VGP - Vertebrate Genomes Project assembly hubs, track statistics

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This assembly hub contains assemblies released by the Vertebrate Genomes Project. (set of alternate/haplotype assemblies)

See also: hub access, assembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser		 ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes		 Ensembl
genes		 gc5 base gaps assembly
sequences		 Repeat
Masker		 TRF
simpleRepeat		 window
Masker		 cpg
islands
1 Abyssinian ground-hornbill
GCA_009769595.1		 n/a 11,948
(1.86 %)		 22,509
(2.24 %)		 n/a 43.51
(100.00 %)		 n/a 3,527
(100.00 %)		 361,147
(5.36 %)		 125,372
(0.75 %)		 5,917,083
(18.51 %)		 38,787
(3.82 %)
2 Aeolian wall lizard (La Canna islet rPodRaf1 alternate hap 2022)
GCA_027172095.1		 n/a 2,101
(1.18 %)		 5,350
(2.76 %)		 n/a 43.70
(99.99 %)		 3
(0.00 %)		 4,811
(100.00 %)		 103,373
(4.27 %)		 58,480
(3.90 %)		 895,535
(27.44 %)		 10,399
(2.84 %)
3 African hunting dog (LycPic1hap1 2024)
GCA_040955645.1		 n/a 18,688
(1.61 %)		 19,670
(1.44 %)		 n/a 41.35
(100.00 %)		 82
(0.00 %)		 86
(100.00 %)		 4,281,139
(31.62 %)		 959,378
(2.78 %)		 12,859,760
(32.95 %)		 49,122
(2.32 %)
4 African ostrich (bStrCam1hap2 2024)
GCA_040807015.1		 n/a 13,036
(1.56 %)		 32,740
(2.89 %)		 n/a 45.71
(100.00 %)		 82
(0.00 %)		 250
(100.00 %)		 651,979
(9.34 %)		 459,653
(10.08 %)		 4,547,348
(28.27 %)		 49,261
(10.50 %)
5 African savanna elephant (hap1 mLoxAfr1 2023)
GCA_030020305.1		 n/a 18,845
(1.07 %)		 22,426
(1.10 %)		 n/a 41.34
(99.85 %)		 169
(0.15 %)		 1,253
(99.85 %)		 4,406,744
(29.55 %)		 925,868
(4.71 %)		 15,966,881
(50.49 %)		 68,531
(1.61 %)
6 Alvarez's mastiff bat (hap2 2024)
GCA_037176705.1		 n/a 19,066
(1.48 %)		 22,356
(1.48 %)		 n/a 42.25
(100.00 %)		 75
(0.00 %)		 287
(100.00 %)		 3,908,607
(31.48 %)		 664,931
(5.23 %)		 11,892,191
(41.08 %)		 76,453
(2.43 %)
7 American alligator (2023 genbank)
GCA_030867065.1		 n/a 14,487
(0.97 %)		 20,444
(1.61 %)		 n/a 45.04
(99.81 %)		 136
(0.19 %)		 806
(99.81 %)		 3,380,365
(43.12 %)		 560,127
(2.00 %)		 12,524,244
(32.47 %)		 50,852
(2.67 %)
8 American flamingo
GCA_009819805.1		 n/a 12,384
(1.73 %)		 23,611
(2.05 %)		 n/a 43.35
(100.00 %)		 n/a 3,529
(100.00 %)		 496,877
(7.22 %)		 162,522
(0.74 %)		 6,684,675
(20.14 %)		 51,895
(5.89 %)
9 American mink (hap2 2024)
GCA_964106205.1		 n/a 18,890
(1.43 %)		 21,684
(1.33 %)		 n/a 42.35
(99.98 %)		 2,849
(0.02 %)		 3,200
(99.98 %)		 4,158,563
(30.22 %)		 786,430
(5.25 %)		 13,845,377
(37.58 %)		 64,307
(2.75 %)
10 American pika (hap2 mOchPri1 2023)
GCA_030435715.1		 n/a 16,911
(1.23 %)		 21,107
(1.43 %)		 n/a 44.43
(100.00 %)		 375
(0.00 %)		 6,123
(100.00 %)		 1,808,768
(10.42 %)		 561,106
(21.05 %)		 10,283,513
(45.97 %)		 54,919
(1.33 %)
11 American shad (fAloSap1 alternate hap 2021)
GCA_018492705.1		 n/a 15,901
(2.25 %)		 61,133
(6.37 %)		 n/a 43.14
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,411
(100.00 %)		 2,043,181
(23.64 %)		 1,141,539
(11.35 %)		 3,668,314
(38.60 %)		 40,218
(2.14 %)
12 amphioxus (hap1 2024)
GCA_035149815.1		 n/a 5,253
(0.98 %)		 41,226
(12.64 %)		 n/a 41.60
(100.00 %)		 81
(0.00 %)		 65
(100.00 %)		 126,311
(1.61 %)		 178,951
(7.87 %)		 2,137,821
(27.19 %)		 44,152
(5.26 %)
13 Anna's hummingbird
GCA_003957575.1		 n/a 11,084
(1.90 %)		 19,321
(2.14 %)		 n/a 41.32
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 3,803
(100.00 %)		 475,493
(7.41 %)		 223,791
(1.37 %)		 5,585,250
(20.30 %)		 14,903
(1.46 %)
14 Antarctic lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_951214905.1		 n/a 17,318
(1.49 %)		 80,097
(5.79 %)		 n/a 43.49
(100.00 %)		 n/a 11,436
(100.00 %)		 5,482,467
(36.71 %)		 1,454,729
(18.84 %)		 6,756,226
(47.56 %)		 92,057
(3.50 %)
15 Arabian camel (hap2 2024)
GCA_036321565.1		 n/a 17,085
(1.73 %)		 19,317
(1.59 %)		 n/a 41.75
(100.00 %)		 210
(0.00 %)		 173
(100.00 %)		 2,818,446
(29.44 %)		 316,646
(8.90 %)		 11,192,133
(31.47 %)		 52,135
(1.67 %)
16 Aristotle's catfish (alternate hap 2022)
GCA_946807865.1		 n/a 14,032
(2.44 %)		 39,770
(4.92 %)		 n/a 38.85
(100.00 %)		 n/a 7,617
(100.00 %)		 1,808,149
(37.98 %)		 583,449
(10.56 %)		 4,203,368
(40.67 %)		 24,867
(2.06 %)
17 Asian bonytongue
GCA_900964985.2		 n/a 16,053
(2.73 %)		 74,777
(7.26 %)		 n/a 44.15
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,006
(100.00 %)		 482,351
(3.03 %)		 207,018
(1.68 %)		 4,139,370
(26.26 %)		 85,546
(10.82 %)
18 Asiatic elephant (mEleMax1 alternate hap 2022)
GCA_024166345.1		 n/a 17,906
(1.18 %)		 21,966
(1.14 %)		 n/a 41.14
(100.00 %)		 n/a 6,361
(100.00 %)		 3,818,524
(29.72 %)		 533,426
(3.22 %)		 14,381,781
(47.30 %)		 50,264
(1.15 %)
19 Asiatic tapir (hap1 2023)
GCA_031878655.1		 n/a 18,969
(1.75 %)		 20,207
(1.36 %)		 n/a 41.25
(100.00 %)		 79
(0.00 %)		 262
(100.00 %)		 3,650,963
(38.06 %)		 355,322
(2.63 %)		 14,837,952
(31.37 %)		 37,174
(1.87 %)
20 Atlantic cod
GCA_902167395.1		 n/a 13,366
(2.68 %)		 66,599
(9.29 %)		 n/a 45.55
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3,592
(100.00 %)		 696,727
(10.13 %)		 749,876
(13.00 %)		 2,554,769
(33.77 %)		 87,167
(8.03 %)
21 Atlantic hagfish (MG_SS 2024)
GCF_040869285.1		 46,374
(1.72 %)		 7,719
(0.19 %)		 59,788
(2.68 %)		 n/a 44.23
(99.94 %)		 4,876
(0.06 %)		 4,270
(100.00 %)		 2,094,143
(3.54 %)		 3,212,025
(29.83 %)		 8,998,320
(75.15 %)		 408,391
(12.65 %)
22 Atlantic halibut
GCA_009819745.1		 n/a 16,554
(3.01 %)		 54,832
(7.45 %)		 n/a 42.29
(100.00 %)		 62
(0.00 %)		 4,053
(100.00 %)		 494,008
(4.23 %)		 299,066
(3.87 %)		 4,272,649
(24.46 %)		 36,868
(2.33 %)
23 Atlantic horse mackerel (alternate hap 2021)
GCA_905171655.2		 n/a 15,331
(2.42 %)		 52,370
(6.91 %)		 n/a 41.96
(100.00 %)		 74
(0.00 %)		 1,049
(100.00 %)		 1,454,631
(18.29 %)		 383,946
(4.34 %)		 4,363,016
(32.69 %)		 56,416
(3.08 %)
24 Atlantic stingray (hap2 2023)
GCA_030144785.1		 n/a 11,960
(0.40 %)		 25,618
(1.25 %)		 n/a 42.94
(99.99 %)		 1,633
(0.01 %)		 1,412
(100.00 %)		 7,453,535
(49.31 %)		 686,063
(13.00 %)		 19,985,605
(50.32 %)		 86,138
(2.16 %)
25 Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap2.1 2024)
GCA_964270935.1		 n/a 17,961
(1.59 %)		 20,087
(1.36 %)		 n/a 42.05
(99.99 %)		 917
(0.01 %)		 1,796
(99.99 %)		 3,626,392
(35.51 %)		 824,778
(7.32 %)		 11,499,904
(39.18 %)		 74,348
(3.46 %)
26 Australian echidna (mTacAcu1 alternate hap 2020)
GCA_015852515.1		 n/a 13,505
(1.03 %)		 18,978
(1.47 %)		 n/a 45.32
(99.98 %)		 26
(0.02 %)		 3,482
(100.00 %)		 6,880,857
(41.88 %)		 1,099,932
(7.47 %)		 8,156,735
(56.68 %)		 70,515
(2.88 %)
27 axolotl (DD151 2021)
GCA_002915635.3		 n/a 16,280
(0.07 %)		 186,628
(1.11 %)		 n/a 46.01
(99.99 %)		 184,422
(0.01 %)		 27,157
(100.00 %)		 28,291,633
(68.19 %)		 7,299,053
(4.96 %)		 211,579
(99.99 %)		 2,388,998
(5.24 %)
28 banded archerfish (fToxJac2 alternate hap 2021)
GCA_017976295.1		 n/a 15,211
(3.23 %)		 41,620
(7.14 %)		 n/a 41.08
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2,393
(100.00 %)		 785,178
(17.57 %)		 249,148
(8.36 %)		 3,391,653
(26.49 %)		 13,787
(0.93 %)
29 banded killifish (hap2 2024)
GCA_037038625.1		 n/a 15,024
(1.45 %)		 65,141
(4.53 %)		 n/a 41.23
(99.52 %)		 373
(0.48 %)		 196
(100.00 %)		 2,509,508
(50.53 %)		 441,892
(5.11 %)		 6,245,443
(38.22 %)		 93,198
(3.82 %)
30 barbel (alternate hap 2022)
GCA_936446605.1		 n/a 26,794
(3.15 %)		 76,434
(5.64 %)		 n/a 37.81
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 8,035
(100.00 %)		 4,084,361
(52.18 %)		 538,411
(4.25 %)		 7,659,980
(38.94 %)		 58,008
(2.90 %)
31 Barn swallow (bHirRus1 v3 alternate hap 2021)
GCA_015227815.3		 n/a 11,132
(1.94 %)		 20,993
(2.40 %)		 n/a 42.41
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 2,476
(100.00 %)		 550,072
(10.78 %)		 282,378
(2.00 %)		 5,634,117
(20.43 %)		 30,305
(2.79 %)
32 basking shark (sCetMax3.hap2.1 2024)
GCA_964194165.1		 n/a 13,515
(0.42 %)		 21,374
(1.06 %)		 n/a 44.47
(99.99 %)		 2,740
(0.01 %)		 6,569
(99.99 %)		 6,483,403
(66.87 %)		 1,041,828
(9.99 %)		 21,142,745
(50.24 %)		 107,555
(1.88 %)
33 bats A.intermedius (hap2 2024)
GCA_038363225.1		 n/a 17,124
(1.63 %)		 18,342
(1.54 %)		 n/a 42.25
(100.00 %)		 56
(0.00 %)		 187
(100.00 %)		 2,597,378
(26.81 %)		 332,733
(4.43 %)		 10,957,327
(33.52 %)		 63,688
(2.22 %)
34 bird A.albertisi (hap2 2024)
GCA_039906465.1		 n/a 12,101
(1.93 %)		 21,258
(2.30 %)		 n/a 42.52
(99.99 %)		 344
(0.01 %)		 525
(100.00 %)		 412,944
(6.30 %)		 232,333
(2.21 %)		 5,715,517
(21.35 %)		 20,873
(2.13 %)
35 bird E.chinensis (hap1 2024)
GCA_039878515.1		 n/a 12,607
(2.39 %)		 22,429
(2.59 %)		 n/a 41.57
(99.99 %)		 331
(0.01 %)		 425
(100.00 %)		 521,486
(5.26 %)		 266,418
(2.40 %)		 5,305,054
(20.63 %)		 19,590
(2.16 %)
36 black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap2 2024)
GCA_043290065.1		 n/a 19,814
(0.63 %)		 20,140
(0.63 %)		 n/a 41.82
(100.00 %)		 723
(0.00 %)		 315
(100.00 %)		 3,657,357
(14.24 %)		 1,158,716
(2.84 %)		 22,924,986
(64.53 %)		 46,774
(0.90 %)
37 black rhinoceros (alternate hap 2021)
GCA_020826835.1		 n/a 19,000
(1.37 %)		 22,547
(1.26 %)		 n/a 41.56
(99.97 %)		 178
(0.03 %)		 1,199
(100.00 %)		 4,340,245
(37.22 %)		 564,468
(8.07 %)		 14,384,523
(40.40 %)		 44,971
(1.16 %)
38 black-capped chickadee (hap2 2023)
GCA_030490855.1		 n/a 11,495
(1.90 %)		 22,202
(2.49 %)		 n/a 42.77
(99.94 %)		 240
(0.06 %)		 157
(100.00 %)		 560,436
(11.20 %)		 441,102
(7.11 %)		 5,126,888
(23.42 %)		 35,457
(2.90 %)
39 black-headed gull (Kunming 2023)
GCA_030820635.1		 n/a 12,902
(1.75 %)		 23,180
(2.09 %)		 n/a 43.21
(100.00 %)		 149
(0.00 %)		 297
(100.00 %)		 498,044
(5.37 %)		 199,557
(4.44 %)		 6,843,616
(23.12 %)		 42,444
(3.62 %)
40 black-legged kittiwake (bRisTri1.mat 2023)
GCA_028501385.1		 n/a 12,650
(1.68 %)		 22,959
(2.02 %)		 n/a 44.62
(99.95 %)		 223
(0.05 %)		 733
(100.00 %)		 483,413
(5.25 %)		 221,284
(9.35 %)		 6,264,499
(27.26 %)		 42,776
(4.88 %)
41 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 1 2023)
GCA_028021495.1		 n/a 15,274
(2.92 %)		 51,453
(7.45 %)		 n/a 43.07
(99.99 %)		 373
(0.01 %)		 461
(100.00 %)		 1,239,364
(29.69 %)		 354,703
(9.63 %)		 3,006,556
(30.35 %)		 53,503
(4.48 %)
42 blackcap
GCA_009819715.1		 n/a 11,586
(1.87 %)		 22,618
(2.41 %)		 n/a 42.17
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 3,566
(100.00 %)		 473,456
(5.97 %)		 308,518
(2.29 %)		 5,987,640
(19.64 %)		 25,451
(2.38 %)
43 blacktail shiner (hap1 2024)
GCA_038021265.1		 n/a 17,403
(2.99 %)		 45,903
(5.38 %)		 n/a 38.64
(99.99 %)		 709
(0.01 %)		 673
(100.00 %)		 2,141,901
(35.77 %)		 482,931
(17.18 %)		 4,297,133
(46.82 %)		 41,889
(2.32 %)
44 Blainville's beaked whale (mMesDen1 alternate hap 2022)
GCA_025094165.1		 n/a 17,838
(1.54 %)		 21,389
(1.35 %)		 n/a 41.71
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,198
(100.00 %)		 3,542,727
(35.35 %)		 650,369
(8.86 %)		 10,971,320
(41.15 %)		 62,389
(1.68 %)
45 Blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 alternate hap 2020)
GCA_008658375.2		 n/a 16,997
(1.82 %)		 20,609
(1.44 %)		 n/a 41.20
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 10,999
(100.00 %)		 3,126,800
(43.49 %)		 454,452
(1.23 %)		 9,916,868
(33.63 %)		 55,436
(1.85 %)
46 blue-and-yellow macaw (hap2 2023)
GCA_028858555.1		 n/a 13,216
(1.69 %)		 23,855
(2.07 %)		 n/a 43.30
(99.92 %)		 130
(0.08 %)		 274
(100.00 %)		 746,174
(21.96 %)		 291,116
(9.91 %)		 5,424,976
(28.69 %)		 26,750
(2.02 %)
47 blunt-snouted clingfish
GCA_900650505.1		 n/a 12,494
(1.93 %)		 44,967
(5.14 %)		 n/a 38.20
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 7,675
(100.00 %)		 608,174
(4.23 %)		 390,755
(4.71 %)		 4,977,071
