %)
12,039,926
(16.61 %)
19,817
(0.34 %)
382 large tree shrew (BS70 2022)
GCA_026018925.1
n/a 21,678
(1.34 %)
22,317
(1.25 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
1,188
(0.00 %)
1,198
(100.00 %)
5,530,547
(22.20 %)
1,357,640
(10.13 %)
14,334,312
(46.09 %)
123,453
(2.17 %)
383 least weasel (hap1.1 2025)
GCA_964662115.1
n/a 19,085
(1.11 %)
23,074
(1.09 %)
n/a 43.54
(99.98 %)
2,938
(0.02 %)
3,189
(100.00 %)
4,687,333
(25.05 %)
908,610
(10.98 %)
12,922,050
(49.64 %)
68,749
(2.22 %)
384 least weasel (hap2.1 2025)
GCA_964662095.1
n/a 18,255
(1.29 %)
22,201
(1.27 %)
n/a 42.68
(99.98 %)
2,709
(0.02 %)
4,948
(99.98 %)
4,268,233
(27.47 %)
787,850
(6.40 %)
12,592,088
(42.54 %)
62,416
(2.34 %)
385 leopard (Hobbes primary hap 2022)
GCF_024362965.1
70,501
(3.29 %)
18,472
(1.56 %)
20,388
(1.41 %)
n/a 41.75
(99.99 %)
335
(0.01 %)
382
(100.00 %)
4,634,038
(33.80 %)
932,991
(2.25 %)
13,686,652
(34.03 %)
65,793
(2.64 %)
386 leopard (Maewha 2016 refseq)
GCF_001857705.1
73,279
(3.20 %)
18,881
(1.63 %)
21,010
(1.44 %)
n/a 41.71
(96.17 %)
214,953
(3.85 %)
265,330
(96.15 %)
5,247,029
(42.87 %)
1,059,446
(5.13 %)
14,265,573
(32.20 %)
77,001
(2.45 %)
387 leopard cat
GCF_016509475.1
59,965
(3.05 %)
18,472
(1.65 %)
19,934
(1.38 %)
n/a 41.80
(100.00 %)
56
(0.00 %)
123
(100.00 %)
4,978,115
(43.28 %)
901,754
(1.84 %)
13,596,535
(34.23 %)
67,390
(2.50 %)
388 Leschenault's rousette (2020)
GCA_015472975.1
n/a 17,815
(2.05 %)
23,917
(1.90 %)
n/a 40.13
(99.14 %)
100,669
(0.88 %)
108,810
(99.12 %)
2,688,705
(31.20 %)
428,968
(1.19 %)
12,245,385
(26.51 %)
58,118
(6.81 %)
389 lesser Egyptian jerboa (2021)
GCF_020740685.1
51,730
(1.99 %)
20,129
(1.24 %)
22,089
(1.24 %)
40,414
(1.76 %)
42.00
(99.52 %)
561
(0.48 %)
160
(100.00 %)
7,346,291
(41.25 %)
1,187,587
(2.92 %)
14,222,177
(44.13 %)
34,688
(0.86 %)
390 lesser Egyptian jerboa (alternate hap 2021)
GCA_020740715.1
n/a 17,777
(1.27 %)
19,232
(1.28 %)
n/a 42.13
(92.75 %)
2,875
(7.25 %)
508
(100.00 %)
6,476,967
(33.93 %)
999,133
(2.78 %)
11,809,834
(40.52 %)
29,872
(0.82 %)
391 lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 refseq)
GCF_000280705.1
25,978
(1.44 %)
19,408
(1.38 %)
20,312
(1.35 %)
n/a 41.87
(87.17 %)
326,464
(12.87 %)
337,360
(87.13 %)
6,125,934
(38.31 %)
832,825
(1.53 %)
13,661,612
(33.98 %)
26,669
(0.59 %)
392 lesser false vampire bat (Vietnam 20211001_DDb primary hap 2024)
GCA_043880595.1
n/a 18,484
(1.87 %)
24,356
(1.84 %)
n/a 41.88
(97.91 %)
866
(2.09 %)
617
(99.68 %)
3,419,622
(36.65 %)
663,182
(2.53 %)
11,508,574
(30.58 %)
84,174
(4.85 %)
393 lesser horseshoe bat (hap1 2024)
GCA_964194185.1
n/a 19,031
(1.88 %)
21,003
(1.63 %)
n/a 40.81
(99.99 %)
1,627
(0.01 %)
723
(100.00 %)
3,133,745
(33.46 %)
660,064
(3.79 %)
11,720,176
(32.32 %)
35,414
(1.75 %)
394 lesser horseshoe bat (hap2 2024)
GCA_964194215.1
n/a 18,875
(1.72 %)
21,166
(1.58 %)
n/a 41.18
(99.99 %)
1,648
(0.01 %)
2,727
(99.99 %)
3,160,659
(34.00 %)
696,130
(6.23 %)
11,662,645
(34.26 %)
36,176
(1.80 %)
395 lesser noctule (v2 hap1 2025)
GCA_964264875.2
n/a 18,342
(1.54 %)
22,974
(1.62 %)
n/a 43.04
(100.00 %)
302
(0.00 %)
588
(100.00 %)
4,258,096
(37.31 %)
1,289,911
(11.51 %)
9,694,758
(42.52 %)
65,974
(2.80 %)
396 lesser noctule (v2 hap2 2025)
GCA_964264895.2
n/a 17,492
(1.62 %)
22,188
(1.72 %)
n/a 43.10
(100.00 %)
247
(0.00 %)
920
(100.00 %)
3,886,341
(36.52 %)
1,139,308
(10.89 %)
9,356,457
(40.65 %)
62,254
(3.00 %)
397 lesser panda (RP43 2017)
GCA_002007465.1
n/a 19,120
(1.69 %)
20,591
(1.50 %)
n/a 41.60
(98.56 %)
137,333
(1.45 %)
148,922
(98.55 %)
4,513,888
(40.87 %)
692,778
(1.62 %)
13,691,859
(31.36 %)
64,369
(2.52 %)
398 lesser sac-winged bat (primary hap 2024 refseq)
GCF_036850995.1
53,210
(2.49 %)
18,323
(1.42 %)
21,350
(1.39 %)
n/a 41.84
(99.24 %)
573
(0.76 %)
168
(100.00 %)
4,224,344
(28.69 %)
1,030,576
(2.60 %)
12,591,989
(42.30 %)
98,189
(2.06 %)
399 lion
GCF_018350215.1
67,745
(2.86 %)
17,956
(1.69 %)
19,033
(1.40 %)
61,242
(3.04 %)
41.71
(100.00 %)
55
(0.00 %)
99
(100.00 %)
4,666,951
(42.23 %)
889,987
(1.87 %)
13,151,686
(33.40 %)
62,675
(2.56 %)
400 little brown bat
GCF_000147115.1
50,660
(2.76 %)
19,314
(1.86 %)
22,683
(1.70 %)
n/a 42.50
(96.66 %)
61,131
(3.35 %)
72,785
(96.65 %)
3,682,263
(37.05 %)
634,854
(2.15 %)
10,841,759
(33.45 %)
57,630
(1.79 %)
401 little pocket mouse (longimembris alternate hap 2022)
GCA_024363435.1
n/a 19,150
(1.52 %)
23,435
(1.64 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
229
(0.00 %)
718
(100.00 %)
n/a 1,051,300
(12.43 %)
9,858,628
(43.20 %)
48,101
(2.62 %)
402 little pocket mouse (longimembris primary hap 2022)
GCA_024363575.1
n/a 19,760
(1.50 %)
24,317
(1.63 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
215
(0.00 %)
1,135
(100.00 %)
3,913,744
(28.43 %)
1,095,577
(12.70 %)
10,273,833
(43.74 %)
49,636
(2.61 %)
403 little tube-nosed bat
GCA_004026665.1
n/a 22,009
(1.26 %)
45,725
(1.35 %)
n/a 43.80
(99.90 %)
6,795
(0.03 %)
886,972
(99.97 %)
3,372,804
(23.57 %)
1,014,476
(3.00 %)
11,948,592
(41.18 %)
71,530
(2.05 %)
404 long-finned pilot whale (v2 primary hap 2024 refseq)
GCF_963455315.2
61,447
(2.80 %)
18,725
(1.51 %)
20,946
(1.39 %)
n/a 42.38
(99.99 %)
1,084
(0.01 %)
2,076
(99.99 %)
4,125,452
(35.62 %)
1,577,896
(12.03 %)
12,347,170
(42.01 %)
71,822
(5.51 %)
405 long-finned pilot whale (X-22926-18 2019)
GCF_006547405.1
66,117
(3.28 %)
18,772
(1.80 %)
21,031
(1.46 %)
33,672
(1.78 %)
41.29
(99.58 %)
14,859
(0.42 %)
20,999
(99.58 %)
3,962,125
(45.58 %)
557,247
(1.11 %)
12,616,535
(34.70 %)
62,905
(1.69 %)
406 long-tailed chinchilla
GCF_000276665.1
54,854
(2.98 %)
18,096
(1.59 %)
19,514
(1.52 %)
n/a 41.06
(95.56 %)
78,817
(4.46 %)
81,656
(95.54 %)
4,018,866
(30.94 %)
607,082
(1.15 %)
13,528,234
(28.15 %)
46,931
(1.25 %)
407 long-tongued fruit bat (US102 2019 Broad)
GCA_004027375.1
n/a 19,208
(1.99 %)
31,180
(1.92 %)
n/a 39.56
(99.97 %)
2,056
(0.01 %)
174,041
(99.99 %)
2,893,453
(32.61 %)
597,516
(1.76 %)
12,093,608
(28.14 %)
63,015
(4.70 %)
408 Lowland paca
GCA_004365215.1
n/a 21,953
(0.62 %)
56,356
(0.80 %)
n/a 40.83
(99.78 %)
3,060
(0.01 %)
3,771,510
(99.99 %)
5,892,507
(29.20 %)
802,811
(1.38 %)
18,630,883
(38.61 %)
61,715
(0.94 %)
409 Malayan pangolin (MJ-LG 2024)
GCF_040802235.1
87,404
(4.24 %)
18,382
(1.54 %)
19,802
(1.30 %)
n/a 41.03
(100.00 %)
90
(0.00 %)
63
(100.00 %)
3,146,889
(38.39 %)
384,539
(2.15 %)
12,642,995
(34.68 %)
48,454
(1.30 %)
410 Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 refseq)
GCF_001685135.1
48,591
(2.76 %)
19,458
(1.57 %)
24,783
(1.38 %)
41,272
(1.95 %)
40.78
(92.27 %)
984,658
(7.81 %)
80,670
(100.00 %)
3,064,599
(35.21 %)
866,309
(3.08 %)
13,310,859
(28.76 %)
35,558
(0.84 %)
411 Malayan pangolin YNU ManJav 2.0
GCF_014570535.1
68,043
(3.50 %)
18,167
(1.72 %)
20,453
(1.54 %)
n/a 40.83
(91.78 %)
57,746
(8.23 %)
17,969
(100.00 %)
2,864,567
(34.23 %)
277,996
(1.69 %)
12,659,207
(25.72 %)
33,486
(1.00 %)
412 marsupial mole (Waite Creek area ABTC07570 2025)
GCA_048126345.1
n/a 25,281
(0.80 %)
18,740
(0.87 %)
n/a 37.80
(99.99 %)
196
(0.01 %)
889
(99.99 %)
6,538,990
(26.08 %)
1,450,668
(2.40 %)
21,374,371
(47.19 %)
17,923
(0.30 %)
413 Masai giraffe (MA1 2016 Penn St)
GCA_001651235.1
n/a 20,950
(1.52 %)
28,854
(1.33 %)
n/a 41.39
(96.50 %)
257,672
(3.48 %)
770,838
(96.52 %)
5,502,479
(43.94 %)
531,418
(2.64 %)
13,936,018
(36.18 %)
40,504
(1.02 %)
414 meadow jumping mouse
GCA_004024765.1
n/a 22,236
(1.08 %)
44,719
(1.21 %)
n/a 42.31
(99.88 %)
7,610
(0.03 %)
1,165,710
(99.97 %)
6,135,446
(33.31 %)
1,525,146
(3.34 %)
13,854,475
(39.91 %)
26,633
(0.68 %)
415 meadow vole (hap1 2024 genbank)
GCA_037038515.1
n/a 19,134
(1.78 %)
20,672
(1.55 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
60
(0.00 %)
181
(100.00 %)
4,818,689
(41.90 %)
962,362
(4.16 %)
12,161,222
(34.42 %)
23,781
(0.74 %)
416 meadow vole (hap1 2024 refseq)
GCF_037038515.1
56,969
(2.88 %)
19,974
(1.74 %)
20,672
(1.55 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
60
(0.00 %)
180
(100.00 %)
4,116,239
(33.62 %)
962,362
(4.16 %)
12,161,153
(34.42 %)
23,781
(0.74 %)
417 meadow vole (hap2 2024)
GCA_037039175.1
n/a 19,001
(1.82 %)
20,271
(1.68 %)
n/a 42.58
(100.00 %)
53
(0.00 %)
143
(100.00 %)
3,141,368
(21.37 %)
898,900
(4.24 %)
11,475,531
(32.14 %)
22,186
(0.75 %)
418 meerkat (VVHF042 2019 DNA Zoo refseq)
GCF_006229205.1
58,806
(2.67 %)
19,009
(1.64 %)
19,088
(1.36 %)
n/a 41.68
(99.72 %)
65,245
(0.28 %)
63,791
(100.00 %)
4,564,931
(40.13 %)
634,179
(1.21 %)
13,631,635
(32.17 %)
64,858
(2.22 %)
419 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 alternate hap 2022)
GCA_024711525.1
n/a 18,555
(1.22 %)
24,508
(1.35 %)
n/a 42.04
(100.00 %)
181
(0.00 %)
3,482
(100.00 %)
6,419,007
(53.84 %)
1,384,128
(15.63 %)
11,486,822
(50.51 %)
38,521
(1.60 %)
420 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022)
GCA_024711535.1
n/a 21,281
(1.16 %)
28,592
(1.34 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
182
(0.00 %)
4,354
(100.00 %)
4,378,955
(29.66 %)
1,568,842
(17.75 %)
12,889,786
(51.96 %)
46,167
(1.71 %)
421 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022)
GCF_024711535.1
68,331
(2.37 %)
21,280
(1.16 %)
28,582
(1.34 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
182
(0.00 %)
4,535
(100.00 %)
4,378,949
(29.66 %)
1,568,842
(17.75 %)
12,889,725
(51.96 %)
46,167
(1.71 %)
422 Merriam's long-tongued bat (hap1 2024)
GCA_039655065.1
n/a 18,172
(1.67 %)
20,736
(1.60 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
47
(0.00 %)
82
(100.00 %)
2,998,913
(29.48 %)
418,833
(1.07 %)
11,783,716
(32.96 %)
65,956
(4.38 %)
423 Merriam's long-tongued bat (hap2 2024)
GCA_039656995.1
n/a 18,105
(1.68 %)
20,751
(1.60 %)
n/a 42.18
(100.00 %)
45
(0.00 %)
71
(100.00 %)
2,994,788
(29.48 %)
415,375
(1.07 %)
11,752,432
(32.88 %)
65,597
(4.38 %)
424 Mexican gray wolf (hap1 2025 refseq)
GCF_048164855.1
112,768
(4.40 %)
19,582
(1.52 %)
20,911
(1.39 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
167
(0.00 %)
249
(100.00 %)
4,598,813
(31.70 %)
1,102,136
(4.40 %)
13,591,364
(35.18 %)
53,470
(2.24 %)
425 Mexican gray wolf (hap2 2025)
GCA_048164845.1
n/a 18,738
(1.56 %)
19,759
(1.41 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
124
(0.00 %)
155
(100.00 %)
4,265,479
(32.40 %)
1,030,876
(4.11 %)
12,818,772
(34.22 %)
50,269
(2.22 %)
426 minke whale (2013 refseq)
GCF_000493695.1
42,553
(2.38 %)
19,159
(1.73 %)
18,656
(1.42 %)
n/a 40.94
(94.06 %)
173,296
(5.96 %)
184,072
(94.04 %)
n/a 573,951
(1.48 %)
13,504,347
(30.96 %)
65,448
(1.38 %)
427 minke whale (alternate hap 2023)
GCA_950005055.1
n/a 20,412
(1.46 %)
27,421
(1.34 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
1
(0.00 %)
21,272
(100.00 %)
3,811,435
(36.24 %)
959,712
(10.27 %)
12,159,896
(41.30 %)
69,852
(1.62 %)
428 minke whale (primary hap 2023 refseq)
GCF_949987535.1
61,711
(2.51 %)
19,550
(1.49 %)
21,499
(1.26 %)
n/a 41.55
(99.99 %)
1,177
(0.01 %)
1,374
(100.00 %)
4,006,927
(35.92 %)
1,058,105
(12.08 %)
12,708,103
(42.66 %)
72,756
(1.59 %)
429 Mongolian gerbil (243 2017 Lucigen Corp.)
GCF_002204375.1
40,359
(2.29 %)
21,215
(1.83 %)
24,305
(1.47 %)
n/a 42.09
(95.23 %)
91,601
(4.78 %)
68,793
(100.00 %)
4,821,343
(37.74 %)
940,776
(1.82 %)
13,848,274
(31.31 %)
24,154
(0.74 %)
430 Mongolian gerbil (EAM2014 2019 BGI)
GCA_008131255.1
n/a 19,952
(1.59 %)
23,462
(1.36 %)
n/a 41.98
(99.01 %)
103,843
(0.97 %)
412,933
(99.03 %)
5,009,454
(0.00 %)
1,042,929
(2.52 %)
14,121,194
(34.63 %)
26,044
(0.71 %)
431 Mongolian gerbil (TT.TT164.6M 2023)
GCF_030254825.1
65,502
(2.97 %)
19,045
(1.53 %)
20,203
(1.29 %)
n/a 41.87
(100.00 %)
53
(0.00 %)
193
(100.00 %)
4,477,607
(37.21 %)
1,124,432
(5.22 %)
13,244,320
(39.20 %)
25,300
(0.76 %)
432 monito del monte (mDroGli1 alternate hap 2021)
GCA_019395325.1
n/a 16,419
(0.77 %)
17,219
(0.89 %)
n/a 39.03
(100.00 %)
33
(0.00 %)
9,959
(100.00 %)
6,332,360
(29.69 %)
1,065,454
(2.09 %)
17,908,986
(42.25 %)
13,856
(0.35 %)
433 monito del monte (primary hap 2021 refseq)
GCF_019393635.1
47,034
(2.02 %)
18,399
(0.80 %)
15,519
(0.85 %)
n/a 39.11
(99.91 %)
260
(0.09 %)
17
(100.00 %)
9,107,968
(41.08 %)
1,249,635
(2.12 %)
21,135,324
(42.80 %)
16,598
(0.36 %)
434 Montane guinea pig
GCA_004027695.1
n/a 20,064
(1.06 %)
31,321
(1.18 %)
39,905
(1.42 %)
40.09
(99.88 %)
11,321
(0.04 %)
1,379,500
(99.96 %)
4,730,634
(30.02 %)
1,583,664
(6.57 %)
15,806,339
(40.40 %)
37,371
(0.76 %)
435 moose/elk (2024)
GCA_964270355.1
n/a 19,816
(1.60 %)
22,341
(1.44 %)
n/a 41.70
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1,737
(100.00 %)
3,099,775
(24.20 %)
406,796
(2.52 %)
13,117,056
(38.34 %)
50,644
(1.33 %)
436 moose/elk (AALL_1980 2023)
GCA_015832495.2
n/a 19,116
(1.66 %)
21,184
(1.45 %)
n/a 41.55
(95.50 %)
71,769
(4.51 %)
77,708
(95.49 %)
3,026,678
(23.77 %)
373,266
(0.91 %)
13,167,376
(34.08 %)
44,302
(1.21 %)
437 moose/elk (MIG12-28694850 2019)
GCA_007570765.1
n/a 21,375
(1.65 %)
26,769
(1.42 %)
n/a 41.64
(92.66 %)
83,831
(7.35 %)
131,373
(92.65 %)
5,022,053
(43.27 %)
384,658
(1.22 %)
13,422,381
(34.52 %)
49,216
(1.18 %)
438 mountain beaver
GCA_004027875.1
n/a 22,428
(1.10 %)
38,670
(1.12 %)
n/a 40.58
(99.89 %)
7,253
(0.02 %)
1,286,779
(99.98 %)
5,859,004
(32.29 %)
914,052
(2.37 %)
16,249,666
(38.21 %)
39,133
(0.76 %)
439 muskrat
GCA_004026605.1
n/a 22,540
(1.52 %)
32,136
(1.35 %)
n/a 41.59
(99.93 %)
6,243
(0.02 %)
571,599
(99.98 %)
4,437,736
(28.49 %)
922,826
(2.38 %)
13,945,732
(35.23 %)
19,876
(0.50 %)
440 naked mole-rat (2022)
GCA_944319725.1
n/a 20,755
(1.51 %)
20,024
(1.35 %)
n/a 39.98
(99.96 %)
2,332
(0.04 %)
264
(100.00 %)
3,593,261
(30.76 %)
529,045
(1.14 %)
13,294,831
(36.07 %)
32,235
(0.93 %)
441 naked mole-rat (MEF-2018 2020)
GCA_014060925.1
n/a 22,011
(1.30 %)
21,392
(1.22 %)
n/a 40.13
(95.11 %)
139,535
(4.91 %)
148,797
(95.09 %)
4,885,102
(35.91 %)
654,418
(1.90 %)
16,401,315
(34.21 %)
40,717
(0.98 %)
442 naked mole-rat (NMR 29 2012 refseq)
GCF_000247695.1
74,587
(3.56 %)
21,332
(1.74 %)
20,861
(1.51 %)
n/a 40.21
(88.43 %)
110,424
(11.59 %)
114,653
(88.41 %)
4,179,991
(32.69 %)
484,933
(0.92 %)
13,672,561
(27.63 %)
31,950
(0.88 %)
443 narwhal (Baffin Bay 2019)
GCF_005190385.1
51,639
(2.71 %)
18,741
(1.78 %)
20,365
(1.40 %)
33,148
(1.79 %)
41.22
(99.52 %)
18,323
(0.49 %)
6,972
(100.00 %)
4,011,742
(43.97 %)
565,367
(1.22 %)
12,720,018
(34.85 %)
60,492
(1.58 %)
444 narwhal (Baffin Bay Population NGI 2022)
GCA_005190385.3
n/a 18,681
(1.79 %)
19,816
(1.40 %)
n/a 41.26
(100.00 %)
313
(0.00 %)
101
(100.00 %)
3,618,235
(37.24 %)
612,229
(1.52 %)
12,641,632
(35.02 %)
60,518
(1.78 %)
445 Natal long-fingered bat
GCF_001595765.1
32,050
(3.03 %)
18,015
(2.17 %)
18,293
(1.87 %)
n/a 42.07
(96.24 %)
204,616
(3.79 %)
1,269
(100.00 %)
2,565,457
(28.95 %)
376,532
(1.91 %)
10,427,823
(26.35 %)
63,261
(2.07 %)
446 Nathusius's pipistrelle (hap1.1 2025)
GCA_964656225.1
n/a 18,001
(1.75 %)
21,219
(1.77 %)
n/a 42.26
(99.98 %)
1,836
(0.02 %)
1,062
(100.00 %)
3,664,854
(32.90 %)
906,692
(8.55 %)
10,164,440
(37.98 %)
56,705
(2.75 %)
447 Nathusius's pipistrelle (hap2.1 2025)
GCA_964656075.1
n/a 17,899
(1.71 %)
20,808
(1.69 %)
n/a 42.15
(99.98 %)
1,832
(0.02 %)
2,485
(99.98 %)
3,637,576
(31.92 %)
930,013
(11.25 %)
9,967,930
(39.61 %)
56,237
(2.62 %)
448 Nathusius's pipistrelle (primary hap 2024)
GCA_963693515.1
n/a 17,944
(1.86 %)
20,545
(1.83 %)
n/a 42.45
(100.00 %)
263
(0.00 %)
154
(100.00 %)
3,628,328
(34.57 %)
838,723
(4.04 %)
10,155,601
(35.22 %)
56,332
(2.92 %)
449 Natterer's bat (hap1.2 2025)
GCA_964212035.2
n/a 19,475
(1.82 %)
22,424
(1.68 %)
n/a 43.15
(100.00 %)
225
(0.00 %)
212
(100.00 %)
3,841,654
(38.99 %)
801,041
(5.78 %)
10,278,311
(38.66 %)
64,639
(2.57 %)
450 Natterer's bat (hap2.2 2025)
GCA_964212025.2
n/a 18,368
(1.91 %)
21,701
(1.80 %)
n/a 43.27
(100.00 %)
136
(0.00 %)
309
(100.00 %)
3,509,151
(38.16 %)
704,537
(5.21 %)
9,806,703
(36.74 %)
61,004
(2.65 %)
451 neotropical fruit bat
GCF_014824575.2
49,109
(2.78 %)
17,703
(1.63 %)
19,389
(1.60 %)
n/a 42.32
(99.79 %)
38,675
(0.21 %)
26,068
(100.00 %)
2,862,405
(29.31 %)
366,960
(1.48 %)
11,796,203
(31.27 %)
59,091
(1.70 %)
452 Nilgiri tahr
GCA_004026825.1
n/a 22,735
(1.44 %)
34,961
(1.27 %)
n/a 42.37
(99.93 %)
10,387
(0.04 %)
479,550
(99.96 %)
5,793,761
(48.50 %)
535,297
(1.34 %)
13,378,352
(42.46 %)
57,653
(1.29 %)
453 nine-banded armadillo (v2 hap1 2023)
GCA_030445055.2
n/a 19,350
(1.07 %)
22,207
(1.07 %)
n/a 40.97
(99.27 %)
823
(0.73 %)
588
(100.00 %)
4,330,716
(32.85 %)
661,966
(1.52 %)
18,302,021
(42.22 %)
130,245
(2.79 %)
454 nine-banded armadillo (v2 hap2 2023)
GCF_030445035.2
72,174
(2.47 %)
21,051
(1.11 %)
24,418
(1.07 %)
n/a 41.00
(99.67 %)
793
(0.33 %)
546
(100.00 %)
5,412,063
(53.31 %)
738,320
(2.02 %)
19,755,423
(43.69 %)
142,597
(2.85 %)
455 nine-banded armadillo (v3.2 3-136 2012 Baylor)
GCF_000208655.3
46,110
(1.87 %)
20,820
(1.08 %)
25,226
(1.08 %)
n/a 40.77
(90.89 %)
268,437
(9.13 %)
314,788
(90.87 %)
4,552,770
(34.01 %)
651,225
(1.26 %)
19,266,969
(38.27 %)
139,490
(2.47 %)
456 North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 alternate hap 2022)
GCA_026167925.1
n/a 19,342
(1.57 %)
20,947
(1.48 %)
n/a 42.40
(100.00 %)
229
(0.00 %)
1,006
(100.00 %)
4,161,568
(23.13 %)
1,278,205
(8.22 %)
13,148,019
(37.60 %)
23,523
(0.71 %)
457 North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 primary hap 2022)
GCA_026229955.1
n/a 19,700
(1.54 %)
22,354
(1.46 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
244
(0.00 %)
2,082
(100.00 %)
6,089,884
(47.99 %)
1,358,786
(9.39 %)
13,799,349
(39.08 %)
24,733
(0.70 %)
458 North American porcupine (mEreDor1 alternate hap 2023)
GCA_028500835.1
n/a 15,210
(1.55 %)
18,316
(1.43 %)
n/a 41.06
(100.00 %)
1
(0.00 %)
5,051
(100.00 %)
3,911,633
(40.55 %)
565,546
(1.54 %)
10,853,726
(32.61 %)
40,925
(1.35 %)
459 North American porcupine (mEreDor1 primary hap 2023)
GCA_028451465.1
n/a 18,102
(1.58 %)
20,073
(1.40 %)
n/a 41.03
(100.00 %)
277
(0.00 %)
116
(100.00 %)
4,958,089
(41.64 %)
719,163
(1.59 %)
13,867,662
(33.89 %)
51,299
(1.36 %)
460 North Atlantic right whale (hap1 2023)
GCA_028571275.1
n/a 18,699
(1.61 %)
20,354
(1.28 %)
n/a 41.64
(99.84 %)
385
(0.16 %)
947
(100.00 %)
3,815,900
(43.46 %)
718,935
(11.38 %)
11,928,210
(42.25 %)
85,881
(1.90 %)
461 North Atlantic right whale (hap2 + XY 2023 refseq)
GCF_028564815.1
49,646
(1.86 %)
19,562
(1.46 %)
21,631
(1.25 %)
n/a 41.69
(99.83 %)
367
(0.17 %)
789
(100.00 %)
1,368,536
(2.24 %)
841,303
(13.08 %)
12,527,582
(43.92 %)
94,259
(1.92 %)
462 North Pacific right whale
GCA_004363455.1
n/a 23,145
(1.43 %)
38,161
(1.21 %)
n/a 41.15
(99.88 %)
7,094
(0.03 %)
1,361,057
(99.97 %)
5,039,622
(45.69 %)
694,986
(1.31 %)
14,063,101
(40.51 %)
74,800
(1.52 %)
463 northern American river otter
GCF_010015895.1
53,945
(2.18 %)
18,974
(1.68 %)
21,247
(1.45 %)
n/a 41.41
(99.58 %)
7,620
(0.42 %)
13,541
(99.58 %)
4,538,847
(41.18 %)
685,281
(1.20 %)
13,840,953
(32.61 %)
53,559
(1.88 %)
464 northern bat (alternate hap 2023)
GCA_951640545.1
n/a 18,343
(1.80 %)
23,253
(1.77 %)
n/a 43.55
(100.00 %)
3
(0.00 %)
4,899
(100.00 %)
1,174,241
(2.96 %)
825,170
(5.11 %)
9,889,579
(36.12 %)
76,164
(3.52 %)
465 northern bat (primary hap 2023)
GCA_951640355.1
n/a 18,636
(1.75 %)
21,446
(1.68 %)
n/a 43.32
(99.99 %)
1,423
(0.01 %)
207
(100.00 %)
1,259,729
(2.95 %)
905,676
(6.25 %)
10,554,535
(38.21 %)
77,656
(3.27 %)
466 northern black mastiff bat (mMolNig1 2022)
GCA_026936385.1
n/a 18,924
(1.53 %)
22,934
(1.58 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
199
(0.00 %)
146
(100.00 %)
3,850,624
(31.21 %)
648,359
(3.76 %)
11,788,702
(39.25 %)
85,908
(2.60 %)
467 northern black mastiff bat (mMolNig1hap1 2024)
GCA_039880945.1
n/a 18,933
(1.44 %)
23,629
(1.50 %)
n/a 42.60
(100.00 %)
113
(0.00 %)
366
(100.00 %)
4,027,155
(30.73 %)
712,278
(5.22 %)
12,003,034