(42.41 %)		 23,532
(1.46 %)
48 Boeseman's rainbowfish (fMelBoe1 alternate hap 2021)
GCA_017639755.1		 n/a 13,882
(2.27 %)		 45,919
(5.98 %)		 n/a 39.50
(99.99 %)		 45
(0.01 %)		 3,194
(100.00 %)		 803,073
(13.60 %)		 258,404
(4.19 %)		 4,674,614
(28.36 %)		 15,524
(1.02 %)
49 bonti-bonti (fTelBon1 alternate hap 2022)
GCA_933228925.1		 n/a 12,424
(1.95 %)		 46,550
(6.00 %)		 n/a 41.63
(100.00 %)		 n/a 4,619
(100.00 %)		 789,207
(14.61 %)		 348,482
(20.98 %)		 3,447,241
(38.72 %)		 27,035
(4.16 %)
50 bony fish P.klunzingeri (RE-2024bhap2 2024)
GCA_042242125.1		 n/a 14,475
(2.89 %)		 44,413
(7.11 %)		 n/a 42.15
(100.00 %)		 93
(0.00 %)		 84
(100.00 %)		 1,762,151
(30.90 %)		 262,291
(5.80 %)		 3,580,461
(24.37 %)		 19,851
(1.40 %)
51 Bornean orangutan (v2 AG05252 alternate hap 2024)
GCA_028885525.2		 n/a 19,761
(1.78 %)		 20,268
(1.16 %)		 n/a 40.95
(99.70 %)		 10
(0.30 %)		 33
(100.00 %)		 5,201,908
(53.67 %)		 980,696
(9.42 %)		 15,105,351
(41.63 %)		 41,454
(1.11 %)
52 Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 primary hap 2022)
GCA_024803745.1		 n/a 17,791
(1.12 %)		 22,667
(1.29 %)		 n/a 41.66
(100.00 %)		 106
(0.00 %)		 2,898
(100.00 %)		 6,293,452
(41.30 %)		 1,076,688
(17.94 %)		 8,553,272
(57.13 %)		 31,102
(1.31 %)
53 Botta's pocket gopher (hap2 2023)
GCA_031878665.1		 n/a 17,612
(1.68 %)		 22,099
(1.91 %)		 n/a 41.23
(99.99 %)		 541
(0.01 %)		 365
(100.00 %)		 2,748,918
(17.16 %)		 827,542
(4.51 %)		 8,832,809
(39.20 %)		 26,416
(1.35 %)
54 boutu (hap2 2024)
GCA_036417475.1		 n/a 17,954
(1.51 %)		 19,994
(1.30 %)		 n/a 42.02
(100.00 %)		 240
(0.00 %)		 800
(100.00 %)		 3,723,164
(34.96 %)		 809,880
(11.02 %)		 11,359,211
(41.42 %)		 60,067
(1.55 %)
55 bowfin (hap2 2024)
GCA_036365475.1		 n/a 13,813
(1.89 %)		 27,088
(4.55 %)		 n/a 40.60
(100.00 %)		 80
(0.00 %)		 297
(100.00 %)		 886,999
(13.24 %)		 358,077
(7.37 %)		 4,625,277
(36.22 %)		 43,764
(2.79 %)
56 Brauer's lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_963281105.1		 n/a 17,999
(1.60 %)		 76,655
(5.58 %)		 n/a 42.04
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 10,799
(100.00 %)		 5,994,257
(39.29 %)		 1,126,685
(10.35 %)		 6,996,991
(46.02 %)		 71,016
(3.36 %)
57 Brazilian merganser (hap2 2024)
GCA_036850655.1		 n/a 12,578
(1.76 %)		 23,066
(2.06 %)		 n/a 42.87
(100.00 %)		 244
(0.00 %)		 720
(100.00 %)		 773,452
(7.75 %)		 522,491
(10.88 %)		 5,592,104
(31.80 %)		 33,981
(4.60 %)
58 Brown anole (rAnoSag1 2024)
GCA_037176775.1		 n/a 12,479
(1.04 %)		 16,886
(1.81 %)		 n/a 41.00
(100.00 %)		 172
(0.00 %)		 41
(100.00 %)		 1,249,920
(6.94 %)		 941,401
(5.42 %)		 8,402,482
(44.77 %)		 37,299
(1.02 %)
59 budgerigar (paternal)
GCA_012275275.1		 n/a 13,127
(1.94 %)		 22,492
(2.30 %)		 n/a 41.84
(98.98 %)		 737
(1.02 %)		 330
(100.00 %)		 505,478
(9.66 %)		 231,633
(2.15 %)		 5,778,405
(20.30 %)		 20,205
(1.61 %)
60 butterfish (fScaArg1 alternate hap 2021)
GCA_020382915.1		 n/a 15,228
(3.42 %)		 41,322
(7.36 %)		 n/a 41.47
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 1,592
(100.00 %)		 972,098
(18.43 %)		 155,031
(1.41 %)		 3,452,400
(21.36 %)		 15,255
(1.12 %)
61 California sea lion (mZalCal1 alternate hap 2020)
GCA_009762295.2		 n/a 18,319
(1.81 %)		 18,772
(1.48 %)		 n/a 41.58
(100.00 %)		 n/a 3,096
(100.00 %)		 3,724,021
(42.91 %)		 488,356
(1.26 %)		 10,891,276
(33.15 %)		 44,467
(1.57 %)
62 Canada lynx (LIC74 v2 alternate hap 2020)
GCA_007474575.2		 n/a 12,041
(1.42 %)		 15,226
(1.16 %)		 n/a 41.46
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 15,046
(100.00 %)		 2,939,291
(43.50 %)		 544,849
(1.76 %)		 7,650,345
(32.74 %)		 39,099
(2.44 %)
63 Caribbean electric ray (hap1 2024)
GCA_036971445.1		 n/a 11,967
(0.44 %)		 20,851
(1.23 %)		 n/a 43.35
(99.99 %)		 1,443
(0.01 %)		 596
(100.00 %)		 4,902,656
(34.96 %)		 1,040,893
(17.82 %)		 16,403,253
(54.79 %)		 113,936
(1.69 %)
64 carmine bee-eater
GCA_009819585.1		 n/a 12,381
(1.76 %)		 28,865
(2.78 %)		 n/a 43.05
(100.00 %)		 n/a 3,296
(100.00 %)		 542,765
(7.77 %)		 204,389
(1.06 %)		 6,415,832
(21.53 %)		 31,638
(2.54 %)
65 channel bull blenny
GCA_900634435.1		 n/a 15,980
(2.79 %)		 53,680
(6.62 %)		 n/a 40.96
(100.00 %)		 10
(0.00 %)		 11,565
(100.00 %)		 451,656
(4.76 %)		 321,158
(5.51 %)		 3,800,099
(26.83 %)		 20,338
(1.21 %)
66 chevron butterflyfish (hap2 2024)
GCA_039877575.1		 n/a 15,116
(2.91 %)		 47,839
(7.01 %)		 n/a 42.73
(100.00 %)		 43
(0.00 %)		 71
(100.00 %)		 463,848
(3.80 %)		 254,561
(4.23 %)		 3,654,295
(24.08 %)		 30,593
(1.99 %)
67 chicken (Cobb bGalGal5 alternate hap 2022)
GCA_027408205.1		 n/a 11,740
(2.36 %)		 21,473
(2.56 %)		 n/a 42.25
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 2,263
(100.00 %)		 551,116
(10.78 %)		 241,638
(4.43 %)		 4,973,260
(21.77 %)		 21,151
(2.71 %)
68 chicken (Cobb bGalGal5 primary hap 2022)
GCA_027408225.1		 n/a 13,037
(2.20 %)		 23,550
(2.37 %)		 n/a 42.31
(99.81 %)		 460
(0.19 %)		 252
(100.00 %)		 681,166
(12.04 %)		 381,093
(7.09 %)		 5,610,806
(24.65 %)		 25,664
(2.75 %)
69 chicken (Huxu 2023)
GCA_024206055.2		 n/a 13,405
(2.26 %)		 24,435
(2.45 %)		 n/a 42.64
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 41
(100.00 %)		 704,190
(12.54 %)		 502,701
(5.74 %)		 5,731,097
(23.50 %)		 27,781
(2.90 %)
70 chicken (matHap)
GCF_016699485.2		 74,716
(9.14 %)		 13,128
(2.33 %)		 23,484
(2.48 %)		 72,013
(9.34 %)		 42.20
(99.68 %)		 463
(0.32 %)		 677
(99.68 %)		 697,827
(12.53 %)		 290,892
(2.63 %)		 5,887,021
(21.30 %)		 24,469
(2.59 %)
71 chicken (Ross bGalGal4 alternate hap 2022)
GCA_027408255.1		 n/a 11,339
(2.33 %)		 20,588
(2.51 %)		 n/a 42.16
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,684
(100.00 %)		 537,847
(10.84 %)		 217,964
(3.81 %)		 4,879,985
(21.43 %)		 19,653
(2.66 %)
72 chicken (Ross bGalGal4 primary hap 2023)
GCA_027557775.1		 n/a 12,855
(2.22 %)		 23,147
(2.37 %)		 n/a 42.15
(99.74 %)		 566
(0.26 %)		 246
(100.00 %)		 672,973
(12.00 %)		 342,156
(6.53 %)		 5,690,712
(23.98 %)		 24,413
(2.63 %)
73 chimpanzee (v2 AG18354 alternate hap 2024)
GCA_028858805.2		 n/a 19,981
(1.80 %)		 20,886
(1.18 %)		 n/a 40.63
(99.83 %)		 5
(0.17 %)		 23
(100.00 %)		 5,080,229
(48.83 %)		 937,411
(11.36 %)		 14,905,102
(42.22 %)		 46,330
(1.11 %)
74 Chinese pangolin (hap2 mManPen7 2023)
GCA_030020945.1		 n/a 18,538
(1.34 %)		 21,724
(1.27 %)		 n/a 41.09
(99.48 %)		 190
(0.52 %)		 700
(100.00 %)		 3,362,899
(34.48 %)		 678,384
(4.11 %)		 12,024,241
(39.52 %)		 48,960
(1.19 %)
75 chub mackerel (fScoJap1 alternate hap 2022)
GCA_027409835.1		 n/a 15,165
(2.44 %)		 46,105
(6.16 %)		 n/a 39.93
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,163
(100.00 %)		 1,546,066
(27.08 %)		 537,737
(9.87 %)		 4,485,153
(30.70 %)		 14,774
(0.81 %)
76 climbing perch
GCA_900650485.1		 n/a 14,940
(3.51 %)		 39,688
(7.41 %)		 n/a 40.40
(99.61 %)		 36
(0.39 %)		 2,641
(100.00 %)		 307,993
(2.63 %)		 121,935
(1.79 %)		 3,190,928
(20.98 %)		 10,131
(0.86 %)
77 clouded leopard (mNeoNeb1 alternate hap 2023)
GCA_028018655.1		 n/a 16,430
(1.52 %)		 21,057
(1.44 %)		 n/a 41.79
(100.00 %)		 n/a 10,377
(100.00 %)		 3,845,437
(33.39 %)		 794,587
(2.14 %)		 10,765,695
(33.40 %)		 56,375
(2.45 %)
78 common blue-tongued skink (hap1 2024)
GCA_035046495.1		 n/a 13,999
(1.21 %)		 18,145
(2.02 %)		 n/a 44.85
(100.00 %)		 286
(0.00 %)		 827
(100.00 %)		 844,126
(6.57 %)		 462,086
(2.56 %)		 8,237,807
(37.72 %)		 30,098
(0.96 %)
79 common bottlenose dolphin (paternal 2020)
GCA_011762515.1		 n/a 18,537
(1.77 %)		 20,619
(1.44 %)		 n/a 41.42
(98.08 %)		 868
(1.92 %)		 1,166
(100.00 %)		 3,997,801
(45.93 %)		 609,838
(1.85 %)		 12,400,272
(34.53 %)		 64,630
(1.84 %)
80 common brushtail (alternate hap 2020)
GCA_011100645.1		 n/a 14,863
(0.75 %)		 15,426
(0.89 %)		 n/a 39.41
(100.00 %)		 313
(0.00 %)		 12,446
(100.00 %)		 5,846,769
(38.56 %)		 987,917
(1.99 %)		 16,764,356
(40.14 %)		 13,303
(0.35 %)
81 common buzzard (bButBut1.hap2.1 2024)
GCA_964188375.1		 n/a 13,593
(1.72 %)		 24,541
(2.09 %)		 n/a 43.49
(99.99 %)		 471
(0.01 %)		 929
(99.99 %)		 439,011
(4.19 %)		 247,629
(8.40 %)		 6,711,875
(25.06 %)		 49,141
(4.61 %)
82 common cuckoo (bCucCan1 alternate hap 2021)
GCA_017976305.1		 n/a 12,464
(1.91 %)		 24,623
(2.50 %)		 n/a 42.28
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 1,004
(100.00 %)		 505,582
(10.93 %)		 292,484
(2.48 %)		 6,061,828
(21.38 %)		 24,010
(1.80 %)
83 common frog (alternate hap 2021)
GCA_905171725.1		 n/a 13,073
(0.44 %)		 43,036
(1.95 %)		 n/a 44.07
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 12,033
(100.00 %)		 1,489,788
(2.18 %)		 2,621,157
(9.04 %)		 17,154,926
(55.44 %)		 581,115
(7.68 %)
84 common moorhen (bGalChl1.hap2.1 2024)
GCA_964237395.1		 n/a 12,745
(1.75 %)		 23,052
(2.18 %)		 n/a 43.90
(99.99 %)		 536
(0.01 %)		 931
(99.99 %)		 483,812
(5.59 %)		 210,131
(3.30 %)		 6,332,994
(22.33 %)		 26,285
(2.20 %)
85 common myna (bArcTri1 alternate hap 2023)
GCA_027559525.1		 n/a 10,692
(1.77 %)		 20,925
(2.29 %)		 n/a 42.15
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,221
(100.00 %)		 328,602
(4.16 %)		 604,057
(8.02 %)		 5,233,128
(25.06 %)		 25,210
(3.70 %)
86 common pipistrelle (alternate hap 2020)
GCA_903992515.1		 n/a 15,974
(1.72 %)		 20,563
(1.66 %)		 n/a 42.41
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 10,459
(100.00 %)		 2,634,333
(23.76 %)		 703,674
(2.65 %)		 8,909,525
(33.95 %)		 50,430
(2.54 %)
87 common pochard (bAytFer1.hap2.1 2024)
GCA_964211795.1		 n/a 12,828
(1.96 %)		 23,534
(2.35 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 405
(0.01 %)		 767
(99.99 %)		 725,169
(7.34 %)		 472,156
(5.81 %)		 5,786,296
(25.35 %)		 30,917
(2.80 %)
88 common sole (alternate hap 2023)
GCA_958295035.1		 n/a 14,904
(2.99 %)		 43,194
(7.09 %)		 n/a 40.77
(100.00 %)		 n/a 1,318
(100.00 %)		 1,128,080
(18.77 %)		 328,975
(8.35 %)		 3,952,898
(31.64 %)		 26,979
(2.08 %)
89 common swift (bApuApu2 alternate hap 2021)
GCA_020740585.1		 n/a 11,653
(1.89 %)		 19,731
(2.20 %)		 n/a 42.01
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 1,697
(100.00 %)		 443,384
(6.09 %)		 185,968
(1.18 %)		 5,916,553
(20.88 %)		 18,864
(1.75 %)
90 common tern
GCA_009819645.1		 n/a 12,773
(1.79 %)		 24,751
(2.23 %)		 n/a 43.24
(100.00 %)		 n/a 2,235
(100.00 %)		 549,460
(7.58 %)		 204,051
(1.02 %)		 6,880,566
(20.70 %)		 47,352
(3.95 %)
91 common toad (alternate hap 2021)
GCA_905171715.1		 n/a 12,074
(0.39 %)		 46,329
(1.82 %)		 n/a 44.48
(99.99 %)		 156
(0.01 %)		 24,351
(99.99 %)		 1,186,360
(1.65 %)		 2,279,941
(13.33 %)		 14,665,548
(61.48 %)		 405,097
(4.49 %)
92 common vampire bat (HL8 alternate hap 2022)
GCA_022682395.1		 n/a 17,520
(1.75 %)		 18,995
(1.67 %)		 n/a 42.89
(99.99 %)		 580
(0.01 %)		 430
(100.00 %)		 2,597,497
(28.17 %)		 356,620
(2.88 %)		 10,797,225
(31.23 %)		 61,931
(2.30 %)
93 common vampire bat (HL8 alternate hap 2022)
GCA_022682395.2		 n/a 17,485
(1.76 %)		 18,907
(1.66 %)		 n/a 42.87
(99.99 %)		 576
(0.01 %)		 429
(100.00 %)		 2,592,246
(28.20 %)		 352,985
(2.87 %)		 10,737,944
(31.11 %)		 61,125
(2.28 %)
94 common wall lizard (hap2 2024)
GCA_964188365.1		 n/a 13,838
(1.39 %)		 19,262
(2.35 %)		 n/a 44.17
(99.99 %)		 734
(0.01 %)		 825
(99.99 %)		 815,808
(4.07 %)		 494,366
(4.53 %)		 6,739,651
(37.84 %)		 113,458
(3.63 %)
95 common whitefish (fCorLav1.hap2.1 2024)
GCA_964263835.1		 n/a 25,968
(1.48 %)		 104,922
(4.18 %)		 n/a 43.67
(99.96 %)		 4,689
(0.04 %)		 8,669
(99.96 %)		 1,320,339
(4.08 %)		 1,364,334
(15.61 %)		 7,674,742
(61.10 %)		 94,019
(3.82 %)
96 common yellowthroat
GCA_009764545.1		 n/a 10,611
(1.77 %)		 21,125
(2.21 %)		 n/a 41.77
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 4,976
(100.00 %)		 422,889
(5.99 %)		 294,928
(2.71 %)		 5,928,421
(19.76 %)		 21,397
(1.91 %)
97 convict blenny (fPhoLeu1 alternate hap 2021)
GCA_020510965.1		 n/a 5,231
(0.27 %)		 47,644
(1.48 %)		 n/a 44.62
(99.99 %)		 144
(0.01 %)		 21,561
(99.99 %)		 2,803,873
(49.20 %)		 655,416
(2.69 %)		 7,558,550
(67.05 %)		 181,626
(10.52 %)
98 copperband butterflyfish (fCheRos1 alternate hap 2021)
GCA_017976315.1		 n/a 13,622
(2.81 %)		 43,285
(6.93 %)		 n/a 42.59
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,125
(100.00 %)		 1,741,373
(32.89 %)		 182,926
(2.01 %)		 3,659,106
(21.68 %)		 27,693
(1.89 %)
99 corroboree frog (hap1 2023)
GCA_028390055.1		 n/a 14,955
(0.23 %)		 n/a n/a 45.61
(99.80 %)		 2,431
(0.20 %)		 5,958
(99.80 %)		 20,007,151
(76.28 %)		 5,951,819
(19.40 %)		 5,958
(99.80 %)		 991,009
(4.86 %)
100 Cory's shearwater (bCalBor7.hap2.1 2024)
GCA_964196065.1		 n/a 12,750
(1.85 %)		 23,191
(2.16 %)		 n/a 43.03
(99.99 %)		 477
(0.01 %)		 726
(99.99 %)		 403,846
(4.59 %)		 252,125
(3.30 %)		 6,206,493
(22.07 %)		 41,821
(4.50 %)
101 Cretan wall lizard (alternate hap 2023)
GCA_951804955.1		 n/a 13,192
(1.36 %)		 19,293
(2.32 %)		 n/a 43.88
(100.00 %)		 n/a 1,936
(100.00 %)		 808,341
(4.31 %)		 467,532
(2.91 %)		 6,418,809
(38.02 %)		 107,080
(3.15 %)
102 crucian carp (alternate hap 2023)
GCA_963082795.1		 n/a 4,509
(3.03 %)		 16,936
(7.22 %)		 n/a 38.67
(100.00 %)		 n/a 3,713
(100.00 %)		 430,197
(46.38 %)		 101,926
(7.54 %)		 1,077,239
(32.21 %)		 10,612
(4.11 %)
103 cuckoo roller (hap1 2023)
GCA_034619455.1		 n/a 13,157
(1.67 %)		 30,413
(2.59 %)		 n/a 43.53
(100.00 %)		 290
(0.00 %)		 353
(100.00 %)		 609,076
(8.83 %)		 331,584
(6.01 %)		 5,966,458
(23.99 %)		 45,694
(7.05 %)
104 cunner (fTauAds1 alternate hap 2021)
GCA_020745675.1		 n/a 14,861
(2.74 %)		 42,996
(6.34 %)		 n/a 41.31
(99.99 %)		 31
(0.01 %)		 1,476
(100.00 %)		 1,373,727
(30.17 %)		 220,572
(4.38 %)		 4,176,936
(27.32 %)		 17,129
(1.04 %)
105 Dalmatian pelican (alternate hap 2023)
GCA_030449815.1		 n/a 12,766
(1.68 %)		 26,055
(2.18 %)		 n/a 43.44
(100.00 %)		 n/a 7,284
(100.00 %)		 607,561
(13.23 %)		 239,649
(4.41 %)		 6,086,519
(23.21 %)		 38,398
(5.49 %)
106 Daubenton's bat (alternate hap 2023)
GCA_963242275.1		 n/a 18,895
(1.78 %)		 24,235
(1.81 %)		 n/a 43.39
(100.00 %)		 n/a 4,930
(100.00 %)		 2,813,870
(23.75 %)		 718,406
(5.18 %)		 9,977,320
(37.24 %)		 62,910
(2.66 %)
107 denticle herring
GCA_900700345.2		 n/a 14,119
(3.95 %)		 47,988
(8.57 %)		 n/a 43.51
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 1,972
(100.00 %)		 312,660
(2.77 %)		 160,575
(2.83 %)		 2,525,528
(27.70 %)		 50,830
(8.72 %)
108 diamondback terrapin (hap2 rMalTer1 2023)
GCA_027887205.1		 n/a 15,081
(1.08 %)		 19,115
(1.62 %)		 n/a 44.46
(99.98 %)		 127
(0.02 %)		 59
(100.00 %)		 4,093,707
(46.36 %)		 404,046
(1.70 %)		 11,113,266
(33.78 %)		 111,129
(2.68 %)
109 Domestic goose (bAnsAns1.hap2.1 2024)
GCA_964211785.1		 n/a 12,473
(1.84 %)		 22,849
(2.21 %)		 n/a 43.41
(99.99 %)		 754
(0.01 %)		 1,135
(99.99 %)		 594,136
(5.06 %)		 375,813
(7.54 %)		 5,497,978
(26.76 %)		 39,164
(4.55 %)
110 dorado (hap1 2023)
GCA_030448965.1		 n/a 16,788
(2.12 %)		 50,338
(4.68 %)		 n/a 41.27
(98.12 %)		 641
(1.88 %)		 182
(100.00 %)		 2,709,759
(34.74 %)		 798,364
(14.84 %)		 5,418,190
(36.02 %)		 30,055
(1.31 %)
111 Downy woodpecker (bDryPub1 alternate hap 2020)
GCA_014839825.1		 n/a 11,732
(1.74 %)		 22,080
(2.25 %)		 n/a 45.44
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 1,342
(100.00 %)		 921,959
(20.95 %)		 334,804
(3.26 %)		 5,352,773
(31.27 %)		 24,105
(1.81 %)
112 dugong (hap2 mDugDug1 2023)
GCA_030020955.1		 n/a 18,538
(1.23 %)		 20,775
(1.09 %)		 n/a 40.64
(100.00 %)		 89
(0.00 %)		 167
(100.00 %)		 4,455,227
(33.01 %)		 444,021
(1.73 %)		 14,946,847
(47.37 %)		 29,828
(0.79 %)
113 East African grey crowned-crane
GCA_011004865.1		 n/a 11,799
(1.88 %)		 22,122
(2.30 %)		 n/a 42.41
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 971
(100.00 %)		 457,930
(6.40 %)		 150,544
(0.85 %)		 6,074,490
(20.16 %)		 33,323
(3.81 %)
114 eastern narrow-mouthed toad (hap2 2023)
GCA_027917415.1		 n/a 13,632
(0.43 %)		 35,630
(1.52 %)		 n/a 46.77
(99.99 %)		 1,773
(0.01 %)		 590
(100.00 %)		 1,759,193
(1.98 %)		 2,013,186
(16.21 %)		 16,138,898
(60.55 %)		 614,432
(5.85 %)
115 electric eel (fEleEle1 alternate hap 2020)
GCA_013347915.1		 n/a 12,020
(3.63 %)		 38,881
(7.31 %)		 n/a 42.77
(100.00 %)		 n/a 2,629
(100.00 %)		 429,509
(7.66 %)		 432,260
(11.41 %)		 2,049,609
(24.32 %)		 35,597
(4.37 %)
116 emu (hap2 2024)
GCA_036417515.1		 n/a 12,839
(1.57 %)		 24,113
(1.98 %)		 n/a 44.40
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 242
(100.00 %)		 657,460
(14.23 %)		 397,600
(8.84 %)		 4,824,789
(26.94 %)		 48,081
(7.49 %)
117 epaulette shark (alternate hap sHemOce1 2021)
GCA_020745765.1		 n/a 12,650
(0.38 %)		 20,614
(1.06 %)		 n/a 42.75
(97.99 %)		 3,552
(2.01 %)		 4,000
(100.00 %)		 9,489,793
(70.34 %)		 976,827
(6.97 %)		 21,183,330
(44.32 %)		 42,917
(1.08 %)
118 ermine (alternate hap 2020)
GCA_009829165.1		 n/a 13,583
(1.65 %)		 15,403
(1.46 %)		 n/a 41.72
(100.00 %)		 n/a 3,327
(100.00 %)		 3,139,035
(40.57 %)		 480,111
(1.29 %)		 9,106,061
(31.93 %)		 39,139
(2.25 %)
119 Eurasian badger (2021)
GCA_922990625.1		 n/a 19,332
(1.42 %)		 22,424
(1.40 %)		 n/a 42.47
(100.00 %)		 27
(0.00 %)		 726
(100.00 %)		 4,362,536
(31.74 %)		 801,232
(4.02 %)		 13,893,672
(37.73 %)		 65,806
(4.13 %)
120 Eurasian badger (v3.2 2022)
GCA_922984935.2		 n/a 19,268
(1.40 %)		 22,121
(1.36 %)		 41,043
(1.93 %)		 42.48
(100.00 %)		 101
(0.00 %)		 538
(100.00 %)		 4,417,203
(31.72 %)		 821,664
(4.02 %)		 13,814,720
(38.08 %)		 66,524
(3.95 %)
121 Eurasian collared-dove (bStrDea1.hap2.1 2024)
GCA_964273585.1		 n/a 13,051
(1.80 %)		 24,815
(2.25 %)		 n/a 42.33
(99.99 %)		 683
(0.01 %)		 584
(100.00 %)		 482,819
(5.02 %)		 292,761
(7.61 %)		 6,282,928
(25.46 %)		 35,630
(3.58 %)
122 Eurasian curlew (hap2 2024)
GCA_964059295.1		 n/a 12,728
(1.78 %)		 23,645
(2.18 %)		 n/a 43.53
(99.99 %)		 693
(0.01 %)		 1,504
(99.99 %)		 544,959
(6.24 %)		 393,773
(4.49 %)		 5,839,698
(24.52 %)		 35,759
(3.26 %)
123 Eurasian minnow (alternate hap 2023)
GCA_949152275.1		 n/a 17,920
(3.03 %)		 59,697
(6.61 %)		 n/a 39.13
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 4,949
(100.00 %)		 2,285,870
(44.17 %)		 480,649
(10.13 %)		 4,833,803
(39.56 %)		 57,737
(4.15 %)
124 Eurasian nightjar (alternate hap 2021)
GCA_907165095.1		 n/a 12,266
(1.90 %)		 22,091
(2.30 %)		 n/a 41.97
(100.00 %)		 25
(0.00 %)		 2,502
(100.00 %)		 458,278
(5.64 %)		 212,205
(1.54 %)		 6,032,224
(21.16 %)		 21,942
(1.89 %)
125 Eurasian red squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685485.1		 n/a 12,437
(1.51 %)		 12,702
(1.22 %)		 n/a 40.06
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 10,657
(100.00 %)		 2,303,176
(35.38 %)		 353,996
(1.49 %)		 7,218,556
(31.67 %)		 24,268
(1.07 %)
126 Eurasian river otter (alternate hap 2019)
GCA_902653095.1		 n/a 9,910
(1.59 %)		 11,315
(1.31 %)		 n/a 41.85
(100.00 %)		 n/a 8,506
(100.00 %)		 2,052,338
(42.25 %)		 316,084
(1.64 %)		 6,222,460
(33.12 %)		 27,057
(1.96 %)
127 Eurasian water vole (alternate hap 2020)
GCA_903992525.1		 n/a 16,761
(1.66 %)		 19,715
(1.37 %)		 n/a 42.13
(100.00 %)		 105
(0.00 %)		 16,473
(100.00 %)		 3,118,266
(26.44 %)		 829,463
(2.82 %)		 9,700,482
(31.37 %)		 14,146
(0.57 %)
128 European chub (alternate hap 2023)
GCA_949319155.1		 n/a 17,416
(2.74 %)		 60,936
(6.02 %)		 n/a 38.65
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 7,437
(100.00 %)		 2,377,147
(47.98 %)		 578,235
(8.27 %)		 5,267,308
(40.22 %)		 50,909
(3.45 %)
129 European flounder (alternate hap 2023)
GCA_949316195.1		 n/a 14,690
(3.17 %)		 48,422
(7.90 %)		 n/a 42.61
(100.00 %)		 n/a 1,915
(100.00 %)		 1,138,190
(26.31 %)		 249,865
(4.72 %)		 3,352,038
(25.55 %)		 36,828
(3.13 %)
130 European leaf-toed gecko (hap2 2023)
GCA_029931755.1		 n/a 14,220
(1.16 %)		 21,979
(2.19 %)		 n/a 44.64
(99.68 %)		 177
(0.32 %)		 381
(100.00 %)		 1,169,660
(6.57 %)		 432,998
(2.45 %)		 8,403,791
(39.55 %)		 82,695
(2.80 %)
131 European mink (alternate hap 2023)
GCA_030435785.1		 n/a 15,419
(1.50 %)		 21,175
(1.51 %)		 n/a 42.09
(100.00 %)		 n/a 12,043
(100.00 %)		 2,952,218
(30.62 %)		 538,508
(2.18 %)		 9,303,303
(34.20 %)		 47,810
(2.50 %)
132 European mole (hap2 2024)
GCA_964194205.1		 n/a 18,064
(1.69 %)		 19,764
(1.59 %)		 n/a 42.07
(99.99 %)		 1,040
(0.01 %)		 1,396
(99.99 %)		 2,567,492
(23.34 %)		 570,250
(2.16 %)		 10,485,959
(33.56 %)		 46,213
(3.27 %)
133 European plaice (alternate hap 2022)
GCA_947347695.1		 n/a 14,619
(2.94 %)		 50,389
(7.92 %)		 n/a 42.58
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 3,222
(100.00 %)		 430,112
(3.88 %)		 299,581
(6.89 %)		 3,182,258
(27.97 %)		 40,094
(3.66 %)
134 European pond turtle (hap2 rEmyOrb1 2023)
GCA_028017845.1		 n/a 14,971
(1.00 %)		 20,099
(1.61 %)		 n/a 44.79
(99.77 %)		 130
(0.23 %)		 156
(100.00 %)		 1,536,611
(12.44 %)		 471,903
(2.16 %)		 11,129,943
(35.50 %)		 138,047
(2.94 %)
135 European robin (alternate hap 2021)
GCA_903797565.2		 n/a 11,359
(1.98 %)		 21,437
(2.45 %)		 n/a 41.70
(100.00 %)		 18
(0.00 %)		 3,668
(100.00 %)		 346,477
(2.88 %)		 283,542
(2.49 %)		 5,597,130
(19.71 %)		 22,977
(2.32 %)
136 European shag (alternate hap 2023)
GCA_949628205.1		 n/a 11,681
(1.64 %)		 22,195
(2.04 %)		 n/a 43.00
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 9,752
(100.00 %)		 363,092
(4.61 %)		 347,630
(2.63 %)		 5,664,392
(21.56 %)		 32,162
(3.60 %)
137 European shrew (alternate hap 2023)
GCA_027595995.1		 n/a 17,506
(1.26 %)		 25,527
(1.52 %)		 n/a 43.20
(100.00 %)		 n/a 5,699
(100.00 %)		 2,400,784
(15.19 %)		 1,062,793
(3.20 %)		 13,284,496
(41.93 %)		 77,009
(2.86 %)
138 European snow vole (alternate hap 2023)
GCA_950005115.1		 n/a 18,364
(1.79 %)		 20,379
(1.63 %)		 n/a 42.19
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 4,256
(100.00 %)		 3,049,618
(22.22 %)		 852,708
(4.50 %)		 10,501,392
(33.34 %)		 17,629
(0.60 %)
139 European starfish
GCA_902459445.1		 n/a 3,860
(0.82 %)		 23,866
(8.36 %)		 n/a 38.77
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 3,969
(100.00 %)		 123,986
(1.40 %)		 146,247
(6.44 %)		 2,404,792
(37.16 %)		 14,304
(1.48 %)
140 European turtle dove (v1.2 alternate hap 2021)
GCA_901699165.2		 n/a 11,276
(1.79 %)		 21,210
(2.15 %)		 n/a 41.73
(100.00 %)		 n/a 3,334
(100.00 %)		 426,785
(4.89 %)		 182,446
(0.97 %)		 6,038,491
(20.24 %)		 29,692
(2.35 %)
141 European woodmouse (alternate hap 2022)
GCA_947179525.1		 n/a 18,692
(1.72 %)		 22,021
(1.36 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 10,863
(100.00 %)		 4,055,957
(36.08 %)		 1,513,576
(9.53 %)		 11,306,811
(39.67 %)		 20,865
(0.55 %)
142 Eurpoean golden plover (bPluApr1 alternate hap 2021)
GCA_017639475.1		 n/a 11,836
(1.83 %)		 21,119
(2.12 %)		 n/a 42.78
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 1,147
(100.00 %)		 443,887
(6.00 %)		 149,233
(0.76 %)		 6,328,128
(20.72 %)		 37,413
(3.59 %)
143 false killer whale (hap2 2024)
GCA_039906525.1		 n/a 17,866
(1.45 %)		 21,079
(1.46 %)		 n/a 42.37
(99.08 %)		 133
(0.92 %)		 416
(100.00 %)		 3,852,502
(34.98 %)		 1,112,185
(16.42 %)		 11,435,533
(44.17 %)		 75,215
(4.36 %)
144 Filfola wall lizard (rPodFil1.hap2.1 2024)
GCA_964270875.1		 n/a 13,804
(1.42 %)		 19,450
(2.39 %)		 n/a 43.73
(99.99 %)		 795
(0.01 %)		 937
(99.99 %)		 782,998
(3.95 %)		 448,089
(3.61 %)		 6,735,032
(36.83 %)		 81,312
(2.54 %)
145 fire-bellied toad (aBomBom1 alternate hap 2023)
GCA_027579415.1		 n/a 2,936
(0.15 %)		 17,722
(1.38 %)		 n/a 38.51