(41.58 %)
96,116
(3.02 %)
468 northern black mastiff bat (mMolNig1hap2 2024)
GCA_039880925.1
n/a 18,305
(1.49 %)
22,534
(1.56 %)
n/a 42.75
(100.00 %)
80
(0.00 %)
282
(100.00 %)
3,783,543
(30.10 %)
656,592
(4.68 %)
11,353,707
(40.26 %)
92,041
(3.01 %)
469 northern bottlenose whale (alternate hap 2023)
GCA_949752845.1
n/a 19,537
(1.44 %)
27,826
(1.30 %)
n/a 41.67
(100.00 %)
n/a 23,401
(100.00 %)
3,634,923
(35.56 %)
672,860
(11.00 %)
11,175,398
(41.72 %)
62,007
(1.94 %)
470 northern bottlenose whale (primary hap 2023)
GCA_949752795.1
n/a 19,073
(1.44 %)
20,821
(1.21 %)
n/a 41.81
(99.99 %)
1,098
(0.01 %)
757
(100.00 %)
3,997,911
(34.76 %)
769,275
(14.94 %)
12,133,820
(44.83 %)
67,258
(2.00 %)
471 northern elephant seal (BS05 2019 Broad)
GCA_004023865.1
n/a 22,834
(1.54 %)
36,083
(1.32 %)
n/a 41.52
(99.94 %)
9,483
(0.04 %)
330,739
(99.96 %)
4,849,944
(43.83 %)
600,306
(1.16 %)
13,420,049
(34.43 %)
57,236
(1.62 %)
472 northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 genbank)
GCA_029215605.1
n/a 19,278
(1.60 %)
19,908
(1.39 %)
n/a 41.84
(100.00 %)
98
(0.00 %)
596
(100.00 %)
4,348,333
(34.40 %)
621,985
(2.21 %)
13,251,768
(35.32 %)
69,898
(2.38 %)
473 Northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 refseq)
GCF_029215605.1
74,106
(3.88 %)
19,277
(1.60 %)
20,000
(1.36 %)
n/a 41.84
(100.00 %)
98
(0.00 %)
595
(100.00 %)
4,348,327
(34.40 %)
621,980
(2.21 %)
13,251,706
(35.32 %)
69,897
(2.38 %)
474 northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap2 2023)
GCA_029215635.1
n/a 19,340
(1.59 %)
19,732
(1.37 %)
n/a 41.91
(100.00 %)
60
(0.00 %)
482
(100.00 %)
4,365,070
(34.26 %)
627,639
(2.43 %)
13,174,494
(35.47 %)
74,314
(2.49 %)
475 northern elephant seal (v3 JK_09032017 2022)
GCF_021288785.2
53,819
(3.32 %)
20,099
(1.75 %)
20,957
(1.35 %)
n/a 41.51
(99.35 %)
39,936
(0.65 %)
142,455
(100.00 %)
4,368,400
(33.93 %)
588,877
(1.19 %)
13,745,426
(32.96 %)
52,064
(1.59 %)
476 northern fur seal
GCF_003265705.1
54,953
(2.43 %)
23,408
(1.78 %)
23,666
(1.43 %)
52,089
(2.17 %)
41.48
(98.01 %)
38,666
(1.99 %)
52,469
(98.01 %)
5,047,032
(43.38 %)
638,130
(1.06 %)
14,922,442
(33.12 %)
57,281
(1.44 %)
477 northern fur seal (GAN/ISIS: 27379988/994484 2025)
GCF_003265705.2
71,169
(3.14 %)
21,276
(1.78 %)
21,276
(1.42 %)
n/a 41.44
(98.05 %)
30,369
(1.95 %)
43,734
(98.05 %)
4,118,994
(34.95 %)
578,801
(1.07 %)
13,530,999
(33.27 %)
51,258
(1.43 %)
478 northern gundi (hap1 2025)
GCA_048771875.1
n/a 16,996
(1.51 %)
21,787
(1.66 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
117
(0.00 %)
535
(100.00 %)
3,293,772
(27.51 %)
602,403
(3.02 %)
11,827,700
(30.64 %)
44,220
(1.55 %)
479 northern gundi (hap2 2025)
GCA_048771865.1
n/a 17,037
(1.43 %)
21,690
(1.55 %)
n/a 42.88
(100.00 %)
115
(0.00 %)
1,031
(100.00 %)
3,527,940
(26.81 %)
646,620
(6.32 %)
11,343,462
(34.09 %)
47,125
(1.51 %)
480 northern gundi (US049 2019)
GCA_004027205.1
n/a 18,035
(1.39 %)
27,379
(1.57 %)
n/a 42.68
(99.91 %)
5,037
(0.02 %)
865,110
(99.98 %)
4,149,883
(27.83 %)
654,063
(1.64 %)
12,342,565
(33.72 %)
47,533
(1.43 %)
481 northern mole vole
GCA_001685095.1
n/a 23,252
(1.39 %)
44,209
(1.25 %)
n/a 41.68
(99.04 %)
371,627
(0.98 %)
722,087
(99.02 %)
3,923,814
(25.79 %)
898,453
(2.47 %)
13,708,986
(29.04 %)
16,583
(0.36 %)
482 northern white rhinoceros
GCA_004027795.1
n/a 25,328
(1.34 %)
61,003
(1.95 %)
n/a 41.32
(99.90 %)
7,054
(0.03 %)
949,480
(99.97 %)
4,330,882
(38.89 %)
484,754
(1.12 %)
15,544,248
(33.11 %)
43,689
(2.08 %)
483 northern woolly horseshoe bat (20210929_DDc primary hap 2024)
GCA_043748575.1
n/a 18,475
(1.82 %)
19,990
(1.56 %)
n/a 40.72
(100.00 %)
63
(0.00 %)
68
(100.00 %)
3,507,612
(39.92 %)
711,081
(2.15 %)
11,788,205
(32.17 %)
35,670
(1.25 %)
484 Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 genbank)
GCA_036323735.1
114,725
(42.69 %)
21,917
(1.75 %)
19,476
(1.26 %)
n/a 41.82
(99.86 %)
220
(0.14 %)
77
(100.00 %)
4,700,726
(39.99 %)
1,603,005
(5.45 %)
13,451,813
(38.68 %)
20,118
(0.44 %)
485 Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 refseq)
GCF_036323735.1
114,725
(5.38 %)
21,870
(1.74 %)
19,989
(1.27 %)
n/a 41.82
(99.86 %)
220
(0.14 %)
76
(100.00 %)
5,294,185
(42.75 %)
1,603,005
(5.45 %)
13,451,760
(38.68 %)
20,118
(0.44 %)
486 Norway rat (F344/Stm 2024)
GCA_041222355.1
n/a 21,764
(1.78 %)
20,141
(1.30 %)
n/a 41.87
(99.96 %)
234
(0.04 %)
120
(100.00 %)
4,636,987
(39.98 %)
1,579,595
(5.22 %)
13,544,768
(38.06 %)
20,127
(0.46 %)
487 Norway rat BN7 haplotype
GCA_015244455.1
n/a 3,096
(1.64 %)
2,450
(1.02 %)
n/a 41.23
(100.00 %)
6
(0.00 %)
3,156
(100.00 %)
517,347
(50.76 %)
157,701
(3.90 %)
1,502,752
(34.14 %)
1,806
(0.40 %)
488 Norway rat BN7.2
GCF_015227675.2
97,432
(4.08 %)
21,526
(1.86 %)
19,266
(1.33 %)
54,530
(2.79 %)
41.99
(99.19 %)
581
(0.81 %)
757
(99.19 %)
5,029,005
(45.44 %)
1,514,974
(3.57 %)
13,450,428
(35.83 %)
19,244
(0.46 %)
489 Norway rat celera
GCF_000002265.2
39,745
(2.91 %)
21,492
(1.95 %)
19,112
(1.38 %)
n/a 41.98
(95.28 %)
111,391
(4.74 %)
118,423
(95.26 %)
9,721,869
(43.57 %)
1,387,703
(3.05 %)
13,224,921
(32.45 %)
18,944
(0.42 %)
490 Norway rat Rnor6.0
GCF_000001895.5
69,456
(3.34 %)
22,369
(1.83 %)
20,269
(1.32 %)
n/a 41.93
(95.13 %)
145,731
(4.89 %)
76,195
(95.16 %)
5,329,187
(44.14 %)
1,620,304
(3.72 %)
14,520,050
(33.09 %)
22,600
(0.47 %)
491 Norway rat SHR/Utx RGD_8142385 2022
GCA_023515785.1
n/a 21,116
(1.68 %)
20,103
(1.27 %)
57,027
(2.45 %)
41.85
(99.82 %)
1,256
(0.18 %)
2,151
(100.00 %)
4,704,388
(38.22 %)
1,611,144
(5.76 %)
13,524,575
(38.35 %)
20,720
(0.48 %)
492 Norway rat SHRSP/BppUtx 2022
GCA_021556685.1
n/a 22,366
(1.71 %)
20,531
(1.26 %)
57,580
(2.44 %)
41.86
(99.94 %)
1,610
(0.06 %)
2,734
(100.00 %)
5,238,574
(46.36 %)
1,638,412
(5.87 %)
13,769,141
(38.49 %)
21,006
(0.49 %)
493 Norway rat WKY/Bbb 2022
GCA_023515805.1
n/a 21,607
(1.68 %)
21,244
(1.28 %)
58,136
(2.47 %)
41.92
(99.80 %)
1,456
(0.20 %)
3,553
(100.00 %)
4,811,412
(38.21 %)
1,650,950
(5.41 %)
13,740,644
(38.24 %)
21,449
(0.51 %)
494 nutria
GCA_004027025.1
n/a 24,707
(1.00 %)
47,533
(1.18 %)
n/a 41.70
(99.84 %)
15,249
(0.05 %)
1,684,916
(99.95 %)
6,961,690
(30.09 %)
1,698,977
(3.31 %)
15,207,563
(42.57 %)
59,854
(1.00 %)
495 okapi
GCA_001660835.1
n/a 21,483
(1.43 %)
31,061
(1.26 %)
n/a 41.48
(95.11 %)
376,008
(4.86 %)
1,213,177
(95.14 %)
5,808,036
(42.90 %)
619,044
(4.22 %)
14,940,153
(35.17 %)
47,417
(1.12 %)
496 Ord's kangaroo rat
GCF_000151885.1
30,625
(2.21 %)
17,959
(1.54 %)
19,318
(1.54 %)
n/a 42.06
(92.36 %)
83,035
(7.65 %)
148,226
(92.35 %)
4,337,455
(33.76 %)
1,140,316
(7.60 %)
10,422,685
(36.59 %)
61,921
(3.56 %)
497 pacarana
GCA_004027595.1
n/a 20,748
(1.20 %)
33,195
(1.31 %)
n/a 41.81
(99.90 %)
6,392
(0.02 %)
1,164,830
(99.98 %)
4,374,443
(30.16 %)
660,811
(1.38 %)
14,062,133
(35.99 %)
59,382
(1.23 %)
498 Pacific pocket mouse (BS65 2019 Broad)
GCA_004363475.1
n/a 21,575
(1.07 %)
47,478
(1.31 %)
n/a 41.87
(99.76 %)
18,801
(0.07 %)
2,428,619
(99.93 %)
4,881,232
(20.80 %)
1,352,971
(4.11 %)
12,583,960
(48.42 %)
74,961
(2.33 %)
499 Pacific pocket mouse (PPM17 2022 San Diego Zoo)
GCF_023159225.1
46,202
(2.48 %)
18,752
(1.50 %)
22,526
(1.60 %)
n/a 41.98
(99.96 %)
1,807
(0.04 %)
6,180
(100.00 %)
3,313,319
(16.79 %)
1,066,382
(10.88 %)
9,981,468
(42.63 %)
49,134
(2.83 %)
500 Pacific walrus
GCF_000321225.1
27,163
(1.89 %)
20,293
(1.71 %)
20,982
(1.48 %)
n/a 41.36
(95.85 %)
66,766
(4.16 %)
70,656
(95.84 %)
4,372,578
(41.12 %)
511,500
(1.05 %)
13,507,582
(30.43 %)
45,142
(1.29 %)
501 Pacific white-sided dolphin
GCF_003676395.1
65,970
(3.26 %)
18,743
(1.79 %)
20,862
(1.45 %)
31,917
(1.69 %)
41.28
(99.56 %)
16,699
(0.44 %)
21,350
(99.56 %)
3,971,820
(45.64 %)
574,056
(1.14 %)
12,602,965
(34.83 %)
62,275
(1.67 %)
502 pale spear-nosed bat (alternate hap MPI-MPIP 2019)
GCA_004115245.1
n/a 18,118
(1.63 %)
23,536
(1.65 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
38
(0.00 %)
10,873
(100.00 %)
3,001,130
(29.46 %)
375,042
(0.79 %)
11,813,971
(29.64 %)
67,712
(4.23 %)
503 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 alternate hap 2020)
GCA_004115245.2
n/a 18,116
(1.63 %)
23,608
(1.65 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
38
(0.00 %)
10,895
(100.00 %)
3,002,448
(29.46 %)
375,226
(0.79 %)
11,824,034
(29.65 %)
67,718
(4.23 %)
504 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 primary hap 2020)
GCF_004126475.2
54,932
(3.31 %)
18,171
(1.69 %)
20,025
(1.62 %)
42,786
(3.39 %)
42.38
(99.28 %)
884
(0.72 %)
77
(100.00 %)
3,069,141
(30.00 %)
385,664
(0.81 %)
12,050,232
(30.57 %)
63,905
(3.75 %)
505 Pallas's mastiff bat
GCF_014108415.1
48,421
(2.20 %)
18,667
(1.61 %)
21,915
(1.59 %)
n/a 42.35
(97.95 %)
349
(2.05 %)
60
(100.00 %)
3,863,217
(32.76 %)
624,933
(1.88 %)
11,572,319
(37.09 %)
79,984
(2.45 %)