(100.00 %)		 n/a 13,751
(100.00 %)		 919,882
(3.50 %)		 1,443,294
(10.50 %)		 7,705,012
(57.28 %)		 74,669
(1.25 %)
146 Fleay's barred frog (hap2 2024)
GCA_038048865.1		 n/a 14,224
(0.69 %)		 22,406
(1.57 %)		 n/a 40.75
(99.89 %)		 1,383
(0.12 %)		 914
(100.00 %)		 1,300,452
(3.37 %)		 1,495,355
(10.56 %)		 13,385,401
(44.67 %)		 64,121
(0.88 %)
147 flier cichlid
GCA_007364235.1		 n/a 17,494
(2.06 %)		 62,257
(5.73 %)		 n/a 41.17
(99.98 %)		 13
(0.02 %)		 9,305
(99.98 %)		 1,140,986
(16.60 %)		 316,083
(2.17 %)		 6,036,560
(30.48 %)		 26,445
(1.22 %)
148 Florida worm lizard (hap1 rRhiFlo1 2023)
GCA_030035715.1		 n/a 14,392
(0.90 %)		 17,909
(1.50 %)		 n/a 42.86
(99.84 %)		 213
(0.16 %)		 836
(99.84 %)		 1,440,070
(7.19 %)		 620,131
(2.54 %)		 10,919,950
(45.21 %)		 47,933
(1.03 %)
149 freshwater garfish (fXenCan1 alternate hap 2020)
GCA_014839645.1		 n/a 13,745
(2.58 %)		 50,416
(6.72 %)		 n/a 41.33
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 5,171
(100.00 %)		 442,646
(4.09 %)		 276,927
(5.42 %)		 3,741,267
(26.25 %)		 28,827
(2.28 %)
150 Gaboon caecilian
GCA_902459495.1		 n/a 12,821
(0.47 %)		 30,612
(1.44 %)		 n/a 43.23
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 9,651
(100.00 %)		 1,139,595
(1.64 %)		 1,170,215
(3.77 %)		 17,091,511
(52.44 %)		 235,170
(4.50 %)
151 garden warbler (bSylBor1 alternate hap 2020)
GCA_014839765.1		 n/a 12,359
(1.95 %)		 23,228
(2.46 %)		 n/a 41.98
(100.00 %)		 n/a 775
(100.00 %)		 485,213
(6.08 %)		 333,505
(2.21 %)		 6,358,327
(19.87 %)		 26,594
(2.34 %)
152 Gharial (hap1 2023)
GCA_030020385.1		 n/a 14,254
(0.94 %)		 23,016
(2.00 %)		 n/a 45.13
(99.95 %)		 61
(0.05 %)		 298
(100.00 %)		 1,230,357
(13.08 %)		 350,230
(2.85 %)		 11,854,314
(33.03 %)		 39,919
(1.95 %)
153 giant manta (sMobBir1 2023)
GCA_030035685.1		 n/a 12,198
(0.42 %)		 23,127
(1.17 %)		 n/a 42.85
(98.49 %)		 1,742
(1.51 %)		 1,558
(100.00 %)		 7,431,472
(52.41 %)		 716,951
(7.28 %)		 19,456,793
(50.99 %)		 91,414
(1.45 %)
154 gilthead seabream
GCA_900880695.1		 n/a 13,090
(2.37 %)		 48,927
(6.41 %)		 n/a 41.97
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 7,241
(100.00 %)		 422,758
(2.89 %)		 231,452
(2.54 %)		 3,818,141
(24.36 %)		 38,368
(2.40 %)
155 golden eagle (v1.4 alternate hap 2021)
GCA_902153765.2		 n/a 9,172
(1.85 %)		 16,917
(2.12 %)		 n/a 42.48
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 3,855
(100.00 %)		 377,153
(8.49 %)		 117,959
(0.78 %)		 4,418,970
(18.34 %)		 27,767
(3.57 %)
156 Goodes thornscrub tortoise
GCA_007399395.1		 n/a 13,359
(0.95 %)		 19,347
(1.51 %)		 n/a 44.27
(100.00 %)		 n/a 8,736
(100.00 %)		 1,404,513
(13.79 %)		 334,726
(2.35 %)		 9,735,007
(33.33 %)		 61,680
(2.32 %)
157 Grand Cayman blue iguana (hap2 2023)
GCA_030412085.1		 n/a 13,758
(1.02 %)		 16,909
(1.62 %)		 n/a 41.53
(99.01 %)		 19
(0.99 %)		 52
(99.01 %)		 1,069,189
(6.12 %)		 410,262
(1.25 %)		 11,390,195
(32.28 %)		 60,835
(1.92 %)
158 gray short-tailed opossum (mMonDom1 alternate hap 2023)
GCA_027917375.1		 n/a 12,662
(0.70 %)		 15,124
(0.89 %)		 n/a 37.74
(100.00 %)		 24
(0.00 %)		 8,086
(100.00 %)		 4,098,004
(25.33 %)		 806,470
(2.98 %)		 16,244,072
(43.39 %)		 24,879
(0.67 %)
159 gray squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685475.1		 n/a 17,156
(1.53 %)		 18,190
(1.33 %)		 n/a 40.25
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 9,510
(100.00 %)		 3,455,580
(34.94 %)		 530,053
(1.56 %)		 10,927,458
(32.64 %)		 38,976
(1.13 %)
160 gray wolf (alternate hap 2021)
GCA_905319845.1		 n/a 12,760
(1.57 %)		 14,423
(1.42 %)		 n/a 41.35
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,537
(100.00 %)		 2,725,227
(31.66 %)		 616,862
(3.40 %)		 8,041,744
(32.68 %)		 32,293
(2.35 %)
161 great fruit-eating bat (mArtLit1hap2 2024)
GCA_038363175.2		 n/a 16,978
(1.61 %)		 18,544
(1.54 %)		 n/a 42.42
(100.00 %)		 54
(0.00 %)		 312
(100.00 %)		 2,601,985
(26.67 %)		 331,187
(4.87 %)		 10,884,729
(33.93 %)		 63,610
(2.71 %)
162 great potoo (bNycGra1 alternate hap 2020)
GCA_013368595.1		 n/a 11,630
(1.85 %)		 20,866
(2.20 %)		 n/a 42.73
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 1,395
(100.00 %)		 421,187
(9.08 %)		 159,172
(0.96 %)		 5,602,689
(22.75 %)		 29,548
(2.77 %)
163 great white shark (alternate hap 2021)
GCA_017639455.1		 n/a 20
(0.30 %)		 63
(2.06 %)		 n/a 45.02
(99.98 %)		 28
(0.02 %)		 39
(100.00 %)		 8,165
(60.43 %)		 2,740
(27.09 %)		 15,863
(31.63 %)		 167
(5.51 %)
164 greater argentine (alternate hap 2023)
GCA_951799415.1		 n/a 15,483
(3.45 %)		 47,484
(7.95 %)		 n/a 44.71
(100.00 %)		 n/a 4,805
(100.00 %)		 1,400,150
(23.78 %)		 738,163
(17.35 %)		 2,460,977
(35.90 %)		 20,794
(2.09 %)
165 greater horseshoe bat (MPI-CBG alternate hap 2019)
GCA_004115295.1		 n/a 14,896
(1.85 %)		 18,939
(1.59 %)		 n/a 40.69
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 13,426
(100.00 %)		 2,426,330
(34.43 %)		 418,341
(1.36 %)		 8,763,234
(27.86 %)		 24,370
(1.08 %)
166 greater pipefish
GCA_901709685.1		 n/a 10,795
(5.59 %)		 33,380
(12.07 %)		 n/a 43.29
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 1,848
(100.00 %)		 140,376
(2.96 %)		 81,000
(3.32 %)		 1,318,564
(23.30 %)		 34,104
(12.82 %)
167 greater pipefish (v2 2023 genbank)
GCA_948146105.1		 n/a 13,412
(4.76 %)		 45,946
(11.50 %)		 n/a 44.34
(99.99 %)		 95
(0.01 %)		 251
(100.00 %)		 494,547
(20.10 %)		 204,804
(10.66 %)		 1,444,044
(34.08 %)		 47,904
(17.47 %)
168 greater pipefish (v2 alternate haplotype 2023)
GCA_948146095.1		 n/a 13,681
(4.93 %)		 45,034
(11.64 %)		 n/a 43.88
(100.00 %)		 n/a 4,533
(100.00 %)		 460,038
(18.47 %)		 163,838
(7.90 %)		 1,681,190
(29.08 %)		 47,523
(15.60 %)
169 greater sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_949358355.1		 n/a 13,432
(2.10 %)		 50,930
(6.39 %)		 n/a 41.05
(100.00 %)		 n/a 4,952
(100.00 %)		 2,495,763
(38.80 %)		 473,105
(6.27 %)		 3,444,123
(38.56 %)		 35,298
(1.94 %)
170 green sea turtle (v2 alternate hap 2021)
GCA_015220195.2		 n/a 13,635
(1.05 %)		 19,414
(1.61 %)		 n/a 44.16
(99.95 %)		 60
(0.05 %)		 6,797
(99.95 %)		 3,221,668
(44.97 %)		 275,275
(1.28 %)		 9,802,895
(32.14 %)		 45,469
(1.48 %)
171 grey whale (mEscRob2 alternate hap 2023)
GCA_028021475.1		 n/a 19,129
(1.37 %)		 24,628
(1.24 %)		 n/a 41.83
(100.00 %)		 n/a 14,442
(100.00 %)		 3,892,130
(35.74 %)		 874,864
(15.70 %)		 11,484,916
(45.69 %)		 73,507
(1.72 %)
172 gudgeon (alternate hap 2023)
GCA_949357705.1		 n/a 16,645
(1.92 %)		 62,533
(4.55 %)		 n/a 39.69
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 7,253
(100.00 %)		 5,166,731
(67.78 %)		 750,850
(11.35 %)		 5,903,440
(54.20 %)		 90,235
(5.58 %)
173 gyrfalcon (bFalRus1 alternate hap 2020)
GCA_015220155.1		 n/a 6,534
(1.74 %)		 12,152
(1.97 %)		 n/a 42.70
(100.00 %)		 n/a 8,370
(100.00 %)		 179,674
(3.19 %)		 76,165
(0.79 %)		 2,908,228
(16.85 %)		 11,838
(2.15 %)
174 Harpy eagle (bHarHar1 alternate hap 2022)
GCA_026419925.1		 n/a 11,838
(1.64 %)		 24,014
(2.16 %)		 n/a 43.80
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,969
(100.00 %)		 405,109
(3.51 %)		 220,222
(6.17 %)		 4,708,177
(25.30 %)		 58,446
(5.44 %)
175 Hawaiian crow (bCorHaw1 alternate hap 2021)
GCA_020740675.1		 n/a 7,477
(1.92 %)		 14,094
(2.40 %)		 n/a 43.16
(100.00 %)		 n/a 2,762
(100.00 %)		 296,732
(12.20 %)		 135,408
(4.08 %)		 3,123,655
(20.92 %)		 23,288
(3.74 %)
176 hazel dormouse (alternate hap 2023)
GCA_963383665.1		 n/a 11,130
(1.23 %)		 22,071
(1.36 %)		 n/a 42.15
(99.99 %)		 n/a 31,856
(100.00 %)		 2,958,239
(41.25 %)		 788,242
(4.52 %)		 6,056,268
(41.88 %)		 36,143
(1.96 %)
177 hemichordates Saccoglossus (HW-2024a hap2 2024)
GCA_040954595.1		 n/a 4,919
(1.33 %)		 34,873
(16.02 %)		 n/a 39.72
(99.96 %)		 254
(0.04 %)		 56
(100.00 %)		 84,495
(1.58 %)		 118,073
(13.23 %)		 1,301,514
(28.77 %)		 20,511
(4.03 %)
178 hippopotamus (mHipAmp2 hap1 2023)
GCA_030028035.1		 n/a 20,391
(1.63 %)		 20,668
(1.37 %)		 n/a 41.62
(100.00 %)		 83
(0.00 %)		 545
(100.00 %)		 3,778,764
(35.17 %)		 563,345
(3.63 %)		 13,524,869
(35.56 %)		 48,164
(1.90 %)
179 hoatzin (hap2 2023)
GCA_030867165.1		 n/a 12,349
(1.54 %)		 27,206
(2.21 %)		 n/a 45.91
(100.00 %)		 212
(0.00 %)		 535
(100.00 %)		 529,757
(21.69 %)		 235,999
(14.32 %)		 4,845,810
(31.86 %)		 53,781
(5.77 %)
180 honeycomb rockfish (fSebUmb1 alternate hap 2020)
GCA_015220095.1		 n/a 15,058
(2.50 %)		 46,340
(5.85 %)		 n/a 40.71
(100.00 %)		 21
(0.00 %)		 2,131
(100.00 %)		 1,642,351
(37.42 %)		 389,169
(5.43 %)		 4,687,710
(35.55 %)		 34,408
(1.75 %)
181 horn shark (hap1 2024)
GCA_036365525.1		 n/a 15,006
(0.28 %)		 22,481
(0.80 %)		 n/a 45.05
(99.53 %)		 2,781
(0.47 %)		 2,532
(99.97 %)		 1,344,546
(5.76 %)		 2,364,825
(28.34 %)		 5,088
(99.53 %)		 89,340
(2.10 %)
182 horse (maternal 2024)
GCA_036418255.1		 n/a 16,789
(1.65 %)		 18,017
(1.36 %)		 n/a 42.07
(100.00 %)		 210
(0.00 %)		 821
(100.00 %)		 3,146,381
(34.68 %)		 430,664
(5.91 %)		 13,246,059
(32.62 %)		 37,293
(2.80 %)
183 hourglass treefrog (maternal 2023)
GCA_027789725.1		 n/a 14,359
(0.89 %)		 32,575
(2.67 %)		 n/a 43.88
(95.18 %)		 788
(4.82 %)		 3,358
(95.18 %)		 922,807
(2.38 %)		 1,744,603
(15.45 %)		 10,318,168
(48.47 %)		 244,270
(5.02 %)
184 house finch (bHaeMex1 alternate hap 2022)
GCA_027406555.1		 n/a 12,027
(1.89 %)		 23,973
(2.49 %)		 n/a 43.03
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 1,004
(100.00 %)		 385,230
(3.05 %)		 398,497
(5.70 %)		 5,772,203
(22.69 %)		 28,740
(2.98 %)
185 house mouse (alternate hap 2023)
GCA_949316305.1		 n/a 661
(0.88 %)		 720
(0.54 %)		 n/a 38.59
(100.00 %)		 n/a 1,806
(100.00 %)		 97,279
(72.21 %)		 40,071
(55.89 %)		 208,928
(64.94 %)		 506
(0.31 %)
186 house sparrow (hap2 2024)
GCA_036417895.1		 n/a 12,201
(1.59 %)		 24,721
(2.19 %)		 n/a 44.46
(100.00 %)		 182
(0.00 %)		 482
(100.00 %)		 629,688
(12.73 %)		 644,409
(14.12 %)		 5,103,050
(31.93 %)		 33,424
(2.42 %)
187 human (mHomSap3 WGS:JACSEX01 2021)
GCA_016695395.2		 n/a 20,401
(1.92 %)		 20,682
(1.21 %)		 n/a 40.87
(99.64 %)		 1,217
(0.36 %)		 950
(100.00 %)		 5,350,025
(52.32 %)		 1,006,502
(4.68 %)		 15,969,368
(38.50 %)		 50,826
(1.08 %)
188 human (WGS:JACSEW01 2021 alternate hap)
GCA_016700455.2		 n/a 19,667
(1.95 %)		 20,065
(1.23 %)		 n/a 40.96
(99.60 %)		 1,172
(0.40 %)		 994
(100.00 %)		 5,086,372
(51.37 %)		 932,450
(3.67 %)		 15,152,141
(37.48 %)		 49,325
(1.10 %)
189 Humboldt's penguin (bSphHub1 alternate hap 2022)
GCA_027474345.1		 n/a 11,806
(1.66 %)		 21,429
(1.97 %)		 n/a 43.73
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 4,343
(100.00 %)		 508,803
(10.25 %)		 162,918
(5.44 %)		 6,029,969
(24.67 %)		 27,953
(3.83 %)
190 hybrid cattle (Angus x Brahman F1 Angus haplotype 2018)
GCA_003369685.2		 n/a 19,096
(1.59 %)		 20,674
(1.34 %)		 n/a 41.99
(99.75 %)		 277
(0.25 %)		 1,435
(100.00 %)		 5,290,422
(47.51 %)		 478,946
(1.94 %)		 12,568,313
(41.15 %)		 45,850
(1.37 %)
191 Indian glassy fish
GCA_900651595.1		 n/a 14,412
(3.70 %)		 41,944
(8.58 %)		 n/a 42.27
(99.58 %)		 230
(0.42 %)		 2,242
(100.00 %)		 304,774
(2.86 %)		 140,555
(2.80 %)		 2,689,154
(24.08 %)		 15,419
(1.38 %)
192 Indo-Pacific tarpon (alternate hap 2020)
GCA_013368575.1		 n/a 17,858
(2.43 %)		 32,738
(5.46 %)		 n/a 43.05
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 4,333
(100.00 %)		 583,632
(3.71 %)		 418,411
(3.74 %)		 5,198,155
(21.50 %)		 76,879
(3.71 %)
193 Italian wall lizard (rPodSic1.hap2.1 2024)
GCA_964188395.1		 n/a 13,696
(1.37 %)		 19,278
(2.32 %)		 n/a 44.15
(99.99 %)		 690
(0.01 %)		 842
(99.99 %)		 763,893
(4.21 %)		 451,861
(6.69 %)		 6,696,380
(38.71 %)		 98,815
(3.65 %)
194 jewelled blenny
GCA_902148835.1		 n/a 15,945
(2.17 %)		 101,825
(8.93 %)		 n/a 44.49