506 pallid bat (TK200870 primary hap 2023)
GCA_027563665.1
n/a 19,688
(1.69 %)
21,998
(1.64 %)
n/a 43.04
(99.72 %)
234
(0.28 %)
112
(99.99 %)
2,794,986
(22.60 %)
938,016
(3.72 %)
11,241,518
(39.41 %)
70,272
(2.89 %)
507 Parnell's mustached bat (2013)
GCA_000465405.1
n/a 21,436
(1.40 %)
57,232
(2.18 %)
n/a 40.82
(99.34 %)
265,720
(0.70 %)
443,121
(99.30 %)
2,780,805
(29.26 %)
290,520
(0.63 %)
12,354,814
(27.13 %)
69,806
(1.89 %)
508 Parnell's mustached bat (Mesoamerican 2021)
GCF_021234165.1
37,033
(2.48 %)
18,339
(1.76 %)
21,630
(1.69 %)
n/a 41.32
(100.00 %)
12
(0.00 %)
333
(100.00 %)
2,828,339
(30.56 %)
333,670
(0.75 %)
12,444,271
(30.90 %)
53,180
(4.61 %)
509 particolored bat (primary hap 2024)
GCA_963924515.1
n/a 17,913
(1.72 %)
20,720
(1.72 %)
n/a 43.54
(99.99 %)
980
(0.01 %)
185
(100.00 %)
2,932,869
(21.94 %)
874,665
(4.83 %)
10,263,103
(37.46 %)
77,397
(4.55 %)
510 Patagonian cavy
GCA_004027295.1
n/a 21,143
(0.94 %)
40,887
(1.10 %)
n/a 39.86
(99.87 %)
6,223
(0.02 %)
1,911,987
(99.98 %)
5,194,890
(30.95 %)
892,551
(2.11 %)
17,052,577
(40.22 %)
45,730
(0.84 %)
511 Pere David's deer
GCA_002443075.1
n/a 20,723
(1.65 %)
23,551
(1.43 %)
n/a 41.58
(97.49 %)
144,642
(2.51 %)
339,454
(97.49 %)
5,171,293
(43.30 %)
427,987
(1.20 %)
13,665,133
(35.97 %)
48,374
(1.14 %)
512 Philippine flying lemur (mCynVol1 alternate hap 2022)
GCA_027409165.1
n/a 18,794
(1.72 %)
21,421
(1.40 %)
n/a 40.18
(100.00 %)
n/a 1,750
(100.00 %)
4,001,442
(39.37 %)
547,894
(2.75 %)
13,870,563
(34.33 %)
40,162
(1.31 %)
513 Philippine flying lemur (primary hap 2022 genbank)
GCA_027409185.1
n/a 20,384
(1.64 %)
22,124
(1.29 %)
n/a 40.24
(100.00 %)
116
(0.00 %)
131
(100.00 %)
4,492,423
(39.31 %)
627,842
(4.79 %)
15,561,515
(36.57 %)
45,336
(1.27 %)
514 Philippine flying lemur (primary hap 2022 refseq)
GCF_027409185.1
44,950
(1.91 %)
20,385
(1.64 %)
22,123
(1.29 %)
n/a 40.24
(100.00 %)
116
(0.00 %)
130
(100.00 %)
4,492,417
(39.31 %)
627,841
(4.79 %)
15,561,458
(36.57 %)
45,336
(1.27 %)
515 pig (Bamei 2023)
GCA_030704935.1
n/a 18,472
(1.44 %)
19,911
(1.28 %)
n/a 42.63
(99.98 %)
878
(0.02 %)
379
(100.00 %)
3,996,827
(27.97 %)
2,094,728
(7.23 %)
12,677,118
(40.57 %)
81,791
(2.82 %)
516 pig (Duroc 2017)
GCF_000003025.6
77,695
(4.05 %)
18,980
(1.64 %)
19,453
(1.32 %)
59,876
(4.84 %)
41.87
(98.81 %)
544
(1.19 %)
1,313
(98.81 %)
5,021,184
(45.67 %)
710,994
(1.32 %)
13,243,289
(36.33 %)
79,132
(1.82 %)
517 pig (Norwegian landrace 2024)
GCA_963921485.1
n/a 18,500
(1.46 %)
19,718
(1.29 %)
n/a 42.45
(100.00 %)
n/a 54
(100.00 %)
4,068,783
(28.54 %)
1,511,605
(5.52 %)
12,867,101
(39.59 %)
82,002
(2.44 %)
518 pig (USMARCv1 2017)
GCA_002844635.1
n/a 19,458
(1.54 %)
21,487
(1.27 %)
58,655
(2.58 %)
42.49
(95.20 %)
661
(4.80 %)
14,157
(100.00 %)
5,159,244
(47.53 %)
902,079
(3.63 %)
13,145,120
(36.86 %)
82,442
(2.62 %)
519 pig (Wuzhishan WZS1 2025)
GCA_048338725.1
n/a 18,525
(1.46 %)
19,792
(1.29 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
n/a 20
(100.00 %)
4,084,482
(28.40 %)
1,424,314
(5.35 %)
12,927,595
(39.56 %)
81,967
(2.96 %)
520 plains zebra (Etosha38 2022 UCLA)
GCF_021613505.1
55,794
(2.87 %)
19,529
(1.76 %)
21,214
(1.39 %)
n/a 41.38
(99.04 %)
14,595
(0.96 %)
11,098
(100.00 %)
3,683,862
(38.74 %)
314,723
(0.68 %)
15,217,328
(29.38 %)
41,391
(1.27 %)
521 platypus (alternate hap Pmale09 2020)
GCA_004115175.2
n/a 13,244
(1.26 %)
19,241
(1.68 %)
n/a 46.27
(100.00 %)
25
(0.00 %)
5,868
(100.00 %)
4,420,884
(51.59 %)
513,006
(3.13 %)
7,749,797
(49.18 %)
81,538
(8.24 %)
522 platypus (Pmale09 v4 2020)
GCF_004115215.2
51,379
(3.07 %)
14,778
(1.26 %)
18,888
(1.63 %)
n/a 46.14
(99.18 %)
515
(0.82 %)
322
(100.00 %)
5,071,089
(51.34 %)
578,614
(2.89 %)
9,113,848
(48.93 %)
87,796
(6.47 %)
523 polar bear (Baiyulong BGI 2014 refseq)
GCF_000687225.1
35,751
(2.39 %)
18,466
(1.69 %)
15,384
(1.38 %)
n/a 41.65
(98.35 %)
110,343
(1.67 %)
134,162
(98.33 %)
4,123,540
(40.16 %)
553,196
(1.29 %)
13,765,581
(29.91 %)
54,907
(1.17 %)
524 polar bear (UCSC 2021)
GCF_017311325.1
52,175
(2.92 %)
18,588
(1.75 %)
20,731
(1.54 %)
n/a 41.88
(99.60 %)
45,532
(0.41 %)
3,900
(100.00 %)
4,204,162
(40.75 %)
572,129
(1.75 %)
13,926,894
(30.79 %)
63,315
(1.93 %)
525 prairie deer mouse (Baylor 2013)
GCF_000500345.1
50,187
(2.51 %)
20,427
(1.69 %)
20,874
(1.45 %)
n/a 42.34
(94.06 %)
182,263
(5.97 %)
212,962
(94.03 %)
n/a 1,229,123
(2.83 %)
14,447,916
(30.09 %)
23,246
(0.56 %)
526 prairie deer mouse (Harvard 2020)
GCF_003704035.1
69,779
(3.28 %)
19,755
(1.73 %)
19,194
(1.43 %)
n/a 42.28
(95.07 %)
147,442
(4.96 %)
155,966
(95.04 %)
4,751,621
(29.04 %)
1,172,212
(2.66 %)
13,934,672
(29.87 %)
22,444
(0.57 %)
527 prairie vole
GCF_000317375.1
40,484
(2.72 %)
19,648
(1.91 %)
19,489
(1.62 %)
n/a 42.25
(92.03 %)
180,677
(8.00 %)
187,012
(92.00 %)
3,779,126
(25.51 %)
879,192
(2.11 %)
12,360,347
(27.34 %)
18,233
(0.52 %)
528 proboscis bat (hap1 2024)
GCA_037038545.1
n/a 17,919
(1.46 %)
19,330
(1.31 %)
n/a 40.78
(100.00 %)
68
(0.00 %)
41
(100.00 %)
3,707,234
(28.28 %)
643,817
(2.22 %)
12,106,384
(41.48 %)
54,438
(1.38 %)
529 proboscis bat (hap2 2024)
GCA_037038555.1
n/a 17,253
(1.51 %)
18,507
(1.35 %)
n/a 40.91
(100.00 %)
39
(0.00 %)
38
(100.00 %)
3,466,835
(27.96 %)
585,261
(1.91 %)
11,364,898
(40.65 %)
50,527
(1.37 %)
530 pronghorn (PH2016 2021)
GCA_021018645.1
n/a 21,848
(1.58 %)
27,614
(1.56 %)
n/a 41.70
(96.83 %)
74,027
(3.17 %)
140,480
(96.83 %)
3,335,744
(24.40 %)
405,435
(4.11 %)
13,855,606
(34.67 %)
48,670
(1.19 %)
531 Przewalski's horse (Burgud 2014 refseq)
GCF_000696695.1
45,089
(2.76 %)
19,546
(1.69 %)
22,107
(1.36 %)
n/a 41.27
(99.13 %)
80,963
(0.88 %)
134,060
(99.12 %)
3,787,533
(40.54 %)
435,607
(1.73 %)
14,738,418
(28.36 %)
40,752
(0.94 %)
532 Przewalski's horse (Varuska primary hap 2024)
GCF_037783145.1
117,131
(4.09 %)
18,569
(1.70 %)
20,018
(1.38 %)
n/a 42.23
(100.00 %)
310
(0.00 %)
2,146
(100.00 %)
3,768,149
(39.86 %)
632,308
(5.35 %)
14,449,518
(32.71 %)
42,166
(4.46 %)
533 puma (L17-30 alternate hap 2023)
GCA_028749965.1
n/a 18,380
(1.53 %)
20,701
(1.40 %)
n/a 41.91
(100.00 %)
96
(0.00 %)
304
(100.00 %)
4,881,674
(33.96 %)
978,817
(2.17 %)
13,422,986
(35.08 %)
69,437
(2.62 %)
534 puma (L17-30 primary hap 2023)
GCA_028749985.1
n/a 17,553
(1.53 %)
19,299
(1.39 %)
n/a 41.89
(100.00 %)
134
(0.00 %)
390
(100.00 %)
4,629,539
(33.53 %)
919,008
(2.02 %)
12,766,157
(34.70 %)
65,437
(2.53 %)
535 puma (SC36_Marlon 2018 refseq)
GCF_003327715.1
25,588
(1.44 %)
17,664
(1.57 %)
16,565
(1.29 %)
n/a 41.36
(95.34 %)
178,992
(4.69 %)
2,175
(100.00 %)
4,885,335
(42.70 %)
833,138
(1.76 %)
13,705,778
(31.28 %)
58,912
(1.65 %)
536 punctate agouti
GCA_004363535.1
n/a 22,612
(1.05 %)
45,433
(1.19 %)
n/a 40.79
(99.92 %)
6,459
(0.02 %)
993,123
(99.98 %)
5,671,738
(32.53 %)
945,722
(1.69 %)
17,003,309
(36.58 %)
85,696
(1.65 %)
537 pygmy sperm whale
GCA_004363705.1
n/a 22,661
(1.30 %)
42,546
(1.15 %)
n/a 41.89
(99.89 %)
6,053
(0.02 %)
1,258,125
(99.98 %)
5,185,912
(43.65 %)
836,752
(1.88 %)
14,150,125
(39.88 %)
95,344
(2.15 %)
538 pygmy sperm whale (haplotype 1 2022 refseq)
GCF_026419965.1
73,518
(2.67 %)
18,496
(1.55 %)
20,718
(1.32 %)
n/a 42.05
(99.81 %)
143
(0.19 %)
581
(100.00 %)
3,817,659
(34.51 %)
758,297
(7.42 %)
12,196,998
(39.96 %)
101,353
(2.90 %)
539 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 2 2022)
GCA_026419985.1
n/a 18,550
(1.51 %)
20,491
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
138
(0.01 %)
391
(100.00 %)
3,860,112
(33.83 %)
820,375
(9.58 %)
12,159,196
(41.59 %)
106,168
(2.78 %)
540 Pyrenean desman (IBE-C5619 2021)
GCA_019455555.1
n/a 17,527
(1.87 %)
20,474
(1.83 %)
n/a 41.67
(98.52 %)
63,679
(1.49 %)
75,985
(98.51 %)
2,147,379
(23.41 %)
327,740
(0.98 %)
10,539,226
(28.05 %)
44,487
(4.39 %)
541 rabbit (A946 2020)
GCA_013371645.1
n/a 19,881
(1.40 %)
22,566
(1.32 %)
n/a 44.09
(99.92 %)
4,254
(0.08 %)
5,157
(99.93 %)
5,202,709
(44.78 %)
1,059,544
(2.39 %)
13,897,372
(40.69 %)
119,691
(2.74 %)
542 rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 refseq)
GCF_009806435.1
83,033
(4.16 %)
19,486
(1.31 %)
23,267
(1.31 %)
n/a 43.83
(97.68 %)
18,178
(2.32 %)
3,160
(100.00 %)
4,072,524
(21.41 %)
976,273
(2.33 %)
13,766,413
(39.76 %)
113,371
(2.46 %)
543 rabbit (primary hap 2024 refseq)
GCF_964237555.1
95,289
(4.22 %)
19,385
(1.31 %)
22,631
(1.31 %)
n/a 44.02
(99.98 %)
2,276
(0.02 %)
221
(100.00 %)
4,099,586
(21.20 %)
1,062,900
(3.78 %)
13,416,814
(41.72 %)
116,523
(2.66 %)
544 rabbit (Thorbecke 2009 Broad refseq)
GCF_000003625.3
43,642
(2.34 %)
18,665
(1.39 %)
20,095
(1.24 %)
n/a 43.75
(95.14 %)
80,789
(4.88 %)
84,024
(95.12 %)
4,890,480
(44.71 %)
883,939
(1.73 %)
13,254,520
(38.27 %)
110,337
(2.33 %)
545 raccoon dog (2021)
GCF_905146905.1
52,577
(2.89 %)
19,628
(1.60 %)
20,274
(1.43 %)
n/a 41.28
(99.98 %)
70
(0.02 %)
811
(100.00 %)
4,499,368
(31.98 %)
1,005,212
(2.04 %)
13,884,201
(32.95 %)
52,450
(2.27 %)
546 Rambouillet sheep (Baylor 2017)
GCF_002742125.1
50,083
(2.48 %)
19,992
(1.47 %)
22,506
(1.31 %)
41,290
(1.46 %)
41.91
(99.99 %)
4,847
(0.01 %)
7,486
(99.99 %)
5,764,757
(47.38 %)
507,629
(1.55 %)
14,138,601
(41.27 %)
51,748
(1.29 %)
547 Rambouillet sheep (U.Idaho 2021)
GCF_016772045.1
70,461
(3.21 %)
19,413
(1.59 %)
21,222
(1.35 %)
n/a 41.99
(100.00 %)
84
(0.00 %)
142
(100.00 %)
5,300,958
(46.83 %)
455,553
(1.24 %)
13,023,443
(40.62 %)
43,959
(1.30 %)
548 ratel
GCA_004024625.1
n/a 22,196
(1.21 %)
35,937
(1.18 %)
n/a 42.00
(99.85 %)
6,511
(0.02 %)
2,074,823
(99.98 %)
6,171,383
(41.93 %)
877,669
(1.49 %)
15,269,908
(41.22 %)
95,094
(1.91 %)
549 red bat
GCA_004026805.1
n/a 27,510
(1.22 %)
65,467
(1.48 %)
n/a 42.69
(99.94 %)
6,380
(0.02 %)
525,280
(99.98 %)
4,644,227
(28.24 %)
1,170,868
(2.68 %)
15,628,238
(39.97 %)
125,564
(3.55 %)
550 red deer (2021)
GCF_910594005.1
68,992
(2.68 %)
20,470
(1.48 %)
22,563
(1.32 %)
n/a 42.98
(100.00 %)
40
(0.00 %)
144
(100.00 %)
5,501,063
(44.60 %)
503,301
(12.23 %)
13,102,622
(44.55 %)
88,756
(1.66 %)
551 red deer (alternate hap 2021)
GCA_910593805.1
n/a 18,817
(1.29 %)
21,916
(1.20 %)
n/a 44.23
(100.00 %)
22
(0.00 %)
4,021
(100.00 %)
3,279,005
(20.48 %)
472,706
(21.87 %)
11,466,609
(50.26 %)
128,858
(2.07 %)
552 red fox (BD-2025 2025)
GCF_048418805.1
84,632
(3.45 %)
19,565
(1.57 %)
19,909
(1.38 %)
n/a 41.31
(100.00 %)
104
(0.00 %)
289
(100.00 %)
4,480,315
(31.76 %)
1,010,887
(2.70 %)
13,766,344
(33.12 %)
50,763
(2.22 %)
553 red fox (hap1 2024)
GCA_964106825.2
n/a 19,622
(1.57 %)
20,371
(1.38 %)
n/a 41.34
(99.98 %)
1,845
(0.02 %)
461
(100.00 %)
4,519,485
(31.91 %)
1,018,114
(2.59 %)
13,810,284
(32.99 %)
52,053
(2.31 %)
554 red fox (hap2 2024)
GCA_964106925.2
n/a 19,517
(1.57 %)
20,105
(1.37 %)
n/a 41.31
(99.99 %)
1,819
(0.02 %)
350
(100.00 %)
4,487,839
(31.79 %)
1,010,106
(2.64 %)
13,838,711
(33.07 %)
51,373
(2.26 %)
555 red fox (tameXaggressive cross 2018)
GCF_003160815.1
43,508
(2.67 %)
19,826
(1.69 %)
18,893
(1.40 %)
n/a 41.08
(97.06 %)
246,167
(2.96 %)
82,424
(100.00 %)
4,919,102
(40.79 %)
954,461
(2.46 %)
14,190,625
(30.86 %)
53,204
(1.88 %)
556 reed vole (MF-2015 2020)
GCF_014885135.2
55,722
(3.60 %)
19,808
(1.93 %)
20,787
(1.69 %)
n/a 42.36
(95.60 %)
67,118
(4.40 %)
10,460
(100.00 %)
3,130,955
(20.09 %)
831,969
(2.09 %)
11,985,657
(28.48 %)
18,764
(0.58 %)
557 Reeves' muntjac (alternate hap 2024)
GCA_963930665.1
n/a 18,947
(1.29 %)
24,114
(1.28 %)
n/a 42.75
(100.00 %)
n/a 8,892
(100.00 %)
3,375,476
(23.21 %)
654,539
(6.64 %)
11,132,469
(48.29 %)
79,357
(2.66 %)
558 Reeves' muntjac (primary hap 2024)
GCF_963930625.1
52,442
(2.57 %)
19,577
(1.52 %)
22,283
(1.38 %)
n/a 41.89
(99.99 %)
682
(0.01 %)
267
(100.00 %)
3,294,672
(23.89 %)
527,436
(2.98 %)
13,137,581
(39.89 %)
57,436
(1.81 %)
559 reindeer (2023)
GCA_963422255.1
n/a 21,329
(1.58 %)
25,201
(1.59 %)
n/a 41.46
(98.35 %)
131,886
(1.65 %)
259,765
(98.35 %)
3,254,173
(23.49 %)
440,431
(2.00 %)
14,258,607
(36.17 %)
48,931
(1.20 %)
560 reindeer (US061 2019)
GCA_004026565.1
n/a 24,150
(1.39 %)
39,911
(1.41 %)
n/a 42.08
(99.89 %)
4,769
(0.02 %)
1,365,508
(99.98 %)
6,083,178
(46.10 %)
546,470
(1.23 %)
14,434,855
(43.16 %)
55,319
(1.23 %)
561 Rice's whale (hap1 2023)
GCA_028017805.1
n/a 19,396
(1.48 %)
21,693
(1.26 %)
n/a 41.62
(97.80 %)
131
(2.20 %)
1,039
(100.00 %)
3,973,936
(35.55 %)
987,571
(11.66 %)
12,473,459
(42.11 %)
74,971
(1.64 %)
562 Rice's whale (hap2 2023 refseq)
GCF_028023285.1
59,888
(2.34 %)
19,291
(1.53 %)
21,195
(1.30 %)
n/a 41.44
(99.90 %)
334
(0.10 %)
774
(100.00 %)
3,917,923
(36.26 %)
828,521
(9.28 %)
12,518,796
(41.08 %)
73,126
(1.69 %)
563 Rickett's big-footed myotis (AB-2021 2024)
GCA_036010255.1
n/a 18,982
(1.81 %)
22,002
(1.76 %)
n/a 43.12
(100.00 %)
n/a 105
(100.00 %)
2,909,847
(24.53 %)
757,964
(3.03 %)
10,561,925
(36.25 %)
57,318
(2.32 %)
564 Risso's dolphin (hap1.1 2024)
GCA_964374135.1
n/a 18,825
(1.58 %)
20,986
(1.29 %)
n/a 42.25
(99.99 %)
1,138
(0.01 %)
1,150
(100.00 %)
4,405,513
(43.51 %)
1,342,544
(11.28 %)
12,274,096
(41.76 %)
76,936
(4.65 %)
565 Risso's dolphin (hap2.1 2024)
GCA_964374185.1
n/a 18,061
(1.68 %)
20,080
(1.36 %)
n/a 41.97
(99.99 %)
1,073
(0.01 %)
2,135
(99.99 %)
3,948,427
(43.52 %)
848,222
(8.00 %)
11,527,950
(38.76 %)
70,117
(3.31 %)
566 Ryukyu mouse (v2 2017)
GCF_900094665.2
53,792
(2.85 %)
21,351
(2.29 %)
18,073
(1.39 %)
n/a 41.70
(89.05 %)
306,599
(10.98 %)
30,835
(92.70 %)
4,479,912
(35.83 %)
1,351,677
(2.59 %)
12,964,608
(27.49 %)
15,963
(0.43 %)
567 Saanen dairy goat
GCA_015443085.1
n/a 19,257
(1.54 %)
21,221
(1.32 %)
n/a 42.30
(100.00 %)
170
(0.00 %)
1,362
(100.00 %)
5,336,862
(47.58 %)
515,161
(2.87 %)
13,144,895
(41.67 %)
58,623
(2.22 %)
568 saddleback dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949987525.1
n/a 18,509
(1.54 %)
22,514
(1.36 %)
n/a 41.95
(100.00 %)
1
(0.00 %)
7,427
(100.00 %)
3,675,922
(35.75 %)
950,374
(10.49 %)
11,670,399
(40.31 %)
63,587
(3.15 %)
569 saddleback dolphin (v1 primary hap 2023 refseq)
GCF_949987515.1
46,746
(2.39 %)
18,624
(1.49 %)
20,662
(1.31 %)
n/a 42.06
(99.99 %)
968
(0.01 %)
630
(100.00 %)
4,020,676
(35.99 %)
1,259,549
(13.09 %)
12,359,748
(42.64 %)
66,179
(3.91 %)
570 saddleback dolphin (v2 primary hap 2024 refseq)
GCF_949987515.2
46,014
(2.36 %)
18,616
(1.49 %)
20,618
(1.32 %)
n/a 42.06
(99.99 %)
968
(0.01 %)
1,598
(99.99 %)
4,020,525
(35.99 %)
1,258,165
(13.09 %)
12,359,758
(42.64 %)
66,188
(3.91 %)
571 saiga antelope
GCA_004024985.1
n/a 23,736
(0.84 %)
55,133
(0.88 %)
n/a 42.52
(99.87 %)
2,867
(0.01 %)
1,775,066
(99.99 %)
6,485,113
(49.43 %)
447,097
(0.88 %)
13,972,753
(44.46 %)
46,883
(0.82 %)
572 Schreibers' long-fingered bat (US075 2019)
GCA_004026525.1
n/a 20,147
(2.06 %)
31,271
(1.82 %)
n/a 42.27
(99.94 %)
6,918
(0.04 %)
184,538
(99.96 %)
2,772,932
(29.66 %)
366,782
(1.13 %)
10,477,531
(28.60 %)
62,520
(2.73 %)
573 Schreibers' long-fingered bat (v2 hap1 2025)
GCA_964146895.2
n/a 18,109
(2.10 %)
21,263
(1.89 %)
n/a 42.51
(100.00 %)
140
(0.00 %)
186
(100.00 %)
2,812,261
(34.39 %)
457,565
(5.58 %)
10,220,083
(31.02 %)
59,522
(2.81 %)
574 Schreibers' long-fingered bat (v2 hap2 2025)
GCA_964145185.2
n/a 17,286
(2.19 %)
20,474
(1.95 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
86
(0.00 %)
254
(100.00 %)
2,610,773
(33.65 %)
389,844
(4.42 %)
9,728,138
(29.49 %)
56,508
(2.97 %)
575 scimitar-horned oryx
GCF_014754425.2
51,527
(2.72 %)
19,713
(1.57 %)
21,928
(1.32 %)
n/a 41.74
(99.30 %)
16,241
(0.70 %)
9,089
(100.00 %)
5,435,109
(46.76 %)
414,279
(0.98 %)
13,490,956
(40.45 %)
42,961
(1.10 %)
576 Screaming hairy armadillo
GCA_004027955.1
n/a 24,532
(0.39 %)
56,725
(0.46 %)
n/a 39.68
(99.70 %)
2,747
(0.01 %)
7,680,080
(99.99 %)
8,978,735
(36.02 %)
1,516,551
(1.58 %)
32,918,217
(47.67 %)
234,762
(1.56 %)
577 sea otter (GAN:26980312 2017 refseq)
GCF_002288905.1
38,140
(2.17 %)
18,578
(1.64 %)
20,913
(1.44 %)
34,179
(1.77 %)
41.56
(98.79 %)
23,134
(1.21 %)
29,589
(98.79 %)
4,703,044
(41.42 %)
721,750
(1.39 %)
14,065,653
(32.89 %)
55,388
(1.87 %)
578 Seba's short-tailed bat
GCA_004027735.1
n/a 21,878
(0.94 %)
55,858
(1.10 %)
n/a 42.70
(99.84 %)
3,864
(0.01 %)
1,929,203
(99.99 %)
3,802,235
(28.35 %)
606,320
(1.03 %)
15,171,250
(31.99 %)
118,227
(2.28 %)
579 sei whale (hap1.1 2025)
GCA_965194805.1
n/a 19,292
(1.27 %)
21,865
(1.14 %)
n/a 41.99
(99.99 %)
1,179
(0.01 %)
2,572
(100.00 %)
4,525,289
(42.25 %)
1,097,216
(21.14 %)
12,203,884
(50.47 %)
80,128
(1.58 %)
580 sei whale (hap2.1 2025)
GCA_965194725.1
n/a 19,313
(1.37 %)
21,662
(1.17 %)
n/a 41.68
(99.99 %)
1,066
(0.01 %)
2,917
(99.99 %)
4,418,625
(42.98 %)
875,114
(15.81 %)
12,360,254
(46.52 %)
78,537
(1.66 %)
581 sheep (hu hu3095 2024)
GCA_040805955.1
n/a 19,388
(1.42 %)
21,612
(1.28 %)
n/a 43.17
(100.00 %)
n/a 28
(100.00 %)
5,311,536
(44.06 %)
653,238
(7.29 %)
12,937,231
(44.10 %)
63,230
(6.03 %)
582 sheep (OAR_USU_Benz2616 2023)
GCF_016772045.2
89,680
(5.44 %)
19,308
(1.52 %)
21,506
(1.35 %)
n/a 42.01
(100.00 %)
84
(0.00 %)
143
(100.00 %)
3,275,767
(22.85 %)
464,346
(1.26 %)
12,987,607
(40.61 %)
44,477
(1.28 %)
583 sheep (Texel 2015)
GCA_000298735.2
n/a 19,179
(1.56 %)
19,001
(1.26 %)
48,105
(1.85 %)
41.90
(98.94 %)
44,566
(1.07 %)
48,481
(98.93 %)
5,429,824
(46.13 %)
540,267
(1.64 %)
13,509,668
(38.83 %)
43,911
(1.13 %)
584 shrew mouse
GCF_900095145.1
46,279
(2.64 %)
20,549
(2.23 %)
18,979
(1.49 %)
94,079
(3.98 %)
41.89
(90.53 %)
269,643
(9.50 %)
17,879
(93.73 %)
4,788,498
(38.32 %)
1,499,714
(3.03 %)
13,021,757
(27.83 %)
16,787
(0.47 %)
585 Siberian hamster (SSSS 2022)
GCA_023856395.1
n/a 18,375
(1.83 %)
17,066
(1.44 %)
n/a 41.27
(99.64 %)
88,601
(0.37 %)
7,756
(100.00 %)
3,152,242
(21.63 %)
1,087,009
(2.64 %)