(99.63 %)		 9
(0.37 %)		 4,516
(100.00 %)		 744,228
(4.25 %)		 519,896
(5.73 %)		 4,677,160
(28.52 %)		 138,484
(9.55 %)
195 John dory (alternate hap 2023)
GCA_960530785.1		 n/a 14,960
(2.23 %)		 74,436
(6.65 %)		 n/a 43.94
(100.00 %)		 n/a 5,370
(100.00 %)		 1,620,688
(23.00 %)		 902,057
(13.66 %)		 4,547,953
(39.90 %)		 129,990
(12.07 %)
196 kagu (bRhyJub1 alternate hap 2023)
GCA_027595965.1		 n/a 8,732
(1.74 %)		 16,473
(2.17 %)		 n/a 45.10
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,819
(100.00 %)		 314,902
(10.49 %)		 133,061
(10.84 %)		 3,656,435
(25.68 %)		 32,592
(5.25 %)
197 kakapo (Jane alternate hap 2019)
GCA_004011185.1		 n/a 3,256
(1.65 %)		 6,220
(1.98 %)		 n/a 41.74
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 3,728
(100.00 %)		 127,817
(7.83 %)		 53,447
(1.21 %)		 1,502,789
(18.09 %)		 5,487
(1.71 %)
198 killer whale (alternate hap 2022)
GCA_937001455.1		 n/a 14,982
(1.50 %)		 19,185
(1.30 %)		 n/a 42.13
(100.00 %)		 n/a 12,410
(100.00 %)		 2,752,892
(35.61 %)		 589,217
(10.15 %)		 8,371,032
(41.11 %)		 57,347
(3.41 %)
199 king vulture (hap2 2024)
GCA_037950955.1		 n/a 12,764
(1.49 %)		 23,033
(1.77 %)		 n/a 44.67
(100.00 %)		 128
(0.00 %)		 140
(100.00 %)		 432,536
(3.01 %)		 230,315
(20.91 %)		 4,960,923
(35.56 %)		 86,907
(3.76 %)
200 Korean giant-fin mudskipper
GCA_009829135.1		 n/a 13,470
(2.34 %)		 42,799
(5.73 %)		 n/a 40.16
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,799
(100.00 %)		 394,414
(4.41 %)		 509,973
(7.17 %)		 4,581,968
(38.91 %)		 34,522
(2.54 %)
201 lammergeier (bGypBar2 alternate hap 2023)
GCA_028017155.1		 n/a 10,584
(1.75 %)		 19,112
(2.09 %)		 n/a 43.19
(100.00 %)		 n/a 2,892
(100.00 %)		 363,564
(3.53 %)		 235,220
(7.22 %)		 5,072,834
(23.83 %)		 24,909
(2.64 %)
202 lance-tailed manakin
GCA_009829205.1		 n/a 12,282
(1.85 %)		 23,867
(2.36 %)		 n/a 42.20
(100.00 %)		 n/a 4,269
(100.00 %)		 472,384
(7.01 %)		 237,680
(1.65 %)		 6,121,661
(19.48 %)		 25,589
(2.05 %)
203 lanner falcon (bFalBia1 alternate hap 2022)
GCA_023634305.1		 n/a 12,458
(1.70 %)		 22,259
(2.05 %)		 n/a 43.23
(100.00 %)		 n/a 3,090
(100.00 %)		 413,301
(3.46 %)		 189,449
(5.28 %)		 5,962,597
(22.07 %)		 31,611
(2.72 %)
204 large-eye snaggletooth (alternate hap 2023)
GCA_949987545.1		 n/a 15,841
(2.36 %)		 79,276
(8.51 %)		 n/a 46.35
(100.00 %)		 n/a 5,761
(100.00 %)		 2,935,570
(42.17 %)		 1,208,602
(21.28 %)		 3,157,730
(42.63 %)		 88,759
(6.30 %)
205 largescale foureyes (fAnaAna1 alternate hap 2020)
GCA_014839705.1		 n/a 8,132
(2.11 %)		 25,878
(4.67 %)		 n/a 38.55
(100.00 %)		 n/a 5,088
(100.00 %)		 260,789
(2.73 %)		 158,564
(2.12 %)		 3,023,128
(27.39 %)		 9,678
(1.02 %)
206 Lataste's viper (alternate hap 2022)
GCA_024294605.1		 n/a 13,155
(1.15 %)		 22,239
(2.06 %)		 n/a 41.01
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 6,800
(100.00 %)		 1,155,093
(7.75 %)		 707,777
(4.25 %)		 7,071,611
(44.00 %)		 104,556
(4.39 %)
207 leatherback sea turtle (v2 alternate hap 2020)
GCA_009762595.2		 n/a 11,035
(1.05 %)		 16,064
(1.50 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 7
(0.00 %)		 9,006
(100.00 %)		 2,685,200
(47.08 %)		 208,060
(1.19 %)		 7,184,246
(33.31 %)		 25,133
(1.42 %)
208 lesser Egyptian jerboa (alternate hap 2021)
GCA_020740715.1		 n/a 17,777
(1.27 %)		 19,232
(1.28 %)		 n/a 42.13
(92.75 %)		 2,875
(7.25 %)		 508
(100.00 %)		 6,476,967
(33.93 %)		 999,133
(2.78 %)		 11,809,834
(40.52 %)		 29,872
(0.82 %)
209 lesser horseshoe bat (hap2 2024)
GCA_964194215.1		 n/a 18,875
(1.72 %)		 21,166
(1.58 %)		 n/a 41.18
(99.99 %)		 1,648
(0.01 %)		 2,727
(99.99 %)		 3,160,659
(34.00 %)		 696,130
(6.23 %)		 11,662,645
(34.26 %)		 36,176
(1.80 %)
210 lesser kestrel (alternate hap 2021)
GCA_017639645.1		 n/a 12,578
(1.83 %)		 22,257
(2.16 %)		 n/a 42.51
(98.97 %)		 258
(1.03 %)		 551
(100.00 %)		 431,717
(3.61 %)		 201,876
(1.38 %)		 6,620,060
(19.16 %)		 27,552
(2.26 %)
211 lesser noctule (mNycLei1.hap2.1 2024)
GCA_964264895.1		 n/a 17,557
(1.64 %)		 22,484
(1.74 %)		 n/a 43.06
(99.98 %)		 1,563
(0.02 %)		 2,898
(99.98 %)		 2,999,553
(21.19 %)		 1,122,371
(10.04 %)		 9,331,392
(40.02 %)		 61,834
(2.95 %)
212 lesser rhea (bPtePen1 alternate hap 2023)
GCA_028389885.1		 n/a 10,465
(1.71 %)		 19,083
(2.16 %)		 n/a 42.10
(100.00 %)		 n/a 910
(100.00 %)		 520,125
(6.78 %)		 251,547
(4.21 %)		 5,321,207
(21.53 %)		 34,698
(5.69 %)
213 lesser salmon catfish (fNeoGra1 alternate hap 2023)
GCA_027579805.1		 n/a 15,487
(0.88 %)		 85,135
(3.39 %)		 n/a 42.43
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 6,593
(100.00 %)		 5,572,163
(49.59 %)		 1,052,072
(6.02 %)		 7,246,646
(62.69 %)		 157,768
(4.38 %)
214 lesser sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_950004245.1		 n/a 13,792
(2.19 %)		 51,353
(6.60 %)		 n/a 41.16
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 3,620
(100.00 %)		 2,536,362
(38.05 %)		 513,115
(7.50 %)		 3,542,854
(37.60 %)		 31,814
(1.79 %)
215 limp eelpout (alternate hap 2023)
GCA_949748265.1		 n/a 15,033
(2.98 %)		 51,296
(7.68 %)		 n/a 43.01
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 2,700
(100.00 %)		 1,099,919
(28.68 %)		 314,919
(9.57 %)		 2,620,601
(30.23 %)		 49,248
(4.19 %)
216 live sharksucker
GCA_900963505.1		 n/a 14,632
(3.51 %)		 40,441
(7.51 %)		 n/a 41.42
(99.96 %)		 19
(0.04 %)		 1,405
(100.00 %)		 435,742
(3.57 %)		 139,003
(1.51 %)		 3,161,165
(22.06 %)		 16,302
(1.34 %)
217 lizards P.bocagei (rPodBoc1.hap2.1 2024)
GCA_964188325.1		 n/a 13,653
(1.34 %)		 19,764
(2.32 %)		 n/a 44.23
(99.99 %)		 817
(0.01 %)		 1,444
(99.99 %)		 857,503
(4.68 %)		 507,819
(4.16 %)		 6,632,822
(39.41 %)		 103,858
(4.10 %)
218 lizards P.erhardii (rPodErh1.hap2.1 2024)
GCA_964251985.1		 n/a 13,817
(1.35 %)		 21,024
(2.50 %)		 n/a 43.77
(99.99 %)		 811
(0.01 %)		 1,458
(99.99 %)		 890,080
(4.42 %)		 526,749
(3.38 %)		 7,001,691
(37.94 %)		 89,526
(2.96 %)
219 lizards P.melisellensis (rPodMel1.hap2.1 2024)
GCA_964234825.1		 n/a 13,759
(1.39 %)		 19,452
(2.34 %)		 n/a 43.90
(99.99 %)		 754
(0.01 %)		 954
(99.99 %)		 768,595
(5.31 %)		 448,816
(5.54 %)		 6,722,284
(37.88 %)		 82,575
(2.83 %)
220 lizards P.pityusensis (rPodPit1.hap2.2 2024)
GCA_964106635.2		 n/a 13,828
(1.41 %)		 19,048
(2.34 %)		 n/a 43.89
(99.98 %)		 1,365
(0.02 %)		 1,548
(99.98 %)		 803,451
(4.16 %)		 440,340
(2.30 %)		 6,774,254
(37.14 %)		 89,229
(3.04 %)
221 long-tailed hermit (PSU5 alternate hap 2022)
GCA_023637925.1		 n/a 12,264
(2.01 %)		 20,528
(2.37 %)		 n/a 40.99
(100.00 %)		 n/a 230
(100.00 %)		 498,393
(5.07 %)		 266,700
(1.49 %)		 6,131,743
(20.45 %)		 15,809
(1.43 %)
222 longspined bullhead (fTauBub2.1 alternate hap 2021)
GCA_910589325.1		 n/a 15,137
(3.09 %)		 52,499
(7.75 %)		 n/a 42.22
(100.00 %)		 n/a 1,778
(100.00 %)		 448,166
(4.67 %)		 416,181
(8.95 %)		 3,288,388
(27.99 %)		 55,747
(4.41 %)
223 lumpfish
GCA_009769515.1		 n/a 12,848
(3.32 %)		 43,711
(8.09 %)		 n/a 42.84
(100.00 %)		 n/a 1,866
(100.00 %)		 407,698
(6.03 %)		 360,501
(11.29 %)		 2,456,041
(28.07 %)		 45,916
(5.21 %)
224 lumpfish (primary hap v2.1 2023 genbank)
GCA_963457625.1		 n/a 14,944
(3.23 %)		 50,328
(8.09 %)		 n/a 42.82
(99.97 %)		 954
(0.03 %)		 232
(100.00 %)		 1,034,598
(25.93 %)		 434,819
(13.21 %)		 2,907,371
(30.18 %)		 55,066
(5.20 %)
225 Macqueen's bustard (paternal 2024)
GCA_036418225.1		 n/a 11,814
(1.80 %)		 23,161
(2.38 %)		 n/a 43.09
(100.00 %)		 84
(0.00 %)		 343
(100.00 %)		 586,864
(13.28 %)		 184,036
(5.91 %)		 5,606,205
(25.25 %)		 42,560
(7.71 %)
226 maguari stork (bCicMag1 alternate hap 2021)
GCA_017639665.1		 n/a 10,658
(1.74 %)		 18,941
(1.98 %)		 n/a 42.26
(100.00 %)		 5
(0.00 %)		 4,278
(100.00 %)		 326,479
(4.02 %)		 141,715
(0.74 %)		 5,600,372
(19.59 %)		 27,330
(3.35 %)
227 mallard (hap2 2024)
GCA_964188335.1		 n/a 12,715
(1.89 %)		 24,338
(2.42 %)		 n/a 42.70
(99.99 %)		 485
(0.01 %)		 972
(99.99 %)		 795,168
(13.44 %)		 445,147
(7.71 %)		 5,728,430
(26.21 %)		 35,679
(3.13 %)
228 marbled rockcod (alternate hap 2023)
GCA_949606865.1		 n/a 14,564
(1.72 %)		 71,604
(6.41 %)		 n/a 41.49
(100.00 %)		 n/a 8,737
(100.00 %)		 1,662,251
(42.29 %)		 439,119
(12.96 %)		 3,776,125
(45.00 %)		 56,507
(2.83 %)
229 Mauritius kestrel (alternate hap 2023)
GCA_963210275.1		 n/a 4,774
(1.89 %)		 8,695
(2.32 %)		 n/a 43.52
(100.00 %)		 n/a 2,259
(100.00 %)		 135,092
(3.67 %)		 112,042
(8.63 %)		 1,739,144
(22.50 %)		 12,908
(3.26 %)
230 Mauritius parakeet (alternate hap 2023)
GCA_963243765.1		 n/a 8,873
(1.81 %)		 16,175
(2.24 %)		 n/a 42.92
(100.00 %)		 n/a 2,130
(100.00 %)		 331,293
(6.89 %)		 161,393
(5.94 %)		 3,516,196
(24.86 %)		 16,659
(1.74 %)
231 meadow viper (alternate hap 2022)
GCA_947247025.1		 n/a 10,549
(1.13 %)		 20,171
(2.08 %)		 n/a 41.02
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 9,587
(100.00 %)		 889,533
(7.84 %)		 565,831
(6.37 %)		 5,968,624
(41.74 %)		 73,632
(3.80 %)
232 meadow vole (hap2 2024)
GCA_037039175.1		 n/a 19,001
(1.82 %)		 20,271
(1.68 %)		 n/a 42.58
(100.00 %)		 53
(0.00 %)		 143
(100.00 %)		 3,141,368
(21.37 %)		 898,900
(4.24 %)		 11,475,531
(32.14 %)		 22,186
(0.75 %)
233 Merriam's long-tongued bat (hap2 2024)
GCA_039656995.1		 n/a 18,105
(1.68 %)		 20,751
(1.60 %)		 n/a 42.18
(100.00 %)		 45
(0.00 %)		 71
(100.00 %)		 2,994,788
(29.48 %)		 415,375
(1.07 %)		 11,752,432
(32.88 %)		 65,597
(4.38 %)
234 Mexican burrowing toad (hap2 2024)
GCA_037306015.1		 n/a 13,824
(0.44 %)		 23,296
(1.27 %)		 n/a 41.86
(99.99 %)		 2,009
(0.01 %)		 656
(100.00 %)		 1,860,053
(2.17 %)		 2,751,941
(10.76 %)		 24,252,866
(53.00 %)		 157,012
(1.21 %)
235 Mexican gopher tortoise (WGS:JAMKFD01 2022)
GCA_025201965.1		 n/a 15,425
(0.94 %)		 20,005
(1.48 %)		 n/a 44.46
(95.51 %)		 1,790
(4.49 %)		 4,782
(95.51 %)		 1,404,726
(11.28 %)		 453,302
(2.47 %)		 11,996,092
(34.08 %)		 77,167
(2.14 %)
236 milkfish
GCA_902362175.1		 n/a 16,565
(3.38 %)		 42,094
(6.75 %)		 n/a 41.51
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 1,937
(100.00 %)		 930,392
(8.11 %)		 708,375
(9.04 %)		 3,612,575
(26.46 %)		 21,531
(1.27 %)
237 minke whale (alternate hap 2023)
GCA_950005055.1		 n/a 20,412
(1.46 %)		 27,421
(1.34 %)		 n/a 41.50
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 21,272
(100.00 %)		 3,811,435
(36.24 %)		 959,712
(10.27 %)		 12,159,896
(41.30 %)		 69,852
(1.62 %)
238 monito del monte (mDroGli1 alternate hap 2021)
GCA_019395325.1		 n/a 16,419
(0.77 %)		 17,219
(0.89 %)		 n/a 39.03
(100.00 %)		 33
(0.00 %)		 9,959
(100.00 %)		 6,332,360
(29.69 %)		 1,065,454
(2.09 %)		 17,908,986
(42.25 %)		 13,856
(0.35 %)
239 mute swan (bCygOlo1 v2 alternate hap 2021)
GCA_009769485.2		 n/a 10,145
(1.98 %)		 18,617
(2.30 %)		 n/a 42.21
(100.00 %)		 14
(0.00 %)		 5,640
(100.00 %)		 533,330
(9.11 %)		 213,518
(1.29 %)		 4,813,886
(20.16 %)		 25,667
(3.86 %)
240 Natterer's bat (mMyoNat1.hap2.1 2024)
GCA_964212025.1		 n/a 18,275
(1.81 %)		 21,799
(1.80 %)		 n/a 43.28
(99.99 %)		 1,387
(0.01 %)		 1,706
(99.99 %)		 2,833,193
(23.73 %)		 705,278
(5.10 %)		 9,802,564
(36.67 %)		 61,024
(2.68 %)
241 Nelson's sparrow (bAmmNel1 alternate hap 2023)
GCA_027579665.1		 n/a 11,687
(1.78 %)		 24,169
(2.43 %)		 n/a 43.32
(100.00 %)		 n/a 2,834
(100.00 %)		 414,780
(3.26 %)		 491,012
(10.03 %)		 5,570,475
(26.24 %)		 29,485
(4.55 %)
242 New Caledonian crow
GCA_009651025.1		 n/a 11,097
(1.99 %)		 20,436
(2.45 %)		 n/a 42.67
(100.00 %)		 n/a 894
(100.00 %)		 377,050
(6.03 %)		 178,064
(1.53 %)		 5,305,126
(19.49 %)		 26,107
(2.52 %)
243 New Zealand spotty
GCA_009762545.1		 n/a 13,566
(2.17 %)		 40,774
(5.21 %)		 n/a 40.81
(100.00 %)		 n/a 3,286
(100.00 %)		 472,659
(4.46 %)		 348,429
(5.17 %)		 4,169,213
(33.57 %)		 16,368