12,055,167
(29.20 %)
15,455
(0.48 %)
586 Siberian musk deer (BS20 2019 Broad)
GCA_004024705.1
n/a 23,440
(1.32 %)
37,497
(1.19 %)
n/a 42.32
(99.86 %)
19,764
(0.07 %)
1,195,467
(99.93 %)
6,726,950
(49.79 %)
437,480
(1.57 %)
14,155,240
(46.22 %)
49,177
(1.05 %)
587 sika deer (Changchun, China MLH-2022 2023)
GCA_034195675.1
n/a 20,087
(1.59 %)
23,556
(1.46 %)
n/a 41.66
(99.97 %)
1,724
(0.03 %)
1,889
(100.00 %)
3,925,148
(27.17 %)
419,490
(1.24 %)
13,364,988
(37.79 %)
47,630
(1.31 %)
588 small Madagascar hedgehog
GCF_000313985.2
37,090
(1.93 %)
18,969
(1.19 %)
19,298
(1.31 %)
n/a 43.01
(88.43 %)
270,406
(11.60 %)
7,490
(100.00 %)
3,789,337
(28.89 %)
429,226
(0.87 %)
16,951,112
(32.23 %)
39,993
(0.70 %)
589 smoky shrew (2023)
GCF_029834395.1
37,165
(1.66 %)
17,572
(1.06 %)
24,146
(1.29 %)
n/a 43.43
(100.00 %)
n/a 497
(100.00 %)
2,593,080
(14.11 %)
1,194,567
(7.25 %)
14,051,522
(48.20 %)
107,473
(2.80 %)
590 snow leopard (11264 2022)
GCF_023721935.1
53,569
(3.37 %)
18,780
(1.67 %)
21,038
(1.40 %)
n/a 41.60
(99.30 %)
23,786
(0.70 %)
2,636
(100.00 %)
4,714,429
(34.93 %)
919,518
(1.59 %)
13,711,504
(33.24 %)
64,690
(2.41 %)
591 snowshoe hare
GCA_004026855.1
n/a 23,263
(0.88 %)
55,811
(1.01 %)
n/a 44.12
(99.87 %)
10,153
(0.03 %)
1,602,982
(99.97 %)
4,767,120
(21.29 %)
1,040,992
(2.22 %)
15,680,144
(43.23 %)
126,152
(2.28 %)
592 social tuco-tuco
GCA_004027165.1
n/a 25,166
(1.12 %)
41,316
(1.26 %)
n/a 40.71
(99.89 %)
16,191
(0.06 %)
823,762
(99.94 %)
5,390,906
(28.28 %)
1,027,922
(2.15 %)
15,241,308
(38.39 %)
31,883
(0.72 %)
593 soprano pipistrelle (alternate hap 2023)
GCA_949987765.1
n/a 17,590
(1.81 %)
21,597
(1.85 %)
n/a 42.88
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,717
(100.00 %)
2,734,555
(21.46 %)
795,752
(6.56 %)
9,601,735
(36.35 %)
62,524
(3.25 %)
594 soprano pipistrelle (primary hap 2023)
GCA_949987585.1
n/a 18,056
(1.78 %)
21,158
(1.79 %)
n/a 42.67
(100.00 %)
161
(0.00 %)
249
(100.00 %)
2,899,535
(21.64 %)
853,717
(7.80 %)
10,162,216
(37.72 %)
63,256
(3.06 %)
595 South African ground squirrel
GCA_004024805.1
n/a 22,802
(1.44 %)
33,892
(1.27 %)
n/a 39.97
(99.92 %)
9,745
(0.04 %)
587,115
(99.96 %)
5,256,998
(34.93 %)
594,122
(1.27 %)
14,462,947
(33.96 %)
34,141
(0.80 %)
596 Southeastern Asian house mouse (2016)
GCA_001624445.1
n/a 21,103
(2.24 %)
18,682
(1.45 %)
102,099
(4.16 %)
41.83
(86.23 %)
424,005
(13.83 %)
52,352
(97.85 %)
4,990,851
(39.88 %)
1,356,202
(2.67 %)
13,469,640
(26.15 %)
16,724
(0.41 %)
597 Southeastern Asian house mouse (2022)
GCA_921999005.2
n/a 21,799
(2.13 %)
19,729
(1.40 %)
110,356
(4.43 %)
41.78
(99.19 %)
278
(0.81 %)
151
(100.00 %)
4,663,228
(40.41 %)
1,549,985
(3.70 %)
13,012,600
(34.99 %)
21,349
(0.52 %)
598 Southeastern Asian house mouse (T2T 2024)
GCA_964188545.1
n/a 22,529
(1.85 %)
20,409
(1.22 %)
n/a 41.10
(99.90 %)
78
(0.10 %)
416
(99.90 %)
4,880,101
(47.77 %)
1,689,287
(15.13 %)
12,822,147
(42.92 %)
22,642
(0.54 %)
599 southern elephant seal
GCF_011800145.1
53,210
(2.86 %)
19,520
(1.73 %)
20,727
(1.41 %)
39,634
(1.86 %)
41.45
(99.36 %)
22,850
(0.64 %)
1,115
(100.00 %)
4,728,105
(43.75 %)
585,443
(1.13 %)
13,463,979
(33.65 %)
53,182
(1.62 %)
600 southern grasshopper mouse (2020)
GCF_903995425.1
47,152
(2.39 %)
19,356
(1.68 %)
18,821
(1.36 %)
n/a 41.81
(98.94 %)
2,143
(1.06 %)
2,949
(100.00 %)
4,850,460
(28.64 %)
1,195,836
(2.72 %)
13,540,762
(32.73 %)
18,046
(0.54 %)
601 southern multimammate mouse
GCF_008632895.1
69,058
(3.04 %)
20,313
(2.11 %)
17,745
(1.38 %)
n/a 41.39
(91.90 %)
146,713
(8.12 %)
28
(100.00 %)
4,875,400
(38.43 %)
1,454,350
(2.93 %)
13,104,717
(28.82 %)
16,715
(0.45 %)
602 southern tamandua (mTamTet1 alternate hap 2022)
GCA_023853755.1
n/a 20,179
(1.21 %)
24,249
(1.19 %)
n/a 39.54
(100.00 %)
4
(0.00 %)
7,866
(100.00 %)
3,953,031
(35.88 %)
531,111
(1.14 %)
16,354,874
(39.96 %)
59,907
(1.35 %)
603 southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022)
GCA_023851605.1
n/a 20,058
(1.26 %)
22,196
(1.13 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
961
(0.56 %)
201
(100.00 %)
4,037,291
(46.02 %)
593,019
(1.17 %)
18,033,833
(40.56 %)
65,039
(1.33 %)
604 southern three-banded armadillo
GCA_004025125.1
n/a 29,138
(0.73 %)
56,522
(0.75 %)
n/a 39.20
(99.82 %)
15,801
(0.04 %)
2,941,308
(99.96 %)
6,990,740
(38.88 %)
839,452
(1.23 %)
24,805,397
(43.95 %)
71,951
(0.98 %)
605 southern two-toed sloth (mChoDid1 alternate hap 2020)
GCA_015220265.1
n/a 22,897
(1.23 %)
27,007
(1.18 %)
n/a 39.87
(100.00 %)
70
(0.00 %)
12,050
(100.00 %)
4,502,020
(38.27 %)
576,759
(1.02 %)
17,143,050
(40.65 %)
51,339
(1.15 %)
606 southern two-toed sloth (mChoDid1 primary hap 2020)
GCF_015220235.1
63,054
(2.39 %)
21,998
(1.29 %)
23,177
(1.18 %)
45,345
(1.69 %)
39.89
(97.48 %)
1,243
(2.52 %)
146
(100.00 %)
4,559,690
(39.66 %)
577,607
(1.02 %)
16,594,630
(40.50 %)
51,430
(1.14 %)
607 southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 refseq)
GCF_000283155.1
37,037
(2.11 %)
18,398
(1.71 %)
19,753
(1.44 %)
n/a 40.90
(96.05 %)
54,737
(3.96 %)
57,824
(96.04 %)
3,685,898
(38.31 %)
421,694
(0.97 %)
14,765,529
(28.93 %)
36,281
(1.02 %)
608 Sowerby's beaked whale (hap1 2024)
GCA_964165515.1
n/a 19,471
(1.39 %)
22,951
(1.24 %)
n/a 42.04
(99.99 %)
1,095
(0.01 %)
1,604
(100.00 %)
4,307,839
(34.31 %)
825,475
(10.97 %)
11,375,945
(45.31 %)
76,527
(3.10 %)
609 Sowerby's beaked whale (hap2 2024)
GCA_964148845.1
n/a 18,591
(1.46 %)
21,588
(1.27 %)
n/a 42.00
(99.99 %)
974
(0.01 %)
2,126
(99.99 %)
3,961,403
(34.20 %)
742,897
(9.73 %)
10,832,739
(43.68 %)
70,803
(2.85 %)
610 Sowerby's beaked whale (US080 2019)
GCA_004027085.1
n/a 22,800
(1.32 %)
38,247
(1.17 %)
n/a 41.68
(99.84 %)
8,597
(0.03 %)
1,810,317
(99.97 %)
5,520,986
(45.05 %)
1,081,962
(2.69 %)
13,480,261
(43.01 %)
69,001
(1.39 %)
611 sperm whale (SW-GA 2023)
GCF_002837175.3
62,616
(2.83 %)
19,485
(1.75 %)
22,707
(1.41 %)
n/a 41.33
(95.82 %)
121,387
(4.20 %)
133,555
(95.80 %)
3,906,439
(36.43 %)
691,647
(2.39 %)
13,489,368
(32.95 %)
86,751
(2.23 %)
612 spotted-tailed quoll (Chaos hap1 2025)
GCA_048593285.1
n/a 15,188
(0.80 %)
15,406
(0.90 %)
n/a 36.07
(99.97 %)
151
(0.03 %)
157
(99.97 %)
4,933,924
(23.65 %)
1,239,006
(2.76 %)
20,612,787
(41.98 %)
21,700
(0.64 %)
613 spotted-tailed quoll (Chaos hap2 2025)
GCA_048593245.1
n/a 15,441
(0.80 %)
15,791
(0.92 %)
n/a 36.12
(99.99 %)
118
(0.01 %)
124
(99.99 %)
4,962,547
(23.62 %)
1,257,253
(2.87 %)
20,652,321
(42.01 %)
22,718
(0.69 %)
614 star-nosed mole
GCF_000260355.1
30,444
(2.86 %)
16,116
(1.82 %)
17,403
(1.78 %)
n/a 41.55
(95.10 %)
82,557
(4.92 %)
84,595
(95.08 %)
1,855,039
(18.90 %)
308,473
(0.86 %)
9,571,561
(26.02 %)
48,079
(2.76 %)
615 Steller sea lion
GCF_004028035.1
46,044
(2.38 %)
21,171
(1.78 %)
21,626
(1.43 %)
36,701
(1.75 %)
41.38
(99.41 %)
18,994
(0.59 %)
24,485
(99.41 %)
4,556,415
(43.53 %)
577,797
(1.09 %)
13,545,012
(33.71 %)
51,355
(1.45 %)
616 Stephens's kangaroo rat
GCA_004024685.1
n/a 20,638
(1.19 %)
43,541
(1.37 %)
n/a 41.90
(99.85 %)
8,882
(0.04 %)
1,278,525
(99.96 %)
4,886,095
(30.36 %)
1,229,832
(5.30 %)
11,334,494
(44.33 %)
38,450
(1.17 %)
617 steppe mouse (ZRU 2018)
GCA_003336285.1
n/a 22,032
(2.17 %)
20,891
(1.41 %)
n/a 41.70
(95.78 %)
123,681
(4.24 %)
161,217
(95.76 %)
4,964,415
(42.35 %)
1,414,584
(2.75 %)
12,989,925
(31.80 %)
17,544
(0.44 %)
618 Stoliczka's trident bat (China 2021113_DDA primary hap 2024)
GCA_043727835.1
n/a 19,605
(1.80 %)
20,075
(1.48 %)
n/a 41.32
(100.00 %)
87
(0.00 %)
80
(100.00 %)
4,110,913
(40.46 %)
838,212
(2.48 %)
11,938,168
(33.52 %)
40,424
(1.32 %)
619 straw-colored fruit bat
GCA_000465285.1
n/a 20,161
(1.66 %)
40,283
(1.50 %)
n/a 39.24
(99.62 %)
154,908
(0.40 %)
288,446
(99.60 %)
2,814,732
(32.92 %)
372,539
(1.01 %)
12,351,823
(25.93 %)
67,245
(2.34 %)
620 stripe-headed round-eared bat
GCA_004024845.1
n/a 20,248
(1.62 %)
29,173
(1.61 %)
n/a 42.04
(99.96 %)
2,860
(0.01 %)
252,670
(99.99 %)
3,018,746
(29.48 %)
333,243
(0.74 %)
12,128,116
(30.51 %)
59,513
(1.87 %)
621 striped dolphin (alternate hap 2023)
GCA_951394445.1
n/a 18,204
(1.54 %)
21,036
(1.34 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
n/a 3,464
(100.00 %)
3,767,720
(35.65 %)
1,102,723
(10.92 %)
11,794,617
(40.96 %)
67,537
(3.57 %)
622 striped dolphin (primary hap 2023)
GCA_951394435.1
n/a 18,595
(1.48 %)
20,637
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
993
(0.01 %)
639
(100.00 %)
4,097,623
(35.88 %)
1,442,973
(13.60 %)
12,327,244
(43.08 %)
68,498
(4.29 %)
623 striped hyena (BS54 2019 Broad)
GCA_004023945.1
n/a 22,373
(1.45 %)
39,382
(1.45 %)
n/a 41.66
(99.93 %)
11,849
(0.05 %)
362,072
(99.95 %)
5,048,667
(42.42 %)
712,073
(1.24 %)
13,879,012
(34.58 %)
69,835
(2.20 %)
624 striped hyena (Hyena2069 2018 Potsdam U)
GCF_003009895.1
48,870
(2.41 %)
18,793
(1.67 %)
20,950
(1.44 %)
n/a 41.56
(99.29 %)
23,058
(0.71 %)
5,761
(100.00 %)
4,782,500
(41.88 %)
701,157
(1.32 %)
13,436,624
(33.05 %)
58,977
(2.20 %)
625 sugar glider (PSGF00001 2023)
GCA_028583685.1
n/a 19,326
(0.81 %)
17,560
(0.95 %)
n/a 38.95
(98.12 %)
85,933
(1.89 %)
1,895
(100.00 %)
6,382,198
(27.07 %)
1,058,207
(1.74 %)
22,508,040
(39.84 %)
16,224
(0.33 %)
626 sugar glider (PSGF00001 2023)
GCF_028583685.1
55,990
(2.41 %)
19,328
(0.81 %)
17,559
(0.95 %)
n/a 38.95
(98.12 %)
85,933
(1.89 %)
1,896
(100.00 %)
6,382,203
(27.07 %)
1,058,208
(1.74 %)
22,508,106
(39.84 %)
16,224
(0.33 %)
627 Sumatran rhinoceros (Ipuh 2017)
GCA_002844835.1
n/a 20,368
(1.53 %)
24,204
(1.23 %)
n/a 41.05
(95.54 %)
50,876
(4.40 %)
1,112,463
(95.60 %)
4,516,240
(39.90 %)
561,540
(1.56 %)
15,821,451
(34.68 %)
45,201
(1.03 %)
628 Sumatran serow (serow.1 2024)
GCF_032405125.1
36,400
(1.65 %)
19,192
(1.42 %)
22,014
(1.41 %)
n/a 43.08
(100.00 %)
6
(0.00 %)
159
(100.00 %)
3,242,768
(21.18 %)
612,565
(8.05 %)
12,812,990
(44.37 %)
75,177
(5.86 %)
629 Sunda flying lemur (2014 WashU)
GCF_000696425.1
34,734
(1.83 %)
21,356
(1.55 %)
25,832
(1.21 %)
n/a 40.21
(87.96 %)
412,608
(12.07 %)
511,878
(87.93 %)
4,961,153
(38.35 %)
854,441
(3.33 %)
17,562,576
(28.82 %)
82,988
(1.05 %)
630 Sunda flying lemur (US047 2019 Broad)
GCA_004027255.1
n/a 24,882
(1.29 %)
43,546
(1.12 %)
n/a 40.46
(99.88 %)
5,895
(0.02 %)
1,655,642
(99.98 %)
5,807,241
(38.62 %)
953,765
(2.48 %)
18,836,777
(37.68 %)
114,955
(1.43 %)
631 tailed tailless bat
GCA_004027475.1
n/a 19,920
(1.58 %)
28,017
(1.58 %)
n/a 41.76
(99.95 %)
4,640
(0.02 %)
341,895
(99.98 %)
3,139,817
(30.43 %)
381,536
(0.81 %)
12,069,229
(32.73 %)
54,528
(2.15 %)
632 tailess tenrec (hap1 2025)
GCF_050624435.1
45,770
(1.60 %)
21,323
(0.86 %)
25,223
(1.02 %)
n/a 44.80
(100.00 %)
175
(0.00 %)
2,180
(100.00 %)
5,633,466
(38.91 %)
1,001,072
(14.26 %)
17,866,411
(50.04 %)
53,320
(1.01 %)
633 takin (Tak-1 2022)
GCF_023091745.1
31,927
(1.65 %)
19,290
(1.42 %)
21,656
(1.27 %)
n/a 43.32
(100.00 %)
152
(0.00 %)
1,363
(100.00 %)
3,256,033
(21.01 %)
714,375
(8.32 %)
13,010,154
(44.58 %)
49,134
(7.43 %)
634 Talazac's shrew tenrec
GCA_004026705.1
n/a 22,605
(0.81 %)
50,725
(1.09 %)
n/a 43.03
(99.93 %)
6,619
(0.02 %)
795,514
(99.98 %)
3,493,378
(14.58 %)
705,274
(1.31 %)
20,975,335
(36.85 %)
70,793
(1.26 %)
635 tammar wallaby (alternate hap 2023)
GCA_028389975.1
n/a 11,133
(0.77 %)
13,869
(0.98 %)
n/a 38.63
(100.00 %)
2
(0.00 %)
14,285
(100.00 %)
3,114,522
(26.10 %)
661,874
(3.02 %)
11,667,649
(38.41 %)
12,393
(0.46 %)
636 tammar wallaby (Barry hap1 2025)
GCA_048593335.1
n/a 17,491
(0.79 %)
15,701
(0.88 %)
n/a 38.69
(100.00 %)
32
(0.00 %)
40
(100.00 %)
5,762,317
(26.52 %)
1,078,692
(1.83 %)
22,476,051
(38.99 %)
22,756
(0.48 %)
637 tammar wallaby (Barry hap2 2025)
GCA_048593345.1
n/a 17,037
(0.79 %)
15,066
(0.87 %)
n/a 38.62
(100.00 %)
16
(0.00 %)
24
(100.00 %)
5,608,153
(26.57 %)
1,050,173
(1.77 %)
21,856,273
(38.96 %)
21,811
(0.47 %)
638 tammar wallaby (v2 primary hap 2023 refseq)
GCF_028372415.1
73,219
(3.07 %)
17,615
(0.77 %)
15,415
(0.86 %)
n/a 38.73
(99.81 %)
515
(0.19 %)
272
(100.00 %)
5,866,314
(26.30 %)
1,193,604
(2.72 %)
22,677,480
(39.53 %)
23,590
(0.47 %)
639 Tasmanian devil (McLovin hap1 2025)
GCA_048593225.1
n/a 15,725
(0.77 %)
16,721
(0.92 %)
n/a 36.17
(99.49 %)
1,514
(0.51 %)
1,521
(99.49 %)
5,222,976
(23.42 %)
1,357,438
(3.95 %)
21,705,122
(42.26 %)
24,443
(0.70 %)
640 Tasmanian devil (McLovin hap2 2025)
GCA_048593325.1
n/a 15,165
(0.76 %)
15,663
(0.91 %)
n/a 36.00
(99.11 %)
2,578
(0.89 %)
2,584
(99.11 %)
5,039,957
(23.64 %)
1,257,168
(2.97 %)
20,893,744
(41.44 %)
22,574
(0.67 %)
641 Tasmanian devil (primary hap 2019)
GCF_902635505.1
52,070
(2.36 %)
15,918
(0.85 %)
16,111
(0.91 %)
n/a 36.16
(100.00 %)
354
(0.00 %)
106
(100.00 %)
6,789,158
(44.28 %)
1,246,027
(2.19 %)
21,434,803
(41.20 %)
23,609
(0.65 %)
642 thirteen-lined ground squirrel (2021 HiC)
GCF_016881025.1
69,352
(3.50 %)
18,934
(1.68 %)
16,775
(1.37 %)
n/a 39.91
(93.25 %)
146,412
(6.77 %)
7,132
(100.00 %)
4,262,890
(35.64 %)
640,624
(1.64 %)
14,118,452
(27.90 %)
28,317
(0.64 %)
643 Tibetan sand fox (lyu1992 2022)
GCA_024500485.1
n/a 19,552
(1.59 %)
19,307
(1.35 %)
n/a 41.25
(100.00 %)
145
(0.00 %)
234
(100.00 %)
4,500,832
(32.18 %)
999,068
(2.01 %)
13,646,015
(32.98 %)
49,402
(2.19 %)
644 tiger
GCF_018350195.1
71,226
(2.84 %)
18,513
(1.68 %)
19,919
(1.39 %)
n/a 41.64
(100.00 %)
65
(0.00 %)
131
(100.00 %)
4,878,003
(42.77 %)
912,595
(1.82 %)
13,804,650
(33.76 %)
64,312
(2.55 %)
645 Townsend's big-eared bat (haplotype 1 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230055.1
n/a 19,370
(1.77 %)
21,062
(1.61 %)
n/a 42.81
(100.00 %)
219
(0.00 %)
610
(100.00 %)
2,923,694
(25.49 %)
772,382
(3.25 %)
10,654,074
(37.41 %)
48,226
(2.42 %)
646 Townsend's big-eared bat (haplotype 2 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230045.1
n/a 18,627
(1.82 %)
20,108
(1.67 %)
n/a 42.95
(100.00 %)
217
(0.00 %)
182
(100.00 %)
2,733,927
(24.79 %)
715,258
(3.17 %)
10,099,456
(36.35 %)
47,139
(2.58 %)
647 Transcaucasian mole vole
GCA_001685075.1
n/a 20,173
(1.62 %)
18,627
(1.30 %)
n/a 41.51
(96.09 %)
440,846
(3.96 %)
499,269
(96.04 %)
3,827,136
(25.51 %)
810,597
(2.65 %)
13,634,524
(27.54 %)
9,596
(0.16 %)
648 trefoil horseshoe bat (Malaysia primary hap 2024)
GCA_043728145.1
n/a 18,871
(1.79 %)
20,351
(1.55 %)
n/a 40.66
(99.99 %)
397
(0.01 %)
136
(100.00 %)
3,580,957
(40.75 %)
683,947
(2.19 %)
11,464,418
(33.39 %)
37,175
(1.31 %)
649 True's beaked whale (hap1.1 2024)
GCA_964341445.1
n/a 19,530
(1.21 %)
24,576
(1.13 %)
n/a 42.48
(99.99 %)
1,240
(0.01 %)
2,757
(100.00 %)
4,847,855
(34.88 %)
949,927
(20.01 %)
10,981,914
(51.51 %)
91,880
(2.74 %)
650 True's beaked whale (hap2.1 2024)
GCA_964341485.1
n/a 19,313
(1.40 %)
22,642
(1.25 %)
n/a 42.03
(99.99 %)
1,073
(0.01 %)
2,457
(99.99 %)
4,540,507
(37.61 %)
826,104
(12.82 %)
11,296,445
(45.25 %)
80,840
(2.24 %)
651 Upper Galilee mountains blind mole rat (2095 2014 refseq)
GCF_000622305.1
54,680
(2.07 %)
19,704
(1.26 %)
21,262
(1.20 %)
n/a 41.26
(95.18 %)
201,121
(4.83 %)
356,097
(95.17 %)
6,165,645
(34.95 %)
1,197,750
(2.77 %)
16,282,383
(36.21 %)
22,905
(0.49 %)
652 Vancouver Island marmot (RANI-1049 2019)
GCA_005458795.1
n/a 19,867
(1.62 %)
15,893
(1.33 %)
n/a 39.77
(94.43 %)
296,819
(5.60 %)
315,631
(94.40 %)
4,452,628
(33.94 %)
751,210
(1.84 %)
13,917,879
(30.08 %)
26,541
(0.58 %)
653 vaquita (alternate hap mPhoSin1 2019)
GCA_008692045.1
n/a 9,367
(1.66 %)
11,297
(1.30 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
1
(0.00 %)
9,470
(100.00 %)
1,708,360
(43.81 %)
267,584
(1.67 %)
5,373,410
(33.52 %)
29,783
(1.94 %)
654 vaquita (mPhoSin1 2019)
GCF_008692025.1
60,106
(3.00 %)
18,611
(1.76 %)
20,103
(1.39 %)
35,176
(2.22 %)
41.36
(99.66 %)
212
(0.34 %)
64
(100.00 %)
4,067,454
(44.25 %)
602,407
(1.34 %)
12,468,582
(35.55 %)
66,806
(1.79 %)
655 water buffalo (Mediterranean 2018)
GCF_003121395.1
69,771
(3.14 %)
19,465
(1.58 %)
21,849
(1.37 %)
46,051
(1.86 %)
41.81
(99.99 %)
410
(0.01 %)
509
(100.00 %)
5,407,697
(47.11 %)
473,976
(1.54 %)
13,015,899
(41.23 %)
43,120
(1.15 %)
656 water buffalo (Murrah 2021)
GCF_019923935.1
80,565
(3.26 %)
19,402
(1.59 %)
20,375
(1.31 %)
n/a 41.75
(100.00 %)
659
(0.00 %)
26
(100.00 %)
5,358,548
(47.11 %)
447,338
(1.14 %)
13,034,537
(41.28 %)
40,189
(1.07 %)
657 Weddell seal (WS11-02 2013 refseq)
GCF_000349705.1
48,264
(2.73 %)
21,063
(1.73 %)
22,333
(1.43 %)
n/a 41.39
(70.44 %)
152,836
(29.58 %)
169,547
(70.42 %)
4,420,479
(41.72 %)
471,256
(0.66 %)
13,410,237
(22.09 %)
48,738
(1.01 %)
658 western European hedgehog (2012 refseq)
GCF_000296755.1
29,923
(1.67 %)
18,067
(1.33 %)
19,777
(1.35 %)
n/a 41.54
(85.94 %)
219,764
(14.09 %)
225,567
(85.91 %)
6,594,783
(45.66 %)
1,271,533
(2.29 %)
12,374,161
(42.02 %)
28,528
(0.71 %)
659 western European hedgehog (alternate hap 2023)
GCA_950295305.1
n/a 14,370
(1.06 %)
24,297
(1.27 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
1
(0.00 %)
26,601
(100.00 %)
3,360,923
(19.59 %)
1,043,098
(3.92 %)
8,511,380
(53.68 %)
23,321
(0.97 %)
660 western European hedgehog (primary hap 2023 refseq)
GCF_950295315.1
61,103
(2.36 %)
18,125
(1.16 %)
20,689
(1.21 %)
n/a 42.00
(99.97 %)
3,760
(0.03 %)
1,174
(100.00 %)
4,891,329
(19.68 %)
1,507,929
(3.81 %)
12,571,105
(54.50 %)
32,667
(0.90 %)
661 western European house mouse (WSB_EiJ v3 2022)
GCA_921998345.2
n/a 21,722
(2.14 %)
19,586
(1.39 %)
108,856
(4.46 %)
41.81
(98.87 %)
1,233
(1.13 %)
233
(100.00 %)
4,634,551
(40.61 %)
1,541,826
(3.49 %)
13,030,566
(35.21 %)
22,985
(0.56 %)
662 western roe deer (2023)
GCA_951849835.1
n/a 20,291
(1.29 %)
23,555
(1.23 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
n/a 212
(100.00 %)
4,204,612
(25.49 %)
848,463
(7.79 %)
12,687,776