(0.83 %)
244 Nicobar pigeon (hap2 2024)
GCA_036010745.1		 n/a 13,270
(1.84 %)		 24,753
(2.28 %)		 n/a 42.94
(100.00 %)		 118
(0.00 %)		 226
(100.00 %)		 675,092
(12.72 %)		 313,111
(3.64 %)		 6,547,843
(23.22 %)		 37,728
(3.88 %)
245 nine-banded armadillo (mDasNov1 hap1 2023)
GCA_030445055.1		 n/a 19,429
(1.06 %)		 22,396
(1.07 %)		 n/a 40.96
(99.27 %)		 845
(0.73 %)		 594
(100.00 %)		 4,369,568
(32.83 %)		 673,707
(1.55 %)		 18,586,102
(42.41 %)		 131,852
(2.78 %)
246 nine-banded armadillo (mDasNov1 hap1 2023)
GCA_030445055.2		 n/a 19,350
(1.07 %)		 22,207
(1.07 %)		 n/a 40.97
(99.27 %)		 823
(0.73 %)		 588
(100.00 %)		 4,330,716
(32.85 %)		 661,966
(1.52 %)		 18,302,021
(42.22 %)		 130,245
(2.79 %)
247 ninespine stickleback (alternate hap 2023)
GCA_949316245.1		 n/a 13,050
(3.93 %)		 44,650
(10.12 %)		 n/a 44.10
(100.00 %)		 n/a 1,934
(100.00 %)		 512,583
(14.83 %)		 156,305
(8.46 %)		 2,005,803
(27.09 %)		 59,674
(9.19 %)
248 North American porcupine (mEreDor1 alternate hap 2023)
GCA_028500835.1		 n/a 15,210
(1.55 %)		 18,316
(1.43 %)		 n/a 41.06
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 5,051
(100.00 %)		 3,911,633
(40.55 %)		 565,546
(1.54 %)		 10,853,726
(32.61 %)		 40,925
(1.35 %)
249 North Atlantic right whale (hap1 2023)
GCA_028571275.1		 n/a 18,699
(1.61 %)		 20,354
(1.28 %)		 n/a 41.64
(99.84 %)		 385
(0.16 %)		 947
(100.00 %)		 3,815,900
(43.46 %)		 718,935
(11.38 %)		 11,928,210
(42.25 %)		 85,881
(1.90 %)
250 North Atlantic right whale (mEubGla1 hap2 2023)
GCA_028564815.1		 n/a 19,541
(1.47 %)		 21,516
(1.25 %)		 n/a 41.69
(99.83 %)		 363
(0.17 %)		 779
(100.00 %)		 1,361,117
(2.23 %)		 836,632
(13.12 %)		 12,597,969
(44.00 %)		 93,862
(1.92 %)
251 North Island brown kiwi (hap2 2024)
GCA_036417975.1		 n/a 13,664
(1.44 %)		 37,696
(2.80 %)		 n/a 44.42
(100.00 %)		 155
(0.00 %)		 349
(100.00 %)		 760,455
(8.84 %)		 626,528
(6.85 %)		 5,029,822
(30.45 %)		 54,278
(9.43 %)
252 northern bat (alternate hap 2023)
GCA_951640545.1		 n/a 18,343
(1.80 %)		 23,253
(1.77 %)		 n/a 43.55
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 4,899
(100.00 %)		 1,174,241
(2.96 %)		 825,170
(5.11 %)		 9,889,579
(36.12 %)		 76,164
(3.52 %)
253 northern black mastiff bat (mMolNig1hap2 2024)
GCA_039880925.1		 n/a 18,305
(1.49 %)		 22,534
(1.56 %)		 n/a 42.75
(100.00 %)		 80
(0.00 %)		 282
(100.00 %)		 3,783,543
(30.10 %)		 656,592
(4.68 %)		 11,353,707
(40.26 %)		 92,041
(3.01 %)
254 northern bottlenose whale (alternate hap 2023)
GCA_949752845.1		 n/a 19,537
(1.44 %)		 27,826
(1.30 %)		 n/a 41.67
(100.00 %)		 n/a 23,401
(100.00 %)		 3,634,923
(35.56 %)		 672,860
(11.00 %)		 11,175,398
(41.72 %)		 62,007
(1.94 %)
255 northern gannet (hap1 2023)
GCA_031468805.1		 n/a 13,367
(1.65 %)		 24,403
(2.00 %)		 n/a 42.94
(100.00 %)		 263
(0.00 %)		 829
(100.00 %)		 498,574
(4.51 %)		 273,984
(5.20 %)		 5,544,122
(27.29 %)		 34,879
(3.83 %)
256 northern goshawk (bAccGen1 v1 alternate hap 2022)
GCA_929447715.1		 n/a 12,115
(1.73 %)		 22,764
(2.15 %)		 n/a 43.51
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 4,484
(100.00 %)		 417,395
(3.68 %)		 231,908
(7.24 %)		 5,424,533
(24.05 %)		 35,691
(4.26 %)
257 northern pike
GCA_011004835.1		 n/a 11,782
(2.41 %)		 40,748
(5.68 %)		 n/a 42.32
(99.93 %)		 11
(0.07 %)		 3,813
(100.00 %)		 700,818
(30.15 %)		 372,729
(7.71 %)		 3,058,655
(31.76 %)		 29,687
(2.57 %)
258 Norway rat BN7 haplotype
GCA_015244455.1		 n/a 3,096
(1.64 %)		 2,450
(1.02 %)		 n/a 41.23
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 3,156
(100.00 %)		 517,347
(50.76 %)		 157,701
(3.90 %)		 1,502,752
(34.14 %)		 1,806
(0.40 %)
259 olive python (hap2 2023)
GCA_030867085.1		 n/a 13,421
(1.31 %)		 17,659
(2.08 %)		 n/a 40.15
(99.66 %)		 93
(0.34 %)		 158
(99.66 %)		 733,358
(2.95 %)		 403,552
(3.04 %)		 7,746,871
(29.97 %)		 34,363
(2.08 %)
260 orange-tipped seq squirt (alternate hap 2023)
GCA_963082865.1		 n/a 167
(2.38 %)		 431
(15.83 %)		 n/a 36.74
(100.00 %)		 n/a 70
(100.00 %)		 885
(7.97 %)		 855
(38.55 %)		 9,941
(42.25 %)		 24
(10.92 %)
261 orbiculate cardinalfish
GCA_902148825.1		 n/a 14,018
(1.51 %)		 45,251
(3.61 %)		 n/a 37.73
(99.94 %)		 142
(0.06 %)		 7,038
(99.94 %)		 1,041,393
(5.09 %)		 744,623
(6.94 %)		 6,250,631
(45.53 %)		 22,522
(0.77 %)
262 painted frog (alternate hap 2022)
GCA_027410455.1		 n/a 7,223
(0.52 %)		 11,927
(1.11 %)		 n/a 38.96
(100.00 %)		 76
(0.00 %)		 4,081
(100.00 %)		 988,792
(3.99 %)		 1,766,202
(10.24 %)		 9,974,001
(52.99 %)		 64,462
(1.33 %)
263 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 alternate hap 2020)
GCA_004115245.2		 n/a 18,116
(1.63 %)		 23,608
(1.65 %)		 n/a 42.48
(100.00 %)		 38
(0.00 %)		 10,895
(100.00 %)		 3,002,448
(29.46 %)		 375,226
(0.79 %)		 11,824,034
(29.65 %)		 67,718
(4.23 %)
264 Papuan ground boa (hap1 2024)
GCA_035125265.1		 n/a 13,365
(1.26 %)		 17,388
(1.98 %)		 n/a 41.07
(100.00 %)		 99
(0.00 %)		 279
(100.00 %)		 726,428
(2.81 %)		 331,756
(2.05 %)		 7,184,711
(33.57 %)		 51,973
(2.70 %)
265 parallel lanternfish (alternate hap 2024)
GCA_964188415.1		 n/a 15,421
(1.80 %)		 62,324
(6.15 %)		 n/a 42.79
(99.90 %)		 4,955
(0.10 %)		 4,978
(99.90 %)		 4,032,523
(34.18 %)		 982,411
(16.51 %)		 5,189,655
(46.47 %)		 64,543
(3.14 %)
266 peladilla (fAplTae1 alternate hap 2021)
GCA_017639685.1		 n/a 16,729
(3.56 %)		 56,451
(8.61 %)		 n/a 45.00
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 5,701
(100.00 %)		 1,153,359
(18.94 %)		 829,887
(14.54 %)		 2,793,018
(28.79 %)		 49,469
(4.32 %)
267 peregrine falcon (bFalPer1 alternate hap 2022)
GCA_023634185.1		 n/a 12,529
(1.75 %)		 24,654
(2.25 %)		 n/a 42.72
(100.00 %)		 n/a 2,745
(100.00 %)		 517,204
(7.95 %)		 218,606
(4.15 %)		 6,216,533
(21.16 %)		 26,313
(2.41 %)
268 Peter's clawed frog (aXenPet1 2024)
GCA_038501915.1		 n/a 21,977
(1.55 %)		 31,925
(2.52 %)		 n/a 39.40
(99.99 %)		 1,072
(0.01 %)		 1,183
(100.00 %)		 825,817
(1.86 %)		 1,047,172
(7.89 %)		 12,996,911
(44.48 %)		 99,118
(1.26 %)
269 Philippine flying lemur (mCynVol1 alternate hap 2022)
GCA_027409165.1		 n/a 18,794
(1.72 %)		 21,421
(1.40 %)		 n/a 40.18
(100.00 %)		 n/a 1,750
(100.00 %)		 4,001,442
(39.37 %)		 547,894
(2.75 %)		 13,870,563
(34.33 %)		 40,162
(1.31 %)
270 pig-tailed macaque (mMacNem1hap2 2024)
GCA_043161795.1		 n/a 19,859
(1.78 %)		 20,597
(1.19 %)		 n/a 41.15
(100.00 %)		 232
(0.00 %)		 233
(100.00 %)		 5,125,011
(53.00 %)		 956,928
(9.12 %)		 14,621,759
(41.68 %)		 96,199
(1.55 %)
271 pinecone soldierfish
GCA_902148815.1		 n/a 15,563
(2.38 %)		 54,264
(6.19 %)		 n/a 41.81
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 2,193
(100.00 %)		 1,040,418
(5.81 %)		 623,499
(4.08 %)		 4,888,400
(27.89 %)		 40,331
(2.02 %)
272 pink pigeon (alternate hap 2023)
GCA_963082445.1		 n/a 10,425
(1.96 %)		 20,219
(2.49 %)		 n/a 42.52
(100.00 %)		 n/a 1,277
(100.00 %)		 344,711
(4.99 %)		 225,902
(3.41 %)		 4,563,425
(21.61 %)		 28,391
(3.74 %)
273 plains spadefoot toad (alternate hap 2022)
GCA_027382365.2		 n/a 10,906
(1.98 %)		 19,820
(4.33 %)		 n/a 40.04
(100.00 %)		 n/a 1,516
(100.00 %)		 390,896
(3.25 %)		 482,493
(7.83 %)		 4,361,670
(34.36 %)		 52,508
(3.70 %)
274 platypus (alternate hap Pmale09 2020)
GCA_004115175.2		 n/a 13,244
(1.26 %)		 19,241
(1.68 %)		 n/a 46.27
(100.00 %)		 25
(0.00 %)		 5,868
(100.00 %)		 4,420,884
(51.59 %)		 513,006
(3.13 %)		 7,749,797
(49.18 %)		 81,538
(8.24 %)
275 plumbeous ibis (bTheCae1 alternate hap 2021)
GCA_020745805.1		 n/a 11,774
(1.90 %)		 20,857
(2.20 %)		 n/a 42.59
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 749
(100.00 %)		 356,053
(4.37 %)		 157,695
(0.93 %)		 5,995,637
(19.60 %)		 30,478
(4.03 %)
276 pollack (alternate hap 2023)
GCA_949987605.1		 n/a 14,050
(2.77 %)		 63,249
(8.86 %)		 n/a 45.41
(100.00 %)		 n/a 4,970
(100.00 %)		 708,455
(9.71 %)		 797,241
(15.67 %)		 2,785,159
(33.18 %)		 78,151
(7.95 %)
277 prehistoric monster fish
GCA_902500245.1		 n/a 10,944
(0.64 %)		 59,123
(2.21 %)		 n/a 41.96
(100.00 %)		 8
(0.00 %)		 19,587
(100.00 %)		 947,336
(2.69 %)		 554,284
(3.27 %)		 7,314,941
(58.56 %)		 125,285
(5.42 %)
278 proboscis bat (hap2 2024)
GCA_037038555.1		 n/a 17,253
(1.51 %)		 18,507
(1.35 %)		 n/a 40.91
(100.00 %)		 39
(0.00 %)		 38
(100.00 %)		 3,466,835
(27.96 %)		 585,261
(1.91 %)		 11,364,898
(40.65 %)		 50,527
(1.37 %)
279 Puerto Rican coqui (hap2 2024)
GCA_035609135.1		 n/a 13,892
(0.57 %)		 32,011
(1.64 %)		 n/a 44.93
(100.00 %)		 685
(0.00 %)		 843
(100.00 %)		 1,042,636
(2.00 %)		 1,430,690
(16.22 %)		 14,621,029
(53.91 %)		 503,166
(8.84 %)
280 pygmy chimpanzee (paternal 2024)
GCA_028858825.2		 n/a 20,282
(1.77 %)		 21,509
(1.17 %)		 n/a 40.46
(99.84 %)		 7
(0.16 %)		 38
(100.00 %)		 5,163,745
(50.07 %)		 970,057
(12.58 %)		 15,047,429
(42.91 %)		 47,029
(1.08 %)
281 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 2 2022)
GCA_026419985.1		 n/a 18,550
(1.51 %)		 20,491
(1.29 %)		 n/a 42.18
(99.99 %)		 138
(0.01 %)		 391
(100.00 %)		 3,860,112
(33.83 %)		 820,375
(9.58 %)		 12,159,196
(41.59 %)		 106,168
(2.78 %)
282 razorbill
GCA_008658355.1		 n/a 12,937
(1.75 %)		 24,253
(2.09 %)		 n/a 42.61
(100.00 %)		 n/a 3,309
(100.00 %)		 562,549
(7.14 %)		 210,852
(1.04 %)		 7,264,995
(20.26 %)		 40,926
(2.91 %)
283 red deer (alternate hap 2021)
GCA_910593805.1		 n/a 18,817
(1.29 %)		 21,916
(1.20 %)		 n/a 44.23
(100.00 %)		 22
(0.00 %)		 4,021
(100.00 %)		 3,279,005
(20.48 %)		 472,706
(21.87 %)		 11,466,609
(50.26 %)		 128,858
(2.07 %)
284 red fox (hap2 2024)
GCA_964106925.2		 n/a 19,517
(1.57 %)		 20,105
(1.37 %)		 n/a 41.31
(99.99 %)		 1,819
(0.02 %)		 350
(100.00 %)		 4,487,839
(31.79 %)		 1,010,106
(2.64 %)		 13,838,711
(33.07 %)		 51,373
(2.26 %)
285 red-bellied piranha (fPygNat1 alternate hap 2020)
GCA_015220065.1		 n/a 4,539
(2.01 %)		 14,061
(4.35 %)		 n/a 40.48
(100.00 %)		 n/a 1,751
(100.00 %)		 759,605
(49.59 %)		 161,693
(7.99 %)		 1,684,737
(29.93 %)		 7,525
(1.31 %)
286 red-crested turaco
GCA_009764505.1		 n/a 11,247
(1.70 %)		 23,705
(2.27 %)		 n/a 42.64
(100.00 %)		 n/a 3,476
(100.00 %)		 482,817
(8.51 %)		 153,169
(0.81 %)		 5,919,109
(21.87 %)		 39,766
(3.41 %)
287 Red-fronted tinkerbird (bPogPus1 alternate hap 2020)
GCA_015220175.1		 n/a 11,434
(1.65 %)		 21,710
(2.11 %)		 n/a 46.12
(100.00 %)		 12
(0.00 %)		 2,748
(100.00 %)		 859,899
(15.52 %)		 319,622
(3.85 %)		 5,367,970
(34.63 %)		 23,381
(1.81 %)
288 red-legged seriema
GCA_009819485.1		 n/a 10,131
(1.78 %)		 19,775
(2.21 %)		 n/a 42.28
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,840
(100.00 %)		 366,591
(6.01 %)		 117,928
(0.90 %)		 5,340,048
(18.90 %)		 26,293
(2.86 %)
289 red-throated loon (hap1 2023)
GCA_030936125.1		 n/a 13,357
(1.64 %)		 29,603
(2.35 %)		 n/a 43.54
(100.00 %)		 260
(0.00 %)		 3,225
(100.00 %)		 549,694
(8.44 %)		 246,171
(10.46 %)		 5,258,356
(27.36 %)		 39,810
(3.37 %)
290 red-throated loon (hap2 2023 genbank)
GCA_030936135.1		 25,173
(40.74 %)		 13,218
(1.71 %)		 28,120
(2.39 %)		 n/a 43.11
(100.00 %)		 249
(0.00 %)		 1,195
(100.00 %)		 544,427
(8.81 %)		 223,674
(5.77 %)		 6,669,469
(23.63 %)		 38,306
(3.37 %)
291 reedfish (v3 alternate hap 2021)
GCA_900700845.3		 n/a 11,382
(0.41 %)		 28,399
(1.33 %)		 n/a 39.39
(99.99 %)		 17
(0.01 %)		 17,099
(99.99 %)		 6,708,926
(37.23 %)		 883,916
(2.81 %)		 16,745,782
(46.94 %)		 74,951
(1.15 %)
292 Rice's whale (hap1 2023)
GCA_028017805.1		 n/a 19,396
(1.48 %)		 21,693
(1.26 %)		 n/a 41.62
(97.80 %)		 131
(2.20 %)		 1,039
(100.00 %)		 3,973,936
(35.55 %)		 987,571
(11.66 %)		 12,473,459
(42.11 %)		 74,971
(1.64 %)
293 Rice's whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028023285.1		 59,888
(43.60 %)		 19,291
(1.53 %)		 21,195
(1.30 %)		 n/a 41.44
(99.90 %)		 334
(0.10 %)		 774
(100.00 %)		 3,917,923
(36.26 %)		 828,521
(9.28 %)		 12,518,796
(41.08 %)		 73,126
(1.69 %)
294 rifleman (bAcaChl1 alternate hap 2021)
GCA_016880875.1		 n/a 9,867
(1.89 %)		 19,635
(2.52 %)		 n/a 42.54
(100.00 %)		 20
(0.00 %)		 2,879
(100.00 %)		 394,769
(10.00 %)		 186,556
(1.91 %)		 4,428,687
(19.09 %)		 15,730
(1.88 %)
295 Riggenbach's reed frog (aHypRig1 alternate hap 2024)
GCA_040937895.1		 n/a 26,401
(0.36 %)		 90,909
(1.63 %)		 n/a 44.93
(100.00 %)		 19
(0.00 %)		 14,096
(100.00 %)		 4,036,529
(2.70 %)		 6,299,339
(18.78 %)		 14,096
(100.00 %)		 1,426,030
(6.65 %)
296 ring-tailed lemur (mLemCat1 alternate hap 2021)
GCA_020740595.1		 n/a 18,683
(1.98 %)		 21,178
(1.55 %)		 n/a 41.29
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 312
(100.00 %)		 3,400,356
(36.84 %)		 511,707
(7.13 %)		 13,027,744
(33.21 %)		 50,614
(1.83 %)
297 roach minnow (alternate hap 2023)
GCA_951802655.1		 n/a 18,165
(2.73 %)		 62,580
(6.00 %)		 n/a 38.74
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 4,612
(100.00 %)		 2,483,904
(48.29 %)		 584,363
(7.55 %)		 5,582,076
(40.38 %)		 60,229
(3.53 %)
298 rock gunnel (alternate hap 2021)
GCA_910591705.2		 n/a 15,291
(3.29 %)		 45,865
(7.56 %)		 n/a 42.26
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,165
(100.00 %)		 1,131,154
(25.69 %)		 269,583
(5.08 %)		 3,371,712
(24.64 %)		 36,810
(2.68 %)
299 rock pigeon (racing homer bColLiv1 2024)
GCA_036010775.2		 n/a 12,450
(1.75 %)		 23,660
(2.21 %)		 n/a 42.27
(100.00 %)		 192
(0.00 %)		 673
(100.00 %)		 586,422
(10.85 %)		 392,341
(12.38 %)		 5,521,172
(28.56 %)		 33,479
(3.29 %)
300 rock pigeon (racing homer maternal 2024)
GCA_036010775.1		 n/a 12,450
(1.75 %)		 25,274
(2.35 %)		 n/a 42.27
(100.00 %)		 192
(0.00 %)		 673
(100.00 %)		 586,422
(10.85 %)		 392,341
(12.38 %)		 5,521,172
(28.56 %)		 33,479
(3.29 %)
301 rock ptarmigan (bLagMut1 alternate hap 2022)
GCA_023344045.1		 n/a 12,090
(2.36 %)		 21,910
(2.57 %)		 n/a 41.56
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 3,212
(100.00 %)		 585,577
(10.45 %)		 202,342
(1.61 %)		 5,390,780
(20.38 %)		 19,210
(2.23 %)
302 Rosablanca catfish (hap2 2023)
GCA_030015355.1		 n/a 15,434
(2.01 %)		 44,991
(4.63 %)		 n/a 40.24
(100.00 %)		 192
(0.00 %)		 302
(100.00 %)		 2,506,810
(40.54 %)		 613,867
(8.67 %)		 5,070,851
(48.32 %)		 46,071
(2.57 %)
303 royal ground snake (hap2 2023)
GCA_031021085.1		 n/a 13,845
(0.96 %)		 23,108
(1.86 %)		 n/a 41.26
(100.00 %)		 n/a 1,128
(100.00 %)		 2,008,682
(10.16 %)		 1,718,408
(7.36 %)		 9,467,451
(52.99 %)		 140,557
(4.65 %)
304 royal ground snake (hap3 2023)
GCA_031001685.1		 n/a 12,606
(0.83 %)		 22,421
(1.62 %)		 n/a 41.63
(100.00 %)		 n/a 3,543
(100.00 %)		 2,080,172
(11.19 %)		 1,814,619
(9.22 %)		 8,889,119
(57.36 %)		 145,328
(4.63 %)
305 rudd (Europe DD20220513a primary hap 2022)
GCA_024453875.1		 n/a 17,895
(2.55 %)		 64,448
(5.84 %)		 n/a 38.93
(99.99 %)		 418
(0.01 %)		 110
(100.00 %)		 2,661,155
(49.83 %)		 673,071
(10.59 %)		 5,755,954
(42.48 %)		 66,952
(4.46 %)
306 rufous frog (hap1 2023)
GCA_031893025.1		 n/a 13,727
(0.84 %)		 24,896
(2.06 %)		 n/a 42.95
(99.51 %)		 973
(0.49 %)		 2,266
(100.00 %)		 729,332
(2.15 %)		 1,402,564
(24.45 %)		 8,156,596
(55.96 %)		 175,180
(3.64 %)
307 saddleback dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949987525.1		 n/a 18,509
(1.54 %)		 22,514
(1.36 %)		 n/a 41.95
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 7,427
(100.00 %)		 3,675,922
(35.75 %)		 950,374
(10.49 %)		 11,670,399
(40.31 %)		 63,587
(3.15 %)
308 Saker falcon (bFalChe1 alternate hap 2022)
GCA_023634115.1		 n/a 12,258
(1.66 %)		 25,579
(2.30 %)		 n/a 43.39
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 4,162
(100.00 %)		 506,343
(6.77 %)		 182,589
(7.22 %)		 5,435,776
(23.60 %)		 29,420
(2.47 %)
309 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 alternate hap 2023)
GCA_027887135.1		 n/a 12,826
(1.74 %)		 26,019
(2.35 %)		 n/a 43.09
(100.00 %)		 n/a 3,054
(100.00 %)		 482,850
(3.37 %)		 523,437
(10.15 %)		 6,386,315
(26.20 %)		 32,734
(4.25 %)
310 San Diegan legless lizard (HBS135921 alternate hap 2023)
GCA_029215795.1		 n/a 14,039
(1.09 %)		 19,528
(1.85 %)		 n/a 43.71
(100.00 %)		 31
(0.00 %)		 122
(100.00 %)		 1,307,065
(5.31 %)		 672,219
(3.50 %)		 9,949,858
(39.30 %)		 83,890
(3.97 %)
311 sand lizard
GCA_009819545.1		 n/a 14,226
(1.28 %)		 25,396
(2.33 %)		 n/a 43.80
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 12,662
(100.00 %)		 1,001,433
(5.27 %)		 445,157
(1.79 %)		 7,227,826
(34.26 %)		 80,300
(2.76 %)
312 Sardinian treefrog (hap2 2023)
GCA_029493135.1		 n/a 14,077
(0.47 %)		 36,608
(1.60 %)		 n/a 43.86
(99.99 %)		 2,097
(0.01 %)		 2,802
(100.00 %)		 1,819,971
(2.73 %)		 2,865,173
(16.12 %)		 15,335,602
(63.85 %)		 651,438
(8.09 %)
313 Schreibers' long-fingered bat (hap2 2024)
GCA_964145185.1		 n/a 17,115
(2.05 %)		 19,972
(1.93 %)		 n/a 42.62
(99.99 %)		 1,137
(0.01 %)		 1,305
(99.99 %)		 2,445,695
(27.61 %)		 386,295
(4.40 %)		 9,657,997
(29.32 %)		 56,451
(2.93 %)
314 sea lamprey
GCA_010993595.1		 n/a 6,180
(0.71 %)		 31,191
(4.14 %)		 n/a 48.30
(100.00 %)		 11
(0.00 %)		 4,064
(100.00 %)		 1,494,745
(38.42 %)		 891,392
(20.02 %)		 4,259,383
(49.70 %)		 147,499
(35.87 %)
315 shanny (alternate hap 2023)
GCA_963383635.1		 n/a 14,728
(2.46 %)		 62,094
(7.09 %)		 n/a 42.32
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 3,847
(100.00 %)		 939,151
(11.90 %)		 472,983
(7.68 %)		 4,326,183
(28.40 %)		 64,290
(4.16 %)
316 sharpnose sevengill shark (hap2 2024)
GCA_035084135.1		 n/a 12,603
(0.52 %)		 23,419
(1.42 %)		 n/a 44.36
(99.99 %)		 1,695
(0.01 %)		 2,889
(99.99 %)		 559,171
(2.08 %)		 973,228
(15.01 %)		 11,768,442
(55.69 %)		 108,468
(3.25 %)
317 siamang (Jambi alternate hap 2024)
GCA_028878085.3		 n/a 19,572
(1.70 %)		 20,107
(1.11 %)		 n/a 40.45
(99.93 %)		 3
(0.07 %)		 40
(100.00 %)		 5,057,491
(55.54 %)		 869,279
(15.07 %)		 14,090,400
(46.04 %)		 87,907
(1.41 %)
318 siamang (v2 Jambi alternate hap 2024)
GCA_028878085.2		 n/a 19,572
(1.70 %)		 20,107
(1.11 %)		 n/a 40.45
(99.93 %)		 3
(0.07 %)		 40
(100.00 %)		 5,057,491
(55.54 %)		 869,279
(15.07 %)		 14,090,400
(46.04 %)		 87,907
(1.41 %)
319 Siamese fighting fish (v5.4 alternate hap 2023)
GCA_900651605.2		 n/a 14,737
(4.05 %)		 61,568
(10.70 %)		 n/a 45.50
(100.00 %)		 108
(0.00 %)		 3,872
(100.00 %)		 392,585
(19.23 %)		 190,741
(5.09 %)		 1,994,824
(23.20 %)		 74,259
(13.49 %)
320 Skyros wall lizard (rPodGai1.hap2.1 2024)
GCA_964106785.1		 n/a 13,756
(1.40 %)		 19,148
(2.33 %)		 n/a 43.77
(99.99 %)		 783
(0.01 %)		 127
(100.00 %)		 790,266
(3.86 %)		 448,558
(4.00 %)		 6,780,108
(37.51 %)		 86,165
(2.71 %)
321 slow loris (mNycCou1 alternate hap 2022)
GCA_027406535.1		 n/a 21,660
(1.50 %)		 22,771
(1.32 %)		 n/a 40.88
(100.00 %)		 n/a 6,485
(100.00 %)		 4,275,926
(39.13 %)		 533,324
(1.57 %)		 13,459,597
(39.86 %)		 35,720
(0.78 %)
322 smaller spotted catshark (alternate hap 2021)
GCA_902713625.2		 n/a 11,589
(0.31 %)		 32,603
(1.10 %)		 n/a 47.54
(100.00 %)		 6
(0.00 %)		 26,655
(100.00 %)		 1,346,532
(1.83 %)		 1,273,326
(5.35 %)		 19,727,443
(51.55 %)		 427,693
(8.25 %)
323 smalleye Pacific opah (hap1 2023)
GCA_029633845.1		 n/a 13,661
(1.11 %)		 75,418
(4.21 %)		 n/a 45.01
(99.96 %)		 3,120
(0.04 %)		 1,059
(100.00 %)		 4,634,757
(53.53 %)		 1,006,319
(17.13 %)		 5,273,732
(51.16 %)		 145,115
(7.59 %)
324 smalltooth sawfish
GCA_009764485.1		 n/a 9,086
(0.58 %)		 20,468
(1.57 %)		 n/a 42.65
(100.00 %)		 n/a 10,892
(100.00 %)		 315,695
(1.23 %)		 320,148
(1.73 %)		 8,305,059
(38.33 %)		 37,147
(1.43 %)
325 snake N.helvetica (rNatHel1.hap2.1 2024)
GCA_964273795.1		 n/a 11,975
(1.14 %)		 16,941
(1.86 %)		 n/a 41.42
(99.98 %)		 1,674
(0.02 %)		 2,176
(99.98 %)		 1,088,721
(8.03 %)		 743,110
(5.43 %)		 7,446,281
(43.88 %)		 96,764
(4.19 %)
326 soprano pipistrelle (alternate hap 2023)
GCA_949987765.1		 n/a 17,590
(1.81 %)		 21,597
(1.85 %)		 n/a 42.88
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,717
(100.00 %)		 2,734,555
(21.46 %)		 795,752
(6.56 %)		 9,601,735
(36.35 %)		 62,524
(3.25 %)
327 South Island takahe (alternate hap 2021)
GCA_020801775.1		 n/a 12,655
(1.70 %)		 n/a n/a 43.63
(99.16 %)		 238
(0.84 %)		 178
(100.00 %)		 554,912
(9.42 %)		 230,808
(4.34 %)		 6,406,358
(24.83 %)		 22,941
(1.98 %)
328 southern bluefin tuna (alternate hap 2021)
GCA_910596085.1		 n/a 15,727
(2.61 %)		 43,177
(5.74 %)		 n/a 39.72
(100.00 %)		 n/a 895
(100.00 %)		 1,590,386
(33.53 %)		 246,800
(2.86 %)		 5,173,834
(26.85 %)		 14,473
(0.87 %)
329 southern tamandua (mTamTet1 alternate hap 2022)
GCA_023853755.1		 n/a 20,179
(1.21 %)		 24,249
(1.19 %)		 n/a 39.54
(100.00 %)		 4
(0.00 %)		 7,866
(100.00 %)		 3,953,031
(35.88 %)		 531,111
(1.14 %)		 16,354,874
(39.96 %)		 59,907
(1.35 %)
330 southern two-toed sloth (mChoDid1 alternate hap 2020)
GCA_015220265.1		 n/a 22,897
(1.23 %)		 27,007
(1.18 %)		 n/a 39.87
(100.00 %)		 70
(0.00 %)		 12,050
(100.00 %)		 4,502,020
(38.27 %)		 576,759
(1.02 %)		 17,143,050
(40.65 %)		 51,339
(1.15 %)
331 Sowerby's beaked whale (hap2 2024)
GCA_964148845.1		 n/a 18,591
(1.46 %)		 21,588
(1.27 %)		 n/a 42.00
(99.99 %)		 974
(0.01 %)		 2,126
(99.99 %)		 3,961,403
(34.20 %)		 742,897
(9.73 %)		 10,832,739
(43.68 %)		 70,803
(2.85 %)
332 speckled mousebird (bColStr4 hap2 2023)
GCA_028858625.2		 n/a 12,332
(1.76 %)		 22,895
(2.24 %)		 n/a 42.74
(99.53 %)		 136
(0.47 %)		 242
(100.00 %)		 521,023
(11.26 %)		 304,406
(7.39 %)		 5,319,571
(25.46 %)		 27,299
(2.35 %)
333 speckled mousebird (hap2 2023)
GCA_028858625.1		 n/a 13,169
(1.74 %)		 26,896
(2.47 %)		 n/a 42.62
(99.56 %)		 151
(0.44 %)		 243
(100.00 %)		 570,907
(11.75 %)		 317,226
(6.96 %)		 5,854,600
(25.51 %)		 28,905
(2.31 %)
334 spotted gar (fLepOcu1hap1 2024)
GCA_040954845.1		 n/a 13,777
(1.63 %)		 24,910
(4.29 %)		 n/a 40.54
(100.00 %)		 76
(0.00 %)		 831
(100.00 %)		 1,218,814
(33.09 %)		 230,177
(10.66 %)		 5,685,909
(34.46 %)		 52,438
(3.69 %)
335 spotted ratfish (hap1 2024)
GCA_035084065.1		 n/a 10,920
(1.26 %)		 14,403
(2.60 %)		 n/a 43.46
(99.96 %)		 2,088
(0.04 %)		 1,042
(100.00 %)		 3,325,883
(44.48 %)		 604,780
(8.87 %)		 5,926,808
(44.92 %)		 64,249
(4.00 %)
336 starry smooth-hound (sMusAst1.hap2.1 2024)
GCA_964214025.1		 n/a 12,414
(0.43 %)		 22,037
(1.15 %)		 n/a 45.49
(99.98 %)		 3,505
(0.02 %)		 7,908
(99.98 %)		 1,083,980
(2.93 %)		 1,065,586
(9.57 %)		 13,986,241
(53.49 %)		 105,379
(3.46 %)
337 sterlet (paternal 2022)
GCA_902713435.2		 n/a 24,717
(1.73 %)		 40,151
(4.13 %)		 74,807
(5.54 %)		 40.09
(99.99 %)		 475
(0.01 %)		 1,517
(100.00 %)		 1,844,596
(9.77 %)		 1,119,340
(9.88 %)		 9,372,934
(41.58 %)		 65,007
(2.74 %)
338 stone loach (alternate hap 2022)
GCA_947034905.1		 n/a 16,177
(4.18 %)		 40,160
(7.35 %)		 n/a 39.58
(100.00 %)		 n/a 2,237
(100.00 %)		 1,208,781
(38.02 %)		 121,854
(7.96 %)		 2,956,942
(32.61 %)		 27,787
(3.58 %)
339 striped catfish (fPanHyp1 alternate hap 2022)
GCA_027382375.1		 n/a 15,871
(2.85 %)		 42,287
(5.51 %)		 n/a 38.96
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 3,274
(100.00 %)		 1,826,752
(37.53 %)		 592,022
(6.69 %)		 4,899,884
(32.33 %)		 17,357
(1.25 %)
340 striped dolphin (alternate hap 2023)
GCA_951394445.1		 n/a 18,204
(1.54 %)		 21,036
(1.34 %)		 n/a 42.07
(100.00 %)		 n/a 3,464
(100.00 %)		 3,767,720
(35.65 %)		 1,102,723
(10.92 %)		 11,794,617
(40.96 %)		 67,537
(3.57 %)
341 Sumatran orangutan (v2 AG06213 alternate hap 2024)
GCA_028885685.2		 n/a 19,884
(1.79 %)		 20,383
(1.18 %)		 n/a 40.95
(99.75 %)		 10
(0.25 %)		 48
(100.00 %)		 5,192,176
(53.57 %)		 950,166
(9.22 %)		 15,240,038