(48.28 %)
57,315
(1.25 %)
663 western spotted skunk
GCA_004023965.1
n/a 21,665
(1.46 %)
34,370
(1.32 %)
n/a 41.61
(99.92 %)
11,822
(0.05 %)
433,831
(99.95 %)
4,889,781
(40.77 %)
901,906
(2.30 %)
13,931,764
(34.80 %)
54,394
(1.54 %)
664 western wild mouse (SPRET_EiJ v3 2022)
GCA_921997135.2
n/a 21,699
(2.10 %)
18,837
(1.32 %)
n/a 41.69
(99.51 %)
1,576
(0.49 %)
143
(100.00 %)
4,507,329
(41.24 %)
1,517,241
(3.77 %)
12,832,499
(36.17 %)
22,568
(0.53 %)
665 whiskered bat (hap1 2024)
GCA_964094495.2
n/a 19,504
(1.78 %)
22,272
(1.73 %)
n/a 42.99
(99.99 %)
1,566
(0.02 %)
533
(100.00 %)
3,046,246
(25.06 %)
753,151
(4.86 %)
10,596,418
(37.62 %)
66,785
(2.55 %)
666 whiskered bat (hap2 2024)
GCA_964195625.1
n/a 18,681
(1.83 %)
21,523
(1.79 %)
n/a 43.13
(99.99 %)
1,414
(0.01 %)
1,741
(99.99 %)
2,849,223
(24.50 %)
688,594
(4.80 %)
9,968,980
(36.80 %)
64,365
(2.68 %)
667 white-beaked dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949774935.1
n/a 17,639
(1.50 %)
25,684
(1.35 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
n/a 25,619
(100.00 %)
3,039,324
(36.05 %)
637,912
(8.02 %)
9,746,398
(38.98 %)
56,325
(3.33 %)
668 white-beaked dolphin (primary hap 2023 refseq)
GCF_949774975.1
59,995
(2.43 %)
18,737
(1.57 %)
20,767
(1.34 %)
n/a 41.91
(99.99 %)
1,070
(0.01 %)
410
(100.00 %)
3,820,566
(36.21 %)
922,103
(8.43 %)
12,304,360
(39.74 %)
68,551
(3.58 %)
669 white-footed mouse (LL stock 2020)
GCF_004664715.2
54,479
(2.82 %)
19,971
(1.69 %)
20,132
(1.42 %)
n/a 42.23
(99.95 %)
2,299
(0.05 %)
1,857
(100.00 %)
5,060,487
(30.71 %)
1,258,073
(2.85 %)
14,007,098
(32.99 %)
23,456
(0.67 %)
670 white-tailed deer (Illinois 20LAN1187 2024)
GCF_023699985.2
68,660
(3.60 %)
19,951
(1.73 %)
21,804
(1.48 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
294
(0.00 %)
718
(100.00 %)
4,512,173
(43.10 %)
402,481
(1.14 %)
12,813,223
(37.56 %)
45,863
(1.30 %)
671 white-tailed deer (Pink-7 2017 refseq)
GCF_002102435.1
57,787
(2.93 %)
20,661
(1.75 %)
23,085
(1.50 %)
40,987
(1.94 %)
41.55
(99.10 %)
107,058
(0.91 %)
48,653
(99.10 %)
4,800,704
(41.29 %)
413,129
(2.59 %)
13,296,779
(34.22 %)
44,165
(1.19 %)
672 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 alternate hap 2022)
GCA_024140225.1
n/a 12,198
(1.10 %)
18,494
(1.29 %)
n/a 39.87
(100.00 %)
26
(0.00 %)
14,841
(100.00 %)
1,725,021
(17.81 %)
802,415
(4.26 %)
8,321,474
(45.72 %)
15,669
(0.79 %)
673 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 primary hap 2022)
GCF_024139225.1
40,430
(1.81 %)
17,575
(1.21 %)
21,880
(1.35 %)
47,496
(1.55 %)
39.81
(99.57 %)
1,010
(0.43 %)
147
(100.00 %)
2,846,063
(18.57 %)
1,252,362
(3.89 %)
13,776,063
(46.50 %)
24,589
(0.78 %)
674 wild Bactrian camel (BCGSAC Cfer 1.0 YT-003-E 2020)
GCF_009834535.1
70,235
(4.11 %)
18,202
(1.93 %)
20,199
(1.66 %)
42,728
(2.35 %)
41.66
(99.99 %)
2,345
(0.01 %)
2,043
(100.00 %)
3,091,018
(33.31 %)
332,720
(5.33 %)
12,161,286
(28.79 %)
55,524
(1.75 %)
675 wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 refseq)
GCF_000311805.1
34,726
(2.40 %)
18,746
(1.96 %)
17,104
(1.61 %)
n/a 41.28
(98.83 %)
60,971
(1.18 %)
68,872
(98.82 %)
2,991,821
(33.93 %)
353,632
(1.23 %)
12,349,615
(25.12 %)
45,437
(1.02 %)
676 wild goat
GCA_000978405.1
n/a 19,104
(1.48 %)
16,198
(1.21 %)
n/a 41.91
(91.72 %)
279,195
(8.31 %)
368,693
(91.69 %)
5,563,294
(45.39 %)
452,402
(1.99 %)
13,802,376
(35.47 %)
41,935
(0.63 %)
677 wild yak (GX-2022 2023)
GCF_027580195.1
52,505
(2.90 %)
19,278
(1.60 %)
20,813
(1.31 %)
n/a 41.87
(100.00 %)
196
(0.00 %)
2,040
(100.00 %)
5,706,841
(46.71 %)
464,013
(1.82 %)
12,973,198
(41.46 %)
42,508
(1.32 %)
678 wild yak (yakQH1 2013)
GCF_000298355.1
29,789
(1.92 %)
19,936
(1.62 %)
19,914
(1.32 %)
n/a 41.71
(95.48 %)
192,006
(4.54 %)
233,198
(95.46 %)
5,348,663
(46.08 %)
449,880
(1.38 %)
13,572,902
(36.62 %)
41,147
(0.82 %)
679 woodchuck (v1.1 L192 2022)
GCF_021218885.2
68,030
(3.47 %)
19,116
(1.55 %)
21,017
(1.38 %)
n/a 39.92
(100.00 %)
47
(0.00 %)
3,380
(100.00 %)
5,285,788
(43.20 %)
912,552
(2.73 %)
14,538,866
(35.15 %)
36,914
(1.02 %)
680 woodland dormouse
GCA_004027655.1
n/a 23,556
(1.09 %)
55,517
(1.33 %)
n/a 41.52
(99.86 %)
15,691
(0.06 %)
1,283,630
(99.94 %)
7,674,195
(34.99 %)
1,698,258
(3.76 %)
13,705,886
(42.23 %)
68,562
(1.41 %)
681 woodland thicket rat
GCF_004785775.1
43,129
(2.40 %)
22,710
(2.13 %)
21,042
(1.49 %)
n/a 41.17
(98.57 %)
76,623
(1.44 %)
23,656
(100.00 %)
4,732,544
(38.04 %)
1,424,025
(3.23 %)
13,549,399
(30.42 %)
18,232
(0.48 %)
682 woolly hare (The Qinghai-Tibet Plateau SH-2023 2024)
GCA_036325905.1
n/a 19,363
(1.28 %)
22,239
(1.28 %)
n/a 44.08
(100.00 %)
240
(0.00 %)
112
(100.00 %)
4,432,114
(42.23 %)
966,165
(7.11 %)
13,263,822
(43.77 %)
96,755
(2.28 %)
683 Yangtze finless porpoise (v2 wild 2018 refseq)
GCF_003031525.2
43,310
(2.49 %)
18,747
(1.81 %)
19,638
(1.46 %)
n/a 41.28
(99.29 %)
52,647
(0.72 %)
66,343
(99.28 %)
3,547,466
(35.83 %)
540,760
(1.65 %)
12,691,756
(32.88 %)
59,050
(1.48 %)
684 Yangtze River dolphin (v1.1 BGI 2013 refseq)
GCF_000442215.2
26,128
(1.61 %)
18,978
(1.74 %)
20,661
(1.39 %)
n/a 41.24
(98.69 %)
123,788
(1.33 %)
148,598
(98.67 %)
3,788,303
(37.04 %)
690,288
(1.96 %)
12,841,906
(35.04 %)
62,458
(1.54 %)
685 yellow-bellied marmot (hap1 2025 refseq)
GCF_047511675.1
55,299
(2.52 %)
19,502
(1.44 %)
20,297
(1.34 %)
n/a 39.90
(100.00 %)
330
(0.00 %)
813
(100.00 %)
4,038,893
(29.07 %)
978,915
(3.28 %)
14,404,633
(34.97 %)
36,674
(1.05 %)
686 yellow-bellied marmot (hap2 2025)
GCA_047512175.1
n/a 18,677
(1.51 %)
19,370
(1.40 %)
n/a 40.03
(100.00 %)
307
(0.00 %)
329
(100.00 %)
3,694,109
(28.05 %)
793,102
(2.43 %)
13,585,913
(33.39 %)
33,990
(1.02 %)
687 yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.1 2019)
GCF_003676075.3
42,667
(2.16 %)
19,547
(1.52 %)
21,406
(1.40 %)
n/a 39.89
(97.96 %)
35,509
(2.04 %)
66,442
(97.96 %)
3,814,223
(27.39 %)
800,865
(1.96 %)
14,323,977
(32.63 %)
34,122
(0.91 %)
688 yellow-footed antechinus (v2 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021)
GCF_016432865.1
47,618
(2.51 %)
15,703
(0.78 %)
16,155
(0.90 %)
n/a 36.21
(99.99 %)
620
(0.01 %)
486
(100.00 %)
5,191,383
(23.81 %)
1,269,772
(2.59 %)
21,430,585
(42.69 %)
28,118
(0.66 %)
689 yellow-spotted hyrax
GCA_004026845.1
n/a 20,424
(0.86 %)
43,984
(1.27 %)
n/a 40.93
(99.94 %)
3,815
(0.01 %)
971,748
(99.99 %)
5,365,974
(31.41 %)
435,699
(1.22 %)
21,229,266
(45.17 %)
38,521
(0.68 %)
690 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 2023)
GCA_028571685.1
n/a 17,610
(1.00 %)
20,322
(1.04 %)
n/a 40.80
(100.00 %)
276
(0.00 %)
62
(100.00 %)
3,295,935
(23.58 %)
389,907
(6.37 %)
19,525,382
(45.90 %)
31,831
(0.63 %)
691 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 alternate hap 2023)
GCA_028571665.1
n/a 16,320
(1.03 %)
20,318
(1.13 %)
n/a 40.93
(100.00 %)
1
(0.00 %)
4,169
(100.00 %)
2,911,332
(23.50 %)
347,110
(4.57 %)
17,256,419
(44.04 %)
28,674
(0.68 %)
692 Yong Hoi Sen's woolly horseshoe bat (Malaysia 20210929_DDd primary hap 2024)
GCA_043880425.1
n/a 18,352
(1.71 %)
20,233
(1.46 %)
n/a 41.73
(100.00 %)
196
(0.00 %)
1,530
(100.00 %)
3,466,695
(41.95 %)
934,524
(8.81 %)
11,690,112
(36.30 %)
35,257
(5.20 %)
693 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP alternate hap 2023)
GCA_028536395.1
n/a 19,188
(1.79 %)
21,673
(1.72 %)
n/a 43.03
(100.00 %)
215
(0.00 %)
250
(100.00 %)
3,043,589
(24.76 %)
773,853
(4.49 %)
10,648,494
(37.26 %)
61,910
(2.52 %)
694 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP primary hap 2023 refseq)
GCF_028538775.1
48,707
(3.25 %)
18,807
(1.93 %)
21,046
(1.76 %)
n/a 43.22
(100.00 %)
209
(0.00 %)
684
(100.00 %)
3,552,235
(38.46 %)
719,552
(4.26 %)
10,089,365
(36.35 %)
60,974
(2.61 %)
695 zebu cattle (Hainan HN024 2024)
GCA_039881165.1
n/a 19,162
(1.53 %)
20,991
(1.34 %)
n/a 41.77
(99.99 %)
350
(0.01 %)
292
(100.00 %)
3,296,209
(23.14 %)
440,574
(1.28 %)
12,824,144
(40.98 %)
39,400
(1.07 %)
696 zebu cattle (Nelore 2014 refseq)
GCF_000247795.1
39,830
(2.52 %)
18,603
(1.59 %)
18,779
(1.29 %)
n/a 41.75
(92.62 %)
6,941,272
(7.66 %)
253,770
(92.59 %)
5,119,428
(46.84 %)
358,908
(0.88 %)
13,431,672
(36.60 %)
35,241
(0.84 %)
697 zebu cattle (Sahiwal x Tharparkar maternal NIAB-ARS_2022 2023)
GCF_029378745.1
70,745
(4.27 %)
19,546
(1.58 %)
21,187
(1.33 %)
n/a 41.86
(100.00 %)
283
(0.00 %)
67
(100.00 %)
5,530,890
(46.61 %)
459,827
(1.43 %)
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Plants 351 assemblies assembly stats track stats
Fungi 3960 assemblies assembly stats track stats
Viruses 14979 assemblies assembly stats track stats
Archaea 2641 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 21569 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 687 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 5058 assemblies assembly stats track stats