(41.74 %)		 41,928
(1.16 %)
342 Suruca trogon (bTroSur1 alternate hap 2021)
GCA_020746095.1		 n/a 11,628
(1.91 %)		 21,635
(2.31 %)		 n/a 42.86
(100.00 %)		 17
(0.00 %)		 1,535
(100.00 %)		 421,231
(6.57 %)		 146,070
(1.11 %)		 5,727,350
(21.91 %)		 37,752
(3.68 %)
343 Suwannee snapping turtle (hap1 2023)
GCA_033296515.1		 n/a 14,713
(1.06 %)		 18,602
(1.60 %)		 n/a 44.58
(100.00 %)		 290
(0.00 %)		 366
(100.00 %)		 1,352,115
(12.17 %)		 388,630
(1.94 %)		 10,550,154
(33.42 %)		 113,023
(3.09 %)
344 Swainson's thrush (bCatUst1 v2 alternate hap 2020)
GCA_009819505.2		 n/a 13,403
(1.85 %)		 27,669
(2.52 %)		 n/a 42.86
(100.00 %)		 13
(0.00 %)		 3,601
(100.00 %)		 704,976
(13.16 %)		 649,859
(4.89 %)		 6,740,713
(22.65 %)		 49,076
(3.54 %)
345 swamp sparrow (bMelGeo1 alternate hap 2023)
GCA_028019105.1		 n/a 12,160
(1.83 %)		 24,622
(2.46 %)		 n/a 43.37
(100.00 %)		 n/a 862
(100.00 %)		 383,634
(3.06 %)		 527,550
(8.40 %)		 5,916,654
(24.97 %)		 31,261
(3.21 %)
346 Swift parrot (hap2 2024)
GCA_037157625.1		 n/a 11,928
(1.78 %)		 20,879
(2.12 %)		 n/a 42.78
(99.75 %)		 122
(0.25 %)		 413
(100.00 %)		 481,463
(6.65 %)		 359,572
(7.59 %)		 5,094,615
(26.27 %)		 23,296
(2.08 %)
347 tailed frog (A.truei hap2 2024)
GCA_040206675.1		 n/a 14,405
(0.55 %)		 41,584
(1.88 %)		 n/a 44.89
(99.97 %)		 6,023
(0.03 %)		 2,779
(100.00 %)		 1,770,524
(4.86 %)		 3,429,564
(18.94 %)		 15,718,939
(55.22 %)		 441,543
(6.61 %)
348 tammar wallaby (mMacEug1 alternate hap 2023)
GCA_028389975.1		 n/a 11,133
(0.77 %)		 13,869
(0.98 %)		 n/a 38.63
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 14,285
(100.00 %)		 3,114,522
(26.10 %)		 661,874
(3.02 %)		 11,667,649
(38.41 %)		 12,393
(0.46 %)
349 tawny frogmouth (bPodStr1 alternate hap 2023)
GCA_028020675.1		 n/a 11,432
(1.95 %)		 20,528
(2.37 %)		 n/a 42.31
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 911
(100.00 %)		 470,125
(9.51 %)		 140,846
(3.57 %)		 5,002,695
(22.08 %)		 22,424
(2.33 %)
350 tawny owl (hap2 2023)
GCA_031877785.1		 n/a 12,367
(1.72 %)		 21,445
(2.03 %)		 n/a 42.53
(99.88 %)		 206
(0.12 %)		 184
(100.00 %)		 392,959
(4.59 %)		 235,300
(7.72 %)		 6,437,772
(24.82 %)		 27,952
(2.71 %)
351 thorny skate
GCA_010909745.1		 n/a 5,885
(0.35 %)		 24,457
(1.45 %)		 n/a 44.61
(100.00 %)		 3
(0.00 %)		 21,995
(100.00 %)		 553,415
(2.65 %)		 761,469
(4.53 %)		 6,043,769
(57.75 %)		 159,552
(5.54 %)
352 tiger shark (hap2 2023)
GCA_030684295.1		 n/a 12,516
(0.44 %)		 17,465
(1.05 %)		 n/a 44.66
(99.65 %)		 1,203
(0.35 %)		 2,136
(99.65 %)		 8,278,458
(59.68 %)		 903,434
(18.42 %)		 14,975,344
(48.25 %)		 48,378
(1.60 %)
353 tiny Cayenne caecilian
GCA_901765105.1		 n/a 12,197
(0.36 %)		 33,747
(1.15 %)		 n/a 43.95
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 23,871
(100.00 %)		 1,453,442
(1.57 %)		 1,309,062
(3.23 %)		 17,953,416
(52.19 %)		 326,452
(3.86 %)
354 torafugu
GCA_901000745.3		 n/a 13,635
(4.82 %)		 48,723
(11.83 %)		 n/a 45.60
(99.82 %)		 38
(0.18 %)		 2,012
(100.00 %)		 249,793
(9.32 %)		 151,193
(4.49 %)		 1,577,144
(20.25 %)		 46,936
(9.72 %)
355 tourmaline sunangel (hap2 2024)
GCA_036172335.1		 n/a 11,697
(2.00 %)		 19,544
(2.34 %)		 n/a 41.82
(99.99 %)		 370
(0.01 %)		 200
(100.00 %)		 480,724
(5.14 %)		 292,213
(3.66 %)		 5,608,823
(21.79 %)		 17,191
(1.69 %)
356 trahira (hap1 2023)
GCA_029633855.1		 n/a 16,039
(2.06 %)		 44,287
(4.38 %)		 n/a 40.99
(92.91 %)		 867
(7.09 %)		 597
(100.00 %)		 2,228,831
(30.95 %)		 687,495
(13.85 %)		 5,309,097
(36.70 %)		 27,070
(2.09 %)
357 tufted duck
GCA_009819845.1		 n/a 12,117
(2.03 %)		 21,464
(2.36 %)		 n/a 41.71
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 780
(100.00 %)		 732,317
(7.82 %)		 353,660
(1.57 %)		 6,119,549
(21.70 %)		 27,920
(2.56 %)
358 Tungara frog (aEngPut4 2024)
GCA_040894015.1		 n/a 13,192
(0.88 %)		 29,242
(2.52 %)		 n/a 43.08
(100.00 %)		 507
(0.00 %)		 819
(100.00 %)		 736,700
(2.60 %)		 1,165,044
(20.79 %)		 8,671,642
(52.60 %)		 207,553
(4.71 %)
359 tunicate S.clava (kaStyClav1.hap2.1 2024)
GCA_964204955.1		 n/a 3,537
(0.78 %)		 12,938
(7.13 %)		 n/a 36.53
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 269
(100.00 %)		 91,318
(3.44 %)		 79,330
(9.47 %)		 2,208,574
(39.20 %)		 6,157
(5.53 %)
360 two-lined caecilian
GCA_901001175.1		 n/a 13,456
(0.33 %)		 47,486
(1.34 %)		 n/a 44.33
(100.00 %)		 2
(0.00 %)		 27,233
(100.00 %)		 1,968,437
(1.91 %)		 1,716,136
(3.97 %)		 25,847,315
(43.76 %)		 523,234
(6.59 %)
361 vaquita (alternate hap mPhoSin1 2019)
GCA_008692045.1		 n/a 9,367
(1.66 %)		 11,297
(1.30 %)		 n/a 41.50
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 9,470
(100.00 %)		 1,708,360
(43.81 %)		 267,584
(1.67 %)		 5,373,410
(33.52 %)		 29,783
(1.94 %)
362 warty frogfish (fAntMac1 alternate hap 2020)
GCA_013347815.1		 n/a 14,197
(3.33 %)		 44,782
(7.70 %)		 n/a 41.82
(100.00 %)		 n/a 2,294
(100.00 %)		 396,279
(4.74 %)		 275,154
(5.76 %)		 2,933,132
(29.41 %)		 35,104
(4.08 %)
363 western capercaillie (alternate hap 2023)
GCA_951394355.1		 n/a 11,226
(2.33 %)		 20,526
(2.54 %)		 n/a 41.53
(100.00 %)		 n/a 5,463
(100.00 %)		 436,894
(5.48 %)		 209,008
(1.73 %)		 4,790,071
(20.27 %)		 17,864
(2.58 %)
364 western European hedgehog (alternate hap 2023)
GCA_950295305.1		 n/a 14,370
(1.06 %)		 24,297
(1.27 %)		 n/a 42.08
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 26,601
(100.00 %)		 3,360,923
(19.59 %)		 1,043,098
(3.92 %)		 8,511,380
(53.68 %)		 23,321
(0.97 %)
365 western lowland gorilla (paternal KB3781 2024)
GCA_028885475.2		 n/a 20,265
(1.62 %)		 40,901
(1.63 %)		 n/a 40.53
(99.94 %)		 2
(0.06 %)		 24
(100.00 %)		 5,171,525
(50.35 %)		 1,002,906
(19.45 %)		 15,064,682
(47.42 %)		 64,337
(1.17 %)
366 Western terrestrial garter snake
GCA_009769695.1		 n/a 13,101
(0.94 %)		 24,980
(1.75 %)		 n/a 41.02
(99.93 %)		 19
(0.07 %)		 13,642
(99.93 %)		 1,410,212
(7.70 %)		 1,080,385
(4.56 %)		 9,112,844
(43.96 %)		 91,606
(2.53 %)
367 whiskered bat (hap2 2024)
GCA_964195625.1		 n/a 18,681
(1.83 %)		 21,523
(1.79 %)		 n/a 43.13
(99.99 %)		 1,414
(0.01 %)		 1,741
(99.99 %)		 2,849,223
(24.50 %)		 688,594
(4.80 %)		 9,968,980
(36.80 %)		 64,365
(2.68 %)
368 whiskered treeswift (bHemCom1 alternate hap 2021)
GCA_020745695.1		 n/a 11,632
(1.83 %)		 20,659
(2.18 %)		 n/a 42.16
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 2,405
(100.00 %)		 553,633
(11.80 %)		 147,999
(0.81 %)		 5,825,472
(20.55 %)		 20,481
(1.61 %)
369 white-beaked dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949774935.1		 n/a 17,639
(1.50 %)		 25,684
(1.35 %)		 n/a 42.08
(100.00 %)		 n/a 25,619
(100.00 %)		 3,039,324
(36.05 %)		 637,912
(8.02 %)		 9,746,398
(38.98 %)		 56,325
(3.33 %)
370 white-crowned manakin (hap2 2024)
GCA_036250135.1		 n/a 12,135
(1.94 %)		 21,591
(2.38 %)		 n/a 42.49
(99.99 %)		 307
(0.01 %)		 595
(100.00 %)		 375,468
(3.93 %)		 263,979
(3.93 %)		 5,786,346
(21.36 %)		 25,275
(2.50 %)
371 white-tailed eagle (bHalAlb1.1 alternate hap 2022)
GCA_947461935.1		 n/a 7,755
(1.71 %)		 16,331
(2.39 %)		 n/a 43.66
(100.00 %)		 n/a 4,971
(100.00 %)		 304,566
(13.21 %)		 116,307
(6.64 %)		 3,407,853
(22.91 %)		 34,573
(4.56 %)
372 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 alternate hap 2022)
GCA_024140225.1		 n/a 12,198
(1.10 %)		 18,494
(1.29 %)		 n/a 39.87
(100.00 %)		 26
(0.00 %)		 14,841
(100.00 %)		 1,725,021
(17.81 %)		 802,415
(4.26 %)		 8,321,474
(45.72 %)		 15,669
(0.79 %)
373 white-tufted-ear marmoset (maternal 2020)
GCA_011078405.1		 n/a 21,684
(1.92 %)		 21,053
(1.29 %)		 n/a 40.97
(99.58 %)		 1,068
(0.42 %)		 216
(100.00 %)		 5,099,933
(50.01 %)		 797,450
(2.45 %)		 15,059,591
(37.67 %)		 36,133
(0.92 %)
374 whooping crane (paternal hap 2023)
GCA_028858595.1		 n/a 13,284
(1.87 %)		 23,528
(2.20 %)		 n/a 42.47
(99.50 %)		 586
(0.50 %)		 395
(100.00 %)		 569,940
(8.69 %)		 162,569
(0.98 %)		 7,021,319
(20.20 %)		 38,582
(3.77 %)
375 yellow-bellied toad (2024)
GCA_964205305.1		 n/a 16,306
(0.23 %)		 45,587
(0.94 %)		 n/a 38.94
(99.99 %)		 6,811
(0.01 %)		 10,308
(99.99 %)		 4,195,244
(3.50 %)		 7,201,985
(14.20 %)		 10,308
(99.99 %)		 412,512
(1.53 %)
376 yellow-crowned parrot (bAmaOch1hap2 2024)
GCA_039720425.1		 n/a 12,079
(1.50 %)		 21,895
(1.84 %)		 n/a 44.31
(100.00 %)		 138
(0.00 %)		 2,468
(100.00 %)		 514,155
(7.08 %)		 298,648
(19.26 %)		 3,943,979
(37.27 %)		 27,272
(1.79 %)
377 yellow-legged gull (bLarMic1.1_alternate_haplotype 2024)
GCA_964199725.1		 n/a 12,692
(1.61 %)		 24,720
(2.07 %)		 n/a 44.79
(100.00 %)		 n/a 4,673
(100.00 %)		 486,967
(5.03 %)		 248,816
(10.71 %)		 6,176,494
(29.58 %)		 44,101
(6.72 %)
378 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 alternate hap 2023)
GCA_028571665.1		 n/a 16,320
(1.03 %)		 20,318
(1.13 %)		 n/a 40.93
(100.00 %)		 1
(0.00 %)		 4,169
(100.00 %)		 2,911,332
(23.50 %)		 347,110
(4.57 %)		 17,256,419
(44.04 %)		 28,674
(0.68 %)
379 yellow-throated sandgrouse
GCA_009769505.1		 n/a 11,788
(1.85 %)		 23,306
(2.45 %)		 n/a 42.31
(100.00 %)		 n/a 1,958
(100.00 %)		 467,960
(6.96 %)		 182,645
(0.99 %)		 6,050,545
(20.78 %)		 26,357
(2.20 %)
380 yellowfin seabream (v.2019 alternate hap 2020)
GCA_904848175.1		 n/a 814
(1.87 %)		 3,814
(6.84 %)		 n/a 42.36
(99.98 %)		 80
(0.02 %)		 349
(100.00 %)		 38,000
(5.03 %)		 29,516
(7.35 %)		 232,988
(20.37 %)		 2,289
(2.07 %)
381 yellowfin tuna (alternate hap 2021)
GCA_914744365.1		 n/a 15,959
(2.63 %)		 43,025
(5.73 %)		 n/a 39.71
(100.00 %)		 n/a 640
(100.00 %)		 1,427,221
(28.44 %)		 257,108
(3.15 %)		 5,197,531
(26.91 %)		 13,909
(0.83 %)
382 zebra finch (alternate hap Blue55 v1 2020)
GCA_009859025.1		 n/a 10,734
(1.84 %)		 19,978
(2.21 %)		 n/a 41.07
(99.99 %)		 16
(0.01 %)		 4,677
(100.00 %)		 436,071
(7.44 %)		 217,580
(1.43 %)		 5,800,691
(19.24 %)		 19,512
(1.90 %)
383 zebra finch (Black17 v1.4 alternate hap 2021)
GCA_003957525.2		 n/a 11,213
(2.01 %)		 21,533
(2.54 %)		 n/a 41.92
(100.00 %)		 10
(0.00 %)		 1,646
(100.00 %)		 470,860
(9.54 %)		 387,943
(3.32 %)		 5,428,128
(20.68 %)		 23,838
(2.47 %)
384 zebra finch (maternal)
GCA_008822115.3		 n/a 11,950
(2.00 %)		 22,828
(2.51 %)		 n/a 42.06
(98.45 %)		 583
(1.55 %)		 206
(100.00 %)		 494,110
(9.54 %)		 347,933
(2.80 %)		 5,875,448
(20.29 %)		 27,387
(2.57 %)
385 zebra finch (paternal W)
GCF_008822105.2		 50,407
(7.20 %)		 12,470
(1.95 %)		 23,352
(2.42 %)		 n/a 41.81
(97.98 %)		 857
(2.02 %)		 205
(100.00 %)		 529,829
(9.55 %)		 357,586
(2.56 %)		 6,359,599
(20.12 %)		 27,755
(2.36 %)
386 zebrafish (fDanRer4 alternate hap 2022)
GCA_944039255.1		 n/a 6,365
(2.41 %)		 16,467
(3.26 %)		 n/a 36.72
(100.00 %)		 n/a 4,719
(100.00 %)		 1,317,027
(59.43 %)		 323,062
(10.58 %)		 3,014,570
(45.46 %)		 14,563
(1.98 %)
387 zebrafish (WGS:CAHPTA01 2020)
GCA_903684865.1		 n/a 17,535
(2.50 %)		 44,169
(3.34 %)		 n/a 36.57
(99.99 %)		 712
(0.01 %)		 1,252
(100.00 %)		 3,891,854
(61.07 %)		 927,173
(7.78 %)		 8,621,517
(50.27 %)		 44,554
(2.12 %)
388 zebrafish (WGS:CAHPTB02 2020)
GCA_903684855.2		 n/a 17,692
(2.51 %)		 43,578
(3.27 %)		 n/a 36.56
(99.99 %)		 1,352
(0.01 %)		 755
(100.00 %)		 3,937,397
(60.86 %)		 936,258
(7.76 %)		 8,732,369
(50.44 %)		 44,812
(2.09 %)
389 zig-zag eel
GCA_900700395.1		 n/a 1,204
(2.88 %)		 4,065
(7.13 %)		 n/a 41.24
(99.99 %)		 n/a 1,437
(100.00 %)		 26,319
(3.19 %)		 14,209
(3.21 %)		 211,357
(18.05 %)		 1,253
(1.49 %)
TOTALS:total assembly count 389

Alternate sets of VGP assembliesNCBI Refseq
Index pages:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Assembly statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies
Track statistics:  primary assembly alternate/haplotype trio mat/pat legacy/superseded other NCBI Refseq assemblies